View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1900_low_4 (Length: 535)

Name: NF1900_low_4
Description: NF1900
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1900_low_4
NF1900_low_4
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (17-520)||(4574554-4575057)
chr6 (16-520)||(4560751-4561253)
chr6 (11-520)||(4266549-4267058)
chr6 (11-520)||(4489738-4490247)
chr6 (16-520)||(4480938-4481442)
chr6 (11-517)||(3171981-3172487)
chr6 (17-466)||(4503834-4504283)
chr6 (11-520)||(4457834-4458344)
chr6 (11-520)||(4514504-4515013)
chr6 (11-520)||(4461363-4461872)
chr6 (11-520)||(4470043-4470552)
chr6 (11-520)||(4506097-4506606)
chr6 (11-510)||(4563951-4564453)
chr6 (18-451)||(4598418-4598851)
chr6 (18-451)||(4613170-4613603)
chr6 (11-510)||(4259547-4260046)
chr6 (16-427)||(4516566-4516977)
chr6 (18-451)||(4579679-4580112)
chr6 (21-429)||(4585886-4586294)
chr6 (51-510)||(4299214-4299673)
chr6 (23-510)||(4626203-4626690)
chr6 (16-382)||(4602034-4602400)
chr6 (16-400)||(4617267-4617651)
chr6 (18-521)||(4622389-4622890)
chr6 (21-520)||(4592481-4592983)
chr6 (11-388)||(4557365-4557742)
chr6 (11-388)||(4571212-4571589)
chr6 (11-429)||(4256098-4256503)
chr6 (17-276)||(4568302-4568561)
chr6 (24-162)||(4493208-4493346)
chr6 (34-145)||(4391885-4391996)
chr6 (347-387)||(4835531-4835571)
chr6 (482-520)||(4503768-4503806)
chr6 (355-427)||(4568628-4568700)
chr6 (456-520)||(4602477-4602541)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (11-520)||(24103239-24103748)
chr5 (11-249)||(27999753-27999991)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (11-520)||(20863226-20863735)
chr8 (11-520)||(1674466-1674979)
chr8 (11-388)||(16685782-16686159)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (11-520)||(1281354-1281866)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (19-510)||(3086668-3087159)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (18-510)||(4082-4571)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (11-511)||(3110-3611)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (18-145)||(3443-3569)
scaffold0475 (204-250)||(3162-3208)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (312-520)||(4-216)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (120-161)||(1351057-1351098)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 484; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 520
Target Start/End: Original strand, 4574554 - 4575057
Alignment:
Q  17 aaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574554 aaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttc 4574653  T
Q  117 aatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574654 aatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagat 4574753  T
Q  217 caggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574754 caggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatt 4574853  T
Q  317 tacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4574854 tacataaacaacagatcttggttcttttgattcaatccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgt 4574953  T
Q  417 ggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaag 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4574954 ggactttgatttacaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagggaacatagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattagaag 4575053  T
Q  517 tatt 520  Q
    ||||    
T  4575054 tatt 4575057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 4560751 - 4561253
Alignment:
Q  16 caaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggtt 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4560751 caaaaaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgatgggtggtt 4560850  T
Q  116 caatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaaga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560851 caatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaa-tcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaaga 4560949  T
Q  216 tcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaat 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4560950 tcaggcctaatgatccataaaaatggtttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaag-gcttctcttgagacttaacagtgatgctgccaaaat 4561048  T
Q  316 ttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttg 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4561049 ttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattacagtctaaagatgtcaagtgattttg 4561148  T
Q  416 tggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaa 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4561149 tggactttgatttacaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagggaacatagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattagaa 4561248  T
Q  516 gtatt 520  Q
    |||||    
T  4561249 gtatt 4561253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4267058 - 4266549
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  4267058 atcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaaggg 4266959  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  4266958 tggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttaaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatga 4266859  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  4266858 caagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctgttggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctacc 4266759  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |    
T  4266758 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtga 4266659  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4266658 ttttgtggactttgatttaaaaaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcataacatcactctcaagttcat 4266559  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
      ||||||||    
T  4266558 atgaagtatt 4266549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4490247 - 4489738
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  4490247 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatactctccatgattgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggg 4490148  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||| |    
T  4490147 tgattcaataccttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgacaacacctgtgagccaccaataa 4490048  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4490047 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaatagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 4489948  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4489947 aaaatttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatttcaagtga 4489848  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    |||| |||| |||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||   | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4489847 ttttctggaatttgatctaaaaaagaagaaaatgggccaattgtgtatacagaagggaatatagaactaagagcattgatagcatcactctcaagttcat 4489748  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
    | ||||||||    
T  4489747 tagaagtatt 4489738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Original strand, 4480938 - 4481442
Alignment:
Q  16 caaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggtt 115  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  4480938 caaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatacactttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccgattgaagggtggtt 4481037  T
Q  116 caatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaaga 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  4481038 caaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatttgaaatttctttcaaatactcagatgacaacaccactgagccaccaatgacaaga 4481137  T
Q  216 tcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaat 315  Q
    | || |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4481138 ttagacctaataatccacaaaaagttttttttgctattggcaaaaccccaagcaaactctaagagtttctcttgagacataattgtgatgctgccaaaat 4481237  T
Q  316 ttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttg 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| || |||    
T  4481238 ttacataaacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaatgtttccaagtgatattg 4481337  T
Q  416 tggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaa 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4481338 tggactttgatttaaaaaagaagccaatggaccaatggtgtatagagaagggaatatagaatagagagaattcataacatcactctcaagttcataagaa 4481437  T
Q  516 gtatt 520  Q
    |||||    
T  4481438 gtatt 4481442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 517
Target Start/End: Original strand, 3171981 - 3172487
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |     
T  3171981 atcagcaaaaaatggcctacacaacattggcattccagcacatacactttccgtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaatccgccaattgaagga 3172080  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3172081 tggttcaacactttctcttgcggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatga 3172180  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3172181 caagatcaggcctaataatccacaaaaagggtttcttgctgttggctaaaccccaagcaaactctaataatttctcttgagacataactatgatgctgcc 3172280  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3172281 aaaatttacataaacaacagattttgattcttttgtttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagaatctaaagatgccaagtga 3172380  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||||   | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3172381 ttttgcggactttgacttaaaaacgaagcgaacggaccaattgtgtatagagaagggaatatagaactaagagtattcataacatcactctcaagttcat 3172480  T
Q  511 tcgaagt 517  Q
    | |||||    
T  3172481 tagaagt 3172487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4504283 - 4503834
Alignment:
Q  17 aaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4504283 aaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacaaacactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggttc 4504184  T
Q  117 aatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagat 216  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||    
T  4504183 aacactttatcttgtggacaccaacttgctacaagtcctctattagaagtttcattcacaaaatcagatgacaacacctctgagccaccaataacaagat 4504084  T
Q  217 caggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatt 316  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  || |||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  4504083 caggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttatcttaagacataactgtaatgctgccaaaatt 4503984  T
Q  317 tacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgt 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503983 tacataaacaacagatcctggttcttttaattcaagccaatcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgt 4503884  T
Q  417 ggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagg 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503883 ggactttgatttacaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaagg 4503834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 4457834 - 4458344
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  4457834 atcaccaaagaatggccaacgcagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagtttcatccacaatgagtcaagaatcctccgattgaaggg 4457933  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4457934 tggttcaacactttatcttgtggacaccaacttgctattaagcctctatcagaagtttcattcacaaaatccgatgacaaaacaaccgagccaccaatga 4458033  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttt-ttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgc 309  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  4458034 caagatcaggcctagttatccacaaaaaaggttttcttgctgttggccaaaacccaagcaaattctaagagcttctcttgagacataactgtgatgcttc 4458133  T
Q  310 caaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtc 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| |||||     
T  4458134 caaaatttacataaataacagactttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatattctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtg 4458233  T
Q  410 attttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttca 509  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4458234 attttgtggactttgatttataaaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagtattcataacatcactctcaagttca 4458333  T
Q  510 ttcgaagtatt 520  Q
    |  ||||||||    
T  4458334 taagaagtatt 4458344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4515013 - 4514504
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    
T  4515013 atcaccaaagaattgccaacaaagcattggcactccagcgcatatgctctcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaaggg 4514914  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  4514913 tggttcaaaactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcattcacaaactcagacgacaaaaccactgagccaccaatga 4514814  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||  |||||||||  |||||||| ||    
T  4514813 caagatcaggcctaatgatccataaaaaggttttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaacaatttctccggagacataatcgtgatgctacc 4514714  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| |    
T  4514713 aaaattaacataaacaacagatcctgattcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtga 4514614  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4514613 ttttgtggactttgattcaaaaacgaagcaaatgggccaatggtgtatagagaagggagcatagaataaagagcattcataacatcactctcaagatcat 4514514  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
    | ||||||||    
T  4514513 tagaagtatt 4514504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 4461363 - 4461872
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  4461363 atcaccaaagaatggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggg 4461462  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||  | |||||| |||||||    
T  4461463 tggttcagtacttgctcttgcggacaccagcttgctattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatga 4461562  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |  ||  ||| |||||| |||||||||||    
T  4461563 caagatcaggcctaatgatccataaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagttgatcaggagtcataactgtgatgctgcc 4461662  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || || |    
T  4461663 aaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaggtga 4461762  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||   ||||||||| |||||| || |||||||    
T  4461763 ttttgtggactttgatttataaaagaagaaagtggaccaatggtgtatagagaagggaatataaaatagagttcattcataatatcactttcgagttcat 4461862  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
    | ||||||||    
T  4461863 tagaagtatt 4461872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 4470043 - 4470552
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4470043 atcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaaggg 4470142  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  |  | ||||| ||||||||||||||| | || | ||  || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4470143 tggttcagtacttgctcttgaggacaccagttcacgattaggcctctatctgaaattccatttacaatctctgatgagaaaactaccgagccgccaatga 4470242  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  4470243 caagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgccaaaccccaagcaaactctaacagtttctctggagacataactgtgacgctgcc 4470342  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||  |  | |    
T  4470343 gaaatttacatagacaacagatcctggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattgaaatttaaagatgctagatga 4470442  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4470443 ttttgtggactttgatttaaaaaagaagaaagtggaccaatggcgtatagagaagggaatatagaatagagttcattcataacatcactttcaagttcat 4470542  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
    | ||||||||    
T  4470543 tagaagtatt 4470552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 4506097 - 4506606
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| || |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  4506097 atcaccaaagaacggccaacacagcattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaaggg 4506196  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    || || || ||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||   ||| || || || |||||||| ||||||||||| |    
T  4506197 tgatttaacactttctcttgtgaacaccagcttgctataaggcttctatctgaaatttcatttgcaaactctgaagacaaaaccactgagccaccaatta 4506296  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||  |||||||||  |||||||| ||    
T  4506297 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaaaaatttctccggagacataattgtgatgcttcc 4506396  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || | |    
T  4506397 aaaattcacataaacaacagaagccggttcttttgattccagccattcgagacatttagtatcctctttccaaagatttgaatctaaagttgcaaactga 4506496  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4506497 ttttgtggactttgatttacaaatgaagttaaagggccaatagtgtatagagaaggaaacataatatcaagagcattcagaacattactctcaagttcat 4506596  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
    | ||||||||    
T  4506597 tagaagtatt 4506606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 510
Target Start/End: Original strand, 4563951 - 4564453
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    
T  4563951 atcaccaaagaatggccaacacaacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccgccaattgaaggg 4564050  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4564051 tggttcaatactttctcctgtggacaccaacttgcaattaagcctctatctgaaatttcattcacaaactcagatgacaaaacgactgagccaccaatga 4564150  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |  || |  | | | | |||||| || ||||| ||    
T  4564151 caaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttattgcaattggccaacccccaagcaaattccaacagttgttttggtgtcataactgtaatgcttcc 4564250  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  |||||||   ||| | |    
T  4564251 aaaattcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacacttagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagaatccaattga 4564350  T
Q  411 t---tttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagtt 507  Q
    |   |||||||| |||| ||||  || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||| || |||||||||| |||||    
T  4564351 tgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcatttattacatcactctaaagtt 4564450  T
Q  508 cat 510  Q
    |||    
T  4564451 cat 4564453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 451
Target Start/End: Original strand, 4598418 - 4598851
Alignment:
Q  18 aaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttca 117  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||| |    
T  4598418 aaaaagggacaacacaacattggcactccggcacatatactttcagtggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggttta 4598517  T
Q  118 atactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatc 217  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4598518 atacttgctcttgcagacaccagcttgcaactaagcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaaccgagccaccaatgacaagatc 4598617  T
Q  218 aggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||  || ||| || || ||||| ||||||||     
T  4598618 aggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaagtctaacaacttttctgcagtcatcaccgttatgctcccaaaattc 4598717  T
Q  318 acataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtg 417  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| |  ||||||     
T  4598718 acataaacaacagaccttggttcattggattcaagccagtcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacctaaagatgccaaatgcttttgtt 4598817  T
Q  418 gactttgatttagaaaagaagctaatggaccaat 451  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||    
T  4598818 gactttgatttaaaaacgaagataaagggccaat 4598851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4613603 - 4613170
Alignment:
Q  18 aaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttca 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |    
T  4613603 aaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccaattgaagggtggttta 4613504  T
Q  118 atactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatc 217  Q
    |||||| |||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4613503 atacttgctcttgaggacaccagctcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactctgatgacaaaacaactgagccgccaatgacaagatc 4613404  T
Q  218 aggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  || || |||  || |||||| || ||||| ||||||||     
T  4613403 aggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctattcgccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataacggtcatgctcccaaaattc 4613304  T
Q  318 acataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtg 417  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    ||||  || ||||| ||||||||    
T  4613303 acataaacaacggacttcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttctttccaaagattggtacttaaacttgccaagtgattttgtg 4613204  T
Q  418 gactttgatttagaaaagaagctaatggaccaat 451  Q
    |||||||| ||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  4613203 gactttgacttaaaagtgaagataaaggaccaat 4613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4260046 - 4259547
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  4260046 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggaacttcggcacaaatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagttaagaatccaccaactgaagag 4259947  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  ||  ||| |||||||| ||||  |  ||||||||||| |    
T  4259946 tggttcagtacttgctcttgcggacaccagctcgcgattaggcctctatccgaaatttcactctcaaactcagatgacaaaataaaggagccaccaataa 4259847  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |  ||| ||| |||||| || ||||||||    
T  4259846 tgaggtcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaaaaattgatctggagtcataactgtaatgctgcc 4259747  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||| || |||||||||||    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||| || || |    
T  4259746 aaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttaaattcaagccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaacgatgccaggtga 4259647  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    || |||||| |||||||||  || |||| ||| || ||||| |  |||| |||||| |||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4259646 ttatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaatagcatataaagaagggaacatagaatagagcacattcattacatcactctcaagttcat 4259547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 427
Target Start/End: Original strand, 4516566 - 4516977
Alignment:
Q  16 caaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggtt 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||||    
T  4516566 caaaaaaaggccaacacaacattggtactccggcacagatgctttccattgtggagttccatccacaatgagtcaagaatcctccaactgaaggatggtt 4516665  T
Q  116 caatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaaga 215  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  4516666 caacactttctcttgcggacaccagcttgctattacgcctctatccgaagtttcattcacaaaatcggatgacaaaataaccgagccaccaatgacaagg 4516765  T
Q  216 tcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaat 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |  ||| ||| ||| || |||||||| |||||||    
T  4516766 tcaggcctaataatccacaaaaaaggtttcttgctgttggccaaaccccaagcgaactctaacagttgatctggagtcatgaccgtgatgcttccaaaat 4516865  T
Q  316 ttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttg 415  Q
    | |||||||| ||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||| ||||||    
T  4516866 tcacataaactacagaaccttgttccttagattcaagccattcaagacatttcatatcttctttccaaagattagaacctatagaagccaagttattttg 4516965  T
Q  416 tggactttgatt 427  Q
     |||||||||||    
T  4516966 cggactttgatt 4516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 451
Target Start/End: Original strand, 4579679 - 4580112
Alignment:
Q  18 aaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttca 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  4579679 aaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtgattgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttca 4579778  T
Q  118 atactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatc 217  Q
     ||||| |||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||  | ||||| || |||||||||||    
T  4579779 gtacttgctcttgcggacaccagctcgttattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacagctgagccgccgatgacaagatc 4579878  T
Q  218 aggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattt 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || || |||  || |||||| || | ||| ||||||||     
T  4579879 gggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgcagtcataactgtcaagctcccaaaattc 4579978  T
Q  318 acataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtg 417  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||| |  |||| ||    
T  4579979 acataaacaacagacctaggttccttggattcaagccaataaagacacttggtatcttctttccaaaaattggtgcttaaagatgtcaaatggttttctg 4580078  T
Q  418 gactttgatttagaaaagaagctaatggaccaat 451  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||    
T  4580079 gactttgatttaaaaacgaagataaagggccaat 4580112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 429
Target Start/End: Original strand, 4585886 - 4586294
Alignment:
Q  21 aatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaata 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  4585886 aatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcaata 4585985  T
Q  121 ctttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcagg 220  Q
    ||| |||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  4585986 cttgctcttgcgggcaccaacccgcgattaggcctctatctgaaatttcattcttaaactcagatgacaaaaccaaggaaccaccaatgacaagatcagg 4586085  T
Q  221 cctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttaca 320  Q
     ||||||||||| |||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||  || |||||| ||  |||| |||||||| |||    
T  4586086 tctaatgatccataaaaaatgttgcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgtagtcataactgttgtgctcccaaaattcaca 4586185  T
Q  321 taaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggac 420  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    ||||||||  ||||  ||||||||||    
T  4586186 taaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttggtatcctctttccaaagatttgtacttaaagatgctaagtggttttgtggac 4586285  T
Q  421 tttgattta 429  Q
    |||||||||    
T  4586286 tttgattta 4586294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4299673 - 4299214
Alignment:
Q  51 catatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctatta 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||  |||    
T  4299673 catatgctttcaatggttgagttccatccacagtgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttcagtacttgttcttgtggacactagcttgcggtta 4299574  T
Q  151 gtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgct 250  Q
    | ||||||| ||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  | | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||     
T  4299573 ggcctctatttgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacaagccgccaatgacaaggtctggcctaatgatccacaaaaatggtttcctgca 4299474  T
Q  251 gttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattca 350  Q
     ||||||||||||||||||| |||||  || | |||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||  || || || ||||||    
T  4299473 attggccaaaccccaagcaatctctaacagttgctctggagtcataactgtaacgctgccaaaattcacataaacaaccgatcccggctccttggattca 4299374  T
Q  351 agccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaa 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||  || |||| ||| || ||||    
T  4299373 agccattcaagacatttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagattccaagtgattatgtggagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaa 4299274  T
Q  451 ttgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    | || |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4299273 tagtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcattacatcactctcaagttcat 4299214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 510
Target Start/End: Original strand, 4626203 - 4626690
Alignment:
Q  23 tggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatact 122  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||| ||||    
T  4626203 tggccaacacagcattggaactccagcgcatatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaattgaaggatggttcagtact 4626302  T
Q  123 ttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcaggcc 222  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || |||||  |||  |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626303 ttctcttgcggacaccagcttgcgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcggatgacgaaataaatgagccaccaatcacaagatcaggcc 4626402  T
Q  223 taatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttacata 322  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||| ||||||  | | ||||||||| || |||||    
T  4626403 taatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaacagtttctgtggagtcataactataacgctgccaaagttcacata 4626502  T
Q  323 aacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactt 422  Q
    |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  4626503 aacaacagactttggttccttgaattcaagccattcaagacaattggtgtcttctttccaaagattggaacctaaagatatcaactggttttgtggactt 4626602  T
Q  423 tgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
     |||| | || ||||   || || ||||| || |||| |||| | |||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4626603 cgattcaaaagagaatgcaaaggtccaatggtatatacagaaaggaacgtagaatagagcgcattcattacatcaccctcaagttcat 4626690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 382
Target Start/End: Original strand, 4602034 - 4602400
Alignment:
Q  16 caaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggtt 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  4602034 caaaaaaaggccaacacaacatcggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccgccgatcgaagggtggtt 4602133  T
Q  116 caatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaaga 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4602134 caacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcatttgtaaactcagatgacaaaatcactgagccaccaatgacaaga 4602233  T
Q  216 tcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||  |  |  |   | | |||||| || |||||||||||||    
T  4602234 tcaggcctaatgatccacaaaaatggtttatggcaattggccaaaccccaagcgaattctaataattgatggggtgtcataactgtaatgctgccaaaat 4602333  T
Q  316 ttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttcca 382  Q
    | ||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4602334 tcacataaacaacggatcccggctccttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttcca 4602400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 400
Target Start/End: Original strand, 4617267 - 4617651
Alignment:
Q  16 caaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggtt 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  4617267 caaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatactttcagtggttgaattccatccgcaatgagtcaagaatcctccgattgaagggtggtt 4617366  T
Q  116 caatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaaga 215  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4617367 caacactttgtcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgcaatttcatttgtaaactcagatgagaaaatcactgagccaccaatgacaaga 4617466  T
Q  216 tcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaat 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |  |  | |||  | | |||||| || |||||||| ||||    
T  4617467 tcaggccttatgatccacaaaaatgatttcttgcaattggccaaaccccaagcaaattccagtaattgctcgggtgtcataactgtaatgctgccgaaat 4617566  T
Q  316 ttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaaga 400  Q
    | ||||||||||| ||||  || || || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4617567 tcacataaacaactgatcccggctccttggattcaagccaatcaagacactctgtatcttctttccaaaggttggaatctaaaga 4617651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 521
Target Start/End: Original strand, 4622389 - 4622890
Alignment:
Q  18 aaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttca 117  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || | ||||||| |    
T  4622389 aaaaatggccaacacagcattgaaactccagcacatatgctttcggtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgcagggtggttaa 4622488  T
Q  118 atactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatc 217  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  | |||||| || |||||||| ||    
T  4622489 gtacttcctcttgtggacaccaacctgcgattaggcctctacctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgcccatgacaaggtc 4622588  T
Q  218 aggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||| ||| || || ||||||||||||||     
T  4622589 aggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctatcagccaaaccccaagcaaactctaatagttgatctcgagtcatcactgtaatgctgccaaaattc 4622688  T
Q  318 acataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtg 417  Q
    || ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  4622689 acgtaaacaagag-tc-aggttccttggattcaagccactcaagacacttgatatcttctttccaaagattggaacctagagatgccaagtgattatgtg 4622786  T
Q  418 gactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagt 517  Q
    || |||||||||  || |||| ||| || ||||  || || | ||| || ||||  |||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||    
T  4622787 gagtttgatttaataatgaaggtaaaggtccaacggtatacaaagatgggaacattgaatagagcgcattcatcgcatcagtctcaagttcattataagt 4622886  T
Q  518 atta 521  Q
    ||||    
T  4622887 atta 4622890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 4592481 - 4592983
Alignment:
Q  21 aatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaata 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  4592481 aatggccaacacaacattggaattccagcacatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggtttaata 4592580  T
Q  121 ctttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatcagg 220  Q
    ||| |||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  4592581 cttgctcttgaggacaccagctcgcgattacgcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaattgtgccaccaatgacaagatcagg 4592680  T
Q  221 cctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaatttaca 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||  |  |||||| || | |||||| ||||| |||    
T  4592681 cctaatgatccacaaaaaaggtttattgcaattggccaaaccccaagcaaactctaacattttctcttcattcataactgtaaggctgccgaaattcaca 4592780  T
Q  321 taaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat---tttgtg 417  Q
    |||||||| || |  | ||| || ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |  || ||  | |||||   ||| | ||   ||||||    
T  4592781 taaacaacggaacccgattccttcgattcaagccatttaagacactcagtatcttctttccatatgttggaaccaaaagaatccaattgatggatttgtg 4592880  T
Q  418 gactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagt 517  Q
    || |||| ||||  || |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||||| |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||    
T  4592881 gagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacatagaggagagagcatttattacatcactctcaagttcattgaaagt 4592980  T
Q  518 att 520  Q
    |||    
T  4592981 att 4592983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Original strand, 4557365 - 4557742
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |     
T  4557365 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcagatatgctttcagtggttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagga 4557464  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  4557465 tggtttaatacttgctcttgcgggcaccagcccgcgattaggcctctatctgaaatttcattgacaaactccgatgacaaaacaactgagccaccgatga 4557564  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || || |||   | |||||| || ||||| ||    
T  4557565 caagatcgggcctaatgatccacaaaaagggttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgccgtcataactgtcatgctccc 4557664  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagatt 388  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4557665 aaaattcacataaacaacggacctcggttccttggattcaagccaaccaagacacttgttatcttctttccaaagatt 4557742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Original strand, 4571212 - 4571589
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||| |     
T  4571212 atcagcaaaaaatggctaacacaacattggaactccagtagatatgctttcggtcgttgagttccatccacagtgagtcaagaaaccaccaattgaagga 4571311  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4571312 tggttcaatactttctcttgcgagcaccaaccagcaattaggcctctatctgaaatttcattcacaaactccgatgacaaaacaactgagccaccaatga 4571411  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| || || |||||||| ||||||||||  || || |||  || |||||| ||  |||| ||    
T  4571412 caagatcgggcctaatgatccacaaaaagagttgcttgctatttgctaaaccccatgcaaactctaacagtttttctgaagtcataactgtcctgctccc 4571511  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagatt 388  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4571512 aaaattcacataaacaacggacctcggttcctttgattcaagccaatcaagacacttgttatcttctttccaaagatt 4571589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4256503 - 4256098
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  4256503 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccggcacaaatgctttcaatggttgagttccatcctcaatgagtcaagaatccaccaactgaagag 4256404  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| |             ||||||| ||||  |  |||||||||||||    
T  4256403 tggttcagtacttgctcttgcggacaccaactctcgattagtcctctatccgaaact-------------cagatgacaaaataaaggagccaccaatga 4256317  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |  ||| ||| |||||| || ||||||||    
T  4256316 cgaggtcaggcctaatgatacacaaaaatggtttcttgctattggccaatccccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgctgcc 4256217  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||| || |||||||||||    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| |    
T  4256216 aaaattcacgtaaacaacagactcaggttccttggattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaacgatgccaagtga 4256117  T
Q  411 ttttgtggactttgattta 429  Q
     | |||||| |||||||||    
T  4256116 ctatgtggagtttgattta 4256098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 4568302 - 4568561
Alignment:
Q  17 aaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttc 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  4568302 aaaaaaaggccaacataacattggtactctggcacaaatgctttccaatgtggagttccatccacaatgagtcaagaatcgtccaactgaagggtggttc 4568401  T
Q  117 aatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagat 216  Q
    || |||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || | |||| ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| |    
T  4568402 aacacttgctcttgcggacaccagcttgctatttggcctctatccgaagttccattcacaaactcggatgacaaaataactgagccaccaatgacaagct 4568501  T
Q  217 caggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactcta 276  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  4568502 aaggcctaatgatccacaaaaaaggtttcttgctgttggcaaaacctcaagagaactcta 4568561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Original strand, 4493208 - 4493346
Alignment:
Q  24 ggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactt 123  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||  | ||    
T  4493208 ggccaacacaacattggcactccggcacatatgtttttggtagttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaatcgaatggtggttcagcagtt 4493307  T
Q  124 tctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctg 162  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4493308 tctcttgtggacaccaactagcaattaggcctctatctg 4493346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4391996 - 4391885
Alignment:
Q  34 acattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaatactttctcttgtgg 133  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||  | | || ||||||||||||||| |||||  ||    
T  4391996 acattggaactctagaacaaatgctttcaatgggtgagtttcatccacaatgcgttaagaatccacaaattcaagggtggttcaatacttgctctttcgg 4391897  T
Q  134 acaccaacttgc 145  Q
    |||||| |||||    
T  4391896 acaccatcttgc 4391885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4835571 - 4835531
Alignment:
Q  347 ttcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagat 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4835571 ttcaagccattcaagacattttgtatcttccttccaaagat 4835531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 482 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 4503806 - 4503768
Alignment:
Q  482 agcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 520  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4503806 agcattcatagcatcactctcaagttcattagaagtatt 4503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 4568628 - 4568700
Alignment:
Q  355 attcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtggactttgatt 427  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||    
T  4568628 attcaagacatttcatatcttctttccaaagattggaacctaaagaagccaagtgcttttggggattttgatt 4568700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 456 - 520
Target Start/End: Original strand, 4602477 - 4602541
Alignment:
Q  456 tatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcattcgaagtatt 520  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4602477 tataaagaagggaacatagaatatagtgcattcattacatcactctcaagttcattgtaagtatt 4602541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 24103239 - 24103748
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  24103239 atcaccaaagaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaatcgaaggg 24103338  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  24103339 tggtttaacactttatcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaacttctttaaaaaaatcagatgacaaaacaactgagcccccaatga 24103438  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24103439 caagatcaggcctaattatccacaaaaaagggttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaagagcttctctcgtgacataactgtgatgctacc 24103538  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |    
T  24103539 aaaatttacataaacaactgatcttggttcttttgattcaagccactcaagacatttagtatcttctttccaaagattggaatttaaagatgccaagtga 24103638  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24103639 ttttgtggactttgatttaaaaaagaagcaaatgggccaatggtgtatatagaagggaacatagagtagagagcattcataacatcactctcaagttcat 24103738  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
      ||||||||    
T  24103739 atgaagtatt 24103748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27999991 - 27999753
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||    
T  27999991 atcagcaaaaaatgaccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcggtggttgagttccatccgcagtgagtcaagaacccgctgattgaaggg 27999892  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27999891 tggttcaaaactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcctaaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatga 27999792  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgc 249  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  27999791 caagattaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgc 27999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20863735 - 20863226
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | |||| |     
T  20863735 atcagcaaaaaatggccagcacaacattggcactccagcacatatgctctcaatggttgagttccatccacaatgagttagaaatccaccaattgaagga 20863636  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20863635 tggttcaacaccttctcttgtggacaccaactcgcgattaggcctctatctgaaatttcattcacaaacgcagatgaaaaaatcaccgagccaccaatga 20863536  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  || |||  |||||| || ||| | |||||    
T  20863535 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggtttcttgctgttggccaaaccccatgcaaactctaacaatttttctacagacatgactgtggtactgcc 20863436  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
    |||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||| | ||||| |    
T  20863435 aaaatttacatatacaatagatcccggttctttcgattcaagccatgcaagacattcagtgtcttctttccaaagacttgaatctaaagacgccaagtga 20863336  T
Q  411 ttttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| | || || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20863335 ttctgtggactttgatttaaaaaagaaacaaaagggccaatggtgtatagagaagggaacatagaatagagaacattcataacatcactctcaagctcat 20863236  T
Q  511 tcgaagtatt 520  Q
    |  |||||||    
T  20863235 tgaaagtatt 20863226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 1674466 - 1674979
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||    
T  1674466 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcgcatatgctttcagtggttgagttccatccgcagtgtgtcaagaatccgccgattgaaggg 1674565  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1674566 tggttcaacactttctcttgtggacaccaatttgatattaggcctctatctgaaatttctttcataaactcagatgacaaaaccactgagccaccaatga 1674665  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |  || |  ||| ||| ||||||| | ||||| ||    
T  1674666 caagatcaggcctagtgatccacaaaaaaggtttcttgcaatcggccaaaccccaagcaaactccaatagttgatctggagtcataacaataatgctacc 1674765  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
     ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  ||||||||   || | |    
T  1674766 gaaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattga 1674865  T
Q  411 t---tttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaata-gaaagcattcataacatcactctcaagt 506  Q
    |   |||||||| |||| ||||  || |||| ||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||  | || |||  | || |||||||||||||||    
T  1674866 tgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacaaagaggaggagagcggttattacatcactctcaagt 1674965  T
Q  507 tcattcgaagtatt 520  Q
    |||||  |||||||    
T  1674966 tcattgaaagtatt 1674979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16686159 - 16685782
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |     
T  16686159 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggaactccagcatatatactttcagtggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccgattgaagga 16686060  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| || || | |||||    
T  16686059 tggtttaatacttgctcttgcgggcaccagctcgcgattaggcttctatctgagatttcattcttaaactcagatgacaaaaccacggaaccgcaaatga 16685960  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||  |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  || || |||  || |||||| || ||||| ||    
T  16685959 caagatcagacctaatgatccattgaaaatgttgcttgctattggtcaaaccccaagcaaactctaatagtttttctgcagtcataactgtcatgctccc 16685860  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagatt 388  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  16685859 aaaattcacataaacaacggaactcggttccttggattcaagccaatcaagacacttggtatcttatttccaaagatt 16685782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 520
Target Start/End: Original strand, 1281354 - 1281866
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1281354 atcagcaaaaaatggccaacacaacattggcactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgattgaaggg 1281453  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  1281454 tggttcaacactttctcttgtggacaccaacttgctattaggcctctatctgaaatttcattcgcaaagtcagatgacaaaatcactgagccgccaatga 1281553  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||    || | |||| ||| |||||| || ||||| ||    
T  1281554 caagatcaggcctagtgatccacaaaaatggtttcttgctattagccagaccccaagcaaattcctgaagttgctctggagtcataactgtaatgcttcc 1281653  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtca 410  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||| || || ||||||||   ||| | |    
T  1281654 gaaattcacataaacaacagatctcggttccttcgattcaagccattgaagacactcgatatcttctttccaaaggttggaatctaaagaatccaattga 1281753  T
Q  411 t---tttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagtt 507  Q
    |   |||||||| |||| ||||  || |||| ||| || ||||| | ||| | ||||||||  | |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  1281754 tgaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatcgggtaaacagaaggaattatagaggagagagcatttattacatcactctcaagtt 1281853  T
Q  508 cattcgaagtatt 520  Q
    ||||  |||||||    
T  1281854 cattgaaagtatt 1281866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 510
Target Start/End: Original strand, 3086668 - 3087159
Alignment:
Q  19 aaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttcaa 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  3086668 aaaatggccaacacaacattggcactccagcaagtacgctttcaaccgttgagttccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtgattcaa 3086767  T
Q  119 tactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatca 218  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||  |  ||||| |||||||||||||||    
T  3086768 tacttgctcttgcggacaccagcttgcgattagacctctatctgaaatttctttctcaaactcagatgacataataaaggagccgccaatgacaagatca 3086867  T
Q  219 ggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattta 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||| |||||| || |||||||||||| | |    
T  3086868 ggcctaatgatccacaaaaatggtttcttgctattggccaaaccccaagcaaactctaatagttgctcttgagtcataactgtaatgctgccaaaactca 3086967  T
Q  319 cataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtgg 418  Q
    |||||||||||||     || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||| ||||     
T  3086968 cataaacaacagactcaagtccctttgattcaagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagatgccaagtgattatgtga 3087067  T
Q  419 actttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    | |||||||||| |  |||| |||||| ||||| || ||||  ||||| |||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3087068 agtttgatttagtagtgaaggtaatggtccaatggtatataatgaagggaacacagaatatagcgcattcattacatcactctcaagttcat 3087159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4571 - 4082
Alignment:
Q  18 aaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttca 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  4571 aaaaatggccaacacaacattggcactcctacacatatgctttcaatggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccaattgaagggtggttca 4472  T
Q  118 atactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatgacaagatc 217  Q
     ||||| ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| ||    
T  4471 gtacttgctcttgtggacaccagctcgcaattaggcctctatctgaaatttcattctcaaactcagatgacaaaataaacgagccgccaatgacaaggtc 4372  T
Q  218 aggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgccaaaattt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||| |||| |||||||||||||||  || |  ||| ||| |||||| || ||||| ||||||||     
T  4371 aggcctaatgatccacaaaaaggatttcttacaattggtcaaaacccaagcaaactctaacagttgatctggagtcataactgtaatgcttccaaaattc 4272  T
Q  318 acataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcattttgtg 417  Q
    ||||||||||| ||    ||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    ||| ||| ||||    
T  4271 acataaacaaccgactcaggttccttggatgcaagccactcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaagat---tagtgattatgtg 4175  T
Q  418 gactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttcat 510  Q
    || |||||||||  || |||| ||| || ||||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  4174 gagtttgatttaataatgaagttaaaggtccaatggtatataaagaagggaacatagaatagagagcattcaatacaccgctctcaagttcat 4082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3110
Alignment:
Q  11 atcatcaaaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaagg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  3611 atcaccaaagaatggccaacaaagcattggtactccagcgcatatgctttcagtggttgaattccatccacaatgagtcaagaatccaccaattgaaggg 3512  T
Q  111 tggttcaatactttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatctgaaatttctttcaaaaaatcagatgagaaaaccaccgagccaccaatga 210  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || ||||| ||||  | |||||| |||||||    
T  3511 tggatcagtacttgctcttgtggacaccagcttgtgattaggcctctatctgaaatttcattctcaaattctgatgacaaaataaacgagccgccaatga 3412  T
Q  211 caagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgctgttggccaaaccccaagcaaactctacgagcttctctcgagacataacagtgatgctgcc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||  || |  | | ||| |||||| || ||||||||    
T  3411 caagatcaggcctaatgatccacaaaaacggtttcttgctatcggccaaaccccaagcaaattctaacagttgatttggagtcataactgtaatgctgcc 3312  T
Q  311 aaaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtct-aaagatgtcaagtc 409  Q
     ||||| ||||||||||||||    ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  || ||||||  |||||     
T  3311 gaaattcacataaacaacagactcaggttccttggattcgagccattcaagacacttggtatcttctttccaaagattggaacctaaaagattccaagtg 3212  T
Q  410 attttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaatagaaagcattcataacatcactctcaagttca 509  Q
    ||| |||||| ||||| |||  || |||| |||||| || ||  ||||||  || || |||| ||| | ||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  3211 attatgtggagtttgacttaataatgaaggtaatggtccgatactgtataatgatgggaacatagagtggagcgcattcagtacatcactctcaagttca 3112  T
Q  510 tt 511  Q
    ||    
T  3111 tt 3110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3569 - 3443
Alignment:
Q  18 aaaaatggccaacataacattggaactccagcacatatgctttcagtggttgagttccatccgcaatgagtcaagaatccaccgactgaaaggtggttca 117  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  3569 aaaaatggccaacgcagcattggaactccagaacaaatgctttcaatggttgagttccatccacaatgagttaagaatccaccaact-aagggtggttca 3471  T
Q  118 atactttctcttgtggacaccaacttgc 145  Q
    | |||| |||||  |||||||| |||||    
T  3470 acacttgctcttacggacaccatcttgc 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3208 - 3162
Alignment:
Q  204 ccaatgacaagatcaggcctaatgatccacaaaaagggttttttgct 250  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3208 ccaatgacaaggtcagacctaatgatccacacaaagggtttcttgct 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 520
Target Start/End: Original strand, 4 - 216
Alignment:
Q  312 aaatttacataaacaacagatcttggttcttttgattcaagccattcaagacatttagtatcttctttccaaagattagagtctaaagatgtcaagtcat 411  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||  ||||||||   || | ||    
T  4 aaattcacataaacaaccgatcccggttcgttggattcaagccattcaagacactcagtatcttctttccaaaggttggaacctaaagattctaattgat 103  T
Q  412 ---tttgtggactttgatttagaaaagaagctaatggaccaattgtgtatagagaaggaaacaaagaata-gaaagcattcataacatcactctcaagtt 507  Q
       |||||||| |||| ||||  || |||| ||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||  | || |||  | || ||||||||||||||||    
T  104 gaatttgtggagtttggtttaataatgaaggtaaagggccaatggggtaaagagaaggaaacaaagaggaggagagcggttattacatcactctcaagtt 203  T
Q  508 cattcgaagtatt 520  Q
    ||||  |||||||    
T  204 cattgaaagtatt 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1351098 - 1351057
Alignment:
Q  120 actttctcttgtggacaccaacttgctattagtcctctatct 161  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  1351098 actttctcttgtggacaccaacctaccattagtcctctatct 1351057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University