View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19003_high_6 (Length: 432)

Name: NF19003_high_6
Description: NF19003
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19003_high_6
NF19003_high_6
[»] chr5 (98 HSPs)
chr5 (1-413)||(37705733-37706145)
chr5 (1-383)||(25904047-25904431)
chr5 (2-377)||(10474275-10474652)
chr5 (1-383)||(24126800-24127184)
chr5 (2-343)||(18511163-18511507)
chr5 (12-383)||(17072827-17073201)
chr5 (19-389)||(40221460-40221833)
chr5 (1-411)||(17818441-17818852)
chr5 (42-386)||(10529093-10529437)
chr5 (22-385)||(21947969-21948333)
chr5 (12-386)||(39854425-39854800)
chr5 (1-385)||(26097675-26098059)
chr5 (42-343)||(25804009-25804309)
chr5 (1-385)||(2818284-2818673)
chr5 (1-343)||(16092150-16092495)
chr5 (42-383)||(31472606-31472948)
chr5 (1-383)||(1189558-1189949)
chr5 (42-385)||(25921467-25921810)
chr5 (1-377)||(18509268-18509648)
chr5 (1-351)||(6756470-6756820)
chr5 (12-385)||(36402291-36402665)
chr5 (42-385)||(4236571-4236913)
chr5 (42-384)||(38882048-38882390)
chr5 (42-383)||(39397987-39398327)
chr5 (42-343)||(2174903-2175203)
chr5 (42-343)||(6745053-6745353)
chr5 (42-343)||(18466668-18466969)
chr5 (42-343)||(27912520-27912821)
chr5 (1-385)||(18596589-18596973)
chr5 (1-384)||(31465940-31466314)
chr5 (1-305)||(658309-658610)
chr5 (113-383)||(34530731-34531001)
chr5 (42-350)||(16776135-16776442)
chr5 (1-375)||(2954368-2954742)
chr5 (1-383)||(695833-696203)
chr5 (43-343)||(34477048-34477349)
chr5 (45-384)||(31179368-31179707)
chr5 (45-384)||(31545023-31545362)
chr5 (42-343)||(18468995-18469294)
chr5 (42-343)||(27910435-27910735)
chr5 (42-385)||(12555917-12556260)
chr5 (45-384)||(31542678-31543016)
chr5 (42-343)||(34479412-34479714)
chr5 (42-343)||(6747290-6747589)
chr5 (44-343)||(21684448-21684746)
chr5 (45-343)||(15552229-15552527)
chr5 (1-376)||(21288715-21289087)
chr5 (1-265)||(2723964-2724221)
chr5 (42-260)||(41585738-41585956)
chr5 (1-377)||(6661139-6661511)
chr5 (20-249)||(20505813-20506042)
chr5 (169-383)||(20042994-20043208)
chr5 (165-383)||(20044954-20045172)
chr5 (179-385)||(26098382-26098588)
chr5 (42-285)||(10586873-10587117)
chr5 (42-248)||(39798126-39798332)
chr5 (42-260)||(4410090-4410307)
chr5 (113-353)||(9020197-9020432)
chr5 (42-231)||(10749796-10749985)
chr5 (1-383)||(36208524-36208901)
chr5 (1-340)||(20053834-20054164)
chr5 (42-231)||(10757273-10757461)
chr5 (44-231)||(15354571-15354757)
chr5 (44-231)||(23665140-23665326)
chr5 (44-231)||(23793261-23793447)
chr5 (45-231)||(3373134-3373320)
chr5 (44-231)||(15356847-15357033)
chr5 (45-231)||(38960129-38960314)
chr5 (113-285)||(17413232-17413402)
chr5 (20-245)||(15143547-15143776)
chr5 (44-224)||(23741855-23742034)
chr5 (245-385)||(20507659-20507799)
chr5 (1-139)||(26098237-26098380)
chr5 (159-411)||(42770690-42770934)
chr5 (1-111)||(20043206-20043317)
chr5 (112-183)||(42770954-42771025)
chr5 (113-276)||(34033632-34033797)
chr5 (168-297)||(4754188-4754312)
chr5 (189-297)||(2144706-2144811)
chr5 (287-343)||(4410045-4410101)
chr5 (20-157)||(15445237-15445376)
chr5 (113-227)||(4897828-4897943)
chr5 (189-308)||(29748370-29748485)
chr5 (333-383)||(2723911-2723961)
chr5 (288-385)||(41585946-41586043)
chr5 (189-276)||(15224911-15224997)
chr5 (168-276)||(31782578-31782690)
chr5 (168-245)||(35430259-35430338)
chr5 (192-230)||(1170811-1170849)
chr5 (192-230)||(2298145-2298183)
chr5 (48-90)||(8565946-8565988)
chr5 (48-90)||(19806489-19806531)
chr5 (48-90)||(32636950-32636992)
chr5 (192-230)||(35385596-35385634)
chr5 (189-230)||(10627364-10627405)
chr5 (11-90)||(28786543-28786623)
chr5 (44-231)||(23667415-23667601)
chr5 (11-90)||(42238399-42238482)
[»] chr1 (111 HSPs)
chr1 (1-383)||(11457428-11457812)
chr1 (1-403)||(18307033-18307437)
chr1 (1-386)||(12302458-12302850)
chr1 (1-385)||(13215023-13215412)
chr1 (1-385)||(41646862-41647248)
chr1 (1-411)||(6756443-6756854)
chr1 (1-413)||(9241040-9241453)
chr1 (2-383)||(50076627-50077009)
chr1 (42-352)||(50307542-50307853)
chr1 (1-383)||(18839531-18839916)
chr1 (1-385)||(16428595-16428980)
chr1 (1-385)||(2949185-2949570)
chr1 (3-385)||(17324588-17324975)
chr1 (1-382)||(25251227-25251611)
chr1 (1-377)||(14097922-14098301)
chr1 (42-385)||(6995696-6996039)
chr1 (1-343)||(47906254-47906599)
chr1 (42-384)||(51749982-51750324)
chr1 (19-385)||(3579588-3579957)
chr1 (1-376)||(17186082-17186458)
chr1 (8-383)||(50078779-50079158)
chr1 (1-383)||(50248523-50248909)
chr1 (1-358)||(31424968-31425331)
chr1 (42-384)||(10399824-10400166)
chr1 (1-383)||(31489859-31490240)
chr1 (1-385)||(38925436-38925817)
chr1 (12-377)||(39462469-39462835)
chr1 (19-376)||(17324016-17324372)
chr1 (42-385)||(28998249-28998592)
chr1 (42-385)||(29003965-29004308)
chr1 (42-376)||(20302410-20302743)
chr1 (42-343)||(15294830-15295131)
chr1 (12-385)||(15823488-15823863)
chr1 (1-413)||(31422813-31423241)
chr1 (42-384)||(6822958-6823299)
chr1 (2-343)||(25127856-25128202)
chr1 (42-385)||(2510321-2510667)
chr1 (42-343)||(24325648-24325948)
chr1 (1-385)||(28207019-28207405)
chr1 (42-385)||(28840620-28840964)
chr1 (42-385)||(31735517-31735864)
chr1 (43-385)||(28842435-28842778)
chr1 (1-334)||(40133937-40134272)
chr1 (45-377)||(2617466-2617798)
chr1 (1-352)||(17318868-17319215)
chr1 (50-385)||(47451590-47451919)
chr1 (1-343)||(27336891-27337235)
chr1 (1-343)||(27339082-27339427)
chr1 (42-384)||(13761780-13762121)
chr1 (42-384)||(20291400-20291741)
chr1 (42-343)||(39932057-39932359)
chr1 (46-384)||(16226110-16226448)
chr1 (1-357)||(4131328-4131692)
chr1 (42-335)||(46431702-46431996)
chr1 (45-343)||(9463243-9463541)
chr1 (102-385)||(48665113-48665403)
chr1 (42-384)||(51752308-51752648)
chr1 (45-383)||(14183589-14183923)
chr1 (102-343)||(21948244-21948484)
chr1 (45-343)||(9459416-9459714)
chr1 (46-343)||(47179697-47179993)
chr1 (1-410)||(42922151-42922557)
chr1 (46-343)||(47177346-47177642)
chr1 (23-281)||(16432440-16432702)
chr1 (1-413)||(8347227-8347636)
chr1 (42-399)||(49495206-49495552)
chr1 (1-260)||(25248504-25248766)
chr1 (128-384)||(6823827-6824091)
chr1 (20-242)||(16429042-16429267)
chr1 (74-410)||(18800600-18800932)
chr1 (72-296)||(15669419-15669641)
chr1 (20-247)||(6115074-6115304)
chr1 (1-350)||(8349006-8349352)
chr1 (46-260)||(16231630-16231843)
chr1 (45-231)||(23785935-23786121)
chr1 (42-235)||(51757623-51757815)
chr1 (1-358)||(13125411-13125768)
chr1 (42-183)||(23816030-23816171)
chr1 (138-377)||(26520205-26520449)
chr1 (20-385)||(30790373-30790733)
chr1 (111-245)||(30738695-30738830)
chr1 (1-248)||(16561545-16561794)
chr1 (20-245)||(26613211-26613440)
chr1 (45-297)||(27916529-27916780)
chr1 (70-245)||(155788-155963)
chr1 (1-155)||(15916562-15916718)
chr1 (288-382)||(25248756-25248850)
chr1 (113-285)||(28279309-28279480)
chr1 (203-285)||(26332719-26332798)
chr1 (42-90)||(13358810-13358858)
chr1 (287-384)||(16231544-16231641)
chr1 (189-245)||(26332632-26332688)
chr1 (100-245)||(14353047-14353192)
chr1 (203-377)||(13127790-13127959)
chr1 (136-245)||(49959129-49959240)
chr1 (311-351)||(6115344-6115384)
chr1 (11-90)||(4144644-4144726)
chr1 (191-230)||(4144826-4144865)
chr1 (113-156)||(43104332-43104375)
chr1 (48-90)||(834167-834209)
chr1 (192-230)||(2232597-2232635)
chr1 (48-90)||(28220226-28220268)
chr1 (48-90)||(28265554-28265596)
chr1 (48-90)||(40122196-40122238)
chr1 (48-90)||(45644354-45644396)
chr1 (48-90)||(49918476-49918518)
chr1 (48-90)||(50167175-50167217)
chr1 (189-230)||(14997040-14997081)
chr1 (42-74)||(13447269-13447301)
chr1 (35-90)||(21353335-21353391)
chr1 (48-88)||(32889443-32889483)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (1-411)||(1225138-1225549)
chr8 (1-385)||(14419141-14419528)
chr8 (1-383)||(30480454-30480838)
chr8 (1-383)||(27106850-27107232)
chr8 (42-411)||(27910987-27911354)
chr8 (42-411)||(27957406-27957773)
chr8 (1-385)||(13858438-13858821)
chr8 (1-385)||(14807749-14808145)
chr8 (42-385)||(32339303-32339650)
chr8 (1-385)||(15072708-15073096)
chr8 (42-385)||(4424016-4424359)
chr8 (43-382)||(36865538-36865877)
chr8 (42-343)||(608774-609075)
chr8 (12-385)||(28251530-28251904)
chr8 (42-385)||(27829295-27829637)
chr8 (42-385)||(15809213-15809559)
chr8 (1-385)||(15067979-15068366)
chr8 (42-385)||(3874004-3874351)
chr8 (1-383)||(25952521-25952904)
chr8 (1-410)||(15185667-15186072)
chr8 (42-385)||(27826984-27827326)
chr8 (42-385)||(41384743-41385085)
chr8 (1-383)||(33541361-33541723)
chr8 (12-385)||(41382671-41383034)
chr8 (45-383)||(5372173-5372512)
chr8 (42-343)||(22684647-22684951)
chr8 (42-343)||(28283215-28283514)
chr8 (42-384)||(18810707-18811048)
chr8 (45-384)||(44720842-44721181)
chr8 (45-335)||(43079650-43079940)
chr8 (137-383)||(14477276-14477522)
chr8 (45-343)||(43082013-43082311)
chr8 (1-383)||(21482322-21482693)
chr8 (1-352)||(21480545-21480885)
chr8 (45-343)||(24873178-24873476)
chr8 (42-285)||(43530213-43530456)
chr8 (3-293)||(15956051-15956338)
chr8 (42-384)||(18812892-18813222)
chr8 (1-410)||(31162186-31162596)
chr8 (34-353)||(3005616-3005932)
chr8 (206-408)||(26775176-26775378)
chr8 (189-351)||(5622879-5623041)
chr8 (220-383)||(35872555-35872713)
chr8 (83-260)||(181622-181799)
chr8 (1-178)||(2468082-2468260)
chr8 (1-245)||(31578234-31578476)
chr8 (1-248)||(31035252-31035502)
chr8 (116-285)||(31573794-31573961)
chr8 (165-355)||(37214317-37214517)
chr8 (283-385)||(3886153-3886255)
chr8 (211-308)||(31035144-31035238)
chr8 (335-411)||(14419784-14419860)
chr8 (1-86)||(37214215-37214302)
chr8 (272-343)||(12517248-12517319)
chr8 (203-287)||(2468261-2468341)
chr8 (288-385)||(181535-181632)
chr8 (1-161)||(35872407-35872553)
chr8 (145-230)||(13985176-13985262)
chr8 (41-90)||(10930192-10930241)
chr8 (4-90)||(31566514-31566600)
chr8 (186-230)||(2267161-2267205)
chr8 (10-86)||(14477547-14477626)
chr8 (126-245)||(17847661-17847782)
chr8 (203-245)||(33839077-33839120)
chr8 (48-90)||(1345371-1345413)
chr8 (311-385)||(2468361-2468435)
chr8 (192-230)||(9021251-9021289)
chr8 (48-90)||(15212912-15212954)
chr8 (192-230)||(16752666-16752704)
chr8 (192-230)||(16757411-16757449)
chr8 (192-230)||(17799568-17799606)
chr8 (48-90)||(19175805-19175847)
chr8 (48-90)||(19752445-19752487)
chr8 (48-90)||(27811404-27811446)
chr8 (192-230)||(28327908-28327946)
chr8 (192-230)||(28332631-28332669)
chr8 (192-230)||(28895502-28895540)
chr8 (168-230)||(30423212-30423274)
chr8 (48-90)||(33352276-33352318)
chr8 (48-90)||(40321206-40321248)
chr8 (302-385)||(43530122-43530209)
chr8 (49-90)||(4733832-4733873)
chr8 (189-245)||(13985954-13986011)
[»] chr3 (139 HSPs)
chr3 (1-382)||(43421366-43421747)
chr3 (1-383)||(3314608-3314993)
chr3 (1-383)||(1626632-1627016)
chr3 (1-383)||(5926714-5927097)
chr3 (1-352)||(28101951-28102304)
chr3 (1-383)||(43423414-43423796)
chr3 (1-385)||(1313332-1313715)
chr3 (1-385)||(53917612-53917999)
chr3 (1-411)||(39715366-39715774)
chr3 (1-385)||(51943293-51943681)
chr3 (1-383)||(880402-880785)
chr3 (1-386)||(4308228-4308617)
chr3 (1-385)||(53915444-53915831)
chr3 (4-385)||(45882861-45883248)
chr3 (1-386)||(43226007-43226392)
chr3 (1-343)||(47148844-47149188)
chr3 (1-383)||(53468402-53468788)
chr3 (42-386)||(51726999-51727342)
chr3 (42-384)||(11170327-11170669)
chr3 (12-343)||(27101142-27101474)
chr3 (25-386)||(43228212-43228575)
chr3 (42-343)||(38890004-38890305)
chr3 (42-382)||(10956019-10956359)
chr3 (12-384)||(18096861-18097235)
chr3 (12-343)||(18099131-18099463)
chr3 (1-382)||(51674715-51675087)
chr3 (42-343)||(42990268-42990569)
chr3 (42-382)||(10958315-10958655)
chr3 (1-343)||(30005805-30006151)
chr3 (42-385)||(28761419-28761763)
chr3 (42-377)||(24979637-24979973)
chr3 (58-383)||(889781-890104)
chr3 (42-384)||(3859451-3859792)
chr3 (42-385)||(4103888-4104234)
chr3 (1-385)||(32263987-32264378)
chr3 (42-343)||(9604599-9604899)
chr3 (42-343)||(25533406-25533707)
chr3 (45-343)||(746721-747019)
chr3 (1-385)||(12267925-12268301)
chr3 (42-385)||(26720470-26720812)
chr3 (1-294)||(6484372-6484666)
chr3 (42-384)||(22114297-22114639)
chr3 (113-377)||(6561740-6562005)
chr3 (1-385)||(48361617-48362005)
chr3 (42-384)||(5191576-5191916)
chr3 (1-383)||(54691522-54691906)
chr3 (1-385)||(18162586-18162973)
chr3 (45-343)||(10084384-10084682)
chr3 (12-383)||(36011751-36012123)
chr3 (46-385)||(458202-458545)
chr3 (42-303)||(1321483-1321744)
chr3 (46-385)||(455825-456168)
chr3 (45-331)||(25388882-25389167)
chr3 (45-384)||(6065791-6066131)
chr3 (45-343)||(10621525-10621823)
chr3 (46-343)||(50493963-50494260)
chr3 (48-383)||(53591119-53591442)
chr3 (45-384)||(6063441-6063782)
chr3 (142-384)||(35777344-35777587)
chr3 (1-385)||(15780782-15781187)
chr3 (45-317)||(28413027-28413299)
chr3 (35-343)||(10191295-10191602)
chr3 (152-383)||(28100143-28100374)
chr3 (46-343)||(38210334-38210631)
chr3 (147-383)||(28180948-28181182)
chr3 (102-343)||(29956650-29956891)
chr3 (42-384)||(5522619-5522949)
chr3 (1-376)||(32219026-32219395)
chr3 (1-286)||(4666535-4666822)
chr3 (1-256)||(25688107-25688367)
chr3 (58-386)||(35917952-35918285)
chr3 (4-410)||(23633357-23633756)
chr3 (20-383)||(31151271-31151634)
chr3 (42-285)||(7606580-7606822)
chr3 (1-259)||(6231849-6232107)
chr3 (1-289)||(17795280-17795566)
chr3 (1-289)||(19103720-19104006)
chr3 (45-343)||(42992250-42992532)
chr3 (130-410)||(23636924-23637200)
chr3 (1-382)||(27635604-27635959)
chr3 (1-229)||(3306839-3307068)
chr3 (42-246)||(5886261-5886463)
chr3 (42-246)||(5899734-5899936)
chr3 (113-400)||(53597148-53597430)
chr3 (1-297)||(561725-562021)
chr3 (42-243)||(11168165-11168366)
chr3 (116-297)||(13420252-13420429)
chr3 (113-375)||(54884089-54884348)
chr3 (159-383)||(28137415-28137628)
chr3 (1-177)||(47701623-47701798)
chr3 (113-297)||(25635394-25635575)
chr3 (215-342)||(41849117-41849244)
chr3 (119-307)||(1673975-1674160)
chr3 (254-382)||(6231374-6231502)
chr3 (7-335)||(36871257-36871583)
chr3 (253-383)||(47701798-47701928)
chr3 (239-384)||(11163073-11163218)
chr3 (1-164)||(25634030-25634194)
chr3 (203-385)||(24177201-24177380)
chr3 (22-183)||(24181504-24181668)
chr3 (325-411)||(6484281-6484367)
chr3 (271-382)||(3306724-3306835)
chr3 (1-123)||(41849243-41849368)
chr3 (167-263)||(4560401-4560497)
chr3 (112-275)||(14634504-14634665)
chr3 (203-297)||(25633933-25634024)
chr3 (189-308)||(13419883-13419997)
chr3 (47-245)||(1620457-1620657)
chr3 (186-268)||(31021281-31021362)
chr3 (42-90)||(35919107-35919155)
chr3 (1-69)||(28181242-28181312)
chr3 (44-90)||(53894051-53894097)
chr3 (311-385)||(1321363-1321437)
chr3 (218-263)||(7606828-7606873)
chr3 (41-90)||(30236251-30236300)
chr3 (205-245)||(7768632-7768672)
chr3 (41-90)||(46173483-46173532)
chr3 (42-86)||(42992607-42992651)
chr3 (168-245)||(11066652-11066731)
chr3 (192-230)||(6303310-6303348)
chr3 (192-230)||(10094218-10094256)
chr3 (192-230)||(10100235-10100273)
chr3 (192-230)||(10201098-10201136)
chr3 (48-90)||(16264354-16264396)
chr3 (192-230)||(16462203-16462241)
chr3 (192-230)||(22626128-22626166)
chr3 (48-90)||(25795785-25795827)
chr3 (192-230)||(27544273-27544311)
chr3 (48-90)||(32143325-32143367)
chr3 (48-90)||(40913419-40913461)
chr3 (48-90)||(44331671-44331713)
chr3 (192-230)||(47883026-47883064)
chr3 (48-90)||(51398940-51398982)
chr3 (299-352)||(4560514-4560567)
chr3 (1-61)||(880191-880251)
chr3 (311-343)||(6719358-6719390)
chr3 (31-90)||(10612761-10612821)
chr3 (48-88)||(32744436-32744476)
chr3 (11-90)||(47878131-47878214)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (1-383)||(13057173-13057557)
chr6 (2-383)||(3629819-3630199)
chr6 (1-377)||(3631890-3632267)
chr6 (42-396)||(3390345-3390700)
chr6 (1-385)||(32279974-32280360)
chr6 (12-384)||(11982991-11983365)
chr6 (1-383)||(13039733-13040117)
chr6 (12-385)||(9019903-9020278)
chr6 (42-383)||(25477253-25477602)
chr6 (42-376)||(14458761-14459093)
chr6 (42-386)||(1230243-1230587)
chr6 (42-386)||(28241315-28241659)
chr6 (1-384)||(15541092-15541476)
chr6 (1-385)||(30728775-30729165)
chr6 (42-385)||(14507170-14507512)
chr6 (1-383)||(24338401-24338783)
chr6 (1-383)||(3233674-3234065)
chr6 (42-343)||(4816225-4816526)
chr6 (42-385)||(15532676-15533018)
chr6 (1-383)||(12161509-12161889)
chr6 (43-343)||(20915351-20915651)
chr6 (102-385)||(15530177-15530459)
chr6 (42-343)||(30967220-30967521)
chr6 (45-343)||(19704564-19704864)
chr6 (42-385)||(30034597-30034944)
chr6 (42-343)||(2628880-2629179)
chr6 (48-385)||(12195515-12195852)
chr6 (45-343)||(26065005-26065298)
chr6 (45-343)||(26084974-26085267)
chr6 (1-285)||(14466399-14466688)
chr6 (113-375)||(22490626-22490889)
chr6 (45-343)||(26932559-26932857)
chr6 (1-385)||(3027805-3028187)
chr6 (1-351)||(15719665-15720005)
chr6 (2-242)||(1069670-1069913)
chr6 (154-384)||(19227514-19227744)
chr6 (45-263)||(5273213-5273431)
chr6 (20-296)||(15367101-15367375)
chr6 (45-377)||(17012029-17012358)
chr6 (45-297)||(16455421-16455672)
chr6 (235-383)||(32447502-32447651)
chr6 (2-246)||(12186025-12186271)
chr6 (45-231)||(26066121-26066307)
chr6 (45-231)||(33311257-33311442)
chr6 (1-350)||(19696453-19696803)
chr6 (45-231)||(33308988-33309173)
chr6 (234-376)||(13870608-13870749)
chr6 (44-231)||(29754705-29754892)
chr6 (238-385)||(1072067-1072214)
chr6 (1-174)||(15346535-15346707)
chr6 (45-231)||(26068392-26068578)
chr6 (1-247)||(26945258-26945507)
chr6 (254-385)||(17852519-17852650)
chr6 (1-276)||(22857906-22858181)
chr6 (217-385)||(15346368-15346524)
chr6 (271-385)||(8995456-8995570)
chr6 (12-130)||(10584227-10584348)
chr6 (5-351)||(25078514-25078856)
chr6 (270-383)||(10584105-10584213)
chr6 (1-167)||(25465544-25465710)
chr6 (113-285)||(20526885-20527054)
chr6 (45-244)||(28037722-28037927)
chr6 (117-245)||(7542452-7542581)
chr6 (190-245)||(11138423-11138479)
chr6 (72-163)||(30445723-30445815)
chr6 (326-385)||(15367013-15367079)
chr6 (1-36)||(3394695-3394730)
chr6 (192-230)||(3577658-3577696)
chr6 (252-309)||(4595048-4595102)
chr6 (192-230)||(13878727-13878765)
chr6 (192-230)||(13883475-13883513)
chr6 (192-230)||(16785919-16785957)
chr6 (192-230)||(26887368-26887406)
chr6 (48-90)||(26954286-26954328)
chr6 (113-163)||(28078261-28078310)
chr6 (192-230)||(31248858-31248896)
chr6 (48-90)||(31936591-31936633)
chr6 (48-90)||(33211185-33211227)
chr6 (192-230)||(35201470-35201508)
chr6 (203-274)||(6843217-6843287)
chr6 (216-276)||(30445602-30445661)
[»] chr7 (109 HSPs)
chr7 (1-383)||(44724533-44724915)
chr7 (1-385)||(443547-443936)
chr7 (1-383)||(20137062-20137444)
chr7 (1-383)||(21678020-21678400)
chr7 (1-358)||(21592094-21592453)
chr7 (20-383)||(4295904-4296271)
chr7 (1-385)||(13099423-13099813)
chr7 (1-383)||(11355212-11355597)
chr7 (1-383)||(39145937-39146322)
chr7 (20-385)||(27306202-27306566)
chr7 (1-385)||(42330952-42331336)
chr7 (1-383)||(21679981-21680366)
chr7 (1-343)||(9679053-9679397)
chr7 (1-382)||(21990106-21990488)
chr7 (1-376)||(24748555-24748931)
chr7 (42-385)||(44516-44859)
chr7 (1-383)||(9680768-9681158)
chr7 (42-385)||(38393934-38394281)
chr7 (1-385)||(31434999-31435384)
chr7 (1-396)||(42223097-42223494)
chr7 (42-343)||(48457647-48457948)
chr7 (42-343)||(7471974-7472275)
chr7 (42-343)||(18345535-18345836)
chr7 (45-385)||(35581-35921)
chr7 (42-382)||(37412119-37412462)
chr7 (42-343)||(20297356-20297657)
chr7 (42-343)||(20626032-20626333)
chr7 (42-343)||(20629923-20630224)
chr7 (42-343)||(20642342-20642643)
chr7 (42-384)||(1049290-1049631)
chr7 (42-384)||(40836737-40837078)
chr7 (42-343)||(7470016-7470317)
chr7 (42-385)||(20299406-20299755)
chr7 (42-343)||(1849975-1850276)
chr7 (42-343)||(28487547-28487848)
chr7 (42-338)||(40946327-40946623)
chr7 (42-343)||(1046919-1047219)
chr7 (42-343)||(3878571-3878872)
chr7 (1-350)||(27832592-27832936)
chr7 (42-385)||(3035669-3036019)
chr7 (47-358)||(24258442-24258757)
chr7 (113-383)||(25276095-25276365)
chr7 (42-384)||(25542484-25542823)
chr7 (42-385)||(28485514-28485860)
chr7 (45-385)||(31155908-31156248)
chr7 (45-343)||(7351649-7351947)
chr7 (42-268)||(7092207-7092432)
chr7 (107-385)||(11757176-11757460)
chr7 (1-410)||(7188470-7188875)
chr7 (60-343)||(7349285-7349568)
chr7 (1-308)||(24813450-24813755)
chr7 (42-333)||(43253511-43253801)
chr7 (42-268)||(7094454-7094679)
chr7 (103-410)||(22828687-22828995)
chr7 (112-410)||(20091609-20091903)
chr7 (58-411)||(24817362-24817711)
chr7 (144-352)||(26804554-26804765)
chr7 (113-384)||(22251611-22251878)
chr7 (1-382)||(24465503-24465871)
chr7 (219-385)||(18567565-18567731)
chr7 (42-259)||(38396713-38396929)
chr7 (1-186)||(22393873-22394059)
chr7 (45-231)||(2935374-2935560)
chr7 (1-183)||(26295601-26295782)
chr7 (180-385)||(22392425-22392618)
chr7 (44-231)||(22137184-22137370)
chr7 (44-231)||(40552211-40552397)
chr7 (45-231)||(1606486-1606671)
chr7 (6-308)||(11081540-11081842)
chr7 (44-231)||(22108173-22108359)
chr7 (44-231)||(40549933-40550119)
chr7 (45-231)||(9027191-9027376)
chr7 (45-275)||(6332283-6332514)
chr7 (113-308)||(6048903-6049094)
chr7 (189-276)||(11084438-11084523)
chr7 (113-183)||(6348936-6349006)
chr7 (1-68)||(22251536-22251605)
chr7 (42-90)||(11759374-11759422)
chr7 (189-245)||(16297166-16297222)
chr7 (1-85)||(26804762-26804849)
chr7 (260-385)||(30906264-30906387)
chr7 (276-337)||(38396316-38396377)
chr7 (189-269)||(12310157-12310236)
chr7 (2-88)||(20091109-20091196)
chr7 (189-276)||(26210603-26210688)
chr7 (48-90)||(12097867-12097909)
chr7 (192-246)||(2120881-2120937)
chr7 (60-163)||(6046668-6046772)
chr7 (189-230)||(21369642-21369683)
chr7 (189-242)||(40281519-40281572)
chr7 (288-343)||(7094662-7094717)
chr7 (192-230)||(3320194-3320232)
chr7 (192-230)||(3324942-3324980)
chr7 (192-230)||(7069780-7069818)
chr7 (192-230)||(7074787-7074825)
chr7 (48-90)||(9190059-9190101)
chr7 (192-230)||(15541139-15541177)
chr7 (192-230)||(25351353-25351391)
chr7 (192-230)||(25357047-25357085)
chr7 (192-230)||(25405393-25405431)
chr7 (192-230)||(25410130-25410168)
chr7 (48-90)||(27347943-27347985)
chr7 (48-90)||(36146408-36146450)
chr7 (48-90)||(41317434-41317476)
chr7 (192-230)||(42006663-42006701)
chr7 (49-90)||(4253529-4253570)
chr7 (252-297)||(6348859-6348903)
chr7 (48-92)||(4796716-4796760)
chr7 (2-86)||(25276381-25276465)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (1-383)||(28196557-28196939)
chr2 (1-383)||(19007560-19007944)
chr2 (3-382)||(6264101-6264479)
chr2 (1-385)||(42923458-42923848)
chr2 (12-385)||(21520655-21521032)
chr2 (12-385)||(40032016-40032395)
chr2 (1-385)||(22287287-22287673)
chr2 (42-383)||(11739553-11739895)
chr2 (2-352)||(17848394-17848741)
chr2 (2-385)||(6258769-6259152)
chr2 (1-383)||(14837193-14837572)
chr2 (42-384)||(19504340-19504681)
chr2 (42-382)||(19502005-19502345)
chr2 (1-377)||(3022089-3022476)
chr2 (1-383)||(17849037-17849421)
chr2 (42-384)||(27104718-27105058)
chr2 (5-350)||(44289022-44289370)
chr2 (42-386)||(45279978-45280323)
chr2 (42-384)||(13910039-13910380)
chr2 (42-385)||(23452231-23452578)
chr2 (42-385)||(42064433-42064776)
chr2 (42-375)||(34979571-34979906)
chr2 (1-385)||(43623530-43623905)
chr2 (42-385)||(42452701-42453041)
chr2 (71-383)||(45239000-45239316)
chr2 (1-383)||(31732732-31733100)
chr2 (126-382)||(15539553-15539809)
chr2 (42-384)||(24162217-24162548)
chr2 (46-343)||(35215584-35215881)
chr2 (46-343)||(35217961-35218258)
chr2 (45-383)||(11578104-11578439)
chr2 (10-253)||(5375306-5375550)
chr2 (1-385)||(18800266-18800639)
chr2 (25-411)||(22874034-22874411)
chr2 (1-293)||(28459143-28459435)
chr2 (1-177)||(22407405-22407583)
chr2 (1-308)||(17897199-17897502)
chr2 (206-383)||(22163106-22163282)
chr2 (1-308)||(20146560-20146866)
chr2 (203-343)||(38020162-38020302)
chr2 (4-167)||(22707705-22707872)
chr2 (44-231)||(36558860-36559047)
chr2 (44-231)||(36561137-36561324)
chr2 (230-385)||(22407591-22407746)
chr2 (46-231)||(45332179-45332364)
chr2 (45-411)||(37962938-37963290)
chr2 (20-247)||(40699429-40699660)
chr2 (1-168)||(23870951-23871120)
chr2 (10-385)||(35107218-35107590)
chr2 (118-293)||(27136195-27136368)
chr2 (1-134)||(22162975-22163108)
chr2 (51-177)||(7462950-7463077)
chr2 (248-343)||(5377629-5377724)
chr2 (161-260)||(38414194-38414291)
chr2 (113-230)||(20589763-20589881)
chr2 (289-382)||(38020064-38020157)
chr2 (193-285)||(43139395-43139484)
chr2 (2-72)||(15539481-15539553)
chr2 (189-285)||(27583480-27583573)
chr2 (113-246)||(15693958-15694094)
chr2 (319-385)||(12342681-12342747)
chr2 (168-245)||(17921754-17921833)
chr2 (189-246)||(26345661-26345718)
chr2 (189-285)||(35028595-35028688)
chr2 (48-90)||(17057369-17057411)
chr2 (48-90)||(17085352-17085394)
chr2 (203-245)||(34575265-34575308)
chr2 (335-410)||(40699203-40699278)
chr2 (48-90)||(723744-723786)
chr2 (192-230)||(2736205-2736243)
chr2 (192-230)||(2740941-2740979)
chr2 (48-90)||(11067431-11067473)
chr2 (48-90)||(11151591-11151633)
chr2 (192-230)||(17462436-17462474)
chr2 (192-230)||(20054909-20054947)
chr2 (192-230)||(22712660-22712698)
chr2 (192-230)||(22717369-22717407)
chr2 (168-230)||(28458949-28459011)
chr2 (119-245)||(30720684-30720811)
chr2 (48-90)||(33162450-33162492)
chr2 (48-90)||(34139770-34139812)
chr2 (48-90)||(39284962-39285004)
chr2 (192-230)||(39680045-39680083)
chr2 (192-230)||(39686983-39687021)
chr2 (192-230)||(45567409-45567447)
chr2 (41-90)||(1345592-1345641)
chr2 (41-90)||(2838081-2838130)
chr2 (189-245)||(7502975-7503032)
chr2 (146-183)||(38020312-38020349)
chr2 (35-90)||(17943674-17943730)
chr2 (31-90)||(34575119-34575179)
[»] chr4 (121 HSPs)
chr4 (1-383)||(12395796-12396180)
chr4 (1-383)||(12400758-12401142)
chr4 (1-383)||(19095880-19096268)
chr4 (1-383)||(38928130-38928513)
chr4 (1-408)||(16453282-16453690)
chr4 (45-385)||(48486315-48486655)
chr4 (1-385)||(40091366-40091752)
chr4 (1-386)||(40637069-40637458)
chr4 (1-358)||(33415441-33415797)
chr4 (1-385)||(36921444-36921832)
chr4 (2-411)||(36378262-36378672)
chr4 (42-386)||(14633315-14633657)
chr4 (42-385)||(22802728-22803071)
chr4 (42-385)||(24888792-24889135)
chr4 (1-385)||(36919535-36919924)
chr4 (1-385)||(24878985-24879374)
chr4 (1-385)||(24880447-24880836)
chr4 (1-385)||(619400-619784)
chr4 (12-385)||(22800825-22801199)
chr4 (42-343)||(8631413-8631714)
chr4 (1-385)||(47274723-47275106)
chr4 (42-385)||(5198416-5198759)
chr4 (1-385)||(14787380-14787770)
chr4 (42-384)||(11434952-11435293)
chr4 (42-352)||(37313059-37313370)
chr4 (42-343)||(24348256-24348557)
chr4 (42-343)||(37089366-37089666)
chr4 (42-386)||(47868396-47868740)
chr4 (42-385)||(22044385-22044727)
chr4 (42-385)||(22046680-22047022)
chr4 (42-385)||(51015242-51015584)
chr4 (42-385)||(9148247-9148591)
chr4 (42-343)||(11006231-11006532)
chr4 (42-343)||(11008562-11008861)
chr4 (1-377)||(41997496-41997872)
chr4 (42-386)||(6764834-6765183)
chr4 (42-343)||(38409243-38409543)
chr4 (52-382)||(56030443-56030770)
chr4 (42-343)||(7941359-7941662)
chr4 (68-343)||(13543997-13544272)
chr4 (46-385)||(44599836-44600175)
chr4 (44-386)||(2484869-2485211)
chr4 (42-384)||(18847150-18847491)
chr4 (42-308)||(26085971-26086236)
chr4 (45-343)||(18709161-18709458)
chr4 (1-385)||(17662196-17662575)
chr4 (22-377)||(19322701-19323056)
chr4 (45-384)||(9174143-9174482)
chr4 (32-267)||(16455355-16455591)
chr4 (45-384)||(16934140-16934479)
chr4 (42-343)||(31849593-31849894)
chr4 (45-377)||(9176471-9176803)
chr4 (107-343)||(5637524-5637760)
chr4 (45-343)||(22132389-22132684)
chr4 (46-343)||(22780371-22780668)
chr4 (46-343)||(22782736-22783033)
chr4 (107-343)||(3824629-3824863)
chr4 (1-305)||(36380425-36380730)
chr4 (45-384)||(16931786-16932125)
chr4 (20-383)||(18537444-18537806)
chr4 (45-383)||(18409344-18409681)
chr4 (19-297)||(27499129-27499406)
chr4 (45-343)||(22134615-22134909)
chr4 (1-239)||(2891433-2891674)
chr4 (1-357)||(18534785-18535138)
chr4 (153-383)||(3937314-3937543)
chr4 (58-343)||(47210762-47211035)
chr4 (126-377)||(52942537-52942776)
chr4 (163-383)||(6132871-6133090)
chr4 (20-385)||(8756221-8756587)
chr4 (1-233)||(13547302-13547536)
chr4 (42-385)||(53405123-53405472)
chr4 (1-297)||(38890177-38890472)
chr4 (220-383)||(38270158-38270321)
chr4 (220-383)||(24446756-24446914)
chr4 (1-293)||(30136640-30136931)
chr4 (1-177)||(4215510-4215685)
chr4 (55-410)||(15032554-15032898)
chr4 (42-183)||(5635470-5635611)
chr4 (1-284)||(28453782-28454067)
chr4 (245-385)||(5100993-5101133)
chr4 (45-246)||(12102221-12102425)
chr4 (42-183)||(11437561-11437701)
chr4 (20-287)||(47150863-47151131)
chr4 (42-177)||(5101133-5101267)
chr4 (271-383)||(2891314-2891427)
chr4 (1-133)||(47563009-47563141)
chr4 (1-245)||(25357772-25358022)
chr4 (169-376)||(10112876-10113080)
chr4 (1-297)||(9863795-9864092)
chr4 (115-387)||(40999017-40999286)
chr4 (48-276)||(3982175-3982411)
chr4 (1-113)||(6133105-6133219)
chr4 (1-90)||(14789379-14789470)
chr4 (1-230)||(16185787-16186018)
chr4 (113-246)||(31983593-31983727)
chr4 (32-159)||(49088791-49088921)
chr4 (189-275)||(10114435-10114519)
chr4 (1-91)||(3937227-3937317)
chr4 (1-161)||(24446608-24446754)
chr4 (312-411)||(16455257-16455356)
chr4 (1-87)||(52942437-52942527)
chr4 (338-411)||(36380344-36380417)
chr4 (189-276)||(38208825-38208911)
chr4 (189-308)||(9022380-9022495)
chr4 (20-90)||(10114608-10114680)
chr4 (48-90)||(5143263-5143305)
chr4 (48-90)||(5269242-5269284)
chr4 (168-230)||(5336903-5336964)
chr4 (192-230)||(7050401-7050439)
chr4 (192-230)||(11853549-11853587)
chr4 (48-90)||(12739550-12739592)
chr4 (289-410)||(16186079-16186199)
chr4 (48-90)||(26175636-26175678)
chr4 (48-90)||(36463389-36463431)
chr4 (48-90)||(48893638-48893680)
chr4 (192-230)||(55822265-55822303)
chr4 (189-245)||(54906722-54906779)
chr4 (191-227)||(16489352-16489388)
chr4 (1-90)||(22295456-22295545)
chr4 (191-227)||(25699752-25699788)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-343)||(14335-14677)
scaffold0131 (1-385)||(14970-15352)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (42-386)||(183635-183977)
scaffold0005 (1-385)||(51960-52350)
scaffold0005 (1-90)||(50260-50351)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (12-377)||(79144-79510)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-385)||(3948-4331)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (42-386)||(41477-41821)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (42-385)||(69286-69632)
scaffold0025 (232-343)||(73207-73318)
scaffold0025 (221-264)||(73160-73203)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-383)||(79812-80198)
scaffold0004 (192-230)||(188386-188424)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-385)||(11422-11810)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (45-384)||(6151-6490)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (47-384)||(2832-3168)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (45-343)||(34-332)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (44-343)||(29164-29462)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-383)||(85184-85566)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (1-410)||(15774-16180)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (42-267)||(1447-1671)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (105-342)||(2036-2272)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-376)||(16602-16975)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (1-374)||(1594-1958)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (156-383)||(35593-35819)
scaffold0011 (20-82)||(35848-35912)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (60-377)||(4773-5089)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (44-231)||(22221-22407)
scaffold0140 (44-231)||(24496-24682)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (215-386)||(993-1169)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (44-90)||(4675-4721)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (42-82)||(1445-1485)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (48-90)||(20415-20457)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (192-230)||(224819-224857)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 37705733 - 37706145
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  37705733 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccat 37705832  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705833 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 37705932  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37705933 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatt 37706032  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattg 400  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706033 tgtcgttgcctttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattg 37706132  T
Q  401 taaaaaatctgac 413  Q
    |||||||||||||    
T  37706133 taaaaaatctgac 37706145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25904431 - 25904047
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25904431 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtc 25904332  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||     
T  25904331 atccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcc 25904232  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||     
T  25904231 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagt 25904132  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25904131 tttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 25904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 377
Target Start/End: Original strand, 10474275 - 10474652
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||    
T  10474275 aaaagtagaaattagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagcca 10474374  T
Q  100 ttcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||      
T  10474375 tccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcct 10474474  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474475 gtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgtatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagat 10474574  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10474575 ttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatttcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 10474652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24127184 - 24126800
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24127184 caaaagtagaaaacaacgagagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 24127085  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  || |||||||||     
T  24127084 ctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc 24126985  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24126984 cgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaatcaatcttcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagt 24126885  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24126884 tttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagccccatctatctcaaggtttacactgatataatgtctatatttatagtaaaag 24126800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 18511163 - 18511507
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  18511163 aaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 18511262  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||     
T  18511263 ctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcc 18511362  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18511363 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagt 18511462  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18511463 tttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18511507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17073201 - 17072827
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | | ||||| ||    
T  17073201 aacagcgagagaaaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttac 17073102  T
Q  110 tata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaag 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  17073101 tataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaag 17073002  T
Q  209 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17073001 agattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 17072902  T
Q  309 cgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
      |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17072901 tctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 17072827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 40221833 - 40221460
Alignment:
Q  19 agagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||| ||    
T  40221833 agagagaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatg 40221734  T
Q  116 atgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  40221733 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactca 40221634  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttct 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  40221633 atcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattct 40221534  T
Q  316 aaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactc 389  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40221533 aaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgagtcaatgtctatatttatagtaaaagtaactc 40221460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 17818441 - 17818852
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagaga--aaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  17818441 caaaagtagaaaacagcgagagagagaaaggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagaa--g 17818538  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | |  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  17818539 ccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctctt 17818638  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  17818639 cccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactcta 17818738  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 396  Q
    | ||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17818739 gttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcag-cccctctttctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttataacaaaagtaactcccataaa 17818837  T
Q  397 attgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||||| |||||||    
T  17818838 attgtaacaaatctg 17818852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 10529093 - 10529437
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  10529093 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 10529192  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529193 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10529292  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  10529293 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaacccactctatc 10529392  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    |||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  10529393 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 10529437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21948333 - 21947969
Alignment:
Q  22 gagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||    
T  21948333 gagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatga 21948234  T
Q  120 gtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcc 219  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  21948233 gtaacgttacaaaagagatatcaaggggttacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcc 21948134  T
Q  220 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21948133 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaac 21948034  T
Q  320 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | || |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  21948033 ccttgtttcag-cccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 21947969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39854800 - 39854425
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | | || | |||    
T  39854800 aacagcgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccac 39854701  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | | ||||||| |||||||| ||    
T  39854700 tatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatga 39854601  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39854600 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 39854501  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
     |||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  39854500 ctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 39854425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26098059 - 26097675
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  26098059 caaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc 26097960  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
      | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   | |||     
T  26097959 tct-gttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcc 26097861  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  26097860 cgtaaccaagagactcattcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaaccctctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagt 26097762  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  26097761 tttgttgttgccattctaaacctttatttcagccccctctatctcaaagtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 26097675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25804309 - 25804009
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  25804309 aagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 25804211  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804210 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 25804111  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  25804110 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttgagccccctctatc 25804011  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  25804010 tc 25804009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 2818284 - 2818673
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2818284 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 2818383  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |  || ||    
T  2818384 tcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctttt 2818483  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc-aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  2818484 cccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaatcaaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccat 2818583  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  2818584 agttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 2818673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 16092150 - 16092495
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| | ||  |    
T  16092150 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaacc 16092249  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  16092250 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 16092349  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  16092350 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaa 16092449  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16092450 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctc 16092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Original strand, 31472606 - 31472948
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31472606 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 31472705  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472706 caatgggttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 31472805  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  31472806 atcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctat 31472905  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||    
T  31472906 ctcaaggtttacactaatacaatgtccatatttatagtaaaag 31472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 1189558 - 1189949
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggg-ggagaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||      
T  1189558 caaaagtagaaaactgcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatc 1189657  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    | | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||    
T  1189658 cctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 1189757  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1189758 cctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgta 1189857  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  1189858 gttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 1189949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 25921467 - 25921810
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  25921467 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 25921566  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25921567 aatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaa 25921666  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25921667 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 25921766  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  25921767 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 25921810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 18509268 - 18509648
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  18509268 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagc 18509367  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | |||||||    
T  18509368 ccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaacgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttc 18509467  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509468 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctag 18509567  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagcccc-ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     ||||||||||   ||||||||| || |||||||||| || | |||||| |||||  |||||  || ||||||||||||||    
T  18509568 ttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccctctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatag 18509648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6756820 - 6756470
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  6756820 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 6756721  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  6756720 ct-cgtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg--ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 6756624  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6756623 ccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttag 6756524  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6756523 ttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcagctccctctatctcaaagttta 6756470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 36402291 - 36402665
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||    
T  36402291 aacagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcac 36402389  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||   | |||||| || |||||||||||    
T  36402390 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaaga 36402489  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||     
T  36402490 gattcaatcctaatagtattttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgt 36402589  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  36402590 cattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaacgtttactctgatataaggtctatatttatagtaaaagta 36402665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4236913 - 4236571
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  4236913 aagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 4236815  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4236814 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 4236715  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  4236714 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatc 4236615  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  4236614 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 4236571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38882390 - 38882048
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  38882390 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 38882292  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882291 aatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38882192  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc-cccctctat 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  38882191 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctctat 38882092  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  38882091 ctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 38882048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Original strand, 39397987 - 39398327
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||| ||||||    
T  39397987 aagaatgttttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatc 39398086  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||   | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398087 aatgggttacaagaataagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 39398186  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  39398187 tcaaccctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctat 39398284  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||| |||||    
T  39398285 ctcaaggtttacaccggtacaatgtttatatttatagtaaaag 39398327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2175203 - 2174903
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||| |||||| ||||||| | || |||    
T  2175203 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa-gagaaatc 2175105  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2175104 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaa 2175005  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2175004 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 2174905  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  2174904 tc 2174903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6745353 - 6745053
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  6745353 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 6745254  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745253 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 6745154  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  6745153 tcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgtttcagccccctttatc 6745055  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  6745054 tc 6745053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18466969 - 18466668
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | |||| || ||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  18466969 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 18466870  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466869 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18466770  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18466769 tcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 18466670  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  18466669 tc 18466668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27912821 - 27912520
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  27912821 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 27912722  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912721 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27912622  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  27912621 tcaaccctcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcaccctctatc 27912522  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  27912521 tc 27912520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18596973 - 18596589
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagag-agaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||     
T  18596973 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagc 18596876  T
Q  98 cattcgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  18596875 catccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctctt 18596776  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18596775 cccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccta 18596676  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||||||||  || | || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18596675 gttttgttgtt--gtctttatacccttgtttcagccccctctatcccaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 18596589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31465940 - 31466314
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |    
T  31465940 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc 31466039  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
              |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||     
T  31466040 ----------ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcc 31466128  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31466129 cgtaaccaagagactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagt 31466228  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  31466229 tttgtcgttacttttttaaacctttgtttcagccccttttatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31466314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 658309 - 658610
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| |    
T  658309 caaaagtagaaaacagcaagagaaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagcc 658403  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||     
T  658404 atccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 658503  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  658504 cgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagt 658603  T
Q  299 tttgttg 305  Q
    |||||||    
T  658604 tttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 383
Target Start/End: Original strand, 34530731 - 34531001
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  34530731 atgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtagccaagagac 34530830  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34530831 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatt 34530930  T
Q  313 tctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || |||||    
T  34530931 tctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttacagtaaaag 34531001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16776442 - 16776135
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||    
T  16776442 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatc 16776343  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776342 aatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 16776244  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  16776243 tcaacccacaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgtttcagccccctctatc 16776144  T
Q  342 tcaaggttt 350  Q
    |||| ||||    
T  16776143 tcaaagttt 16776135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2954742 - 2954368
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||  |    
T  2954742 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatcc 2954645  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  2954644 ctccgcttcactatatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttct 2954546  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  2954545 cgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctag 2954446  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 375  Q
     ||||||| ||  |||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  2954445 ttttgttgctgtctttctaaacccttgtttcatactcctctatctcaaagtttacactgatacaaagcctatatttat 2954368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 696203 - 695833
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |    
T  696203 caaaagtagaaaacaaca---gagaaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagcc 696107  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  696106 ctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 696007  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||           |||||||||||||    
T  696006 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaag-----------atacaaaccctag 695919  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||    
T  695918 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctttatctcaaggtttacactcatacaatgtctatattcatagtaaaag 695833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 43 - 343
Target Start/End: Original strand, 34477048 - 34477349
Alignment:
Q  43 agaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  34477048 agaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatca 34477146  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34477147 atgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtga 34477246  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34477247 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 34477346  T
Q  341 ctc 343  Q
    |||    
T  34477347 ctc 34477349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 31179368 - 31179707
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || || |||    
T  31179368 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaat 31179466  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179467 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 31179566  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  31179567 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctc 31179666  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  31179667 aaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 31179707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31545362 - 31545023
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | ||||||||||||||||   ||||||| | || ||||||    
T  31545362 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaat 31545264  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545263 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 31545164  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  31545163 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctc 31545064  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  31545063 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31545023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18469294 - 18468995
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||   |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| || |||    
T  18469294 aagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagag--cagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 18469197  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469196 aatgggttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18469097  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18469096 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 18468997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27910735 - 27910435
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||   | |||| || ||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  27910735 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 27910636  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910635 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27910536  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  27910535 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacc-ttgtttcagcccccgctatc 27910437  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  27910436 tc 27910435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 12555917 - 12556260
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagg-gatat 140  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | | |||||| || || |||||||||| |||||||| | ||| |    
T  12555917 aagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgt 12556016  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12556017 caatgagttacaagaaaaagtctcttgtctaattcta-ccaaaactccaatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtga 12556115  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12556116 atcaaccctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttatttcagccccctctat 12556215  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  12556216 ctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 12556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31543016 - 31542678
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | ||||||||||||||||   ||||||| | || ||||||    
T  31543016 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaat 31542918  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542917 gggtt-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 31542819  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31542818 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 31542719  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  31542718 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 31542678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 34479412 - 34479714
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  34479412 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 34479510  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||  |  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34479511 aatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtg 34479610  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  34479611 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 34479710  T
Q  340 tctc 343  Q
    ||||    
T  34479711 tctc 34479714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6747589 - 6747290
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | | || | |||||||||| ||||||| |||||||| | | |||    
T  6747589 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaaagaa-atc 6747491  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747490 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 6747391  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6747390 tcaaccctcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatc 6747292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Original strand, 21684448 - 21684746
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||||    
T  21684448 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaa 21684546  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21684547 tgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatc 21684646  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21684647 aacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 21684746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15552527 - 15552229
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  15552527 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 15552429  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552428 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 15552329  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  15552328 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 15552229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21289087 - 21288715
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||   ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | |    
T  21289087 caaaagtagaaaacaacgagagaacaaaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 21288988  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  21288987 ccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaag--------atgagttacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccg 21288896  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca------aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21288895 taaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaaggtgaatcaaccctcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccc 21288797  T
Q  295 tagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
    ||  ||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  21288796 tatttttattgttgctattctaaacccttatttcaaccccctctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttata 21288715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2724221 - 2723964
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  2724221 caaaagtagaaaacagcgaaagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 2724122  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||         | |||||||||     
T  2724121 ctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcc 2724031  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2724030 cgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcatccctcaaaccctagtgtttg 2723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 260
Target Start/End: Original strand, 41585738 - 41585956
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41585738 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatc 41585837  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41585838 aatgacttacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaa 41585937  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagt 260  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41585938 tcaaccctcaaaccctagt 41585956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 6661139 - 6661511
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||| || ||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||    
T  6661139 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaa-agagaacacacgaaatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtc 6661235  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || |||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |  ||| |||||    
T  6661236 atccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttc 6661335  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  6661336 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaacc--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaa 6661432  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     ||| ||||||   ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  6661433 ttttcttgttg-acttctaaacccttgtttcaaccctctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6661511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 249
Target Start/End: Original strand, 20505813 - 20506042
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgat 117  Q
    ||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | | ||||||||||||||||    
T  20505813 gagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagccctccgtttcactatatgat 20505910  T
Q  118 gagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaat 217  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20505911 gagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaat 20506010  T
Q  218 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506011 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 20506042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 169 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20042994
Alignment:
Q  169 ctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 268  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  269 ccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtcta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||  || | |||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctatgatacaaagccta 20043009  T
Q  369 tatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||| |||||    
T  20043008 tatttatagtaaaag 20042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 165 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20044954
Alignment:
Q  165 ccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 264  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  265 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  || |    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgtttcagccccctctgtctcaaggtttgctctgatacaaag 20044973  T
Q  365 tctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||||||| |||||    
T  20044972 cctatatttatagtaaaag 20044954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 179 - 385
Target Start/End: Original strand, 26098382 - 26098588
Alignment:
Q  179 ccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagaca 278  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26098382 ccaaaaccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagaca 26098481  T
Q  279 aactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagc 378  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||||||||     
T  26098482 aactctatacaaaccctagtcttcttgttgccattctaaacccttatttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagt 26098581  T
Q  379 aaaagta 385  Q
    |||||||    
T  26098582 aaaagta 26098588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10587117 - 10586873
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggg-agaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||    
T  10587117 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaat 10587019  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10587018 caatgggttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggtga 10586919  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactcta 285  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  10586918 atcaaccctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaactcta 10586873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39798332 - 39798126
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| | | || | ||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||    
T  39798332 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatc 39798233  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798232 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 39798133  T
Q  242 tcaaccc 248  Q
    |||||||    
T  39798132 tcaaccc 39798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4410307 - 4410090
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||   | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  4410307 aagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 4410209  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410208 aataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 4410109  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagt 260  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4410108 tcaacccacaaaccctagt 4410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9020432 - 9020197
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||| ||||||| ||    
T  9020432 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaac 9020333  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtt 312  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| |||||| |     
T  9020332 tcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttg-tgttgcctc 9020238  T
Q  313 tctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 353  Q
     | || ||||  ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  9020237 ccaaacccttgttttcagctccctctagcacaaggtttaca 9020197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10749985 - 10749796
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||    
T  10749985 aagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 10749887  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10749886 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36208901 - 36208524
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaa-cgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |     
T  36208901 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaaacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatggggaa-agagcagccc 36208805  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtct-cccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  36208804 gccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttc 36208705  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |   ||||||||| | |   ||  ||||| || |||| || |||||||||    
T  36208704 ccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtgaatcaa--caacaaccctagtttctcccgcttagaga-aatctctcta-aaaccctag 36208609  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  36208608 -tttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 36208524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20054164 - 20053834
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaa-gagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| | |||    
T  20054164 caaaagtagaaaacg--aagagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcag 20054067  T
Q  97 tcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | | ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||  || ||||||     
T  20054066 ccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc---gggttacaagaataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatctc- 20053971  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||    
T  20053970 -ca---aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactct 20053878  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    || |||  ||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  20053877 agtttttgtgttgc-cttctaaacccttgtttcagcgccctctat 20053834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10757461 - 10757273
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||    
T  10757461 aagaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gaaaaatc 10757363  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757362 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 15354571 - 15354757
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| | ||||||||| |||| |||| || |||||    
T  15354571 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 15354669  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15354670 tgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23665326 - 23665140
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  23665326 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 23665228  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665227 tgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 23793261 - 23793447
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  23793261 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 23793359  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793360 tgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 3373134 - 3373320
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  3373134 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 3373232  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373233 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 15356847 - 15357033
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||| | | || | |||||| | ||||||||| ||||||| | || |||||    
T  15356847 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 15356945  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356946 tgggttacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 38960129 - 38960314
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  38960129 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaat 38960227  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960228 gggttacaagaat-agtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 285
Target Start/End: Original strand, 17413232 - 17413402
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |   |||||||||| | |||  |  ||||||||| | | |||||||||    
T  17413232 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctcttcccttgaccaagaga 17413331  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17413332 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 17413402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15143776 - 15143547
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    |||||||| | ||||||||| || ||| |||||| ||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||     |||| ||||||| |||    
T  15143776 gagagaaaagtagagagaacacacgaaatttgtttacccatttcggtcaaatactgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatga 15143677  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15143676 tgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactca 15143577  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15143576 atcctaacagtgcttccaaaggtgaatcaa 15143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 23741855 - 23742034
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  23741855 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 23741953  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaata 224  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23741954 tgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 385
Target Start/End: Original strand, 20507659 - 20507799
Alignment:
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20507659 acccttaaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 20507758  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  20507759 aagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 20507799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 26098237 - 26098380
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagaga--aaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-gggggagaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  26098237 caaaagtagaaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagca 26098336  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggata 139  Q
    | | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26098337 gccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770690
Alignment:
Q  159 agtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 258  Q
    |||||| || ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||   |||| ||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaatagt--ttcccatggtgaatgaacccc--aacctta 42770839  T
Q  259 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||| || | || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  42770838 gtgtttgttgccaagag-caaattctatataaacc-taattttgt-gttgccttccaaacccttgttttcagtcccctctatctcaaggtttactc-gat 42770743  T
Q  359 gtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
      || || ||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || |||||||    
T  42770742 acaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatctg 42770690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20043317 - 20043206
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |    
T  20043317 caaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaacc 20043219  T
Q  99 attcgtttcacta 111  Q
    |||||||||||||    
T  20043218 attcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770954
Alignment:
Q  112 tatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaa 42770954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 276
Target Start/End: Original strand, 34033632 - 34033797
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatc-aatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||| | || |||||| |   || ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||    
T  34033632 atgatgagtaactttacaaaagagatatcgaaggggttaccataacaagtcttcaaacttaattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaaga 34033731  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  34033732 gactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatcaatc--ccaacgctagtgtttgttgccaagaga 34033797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754188
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 267  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 4754215  T
Q  268 gccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4754214 gccaagag-caaactc--tacaaaccctag 4754188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 297
Target Start/End: Original strand, 2144706 - 2144811
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt-ttgttgccaagagacaaactctat 286  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  2144706 aatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-caaactc--t 2144800  T
Q  287 acaaaccctag 297  Q
    |||||||||||    
T  2144801 acaaaccctag 2144811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410045
Alignment:
Q  287 acaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 4410045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 15445237 - 15445376
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||| |||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  ||| | ||| | |||||| ||||||| |||    
T  15445237 gagagaaagaaagagaaaacacacgaaatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttccactataatga 15445335  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaat 157  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15445336 tgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaat 15445376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4897943 - 4897828
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||  |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||| |    
T  4897943 atgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagata 4897844  T
Q  212 ctcaatcctaatagtg 227  Q
    ||||||||||| ||||    
T  4897843 ctcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29748485 - 29748370
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 287  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||   || ||| ||    
T  29748485 aatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatcct--aaccctactgtttgttgccaagag---aattctcta 29748391  T
Q  288 caaaccctagatttgttgttg 308  Q
    |||||||||| ||| ||||||    
T  29748390 caaaccctagttttcttgttg 29748370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2723961 - 2723911
Alignment:
Q  333 ccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2723961 ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 2723911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 385
Target Start/End: Original strand, 41585946 - 41586043
Alignment:
Q  288 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||| |||||| |||   ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||| |||||||    
T  41585946 caaaccctagttttgttcttgttattctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaaacctatatttatagtaaaagta 41586043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Original strand, 15224911 - 15224997
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    ||||||||| | | ||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15224911 aatctcttcccatgaccaaaagactttatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcat--aaccctagtgtttgttgccaagaga 15224997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 276
Target Start/End: Original strand, 31782578 - 31782690
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaaccc---tcaaaccctagtgt 262  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||  |    | |||||||||||    
T  31782578 cctaattctacccaattccc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttttgttcaaggtgaatcaaaacaatcccaaccctagtgt 31782676  T
Q  263 ttgttgccaagaga 276  Q
    ||||||||||||||    
T  31782677 ttgttgccaagaga 31782690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35430338 - 35430259
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaa-accctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35430338 cctaattctacccaaagacccgaatctcttccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 35430259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1170849 - 1170811
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170849 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 2298145 - 2298183
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298145 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 8565946 - 8565988
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  8565946 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgaga 8565988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19806531 - 19806489
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19806531 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 19806489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32636992 - 32636950
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32636992 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 32636950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 35385596 - 35385634
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35385596 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10627405 - 10627364
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627405 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28786623 - 28786543
Alignment:
Q  11 aaacagcaagagagaaa-ggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  28786623 aaacagcaagagataaaaggaag-gagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggaga 28786543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23667601 - 23667415
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||| ||| | ||| | | || | || ||| |||||||| || |||| |||| || |||||    
T  23667601 gaatttgttggcccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttac-aaagagaaatcaa 23667503  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||| |||| || ||| |  ||||||||||| ||||||  || ||||||||   |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  23667502 tgggttgcaagcat-agtttttcgcctaattctttccaaagtcccaatctctttctgtaagcaagagagtccaatccttatagtgtttc 23667415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 42238482 - 42238399
Alignment:
Q  11 aaacagcaagagagaaa-ggaaga--gagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  42238482 aaacagcaagagataaaaggaagaaggagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggaga 42238399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 111)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 11457428 - 11457812
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  11457428 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagac 11457527  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  11457528 atccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcg 11457627  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  11457628 cgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagt 11457727  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11457728 tttgttgttgtctttctaaaccattgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 11457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18307437 - 18307033
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  18307437 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcc 18307339  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  18307338 atccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 18307239  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18307238 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctag 18307139  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 397  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18307138 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaaatagctcccataaaa 18307039  T
Q  398 ttgtaa 403  Q
    ||||||    
T  18307038 ttgtaa 18307033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 12302458 - 12302850
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  12302458 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagcc 12302557  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||     
T  12302558 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcc 12302657  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12302658 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagt 12302757  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  12302758 tttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtaa 12302850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13215412 - 13215023
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |    
T  13215412 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 13215313  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaggga----tatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||    
T  13215312 ccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctct 13215213  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13215212 tcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccct 13215113  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  13215112 agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 13215023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41647248 - 41646862
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||| |    
T  41647248 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagcc 41647149  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  41647148 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcc 41647049  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  41647048 cgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccataaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagt 41646949  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  41646948 tttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 41646862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6756854 - 6756443
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggg-agaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||  ||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||    
T  6756854 caaaagtagaaaacagc--gagaggaaagaagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagt 6756757  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  6756756 cttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 6756657  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-gagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6756656 ctcgtaatcaaga--ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccct 6756559  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataa 395  Q
    || ||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6756558 agttttgttgttgcctttctaagcccttgtttcagtcccctctatttcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactctcataa 6756459  T
Q  396 aattgtaaaaaatctg 411  Q
    |||||||| |||||||    
T  6756458 aattgtaacaaatctg 6756443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 9241040 - 9241453
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  9241040 caaaagtagaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagcc 9241137  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  9241138 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttc 9241237  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241238 tcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 9241337  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcag-ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 396  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9241338 ttttgttgttgcctttctaaacc-ttgtttcagcccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaacccccataaa 9241436  T
Q  397 attgtaaaaaatctgac 413  Q
    |||| || |||||||||    
T  9241437 attggaacaaatctgac 9241453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 383
Target Start/End: Original strand, 50076627 - 50077009
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  50076627 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgggg-agagagcagtca 50076724  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||     
T  50076725 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcc 50076824  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  50076825 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagt 50076924  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||  |||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50076925 tttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccctttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 352
Target Start/End: Original strand, 50307542 - 50307853
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  50307542 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtc 50307641  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307642 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 50307741  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||| | |||    
T  50307742 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttttttcagccccatatat 50307841  T
Q  341 ctcaaggtttac 352  Q
    ||||||||||||    
T  50307842 ctcaaggtttac 50307853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18839916 - 18839531
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| |    
T  18839916 caaaactagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagcc 18839817  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | |||||||    
T  18839816 ctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttc 18839717  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18839716 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctag 18839617  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18839616 ttttgttgttgcctatctaaacccttgtttcagccccctctatctcatggtttacaataatacaatgtctatatttatagtaaaag 18839531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16428980 - 16428595
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  16428980 caaaagtagaaaacatc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 16428883  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||    
T  16428882 ctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttc 16428783  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428782 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctag 16428683  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||   |||||||||||| |||||||    
T  16428682 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctaatggtttgctctgatataaaacctatatttatagtaaaagta 16428595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 2949185 - 2949570
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  2949185 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggagagagcagcc 2949283  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||     
T  2949284 ctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattct 2949383  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2949384 cgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagt 2949483  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||| ||||||||||| | |||||||    
T  2949484 tttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttttctcggattcaatatctatatttattgtaaaagta 2949570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 385
Target Start/End: Original strand, 17324588 - 17324975
Alignment:
Q  3 aaagtagaaaacagcaagaga---gaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  17324588 aaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 17324687  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  17324688 cctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 17324787  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17324788 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccag 17324887  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     |||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||| ||| |  || |||||||||||||| |||||||    
T  17324888 ttttgttgttgccattctaaacccttgttttagccccctgtatcttcaggtttactctggttcaaggtctatatttatagtaaaagta 17324975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 25251227 - 25251611
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||  |    
T  25251227 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaacc 25251326  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  25251327 ctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 25251426  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  25251427 ccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctag 25251526  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  25251527 ttttgttgttgtctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 25251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 14097922 - 14098301
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| |    
T  14097922 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagcc 14098021  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  14098022 ctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttc 14098121  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14098122 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctag 14098221  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     ||||| ||||| ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||   ||||  || ||||||||||||||    
T  14098222 ttttgtagttgcctttttaaaccattgtttcagtcccctctatctcaaagtttagtttgatacaaggtctatatttatag 14098301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 6995696 - 6996039
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  6995696 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtc 6995795  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6995796 aatgagttacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaa 6995895  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  6995896 tcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgtttcggccccctctatc 6995995  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||| ||||| |||||  || |||||||||||||  |||||||    
T  6995996 tcaagatttactctgattcaaggtctatatttataataaaagta 6996039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47906599 - 47906254
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||     
T  47906599 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagc 47906500  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  47906499 cctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttc 47906400  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47906399 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatag 47906300  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
     |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47906299 ttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47906254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51750324 - 51749982
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  51750324 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 51750225  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750224 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51750125  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51750124 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 51750025  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  51750024 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 385
Target Start/End: Original strand, 3579588 - 3579957
Alignment:
Q  19 agagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatga 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| |||||||||| ||||    
T  3579588 agagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atga 3579686  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaa 216  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3579687 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaa 3579786  T
Q  217 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttcta 316  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  3579787 tcctaattgtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctg 3579886  T
Q  317 aacctttatttcag--ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| || ||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  3579887 aacccttgtttcagccccccctctatctcaaattttacgctgatacaaggtctatatttaaagtaaaagta 3579957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 17186082 - 17186458
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||      
T  17186082 caaaagtagaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagca 17186179  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||   | |||||||||    
T  17186180 ctccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttc 17186279  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17186280 ccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctag 17186379  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||    
T  17186380 ttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaaatctatatttata 17186458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 383
Target Start/End: Original strand, 50078779 - 50079158
Alignment:
Q  8 agaaaacagcaagagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgt 104  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||    
T  50078779 agaaaacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgt 50078878  T
Q  105 ttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaa 203  Q
    | ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||    
T  50078879 tccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaa 50078978  T
Q  204 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgt 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50078979 ccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgt 50079078  T
Q  304 tgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    || ||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50079079 tgctgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 50079158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 50248523 - 50248909
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaa--acag 96  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||     
T  50248523 caaaagttgaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaa 50248622  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |   |||||||    
T  50248623 ccatctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctctt 50248722  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  50248723 cctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcata 50248822  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50248823 gttttgttgttgtctttttaaacctttgtttcagctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 50248909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 31424968 - 31425331
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |    
T  31424968 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagcc 31425066  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  31425067 ttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttt 31425166  T
Q  198 acgtaaccaagag---actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaacc 293  Q
     ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31425167 ccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaacc 31425266  T
Q  294 ctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31425267 ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttacattgat 31425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 10399824 - 10400166
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  10399824 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 10399923  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399924 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10400023  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10400024 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatc 10400123  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||   |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  10400124 tcccagtttgctctgatacaaggtctatatttatagaaaaagt 10400166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31490240 - 31489859
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |    
T  31490240 caaaagtagaaaacagggagagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagcc 31490142  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||     
T  31490141 ctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcc 31490042  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||     
T  31490041 cgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagt 31489944  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  31489943 tttgttgttacctttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 31489859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 38925436 - 38925817
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  38925436 caaaagtagaaaaca--atgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcc 38925532  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  38925533 ctccgttttactat--gatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 38925630  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  38925631 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagt 38925730  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  38925731 tttgttgttgcctttctgaactcttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 38925817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39462835 - 39462469
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | ||||||||    
T  39462835 aacagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcac 39462737  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  39462736 tatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggttacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 39462637  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39462636 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctaaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgc 39462537  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  39462536 atttctaaacctttgtttcagccttctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatag 39462469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17324372 - 17324016
Alignment:
Q  19 agagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgat 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| | | |||||||||||| ||||    
T  17324372 agagagaaaggaagagagaacacaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgat 17324273  T
Q  118 gagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaat 217  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   | ||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  17324272 gaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaat 17324173  T
Q  218 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||| || ||||| |    
T  17324172 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaatc--agttttgttgtggcctttctga 17324075  T
Q  318 acctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  17324074 acccttgttttagccctctctatctcaaggtttactctaatacaaagtctatatttata 17324016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 28998249 - 28998592
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  28998249 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 28998348  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998349 aatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28998448  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28998449 tcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatc 28998548  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28998549 tcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 28998592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 29003965 - 29004308
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  29003965 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtc 29004064  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004065 aatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 29004164  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29004165 tcaaccctcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcctcctctatc 29004264  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  29004265 tcaaagtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 29004308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20302743 - 20302410
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | || | |||||| ||||||||| | ||||||| | || |||    
T  20302743 aagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 20302645  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302644 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20302545  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20302544 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20302445  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||    
T  20302444 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 20302410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 15294830 - 15295131
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  15294830 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 15294929  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294930 aatgggttacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 15295029  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  15295030 tcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatc 15295129  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  15295130 tc 15295131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15823863 - 15823488
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | |  ||| |||    
T  15823863 aacaacaagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccac 15823764  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||    
T  15823763 tatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaga 15823664  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15823663 gactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 15823564  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     |||||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15823563 ctttctaaacccttgtttcagccccctttatctctaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15823488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 31422813 - 31423241
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  31422813 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagcc 31422912  T
Q  99 attcgtttcac------------tata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaac 185  Q
     |  |||||||            |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  31422913 ctctgtttcaccctctctttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 31423012  T
Q  186 cctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactct 284  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  31423013 ctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactct 31423112  T
Q  285 atacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||    
T  31423113 atataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcttatatttatagtaaaagt 31423212  T
Q  385 aactcccataaaattgtaaaaaatctgac 413  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||    
T  31423213 atctcccataaaattggaacaaatctgac 31423241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6823299 - 6822958
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  6823299 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 6823200  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6823199 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaa 6823100  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6823099 tcaacccacaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 6823001  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| |||| | |||||  || ||||||||  |||| ||||||    
T  6823000 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagt 6822958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25128202 - 25127856
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagaga--gaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||     
T  25128202 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagc 25128103  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctct 195  Q
    | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||    
T  25128102 cctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaattacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctct 25128004  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25128003 tcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccct 25127904  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    || ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  25127903 agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaggcccctctatctc 25127856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 2510321 - 2510667
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||    
T  2510321 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaactttacaagagagaaatc 2510420  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2510421 aatgggttacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaa 2510519  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  2510520 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgtttcagccccctctatc 2510619  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  2510620 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 2510667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24325948 - 24325648
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  24325948 aagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatc 24325849  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24325848 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaa 24325749  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  24325748 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgtttcagccccctctatc 24325650  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  24325649 tc 24325648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 28207019 - 28207405
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28207019 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 28207118  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  28207119 ccctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctctt 28207216  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  28207217 cctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaactctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaacccta 28207316  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28207317 gttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28207405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28840964 - 28840620
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  28840964 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 28840866  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840865 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28840766  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta-- 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||| ||      
T  28840765 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgtttcatccccctgtatc 28840666  T
Q  340 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28840665 tctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28840620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 31735517 - 31735864
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  31735517 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 31735616  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31735617 aatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaa 31735716  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  31735717 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 31735816  T
Q  342 tca----aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||    | |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  31735817 tcattcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 31735864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28842778 - 28842435
Alignment:
Q  43 agaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || | | |||| |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  28842778 agaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatca 28842680  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28842679 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaat 28842580  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta--t 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |    
T  28842579 caacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 28842480  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||| |||| | |||||  || || ||||||||||| |||||||    
T  28842479 ctcaaagtttgctctgatacaaggtttatatttatagtaaaagta 28842435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40134272 - 40133937
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  40134272 caaaagtagaaaacaacgagagaaaaag-aatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 40134174  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  40134173 atccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttc 40134074  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  40134073 ccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcg 40133974  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagcccc 334  Q
     ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||    
T  40133973 ttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagcccc 40133937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2617798 - 2617466
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  2617798 aatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 2617699  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617698 gggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 2617599  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  2617598 accctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctca 2617499  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    | |||| | |||||  || ||||||||||||||    
T  2617498 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatag 2617466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17319215 - 17318868
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  17319215 caaaagtagaaaatagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggg-agagagcagcc 17319117  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| |||    
T  17319116 ctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataagttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttc 17319017  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17319016 ccgtaaccaagagactcaatcc------tgtttcccaaggtgaatcaaccttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctag 17318923  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318922 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttac 17318868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 50 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451590
Alignment:
Q  50 gttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggtt 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagtt 47451820  T
Q  150 acaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 249  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         | || |||||||||||||    
T  47451819 acaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa------acactaatgtgaatcaaccct 47451726  T
Q  250 caaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtt 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||    
T  47451725 caaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgtttaagccccctctatctcaaagtt 47451626  T
Q  350 tacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  47451625 tactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 47451590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 27336891 - 27337235
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27336891 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 27336990  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  |  |||||    
T  27336991 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctctt 27337089  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||    
T  27337090 cccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaacccta 27337188  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27337189 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 27337235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 27339082 - 27339427
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27339082 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcag 27339181  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |  |||||    
T  27339182 ccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctctt 27339280  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27339281 cccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaacccta 27339380  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    | ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  27339381 gttttattgttgcctttctaagcccttgtttcagccccctctatctc 27339427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13762121 - 13761780
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  13762121 aagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 13762023  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13762022 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaa 13761923  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  13761922 tcaacccccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccctctctatc 13761823  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  13761822 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 13761780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20291741 - 20291400
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  | | || | |||||||||||||| | | ||||||| | || |||    
T  20291741 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgttacaaa-gagaaatc 20291643  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291642 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20291543  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  20291542 tcaaccctcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatctccctctatc 20291443  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||||  ||| | || ||  || |||||||||||||| ||||||    
T  20291442 tcaaaatttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 20291400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39932359 - 39932057
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga-gaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| | | |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  39932359 aagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaat 39932260  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39932259 caatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtta 39932160  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39932159 atcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 39932060  T
Q  341 ctc 343  Q
    |||    
T  39932059 ctc 39932057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16226448 - 16226110
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  16226448 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 16226350  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226349 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 16226250  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  16226249 acccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttttagacccctctatctca 16226150  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    | |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16226149 aagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 16226110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 4131328 - 4131692
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  4131328 caaaaatagaaaacaacgagagagaaaagaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4131427  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaggga----tatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatct 193  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || |  ||    
T  4131428 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcct 4131526  T
Q  194 cttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 293  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4131527 cttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacc 4131626  T
Q  294 ctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta--tctcaaggtttacactga 357  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  4131627 ctagttttgttgttgccattctaaatccttgtttcagccccctctatctctcaaggtttactctga 4131692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 335
Target Start/End: Original strand, 46431702 - 46431996
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggg--agaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggata 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |    
T  46431702 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaa 46431800  T
Q  140 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431801 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 46431900  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  46431901 aatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccc 46431996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 9463243 - 9463541
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  9463243 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 9463341  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463342 gggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 9463441  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9463442 aacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 9463541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48665403 - 48665113
Alignment:
Q  102 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg- 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||     
T  48665403 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgg 48665304  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48665303 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttt 48665204  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaacctttatttca------gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||       |||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  48665203 tgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 48665113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51752648 - 51752308
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | ||||||||| |||||| | ||||||| | || |||    
T  51752648 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatc 51752550  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51752549 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatc-taatagtgtttcacaaggtgaa 51752451  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  51752450 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgtttcagccccctctatc 51752351  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  51752350 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 51752308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 383
Target Start/End: Original strand, 14183589 - 14183923
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14183589 aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 14183688  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  14183689 atgggttgcaagaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttccaaggtgaat 14183788  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  14183789 caacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctag-tttg-tgttgc-attctaaacccttgtttcagccctctctatct 14183882  T
Q  343 caaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||| |||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  14183883 caaggtttactctgatacatggtctatatttatagtaaaag 14183923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 102 - 343
Target Start/End: Original strand, 21948244 - 21948484
Alignment:
Q  102 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   ||||| |||    
T  21948244 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcgtcttcccgt 21948343  T
Q  202 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagattt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21948344 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 21948442  T
Q  302 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21948443 gttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 21948484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 9459416 - 9459714
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  9459416 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 9459514  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459515 gggttacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 9459614  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9459615 aacccacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 9459714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47179993 - 47179697
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  47179993 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 47179896  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179895 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 47179796  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47179795 acccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47179697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42922557 - 42922151
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | |||||    
T  42922557 caaaagtagaaaacaac--gggagaaagaaagagataacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtc 42922460  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  42922459 ctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 42922360  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  42922359 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctag 42922263  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 397  Q
     ||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||     
T  42922262 ttttcttgttg-acttctaaacccttatttcaaccccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaat 42922164  T
Q  398 ttgtaaaaaatct 410  Q
    ||| || ||||||    
T  42922163 ttggaacaaatct 42922151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47177642 - 47177346
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  47177642 atttgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 47177545  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca-atcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177544 ggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 47177445  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47177444 acccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47177346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16432702 - 16432440
Alignment:
Q  23 agaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-gggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatg 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   |||||||||||| |||||    
T  16432702 agaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatg 16432603  T
Q  119 agtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatc 218  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||     ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16432602 agtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatc 16432503  T
Q  219 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaac 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16432502 ctaataatgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagacaaac 16432440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 8347227 - 8347636
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| | | ||  |    
T  8347227 caaaagtagaaaacagc--gatagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatcc 8347324  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  |||||||||    
T  8347325 ctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttc 8347424  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8347425 ccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccct--aaccttggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctag 8347521  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 396  Q
     ||| ||||||   ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||| ||||||| | | ||||||    
T  8347522 ttttcttgttg-acttctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttacatctgatacaaggtctat-tttatagtaaaagtacccctcataaa 8347619  T
Q  397 attgtaaaaaatctgac 413  Q
    |||| || |||||||||    
T  8347620 attggaacaaatctgac 8347636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 399
Target Start/End: Original strand, 49495206 - 49495552
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49495206 aagaatttctttacctagttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 49495305  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  49495306 caatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtga 49495405  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||        ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  49495406 atcaactc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctag-tttg-------atttataaacccttgtttcagccccctctat 49495493  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaatt 399  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  49495494 ctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaatt 49495552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 25248504 - 25248766
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  |||||| | ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||    
T  25248504 caaaagtagaaaacagcgagagacaccggaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtc 25248603  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctctt 196  Q
     | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  25248604 ctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctctt 25248702  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 260  Q
    |  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248703 cctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 25248766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823827
Alignment:
Q  128 acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaacc-------aagagactcaatcct 220  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||       |||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  221 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 6823892  T
Q  321 tttatttcagc-cccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
     || ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||  |||| ||||||    
T  6823891 cttgtttcagcccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatataaatagtaaaagt 6823827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16429267 - 16429042
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||| ||||| |||    
T  16429267 gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatga 16429168  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaa 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16429167 tgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaa 16429068  T
Q  217 tcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16429067 tcctaatagtgtttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 410
Target Start/End: Original strand, 18800600 - 18800932
Alignment:
Q  74 acctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaa 172  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||  | || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18800600 acctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaa 18800699  T
Q  173 ttctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa 272  Q
    ||||| |||||   | ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||    
T  18800700 ttctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagactcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaa 18800797  T
Q  273 gagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatt 372  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||   |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  18800798 gag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttg-acttctaaacctttgtttcagccccttgtatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatt 18800895  T
Q  373 tatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 410  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||    
T  18800896 tatagtaaaagtatc-ctcataaaattggaaaaaatct 18800932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669641
Alignment:
Q  72 tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 170  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  171 aattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 270  Q
    ||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 15669616  T
Q  271 aagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  15669617 aagag-caaactttatacaaacccta 15669641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Original strand, 6115074 - 6115304
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattc-gtttcactata-tg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||    
T  6115074 gagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag-cattccgtttcactataatg 6115172  T
Q  116 atgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |||||||||| || |||||||||||||    
T  6115173 atgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaagaataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactca 6115272  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 247  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6115273 atcctaatagtgtttttcaaggtgaatcaacc 6115304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 8349006 - 8349352
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| |||  |||| |||||| ||||||| ||||  |    
T  8349006 caaaagtagaaaaca--attagagaaagaaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaacc 8349103  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     |   || ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  8349104 ctctattccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttc 8349203  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  8349204 ccgtgaccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaa 8349300  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttt 350  Q
     ||| ||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8349301 ttttcttgttg-acttctaaacccttgtttcagccctctctatctcaaggttt 8349352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16231843 - 16231630
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  16231843 atttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 16231746  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231745 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 16231646  T
Q  245 accctcaaaccctagt 260  Q
    |||| |||||||||||    
T  16231645 acccacaaaccctagt 16231630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23786121 - 23785935
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  23786121 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 23786023  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23786022 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51757815 - 51757623
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | ||||||||| |||||| | |||| |||| || |||    
T  51757815 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttac-aaagagaaatc 51757717  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 235  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757716 gataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 13125411 - 13125768
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaa-gagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| || |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||  ||||| || | ||      
T  13125411 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaaagagagaacacatgaaatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaac 13125508  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
      | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||  || |||||||    
T  13125509 tctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctct 13125608  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata-caaaccc 294  Q
    || | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13125609 tcccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaaccc 13125705  T
Q  295 tagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    ||| ||  |||||| | |||| |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  13125706 tagtttccttgttg-gcttcttaacccttgtttcagccccctttctctcaagttttactctgat 13125768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23816171 - 23816030
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  | | || | || ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  23816171 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 23816072  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23816071 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 23816030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 377
Target Start/End: Original strand, 26520205 - 26520449
Alignment:
Q  138 tatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaac------caagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||      |||||||||||||| |||||||||||    
T  26520205 tatcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgttt 26520304  T
Q  231 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacc-tttatttca 329  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   ||||||||| ||  |||||    
T  26520305 cccaaggtgaatcaa-cctc-aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttg-acttctaaaccgttgttttca 26520400  T
Q  330 g-ccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  26520401 gcccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 26520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Original strand, 30790373 - 30790733
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaattt-gttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||| ||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||| | || ||||||| |||    
T  30790373 gagagaaagaaagagagcacacacgaattttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattccactataatga 30790471  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||  |   |||||||| ||||||||| ||||||     
T  30790472 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc- 30790570  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttct 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |    |  ||||| || |||||   ||||||||| ||| |||||  ||||||    
T  30790571 atcctaacagtgtttcccaaggtaaatcaacc--acaaccctagtgtctccctcttagaga-aatctcta---aaaccctag-tttattgtt-tgtttct 30790662  T
Q  316 aaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  30790663 aaactcttgttttcagctccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 30790733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Original strand, 30738695 - 30738830
Alignment:
Q  111 atatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||| || |||||||||   | |||||||    
T  30738695 atatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaaga 30738794  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30738795 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 30738830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16561794 - 16561545
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||  |    
T  16561794 caaaagtagaaaacggc--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaacc 16561697  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     || ||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||| |||||  |  ||||| ||    
T  16561696 ctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatt 16561597  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 248  Q
      |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561596 tccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 16561545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Original strand, 26613211 - 26613440
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |  ||   |  ||| ||||||| |||    
T  26613211 gagagaaagaaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctctctgttccactataatga 26613310  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    | |||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||| ||  |||||||||  || |||||| ||||||    
T  26613311 ttagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtgaccaagtgactca 26613410  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26613411 atccgaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 26613440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27916780 - 27916529
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatat-gatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27916780 aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttacaaa-gagatatca 27916682  T
Q  143 atg--ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    | |  ||||| |||||| ||||| |   |||||||| | |||||  |  |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27916681 aagaaggttaaaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtg 27916582  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    ||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  27916581 aatcaa--ttccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctag 27916529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 155963 - 155788
Alignment:
Q  70 attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg- 167  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||  |||||||||||| | ||| |       
T  155963 attgacctagtttgggg-agagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaa 155866  T
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155865 cctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 155788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15916718 - 15916562
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaa-cagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||     
T  15916718 caaaagtagaaaaacagc--gagaaaaagaaagagagaacgcacaaaatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagc 15916621  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaaga 155  Q
    | | |||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15916620 cctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaaga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 382
Target Start/End: Original strand, 25248756 - 25248850
Alignment:
Q  288 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||| ||||    
T  25248756 caaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttctagaaaaa 25248850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28279480 - 28279309
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||||| | |||  || ||||||||| ||| |||||||      
T  28279480 atgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaag 28279381  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28279380 ctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgtcaagag-caaactcta 28279309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 285
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332798
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaacc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 26332798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 13358858 - 13358810
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358858 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 13358810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16231641 - 16231544
Alignment:
Q  287 acaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16231641 acaaaccctagttttcttgttgcttttctagacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 16231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Original strand, 26332632 - 26332688
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26332632 aatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa 26332688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14353192 - 14353047
Alignment:
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaacc-ctaatctcttc 197  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||  || |||| |||||||||||||| || ||   |||||||||| |||||  | | ||||||||     
T  14353192 ttcgttccactataatgatgaataactttacaaaag--atttcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctacccaaagtctcgaatctcttt 14353096  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14353095 ccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 14353047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 377
Target Start/End: Original strand, 13127790 - 13127959
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 302  Q
    ||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  |||     
T  13127790 accaagagacttaattccaacaatgtttcccaaggtgaatctatc--ccaaccctagtgtttgttgccaaaag-gaaactctatataaaccctacttttc 13127886  T
Q  303 ttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||||||| | |||  || || |||||||||||    
T  13127887 ttgttg-gcttctaaacccttgtttca-acccctctctctaaaggtttactccgatacaaggtttatatttatag 13127959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49959240 - 49959129
Alignment:
Q  136 gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaacc-ctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-cc 233  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||   ||||||| ||||||||  | | ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  49959240 gatatcaaagggttaaaagaatcagtttcaaacctaattttatccaaagtctcgaatctcttctcatgaccaagagactcattcctaatagtgtttctcc 49959141  T
Q  234 aaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||||||    
T  49959140 aaggtgaatcaa 49959129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 351
Target Start/End: Original strand, 6115344 - 6115384
Alignment:
Q  311 tttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6115344 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttta 6115384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 4144644 - 4144726
Alignment:
Q  11 aaacagcaagagagaaaggaaga--gagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||   ||||||| |||||||||||    
T  4144644 aaacagcaagagataaaggaagaaggagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctactctgggggaga 4144726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 230
Target Start/End: Original strand, 4144826 - 4144865
Alignment:
Q  191 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144826 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43104375 - 43104332
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaa 156  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43104375 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaa 43104332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 834167 - 834209
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  834167 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggaga 834209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2232635 - 2232597
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232635 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 28220226 - 28220268
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28220226 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 28220268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 28265554 - 28265596
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28265554 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 28265596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 40122196 - 40122238
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  40122196 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggaga 40122238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 45644354 - 45644396
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45644354 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 45644396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 49918518 - 49918476
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  49918518 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggaga 49918476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 50167175 - 50167217
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  50167175 ttgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggaga 50167217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14997081 - 14997040
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997081 aatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Original strand, 13447269 - 13447301
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 74  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13447269 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Original strand, 21353335 - 21353391
Alignment:
Q  35 agaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21353335 agaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggaga 21353391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Original strand, 32889443 - 32889483
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32889443 ttgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctggggga 32889483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1225549 - 1225138
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | | |    
T  1225549 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggcc 1225452  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagg-gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  1225451 atccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttc 1225352  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1225351 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctag 1225252  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 397  Q
     ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1225251 ttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagtaaaagtaactcccataaaa 1225152  T
Q  398 ttgtaaaaaatctg 411  Q
    |||||| |||||||    
T  1225151 ttgtaacaaatctg 1225138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 14419141 - 14419528
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  14419141 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 14419240  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  14419241 atctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 14419340  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419341 ccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctag 14419440  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14419441 tttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 14419528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 30480454 - 30480838
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  30480454 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 30480553  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||     
T  30480554 atccatttcactatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcc 30480653  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||     
T  30480654 cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagt 30480753  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  30480754 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 30480838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 27106850 - 27107232
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||| ||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  27106850 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagcc 27106947  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  27106948 ctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcc 27107047  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  27107048 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagt 27107147  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  27107148 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 27107232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27911354 - 27910987
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27911354 aagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatc 27911256  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911255 aatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27911156  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27911155 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc-cttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27911057  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  27911056 tcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatctg 27910987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27957773 - 27957406
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  27957773 aagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggg-agagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatc 27957675  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957674 aatgagttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27957575  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27957574 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc-cttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27957476  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  27957475 tcaaggtttacattgatacaatgtcaatatttattgtaaaagtatctcccataaaattggaacaaatctg 27957406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 13858438 - 13858821
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |     
T  13858438 caaaagtagaaaacagt--gagagaaagaaagggagaacacaaagaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 13858535  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  13858536 tctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatgggctgcaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcc 13858634  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13858635 cgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagt 13858734  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  13858735 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcatccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 13858821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14808145 - 14807749
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaa----- 93  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |          
T  14808145 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaggggga 14808046  T
Q  94 -----cagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct 188  Q
         ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  14808045 gagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 14807946  T
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 288  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14807945 agcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatac 14807846  T
Q  289 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  14807845 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14807749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32339650 - 32339303
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  32339650 aagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatc 32339551  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32339550 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaa 32339451  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32339450 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 32339351  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  32339350 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 32339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15073096 - 15072708
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||     
T  15073096 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagc 15072997  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatc-tctt 196  Q
    | | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || || | ||||    
T  15072996 cctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctctt 15072897  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15072896 ctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccata 15072797  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15072796 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15072708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4424359 - 4424016
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  | | |||||||||||||||||  |||||||||  | |||    
T  4424359 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatc 4424260  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4424259 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaa 4424160  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  4424159 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatc 4424060  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||| | |||||  || |||| ||||||||| |||||||    
T  4424059 tcaaagtttgctctgatacaaggtctgtatttatagtaaaagta 4424016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 43 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36865877 - 36865538
Alignment:
Q  43 agaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-gggggagaaaacagtcattc-gtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggata 139  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36865877 agaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcag-cattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagata 36865779  T
Q  140 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865778 ttaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgt---gaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 36865682  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  36865681 aatcaaccctcaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 36865582  T
Q  340 tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  36865581 tcttaaggtttacatctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 36865538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 609075 - 608774
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  609075 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 608976  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  608975 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaa 608876  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  608875 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccccctctatc 608776  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  608775 tc 608774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 28251530 - 28251904
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | || | |||    
T  28251530 aacagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccac 28251628  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || |  |||||| |||||||||||    
T  28251629 tatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 28251728  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28251729 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 28251828  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28251829 cattctaaacccttgtttcaacccactctatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28251904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27829637 - 27829295
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  27829637 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 27829539  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829538 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27829439  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27829438 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27829339  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  27829338 tccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 27829295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15809559 - 15809213
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |  | | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  15809559 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 15809460  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15809459 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 15809360  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  15809359 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt-ccaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatc 15809261  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15809260 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15809213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15068366 - 15067979
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||| | |||| |||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  15068366 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 15068267  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | |||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||     
T  15068266 cctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctcttt 15068167  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15068166 ccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctgg 15068067  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||   ||||  || || ||||||||||| |||||||    
T  15068066 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttaggttgatacaaggtttatatttatagtaaaagta 15067979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3874351 - 3874004
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  3874351 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 3874252  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3874251 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 3874152  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3874151 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcccccgctatc 3874052  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  3874051 tctctcaaagtttagcctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 3874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25952904 - 25952521
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |    
T  25952904 caaaagtagaaaacggcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagcc 25952806  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||   |  ||| |||||    
T  25952805 ctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttc 25952706  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  25952705 tcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatac-aaccctaa 25952607  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  25952606 ttttattgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttcctctgatacaaagcttatatttatagtaaaag 25952521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 15185667 - 15186072
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15185667 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtc 15185764  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||       |||||||    
T  15185765 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctcttc 15185857  T
Q  198 acgtaaccaagag--actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
     ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  15185858 ccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccat 15185957  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataa 395  Q
    || |||||| ||   |||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||| ||||||| | | |||||    
T  15185958 agttttgttattttctttctaaacccttgtttcagtcacctttatctcaaggtttactctgatacaaagtttatatttatagtaaaagtatccctcataa 15186057  T
Q  396 aattgtaaaaaatct 410  Q
    ||||| || ||||||    
T  15186058 aattggaacaaatct 15186072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27827326 - 27826984
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  27827326 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 27827228  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827227 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27827128  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27827127 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 27827028  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  27827027 tccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 27826984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41385085 - 41384743
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  41385085 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtc 41384986  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| |||||||||| || |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41384985 aatgagttacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaa 41384886  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  41384885 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatc 41384787  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||  |||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  41384786 tcaatttttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 41384743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 33541361 - 33541723
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  33541361 caaaagtagaaatcagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 33541460  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                      |||||||||| | |||  || |||||||||     
T  33541461 ttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg----------------------cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcc 33541538  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  33541539 cgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagt 33541638  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33541639 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 33541723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41383034 - 41382671
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  |||||||    
T  41383034 aacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcac 41382936  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  41382935 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaga 41382836  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    ||||||||| ||||           ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||     
T  41382835 gactcaatcataat-----------aggtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgt 41382747  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  41382746 cattctaaacccttgttttagccccatctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 41382671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 383
Target Start/End: Original strand, 5372173 - 5372512
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggg-agaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5372173 aatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatca 5372272  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372273 atgagttacaagaataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 5372372  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  5372373 taaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatct 5372471  T
Q  343 caaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  5372472 caagatttacactgatacaatgtctataattatagtaaaag 5372512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 22684647 - 22684951
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||    
T  22684647 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatc 22684746  T
Q  142 aat---gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 238  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684747 aatattgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 22684846  T
Q  239 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||    
T  22684847 gaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagcctcctct 22684946  T
Q  339 atctc 343  Q
    |||||    
T  22684947 atctc 22684951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 28283215 - 28283514
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  28283215 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 28283312  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28283313 aatgggttgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaa 28283412  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28283413 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 28283512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18811048 - 18810707
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| | | |  | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  18811048 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 18810950  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810949 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18810850  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18810849 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 18810750  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  18810749 tccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 18810707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44721181 - 44720842
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||   | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  44721181 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 44721083  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44721082 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatc 44720983  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44720982 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 44720883  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  44720882 aaagtttgctttgatataaggtctatatttatagtaaaagt 44720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43079940 - 43079650
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  43079940 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 43079842  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079841 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 43079742  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  43079741 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccc 43079650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 137 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14477522 - 14477276
Alignment:
Q  137 atatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477522 atatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaag 14477423  T
Q  237 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  14477422 gtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccct 14477323  T
Q  337 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||| |||||    
T  14477322 ctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 14477276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43082311 - 43082013
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  43082311 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 43082213  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43082212 gggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatc 43082113  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43082112 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 43082013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21482693 - 21482322
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |     
T  21482693 caaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccc 21482595  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  21482594 tccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 21482495  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  21482494 cataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag- 21482400  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||        |||||||||| || |||||| || ||||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  21482399 tttg-------atttctaaacccttgtttcagtccactctatctcaaagtttactctgatacaaattctatatttatagtaaaag 21482322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21480885 - 21480545
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttg-acctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||| || |||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |     
T  21480885 caaaagaagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacacgaattttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 21480787  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||     
T  21480786 tctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcc 21480687  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  21480686 cgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaacctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctag- 21480592  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
    ||||        |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21480591 tttg-------atttctaaacccttgtttcagccccatctatctcaaggtttac 21480545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 24873178 - 24873476
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  24873178 aatttgttgactcaattcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 24873276  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24873277 cggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatc 24873376  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24873377 aacccacaaaccctagtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 24873476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43530456 - 43530213
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  43530456 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatc 43530357  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530356 aatgggttacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43530257  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  43530256 tcaaccttcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactcta 43530213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15956338 - 15956051
Alignment:
Q  3 aaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |  |  | |    
T  15956338 aaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccct 15956241  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |    
T  15956240 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 15956141  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 293  Q
    || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15956140 gtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18813222 - 18812892
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | | |  | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  18813222 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 18813124  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813123 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18813024  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||           |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18813023 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctctatc 18812935  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  18812934 tccaagtttgctctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 18812892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31162596 - 31162186
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggg--agaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||   || ||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| | |||    
T  31162596 caaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaaaaagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcag 31162497  T
Q  97 tcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | |  ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  || |||||||    
T  31162496 ccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagtcccaatctct 31162397  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  31162396 tccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct--aacgttagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaacact 31162300  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaaccttt-atttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccata 394  Q
    | |||||||| |  ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||||    
T  31162299 a-atttgttgct-tgtttctaaacctttgtttttagccccctctttctcaaggtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcata 31162202  T
Q  395 aaattgtaaaaaatct 410  Q
    |||||| || ||||||    
T  31162201 aaattggaacaaatct 31162186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 3005616 - 3005932
Alignment:
Q  34 gagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaa 131  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  | | |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  3005616 gagaacacaagaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaa 3005715  T
Q  132 aagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  3005716 aagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgtttt 3005815  T
Q  232 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttattt-cag 330  Q
    |||| |||||||||   || ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||| || ||| |||    
T  3005816 ccaaagtgaatcaa---tccaaccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaactctag-tttgttatt-tgtttctaaacccttgtttccag 3005909  T
Q  331 ccccctctatctcaaggtttaca 353  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3005910 ccccctctatctcaaggtttaca 3005932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 206 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775176
Alignment:
Q  206 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  306 ttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaa 405  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaaca 26775179  T
Q  406 aat 408  Q
    |||    
T  26775178 aat 26775176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 351
Target Start/End: Original strand, 5622879 - 5623041
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 288  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5622879 aatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctatac 5622978  T
Q  289 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5622979 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttta 5623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 220 - 383
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872713
Alignment:
Q  220 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 35872649  T
Q  320 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35872650 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 35872713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 181799 - 181622
Alignment:
Q  83 gggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaa 182  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  181799 gggggagagagcagtcatctgtttcactat--gatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaa 181703  T
Q  183 aaccctaatctctt--cacgtaaccaagagactcaatcct-aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 260  Q
    |  || | ||||||  | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  181702 agtcccattctcttcccgcgtaactaagagacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagt 181622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 2468082 - 2468260
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||| |     
T  2468082 caaaattagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccc 2468180  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctat 178  Q
    |   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2468181 tctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaataagtctcccgtctaattctat 2468260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31578234 - 31578476
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | ||||      
T  31578234 caaaagtagaaaacaac--gagagaaag--agagagcacacaa-aatttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttc 31578328  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  || |||||||||    
T  31578329 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttc 31578428  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
     | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31578429 ccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatcaa 31578476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31035502 - 31035252
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgaccta--gtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||| | |||    
T  31035502 caaaactagaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacctatagtctgggggagagagcag 31035405  T
Q  97 tcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctc 194  Q
     | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||  |  ||||||    
T  31035404 ccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaagtctcaatctc 31035306  T
Q  195 ttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 248  Q
    |||  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31035305 ttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaatcaaccc 31035252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 285
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573961
Alignment:
Q  116 atgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc 214  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  215 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagaga-aaactcta 31573961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214517
Alignment:
Q  165 ccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 264  Q
    ||||||||||||| |||||   | |||| |||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  265 gttgccaagagacaaactctatacaaaccct-------------------agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaa 345  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||                   || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaaccctcaatctcttcccgtaaccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaa 37214507  T
Q  346 ggtttacact 355  Q
    ||||||||||    
T  37214508 ggtttacact 37214517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 385
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886255
Alignment:
Q  283 ctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaa 3886252  T
Q  383 gta 385  Q
    |||    
T  3886253 gta 3886255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035144
Alignment:
Q  211 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 31035144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 411
Target Start/End: Original strand, 14419784 - 14419860
Alignment:
Q  335 ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14419784 ctctatctcaaggtttaccctgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtagcaaatctg 14419860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 37214215 - 37214302
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg 86  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214215 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg 37214302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517319
Alignment:
Q  272 agagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 12517319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 287
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468341
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtatttgttgccaagag-caaactctata 2468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 181632 - 181535
Alignment:
Q  288 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  181632 caaaccctagttttattgttgccattctaagcccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 181535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 35872407 - 35872553
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||             |||||| | ||| |    
T  35872407 caaaagtagaaaaca---agagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagcc 35872490  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagt 161  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  35872491 ctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 230
Target Start/End: Original strand, 13985176 - 13985262
Alignment:
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||||||||| ||| ||   |||||||||| |||||  ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13985176 gggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Original strand, 10930192 - 10930241
Alignment:
Q  41 caagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10930192 caagaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 10930241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Original strand, 31566514 - 31566600
Alignment:
Q  4 aagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  31566514 aagtagaaaacagc--gagagaaagaaagagagaactcacgaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtatgggggaga 31566600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 230
Target Start/End: Original strand, 2267161 - 2267205
Alignment:
Q  186 cctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2267161 cctaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 2267205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14477626 - 14477547
Alignment:
Q  10 aaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacct-agttcggtccaaattgacctagtctgggg 86  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14477626 aaaaaagcgagagagaaaagaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctgggg 14477547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17847782 - 17847661
Alignment:
Q  126 ttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaata 224  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17847782 ttacaaaagagatatcaaagg-ttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaata 17847684  T
Q  225 gtgtttc--ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||   |||||||||||||    
T  17847683 gtgtttcgttcaaggtgaatcaa 17847661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 245
Target Start/End: Original strand, 33839077 - 33839120
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33839077 accaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 33839120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 1345371 - 1345413
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1345371 ttgttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggaga 1345413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 385
Target Start/End: Original strand, 2468361 - 2468435
Alignment:
Q  311 tttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  2468361 tttctaaatccttgtttcagctccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 2468435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 9021251 - 9021289
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021251 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15212954 - 15212912
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15212954 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 15212912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 16752666 - 16752704
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752666 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 16757411 - 16757449
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757411 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 17799568 - 17799606
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799568 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19175847 - 19175805
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19175847 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 19175805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752445
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggaga 19752445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 27811446 - 27811404
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27811446 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 27811404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28327946 - 28327908
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327946 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28332669 - 28332631
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332669 ctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28895540 - 28895502
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895540 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 33352318 - 33352276
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33352318 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 33352276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 40321248 - 40321206
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40321248 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 40321206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43530209 - 43530122
Alignment:
Q  302 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    || |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  43530209 gttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 43530122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733832
Alignment:
Q  49 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 4733832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Original strand, 13985954 - 13986011
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13985954 aatctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 13986011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 139)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 43421366 - 43421747
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  43421366 caaaagtataaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 43421463  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||     
T  43421464 atctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcc 43421563  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  43421564 cgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagt 43421663  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  43421664 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 43421747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3314993 - 3314608
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  3314993 caaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 3314894  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  3314893 ctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttc 3314794  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3314793 ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctag 3314694  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  3314693 ttttgttgttacctttctaaacccttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 3314608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 1626632 - 1627016
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |    
T  1626632 caaaagtgaaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagcc 1626731  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |     
T  1626732 ctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccc 1626831  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||     
T  1626832 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagt 1626931  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1626932 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 1627016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 5926714 - 5927097
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  5926714 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaaaagagaacacaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtca 5926813  T
Q  100 ttcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| |    
T  5926814 tccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttccc 5926913  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |    
T  5926914 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagtt 5927013  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  5927014 ttgttgttgcatttctaaacccttgtttcagccctctctatctcaaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaag 5927097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 28101951 - 28102304
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| | ||| |    
T  28101951 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagcc 28102050  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  28102051 atccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 28102150  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28102151 cgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagt 28102250  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28102251 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggttac 28102304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 43423414 - 43423796
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||      
T  43423414 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagct 43423511  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  43423512 ctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 43423611  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43423612 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagt 43423711  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43423712 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctttctcaaggtttacagtgatacaatgtctatatttatagtaaaag 43423796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1313715 - 1313332
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  1313715 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 1313618  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||     
T  1313617 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc 1313518  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1313517 cgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagt 1313418  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  1313417 tttgttgttgccattgtaaacc-ttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 1313332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 53917612 - 53917999
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||     
T  53917612 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagc 53917711  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  53917712 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttc 53917811  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917812 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctag 53917911  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  53917912 ttttgttgttgtcattctaaaccattgtttcagccccctccatctcaaggtttaatctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 53917999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39715774 - 39715366
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaa-gagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||   ||      
T  39715774 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaaatgatctagtatgggggagag--caac 39715677  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    |||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  39715676 catctgtttcactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 39715579  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  39715578 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctag 39715479  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 397  Q
     |||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39715478 ttttggtgttgcctctctaaacccttatttcag-cccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccatgaaa 39715380  T
Q  398 ttgtaaaaaatctg 411  Q
    |||||| |||||||    
T  39715379 ttgtaacaaatctg 39715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51943681 - 51943293
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagaga---gaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  51943681 caaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagca 51943582  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  51943581 gccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagacgtcaatgagttacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctct 51943483  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  51943482 tctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccct 51943383  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  51943382 agttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagcaccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 51943293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 880402 - 880785
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  880402 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 880499  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||      
T  880500 ctccattttactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttc 880599  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  880600 cgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctag 880699  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  880700 ttttgttgttgccattctaaactcttgtttcagacccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 4308228 - 4308617
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  4308228 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcag 4308327  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||    
T  4308328 ccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctctt 4308427  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4308428 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccta 4308527  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  4308528 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 4308617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 53915444 - 53915831
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||     
T  53915444 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagc 53915543  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  53915544 cctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 53915643  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53915644 ccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctag 53915743  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||   | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  53915744 ttttgttgttgtcatcctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 53915831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45883248 - 45882861
Alignment:
Q  4 aagtagaaaacagcaagaga---gaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct-gggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  45883248 aagtagaaaacagcaagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagc 45883149  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||    
T  45883148 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttc 45883049  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45883048 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctag 45882949  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  45882948 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcatagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 45882861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43226392 - 43226007
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaa--acagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  43226392 caaaagtagaaacaacagcgagaga-aaaggaagagagaacacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 43226294  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||     
T  43226293 ctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 43226194  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||     
T  43226193 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagt 43226095  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  43226094 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagtaa 43226007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 47148844 - 47149188
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca--agaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  47148844 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatttgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtc 47148943  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     |  ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||     
T  47148944 ctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcc 47149043  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  47149044 cgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccatcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctag 47149142  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47149143 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47149188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 53468402 - 53468788
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagt--ctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  | | |||    
T  53468402 caaaagtagaaaatagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcag 53468501  T
Q  97 tcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||    
T  53468502 ccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctct 53468601  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  53468602 ccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaa-cct 53468700  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     | |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53468701 ggttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctttatctaaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 53468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 51726999 - 51727342
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  51726999 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 51727098  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727099 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51727198  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  51727199 tcaaccctcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatc 51727297  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    |||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  51727298 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 51727342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11170669 - 11170327
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  11170669 aagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 11170570  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170569 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11170470  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11170469 tcaatccgcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 11170370  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11170369 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11170327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 27101142 - 27101474
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| |||    
T  27101142 aacagcaagaga-aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccac 27101240  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||  ||||||||||    
T  27101241 tatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaaga 27101340  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27101341 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 27101440  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
     |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27101441 ctttctaaacccttgtttcagcctcctctatctc 27101474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43228575 - 43228212
Alignment:
Q  25 aaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagta 122  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||    
T  43228575 aaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagta 43228476  T
Q  123 accttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaa 222  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43228475 acgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 43228376  T
Q  223 tagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  43228375 tagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactct 43228276  T
Q  323 tatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  43228275 tgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaatgtctatatttatagtgaaagtaa 43228212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38890305 - 38890004
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  38890305 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 38890206  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890205 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38890106  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38890105 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 38890006  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  38890005 tc 38890004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 382
Target Start/End: Original strand, 10956019 - 10956359
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  10956019 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 10956118  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10956119 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaa 10956218  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10956219 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 10956318  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |  | |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  10956319 ttcatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 10956359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Original strand, 18096861 - 18097235
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||   | |||| |||    
T  18096861 aacagcgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccac 18096959  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||    
T  18096960 tatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 18097059  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18097060 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 18097159  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctc-aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
      ||||||||| || ||| |||||||||||||||  | ||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  18097160 cattctaaacccttgtttgagccccctctatctctcaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18097235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 18099131 - 18099463
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| | | |||| |||    
T  18099131 aacagcgagagagaaagaaa-agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccac 18099229  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||    
T  18099230 tatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 18099329  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18099330 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 18099429  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
      ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18099430 cattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18099463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 51674715 - 51675087
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |    
T  51674715 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagcc 51674814  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  51674815 ctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttct 51674914  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |           ||||||| |||     
T  51674915 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagt 51675003  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||    
T  51675004 tttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaacgtttacattgatacaacgtctatatttatagtaaaa 51675087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42990569 - 42990268
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  42990569 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 42990470  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990469 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 42990370  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42990369 tcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 42990270  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  42990269 tc 42990268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 382
Target Start/End: Original strand, 10958315 - 10958655
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  10958315 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatc 10958414  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958415 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 10958514  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10958515 tcaaccttcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 10958614  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |  | |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  10958615 tttatgtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 10958655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30006151 - 30005805
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||    
T  30006151 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcag 30006052  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||    
T  30006051 ccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt 30005952  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  30005951 ctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccta 30005852  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30005851 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 30005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 28761419 - 28761763
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggata 139  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28761419 aagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagata 28761518  T
Q  140 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28761519 tcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtg 28761618  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 339  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  28761619 aatcaactctcaaacccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcaaccccctcta 28761717  T
Q  340 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  28761718 tctcaaggtttactctgatgcaaagtctatatttatagtaaaagta 28761763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24979973 - 24979637
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  24979973 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatat 24979874  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
     |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24979873 taatttgttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtga 24979774  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24979773 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctat 24979674  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    ||||| |||||| |||||  || || |||||||||||    
T  24979673 ctcaaagtttactctgatacaaggtatatatttatag 24979637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 58 - 383
Target Start/End: Original strand, 889781 - 890104
Alignment:
Q  58 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  889781 agttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaagaat 889880  T
Q  158 aagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 257  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  889881 aactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacccc 889979  T
Q  258 agtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactg 356  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  889980 agtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggtt--ttgttgccattctaaacccttgtttcagcttcctctatctcaaggtttacactg 890077  T
Q  357 atgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  890078 atacaatatctatatttatagtaaaag 890104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3859792 - 3859451
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  3859792 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 3859694  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859693 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 3859594  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3859593 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 3859494  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  3859493 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 3859451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 4103888 - 4104234
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  4103888 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 4103986  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103987 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 4104086  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4104087 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 4104186  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  4104187 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 4104234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 32263987 - 32264378
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga-atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |     
T  32263987 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaattgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccc 32264086  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagg-gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   | |  ||||||    
T  32264087 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttc 32264186  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||    
T  32264187 ccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttag 32264286  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaagg----tttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |    ||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  32264287 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctctatctcaaagttaatttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 32264378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 9604599 - 9604899
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  9604599 aagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 9604698  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604699 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 9604798  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9604799 tcaaccctcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacc-ttgtttcagccccctctatc 9604897  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  9604898 tc 9604899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25533707 - 25533406
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  25533707 aagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 25533608  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533607 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 25533508  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25533507 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 25533408  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  25533407 tc 25533406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 747019 - 746721
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  747019 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 746921  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  746920 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 746821  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  746820 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 746721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 12267925 - 12268301
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |    
T  12267925 caaaagtagaaaacaacgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagcc 12268023  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  12268024 ctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag-----------ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 12268112  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12268113 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctag 12268212  T
Q  298 -atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      ||||||||||  |||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  12268213 tttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagctccctctatctcaaagtttactctgatacaagttctatatttatagtaaaagta 12268301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26720812 - 26720470
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  26720812 aagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 26720713  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26720712 aaagggttaaaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaaggtgaa 26720614  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26720613 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatc 26720514  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  26720513 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 26720470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6484666 - 6484372
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  6484666 caaaagtagaaaacagcgagagagaat--aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 6484569  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  6484568 ctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcc 6484469  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccc 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6484468 cgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaaccc 6484372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 22114297 - 22114639
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||| | ||  | | || |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  22114297 aagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 22114396  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114397 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22114496  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22114497 tcaacccacaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatc 22114596  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  22114597 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 22114639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6562005 - 6561740
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagg-gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  6562005 atgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 6561906  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6561905 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcct 6561806  T
Q  312 ttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  6561805 ttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatag 6561740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 48361617 - 48362005
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagaga---gaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||| | |||||   |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48361617 caaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagca 48361716  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    |   | ||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  48361717 gctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctct 48361816  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48361817 tcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccct 48361916  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||||   ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  48361917 agttttgttgttgtcattctaaacc-ttgtttcagccccctgtatctcaaagtttactatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 48362005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5191916 - 5191576
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |  | | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  5191916 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 5191819  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191818 aatgggttacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 5191719  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5191718 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 5191619  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| |   |||  || |||||||||||||| ||||||    
T  5191618 tccaagtttgcttagatacaaggtctatatttatagtaaaagt 5191576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 54691522 - 54691906
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagca-agagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| | |||     
T  54691522 caaaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaaacataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagc 54691621  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  54691622 cctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaataagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttc 54691721  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     | ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54691722 ccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 54691821  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||| || |||||||| | || ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||||||||||| |||||    
T  54691822 ttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttta-ccccctctatcttaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 54691906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18162973 - 18162586
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaagaa--tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||| ||| ||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18162973 caaaagtagaaaactgcagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcag 18162875  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||    
T  18162874 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctct 18162775  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18162774 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccct 18162675  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacac-tgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||||| |||||||||| || |||||   ||||||||||| | |||||| | ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18162674 agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca--tccctctatctccaagtttactcatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 18162586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 10084384 - 10084682
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||     
T  10084384 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaac 10084483  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084484 gggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 10084583  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10084584 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagccccctctatctc 10084682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36012123 - 36011751
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||| | |  ||| |||    
T  36012123 aacagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttccac 36012025  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||    
T  36012024 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaaga 36011925  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||     
T  36011924 tattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgt 36011825  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  36011824 ctttctaaatccttgtttcagccccctttatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 36011751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 458545 - 458202
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  458545 atttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 458447  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458446 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 458347  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----t 340  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    |    
T  458346 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 458247  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  458246 ctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 458202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1321744 - 1321483
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  1321744 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 1321645  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321644 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1321545  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1321544 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 456168 - 455825
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  456168 atttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 456070  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456069 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 455970  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----t 340  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    |    
T  455969 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctct 455870  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  455869 ctcaaggtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 455825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25389167 - 25388882
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  25389167 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 25389069  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25389068 gggttacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcc-aaggtgaatc 25388970  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  25388969 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagc 25388882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 6065791 - 6066131
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  6065791 aatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 6065889  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065890 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 6065989  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcag-ccccctctatct 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  6065990 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccccctctatct 6066089  T
Q  343 caaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||| |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6066090 caaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6066131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 10621525 - 10621823
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  10621525 aatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 10621623  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621624 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 10621723  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  10621724 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagcaccctctatctc 10621823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 50494260 - 50493963
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  50494260 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 50494162  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494161 ggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 50494062  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50494061 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 50493963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 53591442 - 53591119
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatggg 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||     
T  53591442 ttgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggg-agagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatgga 53591344  T
Q  148 ttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53591343 ttagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 53591244  T
Q  248 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaagg 347  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||           ||||||||| ||||||||||  |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  53591243 ctcaaaccctagtgtttgttctaaagagac-----------aaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaagg 53591155  T
Q  348 tttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53591154 tttacacttatacaatgtctatatttatagtaaaag 53591119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 6063441 - 6063782
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  6063441 aatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 6063539  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063540 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 6063639  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6063640 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 6063739  T
Q  344 --aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
      || |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6063740 tcaaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6063782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 142 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777344
Alignment:
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctat 35777388  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||||| |||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  35777387 ctcaaagtttgctttgatacaatgtctatatttatagtaaaagt 35777344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15781187 - 15780782
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15781187 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggc 15781088  T
Q  99 a---ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaaggga----tatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaa 190  Q
        |||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |  |     
T  15781087 gcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcag 15780988  T
Q  191 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagaca-----------a 279  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||           |    
T  15780987 cctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaa 15780888  T
Q  280 actctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagca 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| |||||  || |||||||||||||| |    
T  15780887 actctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttactctgatacaaggtctatatttatagta 15780788  T
Q  380 aaagta 385  Q
    ||||||    
T  15780787 aaagta 15780782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 28413027 - 28413299
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  28413027 aatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 28413125  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413126 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 28413225  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28413226 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaa 28413299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 343
Target Start/End: Original strand, 10191295 - 10191602
Alignment:
Q  35 agaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag 134  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10191295 agaacacaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaag 10191394  T
Q  135 ggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccca 234  Q
     || || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10191395 agaaatgaacgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttccca 10191493  T
Q  235 aggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagcccc 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |||||||    
T  10191494 aggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgttccagcccc 10191593  T
Q  335 ctctatctc 343  Q
    || ||||||    
T  10191594 ctttatctc 10191602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 152 - 383
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100374
Alignment:
Q  152 aagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  252 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaagggtta 28100342  T
Q  352 cactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  28100343 ctctgatacaacgcttatatttatagtaaaag 28100374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38210631 - 38210334
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||   | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  38210631 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 38210533  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210532 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 38210433  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38210432 acccacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38210334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28180948
Alignment:
Q  147 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 246  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  247 cctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaag 346  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc--tatttcagccccctctatctcaag 28180985  T
Q  347 gtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28180984 gtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 28180948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 102 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29956891 - 29956650
Alignment:
Q  102 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||    
T  29956891 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgt 29956792  T
Q  202 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagattt 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29956791 aaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaatttt 29956692  T
Q  302 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29956691 gttgttgaatttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 29956650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 5522619 - 5522949
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  5522619 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 5522717  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5522718 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaa 5522817  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||           ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5522818 tcaacccacaaacccgagtgtttgttccgaagag-----------acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 5522906  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  5522907 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 5522949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32219395 - 32219026
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||    
T  32219395 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcag 32219296  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||  || |||||||    
T  32219295 ccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctct 32219196  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||           ||    
T  32219195 tcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaact-----------ct 32219107  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | |||  || |||||||||||||    
T  32219106 agttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtcagatacaaggtctatatttata 32219026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4666822 - 4666535
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| |    
T  4666822 caaaagtataaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagcc 4666726  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataag--tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||    
T  4666725 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctct 4666626  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctat 286  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  4666625 tcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagagacaaaccctat 4666535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 25688107 - 25688367
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25688107 caaaagtagaaaacatcaacgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 25688206  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||    
T  25688207 ccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctct 25688306  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688307 tctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 386
Target Start/End: Original strand, 35917952 - 35918285
Alignment:
Q  58 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaat 157  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||   | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35917952 agttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 35918050  T
Q  158 aagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 257  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35918051 aagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccctcaaactct 35918150  T
Q  258 a------gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
    |      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||     
T  35918151 agtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaaatttg 35918250  T
Q  352 cactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    |  ||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  35918251 ctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 35918285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23633756 - 23633357
Alignment:
Q  4 aagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcatt 101  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| | |     
T  23633756 aagtagaaaacatc--gagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctc 23633660  T
Q  102 cgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||    
T  23633659 cttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg 23633561  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  23633560 tgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttt 23633466  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattg 400  Q
    | |||||| | ||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  23633465 tcttgttg-gcttctaaatccttgttttagccctctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattg 23633367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31151634 - 31151271
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgca--agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatga 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||  |    
T  31151634 gagagaaaagaagagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataaca 31151535  T
Q  117 -tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  31151534 atgagtaactttacaaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactca 31151437  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||    
T  31151436 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttct 31151341  T
Q  316 aaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  31151340 aaacccttgttttcagccccctctatctcgaggtttacatctgatacaaagtctatatttatagtaaaag 31151271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 285
Target Start/End: Original strand, 7606580 - 7606822
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||| ||||||| |||||||  | | |||    
T  7606580 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaatagaa-atc 7606678  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606679 aatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7606778  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7606779 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6232107 - 6231849
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |    
T  6232107 caaaaataaaaaacagcgagagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagcc 6232009  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| |||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  6232008 ctccgtt-cactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaatccc-aatctcttc 6231911  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 259  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231910 ccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctag 6231849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17795566 - 17795280
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  17795566 caaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 17795468  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||     
T  17795467 ttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttt 17795368  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataca 289  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17795367 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctataca 17795280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19104006 - 19103720
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  19104006 caaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 19103908  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||     
T  19103907 ttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttt 19103808  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataca 289  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19103807 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctataca 19103720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42992532 - 42992250
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |   || ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  42992532 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaat 42992433  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    | |||||||||||||               ||| |||||  || | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42992432 gagttacaagaataa---------------ctacccaaagtcc-actctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatca 42992349  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  42992348 accctcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 42992250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23636924
Alignment:
Q  130 aaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  230 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 329  Q
    || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| || ||| |    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttg-gcttctaaacccttgtttta 23637005  T
Q  330 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||  |||| || | | |||||||||| || ||||||    
T  23637004 gcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaagtatatatttatattaaaattatccctcataaaattgaaacaaatct 23636924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 27635604 - 27635959
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagaga---gaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27635604 caaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 27635703  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||             
T  27635704 gccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaagcc--------- 27635794  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
       |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||                   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27635795 ---cgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccc-------------------accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccct 27635872  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    || |||||||||    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||| ||| ||||    
T  27635873 agttttgttgtttgcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctaattcaaggtctatatttgtagtaaaa 27635959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3307068 - 3306839
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||  |    
T  3307068 caaaagtagaaaacagcgaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctaggagagag--caacc 3306971  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||     
T  3306970 atccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatcttt 3306871  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 229  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306870 ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5886463 - 5886261
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| || |||| |  | |||    
T  5886463 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaa-gacaaatc 5886365  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5886364 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaa 5886266  T
Q  242 tcaac 246  Q
    |||||    
T  5886265 tcaac 5886261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5899936 - 5899734
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| || |||| | || |||    
T  5899936 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaa-gagaaatc 5899838  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5899837 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaa 5899739  T
Q  242 tcaac 246  Q
    |||||    
T  5899738 tcaac 5899734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 53597430 - 53597148
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |  ||||| ||| | | ||||||||||    
T  53597430 atgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaatctcaatctattctcatgaccaagagac 53597331  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||   |    
T  53597330 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa--cttcaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaacccctagttttcttgttg-act 53597235  T
Q  313 tctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattg 400  Q
    | |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  53597234 tataaacccttgtttca-tcccctctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattg 53597148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 561725 - 562021
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgg-gggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | || |||||||||| |  ||| |||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||     
T  561725 caaaagtagaaaacatcgagaga-agagaaagagagaacacgtgaaatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagc 561823  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||    
T  561824 ccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctctt 561923  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  561924 cacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc--tgaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaacccta 562020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11168366 - 11168165
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| || |||||||| |||||| ||||||||| || |||    
T  11168366 aagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatc 11168267  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168266 aatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11168167  T
Q  242 tc 243  Q
    ||    
T  11168166 tc 11168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 13420252 - 13420429
Alignment:
Q  116 atgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13420252 atgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactca 13420351  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13420352 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactctatacaaaccctag 13420429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54884348 - 54884089
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||   |||||||||||||    
T  54884348 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaagtttcaatctctttctgtaaccaagagac 54884250  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  54884249 tcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc--tacaaattctagttttgttgttgcctt 54884152  T
Q  313 tctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 375  Q
    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  54884151 tctaaacccttgttcgagctccctctatctcaaggtttacaatgatccaatgtttatatttat 54884089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 383
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137628
Alignment:
Q  159 agtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 258  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  259 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||           |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaact-----------ctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgat 28137603  T
Q  359 gtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
      || |  ||||||||||| |||||    
T  28137604 acaacgcatatatttatagtaaaag 28137628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 47701623 - 47701798
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  47701623 caaaagtagaaaaca--atgagagaaaggaa-agagaacgcaaaagaatttgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagcc 47701719  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 177  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701720 ctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25635575 - 25635394
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  25635575 atgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagac 25635476  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25635475 taaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctag 25635394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 215 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849117
Alignment:
Q  215 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttc 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  315 taaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgtttcagccccctctatct 41849117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1674160 - 1673975
Alignment:
Q  119 agtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatc 218  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  1674160 agtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatc 1674061  T
Q  219 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgtt 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  1674060 ctaatagtgtttcccatggtgaatcaatcct--aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgtt 1673975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231374
Alignment:
Q  254 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagcccgctctatctcaagatttaca 6231403  T
Q  354 ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6231402 ctgatacaatgtctatatttatagtaaaa 6231374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 36871257 - 36871583
Alignment:
Q  7 tagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaattt-gttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgt 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| | | |||    
T  36871257 tagaaaacagcgagaga-aaataaagagagaacacacgaaattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgt 36871355  T
Q  105 ttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgta 202  Q
    | ||||||| |||||| |||| ||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||  |||     
T  36871356 tccactataatgatgattaactttacaaa-gagataacaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtg 36871454  T
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 302  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||     
T  36871455 accaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatcct--aaccctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagttttc 36871551  T
Q  303 ttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc 335  Q
    |||||| | || |||||| || |||||||||||    
T  36871552 ttgttg-gcttgtaaacccttgtttcagccccc 36871583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 253 - 383
Target Start/End: Original strand, 47701798 - 47701928
Alignment:
Q  253 accctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47701798 accctggtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttac 47701897  T
Q  353 actgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  47701898 actgatacaatgtctatatttatagtaaaag 47701928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11163218 - 11163073
Alignment:
Q  239 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 338  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11163218 gaatcaatccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 11163119  T
Q  339 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||||||| |||| | |||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  11163118 atctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatcgtaaaagt 11163073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25634194 - 25634030
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagag--agaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||  || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||| |    
T  25634194 caaaagtagaaaacaacaagagtaagaaagga-gagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagcc 25634097  T
Q  99 attcgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctc 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25634096 attcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177201
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  303 ttgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||  |||||||    
T  24177283 ttgttg-acatctaaactcttgttttcagccccctctagctcaatgtttactatgatacaaggtctatatttataataaaagta 24177201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24181668 - 24181504
Alignment:
Q  22 gagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatg 118  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| | |||||||||||  ||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  24181668 gagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatg 24181569  T
Q  119 agtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24181568 agtaactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaa 24181504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 325 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6484367 - 6484281
Alignment:
Q  325 tttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6484367 tttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgcctatatttatagcaaaagtaactcccataaaaatgtaacaaatctg 6484281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3306835 - 3306724
Alignment:
Q  271 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctata 370  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3306835 aagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgtttcagccccctatatctctaggtttacactgatacaatgtctata 3306736  T
Q  371 tttatagcaaaa 382  Q
    ||||||| ||||    
T  3306735 tttatagtaaaa 3306724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41849368 - 41849243
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  41849368 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 41849269  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaa 123  Q
    | |  |||||||||||||||||||||    
T  41849268 cctctgtttcactatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560497
Alignment:
Q  167 gcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 263  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 275
Target Start/End: Original strand, 14634504 - 14634665
Alignment:
Q  112 tatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagag 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |   |||||| ||| |||||  |  ||||||||| ||| || |||||    
T  14634504 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatctcttctcgtgactaagag 14634603  T
Q  211 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagag 275  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||    
T  14634604 acacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-tctcaa--cccagtgtttgttgccaagag 14634665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633933
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 25633933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13419997 - 13419883
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 288  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  13419997 aatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tac 13419903  T
Q  289 aaaccctagatttgttgttg 308  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  13419902 aaaccctagttttcttgttg 13419883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 245
Target Start/End: Original strand, 1620457 - 1620657
Alignment:
Q  47 tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||| | | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||     
T  1620457 tttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttacaaa-gagatatcaaa 1620555  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||  || || |   |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1620556 gggttacaagaactagccttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 1620655  T
Q  244 aa 245  Q
    ||    
T  1620656 aa 1620657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Original strand, 31021281 - 31021362
Alignment:
Q  186 cctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 268  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  31021281 cctaatctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttg 31021362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Original strand, 35919107 - 35919155
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919107 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 35919155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28181312 - 28181242
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca--agaatttgttgacctagttcggtccaa 69  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181312 caaaagtagaaaacagcgacagagaaaagaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 90
Target Start/End: Original strand, 53894051 - 53894097
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53894051 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 53894097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1321437 - 1321363
Alignment:
Q  311 tttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  1321437 tttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 1321363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 263
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  218 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30236300 - 30236251
Alignment:
Q  41 caagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30236300 caagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 30236251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7768672 - 7768632
Alignment:
Q  205 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7768672 caagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 7768632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 46173532 - 46173483
Alignment:
Q  41 caagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  46173532 caagaaattgttgatctagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 46173483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42992651 - 42992607
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg 86  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992651 aagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggg 42992607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066652
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11066652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6303348 - 6303310
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303348 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 10094218 - 10094256
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094218 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 10100235 - 10100273
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100235 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 10201098 - 10201136
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201098 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264396
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 16264396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16462241 - 16462203
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462241 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 22626128 - 22626166
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626128 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795827
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 25795827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27544311 - 27544273
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544311 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143367
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 32143367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 40913461 - 40913419
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40913461 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 40913419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44331713 - 44331671
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44331713 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 44331671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 47883026 - 47883064
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883026 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 51398982 - 51398940
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51398982 ttgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 51398940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 352
Target Start/End: Original strand, 4560514 - 4560567
Alignment:
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
    ||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4560514 tttgttgttacctttataaaccattgtttcagccccctctatctcaatgtttac 4560567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 880191 - 880251
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagtt 61  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  880191 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 343
Target Start/End: Original strand, 6719358 - 6719390
Alignment:
Q  311 tttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6719358 tttctaaacccttatttcagccccctctatctc 6719390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 10612761 - 10612821
Alignment:
Q  31 agagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10612761 agagagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggaga 10612821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 88
Target Start/End: Original strand, 32744436 - 32744476
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggga 88  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32744436 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggggga 32744476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 47878131 - 47878214
Alignment:
Q  11 aaacagcaagagagaaa-ggaaga--gagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  47878131 aaacagcaagagataaaaggaagaatgagaacacaagaatttgtttacccagttcggtctaataatgacctagtctggaggaga 47878214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13057557 - 13057173
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |    
T  13057557 caaaagtagaaaacagatagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagcc 13057459  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  13057458 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 13057359  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057358 ccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctag 13057259  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13057258 ttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 13057173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 383
Target Start/End: Original strand, 3629819 - 3630199
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |     
T  3629819 aaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccc 3629915  T
Q  100 ttcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
    |  |||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  3629916 tcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttccc 3630015  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3630016 gtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagtt 3630115  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3630116 ttgttgttgcctttctaaaccgatgtttcagccccctctatctcaagttttacattgatacaatgtctatatttatagtaaaag 3630199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 3631890 - 3632267
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||| |    
T  3631890 caaaagtagaaaacatcgagagaaaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggacagag--cagcc 3631987  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  3631988 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttt 3632087  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632088 ccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 3632187  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3632188 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaactccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatag 3632267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 42 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 3390700 - 3390345
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3390700 aagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatat 3390601  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390600 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 3390501  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  3390500 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctat 3390401  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 396  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  3390400 ctcaaggtttatactgatacaatgtctatatttatagtaaaagtatctctcataaa 3390345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32280360 - 32279974
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  32280360 caaaagtagaaaataacatgagagaaaggaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 32280261  T
Q  99 attcgtttcactatat-gatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  || |||||||||    
T  32280260 ctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttc 32280161  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280160 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 32280061  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||||||    
T  32280060 atttgttgttgcctttttaaacccttgtttcag-cccctctatctccaagtttactatgatacaaggtctatatatataggaaaagta 32279974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 384
Target Start/End: Original strand, 11982991 - 11983365
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||    
T  11982991 aacagcgagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccac 11983090  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||    
T  11983091 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaaga 11983190  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11983191 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 11983290  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11983291 ctttctaagcctttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11983365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13040117 - 13039733
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  13040117 caaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 13040019  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |  |||||||||    
T  13040018 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttc 13039919  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13039918 ccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaag 13039819  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  13039818 ttttgttcttgcctttctaaacccttgtttcagcctcctatatctcaaggtttacactgatacaatatctatatttatagtaaaag 13039733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9020278 - 9019903
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |   ||||||||    
T  9020278 aacagcgagagaaaagggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcac 9020179  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||   |||||||||    
T  9020178 tatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaaga 9020079  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9020078 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 9019979  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     |||||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  9019978 ctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 9019903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25477602 - 25477253
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaacc-------ttacaaaa 133  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |  ||||||||||| |||||||||||        ||||||||    
T  25477602 aagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttacaaaa 25477503  T
Q  134 gggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477502 gagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 25477403  T
Q  234 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25477402 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 25477303  T
Q  334 cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  25477302 cctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 25477253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 376
Target Start/End: Original strand, 14458761 - 14459093
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  | | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  14458761 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 14458860  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14458861 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagg--aa 14458958  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14458959 tcagccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcagccccctctatc 14459058  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||    
T  14459059 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttata 14459093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 1230243 - 1230587
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  1230243 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 1230342  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230343 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1230442  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  1230443 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccctctctatc 1230542  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    |||| |||| |  ||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  1230543 tcaaagtttgctatgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 1230587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 28241315 - 28241659
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  28241315 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 28241414  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241415 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 28241514  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28241515 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 28241614  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    || | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  28241615 tctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 28241659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15541092 - 15541476
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |    
T  15541092 caaaattagaaaacaacgagagagaaaa-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcag-c 15541189  T
Q  99 attc-gtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||    
T  15541190 tttctgtttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttc 15541289  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15541290 tcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctag 15541389  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
     |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  15541390 ttttgtttttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 15541476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 30728775 - 30729165
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |    
T  30728775 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagcc 30728874  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag----ggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctc 194  Q
     | |||| |||||||  ||||||||| |||||||||     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||    
T  30728875 ttccgttccactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctc 30728974  T
Q  195 ttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccc 294  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30728975 ttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccc 30729074  T
Q  295 tagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     || ||||||||||  |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  30729075 aagttttgttgttgtctttcgatacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 30729165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 14507170 - 14507512
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || ||||||||||||| |||| | ||||||| | || |||    
T  14507170 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgataagtatcgttacaaa-gagaaatc 14507268  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507269 aatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14507368  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  14507369 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatc 14507468  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||| | || ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  14507469 tcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14507512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 24338401 - 24338783
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaat--ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |    
T  24338401 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtctgggggagag--cagcc 24338496  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||  | |||||||||     
T  24338497 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctcttt 24338596  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc-tagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
     | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24338597 ccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaaatcaaccctcaaacccctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaacccta 24338696  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24338697 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24338783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 3233674 - 3234065
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacc-----tagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaa 91  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  3233674 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagag 3233773  T
Q  92 aacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaat 191  Q
    | ||| | | |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||    
T  3233774 agcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaat 3233873  T
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaa 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  3233874 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaa 3233973  T
Q  291 accctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  3233974 accttagttttgttgttgtctttctaaatccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgatacaa-gtctatatttatagtaaaag 3234065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 4816225 - 4816526
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  4816225 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatc 4816324  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816325 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 4816424  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4816425 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 4816524  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  4816525 tc 4816526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 15532676 - 15533018
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | | | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15532676 aagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctaggg-atagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatc 15532774  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  || ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15532775 aatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 15532874  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15532875 tcaaccctcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 15532974  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15532975 tcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15533018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 12161509 - 12161889
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||| |    
T  12161509 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttaggg-agagaacagcc 12161607  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || | |||  |  |||||||||     
T  12161608 atccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcc 12161707  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||     
T  12161708 cgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaaacaaccctcaaaccctagtgtttgtt--ccagagacaaactctatacaaaccctagt 12161805  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||    
T  12161806 tttgttgttgcatttctaaacccttgtttcag-cccctttatctcaaggtttacaatgatacaatgtctatatttaaagtaaaag 12161889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 343
Target Start/End: Original strand, 20915351 - 20915651
Alignment:
Q  43 agaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||    
T  20915351 agaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatca 20915449  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20915450 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20915549  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20915550 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20915649  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  20915650 tc 20915651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 102 - 385
Target Start/End: Original strand, 15530177 - 15530459
Alignment:
Q  102 cgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||| |||    
T  15530177 cgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaatctcttcccgt 15530275  T
Q  202 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagattt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15530276 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttt 15530375  T
Q  302 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||   |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15530376 gttgttgccattctaagcccttgcttcagccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 15530459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30967521 - 30967220
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||   | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  30967521 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 30967422  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967421 aatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30967322  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30967321 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 30967222  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  30967221 tc 30967220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 19704564 - 19704864
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaa-agggatatcaa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| || || |||||    
T  19704564 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaa 19704663  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704664 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 19704763  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  19704764 caacccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctccatct 19704863  T
Q  343 c 343  Q
    |    
T  19704864 c 19704864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 30034597 - 30034944
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | | || | | |||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  30034597 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 30034696  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034697 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 30034796  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||||||||    
T  30034797 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttttagctccctctatc 30034896  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  30034897 tctcttaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 30034944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 2628880 - 2629179
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  2628880 aagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatc 2628978  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2628979 aatgggttacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 2629078  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  2629079 tcaacccttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatc 2629177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195852
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatggg 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatggg 12195613  T
Q  148 ttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 246  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195614 ttacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12195713  T
Q  247 cctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaag 346  Q
    || |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  12195714 ccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 12195813  T
Q  347 gtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  12195814 gtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 12195852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26065298 - 26065005
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||||| | ||||||| ||||||| | ||  |||||    
T  26065298 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaat 26065201  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065200 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 26065101  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26065100 accctcaaaccctagtgtttc---caaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26085267 - 26084974
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||||| | ||||||| ||||||| | ||  |||||    
T  26085267 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaat 26085170  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085169 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 26085070  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26085069 accctcaaaccctagtgtttc---caaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 26084974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14466688 - 14466399
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||    
T  14466688 caaaagtagaaaacagcagcgagagaaagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagt 14466589  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  14466588 catccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctt 14466489  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc-aaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14466488 tccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaatcctcaaaaccctagtgtttgttgccaatagacaaactcta 14466399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 113 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490626
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  || ||||||||  ||||||||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagac 22490790  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtt 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22490789 tcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctt 22490690  T
Q  313 tc-taaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 375  Q
    ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22490689 tcaaaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaattcaatgtctatatttat 22490626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 26932559 - 26932857
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  26932559 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 26932657  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26932658 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatc 26932757  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  26932758 aacccacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgtttcaaccccctctatctc 26932857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 3027805 - 3028187
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaa-cagt 97  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | | ||||||||| |||  ||||||||||||||||  || | |||     
T  3027805 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagc 3027902  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |  ||||||||    
T  3027903 cctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctcaatctctt 3028002  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3028003 cacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacccta 3028099  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||| |||||| || | || ||||  |||||||||| | ||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  3028100 gttttg-tgttgccttccaaacccttgttttcagccccttttatctcatggtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 3028187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15720005 - 15719665
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||  |    
T  15720005 caaaaatagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacatgaaatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatgggggg--aaagagcaa 15719909  T
Q  100 ttc---gtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     ||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||    
T  15719908 ctctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctct 15719809  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15719808 tcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaactc---aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccct 15719713  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
    || ||||        |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15719712 ag-tttg-------atttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggttta 15719665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 1069670 - 1069913
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |     
T  1069670 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacataaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccc 1069769  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  1069770 tccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 1069869  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069870 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227744
Alignment:
Q  154 gaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  254 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 353  Q
    |||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||| |     
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttgagccccctttatctcaaagtttgct 19227713  T
Q  354 ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  19227714 ctgatacaagatctatatttatagtaaaagt 19227744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 263
Target Start/End: Original strand, 5273213 - 5273431
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | ||||||| |||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  5273213 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 5273311  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273312 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 5273411  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtt 263  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5273412 aacccacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15367375 - 15367101
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg-gagaaaacagtcattcgtttcactatatgat 117  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | ||||||||||||||||    
T  15367375 gagagaaagaaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgat 15367276  T
Q  118 gagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaat 217  Q
    || |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||     ||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  15367275 gaataactttacaatagagatattaatgggttacaagaataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaat 15367176  T
Q  218 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  15367175 cctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaacacaatacaaccccta 15367101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17012358 - 17012029
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  | ||  |   ||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17012358 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatga-tctctatgttccctataacgatgagtaactttacaaaagagatatca 17012260  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  17012259 atgagttacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatattgtttcagaaggtgaa 17012161  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  17012160 tcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctag-tttgttgtt-tacttctaaacccttttattcagacccctctat 17012066  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    |||||||||||| | |||  || ||||||||||||||    
T  17012065 ctcaaggtttactccgatacaaggtctatatttatag 17012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455672
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| | | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455521 aagggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaat 16455620  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16455621 caacc--acaaccctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctag 16455672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 235 - 383
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447651
Alignment:
Q  235 aggtgaatcaaccctcaaacc-ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc 333  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccc 32447601  T
Q  334 cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||| |||||    
T  32447602 cctctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaag 32447651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 12186025 - 12186271
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||| | ||| |     
T  12186025 aaaagtagaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacctagtccgaggcagagagcagccc 12186122  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  |  |||||||||    
T  12186123 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttc 12186222  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 246  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186223 ccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 12186271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 26066121 - 26066307
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | || | |||||| |||| |||||| ||||||| | || ||||||    
T  26066121 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 26066219  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066220 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33311442 - 33311257
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  33311442 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaat 33311344  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33311343 gggttacaagaat-agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19696803 - 19696453
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaa-cagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||     
T  19696803 caaaagtagaaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagc 19696706  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     ||  ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||  |  |||||||    
T  19696705 tatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaagaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctct 19696606  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    |   || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19696605 ttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttgaaccctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaaccct 19696509  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatttcagcc--ccctctatctcaaggttt 350  Q
    | ||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  19696508 a-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgttttcagccctccctctctctcaaggttt 19696453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33309173 - 33308988
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  33309173 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 33309075  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33309074 gggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 376
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870749
Alignment:
Q  234 aaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttatttcag-cc 13870706  T
Q  334 cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  || | |||||||||||    
T  13870707 cctctatctcaaggtttgctctgatacaaagcctatatttata 13870749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 29754705 - 29754892
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  29754705 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 29754803  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29754804 tgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 238 - 385
Target Start/End: Original strand, 1072067 - 1072214
Alignment:
Q  238 tgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 337  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||    
T  1072067 tgaatcaactcacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccttc 1072166  T
Q  338 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1072167 tatctcaaagtttactctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 1072214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15346707 - 15346535
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||       
T  15346707 caaaagtagaaaacaacaagaga--aagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctt 15346610  T
Q  100 ttcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatt 174  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15346609 tccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcttaatt 15346535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 26068392 - 26068578
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||| ||| ||||||| | || ||||||    
T  26068392 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttacaaa-gagaaatcaat 26068490  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26068491 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26945507 - 26945258
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaag-aatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  || | |||||||| ||| |||||||||||||  |||| || |||||||| || | | | |    
T  26945507 caaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaagacacgaaatttgtttacccagttcggtccaaacctgacataatctgggggggagagctgcc 26945409  T
Q  99 attcgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtct-cccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||    
T  26945408 cttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctctt 26945309  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 247  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26945308 cccgtgaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgactcaacc 26945258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852519
Alignment:
Q  254 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 353  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttact 17852551  T
Q  354 ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  17852550 ctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 17852519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 22857906 - 22858181
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22857906 caaaagtacaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagcc 22858003  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat-gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||| |   ||||| |||| | |||  |  |||||||    
T  22858004 atccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctct 22858102  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22858103 tcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttaccaagaga 22858181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346368
Alignment:
Q  217 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttcta 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||         |||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctag-tttgaa-------ttcta 15346437  T
Q  317 aacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  15346436 aacccttggttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 15346368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8995570 - 8995456
Alignment:
Q  271 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctata 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||| |||||  ||  ||||||    
T  8995570 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagccccctctatctctcagtttactctgatacaagatctata 8995471  T
Q  371 tttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||| |||||||    
T  8995470 tttatagtaaaagta 8995456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10584348 - 10584227
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa--tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | | ||||||||    
T  10584348 aacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcac 10584249  T
Q  110 tat-atgatgagtaaccttaca 130  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  10584248 tataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 351
Target Start/End: Original strand, 25078514 - 25078856
Alignment:
Q  5 agtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattc 102  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||| ||||| | |    
T  25078514 agtagaaaacagttagagaaaaag-aagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactggga-agaaagcagtcctcc 25078611  T
Q  103 gtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
    ||| |||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| |  ||| |  ||||||||  ||    
T  25078612 gttccactgtaatgacgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattcta-cttaaatctcaatctctttccg 25078710  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |    
T  25078711 tgaccaagagactcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaatcaa--tttcaaccctaatgtttgttgccaagag-taaactc--tacaaaccctaga-t 25078804  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaaccttt-atttcagcccc-ctctatctcaaggttta 351  Q
    ||||| |  ||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  25078805 tgttg-tatgtttctaaacctttgttttcggcccctctctctctcaaggttta 25078856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 270 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10584213 - 10584105
Alignment:
Q  270 caagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  10584213 caagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcttttataaacctttgttt-----ccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttat 10584119  T
Q  370 atttatagcaaaag 383  Q
    |||||||| |||||    
T  10584118 atttatagtaaaag 10584105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 25465544 - 25465710
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| |||| |||| | |||||    
T  25465544 caaaagtagaaaacagc--gagagaaagaaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtc 25465641  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 167  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25465642 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaggggtacaagaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20527054 - 20526885
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||| | |||  | ||||||||||  || |||||||||    
T  20527054 atgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcttaatctcttcttgtgaccaagaga 20526956  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20526955 ctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgtcaagag-caaactcta 20526885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 244
Target Start/End: Original strand, 28037722 - 28037927
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgt---ttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggata 139  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||| | |||||   | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28037722 aatttgtttacccagctcggtccaaaactgacctagactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagata 28037821  T
Q  140 tcaatgggttacaagaataag-tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 238  Q
    |||| |||||||||||||||| | |    |||||||||| |||||  |  ||||| ||  ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28037822 tcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaagggactcaatcctaacagtgtttcccaaggt 28037921  T
Q  239 gaatca 244  Q
    ||||||    
T  28037922 gaatca 28037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Original strand, 7542452 - 7542581
Alignment:
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactc 214  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7542452 tgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaaaaattagtcttcaaacctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactc 7542550  T
Q  215 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  7542551 aatcataatagtgtttctccaagtgaatcaa 7542581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11138479 - 11138423
Alignment:
Q  190 atctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11138479 atctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 11138423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30445815 - 30445723
Alignment:
Q  72 tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtct 163  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||  | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30445815 tgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaattagtct 30445723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15367079 - 15367013
Alignment:
Q  326 ttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgt-------aatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| |||||||    
T  15367079 ttcagccccctctatctcaaggtttacaccgatgtctgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 15367013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 3394730 - 3394695
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagag 36  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3394730 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagag 3394695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 3577658 - 3577696
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577658 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4595102 - 4595048
Alignment:
Q  252 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4595102 aaccctagtgtttgttgccaagtga-aaactc--tacaaaccctagttttgttgttgc 4595048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13878765 - 13878727
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878765 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13883513 - 13883475
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883513 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16785957 - 16785919
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16785957 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 26887368 - 26887406
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887368 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 26954286 - 26954328
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  26954286 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggaga 26954328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Original strand, 28078261 - 28078310
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtct 163  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28078261 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaa-aggttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 31248858 - 31248896
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248858 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936633
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagaga 31936633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 33211185 - 33211227
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33211185 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggaga 33211227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 35201470 - 35201508
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201470 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6843287 - 6843217
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcc-caaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaga 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  6843287 accaagagactcaatcctaatggtgtgtgttcaaggtgattcaatcct--aaccctagtgtttgttgccaaga 6843217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30445661 - 30445602
Alignment:
Q  216 atcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30445661 atcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc-tcaa-ccgtagtgtttgttgccaagaga 30445602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 109)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 44724915 - 44724533
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  44724915 caaaagtagaaaacaac--gagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 44724818  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||     
T  44724817 ctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttct 44724718  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  44724717 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagt 44724618  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  44724617 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctccaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 44724533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 443936 - 443547
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagaga--aaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggg-agaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  443936 caaaagtagaaaacagcgagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagca 443837  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||    
T  443836 gcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctct 443737  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  443736 tcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccct 443637  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || |||||||||||  ||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  443636 agttttgttgttgccattctaaaccattgttttagctccctctatctcaaggtttactctgattcaaagtctatatttatagtaaaagta 443547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 20137062 - 20137444
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  20137062 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagcc 20137158  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  20137159 ctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 20137258  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20137259 ccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctag 20137358  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||| |||||    
T  20137359 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagccaatatttatagtaaaag 20137444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21678400 - 21678020
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |      
T  21678400 caaaagtagaaaacagc--gggagaaaagaagagagaacacaagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagccca 21678303  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  || ||| ||||| ||    
T  21678302 ctgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaagaatacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcg 21678203  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21678202 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 21678103  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  21678102 tgatgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacattgatacaatatctatatttatagtaaaag 21678020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 21592094 - 21592453
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  21592094 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagcc 21592193  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||     
T  21592194 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcg 21592293  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||      
T  21592294 cgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctact 21592393  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21592394 tttgttgttgcatttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgat 21592453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 383
Target Start/End: Original strand, 4295904 - 4296271
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgat 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | |  |||||||||||||||    
T  4295904 gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgat 4296003  T
Q  118 gagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaat 217  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4296004 gagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaat 4296103  T
Q  218 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttcta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  4296104 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattcta 4296203  T
Q  317 aacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat-gtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  4296204 aacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaatgtctatatttatagtaaaag 4296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 13099423 - 13099813
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13099423 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 13099522  T
Q  97 tcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagg-gatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctc 194  Q
     | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  13099523 ccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctc 13099622  T
Q  195 ttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccc 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13099623 ttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccc 13099722  T
Q  295 tagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  13099723 tagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcaaccccctctatctcaaggtttactttgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 13099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11355597 - 11355212
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagaga-aaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||     
T  11355597 caaaagtagaaaacaacaagagagagaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagc 11355498  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
      |  ||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  11355497 tctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 11355398  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355397 ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctag 11355298  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||    
T  11355297 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaagcctatatttatagtaaaag 11355212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 39145937 - 39146322
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| | | | ||| |    
T  39145937 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagcc 39146036  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||    
T  39146037 ccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttc 39146136  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146137 ccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 39146236  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
T  39146237 ttttgttgttgtctatctaaacccttgtttcagccccctccatctcaaggtttacactgatacagtgtctatatttatagtaaaag 39146322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Original strand, 27306202 - 27306566
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatga 119  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | |||| |||||||||||||    
T  27306202 gagagaaaagaagagagaacacaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatga 27306301  T
Q  120 gtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcc 219  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27306302 gtaacgttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcc 27306401  T
Q  220 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27306402 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 27306500  T
Q  320 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  27306501 ccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 27306566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 42330952 - 42331336
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |    
T  42330952 caaaagtagaaaacagcgagagagaaag--agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccct 42331049  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||    
T  42331050 ccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccg 42331149  T
Q  201 t--aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  42331150 tgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagt 42331249  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  42331250 tttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 42331336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21680366 - 21679981
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctag---ttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||  || |  ||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  21680366 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagca 21680269  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    |   |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || |||||||    
T  21680268 gctctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaataaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctct 21680169  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21680168 tccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccct 21680069  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21680068 agttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 21679981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9679397 - 9679053
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||     
T  9679397 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagta 9679298  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  9679297 ctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttca 9679198  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9679197 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctag 9679099  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
     ||||||||||   ||||| | | || |||||||||||||||||||    
T  9679098 ttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctc 9679053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21990488 - 21990106
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  21990488 caaaagtagcaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagcc 21990389  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     |  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||     
T  21990388 ctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagttacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcc 21990289  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||     
T  21990288 cgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagt 21990189  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||||||||||   ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  21990188 tttgttgttgtcattctaaacccttgtttcag-cccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 21990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24748931 - 24748555
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |    
T  24748931 caaaagtagaaaacaac--gagagaaataaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagcc 24748834  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  24748833 ctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 24748734  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24748733 ccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctag 24748634  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
     ||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24748633 ttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctaagtcaaagtttacactgatacaatgtctatatttata 24748555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 44859 - 44516
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  44859 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 44760  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  || || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44759 aatgggttacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaa 44660  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44659 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 44560  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  44559 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 44516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9681158 - 9680768
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa--tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  9681158 caaaagtagaaaagatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 9681059  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  9681058 ctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 9680959  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9680958 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatag 9680859  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  9680858 ttttgttgttgcccttctaaacccttgtttcaaccccctctatctctctcaaggtttacatctgatacaaggtctatatttatagtaaaag 9680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 38394281 - 38393934
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  38394281 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 38394182  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394181 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38394082  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38394081 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 38393982  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  38393981 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 38393934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 31434999 - 31435384
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  31434999 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagcc 31435096  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||   | |  ||||||    
T  31435097 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttc 31435196  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31435197 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctag 31435296  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  31435297 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 31435384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 42223494 - 42223097
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  42223494 caaaagtagaaaaca--atgagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagcc 42223397  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |||||||||     
T  42223396 atccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggtttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcc 42223297  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42223296 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctag 42223197  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc-cctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaa 396  Q
     |||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  42223196 ttttgttgttgccattctaaacccttgtttcatcccacatctatctcaaggtttactctgatacaaagcctatatttatagtaaaagaaaccctcataaa 42223097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48457948 - 48457647
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  48457948 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 48457849  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48457848 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaa 48457749  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48457748 tgaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 48457649  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  48457648 tc 48457647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 7471974 - 7472275
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  7471974 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 7472073  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472074 aatgggttacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7472173  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7472174 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatc 7472273  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  7472274 tc 7472275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18345836 - 18345535
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  18345836 aagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 18345737  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345736 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 18345637  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18345636 tcaaccctcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctatc 18345537  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  18345536 tc 18345535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 45 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35921 - 35581
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  35921 aatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 35822  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35821 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatca 35722  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  35721 accctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgtttcagccccctctatctca 35622  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  35621 aagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 35581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 382
Target Start/End: Original strand, 37412119 - 37412462
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagg-gata 139  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  37412119 aagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagata 37412218  T
Q  140 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412219 tcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 37412318  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc-caagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |    
T  37412319 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctat 37412418  T
Q  339 atctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  37412419 atctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaa 37412462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20297657 - 20297356
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  20297657 aagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 20297558  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297557 aatgggttacaagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20297458  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20297457 tcaaccctcaaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 20297358  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  20297357 tc 20297356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20626333 - 20626032
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  20626333 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 20626234  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626233 aatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20626134  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20626133 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20626034  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  20626033 tc 20626032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20630224 - 20629923
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  20630224 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 20630125  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630124 aatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20630025  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20630024 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20629925  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  20629924 tc 20629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20642643 - 20642342
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  20642643 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 20642544  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642543 aatgggttacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20642444  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20642443 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 20642344  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  20642343 tc 20642342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 1049290 - 1049631
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  1049290 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 1049388  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1049389 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaa 1049488  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1049489 tcaacccacaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 1049588  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| |||| | || ||  || |||||||||||||| ||||||    
T  1049589 tcaaagtttgctctaatacaaggtctatatttatagtaaaagt 1049631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 40836737 - 40837078
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  40836737 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 40836835  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836836 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 40836935  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  40836936 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccccctcaatc 40837035  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |  ||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  40837036 tccaaatttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 40837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 7470016 - 7470317
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  7470016 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 7470115  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7470116 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaa 7470215  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7470216 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 7470315  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  7470316 tc 7470317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20299755 - 20299406
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  20299755 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 20299656  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299655 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 20299556  T
Q  242 tcaaccctcaaa-ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacct-ttatttcagccccctcta 339  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  || |||||||||||||||    
T  20299555 tcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctcta 20299456  T
Q  340 tctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  20299455 tctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 20299406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1850276 - 1849975
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  1850276 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 1850177  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1850176 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 1850077  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1850076 tcaacccacaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 1849977  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  1849976 tc 1849975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28487848 - 28487547
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  28487848 aagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 28487749  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28487748 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaa 28487649  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28487648 tcaacccacgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 28487549  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  28487548 tc 28487547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40946623 - 40946327
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  40946623 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 40946524  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  40946523 aataggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaa 40946424  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40946423 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 40946327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 1046919 - 1047219
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  1046919 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 1047017  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047018 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1047117  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  1047118 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatc 1047217  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  1047218 tc 1047219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3878872 - 3878571
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  3878872 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 3878773  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3878772 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaa 3878673  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3878672 tcaacccacaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 3878573  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  3878572 tc 3878571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 27832592 - 27832936
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||     ||||||||||||||||||||||| |  || | |    
T  27832592 caaaagtagaaaacagt--gagagaaagaaagagataacacaagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccct 27832684  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
     | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||||||| |    
T  27832685 ccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtctcaatctcttccc 27832784  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27832785 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatgttgccaagagacaaactctatacaaaccttagtt 27832884  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc-cccctctatctcaaggttt 350  Q
     ||||||||| ||| |||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27832885 ctgttgttgcctttttaaacccttgtttcagctccactctatcacaaggttt 27832936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3036019 - 3035669
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | || |||||| || |||    
T  3036019 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatc 3035920  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca---cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035919 aatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 3035820  T
Q  239 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctct 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3035819 gaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctct 3035720  T
Q  339 atctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  3035719 atctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 3035669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24258757 - 24258442
Alignment:
Q  47 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata----tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| | ||| | | |||| |||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24258757 tttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 24258658  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24258657 atgggttacaagaataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaat 24258558  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24258557 caaccctcaaaccatagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatct 24258458  T
Q  343 caaggtttacactgat 358  Q
    ||| |||||| |||||    
T  24258457 caatgtttactctgat 24258442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 113 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25276365 - 25276095
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagac 212  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  25276365 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 25276266  T
Q  213 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25276265 tcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctt 25276166  T
Q  313 tctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||   || ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  25276165 tctaaattattgttttagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 25276095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25542823 - 25542484
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||   | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  25542823 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 25542725  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25542724 aatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtctttcc-aaggtgaa 25542626  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25542625 tcaacccacaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgtttcag-cccctctatc 25542527  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  25542526 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 25542484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28485860 - 28485514
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||  | |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  28485860 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagg-agagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 28485762  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28485761 aatggattacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaa 28485662  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  28485661 tcaacccgcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccttctatc 28485562  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  28485561 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 28485514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 385
Target Start/End: Original strand, 31155908 - 31156248
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | ||||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  31155908 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 31156006  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156007 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 31156106  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31156107 aacccacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 31156206  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || |||| |  ||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  31156207 aaagtttgccttgatacaagctctatatttatagtaaaagta 31156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 7351649 - 7351947
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  7351649 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 7351747  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351748 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 7351847  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7351848 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7351947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Original strand, 7092207 - 7092432
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  7092207 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatc 7092305  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7092306 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaa 7092405  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7092406 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 7092432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11757460 - 11757176
Alignment:
Q  107 cactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaacca 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||    
T  11757460 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 11757361  T
Q  207 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11757360 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 11757261  T
Q  306 ttgcgtttctaaacct-ttatttcagccccctctatctc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||   |||||||||  || |||||||||||||||||||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  11757260 ttgtcattctaaaccccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 11757176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7188875 - 7188470
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||| | ||| |     
T  7188875 caaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagaacacgcaa-aatttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagcct 7188778  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||| |||     
T  7188777 tccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcaatctattcc 7188678  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||      
T  7188677 cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctatacaaaccctatt 7188581  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaat 398  Q
    ||| ||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||    
T  7188580 tttattgttg-acttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaat 7188482  T
Q  399 tgtaaaaaatct 410  Q
    || || ||||||    
T  7188481 tggaacaaatct 7188470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 343
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349568
Alignment:
Q  60 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataa 159  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataa 7349383  T
Q  160 gtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 258  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7349384 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 7349483  T
Q  259 gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  7349484 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgtttcagccccctctatctc 7349568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 24813450 - 24813755
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24813450 caaaagtagaaaacaacgagaga-aaaggaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagcc 24813548  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||    
T  24813549 atccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttc 24813648  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24813649 ccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 24813744  T
Q  298 atttgttgttg 308  Q
     ||| ||||||    
T  24813745 ttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 333
Target Start/End: Original strand, 43253511 - 43253801
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| | |  | | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  43253511 aagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 43253610  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253611 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 43253710  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccc 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| | || |||||||||    
T  43253711 tcaaccctcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgtttcagccc 43253801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 268
Target Start/End: Original strand, 7094454 - 7094679
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  7094454 aagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatc 7094553  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094554 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7094653  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttg 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7094654 tcaaccctcaaacccta-tgtttgttg 7094679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 410
Target Start/End: Original strand, 22828687 - 22828995
Alignment:
Q  103 gtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgt 201  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| | |    
T  22828687 gtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccat 22828786  T
Q  202 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagattt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  22828787 aaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctatacaaaccttagtttt 22828886  T
Q  302 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgt 401  Q
    |||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || | |||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||     
T  22828887 gttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcaaggtttactcggatacaaagcctatatttatagtaaaagtatccctcataaaactgg 22828986  T
Q  402 aaaaaatct 410  Q
    || ||||||    
T  22828987 aacaaatct 22828995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 410
Target Start/End: Original strand, 20091609 - 20091903
Alignment:
Q  112 tatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||    
T  20091609 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20091708  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgt 311  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  20091709 tttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgcct 20091804  T
Q  312 ttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 410  Q
        || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  20091805 ccgaaacccttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctgataaaaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 20091903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 411
Target Start/End: Original strand, 24817362 - 24817711
Alignment:
Q  58 agttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaaga 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  24817362 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaaga 24817461  T
Q  156 ataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||   ||||    
T  24817462 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaaccc---aacc 24817558  T
Q  256 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-c 354  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||   ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24817559 ctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttg-acttctaaacccttgtttcag-cccctctatctcaaggtttacatc 24817655  T
Q  355 tgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||  || |||||||||||||   |||||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  24817656 tgatacaaggtctatatttata-ttaaagtatccctcataaaattgtaacaaatctg 24817711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804554
Alignment:
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  244 aaccctcaaacccta---gtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 26804566  T
Q  341 ctcaaggtttac 352  Q
    ||||| ||||||    
T  26804565 ctcaaagtttac 26804554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 113 - 384
Target Start/End: Original strand, 22251611 - 22251878
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaaggga----tatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaag 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22251611 atgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaag 22251710  T
Q  209 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 308  Q
    |||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22251711 agactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttg 22251802  T
Q  309 cgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    | |||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  || || ||||||||||| ||||||    
T  22251803 cctttctaaactcttgtttcagcctcctctatctcaaagtttactctgattcaaggtttatatttatagtaaaagt 22251878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24465871 - 24465503
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | | |||||||| ||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  24465871 caaaagtagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacga-aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcac 24465774  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
     ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |    
T  24465773 ccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaatgagttaaaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 24465675  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  24465674 atgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaa---ttcaaccctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctag-t 24465580  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |||        |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  24465579 ttg-------atttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacatctgatacaaagtctatatctatagtaaaa 24465503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 219 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567565
Alignment:
Q  219 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  319 cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||    
T  18567631 cccttgtttcagccccttctatctcaaagtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaagta 18567565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38396929 - 38396713
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || | | || | |||||||||||||||||  ||||||| | || |||    
T  38396929 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagttacaaa-gagaaatc 38396831  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38396830 aatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 38396731  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctag 259  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  38396730 tcaacccacaaaacctag 38396713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22394059 - 22393873
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  22394059 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaacc 22393962  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaacc 186  Q
     | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22393961 ctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaacc 22393873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2935560 - 2935374
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  2935560 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 2935462  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935461 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26295782 - 26295601
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||| |||||| ||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26295782 caaaagtagaaaacaac--gaaagaaagaaagagataacacaagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcat 26295685  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26295684 ctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaa 26295601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22392618 - 22392425
Alignment:
Q  180 caaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaa 279  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||    
T  22392618 caaaaccctcatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaatag-caa 22392523  T
Q  280 actctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagca 379  Q
    | |||||||||||||||| ||||        ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |    
T  22392522 attctatacaaaccctag-tttg-------atttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagta 22392431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22137370 - 22137184
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  22137370 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 22137272  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137271 tgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40552397 - 40552211
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  40552397 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 40552299  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552298 tgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1606671 - 1606486
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  1606671 aatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 1606573  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606572 gggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081540
Alignment:
Q  6 gtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcg 103  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagag-gaaaaaaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccg 11081744  T
Q  104 tttcactatat-gatgagtaaccttacaaaagggatatcaat--gggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
    || || | ||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||||||| ||||| |   ||||||| ||  ||||| |||||||||||| |    
T  11081743 ttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttccc 11081644  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||| |    
T  11081643 gtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag---aattctctacaaaccctagtt 11081549  T
Q  300 ttgttgttg 308  Q
    |||||||||    
T  11081548 ttgttgttg 11081540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22108359 - 22108173
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  22108359 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 22108261  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108260 tgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40550119 - 40549933
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  40550119 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 40550021  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550020 tgggttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 9027191 - 9027376
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  9027191 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 9027289  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9027290 gggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6332514 - 6332283
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  6332514 aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatta 6332415  T
Q  143 atgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||  |  |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  6332414 aagggttacaagaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaaactgaa 6332315  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagag 275  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  6332314 tcaa-tctc-aatcctagtgtttgttgccaagag 6332283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6049094 - 6048903
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |   ||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||| |||||||||    
T  6049094 atgatgagtaactttacaaa-gggatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagaga 6048996  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 308  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  6048995 ttcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcc-caaa-cctagtgtttgttgccaagag---aattctttacaaaccctagttttgatgttg 6048903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11084523 - 11084438
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11084523 aatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaa-tctc-aaccctattgtttgttgccaagaga 11084438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348936
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaa 6348936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 22251536 - 22251605
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtcca 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251536 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11759422 - 11759374
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759422 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 11759374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Original strand, 16297166 - 16297222
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16297166 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaa 16297222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26804849 - 26804762
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggg 85  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26804849 caaaagtagaaaacaacatcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctggg 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 385
Target Start/End: Original strand, 30906264 - 30906387
Alignment:
Q  260 tgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  30906264 tgtttgttgctaagag-caaactctatacaaactctag-tttgttattt-gtttctaaattcttgttttcagccccctctatctcaagatttactcttat 30906360  T
Q  359 gtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      || ||||||||||||||||||||||    
T  30906361 acaaggtctatatttatagcaaaagta 30906387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396316
Alignment:
Q  276 acaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctc 337  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctc 38396316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310236
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgttcaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgc 12310236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 20091109 - 20091196
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggga 88  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| || |||||| || | | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20091109 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaaagagagaacacacgaatttatttatccagttcggtccaatactgacctagtctggggga 20091196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26210688 - 26210603
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctca-aaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26210688 aatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatcaa---tcacaaccctagtg-ttgttgccaagaga 26210603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097909
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 12097909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2120937 - 2120881
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt--cccaaggtgaatcaac 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2120937 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttgtccaaggtgaatcaac 2120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046668
Alignment:
Q  60 ttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaat 157  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||   ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaggtttacaagaat 6046674  T
Q  158 aagtct 163  Q
    ||||||    
T  6046673 aagtct 6046668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21369683 - 21369642
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369683 aatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 242
Target Start/End: Original strand, 40281519 - 40281572
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40281519 aatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaaggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 343
Target Start/End: Original strand, 7094662 - 7094717
Alignment:
Q  288 caaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7094662 caaaccctatgtttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctc 7094717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 3320194 - 3320232
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3320194 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 3324942 - 3324980
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324942 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7069818 - 7069780
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069818 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7074825 - 7074787
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074825 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190059
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggaga 9190059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 15541139 - 15541177
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541139 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25351391 - 25351353
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351391 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25357085 - 25357047
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357085 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25405431 - 25405393
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25405431 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25410168 - 25410130
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410168 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 27347985 - 27347943
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27347985 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 27347943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 36146408 - 36146450
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  36146408 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggaga 36146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 41317434 - 41317476
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41317434 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 41317476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42006701 - 42006663
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006701 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 90
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253570
Alignment:
Q  49 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaattgacctactctgtgggaga 4253570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348859
Alignment:
Q  252 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctag 6348859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4796760 - 4796716
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaa 92  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4796760 ttgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaa 4796716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25276465 - 25276381
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggg 86  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||| |||  ||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25276465 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaa--aagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctgggg 25276381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28196939 - 28196557
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  28196939 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagcc 28196842  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||     
T  28196841 attcgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcc 28196742  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28196741 cataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 28196642  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |  ||||||||||| |||||    
T  28196641 tttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaaagcatatatttatagtaaaag 28196557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19007944 - 19007560
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  19007944 caaaagtagaaaacaacgagagagaaatgaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 19007845  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||     
T  19007844 cttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcc 19007745  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||      
T  19007744 cataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataat 19007645  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || | |||||||||||| |||||    
T  19007644 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactatgatacaaagcctatatttatagtaaaag 19007560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 382
Target Start/End: Original strand, 6264101 - 6264479
Alignment:
Q  3 aaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |    
T  6264101 aaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccct 6264200  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||  |    
T  6264201 ccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatc 6264300  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    |    
T  6264301 gtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaaccc----t 6264396  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  6264397 ttgttgttgcctttctaaacctttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 6264479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 42923458 - 42923848
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagaga--aaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  42923458 caaaagtagaaaacaacgagagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcag 42923557  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42923558 ccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctt 42923657  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42923658 cccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatccta 42923757  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  42923758 gttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagcctcctctatctctcaaggtttactatgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 42923848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 21520655 - 21521032
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  21520655 aacagcgagagagaaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcac 21520754  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||  ||||||||||    
T  21520755 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaaga 21520854  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21520855 gactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgc 21520954  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctcta--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||||  |||||| |||||  |||||  || || ||||||||||| |||||||    
T  21520955 ctttctaaacccttgtttcagccccatctatctctcaaagtttagtctgatacaaggtttatatttatagtaaaagta 21521032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 40032016 - 40032395
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | | | ||||||||    
T  40032016 aacagcgagaga-aaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcac 40032114  T
Q  110 tat-atgatgagtaaccttacaaaag----ggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaac 204  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||  |||||    
T  40032115 tataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaac 40032214  T
Q  205 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40032215 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 40032314  T
Q  305 gttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  40032315 gttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 40032395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 22287287 - 22287673
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  22287287 caaacgtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 22287386  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||     |||||||||     
T  22287387 ctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcc 22287486  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||     
T  22287487 cgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagt 22287586  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||  | ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22287587 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctcaaagtttactttaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22287673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 42 - 383
Target Start/End: Original strand, 11739553 - 11739895
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  11739553 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatat 11739652  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739653 caatggattccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 11739752  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||    
T  11739753 atcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgttccagccccctctat 11739852  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11739853 ctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttatagtaaaag 11739895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17848741 - 17848394
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  17848741 aaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtca 17848644  T
Q  100 ttcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||  ||||||||| |    
T  17848643 tccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat-ggttacaagaataagtctcccgcc---ttctacccaaagcctcaatctcttccc 17848548  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  17848547 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagt 17848448  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
    ||||||||||  |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17848447 tttgttgttgtctttctaaaccctcgtttgagccccctctatctcaaggattac 17848394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 385
Target Start/End: Original strand, 6258769 - 6259152
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |     
T  6258769 aaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggg-agagagcagccc 6258867  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||  ||     
T  6258868 tccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaatct--tcc 6258965  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||     
T  6258966 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagt 6259065  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||| ||||||| |||||||||  || ||||| || |||||||||||| |||||  || ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  6259066 tttattgttgcctttctaaactcttgtttcatcctcctctatctcaaagtttagtctaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 6259152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14837572 - 14837193
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  14837572 caaaagtataaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatcc 14837473  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||  |  |||||||||    
T  14837472 atccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttc 14837373  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  14837372 ------ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctag 14837279  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||  ||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  14837278 ttttgttgttgtcttttttaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttacagtaaaag 14837193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 19504340 - 19504681
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  19504340 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 19504439  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504440 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 19504538  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19504539 tcaaccaacaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 19504638  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  19504639 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 19504681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 382
Target Start/End: Original strand, 19502005 - 19502345
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  19502005 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 19502104  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502105 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 19502204  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  19502205 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctttatc 19502304  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  19502305 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaa 19502345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3022476 - 3022089
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  3022476 caaaagcagaaaacaacgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 3022377  T
Q  99 attcgtttcactata----------tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct 188  Q
    ||  |||||| ||||          ||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  3022376 atctgtttcattataacgatgataatgatgagtaactttataaa-gagatattaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctc 3022278  T
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 288  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022277 aatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatac 3022178  T
Q  289 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  3022177 aaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgtttcagcctcctatatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 3022089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17849421 - 17849037
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || |||||| | ||| |    
T  17849421 caaaagtagaaaacaacgggagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagcc 17849322  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
       |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||     
T  17849321 cc-cgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctta 17849223  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  17849222 ccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctag 17849123  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  17849122 ttttgttgttatctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtttatatttatagtaaaag 17849037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27105058 - 27104718
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||  ||||||| | || |||    
T  27105058 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttacaaa-gagaaatc 27104960  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104959 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 27104860  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  27104859 tcaacccacaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtttcagccccctctatc 27104761  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  27104760 tcaaagttttctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 27104718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Original strand, 44289022 - 44289370
Alignment:
Q  5 agtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattc 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||  |||      
T  44289022 agtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatct 44289121  T
Q  103 gtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||| || ||  || ||||||||| |||    
T  44289122 gtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacgggttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgt 44289221  T
Q  202 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagattt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  44289222 aaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagtttt 44289321  T
Q  302 gttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttt 350  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  44289322 gttgttgccttcctaaacctttgttttagtcccctctatatcaaggttt 44289370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 45279978 - 45280323
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  45279978 aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 45280077  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45280078 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaa 45280177  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc-gtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45280178 tcaaccctctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgtttcagccccctctat 45280277  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    ||||| |||| | |||||  || || |||||||||||  |||||||    
T  45280278 ctcaaagtttgctctgatacaaggtatatatttatagtgaaagtaa 45280323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 13910039 - 13910380
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  | | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  13910039 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 13910137  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13910138 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaa 13910237  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13910238 tcaacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 13910337  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  13910338 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 13910380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 23452231 - 23452578
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  23452231 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 23452330  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23452331 aatgggttacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaa 23452430  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  23452431 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctgtc 23452530  T
Q  342 tc----aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||    || |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  23452531 tctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 23452578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42064776 - 42064433
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || ||    
T  42064776 aagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaat 42064678  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064677 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 42064578  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  42064577 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctat 42064478  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||| | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  42064477 ctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 42064433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 375
Target Start/End: Original strand, 34979571 - 34979906
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaac-agtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggata 139  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | | |  || | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34979571 aagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagata 34979670  T
Q  140 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34979671 taaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtg 34979770  T
Q  240 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||  || |||||||||||||||    
T  34979771 aatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgtttcagccccctcta 34979870  T
Q  340 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttat 375  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  34979871 tctcaaggtttacactaatacaatgtctatatttat 34979906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 43623530 - 43623905
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||     
T  43623530 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagc 43623629  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||    
T  43623630 cctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttc 43623729  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  43623730 ccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctag 43623817  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||   |||||| |||||  || |||||| ||||||| |||||||    
T  43623818 ttttgttgttgcctttctaaaccattgtttcacccccctctatctcccagtttactctgatacaaggtctatttttatagtaaaagta 43623905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42453041 - 42452701
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  42453041 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 42452943  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452942 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 42452843  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42452842 tcaacccacaaactctagtgtttgttac--agagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 42452745  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  42452744 tccaagtttgctctgatacaatgtctatatttataataaaagta 42452701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 71 - 383
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239316
Alignment:
Q  71 ttgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 170  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  171 aattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 270  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  271 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----tctcaaggtttaca-ctgatgtaatgt 365  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| | || |||||||||||||||    |||||||||||||| |||||| |  ||    
T  45239200 aa-agagaaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgtttcagccccctctatctctctcaaggtttacatctgatgaatggt 45239298  T
Q  366 ctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||||| |||||    
T  45239299 ctatatttatagtaaaag 45239316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 31732732 - 31733100
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  31732732 caaaagtagaaaacagcgagaga-aaag--atagagaacacacgaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcct 31732828  T
Q  101 tcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcac 199  Q
     |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||             
T  31732829 ccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa--------- 31732919  T
Q  200 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagat 299  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31732920 ---accaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagtt 31733016  T
Q  300 ttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  || |||||||||||||| |||||    
T  31733017 ttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaatgtttactctgttacaaagtctatatttatagtaaaag 31733100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 126 - 382
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539809
Alignment:
Q  126 ttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatag 225  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatag 15539652  T
Q  226 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || |    
T  15539653 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgt 15539752  T
Q  326 ttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  15539753 ttcaaccccctatatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaa 15539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 24162217 - 24162548
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  24162217 aagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattacaaa-gagaaatc 24162315  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |          | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24162316 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca----------gcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaa 24162405  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24162406 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 24162505  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  24162506 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 24162548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Original strand, 35215584 - 35215881
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  35215584 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 35215682  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215683 agttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 35215782  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35215783 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35215881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Original strand, 35217961 - 35218258
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||| |    
T  35217961 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaacg 35218059  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218060 ggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 35218159  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35218160 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 35218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 383
Target Start/End: Original strand, 11578104 - 11578439
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| | | ||| | | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11578104 aatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatca 11578203  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11578204 atgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaat 11578303  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    |||||  | |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11578304 caacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatacaaaccctagtttttttgttg-acttctaaacccttgtttcagcccactctatct 11578398  T
Q  343 caaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  11578399 caagatttaccctgatataaggtctatatttatagtaaaag 11578439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Original strand, 5375306 - 5375550
Alignment:
Q  10 aaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |    
T  5375306 aaaacagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttcc 5375405  T
Q  108 actatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaa 207  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||    
T  5375406 actatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaa 5375504  T
Q  208 gagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5375505 gagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 18800266 - 18800639
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||| |||||||| ||| |  ||     
T  18800266 caaaagtagaaaacagca-ga-agaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctgggg-agagagtagc 18800362  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    | | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18800363 cctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctctt 18800462  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18800463 cctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc---aaccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaacccta 18800558  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | ||          |||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  18800559 gctt--------gatttctaaacccttgtttcagccccctatatctccatgtttaccctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 18800639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22874411 - 22874034
Alignment:
Q  25 aaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagt 121  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||   |  ||||||||||| ||||||||    
T  22874411 aaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagt 22874312  T
Q  122 aaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatccta 221  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  22874311 aactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatccta 22874212  T
Q  222 atagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacct 321  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||     
T  22874211 atactgttttccaaggtgaatcaaccc---aaccatagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttg-------atttctaaaccc 22874124  T
Q  322 ttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||  || | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  22874123 ttgtttcagccccctctatctccaggtttgctctgatacaaagcctgtatttatagcaaaagtaaccctcataaaattgaaacaaatctg 22874034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 28459143 - 28459435
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |  || |    
T  28459143 caaaagtagaaaacagg--gagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagcc 28459239  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  || ||| || ||||||    
T  28459240 ctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttc 28459339  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28459340 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccaccctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacc 28459435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 22407405 - 22407583
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22407405 caaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 22407504  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 177  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22407505 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccccctaattcta 22407583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 17897199 - 17897502
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  17897199 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctgggg-agagagcagcc 17897295  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| |||    
T  17897296 atccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaatctcaatcttttc 17897395  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17897396 tcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-tctcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactctatacaaaccctag 17897491  T
Q  298 atttgttgttg 308  Q
     ||| ||||||    
T  17897492 ttttattgttg 17897502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 206 - 383
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163282
Alignment:
Q  206 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttg 22163204  T
Q  306 ttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22163205 ttgcctttctaaatccttgtttcagccccctctatctcaaagtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 22163282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 20146560 - 20146866
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaattt-gttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| | || ||| || ||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||| |    
T  20146560 caaaagtagaaaacaacgagaga-aaagaaagagagatcacacgaaattcgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgagggagagagcagcc 20146658  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||    
T  20146659 ctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatctcaatcttttc 20146758  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20146759 ccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactctatacaaaccctag 20146855  T
Q  298 atttgttgttg 308  Q
     ||| ||||||    
T  20146856 ttttcttgttg 20146866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 203 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38020302 - 38020162
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38020302 accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttg 38020203  T
Q  303 ttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38020202 ttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 38020162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 22707705 - 22707872
Alignment:
Q  4 aagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctg--ggggagaaaacagtca 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| | ||| |     
T  22707705 aagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccc 22707804  T
Q  100 ttcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 167  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707805 tctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 36558860 - 36559047
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  36558860 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 36558958  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36558959 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 36561137 - 36561324
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  36561137 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 36561235  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36561236 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 385
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407746
Alignment:
Q  230 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttca 22407690  T
Q  330 gccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || |||| |||||||  |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22407691 gcaccctatatctcacagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22407746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 231
Target Start/End: Original strand, 45332179 - 45332364
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  |||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||    
T  45332179 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttacaaa-gagaaatcaatg 45332277  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45332278 ggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 411
Target Start/End: Original strand, 37962938 - 37963290
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||||    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||   | |||||    
T  37962938 aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaa 37963034  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||    
T  37963035 tggattacaagaataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatc 37963134  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||| |   |||| | |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||        |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37963135 aacac---aaccatggtgtttgttgtcaagag-caaactatacacaaaccctag-tttg-------atttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 37963222  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||||||| || ||  || |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||| || |||||||    
T  37963223 aaggtttactcttatacaaagtctatatttatagtaaaagtatccatcataaaattggaacaaatctg 37963290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 40699660 - 40699429
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | | ||  | |  ||| ||||||| |||    
T  40699660 gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacctagttcggtctaatactgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatga 40699561  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40699560 tgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactca 40699461  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40699460 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 40699429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23871120 - 23870951
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||| | ||  |    
T  23871120 caaaagtagaaaacagcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacctagtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaacc 23871021  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgc 168  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23871020 ctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataagtctgccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35107590 - 35107218
Alignment:
Q  10 aaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaat--ttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgttt 106  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||  ||| ||||     
T  35107590 aaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttc 35107492  T
Q  107 cactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcc--cgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaa 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| |     ||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |    
T  35107491 cactataatgatgagtaacattacaaaagagataacaa-aggttacaagaataagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtga 35107393  T
Q  204 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35107392 ccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaatcc-caaccc----tgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttct 35107299  T
Q  304 tgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||   |||||||| |||  ||| ||  | ||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  35107298 tgttg-acttctaaactcttggttttag-actctctacctcaaggtttactatgatacaatgtctatatttatagtaaaagta 35107218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 293
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136368
Alignment:
Q  118 gagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaa 216  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||  || ||| ||||  ||| ||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  217 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 293  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacc 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22162975 - 22163108
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||      
T  22162975 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagct 22163072  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaag 134  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22163073 ctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaag 22163108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  51 ttgacctagttcggtccaaa-ttgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggtt 149  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtt 7463049  T
Q  150 acaagaataagtctcccgcctaattcta 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7463050 acaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Original strand, 5377629 - 5377724
Alignment:
Q  248 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  5377629 ctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagtcccctctatctc 5377724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 260
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414291
Alignment:
Q  161 tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 260  Q
    ||||||||||||||||| | |||  || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttc-cgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa-cctcaaaccctagt 38414291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20589782  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgttt 230  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20589781 ctcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38020157 - 38020064
Alignment:
Q  289 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  38020157 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttccaaccccctctatctccaggtttacaccgatacaatgtctatatttatagtaaaa 38020064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43139484 - 43139395
Alignment:
Q  193 tcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43139484 tcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactcta 43139395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Original strand, 15539481 - 15539553
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaatt 72  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15539481 aaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 285
Target Start/End: Original strand, 27583480 - 27583573
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27583480 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca--ctcccaaccttagtgttcgttgccaagaga-aaactcta 27583573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15694094 - 15693958
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaa-accctaatctcttcacgtaaccaagag 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||   |||||||||| |||||  ||| |||||||||  || ||||||||    
T  15694094 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagag 15693995  T
Q  211 actcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaac 246  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15693994 actttatcctaatagtgtttctccacggtgaatcaac 15693958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 385
Target Start/End: Original strand, 12342681 - 12342747
Alignment:
Q  319 cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12342681 cctttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgatacaatgtgtatatttatagtaaaagta 12342747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921754
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaa-ccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaa 17921754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26345718 - 26345661
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 246  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26345718 aatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatcaac 26345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35028688 - 35028595
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactcta 285  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35028688 aatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgttaccaagag-caaactcta 35028595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057411
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggaga 17057411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085394
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggaga 17085394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 245
Target Start/End: Original strand, 34575265 - 34575308
Alignment:
Q  203 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34575265 accaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaa 34575308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40699278 - 40699203
Alignment:
Q  335 ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 410  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| || ||||||    
T  40699278 ctctctctcaaggtttactctgatgcaaggtctatatttatagtaaaagtatccctcagaaaattggaacaaatct 40699203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 723744 - 723786
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  723744 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 723786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2736243 - 2736205
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736243 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2740979 - 2740941
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740979 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11067473 - 11067431
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11067473 ttgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 11067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 11151591 - 11151633
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11151591 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 11151633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17462474 - 17462436
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462474 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 20054909 - 20054947
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054909 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 22712660 - 22712698
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712660 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 22717369 - 22717407
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717369 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||||||| |||||  || ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Original strand, 30720684 - 30720811
Alignment:
Q  119 agtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaacc-ctaatctcttcacgtaaccaagagactcaa 216  Q
    |||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||  | | ||||||||| |||  | |||||||||||    
T  30720684 agtaactttacaaaag--atttcaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcacgaatctcttctcgtgccaaagagactcaa 30720781  T
Q  217 tcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30720782 tcctaatagtgtttctccaagatgaatcaa 30720811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 33162450 - 33162492
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  33162450 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggaga 33162492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 34139770 - 34139812
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34139770 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 34139812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 39285004 - 39284962
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39285004 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 39284962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39680083 - 39680045
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680083 ctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39687021 - 39686983
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39687021 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45567447 - 45567409
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567447 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1345641 - 1345592
Alignment:
Q  41 caagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1345641 caagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggaga 1345592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2838130 - 2838081
Alignment:
Q  41 caagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  2838130 caagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggaga 2838081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7503032 - 7502975
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7503032 aatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtggatcaa 7502975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020312
Alignment:
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaa 38020312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 17943730 - 17943674
Alignment:
Q  35 agaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  17943730 agaacacaagaatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggaga 17943674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 34575119 - 34575179
Alignment:
Q  31 agagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  34575119 agagagaacacaaaaatttgtttacctagttcgatccaatgctgacctagtctgggggaga 34575179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 121)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 12395796 - 12396180
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  12395796 caaaagtagaagacaacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 12395895  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  12395896 ccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcc 12395995  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  12395996 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagt 12396095  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12396096 tttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12396180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 12400758 - 12401142
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  12400758 caaaagtagaagacaacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 12400857  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  12400858 ccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcc 12400957  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  12400958 cgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagt 12401057  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12401058 tttgttgttgcctttctaaatccttgtttcagccccatctatctcaaggtttacatttatacaatgtctatatttatagtaaaag 12401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19096268 - 19095880
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaa---aggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaaca 95  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||   || |||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19096268 caaaagtagaaaacaacgagagaaaataaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 19096169  T
Q  96 gtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    |   | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19096168 gctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctct 19096069  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccc 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19096068 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccc 19095969  T
Q  295 tagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||  ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  19095968 taattttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 19095880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Original strand, 38928130 - 38928513
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  38928130 caaaagtagaaaacaac--gagataaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 38928227  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||     
T  38928228 ctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcc 38928327  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38928328 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctag 38928427  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || ||  || | |||||||||||| |||||    
T  38928428 ttttgttgttgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctaatacaaagcctatatttatagtaaaag 38928513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16453690 - 16453282
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  16453690 caaaagtagaaaacagt--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaacc 16453593  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||    
T  16453592 atctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttc 16453493  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  16453492 tcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctag 16453393  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 397  Q
     ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||| | |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453392 ttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctctcggtttgctctgatacaaagcctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 16453293  T
Q  398 ttgtaaaaaat 408  Q
    |||||| ||||    
T  16453292 ttgtaacaaat 16453282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 45 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48486655 - 48486315
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  48486655 aatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaat 48486556  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486555 gtgttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 48486456  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48486455 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctca 48486356  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  48486355 aagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 48486315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 40091366 - 40091752
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  40091366 caaaagtagaaaatagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagcc 40091465  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||     
T  40091466 ctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 40091565  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  40091566 cgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagt 40091665  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  40091666 tttgttgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactttgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 40091752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40637458 - 40637069
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40637458 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 40637359  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||    
T  40637358 ccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 40637259  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40637258 cccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccta 40637159  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  40637158 gttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 40637069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 33415441 - 33415797
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |    
T  33415441 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagcc 33415538  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||     
T  33415539 ctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcc 33415638  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33415639 cgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccttagtgtttgtt-ccaagagacaaactctatacaaaccctagt 33415737  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgat 358  Q
    ||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33415738 tttgttgttacctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttactctgat 33415797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 36921444 - 36921832
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |    
T  36921444 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagcc 36921543  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||     
T  36921544 atccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcc 36921643  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36921644 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctag 36921743  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta--tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | |||||||    
T  36921744 ttttgttgttgcctttctaagcccttgtttca-ccccctctatctctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttattgtaaaagta 36921832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36378672 - 36378262
Alignment:
Q  2 aaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |     
T  36378672 aaaagtagaaaacagcaggagaaaa--gaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 36378575  T
Q  100 ttcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||     
T  36378574 tccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcc 36378475  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36378474 cgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 36378375  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaat 398  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  36378374 tttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccgtctatctcaaggtttattctgatacaaagtctatatttatagtaaaagtaaccctcataaaat 36378275  T
Q  399 tgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||| |||||||    
T  36378274 tgtaacaaatctg 36378262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14633657 - 14633315
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  14633657 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatc 14633558  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633557 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 14633459  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  14633458 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag-cccttctatc 14633360  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  14633359 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 14633315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 22802728 - 22803071
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22802728 aagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatc 22802827  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802828 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22802927  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22802928 tcaaccctcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 22803027  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22803028 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22803071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24889135 - 24888792
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  24889135 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatc 24889036  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889035 aatgggttacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 24888936  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24888935 tcaaccctcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 24888836  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  24888835 tctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 24888792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 36919535 - 36919924
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |    
T  36919535 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagcc 36919634  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    ||   || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  ||||||     
T  36919635 atctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcc 36919734  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36919735 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctag 36919834  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc--tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  36919835 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatctatcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 36919924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24879374 - 24878985
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24879374 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 24879275  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | | ||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||    
T  24879274 ccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctct 24879175  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24879174 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccct 24879075  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||    
T  24879074 agttttgttgttgtctttctaaaccctagtttcagccccctctatctccaagtttactcggatacaaggtctatatttatagtaaaagta 24878985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24880836 - 24880447
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24880836 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 24880737  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaacctt-acaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
     | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||    
T  24880736 ccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctct 24880637  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24880636 tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccct 24880537  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |  |||  |||||||||||||| | |||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||    
T  24880536 agttttgttgttgcctttctaaaccctagtttacgccccctctatctccaagtttactccgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 24880447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 619400 - 619784
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||    
T  619400 caaaagtagaaaacaacagcagagaa-gaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtc 619497  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  || |||||||||     
T  619498 atccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcc 619597  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  619598 cttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagt 619697  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  619698 tttgttgttgtctttataaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 619784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 385
Target Start/End: Original strand, 22800825 - 22801199
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |  ||| |||    
T  22800825 aacagcgagagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccac 22800923  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||||| |||||    
T  22800924 tatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaaga 22801023  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  22801024 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgt 22801123  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  22801124 cattctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 22801199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 8631413 - 8631714
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  8631413 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 8631512  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631513 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 8631612  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8631613 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 8631712  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  8631713 tc 8631714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47275106 - 47274723
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagaga-gaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||     
T  47275106 caaaagtagaaaacagc--gagagaaatcaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 47275010  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   |||||    
T  47275009 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttc 47274910  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47274909 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctag 47274811  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  47274810 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 47274723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5198759 - 5198416
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  5198759 aagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 5198660  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5198659 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaa 5198560  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5198559 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 5198460  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  5198459 tcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 5198416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 14787380 - 14787770
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaag-gaagaga-gaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaa--cag 96  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  14787380 caaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacacaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 14787479  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  14787480 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctctt 14787579  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14787580 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaacccta 14787679  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc--aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||   ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  14787680 gttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14787770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11435293 - 11434952
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  11435293 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 11435195  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435194 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 11435095  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11435094 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 11434995  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  11434994 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 11434952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 352
Target Start/End: Original strand, 37313059 - 37313370
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatat 140  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37313059 aagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 37313158  T
Q  141 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37313159 taatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtga 37313258  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37313259 atcaactctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 37313358  T
Q  341 ctcaaggtttac 352  Q
    ||||||||||||    
T  37313359 ctcaaggtttac 37313370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24348557 - 24348256
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  24348557 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 24348458  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348457 aatgggttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 24348358  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24348357 tcaacccacaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 24348258  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  24348257 tc 24348256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 37089366 - 37089666
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  37089366 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 37089464  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089465 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 37089564  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37089565 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatc 37089664  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  37089665 tc 37089666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47868740 - 47868396
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  47868740 aagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 47868641  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47868640 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaa 47868541  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  47868540 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttctttcagccctctctatc 47868441  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    || | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  47868440 tccaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 47868396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 22044385 - 22044727
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  22044385 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 22044483  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22044484 aatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaa 22044583  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22044584 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 22044683  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  22044684 tccaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 22044727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 22046680 - 22047022
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  22046680 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 22046778  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046779 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 22046878  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22046879 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 22046978  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | | |||  || | |||||||||||| |||||||    
T  22046979 tccaagtttgctccgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 22047022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51015584 - 51015242
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||    
T  51015584 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatc 51015486  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015485 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 51015386  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51015385 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 51015286  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    || | |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  51015285 tccaagtttgctctgatacaaagtctatatttatagtaaaagta 51015242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9148591 - 9148247
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  9148591 aagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 9148493  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148492 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 9148393  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta-- 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||      
T  9148392 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgcttcagccccctctatc 9148293  T
Q  340 tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||| |||| | |||||  || | |||||||||||| |||||||    
T  9148292 tctcaaagtttgctctgatacaaggcctatatttatagtaaaagta 9148247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 11006231 - 11006532
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  11006231 aagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattacaaa-gagaaatc 11006329  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11006330 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 11006429  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11006430 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 11006529  T
Q  341 ctc 343  Q
    |||    
T  11006530 ctc 11006532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 11008562 - 11008861
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | |||||||   || |||    
T  11008562 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccattacaaa---gaaatc 11008658  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11008659 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 11008758  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11008759 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 11008858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41997872 - 41997496
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||  | ||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |     
T  41997872 caaaagtagaaaacagcgagagc-aaagaaagagagaacttatgaaatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctgggg-agagagcggccc 41997775  T
Q  100 ttcgtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| |||     
T  41997774 tccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcc 41997675  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaga 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41997674 cgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagt 41997575  T
Q  299 tttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    ||||||||| | ||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  41997574 tttgttgtttcctttctgaacacttgtttcagccccctttatctcaaggtttactctgatacaaagtctatatttatag 41997496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6765183 - 6764834
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  6765183 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 6765084  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6765083 aatgggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaa 6764984  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgc-----caagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccct 336  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  6764983 tcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccctt 6764884  T
Q  337 ctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    ||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  6764883 ctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 6764834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38409543 - 38409243
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  38409543 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 38409445  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409444 aatgggttacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 38409345  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  38409344 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgtttcagccccctctatc 38409245  T
Q  342 tc 343  Q
    ||    
T  38409244 tc 38409243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 56030770 - 56030443
Alignment:
Q  52 tgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttac 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | |||||||   |||||||| |||| |||||||||  || |||||| |||||    
T  56030770 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttac 56030674  T
Q  152 aagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030673 aagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 56030574  T
Q  252 aaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggttta 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  56030573 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaggttta 56030474  T
Q  352 cactgatgtaatgtctatatttatagcaaaa 382  Q
    | |||||  || | |||||||||||| ||||    
T  56030473 ctctgatacaaagcctatatttatagtaaaa 56030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7941662 - 7941359
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||    
T  7941662 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatc 7941563  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941562 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 7941463  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtg--tttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta 339  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  7941462 tcaacccacaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctcta 7941363  T
Q  340 tctc 343  Q
    ||||    
T  7941362 tctc 7941359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13543997
Alignment:
Q  68 aaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 167  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 267  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgtt 13544074  T
Q  268 gcc-aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| | | || |||||||||||||||||||    
T  13544073 gccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgtttcagccccctctatctc 13543997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 385
Target Start/End: Original strand, 44599836 - 44600175
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || |||||||    
T  44599836 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatg 44599934  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599935 agttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 44600034  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44600035 acccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctca 44600134  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||| |  | ||  || |||||||||||||| |||||||    
T  44600135 aagtttgctttaatacaaggtctatatttatagtaaaagta 44600175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 386
Target Start/End: Original strand, 2484869 - 2485211
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||    
T  2484869 gaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaa 2484967  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2484968 tgggttacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 2485067  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccc-tctatct 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||| ||    
T  2485068 aacccagaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttttagcccccttctagct 2485167  T
Q  343 caaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    ||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  2485168 caaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 2485211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18847491 - 18847150
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  18847491 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatc 18847394  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18847393 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtga 18847294  T
Q  241 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18847293 atcaacccacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcaaccccctctat 18847194  T
Q  341 ctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    ||||| ||||    ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  18847193 ctcaaagtttgttttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 18847150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 308
Target Start/End: Original strand, 26085971 - 26086236
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || | |    
T  26085971 aagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaaac 26086069  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086070 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 26086169  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086170 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 26086236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 18709161 - 18709458
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  18709161 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 18709259  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18709260 gggttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatca 18709359  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18709360 actcacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 18709458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 17662196 - 17662575
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  17662196 caaaagtagaaaacaacagcgagaaaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagc 17662294  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||||    
T  17662295 cctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttc 17662394  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||           |||||||||||    
T  17662395 ctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgtttcaaagag-----------acaaaccctag 17662483  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta----tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    |||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  17662484 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctctctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 17662575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19323056 - 19322701
Alignment:
Q  22 gagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgat 117  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  | | |||| ||||||| ||||    
T  19323056 gagaaagaaagagagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgat 19322957  T
Q  118 gagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaat 217  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19322956 gagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaat 19322857  T
Q  218 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||    
T  19322856 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaa 19322761  T
Q  318 acctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||    
T  19322760 acccttgtttcatccccctctatctcaaggtttactctgatacaagatctatatttatag 19322701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 9174143 - 9174482
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  9174143 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 9174241  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174242 gagttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 9174341  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9174342 aactcacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 9174441  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
     | |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  9174442 caagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 9174482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16455591 - 16455355
Alignment:
Q  32 gagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttaca 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16455591 gagagaacacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttaca 16455492  T
Q  131 aaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455491 aaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16455392  T
Q  231 cccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455391 cccaaggtgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgtt 16455355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 16934140 - 16934479
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  16934140 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 16934238  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16934239 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatc 16934338  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16934339 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctctatctc 16934438  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16934439 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 16934479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 343
Target Start/End: Original strand, 31849593 - 31849894
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  31849593 aagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 31849691  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |  |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849692 aatgggttacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 31849791  T
Q  242 tcaaccctcaaaccct-agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctat 340  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31849792 tcaacccacaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctat 31849891  T
Q  341 ctc 343  Q
    |||    
T  31849892 ctc 31849894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 377
Target Start/End: Original strand, 9176471 - 9176803
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  9176471 aatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 9176569  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176570 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 9176669  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9176670 aacccacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 9176769  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     | |||| |  ||||  || ||||||||||||||    
T  9176770 caagtttgctttgatacaaggtctatatttatag 9176803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 107 - 343
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637760
Alignment:
Q  107 cactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaacca 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  207 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 5637723  T
Q  307 tgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5637724 tgcctttctaaactcttgtttcagccccctctatctc 5637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 22132389 - 22132684
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  22132389 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 22132487  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132488 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 22132587  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  22132588 acccacaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 22132684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Original strand, 22780371 - 22780668
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||    
T  22780371 atttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 22780469  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780470 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 22780569  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22780570 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctc 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 343
Target Start/End: Original strand, 22782736 - 22783033
Alignment:
Q  46 atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||    
T  22782736 atttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatg 22782834  T
Q  146 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782835 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatca 22782934  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22782935 acccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgtttcagccccctctatctc 22783033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 107 - 343
Target Start/End: Original strand, 3824629 - 3824863
Alignment:
Q  107 cactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaacca 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||    
T  3824629 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 3824728  T
Q  207 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgt 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3824729 atagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 3824828  T
Q  307 tgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3824829 tgcttttctaaacc--tgtttcagccccctctatctc 3824863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36380730 - 36380425
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  36380730 caaaagtagaaaacag-aag-gagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcag-c 36380634  T
Q  99 attc-gtttcactat-atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
    | || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||    
T  36380633 actcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 36380534  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36380533 ccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaacccta 36380434  T
Q  297 gatttgttg 305  Q
    | |||||||    
T  36380433 gttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Original strand, 16931786 - 16932125
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  16931786 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 16931884  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16931885 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatc 16931984  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16931985 aacccacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtatcagccccctctatctc 16932084  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  ||||  || || ||||||||||| ||||||    
T  16932085 aaagtttgctttgatacaaggtttatatttatagtaaaagt 16932125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 383
Target Start/End: Original strand, 18537444 - 18537806
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||| | | |||| ||||||| |||    
T  18537444 gagagaaagaaagagagaacgcacaaaatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatga 18537543  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18537544 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactca 18537642  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttct 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  18537643 atcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttct 18537737  T
Q  316 aaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  18537738 aaacccttgttttcagccccctctatctcaatgtttactctgatacaagatctatatttatagtaaaag 18537806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 383
Target Start/End: Original strand, 18409344 - 18409681
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||    |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  18409344 aatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaa 18409442  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  18409443 tgggttacaagaataaatctcccgcctaattcta-ccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaat 18409541  T
Q  243 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  18409542 caaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cctctctatct 18409640  T
Q  343 caaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||    
T  18409641 cattgtttacactgatacaaattctatatttatagtaaaag 18409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27499406 - 27499129
Alignment:
Q  19 agagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| | ||||||||| |||| ||    
T  27499406 agagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggggaa-agagcagcccttcgtttcaatataatg 27499308  T
Q  116 atgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27499307 atgagtaaccttacaaaagagatatta---ggttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactca 27499211  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499210 atcctaatagtgtttctcaggatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 27499129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Original strand, 22134615 - 22134909
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | |  | |||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  22134615 aatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaat 22134712  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |  || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134713 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 22134812  T
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  22134813 acccacaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cccctctatctc 22134909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2891674 - 2891433
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||    
T  2891674 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtc 2891575  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  2891574 atctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 2891475  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891474 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 18534785 - 18535138
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||| || | ||  |    
T  18534785 caaaagtagaaaatagc--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcaccc 18534882  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  18534883 ctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 18534982  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18534983 tcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 18535079  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaac-ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactga 357  Q
     |||||||||  |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18535080 -tttgttgtt-tgtttttaaacacttgttttcagccccctctatctcaaggtttactctga 18535138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 383
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937543
Alignment:
Q  153 agaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  253 accctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgtttcagctccctctatctcaaggtttac 3937513  T
Q  353 actgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     |||||  || |||||||||||||| |||||    
T  3937514 tctgat-aaaagtctatatttatagtaaaag 3937543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 343
Target Start/End: Original strand, 47210762 - 47211035
Alignment:
Q  58 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaat 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47210762 agttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 47210861  T
Q  158 aagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            | ||||||||    
T  47210862 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa------------cacaaaccct 47210949  T
Q  258 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47210950 agtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 47211035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 377
Target Start/End: Original strand, 52942537 - 52942776
Alignment:
Q  126 ttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatag 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942537 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaccc-------------gtaaccaagagactcaatcctaatag 52942623  T
Q  226 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttat 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |    
T  52942624 tgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 52942723  T
Q  326 ttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgt--aatgtctatatttatag 377  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |  || ||||||||||||||    
T  52942724 ttcag-cccctctatctcaaagtttagtctgatatacaaggtctatatttatag 52942776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 163 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132871
Alignment:
Q  163 tcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 262  Q
    ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  263 ttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaa 362  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaaccctt-gttcagcctcctctatctcaatgtttacaccgatacaa 6132892  T
Q  363 tgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  6132891 tgtctatatttatagtaaaag 6132871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 385
Target Start/End: Original strand, 8756221 - 8756587
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||| |||||| ||||||   |||||||||||| ||||| | ||  ||| |||| ||||||| |||    
T  8756221 gagagaaagaaagagagaacacacaaaatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatga 8756320  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaacc-aagagactca 215  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |  ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  8756321 ttagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactca 8756420  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttct 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||   ||||    
T  8756421 atcctagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttg-acttct 8756516  T
Q  316 aaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  8756517 aaacccttgttttcagccccttctatctcaaggtttactctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 8756587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13547536 - 13547302
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa--tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  13547536 caaaagtagaaaagatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 13547437  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttca 198  Q
     | | ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  |||||||||     
T  13547436 ctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcc 13547337  T
Q  199 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547336 cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 53405472 - 53405123
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||   |  ||| |||||||||||||||| | || |||||| || |||    
T  53405472 aagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag--cagctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatc 53405375  T
Q  142 aatgggttacaagaataag------tctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 235  Q
    |||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| | |||  |  |  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  53405374 aatgggttacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaa 53405275  T
Q  236 ggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagcccc- 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||     
T  53405274 ggtgaatcaaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagcccct 53405176  T
Q  335 --ctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
       ||| |||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  53405175 ctatctctctcaaagtttagcctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 53405123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 38890177 - 38890472
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| | ||| |    
T  38890177 caaaattagaaaacagcgagaga-aaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagcc 38890275  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     |  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  38890276 ctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttc 38890375  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38890376 ccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatcaacc--ccaaccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 38890472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 220 - 383
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270321
Alignment:
Q  220 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  320 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | || |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  38270258 ccttgtttcagcctcttctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 38270321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 220 - 383
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446914
Alignment:
Q  220 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaacccta-----gttgttgcctttctaaac 24446850  T
Q  320 ctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24446851 ccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaatgtctatatttatagtaaaag 24446914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 30136931 - 30136640
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| | | ||||| | ||| |    
T  30136931 caaaagtagaaaacaacaagaga-aaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagcc 30136833  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    ||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  ||| |||||    
T  30136832 atctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgagtcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttc 30136733  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacc 293  Q
     ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30136732 tcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4215685 - 4215510
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  4215685 caaaagtagaaaactgcgagaga-aaagaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccat 4215587  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 177  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215586 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 4215510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 410
Target Start/End: Original strand, 15032554 - 15032898
Alignment:
Q  55 cctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttaca 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||   |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15032554 cctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttaca 15032653  T
Q  153 agaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||  || ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||     
T  15032654 agaataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaa-cctca- 15032751  T
Q  253 accctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttac 352  Q
             |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15032752 ---------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-acttctaaacccttgtttcagccccctttatctcaaggtttac 15032840  T
Q  353 actgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatct 410  Q
     ||| |   | |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| || ||||||    
T  15032841 tctggtaccaagtctatatttatagtaaaagtatccctcataaaattggaacaaatct 15032898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Original strand, 5635470 - 5635611
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  5635470 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 5635569  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5635570 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 5635611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28454067 - 28453782
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagaga--gaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |  ||    
T  28454067 caaaagtagaaaacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtag 28453968  T
Q  97 tcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctct 195  Q
    |  | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||   || |||||||    
T  28453967 ttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaagaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctct 28453868  T
Q  196 tcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactct 284  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28453867 tcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttcttgccaagag-caaactct 28453782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5101133 - 5100993
Alignment:
Q  245 accctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctca 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5101133 accctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgtttcagtcccctctatctca 5101034  T
Q  345 aggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  5101033 aggtttaccctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 5100993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12102425 - 12102221
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatca 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12102425 aatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatca 12102326  T
Q  143 atgggttacaagaataagtctcc-cgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
     ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||   | ||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102325 gtgggttacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 12102226  T
Q  242 tcaac 246  Q
    |||||    
T  12102225 tcaac 12102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11437701 - 11437561
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  11437701 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 11437603  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11437602 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa 11437561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 47150863 - 47151131
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaattt-gttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tga 116  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   ||  ||| ||||||| |||    
T  47150863 gagagaaagaaagagagaacacaagaaattagtttacccaattcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatga 47150962  T
Q  117 tgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactca 215  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||  |  |||||||||| || |||||||||||||    
T  47150963 tgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactca 47151062  T
Q  216 atcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  47151063 atcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttcaaccctagtgttggttaccaagag-caaactctata 47151131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5101267 - 5101133
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||    
T  5101267 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggg-agatagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatc 5101169  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattcta 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5101168 aatgggttacaagaataagtctcctgcctaagtcta 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2891427 - 2891314
Alignment:
Q  271 aagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactga-tgtaatgtctat 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  2891427 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatcttaaggtttacactgattacaatgtctat 2891328  T
Q  370 atttatagcaaaag 383  Q
    |||||||| |||||    
T  2891327 atttatagtaaaag 2891314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 47563141 - 47563009
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |    
T  47563141 caaaagtagaaaacagc--gagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagcc 47563044  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaa 133  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47563043 ctccgtttcactataagatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25358022 - 25357772
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca--agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | |||     
T  25358022 caaaagtagaaaacaac--gagagaaag-aagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagc 25357926  T
Q  98 cattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattc----tatccaaaaccctaat 191  Q
     || ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||||    ||||||||  || |||    
T  25357925 tatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaat 25357826  T
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25357825 ctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaa 25357772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10113080 - 10112876
Alignment:
Q  169 ctaattctatccaaaaccctaatctcttcac-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 267  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10113080 ctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaa-tctc-aaccctagtgtttgtt 10112983  T
Q  268 gccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgt 365  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||  ||||| | ||||||| ||||  ||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||  |||||    
T  10112982 gccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttg-gcttctaaacccttgttttcaactccctctctctcgaggtttacatctgatacaatgt 10112887  T
Q  366 ctatatttata 376  Q
    |||||||||||    
T  10112886 ctatatttata 10112876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9864092 - 9863795
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctggggg--agaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| | |||    
T  9864092 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcag 9863995  T
Q  97 tcattcgtttcactata----tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctatccaaaaccctaat 191  Q
       | |||| |||||||    ||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||| |   || ||||||| |||||  |  |||    
T  9863994 ctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctacccaaagtctcaat 9863896  T
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaa 291  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  9863895 ctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaaac--ccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaactc--tacaaa 9863801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 387
Target Start/End: Original strand, 40999017 - 40999286
Alignment:
Q  115 gatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact 213  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |   |||||||   |||||||||| |||||  |   |||||||| ||| |||||||||||    
T  40999017 gatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtctcgatctcttcccgtgaccaagagact 40999116  T
Q  214 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttg-cgtt 312  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||      
T  40999117 caatcctaataatgttttcctaggtgaatcaa-tctc-aatcctagtgtttgttgtcaagag-caaactctatacaacccctagttttcttgttgacg-- 40999211  T
Q  313 tctaaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaac 387  Q
    |||||| ||||  ||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  40999212 tctaaacccttgttttcag-actctctacctcaaggtttactctgatataaggtttatatttatagtaaaaataac 40999286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 276
Target Start/End: Original strand, 3982175 - 3982411
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatg 145  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||| | ||| | | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  3982175 ttgtttaccttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaag 3982274  T
Q  146 ggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctatccaaa-accctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 242  Q
     ||||||||||| |||| ||   | |||||||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3982275 tgttacaagaatcagtcttcaaacttaattctacccaaagtcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaat 3982374  T
Q  243 --caaccctc-aaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
       |||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3982375 aaaaacaatctcaaccctagtgtttgttgccaagaga 3982411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6133219 - 6133105
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  6133219 caaaagtagaaaacaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtc 6133120  T
Q  99 attcgtttcactata 113  Q
    || |||| |||||||    
T  6133119 atccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 14789379 - 14789470
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaag-gaagaga-gaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789379 caaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 14789470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16185787 - 16186018
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||  |||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  16185787 caaaagtagaaaacaacgagaaacaaaa-aagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagcc 16185885  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     |  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||   | ||||||||    
T  16185886 ctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaagggttgcaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctctt 16185984  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16185985 cccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 31983593 - 31983727
Alignment:
Q  113 atgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagaga 211  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||  |  ||||||||| | | |||||||||    
T  31983593 atgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccatgaccaagaga 31983692  T
Q  212 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 246  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31983693 cttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 31983727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49088921 - 49088791
Alignment:
Q  32 gagagaacgcaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctg-ggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttac 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||  |  ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49088921 gagagaacgcaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactatatgatgactaacattac 49088822  T
Q  130 aaaag-ggatatcaatgggttacaagaataa 159  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  49088821 aaaagaagatgtcaatgagttacaagaataa 49088791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10114519 - 10114435
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagag 275  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10114519 aatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag 10114435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 3937227 - 3937317
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaa 91  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3937227 caaaagtagaaaacaac--gagagaaagaaagagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggagaa 3937317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 24446608 - 24446754
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||             |||||| | ||| |    
T  24446608 caaaagtagaaaaca---agagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagcc 24446691  T
Q  99 attcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagt 161  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  24446692 ctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16455356 - 16455257
Alignment:
Q  312 ttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||||| | |||||  || | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  16455356 ttctaaacccttgtttcagccccctttatctctcggtttgctctgatacaaagcctatattaatagcaaaagtaactaccattaaattgtaacaaatctg 16455257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 52942437 - 52942527
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagag-aaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggg 87  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942437 caaaagtagaaaacaacagcgagaggaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggg 52942527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36380417 - 36380344
Alignment:
Q  338 tatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaattgtaaaaaatctg 411  Q
    ||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  36380417 tatctcaaggtttactctgatacaaagtccatatttatagtaaaagtaaccctcataaaattgtaacaaatctg 36380344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Original strand, 38208825 - 38208911
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagaga 276  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38208825 aatctcttcttgtgaccaaaagactcaatcttaatagtgtttctccaagatgaatcaatc-tcaa-ccctagtgtttgttgccaagaga 38208911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9022495 - 9022380
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctata 287  Q
    ||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||   || ||| ||    
T  9022495 aatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatccc--aaccatagtgtttgttgccaagag---aattctcta 9022401  T
Q  288 caaaccctagatttgttgttg 308  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  9022400 caaaccctagttttgatgttg 9022380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 10114680 - 10114608
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10114680 gagagaaagaaagagagaacacatgaaatttgtttacctaattcggtccaatactgacctagtctgggggaga 10114608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143305
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 5143305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269242
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggaga 5269242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 5336903 - 5336964
Alignment:
Q  168 cctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5336903 cctaattctacccaagtccc-aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 7050401 - 7050439
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050401 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11853587 - 11853549
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853587 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 12739550 - 12739592
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12739550 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 12739592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 410
Target Start/End: Original strand, 16186079 - 16186199
Alignment:
Q  289 aaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttc-agccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaac 387  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||  || || ||||||||||| ||||||| |    
T  16186079 aaaccctag-tttgttgttt-gtttctaaacccttgtttttagccccctctctctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttatagtaaaagtatc 16186176  T
Q  388 tcccataaaattgtaaaaaatct 410  Q
     | | |||||||| || ||||||    
T  16186177 cctcctaaaattggaacaaatct 16186199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 26175636 - 26175678
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26175636 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 26175678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 36463389 - 36463431
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36463389 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 36463431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 48893638 - 48893680
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48893638 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 48893680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55822303 - 55822265
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822303 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54906779 - 54906722
Alignment:
Q  189 aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatcaa 245  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54906779 aatctcttccagtgaccaagagactcaattctaatagtgtttctccatggtgaatcaa 54906722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16489388 - 16489352
Alignment:
Q  191 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 227  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16489388 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22295545 - 22295456
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaag-aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggaga 90  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||    
T  22295545 caaaggtagaaaacagc--gagagaaaggaagagagaacacatgaaatttgtttacccagttcagtccaatactgccctagtgtgggggaga 22295456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25699788 - 25699752
Alignment:
Q  191 tctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 227  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25699788 tctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 14335 - 14677
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |    
T  14335 caaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccct 14434  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| ||    
T  14435 ccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccg 14534  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14535 taaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttt 14634  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14635 tgttgttgtctttctaaaccattgtttcatccccctctatctc 14677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 14970
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcat 100  Q
    ||||||||||||||| || || | ||  ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| | |    
T  15352 caaaagtagaaaacaacatgataaaa--gaagagagaacacaagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagcctt 15255  T
Q  101 tcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacg 200  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||  ||    
T  15254 ccgttccactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccg 15155  T
Q  201 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  15154 taaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttt 15055  T
Q  301 tgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  15054 tgttgttgcctttctaaatcattgtttcagccccctctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 14970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 183635 - 183977
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  183635 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatc 183734  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183735 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc-cgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 183833  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  183834 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgtttcag-cccttctatc 183932  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  183933 tcaaagtttactctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 183977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52350 - 51960
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaag-gaagaga-gaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaa--cag 96  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  52350 caaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacacaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcag 52251  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  52250 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctctt 52151  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  52150 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaacccta 52051  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc--aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||   ||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  52050 gttttgttgttgccattctaaacccttgtttcagccccctctatctctcaaagtttagtatgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 51960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 50351 - 50260
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaag-gaagaga-gaacgcaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351 caaaagtagaaaacaactagagagaaaaagaagagaagaacacaagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggaga 50260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 79510 - 79144
Alignment:
Q  12 aacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcac 109  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||| |||    
T  79510 aacagcaagagaaaaag-aagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccac 79412  T
Q  110 tatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  |||||| |||||||||||    
T  79411 tatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaaga 79312  T
Q  210 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  79311 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 79212  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
     |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  79211 ctttctaaacccttgttttagccccctctatctcaagttttactctgattcaaggtctatatttatag 79144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4331 - 3948
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagaga-gaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagt 97  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||     
T  4331 caaaagtagaaaacagc--gagagaaatcaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggg-agagagcagc 4235  T
Q  98 cattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |   |||||    
T  4234 cctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttc 4135  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4134 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctag 4036  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  4035 ttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaagtttagtctgatacaaggtctatatttatagtaaaagta 3948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 386
Target Start/End: Original strand, 41477 - 41821
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  41477 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatc 41576  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577 aatgggttacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 41676  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41677 tcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 41776  T
Q  342 tcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
    || | |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  41777 tctaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 41821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Original strand, 69286 - 69632
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | || | |||||||||||||||||| ||||||| | || |||    
T  69286 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatc 69384  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69385 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 69484  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctcta-- 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||      
T  69485 tcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatc 69584  T
Q  340 --tctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
      |||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  69585 tctctcaaagtttgctctgatataaggtctatatttattgtaaaagta 69632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73318
Alignment:
Q  232 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagc 73306  T
Q  332 cccctctatctc 343  Q
    ||||||||||||    
T  73307 cccctctatctc 73318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 264
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73203
Alignment:
Q  221 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 80198 - 79812
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaa-ggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  80198 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcag 80099  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
     | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  80098 ccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaggaataagtctcctgcctaa-tctacccaaagccccaatctctt 80000  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc-aagagacaaactctatacaaaccct 295  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  79999 cccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccct 79900  T
Q  296 agatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    || ||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||| |||||    
T  79899 agttttattgttgtctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaggtttacactgatacaaaaactatatttatagtaaaag 79812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 188386 - 188424
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188386 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 11422 - 11810
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaa-gagagaaag-gaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacag 96  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11422 caaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcag 11521  T
Q  97 tcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctctt 196  Q
       | |  | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  11522 ctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 11621  T
Q  197 cacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaacccta 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  11622 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaacccta 11721  T
Q  297 gatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagta 385  Q
    | ||||||||||   ||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  11722 gttttgttgttgtcattctaaatccctgtttcagccccctctatctccaggtttactctgattcaaggtctatatttatagtaaaagta 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6490 - 6151
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  6490 aatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaat 6392  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6391 gggttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 6292  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6291 aacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 6192  T
Q  344 aaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    || |||| |  ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6191 aaagtttgctttgatacaaggtctatatttatagtaaaagt 6151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3168 - 2832
Alignment:
Q  47 tttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgg 146  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||    
T  3168 tttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgg 3070  T
Q  147 gttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3069 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaac 2970  T
Q  247 cctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaag 346  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  2969 ccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcagccccctctatctcaaa 2870  T
Q  347 gtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagt 384  Q
    |||| | |||||  ||  ||||||||||||| ||||||    
T  2869 gtttgctctgatacaagttctatatttatagtaaaagt 2832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 332 - 34
Alignment:
Q  45 aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaat 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | |  | |||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||    
T  332 aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaat 234  T
Q  145 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  233 gggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 134  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  133 aacccacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttcagccccctctatctc 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29462 - 29164
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | ||||||||||||||||   ||||||| | || |||||    
T  29462 gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaa 29364  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 243  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29363 tgagttacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatc 29264  T
Q  244 aaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctc 343  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  29263 aacccataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgtttcagccccctctatctc 29164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 85566 - 85184
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaa--gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  85566 caaaagtagaaaacaac--gagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtc 85469  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |  |||||||||    
T  85468 atccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgtctgattctactcaaagtcacaatctcttc 85369  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85368 tcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctag 85269  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
     ||||||||||  ||| |||| | || ||||  || | |||||||||||||||||  ||||  || | |||||||||||| |||||    
T  85268 ttttgttgttgtctttttaaatccttgtttc-tcctcttctatctcaaggtttactttgatacaaagcctatatttatagtaaaag 85184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 15774 - 16180
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | |||||    
T  15774 caaaagtagaaaacaac--gggagaaagaaagagataacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtc 15871  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  15872 ctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 15971  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  15972 ccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaa-cctc-aaccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctag 16068  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaactcccataaaa 397  Q
     ||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| | | ||||||     
T  16069 ttttcttgttg-acttctaaacccttatttcaaccccctctatcttaaggtttactctgatacaaaatctatatttatagtaaaagtatccctcataaat 16167  T
Q  398 ttgtaaaaaatct 410  Q
    ||| || ||||||    
T  16168 ttggaacaaatct 16180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Original strand, 1447 - 1671
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||||||||||||| | ||||||| | || |||    
T  1447 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatc 1545  T
Q  142 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 1645  T
Q  242 tcaaccctcaaaccctagtgtttgtt 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1646 tcaacccacaaaccctagtgtttgtt 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2272 - 2036
Alignment:
Q  105 ttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaac 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |  || ||| ||||||    
T  2272 ttcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaac 2173  T
Q  205 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgtt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2172 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactctgtacaaaccctagttttgtt 2074  T
Q  305 gttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatct 342  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  2073 gttgcctttctaaacccttgtttcagccccctatatct 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 16602 - 16975
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgca-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||| || | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |  |  |    
T  16602 caaaaatagaaaacaacgagaga-aaagaaagagaaaacacacaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaacc 16700  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     || ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |  |||||||||    
T  16701 ctttgtcccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttc 16800  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16801 ccgtcaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctag 16897  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttata 376  Q
     |||| |||||  |||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||    
T  16898 ttttg-tgttgtctttcaaacccttgttttcagcctcctctatctcaaggtttactctgatacaaggtttatatttata 16975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1958
Alignment:
Q  1 caaaagtagaaaacagcaagagagaaaggaagagagaacgcaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctagtctgggggagaaaacagtc 98  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  1594 caaaagtagaaaacaatgagaga-aaagaaagagagaacacacgaaatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagcc 1692  T
Q  99 attcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagggatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttc 197  Q
     | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  1693 ctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttc 1792  T
Q  198 acgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctag 297  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  1793 ccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatcaacc--acaaccctagtgtttgttg---------aaactctatacaaaccctag 1881  T
Q  298 atttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca-ctgatgtaatgtctatattta 374  Q
     ||| ||||||   ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  || |||||||||||    
T  1882 ttttcttgttg-acttctaaacccttgtttcagccacctctatctctaggtttacatctgatacaaggtctatattta 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35593
Alignment:
Q  156 ataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 255  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  256 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcgtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacact 355  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||| |  |||||  |||    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttcag-cgcctctatcacccggtttgtact 35621  T
Q  356 gatgtaatgtctatatttatagcaaaag 383  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35620 gatacaatgtctatatttatagtaaaag 35593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35912 - 35848
Alignment:
Q  20 gagagaaaggaagagagaacgcaaga--atttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct 82  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35912 gagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtct 35848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5089 - 4773
Alignment:
Q  60 ttcggtccaa-attgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagg-gatatcaatgggttacaagaa 156  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||  |  ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  5089 ttcggtccaatactgacctagtctggggcagagagcagttctatgttccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaa 4990  T
Q  157 taagtctcccgcctaattctatccaaaaccct-aatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||     
T  4989 taagtctcccgcctaattcta-ccaaaagcttcaatctcttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaacatgaatcaa-actc-aact 4893  T
Q  256 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttg-ttgcgtttctaaa-cctttatttcagccccctctatctcaaggtttaca 353  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  4892 ctagtgtttgttgctgagaga-aaacgctatataaaccctag-tttgttgcttac--ttctaaatcctttttttcagacccctctatctcaaggtttact 4797  T
Q  354 ctgatgtaatgtctatatttatag 377  Q
    |||||  || ||||||||||||||    
T  4796 ctgatacaaggtctatatttatag 4773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22407 - 22221
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  22407 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 22309  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22308 tgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24682 - 24496
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaaacagtcattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagggatatcaa 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | | || | |||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||    
T  24682 gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaa 24584  T
Q  144 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 231  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24583 tgagttacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 386
Target Start/End: Original strand, 993 - 1169
Alignment:
Q  215 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaa-----gagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgc 309  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||| | ||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  993 aatcctaaaagtatttcgcaaggtggatcaaccctccaaacgtagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgc 1092  T
Q  310 gtttctaaacctttatttcagccccctctatctcaaggtttacactgatgtaatgtctatatttatagcaaaagtaa 386  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  1093 ctttctaaacccttgtttcagccccttctatctcaaagtttgctctgatacaaggtctatatttatagtgaaagtaa 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 90
Target Start/End: Original strand, 4675 - 4721
Alignment:
Q  44 gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4675 gaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 4721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Original strand, 1445 - 1485
Alignment:
Q  42 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtct 82  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1445 aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 20415 - 20457
Alignment:
Q  48 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggaga 90  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20415 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggaga 20457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 224857 - 224819
Alignment:
Q  192 ctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 230  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224857 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University