View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18981_low_12 (Length: 311)

Name: NF18981_low_12
Description: NF18981
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18981_low_12
NF18981_low_12
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (10-299)||(12497799-12498088)
chr3 (10-299)||(14876789-14877078)
chr3 (10-299)||(17489401-17489690)
chr3 (10-302)||(9522270-9522562)
chr3 (10-299)||(16370964-16371253)
chr3 (10-299)||(16492471-16492760)
chr3 (10-296)||(16807219-16807505)
chr3 (22-299)||(10905773-10906050)
chr3 (10-299)||(16691711-16692000)
chr3 (10-299)||(15348535-15348824)
chr3 (22-299)||(10005163-10005440)
chr3 (10-299)||(15725223-15725512)
chr3 (22-299)||(48425010-48425287)
chr3 (22-299)||(13252253-13252530)
chr3 (22-299)||(15589682-15589959)
chr3 (22-299)||(16635336-16635613)
chr3 (22-299)||(43162660-43162937)
chr3 (10-299)||(15338820-15339109)
chr3 (10-299)||(15402800-15403089)
chr3 (22-299)||(20062344-20062621)
chr3 (10-298)||(15208442-15208730)
chr3 (10-299)||(5425220-5425508)
chr3 (10-299)||(53385308-53385597)
chr3 (17-299)||(26792689-26792971)
chr3 (10-299)||(6600298-6600587)
chr3 (10-299)||(16412572-16412861)
chr3 (10-299)||(16756875-16757164)
chr3 (37-302)||(15247725-15247990)
chr3 (28-299)||(15227228-15227499)
chr3 (37-299)||(13972399-13972661)
chr3 (11-299)||(47123506-47123794)
chr3 (11-299)||(10383531-10383819)
chr3 (28-299)||(13322931-13323202)
chr3 (10-299)||(14571409-14571698)
chr3 (46-299)||(15953247-15953500)
chr3 (28-299)||(18134625-18134896)
chr3 (25-302)||(16329935-16330212)
chr3 (76-299)||(12850558-12850781)
chr3 (149-299)||(15016034-15016184)
chr3 (10-299)||(10420324-10420613)
chr3 (37-299)||(14086261-14086523)
chr3 (46-302)||(8759358-8759614)
chr3 (46-302)||(13941621-13941877)
chr3 (46-302)||(41177119-41177375)
chr3 (10-296)||(11304055-11304341)
chr3 (28-296)||(12360824-12361092)
chr3 (25-299)||(11961313-11961587)
chr3 (10-152)||(31689049-31689191)
chr3 (10-154)||(31945033-31945177)
chr3 (147-302)||(16836786-16836941)
chr3 (46-211)||(16381294-16381459)
chr3 (169-299)||(8274689-8274819)
chr3 (10-299)||(44776808-44777097)
chr3 (169-299)||(16742993-16743123)
chr3 (169-305)||(13975329-13975465)
chr3 (169-287)||(6153141-6153259)
chr3 (169-299)||(15576470-15576600)
chr3 (7-63)||(320781-320836)
chr3 (185-287)||(21686681-21686783)
chr3 (10-71)||(12854365-12854426)
chr3 (247-299)||(17192892-17192944)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (10-298)||(24675052-24675340)
chr2 (10-299)||(22757054-22757343)
chr2 (10-299)||(21325857-21326146)
chr2 (10-299)||(23188571-23188860)
chr2 (10-299)||(24708073-24708362)
chr2 (10-299)||(23138600-23138889)
chr2 (10-299)||(23550390-23550679)
chr2 (10-260)||(27377101-27377351)
chr2 (22-299)||(16924835-16925112)
chr2 (22-299)||(16998575-16998852)
chr2 (34-299)||(23063664-23063929)
chr2 (10-299)||(44386160-44386449)
chr2 (22-299)||(16981727-16982004)
chr2 (22-299)||(17063292-17063569)
chr2 (16-299)||(21145621-21145904)
chr2 (22-299)||(9609711-9609988)
chr2 (10-299)||(22325447-22325736)
chr2 (10-299)||(24709596-24709885)
chr2 (22-299)||(27217591-27217868)
chr2 (10-299)||(24261933-24262222)
chr2 (10-299)||(24878586-24878875)
chr2 (10-299)||(27370832-27371121)
chr2 (22-299)||(10868425-10868702)
chr2 (22-299)||(17066953-17067227)
chr2 (10-298)||(23087013-23087301)
chr2 (25-299)||(30211508-30211782)
chr2 (112-299)||(24825873-24826060)
chr2 (37-299)||(27365670-27365932)
chr2 (11-299)||(31830222-31830510)
chr2 (30-306)||(45529100-45529370)
chr2 (25-299)||(11358465-11358739)
chr2 (10-187)||(41609047-41609224)
chr2 (11-298)||(20832549-20832836)
chr2 (28-299)||(23293539-23293810)
chr2 (11-299)||(1063315-1063603)
chr2 (10-299)||(23276339-23276628)
chr2 (46-302)||(27787340-27787596)
chr2 (48-287)||(24653946-24654185)
chr2 (25-103)||(24833360-24833438)
chr2 (46-211)||(24944966-24945131)
chr2 (46-302)||(12573952-12574208)
chr2 (10-54)||(45676685-45676729)
chr2 (169-299)||(22276001-22276131)
chr2 (10-53)||(23599834-23599877)
chr2 (187-306)||(25128387-25128506)
chr2 (169-299)||(12640510-12640640)
chr2 (169-299)||(24831778-24831908)
chr2 (270-299)||(27368423-27368452)
chr2 (31-71)||(17967577-17967617)
chr2 (185-233)||(23817750-23817798)
chr2 (185-233)||(28144701-28144749)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (10-299)||(23516405-23516694)
chr5 (10-299)||(23573606-23573895)
chr5 (10-299)||(23440089-23440378)
chr5 (10-298)||(18775641-18775929)
chr5 (10-299)||(21984538-21984827)
chr5 (10-299)||(25423053-25423342)
chr5 (10-299)||(22333120-22333409)
chr5 (45-296)||(20798659-20798910)
chr5 (24-299)||(26738938-26739213)
chr5 (10-299)||(14999972-15000261)
chr5 (10-299)||(19769824-19770113)
chr5 (10-299)||(23471093-23471382)
chr5 (10-299)||(27610218-27610507)
chr5 (22-299)||(40708656-40708933)
chr5 (10-302)||(41770706-41770998)
chr5 (10-299)||(27668723-27669012)
chr5 (10-299)||(27685633-27685922)
chr5 (22-299)||(34566370-34566647)
chr5 (22-299)||(16356378-16356655)
chr5 (10-299)||(22134532-22134821)
chr5 (10-299)||(27518271-27518560)
chr5 (10-302)||(29476303-29476595)
chr5 (10-299)||(37291729-37292018)
chr5 (10-287)||(20468341-20468618)
chr5 (22-224)||(21343666-21343868)
chr5 (35-299)||(22348314-22348576)
chr5 (10-251)||(20573385-20573626)
chr5 (89-299)||(21498269-21498479)
chr5 (47-296)||(21564202-21564451)
chr5 (37-299)||(23442526-23442788)
chr5 (11-299)||(25847922-25848210)
chr5 (28-299)||(21890992-21891263)
chr5 (10-299)||(28924001-28924290)
chr5 (11-299)||(14887224-14887512)
chr5 (28-299)||(22461816-22462087)
chr5 (28-299)||(24735844-24736115)
chr5 (28-299)||(24737018-24737289)
chr5 (28-299)||(24749787-24750058)
chr5 (10-299)||(28895175-28895464)
chr5 (11-299)||(37545729-37546018)
chr5 (10-272)||(21662300-21662561)
chr5 (25-299)||(24798630-24798904)
chr5 (11-299)||(20342129-20342417)
chr5 (7-299)||(22236153-22236445)
chr5 (25-299)||(22381060-22381334)
chr5 (25-298)||(22502540-22502813)
chr5 (10-299)||(20773606-20773895)
chr5 (25-233)||(21404715-21404923)
chr5 (46-272)||(21665761-21665986)
chr5 (25-299)||(23080322-23080596)
chr5 (28-299)||(20821317-20821588)
chr5 (46-299)||(17269566-17269819)
chr5 (222-299)||(21339519-21339596)
chr5 (169-306)||(11210920-11211057)
chr5 (169-299)||(27011089-27011219)
chr5 (10-98)||(21625382-21625470)
chr5 (169-299)||(21937421-21937551)
chr5 (185-299)||(23503464-23503578)
chr5 (169-299)||(24581216-24581346)
chr5 (265-302)||(21404939-21404976)
chr5 (189-286)||(25244598-25244695)
chr5 (189-286)||(25308750-25308847)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (10-299)||(21167031-21167320)
chr8 (10-299)||(30313638-30313927)
chr8 (10-299)||(19977965-19978254)
chr8 (10-299)||(15533378-15533667)
chr8 (10-299)||(16408539-16408828)
chr8 (10-299)||(21250940-21251229)
chr8 (10-299)||(22164685-22164974)
chr8 (10-299)||(22133535-22133824)
chr8 (10-299)||(32600142-32600431)
chr8 (10-299)||(21394359-21394648)
chr8 (10-299)||(21788852-21789141)
chr8 (10-299)||(21922229-21922518)
chr8 (10-306)||(23650039-23650335)
chr8 (10-296)||(22046372-22046657)
chr8 (10-299)||(22032030-22032319)
chr8 (10-299)||(17674517-17674806)
chr8 (22-299)||(19112700-19112977)
chr8 (10-299)||(20018244-20018533)
chr8 (10-299)||(19485364-19485653)
chr8 (10-251)||(15441179-15441420)
chr8 (10-299)||(22987199-22987488)
chr8 (10-299)||(22120668-22120957)
chr8 (10-285)||(23948887-23949162)
chr8 (25-299)||(20396619-20396893)
chr8 (46-298)||(20388133-20388385)
chr8 (157-299)||(22377947-22378089)
chr8 (157-299)||(22384122-22384264)
chr8 (10-298)||(21681965-21682253)
chr8 (28-299)||(20010394-20010665)
chr8 (11-299)||(6679110-6679398)
chr8 (28-299)||(1266255-1266526)
chr8 (11-299)||(804167-804455)
chr8 (28-299)||(19851427-19851698)
chr8 (28-299)||(19857463-19857734)
chr8 (10-299)||(22061927-22062216)
chr8 (10-299)||(23654925-23655214)
chr8 (28-299)||(21324903-21325175)
chr8 (11-299)||(14565141-14565429)
chr8 (28-296)||(20007866-20008134)
chr8 (10-299)||(21840415-21840704)
chr8 (11-299)||(6603657-6603945)
chr8 (28-299)||(31416968-31417239)
chr8 (10-284)||(16265127-16265401)
chr8 (25-299)||(29303920-29304194)
chr8 (46-302)||(31571333-31571589)
chr8 (11-287)||(28982356-28982632)
chr8 (11-287)||(28987576-28987852)
chr8 (11-222)||(27347225-27347436)
chr8 (25-299)||(12304771-12305045)
chr8 (169-299)||(20652827-20652957)
chr8 (169-306)||(22982593-22982730)
chr8 (167-299)||(22051018-22051150)
chr8 (250-299)||(23949158-23949207)
chr8 (169-285)||(21197010-21197126)
chr8 (169-299)||(16877589-16877719)
chr8 (169-299)||(21850831-21850961)
chr8 (10-42)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (12-299)||(278884-279171)
scaffold0005 (10-299)||(164763-165052)
scaffold0005 (10-299)||(308622-308911)
scaffold0005 (10-299)||(260271-260560)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (10-299)||(65369-65657)
scaffold0042 (10-218)||(39924-40132)
scaffold0042 (266-298)||(39874-39906)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (10-299)||(19864483-19864772)
chr6 (12-299)||(12497824-12498111)
chr6 (12-299)||(12510790-12511077)
chr6 (10-298)||(21833178-21833466)
chr6 (10-298)||(25765487-25765774)
chr6 (12-299)||(12505153-12505440)
chr6 (10-299)||(16963563-16963852)
chr6 (10-299)||(16927836-16928125)
chr6 (10-302)||(25610054-25610346)
chr6 (10-299)||(27331629-27331918)
chr6 (10-299)||(27392369-27392658)
chr6 (10-298)||(22078885-22079173)
chr6 (10-298)||(18408140-18408428)
chr6 (10-299)||(5839415-5839704)
chr6 (10-306)||(23078265-23078561)
chr6 (10-299)||(16626913-16627202)
chr6 (10-299)||(28263393-28263682)
chr6 (10-299)||(28342142-28342431)
chr6 (16-299)||(1543280-1543563)
chr6 (10-299)||(24313364-24313653)
chr6 (10-299)||(25112348-25112637)
chr6 (22-299)||(29592116-29592393)
chr6 (10-299)||(2874999-2875288)
chr6 (10-299)||(27187232-27187521)
chr6 (10-299)||(27261719-27262008)
chr6 (10-298)||(22762652-22762940)
chr6 (10-299)||(28292568-28292857)
chr6 (10-234)||(17032358-17032582)
chr6 (10-299)||(25750605-25750894)
chr6 (25-299)||(21471412-21471686)
chr6 (36-299)||(18197743-18198006)
chr6 (10-145)||(22433793-22433928)
chr6 (46-299)||(25768023-25768276)
chr6 (37-299)||(14131375-14131637)
chr6 (28-299)||(15459150-15459421)
chr6 (25-299)||(10469045-10469319)
chr6 (10-296)||(22796831-22797117)
chr6 (28-299)||(19879112-19879383)
chr6 (64-299)||(34645782-34646017)
chr6 (25-299)||(24364223-24364497)
chr6 (37-298)||(21564329-21564590)
chr6 (28-299)||(18794504-18794775)
chr6 (28-298)||(8766345-8766615)
chr6 (220-299)||(11291818-11291897)
chr6 (39-299)||(11287794-11288054)
chr6 (168-292)||(25750900-25751024)
chr6 (157-302)||(1640715-1640860)
chr6 (93-298)||(17415365-17415570)
chr6 (46-299)||(27560813-27561066)
chr6 (39-299)||(11280701-11280961)
chr6 (28-103)||(1640613-1640688)
chr6 (28-94)||(18787702-18787768)
chr6 (169-299)||(25743283-25743413)
chr6 (169-298)||(16098005-16098134)
chr6 (139-299)||(18800867-18801027)
chr6 (46-302)||(28283006-28283262)
chr6 (121-299)||(14381663-14381841)
chr6 (169-299)||(16382569-16382699)
chr6 (185-299)||(18571622-18571736)
chr6 (185-299)||(1648980-1649094)
chr6 (169-287)||(18838116-18838234)
chr6 (169-299)||(23996203-23996333)
chr6 (172-292)||(16233167-16233287)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (10-299)||(16252236-16252525)
chr4 (10-299)||(16355236-16355525)
chr4 (10-299)||(12523608-12523897)
chr4 (10-298)||(7090365-7090652)
chr4 (43-299)||(15149797-15150053)
chr4 (10-299)||(14680499-14680788)
chr4 (10-299)||(18227237-18227526)
chr4 (10-299)||(14652240-14652529)
chr4 (10-299)||(14159424-14159713)
chr4 (22-299)||(18297149-18297426)
chr4 (10-299)||(19778584-19778873)
chr4 (22-299)||(23955691-23955968)
chr4 (22-299)||(8386356-8386633)
chr4 (22-299)||(12476544-12476821)
chr4 (10-299)||(14303769-14304057)
chr4 (10-299)||(14851157-14851446)
chr4 (10-299)||(27711268-27711557)
chr4 (10-299)||(14266690-14266979)
chr4 (22-299)||(29039195-29039472)
chr4 (10-298)||(40472972-40473260)
chr4 (10-299)||(8053414-8053703)
chr4 (22-275)||(15364330-15364583)
chr4 (10-198)||(14927151-14927339)
chr4 (28-299)||(15003415-15003686)
chr4 (11-299)||(3264845-3265133)
chr4 (11-299)||(11207282-11207570)
chr4 (28-299)||(16145862-16146133)
chr4 (11-299)||(29453588-29453876)
chr4 (25-299)||(15070360-15070634)
chr4 (25-299)||(33222865-33223139)
chr4 (10-299)||(15245856-15246145)
chr4 (28-299)||(1649328-1649599)
chr4 (25-299)||(20890930-20891203)
chr4 (25-299)||(44661917-44662191)
chr4 (178-299)||(15415077-15415198)
chr4 (10-97)||(18607823-18607910)
chr4 (46-302)||(51606229-51606485)
chr4 (215-299)||(16676494-16676578)
chr4 (46-211)||(42702871-42703036)
chr4 (139-299)||(15359141-15359301)
chr4 (65-207)||(18164332-18164474)
chr4 (169-299)||(13247736-13247866)
chr4 (222-299)||(1640216-1640293)
chr4 (150-299)||(16752665-16752814)
chr4 (171-299)||(55375409-55375537)
chr4 (28-103)||(15415226-15415301)
chr4 (185-287)||(12132472-12132574)
chr4 (169-299)||(14997407-14997537)
chr4 (147-212)||(9849616-9849681)
chr4 (151-299)||(27900459-27900607)
chr4 (169-299)||(16445263-16445393)
chr4 (10-42)||(15351934-15351966)
chr4 (169-299)||(9290926-9291056)
chr4 (169-299)||(15293208-15293338)
chr4 (28-81)||(15359326-15359379)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (10-299)||(64085-64374)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (10-299)||(639-928)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (10-299)||(5977-6266)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (10-299)||(33627-33916)
scaffold0109 (10-299)||(8559-8848)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (10-299)||(14323-14612)
scaffold0044 (10-299)||(583-872)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (10-302)||(15154709-15155001)
chr7 (10-299)||(17376-17665)
chr7 (10-299)||(11553162-11553451)
chr7 (10-299)||(12687422-12687711)
chr7 (10-299)||(11237273-11237562)
chr7 (10-299)||(14954541-14954830)
chr7 (10-302)||(14037728-14038020)
chr7 (10-302)||(14347758-14348050)
chr7 (22-299)||(8198561-8198838)
chr7 (10-299)||(8707526-8707815)
chr7 (10-299)||(10870916-10871205)
chr7 (10-299)||(14332318-14332607)
chr7 (10-299)||(15161117-15161406)
chr7 (10-305)||(23516823-23517118)
chr7 (10-299)||(15203800-15204089)
chr7 (10-299)||(18177663-18177952)
chr7 (10-299)||(18551818-18552107)
chr7 (10-306)||(13685984-13686281)
chr7 (22-299)||(44791411-44791688)
chr7 (76-299)||(15624539-15624762)
chr7 (28-299)||(12206838-12207109)
chr7 (10-299)||(15102639-15102928)
chr7 (28-299)||(19147151-19147422)
chr7 (28-299)||(20746550-20746821)
chr7 (28-299)||(8212166-8212437)
chr7 (10-299)||(14264282-14264571)
chr7 (11-299)||(11306301-11306589)
chr7 (11-299)||(49152224-49152512)
chr7 (28-299)||(16072332-16072603)
chr7 (28-299)||(11388466-11388736)
chr7 (25-302)||(21661900-21662174)
chr7 (28-299)||(13665493-13665759)
chr7 (46-299)||(16950509-16950762)
chr7 (193-299)||(35964910-35965016)
chr7 (46-298)||(14286415-14286667)
chr7 (46-302)||(18053988-18054244)
chr7 (46-302)||(23199778-23200034)
chr7 (46-302)||(23505905-23506161)
chr7 (7-306)||(6413430-6413729)
chr7 (25-299)||(13021294-13021568)
chr7 (25-299)||(12455640-12455913)
chr7 (10-71)||(12254326-12254387)
chr7 (10-299)||(14129795-14130084)
chr7 (10-299)||(14433613-14433902)
chr7 (46-211)||(26288162-26288327)
chr7 (46-302)||(1442-1698)
chr7 (242-298)||(11772302-11772358)
chr7 (46-161)||(15340454-15340569)
chr7 (132-299)||(26118643-26118810)
chr7 (185-299)||(14936443-14936557)
chr7 (169-299)||(7823980-7824110)
chr7 (169-299)||(12368636-12368766)
chr7 (185-299)||(15364036-15364150)
chr7 (25-103)||(26118818-26118896)
chr7 (169-299)||(27107834-27107964)
chr7 (178-306)||(41199-41327)
chr7 (169-299)||(4440008-4440138)
chr7 (28-137)||(15479338-15479447)
chr7 (268-299)||(9596236-9596267)
chr7 (169-292)||(21674600-21674723)
chr7 (185-287)||(45146652-45146753)
chr7 (185-213)||(13353247-13353275)
chr7 (10-42)||(13634038-13634070)
chr7 (184-284)||(20466877-20466977)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-299)||(127253-127542)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (10-299)||(17045138-17045427)
chr1 (10-299)||(20249797-20250086)
chr1 (10-299)||(50620367-50620656)
chr1 (10-299)||(19106314-19106603)
chr1 (10-299)||(20136725-20137014)
chr1 (10-299)||(16350722-16351011)
chr1 (10-299)||(21747482-21747770)
chr1 (10-299)||(19760989-19761278)
chr1 (10-299)||(33391152-33391441)
chr1 (10-245)||(16078810-16079045)
chr1 (10-299)||(21830250-21830539)
chr1 (10-299)||(51333616-51333905)
chr1 (10-296)||(21836897-21837183)
chr1 (33-298)||(16369267-16369532)
chr1 (10-299)||(41354592-41354881)
chr1 (10-236)||(50612602-50612828)
chr1 (10-164)||(21163227-21163381)
chr1 (28-299)||(19664999-19665270)
chr1 (46-306)||(20940179-20940439)
chr1 (11-299)||(37677027-37677316)
chr1 (25-296)||(31550307-31550578)
chr1 (28-299)||(20856884-20857155)
chr1 (28-296)||(19854279-19854547)
chr1 (25-299)||(20294374-20294648)
chr1 (10-299)||(22433239-22433528)
chr1 (25-296)||(20075185-20075456)
chr1 (147-299)||(11382678-11382830)
chr1 (46-299)||(20244183-20244436)
chr1 (142-299)||(41307904-41308061)
chr1 (11-221)||(20395194-20395404)
chr1 (10-103)||(24476927-24477020)
chr1 (76-299)||(20836011-20836237)
chr1 (169-299)||(20831515-20831645)
chr1 (169-299)||(46518827-46518957)
chr1 (169-231)||(22142232-22142294)
chr1 (268-299)||(16078775-16078806)
chr1 (169-287)||(20914316-20914434)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (10-299)||(4459-4748)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (10-299)||(27930-28219)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (10-295)||(32810-33095)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (10-299)||(180180-180469)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (10-299)||(219471-219760)
scaffold0012 (10-299)||(229006-229295)
scaffold0012 (169-299)||(33049-33179)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (10-302)||(874-1165)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (10-306)||(5986-6282)
scaffold0120 (46-299)||(1578-1831)
scaffold0120 (169-299)||(22816-22946)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (10-299)||(36-325)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (10-299)||(6335-6624)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (10-299)||(16950-17239)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (10-299)||(162076-162365)
scaffold0001 (10-299)||(448022-448311)
scaffold0001 (46-299)||(90986-91239)
scaffold0001 (169-305)||(78677-78813)
scaffold0001 (136-211)||(175352-175427)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (10-298)||(749-1036)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (10-298)||(9306-9594)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (10-306)||(111984-112280)
scaffold0004 (10-299)||(203522-203811)
scaffold0004 (11-302)||(117532-117823)
scaffold0004 (46-299)||(322703-322956)
scaffold0004 (25-299)||(385797-386071)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (10-299)||(1102-1391)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (10-299)||(5184-5473)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (10-299)||(14840-15129)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-306)||(15126-15422)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (16-299)||(109865-110148)
scaffold0029 (28-299)||(112540-112811)
scaffold0029 (10-299)||(96056-96345)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (10-299)||(377-666)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (10-299)||(7340-7629)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-299)||(968-1257)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (10-299)||(3995-4284)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (10-299)||(15456-15744)
scaffold0333 (224-299)||(15832-15907)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (10-299)||(14002-14291)
scaffold0106 (10-299)||(31373-31662)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (16-296)||(43123-43403)
scaffold0028 (10-299)||(8448-8737)
scaffold0028 (215-299)||(13834-13918)
scaffold0028 (37-299)||(50568-50830)
scaffold0028 (169-306)||(106620-106757)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (22-299)||(3115-3392)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (10-232)||(16920-17142)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (10-299)||(16519-16808)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (22-299)||(26587-26864)
scaffold0011 (10-298)||(195758-196045)
scaffold0011 (28-299)||(148551-148822)
scaffold0011 (10-211)||(68582-68783)
scaffold0011 (169-299)||(122004-122134)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-299)||(6900-7191)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (23-299)||(314-590)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (25-299)||(116959-117233)
scaffold0037 (169-299)||(98137-98267)
scaffold0037 (169-233)||(23586-23650)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (46-299)||(1-254)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (10-299)||(13031-13320)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (25-292)||(886-1153)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (60-299)||(49506-49745)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (112-298)||(21932-22118)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (10-299)||(16470-16759)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (112-299)||(7855-8042)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (25-299)||(25773-26047)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (25-299)||(5645-5918)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (25-299)||(25125-25399)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (124-299)||(9047-9222)
scaffold0507 (10-103)||(6940-7033)
scaffold0507 (169-306)||(380-517)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (28-299)||(10793-11064)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (25-302)||(86555-86832)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (37-299)||(26132-26394)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (46-306)||(28816-29076)
scaffold0064 (46-306)||(40807-41067)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (10-299)||(13955-14244)
scaffold0034 (82-299)||(5007-5224)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (46-294)||(3874-4122)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (10-306)||(18584-18880)
scaffold0326 (10-71)||(3637-3698)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (28-298)||(79-349)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (37-299)||(7090-7352)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (37-299)||(19973-20235)
scaffold0298 (10-299)||(13415-13704)
scaffold0298 (10-299)||(17185-17474)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (46-299)||(47123-47376)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (91-292)||(58467-58668)
scaffold0058 (47-306)||(19120-19379)
scaffold0058 (25-83)||(59042-59100)
scaffold0058 (185-307)||(74038-74160)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (172-296)||(7522-7646)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (46-298)||(51918-52170)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (28-306)||(10130-10408)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (148-298)||(835-985)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (61-211)||(4567-4717)
scaffold0023 (10-125)||(36974-37089)
scaffold0023 (247-299)||(4508-4560)
scaffold0023 (46-98)||(18993-19045)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (46-299)||(2750-3003)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (28-299)||(27500-27771)
scaffold0139 (10-299)||(1203-1491)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (37-299)||(1223-1485)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (46-299)||(5968-6220)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (10-299)||(9761-10045)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (10-299)||(14049-14337)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (28-298)||(3872-4142)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (37-255)||(1167-1385)
scaffold0165 (10-71)||(26203-26264)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (28-299)||(172-443)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (28-299)||(25919-26190)
scaffold0113 (25-299)||(16654-16928)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (37-299)||(21725-21987)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (28-298)||(27207-27476)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (46-299)||(5056-5309)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (10-299)||(39702-39991)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (10-299)||(42387-42676)
scaffold0010 (10-299)||(47453-47742)
scaffold0010 (149-227)||(2252-2330)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (10-306)||(49080-49376)
scaffold0053 (10-299)||(57871-58159)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (28-299)||(14305-14576)
scaffold0203 (28-191)||(9039-9202)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (28-299)||(509-780)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (28-299)||(18830-19101)
scaffold0090 (132-299)||(23096-23263)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (28-299)||(49261-49532)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (11-298)||(38942-39229)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (46-299)||(37201-37454)
scaffold0026 (142-299)||(27391-27548)
scaffold0026 (142-299)||(38228-38385)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (57-299)||(4760-5002)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (25-299)||(16767-17041)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (10-299)||(10851-11140)
scaffold0124 (37-299)||(453-715)
scaffold0124 (169-299)||(7864-7994)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (28-299)||(6164-6436)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (10-306)||(61260-61556)
scaffold0067 (10-306)||(52226-52522)
scaffold0067 (46-306)||(67648-67908)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (10-257)||(4235-4482)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (28-299)||(20103-20374)
scaffold0114 (13-298)||(43471-43756)
scaffold0114 (13-298)||(44483-44768)
scaffold0114 (28-211)||(36036-36219)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (25-299)||(26239-26513)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (37-299)||(33731-33993)
scaffold0076 (169-299)||(40380-40510)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (46-298)||(12836-13088)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (10-206)||(136082-136278)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (46-196)||(2023-2173)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (12-103)||(6238-6329)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (46-299)||(248612-248865)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (46-226)||(13380-13560)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (169-299)||(1916-2046)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (46-306)||(7285-7543)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (10-71)||(7498-7559)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (48-221)||(42784-42957)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (152-305)||(28314-28467)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (169-299)||(964-1094)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (185-299)||(14661-14775)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (169-299)||(46276-46406)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (147-299)||(5313-5465)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (178-298)||(1-121)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (171-299)||(23518-23646)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (37-145)||(45835-45943)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (169-299)||(3929-4059)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (169-299)||(14779-14909)
scaffold0132 (246-299)||(43737-43790)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (169-306)||(24002-24139)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (185-299)||(1108-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (169-299)||(440-570)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (169-299)||(8217-8347)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (185-299)||(10493-10607)
scaffold0447 (185-299)||(5879-5993)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (169-299)||(14791-14921)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (169-299)||(13030-13160)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (262-299)||(3773-3810)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (10-103)||(3518-3611)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (28-103)||(887-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (10-97)||(9182-9269)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (169-299)||(3281-3411)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (185-299)||(8488-8602)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (242-299)||(1288-1345)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (185-292)||(4005-4112)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (245-299)||(26211-26265)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498088
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12498088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876789
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14876789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489690
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17489690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522562
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtga 9522562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371253
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492471
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16492471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807219
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || | |||  |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgact 16807219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906050
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10906050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692000
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || || |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 16692000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348535
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15348535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005440
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10005440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725223
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 15725223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425287
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 48425287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252530
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 13252530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589682
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15589682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635613
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16635613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162937
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 43162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339109
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| || ||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 15339109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402800
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 15402800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062344
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 20062344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208730
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 15208730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425220
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 5425220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385308
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 53385308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792689
Alignment:
Q  17 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | |||  | |||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  117 gtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 216  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  217 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 26792689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600587
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||| ||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 6600587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412572
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| | ||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctg 16412572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756875
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | |  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 16756875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 302
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15247990
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| || ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
     ||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtga 15247990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227499
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 15227499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972399
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 13972399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123794
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 47123794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383819
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322931
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||  || ||  ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 13322931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571698
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctg 14571698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953247
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| | ||||| ||| || || ||| | ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15953247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134625
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| ||  | ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 18134625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329935
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtga 16329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850558
Alignment:
Q  76 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  176 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 275  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  276 atgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctg 12850558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15016034
Alignment:
Q  149 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttg 248  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  249 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctg 15016034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420324
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||| ||  |||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 10420324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086523
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 14086523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759358
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 8759358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941877
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 13941877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177375
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 41177375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304055
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||||  ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    || | |    ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgact 11304055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360824
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| |  ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 12360824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961313
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||  ||||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| | ||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11961313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgata 152  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacg 154  Q
    |||||   || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16836941 - 16836786
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  16836941 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 16836842  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16836841 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtga 16836786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381294
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 16381294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274689
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 8274689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777097
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||||||||  |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   |||||||||| | ||| || || ||  | ||||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 44777097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742993
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16742993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975329
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgc 305  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgc 13975329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153141
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||  |  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  269 gcttatcatgataactctt 287  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt 6153141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576600
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 15576600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  7 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 63  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686783
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| || || ||  |  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  285 ctt 287  Q
    |||    
T  21686781 ctt 21686783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192944
Alignment:
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 17192944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675340
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 24675340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22757054
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22757054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325857
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21325857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188860
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23188860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708073
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctg 24708073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138889
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23138889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550679
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377101
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatc 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925112
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16925112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998852
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16998852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 299
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063929
Alignment:
Q  34 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaa 133  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  134 ctctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  234 gtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctg 23063929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386160
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 44386160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982004
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16982004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063569
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17063569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145621
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
    | || |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21145621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9609988
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 9609988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325447
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22325447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709885
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| | ||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24709885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217868
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27217868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262222
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24262222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878586
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24878586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371121
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | |||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctg 27371121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868702
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctg 10868702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067227
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17067227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087301
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactct 23087301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211508
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    ||   | |||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctg 30211508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825873
Alignment:
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||||||| ||||| || |  ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctg 24825873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365670
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 27365670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830510
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 31830510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 306
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529370
Alignment:
Q  30 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgtt 129  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||| || ||||  ||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  130 cgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 229  Q
    | ||||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  230 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||| ||||||||      |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45529300 acacatggtcttc------aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgct 45529370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358465
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||| | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11358465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 187  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832836
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 20832836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293810
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctg 23293810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063603
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1063603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276628
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| | ||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctg 23276628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787596
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 27787596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 287
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  48 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  |  |||| | |    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  148 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 247  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  248 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833360
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 24833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945131
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 24945131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574208
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| | ||  || ||||| |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   | || || || | ||| || || ||  | ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 12574208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276131
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 22276131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 53  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128506
Alignment:
Q  187 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 286  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  287 tttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    | |||| |||||| ||||||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgct 25128506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640510
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 12640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831778
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 24831778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368423
Alignment:
Q  270 cttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctg 27368423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  31 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817750
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacac 23817750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144749
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacac 28144749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516694
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23516694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573895
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23573895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440378
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23440378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775929
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 18775929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984538
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctg 21984538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423342
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 25423342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333120
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22333120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 45 - 296
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798910
Alignment:
Q  45 aacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgat 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  145 aactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttctt 244  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgact 20798910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738938
Alignment:
Q  24 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  124 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 223  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  224 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||| |  || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 26738938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999972
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 14999972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770113
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19770113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471382
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctg 23471382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610507
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27610507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708933
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 40708933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41770998
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 41770998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668723
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27668723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685633
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27685633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566647
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 34566647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356655
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16356655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134821
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 22134821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518560
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27518560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476303
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtga 29476303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291729
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctg 37291729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468341
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  |||||||| |||   | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactctt 20468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  222 tct 224  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 299
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348576
Alignment:
Q  35 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaac 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  135 tctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacg 234  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  235 tggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctg 22348576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 251  Q
    ||   |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498269
Alignment:
Q  89 tcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 188  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 288  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||| | ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  289 tgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctg 21498269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564202
Alignment:
Q  47 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| || | |||||| || ||||     
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgact 21564202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442526
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | |||  ||| ||||| |||| ||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23442526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848210
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | |||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25848210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890992
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 21890992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28924001
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 28924001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887224
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14887224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462087
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 22462087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735844
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24735844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737018
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24737018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749787
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24749787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895175
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  |||||||  |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 28895175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545729
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| || || | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  211 acatgagtgactctca-aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| |||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctg 37545729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  |||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 272  Q
    || | |||||||||| | |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798630
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24798630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342417
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | | |||||||||| ||| || || ||    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20342417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236153
Alignment:
Q  7 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 106  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  107 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 206  Q
    | |||||||  || | ||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  207 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 22236153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381334
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22381334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502813
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 22502813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773895
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || |||| ||| || ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 20773895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 233
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21404923
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | ||||||||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  225 caaaaacac 233  Q
     ||||||||    
T  21404915 aaaaaacac 21404923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  |||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 272  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080322
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctg 23080322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821588
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 20821588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269566
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 17269566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339519
Alignment:
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21339519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210920
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgct 11210920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011219
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 27011219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 98  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937421
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 21937421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503578
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  23503564 cttctgtctactctg 23503578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581346
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || | ||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 24581346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 302
Target Start/End: Original strand, 21404939 - 21404976
Alignment:
Q  265 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21404939 ctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtga 21404976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244598
Alignment:
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 286  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25244598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308750
Alignment:
Q  189 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 286  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25308750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21167031
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21167031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313638
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 30313638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978254
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19978254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533667
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 15533667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408539
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16408539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251229
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 21251229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164685
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22164685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133535
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 22133535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600431
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 32600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394359
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21394359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788852
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21788852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922229
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctg 21922229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650335
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgct 23650335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046657
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgact 22046657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032319
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctg 22032319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674517
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17674517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19112977
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19112977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018244
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20018244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485364
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 251  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987488
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||  |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22987488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120668
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||| ||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22120668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396619
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |  ||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctg 20396619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388385
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||  || | ||| || | |||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     || ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactct 20388385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377947
Alignment:
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22377947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384122
Alignment:
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22384122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681965
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 21681965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010394
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20010394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679398
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6679398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266526
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||   |||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctg 1266526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804167
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 804167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851698
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctg 19851698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857734
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctg 19857734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061927
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||  |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22061927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655214
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | | |   ||  |||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||||| |||||  || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 23655214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324903
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtgataatccaactcggtacgccacc 126  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  127 gttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 226  Q
    |||| ||| || | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  227 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 21324903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565429
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 14565429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008134
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    |||||| || ||| | ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgact 20008134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840704
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     | | |||| ||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 21840704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603945
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6603945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416968
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctg 31416968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    || | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303920
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| || ||| ||||| | |||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 29303920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571333
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 31571333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 287  Q
    |   ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    ||||   || ||||| || | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  211 acatgagtgact 222  Q
    | | ||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305045
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||  ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12305045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652827
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctg 20652827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982730
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||| | || ||  |  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgct 22982730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 299
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051150
Alignment:
Q  167 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttct 266  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  267 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 22051150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 299
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949207
Alignment:
Q  250 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23949207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21197010
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| || | |||||||||||||| || ||  || | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  269 gcttatcatgataactc 285  Q
     ||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactc 21197010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877589
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850831
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 21850831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 42  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278884
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 278884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164763
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 164763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308911
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 308911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260560
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||  || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
     |||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 260560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65657
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 65657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  210 cacatgagt 218  Q
    |||| ||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39874
Alignment:
Q  266 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 39874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864772
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctg 19864772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498111
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12498111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510790
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12510790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833178
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765487
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 25765487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505440
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||     
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12505440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963563
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16963563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927836
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctg 16927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25610054
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtga 25610054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331629
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 27331629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392369
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 27392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078885
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactct 22078885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408140
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactct 18408140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839415
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 5839415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078561
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgct 23078561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626913
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16626913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263393
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28263393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342142
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28342142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543280
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 1543280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313364
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24313364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112637
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctg 25112637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592116
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 29592116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874999
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 2874999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187521
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27187521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261719
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27261719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762652
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactct 22762652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292568
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 28292568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacg 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750894
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471686
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 21471686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197743
Alignment:
Q  36 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaact 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  136 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgt 235  Q
    ||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  236 ggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | | | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18197743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433928
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22433928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768276
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131375
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  || || ||||  || ||||| |||| |||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| |||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 14131375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459421
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 15459421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469045
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10469045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796831
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || ||||  |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagact 22796831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879383
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || | |||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 19879383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645782
Alignment:
Q  64 gacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataa 163  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||| || |||| |||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  164 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttt 263  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  264 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 34645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364497
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564329
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || |  || || ||||  |||||||| |||| ||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactct 21564329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794775
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || |  |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctg 18794775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766345
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| |  ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 8766345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 299
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291897
Alignment:
Q  220 actctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 11291897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287794
Alignment:
Q  39 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 138  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11287794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 292
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  168 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttcta 267  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 302
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640860
Alignment:
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |||||| || ||| |||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtga 1640860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 298
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415570
Alignment:
Q  93 aagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 192  Q
    |||||||||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  193 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  293 gactct 298  Q
    ||||||    
T  17415565 gactct 17415570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560813
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 27560813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280701
Alignment:
Q  39 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctt 138  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||| ||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| | | |||| |||||| ||||| || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11280701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640688
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 1640688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787768
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa 94  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaa 18787768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743283
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 25743283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098134
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactct 16098134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 299
Target Start/End: Original strand, 18800867 - 18801027
Alignment:
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |    
T  18800867 tctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgat 18800966  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |  | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800967 ccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 18801027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28283006
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| |  |  || ||||| |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 28283006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381663
Alignment:
Q  121 gccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtga 220  Q
    ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  221 ctctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctg 14381663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382569
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16382569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571736
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  18571722 cttctgtctactctg 18571736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648980
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  1648994 cttctgtctactctg 1648980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838116
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| |||||| || | || | ||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  269 gcttatcatgataactctt 287  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactctt 18838116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996333
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 23996333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 292
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233287
Alignment:
Q  172 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 271  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  272 tatcatgataactcttttgtc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtc 16233287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252236
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16252236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355236
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctg 16355236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523897
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctg 12523897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090652
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactct 7090652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149797
Alignment:
Q  43 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  143 ataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttc 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  243 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15149797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680788
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14680788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227237
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18227237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652529
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14652529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159713
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   |||| |||||||  ||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctg 14159713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297426
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18297426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778584
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19778584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23955968
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23955968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386633
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8386633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476821
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12476821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303769
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 14303769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851157
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14851157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711557
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266690
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14266690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039195
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 29039195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473260
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactct 40473260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053414
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || ||||| |||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 8053414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927151
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 198  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003415
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15003415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264845
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 3264845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207282
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11207282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146133
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 16146133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453588
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 29453588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070634
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || || | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||  ||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| | ||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 15070634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223139
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 33223139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246145
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      |||| ||| ||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | | || ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15246145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649328
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctg 1649328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891203
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgcca 20891028  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20891203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661917
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | |||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctg 44661917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415077
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  278 gataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctg 15415077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 97  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606229
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 51606229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16676578 - 16676494
Alignment:
Q  215 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676578 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16676494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703036
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 42703036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15359301 - 15359141
Alignment:
Q  139 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 238  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |    
T  15359301 tctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgat 15359202  T
Q  239 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  15359201 ctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctg 15359141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  65 acacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 164  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  165 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 207  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247866
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 13247866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640216
Alignment:
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 1640216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 299
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752814
Alignment:
Q  150 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttga 249  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  250 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 16752814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375409
Alignment:
Q  171 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 270  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  271 ttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctg 55375409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415226
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtg 15415226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132472
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  285 ctt 287  Q
    |||    
T  12132474 ctt 12132472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997537
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctg 14997537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9849681 - 9849616
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 212  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9849681 ctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 9849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900607
Alignment:
Q  151 tacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaa 250  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  251 actcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctg 27900607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445263
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291056
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | |||||| || | || |||||||| || || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 9291056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293208
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
      ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctg 15293208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatca 81  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64085
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 64085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 639 - 928
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || ||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctg 928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6266
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctg 6266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33627
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 33627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8848
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14612
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 583 - 872
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctg 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154709
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtga 15154709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17376
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctg 17376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553162
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 11553162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687711
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12687711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237273
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 11237273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954830
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14954830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038020
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 14038020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348050
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 14348050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198838
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8198838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707815
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8707815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871205
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10871205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332607
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 14332607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161117
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15161117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516823
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgc 305  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgc 23516823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204089
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||| | ||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15204089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18177952
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18177952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551818
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686281
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaga-catcatgcaaattcgaaagatgcggtgataat 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||  | |||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  109 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 208  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  209 tcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgct 13686281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791411
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 44791411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 299
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624762
Alignment:
Q  76 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  176 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 275  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  276 atgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctg 15624762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206838
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||  |||||| || |||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctg 12206838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102639
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15102639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147422
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 19147422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746821
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20746821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212166
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    | | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 8212166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264282
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14264282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306301
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11306301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152512
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 49152512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072332
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 16072332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388466
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11388536 gaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11388466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662174
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||  | ||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | | | ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtga 21662174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665759
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctg 13665759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950509
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 16950509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964910
Alignment:
Q  193 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  293 gactctg 299  Q
     ||||||    
T  35964916 tactctg 35964910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286415
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 14286415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053988
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||  | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 18053988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199778
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 23199778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505905
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||  |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtga 23505905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413729
Alignment:
Q  7 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgata 106  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  107 atccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 206  Q
    | |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| | ||||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  207 agtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||| | |||| || |||| |||||| || ||  | || ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 6413729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021568
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||   || || |||| | ||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 13021568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455913
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12455913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130084
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   |||| ||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 14130084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433902
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||| ||||| ||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   |||| ||||| ||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 14433902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288162
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
     |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtca 26288162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1442
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| |||||| | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||| ||| ||| ||| || || ||  | ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtga 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11772358 - 11772302
Alignment:
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11772358 cttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 11772302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||||| ||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  146 actgatacggaccaat 161  Q
     |||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26118810 - 26118643
Alignment:
Q  132 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 231  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| |||| |||     
T  26118810 aactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaa 26118711  T
Q  232 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26118710 acatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 26118643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936557
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  14936543 cttctgtctactctg 14936557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824110
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 7824110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368636
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 12368636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364150
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  15364136 cttctgtctactctg 15364150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118818
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtg 26118818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107834
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 27107834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41199
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  278 gataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||| ||||| |||| | | |||||||||    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgct 41199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440138
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |  | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 4440138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479338
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  128 ttcgaactct 137  Q
    ||| ||||||    
T  15479347 ttccaactct 15479338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 299
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596267
Alignment:
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 9596267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674600
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtc 21674600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 287
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146753
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||  |  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  285 ctt 287  Q
    |||    
T  45146751 ctt 45146753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 213
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353275
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcaca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcaca 13353275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 42  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20466977
Alignment:
Q  184 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |  | ||||| |||||||| |  |||||  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  284 t 284  Q
    |    
T  20466977 t 20466977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127253
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 127253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045138
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250086
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 20250086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620367
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 50620367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106603
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19106603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137014
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    |||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 20137014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350722
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16350722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747770
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctg 21747770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760989
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19760989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391152
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 33391152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078810
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 16078810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830539
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 21830539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333616
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 51333616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837183
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgact 21837183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 298
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369532
Alignment:
Q  33 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  133 actctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 232  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  233 cgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    | || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactct 16369532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354592
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||||| | |||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 41354592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaa 164  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664999
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 19664999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940179
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgct 20940179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677316
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    ||||| ||| ||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  211 acatgagtgactctcaa-aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | | ||||||| ||||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 37677316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550307
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgact 31550307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856884
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || |||||  |||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctg 20856884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854547
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 19854547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294648
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20294648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433239
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||  ||| || ||||| | |||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || ||||  ||||| || ||  | || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22433239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075185
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgact 20075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 11382678 - 11382830
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || || ||  | ||     
T  11382678 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11382777  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11382778 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11382830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244436
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 41307904 - 41308061
Alignment:
Q  142 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||||||     
T  41307904 gatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctc 41308003  T
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41308004 cctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 41308061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || |||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  211 acatgagtgac 221  Q
    | | |||||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477020
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtg 24477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20836011
Alignment:
Q  76 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  176 act---tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 272  Q
    |||   |||| ||||| || | |||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | || | ||||| |||  | || | ||||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  273 atcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctg 20836011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831515
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 20831515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518957
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 46518957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 231  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16078806 - 16078775
Alignment:
Q  268 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078806 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16078775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914434
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  269 gcttatcatgataactctt 287  Q
      |||| ||||||||||||    
T  20914416 atttataatgataactctt 20914434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4459
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28219
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32810
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 295  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 32810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180469
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 180469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219471
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 219471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229295
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     | | |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctg 229295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33049
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 874
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||| ||  ||||| ||| | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtga 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6282
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgct 6282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1578
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |||||  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctg 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22946
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 22946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 36
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 36  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6624
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||  ||||| | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctg 6624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17239
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162365
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctg 162365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448311
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctg 448311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90986
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     || ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 90986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78677
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgc 305  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgc 78677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  136 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 749
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | || || ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9594
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 9594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112280
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgct 112280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203522
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctg 203522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117823
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
    | | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtga 117823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 322703 - 322956
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||| ||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 322956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386071
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| || |||| ||| || | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  | ||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| |  || ||| | ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctg 386071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1391
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctg 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5473
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctg 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15129
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctg 15129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15126
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgct 15126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109865
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 109865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112811
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 112811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96056
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||| ||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || |||||||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 96056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 377 - 666
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7629
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 7629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 968 - 1257
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| | ||||||||||| || || || ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctg 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4284
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15744
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 15744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15907
Alignment:
Q  224 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14291
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31662
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |  ||| ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 31662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43403
Alignment:
Q  16 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  116 ggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 215  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  216 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgact 43403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8737
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Original strand, 13834 - 13918
Alignment:
Q  215 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13834 gagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 13918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50568
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| |||||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctg 50568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106620
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgct 106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3392
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||| || ||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaaca 232  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16519
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 16519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26587
Alignment:
Q  22 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  122 ccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    ||||||||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  222 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 26587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195758
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctct 195758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148822
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctg 148822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68582
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  210 ca 211  Q
    ||    
T  68583 ca 68582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 122004
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 122004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7191
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtgataat 108  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| | |||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  109 ccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 208  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  209 tcacatgagtgactctc-aaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 314
Alignment:
Q  23 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 122  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  123 caccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 222  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  223 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116959
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || || |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctg 116959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98267
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 98267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23586
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 233  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacac 23586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 1 - 254
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |   | ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctg 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 13031
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||| ||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  ||||| ||| |||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 13031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 886 - 1153
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 292  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49745
Alignment:
Q  60 ttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggacca 159  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  160 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagat 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  260 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctg 49745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 112 - 298
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22118
Alignment:
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactct 22118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16470
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||  | ||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||  ||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctg 16470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 299
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8042
Alignment:
Q  112 actcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  212 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 8042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25773
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || |||| | |||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 25773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5645
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | || | |||||||| ||| |  ||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctg 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25125
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctg 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 299
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9222
Alignment:
Q  124 accgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 223  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  224 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 9222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7033
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtg 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 380
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgct 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10793
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||| | || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctg 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86555
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |||  | ||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtga 302  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtga 86555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26394
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctg 26394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28816
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgct 28816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40807
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || | |||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgct 40807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13955
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 13955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 5007
Alignment:
Q  82 tgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  182 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 281  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  282 actcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctg 5007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4122
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||| ||| |||||| || ||| | ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcga 294  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcga 4122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18584
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 79 - 349
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7090
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20235
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| |||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13415
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||| | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17185
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || || | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 17185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47376
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | | |||| || |||| |||||| || ||| | ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctg 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58467
Alignment:
Q  91 gaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 190  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||| | || ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  191 aagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 290  Q
      ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  291 tc 292  Q
    ||    
T  58468 tc 58467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 306
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19379
Alignment:
Q  47 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataa 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||     
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 19379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatg 83  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 307
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74160
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||| |||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  285 cttttgtcgactctgtgatgctc 307  Q
    ||| || | |||||| |||||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctc 74160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 172 - 296
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7646
Alignment:
Q  172 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  272 tatcatgataactcttttgtcgact 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgact 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51918
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 51918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10130
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||||||||||||   |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgct 10130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 835
Alignment:
Q  148 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 247  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  248 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  61 tgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaa 160  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  161 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  110 caactcggtacgccac 125  Q
    ||||| | ||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4508
Alignment:
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3003
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || | | | ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctg 3003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27771
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||| | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 27771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1203
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||   || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | || ||| ||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1223
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || | |   || ||||| |||| ||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5968
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| |||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||  || | ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10045
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||||| |||||| || ||| | |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14337
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||  ||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4142
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||  |||||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || || |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactct 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | |  |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactca 255  Q
     ||| | ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 172 - 443
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| | |||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25919
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16928
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    |  ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 16928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21725
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| || |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 21725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27476
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || | |||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    ||| || || | | | |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactct 27476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5056
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||  |||| ||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| || ||| | ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 39702 - 39991
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctg 39991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42387
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctg 42387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47453
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctg 47453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  149 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49080
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||  || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | |||  ||| ||| | |||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    || | | || ||||||| |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgct 49080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57871
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || |||||||||| ||  || ||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||   |||| ||||||||||| || || ||  | |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctg 57871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14305
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||| || || ||  | || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 14305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 191  Q
    ||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 509 - 780
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctg 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19101
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    | | |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctg 19101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 299
Target Start/End: Original strand, 23096 - 23263
Alignment:
Q  132 aactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 231  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| |||    
T  23096 aactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaac 23195  T
Q  232 acgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  23196 acatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctg 23263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49261
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 49261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38942
Alignment:
Q  11 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatcc 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||  || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  111 aactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 210  Q
    |||||  || ||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  211 acatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    | | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37454
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | | |||||||| | |||||| || |||    |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 37454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27548 - 27391
Alignment:
Q  142 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  27548 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 27449  T
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  27448 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctg 27391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38385 - 38228
Alignment:
Q  142 gataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || |||     
T  38385 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 38286  T
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  38285 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctg 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 299
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5002
Alignment:
Q  57 aagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacgga 156  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || |||| || |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  157 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 256  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  257 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16767
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | |||| |||||| ||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctg 16767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11140
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || | |||| || || | ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 11140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 453
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7864
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6436
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| || ||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  228 -aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 6436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61260
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 61260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52226
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    | ||||  || ||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
    || | |||| || |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 52226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67648
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||| ||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 67648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 209  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || | ||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  210 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaag 257  Q
    || | |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20374
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 227  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  228 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43756
Alignment:
Q  13 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  113 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 212  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  213 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactct 43756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44768
Alignment:
Q  13 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 112  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  113 ctcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 212  Q
    |||  || ||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  213 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactct 44768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 127  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  128 ttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 211  Q
    ||| ||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26513
Alignment:
Q  25 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 124  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  125 ccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 224  Q
    | ||||  || || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  225 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 26513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33731
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || |  ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  137 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 236  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  237 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 33731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40510
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 40510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12836
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     || |||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 298  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactct 12836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatc 109  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  110 caactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 206  Q
    ||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 196  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6329
Alignment:
Q  12 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 299
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248865
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||  ||| |||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||| || || ||  | ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| | ||| |||| ||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 226  Q
     |||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2046
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7285
Alignment:
Q  46 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgata 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||  | |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  146 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 245  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| |  ||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgct 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Original strand, 42784 - 42957
Alignment:
Q  48 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactctttctgataac 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| |||  | ||||| | |    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  148 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 221  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgac 42957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28314
Alignment:
Q  152 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 251  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||  || |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  252 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgc 305  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgc 28314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 964
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14775
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  14761 cttctgtctactctg 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46406
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctg 46406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Original strand, 5313 - 5465
Alignment:
Q  147 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 246  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  5313 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 5412  T
Q  247 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  5413 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 298
Target Start/End: Original strand, 1 - 121
Alignment:
Q  178 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 277  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  278 gataactcttttgtcgactct 298  Q
    | |||||||| || |||||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactct 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 299
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23646
Alignment:
Q  171 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 270  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||     |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  271 ttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctg 23646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  37 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcgaactc 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  137 tttctgata 145  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3929
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 3929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14909
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctg 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43790
Alignment:
Q  246 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctg 43790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 306
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24139
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgatgct 306  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgct 24139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1108
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||| || || ||  |  |  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  1122 cttctgtctactctg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 440
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| ||  |  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8347
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctg 8347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10607
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  10593 cttctgtctactctg 10607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 5879 - 5993
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  5979 cttctgtctactctg 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14791
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 14791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13160
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 13160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3773
Alignment:
Q  262 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 3773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3518
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtg 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 887
Alignment:
Q  28 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 103  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtg 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9269
Alignment:
Q  10 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 97  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3411
Alignment:
Q  169 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 268  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  269 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 3411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8602
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  285 cttttgtcgactctg 299  Q
    ||| |||| ||||||    
T  8588 cttctgtctactctg 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1345 - 1288
Alignment:
Q  242 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1345 cttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctg 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 4005
Alignment:
Q  185 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  285 cttttgtc 292  Q
    ||| ||||    
T  4012 cttatgtc 4005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26211
Alignment:
Q  245 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University