View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF18996_low_9 (Length: 435)

Name: NF18996_low_9
Description: NF18996
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF18996_low_9
NF18996_low_9
[»] chr5 (107 HSPs)
chr5 (20-417)||(37565961-37566356)
chr5 (26-417)||(28259715-28260102)
chr5 (30-417)||(16774883-16775266)
chr5 (44-414)||(20990250-20990617)
chr5 (30-417)||(26650337-26650719)
chr5 (30-417)||(26921922-26922304)
chr5 (23-417)||(7773488-7773879)
chr5 (42-284)||(41877977-41878218)
chr5 (34-296)||(5341681-5341940)
chr5 (23-296)||(23081701-23081972)
chr5 (23-296)||(23076253-23076524)
chr5 (30-367)||(24057533-24057868)
chr5 (30-395)||(39608735-39609098)
chr5 (30-395)||(25419753-25420117)
chr5 (32-353)||(18941117-18941436)
chr5 (32-281)||(19801861-19802109)
chr5 (23-281)||(23544837-23545094)
chr5 (75-298)||(22507487-22507709)
chr5 (32-281)||(19362533-19362781)
chr5 (75-319)||(19800276-19800522)
chr5 (89-298)||(22500920-22501128)
chr5 (160-407)||(41877684-41877930)
chr5 (94-418)||(38013680-38014004)
chr5 (75-319)||(597203-597447)
chr5 (100-319)||(19508115-19508335)
chr5 (89-314)||(14614893-14615118)
chr5 (96-276)||(5454437-5454617)
chr5 (96-276)||(5582258-5582438)
chr5 (160-418)||(22379545-22379801)
chr5 (96-276)||(25852924-25853104)
chr5 (96-264)||(10686093-10686263)
chr5 (89-276)||(22248222-22248409)
chr5 (160-415)||(29746435-29746690)
chr5 (96-314)||(40010915-40011133)
chr5 (94-314)||(1111621-1111841)
chr5 (89-276)||(14888972-14889160)
chr5 (96-276)||(25846292-25846472)
chr5 (96-276)||(30781013-30781193)
chr5 (89-276)||(24794997-24795184)
chr5 (89-276)||(24800364-24800551)
chr5 (89-276)||(37539939-37540126)
chr5 (89-276)||(37547483-37547670)
chr5 (96-314)||(43028989-43029207)
chr5 (89-276)||(7507995-7508183)
chr5 (89-276)||(14882295-14882483)
chr5 (94-276)||(17938864-17939047)
chr5 (89-276)||(11995078-11995265)
chr5 (97-276)||(15461421-15461600)
chr5 (96-276)||(18894976-18895156)
chr5 (161-319)||(18566603-18566760)
chr5 (161-276)||(20347157-20347272)
chr5 (25-135)||(22379454-22379564)
chr5 (161-276)||(20340553-20340668)
chr5 (42-155)||(19235792-19235906)
chr5 (42-155)||(28371543-28371657)
chr5 (42-155)||(38145870-38145984)
chr5 (42-155)||(42960027-42960141)
chr5 (42-155)||(22336052-22336166)
chr5 (42-155)||(22460047-22460161)
chr5 (42-155)||(22466671-22466785)
chr5 (42-155)||(22749698-22749812)
chr5 (42-155)||(34828973-34829087)
chr5 (42-155)||(23112854-23112969)
chr5 (42-155)||(22339590-22339704)
chr5 (75-212)||(27635935-27636076)
chr5 (42-155)||(9775412-9775527)
chr5 (42-155)||(37805432-37805547)
chr5 (46-155)||(28890476-28890586)
chr5 (46-155)||(28897180-28897290)
chr5 (46-155)||(28910380-28910490)
chr5 (46-155)||(28925648-28925758)
chr5 (46-155)||(28932071-28932181)
chr5 (46-155)||(28933575-28933685)
chr5 (46-155)||(28946775-28946885)
chr5 (75-212)||(24751589-24751729)
chr5 (75-140)||(29746666-29746731)
chr5 (42-155)||(37599411-37599525)
chr5 (75-212)||(24669051-24669191)
chr5 (75-212)||(24738820-24738960)
chr5 (32-155)||(18409149-18409276)
chr5 (185-276)||(24008090-24008180)
chr5 (62-212)||(427182-427336)
chr5 (97-212)||(23444259-23444380)
chr5 (85-140)||(18566571-18566626)
chr5 (89-140)||(20347129-20347180)
chr5 (137-212)||(21829546-21829621)
chr5 (42-155)||(20780631-20780745)
chr5 (46-155)||(20819080-20819189)
chr5 (46-155)||(20826180-20826289)
chr5 (42-155)||(24930984-24931097)
chr5 (97-135)||(41877911-41877949)
chr5 (97-212)||(21574076-21574195)
chr5 (97-212)||(23561669-23561788)
chr5 (97-157)||(758365-758427)
chr5 (89-140)||(20340525-20340576)
chr5 (97-157)||(22312943-22313005)
chr5 (97-157)||(22509284-22509346)
chr5 (42-108)||(20771856-20771922)
chr5 (97-212)||(20843142-20843262)
chr5 (46-85)||(21494878-21494918)
chr5 (33-155)||(19510935-19511060)
chr5 (97-157)||(20937594-20937656)
chr5 (32-85)||(10035044-10035098)
chr5 (22-55)||(597136-597169)
chr5 (31-69)||(18566504-18566544)
chr5 (26-69)||(19800540-19800584)
chr5 (220-264)||(27635846-27635890)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (31-417)||(2972547-2972930)
chr4 (35-417)||(19128157-19128537)
chr4 (20-413)||(20894867-20895257)
chr4 (20-372)||(20889248-20889597)
chr4 (23-417)||(31664936-31665328)
chr4 (20-417)||(33221244-33221639)
chr4 (20-287)||(49548527-49548793)
chr4 (42-407)||(36037458-36037822)
chr4 (26-417)||(21881472-21881860)
chr4 (23-414)||(42220308-42220697)
chr4 (28-418)||(33096975-33097362)
chr4 (97-417)||(49548182-49548502)
chr4 (23-418)||(30396075-30396466)
chr4 (23-382)||(46044719-46045077)
chr4 (22-353)||(45959619-45959964)
chr4 (75-358)||(34772094-34772376)
chr4 (85-295)||(35462547-35462756)
chr4 (75-336)||(42955917-42956177)
chr4 (75-287)||(47872365-47872577)
chr4 (32-345)||(899481-899791)
chr4 (23-296)||(41404643-41404913)
chr4 (75-319)||(45142459-45142704)
chr4 (94-414)||(29455178-29455497)
chr4 (28-264)||(54844913-54845164)
chr4 (85-276)||(7359184-7359375)
chr4 (96-414)||(23435799-23436117)
chr4 (85-319)||(11202341-11202576)
chr4 (94-414)||(29448494-29448813)
chr4 (75-276)||(5938851-5939052)
chr4 (89-276)||(1583850-1584037)
chr4 (96-314)||(52500498-52500716)
chr4 (89-314)||(21396756-21396982)
chr4 (89-276)||(26395625-26395812)
chr4 (96-276)||(3259946-3260126)
chr4 (89-276)||(3266574-3266761)
chr4 (93-276)||(39266192-39266374)
chr4 (85-231)||(7356191-7356339)
chr4 (94-276)||(11937103-11937286)
chr4 (96-276)||(29382719-29382899)
chr4 (97-276)||(49240799-49240978)
chr4 (97-276)||(49749513-49749692)
chr4 (96-202)||(391073-391180)
chr4 (96-180)||(50082207-50082291)
chr4 (75-177)||(45151372-45151473)
chr4 (42-155)||(14910530-14910645)
chr4 (32-163)||(10977129-10977265)
chr4 (55-212)||(15306959-15307121)
chr4 (160-276)||(391177-391293)
chr4 (58-156)||(14821317-14821418)
chr4 (46-209)||(13886614-13886783)
chr4 (42-155)||(16147891-16148005)
chr4 (75-188)||(13452204-13452320)
chr4 (42-155)||(15533731-15533846)
chr4 (46-212)||(15244047-15244219)
chr4 (75-212)||(37881374-37881516)
chr4 (97-212)||(16484596-16484716)
chr4 (97-212)||(15360884-15361003)
chr4 (55-157)||(15406870-15406973)
chr4 (260-353)||(54826052-54826145)
chr4 (97-157)||(23121599-23121661)
chr4 (32-155)||(14485444-14485570)
chr4 (220-276)||(50082293-50082347)
chr4 (97-212)||(13899676-13899797)
chr4 (94-130)||(15470652-15470688)
chr4 (97-176)||(18271262-18271344)
chr4 (62-212)||(53905376-53905529)
chr4 (55-155)||(11847012-11847113)
chr4 (100-212)||(16229180-16229297)
chr4 (137-212)||(18166347-18166422)
chr4 (97-157)||(20940260-20940322)
chr4 (97-155)||(27905211-27905270)
chr4 (97-155)||(40908583-40908642)
chr4 (55-176)||(22725968-22726098)
chr4 (137-212)||(12931881-12931957)
chr4 (97-176)||(18261297-18261379)
chr4 (97-155)||(1651177-1651236)
chr4 (97-157)||(4831203-4831265)
chr4 (97-157)||(4834498-4834560)
chr4 (97-158)||(15005084-15005149)
chr4 (26-69)||(5938788-5938833)
chr4 (26-69)||(45142722-45142767)
chr4 (26-69)||(45151491-45151536)
chr4 (97-176)||(13444207-13444290)
chr4 (97-157)||(2585283-2585346)
chr4 (100-157)||(14484432-14484491)
chr4 (220-264)||(49051095-49051139)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (35-417)||(11392417-11392797)
chr8 (20-417)||(29328120-29328515)
chr8 (23-334)||(25701461-25701771)
chr8 (26-414)||(14416387-14416774)
chr8 (31-353)||(29298953-29299271)
chr8 (31-353)||(29305499-29305817)
chr8 (75-319)||(40144203-40144445)
chr8 (75-314)||(27345695-27345933)
chr8 (30-414)||(43687335-43687706)
chr8 (75-319)||(16266777-16267021)
chr8 (89-319)||(23117202-23117433)
chr8 (85-319)||(14746426-14746662)
chr8 (161-417)||(27948606-27948860)
chr8 (161-417)||(27889948-27890202)
chr8 (89-327)||(26485919-26486158)
chr8 (85-314)||(3697632-3697862)
chr8 (89-319)||(10956593-10956823)
chr8 (94-414)||(14765585-14765904)
chr8 (161-314)||(27873818-27873970)
chr8 (75-276)||(3224634-3224835)
chr8 (96-314)||(16887211-16887429)
chr8 (89-276)||(27909535-27909722)
chr8 (89-276)||(27955954-27956141)
chr8 (89-276)||(36800393-36800580)
chr8 (94-276)||(14563539-14563721)
chr8 (89-276)||(9205301-9205488)
chr8 (89-276)||(28980717-28980904)
chr8 (89-276)||(28985937-28986124)
chr8 (94-276)||(4520684-4520867)
chr8 (96-276)||(14736772-14736952)
chr8 (96-276)||(35541048-35541228)
chr8 (96-314)||(23224660-23224877)
chr8 (160-298)||(6588134-6588271)
chr8 (26-133)||(27873728-27873834)
chr8 (26-133)||(27889858-27889964)
chr8 (26-133)||(27948516-27948622)
chr8 (31-188)||(23653070-23653231)
chr8 (23-212)||(23653764-23653957)
chr8 (249-417)||(27902275-27902441)
chr8 (42-155)||(24321720-24321834)
chr8 (42-155)||(8729130-8729244)
chr8 (46-212)||(39363422-39363599)
chr8 (42-155)||(27942291-27942405)
chr8 (160-276)||(214006-214123)
chr8 (160-276)||(238131-238248)
chr8 (160-276)||(727629-727746)
chr8 (160-276)||(800130-800247)
chr8 (160-276)||(851523-851640)
chr8 (42-155)||(8596208-8596322)
chr8 (75-140)||(6588093-6588158)
chr8 (35-155)||(18609730-18609853)
chr8 (62-212)||(19859473-19859626)
chr8 (75-163)||(31412618-31412710)
chr8 (75-163)||(31418800-31418892)
chr8 (220-319)||(10948511-10948608)
chr8 (55-155)||(14057724-14057825)
chr8 (23-156)||(21930539-21930682)
chr8 (260-353)||(19296683-19296776)
chr8 (94-140)||(213984-214030)
chr8 (94-140)||(238224-238270)
chr8 (94-140)||(727607-727653)
chr8 (94-140)||(800108-800154)
chr8 (94-140)||(851501-851547)
chr8 (97-212)||(14594813-14594933)
chr8 (97-212)||(21690492-21690611)
chr8 (23-156)||(21839404-21839537)
chr8 (137-212)||(20783932-20784006)
chr8 (97-157)||(22025700-22025762)
chr8 (97-157)||(22050201-22050263)
chr8 (97-157)||(22055719-22055781)
chr8 (97-157)||(22177586-22177648)
chr8 (77-155)||(21282038-21282119)
chr8 (136-208)||(38186023-38186096)
chr8 (97-212)||(21686167-21686287)
chr8 (55-135)||(25110828-25110910)
chr8 (33-155)||(44476172-44476297)
chr8 (33-155)||(44479434-44479559)
chr8 (75-179)||(23825102-23825210)
chr8 (26-69)||(27345632-27345677)
chr8 (32-80)||(20012406-20012455)
chr8 (120-157)||(22063703-22063740)
chr8 (97-157)||(21300291-21300354)
chr8 (97-212)||(36445811-36445932)
chr8 (97-157)||(41009574-41009637)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (20-415)||(65145-65539)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (23-417)||(10470567-10470958)
chr6 (35-417)||(27767297-27767677)
chr6 (23-372)||(10464090-10464436)
chr6 (20-319)||(94422-94735)
chr6 (30-417)||(29925630-29926013)
chr6 (30-382)||(12447066-12447417)
chr6 (23-353)||(17207636-17207965)
chr6 (75-314)||(14582783-14583021)
chr6 (32-281)||(23021320-23021568)
chr6 (75-395)||(8069546-8069865)
chr6 (23-382)||(13940359-13940717)
chr6 (20-158)||(17894614-17894752)
chr6 (127-353)||(13128164-13128390)
chr6 (75-319)||(4106674-4106915)
chr6 (89-276)||(1070609-1070796)
chr6 (89-276)||(15332093-15332280)
chr6 (89-276)||(17309665-17309852)
chr6 (89-276)||(25463832-25464019)
chr6 (89-314)||(29159059-29159285)
chr6 (89-276)||(34133941-34134128)
chr6 (89-276)||(16223629-16223816)
chr6 (96-276)||(24369186-24369365)
chr6 (96-276)||(25315616-25315796)
chr6 (96-276)||(26203110-26203290)
chr6 (96-276)||(30799408-30799587)
chr6 (89-319)||(22406613-22406844)
chr6 (42-212)||(25347027-25347201)
chr6 (26-131)||(13135929-13136033)
chr6 (44-155)||(15457412-15457524)
chr6 (44-155)||(15464007-15464119)
chr6 (41-155)||(31250236-31250351)
chr6 (42-155)||(20008998-20009112)
chr6 (160-276)||(24362630-24362746)
chr6 (42-155)||(4476310-4476424)
chr6 (46-212)||(25395948-25396120)
chr6 (42-130)||(20011082-20011171)
chr6 (41-155)||(28290324-28290440)
chr6 (42-155)||(12941745-12941860)
chr6 (23-212)||(18785987-18786182)
chr6 (46-212)||(19472384-19472556)
chr6 (42-155)||(21365585-21365699)
chr6 (42-155)||(23969567-23969681)
chr6 (220-314)||(19096720-19096812)
chr6 (75-212)||(26418724-26418866)
chr6 (42-155)||(9100127-9100240)
chr6 (75-212)||(23234987-23235128)
chr6 (42-155)||(29096751-29096864)
chr6 (42-155)||(25634093-25634207)
chr6 (75-212)||(5290201-5290341)
chr6 (96-157)||(1592758-1592821)
chr6 (137-212)||(23233468-23233544)
chr6 (137-212)||(17414038-17414113)
chr6 (97-155)||(19300787-19300846)
chr6 (23-85)||(25749632-25749695)
chr6 (89-135)||(19096815-19096861)
chr6 (30-155)||(24513944-24514072)
chr6 (97-212)||(10582900-10583019)
chr6 (137-212)||(19451326-19451402)
chr6 (100-157)||(21724875-21724934)
chr6 (72-155)||(31251344-31251428)
chr6 (97-155)||(14581975-14582034)
chr6 (97-157)||(19726606-19726668)
chr6 (96-140)||(24362611-24362654)
chr6 (97-212)||(24720594-24720715)
chr6 (114-157)||(22906984-22907027)
chr6 (97-155)||(8760544-8760605)
chr6 (26-69)||(14582720-14582765)
chr6 (23-78)||(24562194-24562251)
chr6 (75-179)||(24562260-24562368)
chr6 (97-157)||(14375426-14375489)
chr6 (47-111)||(18799336-18799399)
chr6 (137-177)||(19449332-19449372)
chr6 (137-212)||(19467858-19467934)
chr6 (97-176)||(22798616-22798698)
chr6 (97-155)||(24412404-24412466)
[»] chr3 (117 HSPs)
chr3 (42-410)||(29545017-29545384)
chr3 (20-287)||(54519965-54520231)
chr3 (30-417)||(16833151-16833535)
chr3 (26-417)||(16331442-16331829)
chr3 (26-352)||(9691319-9691644)
chr3 (26-417)||(29550849-29551238)
chr3 (26-414)||(20377091-20377477)
chr3 (46-418)||(30596706-30597076)
chr3 (23-418)||(11956443-11956835)
chr3 (97-417)||(54520256-54520576)
chr3 (23-296)||(8373895-8374165)
chr3 (34-296)||(32387987-32388246)
chr3 (26-414)||(46070961-46071347)
chr3 (23-314)||(19344104-19344391)
chr3 (26-415)||(48774467-48774869)
chr3 (32-347)||(49163087-49163399)
chr3 (30-297)||(12725092-12725354)
chr3 (160-413)||(3802718-3802970)
chr3 (94-418)||(50655834-50656158)
chr3 (160-417)||(54091585-54091840)
chr3 (75-314)||(38742895-38743134)
chr3 (114-296)||(20187754-20187934)
chr3 (22-314)||(9771865-9772170)
chr3 (85-314)||(12271344-12271574)
chr3 (94-414)||(53571085-53571404)
chr3 (160-371)||(15374699-15374907)
chr3 (89-276)||(29493527-29493715)
chr3 (96-276)||(2499032-2499212)
chr3 (96-276)||(45611647-45611827)
chr3 (89-276)||(43724052-43724239)
chr3 (160-287)||(3802556-3802682)
chr3 (96-276)||(10767737-10767917)
chr3 (96-314)||(21151407-21151625)
chr3 (89-276)||(28758873-28759060)
chr3 (89-276)||(50142757-50142944)
chr3 (89-276)||(3782739-3782927)
chr3 (94-276)||(10381918-10382101)
chr3 (94-276)||(10410571-10410754)
chr3 (89-276)||(47121121-47121308)
chr3 (89-276)||(47128489-47128676)
chr3 (89-276)||(14845155-14845343)
chr3 (96-276)||(54833175-54833355)
chr3 (23-141)||(27029558-27029675)
chr3 (23-141)||(27031726-27031843)
chr3 (32-148)||(18957698-18957814)
chr3 (144-281)||(18961002-18961137)
chr3 (26-135)||(54091821-54091929)
chr3 (75-179)||(20187671-20187775)
chr3 (42-135)||(3802482-3802575)
chr3 (26-135)||(15374609-15374718)
chr3 (42-155)||(17130642-17130756)
chr3 (42-155)||(14764248-14764362)
chr3 (32-157)||(18913940-18914069)
chr3 (42-155)||(23371994-23372108)
chr3 (42-155)||(38312268-38312382)
chr3 (42-155)||(51300047-51300161)
chr3 (42-155)||(12034465-12034579)
chr3 (77-212)||(11850722-11850860)
chr3 (75-212)||(10597792-10597933)
chr3 (42-155)||(14864733-14864847)
chr3 (46-155)||(10553822-10553932)
chr3 (42-155)||(19236124-19236237)
chr3 (42-155)||(20249254-20249368)
chr3 (42-155)||(12304694-12304809)
chr3 (32-155)||(17243796-17243923)
chr3 (33-155)||(18888901-18889027)
chr3 (89-212)||(18757021-18757149)
chr3 (55-154)||(23174117-23174218)
chr3 (220-276)||(6927529-6927583)
chr3 (23-179)||(24123294-24123454)
chr3 (114-212)||(17512558-17512658)
chr3 (137-212)||(11644878-11644953)
chr3 (97-157)||(16382994-16383056)
chr3 (97-135)||(3802699-3802737)
chr3 (46-155)||(10390515-10390625)
chr3 (46-155)||(10415624-10415734)
chr3 (46-155)||(10422294-10422404)
chr3 (89-179)||(12419383-12419476)
chr3 (32-85)||(42109048-42109102)
chr3 (69-212)||(2270320-2270464)
chr3 (137-212)||(11305830-11305905)
chr3 (75-155)||(31690713-31690796)
chr3 (97-157)||(13203653-13203715)
chr3 (46-156)||(14289086-14289206)
chr3 (97-157)||(14652830-14652892)
chr3 (55-154)||(18899963-18900065)
chr3 (97-155)||(19443469-19443528)
chr3 (69-158)||(17496094-17496183)
chr3 (97-176)||(12274221-12274304)
chr3 (100-157)||(14292706-14292765)
chr3 (97-176)||(15955111-15955193)
chr3 (137-212)||(12152895-12152970)
chr3 (55-155)||(17190795-17190896)
chr3 (75-179)||(8583385-8583493)
chr3 (23-78)||(8583502-8583559)
chr3 (42-155)||(9532794-9532910)
chr3 (195-264)||(12274364-12274434)
chr3 (55-85)||(13342669-13342699)
chr3 (23-78)||(13969069-13969126)
chr3 (23-78)||(13974544-13974601)
chr3 (23-78)||(14084443-14084500)
chr3 (75-179)||(14084509-14084617)
chr3 (23-78)||(14089844-14089901)
chr3 (75-179)||(14089910-14090018)
chr3 (97-155)||(18719251-18719312)
chr3 (23-78)||(49399385-49399442)
chr3 (126-198)||(12356031-12356104)
chr3 (126-198)||(12362580-12362653)
chr3 (97-155)||(14544308-14544368)
chr3 (97-157)||(12363445-12363508)
chr3 (220-264)||(12419556-12419600)
chr3 (97-157)||(12961517-12961580)
chr3 (22-85)||(13037181-13037245)
chr3 (121-176)||(16823843-16823899)
chr3 (55-83)||(17512488-17512516)
chr3 (220-264)||(18756932-18756976)
chr3 (55-83)||(46723611-46723639)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (35-417)||(17592352-17592733)
chr2 (96-417)||(14563832-14564147)
chr2 (23-298)||(27272179-27272453)
chr2 (31-418)||(15643107-15643492)
chr2 (26-317)||(13101091-13101382)
chr2 (23-296)||(32911423-32911694)
chr2 (23-296)||(36800485-36800754)
chr2 (75-319)||(35243943-35244188)
chr2 (75-390)||(11466051-11466364)
chr2 (23-296)||(45028435-45028706)
chr2 (22-413)||(28292631-28293037)
chr2 (32-414)||(25590024-25590402)
chr2 (94-418)||(24481410-24481734)
chr2 (89-327)||(27037237-27037476)
chr2 (89-319)||(34043-34274)
chr2 (94-414)||(1067094-1067413)
chr2 (94-414)||(30196330-30196649)
chr2 (75-276)||(22013065-22013266)
chr2 (94-414)||(11360059-11360374)
chr2 (94-414)||(1061711-1062030)
chr2 (96-314)||(24426755-24426974)
chr2 (89-314)||(2385836-2386062)
chr2 (89-276)||(21604757-21604944)
chr2 (94-276)||(4071496-4071679)
chr2 (96-276)||(4077420-4077600)
chr2 (94-276)||(20850187-20850370)
chr2 (96-314)||(44091003-44091221)
chr2 (89-276)||(31828605-31828793)
chr2 (89-276)||(31833957-31834145)
chr2 (89-276)||(36984517-36984705)
chr2 (96-314)||(27729508-27729726)
chr2 (89-180)||(71522-71613)
chr2 (94-177)||(35585355-35585438)
chr2 (42-155)||(9467-9581)
chr2 (41-155)||(26884097-26884212)
chr2 (42-155)||(19662942-19663056)
chr2 (42-155)||(27211097-27211211)
chr2 (75-212)||(28971337-28971478)
chr2 (42-155)||(10685741-10685856)
chr2 (42-155)||(29280886-29281000)
chr2 (75-212)||(21133311-21133453)
chr2 (42-155)||(6261664-6261778)
chr2 (46-212)||(24660405-24660576)
chr2 (42-111)||(9241278-9241347)
chr2 (42-155)||(20260769-20260884)
chr2 (58-157)||(23062462-23062564)
chr2 (32-155)||(23269133-23269259)
chr2 (32-155)||(23276002-23276128)
chr2 (220-314)||(71428-71520)
chr2 (46-156)||(21123991-21124105)
chr2 (32-155)||(21907182-21907309)
chr2 (32-155)||(23263917-23264043)
chr2 (46-155)||(21074096-21074209)
chr2 (126-218)||(22796682-22796776)
chr2 (30-179)||(38931652-38931805)
chr2 (75-155)||(19649660-19649743)
chr2 (32-111)||(23877772-23877852)
chr2 (97-212)||(25267199-25267320)
chr2 (33-155)||(6482257-6482382)
chr2 (121-212)||(8890027-8890121)
chr2 (97-212)||(19035478-19035598)
chr2 (97-157)||(2105577-2105640)
chr2 (97-212)||(22860301-22860420)
chr2 (97-157)||(20724032-20724095)
chr2 (33-155)||(6485724-6485849)
chr2 (46-156)||(17633770-17633890)
chr2 (97-211)||(20648069-20648189)
chr2 (97-157)||(22809882-22809944)
chr2 (75-179)||(200619-200727)
chr2 (23-78)||(6744532-6744589)
chr2 (26-69)||(22013284-22013329)
chr2 (137-212)||(23062590-23062667)
chr2 (97-212)||(25107529-25107648)
chr2 (97-176)||(20914430-20914513)
chr2 (97-151)||(22703489-22703545)
chr2 (220-264)||(21133222-21133266)
chr2 (73-179)||(23169389-23169499)
chr2 (73-179)||(23580646-23580756)
chr2 (97-157)||(24658773-24658836)
chr2 (220-264)||(28971248-28971292)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (20-284)||(547-810)
[»] chr7 (132 HSPs)
chr7 (23-417)||(12461445-12461836)
chr7 (28-418)||(16843723-16844110)
chr7 (30-417)||(23520937-23521320)
chr7 (34-296)||(19439249-19439508)
chr7 (34-395)||(13019645-13020004)
chr7 (75-319)||(46174303-46174547)
chr7 (89-296)||(46649762-46649967)
chr7 (85-296)||(17468226-17468436)
chr7 (85-296)||(17584778-17584988)
chr7 (75-280)||(2388547-2388750)
chr7 (89-327)||(13963943-13964182)
chr7 (94-418)||(40922773-40923097)
chr7 (85-298)||(20019641-20019855)
chr7 (75-319)||(49158722-49158966)
chr7 (89-276)||(37285201-37285388)
chr7 (94-414)||(2026079-2026399)
chr7 (160-414)||(30271639-30271890)
chr7 (96-298)||(11899280-11899482)
chr7 (96-276)||(11339770-11339950)
chr7 (96-276)||(26113748-26113928)
chr7 (89-276)||(2438876-2439063)
chr7 (96-298)||(18437137-18437339)
chr7 (94-276)||(11299646-11299828)
chr7 (94-276)||(11308010-11308192)
chr7 (160-319)||(21757356-21757514)
chr7 (94-314)||(8197154-8197374)
chr7 (89-314)||(5187197-5187423)
chr7 (96-276)||(11879066-11879246)
chr7 (96-276)||(17726325-17726505)
chr7 (89-276)||(1317758-1317945)
chr7 (89-276)||(26089943-26090130)
chr7 (89-276)||(40684755-40684942)
chr7 (96-263)||(642549-642718)
chr7 (89-276)||(49150577-49150765)
chr7 (89-276)||(49157267-49157455)
chr7 (96-276)||(26120361-26120541)
chr7 (96-276)||(32627396-32627576)
chr7 (94-276)||(42058546-42058729)
chr7 (89-276)||(749835-750022)
chr7 (89-276)||(48987913-48988100)
chr7 (160-319)||(13453751-13453909)
chr7 (89-276)||(2281078-2281266)
chr7 (96-298)||(33404652-33404854)
chr7 (160-296)||(37379954-37380089)
chr7 (94-238)||(8213299-8213445)
chr7 (30-135)||(30271871-30271974)
chr7 (41-155)||(14320683-14320798)
chr7 (32-157)||(19145500-19145629)
chr7 (32-157)||(20744899-20745028)
chr7 (42-155)||(147012-147126)
chr7 (42-155)||(2965876-2965990)
chr7 (75-212)||(32771473-32771614)
chr7 (42-155)||(14565653-14565767)
chr7 (42-155)||(15166719-15166833)
chr7 (42-155)||(18871811-18871925)
chr7 (46-212)||(46624790-46624962)
chr7 (216-296)||(15838732-15838810)
chr7 (160-276)||(30602854-30602970)
chr7 (75-212)||(3327778-3327919)
chr7 (42-155)||(29182169-29182283)
chr7 (312-417)||(12454276-12454380)
chr7 (43-155)||(20907478-20907591)
chr7 (42-155)||(23665944-23666059)
chr7 (44-155)||(31154314-31154426)
chr7 (75-212)||(37244364-37244506)
chr7 (42-113)||(29795675-29795746)
chr7 (42-113)||(29799494-29799565)
chr7 (42-155)||(10897301-10897415)
chr7 (42-155)||(16008029-16008143)
chr7 (42-155)||(16089966-16090080)
chr7 (33-155)||(18606801-18606926)
chr7 (43-155)||(3858473-3858586)
chr7 (33-157)||(13678217-13678345)
chr7 (46-156)||(14266118-14266232)
chr7 (75-212)||(18958485-18958627)
chr7 (42-113)||(11302797-11302868)
chr7 (34-157)||(21232149-21232274)
chr7 (42-155)||(2464258-2464372)
chr7 (75-212)||(15085979-15086120)
chr7 (32-156)||(19151802-19151930)
chr7 (32-156)||(20751201-20751329)
chr7 (97-212)||(14179066-14179185)
chr7 (75-140)||(37379914-37379978)
chr7 (55-155)||(20328365-20328467)
chr7 (46-157)||(14255841-14255956)
chr7 (97-212)||(46682249-46682370)
chr7 (22-141)||(13453884-13454008)
chr7 (97-157)||(14431989-14432051)
chr7 (97-211)||(15098023-15098143)
chr7 (97-157)||(15338826-15338888)
chr7 (34-85)||(15455328-15455379)
chr7 (89-140)||(15622161-15622212)
chr7 (97-157)||(15723330-15723392)
chr7 (22-141)||(21757257-21757381)
chr7 (97-157)||(35962852-35962914)
chr7 (89-212)||(26289824-26289952)
chr7 (62-212)||(10519804-10519955)
chr7 (368-417)||(23518012-23518061)
chr7 (97-212)||(82133-82254)
chr7 (97-157)||(11220227-11220290)
chr7 (97-212)||(15104399-15104520)
chr7 (96-140)||(30602946-30602990)
chr7 (55-155)||(11383955-11384056)
chr7 (55-155)||(11390443-11390544)
chr7 (97-157)||(15711106-15711168)
chr7 (97-157)||(16109181-16109243)
chr7 (46-156)||(16575546-16575666)
chr7 (46-156)||(16589996-16590116)
chr7 (42-155)||(14421299-14421415)
chr7 (97-212)||(15437663-15437783)
chr7 (91-212)||(16952293-16952418)
chr7 (46-176)||(11308933-11309073)
chr7 (46-176)||(11312241-11312381)
chr7 (97-157)||(1612623-1612685)
chr7 (97-157)||(6411821-6411883)
chr7 (97-209)||(12547171-12547288)
chr7 (97-157)||(14281760-14281822)
chr7 (46-156)||(23442201-23442321)
chr7 (23-78)||(4279875-4279932)
chr7 (75-179)||(4279941-4280049)
chr7 (99-154)||(19599844-19599901)
chr7 (23-78)||(19616207-19616264)
chr7 (75-179)||(19616273-19616381)
chr7 (77-155)||(36306152-36306233)
chr7 (31-69)||(20019882-20019922)
chr7 (32-80)||(41783304-41783353)
chr7 (220-264)||(16952204-16952248)
chr7 (220-264)||(18958396-18958440)
chr7 (220-264)||(26289735-26289779)
chr7 (220-264)||(37244275-37244319)
chr7 (20-69)||(46174234-46174285)
chr7 (22-54)||(49149811-49149843)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (26-415)||(29596655-29597042)
chr1 (34-296)||(49327970-49328229)
chr1 (22-413)||(4231098-4231504)
chr1 (26-417)||(21920726-21921115)
chr1 (75-360)||(21962982-21963267)
chr1 (32-353)||(47484043-47484362)
chr1 (110-417)||(29602088-29602394)
chr1 (75-298)||(42626177-42626399)
chr1 (32-281)||(36614870-36615118)
chr1 (32-281)||(43088326-43088574)
chr1 (96-319)||(20570739-20570963)
chr1 (94-414)||(39094317-39094636)
chr1 (131-415)||(20076747-20077033)
chr1 (75-276)||(20292657-20292858)
chr1 (96-298)||(18026667-18026869)
chr1 (96-276)||(6740516-6740696)
chr1 (96-276)||(28556439-28556619)
chr1 (94-276)||(38907991-38908173)
chr1 (96-276)||(20277189-20277369)
chr1 (94-276)||(37682082-37682265)
chr1 (89-276)||(31535237-31535424)
chr1 (89-276)||(31563954-31564141)
chr1 (89-276)||(39189618-39189805)
chr1 (89-276)||(48427844-48428031)
chr1 (94-276)||(22185541-22185723)
chr1 (96-276)||(18418122-18418302)
chr1 (94-276)||(37675389-37675572)
chr1 (89-232)||(17146249-17146393)
chr1 (75-179)||(52990692-52990796)
chr1 (96-202)||(3652709-3652816)
chr1 (26-173)||(24850015-24850175)
chr1 (75-180)||(9269910-9270015)
chr1 (96-180)||(36212044-36212128)
chr1 (96-314)||(20396772-20396994)
chr1 (160-276)||(20299376-20299492)
chr1 (42-155)||(20852183-20852297)
chr1 (42-155)||(20858809-20858923)
chr1 (42-155)||(21705167-21705281)
chr1 (42-155)||(16371482-16371596)
chr1 (36-156)||(21987081-21987205)
chr1 (75-188)||(23195559-23195675)
chr1 (75-212)||(24109083-24109225)
chr1 (46-155)||(16669390-16669500)
chr1 (75-140)||(20299335-20299400)
chr1 (75-209)||(24079529-24079668)
chr1 (55-155)||(19664246-19664348)
chr1 (220-314)||(36211950-36212042)
chr1 (62-212)||(15316566-15316718)
chr1 (97-157)||(3706877-3706939)
chr1 (121-264)||(22030705-22030849)
chr1 (96-176)||(10813614-10813696)
chr1 (30-212)||(20848956-20849144)
chr1 (63-211)||(21664128-21664278)
chr1 (97-157)||(955157-955219)
chr1 (23-155)||(20108649-20108790)
chr1 (97-157)||(22448378-22448440)
chr1 (46-155)||(7792921-7793040)
chr1 (126-212)||(11157038-11157126)
chr1 (97-157)||(20824467-20824530)
chr1 (97-157)||(20941971-20942034)
chr1 (97-179)||(21410771-21410857)
chr1 (234-276)||(17149456-17149496)
chr1 (97-212)||(19666792-19666913)
chr1 (97-157)||(23066816-23066878)
chr1 (55-85)||(5380652-5380682)
chr1 (46-155)||(11156909-11157022)
chr1 (97-212)||(19853030-19853150)
chr1 (97-212)||(19859165-19859285)
chr1 (23-78)||(21541968-21542025)
chr1 (75-179)||(21542034-21542142)
chr1 (23-78)||(42096111-42096168)
chr1 (97-157)||(20838286-20838349)
chr1 (220-264)||(24108994-24109038)
chr1 (97-157)||(29554560-29554623)
chr1 (97-176)||(30491535-30491617)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (26-352)||(1945-2269)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (26-417)||(101505-101892)
scaffold0037 (46-148)||(97464-97570)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (20-417)||(860-1269)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (20-297)||(24571-24846)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (34-281)||(74107-74352)
scaffold0031 (97-176)||(120787-120870)
scaffold0031 (97-176)||(131664-131747)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (23-245)||(7640-7861)
scaffold0310 (160-314)||(12923-13076)
scaffold0310 (23-135)||(12831-12942)
[»] scaffold0076 (5 HSPs)
scaffold0076 (37-296)||(1-258)
scaffold0076 (75-179)||(30236-30344)
scaffold0076 (23-78)||(30353-30410)
scaffold0076 (75-179)||(35637-35745)
scaffold0076 (23-78)||(35754-35811)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (75-353)||(19586-19862)
scaffold0103 (75-353)||(23722-23999)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (75-336)||(15120-15380)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (32-281)||(178938-179186)
scaffold0001 (85-319)||(512473-512706)
scaffold0001 (42-155)||(494075-494189)
scaffold0001 (23-156)||(524568-524711)
scaffold0001 (31-69)||(512733-512773)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (32-353)||(246955-247275)
scaffold0009 (32-353)||(253469-253789)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (20-360)||(801-1155)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (75-319)||(4577-4819)
scaffold0188 (75-212)||(31632-31774)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (109-417)||(30845-31143)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (75-284)||(15080-15289)
scaffold0266 (26-69)||(15018-15062)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (32-281)||(41168-41413)
[»] scaffold0113 (5 HSPs)
scaffold0113 (114-353)||(19231-19469)
scaffold0113 (20-179)||(19093-19252)
scaffold0113 (160-314)||(15179-15332)
scaffold0113 (20-135)||(15083-15198)
scaffold0113 (97-179)||(26870-26956)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (75-336)||(31618-31879)
scaffold0088 (20-69)||(31549-31600)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (85-319)||(5659-5894)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (94-418)||(49998-50322)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (85-313)||(25029-25255)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (182-409)||(9839-10064)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (96-314)||(18362-18580)
scaffold0154 (55-155)||(29707-29808)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (94-276)||(104284-104466)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (23-163)||(143888-144028)
scaffold0019 (182-294)||(137162-137271)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (96-276)||(12208-12388)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (96-264)||(18514-18684)
scaffold0089 (33-157)||(1830-1958)
scaffold0089 (137-212)||(1984-2061)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (94-276)||(13403-13586)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (217-418)||(19960-20160)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (96-180)||(16101-16185)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (32-212)||(4183-4368)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (23-212)||(5-199)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (32-212)||(1220-1405)
[»] scaffold0249 (3 HSPs)
scaffold0249 (44-155)||(14915-15027)
scaffold0249 (46-157)||(7923-8038)
scaffold0249 (32-85)||(6983-7037)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (42-155)||(2967-3081)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (75-212)||(26069-26210)
scaffold0104 (75-212)||(27451-27592)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (42-155)||(110138-110252)
scaffold0026 (70-157)||(142605-142694)
scaffold0026 (97-157)||(63308-63370)
scaffold0026 (97-212)||(27978-28099)
scaffold0026 (97-212)||(38815-38936)
scaffold0026 (97-155)||(124588-124649)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (46-212)||(129752-129924)
scaffold0004 (32-155)||(115670-115796)
scaffold0004 (97-157)||(321062-321125)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (55-264)||(42905-43116)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (58-156)||(18291-18392)
scaffold0005 (97-157)||(258674-258736)
scaffold0005 (97-157)||(265100-265162)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (42-155)||(4286-4400)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (42-155)||(254-368)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (32-155)||(103045-103171)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (42-155)||(80551-80665)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (33-157)||(110-238)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (46-211)||(27942-28113)
scaffold0222 (97-157)||(5122-5184)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (33-157)||(16160-16288)
scaffold0139 (126-212)||(16058-16146)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (42-111)||(36980-37049)
scaffold0124 (137-212)||(9268-9343)
scaffold0124 (137-212)||(44938-45013)
scaffold0124 (32-155)||(44134-44261)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (55-157)||(41732-41835)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (43-155)||(92251-92364)
scaffold0029 (43-155)||(97977-98090)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (32-155)||(1972-2099)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (32-155)||(1197-1324)
scaffold0461 (32-155)||(8133-8260)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (75-211)||(202-343)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (23-78)||(1-56)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (62-212)||(6092-6245)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (34-157)||(17054-17179)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (46-157)||(19515-19631)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (46-212)||(51079-51251)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (62-212)||(8442-8593)
[»] scaffold1469 (1 HSPs)
scaffold1469 (42-155)||(238-352)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (123-212)||(3358-3448)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (97-212)||(18505-18625)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (42-111)||(12-81)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (97-212)||(5068-5187)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (97-212)||(47882-48001)
scaffold0114 (97-157)||(41931-41993)
[»] scaffold1251 (1 HSPs)
scaffold1251 (30-78)||(2255-2302)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (137-212)||(147050-147126)
scaffold0011 (121-212)||(75156-75250)
scaffold0011 (97-179)||(56861-56947)
scaffold0011 (75-179)||(174652-174760)
scaffold0011 (23-78)||(174769-174826)
scaffold0011 (97-157)||(197555-197618)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (55-155)||(284-385)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (97-157)||(3658-3720)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (46-112)||(4477-4544)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (137-212)||(8280-8355)
scaffold0298 (137-212)||(18364-18439)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (23-85)||(5850-5913)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (137-212)||(9281-9356)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (58-157)||(35839-35941)
scaffold0034 (75-155)||(10223-10306)
scaffold0034 (97-155)||(72229-72288)
scaffold0034 (23-78)||(10315-10372)
scaffold0034 (75-155)||(17519-17602)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (97-157)||(141326-141388)
scaffold0021 (97-157)||(146566-146629)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (55-156)||(9408-9519)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (75-212)||(5187-5328)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (97-212)||(2868-2988)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (97-212)||(64965-65085)
scaffold0028 (137-212)||(999-1075)
scaffold0028 (75-179)||(47070-47178)
scaffold0028 (75-179)||(52475-52583)
scaffold0028 (23-78)||(47187-47243)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (75-212)||(451-591)
scaffold0326 (121-176)||(5510-5566)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (62-212)||(17489-17640)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (31-214)||(76648-76837)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (75-155)||(298-381)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (61-157)||(532-629)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (97-157)||(6146-6208)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (97-157)||(14611-14673)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (62-212)||(366-519)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (55-179)||(2525-2652)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (97-176)||(1452-1535)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (97-155)||(51088-51148)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (46-85)||(189-229)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (97-157)||(1841-1904)
scaffold0348 (97-157)||(15579-15641)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (97-179)||(105-191)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (46-85)||(25447-25487)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (97-212)||(44580-44701)
scaffold0102 (97-264)||(38421-38593)
scaffold0102 (97-179)||(29801-29887)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (97-157)||(27861-27924)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (42-82)||(1-41)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (26-78)||(10-64)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (97-157)||(10341-10403)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (374-413)||(161338-161377)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (55-85)||(4372-4402)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (97-212)||(19794-19914)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (23-78)||(38313-38370)
scaffold0106 (75-179)||(38379-38487)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (97-212)||(56004-56124)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (97-158)||(921-987)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (97-212)||(548-667)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (100-212)||(2252-2370)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (97-176)||(10756-10839)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (97-176)||(11713-11796)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (97-155)||(47529-47589)
scaffold0067 (97-155)||(56563-56623)
scaffold0067 (97-155)||(62949-63009)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (97-176)||(207881-207964)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (97-157)||(5513-5576)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (97-155)||(9523-9585)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (97-157)||(6593-6656)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (121-176)||(45527-45583)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (75-155)||(52753-52836)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (97-157)||(44231-44294)
scaffold0010 (97-157)||(49297-49360)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (97-157)||(370396-370459)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 107)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 417
Target Start/End: Original strand, 37565961 - 37566356
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37565961 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgataacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggac 37566060  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37566061 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctccgctg 37566160  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  37566161 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccaattatacaacatgtatggttca 37566259  T
Q  320 acaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37566260 ataaataaatcatacaacacagccatcagcaaca-tcaacaaccagcaatccaacaatccggaataatgcacaatttaatataactatgctcaaaaca 37566356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28260102 - 28259715
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260102 caactacgactaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 28260004  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260003 cctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 28259904  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaat 325  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||    
T  28259903 catatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattc-ccatatgactccaattatacaacatgtatgtttcaataaat 28259806  T
Q  326 aaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28259805 aaatcatacatcacagtcatcagcaaca-tcaacaaccagcaattcaacaacccagaataatgcacaatttaatacaattatgctcaaaaca 28259715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16775266 - 16774883
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16775266 tacaaccaacatc-aagactcatccatgacatgacaacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggcaccaaacaggaccgaagccctc 16775169  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16775168 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctccgctgtttatgcata 16775069  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  || ||  | |  |     
T  16775068 tgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttaaataacatgtataattcaatgattttag 16774970  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16774969 catacattacagtcatcagcaaca-tcaacaatcagcaatccaaccatccagaataatgcacaatttaatataactatgctcaaaaca 16774883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 44 - 414
Target Start/End: Original strand, 20990250 - 20990617
Alignment:
Q  44 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20990250 aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa--tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 20990347  T
Q  144 gttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctac 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20990348 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccac 20990447  T
Q  244 ttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaac 342  Q
    | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || || |    
T  20990448 tcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacttctcagc 20990546  T
Q  343 catcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    ||||| ||||| |||| |  ||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  20990547 catcaacaaca-tcaataatcagtaatccagcaatctagaataatgcataattaaatataactatgctcaaa 20990617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 26650337 - 26650719
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26650337 tacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctc 26650434  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26650435 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc-ccgctgtttatgcata 26650533  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaa 328  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||| || || |||||||    
T  26650534 tgctatggactcactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattcaataaataaa 26650632  T
Q  329 tcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
     |||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26650633 acatacat-tcaaccatcaacaaca-tcaacaaccagcaatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 26650719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 26921922 - 26922304
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26921922 tacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctc 26922019  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26922020 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc-ccgctgtttatgcata 26922118  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaa 328  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||| || || |||||||    
T  26922119 tgctatggactcactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattcaataaataaa 26922217  T
Q  329 tcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
     |||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26922218 acatacat-tcaaccatcaacaaca-tcaacaaccagcaatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 26922304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 7773879 - 7773488
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7773879 tggcaactacatccaacaacaaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactc-tccaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa-caggaccga 7773782  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7773781 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 7773682  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt-atgcaacatgtatggttaaac 321  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||| || ||     
T  7773681 atgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaat 7773583  T
Q  322 aaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    || || | ||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  7773582 aattatagcatacattacagccatcagcaaca-acatcaaacaatgatccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatgctcaaaaca 7773488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41878218 - 41877977
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878218 ctaagactcatgcaagacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 41878119  T
Q  142 tggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacct 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41878118 tggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacct 41878019  T
Q  242 acttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatact 284  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41878018 acttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatact 41877977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5341940 - 5341681
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5341940 accaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgtaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 5341841  T
Q  134 cttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5341840 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgct 5341742  T
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5341741 atggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 5341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23081972 - 23081701
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23081972 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 23081873  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23081872 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt 23081774  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23081773 tatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 23081701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23076524 - 23076253
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076524 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 23076425  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076424 aagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt 23076326  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23076325 tatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 23076253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 24057533 - 24057868
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24057533 tacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctc 24057632  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24057633 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtgtatgcata 24057731  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactc--cacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||   |  ||| ||||||||||| || || |||||     
T  24057732 tgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactctgaatttattcaacatgtatgatttaataaatat 24057829  T
Q  328 atcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagca 367  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  24057830 aacatacattacagccatcaacaaca-tcaacatccagca 24057868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39609098 - 39608735
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39609098 tacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctc 39608999  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39608998 accgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcata 39608900  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || |||||     
T  39608899 tgttatggactcacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaatat 39608802  T
Q  328 atcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatt 395  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  39608801 aacatacattacagccatcaacaaca-tcaacaactagtaatccagcaatccagaaagatgcacaatt 39608735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 395
Target Start/End: Original strand, 25419753 - 25420117
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25419753 tacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgtcaccactaagacccctcaataaatgcatttatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccct 25419852  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25419853 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgtgaacaaatagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcat 25419951  T
Q  229 atgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaata 326  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || |||||    
T  25419952 atgttatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgaatacattct-catatgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaata 25420049  T
Q  327 aatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatt 395  Q
     | ||||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||   ||||||||||    
T  25420050 taacatacattacagccatcaacaaca-tcaacaaccagtaatccagcaatctagaaagatgcacaatt 25420117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18941436 - 18941117
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18941436 caaccaacaacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 18941338  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18941337 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagccctc-ccgctgtttatgcatatg 18941239  T
Q  232 cgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| |     
T  18941238 ctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-ttacatatgactccgaatttatacaacatgtatgatttaataaatataa 18941141  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||    
T  18941140 catacattacagccatcaacaaca 18941117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19802109 - 19801861
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19802109 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 19802010  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19802009 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatc-ccgctgtttatgcatat 19801911  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19801910 gctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 19801861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23545094 - 23544837
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23545094 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagatccctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaaacaggaccg 23544995  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  23544994 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgccccaggacattagtcatc-ccgctgtt 23544896  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23544895 tatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 23544837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 75 - 298
Target Start/End: Original strand, 22507487 - 22507709
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22507487 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 22507586  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  22507587 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaac--tgaccat 22507684  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccac 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  22507685 gcatacaaactccatgtgactccac 22507709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 19362533 - 19362781
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19362533 caaccaacaacaaacactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 19362632  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19362633 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcatc-ccgctgtttatgcatat 19362731  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19362732 gcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 19362781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19800522 - 19800276
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19800522 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctca 19800423  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19800422 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgacca 19800324  T
Q  273 tgcatacatactccatat-gactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19800323 tgcatacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggttaa 19800276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 298
Target Start/End: Original strand, 22500920 - 22501128
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  22500920 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 22501019  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactcca 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  22501020 ctagtgctccaagacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcatacaaactcca 22501117  T
Q  288 tatgactccac 298  Q
    | |||||||||    
T  22501118 tgtgactccac 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 160 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41877930 - 41877684
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41877930 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacat 41877831  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaa 358  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41877830 acaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatcacagccatcagcaaca-tcaa 41877733  T
Q  359 cacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactat 407  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  41877732 caaccagcaattcaacaatccagaataatgcataattaaatataactat 41877684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 418
Target Start/End: Original strand, 38013680 - 38014004
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  38013680 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 38013779  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  38013780 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 38013876  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  38013877 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataaatcatacatcatagccatcagcaatag-caacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 38013975  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  38013976 acaattacataaaactatgctcaacacat 38014004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Original strand, 597203 - 597447
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  597203 agactcctcaaa-tatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 597300  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  597301 ccgctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 597398  T
Q  273 tgc-atacatactccatat-gactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| || || |||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||    
T  597399 tgcaatgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggttaa 597447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 319
Target Start/End: Original strand, 19508115 - 19508335
Alignment:
Q  100 catgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctcca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  19508115 catgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactcca 19508214  T
Q  199 ggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  19508215 ggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactccatgtgactcc 19508312  T
Q  297 acgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    || ||  ||||||||||| ||||    
T  19508313 acttaaacaacatgtatgattaa 19508335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14615118 - 14614893
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  14615118 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 14615019  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||    
T  14615018 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actc 14614922  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  14614921 catgtgactccacttaaacaacatgtatg 14614893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 5454437 - 5454617
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  5454437 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 5454536  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5454537 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 5454617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5582438 - 5582258
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  5582438 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 5582339  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5582338 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 5582258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 160 - 418
Target Start/End: Original strand, 22379545 - 22379801
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22379545 ggaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacat 22379643  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaa 358  Q
    |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  22379644 acaa-cttgaccatgctaacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattcaataaatatagcatacattacagccatcagcaaca-tcat 22379741  T
Q  359 cacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  22379742 caaacagtgatccaacaatccagaataatgcacaattaaacataactatgctcaaaacat 22379801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 25852924 - 25853104
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  25852924 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 25853023  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25853024 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 25853104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Original strand, 10686093 - 10686263
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  10686093 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 10686192  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686193 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 10686263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22248409 - 22248222
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  22248409 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 22248310  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22248309 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 22248222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29746690 - 29746435
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctac 257  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29746690 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 29746591  T
Q  258 atacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtca 357  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||  |||||||||||  ||    
T  29746590 atacaa-cttgaccatgcatacaaactccatatgacttcacttaaacaacatgtatggtt-aataaatagagcatacatctcagtcatcagcaaca-aca 29746494  T
Q  358 acacccagcaatccaa-caatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaa 415  Q
     ||   ||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29746493 tcaattagagatccaatcaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaa 29746435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40011133 - 40010915
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  40011133 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 40011034  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  40011033 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 40010937  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  40010936 ctccacttaaacaacatgtatg 40010915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1111841 - 1111621
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1111841 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 1111742  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  1111741 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 1111645  T
Q  291 gactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||||| ||  |||||||||||    
T  1111644 gactccacttaaacaacatgtatg 1111621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14889160 - 14888972
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  14889160 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 14889061  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14889060 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 14888972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 25846292 - 25846472
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||| |    
T  25846292 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtac 25846391  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25846392 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 25846472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 30781013 - 30781193
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |    
T  30781013 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtac 30781112  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30781113 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 30781193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24795184 - 24794997
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  24795184 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 24795085  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24795084 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 24794997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24800551 - 24800364
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  24800551 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 24800452  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24800451 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 24800364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37540126 - 37539939
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  37540126 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaa 37540027  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37540026 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 37539939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37547670 - 37547483
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  37547670 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaa 37547571  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37547570 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 37547483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Original strand, 43028989 - 43029207
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  43028989 tatgcatgtggtaccaatcaagaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 43029088  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  43029089 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 43029185  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  43029186 ctccacttaaacaacatgtatg 43029207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7508183 - 7507995
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  7508183 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 7508084  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7508083 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 7507995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14882483 - 14882295
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  14882483 atgcaattatgcatgcggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 14882384  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14882383 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 14882295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17939047 - 17938864
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17939047 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 17938948  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17938947 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 17938864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 11995078 - 11995265
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  11995078 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 11995177  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| ||| |||||   || |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11995178 ctagtactctaggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 11995265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Original strand, 15461421 - 15461600
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgct 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  15461421 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 15461520  T
Q  196 ccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15461521 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 15461600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18895156 - 18894976
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  18895156 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggctgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18895057  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18895056 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 18894976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Original strand, 18566603 - 18566760
Alignment:
Q  161 gaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18566603 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 18566702  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  18566703 acaa--ttgaccatgcatacaaactccttgtgactccacttaaacaacgtgtatggttaa 18566760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Original strand, 20347157 - 20347272
Alignment:
Q  161 gaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctaca 258  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20347157 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 20347256  T
Q  259 tacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  20347257 tacaac--tgaccatgca 20347272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 22379454 - 22379564
Alignment:
Q  25 gcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaag 124  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22379454 gcaactacaaccaacgacagagactaatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccaaag 22379553  T
Q  125 ccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||    
T  22379554 ccctcaccgct 22379564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Original strand, 20340553 - 20340668
Alignment:
Q  161 gaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctaca 258  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20340553 gaccgaagccatcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctaca 20340652  T
Q  259 tacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  20340653 tacaac--tgaccatgca 20340668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 19235792 - 19235906
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  19235792 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 19235891  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  19235892 atggttaaagcattc 19235906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28371657 - 28371543
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||    
T  28371657 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttataga 28371558  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  28371557 atggttaaagcattc 28371543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38145984 - 38145870
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||    
T  38145984 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttataga 38145885  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  38145884 atggttaaagcattc 38145870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 42960027 - 42960141
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||    
T  42960027 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttataga 42960126  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  42960127 atggttaaagcattc 42960141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 22336052 - 22336166
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  22336052 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 22336151  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  22336152 atggttaaagcattc 22336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 22460047 - 22460161
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  | | | ||    
T  22460047 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcattgttataga 22460146  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  22460147 atggttaaagcattc 22460161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 22466671 - 22466785
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  22466671 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 22466770  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  22466771 atggttaaagcattc 22466785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 22749698 - 22749812
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  22749698 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 22749797  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  22749798 atggttaaagcattc 22749812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 34828973 - 34829087
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| | | ||    
T  34828973 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccggagccctcaccgttataga 34829072  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  34829073 atggttaaagcattc 34829087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23112969 - 23112854
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||||||||||| | |    
T  23112969 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccctcaccgctgtcg 23112870  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  23112869 aatggttaaagcattc 23112854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 22339590 - 22339704
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  22339590 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtcgtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 22339689  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  22339690 atggttaaagcattc 22339704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27636076 - 27635935
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  27636076 agactcctcaataagtgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 27635977  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  27635976 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 27635935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 9775412 - 9775527
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |    
T  9775412 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcg 9775511  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  9775512 aatggttaaagcattc 9775527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37805547 - 37805432
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||   ||| ||||||| | |    
T  37805547 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggtcgtgacccacaccgctgtcg 37805448  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  37805447 aatggttaaagcattc 37805432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28890586 - 28890476
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28890586 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28890487  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28890486 ttaaagcattc 28890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28897290 - 28897180
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28897290 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28897191  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28897190 ttaaagcattc 28897180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28910490 - 28910380
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28910490 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28910391  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28910390 ttaaagcattc 28910380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28925758 - 28925648
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28925758 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28925659  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28925658 ttaaagcattc 28925648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28932181 - 28932071
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28932181 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28932082  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28932081 ttaaagcattc 28932071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28933685 - 28933575
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28933685 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28933586  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28933585 ttaaagcattc 28933575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28946885 - 28946775
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28946885 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28946786  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  28946785 ttaaagcattc 28946775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24751729 - 24751589
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccct 172  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |  |||| ||    
T  24751729 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24751630  T
Q  173 caccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24751629 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24751589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29746731 - 29746666
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29746731 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctgttga 29746666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37599525 - 37599411
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |  | | ||    
T  37599525 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagtcgaagccctcatctttataga 37599426  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    ||| |||||||||||    
T  37599425 atgattaaagcattc 37599411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24669191 - 24669051
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccct 172  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |  |||| ||    
T  24669191 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24669092  T
Q  173 caccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24669091 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24669051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24738960 - 24738820
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccct 172  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |  |||| ||    
T  24738960 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24738861  T
Q  173 caccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24738860 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24738820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18409276 - 18409149
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||    
T  18409276 caaccaacaacaacgactcatgcaatttcatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcacgtggtaccatattcagggccgaagctct 18409177  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  18409176 caccgctaattgaatggttaaagcattc 18409149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 276
Target Start/End: Original strand, 24008090 - 24008180
Alignment:
Q  185 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24008090 caactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 24008180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 427182 - 427336
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||| ||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  427182 gacaactccactaagactcctcgacaaatgcac--atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcat 427279  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |  | |  ||||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  427280 catggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 427336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23444380 - 23444259
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  23444380 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 23444281  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  23444280 gtgttccaggacatgagtcctc 23444259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 140
Target Start/End: Original strand, 18566571 - 18566626
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18566571 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccagacatgaccgaagccctcaccgctgttga 18566626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Original strand, 20347129 - 20347180
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20347129 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccctcaccgctgttga 20347180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 21829546 - 21829621
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  21829546 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 21829621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 20780631 - 20780745
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |  | | ||    
T  20780631 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagacttctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacaaagccgaagctctcatctttataga 20780730  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  20780731 atggttaaagcattc 20780745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 20819080 - 20819189
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  20819080 gactcatgcaagacatgacaactctac-aagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 20819178  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  20819179 ttaaagcattc 20819189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 20826180 - 20826289
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  20826180 gactcatgcaagacatgacaactctac-aagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 20826278  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  20826279 ttaaagcattc 20826289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24931097 - 24930984
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | ||    
T  24931097 ctaagactcatgcaagacatgacacctctactaagactcctcaaca-atgaaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttataga 24930999  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  24930998 atggttaaagcattc 24930984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41877949 - 41877911
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877949 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 41877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21574195 - 21574076
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||   ||||||  |||    
T  21574195 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcctaagccatcaccgcactgaacaataagt 21574096  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  21574095 gttccaggacatgagtcctc 21574076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23561788 - 23561669
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  || |||  |||    
T  23561788 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgcttggaccaataagt 23561689  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  23561688 gttccaggacatgagtcctc 23561669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758365
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 758365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Original strand, 20340525 - 20340576
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20340525 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccatcaccgctgttga 20340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312943
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22312943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22509346 - 22509284
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22509346 atgcatgtggtaccaaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22509284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 108
Target Start/End: Original strand, 20771856 - 20771922
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggta 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || | |||||| |||||||||||||    
T  20771856 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagacttctgaacaaatgcaactatgcatgtggta 20771922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 20843142 - 20843262
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||  ||||||| | |    
T  20843142 atgcatgtggtaccaatttacagggcaggagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataggccctcaccgctttgaacaacaagg 20843241  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  20843242 tgttccaggacatgagtcctc 20843262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 85
Target Start/End: Original strand, 21494878 - 21494918
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21494878 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 21494918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 19510935 - 19511060
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctc 129  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| |    
T  19510935 aaccaacaacaacgactcatgcaagacatgaccttccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccac 19511034  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  19511035 accgctgtcgaatggttaaagcattc 19511060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 20937594 - 20937656
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20937594 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcat 20937656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 10035044 - 10035098
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10035044 caaccaacaacaacgactcatgcaactacatgacaacaccactaagactcctcaa 10035098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 597136 - 597169
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  597136 gtggcaactacaaccaacaaccaagactcatgca 597169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 18566504 - 18566544
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18566504 acaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 18566544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19800584 - 19800540
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc-atgacatgacaacac 69  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19800584 caactataaccaacaaccaagactcatgcaatgacatgacaacac 19800540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27635890 - 27635846
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  27635890 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 27635846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 31 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2972930 - 2972547
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 130  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2972930 acaaccaacaatgaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcttcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcactca 2972832  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972831 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 2972732  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatc 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2972731 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccaattatacaacatgtatggttcaataaataaatc 2972633  T
Q  331 atacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2972632 atacaacacagccatcagcaaca-tcaacaaccagaaatccaacaatcaagaataatgcacaatttaatataactatgctcaaaaca 2972547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 35 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19128537 - 19128157
Alignment:
Q  35 ccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 134  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128537 ccaacaatgaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 19128438  T
Q  135 ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcga 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19128437 ttttgagtggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaa 19128338  T
Q  235 tggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatac 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19128337 tggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttcaataagtaaatcatac 19128239  T
Q  335 atcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128238 atcacagccatcagcaaca-tcaacaagcagcaatccaacaatccagaataatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 19128157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 413
Target Start/End: Original strand, 20894867 - 20895257
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20894867 atgtggcaactacaaccaacaactaagattcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 20894966  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20894967 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 20895066  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  20895067 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggtt-a 20895164  T
Q  320 acaaataaatcataca-tcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaa 413  Q
    | ||||||| |||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20895165 ataaataaagcatacatttccaaccatca-caaca-tcaacaaccagcaatccagcaatccagaatattgcacaattacataaaactatgctcaa 20895257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 20889248 - 20889597
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20889248 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 20889347  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20889348 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctccgctg 20889447  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  20889448 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggtt-a 20889545  T
Q  320 acaaataaatcataca-tcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatcca 372  Q
    | ||||||| |||||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  20889546 ataaataaagcatacatttccaaccatca-caaca-tcaacaaccagcaatcca 20889597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Original strand, 31664936 - 31665328
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31664936 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcagttatgcatgtggtaccagacaggaccga 31665035  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31665036 agccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 31665135  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaaca 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| || || |    
T  31665136 atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccatttaaacaacatgtatgattcaata 31665234  T
Q  323 aataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | |  | |||||||||||  |||||||||||  || ||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31665235 attttagcatacatcacagtcatcagcaaca-acatcaattagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 31665328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 417
Target Start/End: Original strand, 33221244 - 33221639
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33221244 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccaccaagactcctcaac-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggac 33221342  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33221343 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatttatcatgaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacacgagtcctctccgctg 33221442  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggtta 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||     
T  33221443 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaa-ctagaccatgcatacattatccatatgactccaaattatacaacatgtatggttc 33221541  T
Q  319 aacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  33221542 aataaataaatcatacttcacagccatcaaccaca-tcaacaaccagtaatccaacaatctagaataatgcataattaaatataactatgctcaaaaca 33221639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49548793 - 49548527
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49548793 atgtggcaactacaaccaacaactaaaactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 49548694  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49548693 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttctctccgctg 49548594  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactcca 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49548593 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactcca 49548527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 42 - 407
Target Start/End: Original strand, 36037458 - 36037822
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36037458 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctctacaaatgcaactatgcatgcggtaccaaccaggaccgaagtcctcaccgcttttgaa 36037557  T
Q  142 tggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacct 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36037558 tggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactaatgttccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacct 36037657  T
Q  242 acttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  36037658 acttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaaa-taataaatcatacatcacag 36037755  T
Q  342 ccatcagcaacagtcaac-acccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactat 407  Q
    |||||||||||| || || |  |||||||||||| || |||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  36037756 ccatcagcaacattcgacaattcagcaatccaaccattcaggataatgcataatttaatataactat 36037822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Original strand, 21881472 - 21881860
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21881472 caaccacaatcaacaataaagattcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 21881570  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21881571 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgaggcatctccgctgtttatg 21881670  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaat 325  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |    
T  21881671 catatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacatccttcatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataatt 21881769  T
Q  326 aaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | | ||||||| ||| ||||||||||||  || || |||   ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  21881770 atagcatacattacagccatcagcaaca-acatcaaccaatgatccagcaatccagaataatgcataattaaatataactatgttcaaaaca 21881860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 414
Target Start/End: Original strand, 42220308 - 42220697
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42220308 tggcaactacaaccaacgacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 42220407  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42220408 agtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 42220506  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactc-cacgtatgcaacatgtatggttaaac 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||| ||||||||||| || ||     
T  42220507 atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactctaatttatacaacatgtatgattcaat 42220605  T
Q  322 aaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    ||||| | ||||||| ||| |||||||||| | ||| ||  |||  |||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||    
T  42220606 aaatatagcatacattacagccatcagcaata-tcatcaaacagtgatccaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgctcaaa 42220697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 418
Target Start/End: Original strand, 33096975 - 33097362
Alignment:
Q  28 actacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccc 127  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33096975 actacaaccaacgacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccc 33097074  T
Q  128 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgca 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33097075 tcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgca 33097173  T
Q  228 tatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaata 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||  ||||||||||| || || |||||    
T  33097174 tatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattcaataaata 33097271  T
Q  327 aatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||   | |||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  33097272 tagcatacatgacaaccatcagcaaca-tcatcaaacaatgacccaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgctcaaaacat 33097362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 97 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 49548502 - 49548182
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgct 195  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49548502 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttaaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 49548403  T
Q  196 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  49548402 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactc 49548304  T
Q  296 c-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaat 394  Q
    | |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49548303 caatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatcacagccatcagcaaca-acaacaaccagcaattcaacaatccagaataatgcacaat 49548205  T
Q  395 ttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | |||| |||||||| |||||||    
T  49548204 taaatataactatgcccaaaaca 49548182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 418
Target Start/End: Original strand, 30396075 - 30396466
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30396075 tggcaattacaacccacaaccaagactcatgcatgacatgacaaaaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaataggaccga 30396173  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30396174 agccctcaccgcttt-gaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaacgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 30396271  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaac 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || ||     
T  30396272 atgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgatttaat 30396370  T
Q  322 aaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||  |||   | ||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||||||| |||||    
T  30396371 aaatatagcatacattacagccatcagtaaca-tcatcaaacagtggttcaacaatccagaacaatgcacaactaaacataactatgctcacaacat 30396466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46045077 - 46044719
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46045077 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 46044978  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46044977 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacattagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt 46044879  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||  |   || ||||||||||| || |    
T  46044878 tatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catacgactccgaattcattcaacatgtatgattta 46044781  T
Q  320 acaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccaga 382  Q
    | ||||| | ||||||| ||| |||| | ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  46044780 ataaatacaacatacattacagccattaacaaca-tcaacaaccagtaatccagcaatccaga 46044719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45959964 - 45959619
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||            ||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  45959964 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggt 45959865  T
Q  108 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatga 206  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  45959864 accagacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatga 45959765  T
Q  207 gtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgca 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    
T  45959764 gtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaaca 45959666  T
Q  306 acatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  45959665 acatgtatggtt-aataaataaagcatacatctcagtcatcagcaaca 45959619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 75 - 358
Target Start/End: Original strand, 34772094 - 34772376
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34772094 agactccccaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgattggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 34772193  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34772194 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgacta 34772292  T
Q  273 tgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaa 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  34772293 tgcatacatactccatatgactcca-ttttacaacatgtatgtttaaa-taacaaatcatacatcataaccatcagtaacattcaa 34772376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 85 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35462756 - 35462547
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaa 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35462756 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 35462657  T
Q  185 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatact 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  35462656 caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattct 35462558  T
Q  285 ccatatgactc 295  Q
     ||||||||||    
T  35462557 tcatatgactc 35462547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 75 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42956177 - 42955917
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42956177 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctca 42956078  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42956077 ccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcatctctgctgtttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccat 42955979  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  42955978 gcatacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaataaagcatacat 42955917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 75 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47872577 - 47872365
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47872577 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctca 47872478  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47872477 ccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccat 47872379  T
Q  274 gcatacatactcca 287  Q
    ||||||||||||||    
T  47872378 gcatacatactcca 47872365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 345
Target Start/End: Original strand, 899481 - 899791
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  899481 caaccaacaac-aagactcatgcatgacatgatgacaccactaagac-cctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaacaggactgaagccctcac 899578  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  899579 cgcttttgaatggttaaagcattcatcagaacataagccatcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatg 899677  T
Q  232 cgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| |     
T  899678 caatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccgaatttatacaacatgtatgatttaataaatacaa 899775  T
Q  330 catacatcacaaccat 345  Q
    ||||||||||| ||||    
T  899776 catacatcacagccat 899791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41404913 - 41404643
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41404913 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacataacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaactggaccg 41404814  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  41404813 aagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcatgaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcttc-ccgctg-t 41404716  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41404715 tatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 41404643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45142704 - 45142459
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45142704 agactcctcaaa-tatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 45142606  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45142605 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgacca 45142507  T
Q  273 tgcatacatactccatat-gactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  45142506 tgcatacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggttaa 45142459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29455497 - 29455178
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  29455497 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 29455398  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||    
T  29455397 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatat 29455301  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  29455300 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 29455203  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  29455202 acaattaaataaaactatgctcaaa 29455178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54845164 - 54844913
Alignment:
Q  28 actacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||            ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |    
T  54845164 actacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaga 54845065  T
Q  114 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845064 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagacctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctc 54844965  T
Q  213 tccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54844964 tccgctgtttatgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 54844913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 276
Target Start/End: Original strand, 7359184 - 7359375
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  7359184 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 7359283  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7359284 gcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 7359375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23436117 - 23435799
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  23436117 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 23436018  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  23436017 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 23435921  T
Q  293 ctccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcac 391  Q
    |||||  | || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| | | ||||||||    
T  23435920 ctccaattaatacaacatgtgtggttcaataaataaatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatctataataatgcac 23435822  T
Q  392 aatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  23435821 aattaaatataactatgctcaaa 23435799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11202576 - 11202341
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  11202576 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaacccctcaccgctgttga 11202477  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacat 281  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||     
T  11202476 gcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagc--tgaccatgcaatgcaa 11202379  T
Q  282 actccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  11202378 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 11202341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29448813 - 29448494
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  29448813 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 29448714  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat-gcatacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || || ||||||| |    
T  29448713 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatggaatgca-actccatgt 29448617  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  29448616 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 29448519  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  29448518 acaattaaataaaactatgctcaaa 29448494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 5938851 - 5939052
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5938851 agacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 5938950  T
Q  175 ccgc-tgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    |||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5938951 ccgcttttgagcaactagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 5939048  T
Q  273 tgca 276  Q
    ||||    
T  5939049 tgca 5939052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 1583850 - 1584037
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  1583850 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1583949  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1583950 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 1584037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Original strand, 52500498 - 52500716
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  52500498 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 52500597  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  52500598 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 52500694  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  52500695 ctccacttaaacaacatgtatg 52500716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 314
Target Start/End: Original strand, 21396756 - 21396982
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaaca 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  21396756 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 21396855  T
Q  187 actagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatact 284  Q
    |||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||    
T  21396856 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-act 21396952  T
Q  285 ccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  21396953 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 21396982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 26395625 - 26395812
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  26395625 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26395724  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26395725 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 26395812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3260126 - 3259946
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  3260126 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 3260027  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3260026 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataac--tgaccatgca 3259946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3266761 - 3266574
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  3266761 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 3266662  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3266661 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 3266574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39266374 - 39266192
Alignment:
Q  93 aattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactag 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  39266374 aattatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactag 39266276  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    | |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39266275 tactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 39266192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 7356191 - 7356339
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  7356191 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 7356290  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatg 231  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7356291 gcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 11937103 - 11937286
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11937103 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11937202  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || | || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11937203 actccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 11937286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29382899 - 29382719
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  29382899 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 29382800  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29382799 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 29382719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49240978 - 49240799
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgct 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  49240978 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 49240879  T
Q  196 ccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49240878 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 49240799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49749692 - 49749513
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgct 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||    
T  49749692 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 49749593  T
Q  196 ccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49749592 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 49749513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Original strand, 391073 - 391180
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  391073 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 391172  T
Q  195 tccaggac 202  Q
    ||||||||    
T  391173 tccaggac 391180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 180
Target Start/End: Original strand, 50082207 - 50082291
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50082207 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 50082291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45151473 - 45151372
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45151473 agactcctcaaa-tatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 45151375  T
Q  175 ccg 177  Q
    |||    
T  45151374 ccg 45151372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 14910530 - 14910645
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||| | |    
T  14910530 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactactcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatag 14910629  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  14910630 aatggttaaagcattc 14910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10977265 - 10977129
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccc 127  Q
    ||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |  |||  |||||||||    
T  10977265 caaccaacaataacgactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcgactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccc 10977166  T
Q  128 tcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggac 163  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10977165 tcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcaggac 10977129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 212
Target Start/End: Original strand, 15306959 - 15307121
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaag 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15306959 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccggatattgaatggttaaag 15307058  T
Q  151 cattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  15307059 cattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagcgttccaggacatgagtcctc 15307121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 391177 - 391293
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctac 257  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  391177 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 391276  T
Q  258 atacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  391277 atacaac--tgaccatgca 391293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Original strand, 14821317 - 14821418
Alignment:
Q  58 acatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14821317 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcatt 14821416  T
Q  155 ca 156  Q
    ||    
T  14821417 ca 14821418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 13886614 - 13886783
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  13886614 gactcatgcaatgacttgacaacacccctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 13886713  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtc 209  Q
    |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||||||||||    
T  13886714 atggttaaagcattcattagggcttaagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttcgaggacatgagtc 13886783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16148005 - 16147891
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||    
T  16148005 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttataga 16147906  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  16147905 atggttaaagcattc 16147891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Original strand, 13452204 - 13452320
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  13452204 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 13452303  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaac 188  Q
    |||| |||  |||||||    
T  13452304 tcactgctttgaacaac 13452320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 15533731 - 15533846
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |    
T  15533731 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcg 15533830  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  15533831 aatggttaaagcattc 15533846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 15244047 - 15244219
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 140  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  15244047 gactcatgcaatgatatcacaacccctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtgttaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 15244146  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  15244147 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctc 15244219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 37881374 - 37881516
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  37881374 agacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccctcaccgctattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 37881473  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
     ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  37881474 atcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 37881516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 16484596 - 16484716
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | |    
T  16484596 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 16484695  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16484696 tgttccaggacatgagtcctc 16484716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15361003 - 15360884
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||   ||    
T  15361003 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataggt 15360904  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  15360903 gttccaggacatgagtcctc 15360884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 157
Target Start/End: Original strand, 15406870 - 15406973
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  15406870 atgacatgacaacacctctaagactccttgacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagca 15406968  T
Q  153 ttcat 157  Q
    |||||    
T  15406969 ttcat 15406973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 54826145 - 54826052
Alignment:
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || || |  | |||||||||||  |||||||||||    
T  54826145 acaaacttgaccatgcatacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattttagcatacatcacagtcatcagcaaca 54826052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121661
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 23121661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 14485444 - 14485570
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcat-gacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |  | | | ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  14485444 caaccaacaacaacgactcatgcattgacatgacaacacctctaagactcctcgataattacgactatgcttgtggtaccatattagggccgaagccctc 14485543  T
Q  130 accgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||    
T  14485544 accgctaatcgaatggttaaagcattc 14485570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 276
Target Start/End: Original strand, 50082293 - 50082347
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50082293 tttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 50082347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13899797 - 13899676
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  13899797 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 13899698  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  13899697 gtgttctaggacatgagtcctc 13899676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15470688 - 15470652
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470688 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 15470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 18271262 - 18271344
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  18271262 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 18271344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53905529 - 53905376
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  53905529 gacaacaccactaagactccttgaca-atgca--tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcat 53905433  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |  |||| ||||||| |  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  53905432 cagggcataagctctcaccgatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 53905376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Original strand, 11847012 - 11847113
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  11847012 atgacatgacacc-ccactaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataaacagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 11847110  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  11847111 ttc 11847113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16229297 - 16229180
Alignment:
Q  100 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgc 194  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  ||||||| | |||     
T  16229297 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaaggtgt 16229198  T
Q  195 tccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16229197 tccaggacatgagtcctc 16229180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18166422 - 18166347
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  18166422 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 18166347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 20940260 - 20940322
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20940260 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcat 20940322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 27905211 - 27905270
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27905211 atgcatgtggtaccatatcaggactgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 27905270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908642
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 40908642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22726098 - 22725968
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatgg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |      |||||||||||||||    |||||||  ||| ||||||| | ||||||||||    
T  22726098 atgacatgacaacaccactaagactcctcgacaaatgcaactagacacatgcatgtggtaccattttacaggacataagtcctcaccggattttgaatgg 22725999  T
Q  145 ttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  22725998 ttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 22725968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 12931881 - 12931957
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  12931881 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 12931957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 18261297 - 18261379
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  18261297 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 18261379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1651236 - 1651177
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1651236 atgcatgtggtaccataacagggtcggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 1651177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4831265 - 4831203
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4831265 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4831203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4834560 - 4834498
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4834560 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4834498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15005149 - 15005084
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatc 158  Q
    |||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15005149 atgcatgtggtaccaaattacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatc 15005084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 5938788 - 5938833
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5938788 caactacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 5938833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 45142767 - 45142722
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45142767 caaccacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 45142722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 45151536 - 45151491
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45151536 caaccacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 45151491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 13444207 - 13444290
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||| |||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  13444207 atgcctgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 13444290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2585346 - 2585283
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2585346 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcat 2585283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 157
Target Start/End: Original strand, 14484432 - 14484491
Alignment:
Q  100 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  14484432 catgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcat 14484491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 49051095 - 49051139
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  49051095 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 49051139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 35 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11392797 - 11392417
Alignment:
Q  35 ccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 134  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11392797 ccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacatcactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgc 11392698  T
Q  135 ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcga 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11392697 ttttgaatggttaaagaattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaa 11392598  T
Q  235 tggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatac 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11392597 tggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatac 11392499  T
Q  335 atcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11392498 atcacagccatcagcaaca-tcaacgagcagcattccaacaatccagaataatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 11392417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 417
Target Start/End: Original strand, 29328120 - 29328515
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  29328120 atgtggcaaatacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactacgactcctcaac-tatgcatatatgcatgtcgtaccaaacaggac 29328218  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328219 cgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 29328318  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggtta 318  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||     
T  29328319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttc 29328417  T
Q  319 aacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29328418 aataaataaatcatacatcacagtcatcagcaaca-tcatcaaatagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 29328515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25701771 - 25701461
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25701771 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacattacaacaccactgagactcctcaaaatatgcaataatgcatgtggtaccaaacaagaccga 25701672  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25701671 agccctcaccgcttctgaatggttaaagcattcatcaggatcgtagccctcaccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcctttccgctgttt 25701572  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaaca 322  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  25701571 atgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgatcatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttaaata 25701473  T
Q  323 aataaatcatac 334  Q
    ||||||||||||    
T  25701472 aataaatcatac 25701461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14416774 - 14416387
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14416774 caaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 14416675  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14416674 cctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 14416575  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||    
T  14416574 catatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataaa 14416476  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||| |||| |  ||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  14416475 taaatcatacttctcagccatcaacaaca-tcaataatcagtaatccagcaatctagaataatgcataattaaatataactatgctcaaa 14416387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29299271 - 29298953
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29299271 acaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccgtc- 29299174  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29299173 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 29299075  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||  ||||||||||| || || ||||| |     
T  29299074 gcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattcaataaatatag 29298977  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  29298976 catacattacaaccatcaacaaca 29298953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29305817 - 29305499
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29305817 acaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc- 29305720  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29305719 ccgcttttgaatggtttaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 29305621  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||  ||||||||||| || || ||||| |     
T  29305620 gcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattcaataaatatag 29305523  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||    
T  29305522 catacattacaatcatcaacaaca 29305499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40144445 - 40144203
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40144445 agactcctcaaa-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 40144347  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40144346 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccat 40144249  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40144248 gcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatggttaa 40144203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Original strand, 27345695 - 27345933
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27345695 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 27345794  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27345795 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccat 27345892  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  27345893 gcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 27345933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 414
Target Start/End: Original strand, 43687335 - 43687706
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43687335 tacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctc 43687432  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43687433 accgcttttgaacggttaaagtattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcata 43687531  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt--atgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||  ||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |  |  ||||||||||| || || |||||     
T  43687532 tgtaatggactcccttatgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttgacacaacatgtatgattcaataaatat 43687630  T
Q  328 atcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    | |||||||  ||||||          |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43687631 aacatacat-tcaacca----------tcaacaaccagcaatccagcaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaa 43687706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16267021 - 16266777
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16267021 agactcctcaaa-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctca 16266923  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtg--tatatctacatacaaccttgacc 271  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  16266922 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaac--tgacc 16266825  T
Q  272 atgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  16266824 atgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtacggttaa 16266777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 319
Target Start/End: Original strand, 23117202 - 23117433
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  23117202 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 23117301  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||    
T  23117302 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactc 23117399  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  23117400 catgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 23117433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14746662 - 14746426
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||    
T  14746662 aaatatgcaagtatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttga 14746563  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-ataca 280  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    
T  14746562 gcaactagtgctccaggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca 14746465  T
Q  281 tactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
     ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  14746464 aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 14746426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 417
Target Start/End: Original strand, 27948606 - 27948860
Alignment:
Q  161 gaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacata 260  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27948606 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27948705  T
Q  261 caaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaaca 360  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |  | ||||||| |||  |||||||||||  || ||    
T  27948706 caa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatcagcaaca-acatca 27948803  T
Q  361 cccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
       ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27948804 attagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 27948860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 161 - 417
Target Start/End: Original strand, 27889948 - 27890202
Alignment:
Q  161 gaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacata 260  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27889948 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27890047  T
Q  261 caaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaaca 360  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |  | ||||||| |||  |||||||||||  || ||    
T  27890048 caa-attgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatcagcaaca-acatca 27890145  T
Q  361 cccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
       ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27890146 attagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 27890202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26486158 - 26485919
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||    
T  26486158 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26486059  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||    
T  26486058 ctagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa--ttgaccatgcaatgcaaactc 26485961  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||| |||| |||| ||  ||||||||||| || || ||||||    
T  26485960 catgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataa 26485919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Original strand, 3697632 - 3697862
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||    
T  3697632 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggtccgaagccctcaccgctgttga 3697731  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacat 281  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||     
T  3697732 gcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaa 3697829  T
Q  282 actccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  3697830 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 3697862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10956823 - 10956593
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  10956823 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 10956724  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||    
T  10956723 ctagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actc 10956627  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  10956626 catgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 10956593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Original strand, 14765585 - 14765904
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  14765585 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatctggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 14765684  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  14765685 actccaggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 14765781  T
Q  291 gactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||| |  ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |  ||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  14765782 gactccaatttatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagtcatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 14765879  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  14765880 acaattaaatgtaactatgctcaaa 14765904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 161 - 314
Target Start/End: Original strand, 27873818 - 27873970
Alignment:
Q  161 gaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacata 260  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27873818 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27873917  T
Q  261 caaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27873918 caa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatg 27873970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3224835 - 3224634
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3224835 agacttctcaaatgatgcaaatatacatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcatcgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 3224736  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3224735 ccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 3224638  T
Q  273 tgca 276  Q
    ||||    
T  3224637 tgca 3224634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16887429 - 16887211
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  16887429 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 16887330  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  16887329 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 16887233  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  16887232 ctccacttaaacaacatgtatg 16887211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27909722 - 27909535
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  27909722 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27909623  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27909622 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 27909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27956141 - 27955954
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  27956141 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27956042  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27956041 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 27955954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36800580 - 36800393
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  36800580 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 36800481  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36800480 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 36800393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 14563539 - 14563721
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  14563539 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 14563638  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14563639 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 14563721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9205488 - 9205301
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  9205488 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 9205389  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9205388 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 9205301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 28980717 - 28980904
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||    
T  28980717 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaa 28980816  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28980817 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 28980904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 28985937 - 28986124
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||    
T  28985937 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaa 28986036  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28986037 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 28986124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4520867 - 4520684
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4520867 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 4520768  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4520767 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 4520684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14736952 - 14736772
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  14736952 tatgcatggggtaccaaacaggaccgacgccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14736853  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgct-gtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14736852 tccaggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 14736772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 35541048 - 35541228
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| || |    
T  35541048 tatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactcgtac 35541147  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35541148 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 35541228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23224877 - 23224660
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||| |    
T  23224877 tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcactcaccgctgttgagcaactagtac 23224779  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    |||||||    || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  23224778 tccaggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 23224682  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  23224681 ctccacttaaacaacatgtatg 23224660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 298
Target Start/End: Original strand, 6588134 - 6588271
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctaca 258  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6588134 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 6588233  T
Q  259 tacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccac 298  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6588234 tacaac--tgaccatgcatacaaactccatgtgactccac 6588271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 27873728 - 27873834
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27873728 caactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagc 27873826  T
Q  126 cctcaccg 133  Q
    ||||||||    
T  27873827 cctcaccg 27873834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 27889858 - 27889964
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27889858 caactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagc 27889956  T
Q  126 cctcaccg 133  Q
    ||||||||    
T  27889957 cctcaccg 27889964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 27948516 - 27948622
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27948516 caactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagc 27948614  T
Q  126 cctcaccg 133  Q
    ||||||||    
T  27948615 cctcaccg 27948622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23653231 - 23653070
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccc 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  23653231 acaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccc 23653132  T
Q  128 tcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac 188  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||    
T  23653131 tcaccgctaattgaatggttaaagcatttatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaac 23653070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Original strand, 23653764 - 23653957
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cagga 118  Q
    |||||| | |||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||     
T  23653764 tggcaaatgcaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccccta-gactcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaggg 23653862  T
Q  119 ccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23653863 ccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttccaggacatgagtcctc 23653957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 417
Target Start/End: Original strand, 27902275 - 27902441
Alignment:
Q  249 tatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcag 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |  | ||||||| |||  ||||||    
T  27902275 tatatctacatacaac-ttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatcag 27902373  T
Q  349 caacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    |||||  || ||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27902374 caaca-acatcaattagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 27902441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24321834 - 24321720
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  24321834 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 24321735  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  24321734 atggttaaagcattc 24321720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8729244 - 8729130
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  8729244 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 8729145  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  8729144 atggttaaagcattc 8729130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 39363422 - 39363599
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct- 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |      ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||     
T  39363422 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcgacaaatgcaactggacacatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctg 39363521  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  39363522 tttgaatggttaaaacattcatcaggacccaggtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 39363599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27942405 - 27942291
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||    
T  27942405 ctaagactcatgcaagacatgacaactcaactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttataga 27942306  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||| |||||    
T  27942305 atggttaaaacattc 27942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 214006 - 214123
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatcta 256  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  214006 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 214105  T
Q  257 catacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  214106 catacaac--tgaccatgca 214123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 238248 - 238131
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatcta 256  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  238248 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 238149  T
Q  257 catacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  238148 catacaac--tgaccatgca 238131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 727629 - 727746
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatcta 256  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  727629 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 727728  T
Q  257 catacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  727729 catacaac--tgaccatgca 727746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 800130 - 800247
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatcta 256  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  800130 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 800229  T
Q  257 catacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  800230 catacaac--tgaccatgca 800247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 851523 - 851640
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatcta 256  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  851523 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 851622  T
Q  257 catacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  851623 catacaac--tgaccatgca 851640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8596322 - 8596208
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||    
T  8596322 ctaagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttataga 8596223  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  8596222 atggttaaagcattc 8596208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 6588093 - 6588158
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6588093 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttga 6588158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Original strand, 18609730 - 18609853
Alignment:
Q  35 ccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcac 131  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||    
T  18609730 ccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcac 18609829  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
     ||| | |||||||||||||||||    
T  18609830 tgctatcgaatggttaaagcattc 18609853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 19859473 - 19859626
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  19859473 gacagcaccactaagactcctcgacaaatgcac--atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcat 19859570  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19859571 cagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 19859626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31412710 - 31412618
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggac 163  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31412710 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31412618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31418892 - 31418800
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggac 163  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31418892 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31418800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948511
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggtta 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatta 10948512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14057825 - 14057724
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14057825 atgacatgacaac-cctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagca 14057727  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  14057726 ttc 14057724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 21930539 - 21930682
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtacca---a 112  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |      |||||||||||||||        
T  21930539 tggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcacatgcatgtggtaccatttt 21930638  T
Q  113 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 156  Q
    ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21930639 acagggcagaagccctcgccgaatttgaatggttaaagcattca 21930682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Original strand, 19296683 - 19296776
Alignment:
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || || |  | |||||||||||  |||||||||||    
T  19296683 acaaacttgaccatgcatacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattttagcatacatcacagtcatcagcaaca 19296776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Original strand, 213984 - 214030
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  213984 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 214030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 238270 - 238224
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  238270 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 238224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Original strand, 727607 - 727653
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  727607 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 727653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Original strand, 800108 - 800154
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  800108 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 800154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Original strand, 851501 - 851547
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  851501 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14594933 - 14594813
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  ||||||| | |    
T  14594933 atgcatgtggtaccaatctacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaagg 14594834  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  14594833 tgttccaggacatgagtcctc 14594813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21690611 - 21690492
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaa-ctagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||  |  ||||||   |||    
T  21690611 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaataaagt 21690512  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  21690511 gttccaggacatgagtcctc 21690492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 21839404 - 21839537
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacagga 118  Q
    |||||| | ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    |||  ||||||||||||||||    |||||     
T  21839404 tggcaatttcaaccaacaccaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaca--gggca--tatgcatgtggtaccattttacaggg 21839499  T
Q  119 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 156  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21839500 cagaagccctcgccgaatttgaatggttaaagcattca 21839537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20784006 - 20783932
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  20784006 ttgaatggttaaagcattcatcaggacctaag-cctcaccgctttgaacaataagtgtgccaggacatgagtcctc 20783932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025700
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22025700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050263
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22050263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055781
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22055781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177648
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22177648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 155
Target Start/End: Original strand, 21282038 - 21282119
Alignment:
Q  77 actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21282038 actcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 21282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38186096 - 38186023
Alignment:
Q  136 tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  38186096 tttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagt 38186023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21686287 - 21686167
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--ag 191  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||  |  |||||| |  ||    
T  21686287 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagtcctcaccaatttgaacaattaaag 21686188  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  21686187 tgttccaggacatgagtcctc 21686167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Original strand, 25110828 - 25110910
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||    
T  25110828 atgacatgacaacacccctaagactcctcgacaaatgcagccatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgct 25110910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 44476172 - 44476297
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctc 129  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| |    
T  44476172 aaccaacaacaacgactcatgcaagacatgaccttccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccac 44476271  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  44476272 accgctgtcgaatggttaaagcattc 44476297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 44479434 - 44479559
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctc 129  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| |    
T  44479434 aaccaacaacaacgactcatgcaagacatgaccttccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccac 44479533  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  44479534 accgctgtcgaatggttaaagcattc 44479559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 23825102 - 23825210
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  23825102 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 23825201  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  23825202 ctcaccgct 23825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 27345632 - 27345677
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27345632 caactacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 27345677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20012455 - 20012406
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactc 80  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20012455 caaccatcaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactc 20012406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22063740 - 22063703
Alignment:
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22063740 cgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22063703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21300354 - 21300291
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21300354 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 21300291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36445932 - 36445811
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||  |  |||||| |  |    
T  36445932 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaa 36445833  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  36445832 gtgttccaggacatgagtcctc 36445811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009574
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 41009574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 65539 - 65145
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  65539 atgtggcaactacaatcaacaactaagactcattcatgacatgacaataccactaagactcctcaaaatatgcaattattcatgtggtaccaaacaggac 65440  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65439 cgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 65340  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  65339 tttatgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaa 65241  T
Q  320 acaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaac-acccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaa 415  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |  |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  65240 a-taataaatcatacatcacagccatcagcaacatctaacaattcagcaatccaaccattcagaataatgcataatttaatataactatgcttaaaa 65145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10470958 - 10470567
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470958 tggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 10470860  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470859 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 10470760  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaaca 322  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |    
T  10470759 atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaata 10470661  T
Q  323 aataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | |  | ||||||| |||  |||||||||||  || ||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10470660 attttagcatacattacagtcatcagcaaca-acatcaattagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 10470567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 35 - 417
Target Start/End: Original strand, 27767297 - 27767677
Alignment:
Q  35 ccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 134  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767297 ccaacaatgaagactcttgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 27767396  T
Q  135 ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27767397 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaa 27767496  T
Q  235 tggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatac 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  || ||  | |  |||||||    
T  27767497 tggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatataacatgtatttttcaattattttatcatac 27767595  T
Q  335 atcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    || |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27767596 attacagtcatcagcaaca-tcaacaatcagcaatccaactatccagaataatgcacaatttaatataactatgctcaaaaca 27767677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10464436 - 10464090
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464436 tggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 10464338  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10464337 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttctctccgctgttt 10464238  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgac-tccacgtatgcaacatgtatggttaaac 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |  ||| ||||||||||| || ||     
T  10464237 atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattcctcatatgacatcaatttatacaacatgtatgattcaat 10464139  T
Q  322 aaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatcca 372  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||    
T  10464138 aaataaaacatacat-tcaaccatcaacaaca-tcaacaaccaacaatcca 10464090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 94735 - 94422
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtg 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||            ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  94735 atgtggcaactacaaccaacaattaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtg 94636  T
Q  106 gtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  94635 gtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacat 94536  T
Q  205 gagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  94535 gagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttaaac 94437  T
Q  305 aacatgtatggttaa 319  Q
    |||||||||||||||    
T  94436 aacatgtatggttaa 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 29925630 - 29926013
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29925630 tacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaat-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctc 29925727  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29925728 accccttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcata 29925826  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt--atgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||  |  |  ||||||||||| || || |||||     
T  29925827 tgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattcttcatatgactccaatttgacacaacatgtatgattcaataaatat 29925925  T
Q  328 atcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  29925926 aacatacat-tcaaccatcagcaaca-tcatcaaacagtgatccaacaatccagaataatacataattaaatataactatgctcaaaaca 29926013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12447417 - 12447066
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12447417 tacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccct 12447318  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12447317 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgtgaacaacaagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcat 12447219  T
Q  229 atgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaata 326  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || |||||    
T  12447218 atgctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaata 12447121  T
Q  327 aatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccaga 382  Q
     | ||||||| ||| |||| | |||| | ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  12447120 caacatacattacagccattaacaac-gacaacaaccagtaatccagcaatccaga 12447066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17207965 - 17207636
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17207965 tggcaattacaaccaacaataaagactcatgcatgacatgacgaccccactaagactcctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 17207867  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17207866 aaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatatgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccactgtt 17207768  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaa 320  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || ||    
T  17207767 tatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattcaa 17207669  T
Q  321 caaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
     ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||    
T  17207668 taaatatagcatacattacagccatcaacaaca 17207636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Original strand, 14582783 - 14583021
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14582783 agactcctcaaa-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 14582881  T
Q  175 ccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatg 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  14582882 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccccactgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-ctagatcatg 14582980  T
Q  275 catacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  14582981 catacattcttcatatgactccaacttatacaacatgtatg 14583021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23021568 - 23021320
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23021568 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacacctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 23021469  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23021468 ccgctttagaatggttaaagaattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 23021370  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23021369 gcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 23021320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 75 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8069865 - 8069546
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8069865 agactcctcaaa-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctca 8069767  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8069766 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 8069669  T
Q  273 tgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatcc 371  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| || | ||||| |||||||  ||  ||||| ||||| |||||| |||  |||||    
T  8069668 tgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatggtt-aatagataaagcatacatttcagtcatcaacaacaatcaacaaccaataatcc 8069570  T
Q  372 aacaatccagattaatgcacaatt 395  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||    
T  8069569 agcaatccagaataatgcataatt 8069546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Original strand, 13940359 - 13940717
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13940359 tggcaattacgaacaacaacaaagactcatggatgacatgactacaccactaagacccctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 13940458  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  13940459 aagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc-ccgttgtt 13940557  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||  |  ||  |||||| ||||||| |    
T  13940558 tatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaa-catgaccatgcaaacattct-catatgactccggaattaaacaacatatatggttta 13940655  T
Q  320 acaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccaga 382  Q
     |||||| | |||||| ||||| ||| | ||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13940656 gcaaatacaacatacaccacaatcattatcaata-tcaacaatcagcaatccaacactccaga 13940717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17894752 - 17894614
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17894752 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggac 17894653  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17894652 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatc 17894614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13128390 - 13128164
Alignment:
Q  127 ctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgc 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13128390 ctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgg 13128291  T
Q  227 atatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaat 325  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| || |||||||| || || || |    
T  13128290 atatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattcttcatatgactccaacttatacatcatgtatgattcaataatt 13128192  T
Q  326 aaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    | | |||||||  || ||||||||||||    
T  13128191 atagcatacatttcagccatcagcaaca 13128164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Original strand, 4106674 - 4106915
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4106674 agacttctcaatagatgcaaatatgaatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 4106773  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  4106774 ccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaac--tgacca 4106867  T
Q  273 tgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  4106868 tgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 4106915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 1070609 - 1070796
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  1070609 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1070708  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1070709 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 1070796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15332280 - 15332093
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  15332280 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 15332181  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15332180 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 15332093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 17309665 - 17309852
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  17309665 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17309764  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17309765 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 17309852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 25463832 - 25464019
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  25463832 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 25463931  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25463932 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 25464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 314
Target Start/End: Original strand, 29159059 - 29159285
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaaca 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||    
T  29159059 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 29159158  T
Q  187 actagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatact 284  Q
    |||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||    
T  29159159 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-act 29159255  T
Q  285 ccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  29159256 ccatatgattccacttaaacaacatgtatg 29159285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34134128 - 34133941
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  34134128 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 34134029  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34134028 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 34133941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16223816 - 16223629
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  16223816 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 16223717  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16223716 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 16223629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 24369186 - 24369365
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  24369186 tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 24369284  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24369285 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 24369365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25315796 - 25315616
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  25315796 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 25315697  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25315696 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 25315616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26203290 - 26203110
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  26203290 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26203191  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26203190 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 26203110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30799587 - 30799408
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  30799587 tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 30799489  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30799488 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 30799408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 319
Target Start/End: Original strand, 22406613 - 22406844
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg--cgaaca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  |    
T  22406613 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtttgagta 22406712  T
Q  187 actagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatac 283  Q
    |||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||    
T  22406713 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctac-tgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-ac 22406808  T
Q  284 tccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||    
T  22406809 tccatatgactccacttaactaacatgtatgattaa 22406844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 212
Target Start/End: Original strand, 25347027 - 25347201
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgct-ttt 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||| |||    
T  25347027 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagacacctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgttt 25347126  T
Q  139 gaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  25347127 gaatggttaaagcattcatcaggacctaggccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 25347201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13136033 - 13135929
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136033 caactacgactaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcata-tattcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 13135935  T
Q  126 cctcac 131  Q
    ||||||    
T  13135934 cctcac 13135929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Original strand, 15457412 - 15457524
Alignment:
Q  44 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  15457412 aagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaat 15457511  T
Q  143 ggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||    
T  15457512 ggttaaagcattc 15457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Original strand, 15464007 - 15464119
Alignment:
Q  44 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  15464007 aagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaat 15464106  T
Q  143 ggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||    
T  15464107 ggttaaagcattc 15464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Original strand, 31250236 - 31250351
Alignment:
Q  41 actaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| | | |    
T  31250236 actaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatatcagggccgaagccctcaccgttatag 31250335  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  31250336 aatggttaaagcattc 31250351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20009112 - 20008998
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  20009112 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgtaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 20009013  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  20009012 atggttaaagcattc 20008998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 24362630 - 24362746
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctac 257  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24362630 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 24362729  T
Q  258 atacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  24362730 atacaac--tgaccatgca 24362746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 4476310 - 4476424
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  4476310 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 4476409  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  4476410 atggttaaagcattc 4476424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 25395948 - 25396120
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  25395948 gactcatgcaatgatatgacgacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattga 25396047  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  25396048 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctc 25396120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20011171 - 20011082
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctca 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20011171 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctca 20011082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28290440 - 28290324
Alignment:
Q  41 actaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| |     
T  28290440 actaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtc 28290341  T
Q  139 gaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||||    
T  28290340 gaatggttaaagcattc 28290324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 12941745 - 12941860
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |    
T  12941745 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 12941844  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  12941845 aatggttaaagcattc 12941860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Original strand, 18785987 - 18786182
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggac 119  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |    
T  18785987 tggcaaatgcaaccaacaacaacgactcatgcaattacaggacaacaccaataagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggc 18786086  T
Q  120 cgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||  ||| ||||||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  18786087 agaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttattcaggacataagtcctcaccgcttttaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 18786182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19472556 - 19472384
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | || ||||||||  | | ||||    
T  19472556 gactcatgcaatgacatgacaatacctctaagacccctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaggccctcacgagatattga 19472457  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  19472456 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 19472384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21365699 - 21365585
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||    
T  21365699 ctaagactcatgcaagacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttataga 21365600  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  21365599 atggttaaagcattc 21365585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23969681 - 23969567
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||    
T  23969681 ctaagactcatgcaagacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttataga 23969582  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  23969581 atggttaaagcattc 23969567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19096812 - 19096720
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  19096812 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatatgactccacttaaacaacatgtatg 19096720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26418866 - 26418724
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  26418866 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtatcataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 26418767  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  26418766 ctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 26418724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9100240 - 9100127
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | ||    
T  9100240 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaaca-atgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttataga 9100142  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  9100141 atggttaaagcattc 9100127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23235128 - 23234987
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |    
T  23235128 agactcctcaaaaaataaaaatatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtac 23235029  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  23235028 tcaccgctttgaacaacatggtgttccaggacataagtcctc 23234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 29096751 - 29096864
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | ||    
T  29096751 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaaca-atgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttataga 29096849  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  29096850 atggttaaagcattc 29096864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 25634093 - 25634207
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||    
T  25634093 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagacttatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttataga 25634192  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  25634193 atggttaaagcattc 25634207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5290341 - 5290201
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccct 172  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |  |||| ||    
T  5290341 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggacgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 5290242  T
Q  173 caccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||  |||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  5290241 caccgctttgaacaacaaagtgttccagaacatgagtcctc 5290201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592821
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcat 1592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23233544 - 23233468
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  23233544 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 23233468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 17414038 - 17414113
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  17414038 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 17414113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300787
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19300846 atgcatgtggtaccatatcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Original strand, 25749632 - 25749695
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25749632 tggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 25749695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19096861 - 19096815
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19096861 atgcaaatatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgct 19096815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24514072 - 24513944
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagcc 126  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  24514072 tacaatcaacaacaacgactcatgtaatggcatgacaacattactaagactcctcgacaaatgcaat-atgcatgtggtaccatattcagggccggagcc 24513974  T
Q  127 ctcaccgctttt-gaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24513973 ctcaccgctattcgaatggttaaagcattc 24513944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10583019 - 10582900
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  10583019 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 10582920  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  10582919 gttccaggacttgagtcctc 10582900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 19451326 - 19451402
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19451326 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 19451402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21724934 - 21724875
Alignment:
Q  100 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21724934 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 21724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 31251344 - 31251428
Alignment:
Q  72 ctaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31251344 ctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 31251428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581975
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataacagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14581975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726668
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 19726668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 24362611 - 24362654
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24362611 tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgctgttga 24362654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 24720594 - 24720715
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  24720594 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 24720693  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  24720694 gtgttccaggacatgagtcctc 24720715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 157
Target Start/End: Original strand, 22906984 - 22907027
Alignment:
Q  114 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22906984 caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8760605 - 8760544
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8760605 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccacttatcgaatggttaaagcattc 8760544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 14582720 - 14582765
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  14582720 caactacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacac 14582765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 24562194 - 24562251
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24562194 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 24562251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 24562260 - 24562368
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  24562260 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 24562359  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  24562360 ctcaccgct 24562368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14375489 - 14375426
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14375489 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaggattcat 14375426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 18799336 - 18799399
Alignment:
Q  47 actcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 111  Q
    ||||||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18799336 actcatgaatgacatgacgcc-cctctaagactcctcgaaaaatgcaactatgcatgtggtacca 18799399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 19449332 - 19449372
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccg 177  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19449332 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccg 19449372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 19467858 - 19467934
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |  ||||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  19467858 ttgaatggttaaagcattcattagggcctaagccctcaccgatttgaacaataaggtgttccaggacatgagtcctc 19467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22798698 - 22798616
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  22798698 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatcagggcataagccctcacc 22798616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24412466 - 24412404
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24412466 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc 24412404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 117)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 42 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29545384 - 29545017
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545384 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 29545285  T
Q  142 tggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacct 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29545284 tggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacct 29545185  T
Q  242 acttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaa 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  29545184 acttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttttacaacatgtatggttaaa-taataaatcatacatcacag 29545087  T
Q  342 ccatcagcaacagtcaac-acccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgct 410  Q
    |||||| ||||| || || |  |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29545086 ccatcaacaacattcgacaattcagcaatccaaccattcagaataatgcataatttaatataactatgct 29545017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 54519965 - 54520231
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54519965 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaatactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 54520064  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520065 cgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 54520164  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactcca 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54520165 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactcca 54520231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 16833151 - 16833535
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16833151 tacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtgccaaacaggaccgaagccctc 16833249  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16833250 accgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 16833349  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |  |     
T  16833350 tgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttag 16833448  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    ||||||  |||  |||||||||||  || ||   ||  ||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16833449 catacaatacagtcatcagcaaca-acatcaattagagatctaacaatccagaataatgcacaattaagtataactatgctcaaaaca 16833535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16331829 - 16331442
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16331829 caactacaaccaacaataaagagtcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa--tatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagc 16331732  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16331731 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctatgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 16331632  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaat 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || || |    
T  16331631 catatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttaatcaacatgtatgattcaataatt 16331533  T
Q  326 aaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
      | |||||||||||  |||||||||||  || ||   ||  || |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16331532 ttagcatacatcacagtcatcagcaaca-acatcaattagagattcaacaatccagaataatgcacaatcaaatataactatgctcaaaaca 16331442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9691644 - 9691319
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9691644 caaccacaaccaacaataaagactcatgcatgacataacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagc 9691546  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9691545 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 9691446  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||    
T  9691445 catatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataaa 9691347  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaac 352  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  9691346 taaatcatacttcacagccatcaacaac 9691319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Original strand, 29550849 - 29551238
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29550849 caactacaaccaacgaccacgactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 29550947  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29550948 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgttgtttatg 29551047  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||| || || ||     
T  29551048 catatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaa-catgaccatgcatacatccttcatatgactccaacttatacaacatgtatgattcaataat 29551146  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  29551147 tacaacatacattacagccatcagcaaca-acatcaaacaatgatccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatgctcaaaaca 29551238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 26 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20377477 - 20377091
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  20377477 caactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcaga-tatgcaattatgcatgtggtaccaaataagaccgaaac 20377379  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377378 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 20377279  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||| || || ||     
T  20377278 catatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataat 20377180  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  20377179 tatagcatacattacagccatcagcaaca-acatcaaacaatgatccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatgctcaaa 20377091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 46 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30597076 - 30596706
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597076 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggt 30596977  T
Q  146 taaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctactt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30596976 taaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctactt 30596878  T
Q  246 gtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc---acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaac 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||   |   || ||||||||||| || ||  |||  | ||||||| ||| |    
T  30596877 gtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactccgaaatccattcaacatgtatgatttaa-taatgtaacatacataacagc 30596781  T
Q  343 catcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  30596780 catcaacaaca-tcaacaaacagtaatccgacaatccagtataatgcacaattaaacataactatgctcaaaacat 30596706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11956835 - 11956443
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11956835 tggcaattacaaccctcaaccaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaacaaacaggaccga 11956737  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11956736 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctccccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgttt 11956638  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaac 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || ||     
T  11956637 atgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattcaat 11956539  T
Q  322 aaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    || || | ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||   | ||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||| ||||||||    
T  11956538 aattatagcatacattacagccatcagcaaca-tcatcaaacagtggttcaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgcccaaaacat 11956443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 97 - 417
Target Start/End: Original strand, 54520256 - 54520576
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgct 195  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54520256 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 54520355  T
Q  196 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  54520356 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactc 54520454  T
Q  296 c-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaat 394  Q
    | |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  54520455 caatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatcacagccatcagcaaca-acaacaaccagcaattcaacaatccagaataatgcacaat 54520553  T
Q  395 ttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | |||| |||||||| |||||||    
T  54520554 taaatataactatgcccaaaaca 54520576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8374165 - 8373895
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8374165 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacaacacctctaagacccctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccga 8374066  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8374065 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgtgaagaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 8373967  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8373966 atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 8373895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32388246 - 32387987
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32388246 accaacaacaaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccg 32388147  T
Q  134 cttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  32388146 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgtt 32388048  T
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32388047 atggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 32387987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 46071347 - 46070961
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46071347 caactacgaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcaga-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 46071249  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46071248 ccttatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcttctccgctgtttatg 46071149  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || || ||     
T  46071148 catatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattcaataat 46071050  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    || | ||||||| ||  ||||||||||||  |  ||  ||   ||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||||||||||||    
T  46071049 tatagcatacattactgccatcagcaaca-acctcaaacaatgatccaacaatccagaataattcataattaaatataactatgctcaaa 46070961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19344391 - 19344104
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344391 tggcaactacaaccaacaa-tcagactcatgcatgacatgatgacaccactaagactcctcaaa-tatccaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 19344294  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19344293 agccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctccgctgttt 19344194  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| |||||||  ||  |||||||||||    
T  19344193 atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatacatacat-ttccatacgactccaattacacaacatgtatg 19344104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48774869 - 48774467
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||            ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  48774869 caactacaaccaacaaccaagactcatgcaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaa 48774770  T
Q  113 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  48774769 acaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcct 48774670  T
Q  212 ctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatg 310  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  48774669 ctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaacaacatg 48774571  T
Q  311 tatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaa-caatccagattaatgcacaatttaatacaactatgc 409  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||| ||  |||||||||||  || ||   ||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  48774570 tatggtt-aataaataaagcatacatctcagtcatcagcaaca-acatcaattagagatccaatcaatccagaataatgcacaattaaatataactatgc 48774473  T
Q  410 tcaaaa 415  Q
    ||||||    
T  48774472 tcaaaa 48774467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 347
Target Start/End: Original strand, 49163087 - 49163399
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49163087 caaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcac 49163184  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatg 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49163185 cgcttttgaatggttcaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaaccaatgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatg 49163283  T
Q  232 cgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| |     
T  49163284 ctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgaatacat-tttcatatgactccgaatttatacaacatgtatgatttaataaatataa 49163381  T
Q  330 catacatcacaaccatca 347  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  49163382 catacattacagccatca 49163399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12725354 - 12725092
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12725354 tacaaccaacaa-tgagacacatgcatgacatgacaacatcactaagac-cctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctc 12725258  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12725257 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacctctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctatttatgcata 12725159  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcca 297  Q
    ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12725158 tgaaatggacccactagtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactcca 12725092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 160 - 413
Target Start/End: Original strand, 3802718 - 3802970
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  3802718 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacat 3802817  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaa 358  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  3802818 acaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatcacagccatcaacaaca-tcaa 3802915  T
Q  359 cacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaa 413  Q
    || |||||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  3802916 caaccagcaattcaacaatccaaaataatgcataattaaatataactatgctcaa 3802970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 50656158 - 50655834
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  50656158 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 50656059  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  50656058 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 50655962  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  50655961 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataaatcatacatcatagccatcagcaatag-caacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 50655863  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  50655862 acaattacataaaactatgctcaacacat 50655834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 160 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 54091840 - 54091585
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54091840 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 54091741  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaac 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |  | ||||||| |||  |||||||||||  || |    
T  54091740 acaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatcagcaaca-acatc 54091643  T
Q  360 acccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    |   ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54091642 aattagagatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 54091585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Original strand, 38742895 - 38743134
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38742895 agactcctcaaa-tatgcaaatttgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctca 38742993  T
Q  175 ccgctgcgaa-caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  38742994 ccgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaac--tgacca 38743091  T
Q  273 tgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||| || || ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  38743092 tgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 38743134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 296
Target Start/End: Original strand, 20187754 - 20187934
Alignment:
Q  114 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20187754 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctct 20187853  T
Q  214 ccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20187854 ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 20187934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9772170 - 9771865
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaag---actcctca--------aaatatgcaattatgcatgtggta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||| ||||||   || |||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  9772170 gtggcaactacaaccaacaaccaagactcatgcaaacgacatgacgacactactaagacaacacctcagactcctcaaatatgcaa-tatgcatgtggta 9772072  T
Q  109 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  9772071 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagggccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtactccaggacatgag 9771972  T
Q  208 tcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatgactccacgtatgca 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||  ||    
T  9771971 tcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaaca 9771874  T
Q  306 acatgtatg 314  Q
    |||||||||    
T  9771873 acatgtatg 9771865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12271574 - 12271344
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  12271574 aaatatgcaaatatgcatgttgtaccaaagaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 12271475  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacat 281  Q
     |||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||     
T  12271474 gcaactagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaa 12271377  T
Q  282 actccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  12271376 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 12271344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 53571404 - 53571085
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  53571404 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagt 53571305  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  53571304 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 53571208  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| |  |||||    
T  53571207 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataacaatgc 53571110  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  53571109 acaattaaatataactatgctcaaa 53571085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 160 - 371
Target Start/End: Original strand, 15374699 - 15374907
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15374699 ggaccgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 15374798  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaac 359  Q
    |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  15374799 acaa-catgaccatgcatacattcttcatatgactccacttatacaacatgtatggtttaataaataaagcatacatttcaaccatca-caaca-tcaac 15374895  T
Q  360 acccagcaatcc 371  Q
    | ||||||||||    
T  15374896 aaccagcaatcc 15374907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 29493527 - 29493715
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  29493527 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 29493626  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29493627 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 29493715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2499212 - 2499032
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  2499212 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 2499113  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2499112 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 2499032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 45611647 - 45611827
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  45611647 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 45611746  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45611747 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 45611827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43724239 - 43724052
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  43724239 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 43724140  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43724139 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 43724052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 287
Target Start/End: Original strand, 3802556 - 3802682
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3802556 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 3802655  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactcca 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3802656 acaa-cttgaccatgcatacatactcca 3802682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 10767737 - 10767917
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  10767737 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 10767836  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10767837 tccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 10767917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21151625 - 21151407
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||||| | |    
T  21151625 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactattac 21151526  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  21151525 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 21151429  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  21151428 ctccacttaaacaacatgtatg 21151407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 28758873 - 28759060
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  28758873 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 28758972  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28758973 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 28759060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50142944 - 50142757
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  50142944 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 50142845  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50142844 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 50142757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3782927 - 3782739
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  3782927 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 3782828  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3782827 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 3782739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 10381918 - 10382101
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10381918 attatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 10382017  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10382018 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 10382101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 10410571 - 10410754
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10410571 attatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 10410670  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10410671 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 10410754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 47121121 - 47121308
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  47121121 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 47121220  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  47121221 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaac--tgaccatgca 47121308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 47128489 - 47128676
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  47128489 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 47128588  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  47128589 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaac--tgaccatgca 47128676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14845343 - 14845155
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||    
T  14845343 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaa 14845244  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||||||| ||   || |||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14845243 ctagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 14845155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54833355 - 54833175
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||| |    
T  54833355 tatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtac 54833256  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54833255 tccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 54833175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27029675 - 27029558
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27029675 tggcaactacaacccatggccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 27029577  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27029576 agccctcaccgcttttgaa 27029558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27031843 - 27031726
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031843 tggcaactacaacccatggccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 27031745  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27031744 agccctcaccgcttttgaa 27031726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Original strand, 18957698 - 18957814
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18957698 caaccaactacaatgaatcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 18957797  T
Q  132 cgcttttgaatggttaa 148  Q
    |||||||||||||||||    
T  18957798 cgcttttgaatggttaa 18957814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Original strand, 18961002 - 18961137
Alignment:
Q  144 gttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctac 243  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  18961002 gttaaagcattcatcgggacataagccctcaccgctgtgaacaacaagtgcttcaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggactcac 18961100  T
Q  244 ttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18961101 ttgtgtatatctacatacaa-cttcaccatgcatacat 18961137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54091929 - 54091821
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54091929 caaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 54091831  T
Q  126 cctcaccgct 135  Q
    ||||||||||    
T  54091830 cctcaccgct 54091821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 20187671 - 20187775
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20187671 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 20187770  T
Q  175 ccgct 179  Q
    |||||    
T  20187771 ccgct 20187775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 135
Target Start/End: Original strand, 3802482 - 3802575
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802482 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Original strand, 15374609 - 15374718
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15374609 caaccacaaccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagt 15374708  T
Q  126 cctcaccgct 135  Q
    ||||||||||    
T  15374709 cctcaccgct 15374718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 17130642 - 17130756
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  17130642 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 17130741  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  17130742 atggttaaagcattc 17130756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14764362 - 14764248
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  14764362 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 14764263  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  14764262 atggttaaagcattc 14764248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 18913940 - 18914069
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcat-gacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  || | ||||||||||    
T  18913940 caaccaacaacaacgactcatgcattgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccct 18914039  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18914040 caccgctaattgaatggttaaagcattcat 18914069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23372108 - 23371994
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  23372108 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 23372009  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  23372008 atggttaaagcattc 23371994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38312382 - 38312268
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||    
T  38312382 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttataga 38312283  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||| |||||    
T  38312282 atggttaaaacattc 38312268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 51300047 - 51300161
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  51300047 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 51300146  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  51300147 atggttaaagcattc 51300161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12034579 - 12034465
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |  | | ||    
T  12034579 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatagagccgaagccctcatctttataga 12034480  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  12034479 atggttaaagcattc 12034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11850860 - 11850722
Alignment:
Q  77 actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |  |||| ||||    
T  11850860 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctca 11850761  T
Q  175 ccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  11850760 ccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 11850722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10597933 - 10597792
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  10597933 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgtcaccactgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 10597834  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  10597833 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 10597792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 14864733 - 14864847
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||    
T  14864733 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttataga 14864832  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||| |||||    
T  14864833 atggttaaaacattc 14864847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 10553822 - 10553932
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  || |||| |||| || | | ||||||    
T  10553822 gactcatgcatgacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccaaagctctcatcgttgtagaatgg 10553921  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  10553922 ttaaagcattc 10553932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19236237 - 19236124
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | ||    
T  19236237 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaaca-atgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttataga 19236139  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  19236138 atggttaaagcattc 19236124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20249368 - 20249254
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| || | | ||    
T  20249368 ctaagactcatgcaggacatgacaactccattaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaaaccctcatcgttataga 20249269  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  20249268 atggttaaagcattc 20249254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 12304694 - 12304809
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||  |||| |||   ||| ||||| | | |    
T  12304694 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgtatgtggtatcaaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcg 12304793  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  12304794 aatggttaaagcattc 12304809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17243923 - 17243796
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||    
T  17243923 caaccaacaacaacgactgatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccct 17243824  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  17243823 caccgctagtcgaatggttaaagcattc 17243796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 18888901 - 18889027
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||    
T  18888901 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctc 18889000  T
Q  130 accgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||    
T  18889001 accgctaatcgaatggttaaagcattc 18889027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18757149 - 18757021
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaa 184  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||| ||||||||||  |||    
T  18757149 atgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcaatcattaggacaaaagtcctcaccgctttgaa 18757050  T
Q  185 caacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  18757049 caacaaggtgttccaggacataagtcctc 18757021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 23174117 - 23174218
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  23174117 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaagaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagca 23174216  T
Q  153 tt 154  Q
    ||    
T  23174217 tt 23174218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6927583 - 6927529
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6927583 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 6927529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24123454 - 24123294
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cagga 118  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |  ||||     
T  24123454 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc-cta-gactcctcaataaatgcaaatatgcacgtggtaccataatcaggg 24123357  T
Q  119 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24123356 ccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 24123294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 17512558 - 17512658
Alignment:
Q  114 caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcct 211  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||||| ||||||    
T  17512558 cagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttcaaggacataagtcct 17512657  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  17512658 c 17512658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11644953 - 11644878
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  11644953 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaggccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 11644878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382994
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16382994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 135
Target Start/End: Original strand, 3802699 - 3802737
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802699 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10390625 - 10390515
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  10390625 gactcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 10390526  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  10390525 ttaaagcattc 10390515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10415734 - 10415624
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  10415734 gactcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 10415635  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  10415634 ttaaagcattc 10415624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10422404 - 10422294
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  10422404 gactcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 10422305  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  10422304 ttaaagcattc 10422294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Original strand, 12419383 - 12419476
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  12419383 atgcaaatatgcatatggtaccataatcagggccgaagccctcactgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 12419476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 42109048 - 42109102
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42109048 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 42109102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2270464 - 2270320
Alignment:
Q  69 ccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcc-ggacc 164  Q
    ||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||     
T  2270464 ccactaagactcctcaaca-atgcac--atgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattcaggaca 2270368  T
Q  165 gaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
     ||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  2270367 taagtcctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 2270320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11305905 - 11305830
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11305905 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-tgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 11305830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31690796 - 31690713
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  31690796 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 31690713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13203715 - 13203653
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  13203715 atgcatgtggtaccataaacaggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcat 13203653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14289206 - 14289086
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |      |||||||||||||||    ||||| |  ||||||||||||      
T  14289206 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcacatgcatgtggtaccattttacagggcataagccctcaccgaa 14289107  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14289106 tttgaatggttaaagcattca 14289086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652830
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 18899963 - 18900065
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagc 151  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  18899963 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagc 18900062  T
Q  152 att 154  Q
    |||    
T  18900063 att 18900065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 19443469 - 19443528
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19443469 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19443528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 158
Target Start/End: Original strand, 17496094 - 17496183
Alignment:
Q  69 ccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 158  Q
    ||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17496094 ccactaagactcctcaaca-atgcac--atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatc 17496183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 12274221 - 12274304
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  12274221 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 12274304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 157
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292765
Alignment:
Q  100 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15955193 - 15955111
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  15955193 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 15955111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 12152895 - 12152970
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  12152895 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccatcaccactttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 12152970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Original strand, 17190795 - 17190896
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  17190795 atgacatgacacc-cctctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccaaattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagca 17190893  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  17190894 ttc 17190896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8583493 - 8583385
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  8583493 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 8583394  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  8583393 ctcaccgct 8583385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8583559 - 8583502
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  8583559 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 8583502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 9532794 - 9532910
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgctttt 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||  ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| |     
T  9532794 ctaagactcatgcaagacatgacctcccccataatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtc 9532893  T
Q  139 gaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||||    
T  9532894 gaatggttaaagcattc 9532910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 264
Target Start/End: Original strand, 12274364 - 12274434
Alignment:
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggac-ctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| | ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  12274364 tccagggcatgagccctccccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaac 12274434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 85
Target Start/End: Original strand, 13342669 - 13342699
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13342669 atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 13342699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13969126 - 13969069
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13969126 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 13969069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13974601 - 13974544
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13974601 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 13974544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 14084443 - 14084500
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14084443 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 14084500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 14084509 - 14084617
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  14084509 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 14084608  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  14084609 ctcaccgct 14084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 14089844 - 14089901
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14089844 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 14089901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 14089910 - 14090018
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  14089910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 14090009  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  14090010 ctcaccgct 14090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18719312 - 18719251
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18719312 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 18719251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 49399385 - 49399442
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  49399385 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 49399442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12356104 - 12356031
Alignment:
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctcca 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  12356104 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttcca 12356031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12362653 - 12362580
Alignment:
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctcca 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  12362653 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttcca 12362580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544308
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 14544308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 12363445 - 12363508
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12363445 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 12363508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 12419556 - 12419600
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  12419556 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 12419600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961517
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 12961517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13037245 - 13037181
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgc-atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  13037245 gtggtaacttcaaccaacaacaaagactcatgcaactacttgacaacaccgctaagactcctcaa 13037181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16823899 - 16823843
Alignment:
Q  121 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  16823899 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 16823843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 83
Target Start/End: Original strand, 17512488 - 17512516
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctc 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17512488 atgacatgacaacaccactaagactcctc 17512516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18756976 - 18756932
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  18756976 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 18756932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 46723639 - 46723611
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctc 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46723639 atgacatgacaacaccactaagactcctc 46723611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 35 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17592733 - 17592352
Alignment:
Q  35 ccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac--cgaagccctcacc 132  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  17592733 ccaacaatgaagactcatgcatgacatgacgacatcacta-gactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggacaccgaagccctcacc 17592635  T
Q  133 gcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592634 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgc 17592535  T
Q  233 gatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatgg-ttaaacaaataaatca 331  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || || |||||||    
T  17592534 aatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccac-tatacaacatgtatggtttcaataattaaatca 17592437  T
Q  332 tacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17592436 tacatcacagccatcagcaaca-tcaacaaacagcagtccaacaatccagaataatgcacaatttaatacaactctgctcaaaaca 17592352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 96 - 417
Target Start/End: Original strand, 14563832 - 14564147
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgct 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14563832 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaaaaactagtgct 14563931  T
Q  196 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactc 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||    
T  14563932 ccaggacatgattcctctccgctgtttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgac----catacatactccatatgactc 14564026  T
Q  296 cacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatt 395  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14564027 cacttatacaacatgtatggttcaataaataaatcatacatcacagccatcagcaaca-tcaacaagcagcaatccaacaatctagaataatgcacaatt 14564125  T
Q  396 taatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14564126 taatacaactatgctctaaaca 14564147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 298
Target Start/End: Original strand, 27272179 - 27272453
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272179 tggcaactacatccaacaacaaagactcatgcatgacatcactacaccactaagaatcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 27272277  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27272278 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtcgagcaaccagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtt 27272377  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccac 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272378 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactccac 27272453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 15643492 - 15643107
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 130  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15643492 acaaccaacaacaaggactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 15643393  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15643392 cctcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 15643294  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || || ||||| |     
T  15643293 gcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattcaataaatatag 15643195  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | ||  ||  |||  |||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  15643194 catacattacagccatcagcaata-tcttcaaacagtgatccaacaatccagaacaatgcacaattaaacataactatgctcaaaacat 15643107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13101382 - 13101091
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13101382 caaccacaatcaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagc 13101283  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13101282 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctccgctgtttatg 13101183  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggtt 317  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  13101182 catatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaacttatacaacatgtatggtt 13101091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32911694 - 32911423
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32911694 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 32911595  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32911594 aagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt 32911496  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32911495 tatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 32911423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 36800485 - 36800754
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  36800485 tggcaattacaacccacaaccaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgccgatatgcatgtggtaccaaacaggaccga 36800583  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36800584 aaccctcaccgcttttgaatggttaaggcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 36800682  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36800683 atgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 36800754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35244188 - 35243943
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35244188 agactcctcaatagatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 35244089  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35244088 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgacca 35243990  T
Q  273 tgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  35243989 tgcatacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaa 35243943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 75 - 390
Target Start/End: Original strand, 11466051 - 11466364
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11466051 agactcctcaacaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 11466149  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
     |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11466150 tcgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccat 11466248  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || | ||||| |||||||  ||  ||||| || || |||||| |||  ||||||     
T  11466249 gcatacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aatagataaagcatacatttcagtcatcaacagcaatcaacaaccaataatccag 11466347  T
Q  374 caatccagattaatgca 390  Q
    ||||||||| |||||||    
T  11466348 caatccagaataatgca 11466364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 45028435 - 45028706
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccg 121  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45028435 tggcaattaccaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacatcactaagacccctcgataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccg 45028534  T
Q  122 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45028535 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgttgtgaacaactagttctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt 45028633  T
Q  222 tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45028634 tatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 45028706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 413
Target Start/End: Original strand, 28292631 - 28293037
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||            ||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  28292631 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggt 28292730  T
Q  108 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatga 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||  |    
T  28292731 accagacaggaccgaagccatcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacaaaa 28292830  T
Q  207 gtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgca 305  Q
    | | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||    
T  28292831 gacatcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccttgcatacaaactccatatgactccacttttaca 28292929  T
Q  306 acatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaac-acccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaac 404  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||  ||  |||    
T  28292930 acatgtatgtttaaa-taacaaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatcacccagaataatgcataattacatgaaac 28293028  T
Q  405 tatgctcaa 413  Q
    |||||||||    
T  28293029 tatgctcaa 28293037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25590402 - 25590024
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590402 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccattaagacccctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 25590304  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  25590303 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacaaaagcactcaccgctgtgaacaactagtgaaccaggacataagtcatc-ccgctgtttatgcatatg 25590205  T
Q  232 cgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  ||| || |||||||| || || |||||||     
T  25590204 aaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccgaatttatacatcatgtatgatttaataaataaaa 25590107  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  ||| |||||| |||||||||   |||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  25590106 catacattacagccatcaacaaca-tcatca-acagtaatccagcaatccagaaagatgcacaattaatcacaattatgctcaaa 25590024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24481734 - 24481410
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  24481734 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 24481635  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  24481634 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 24481538  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  24481537 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataaatcatacatcatagccatcagcaatag-caacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 24481439  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  24481438 acaattacataaaactatgctcaacacat 24481410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Original strand, 27037237 - 27037476
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  27037237 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27037336  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||    
T  27037337 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactc 27037434  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||| |||| |||| ||  ||||||||||| || || ||||||    
T  27037435 catgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataa 27037476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 319
Target Start/End: Original strand, 34043 - 34274
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||    
T  34043 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgttgagcaa 34142  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||    
T  34143 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactc 34240  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  34241 catgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 34274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Original strand, 1067094 - 1067413
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1067094 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 1067193  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  1067194 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 1067290  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  1067291 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 1067388  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  1067389 acaattaaataaaactatgctcaaa 1067413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30196649 - 30196330
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  30196649 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagt 30196550  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  30196549 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 30196453  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| |  |||||    
T  30196452 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataacaatgc 30196355  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  30196354 acaattaaatataactatgctcaaa 30196330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22013266 - 22013065
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22013266 agacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 22013167  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22013166 ccgctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 22013069  T
Q  273 tgca 276  Q
    ||||    
T  22013068 tgca 22013065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11360374 - 11360059
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11360374 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11360275  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatg 291  Q
     |||||||||   || |||| |||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || || ||||||| ||    
T  11360274 actccaggaccgaagccctcaccgctgttt---tatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtg 11360181  T
Q  292 actccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgca 390  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | |||||||    
T  11360180 actccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgca 11360083  T
Q  391 caatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  11360082 caattaaatataactatgctcaaa 11360059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Original strand, 1061711 - 1062030
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |    
T  1061711 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactact 1061810  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  1061811 actccaggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 1061907  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  1061908 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 1062005  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  1062006 acaattaaataaaactatgctcaaa 1062030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24426974 - 24426755
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  24426974 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 24426875  T
Q  194 ctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatg 291  Q
    |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||    
T  24426874 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatatg 24426778  T
Q  292 actccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  24426777 actccacttaaacaacatgtatg 24426755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2386062 - 2385836
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaaca 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||    
T  2386062 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagca 2385963  T
Q  187 actagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatact 284  Q
    |||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||    
T  2385962 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-act 2385866  T
Q  285 ccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  2385865 ccatatgactccacttaaacaacatgtatg 2385836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 21604757 - 21604944
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  21604757 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 21604856  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21604857 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 21604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4071679 - 4071496
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4071679 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 4071580  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4071579 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 4071496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 4077420 - 4077600
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||| |    
T  4077420 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgctgttgagcaactagtac 4077519  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4077520 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 4077600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 20850187 - 20850370
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  20850187 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 20850286  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20850287 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 20850370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44091221 - 44091003
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  44091221 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcattgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 44091122  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  44091121 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 44091025  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  44091024 ctccacttaaacaacatgtatg 44091003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 31828605 - 31828793
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  31828605 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31828704  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31828705 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 31828793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 31833957 - 31834145
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  31833957 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31834056  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31834057 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 31834145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36984705 - 36984517
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  36984705 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 36984606  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36984605 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 36984517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Original strand, 27729508 - 27729726
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  27729508 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 27729607  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    || ||| |   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  27729608 tctagggccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtga 27729704  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  27729705 ctccacttaaacaacatgtatg 27729726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 71613 - 71522
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  71613 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 71522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Original strand, 35585355 - 35585438
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35585355 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 35585438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 9467 - 9581
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  9467 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 9566  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  9567 atggttaaagcattc 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Original strand, 26884097 - 26884212
Alignment:
Q  41 actaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | |    
T  26884097 actaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggggccctcaccgttatag 26884196  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  26884197 aatggttaaagcattc 26884212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19663056 - 19662942
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  19663056 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 19662957  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  19662956 atggttaaagcattc 19662942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27211211 - 27211097
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||    
T  27211211 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttataga 27211112  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||| |||||    
T  27211111 atggttaaaacattc 27211097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28971478 - 28971337
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  28971478 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 28971379  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||| |||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  28971378 tcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 28971337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10685856 - 10685741
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |    
T  10685856 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 10685757  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  10685756 aatggttaaagcattc 10685741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 29280886 - 29281000
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |  | | ||    
T  29280886 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatctttataga 29280985  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  29280986 atggttaaagcattc 29281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21133453 - 21133311
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  21133453 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtagtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 21133354  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  21133353 ctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 21133311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6261778 - 6261664
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| | | ||    
T  6261778 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaaaactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaaaccctcaccgttataga 6261679  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  6261678 atggttaaagcattc 6261664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 24660405 - 24660576
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||| | | ||||||||||  |  | ||||    
T  24660405 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaaca-atgcgactatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcagtggatattga 24660503  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24660504 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24660576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Original strand, 9241278 - 9241347
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  9241278 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 9241347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 20260769 - 20260884
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |    
T  20260769 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcg 20260868  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  20260869 aatggttaaagcattc 20260884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Original strand, 23062462 - 23062564
Alignment:
Q  58 acatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcatt 154  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23062462 acatgacaacacttctaagactcctcaacaagtgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatt 23062561  T
Q  155 cat 157  Q
    |||    
T  23062562 cat 23062564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 23269133 - 23269259
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | |  ||||| || ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  23269133 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcttcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccct 23269232  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23269233 caccgctatcgaatggttaaagcattc 23269259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 23276002 - 23276128
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | |  ||||| || ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  23276002 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcttcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccct 23276101  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23276102 caccgctatcgaatggttaaagcattc 23276128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 71520 - 71428
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  71520 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 71428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21124105 - 21123991
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |  ||||||    
T  21124105 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaattcgactatgcatgtggtaccattttacagagcagaagccctcactgaatttgaa 21124006  T
Q  142 tggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||    
T  21124005 tggttaaagcattca 21123991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 21907182 - 21907309
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  21907182 caaccaactacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 21907281  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  21907282 caccgctaatcgaatggttaaaacattc 21907309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 23263917 - 23264043
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| || ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  23263917 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccct 23264016  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||    
T  23264017 caccactatcgaatgattaaagcattc 23264043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21074209 - 21074096
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaa 141  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||    
T  21074209 gactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaa 21074110  T
Q  142 tggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||    
T  21074109 tggttaaagcattc 21074096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22796776 - 22796682
Alignment:
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctctccgct 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  22796776 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattccggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctcaccgct 22796682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38931805 - 38931652
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagc 125  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||   ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||   ||||| | |||||    
T  38931805 tacaaccaacaacaatgactcatgcaactactcgacaacaccgctaagactcctcaaca-atgcgacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagc 38931707  T
Q  126 cctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  38931706 cctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 38931652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19649743 - 19649660
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19649743 agactcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 19649660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Original strand, 23877772 - 23877852
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23877772 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactccccgacaattgcaactatgcatgtggtacca 23877852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 25267199 - 25267320
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  25267199 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 25267298  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  25267299 gtgttccaggacatgagtcctc 25267320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 6482257 - 6482382
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctc 129  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| |    
T  6482257 aaccaacaacaacgactcatgcaagacatgacattccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccac 6482356  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  6482357 accgctgtcgaatggttaaagcattc 6482382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8890121 - 8890027
Alignment:
Q  121 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  8890121 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 8890027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 19035478 - 19035598
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  ||||||| | |    
T  19035478 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaagg 19035577  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19035578 tgttccaggacatgagtcctc 19035598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105640
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 2105640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 22860301 - 22860420
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  ||||||  |||    
T  22860301 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatgttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaataagt 22860400  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  22860401 gttccaggacacgagtcctc 22860420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724095
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 20724095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 6485724 - 6485849
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctc 129  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| |    
T  6485724 aaccaacaacaacgactcatgcaagacatgaccttccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccac 6485823  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  6485824 accgctgtcgaatggttaaagcattc 6485849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 17633770 - 17633890
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |      |||||||||||||||    ||||| | |||| || |||||      
T  17633770 gactcatgcactgacatgacgacaccactaagactcctcaacaaatgcaactatacacatgcatgtggtaccattttacagggcagaagtccccaccgaa 17633869  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17633870 tttgaatggttaaagcattca 17633890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 211
Target Start/End: Original strand, 20648069 - 20648189
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  |||||| |  |    
T  20648069 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaa 20648168  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcct 211  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  20648169 gtgttccaggacatgagtcct 20648189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22809944
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccatatccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 22809944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 200619 - 200727
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  200619 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 200718  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  200719 ctcaccgct 200727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 6744589 - 6744532
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  6744589 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 6744532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22013329 - 22013284
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22013329 caactacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 22013284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 23062590 - 23062667
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |||| |||||||||||| |||||    
T  23062590 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgaatcctc 23062667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25107648 - 25107529
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactag- 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | || ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||  ||||||| ||     
T  25107648 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattaaatggttaaagcattca-cagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaagg 25107550  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  25107549 tgttccaggacatgagtcctc 25107529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20914513 - 20914430
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||    
T  20914513 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcacc 20914430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 151
Target Start/End: Original strand, 22703489 - 22703545
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 151  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22703489 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctttagaatggttaaagc 22703545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21133266 - 21133222
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21133266 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 21133222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23169499 - 23169389
Alignment:
Q  73 taagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaag 168  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  23169499 taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaag 23169400  T
Q  169 ccctcaccgct 179  Q
     ||||||||||    
T  23169399 tcctcaccgct 23169389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23580756 - 23580646
Alignment:
Q  73 taagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaag 168  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  23580756 taagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaag 23580657  T
Q  169 ccctcaccgct 179  Q
     ||||||||||    
T  23580656 tcctcaccgct 23580646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 24658773 - 24658836
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24658773 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 24658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28971292 - 28971248
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  28971292 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 28971248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 547 - 810
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  547 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacatcactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 646  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctctgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 746  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatact 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  747 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatact 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 132)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Original strand, 12461445 - 12461836
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12461445 tggcaactacaaccaatgagagagactcatgcatgacatgatgacaccattaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 12461543  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  12461544 agccctcaccgcatttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcattcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagccctc-ccgctgttt 12461642  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaac 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||     
T  12461643 atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaat 12461741  T
Q  322 aaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12461742 aaataaatcatacattacagccatcagcaaca-tcaataaccagcaattcagcaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 12461836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16844110 - 16843723
Alignment:
Q  28 actacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccc 127  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844110 actacaaccaacaacagagactcatgcatgacatgacgacacccctaagactcctcaataaatgca-ttatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccc 16844012  T
Q  128 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16844011 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgca 16843913  T
Q  228 tatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaata 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| ||||||||||| || || |||||    
T  16843912 tatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatgattcaataaata 16843814  T
Q  327 aatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
     | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||  |||||||||| ||||  ||||||||||| || | || |||||||| |||||    
T  16843813 tagcatacattacaaccatcagcaaca-tcatcaaacagtgatccaacaatacagaacaatgcacaattaaacataagtatgctcacaacat 16843723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 23520937 - 23521320
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23520937 tacacccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacatcactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctc 23521034  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23521035 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcata 23521133  T
Q  230 tgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaa 328  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  23521134 tgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattctccatatgactccaatttatacaacatgtatggttcaataaatata 23521232  T
Q  329 tcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
     ||||||| ||| ||||||||| || ||| ||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23521233 gcatacattacatccatcagcagca-tcatcaaacagtgatccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 23521320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Original strand, 19439249 - 19439508
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19439249 accaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccg 19439348  T
Q  134 cttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |     
T  19439349 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatc-ccgctgtttatgcatattct 19439447  T
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19439448 atggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 19439508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 395
Target Start/End: Original strand, 13019645 - 13020004
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13019645 accaacaacaaagactcatgcatgacatgacgataccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccg 13019744  T
Q  134 cttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  13019745 cttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgtt 13019843  T
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatca 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| | ||    
T  13019844 atggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactccgaatttattcaacatgtatgatttaataaatataaca 13019941  T
Q  332 tacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatt 395  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  13019942 tacattacagccatcaacaaca-tcaacaaccagtaatccagcaatccagaaagatgcacaatt 13020004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Original strand, 46174303 - 46174547
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46174303 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 46174402  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  46174403 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-catgaccat 46174501  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  46174502 gcatacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggttaa 46174547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 89 - 296
Target Start/End: Original strand, 46649762 - 46649967
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46649762 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgtgaacaac 46649861  T
Q  189 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccat 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  46649862 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-cat 46649959  T
Q  289 atgactcc 296  Q
    ||||||||    
T  46649960 atgactcc 46649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17468436 - 17468226
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  17468436 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttga 17468337  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatac 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  17468336 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcatacaaac 17468239  T
Q  284 tccatatgactcc 296  Q
    ||||| |||||||    
T  17468238 tccatgtgactcc 17468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 296
Target Start/End: Original strand, 17584778 - 17584988
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  17584778 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttga 17584877  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatac 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  17584878 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcatacaaac 17584975  T
Q  284 tccatatgactcc 296  Q
    ||||| |||||||    
T  17584976 tccatgtgactcc 17584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2388750 - 2388547
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2388750 agactcctcaaa-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 2388652  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2388651 ccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccat 2388554  T
Q  274 gcataca 280  Q
    |||||||    
T  2388553 gcataca 2388547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 89 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13964182 - 13963943
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  13964182 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 13964083  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||    
T  13964082 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactc 13963985  T
Q  286 catatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataa 327  Q
    ||| |||| |||| ||  ||||||||||| || || ||||||    
T  13963984 catgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataa 13963943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40923097 - 40922773
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  40923097 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagt 40922998  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  40922997 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 40922901  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  40922900 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataaatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 40922802  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  40922801 acaattacataaaactatgctcaacacat 40922773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20019855 - 20019641
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  20019855 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 20019756  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
     |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  20019755 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcatacaa 20019658  T
Q  282 actccatatgactccac 298  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20019657 actccatgtgactccac 20019641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Original strand, 49158722 - 49158966
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49158722 agactcctcaaa-tatgcaat-atgcatgtggtaccaaacatgaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctca 49158819  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  49158820 ccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 49158917  T
Q  273 tgc-atacatactccatat-gactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| || || |||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||    
T  49158918 tgcaatgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatggttaa 49158966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 37285201 - 37285388
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  || |||    
T  37285201 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagctctcaccgctgttgagcaa 37285300  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37285301 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 37285388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2026399 - 2026079
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  2026399 attatgcatgtggtaccaatcgggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 2026300  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   ||  ||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  2026299 actccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 2026203  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  2026202 gactccaattaatacaacatgtgtggttcaataaataaatcatacatcatagtcatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 2026104  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  2026103 acaattaaatataactatgctcaaa 2026079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30271890 - 30271639
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30271890 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacat 30271792  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaa 358  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||||||||||| || || ||||| | |||||||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  30271791 acaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattcaataaatataacatacat-tcaagcatcaacaaca-tcaa 30271695  T
Q  359 cacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  30271694 caaccagcaatccagcaatccaaaataattcacaattaaatataactatgctcaaa 30271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11899482 - 11899280
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  11899482 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11899383  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||    
T  11899382 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatatga 11899286  T
Q  293 ctccac 298  Q
    ||||||    
T  11899285 ctccac 11899280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 11339770 - 11339950
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  11339770 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11339869  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11339870 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 11339950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26113928 - 26113748
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  26113928 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26113829  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26113828 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 26113748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 2438876 - 2439063
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  2438876 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 2438975  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  2438976 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaac--tgaccatgca 2439063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18437339 - 18437137
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  18437339 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcttcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18437240  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||    
T  18437239 tccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatatga 18437143  T
Q  293 ctccac 298  Q
    ||||||    
T  18437142 ctccac 18437137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11299828 - 11299646
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11299828 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11299729  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11299728 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 11299646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11308192 - 11308010
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11308192 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11308093  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11308092 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 11308010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 21757356 - 21757514
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctaca 258  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21757356 ggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 21757455  T
Q  259 tacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21757456 tacaac--tgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatggttaa 21757514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8197374 - 8197154
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8197374 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 8197275  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  8197274 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 8197178  T
Q  291 gactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||||| ||  |||||||||||    
T  8197177 gactccacttaaacaacatgtatg 8197154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5187423 - 5187197
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  5187423 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 5187324  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatact 284  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| || || |||    
T  5187323 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-act 5187227  T
Q  285 ccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  5187226 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 5187197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 11879066 - 11879246
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  11879066 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11879165  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11879166 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaac--tgaccatgca 11879246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17726505 - 17726325
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |    
T  17726505 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgttgagcaactagtac 17726406  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17726405 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 17726325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 1317758 - 1317945
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  1317758 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1317857  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1317858 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 1317945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26090130 - 26089943
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  26090130 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26090031  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26090030 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 26089943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40684942 - 40684755
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  40684942 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 40684843  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40684842 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 40684755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 642549 - 642718
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||| |    
T  642549 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtac 642648  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaa 263  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  642649 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 642718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 49150577 - 49150765
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  49150577 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 49150676  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49150677 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 49150765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 49157267 - 49157455
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  49157267 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 49157366  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49157367 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 49157455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26120541 - 26120361
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  26120541 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcacgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26120442  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  26120441 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaac--tgaccatgca 26120361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 32627396 - 32627576
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  32627396 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 32627495  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| ||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32627496 tccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 32627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 42058546 - 42058729
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  42058546 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 42058645  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42058646 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 42058729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 749835 - 750022
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||    
T  749835 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 749934  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  749935 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 750022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48988100 - 48987913
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||    
T  48988100 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaa 48988001  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48988000 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 48987913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13453909 - 13453751
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctaca 258  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13453909 ggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 13453810  T
Q  259 tacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  13453809 tacaac--tgaccatgcatacaaacttcatgtgactccacttaaataacatgtatggttaa 13453751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 2281078 - 2281266
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  2281078 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 2281177  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgc--tgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2281178 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 2281266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Original strand, 33404652 - 33404854
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  33404652 tatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccgtcatcgcttttgaatggttaaagcattcataaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 33404751  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    || |||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||    
T  33404752 tctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatatga 33404848  T
Q  293 ctccac 298  Q
    ||||||    
T  33404849 ctccac 33404854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 37379954 - 37380089
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctaca 258  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37379954 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 37380053  T
Q  259 tacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37380054 tacaac--tgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 37380089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8213445 - 8213299
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8213445 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 8213346  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatgga 238  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  8213345 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 30271974 - 30271871
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30271974 tacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcgata-atgcagttatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctc 30271877  T
Q  130 accgct 135  Q
    ||||||    
T  30271876 accgct 30271871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14320798 - 14320683
Alignment:
Q  41 actaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | |    
T  14320798 actaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatag 14320699  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  14320698 aatggttaaagcattc 14320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 19145500 - 19145629
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccc 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||||    
T  19145500 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccc 19145599  T
Q  128 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19145600 tcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 19145629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 20744899 - 20745028
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccc 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||||    
T  20744899 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccc 20744998  T
Q  128 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20744999 tcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 20745028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 147012 - 147126
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||    
T  147012 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttataga 147111  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  147112 atggttaaagcattc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 2965876 - 2965990
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  2965876 ctaagactcatgcaggacatgacaaccccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 2965975  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  2965976 atggttaaagcattc 2965990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 32771473 - 32771614
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||    
T  32771473 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccc 32771572  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  32771573 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 32771614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 14565653 - 14565767
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||    
T  14565653 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttataga 14565752  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  14565753 atggttaaagcattc 14565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 15166719 - 15166833
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  15166719 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 15166818  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  15166819 atggttaaagcattc 15166833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 18871811 - 18871925
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  18871811 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 18871910  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  18871911 atggttaaagcattc 18871925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 46624790 - 46624962
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  46624790 gactcatgcaatgacatcacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccgatttacagggcagaagccctcaccggatattga 46624889  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  46624890 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 46624962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 15838732 - 15838810
Alignment:
Q  216 gctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15838732 gctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 15838810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30602970 - 30602854
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctac 257  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30602970 ggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 30602871  T
Q  258 atacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  30602870 atacaac--tgaccatgca 30602854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 3327778 - 3327919
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  3327778 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 3327877  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  3327878 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 3327919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29182283 - 29182169
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | | ||    
T  29182283 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagggccgaagccctcatctttataga 29182184  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  29182183 atggttaaagcattc 29182169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 417
Target Start/End: Original strand, 12454276 - 12454380
Alignment:
Q  312 atggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctc 411  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12454276 atggttcaataaataaatcatacattacagccatcagcaaca-tcaataaccagcaattcagcaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctc 12454374  T
Q  412 aaaaca 417  Q
    ||||||    
T  12454375 aaaaca 12454380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20907591 - 20907478
Alignment:
Q  43 taagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||| || | | |||    
T  20907591 taagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagtcgaagccctcatcgttatagaa 20907492  T
Q  142 tggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||    
T  20907491 tggttaaagcattc 20907478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23666059 - 23665944
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |    
T  23666059 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcg 23665960  T
Q  140 aatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||    
T  23665959 aatggttaaagcattc 23665944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Original strand, 31154314 - 31154426
Alignment:
Q  44 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | | ||||    
T  31154314 aagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaggccctcaccgttatagaat 31154413  T
Q  143 ggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||    
T  31154414 ggttaaagcattc 31154426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37244506 - 37244364
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  37244506 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 37244407  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||| |  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  37244406 ctcaccgttttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 37244364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Original strand, 29795675 - 29795746
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29795675 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29795746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Original strand, 29799494 - 29799565
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29799494 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29799565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10897415 - 10897301
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||    
T  10897415 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttataga 10897316  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  10897315 atggttaaagcattc 10897301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 16008029 - 16008143
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  16008029 ctaagactcatgtaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 16008128  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  16008129 atggttaaagcattc 16008143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 16089966 - 16090080
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  | | ||    
T  16089966 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcacctttataga 16090065  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||| |||||    
T  16090066 atggttaaaccattc 16090080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 18606801 - 18606926
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |    
T  18606801 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccac 18606900  T
Q  130 accgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  18606901 accgctgtcgaatggttaaagcattc 18606926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3858586 - 3858473
Alignment:
Q  43 taagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||    
T  3858586 taagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaa 3858487  T
Q  142 tggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||    
T  3858486 tggttaaagcattc 3858473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Original strand, 13678217 - 13678345
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  13678217 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 13678316  T
Q  130 accgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13678317 acctctaattgaatggttaaagcattcat 13678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14266232 - 14266118
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | || ||||||||||  ||||||    
T  14266232 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaggccctcaccgaatttgaa 14266133  T
Q  142 tggttaaagcattca 156  Q
    ||||||| |||||||    
T  14266132 tggttaacgcattca 14266118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18958627 - 18958485
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||  ||| |    
T  18958627 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcatgacataagtc 18958528  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  18958527 ctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 18958485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Original strand, 11302797 - 11302868
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11302797 ctaagactcatgcaagacatgaaaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 11302868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21232274 - 21232149
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||| | |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||     
T  21232274 accaacaacaacgactcatgtaatgccatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc- 21232176  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21232175 ccgctaatgaatggttaaagcattcat 21232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 2464258 - 2464372
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||   |||||| |||| || | | ||    
T  2464258 ctaagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagtcgaagctctcatcgttataga 2464357  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  2464358 atggttaaagcattc 2464372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15086120 - 15085979
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  15086120 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggctgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 15086021  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| |||| ||||| |||||||    
T  15086020 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccatgacataagtcctc 15085979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Original strand, 19151802 - 19151930
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccc 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||||    ||||| | ||||||     
T  19151802 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacacgacaacaccactaagactccttaacaaatgtgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccg 19151901  T
Q  128 tcaccgcttttgaatggttaaagcattca 156  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19151902 tcaccgaatttgaatggttaaagcattca 19151930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Original strand, 20751201 - 20751329
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccc 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||  | ||||||||||||||||    ||||| | ||||||     
T  20751201 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacacgacaacaccactaagactccttaacaaatgtgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccg 20751300  T
Q  128 tcaccgcttttgaatggttaaagcattca 156  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20751301 tcaccgaatttgaatggttaaagcattca 20751329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14179185 - 14179066
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  14179185 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 14179086  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  14179085 gttccaggacatgagtcctc 14179066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 37379914 - 37379978
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37379914 agactcctcaaa-tatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttga 37379978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20328467 - 20328365
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| | |||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  20328467 atgacatgacaacacctctaagacccctcgacaaatgctactatgcatgtggtaccatatacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagca 20328368  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  20328367 ttc 20328365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14255956 - 14255841
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | || ||||||||||  ||||||    
T  14255956 gactcatgcaataacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaggccctcaccgaatttgaa 14255857  T
Q  142 tggttaaagcattcat 157  Q
    || |||||| ||||||    
T  14255856 tgcttaaagtattcat 14255841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46682370 - 46682249
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  46682370 atgcatttggtaccaatttacaggacagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 46682271  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  46682270 gtgttccaggacatgagtcctc 46682249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13454008 - 13453884
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcat--gacatgacaacaccactaagact---cctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 116  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||    ||| | | |   ||| ||||||||||||||||| |||    
T  13454008 gtggcatctacaaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaaatatgcatgtggtaccaaccag 13453909  T
Q  117 gaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  13453908 gaccgaagccctcaccgctgttgaa 13453884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432051
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14432051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15098143 - 15098023
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  15098143 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 15098044  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcct 211  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  15098043 gtgttccaggacatgagtcct 15098023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15338888
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15338888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 85
Target Start/End: Original strand, 15455328 - 15455379
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15455328 accaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaa 15455379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Original strand, 15622161 - 15622212
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15622161 atgcaaatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgctgttga 15622212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723330
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15723330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Original strand, 21757257 - 21757381
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcat--gacatgacaacaccactaagact---cctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 116  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||  |||||||    ||| | | |   ||| ||||||||||||||||| |||    
T  21757257 gtggcatctacaaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaaatatgcatgtggtaccaaccag 21757356  T
Q  117 gaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  21757357 gaccgaagccctcaccgctgttgaa 21757381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962852
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 35962852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26289952 - 26289824
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |  |||    
T  26289952 atgcaattatgcatgtggtaccataatcaaggccaaagccctcaccgttgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgttttgaa 26289853  T
Q  185 caacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  26289852 caacaaggtgttccaggacataagtcctc 26289824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 10519804 - 10519955
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  10519804 gacaacaccactaagactcctcgaca-atgcac--atgcatgtggtaccaatttacagggaagaagccctcaccggatattaaatggttaaagcattcat 10519900  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |  ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  10519901 cagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctc 10519955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 417
Target Start/End: Original strand, 23518012 - 23518061
Alignment:
Q  368 atccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23518012 atccaacaatccagaataatgcacaattaaatataactatgctcaaaaca 23518061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 82254 - 82133
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  82254 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcactcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 82155  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  82154 gtgttccaggacatgagtcctc 82133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220227
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 11220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15104520 - 15104399
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |    
T  15104520 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 15104421  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  15104420 gtgttccagaacatgagtcctc 15104399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30602990 - 30602946
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30602990 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 30602946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11384056 - 11383955
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  11384056 atgacatgacacc-ccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagca 11383958  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  11383957 ttc 11383955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11390544 - 11390443
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  11390544 atgacatgacacc-ccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagca 11390446  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  11390445 ttc 11390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15711168 - 15711106
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15711168 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcat 15711106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109181
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16109181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16575666 - 16575546
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattat------gcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |||      |||||||||||||    ||||| | |||||||||||||      
T  16575666 gactcatgcaatgacatgacaacaccactatgactcctcaacaaatgcgactatacacatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaa 16575567  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16575566 tttgaatggttaaagcattca 16575546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 16589996 - 16590116
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |      |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||      
T  16589996 gactcatgcaatgacatgacaacaccactatgactcctcaacaaatgcgactatacacatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaa 16590095  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16590096 tttgaatggttaaagcattca 16590116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 14421299 - 14421415
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgctttt 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | || |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| |     
T  14421299 ctaagactcatgcaagacatgacctcccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtc 14421398  T
Q  139 gaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||||    
T  14421399 gaatggttaaagcattc 14421415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15437783 - 15437663
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||  ||||||| | |    
T  15437783 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgctttgaacaacaagg 15437684  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || || |||||||||||||||    
T  15437683 tgttctaggacatgagtcctc 15437663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16952418 - 16952293
Alignment:
Q  91 gcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaa 187  Q
    |||| |||||||| ||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||  ||||||    
T  16952418 gcaaatatgcatgcggtaccatattcagggccgaagacctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcttcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 16952319  T
Q  188 cta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | | ||| |||| ||||| |||||||    
T  16952318 caaggtgttccatgacataagtcctc 16952293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Original strand, 11308933 - 11309073
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatta------tgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc- 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | | |||||| ||      ||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||      
T  11308933 gactcatgcaatggcatgacaacaccaccaagactcctcgacaaatgcaactagacacatgcatgtggtaccattttacaggacataagccctcaccgga 11309032  T
Q  135 ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  11309033 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 11309073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Original strand, 11312241 - 11312381
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatta------tgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc- 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | | |||||| ||      ||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||      
T  11312241 gactcatgcaatggcatgacaacaccaccaagactcctcgacaaatgcaactagacacatgcatgtggtaccattttacaggacataagccctcaccgga 11312340  T
Q  135 ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  11312341 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 11312381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 1612623 - 1612685
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1612623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcat 1612685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 6411821 - 6411883
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  6411821 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcat 6411883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 209
Target Start/End: Original strand, 12547171 - 12547288
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | |    
T  12547171 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaatccctcaccggatattgaatggttaaagcatttatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 12547270  T
Q  192 tgctccaggacatgagtc 209  Q
    || |||||||||||||||    
T  12547271 tgttccaggacatgagtc 12547288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281760
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14281760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 23442201 - 23442321
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattat------gcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| | |||      ||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||      
T  23442201 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagagtcctcatcaaatgcgactatacacatgcatgtggtaccaatttacagggcataagccctcaccgaa 23442300  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23442301 tttgaatggttaaagcattca 23442321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 4279875 - 4279932
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4279875 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 4279932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 4279941 - 4280049
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  4279941 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 4280040  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  4280041 ctcaccgct 4280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Original strand, 19599844 - 19599901
Alignment:
Q  99 gcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 154  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19599844 gcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatt 19599901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 19616207 - 19616264
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19616207 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 19616264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 19616273 - 19616381
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  19616273 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 19616372  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  19616373 ctcaccgct 19616381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36306233 - 36306152
Alignment:
Q  77 actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  36306233 actcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaagaccgaagccctcaccactagtcgaatggttaaagcattc 36306152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20019922 - 20019882
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20019922 acaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 20019882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41783353 - 41783304
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactc 80  Q
    |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41783353 caaccatcaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactc 41783304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16952248 - 16952204
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16952248 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 16952204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18958440 - 18958396
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  18958440 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 18958396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26289779 - 26289735
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  26289779 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 26289735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37244319 - 37244275
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  37244319 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 37244275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 46174234 - 46174285
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  46174234 atgtggcaactacaaccaacaattatgactcatgcaaatgatatgacaacac 46174285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 54
Target Start/End: Original strand, 49149811 - 49149843
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgc 54  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49149811 gtggcaactacaaccaacaaccaagactcatgc 49149843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29597042 - 29596655
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29597042 caactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcaga-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 29596944  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29596943 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgatgccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 29596844  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||| || || ||     
T  29596843 catatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataat 29596745  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaa 415  Q
    || | ||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  29596744 tatagcatacattacagccatcagcaaca-acatcaaacaatgatccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatgctcaaaa 29596655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Original strand, 49327970 - 49328229
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49327970 accaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 49328069  T
Q  134 cttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  49328070 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgct 49328168  T
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  49328169 atggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattct-catatgactcc 49328229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 413
Target Start/End: Original strand, 4231098 - 4231504
Alignment:
Q  22 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||            ||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  4231098 gtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggt 4231197  T
Q  108 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatga 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  4231198 accagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatga 4231297  T
Q  207 gtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgca 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||    
T  4231298 gtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttctaca 4231396  T
Q  306 acatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaac-acccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaac 404  Q
    ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||  ||  |||    
T  4231397 acatgtatgcttaaa-taaccaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatcacccagaataatgcataattacatgaaac 4231495  T
Q  405 tatgctcaa 413  Q
    |||||||||    
T  4231496 tatgctcaa 4231504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Original strand, 21920726 - 21921115
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  21920726 caactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcaga-tatgcaattatgcatgtggtaccaaaaaagaccgaaac 21920824  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21920825 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtactccaggacataagtcctctccgctgtttatg 21920924  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||| || || ||     
T  21920925 catatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaataatacaacatgtatgattcaataat 21921023  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    || | ||||||| | | ||||||||||||  || ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  21921024 tatagcatacattatagccatcagcaaca-acatcaaacaatgatccaacaatctagaataatgcataattaaatataactatgctcaaaaca 21921115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 360
Target Start/End: Original strand, 21962982 - 21963267
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21962982 agactccccaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 21963081  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21963082 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgacca 21963180  T
Q  273 tgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaaca 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||   | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21963181 tgcatacaaactccatatgactccacttctacaacatgcatgtttaaa-tgacaaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaaca 21963267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Original strand, 47484043 - 47484362
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47484043 caaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcac 47484141  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47484142 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatg 47484240  T
Q  232 cgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaat 329  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| |     
T  47484241 ctatagacccactagtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccgaatttatacaacatgtatgatttaataaatataa 47484338  T
Q  330 catacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||    
T  47484339 catacattacagccatcaacaaca 47484362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 110 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29602394 - 29602088
Alignment:
Q  110 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29602394 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtc 29602295  T
Q  210 ctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgt-atgcaaca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  | || |||||    
T  29602294 ctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaataatacaaca 29602196  T
Q  309 tgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatg 408  Q
     ||||| || || || || | ||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  29602195 cgtatgattcaataattatagcatacattacagccatcagcaaca-acatcaaacaatgatccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatg 29602097  T
Q  409 ctcaaaaca 417  Q
    |||||||||    
T  29602096 ctcaaaaca 29602088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 298
Target Start/End: Original strand, 42626177 - 42626399
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42626177 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 42626276  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42626277 ccactgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccat 42626374  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccac 298  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  42626375 gcatacaaactccatgtgactccac 42626399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 36614870 - 36615118
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36614870 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgaagacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacagggccgaaaccctca 36614969  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36614970 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 36615068  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36615069 gcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 36615118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 43088326 - 43088574
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43088326 caaccaacatcaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 43088425  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43088426 ccgcttttgaatggttaaagtattcattaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 43088524  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43088525 gcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa-attgaccatgcatacat 43088574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 319
Target Start/End: Original strand, 20570739 - 20570963
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaa-caactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  20570739 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctctccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtac 20570838  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |||    
T  20570839 tccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaaactccatgtga 20570936  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    |||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  20570937 ctccacttaaacaacatgtatgattaa 20570963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 414
Target Start/End: Original strand, 39094317 - 39094636
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  39094317 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 39094416  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  39094417 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 39094513  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||| || |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  39094514 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaat-aatcatacatcatagccatcagtaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 39094611  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaa 414  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  39094612 acaattaaatataactatgctcaaa 39094636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20077033 - 20076747
Alignment:
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20077033 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcat 20076934  T
Q  229 atgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaa 328  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||    
T  20076933 atgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacat-gaccatgcatacatactccatatgactccacttaaataacatgtatggttaat-aaataaa 20076836  T
Q  329 tcatacatcac-aaccatcagcaacagtcaacacc-cagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaa 415  Q
     |||||||  | ||||||||| |||| ||| ||   |||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20076835 gcatacatttccaaccatcagtaacattcatcaatgcagcaatccaatcatccagaacaatgcacaattaaatataactatgcttaaaa 20076747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 20292657 - 20292858
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20292657 agacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggatcgaagccctca 20292756  T
Q  175 ccgc-tgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    |||| |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20292757 ccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgacca 20292854  T
Q  273 tgca 276  Q
    ||||    
T  20292855 tgca 20292858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18026869 - 18026667
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  18026869 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18026770  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||    
T  18026769 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatatga 18026673  T
Q  293 ctccac 298  Q
    ||||||    
T  18026672 ctccac 18026667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 6740516 - 6740696
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  6740516 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 6740615  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6740616 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 6740696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28556619 - 28556439
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  28556619 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 28556520  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28556519 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 28556439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38908173 - 38907991
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  38908173 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 38908074  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38908073 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 38907991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20277369 - 20277189
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  20277369 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 20277270  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20277269 tccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 20277189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 37682082 - 37682265
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  37682082 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 37682181  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37682182 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 37682265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31535424 - 31535237
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  31535424 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31535325  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31535324 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 31535237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31564141 - 31563954
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  31564141 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31564042  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31564041 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 31563954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39189805 - 39189618
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  39189805 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 39189706  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39189705 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 39189618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 48427844 - 48428031
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  48427844 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 48427943  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48427944 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 48428031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22185723 - 22185541
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22185723 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 22185624  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22185623 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 22185541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Original strand, 18418122 - 18418302
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||| |    
T  18418122 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtac 18418221  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18418222 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 18418302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 37675389 - 37675572
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  37675389 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 37675488  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || | || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37675489 actccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 37675572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 232
Target Start/End: Original strand, 17146249 - 17146393
Alignment:
Q  89 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaa 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||    
T  17146249 atgcaaatatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17146347  T
Q  188 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgc 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17146348 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgc 17146393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 52990692 - 52990796
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52990692 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 52990791  T
Q  175 ccgct 179  Q
    |||||    
T  52990792 ccgct 52990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3652816 - 3652709
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  3652816 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 3652717  T
Q  195 tccaggac 202  Q
    ||||||||    
T  3652716 tccaggac 3652709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 24850015 - 24850175
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||            ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  24850015 caactacaaccaacaaccaagactcatgcaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaa 24850114  T
Q  113 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24850115 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 24850175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Original strand, 9269910 - 9270015
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9269910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagaaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctca 9270009  T
Q  175 ccgctg 180  Q
    ||||||    
T  9270010 ccgctg 9270015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36212128 - 36212044
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36212128 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 36212044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20396994 - 20396772
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgc-tgcgaacaactagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||    ||  ||    
T  20396994 tatgcatgtggtaccaaacagggccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcgttcatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 20396895  T
Q  195 --tc--caggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccat 288  Q
      ||  ||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||    
T  20396894 attcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccat 20396798  T
Q  289 atgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||    
T  20396797 gtgactccacttaaacaacatgtatg 20396772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 20299376 - 20299492
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgc-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctac 257  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20299376 ggaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 20299475  T
Q  258 atacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  20299476 atacaac--tgaccatgca 20299492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20852297 - 20852183
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  20852297 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 20852198  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  20852197 atggttaaagcattc 20852183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20858923 - 20858809
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  20858923 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 20858824  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  20858823 atggttaaagcattc 20858809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 21705167 - 21705281
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||    
T  21705167 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttataga 21705266  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  21705267 atggttaaagcattc 21705281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 16371482 - 16371596
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  16371482 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 16371581  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  16371582 atggttaaagcattc 16371596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21987205 - 21987081
Alignment:
Q  36 caacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcac 131  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||| ||||    
T  21987205 caacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccttcac 21987106  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattca 156  Q
    ||  |||||||||||||||||||||    
T  21987105 cgaatttgaatggttaaagcattca 21987081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23195675 - 23195559
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||    
T  23195675 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 23195576  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaac 188  Q
    ||||||||  |||||||    
T  23195575 tcaccgctttgaacaac 23195559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24109225 - 24109083
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  24109225 agacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 24109126  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  24109125 ctcaccgctttgaacaacgaggtgttccaggacataagtcctc 24109083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16669500 - 16669390
Alignment:
Q  46 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  16669500 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 16669401  T
Q  145 ttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||    
T  16669400 ttaaagcattc 16669390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 140
Target Start/End: Original strand, 20299335 - 20299400
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299335 agacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 20299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 24079529 - 24079668
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  24079529 agacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 24079628  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtc 209  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  24079629 ctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtc 24079668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19664348 - 19664246
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19664348 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagca 19664249  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  19664248 ttc 19664246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36212042 - 36211950
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  36212042 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 36211950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15316718 - 15316566
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa----acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca 156  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||    ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  15316718 gacaacaccactaagactcctcgaca-atgcac--atgcatgtggtaccaattttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattca 15316622  T
Q  157 tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || || |  ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15316621 tcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 15316566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706877
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3706877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22030849 - 22030705
Alignment:
Q  121 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctctccgct 218  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||  ||||||| | | | |||||| |||||| |||| ||||     
T  22030849 gaagccctcaccgaattttgaatggtcaaagcattcatcagggcctaagccctcaccactttgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgc- 22030751  T
Q  219 gtttatgcatatgcgatggac-ctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
     ||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22030750 -tttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaac 22030705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10813696 - 10813614
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10813696 tatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagtcctcaccggagtttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagccctcacc 10813614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 20848956 - 20849144
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagc 125  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||   ||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||   ||||| | |||||    
T  20848956 tacaaccaacaacaatgactcatgcaactactggacaacaccgctaagactcctcgaca-atgcaacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagc 20849054  T
Q  126 cctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  | |||||| |||||| ||||||||  | |  ||||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  20849055 cctcaccggatattgaattgttaaaacattcatcaaggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 20849144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Original strand, 21664128 - 21664278
Alignment:
Q  63 acaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||  |||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21664128 acaactccactaagactcctcaaca-atgcacata--catgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 21664224  T
Q  159 cggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcct 211  Q
     || || |||||||||| |||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21664225 agggcctaagccctcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcct 21664278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 955219 - 955157
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  955219 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcat 955157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20108790 - 20108649
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagactcctcaaaa------tatgcaattatgcatgtggtaccaa--- 112  Q
    |||||| | ||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||   ||||||||||||||||       
T  20108790 tggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaactacatgacaacaccactaagactcctcaaaatgcgactatgca--catgcatgtggtaccaattt 20108693  T
Q  113 acaggaccgaagccctcaccg-cttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  20108692 acagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaatcattc 20108649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448378
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22448440 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcat 22448378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7793040 - 7792921
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |      |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||      
T  7793040 gactcatgcactgacatgacgacaccactaagactcctcaacaaatgcaactatacacatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaa 7792941  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  7792940 tatgaatggttaaagcattc 7792921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Original strand, 11157038 - 11157126
Alignment:
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  11157038 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaacgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 11157126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20824530 - 20824467
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20824530 atgcatgtggtaccaaattcaggaccagagccctcaccgctattagaatggttaaagcattcat 20824467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941971
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 20941971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21410857 - 21410771
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  21410857 atgcatgtggtaccaatttacaggtcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 21410771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Original strand, 17149456 - 17149496
Alignment:
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17149456 atggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 17149496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19666913 - 19666792
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta- 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||| |     
T  19666913 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaag 19666814  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  19666813 gtgtttcaggacatgagtcctc 19666792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23066878 - 23066816
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23066878 atgcatgtggtaccaaaatcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcat 23066816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 85
Target Start/End: Original strand, 5380652 - 5380682
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5380652 atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 5380682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 11156909 - 11157022
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaa 141  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||  | |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||    
T  11156909 gactcatgcaataacatgactacacttccaagactcctcaacaagtgcaactatgcgtgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaa 11157008  T
Q  142 tggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||    
T  11157009 tggttaaagcattc 11157022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 19853030 - 19853150
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcc-ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactag 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||| ||||  ||||||  ||    
T  19853030 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggcataagccctcagcgctttgaacaataag 19853129  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19853130 tgttccaggacatgagtcctc 19853150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 19859165 - 19859285
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcc-ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactag 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||| ||||  ||||||  ||    
T  19859165 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggcataagccctcagcgctttgaacaataag 19859264  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  19859265 tgttccaggacatgagtcctc 19859285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 21541968 - 21542025
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21541968 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 21542025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 21542034 - 21542142
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  21542034 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 21542133  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  21542134 ctcaccgct 21542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 42096168 - 42096111
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  42096168 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 42096111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20838349 - 20838286
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20838349 atgcatgtggtaccaaattcagggccggagccctcaccgctattagaatggttaaagtattcat 20838286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24109038 - 24108994
Alignment:
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  24109038 tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaac 24108994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29554623 - 29554560
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29554623 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat 29554560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30491617 - 30491535
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||    
T  30491617 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatcagggcataagccctcacc 30491535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 352
Target Start/End: Original strand, 1945 - 2269
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1945 caaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactacgactcctcaa--tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 2042  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2043 cctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 2142  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaa 324  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || |||    
T  2143 catatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacattctccatatgactccaaattatacaacatgtatggttcaataaa 2241  T
Q  325 taaatcatacatcacaaccatcagcaac 352  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||    
T  2242 taaatcatacttctcagccatcaacaac 2269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 101892 - 101505
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 125  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  101892 caactacaaccagcgaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcgactatgcatctggtaccaaacaggaccgaagc 101794  T
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101793 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatg 101694  T
Q  226 catatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaat 325  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || |    
T  101693 catatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaa-catgaccatgcatacatccttcatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataatt 101596  T
Q  326 aaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaaca 417  Q
    | | ||||||| |||||||||| | |||  || ||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  101595 acaacatacattacaaccatcaaccaca-acatcaaacaatgatccaacaatccagaataatgcataattaaatataactatgttcaaaaca 101505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 97570 - 97464
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||| |||  ||||||    
T  97570 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctccccgaatttgaa 97471  T
Q  142 tggttaa 148  Q
    |||||||    
T  97470 tggttaa 97464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1269 - 860
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||            ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  1269 atgtagcaactacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtg 1170  T
Q  106 gtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  1169 gtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacat 1070  T
Q  205 gagtcctctccgctgtt-tatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatg 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  1069 gagtcctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 971  T
Q  304 caacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaa 403  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| || || ||||||||||| ||    
T  970 caacatgtatggtt-aataaataaagcatacatttcagtcatcagcaaca-tcaacagtcagcaattcaac-atccagaatattgtacaatttaatataa 874  T
Q  404 ctatgctcaaaaca 417  Q
    ||||||| ||||||    
T  873 ctatgcttaaaaca 860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 297
Target Start/End: Original strand, 24571 - 24846
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||  | | |||||||||||||| |||||||    
T  24571 atgtggaaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacataaccacaccactaagactcctcaac-tatgtgaatgtgcatgtggtaccagacaggac 24669  T
Q  120 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24670 cgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 24769  T
Q  220 tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcca 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24770 tttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaa-cttgaccatgcatacatactccatatgactcca 24846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 74352 - 74107
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  74352 accaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaattaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccg 74253  T
Q  134 cttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  74252 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgct 74154  T
Q  234 atggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  74153 atggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 74107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 120787 - 120870
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  120787 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 131664 - 131747
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  131664 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 131747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 245
Target Start/End: Original strand, 7640 - 7861
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640 tggcaactacaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaat-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 7738  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7739 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgatgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 7838  T
Q  223 atgcatatgcgatggacctactt 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  7839 atgcatatgcaatggacctactt 7861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 12923 - 13076
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12923 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 13022  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13023 acaa-attgaccatgcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatg 13076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Original strand, 12831 - 12942
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12831 tggcaactacaacaaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatggaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 12929  T
Q  123 agccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||||    
T  12930 agccctcaccgct 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 296
Target Start/End: Original strand, 1 - 258
Alignment:
Q  37 aacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1 aacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgct 100  T
Q  136 tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgat 235  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  101 tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaat 199  T
Q  236 ggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  200 ggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattc-ccatatgactcc 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30344 - 30236
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  30344 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 30245  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  30244 ctcaccgct 30236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30410 - 30353
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  30410 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 30353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35745 - 35637
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  35745 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 35646  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  35645 ctcaccgct 35637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35811 - 35754
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  35811 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 35754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 75 - 353
Target Start/End: Original strand, 19586 - 19862
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19586 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 19685  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19686 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccat 19783  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  19784 gcatacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaacaaagcatacatctcagtcatcagcaaca 19862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23722
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23999 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccttataggaccgaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctca 23900  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23899 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccat 23801  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  23800 gcatacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaacaaagcatacatctcagtcatcagcaaca 23722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15380 - 15120
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15380 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtactaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaggattcatcaggaccgaagccctca 15281  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15280 ccgctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaa-cttgaccat 15182  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacat 336  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15181 gcatacatacaccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaataaagcatacat 15120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 178938 - 179186
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  178938 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 179037  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  179038 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 179136  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  179137 gcaatggacccacttttgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 179186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 512706 - 512473
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  512706 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 512607  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatac 283  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  512606 gcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcatacaaac 512509  T
Q  284 tccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  512508 tccttgtgactccacttaaacaacatgtatggttaa 512473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 494189 - 494075
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | ||    
T  494189 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggggccctcaccgttataga 494090  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  494089 atggttaaagcattc 494075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 524568 - 524711
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaatt------atgcatgtggtaccaa--- 112  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |      ||||||||||||||||       
T  524568 tggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgaaatgacatgacgacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcacatgcatgtggtaccaattt 524667  T
Q  113 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 156  Q
    ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  524668 acagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 524711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 512773 - 512733
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  512773 acaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 512733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Original strand, 246955 - 247275
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  246955 caaccaacaagagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaata-atgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctca 247053  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  247054 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 247152  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaa 328  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  247153 gctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccgaatttatacaacatgtatgatttaataaatata 247250  T
Q  329 tcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||    
T  247251 acatacattacagccatcaacaaca 247275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Original strand, 253469 - 253789
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  253469 caaccaacaagagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaata-atgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctca 253567  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  253568 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 253666  T
Q  231 gcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc--acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaa 328  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |  ||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  253667 gctatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat-tttcatatgactccgaatttatacaacatgtatgatttaataaatata 253764  T
Q  329 tcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||    
T  253765 acatacattacagccatcaacaaca 253789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 801 - 1155
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac------------tcctcaaaatatgcaattatgcatgtg 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||            ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  801 atgtagcaactacaaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaaccctgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtg 900  T
Q  106 gtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgctccaggacat 204  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  901 gtaccagataggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacat 1000  T
Q  205 gagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatg 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |     
T  1001 gagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacaaactccataggactccactttta 1099  T
Q  304 caacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaaca 360  Q
    |||| ||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  1100 caacttgtat-gtttatttaacaaatcatacatcacaaccatcaataacattcaaca 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4819 - 4577
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4819 agactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaaccgaagccctca 4721  T
Q  175 ccgctgcgaa-caactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4720 ccgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccat 4623  T
Q  274 gcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||   |||||||||| ||||    
T  4622 gcatacaaactccttgtgactccacttaaataacatgtatgattaa 4577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31774 - 31632
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  31774 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccaaagcactcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 31675  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||  ||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  31674 ctcaccgctttgaacaacaagatgttccaggacataagtcctc 31632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 109 - 417
Target Start/End: Original strand, 30845 - 31143
Alignment:
Q  109 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30845 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagt 30944  T
Q  209 cctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaac 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||  ||||    
T  30945 cctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttacacaac 31042  T
Q  308 atgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactat 407  Q
    ||||||| || |  ||||| | |||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||        ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31043 atgtatgattcagtaaatataacatacatttcaaccatcaacaaca-tcaacaaccag--------caatccagaataatgcacaattaaatacaactat 31133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 284
Target Start/End: Original strand, 15080 - 15289
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15080 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 15179  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccat 273  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15180 ccgctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccat 15278  T
Q  274 gcatacatact 284  Q
    |||||| ||||    
T  15279 gcatacctact 15289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 15018 - 15062
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc-atgacatgacaacac 69  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15018 caactacaaccaacaatcaagactcatgcaatgacatgacaacac 15062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Original strand, 41168 - 41413
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41168 caaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaata-atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 41265  T
Q  132 cgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  41266 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgaagtgaacaacaaatgctccaggacatgagtactc-ccactgtttatgcatatg 41364  T
Q  232 cgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41365 atatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 41413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 353
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19469
Alignment:
Q  114 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19231 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctct 19330  T
Q  214 ccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtat 313  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||    
T  19331 ctgctgtttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtat 19429  T
Q  314 ggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaaca 353  Q
    | || || || |  | |||||||||||  |||||||||||    
T  19430 gattcaataactttaacatacatcacagtcatcagcaaca 19469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Original strand, 19093 - 19252
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgac-atgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacagga 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19093 atgtggcatctacaaccaacaactaagactcatgcatgaccatgacaacaccactaa-actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacagga 19191  T
Q  119 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19192 cggaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 19252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 15179 - 15332
Alignment:
Q  160 ggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15179 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaagacatgagtcctctctgctgtttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 15278  T
Q  260 acaaccttgaccatgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||    
T  15279 acaa-cttgatcatgcatacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatg 15332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 15083 - 15198
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgac-atgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacagga 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15083 atgtggcatctacaaccaacaactaagactcatgcatgaccatgacaacaccactga-actcctaaaaatatgcaattatgcatgtggtactagacagga 15181  T
Q  119 ccgaagccctcaccgct 135  Q
    |||||||||||||||||    
T  15182 ccgaagccctcaccgct 15198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26956 - 26870
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  26956 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 26870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 336
Target Start/End: Original strand, 31618 - 31879
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctca 174  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31618 agacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctca 31717  T
Q  175 ccgctg-cgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgacca 272  Q
    ||||||  || |||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31718 ccgctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa-cttaacca 31816  T
Q  273 tgcatacatactccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacat 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  31817 tgcatacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatggtt-aataaataaagcatacat 31879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 31549 - 31600
Alignment:
Q  20 atgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacac 69  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  31549 atgtagcaactgcaaccaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacac 31600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5894 - 5659
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cga 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||    
T  5894 aaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttga 5795  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacat 281  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||     
T  5794 gcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgcaa 5697  T
Q  282 actccatatgactccacgtatgcaacatgtatggttaa 319  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  5696 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattaa 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 418
Target Start/End: Original strand, 49998 - 50322
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  49998 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagt 50097  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgc-atacatactccatat 290  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||| |    
T  50098 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcaatgca-actccatgt 50194  T
Q  291 gactccacgt-atgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgc 389  Q
    |||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| | ||||||    
T  50195 gactccaattaatacaacatgtatggtttaataaataaatcatacatcatagccatcagcaata-acaacaaccagcaattcatcaatccataataatgc 50293  T
Q  390 acaatttaatacaactatgctcaaaacat 418  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  50294 acaattacataaaactatgctcaacacat 50322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 313
Target Start/End: Original strand, 25029 - 25255
Alignment:
Q  85 aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct-gcga 183  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  25029 aaatatgcaaatatgcatgtggtaacaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctattga 25127  T
Q  184 acaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacata 282  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  25128 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgcataca-a 25224  T
Q  283 ctccatatgactccacgtatgcaacatgtat 313  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  25225 ctccatgtgactccacataaacaacatgtat 25255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 409
Target Start/End: Original strand, 9839 - 10064
Alignment:
Q  182 gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9839 gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-ctagaccatgcatacat 9937  T
Q  282 actccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatggttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatcca 380  Q
     || ||||||||||| || ||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9938 tcttcatatgactccaacttatacaacatgtatgattcaataaataaaacatacat-tcaaccatcaacaaca-tcaacaaccagcaattcaacaatcca 10035  T
Q  381 gattaatgcacaatttaatacaactatgc 409  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10036 gaataatgcacaattaaatataactatgc 10064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18580 - 18362
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  18580 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18481  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatg-catacatactccatatga 292  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||| |||    
T  18480 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgccatgca-actccatgtga 18384  T
Q  293 ctccacgtatgcaacatgtatg 314  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  18383 ctccacttaaacaacatgtatg 18362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Original strand, 29707 - 29808
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||  || |||| ||| | ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  29707 atgacatgacacc-cctctaagactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagca 29805  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  29806 ttc 29808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 104284 - 104466
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  104284 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 104383  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  104384 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 104466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 143888 - 144028
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 122  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143888 tggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 143987  T
Q  123 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  143988 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 144028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 294
Target Start/End: Original strand, 137162 - 137271
Alignment:
Q  182 gaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  137162 gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacat 137259  T
Q  282 actccatatgact 294  Q
     || |||||||||    
T  137260 tct-catatgact 137271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12388 - 12208
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  12388 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 12289  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12288 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 12208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18684 - 18514
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  18684 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18585  T
Q  195 tccaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18584 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 18514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Original strand, 1830 - 1958
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  1830 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 1929  T
Q  130 accgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1930 accgctaattgaatggttaaagcattcat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2061
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  1984 ttgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 13403 - 13586
Alignment:
Q  94 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg-cgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13403 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 13502  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgca 276  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13503 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaac--tgaccatgca 13586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20160 - 19960
Alignment:
Q  217 ctgtttatgcatatgcgatggacctacttgtgtatatctacatacaaccttgaccatgcatacatactccatatgactcc-acgtatgcaacatgtatgg 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||| |||||||||||     
T  20160 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa-cttgaccatgcatacattcttcatatgactccaatttatacaacatgtatga 20062  T
Q  316 ttaaacaaataaatcatacatcacaaccatcagcaacagtcaacacccagcaatccaacaatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaaaa 415  Q
    || || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  20061 ttcaataaatatagcatacattacagccatcagcaaca-tcatcaaacagtgatccaacaatccagaataatgcacaattaaacataaccatgctcaaaa 19963  T
Q  416 cat 418  Q
    |||    
T  19962 cat 19960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16185 - 16101
Alignment:
Q  96 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16185 tatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 16101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4368 - 4183
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  4368 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 4269  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  4268 cacctctaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaatttgttccaggacatgagtcctc 4183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 5
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggac 119  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |    
T  199 tggcaaatgcaaccaacaacaacgactcatgcaattacaggacaacaccaataagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggc 100  T
Q  120 cgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  99 cgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcattcatcgagacataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1405
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccc 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||   ||| | | |||||||    
T  1220 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaaca-atgcgacgatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccc 1318  T
Q  128 tcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  1319 tcaccgtatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15027 - 14915
Alignment:
Q  44 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  15027 aagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaat 14928  T
Q  143 ggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||    
T  14927 ggttaaagcattc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8038 - 7923
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaa 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |  | || ||| ||||||||| |||  |||||    
T  8038 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatatggtaccatattctgggccggagccctcactgctaattgaa 7939  T
Q  142 tggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||||    
T  7938 tggttaaagcattcat 7923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7037 - 6983
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037 caaccaacatcaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 6983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3081 - 2967
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  3081 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 2982  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  2981 atggttaaagcattc 2967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 26069 - 26210
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||    
T  26069 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccc 26168  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  26169 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 26210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 27451 - 27592
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||    
T  27451 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccc 27550  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  27551 tcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 27592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 110138 - 110252
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||    
T  110138 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttataga 110237  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  110238 atggttaaagcattc 110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Original strand, 142605 - 142694
Alignment:
Q  70 cactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142605 cactaagactcctcaaca-atgcgactatgcatgtggtaccattatacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 142694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63308
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  63370 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 63308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28099 - 27978
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  |||||| |  |    
T  28099 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaa 28000  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  27999 gtgttccatgacatgagtcctc 27978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38936 - 38815
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--a 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||  |||||| |  |    
T  38936 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaa 38837  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  38836 gtgttccatgacatgagtcctc 38815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 124649 - 124588
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  124649 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 124588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 129924 - 129752
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  129924 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 129825  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |  |||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  129824 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaacaaagtgttccagggcatgagtcctc 129752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 115670 - 115796
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||| |   ||| ||| ||||||    
T  115670 caaccaacaacaaagactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaattgcaactatgcatgtggtaccatatttagggccggagccct 115769  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||| || | |||||||||||||||||    
T  115770 caccactatcgaatggttaaagcattc 115796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321125
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  321062 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 321125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43116 - 42905
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43116 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcacctaatttgaatggttaaagc 43017  T
Q  152 attcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggac-ctacttgtgt 249  Q
    ||||| | || |  |||||||||||  |  ||||||| | ||| |||||| |||||| |||| ||||  ||||||  ||||| |||||| | ||||||||    
T  43016 attca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcaccgc--tttatgtttatgcaatggactcaacttgtgt 42920  T
Q  250 atatctacatacaac 264  Q
    |||||||||||||||    
T  42919 atatctacatacaac 42905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18392 - 18291
Alignment:
Q  58 acatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18392 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcatt 18293  T
Q  155 ca 156  Q
    ||    
T  18292 ca 18291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 258674 - 258736
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  258674 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 258736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 265100 - 265162
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  265100 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 265162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4400 - 4286
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | ||    
T  4400 ctaagactcatgcaggacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgttgccctcaccgttataga 4301  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  4300 atggttaaagcattc 4286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 254
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||| || | | ||    
T  368 ctaagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtgggaccataacagagctgaagccctcatcgttataga 269  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  268 atggttaaagcattc 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 103171 - 103045
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  103171 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 103072  T
Q  129 caccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||    
T  103071 cacttctttcgaatggttaaagcattc 103045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 80665 - 80551
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||    
T  80665 ctaagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttataga 80566  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  80565 atggttaaagcattc 80551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Original strand, 110 - 238
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  110 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 209  T
Q  130 accgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  210 accactaattgaatggttaaagcattcat 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 27942 - 28113
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  27942 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 28041  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact-agtgctccaggacatgagtcct 211  Q
    |  ||||||||||||||  || |  |||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28042 actgttaaagcattcattagggcataagccctcgccgctttgaacaactaagtgttccaggacatgagtcct 28113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5122
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16288 - 16160
Alignment:
Q  33 aaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 129  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  16288 aaccaacgacgacgactcatgcactgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 16189  T
Q  130 accgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16188 accgctaattgaatggttaaaacattcat 16160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16146 - 16058
Alignment:
Q  126 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||  |||| ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  16146 cctcaccgctattgaatggttaaagaattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacgacaaagtgttccaggacatgagtcctc 16058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 37049 - 36980
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  37049 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9343
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  9268 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 44938 - 45013
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  44938 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 45013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44261 - 44134
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| |  |||| ||  ||||||    
T  44261 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatccatgtggtaccatattcagggccagagccct 44162  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  44161 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 44134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41835 - 41732
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  41835 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagca 41737  T
Q  153 ttcat 157  Q
    |||||    
T  41736 ttcat 41732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 92364 - 92251
Alignment:
Q  43 taagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||    
T  92364 taagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaa 92265  T
Q  142 tggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||    
T  92264 tggttaaagcattc 92251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 98090 - 97977
Alignment:
Q  43 taagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||    
T  98090 taagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaa 97991  T
Q  142 tggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||    
T  97990 tggttaaagcattc 97977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 1972 - 2099
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  1972 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 2071  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  2072 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1324 - 1197
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  1324 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 1225  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  1224 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8260 - 8133
Alignment:
Q  32 caaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 128  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  8260 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 8161  T
Q  129 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  8160 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 8133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 202 - 343
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  202 agacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcaaggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 301  T
Q  171 ctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcct 211  Q
    |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  302 ctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcct 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 56 - 1
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56 tggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6245
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 158  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  6092 gacaacaccgctaagactcctcgaca-atgcaataatgcatgtggtaccaattacagggcagaaaccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 6190  T
Q  159 cggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
     || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  6191 agggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttacaggacatgagtcctc 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17179 - 17054
Alignment:
Q  34 accaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctca 130  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||     
T  17179 accaacaaccacgactcatgtaatgacttgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc- 17081  T
Q  131 ccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17080 ccgctaatgaatggttaaagcattcat 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19631 - 19515
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  19631 gactcatgcaatgacatgacatcacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 19532  T
Q  141 atggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||    
T  19531 atggttaaagcattcat 19515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 51079 - 51251
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 140  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  51079 gactcatgcaatgatatgacgacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 51178  T
Q  141 atggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||  ||  ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  51179 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcacttctttgaataacaaggtgttccaggacatgagtcctc 51251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 8442 - 8593
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  8442 gacaacaccactaagactcctcgaca-atgcac--atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcat 8538  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |  ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  8539 cagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 8593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1469
Description:

Target: scaffold1469; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 238 - 352
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||    
T  238 ctaagactcatgcaagacatgacaactctactaagacttatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttataga 337  T
Q  141 atggttaaagcattc 155  Q
    |||||||||||||||    
T  338 atggttaaagcattc 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3448 - 3358
Alignment:
Q  123 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  3448 agccctcaccggattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagggttccaggacatgagtcctc 3358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18625
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | |    
T  18505 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacgagg 18604  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  18605 tgttccaggacatgagtcctc 18625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 81 - 12
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 111  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  81 ctaagactcatgcgggacatgacaactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5187 - 5068
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  5187 atgcatgtggtaccaatttacagggccgtagccctcaccggatattgaatggttaaatcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagt 5088  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  5087 gttccacgacatgagtcctc 5068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48001 - 47882
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  48001 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagt 47902  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |||||||||||||||    
T  47901 gttctaggacatgagtcctc 47882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 41931 - 41993
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41931 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 41993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1251 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1251
Description:

Target: scaffold1251; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 2255 - 2302
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2255 tacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 2302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 147050 - 147126
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  147050 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 75156 - 75250
Alignment:
Q  121 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  75156 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 75250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 56947 - 56861
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  56947 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 56861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 174760 - 174652
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  174760 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 174661  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  174660 ctcaccgct 174652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 174826 - 174769
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  174826 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 174769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 197618 - 197555
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  197618 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 197555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 284
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  385 atgacatgacacc-cctctaagactcctcgacaaatgcaattatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagca 287  T
Q  153 ttc 155  Q
    |||    
T  286 ttc 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 3658 - 3720
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3658 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4544 - 4477
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  4544 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaa 4477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 8280 - 8355
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  8280 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctc 8355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 18364 - 18439
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  18364 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctc 18439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Original strand, 5850 - 5913
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5850 tggcaatttcaaccaacaacgacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 5913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9356
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  9281 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctc 9356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35941 - 35839
Alignment:
Q  58 acatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcatt 154  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35941 acatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaaaggttaaagcatt 35842  T
Q  155 cat 157  Q
    |||    
T  35841 cat 35839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10306 - 10223
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10306 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 72229 - 72288
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  72229 atgcatgtggtaccatatcaaggccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 72288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10372 - 10315
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  10372 tggcaattacaaccaacaacacagactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 10315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17602 - 17519
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  17602 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaaacattc 17519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141388
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 146566 - 146629
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  146566 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 146629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9519 - 9408
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatg------catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccg-cttttgaatgg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||      |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  9519 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgaatatgcacatccatgtggtaccaatttacaggacataagccctcaccgaattttgaatgg 9420  T
Q  145 ttaaagcattca 156  Q
    ||||||||||||    
T  9419 ttaaagcattca 9408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5328 - 5187
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccc 171  Q
    ||||||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||  |    
T  5328 agactcctcaacaaacacaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtac 5229  T
Q  172 tcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  5228 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 5187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 2868 - 2988
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| | |    
T  2868 atgcatgtggtaccaatttataggacagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccttcaccgctttgaacaacaagg 2967  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2968 tgttccaggacatgagtcctc 2988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 64965 - 65085
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| | |    
T  64965 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaatg 65064  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  65065 tgttccaggacacgagtcctc 65085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 999 - 1075
Alignment:
Q  137 ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  999 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacagagtgttccaggacatgagtcctc 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47178 - 47070
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  47178 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 47079  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  47078 ctcaccgct 47070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 52583 - 52475
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  52583 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 52484  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  52483 ctcaccgct 52475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 47243 - 47187
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc-atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  47243 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaggacatgacaacaccgctaagac 47187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 451
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccct 172  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |  |  |||| ||    
T  591 agactcctcaataaatacaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccactgtagaatgattaaagcattcatcagagcataagctct 492  T
Q  173 caccgctgcgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    |||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  491 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5566 - 5510
Alignment:
Q  121 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  5566 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17640 - 17489
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||   ||||| | |  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17640 gacaacaccactaagactcctcgaca-atgcac--atgcatgtggtaccaatttacagggcagtggccctcaccggatattgaatggttaaagcattcat 17544  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |  |||||||||| |||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  17543 cagggcataagccctcactgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 17489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 76648 - 76837
Alignment:
Q  31 acaaccaacaactaagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagcc 126  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||| | | || | |  ||||||||||||||||   ||| | | ||||||    
T  76648 acaaccaacaacaatgactcatgcaattactcgacaacaccgctaagactcctcgaca-atacgacaatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagcc 76746  T
Q  127 ctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctctc 214  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  76747 ctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctctc 76837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Original strand, 298 - 381
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  298 agactcctcaacaaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 532
Alignment:
Q  61 tgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   | |||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  629 tgacaacacctctaagacccctcggcaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 6146
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6208 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14611
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14673 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 212
Target Start/End: Original strand, 366 - 519
Alignment:
Q  62 gacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    |||||| ||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||     
T  366 gacaactccactaagactcctcgacaaatgcac--atgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcatcggatattgaatggttaaagcattcac 463  T
Q  158 ccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | || |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  464 cagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Original strand, 2525 - 2652
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 152  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  2525 atgacatgacacc-ccactaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 2623  T
Q  153 t--tcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    |  ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  2624 ttctcatcaggacctaagtcctcaccgct 2652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1452
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  1535 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 51088
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51148 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 51088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 229 - 189
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1841
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1904 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15579
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15641 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcat 15579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 105
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  191 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 85
Target Start/End: Original strand, 25447 - 25487
Alignment:
Q  46 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25447 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 25487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 44580 - 44701
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta- 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||  ||||||| |     
T  44580 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccactattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtccacaccgctttgaacaacaag 44679  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  44680 gtgttccagaacatgagtcctc 44701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 38421 - 38593
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctttt--gaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta- 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||  | |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||  ||||||| |     
T  38421 atgcatgtggtaccaatttacagagcagaagccctcaccactatttcgaatggttaaagcattcatcaagacataagtcctcaccgctttgaacaacaag 38520  T
Q  191 gtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcgatggac-ctacttgtgtatatctacatacaac 264  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| | |||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  38521 gtgttctaggacatgagtcctc-ccgct-tatatgcttatgcaacggactccacttgtgtctatcttcatacaac 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Original strand, 29801 - 29887
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgct 179  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  29801 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcaggttataagccctcaccgct 29887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 27861 - 27924
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 27924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  42 ctaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcct 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41 ctaagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 10
Alignment:
Q  26 caactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  64 caactacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagac 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 10341 - 10403
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10341 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 10403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 161377 - 161338
Alignment:
Q  374 caatccagattaatgcacaatttaatacaactatgctcaa 413  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161377 caattcagaataatgcacaatttaatacaactatgctcaa 161338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 85
Target Start/End: Original strand, 4372 - 4402
Alignment:
Q  55 atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4372 atgacatgacaacaccactaagactcctcaa 4402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 19794 - 19914
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaacta-g 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||  ||||||| | |    
T  19794 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacggctttgaacaacaagg 19893  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || |||||| |||||| ||||    
T  19894 tgttccagggcatgagccctc 19914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 38313 - 38370
Alignment:
Q  23 tggcaactacaaccaacaactaagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 78  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  38313 tggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 38370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 38379 - 38487
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatccggaccgaagcc 170  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  38379 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 38478  T
Q  171 ctcaccgct 179  Q
    |||||||||    
T  38479 ctcaccgct 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 56124 - 56004
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaa-ctag 191  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||  |  ||||||   ||    
T  56124 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaatgaag 56025  T
Q  192 tgctccaggacatgagtcctc 212  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  56024 tgttccaggacatgagtcctc 56004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 921
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatc 158  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  987 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaagcattcatc 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 212
Target Start/End: Original strand, 548 - 667
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaactagt 192  Q
    |||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||  | ||||||||||||| || ||||| || |  ||||||||| ||||  ||||||  |||    
T  548 atgcatgtggtaccaaattacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaatcaatcatcagggcataagccctcatcgctttgaacaataagt 647  T
Q  193 gctccaggacatgagtcctc 212  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  648 gttccaggacatgagtcctc 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2370
Alignment:
Q  100 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcaccgctgcgaacaact--agtg 193  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||  |  |||||| |  ||||    
T  2252 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaggcattcatcagggcctaagccctcaccaatttgaacaattaaagtg 2351  T
Q  194 ctccaggacatgagtcctc 212  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2352 ttccaggacatgagtcctc 2370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10839 - 10756
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  10839 atgcatgtggtaccaattacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaaacattcatcagggcataagccctcacc 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11796 - 11713
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  11796 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47529
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  47589 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 47529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56563
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  56623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 56563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62949
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  63009 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 62949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 207964 - 207881
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  207964 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 207881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 5513 - 5576
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5513 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaattgttaaagcattcat 5576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 9523 - 9585
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9523 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc 9585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 6593 - 6656
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6593 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Original strand, 45527 - 45583
Alignment:
Q  121 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatccggaccgaagccctcacc 176  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  45527 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 45583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52836 - 52753
Alignment:
Q  75 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 155  Q
    ||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  52836 agactcctcaacaaatgctgatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 52753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44294 - 44231
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44294 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 44231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 49360 - 49297
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49360 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 49297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 370396 - 370459
Alignment:
Q  97 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 157  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  370396 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 370459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University