View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19030_low_14 (Length: 366)

Name: NF19030_low_14
Description: NF19030
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19030_low_14
NF19030_low_14
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (19-356)||(18059674-18060014)
chr1 (19-356)||(17004638-17004978)
chr1 (19-356)||(38055007-38055347)
chr1 (21-351)||(46523394-46523726)
chr1 (19-276)||(17148647-17148908)
chr1 (19-219)||(19962415-19962617)
chr1 (19-220)||(22227947-22228148)
chr1 (19-220)||(22232644-22232845)
chr1 (21-237)||(22035568-22035785)
chr1 (21-237)||(7640852-7641069)
chr1 (19-186)||(5072302-5072467)
chr1 (21-220)||(2116393-2116589)
chr1 (21-220)||(45051561-45051757)
chr1 (39-186)||(18601052-18601197)
chr1 (314-356)||(22035448-22035490)
chr1 (315-356)||(20254312-20254353)
chr1 (21-95)||(51452765-51452840)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (19-356)||(16376289-16376629)
chr6 (19-356)||(16383613-16383953)
chr6 (19-356)||(10488699-10489039)
chr6 (19-356)||(16556055-16556395)
chr6 (19-356)||(16632611-16632951)
chr6 (19-356)||(22225654-22225994)
chr6 (21-356)||(1556005-1556343)
chr6 (21-356)||(19610018-19610356)
chr6 (21-276)||(16231972-16232230)
chr6 (21-276)||(18086741-18086999)
chr6 (21-276)||(23977849-23978107)
chr6 (21-276)||(13620712-13620970)
chr6 (19-219)||(19299375-19299577)
chr6 (19-185)||(22251482-22251648)
chr6 (25-284)||(29665945-29666208)
chr6 (21-237)||(29869694-29869911)
chr6 (19-130)||(25175792-25175903)
chr6 (19-130)||(27653896-27654006)
chr6 (21-186)||(1650022-1650184)
chr6 (32-130)||(16825678-16825775)
chr6 (269-356)||(33314387-33314474)
chr6 (19-220)||(14626043-14626243)
chr6 (176-238)||(27740957-27741021)
chr6 (21-236)||(15862592-15862820)
chr6 (21-95)||(1657662-1657738)
chr6 (101-133)||(19629556-19629588)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (19-356)||(1467655-1467995)
chr3 (19-356)||(49232436-49232776)
chr3 (19-356)||(25058739-25059079)
chr3 (21-356)||(12902008-12902346)
chr3 (19-356)||(12264708-12265049)
chr3 (19-305)||(22275260-22275549)
chr3 (19-305)||(15468256-15468545)
chr3 (21-352)||(5228317-5228650)
chr3 (21-276)||(18911073-18911331)
chr3 (20-259)||(12811938-12812180)
chr3 (21-284)||(54651529-54651795)
chr3 (21-186)||(18896962-18897127)
chr3 (21-356)||(44228985-44229323)
chr3 (240-356)||(18897139-18897255)
chr3 (19-218)||(16821280-16821476)
chr3 (21-122)||(15936553-15936654)
chr3 (21-122)||(15938395-15938496)
chr3 (19-130)||(41270304-41270413)
chr3 (19-186)||(55316392-55316557)
chr3 (21-219)||(15614973-15615168)
chr3 (101-227)||(11986172-11986300)
chr3 (21-53)||(8268651-8268683)
chr3 (21-53)||(8275751-8275783)
chr3 (21-76)||(2449153-2449208)
chr3 (21-95)||(13954805-13954880)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (19-356)||(11231254-11231594)
chr2 (19-356)||(22513101-22513441)
chr2 (19-356)||(28775723-28776063)
chr2 (19-356)||(24685697-24686037)
chr2 (21-356)||(12728392-12728730)
chr2 (21-356)||(34824475-34824813)
chr2 (21-356)||(16935593-16935931)
chr2 (21-356)||(17006253-17006591)
chr2 (21-356)||(23777963-23778301)
chr2 (21-276)||(8943926-8944184)
chr2 (21-276)||(42177887-42178145)
chr2 (21-276)||(12635786-12636044)
chr2 (21-276)||(3798521-3798779)
chr2 (21-276)||(12641560-12641818)
chr2 (68-356)||(21141895-21142187)
chr2 (21-237)||(23774257-23774474)
chr2 (19-130)||(19886574-19886684)
chr2 (21-237)||(5888548-5888765)
chr2 (21-220)||(7507758-7507969)
chr2 (21-95)||(19689316-19689391)
chr2 (21-76)||(14906355-14906410)
chr2 (21-76)||(23820364-23820419)
chr2 (314-356)||(5888843-5888885)
chr2 (314-356)||(23774137-23774179)
chr2 (21-95)||(17396568-17396643)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (19-356)||(31309-31649)
scaffold0107 (70-356)||(39646-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (19-356)||(39103-39443)
scaffold0076 (19-219)||(43137-43335)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (19-356)||(271276-271616)
chr8 (19-356)||(644304-644644)
chr8 (19-356)||(830039-830379)
chr8 (19-356)||(22088710-22089050)
chr8 (19-356)||(15319075-15319415)
chr8 (19-356)||(15499444-15499784)
chr8 (19-356)||(22006174-22006514)
chr8 (21-356)||(13662183-13662521)
chr8 (21-276)||(13720846-13721104)
chr8 (21-276)||(16872969-16873227)
chr8 (21-356)||(16195230-16195569)
chr8 (23-219)||(21844490-21844684)
chr8 (19-219)||(21851879-21852077)
chr8 (21-220)||(24549120-24549316)
chr8 (19-220)||(6774173-6774371)
chr8 (21-238)||(16674308-16674524)
chr8 (19-130)||(30120951-30121062)
chr8 (21-95)||(22907129-22907204)
chr8 (21-76)||(5238380-5238435)
chr8 (21-76)||(24661163-24661218)
chr8 (21-76)||(43685839-43685894)
chr8 (22-95)||(17345842-17345917)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (19-356)||(7822728-7823068)
chr7 (19-356)||(7830039-7830379)
chr7 (19-356)||(27101553-27101893)
chr7 (19-356)||(27108901-27109241)
chr7 (19-356)||(27176433-27176773)
chr7 (19-356)||(38783645-38783985)
chr7 (19-356)||(15950707-15951047)
chr7 (21-356)||(15760032-15760370)
chr7 (21-276)||(18979939-18980197)
chr7 (21-276)||(15927648-15927906)
chr7 (21-276)||(13758450-13758708)
chr7 (21-276)||(14250816-14251074)
chr7 (21-224)||(48622584-48622788)
chr7 (19-186)||(2437630-2437796)
chr7 (21-237)||(10000288-10000505)
chr7 (21-219)||(13572816-13573012)
chr7 (21-237)||(16418618-16418835)
chr7 (21-122)||(18253761-18253862)
chr7 (21-104)||(15862174-15862257)
chr7 (19-220)||(16478877-16479075)
chr7 (19-186)||(10989582-10989748)
chr7 (19-238)||(13910937-13911156)
chr7 (21-238)||(13321134-13321365)
chr7 (21-95)||(7293289-7293364)
chr7 (21-95)||(30262044-30262119)
chr7 (21-76)||(11516520-11516575)
chr7 (21-76)||(14113904-14113959)
chr7 (21-76)||(15441479-15441534)
chr7 (314-356)||(10000583-10000625)
chr7 (314-356)||(16418498-16418540)
chr7 (21-95)||(14423555-14423629)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (19-356)||(35582036-35582376)
chr5 (19-356)||(21932297-21932637)
chr5 (19-356)||(21938467-21938807)
chr5 (19-356)||(22883000-22883340)
chr5 (19-356)||(36989686-36990026)
chr5 (21-356)||(1219438-1219776)
chr5 (21-356)||(7425324-7425662)
chr5 (19-305)||(17471504-17471793)
chr5 (19-276)||(10777886-10778146)
chr5 (21-356)||(35791016-35791355)
chr5 (21-276)||(23514641-23514899)
chr5 (19-356)||(11211981-11212321)
chr5 (21-237)||(23328678-23328895)
chr5 (21-237)||(24616282-24616499)
chr5 (21-237)||(24712658-24712875)
chr5 (21-237)||(24745676-24745893)
chr5 (19-130)||(18777905-18778015)
chr5 (21-219)||(27009981-27010177)
chr5 (19-130)||(12603-12713)
chr5 (19-130)||(21073508-21073618)
chr5 (19-130)||(25426857-25426967)
chr5 (19-130)||(19500128-19500238)
chr5 (19-130)||(22366394-22366504)
chr5 (19-220)||(29188199-29188397)
chr5 (19-186)||(43443310-43443474)
chr5 (19-238)||(4199898-4200117)
chr5 (101-284)||(32950765-32950952)
chr5 (314-356)||(23328558-23328600)
chr5 (314-354)||(24616165-24616205)
chr5 (314-354)||(24712541-24712581)
chr5 (314-354)||(24745559-24745599)
chr5 (21-76)||(20623262-20623317)
chr5 (21-76)||(21233443-21233498)
chr5 (21-76)||(25900321-25900376)
chr5 (21-76)||(37053037-37053092)
chr5 (19-52)||(11343008-11343041)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (19-356)||(29162-29502)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (21-356)||(153925-154263)
scaffold0023 (19-130)||(169825-169935)
scaffold0023 (19-125)||(36327-36432)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (21-356)||(18168970-18169308)
chr4 (21-356)||(19020486-19020824)
chr4 (21-356)||(15287163-15287501)
chr4 (21-356)||(15294272-15294610)
chr4 (21-276)||(7131983-7132241)
chr4 (21-276)||(20000803-20001061)
chr4 (21-356)||(17145575-17145913)
chr4 (21-356)||(18248218-18248556)
chr4 (21-236)||(22738390-22738607)
chr4 (30-145)||(8378365-8378480)
chr4 (21-237)||(26339140-26339357)
chr4 (21-222)||(22351982-22352184)
chr4 (19-218)||(10644360-10644556)
chr4 (143-356)||(8374508-8374724)
chr4 (21-130)||(47357883-47357989)
chr4 (21-96)||(9795490-9795564)
chr4 (126-238)||(40885585-40885698)
chr4 (21-59)||(8378486-8378524)
chr4 (315-356)||(22738269-22738310)
chr4 (21-53)||(14996444-14996476)
chr4 (21-76)||(16327841-16327896)
chr4 (21-76)||(16609014-16609069)
chr4 (21-76)||(26680493-26680548)
chr4 (314-356)||(22352260-22352302)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (21-356)||(1493-1831)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (21-356)||(2392-2731)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (21-356)||(10257-10595)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (21-276)||(1432-1690)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-356)||(34076-34414)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (19-356)||(7372-7712)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (110-356)||(3-252)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (21-356)||(54416-54755)
scaffold0066 (21-284)||(45102-45369)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (19-220)||(5128-5329)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (21-186)||(3895-4060)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (21-224)||(54008-54212)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (21-237)||(6718-6935)
scaffold0183 (314-356)||(6598-6640)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (19-130)||(10664-10775)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (61-224)||(3547-3711)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (21-220)||(3101-3299)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (19-130)||(21029-21139)
scaffold0139 (19-219)||(13975-14173)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (21-237)||(7330-7547)
scaffold0003 (314-356)||(7210-7252)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (21-220)||(9266-9462)
scaffold0215 (21-220)||(16164-16360)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-122)||(107983-108084)
scaffold0026 (21-130)||(64439-64546)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (19-186)||(1218-1383)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (19-220)||(13240-13438)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (25-237)||(23671-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (21-217)||(177-369)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (19-125)||(31588-31693)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (21-125)||(12045-12149)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (101-284)||(56105-56291)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (21-96)||(13268-13342)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (21-95)||(34374-34450)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (21-76)||(22833-22888)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (101-220)||(41786-41905)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (21-76)||(1497-1552)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (101-222)||(3324-3447)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (20-52)||(42677-42709)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 18059674 - 18060014
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059674 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 18059773  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059774 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 18059873  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18059874 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctattgtaag 18059973  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059974 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 18060014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17004978 - 17004638
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17004978 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 17004879  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004878 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 17004779  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17004778 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 17004679  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004678 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17004638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 38055007 - 38055347
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38055007 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 38055106  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055107 gcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 38055206  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38055207 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 38055306  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055307 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 46523726 - 46523394
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46523726 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 46523628  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523627 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 46523528  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | || ||||    
T  46523527 aattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtg 46523428  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattga 351  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46523427 aatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17148908 - 17148647
Alignment:
Q  19 caaaggtaaggggg-ttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17148908 caaaggtaaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 17148809  T
Q  118 tgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 215  Q
    |||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148808 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 17148709  T
Q  216 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148708 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 19962415 - 19962617
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19962415 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgt 19962514  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962515 gctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19962614  T
Q  217 gaa 219  Q
    |||    
T  19962615 gaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22228148 - 22227947
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22228148 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 22228049  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |  |||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22228048 gctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatg 22227950  T
Q  218 aaa 220  Q
    |||    
T  22227949 aaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22232845 - 22232644
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22232845 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 22232746  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |  |||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22232745 gctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatg 22232647  T
Q  218 aaa 220  Q
    |||    
T  22232646 aaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22035785 - 22035568
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22035785 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 22035686  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  22035685 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 22035587  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  22035586 aattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 7640852 - 7641069
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  7640852 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7640951  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  7640952 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 7641050  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  7641051 aattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 5072302 - 5072467
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  5072302 caaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 5072399  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  5072400 gctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 5072467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116393
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 2116493  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    | || ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  2116492 ttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 2116394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051561
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||     
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgt 45051661  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||| ||||| || ||  ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  45051660 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 45051562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Original strand, 18601052 - 18601197
Alignment:
Q  39 attatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctatt 138  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| || |||     
T  18601052 attatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatg 18601149  T
Q  139 ttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  18601150 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 18601197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22035490 - 22035448
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22035490 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 22035448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20254353 - 20254312
Alignment:
Q  315 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20254353 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 20254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 51452840 - 51452765
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  51452840 aaggtaagggggttagtctttatcttaatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 51452765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 16376289 - 16376629
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16376289 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 16376388  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376389 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16376488  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16376489 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 16376588  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376589 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16376629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 16383613 - 16383953
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16383613 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 16383712  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383713 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16383812  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16383813 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 16383912  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383913 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10489039 - 10488699
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10489039 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 10488940  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488939 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 10488840  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10488839 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 10488740  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488739 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10488699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 16556055 - 16556395
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16556055 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 16556154  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556155 gctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16556254  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16556255 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 16556354  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556355 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 16632611 - 16632951
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16632611 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 16632710  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632711 gctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 16632810  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16632811 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 16632910  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632911 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16632951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 22225654 - 22225994
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225654 caaaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 22225753  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225754 gctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 22225853  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22225854 gaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 22225953  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225954 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22225994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1556343 - 1556005
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1556343 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 1556244  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556243 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1556144  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  1556143 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtg 1556044  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556043 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 1556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19610356 - 19610018
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19610356 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgc 19610257  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19610256 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttataa 19610157  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | || ||||    
T  19610156 aattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtg 19610057  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610056 aatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16232230 - 16231972
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16232230 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 16232131  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232130 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16232031  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16232030 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 18086741 - 18086999
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18086741 aaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18086840  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086841 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18086940  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18086941 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23978107 - 23977849
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23978107 aaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 23978008  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978007 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23977908  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23977907 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620970
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13620911  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620912 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19299577 - 19299375
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19299577 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgt 19299478  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299477 gctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19299378  T
Q  217 gaa 219  Q
    |||    
T  19299377 gaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 22251482 - 22251648
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251482 caaaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 22251581  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251582 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29665945
Alignment:
Q  25 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctct 123  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  124 tgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 221  Q
     |||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaat 29666009  T
Q  222 tatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 284  Q
    | | || ||||| ||||  ||| || ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  29666008 tgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattga 29665945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 29869694 - 29869911
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  29869694 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaat-tttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 29869792  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||| | || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  29869793 ctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtg 29869891  T
Q  218 aaattatgcttaattgatga 237  Q
    ||||| ||| ||||| ||||    
T  29869892 aaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25175903 - 25175792
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcg 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  25175903 caaaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataat-tttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcg 25175805  T
Q  118 tgctcttgctgtg 130  Q
    |||||||||||||    
T  25175804 tgctcttgctgtg 25175792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 27653896 - 27654006
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||    
T  27653896 caaaggtgagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgt 27653994  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  27653995 gctcttgctgtg 27654006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650184
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 1650118  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||| ||||| || ||  ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||    
T  1650119 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattac 1650184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825775
Alignment:
Q  32 gttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 130  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 16825775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 356
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314474
Alignment:
Q  269 attcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 33314474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 14626043 - 14626243
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| ||  ||||||  |||||| ||||  || | | ||| | |||| ||| |||||||    
T  14626043 caaaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttca--ctttacaaattctcaaatgttgtttgaat-tgtgattatggataattattgctaaattc 14626139  T
Q  117 gtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagtta 215  Q
    |||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  14626140 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagtta 14626238  T
Q  216 tgaaa 220  Q
    |||||    
T  14626239 tgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740957
Alignment:
Q  176 ggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 238  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 27740957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15862820 - 15862592
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaattgttg 108  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| | |||||||     
T  15862820 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgtta 15862721  T
Q  109 ttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgt 208  Q
     ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||| || | |  || |||||||||||||    
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  209 taagttatg-aaattatgcttaattgatg 236  Q
     |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 15862592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 1657662 - 1657738
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1657662 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 1657738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19629588 - 19629556
Alignment:
Q  101 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19629588 aattgttgttaaattcgtgctcttgttgtggtg 19629556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 1467655 - 1467995
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1467655 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 1467754  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467755 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 1467854  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1467855 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 1467954  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467955 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1467995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49232776 - 49232436
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49232776 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 49232677  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232676 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 49232577  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  49232576 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 49232477  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232476 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 49232436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25059079 - 25058739
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25059079 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 25058980  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058979 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 25058880  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| || ||    
T  25058879 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaacttatgctattgtgag 25058780  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058779 tgaatcatgatttgagtatacttaattgtgaattgatgatg 25058739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902346
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12902207  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||| || ||||    
T  12902208 aattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattattaactgatactattgtgagtg 12902307  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12902308 aatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatg 12902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 12264708 - 12265049
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12264708 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 12264807  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264808 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 12264907  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaa 314  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | ||      
T  12264908 gagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgg 12265007  T
Q  315 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12265008 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22275549 - 22275260
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275549 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 22275450  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22275449 gctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcat 22275350  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatg 305  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22275349 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatg 22275260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 15468256 - 15468545
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15468256 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgt 15468355  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15468356 gctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcat 15468455  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatg 305  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15468456 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatg 15468545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5228650 - 5228317
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5228650 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgc 5228552  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5228551 tcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatga 5228452  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  5228451 gattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtg 5228352  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgat 352  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228351 aatcatgatttgggtatacttaattgtgaattgat 5228317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18911331 - 18911073
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18911331 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18911232  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911231 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18911132  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911131 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12812180 - 12811938
Alignment:
Q  20 aaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12812180 aaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtg 12812081  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812080 ctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 12811981  T
Q  218 aaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12811980 aatttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651529
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || || ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 54651596  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 284  Q
    |||||| || ||||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  54651595 aattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 18896962 - 18897127
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18896962 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 18897061  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18897062 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattac 18897127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44228985
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtg 44229225  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44229224 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatg 44229125  T
Q  218 aaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 316  Q
    ||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||  | | |||||||| | | ||  ||    
T  44229124 aaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggt 44229025  T
Q  317 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44229024 gaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 240 - 356
Target Start/End: Original strand, 18897139 - 18897255
Alignment:
Q  240 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatactta 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18897139 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatactta 18897238  T
Q  340 attgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||||||||||    
T  18897239 attgtggattgatgatg 18897255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16821476 - 16821280
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  16821476 caaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgt 16821380  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| | |||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  16821379 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatg 16821281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936654
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  121 tc 122  Q
    ||    
T  15936653 tc 15936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938496
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  121 tc 122  Q
    ||    
T  15938495 tc 15938496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41270413 - 41270304
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  41270413 caaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 41270316  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  41270315 gctcttgctgtg 41270304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55316557 - 55316392
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  55316557 caaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 55316460  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  55316459 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 55316392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614973
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgc 15615072  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  15615071 tcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986300
Alignment:
Q  101 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| || ||| |||||||||  |||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  199 gtataaatgttaagttatgaaattatgct 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgct 11986300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 8268651 - 8268683
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268651 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 8275751 - 8275783
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275751 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 2449153 - 2449208
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  2449153 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 2449208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 13954805 - 13954880
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13954805 aaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttga 13954880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 11231254 - 11231594
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11231254 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 11231353  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231354 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 11231453  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11231454 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 11231553  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231554 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 11231594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 22513101 - 22513441
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22513101 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 22513200  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513201 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 22513300  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22513301 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 22513400  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513401 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 28775723 - 28776063
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28775723 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 28775822  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775823 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 28775922  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28775923 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 28776022  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28776023 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 28776063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 24685697 - 24686037
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24685697 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 24685796  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685797 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 24685896  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24685897 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 24685996  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24685997 tgaattatgatttaggtatacttaattgtggattgatgatg 24686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12728730 - 12728392
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12728730 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12728631  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728630 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12728531  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  12728530 aattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtg 12728431  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728430 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 12728392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34824813 - 34824475
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34824813 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 34824714  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824713 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 34824614  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  34824613 aattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtg 34824514  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824513 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 34824475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16935931 - 16935593
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16935931 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgc 16935832  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935831 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16935732  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  16935731 aattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtg 16935632  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935631 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17006591 - 17006253
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17006591 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgc 17006492  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006491 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17006392  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  17006391 aattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtg 17006292  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006291 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17006253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778301
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23778162  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  23778163 aattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtg 23778262  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778263 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23778301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8944184 - 8943926
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8944184 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 8944085  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944084 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 8943985  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8943984 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 42177887 - 42178145
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42177887 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 42177986  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177987 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 42178086  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178087 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 12635786 - 12636044
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12635786 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12635885  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635886 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12635985  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12635986 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 3798521 - 3798779
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3798521 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 3798620  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798621 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 3798720  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798721 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641818
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12641759  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12641760 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21141895
Alignment:
Q  68 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggt 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggt 21142088  T
Q  167 atgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgag 263  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||    
T  21142087 atgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgag 21141988  T
Q  264 atgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||  ||  | | |||||||| | | ||  |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21141987 atgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23774474 - 23774257
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23774474 aaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 23774375  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23774374 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 23774276  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  23774275 aattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 19886574 - 19886684
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  19886574 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 19886672  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  19886673 gctcttgctgtg 19886684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888765
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  || ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  5888648 tcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 5888746  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  5888747 aattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 7507758 - 7507969
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgttg 108  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          |||| |||| |||    
T  7507758 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatgaataattattg 7507857  T
Q  109 ttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatg 207  Q
     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||     
T  7507858 ctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaata 7507956  T
Q  208 ttaagttatgaaa 220  Q
     ||||||||||||    
T  7507957 ataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 19689316 - 19689391
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  19689316 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 19689391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 14906355 - 14906410
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  14906355 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14906410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23820419 - 23820364
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  23820419 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 23820364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Original strand, 5888843 - 5888885
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5888843 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 5888885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23774179 - 23774137
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23774179 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 23774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 17396568 - 17396643
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  17396568 aaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 17396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31649 - 31309
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31649 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 31550  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 31450  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31449 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 31350  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31349 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 31309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 70 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39646
Alignment:
Q  70 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  170 tttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 266  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatg 39736  T
Q  267 tgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    | ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735 ttattcatatttcattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39443 - 39103
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39443 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 39344  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39343 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 39244  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39243 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 39144  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39143 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43335 - 43137
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  43335 caaaggtaagggggttagttactatcacaaacatgta--at-tttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcg 43239  T
Q  118 tgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    ||||||||||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43238 tgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttat 43140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 271276 - 271616
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  271276 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 271375  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271376 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 271475  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  271476 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 271575  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271576 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 271616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 644644 - 644304
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  644644 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 644545  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644544 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 644445  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  644444 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 644345  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644344 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 644304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 830379 - 830039
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  830379 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 830280  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830279 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 830180  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  830179 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 830080  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830079 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 22088710 - 22089050
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22088710 caaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgt 22088809  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088810 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 22088909  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22088910 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 22089009  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089010 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 15319075 - 15319415
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15319075 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 15319174  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15319175 gctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttat 15319274  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15319275 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 15319374  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319375 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15319415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 15499444 - 15499784
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15499444 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 15499543  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15499544 gctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttat 15499643  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15499644 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 15499743  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499744 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 22006174 - 22006514
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22006174 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 22006273  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006274 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 22006373  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||    
T  22006374 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgttattgtgag 22006473  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22006474 tgaatcatgatttgggtatacttaattgtggactgatgatg 22006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 13662183 - 13662521
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13662183 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgc 13662282  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662283 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13662382  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  13662383 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtg 13662482  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13662483 aatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 13720846 - 13721104
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13720846 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13720945  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720946 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13721045  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721046 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 16872969 - 16873227
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16872969 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 16873068  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873069 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16873168  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16873169 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16195569 - 16195230
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16195569 aaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttc 16195470  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195469 tcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16195370  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 316  Q
     ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | |   ||    
T  16195369 gattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggt 16195270  T
Q  317 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16195269 gaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844684
Alignment:
Q  23 ggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 21844587  T
Q  123 ttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844588 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 21851879 - 21852077
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21851879 caaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 21851976  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||  | |  || |||||| ||||| ||||||||||    
T  21851977 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatga 21852076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24549316 - 24549120
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  24549316 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 24549220  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  24549219 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 24549121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 6774173 - 6774371
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||    
T  6774173 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 6774269  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  6774270 gctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 6774368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 16674308 - 16674524
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||    
T  16674308 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgc 16674405  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||| ||||| || ||| || || ||| |||||| ||| |  | ||||| || | ||||||||||| | |||| | |||| | ||||| |||||||||||    
T  16674406 tctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaa 16674504  T
Q  220 -attatgcttaattgatgaa 238  Q
     ||| |||||||||| ||||    
T  16674505 tattgtgcttaattggtgaa 16674524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30121062 - 30120951
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  30121062 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgt 30120963  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  30120962 gctcttgctgtg 30120951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 22907129 - 22907204
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  22907129 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 22907204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5238435 - 5238380
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  5238435 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 5238380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 24661163 - 24661218
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  24661163 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 24661218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 43685894 - 43685839
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  43685894 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 43685839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17345917 - 17345842
Alignment:
Q  22 aggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  17345917 aggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 17345842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7823068 - 7822728
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7823068 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 7822969  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822968 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 7822869  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7822868 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 7822769  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822768 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7822728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7830379 - 7830039
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7830379 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 7830280  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830279 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 7830180  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7830179 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 7830080  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830079 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 27101553 - 27101893
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101553 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 27101652  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101653 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 27101752  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27101753 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 27101852  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101853 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27101893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 27108901 - 27109241
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27108901 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 27109000  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109001 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 27109100  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27109101 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 27109200  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109201 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27109241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27176773 - 27176433
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27176773 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 27176674  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176673 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 27176574  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27176573 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 27176474  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176473 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27176433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 38783645 - 38783985
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38783645 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 38783744  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783745 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 38783844  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38783845 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 38783944  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783945 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38783985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 15950707 - 15951047
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15950707 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 15950806  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950807 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 15950906  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15950907 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtgattattgttaactgatgctattgtaag 15951006  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951007 tgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15951047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 15760032 - 15760370
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15760032 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgc 15760131  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760132 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15760231  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  15760232 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtg 15760331  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760332 aataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 18979939 - 18980197
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18979939 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18980038  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980039 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18980138  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980139 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15927906 - 15927648
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15927906 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgc 15927807  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927806 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15927707  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927706 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13758708 - 13758450
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13758708 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 13758609  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758608 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13758509  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13758508 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 14250816 - 14251074
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250816 aaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 14250915  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250916 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 14251015  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14251016 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622788
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaa 48622783  T
Q  220 attat 224  Q
    |||||    
T  48622784 attat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2437796 - 2437630
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  2437796 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgt 2437698  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    ||||||| |||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  2437697 gctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 2437630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000505
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||  | |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt--ttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10000388 tcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 10000486  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  10000487 aattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13573012 - 13572816
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  13573012 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 13572915  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || || || || | ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  13572914 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418618
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  || ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  16418735 tcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 16418637  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  16418636 aattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18253862
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  121 tc 122  Q
    ||    
T  18253861 tc 18253862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 16478877 - 16479075
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  16478877 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcattta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgt 16478973  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||| ||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  16478974 gctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 16479072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10989748 - 10989582
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  10989748 caaaggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgt 10989650  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  10989649 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 10989582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 13910937 - 13911156
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  13910937 caaaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgt 13911035  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    ||||||| |||| || ||| ||  | ||| |||||||||| | || ||||| || | ||||||||||| | |||| | |||| | ||||| |||||||||    
T  13911036 gctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatg 13911134  T
Q  218 aa-attatgcttaattgatgaa 238  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  13911135 aatattatgctcaattggtgaa 13911156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13321365 - 13321134
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgttg 108  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||||||    
T  13321365 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataattgttg 13321266  T
Q  109 ttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaat 206  Q
     ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13321265 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaat 13321166  T
Q  207 gttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 238  Q
    || ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13321165 gtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 13321134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7293364 - 7293289
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  7293364 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 7293289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 30262044 - 30262119
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  30262044 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 30262119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11516575 - 11516520
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  11516575 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 11516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 14113904 - 14113959
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  14113904 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14113959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 15441479 - 15441534
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  15441479 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 15441534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Original strand, 10000583 - 10000625
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10000583 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 10000625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16418540 - 16418498
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16418540 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 16418498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 14423555 - 14423629
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  14423555 aaggtaagggggttagtc-ttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 14423629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35582376 - 35582036
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35582376 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 35582277  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582276 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 35582177  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35582176 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 35582077  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582076 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 35582036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 21932297 - 21932637
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21932297 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 21932396  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932397 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 21932496  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  21932497 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaag 21932596  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932597 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 21938467 - 21938807
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21938467 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 21938566  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938567 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 21938666  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  21938667 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaag 21938766  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938767 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21938807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 22883000 - 22883340
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22883000 caaagataagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgt 22883099  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883100 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 22883199  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22883200 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 22883299  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883300 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 36989686 - 36990026
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36989686 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgt 36989785  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989786 gctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 36989885  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36989886 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaag 36989985  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989986 tgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 36990026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 1219438 - 1219776
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1219438 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 1219537  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219538 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1219637  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  1219638 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtg 1219737  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219738 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7425662 - 7425324
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7425662 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgc 7425563  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425562 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7425463  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | || ||||    
T  7425462 aattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtg 7425363  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7425362 aatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Original strand, 17471504 - 17471793
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17471504 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgt 17471603  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17471604 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaat 17471703  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatg 305  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17471704 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatg 17471793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 276
Target Start/End: Original strand, 10777886 - 10778146
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10777886 caaaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 10777985  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777986 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 10778085  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778086 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 35791016 - 35791355
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35791016 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 35791115  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791116 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35791215  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 316  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | |   ||    
T  35791216 gattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggt 35791315  T
Q  317 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35791316 gaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23514899 - 23514641
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23514899 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 23514800  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514799 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23514700  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514699 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 11211981 - 11212321
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11211981 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 11212080  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11212081 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttat 11212180  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    |||||||| || || |  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | ||  |    
T  11212181 gaaattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtggg 11212280  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11212281 tggattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23328895 - 23328678
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23328895 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 23328796  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23328795 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 23328697  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  23328696 aattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24616499 - 24616282
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24616499 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 24616400  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  24616399 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 24616301  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  24616300 aattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24712875 - 24712658
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24712875 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 24712776  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  24712775 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 24712677  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  24712676 aattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24745893 - 24745676
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24745893 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 24745794  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  24745793 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 24745695  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  24745694 aattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 18777905 - 18778015
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18777905 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgt 18778003  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  18778004 gctcttgctgtg 18778015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27010177 - 27009981
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  27010177 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 27010080  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||||  | | ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27010079 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12713 - 12603
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  12713 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 12615  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  12614 gctcttgctgtg 12603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 21073508 - 21073618
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  21073508 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgt 21073606  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  21073607 gctcttgctgtg 21073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25426967 - 25426857
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  25426967 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 25426869  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  25426868 gctcttgctgtg 25426857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19500238 - 19500128
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  19500238 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgt 19500140  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  19500139 gctcttgctgtg 19500128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 22366394 - 22366504
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  22366394 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgt 22366492  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  22366493 gctcttgctgtg 22366504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 29188199 - 29188397
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||    
T  29188199 caaaggtaagggggttagtgattattataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgt 29188295  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  29188296 gctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 29188394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 43443310 - 43443474
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  43443310 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat---tgcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgt 43443406  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  43443407 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 43443474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 4199898 - 4200117
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||    
T  4199898 caaaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgt 4199996  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    ||||||| |||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||| | |||| | |||| | ||||| |||||||||    
T  4199997 gctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatg 4200095  T
Q  218 aa-attatgcttaattgatgaa 238  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  4200096 aatattatgctaaattggtgaa 4200117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950765
Alignment:
Q  101 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  199 gtataaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaattga-tatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 284  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| || | |||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattga 32950765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23328600 - 23328558
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328600 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24616205 - 24616165
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 354  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616205 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24712581 - 24712541
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 354  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712581 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24745599 - 24745559
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 354  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745599 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20623317 - 20623262
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  20623317 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20623262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 21233443 - 21233498
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  21233443 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 21233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 25900321 - 25900376
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  25900321 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 25900376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 37053092 - 37053037
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  37053092 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 37053037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 11343041 - 11343008
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcat 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343041 caaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29502 - 29162
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29502 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 29403  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29402 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttat 29303  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| ||| || ||    
T  29302 gaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaatttatgttattgttag 29203  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29202 tgaattatgatttggttatacttaattgtgtattgatgatg 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 153925 - 154263
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  153925 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 154024  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154025 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 154124  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  |||    
T  154125 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattgatgtggttattgttaacttatgctattgtgggtg 154224  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154225 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 154263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 169825 - 169935
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  169825 caaaagtaagggggttagtgattatcataatcatgtataat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 169923  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||||    
T  169924 gctcttgctgtg 169935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36432 - 36327
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  36432 caaaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 36334  T
Q  119 gctcttg 125  Q
    |||||||    
T  36333 gctcttg 36327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18168970
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| || ||||    
T  18169108 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaataatgctattgtgagtg 18169009  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18169008 aatcatgatttggatatacttaattgtgaattgatgatg 18168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020486
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19020625  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  19020624 aattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtg 19020525  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19020524 aatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatg 19020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 15287163 - 15287501
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  15287163 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgc 15287262  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287263 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15287362  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | || ||||    
T  15287363 aattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtg 15287462  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287463 aatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 15294272 - 15294610
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  15294272 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgc 15294371  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15294372 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatga 15294471  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | || ||||    
T  15294472 aattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtg 15294571  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294572 aatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 7131983 - 7132241
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7131983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 7132082  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132083 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7132182  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132183 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20001061 - 20000803
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20001061 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 20000962  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000961 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 20000862  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20000861 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 17145575 - 17145913
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17145575 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 17145674  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17145675 tcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtga 17145774  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | ||  |||    
T  17145775 aattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtg 17145874  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17145875 aattatgacttgggtatacataattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248218
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatga 18248357  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| || ||||  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | ||  |||    
T  18248356 aattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtg 18248257  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18248256 aattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22738607 - 22738390
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  22738607 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgt 22738508  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738507 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtga 22738408  T
Q  219 aattatgcttaattgatg 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22738407 aattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378365
Alignment:
Q  30 gggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  130 ggtgctattttcttgt 145  Q
    | ||||||||||||||    
T  8378380 gatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26339357 - 26339140
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  26339357 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 26339258  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  26339257 tcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtga 26339159  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  26339158 aattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 22351982 - 22352184
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||    
T  22351982 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgc 22352081  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  22352082 tcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 22352180  T
Q  219 aatt 222  Q
    ||||    
T  22352181 aatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10644556 - 10644360
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  10644556 caaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgt 10644460  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || |  |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10644459 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 10644361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374508
Alignment:
Q  143 tgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt--ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||      
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  240 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatactta 339  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||  |||||||||| ||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T
Q  340 attgtggattgatgatg 356  Q
    ||| | |||||||||||    
T  8374524 attatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 47357989 - 47357883
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  47357989 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 47357893  T
Q  121 tcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||    
T  47357892 tcttgctgtg 47357883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885698
Alignment:
Q  126 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 224  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||| |||| || | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattat 40885684  T
Q  225 gcttaattgatgaa 238  Q
    ||| ||||| ||||    
T  40885685 gctcaattggtgaa 40885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378486
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaat 59  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgtacaat 8378486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22738310 - 22738269
Alignment:
Q  315 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22738310 gtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14996476 - 14996444
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996476 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 16327841 - 16327896
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  16327841 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16327896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 16609014 - 16609069
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  16609014 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26680548 - 26680493
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  26680548 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 26680493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Original strand, 22352260 - 22352302
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22352260 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 22352302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1831
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1493 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgc 1592  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1593 acttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1692  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||||| || |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  1693 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatataaaattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtg 1792  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1793 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2731 - 2392
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaa-tctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2731 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtg 2632  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2631 ctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg 2532  T
Q  218 aaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 316  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| || |||    
T  2531 aaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagt 2432  T
Q  317 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2431 gaatcatggtttgggtatacttaattgtggattgatgatg 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10595
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatga 10456  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| || || |    
T  10457 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttgttgttaactgatgctattgtgaggg 10556  T
Q  318 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557 aatcatgacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 1432 - 1690
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1432 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 1531  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1532 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1631  T
Q  219 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 276  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1632 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34414
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 34274  T
Q  218 aaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 316  Q
    || |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||  | | |||||||||||| || |||    
T  34275 aagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgttgctattaactgatgctattgtgagt 34374  T
Q  317 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34375 gaatcatgacttgggtatactaaattatggattgatgatg 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7712
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  7372 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgt 7471  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 216  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7472 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctat 7571  T
Q  217 gaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaag 315  Q
    |||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| | ||  || || | |||||||| | | || ||    
T  7572 gaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgttattaactgatgttgttgtgag 7671  T
Q  316 tgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7672 tgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 110 - 356
Target Start/End: Original strand, 3 - 252
Alignment:
Q  110 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3 taaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatg 102  T
Q  208 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgc 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  103 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgatgc 202  T
Q  307 tatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54416
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg 54556  T
Q  218 aaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgaagtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 316  Q
    ||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | | |||||||| | | ||  ||    
T  54555 aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggt 54456  T
Q  317 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  54455 gaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45102
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  120 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    | |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg 45170  T
Q  218 aaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 284  Q
    ||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45169 aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 45102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 5128 - 5329
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5128 caaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgt 5227  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  5228 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatg 5326  T
Q  218 aaa 220  Q
    |||    
T  5327 aaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4060 - 3895
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4060 aaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 3961  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||    
T  3960 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattac 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54008
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaa 54013  T
Q  220 attat 224  Q
    |||||    
T  54012 attat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6935 - 6718
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  6935 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 6836  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  6835 tcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 6737  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  6736 aattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6640 - 6598
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6640 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 10664 - 10775
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10664 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 10763  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||| ||||    
T  10764 gctcttgttgtg 10775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3547
Alignment:
Q  61 tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgat 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||    
T  3711 tttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgat 3612  T
Q  161 tatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 224  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3611 tatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 3547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3299 - 3101
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3299 aaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 3201  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 220  Q
    |||||||||| || ||| ||  | | | |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |  || |||||| |||||| ||||| |||||    
T  3200 tcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaa 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 21029 - 21139
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21029 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 21127  T
Q  119 gctcttgctgtg 130  Q
    ||||||| ||||    
T  21128 gctcttgttgtg 21139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 13975 - 14173
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  13975 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgt 14072  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    |||||||||||| || ||| |   | ||| |||||||||||| ||  |||| || |  |||||||||| | |  || |||||| ||||| ||||||||||    
T  14073 gctcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatga 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7330
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 218  Q
    ||||| | || ||||  || ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  7447 tcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 7349  T
Q  219 aattatgcttaattgatga 237  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  7348 aattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7252 - 7210
Alignment:
Q  314 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 356  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7252 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9462
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 9362  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    | |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  9363 ttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16360
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16260  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 219  Q
    | |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  16261 ttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 16359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107983
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  121 tc 122  Q
    ||    
T  107984 tc 107983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 64439 - 64546
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  64439 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 64536  T
Q  121 tcttgctgtg 130  Q
    ||||||||||    
T  64537 tcttgctgtg 64546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 1218 - 1383
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1218 caaaggtaggggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgt 1315  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac 186  Q
    |||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | |||||||||||    
T  1316 gctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattac 1383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13438
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||    
T  13240 caaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgta--attttt-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 13336  T
Q  119 gctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    ||||||  |||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  13337 gctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 13435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 23671 - 23884
Alignment:
Q  25 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||     
T  23671 taagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctg 23770  T
Q  125 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 222  Q
    | | || || |  |||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23771 gttatgttg-ttgtttcttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23869  T
Q  223 atgcttaattgatga 237  Q
     ||| ||||| ||||    
T  23870 ttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 369 - 177
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  369 aaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgta--at-tttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 274  T
Q  121 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 217  Q
    |||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||    
T  273 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatg 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Original strand, 31588 - 31693
Alignment:
Q  19 caaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgt 118  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  31588 caaatgtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgt 31686  T
Q  119 gctcttg 125  Q
    |||||||    
T  31687 gctcttg 31693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 125
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  120 ctcttg 125  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 284
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56291
Alignment:
Q  101 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| |||||||||  |||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  199 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattga 56291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34450
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 34450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22888 - 22833
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  22888 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 22833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41905 - 41786
Alignment:
Q  101 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacgtttcaaagtatgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||| | |  || |||||    
T  41905 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgt 41806  T
Q  201 ataaatgttaagttatgaaa 220  Q
    | |||||| ||||| |||||    
T  41805 aaaaatgtgaagttgtgaaa 41786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 1497 - 1552
Alignment:
Q  21 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 76  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  1497 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3324
Alignment:
Q  101 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattac--gtttcaaagtat 198  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| || ||  ||  | ||| |||||| |||||  | ||||| || | |||||||||||   |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtat 3348  T
Q  199 gtataaatgttaagttatgaaatt 222  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  3347 gtataaatatcaagttatgaaatt 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  20 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 52  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University