View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1903_low_23 (Length: 263)

Name: NF1903_low_23
Description: NF1903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1903_low_23
NF1903_low_23
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (75-263)||(23275339-23275528)
chr8 (75-233)||(23403686-23403846)
chr8 (88-263)||(9117692-9117868)
chr8 (93-263)||(15891761-15891932)
chr8 (91-263)||(23403762-23403936)
chr8 (71-263)||(15315094-15315286)
chr8 (71-263)||(15495463-15495655)
chr8 (66-253)||(27702526-27702714)
chr8 (75-253)||(9117500-9117679)
chr8 (71-263)||(29218338-29218531)
chr8 (70-253)||(1043631-1043815)
chr8 (86-253)||(15315299-15315467)
chr8 (86-253)||(15495668-15495836)
chr8 (75-229)||(29276618-29276773)
chr8 (65-236)||(28463793-28463965)
chr8 (96-263)||(4157767-4157931)
chr8 (91-253)||(24043745-24043908)
chr8 (93-263)||(35435327-35435498)
chr8 (75-232)||(24469418-24469575)
chr8 (106-263)||(27702355-27702513)
chr8 (72-236)||(38507057-38507223)
chr8 (122-263)||(7127-7269)
chr8 (69-222)||(23404039-23404193)
chr8 (91-236)||(35435527-35435673)
chr8 (71-234)||(29457112-29457277)
chr8 (74-253)||(44318408-44318588)
chr8 (71-236)||(22444891-22445057)
chr8 (65-253)||(6121495-6121684)
chr8 (117-253)||(15300852-15300989)
chr8 (117-253)||(15481221-15481358)
chr8 (91-253)||(15891585-15891748)
chr8 (76-234)||(31827100-31827258)
chr8 (91-232)||(4157591-4157733)
chr8 (91-263)||(1043828-1044000)
chr8 (93-253)||(2250724-2250885)
chr8 (117-253)||(9778965-9779102)
chr8 (68-253)||(29276809-29276995)
chr8 (124-236)||(1691874-1691987)
chr8 (75-199)||(44728107-44728232)
chr8 (70-253)||(6930-7114)
chr8 (91-253)||(2257325-2257488)
chr8 (154-263)||(22780201-22780308)
chr8 (96-233)||(31618648-31618787)
chr8 (152-263)||(9779115-9779227)
chr8 (76-183)||(22444603-22444710)
chr8 (67-232)||(42692057-42692224)
chr8 (67-183)||(1692171-1692287)
chr8 (75-183)||(6121849-6121957)
chr8 (91-179)||(31826847-31826935)
chr8 (183-263)||(42691943-42692023)
chr8 (152-233)||(22444619-22444701)
chr8 (66-183)||(2251050-2251167)
chr8 (70-178)||(22780053-22780159)
chr8 (90-236)||(42620723-42620872)
chr8 (91-183)||(2257068-2257160)
chr8 (125-236)||(11482623-11482734)
chr8 (75-186)||(15300579-15300691)
chr8 (75-186)||(15480948-15481060)
chr8 (153-232)||(29276636-29276716)
chr8 (91-183)||(31618371-31618463)
chr8 (71-183)||(42691890-42692002)
chr8 (152-233)||(31826848-31826930)
chr8 (152-233)||(44728124-44728206)
chr8 (91-180)||(9779139-9779228)
chr8 (91-179)||(15891786-15891874)
chr8 (153-233)||(15300597-15300679)
chr8 (91-182)||(15300864-15300955)
chr8 (153-233)||(15480966-15481048)
chr8 (91-182)||(15481233-15481324)
chr8 (152-233)||(4157592-4157674)
chr8 (93-179)||(22444889-22444975)
chr8 (152-233)||(24469476-24469558)
chr8 (167-228)||(1691858-1691919)
chr8 (152-236)||(6121855-6121940)
chr8 (152-232)||(31618372-31618453)
chr8 (156-234)||(31618707-31618787)
chr8 (71-163)||(38507292-38507384)
chr8 (93-184)||(11482616-11482706)
chr8 (152-253)||(2251039-2251141)
chr8 (152-253)||(2257069-2257171)
chr8 (74-180)||(44728389-44728495)
chr8 (183-233)||(35236804-35236854)
chr8 (122-179)||(1691932-1691989)
chr8 (183-232)||(1692181-1692230)
chr8 (154-233)||(22780077-22780155)
chr8 (106-183)||(31618639-31618716)
chr8 (166-234)||(42620485-42620554)
chr8 (89-173)||(27702398-27702482)
chr8 (93-181)||(28463881-28463969)
chr8 (91-183)||(35435521-35435613)
chr8 (154-233)||(44728395-44728475)
chr8 (183-222)||(23404010-23404049)
chr8 (152-222)||(38507292-38507363)
chr8 (91-174)||(42620470-42620553)
chr8 (152-233)||(23404088-23404170)
chr8 (91-183)||(2250782-2250874)
chr8 (125-179)||(38507171-38507225)
chr8 (170-215)||(38507270-38507316)
chr8 (122-179)||(35236799-35236856)
chr8 (153-186)||(38169776-38169809)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (75-263)||(10820219-10820408)
chr3 (66-263)||(33623273-33623471)
chr3 (91-263)||(13712222-13712395)
chr3 (70-263)||(11871388-11871582)
chr3 (91-263)||(7515413-7515586)
chr3 (75-263)||(13658086-13658275)
chr3 (91-263)||(43122605-43122777)
chr3 (75-253)||(13657893-13658073)
chr3 (75-234)||(29777243-29777402)
chr3 (72-234)||(43122809-43122973)
chr3 (91-263)||(26997211-26997383)
chr3 (75-253)||(50293760-50293939)
chr3 (91-253)||(48517926-48518088)
chr3 (75-236)||(13712030-13712192)
chr3 (75-236)||(17580010-17580172)
chr3 (75-232)||(47220434-47220592)
chr3 (80-233)||(52211941-52212095)
chr3 (122-234)||(24097949-24098062)
chr3 (75-263)||(47220225-47220414)
chr3 (76-253)||(26997396-26997574)
chr3 (72-234)||(33623077-33623241)
chr3 (70-229)||(24098188-24098350)
chr3 (122-236)||(31324161-31324276)
chr3 (94-263)||(11218079-11218245)
chr3 (125-263)||(24098094-24098233)
chr3 (154-263)||(29777434-29777544)
chr3 (75-215)||(11871602-11871743)
chr3 (125-253)||(54924010-54924139)
chr3 (76-216)||(7515605-7515748)
chr3 (139-253)||(10820421-10820536)
chr3 (75-174)||(1771971-1772069)
chr3 (91-183)||(17579759-17579851)
chr3 (139-253)||(11218258-11218373)
chr3 (93-222)||(11218318-11218450)
chr3 (78-183)||(3750599-3750705)
chr3 (152-233)||(17579760-17579842)
chr3 (74-215)||(25147119-25147263)
chr3 (67-183)||(8112808-8112924)
chr3 (94-249)||(48382170-48382325)
chr3 (152-234)||(1771970-1772052)
chr3 (183-253)||(3750869-3750939)
chr3 (106-180)||(52211935-52212009)
chr3 (106-183)||(31324205-31324282)
chr3 (91-183)||(10820432-10820524)
chr3 (91-183)||(13712106-13712198)
chr3 (154-233)||(25147139-25147219)
chr3 (154-263)||(29230912-29231023)
chr3 (117-183)||(3750880-3750946)
chr3 (152-233)||(25147420-25147502)
chr3 (94-180)||(48518256-48518342)
chr3 (91-180)||(25147414-25147503)
chr3 (106-183)||(33623172-33623249)
chr3 (91-183)||(11218269-11218361)
chr3 (153-236)||(11218366-11218450)
chr3 (166-233)||(11871644-11871712)
chr3 (91-183)||(24097978-24098070)
chr3 (91-183)||(29777318-29777410)
chr3 (91-183)||(43122801-43122893)
chr3 (182-233)||(7515650-7515701)
chr3 (124-183)||(17580004-17580063)
chr3 (75-236)||(29231053-29231211)
chr3 (75-186)||(48381893-48382003)
chr3 (154-236)||(48381912-48381994)
chr3 (186-262)||(23232291-23232366)
chr3 (122-174)||(24098124-24098176)
chr3 (66-134)||(29777535-29777603)
chr3 (152-233)||(3750613-3750696)
chr3 (155-232)||(8112818-8112896)
chr3 (155-220)||(37148194-37148260)
chr3 (122-183)||(29777455-29777516)
chr3 (182-234)||(43389920-43389972)
chr3 (154-233)||(47220493-47220573)
chr3 (154-233)||(48518262-48518342)
chr3 (198-253)||(1771742-1771797)
chr3 (183-222)||(3750929-3750968)
chr3 (154-236)||(8112544-8112627)
chr3 (154-236)||(49122806-49122888)
chr3 (96-182)||(29231048-29231134)
chr3 (201-236)||(1771714-1771749)
chr3 (76-175)||(54923738-54923837)
chr3 (152-193)||(1771724-1771766)
chr3 (87-133)||(10820513-10820559)
chr3 (91-133)||(31324478-31324520)
chr3 (95-161)||(37148194-37148260)
chr3 (152-233)||(45147172-45147254)
chr3 (154-186)||(23232317-23232349)
chr3 (139-183)||(31324457-31324501)
chr3 (91-143)||(37148630-37148682)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (68-263)||(5985767-5985963)
chr6 (91-263)||(4799331-4799504)
chr6 (70-253)||(29134904-29135087)
chr6 (83-262)||(33040915-33041097)
chr6 (70-236)||(14942244-14942411)
chr6 (91-183)||(24012508-24012600)
chr6 (75-180)||(9049760-9049865)
chr6 (152-251)||(7858639-7858739)
chr6 (152-253)||(7675579-7675681)
chr6 (152-253)||(24012497-24012599)
chr6 (89-183)||(7858636-7858730)
chr6 (75-163)||(4799577-4799665)
chr6 (183-236)||(4799534-4799587)
chr6 (152-236)||(9049763-9049848)
chr6 (152-222)||(4799577-4799648)
chr6 (190-253)||(4997916-4997979)
chr6 (122-183)||(4799528-4799589)
chr6 (184-263)||(7858754-7858832)
chr6 (91-173)||(7675578-7675660)
chr6 (122-183)||(4997927-4997988)
chr6 (213-263)||(24012434-24012484)
chr6 (182-233)||(5986033-5986087)
chr6 (91-186)||(4997659-4997754)
chr6 (76-193)||(5986013-5986134)
chr6 (156-222)||(33033177-33033244)
chr6 (75-133)||(7858591-7858649)
chr6 (106-179)||(14942340-14942413)
chr6 (184-229)||(33033235-33033279)
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (70-263)||(22563895-22564089)
chr7 (75-253)||(3173221-3173400)
chr7 (71-253)||(6723395-6723578)
chr7 (94-263)||(22642031-22642201)
chr7 (75-263)||(42759132-42759321)
chr7 (75-263)||(8919489-8919677)
chr7 (75-232)||(42430579-42430737)
chr7 (91-258)||(18942310-18942478)
chr7 (75-262)||(29036317-29036504)
chr7 (75-253)||(42758940-42759119)
chr7 (91-236)||(48840194-48840340)
chr7 (75-236)||(35127437-35127597)
chr7 (72-263)||(44941188-44941380)
chr7 (75-253)||(18942496-18942675)
chr7 (75-236)||(44448996-44449158)
chr7 (91-263)||(30648218-30648391)
chr7 (122-263)||(45203758-45203900)
chr7 (94-260)||(9907492-9907657)
chr7 (60-253)||(22563688-22563882)
chr7 (75-233)||(9907753-9907912)
chr7 (70-236)||(10096940-10097105)
chr7 (75-229)||(46855221-46855376)
chr7 (94-263)||(35127627-35127797)
chr7 (93-253)||(45443191-45443352)
chr7 (106-253)||(9907673-9907821)
chr7 (94-236)||(45324846-45324989)
chr7 (75-236)||(37043265-37043425)
chr7 (75-236)||(45909893-45910051)
chr7 (90-234)||(47193456-47193601)
chr7 (69-231)||(39304963-39305125)
chr7 (76-254)||(45203567-45203746)
chr7 (92-253)||(44941013-44941175)
chr7 (71-211)||(10470502-10470642)
chr7 (91-234)||(37393333-37393476)
chr7 (91-215)||(48840023-48840147)
chr7 (152-263)||(45443365-45443477)
chr7 (91-183)||(3173563-3173653)
chr7 (91-253)||(29036139-29036303)
chr7 (66-193)||(30648435-30648562)
chr7 (75-169)||(38995235-38995329)
chr7 (152-233)||(42430638-42430720)
chr7 (75-186)||(41718322-41718434)
chr7 (152-234)||(37042992-37043075)
chr7 (91-182)||(48840189-48840280)
chr7 (89-183)||(9907684-9907778)
chr7 (66-183)||(45443386-45443503)
chr7 (170-233)||(3173572-3173636)
chr7 (76-174)||(37042976-37043074)
chr7 (152-236)||(8919738-8919823)
chr7 (185-234)||(22641950-22641999)
chr7 (94-183)||(37393659-37393748)
chr7 (154-253)||(18808102-18808202)
chr7 (91-183)||(45324840-45324932)
chr7 (91-186)||(44449072-44449167)
chr7 (152-233)||(39304986-39305068)
chr7 (94-183)||(18808113-18808202)
chr7 (89-186)||(44449201-44449297)
chr7 (106-179)||(45203783-45203856)
chr7 (75-174)||(22641894-22641998)
chr7 (183-263)||(44449183-44449262)
chr7 (91-179)||(45324574-45324661)
chr7 (154-233)||(47332353-47332432)
chr7 (90-192)||(8919722-8919825)
chr7 (68-193)||(41718004-41718129)
chr7 (183-233)||(30648455-30648505)
chr7 (152-233)||(46855277-46855359)
chr7 (91-199)||(10097021-10097128)
chr7 (152-232)||(45324575-45324655)
chr7 (106-179)||(45909891-45909964)
chr7 (72-192)||(47332331-47332451)
chr7 (152-233)||(48840024-48840105)
chr7 (166-217)||(10470537-10470589)
chr7 (187-246)||(6723275-6723334)
chr7 (124-183)||(35127544-35127603)
chr7 (128-193)||(6723275-6723341)
chr7 (183-228)||(38995235-38995280)
chr7 (91-179)||(37043263-37043350)
chr7 (153-233)||(41718028-41718109)
chr7 (198-253)||(41718105-41718160)
chr7 (177-236)||(42430350-42430409)
chr7 (198-263)||(6723317-6723382)
chr7 (91-183)||(37393392-37393484)
chr7 (91-183)||(47193448-47193540)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (69-263)||(43671175-43671370)
chr2 (91-263)||(28582396-28582569)
chr2 (91-263)||(45638074-45638247)
chr2 (75-253)||(5482870-5483049)
chr2 (70-232)||(15786945-15787106)
chr2 (75-263)||(1039062-1039251)
chr2 (71-263)||(5483062-5483255)
chr2 (75-263)||(11974081-11974270)
chr2 (71-254)||(30512945-30513129)
chr2 (75-253)||(35125510-35125689)
chr2 (64-263)||(28182113-28182313)
chr2 (69-254)||(45638259-45638445)
chr2 (91-259)||(42553621-42553789)
chr2 (66-253)||(1038861-1039049)
chr2 (66-253)||(4603676-4603864)
chr2 (91-236)||(34334544-34334690)
chr2 (71-263)||(33615734-33615926)
chr2 (76-253)||(43671383-43671565)
chr2 (72-253)||(33615939-33616121)
chr2 (117-263)||(4603516-4603663)
chr2 (91-236)||(28182343-28182488)
chr2 (107-232)||(33953425-33953551)
chr2 (122-263)||(34334720-34334862)
chr2 (87-222)||(5247925-5248061)
chr2 (94-253)||(28238702-28238860)
chr2 (91-253)||(5247989-5248150)
chr2 (122-253)||(5248154-5248286)
chr2 (91-236)||(30851219-30851363)
chr2 (139-263)||(44436577-44436702)
chr2 (93-253)||(40343570-40343729)
chr2 (76-233)||(40343708-40343865)
chr2 (71-179)||(15285788-15285896)
chr2 (75-193)||(7881923-7882041)
chr2 (95-183)||(28238450-28238538)
chr2 (75-180)||(7438444-7438549)
chr2 (152-263)||(7438420-7438532)
chr2 (88-179)||(29683588-29683679)
chr2 (152-233)||(7881942-7882024)
chr2 (69-183)||(33953146-33953260)
chr2 (170-263)||(35125404-35125498)
chr2 (152-232)||(29683592-29683673)
chr2 (75-215)||(11973918-11974061)
chr2 (93-173)||(15286086-15286166)
chr2 (152-263)||(30513141-30513252)
chr2 (75-253)||(30823329-30823498)
chr2 (107-186)||(5248162-5248241)
chr2 (166-263)||(36387393-36387492)
chr2 (152-233)||(15285809-15285891)
chr2 (75-192)||(29683885-29684002)
chr2 (152-253)||(30851077-30851179)
chr2 (75-183)||(36387414-36387522)
chr2 (91-183)||(1844502-1844594)
chr2 (170-253)||(7438323-7438407)
chr2 (91-175)||(30513169-30513253)
chr2 (91-183)||(30823639-30823731)
chr2 (75-183)||(30851060-30851168)
chr2 (75-183)||(43865351-43865459)
chr2 (155-233)||(28238450-28238529)
chr2 (152-233)||(1844511-1844593)
chr2 (152-217)||(4603462-4603528)
chr2 (152-233)||(33953169-33953251)
chr2 (91-173)||(33953425-33953507)
chr2 (152-253)||(43865368-43865470)
chr2 (110-183)||(7438323-7438396)
chr2 (153-232)||(15286086-15286166)
chr2 (75-163)||(35125340-35125428)
chr2 (167-233)||(33953484-33953551)
chr2 (152-233)||(5247930-5248012)
chr2 (75-173)||(7881615-7881713)
chr2 (75-215)||(44436417-44436557)
chr2 (122-186)||(44436595-44436659)
chr2 (154-232)||(7881634-7881713)
chr2 (152-222)||(35125357-35125428)
chr2 (106-180)||(28182340-28182413)
chr2 (110-179)||(9144158-9144227)
chr2 (184-233)||(9144163-9144212)
chr2 (152-236)||(29683901-29683985)
chr2 (106-183)||(34334741-34334818)
chr2 (110-183)||(35125404-35125477)
chr2 (154-233)||(11973937-11974017)
chr2 (91-142)||(4603461-4603512)
chr2 (183-222)||(7438308-7438347)
chr2 (122-181)||(34334635-34334694)
chr2 (152-233)||(30823648-30823730)
chr2 (183-221)||(44436466-44436504)
chr2 (183-253)||(44436495-44436564)
chr2 (91-183)||(4603550-4603642)
chr2 (75-186)||(36387260-36387372)
chr2 (198-253)||(29683853-29683908)
chr2 (125-183)||(30851213-30851269)
chr2 (200-233)||(28582602-28582635)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (68-263)||(14336616-14336812)
chr4 (75-253)||(25154725-25154903)
chr4 (75-253)||(14336825-14337004)
chr4 (73-233)||(21956019-21956181)
chr4 (70-253)||(15631571-15631754)
chr4 (68-236)||(25363502-25363672)
chr4 (75-222)||(34979478-34979626)
chr4 (94-263)||(53856659-53856829)
chr4 (67-235)||(18598480-18598649)
chr4 (88-222)||(20421072-20421207)
chr4 (91-263)||(41898133-41898305)
chr4 (91-263)||(50523074-50523247)
chr4 (75-253)||(35778910-35779089)
chr4 (91-253)||(41898318-41898481)
chr4 (71-215)||(5322495-5322640)
chr4 (89-253)||(40998120-40998284)
chr4 (71-262)||(32557049-32557241)
chr4 (153-263)||(13846726-13846837)
chr4 (75-263)||(55358463-55358641)
chr4 (94-263)||(46429733-46429907)
chr4 (75-253)||(29031536-29031715)
chr4 (75-253)||(29043656-29043835)
chr4 (75-253)||(53856467-53856646)
chr4 (70-234)||(6112011-6112177)
chr4 (75-253)||(32557254-32557432)
chr4 (91-211)||(26553921-26554042)
chr4 (88-263)||(6111812-6111979)
chr4 (91-253)||(14966354-14966517)
chr4 (75-183)||(13846594-13846702)
chr4 (66-253)||(32751097-32751284)
chr4 (153-263)||(13864058-13864169)
chr4 (131-253)||(23159089-23159212)
chr4 (106-253)||(13870396-13870543)
chr4 (93-222)||(40289652-40289784)
chr4 (72-193)||(7633024-7633145)
chr4 (139-262)||(25154587-25154711)
chr4 (106-236)||(27389926-27390057)
chr4 (139-253)||(40289592-40289707)
chr4 (152-233)||(21956374-21956456)
chr4 (152-253)||(34508846-34508948)
chr4 (152-233)||(34979495-34979577)
chr4 (170-262)||(20421183-20421276)
chr4 (91-207)||(32751322-32751439)
chr4 (70-236)||(46429933-46430091)
chr4 (69-179)||(27389779-27389889)
chr4 (93-193)||(7632838-7632939)
chr4 (183-263)||(13870556-13870637)
chr4 (166-262)||(27389816-27389913)
chr4 (91-179)||(21956369-21956457)
chr4 (170-253)||(52851114-52851197)
chr4 (117-183)||(21956124-21956190)
chr4 (152-236)||(13846611-13846696)
chr4 (70-179)||(29031258-29031367)
chr4 (70-179)||(29043377-29043486)
chr4 (152-236)||(32751353-32751438)
chr4 (91-183)||(18598205-18598297)
chr4 (89-180)||(25363499-25363590)
chr4 (88-179)||(40998430-40998521)
chr4 (183-233)||(7633044-7633094)
chr4 (152-233)||(15631338-15631420)
chr4 (152-233)||(18598206-18598288)
chr4 (152-233)||(26553959-26554041)
chr4 (152-233)||(29031280-29031362)
chr4 (152-233)||(29043399-29043481)
chr4 (153-233)||(7632838-7632919)
chr4 (198-263)||(7632983-7633048)
chr4 (152-236)||(20421076-20421161)
chr4 (91-179)||(15631337-15631425)
chr4 (75-179)||(52850872-52850976)
chr4 (152-233)||(40998435-40998517)
chr4 (110-183)||(20421183-20421256)
chr4 (153-233)||(40289703-40289784)
chr4 (74-183)||(41511279-41511388)
chr4 (91-183)||(23159109-23159201)
chr4 (89-173)||(34508867-34508951)
chr4 (93-180)||(13864082-13864169)
chr4 (154-233)||(23159048-23159132)
chr4 (66-183)||(3253456-3253574)
chr4 (117-183)||(13846747-13846813)
chr4 (93-183)||(27389920-27390010)
chr4 (91-177)||(34979554-34979640)
chr4 (152-233)||(41511288-41511370)
chr4 (94-163)||(13870627-13870696)
chr4 (94-167)||(14966103-14966176)
chr4 (152-232)||(52850889-52850970)
chr4 (94-225)||(13858879-13859010)
chr4 (91-183)||(18598473-18598565)
chr4 (198-253)||(7632915-7632970)
chr4 (125-183)||(6112003-6112061)
chr4 (184-222)||(13870627-13870665)
chr4 (72-134)||(25154549-25154611)
chr4 (183-232)||(5322548-5322597)
chr4 (154-222)||(14966103-14966172)
chr4 (106-179)||(40289607-40289680)
chr4 (139-183)||(7633004-7633048)
chr4 (91-183)||(25154599-25154691)
chr4 (154-236)||(3253462-3253545)
chr4 (198-253)||(25363300-25363355)
chr4 (198-233)||(35778724-35778759)
chr4 (124-183)||(52851125-52851184)
chr4 (110-179)||(13870581-13870651)
chr4 (198-236)||(40289384-40289422)
chr4 (139-180)||(35778724-35778765)
chr4 (153-186)||(40289398-40289431)
chr4 (139-179)||(7632915-7632955)
chr4 (182-222)||(52851174-52851213)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (66-236)||(202269-202440)
scaffold0016 (125-263)||(202470-202609)
scaffold0016 (91-183)||(202491-202583)
scaffold0016 (91-180)||(202354-202443)
[»] chr5 (72 HSPs)
chr5 (91-263)||(6641985-6642158)
chr5 (75-254)||(2803043-2803223)
chr5 (73-236)||(27318959-27319123)
chr5 (66-253)||(39804924-39805112)
chr5 (75-236)||(1069049-1069208)
chr5 (72-236)||(2802870-2803035)
chr5 (76-236)||(42092170-42092331)
chr5 (91-254)||(2796882-2797046)
chr5 (71-236)||(20429598-20429764)
chr5 (73-262)||(30003994-30004184)
chr5 (72-236)||(2796709-2796874)
chr5 (86-233)||(21250548-21250696)
chr5 (70-253)||(8943136-8943320)
chr5 (91-253)||(1737512-1737675)
chr5 (75-252)||(42375417-42375595)
chr5 (139-263)||(39805125-39805250)
chr5 (66-253)||(6641785-6641972)
chr5 (66-253)||(26006275-26006464)
chr5 (76-253)||(27495880-27496056)
chr5 (139-263)||(27496069-27496194)
chr5 (75-183)||(42091993-42092101)
chr5 (91-229)||(17849669-17849808)
chr5 (76-181)||(28571038-28571142)
chr5 (104-215)||(40807766-40807880)
chr5 (91-183)||(8942879-8942971)
chr5 (76-233)||(1737592-1737750)
chr5 (152-253)||(28574661-28574763)
chr5 (70-183)||(28574672-28574785)
chr5 (152-236)||(42092010-42092095)
chr5 (72-183)||(21250252-21250363)
chr5 (97-182)||(1069281-1069366)
chr5 (66-183)||(18008459-18008576)
chr5 (75-183)||(18008175-18008283)
chr5 (91-182)||(27318954-27319045)
chr5 (152-253)||(18008448-18008550)
chr5 (183-236)||(1069286-1069339)
chr5 (75-207)||(35171687-35171820)
chr5 (91-183)||(2802949-2803041)
chr5 (154-233)||(38085339-38085419)
chr5 (76-183)||(5361493-5361600)
chr5 (154-232)||(13626501-13626579)
chr5 (152-233)||(8942880-8942962)
chr5 (152-233)||(21250272-21250354)
chr5 (66-148)||(27318822-27318904)
chr5 (106-183)||(21250539-21250616)
chr5 (106-215)||(40807917-40808029)
chr5 (94-183)||(42092164-42092253)
chr5 (91-183)||(2796788-2796880)
chr5 (152-253)||(5361482-5361584)
chr5 (152-233)||(28571054-28571135)
chr5 (183-233)||(40807786-40807836)
chr5 (183-233)||(40807961-40808011)
chr5 (198-263)||(40807832-40807897)
chr5 (94-193)||(29440278-29440378)
chr5 (91-183)||(39805146-39805238)
chr5 (91-179)||(42375765-42375853)
chr5 (198-253)||(1069201-1069256)
chr5 (75-163)||(27496139-27496229)
chr5 (153-263)||(29440123-29440234)
chr5 (124-193)||(1069155-1069225)
chr5 (152-233)||(17849725-17849807)
chr5 (152-233)||(18008192-18008274)
chr5 (152-233)||(42375770-42375852)
chr5 (89-186)||(38085327-38085424)
chr5 (91-183)||(27496090-27496182)
chr5 (188-263)||(1737425-1737499)
chr5 (125-186)||(13626488-13626548)
chr5 (122-179)||(20429709-20429766)
chr5 (153-231)||(38085094-38085166)
chr5 (198-253)||(40807910-40807965)
chr5 (93-183)||(29440123-29440213)
chr5 (139-183)||(29440258-29440302)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (75-263)||(60472-60661)
scaffold0051 (91-222)||(60680-60812)
scaffold0051 (167-234)||(60728-60796)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (88-263)||(29987215-29987391)
chr1 (70-236)||(45721123-45721290)
chr1 (67-263)||(41810718-41810915)
chr1 (93-263)||(39834007-39834178)
chr1 (75-253)||(1695706-1695885)
chr1 (75-253)||(48074337-48074515)
chr1 (91-263)||(29386099-29386273)
chr1 (89-233)||(20491959-20492104)
chr1 (76-253)||(1102801-1102980)
chr1 (75-263)||(4765016-4765205)
chr1 (72-236)||(4974820-4974985)
chr1 (86-230)||(18030203-18030347)
chr1 (93-263)||(1102617-1102788)
chr1 (71-212)||(38823704-38823846)
chr1 (78-236)||(29987421-29987580)
chr1 (72-234)||(4764820-4764984)
chr1 (154-263)||(15615382-15615492)
chr1 (90-263)||(43142804-43142978)
chr1 (152-263)||(4964921-4965033)
chr1 (88-231)||(42371668-42371812)
chr1 (106-233)||(49588031-49588159)
chr1 (95-233)||(29386306-29386445)
chr1 (93-253)||(39834191-39834353)
chr1 (152-263)||(18088085-18088197)
chr1 (125-236)||(43142662-43142774)
chr1 (71-232)||(18088231-18088392)
chr1 (70-175)||(5739368-5739473)
chr1 (107-236)||(15615219-15615352)
chr1 (152-233)||(47824479-47824560)
chr1 (91-193)||(49113161-49113264)
chr1 (75-180)||(5739491-5739596)
chr1 (83-232)||(5277299-5277449)
chr1 (152-233)||(5739390-5739472)
chr1 (89-183)||(18088082-18088176)
chr1 (154-254)||(5739476-5739577)
chr1 (106-179)||(15615407-15615480)
chr1 (106-183)||(20491950-20492027)
chr1 (152-236)||(20492016-20492101)
chr1 (94-179)||(32712182-32712267)
chr1 (88-181)||(45721472-45721565)
chr1 (152-236)||(3339155-3339239)
chr1 (154-234)||(41810946-41811026)
chr1 (152-233)||(20491718-20491800)
chr1 (152-233)||(45721479-45721561)
chr1 (91-180)||(4974899-4974988)
chr1 (91-183)||(29987415-29987507)
chr1 (154-232)||(15057243-15057322)
chr1 (94-222)||(18087995-18088127)
chr1 (91-186)||(20491717-20491812)
chr1 (89-183)||(4964918-4965012)
chr1 (205-263)||(4975015-4975073)
chr1 (154-259)||(32712182-32712288)
chr1 (91-183)||(3339149-3339240)
chr1 (106-186)||(29386294-29386374)
chr1 (91-186)||(45721204-45721299)
chr1 (152-253)||(4965046-4965148)
chr1 (89-175)||(47824476-47824561)
chr1 (152-233)||(49113181-49113263)
chr1 (184-233)||(18030242-18030291)
chr1 (166-236)||(18088007-18088079)
chr1 (94-183)||(42371407-42371496)
chr1 (107-183)||(15615282-15615358)
chr1 (91-183)||(39834065-39834157)
chr1 (87-170)||(41810951-41811033)
chr1 (152-246)||(42371713-42371808)
chr1 (151-211)||(49588340-49588402)
chr1 (152-233)||(38823743-38823825)
chr1 (91-180)||(4965060-4965149)
chr1 (106-179)||(43142703-43142776)
chr1 (106-179)||(49588091-49588164)
chr1 (91-183)||(18030268-18030359)
chr1 (76-148)||(41542710-41542782)
chr1 (128-183)||(48074119-48074174)
chr1 (187-233)||(48074119-48074165)
chr1 (75-179)||(41524609-41524711)
chr1 (107-179)||(18030544-18030616)
chr1 (92-183)||(49588310-49588401)
chr1 (152-233)||(15615204-15615289)
chr1 (182-236)||(32712318-32712370)
chr1 (154-232)||(42371407-42371486)
chr1 (152-211)||(41542706-41542766)
chr1 (139-183)||(49113141-49113185)
[»] scaffold0121 (3 HSPs)
scaffold0121 (94-260)||(23847-24014)
scaffold0121 (71-236)||(23648-23814)
scaffold0121 (89-183)||(23865-23959)
[»] scaffold0182 (5 HSPs)
scaffold0182 (75-263)||(22358-22547)
scaffold0182 (71-183)||(23399-23511)
scaffold0182 (152-233)||(23408-23490)
scaffold0182 (91-193)||(22211-22314)
scaffold0182 (152-233)||(22212-22294)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (75-263)||(11714-11905)
[»] scaffold0220 (4 HSPs)
scaffold0220 (70-236)||(21992-22159)
scaffold0220 (75-181)||(21813-21919)
scaffold0220 (152-233)||(21830-21912)
scaffold0220 (106-180)||(21989-22063)
[»] scaffold0179 (5 HSPs)
scaffold0179 (152-263)||(32253-32365)
scaffold0179 (166-236)||(32425-32495)
scaffold0179 (91-179)||(32252-32340)
scaffold0179 (106-193)||(32409-32495)
scaffold0179 (71-134)||(32201-32264)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23275528 - 23275339
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23275528 caaatacctctctagatcctttaagtttaacgtttgtttcatataggtcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttc 23275429  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  23275428 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctattaaatcaactttg 23275339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Original strand, 23403686 - 23403846
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23403686 caaatacctctctagatcctttaagtttaacgtttgtttcaaataggtcctttaagtttctaaagtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttc 23403785  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaagg-tttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23403786 ggataggtcctttaagtttctaaggttttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 23403846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9117868 - 9117692
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-cttt 186  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9117868 ggatcctttaagtttcacatttgtttcagataggtcctttaagtttctaagctttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtccttt 9117769  T
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||    
T  9117768 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaggtttcgagtttgtttcagttaggtcctttctatcaaatcaactttg 9117692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15891932 - 15891761
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtt 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15891932 ctttaagtttaacatttgtttcagatacgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttcagataggtcctttaagtt 15891833  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15891832 tctaaggttttagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcatttctatcaaatcaactttg 15891761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 23403762 - 23403936
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggttt-cggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaa 188  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23403762 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaa 23403861  T
Q  189 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  23403862 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 23403936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Original strand, 15315094 - 15315286
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||    
T  15315094 aggtcaaatatctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatt-ctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgtgtttg 15315192  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15315193 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttatttcggataggtcatttctatcaaatcaactttg 15315286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Original strand, 15495463 - 15495655
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||    
T  15495463 aggtcaaatatctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatt-ctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgtgtttg 15495561  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15495562 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttatttcggataggtcatttctatcaaatcaactttg 15495655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27702714 - 27702526
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  27702714 aaaaaaggtcaaatacctccacgagtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagctcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcga 27702615  T
Q  166 gtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  27702614 gtttgtttcggatcggtcctttaaatttctaaggcttcagataggtcttttaagtttggagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 27702526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 9117500 - 9117679
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||     
T  9117500 caaataccttcccgggtcttttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttt 9117599  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  9117600 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 9117679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Original strand, 29218338 - 29218531
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||    
T  29218338 aggtcaaatacctccctggatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttg 29218437  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  29218438 tttcggataggtcctttaaatttttaaggttttatataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatagatcatttttatcaaatcaactttg 29218531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 1043631 - 1043815
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  1043631 aaggccaaatatctccccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcaaatagatcctttaaatttctaaggtctcagatatgtcctttaagtttggagttt 1043730  T
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  1043731 gtttcagatatgtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcttttctatcaa 1043815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15315467 - 15315299
Alignment:
Q  86 ccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-t 184  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  15315467 ccgggtcctttaagtatcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgttacggataagtcct 15315368  T
Q  185 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  15315367 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 15315299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15495836 - 15495668
Alignment:
Q  86 ccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-t 184  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  15495836 ccgggtcctttaagtatcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgttacggataagtcct 15495737  T
Q  185 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  15495736 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 15495668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Original strand, 29276618 - 29276773
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||     
T  29276618 caaatacctccctggattctttaagtttcatgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttt 29276717  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29276718 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttg 29276773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 236
Target Start/End: Original strand, 28463793 - 28463965
Alignment:
Q  65 taaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcg 164  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |    
T  28463793 taaaataggtcaaatacctccccgagtcctttaagtttcatgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaggtttcagataagtactttaagttttg 28463892  T
Q  165 agtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  28463893 agtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcttttaagtttcgagtttatttcaga 28463965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4157931 - 4157767
Alignment:
Q  96 taagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttct 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  4157931 taagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaaggtttcagatatgttctttaagtttcgagtttgtttgggatatgtcctttaagtttct 4157832  T
Q  195 aaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  4157831 aaggtttcagatatgtc----aagtttcaagtttgtttcagataggtcattgctatcaaatcaactttg 4157767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 24043745 - 24043908
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24043745 tcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggttttagataggtcctttaagtttgaagtttgtttcggataggtcctttaag 24043844  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24043845 tttctaaggtttcaaataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 24043908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 35435327 - 35435498
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtt 191  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  35435327 ctttaaatttcacgtttatttcagatgggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgaatttgtttcagatagatcttttaagtt 35435426  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  35435427 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcctttctatcaaatcaactttg 35435498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24469575 - 24469418
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  24469575 caaatacctccccgggtcctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 24469476  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24469475 ggataggtcctttaagtttttaaggtttcagatatgt-ctttaagtttcaagtttgttt 24469418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 263
Target Start/End: Original strand, 27702355 - 27702513
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcag 204  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27702355 gtttgtttcacatagctcttttaagtttttaaggtttcagatagatcctttaagttttgagtttggttcggataggtactttatgtttctaaggtttcag 27702454  T
Q  205 ataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27702455 ataggtcctttaagtttcgagtttgtttaagatatgtcatttctatcaaatcaactttg 27702513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 38507057 - 38507223
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||| | | ||||||||||||||||||    
T  38507057 ggtcaaatagctccccggatcctttaagtttcatgtttgtctcagatagatcctttaagtttctaagattttagataggtcatttaagtttcgagtttgt 38507156  T
Q  172 ttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    || |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38507157 tttggataggtccttttaaatttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcaga 38507223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7269 - 7127
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7269 tcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagtttcgagtttgttttggatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 7170  T
Q  221 tcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    || |||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||    
T  7169 tcgagtttgtttcagataggtcctttctaccaaatcaactttg 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23404193 - 23404039
Alignment:
Q  69 aaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  23404193 aaaggtcaaatatctccccgggtcctttaagtttcatgtttgtctcagatagatcctttaagttactaaggtttcagatatgttctttaaatttcgagtt 23404094  T
Q  169 tgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23404093 tgtttcggataggtcctttaaatttctaaggtgtcagataggtcctttaagtttc 23404039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35435673 - 35435527
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35435673 tcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaag 35435574  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  35435573 tttctaatgtttcagatagatcctttaattttcgagtttgtttcaga 35435527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 234
Target Start/End: Original strand, 29457112 - 29457277
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  29457112 aggtcaaatacatccccgagtcctttaagtttcatgtttgtttcagataggtcttttaagtttctaagatttcagataggttctttaagtttcgagtttg 29457211  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaag-tttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29457212 tttcggatatgtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagttttcaagtttgtttca 29457277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44318588 - 44318408
Alignment:
Q  74 tcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||   | |||||||||  |||||||||    
T  44318588 tcaaatacctccccgcgttctttaagtttcatgtttgcttcaaatagatcctttaagtttctaatgtttcagatagatcttttaagtttgaagtttgttt 44318489  T
Q  174 cggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  44318488 cggataggtcctttaaatttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 44318408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22445057 - 22444891
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||  |  |||||||||| |||||||    
T  22445057 aggtcaaatacctccccaggttctttaagtttcatgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaggtttaacatgggttctttaagttttgagtttg 22444958  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22444957 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 22444891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 253
Target Start/End: Original strand, 6121495 - 6121684
Alignment:
Q  65 taaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcg 164  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  6121495 taaaataggccaaatacctccccgggtcctttaagtttcatgtttgttttagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcg 6121594  T
Q  165 agtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6121595 agtttgtttcggatagatcctttgagtttgttaggtttcggagagatcctttaagttttgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 6121684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15300989 - 15300852
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15300989 atagatcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatagttcatttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 15300890  T
Q  216 aagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||  |||||||||||||   || |||||||||||    
T  15300889 aagttttgagtttgtttcagataggttatttctatcaa 15300852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15481358 - 15481221
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15481358 atagatcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatagttcatttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 15481259  T
Q  216 aagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||  |||||||||||||   || |||||||||||    
T  15481258 aagttttgagtttgtttcagataggttatttctatcaa 15481221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 15891585 - 15891748
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15891585 tcctttaagtttcatatttgtttcagatagatccttaaagtttctaaggtttcagacaggtcctttaagtttgaagtttgtttcagataggtcctttaag 15891684  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  15891685 tttctaaggttttagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcatttttatcaa 15891748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31827258 - 31827100
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    |||||| || || ||| |||||||||| | |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |    
T  31827258 aaatacatccccagatactttaagtttcatgtttgtttcagatagattttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgttt-g 31827160  T
Q  176 gataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31827159 gataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttatttca 31827100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 4157591 - 4157733
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  4157591 tcctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttcggataggtcctttaaa 4157690  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  4157691 tttctaaggtttaagatagatcctataagtttcgagtttgttt 4157733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1044000 - 1043828
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1044000 tcctttaagtttaacgtttgttttcgataagtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaag 1043901  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||| ||| ||||||  | |||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  1043900 tttctaagattttagatagaccttttaagtttcgagtttgttt-agataagtcttttctatcaaatcaactttg 1043828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Original strand, 2250724 - 2250885
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtt 191  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2250724 ctttaagtttcatgtttgttttatacaggtcctttaagtttttaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctgtaagtt 2250823  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||||||||    
T  2250824 tctaaggttttagatcggtcatttaagtttcgagtttgtatcagataggtcctttctatcaa 2250885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 253
Target Start/End: Original strand, 9778965 - 9779102
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9778965 atagatcctttaagtttctaaagtttcagataagttctttaagttttgagtttgtttcggatatgtcttttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 9779064  T
Q  216 aagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  9779065 aagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 9779102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29276995 - 29276809
Alignment:
Q  68 aaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagt 167  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||    
T  29276995 aaaaggccaaatacctccctgggtcctttaagttttacgtttatttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcaagt 29276896  T
Q  168 ttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
      ||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  29276895 aggtttcagataagacttttaagtttctaaagtttcagatatgtcctttaagttttgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 29276809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Original strand, 1691874 - 1691987
Alignment:
Q  124 ctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1691874 ctttaagtttctaaggtttcggatagatcctttaagtttcgagtttattttggataaatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttc 1691973  T
Q  223 aagtttgtttcaga 236  Q
     |||||||||||||    
T  1691974 gagtttgtttcaga 1691987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 44728107 - 44728232
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| ||||| ||||    
T  44728107 caaatacctctccaggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagacaggtcctttaagtttcaagtttatttc 44728206  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  44728207 ggataggtcctttaagtttctaaggt 44728232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 6930 - 7114
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||||||| | |||| || |||||||||||||| | |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||    
T  6930 aaggtcaagtgcctccccagatcctttaagtttcatgtttgtttcagatatatcttttaagtttctaaggtttcaaataagtcatttaagtttcgagttt 7029  T
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||  |||   | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  7030 gtttcaaatattccatttaagtttctaaggtttcacataagtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2257488 - 2257325
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  2257488 tcctttaagtttcatgtttgttttatacaggtcctttaagcttttaaggtttcagataagtcctttcagtttcgagtttgtttcggataggtcctgttag 2257389  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||   ||| ||||||||||    
T  2257388 tttctaaggtttcagatcggtcatttaaatttcgagtttgtatcagataggtcctttctatcaa 2257325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22780308 - 22780201
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  22780308 tttaagtttcgagtttgtttcggatagatttttaagtttataaggtttcagataggt--tttaagtttcgagtttgtttcaaataggtcatttctatcaa 22780211  T
Q  254 atcaactttg 263  Q
    ||||||||||    
T  22780210 atcaactttg 22780201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31618787 - 31618648
Alignment:
Q  96 taagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgcccttt-aagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttc 193  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  31618787 taagtttcaagtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaataggtccttttaagtttcgagtttgtttcaaatgggtcctttaagtttc 31618688  T
Q  194 taaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31618687 taaagttttagataagtcctttaagtttcgagtttgtttc 31618648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9779227 - 9779115
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    || |||||||    
T  9779227 cctttaagtttcatgtttgttttagataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatagatcctttctat 9779128  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||    
T  9779127 caaatcaactttg 9779115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Original strand, 22444603 - 22444710
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22444603 aaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaagtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcg 22444702  T
Q  176 gataggtc 183  Q
    ||||||||    
T  22444703 gataggtc 22444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42692224 - 42692057
Alignment:
Q  67 aaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcgga---tatgccctttaagtttc 163  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| | |||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||   |||| ||| ||||||      
T  42692224 aaaaaggtcaaataattctccgggtcctttaaatttcatgttt-tttcagatagatcttttaagtttataaggtttcagaagatatgtcctctaagttgt 42692126  T
Q  164 gagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42692125 -agtttgtttcggacaggttctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgttt 42692057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1692287 - 1692171
Alignment:
Q  67 aaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgag 166  Q
    |||||||||||||||||| |    |||||||| ||| || |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1692287 aaaaaggtcaaatacctcccttagtcctttaaatttcacatttgttccaaataggtcctttaagtttataaggtttcagatatgtcctttaagtttcgag 1692188  T
Q  167 tttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||| |||||||||    
T  1692187 tttgttttggataggtc 1692171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6121957 - 6121849
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||| | | | |||||||||||||||||||    
T  6121957 caaatacctctctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggttttagataggtcatataagtttcgagtttgtttc 6121858  T
Q  175 ggataggtc 183  Q
     ||||||||    
T  6121857 agataggtc 6121849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 31826847 - 31826935
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31826847 tcctttaagtttcacgtttattttagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggata 31826935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Original strand, 42691943 - 42692023
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  42691943 ctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcatttctatcaaatcaactttg 42692023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 22444619 - 22444701
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22444619 cctttaagtttcacgtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaagtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttc 22444701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2251167 - 2251050
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||| ||| |||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||||||    
T  2251167 aaaataggccaaatacctccctgagtcctttaagttttacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagtttcagataagtcatttacgtttcga 2251068  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  2251067 gtttgtttcagataggtc 2251050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Original strand, 22780053 - 22780159
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| ||||||    
T  22780053 aaggtcaaatacctccccgggtcatttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtc--ttaagtttggagttt 22780150  T
Q  170 gtttcggat 178  Q
    |||||||||    
T  22780151 gtttcggat 22780159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42620872 - 42620723
Alignment:
Q  90 atcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggtttcggatatgcccttt-aagtttcgagtttgtttcggataggtcttt- 186  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||     
T  42620872 atcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatccttttaagtttttaaagtttcagataggtctttttaagtttcgagtttggttaagatgggtctttt 42620773  T
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42620772 aagtttttaaggtttcagattggtcctttaagtttcgagtatgtttcaga 42620723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 2257068 - 2257160
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2257068 tcctttaagttttacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagtttcagataagtcatttacgtttcgagtttgtttcagataggtc 2257160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11482734 - 11482623
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttca 223  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  11482734 tttaagtttttaaggttttagataagttctttaagtttcaagtttgtttcagataggttctttaagtttttaaggtt-cagataagtcctttaagtttcg 11482636  T
Q  224 agtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||    
T  11482635 agtttgtttcaga 11482623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 15300579 - 15300691
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||| | || | |||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15300579 caaatacctcgctgggttctttaagtttcatgtttgtttcagataggtccttttaagtttctaaagttttagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 15300678  T
Q  174 cggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||    
T  15300679 cggataggtcttt 15300691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 15480948 - 15481060
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||| | || | |||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15480948 caaatacctcgctgggttctttaagtttcatgtttgtttcagataggtccttttaagtttctaaagttttagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 15481047  T
Q  174 cggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||    
T  15481048 cggataggtcttt 15481060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Original strand, 29276636 - 29276716
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29276636 ctttaagtttcatgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgttt 29276716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 31618371 - 31618463
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31618371 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatttctaaggtttcaaataagtcctttaagtttcgagtttgtttggaataggtc 31618463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Original strand, 42691890 - 42692002
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  42691890 aggtcaaatacctcactgggtcatttaagtttcacgtctgttttaaatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttg 42691989  T
Q  171 tttcggataggtc 183  Q
    |||  ||||||||    
T  42691990 ttttagataggtc 42692002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 31826848 - 31826930
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31826848 cctttaagtttcacgtttattttagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 31826930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 44728124 - 44728206
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44728124 cctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagacaggtcctttaagtttcaagtttatttc 44728206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9779228 - 9779139
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9779228 tcctttaagtttcatgtttgttttagataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatag 9779139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15891874 - 15891786
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15891874 tcctttaagtttgaagtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggttttagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagata 15891786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 15300597 - 15300679
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15300597 ctttaagtttcatgtttgtttcagataggtccttttaagtttctaaagttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 15300679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15300955 - 15300864
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    ||||||||||||   |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15300955 tcctttaagtttcgagtttgtttcggatagttcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcagataggt 15300864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 15480966 - 15481048
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15480966 ctttaagtttcatgtttgtttcagataggtccttttaagtttctaaagttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 15481048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15481324 - 15481233
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    ||||||||||||   |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15481324 tcctttaagtttcgagtttgtttcggatagttcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcagataggt 15481233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 4157592 - 4157674
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4157592 cctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 4157674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22444975 - 22444889
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22444975 ctttaagttttgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagata 22444889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24469558 - 24469476
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24469558 cctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 24469476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Original strand, 1691858 - 1691919
Alignment:
Q  167 tttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagttt 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  1691858 tttgtttcggatagatctttaagtttctaaggtttcggatagatcctttaagtttcgagttt 1691919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6121940 - 6121855
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  6121940 cctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggttttagataggtcatataagtttcgagtttgtttcaga 6121855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 31618372 - 31618453
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31618372 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatttctaaggtttcaaataagtcctttaagtttcgagtttgttt 31618453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31618787 - 31618707
Alignment:
Q  156 taagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtccttt-aagtttcaagtttgtttca 234  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31618787 taagtttcaagtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaataggtccttttaagtttcgagtttgtttca 31618707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38507384 - 38507292
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttc 163  Q
    |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  38507384 aggtcaaatatctccttggatcctttaagtttaacgtttgttttaaataggtcgtttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttc 38507292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11482706 - 11482616
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtct 184  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11482706 ctttaagtttcaagtttgtttcagataggttctttaagtttttaaggtt-cagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtct 11482616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2251141 - 2251039
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| |    
T  2251141 cctttaagttttacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagtttcagataagtcatttacgtttcgagtttgtttcagataggtcatttctgt 2251042  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  2251041 caa 2251039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 2257069 - 2257171
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| |    
T  2257069 cctttaagttttacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagtttcagataagtcatttacgtttcgagtttgtttcagataggtcatttctgt 2257168  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  2257169 caa 2257171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44728495 - 44728389
Alignment:
Q  74 tcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||||   || || ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||    
T  44728495 tcaaatacctcaatgggtcatttaagtttcacgtttgtttcagacaagtcctttaagtttttaaggtttcagatagattctttaagtttcgagtttgttt 44728396  T
Q  174 cggatag 180  Q
    |||||||    
T  44728395 cggatag 44728389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35236854 - 35236804
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35236854 ctttaagtttctaaggtttcaaataggtcatttaagtttcaagtttatttc 35236804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Original strand, 1691932 - 1691989
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1691932 tcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagata 1691989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1692230 - 1692181
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1692230 ctttaagtttataaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgttt 1692181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 22780077 - 22780155
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  22780077 tttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtc--ttaagtttggagtttgtttc 22780155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31618716 - 31618639
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31618716 gtttgtttcaaatgggtcctttaagtttctaaagttttagataagtcctttaagtttcgagtttgtttccggtaggtc 31618639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Original strand, 42620485 - 42620554
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42620485 gtttgtttcagatatgtcctttaagtttttaagatttcagataagtcctttaaatttcaagtttgtttca 42620554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 173
Target Start/End: Original strand, 27702398 - 27702482
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||  |||| | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27702398 gatcctttaagttttgagtttggttcggataggtactttatgtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 27702482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 28463881 - 28463969
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatagg 181  Q
    ||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28463881 ctttaagttttgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcttttaagtttcgagtttatttcagatagg 28463969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35435613 - 35435521
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35435613 tcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaagtttctaatgtttcagatagatcctttaattttcgagtttgtttcagataggtc 35435521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44728475 - 44728395
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  44728475 tttaagtttcacgtttgtttcagacaagtcctttaagtttttaaggtttcagatagattctttaagtttcgagtttgtttc 44728395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23404049 - 23404010
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23404049 ctttaagtttctaaggtgtcagataggtcctttaagtttc 23404010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38507363 - 38507292
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38507363 cctttaagtttaacgtttgttttaaataggtcgtttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttc 38507292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Original strand, 42620470 - 42620553
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  42620470 tcctttaaattttacgtttgtttcagatatgtcctttaagtttttaagatttcagataagtcctttaaatttcaagtttgtttc 42620553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23404170 - 23404088
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  23404170 cctttaagtttcatgtttgtctcagatagatcctttaagttactaaggtttcagatatgttctttaaatttcgagtttgtttc 23404088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 2250782 - 2250874
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||  |||  | | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2250782 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctgtaagtttctaaggttttagatcggtcatttaagtttcgagtttgtatcagataggtc 2250874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 179
Target Start/End: Original strand, 38507171 - 38507225
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38507171 tttaaatttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagata 38507225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38507316 - 38507270
Alignment:
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38507316 gtttcagataggttctttaagtttctaaggtttcatataggtccttt 38507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35236856 - 35236799
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  35236856 tcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcatttaagtttcaagtttatttcggata 35236799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 186
Target Start/End: Original strand, 38169776 - 38169809
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38169776 ctttaagtttcgagtttgtttcggatagatcttt 38169809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Original strand, 10820219 - 10820408
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10820219 caaatacctccttggatcctttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatatgttctttaagtttcgagtttgtttc 10820318  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  10820319 ggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 10820408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33623471 - 33623273
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  33623471 aaaaaaggtcaaatacctccctggatcctttaagtttcacgtctgttttagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcga 33623372  T
Q  166 gtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  33623371 gtttgtttcggatatgtcctttaagtttctaagatttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 33623273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13712395 - 13712222
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13712395 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 13712296  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  13712295 tttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 13712222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 11871388 - 11871582
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  11871388 aaggtcaaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtctgtttcagataggtcctttaagtttccaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttt 11871487  T
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||    
T  11871488 gtttcgtataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgttttagataggtcatttctatcaagtcaactttg 11871582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 7515413 - 7515586
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7515413 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagtttcagataagtcctttaagttttgagtttgtttcggataggtcctttaag 7515512  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  7515513 tttctaaggtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtaatttctatcaaatcaactttg 7515586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13658275 - 13658086
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13658275 caaatacctccctgggtcctttaaatttaatgtttgtttcatataagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 13658176  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  13658175 ggataagtcctttaagatttttaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 13658086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 43122605 - 43122777
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata-ggtctttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43122605 tcctttaagtttcacgtttgtttcagatagaccctttaagtttttaaggtttcagataggccctttaagtttcgagtttgtttcggatatgttctttaag 43122704  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||||||||    
T  43122705 tttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagttt-tttcagataggtcctttttatcaaatcaactttg 43122777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 13657893 - 13658073
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  13657893 caaatacctccccgggtactttaagtttcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttggagtttgtttc 13657992  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcc-tttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13657993 agataggtcctttaggtttctaaggtttcagataggtccttttaagtttcgagtttgtttcagatatctcatttctatcaa 13658073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 29777243 - 29777402
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  29777243 caaatacctc-ccgggtcctttacgttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttggagtttgtttc 29777341  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29777342 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttatgtttcgagtttgtttca 29777402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43122973 - 43122809
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccgga-tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| | |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||    
T  43122973 ggtcaaatacctcccccgagtcctttaagtttcatgtttttttcagatagatcgtttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttgtagtttg 43122874  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43122873 tttcggataggtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttca 43122809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 26997211 - 26997383
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26997211 tcctttaagtttcatgtttgtttcaaataggtcctttaagtttctagggtttaagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaag 26997310  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  26997311 tttctaaggttttagataggt-ctctaagtttcgagtttgtttcaaatagttcatttctatcaaatcaactttg 26997383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50293939 - 50293760
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||     
T  50293939 caaatacctcttcgggtcctataagttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttt 50293840  T
Q  175 ggat-aggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  50293839 ggataagccctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcagatatatcaattctatcaa 50293760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 48517926 - 48518088
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||| ||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  48517926 tcctctaagtttcatgtttgttttagatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaaa 48518025  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  48518026 tttctaaggtttcagatagct-ctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 48518088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 13712030 - 13712192
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||   ||||||||||    
T  13712030 caaatacctccccgggtcctttaagttttatgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaagtttcaaataggtcctttaagttggaagtttgtttc 13712129  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13712130 gaataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcaga 13712192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17580172 - 17580010
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||  |||| |   |||||||||||||||| ||||    
T  17580172 caaatacctccccggatcctttaaattttatgtttgttttagatagattttttaagtttctaaggttttagataagttttttaagtttcgagtttatttc 17580073  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17580072 ggatagattctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 17580010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47220592 - 47220434
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  47220592 caaatatctccccggatcgtttaagtttcatgtttgtttaagatagatcctttaagtttctaaggttttagatatgtcctttaagttggaagtttgtttc 47220493  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47220492 ggattggtcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 47220434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52212095 - 52211941
Alignment:
Q  80 acctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||| |||| || ||||||||| | |||||| |   |||| |||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  52212095 acctccccgggtcatttaagtttcatgtttgtctgggatagatcctttaagtttctaaggtttcagatgagtcatttaagtttcgagtttgtttcggata 52211996  T
Q  180 ggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52211995 ggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 52211941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 24097949 - 24098062
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24097949 tcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttggagtttatttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 24098048  T
Q  221 tcaagtttgtttca 234  Q
    || |||||||||||    
T  24098049 tcgagtttgtttca 24098062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Original strand, 47220225 - 47220414
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||   ||   ||||||| |||||||||||||||    
T  47220225 caaatacctctctgggttctttaagtttcacgtttgtttaagataggttctttaagtttctaaagtttcaactaaatcctttaaatttcgagtttgtttc 47220324  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  47220325 ggataggtcctttaagtttttaaggttttagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcacatagatcatttctatcaaatcaactttg 47220414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26997574 - 26997396
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||| |    
T  26997574 aaatacctctctgtgtcctttaagttccatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttgatgtttgttttg 26997475  T
Q  176 gataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  26997474 gataggtcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcatttaagttttgagtttgtttcagataagtcctttctatcaa 26997396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 33623077 - 33623241
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgttt-catatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||| ||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||  ||||||    
T  33623077 ggtcaaataactcccctgatcctttaagtttcatgttttttttcagataaatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttacgtttgtagtttg 33623176  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33623177 tttcgaataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttca 33623241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24098350 - 24098188
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatat--gccctttaagtttcgagt 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |||||  |  ||||||||| | | |    
T  24098350 aaggtcaaatacctctctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagttttagatataggttctttaagttgcaaat 24098251  T
Q  168 ttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttg 229  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  24098250 ttgtttcggatatgtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcatttcagtttcgagtttg 24098188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 31324161 - 31324276
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31324161 tcctttaagtttctaaggttttagataggtcatttaagttttgggtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 31324260  T
Q  221 tcaagtttgtttcaga 236  Q
    || |||||||||||||    
T  31324261 tcgagtttgtttcaga 31324276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 11218079 - 11218245
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | | |    |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11218079 tttaagttttatgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtctt----gtttcgagtttgtttcggataaatcctttaagttt 11218174  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  11218175 ctaaggtttcggataagtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 11218245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24098233 - 24098094
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttca 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24098233 tttaagtttctaaggtttcagataggtcatttcagtttcgagtttgatttagatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcg 24098134  T
Q  224 agtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||    ||  ||||||||||||||||||||    
T  24098133 agtttgtttcaggtaggttttttctatcaaatcaactttg 24098094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29777544 - 29777434
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatca 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  29777544 tttaagtttcgagtttgtttcggatatatcctttaagtttctaaggttttagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatca 29777445  T
Q  253 aatcaactttg 263  Q
    ||| |||||||    
T  29777444 aattaactttg 29777434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11871743 - 11871602
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  11871743 caaatacctccccgggtcctataaattttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttc 11871644  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11871643 ggataactcctttaagtttctaaagtttcagataggtccttt 11871602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54924139 - 54924010
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttca 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  54924139 tttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcgaatagattctttaaatttataaggtttcagatagttccttcaagtttcg 54924040  T
Q  224 agtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  54924039 agtttgtttcagataagtcatttctatcaa 54924010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7515748 - 7515605
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7515748 aaatatctctccgggtcttttaaatttcacgtttgttttaaatagattctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcg 7515649  T
Q  176 gataggt-ctttaagtttcta--aggtttcagataggtccttta 216  Q
    | ||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  7515648 ggtaggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtccttta 7515605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10820536 - 10820421
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    ||||| |||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10820536 gtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgttttggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcaagtttgtttcagat 10820437  T
Q  238 ctgtcatttctatcaa 253  Q
      ||| ||||||||||    
T  10820436 aggtcctttctatcaa 10820421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1772069 - 1771971
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  1772069 caaatacctcactgggtcctttaagtttcacgtttgtttcatataggtcctttaagtttctaaggtttcagata-gtcctttaagtttcaagtttgtttc 1771971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 17579759 - 17579851
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17579759 tcctttaagtttcatgtttgtttcagataggttctttaagtttctaaggtttcagataggtgctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 17579851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11218373 - 11218258
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||     
T  11218373 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagataagtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaaatttcgagtttatttcagat 11218274  T
Q  238 ctgtcatttctatcaa 253  Q
      ||||||||||||||    
T  11218273 aggtcatttctatcaa 11218258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11218450 - 11218318
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtt 191  Q
    |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11218450 ctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaacatgtcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtcctttaagtt 11218351  T
Q  192 tctaag---gtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    || |||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  11218350 tc-aagtttgtttcagataagtcctttaagtttc 11218318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 183
Target Start/End: Original strand, 3750599 - 3750705
Alignment:
Q  78 atacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatg-ccctttaagtttcgagtttgtttcgg 176  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  3750599 atacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcaaataagtctttttaagtttcgagtttgtttcgg 3750698  T
Q  177 ataggtc 183  Q
    |||||||    
T  3750699 ataggtc 3750705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 17579760 - 17579842
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17579760 cctttaagtttcatgtttgtttcagataggttctttaagtttctaaggtttcagataggtgctttaagtttcgagtttgtttc 17579842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Original strand, 25147119 - 25147263
Alignment:
Q  74 tcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||    
T  25147119 tcaaatacctccccgggtcttttaagtttcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagatgagtcctttaagtttcaagtttgttt 25147218  T
Q  174 cggataggt-ctttaagtttcta--aggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||| || | ||||||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  25147219 cggacagttcctttaagtttcgagttagtttcagataggtccttt 25147263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8112924 - 8112808
Alignment:
Q  67 aaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgag 166  Q
    ||||||| ||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  8112924 aaaaaggccaaatacctttatgggtcccttaagtttcacgtttgttttagataggtcctttaaatttctaaggtttcagataagtccttaaagtttcgag 8112825  T
Q  167 tttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||| |||||||||    
T  8112824 tttgttttggataggtc 8112808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48382325 - 48382170
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagttt 192  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  48382325 tttaagtttcatatttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggttttagataagtcctttaactttcgagttagtttcggataggtcctttgagttt 48382226  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttcta 249  Q
    ||||  ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||    
T  48382225 ctaaaatttcagataagt-ttttaagtttcgagtttgttttagataggtcatttcta 48382170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1772052 - 1771970
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1772052 cctttaagtttcacgtttgtttcatataggtcctttaagtttctaaggtttcagatag-tcctttaagtttcaagtttgtttca 1771970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3750939 - 3750869
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3750939 ctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 3750869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52212009 - 52211935
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52212009 gtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatag 52211935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 31324205 - 31324282
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31324205 gtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 31324282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10820524 - 10820432
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| | ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10820524 tcctttaagtttgaagtttgttttggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtc 10820432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 13712106 - 13712198
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13712106 tcctttaagttggaagtttgtttcgaataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 13712198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 25147139 - 25147219
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25147139 tttaagtttcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagatgagtcctttaagtttcaagtttgtttc 25147219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Original strand, 29230912 - 29231023
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaag--gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatc 251  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  29230912 tttaagtttcacgtatgtttcagataggtccttaagtttcgaatttgtttcagatatgtcttttaaatttcgagtttgtttcagatatgtcatttctatc 29231011  T
Q  252 aaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||    
T  29231012 aaatcaactttg 29231023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3750946 - 3750880
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3750946 ataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 3750880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25147502 - 25147420
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25147502 cctttaaatttcgcgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaagatttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttc 25147420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48518342 - 48518256
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48518342 tttaagtttcacgtttgtttcagataagttctttaagtttttaaggtttcagatatgtcctttaaattttgagtttgtttcggatag 48518256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25147503 - 25147414
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25147503 tcctttaaatttcgcgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaagatttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcggatag 25147414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Original strand, 33623172 - 33623249
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33623172 gtttgtttcgaataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcatataggtc 33623249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11218361 - 11218269
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  11218361 tcctttaagtttcaagtttgtttcagataagtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaaatttcgagtttatttcagataggtc 11218269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11218450 - 11218366
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11218450 ctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaacatgtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 11218366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11871712 - 11871644
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11871712 gtttgtttcagatagatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttc 11871644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 24097978 - 24098070
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24097978 tcctttaagtttggagtttatttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcatataggtc 24098070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 29777318 - 29777410
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  29777318 tcctttaagtttggagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttatgtttcgagtttgtttcatataggtc 29777410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43122893 - 43122801
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43122893 tcctttaagtttgtagtttgtttcggataggtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcatataggtc 43122801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7515701 - 7515650
Alignment:
Q  182 tctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7515701 tctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttc 7515650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17580063 - 17580004
Alignment:
Q  124 ctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17580063 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 17580004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29231211 - 29231053
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| || |||| |  ||||||||||||| ||||| |||| |   | |||||||  ||||||||||    
T  29231211 caaataactccccggatcttttaagtttcatgtttgtt-cagatagatt-tttaagtttctaatgtttcagatagg--ttctaagtttgaagtttgtttc 29231116  T
Q  175 ggatagg-tctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  29231115 agataggttctttaagtttctaaagtttcagataggtcatttatgtttcgagtttatttcaga 29231053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 48381893 - 48382003
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||   | |||||||||||||||||||||    
T  48381893 caaatatctatccggatcttttaagtttcacgtttgtttcagatagatcc-ttaagtttttaaggttttagatagatcatttaagtttcgagtttgtttc 48381991  T
Q  175 ggataggtcttt 186  Q
     |||| ||||||    
T  48381992 agatatgtcttt 48382003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 48381912 - 48381994
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  48381912 tttaagtttcacgtttgtttcagatagatccttaagtttttaaggttttagatagatcatttaagtttcgagtttgtttcaga 48381994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 262
Target Start/End: Original strand, 23232291 - 23232366
Alignment:
Q  186 taagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  23232291 taagtttttaaggtttcagataggtt-tttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcttttctatcaaatcaacttt 23232366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24098176 - 24098124
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24098176 tcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 24098124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29777603 - 29777535
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttc 134  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  29777603 aaaataggtcaaatacctctctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcatttaagtttc 29777535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 3750613 - 3750696
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtc-ctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  3750613 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcaaataagtctttttaagtttcgagtttgtttc 3750696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8112896 - 8112818
Alignment:
Q  155 ttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  8112896 ttaagtttcacgtttgttttagataggtcctttaaatttctaaggtttcagataagtccttaaagtttcgagtttgttt 8112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 220
Target Start/End: Original strand, 37148194 - 37148260
Alignment:
Q  155 ttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    |||||||||  ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37148194 ttaagtttcatgtttgtaacagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 37148260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29777516 - 29777455
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29777516 tcctttaagtttctaaggttttagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 29777455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 234
Target Start/End: Original strand, 43389920 - 43389972
Alignment:
Q  182 tctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43389920 tctttaagtttataagatttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttca 43389972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47220573 - 47220493
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  47220573 tttaagtttcatgtttgtttaagatagatcctttaagtttctaaggttttagatatgtcctttaagttggaagtttgtttc 47220493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48518342 - 48518262
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  48518342 tttaagtttcacgtttgtttcagataagttctttaagtttttaaggtttcagatatgtcctttaaattttgagtttgtttc 48518262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Original strand, 1771742 - 1771797
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  1771742 gtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcatttctatcaa 1771797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3750968 - 3750929
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3750968 ctttaagtttctaaggttgcagataggtcctttaagtttc 3750929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 8112544 - 8112627
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8112544 tttaagtttcatgtttgttttagatagatcatttaagtttttaaggttttagattggatctttaagtttcaagtttgtttcaga 8112627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 49122806 - 49122888
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  49122806 tttaaatttcgagtttgtttcagataggtcctttaagtttctaa-gttttagttaagtcctttaagcttcgagtttgattcaga 49122888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29231134 - 29231048
Alignment:
Q  96 taagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  29231134 taagtttgaagtttgtttcagataggttctttaagtttctaaagtttcagataggtcatttatgtttcgagtttatttcagataggt 29231048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 236
Target Start/End: Original strand, 1771714 - 1771749
Alignment:
Q  201 tcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1771714 tcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 1771749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Original strand, 54923738 - 54923837
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||| ||| |||||  ||| |  ||||||||||  |||||||||||    
T  54923738 aaatatctctctggattctttaagttttacgtttgttttaaatagatcctttaaatttttaaagtttcacataagttctttaagttttaagtttgtttcg 54923837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Original strand, 1771724 - 1771766
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1771724 cctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttaagtttc 1771766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10820559 - 10820513
Alignment:
Q  87 cggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagttt 133  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10820559 cggatcctttaagtttcatgtttgtttcagataggtcctttaagttt 10820513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31324520 - 31324478
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagttt 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31324520 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagttt 31324478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Original strand, 37148194 - 37148260
Alignment:
Q  95 ttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtt 161  Q
    |||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  37148194 ttaagtttcatgtttgtaacagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 37148260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45147254 - 45147172
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  45147254 cctttaaatttcacgtttatttcagataggtcttttaaatttctaaggttatagataagtcttttaaatttcaagtttgtttc 45147172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 186
Target Start/End: Original strand, 23232317 - 23232349
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23232317 tttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcttt 23232349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31324501 - 31324457
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31324501 gtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcggataggtc 31324457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37148682 - 37148630
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttc 143  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37148682 tcctttaagtttcacgtttgtaacagttagatcctttaagtttctaaggtttc 37148630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 5985767 - 5985963
Alignment:
Q  68 aaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagt 167  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  5985767 aaaaggtcaaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagttttaagt 5985866  T
Q  168 ttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  5985867 ttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttggtttcagataggtcagttctatcaaatcaactttg 5985963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 4799331 - 4799504
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4799331 tcctttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaagtttcagatatgtcctttaagttttgagtttgtttcggatatgtcatttaag 4799430  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   ||  ||||||||||||||||||||    
T  4799431 tttctaaggtttcagataagtcctttaggtttcgagtttgtttcaaataggtgctttctatcaaatcaactttg 4799504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Original strand, 29134904 - 29135087
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  29134904 aaggccaaatacct-tccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcaaatatgtcctttaagtttcgagttt 29135002  T
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||   ||| ||||||||||    
T  29135003 gtttcggatagatcctttaagtttctaaagtttcagataggtcatttaaatttcaagtttttttcagataggtcctttctatcaa 29135087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33041097 - 33040915
Alignment:
Q  83 tctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||  |    
T  33041097 tctctggatcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttgtaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttcggatatat 33040998  T
Q  183 ---ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
       |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||    
T  33040997 gtcctttaagtttctaaggtttcagatagttcttttaagtttcgagtttgtttcagatagatcatttctataaaatcaacttt 33040915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 14942244 - 14942411
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  14942244 aaggccaaatacctctttgggtcctttaagtttcacgtttgttttagatagatcctttaaatttctaaggtttcagataggtcctttaagattcgagttt 14942343  T
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||    
T  14942344 gtttcgtatatgtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcatttaattttcgagttggtttcaga 14942411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24012600 - 24012508
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24012600 tcctttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtc 24012508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9049865 - 9049760
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||    
T  9049865 caaatacatcttcgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcggataggtcctttaaatttcgaatttgtttc 9049766  T
Q  175 ggatag 180  Q
     |||||    
T  9049765 agatag 9049760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 251
Target Start/End: Original strand, 7858639 - 7858739
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  7858639 cctttaagtttgaagtttgtttcggatagttcctttaagtttctaaggtttcagatgagtcatttaagtttcaagtttgtttcagataggtcatttctat 7858738  T
Q  251 c 251  Q
    |    
T  7858739 c 7858739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 7675579 - 7675681
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggatagg-tctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||    
T  7675579 cctttaagtttcacgtttgtttccgatatgatctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttttaaatatgtcatttctat 7675678  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  7675679 caa 7675681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24012599 - 24012497
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| |||||||    
T  24012599 cctttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtcctttctat 24012500  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  24012499 caa 24012497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 183
Target Start/End: Original strand, 7858636 - 7858730
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7858636 gatcctttaagtttgaagtttgtttcggatagttcctttaagtttctaaggtttcagatgagtcatttaagtttcaagtttgtttcagataggtc 7858730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4799665 - 4799577
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttc 163  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4799665 caaatacctccccgattcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttc 4799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4799587 - 4799534
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4799587 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcaga 4799534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9049848 - 9049763
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  9049848 cctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcggataggtcctttaaatttcgaatttgtttcaga 9049763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4799648 - 4799577
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4799648 cctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttc 4799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4997979 - 4997916
Alignment:
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4997979 tttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 4997916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4799589 - 4799528
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  4799589 tcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtc 4799528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7858832 - 7858754
Alignment:
Q  184 tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||||||    
T  7858832 tttaagtttctaaggtttcagataggt-ctttaagtttagagtttgtttctgataagttctttctatcaaatcaactttg 7858754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Original strand, 7675578 - 7675660
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7675578 tcctttaagtttcacgtttgtttccgatatgatctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 7675660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4997988 - 4997927
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4997988 tccttgaaatttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 4997927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 263
Target Start/End: Original strand, 24012434 - 24012484
Alignment:
Q  213 tttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  24012434 tttaagtttcaagtttgtttcagataggttatttctatcaaatcaactttg 24012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5986087 - 5986033
Alignment:
Q  182 tctttaagtttctaaggtttcagataggtccttta---agtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  5986087 tctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaattagtttgaagtttgtttc 5986033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Original strand, 4997659 - 4997754
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||  |||   | |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  4997659 tcctttaagtttcacgtttgttttaaataaatcctttaagtttttaaggtttcatatagatcttttaaggttcgagtttgttttgaatatgtcttt 4997754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5986134 - 5986013
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgcccttta---agtttcgagtttgtt 172  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |  ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||  |||| | ||||||   |||||  ||||||||    
T  5986134 aaatacctccccagatcctttaagtttcatatttatttcagataaattctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaattagtttgaagtttgtt 5986035  T
Q  173 tcggataggtc-tttaagtttc 193  Q
    ||||||| ||| ||||||||||    
T  5986034 tcggataagtcatttaagtttc 5986013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 33033177 - 33033244
Alignment:
Q  156 taagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33033177 taagtttcacgtttgttttagataggtcatttaagtttctaaggttttacataggtcatttaagtttc 33033244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Original strand, 7858591 - 7858649
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagttt 133  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7858591 caaatacctccccgggtcatttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagttt 7858649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 14942340 - 14942413
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  14942340 gtttgtttcgtatatgtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcatttaattttcgagttggtttcagata 14942413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 33033235 - 33033279
Alignment:
Q  184 tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttg 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33033235 tttaagtttctaaggttttagataggt-ctttaagtttcaaatttg 33033279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22564089 - 22563895
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  22564089 aaggccaaatacctccctgagtcctttaagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagttt 22563990  T
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22563989 gtttcggataggtcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttccgatatgtcctttctatcaaatcaactttg 22563895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 3173221 - 3173400
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3173221 caaatacctcatcgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 3173320  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3173321 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 3173400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6723578 - 6723395
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||    
T  6723578 aggtcaaatacctctccgggtcctttaagttttatgtttgtttcagatagatccgttaagtttctaaggttttagatagatcctttaagtttcgagtttg 6723479  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  6723478 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 6723395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22642201 - 22642031
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22642201 tttaagtttcacgtttgtttcagacaggtcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcatttaagttttgagtttgtttcggataagtcctttaagttt 22642102  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22642101 ttaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcatttctatcaaatcaactttg 22642031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42759321 - 42759132
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  42759321 caaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttatttcatataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttc 42759222  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  42759221 ggataagtcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 42759132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Original strand, 8919489 - 8919677
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  8919489 caaatacctccctggatattttaagtttcacgattatttca-atagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 8919587  T
Q  175 ggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8919588 ggataggtcttttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 8919677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42430737 - 42430579
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42430737 caaattcctccccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 42430638  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  42430637 ggataggtcctttaagtttctaaggtttaagataggtcatttaagtttcgagtttgttt 42430579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 18942310 - 18942478
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatagg-tctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18942310 tcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctgaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcggataggttctttaag 18942409  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaa 258  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18942410 tttctaagttttcagataggtcttttaagttttgagtttgtttcagataagtcatttctatcaaatcaa 18942478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29036504 - 29036317
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  29036504 caaatacctcccagggtcctttaagtttcacatttgtttctgataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtc-tttaagtttcgagtttgtttc 29036406  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  29036405 ggataggccctttaagtttttaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcggattggtcatttctatcaaatcaacttt 29036317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 42758940 - 42759119
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| | || ||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42758940 caaatacctccctgggtcctttaagtttcatgtatgtttcagatagatcttttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 42759039  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  42759040 agataggtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcctttctatcaa 42759119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48840340 - 48840194
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48840340 tcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 48840241  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48840240 tttctaaggttttagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 48840194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 35127437 - 35127597
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| || ||||||||    
T  35127437 caaatacctctccgaatcctctaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataaatcctt-aagttttgaatttgtttc 35127535  T
Q  175 ggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35127536 ggataggtctttaaatttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcaga 35127597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44941380 - 44941188
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||| | |||  || |||| ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  44941380 ggtcaaatacctccctgaatcctttaagtttcacatttgttttagataagtcatttatgttgctaagctttcagataggtcctttaagtttcgagtttgt 44941281  T
Q  172 ttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  44941280 tttggataggtcctttaagtttctaagatttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagatatatcatttctatcaaatcaactttg 44941188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18942675 - 18942496
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  18942675 caaatacctctccggatcctttaagtttcatgtttgtttcagataaatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 18942576  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||  |||  ||||||||||    
T  18942575 ggatagatcctttaagtttctaagatttcagataggtcatttaagtctcgagtttctttcagatatgttctttctatcaa 18942496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 44448996 - 44449158
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44448996 caaatatctccccgggtcctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 44449095  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44449096 ggataagtcctttaagtttctaaggtttcagataagttctttaagtttcgagtttgtttcaga 44449158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 30648218 - 30648391
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30648218 tcctttaagtttcatgtttatgtcagatagatcctttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataagtcctttaag 30648317  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  30648318 cttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgattttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 30648391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45203900 - 45203758
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45203900 tcctttaagtttctaagattttaggtaggtcctttaaatttcgagtttgtttcggatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtt 45203801  T
Q  221 tcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45203800 tcgagtttgtttcagatatgtcatttctatcaaatcaactttg 45203758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 9907492 - 9907657
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttc 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||     
T  9907492 tttaagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaaggttttagataggtcctttaagtttggagtttgtttcggatatgtcctttagtttt 9907591  T
Q  194 taaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaact 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  9907592 taaggtttcagataggtcctttaagttttgag-ttatttcagataggtcctttctatcaaatcaact 9907657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 253
Target Start/End: Original strand, 22563688 - 22563882
Alignment:
Q  60 taatttaaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaag 159  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||||| | |||||||||||| | |||| ||| | |||  || |||||| |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22563688 taattaaaaatatgtcaaatatctctccaggtcctttaagtttcatgtttattttagatatatcatttaaggttctaaggtttcagataggtcctttaag 22563787  T
Q  160 tttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  22563788 tttggagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcttttaagtttcgagtttgtttcagatacgtcctttctatcaa 22563882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9907912 - 9907753
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| |||||||||||    
T  9907912 caaatacctttccggatcttttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaagtttcagataggttatttaagtttggagtttgtttc 9907813  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  9907812 ggataggtcctttaagtttataaggtttcagatagatcctttaagtttgaagtttatttc 9907753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 10096940 - 10097105
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||    
T  10096940 aaggccaaatacctccccagatcatttaagttttatgtttgtttcaaatagatcctttaaatttctaaggtttcagataagtcctttaagttttgagttt 10097039  T
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10097040 gtttc-gataggtcctttaagtttctaagatttcagataagt-ctttaagtttcaagtttatttcaga 10097105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46855376 - 46855221
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  46855376 caaatacctccccgggtcctttaagttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttatgaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 46855277  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttg 229  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46855276 gaataggtcctttaagtttctaagatcccagataggtcctttaagtttcgagtttg 46855221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35127797 - 35127627
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  35127797 tttaagtttcacgtttgttttagatatgtcctttaaatttctaaggtatcagataggtccttttagtttcgagtttgtttaggatgggtcctttaagttt 35127698  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  35127697 ctaatgtttcatataagttctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 35127627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Original strand, 45443191 - 45443352
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtt 191  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||  || ||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45443191 ctttaagtttcatgtctgtttcagataaatcatttaagtttttaaggtttcagatagatcctttaagttccgagtttgtttcggatatgttctttaagtt 45443290  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  45443291 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 45443352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9907821 - 9907673
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcag 204  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9907821 gtttgtttcggataggtcctttaagtttataaggtttcagatagatcctttaagtttgaagtttatttcggataagtcctttaagtttctaaggtttcag 9907722  T
Q  205 ataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9907721 ataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 9907673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45324989 - 45324846
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||||||| | |||| ||| | |||| |||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45324989 tttaagttttatgtttcttttagatagatcctttgagtttctaaagtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttaagttt 45324890  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45324889 ttaaggtttcagataagttctttaagtttcaagtttgtttcaga 45324846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37043425 - 37043265
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  37043425 caaatacctctctgggtcctttaagtttcatatttgtttcagatagatcttttaaatttctaaagtttcagatg-gtcctttaagttttgagtttgtttc 37043327  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  37043326 ggataggttctttaagtttctaaggtttcagataggt-ttttaagtttcgagtttgtttcaga 37043265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45910051 - 45909893
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | |    ||||||||||||||||||    
T  45910051 caaatacctctccggatccttcaagtttcatatttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatgggtc----aagtttcgagtttgtttc 45909956  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    | |||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45909955 gtatagatcctttaagtttctatggttttagataggtccttaaagtttcgagtttgtttcaga 45909893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47193601 - 47193456
Alignment:
Q  90 atcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaa 188  Q
    ||||||||||||| | || ||||| | |||| || ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||    
T  47193601 atcctttaagtttcatgtatgttttagatagatcttttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttatttcggatagatccttcaa 47193502  T
Q  189 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47193501 gtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaaatttgtttca 47193456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 231
Target Start/End: Original strand, 39304963 - 39305125
Alignment:
Q  69 aaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    |||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||    
T  39304963 aaaggtcaaataccttcatgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagatagattctttaagtttttaaggtttcatatagatcctttaagtttcgagtt 39305062  T
Q  169 tgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtt 231  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39305063 tgtttcggatagatcctttacgtttctaaggtttgagataggt-ctttaagtttcgagtttgtt 39305125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 45203567 - 45203746
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||| | |||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||||  |||| |  |||||||||| |||||| |||||    
T  45203567 aaatacatcttcggatcttttaaatttcatgtttatttcagatagatcctttaagattttaaggttttagataagttctttaagttttgagtttatttcg 45203666  T
Q  176 gataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaa 254  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  45203667 gatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcagataagtcctttctatcaaa 45203746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 253
Target Start/End: Original strand, 44941013 - 44941175
Alignment:
Q  92 cctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagt 190  Q
    ||||||||||| | |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||  |||| | | |||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||    
T  44941013 cctttaagtttcatgtttgttttaaatagatcatttaagtttctaaggtttaagataagtcatttaagtttgaagtttatttcggatagatcctttaagt 44941112  T
Q  191 ttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  44941113 ttctaaggtttcagatagatcctttaagttttgagtttgtttcagatacgtcatttctatcaa 44941175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Original strand, 10470502 - 10470642
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||| || | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||    
T  10470502 aggtcaaatacctcccgaggtcctttaagatttatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaa-attcgagtttg 10470600  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtc 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470601 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtc 10470642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Original strand, 37393333 - 37393476
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37393333 tcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctctaagtttttaaggtt-cagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataagtcctttaag 37393431  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
     || | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37393432 atttttaggtttcagataggtcccttaagtttcgagtttgtttca 37393476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 215
Target Start/End: Original strand, 48840023 - 48840147
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  48840023 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatt-ctaaggtttcagataggttctttaaattttgagtttgtttcggatagatcctttaag 48840121  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48840122 tttctaaggtttcagataggtccttt 48840147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45443477 - 45443365
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||    
T  45443477 cctttaagtttcacgtttgttttagataggtcctttaagtttttgaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcatttctat 45443378  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||    
T  45443377 caaatcaactttg 45443365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3173653 - 3173563
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3173653 tcctttaagtt--acgttagtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 3173563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 29036139 - 29036303
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgcccttt-aagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaa 188  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||  |||| | ||||| ||||||  |||||||||  ||||||| ||||||    
T  29036139 tcctttaagtttcatatttgtttcagatatatcctttaagtttcaaaggttttagataagtccttttaagtttgaagtttgtttaagataggttctttaa 29036238  T
Q  189 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  29036239 gtttctaaggtttcaggtaggttctttgagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 29036303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30648562 - 30648435
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |    
T  30648562 aaaaaagttcaaatacctctcagg-tcctttaagtttcatgtgtgtgtcagatagatcctttaagtttccaaggtttcagatatgtcctttaagttttaa 30648464  T
Q  166 gtttgtttcggataggt-ctttaagtttc 193  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30648463 gtttgtttcgaataggtcctttaagtttc 30648435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38995329 - 38995235
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  38995329 caaatacctctctggatcctttaagtttaacatttgttttagttaggtcctttaagtttttaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagttt 38995235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42430720 - 42430638
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42430720 cctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 42430638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41718434 - 41718322
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgcccttt-aagtttcgagtttgttt 173  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41718434 caaatacctctctaggtcctttaagtttcacgtttgttttagataggttctttaaatttataaggttttagatatgtccttttaagtttcgagtttgttt 41718335  T
Q  174 cggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||    
T  41718334 cggataggtcttt 41718322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Original strand, 37042992 - 37043075
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37042992 cctttaagtttcatgtttgtttaggatagatgctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttca 37043075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48840280 - 48840189
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48840280 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggt 48840189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9907778 - 9907684
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9907778 gatcctttaagtttgaagtttatttcggataagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 9907684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45443503 - 45443386
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||| ||| ||||||| || | || |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  45443503 aaaataggccaaatacttccctgggtcctttaagtttcacgtttgttttagataggtcctttaagtttttgaggtttcagataggtcctttaagtttcga 45443404  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  45443403 gtttgttttagataggtc 45443386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3173636 - 3173572
Alignment:
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3173636 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 3173572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 37042976 - 37043074
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||   |||| | |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  37042976 aaatacctctctgggtcctttaagtttcatgtttgtttaggatagatgctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttc 37043074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8919823 - 8919738
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8919823 cctttaagtttcatatttatttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttgaagtttgtttcaga 8919738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 22641950 - 22641999
Alignment:
Q  185 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641950 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttca 22641999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37393748 - 37393659
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37393748 tttaaatttcacgtttgttttagataggtcctttaagtttttaaggtttcggataggtctttaaagtttcgagtttgtctcggataggtc 37393659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18808202 - 18808102
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatca 252  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  18808202 tttaagtttcacgtttgttttagataggtcctttatgtttctaaggttttagatagatcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtcatttctatca 18808103  T
Q  253 a 253  Q
    |    
T  18808102 a 18808102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45324932 - 45324840
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45324932 tcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttaagtttttaaggtttcagataagttctttaagtttcaagtttgtttcagataggtc 45324840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Original strand, 44449072 - 44449167
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44449072 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataagtcctttaagtttctaaggtttcagataagttctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcttt 44449167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 39304986 - 39305068
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39304986 cctttaagtttcacgtttgtttcagatagattctttaagtttttaaggtttcatatagatcctttaagtttcgagtttgtttc 39305068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18808202 - 18808113
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18808202 tttaagtttcacgtttgttttagataggtcctttatgtttctaaggttttagatagatcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtc 18808113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44449297 - 44449201
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44449297 gatcctttaagttttacgtttgttctagataggtcctttaaatttctaaggttttagataggtcc-ttaagtttcgagtttgttttagataggtcttt 44449201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45203856 - 45203783
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45203856 gtttgtttcggatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagata 45203783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 174
Target Start/End: Original strand, 22641894 - 22641998
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcct-----ttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||| |||  ||||     |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  22641894 caaatacctccccgaatcctttatgtttcatgtttgtttcagatacatcctttaagttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttt 22641993  T
Q  170 gtttc 174  Q
    |||||    
T  22641994 gtttc 22641998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44449262 - 44449183
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  44449262 ctttaaatttctaaggttttagataggtcctt-aagtttcgagtttgttttagataggtcttttctatcaaatcaactttg 44449183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 45324574 - 45324661
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||| |||||    
T  45324574 tcctttaagttttacgtttgtttcagatatgtcgtttaagtttctaaggtttcagatatg-tttttaagtttcaagtttgttttggata 45324661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 47332353 - 47332432
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47332353 tttaagtttcatgtttgttttagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggt-ctttaagtttaaagtttgtttc 47332432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8919825 - 8919722
Alignment:
Q  90 atcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaa 188  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||    
T  8919825 atcctttaagtttcatatttatttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttgaagtttgtttcagatagatcctttaa 8919726  T
Q  189 gttt 192  Q
    ||||    
T  8919725 gttt 8919722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 193
Target Start/End: Original strand, 41718004 - 41718129
Alignment:
Q  68 aaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgag 166  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||| | | |||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||| | ||  | |||||||||||||||    
T  41718004 aaaaggtcaaatacat-tccggtttctttaagtatcatgtttgtttcagatagatctttttaagtttcaaaggtttag-atgggtcctttaagtttcgag 41718101  T
Q  167 tttgtttcggataggt-ctttaagtttc 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41718102 tttgtttcggataggtcctttaagtttc 41718129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30648505 - 30648455
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30648505 ctttaagtttccaaggtttcagatatgtcctttaagttttaagtttgtttc 30648455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46855359 - 46855277
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46855359 cctttaagttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttatgaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 46855277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 10097021 - 10097128
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  10097021 tcctttaagttttgagtttgtttcg-ataggtcctttaagtttctaagatttcagataagtc-tttaagtttcaagtttatttcagataggtcctttaag 10097118  T
Q  190 tttctaaggt 199  Q
    ||||||||||    
T  10097119 tttctaaggt 10097128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 45324575 - 45324655
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  45324575 cctttaagttttacgtttgtttcagatatgtcgtttaagtttctaaggtttcagatatgt-ttttaagtttcaagtttgttt 45324655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45909964 - 45909891
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45909964 gtttgtttcgtatagatcctttaagtttctatggttttagataggtccttaaagtttcgagtttgtttcagata 45909891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 47332331 - 47332451
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    |||||||||||| | | | || ||||||||| | |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||    
T  47332331 ggtcaaataccttttcaggtcgtttaagtttcatgtttgttttagatagatcatttaagtttctaaggtttcagata-ggtctttaagtttaaagtttgt 47332429  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagttt 192  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  47332430 ttcgaataggtcctttaagttt 47332451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 48840024 - 48840105
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  48840024 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaattctaaggtttcagataggttctttaaattttgagtttgtttc 48840105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 217
Target Start/End: Original strand, 10470537 - 10470589
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaa 217  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470537 gtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaa 10470589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 246
Target Start/End: Original strand, 6723275 - 6723334
Alignment:
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcattt 246  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  6723275 aagtttttaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttaagatatgtcattt 6723334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 183
Target Start/End: Original strand, 35127544 - 35127603
Alignment:
Q  124 ctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35127544 ctttaaatttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 35127603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 6723275 - 6723341
Alignment:
Q  128 aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttc 193  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  6723275 aagtttttaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttaagatatgtcatttaagtttc 6723341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38995280 - 38995235
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagttt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38995280 ctttaagtttttaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagttt 38995235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37043350 - 37043263
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37043350 tcctttaagttttgagtttgtttcggataggttctttaagtttctaaggtttcagataggtt-tttaagtttcgagtttgtttcagata 37043263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 41718028 - 41718109
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt--aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41718028 ctttaagtatcatgtttgtttcagatagatctttttaagtttcaaaggttt-agatgggtcctttaagtttcgagtttgtttc 41718109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Original strand, 41718105 - 41718160
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  41718105 gtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcatatatgtcaattctatcaa 41718160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Original strand, 42430350 - 42430409
Alignment:
Q  177 ataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  42430350 ataggtctttaagtttttaagattttagataggtcttttaagtttcgagttaatttcaga 42430409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Original strand, 6723317 - 6723382
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6723317 gtttaagatatgtcatttaagtttcgagtttgtttaagatatgtcctttctttcaaatcaactttg 6723382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 37393392 - 37393484
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||  ||||||||| || | ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37393392 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataagtcctttaagatttttaggtttcagataggtcccttaagtttcgagtttgtttcaaataggtc 37393484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47193540 - 47193448
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  47193540 tcctttaagtttcgagtttatttcggatagatccttcaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaaatttgtttcatataggtc 47193448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 263
Target Start/End: Original strand, 43671175 - 43671370
Alignment:
Q  69 aaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||  ||||   |||||||||||||||||    
T  43671175 aaaggccaaatacctccctggatcctttaagtttcacgtttgtttcaaataggtcctttaaatttttaaggttttagatagatcctttaagtttcgagtt 43671274  T
Q  169 tgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  43671275 tgtttcggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcaagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 43671370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 28582396 - 28582569
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28582396 tcctttaagtttcacgtttgtttcagatgggtcctttacgtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 28582495  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28582496 tttctatggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 28582569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 45638074 - 45638247
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45638074 tcctttaagtttcatgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaacgtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 45638173  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  45638174 tttctaaagtttcagataggtcctttaagattcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 45638247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 5482870 - 5483049
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||    
T  5482870 caaatacctctccggatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtgttttaagtttcgagtttgtttc 5482969  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  5482970 ggatagatcctttaagtttataaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcatttctatcaa 5483049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15787106 - 15786945
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15787106 aaggtcaaatacctccccgggtcctttaaatttcatgtttgtttcaaatagatcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagttt 15787007  T
Q  170 gtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15787006 gtttaggataggt-tttaagtttctaaagttttagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 15786945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1039251 - 1039062
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||  |  |||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1039251 caaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataaattttttaggtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 1039152  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1039151 ggatatgtcctttaagtttctaaggttacagatatgtcctttatgtttcaagtttgtttcagatatgtcatttctatcaaatcaactttg 1039062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5483255 - 5483062
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  5483255 aggtcaaatacctctctgagtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttccaaggtttcagataagtcctttaagtgtcgagtttg 5483156  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5483155 ttttaaataggtcctttaagtttctacggtttcatataggtcctttaagttttgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 5483062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11974270 - 11974081
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  11974270 caaatacctctctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcttttaagtttataaggtttcagataaatcctttaaatttcgagtttgtttc 11974171  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||    
T  11974170 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatgaaatcaactttg 11974081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 254
Target Start/End: Original strand, 30512945 - 30513129
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| |||||||    
T  30512945 aggtcaaatacctctccgagtcctttaagtttcttgtttgtttcagatagattctttaagtttctaaggtttaagatagatcctttaagtttggagtttg 30513044  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaa 254  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30513045 tttcggataggtcctttatgtttctaaggtttcagataggtcctttaaggttcgagtttgtttcagatatgtcatttctatcaaa 30513129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35125689 - 35125510
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  35125689 caaatacctccccggatccattaagtttcatgtttatttcacatagatcatttaagtttctaaggtttcagataagtgctttaagtttcgagtttgtttc 35125590  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  35125589 ggataggtcctttaaatttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 35125510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 263
Target Start/End: Original strand, 28182113 - 28182313
Alignment:
Q  64 ttaaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttc 163  Q
    |||||| |||| |||||||||   || |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||     
T  28182113 ttaaaataggttaaatacctcaatgggtcctttaagttttacgtttgtttcaaataggtc-tttaaatttctaaggttttagatatgtcctttaagtttg 28182211  T
Q  164 gagtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactt 261  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  28182212 aagtttgtttcggatatgtccttttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgttttagattggtcatttctatcaaatcaactt 28182311  T
Q  262 tg 263  Q
    ||    
T  28182312 tg 28182313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45638445 - 45638259
Alignment:
Q  69 aaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    ||||| ||||||| || || | |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| | |||||    
T  45638445 aaaggccaaatacatccccaggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagtatggagtt 45638346  T
Q  169 tgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaa 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  45638345 tgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcctttctatcaaa 45638259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42553789 - 42553621
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42553789 tcctttaagtttcacatttgtttcagataggtcatttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt-ggataggtcctttaag 42553691  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaac 259  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  42553690 tttctaaagtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaac 42553621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Original strand, 1038861 - 1039049
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||||||||| ||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||| ||    
T  1038861 aaaaaaggtcgaatacctcttcaggttctttaagtttcacgtttatttcagatagatcctttaagtttttaaagtttcagatagatcctttaagtttgga 1038960  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  1038961 gtttgtttcggataggtcatttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttccagtttgtttcggataggtcatttctatcaa 1039049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4603864 - 4603676
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||    
T  4603864 aaaaagggtcaaataccttcccggatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcatttaagtttcga 4603765  T
Q  166 gtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  4603764 gtttgtatcagataagtcctttaagtttctaatgtttcagataggtcctttaagtttctagcttgtttcagataggtcttttctatcaa 4603676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 34334544 - 34334690
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  34334544 tcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttgggatatgtcctttaag 34334643  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34334644 tttctaaggtttcagataggtcatttaagtttctagtttgtttcaga 34334690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Original strand, 33615734 - 33615926
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||  |||   ||||||| |||||||||||    
T  33615734 aggtcaaatacttctctgg-tcctttaagtttcacgtttatttcagataagttctttaagtttctaaggtttcatatagatcctttaaatttcgagtttg 33615832  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  33615833 tttcggataggtcctttaaatttttaaggtttcatataggtcctttaagttttgagtttgtttgagataggtcatttctatcaaatcaactttg 33615926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 43671565 - 43671383
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttca----tatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |    ||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||  |||||||    
T  43671565 aaatacctctccggatcctttaagtttcatgtttattttagatatatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttgaagtttgt 43671466  T
Q  172 ttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  43671465 ttcgaataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaaatttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 43671383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33616121 - 33615939
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||    
T  33616121 ggtcaaatatctcttcggctcatttaagtttcatgtttgttttagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtactttaagttttgagtttgt 33616022  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||   ||||||||||||||    
T  33616021 ttcggataggtccttaaaatttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgaatttgttttagataggtcatttctatcaa 33615939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 263
Target Start/End: Original strand, 4603516 - 4603663
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4603516 ataggtcctttaaatttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttctttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggttcttt 4603615  T
Q  216 aagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    || |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  4603616 aattttcgagtttgtttcagttaggtcatttctatcaaatcaactttg 4603663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28182488 - 28182343
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  28182488 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcttttaagtttggagtttgtttcagatatgtcctttaag 28182389  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  28182388 tttctaaggtttcagata-gttctttaagtttcgagtttgtttcaga 28182343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33953551 - 33953425
Alignment:
Q  107 tttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcaga 205  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33953551 tttgtttcagatagatcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcaga 33953452  T
Q  206 taggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||    
T  33953451 taagccctttaagcttcgagtttgttt 33953425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34334862 - 34334720
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34334862 tcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcgtataagtcatttaagtttctaaggttttagatatgtcctttaagtt 34334763  T
Q  221 tcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||    
T  34334762 tcaaatttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaattttg 34334720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 5247925 - 5248061
Alignment:
Q  87 cggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctt 185  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||  || |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||| | |||    
T  5247925 cggatcctttaagttttatgtttgtttcagataaatcatttaagtttcgaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttcggatagatcctt 5248024  T
Q  186 taagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5248025 taagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 5248061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28238860 - 28238702
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  28238860 tttaagtttcatgtttgtttcagatagatc-tttaagtttttaagatttcagataggtcctttcagtttcgagtt-gtttcgcataggtcctttaagttt 28238763  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  28238762 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 28238702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 5247989 - 5248150
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |    ||||| ||||  || ||||||    
T  5247989 tcctttaagtttgaagtttgtttcggatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttctaag--gtttcagataaatcctttaag 5248086  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  5248087 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 5248150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5248286 - 5248154
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 220  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5248286 tcctttaaatttccaaggtttcaaataggtcttttaagtttcgaatttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtt 5248187  T
Q  221 tcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    || |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  5248186 tcgagtttgtttcagataggtcttttctatcaa 5248154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30851363 - 30851219
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcata-tagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  30851363 tcctttaagtttaacgtttgtttcagaatatgtcctttaaatttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttt-tttcggatagatcatttaa 30851265  T
Q  189 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  30851264 gtttctaaggtttcagataggaccttta--tttcgagtttgtttcaga 30851219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44436702 - 44436577
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  44436702 gtttcagataggtcctttatgtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaaat 44436603  T
Q  238 ctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
      ||| ||||||||||||||||||||    
T  44436602 aggtcttttctatcaaatcaactttg 44436577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40343729 - 40343570
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagttt 192  Q
    ||||||||||   |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||  ||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40343729 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtgctttaagtttctaaggttttagatagatcctttaagtatcgagtttgtttcgaataggt-tttaagttt 40343631  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  40343630 ctaaagtttcagatagttcctttaagtttcgagtttgtttcaaataagtcatttctatcaa 40343570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40343865 - 40343708
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||||   ||| |||||| | ||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||      
T  40343865 aaataccttcccgaatcctttaagtttcatgtttgtttctggtagatccttttaatttctaaggttttagataggtcctttaagttttgagtttgtttta 40343766  T
Q  176 gataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40343765 gataggtgctttaagtttctaaggtttcagataggt-ctttaagtttcgagtttgtttc 40343708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Original strand, 15285788 - 15285896
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  15285788 aggtcaaatacctctccgggtcctttaagtttcaggtttgtttcagataggtcatgtaagtttctaaggcttcagataggtcctttaagtttcgagtttg 15285887  T
Q  171 tttcggata 179  Q
    |||||||||    
T  15285888 tttcggata 15285896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7882041 - 7881923
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||   |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7882041 caaatacctccccgagtcctttaagtttcgtgtttttttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 7881942  T
Q  175 ggataggtctttaagtttc 193  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  7881941 ggataggtctttaattttc 7881923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Original strand, 28238450 - 28238538
Alignment:
Q  95 ttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238450 ttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggttttagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 28238538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7438549 - 7438444
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  7438549 caaatatctctccgggtcctttaagtttcacgtttgttttagataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttc 7438450  T
Q  175 ggatag 180  Q
     |||||    
T  7438449 agatag 7438444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7438532 - 7438420
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    || |||||||    
T  7438532 cctttaagtttcacgtttgttttagataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcagatagatcctttctat 7438433  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    ||||| |||||||    
T  7438432 caaataaactttg 7438420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 179
Target Start/End: Original strand, 29683588 - 29683679
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29683588 ggatcctttaaatttcacgtttgtttcagataggttctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttttggata 29683679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7882024 - 7881942
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7882024 cctttaagtttcgtgtttttttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 7881942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Original strand, 33953146 - 33953260
Alignment:
Q  69 aaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  33953146 aaaggtcaaataccttccagggtcctttaagtttcaattttgtttcagataggccctttaagtttctaaagtttcagataggtcttttaagtttcgagtt 33953245  T
Q  169 tgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||||    
T  33953246 tgtttcggataggtc 33953260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 263
Target Start/End: Original strand, 35125404 - 35125498
Alignment:
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  35125404 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatgggtcatttaagtttcgagtttatttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 35125498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 29683592 - 29683673
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29683592 cctttaaatttcacgtttgtttcagataggttctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 29683673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 11973918 - 11974061
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||  ||||||||||    
T  11973918 caaatacctccccggatcatttaagtttcatgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaggtttcagataagtcttttaaatttgaagtttgtttc 11974017  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttcta--aggtttcagataggtccttt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  11974018 ggatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtccttt 11974061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15286166 - 15286086
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15286166 ctttaagtttcatgtttgtttcatatagatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 15286086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30513252 - 30513141
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||| |    
T  30513252 cctttaagtttcacgtttgtttcagatgagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttc-gataggtcatttctct 30513154  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||    
T  30513153 caaatcaactttg 30513141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 30823329 - 30823498
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | || || || | |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||          ||||||||||||||||    
T  30823329 caaacacctctccggatcctttaagtttcatgtctgatttagatagatccttaaagtttttaaggtttcagata----------gtttcgagtttgtttc 30823418  T
Q  175 ggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  30823419 ggatatgtcttttaagtttttaaggtttcagattaatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 30823498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5248241 - 5248162
Alignment:
Q  107 tttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5248241 tttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcttt 5248162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36387492 - 36387393
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaagg-tttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  36387492 gtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagatttcagatatgtcttttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 36387393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 15285809 - 15285891
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctt-taagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15285809 cctttaagtttcaggtttgtttcagataggtcatgtaagtttctaaggcttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 15285891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29684002 - 29683885
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29684002 caaatacctcccggggtcctttcagtttcatgtttgtttcagatagatactttaagtttc-aagatttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttc 29683904  T
Q  175 ggataggt-ctttaagttt 192  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  29683903 agataggtcctttaagttt 29683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 30851077 - 30851179
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  30851077 cctttaagtttcatatttgtttcagatagatcctttaagtttttaacgtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtcctttctat 30851176  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  30851177 caa 30851179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36387522 - 36387414
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaagg-tttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36387522 caaatacctctctgg-tccattaaatttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaagatttcagatatgtcttttaagtttcgagtttgttt 36387424  T
Q  174 cggataggtc 183  Q
    | ||||||||    
T  36387423 cagataggtc 36387414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1844594 - 1844502
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1844594 tcctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatcggtcctttaagtttgaagtttgtttcggataggtc 1844502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 253
Target Start/End: Original strand, 7438323 - 7438407
Alignment:
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  7438323 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 7438407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30513253 - 30513169
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  30513253 tcctttaagtttcacgtttgtttcagatgagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcg 30513169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30823731 - 30823639
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30823731 tcctttaagttttacgtttgttttagatagatcatttaattttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttatttcggataggtc 30823639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 30851060 - 30851168
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  30851060 caaataccttcccgggtcctttaagtttcatatttgtttcagatagatcctttaagtttttaacgtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 30851159  T
Q  175 ggataggtc 183  Q
     ||||||||    
T  30851160 agataggtc 30851168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 43865351 - 43865459
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  43865351 caaatacctacccgggtcctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcttttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgattttgtttc 43865450  T
Q  175 ggataggtc 183  Q
     ||||||||    
T  43865451 agataggtc 43865459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 233
Target Start/End: Original strand, 28238450 - 28238529
Alignment:
Q  155 ttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28238450 ttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggttttagataagtcctttaagtttcgagtttgtttc 28238529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1844593 - 1844511
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1844593 cctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatcggtcctttaagtttgaagtttgtttc 1844511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 217
Target Start/End: Original strand, 4603462 - 4603528
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaa 217  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4603462 cctttaagtttcacgtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaa 4603528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 33953169 - 33953251
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33953169 cctttaagtttcaattttgtttcagataggccctttaagtttctaaagtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttc 33953251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33953507 - 33953425
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33953507 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagccctttaagcttcgagtttgttt 33953425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 43865368 - 43865470
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||| |||||||    
T  43865368 cctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcttttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgattttgtttcagataggtcctttctat 43865467  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  43865468 caa 43865470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Original strand, 7438323 - 7438396
Alignment:
Q  110 gtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7438323 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 7438396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15286166 - 15286086
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15286166 ctttaagtttcatgtttgtttcatatagatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttt 15286086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Original strand, 35125340 - 35125428
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttc 163  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  35125340 caaatacctccctgggtcctttaagtttaatgtttgtttcagatcggtcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttc 35125428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33953551 - 33953484
Alignment:
Q  167 tttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33953551 tttgtttcagatagatcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 33953484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 5247930 - 5248012
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5247930 cctttaagttttatgtttgtttcagataaatcatttaagtttcgaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttc 5248012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Original strand, 7881615 - 7881713
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  7881615 caaatatctctctagatcatttaagtttcacgtttgtttcaaataggccttttaaatttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgttt 7881713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 44436417 - 44436557
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||  |||| |||||||| ||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |    |||||    
T  44436417 caaataccttcccgggtcctttaaatttcatgtttttttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagttttta--aggtttc 44436514  T
Q  175 ggataggtctttaagtttcta--aggtttcagataggtccttt 215  Q
     |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  44436515 agatatgtctttaagtttctagtttgtttcagataggtccttt 44436557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44436659 - 44436595
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44436659 tcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaaataggtcttt 44436595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 7881634 - 7881713
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7881634 tttaagtttcacgtttgtttcaaataggccttttaaatttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgttt 7881713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 35125357 - 35125428
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35125357 cctttaagtttaatgtttgtttcagatcggtcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttc 35125428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28182413 - 28182340
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28182413 gtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttcagata-gttctttaagtttcgagtttgtttcagatag 28182340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9144227 - 9144158
Alignment:
Q  110 gtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9144227 gtttcaaataggtcttttaagtttctatggtttcagataggtcctctaagtttcgagtttgtttcggata 9144158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9144212 - 9144163
Alignment:
Q  184 tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9144212 tttaagtttctatggtttcagataggtcctctaagtttcgagtttgtttc 9144163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29683985 - 29683901
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29683985 cctttcagtttcatgtttgtttcagatagatactttaagtttc-aagatttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 29683901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34334818 - 34334741
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  34334818 gtttgtttcgtataagtcatttaagtttctaaggttttagatatgtcctttaagtttcaaatttgtttcagataggtc 34334741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Original strand, 35125404 - 35125477
Alignment:
Q  110 gtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35125404 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatgggtcatttaagtttcgagtttatttcagataggtc 35125477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 11973937 - 11974017
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  11973937 tttaagtttcatgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaggtttcagataagtcttttaaatttgaagtttgtttc 11974017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 142
Target Start/End: Original strand, 4603461 - 4603512
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggttt 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  4603461 tcctttaagtttcacgtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttt 4603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 7438308 - 7438347
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7438308 ctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttc 7438347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 181
Target Start/End: Original strand, 34334635 - 34334694
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatagg 181  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34334635 tcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttctagtttgtttcagatagg 34334694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30823730 - 30823648
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||   ||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  30823730 cctttaagttttacgtttgttttagatagatcatttaattttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttatttc 30823648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Original strand, 44436466 - 44436504
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44436466 ctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagttt 44436504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 253
Target Start/End: Original strand, 44436495 - 44436564
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  44436495 ctttaagtttttaaggtttcagatatgtc-tttaagtttctagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 44436564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 4603550 - 4603642
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  4603550 tcctttaagtttcgagtttctttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggttctttaattttcgagtttgtttcagttaggtc 4603642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 36387260 - 36387372
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgag-tttgttt 173  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||    
T  36387260 caaatacctcttcgggttttttaagtttcatgtttgtgtcagatagatcctttaagttttcaagatttcagataggttctttaagtttcgagtttttttt 36387359  T
Q  174 cggataggtcttt 186  Q
    | |||||||||||    
T  36387360 cagataggtcttt 36387372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29683908 - 29683853
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  29683908 gtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 29683853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30851269 - 30851213
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30851269 tttaagtttctaaggtttcagataggaccttta--tttcgagtttgtttcagataggtc 30851213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28582635 - 28582602
Alignment:
Q  200 ttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28582635 ttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 28582602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 14336616 - 14336812
Alignment:
Q  68 aaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagt 167  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  14336616 aaaaggtcaaatacctccctaggtcctttaagttttacgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagt 14336715  T
Q  168 ttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  14336716 ttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttctttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 14336812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25154903 - 25154725
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || | | |||||||| || |||||||||||    
T  25154903 caaatacctccccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagacaggtcctttaagattagagtttgtttc 25154804  T
Q  175 ggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  25154803 ggataggtccttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 25154725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14337004 - 14336825
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||||||    
T  14337004 caaatacctccccaggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatgggtcctttaagtttgaagtttgtttc 14336905  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  14336904 ggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 14336825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 21956019 - 21956181
Alignment:
Q  73 gtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg-t 171  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  21956019 gtcaaatatctccctggatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtt 21956118  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21956119 ttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 21956181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15631754 - 15631571
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  15631754 aaggccaaataccttcccgg-tcctttaagtttcatgtttgtttcacatagatcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttt 15631656  T
Q  170 gtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  15631655 gtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcaaatgggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcttttctatcaa 15631571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25363672 - 25363502
Alignment:
Q  68 aaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttc--ctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  25363672 aaaaggccaaatacctctc-ggatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatctcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcga 25363574  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25363573 gtttgtttcgaatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 25363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 34979478 - 34979626
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34979478 caaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 34979577  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979578 gaataagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 34979626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 53856829 - 53856659
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagttt 192  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  53856829 tttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtgtcgagtttgtttcggataggtcctttaaattt 53856730  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||  ||||| ||||||||||||    
T  53856729 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaactttgtttcaaataggtcacctctattaaatcaactttg 53856659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18598649 - 18598480
Alignment:
Q  67 aaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgag 166  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18598649 aaaaaggccaaatacctccccgggtcctttaagtttcaagtttgttttagataggtcctctaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgag 18598550  T
Q  167 tttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcag 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  18598549 tttgtttcggataggtcctttaagtttcaaaggtttcagataagtcctttaagttttgattttgtttcag 18598480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 20421072 - 20421207
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-cttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20421072 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaaatttcatataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtccttt 20421171  T
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20421172 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 20421207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 41898133 - 41898305
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41898133 tcctttaagtttcacgtttgtttcagatgggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtt-tttaagtttcgagtttgtttcggatagatcctttaag 41898231  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||| |||||||    
T  41898232 tttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcttttatatcaaataaactttg 41898305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 50523074 - 50523247
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  50523074 tcctttaagtttcacgtttgttttagataggtcatttaagtttctatggtttcggatagattctttaagtttcgagtttgtttcggatagatcctttaag 50523173  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  50523174 tttctaaggtttcagataagtcctttaaattttgagtttgtttcagataggtaatttctatcaaatcaactttg 50523247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35779089 - 35778910
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  35779089 caaatatctctctggatcctttaagtttcatgtttgttttcgatagatcctttaagtttttaaggtttcagataagtcatttaagtttcgagtttgtttc 35778990  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
     ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  35778989 agataggtcctttaaatttccaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 35778910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41898481 - 41898318
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  41898481 tcctttaaatttcatgtttgtttcatatagattctttcagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatagatcatttaag 41898382  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  41898381 tttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgttttagatatgtcctttctatcaa 41898318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 5322495 - 5322640
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||    
T  5322495 aggtcaaatacctccccggatcctttaagtttcatgtttgtttaaaatagatcctttaaatttctaaggttgcagataggtcctttaagttttgagtttg 5322594  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtccttt 215  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5322595 ttttggataggtcctttaaatttctaaggtttcagataggtccttt 5322640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 253
Target Start/End: Original strand, 40998120 - 40998284
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-cttta 187  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| | |||| || |||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40998120 gatcctttaaatttcatgtttgttttagatagatcttttaagttactaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtccttta 40998219  T
Q  188 agtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  40998220 ag-ttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 40998284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 262
Target Start/End: Original strand, 32557049 - 32557241
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||  ||| | | ||||| |||  ||||||    
T  32557049 aggtcaaataccttcctagatcctttaaatttcacgtttgttttagataggtcctttaaatttctaaagtttcaaataagtcttttaaattttaagtttg 32557148  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  32557149 tttcggatagatcctttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaaatttcaagtttgtttcatataggtcatttctatcaaatcaacttt 32557241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13846837 - 13846726
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatc 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  13846837 ctttaagtttcgagtttatttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtcgtttctatc 13846738  T
Q  252 aaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||    
T  13846737 aaatcaactttg 13846726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55358641 - 55358463
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||           |||    
T  55358641 caaatacctccctggatcttttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagt-----------ttc 55358553  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  55358552 ggataggtcctttaagttgttaagatttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 55358463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 46429733 - 46429907
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||| ||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  46429733 tttaaatttcacttttgtttcagataggtcatttaagtttctaaggttttagatatggcatttaagtttcgagtttgtttcgaatatatcctttaagttt 46429832  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcag--agct--gtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  46429833 ctaaggtttcagatatgtcctttaggtttcaagtttgtttcagatagataggtcttttctatcaaatcaactttg 46429907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29031715 - 29031536
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||     
T  29031715 caaatacctcctcgggtcctttaactttcatgtttgtttcaaatagatcctttaaatttctgaggttttagataggtccttttagtttcgagtttatttt 29031616  T
Q  175 ggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  29031615 ggatatgtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttccgataggtcatttctatcaa 29031536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29043835 - 29043656
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||     
T  29043835 caaatacctcctcgggtcctttaactttcatgtttgtttcaaatagatcctttaaatttctgaggttttagataggtccttttagtttcgagtttatttt 29043736  T
Q  175 ggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  29043735 ggatatgtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttccgataggtcatttctatcaa 29043656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 53856467 - 53856646
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||  |||  || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||     
T  53856467 caaatacctccccaggtcctttaagtttcatgtttgtttcggataaatcttttaagtttctaaggtttcagatatgtcttttaagtttgaagtttgtttt 53856566  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||    
T  53856567 gaattggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcctttctatcaa 53856646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6112177 - 6112011
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgttt-catatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||| || || | ||||||||||||||||| |||  |||| | | ||||||||| |||||    
T  6112177 aaggccaaatacctccccgggtcctttaagtttcgagtttgttttcaaatggatcctttaagtttctaagcttttagataggtcttttaagtttggagtt 6112078  T
Q  169 tgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6112077 tgttttggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcgtttaagtttcgagtttgtttca 6112011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32557432 - 32557254
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  32557432 caaatacctcttcgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatag--catttaagtttataaggttttagataggtcctttaagttttgagtttgtttc 32557335  T
Q  175 ggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||  |||| ||||||||||    
T  32557334 ggataggtccttttaaatttctaaggtttcagttaggtcctttaagtttcaatttatttttagatatgtcctttctatcaa 32557254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26554042 - 26553921
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26554042 tcctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagttaggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 26553943  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  26553942 tttctaaggtttcagatgggtc 26553921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 263
Target Start/End: Original strand, 6111812 - 6111979
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-ttt 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||         |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6111812 ggatcctttaaatttaacgtttgtttgagataggtcatttaagtttctaa---------tatatcctttaagttttgagtttgtttcggataggtcgttt 6111902  T
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  6111903 aagtttctaagatttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttaagacaggtcctttctatcaaatcaactttg 6111979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14966517 - 14966354
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||| ||| | |||||||| | |||| || |||||| |||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14966517 tcctttaaattttatgtttgttttagatagatcgtttaaggttctaaggttttagataggttctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 14966418  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14966417 tttctaaagtttcggatagatcctttaagttttgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 14966354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 13846594 - 13846702
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  13846594 caaatacctctccggatcctttaaggttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttc 13846693  T
Q  175 ggataggtc 183  Q
     ||||||||    
T  13846694 agataggtc 13846702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Original strand, 32751097 - 32751284
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||||||| |||||| ||  || | |||||||| ||| | |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |    
T  32751097 aaaaaaggccaaatatcttcccaggtcctttaaatttcatgtttgtttaagatagattctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttgaa 32751196  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  32751197 gtttgtttcggataggtcttttaagtctctaa-gtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 32751284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13864169 - 13864058
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatc 251  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  13864169 ctttaagttttaagtttatttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatagatcatttctatc 13864070  T
Q  252 aaatcaactttg 263  Q
    ||||| ||||||    
T  13864069 aaatctactttg 13864058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 253
Target Start/End: Original strand, 23159089 - 23159212
Alignment:
Q  131 tttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttg 229  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  23159089 tttctaaggtttcagataagtcctttaagttttgagtttgtttcggatagaccctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaactttcgagtttg 23159188  T
Q  230 tttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||   ||||||||||||||    
T  23159189 tttcagataggtcatttctatcaa 23159212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 253
Target Start/End: Original strand, 13870396 - 13870543
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcag 204  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  |||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13870396 gtttgttttagatagttcctttaaatttttaaggtttaagataggtcctttaagttt-gaatttgtttcgaataggtcctttaagtttctaaggtttcaa 13870494  T
Q  205 ataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13870495 atatgttctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaa 13870543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40289784 - 40289652
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtt 191  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40289784 ctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaagatttcggataggtcctttaagttttgagtttgtttcggataggtcatttaagtt 40289685  T
Q  192 tctaag---gtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    | | ||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  40289684 t-tgagtttgtttcggataggtcctttaagtttc 40289652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7633145 - 7633024
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||    
T  7633145 ggtcaaatgcctctctggatcttttaagttttacgattgtttca-ataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaagtttgt 7633047  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagtttc 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  7633046 ttcggataggtcctttaagtttc 7633024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 262
Target Start/End: Original strand, 25154587 - 25154711
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||| |||     
T  25154587 gtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttaagatagctcatttaggtttcgagtttgttttagat 25154686  T
Q  238 ctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  25154687 aggtcatttctatcaaatcaacttt 25154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27390057 - 27389926
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcag 204  Q
    |||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||| |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27390057 gtttatttcagatagatcttttaagtttctatggtttcagataagttctttaaatttgaagtttgtttcggataggtcctttaagtttctagggtttcag 27389958  T
Q  205 ataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27389957 attggtcctttcagtttcgagtttgtttcaga 27389926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40289707 - 40289592
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  40289707 gtttcggataggtcatttaagttttgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggattcatataggtcctttaagtttcgagtttatttcagat 40289608  T
Q  238 ctgtcatttctatcaa 253  Q
     | | |||||||||||    
T  40289607 atattatttctatcaa 40289592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21956456 - 21956374
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21956456 cctttaagtttcatgtttgtttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 21956374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34508948 - 34508846
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||    
T  34508948 cctttaaatttcgagtttgtttcgaataggtcctttaagtttttaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttgagatatgtcctttctat 34508849  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  34508848 caa 34508846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 34979495 - 34979577
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34979495 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 34979577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 262
Target Start/End: Original strand, 20421183 - 20421276
Alignment:
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20421183 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatgggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaacttt 20421276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32751439 - 32751322
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  32751439 tcctttaagttttatgtttgtttcagataggtcttttaagtttctaaggttttagatagctcctttaagtttaaagtttgtttcagataggtcctttaag 32751340  T
Q  190 tttctaaggtttcagata 207  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32751339 tttctaaggtttcagata 32751322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46430091 - 46429933
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| ||| |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||    
T  46430091 aaggccaaatatctctccagatcctttaaatttcatatttgttttagatagatcctttaagtttataaggtttcagataaatcctttaagtttggagttt 46429992  T
Q  170 gtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46429991 gtttcgga--------taagtttctaaggtttcagaaaagtcttttaagtttcgagtttgtttcaga 46429933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Original strand, 27389779 - 27389889
Alignment:
Q  69 aaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtt 168  Q
    ||||| ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  27389779 aaaggccaaatacctccatgggtccattaagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaagatttcagataagtcctttaagtttcgagtt 27389878  T
Q  169 tgtttcggata 179  Q
    |||||| ||||    
T  27389879 tgtttcagata 27389889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 193
Target Start/End: Original strand, 7632838 - 7632939
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtt 191  Q
    |||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7632838 ctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttgaagtttgtttcggataggtcctttaagtt 7632937  T
Q  192 tc 193  Q
    ||    
T  7632938 tc 7632939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13870637 - 13870556
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtccttt-aagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  13870637 ctttaagtttctaagatttcagatagatccttttaagtttcaagtttgtttcagataagtcatttctatcaaatcaactttg 13870556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 262
Target Start/End: Original strand, 27389816 - 27389913
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  27389816 gtttgtttcagataggtcctttaagtttttaagatttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagttatttctatcaaatcaacttt 27389913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21956457 - 21956369
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21956457 tcctttaagtttcatgtttgtttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggata 21956369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 52851197 - 52851114
Alignment:
Q  170 gtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||    
T  52851197 gtttcagataggtctttaagtttccaaggtttcagataggtcctttaagtttccagtttgttttagataggtcctttctatcaa 52851114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Original strand, 21956124 - 21956190
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21956124 ataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 21956190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 13846611 - 13846696
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13846611 cctttaaggttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttgtttcaga 13846696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 179
Target Start/End: Original strand, 29031258 - 29031367
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||| |||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  29031258 aaggtcaaatatctccatgggtcctttaagtttcacgtttgttttagataagtcttttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagttt 29031357  T
Q  170 gtttcggata 179  Q
    ||||||||||    
T  29031358 gtttcggata 29031367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 179
Target Start/End: Original strand, 29043377 - 29043486
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||| |||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  29043377 aaggtcaaatatctccatgggtcctttaagtttcacgtttgttttagataagtcttttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagttt 29043476  T
Q  170 gtttcggata 179  Q
    ||||||||||    
T  29043477 gtttcggata 29043486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32751438 - 32751353
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32751438 cctttaagttttatgtttgtttcagataggtcttttaagtttctaaggttttagatagctcctttaagtttaaagtttgtttcaga 32751353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 18598205 - 18598297
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18598205 tcctttgagtttcaagtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcatttaaatttcgagtttgtttcggataggtc 18598297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25363590 - 25363499
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    ||||||||||||||   |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25363590 gatcctttaagtttcgagtttgtttcgaatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatag 25363499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40998521 - 40998430
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||  | |||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40998521 ggatcctttaagtttcacgtttgttttagatatgttctttaagtttataaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcggata 40998430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7633094 - 7633044
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7633094 ctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 7633044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 15631338 - 15631420
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15631338 cctttaagtttcctgtttatttcagataggtcctttaaatttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttc 15631420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 18598206 - 18598288
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  18598206 cctttgagtttcaagtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcatttaaatttcgagtttgtttc 18598288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26554041 - 26553959
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26554041 cctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagttaggtcctttaagtttcgagtttgtttc 26553959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 29031280 - 29031362
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29031280 cctttaagtttcacgtttgttttagataagtcttttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 29031362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 29043399 - 29043481
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29043399 cctttaagtttcacgtttgttttagataagtcttttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 29043481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 7632838 - 7632919
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7632838 ctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttgaagtttgtttc 7632919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7633048 - 7632983
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  7633048 gtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 7632983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 20421076 - 20421161
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20421076 cctttaagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaaatttcatataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 20421161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 15631337 - 15631425
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15631337 tcctttaagtttcctgtttatttcagataggtcctttaaatttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcggata 15631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 52850872 - 52850976
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  52850872 caaatacctcactggatcctttaagtttcacgtttgttttggatatgtcctttaaatttcgaaggtttcagataagtcctttaagtttcgggtttgtttt 52850971  T
Q  175 ggata 179  Q
    |||||    
T  52850972 ggata 52850976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40998517 - 40998435
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40998517 cctttaagtttcacgtttgttttagatatgttctttaagtttataaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttc 40998435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Original strand, 20421183 - 20421256
Alignment:
Q  110 gtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20421183 gtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatgggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtc 20421256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40289784 - 40289703
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40289784 ctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaagatttcggataggtcctttaagttttgagtttgtttc 40289703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41511388 - 41511279
Alignment:
Q  74 tcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    ||||||||||  |||  |||||||||||| | |||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||  |||||||||    
T  41511388 tcaaataccttcccgagtcctttaagttttatgtttatttcagatagatcatttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaaattttaagtttgttt 41511289  T
Q  174 cggataggtc 183  Q
    ||||||||||    
T  41511288 cggataggtc 41511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 23159109 - 23159201
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23159109 tcctttaagttttgagtttgtttcggatagaccctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaactttcgagtttgtttcagataggtc 23159201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34508951 - 34508867
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgttt 173  Q
    |||||||||| |||   |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34508951 gatcctttaaatttcgagtttgtttcgaataggtcctttaagtttttaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgttt 34508867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13864169 - 13864082
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13864169 ctttaagttttaagtttatttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatag 13864082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 23159048 - 23159132
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag----tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  23159048 tttaagtttcgtgattgtttcggataggtcttttaagttaatttctaaggtttcagataagtcctttaagttttgagtttgtttc 23159132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3253574 - 3253456
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatccttt-aagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcg 164  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||| | ||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||   ||||||| ||| |    
T  3253574 aaaaaatgtcaaatacctttccaggtccttttaagtttcatgtttgtttcagttagatcctttaaatttctaatgtttcagatagatcctttaaatttgg 3253475  T
Q  165 agtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3253474 agtttgtttcagataggtc 3253456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13846813 - 13846747
Alignment:
Q  117 atagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13846813 ataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtc 13846747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27390010 - 27389920
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27390010 ctttaaatttgaagtttgtttcggataggtcctttaagtttctagggtttcagattggtcctttcagtttcgagtttgtttcagataggtc 27389920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 177
Target Start/End: Original strand, 34979554 - 34979640
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcgga 177  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||||    
T  34979554 tcctttaagtttcgagtttgtttcgaataagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgaatttatttcgga 34979640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41511370 - 41511288
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41511370 cctttaagttttatgtttatttcagatagatcatttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaaattttaagtttgtttc 41511288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13870696 - 13870627
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttc 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  13870696 tttaagttttacgtttgtttcatgtaggtcatttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttc 13870627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 167
Target Start/End: Original strand, 14966103 - 14966176
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagt 167  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  14966103 tttaagtttcacgtttgtttcagataggtcatttaaatttctaaggtttcaaatatgtcttttaagtttcgagt 14966176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 232
Target Start/End: Original strand, 52850889 - 52850970
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  52850889 cctttaagtttcacgtttgttttggatatgtcctttaaatttcgaaggtttcagataagtcctttaagtttcgggtttgttt 52850970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Original strand, 13858879 - 13859010
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagttt 192  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||| || ||||| ||| ||| |||||  ||| | | ||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||    
T  13858879 tttaagttttatgtttgttttagatagatcttttaaatttttaaagtttcatataggtcttttaagttt-gaatttgtttcgaatcggtcctttaagttt 13858977  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaag 225  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  13858978 ctaaggtttcagacagattctttaagtttcaag 13859010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18598565 - 18598473
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  18598565 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttcaaaggtttcagataagtcctttaagttttgattttgtttcaggtaggtc 18598473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Original strand, 7632915 - 7632970
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  7632915 gtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 7632970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6112061 - 6112003
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6112061 tttaagtttctaaggtttcagataggtcgtttaagtttcgagtttgtttcaaataggtc 6112003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13870665 - 13870627
Alignment:
Q  184 tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13870665 tttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttc 13870627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 25154549 - 25154611
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttc 134  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25154549 ggtcaaataccttcctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttc 25154611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Original strand, 5322548 - 5322597
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5322548 ctttaaatttctaaggttgcagataggtcctttaagttttgagtttgttt 5322597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 14966103 - 14966172
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  14966103 tttaagtttcacgtttgtttcagataggtcatttaaatttctaaggtttcaaatatgtcttttaagtttc 14966172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40289680 - 40289607
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40289680 gtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggattcatataggtcctttaagtttcgagtttatttcagata 40289607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7633048 - 7633004
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7633048 gtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 7633004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 25154599 - 25154691
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||   | |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  25154599 tcctttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttaagatagctcatttaggtttcgagtttgttttagataggtc 25154691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3253545 - 3253462
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||| || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  3253545 tttaagtttcatgtttgtttcagttagatcctttaaatttctaatgtttcagatagatcctttaaatttggagtttgtttcaga 3253462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Original strand, 25363300 - 25363355
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  25363300 gtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagatatgtcttttctgtcaa 25363355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 233
Target Start/End: Original strand, 35778724 - 35778759
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35778724 gtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 35778759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52851184 - 52851125
Alignment:
Q  124 ctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  52851184 ctttaagtttccaaggtttcagataggtcctttaagtttccagtttgttttagataggtc 52851125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13870651 - 13870581
Alignment:
Q  110 gtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggata-tgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  13870651 gtttcatataggtcctttaagtttctaagatttcagatagatccttttaagtttcaagtttgtttcagata 13870581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 236
Target Start/End: Original strand, 40289384 - 40289422
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40289384 gtttcagataggtactttaagtttcgagtttgtttcaga 40289422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Original strand, 35778724 - 35778765
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35778724 gtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatag 35778765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 186
Target Start/End: Original strand, 40289398 - 40289431
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40289398 ctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcttt 40289431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Original strand, 7632915 - 7632955
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7632915 gtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagata 7632955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52851213 - 52851174
Alignment:
Q  182 tctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  52851213 tctttaagtttctaaagtttcagataggt-ctttaagtttc 52851174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 202269 - 202440
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||    
T  202269 aaaataggttaaatacctccccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcaaatagatcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttgga 202368  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202369 gtttgtttcggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 202440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 202609 - 202470
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttca 223  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  202609 tttaaatttctaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcg 202510  T
Q  224 agtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  202509 agtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 202470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 202583 - 202491
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  202583 tcctttaagtttcgagtttgtttcggatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Original strand, 202354 - 202443
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  202354 tcctttaagtttggagtttgtttcggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatag 202443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 72)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6642158 - 6641985
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6642158 tcctttaagttccacgtttgttttagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaag 6642059  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  6642058 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagatagttcctttctatcaaatcaactttg 6641985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2803223 - 2803043
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  2803223 caaataccttcctggatcctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttcatataagtgctttaagtttcgagtttgtttc 2803124  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaa 254  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  2803123 ggatatgtcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaa 2803043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27319123 - 27318959
Alignment:
Q  73 gtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtt 172  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||    
T  27319123 gtcaaatacctccctgaatcctttaagttttatgtttgtttcagatagatcctttaaatttctaaggtttcagataagtcctttaagtttgaagtttgtt 27319024  T
Q  173 tcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27319023 tcggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 27318959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Original strand, 39804924 - 39805112
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    ||||||||  |||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  |    
T  39804924 aaaaaaggctaaatacctcctcagatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagatgggtcctttaagtttgaa 39805023  T
Q  166 gtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  39805024 gtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 39805112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 1069049 - 1069208
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| || ||||| ||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||    
T  1069049 caaatacctc-ccgggtcttttaaattttatgtttgtctcagatagatcctttaagtttctaaggtttcggatg-gtcatttaagtttcgagtttgtttc 1069146  T
Q  175 ggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069147 ggataggtctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 1069208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 2802870 - 2803035
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  2802870 ggtcaaatacttttccgggttctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcttttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttggagtttgt 2802969  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2802970 ttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 2803035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42092331 - 42092170
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||    
T  42092331 aaatacctccccggagcctttaagtttcatgtttgttttagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttgaagtttgtttcg 42092232  T
Q  176 gataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42092231 gataggtcttttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 42092170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2797046 - 2796882
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  2797046 tcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcatataagtgctttaagtttcgagtttgcttcggatatgtcatttaag 2796947  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaa 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  2796946 tttataaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaa 2796882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Original strand, 20429598 - 20429764
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||    
T  20429598 aggtcaaatacctccccggatcttttaagtttcatgtttgtttaaaatagatcctttaagtttctaaggttgcagataggtcctttaagttttgagtttg 20429697  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20429698 ttttggataagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttctttcaga 20429764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 262
Target Start/End: Original strand, 30003994 - 30004184
Alignment:
Q  73 gtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtt 172  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  30003994 gtcaaatacctcactggatcttctaagttttacgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaaggttttagatatgtcatttaagtttcgagtttgtt 30004093  T
Q  173 tcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaacttt 262  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  30004094 tcagatatgtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgaatttatttcagatagatcatttctatcgaatcaacttt 30004184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 2796709 - 2796874
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    |||||||||| |  |||| | |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  2796709 ggtcaaatactttcccgggttctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttggagtttgt 2796808  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2796809 ttcggatatgtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 2796874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21250696 - 21250548
Alignment:
Q  86 ccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-t 184  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21250696 ccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcgaataggtctt 21250597  T
Q  185 ttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21250596 ttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 21250548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8943320 - 8943136
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  8943320 aaggacaaatacctccccgggtccttttagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagttt 8943221  T
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||||||||    
T  8943220 gttccaaataggtcatttaagtttataaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtatcagataggtcttttctatcaa 8943136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1737675 - 1737512
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaag 189  Q
    ||||||||||||   |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1737675 tcctttaagtttggagtttatttcgtatagatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttctgataggtcctttaag 1737576  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  1737575 tttctaaggtttcagataggtgctttaagttttgagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 1737512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 252
Target Start/End: Original strand, 42375417 - 42375595
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| | |||  |||||||| ||| ||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||    
T  42375417 caaatacctctccgggttctttaagtttcatgtttgtttaagatatatcctttaaatttttaaggtttcagatagatcccttaagtttcgtgtttgtttc 42375516  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatca 252  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  42375517 gcataggtcctttaagtttctaaggcttcagataggtcctttaaatttcgagtttgtttcagataggtcatttctatca 42375595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39805250 - 39805125
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||     
T  39805250 gtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcatttaagtttcgagtttctttcagat 39805151  T
Q  238 ctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
      ||| ||||||||||||||||||||    
T  39805150 aggtcctttctatcaaatcaactttg 39805125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Original strand, 6641785 - 6641972
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||| ||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||  |    
T  6641785 aaaataggccaaatatctccccgggtcctt-aagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttgaa 6641883  T
Q  166 gtttgtttcggatag-gtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||| ||||||||||    
T  6641884 gtttgtttcggatagaccctttaagtttctaagatttcacataggtcctttaagtttcgagtttatttcagataggtcctttctatcaa 6641972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26006464 - 26006275
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||    
T  26006464 aaaataggtcaaatacctctgcgggtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatt-tttaagtttctaaggttttagatagacccttgaagtttcga 26006366  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtc-ctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  26006365 gtttgtttcagataggtctttttaagattttaaggtttcagataggtcgttttaagattcgagtttgtttcacatatgtcttttctatcaa 26006275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Original strand, 27495880 - 27496056
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||  | |||||||||    
T  27495880 aaatacctccccgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagtttgaaatttgtttcg 27495979  T
Q  176 gataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
     |||| | ||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||    
T  27495980 aatagatcctttaagtttcaaaggtttc--aaaggtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcctttctatcaa 27496056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27496194 - 27496069
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagag 237  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||     
T  27496194 gtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaagtttctaaggtttgagataggttctttaaatttcgagtttgtttcagat 27496095  T
Q  238 ctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
      ||| ||||||||||||||||||||    
T  27496094 aggtcctttctatcaaatcaactttg 27496069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 42091993 - 42092101
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42091993 caaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 42092092  T
Q  175 ggataggtc 183  Q
     ||||||||    
T  42092093 agataggtc 42092101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17849808 - 17849669
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  17849808 tcctttaagtttcatatttatttcagatagatcgtttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttcgaataggtcctttaag 17849709  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttg 229  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  17849708 tttctaaggtctcaaatagatcctttaagtttcgagtttg 17849669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Original strand, 28571038 - 28571142
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  28571038 aaatacctccccggatcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaagctttcatata-ggtctttaagtttcgagtttgtttcg 28571136  T
Q  176 gatagg 181  Q
    ||||||    
T  28571137 gatagg 28571142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 40807766 - 40807880
Alignment:
Q  104 acgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaag---gt 199  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||    
T  40807766 acgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcgtttaagtttc-aagtttgt 40807864  T
Q  200 ttcagataggtccttt 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  40807865 ttcagataggtccttt 40807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 8942879 - 8942971
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942879 tcctttaagtttcatgtttgtttcatataggtcctttaagtttctaaggtttcatataggtcttttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 8942971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1737750 - 1737592
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||  |||| | |||||||||| | |||||| | | |||| || ||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  1737750 aaatacctgcccgggttctttaagtttcatgtttgtcttagatagatcatttcagtttttaaggtttcagataagtcctttaagtttggagtttatttcg 1737651  T
Q  176 gataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
     |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1737650 tatagatcctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 1737592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28574763 - 28574661
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  28574763 cctttaagtttcatatttgtttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctat 28574664  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  28574663 caa 28574661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28574785 - 28574672
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  28574785 aaggccaaataccttcccgggtcctttaagtttcatatttgtttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttt 28574686  T
Q  170 gtttcggataggtc 183  Q
    ||||| ||||||||    
T  28574685 gtttcagataggtc 28574672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Original strand, 42092010 - 42092095
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42092010 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 42092095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 21250252 - 21250363
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||    
T  21250252 ggtcaaatacctccctgtgtcctttaagtttcaggtttgtttcagataggtccttaaagtttctaaggtttcagatagatcctttatgtttcgagtttgt 21250351  T
Q  172 ttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||    
T  21250352 ttcggataggtc 21250363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1069366 - 1069281
Alignment:
Q  97 aagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1069366 aagttttacgtttgtttcttataagtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggt 1069281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18008576 - 18008459
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcga 165  Q
    |||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  18008576 aaaataggccaaatacctccccgagtcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagatcggtcctttaagtttcga 18008477  T
Q  166 gtttgtttcggataggtc 183  Q
     |||||||| ||||||||    
T  18008476 atttgtttcagataggtc 18008459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Original strand, 18008175 - 18008283
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  18008175 caaataccttcctggatcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatttctaaagtttcagactggtcctttaagttttgagtttgtttc 18008274  T
Q  175 ggataggtc 183  Q
    |||||||||    
T  18008275 ggataggtc 18008283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27319045 - 27318954
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt 182  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27319045 tcctttaagtttgaagtttgtttcggataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggt 27318954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18008550 - 18008448
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||    
T  18008550 cctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttttaaggtttcagatcggtcctttaagtttcgaatttgtttcagataggtcatttctat 18008451  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  18008450 caa 18008448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1069339 - 1069286
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1069339 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 1069286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 35171687 - 35171820
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||  |||   |||||||||||||  |||||||     
T  35171687 caaatacctctccggattctttaaatttcacgtttgtttcagatatgtcctttaaatttctaagatttcaaataaatcctttaagtttcgtatttgtttt 35171786  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagata 207  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  35171787 ggatagatcctttaaatttttaaggtttcagata 35171820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 2802949 - 2803041
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2802949 tcctttaagtttggagtttgtttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 2803041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38085419 - 38085339
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  38085419 tttaagttttgagtttgtttcggagaggtcctttaaatttctaaggtttcagataggtccgttaagttttgagtttgtttc 38085339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5361600 - 5361493
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||     
T  5361600 aaatacctccccgggtcctttaagttgcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagatagattctttaaatttcgagtttgtttca 5361501  T
Q  176 gataggtc 183  Q
    ||||||||    
T  5361500 gataggtc 5361493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13626579 - 13626501
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  13626579 tttaagtttcgagtttgttttggataggtcatttaagtttctaaggtttgagatatgt-ctttaagtttcgagtttgttt 13626501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 8942880 - 8942962
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8942880 cctttaagtttcatgtttgtttcatataggtcctttaagtttctaaggtttcatataggtcttttaagtttcgagtttgtttc 8942962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21250272 - 21250354
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaa-gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21250272 cctttaagtttcaggtttgtttcagataggtccttaaagtttctaaggtttcagatagatcctttatgtttcgagtttgtttc 21250354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 148
Target Start/End: Original strand, 27318822 - 27318904
Alignment:
Q  66 aaaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggata 148  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27318822 aaaaaaggtcaaatacctccctgggtcctttaagtctaacgtttgtttcaaatatgtcctttaagtttataaggtttcagata 27318904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21250616 - 21250539
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250616 gtttgtttcgaataggtcttttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 21250539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40808029 - 40807917
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttcta--aggtttc 202  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |    |||||    
T  40808029 gtttatttcagatagatcctttaactttctaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 40807930  T
Q  203 agataggtccttt 215  Q
    |||||||||||||    
T  40807929 agataggtccttt 40807917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42092253 - 42092164
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42092253 tttaagtttgaagtttgtttcggataggtcttttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 42092164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 2796788 - 2796880
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2796788 tcctttaagtttggagtttgtttcggatatgtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 2796880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5361584 - 5361482
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||   ||| |||||||    
T  5361584 cctttaagttgcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcagatagattctttaaatttcgagtttgtttcagataggtcctttctat 5361485  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  5361484 caa 5361482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 28571054 - 28571135
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28571054 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaagctttcatataggt-ctttaagtttcgagtttgtttc 28571135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Original strand, 40807786 - 40807836
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40807786 ctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttc 40807836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40808011 - 40807961
Alignment:
Q  183 ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40808011 ctttaactttctaaggtttcagataggtcctttaagtttgaagtttgtttc 40807961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 263
Target Start/End: Original strand, 40807832 - 40807897
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  40807832 gtttcggataggtcgtttaagtttcaagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 40807897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29440378 - 29440278
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagttt 192  Q
    ||||||||| |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29440378 tttaagtttcatatttgttttagatagatcctttaagtttttaaggtttcagatatgttttttaagtttggagtttgtttcggataagtcctttaagttt 29440279  T
Q  193 c 193  Q
    |    
T  29440278 c 29440278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39805238 - 39805146
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39805238 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggttttagataggtcatttaagtttcgagtttctttcagataggtc 39805146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42375853 - 42375765
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||| || ||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42375853 tcctttaagtttcacgtttgttttagataggttctttaagcttttaaggttttagataggtcctttaagttttgagtttgtttcggata 42375765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Original strand, 1069201 - 1069256
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||    
T  1069201 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagatatgttctttctatcaa 1069256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27496229 - 27496139
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttcta--aggtttcggatatgccctttaagtttc 163  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27496229 caaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaagtttc 27496139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Original strand, 29440123 - 29440234
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatc 251  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||| ||| |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||  ||||||     
T  29440123 ctttaagtttcatgtttgttttagatatgtcctttaagttttcaaagtttcagataagtcctttaagtttcaaatttgtttcagataggtcccttctatt 29440222  T
Q  252 aaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||    
T  29440223 aaatcaactttg 29440234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 1069155 - 1069225
Alignment:
Q  124 ctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttc 193  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1069155 ctttaagtttataaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagataggtcctttaagtttc 1069225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17849807 - 17849725
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17849807 cctttaagtttcatatttatttcagatagatcgtttaagtttctaaagtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 17849725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 18008192 - 18008274
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18008192 cctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaaatttctaaagtttcagactggtcctttaagttttgagtttgtttc 18008274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42375852 - 42375770
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42375852 cctttaagtttcacgtttgttttagataggttctttaagcttttaaggttttagataggtcctttaagttttgagtttgtttc 42375770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38085424 - 38085327
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||| |||||||||   |||||||||  | || |||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38085424 gatcatttaagttttgagtttgtttcggagaggtcctttaaatttctaaggtttcagataggtccgttaagttttgagtttgtttcggataagtcttt 38085327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27496182 - 27496090
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||  |||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27496182 tcctttaagtttcgagtttgtttcggatatgtcctttaagtttctaaggtttgagataggttctttaaatttcgagtttgtttcagataggtc 27496090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 263
Target Start/End: Original strand, 1737425 - 1737499
Alignment:
Q  188 agtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||    
T  1737425 agtttctaaggttacagataggtcctttaagttttgagtttgttttagatagatc-tttctatcaaatcaactttg 1737499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13626548 - 13626488
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13626548 tttaagtttctaaggtttgagatatgtc-tttaagtttcgagtttgttttggatatgtcttt 13626488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Original strand, 20429709 - 20429766
Alignment:
Q  122 tcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  20429709 tcctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttcgagtttctttcagata 20429766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 231
Target Start/End: Original strand, 38085094 - 38085166
Alignment:
Q  153 ctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtt 231  Q
    |||||||||||||||||||||    |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38085094 ctttaagtttcgagtttgttt----tagc-ctttaagtttctaaggttttagataggt-ctttaagtttcgagtttgtt 38085166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40807965 - 40807910
Alignment:
Q  198 gtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  40807965 gtttcggataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 40807910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Original strand, 29440123 - 29440213
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||  ||||||||||||  || ||||| |||| | |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  29440123 ctttaagtttcatgtttgttttagatatgtcctttaagttttcaaagtttcagataagtcctttaagtttcaaatttgtttcagataggtc 29440213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29440302 - 29440258
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29440302 gtttcggataagtcctttaagtttcgagtttgtttcatataggtc 29440258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Original strand, 60472 - 60661
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  60472 caaatacctccctgggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtactttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 60571  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    | ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  60572 gaatatgtcctttaagattctaaggtttcagataggtcctttatgtttcaagtttgttttagataggtcctttctatcaaatcaactttg 60661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 60812 - 60680
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||  ||| || |||||||    
T  60812 tcctttaagttttatatttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcggataggtcctttatgtttggagtttgtttcaaataagtcctttaag 60713  T
Q  190 tttctaaggtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  60712 tttctaaggtctcggatatgtcctttaagtttc 60680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 60796 - 60728
Alignment:
Q  167 tttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  60796 tttgtttcagatagatcatttaagtttctaaggtttcggataggtcctttatgtttggagtttgtttca 60728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 263
Target Start/End: Original strand, 29987215 - 29987391
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-ttt 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29987215 ggatcctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttttaaggtttcagatagattctttaagtttcgagtttgtttcggataggcccttt 29987314  T
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  29987315 aagcttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 29987391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 45721123 - 45721290
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  45721123 aaggtcaaataccttcccgggtcctttaagtttcatgtttgtttcaggtagatcttttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagctt 45721222  T
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45721223 gtttcggatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 45721290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 263
Target Start/End: Original strand, 41810718 - 41810915
Alignment:
Q  67 aaaaaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgag 166  Q
    ||||||||||||||| || | |  || ||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||    
T  41810718 aaaaaggtcaaatacttccctgagtcatttaagtttcacgtttgtttcagataggttatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttaag 41810817  T
Q  167 tttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  41810818 tttgtttcggatatgtcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaaatcaactttg 41810915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 39834007 - 39834178
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtt 191  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39834007 ctttaagtttcacgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgttttggataggtcctttaagtt 39834106  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  39834107 tttaaagtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcctttctatcaaatcaactttg 39834178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 1695706 - 1695885
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||  ||||||||||    
T  1695706 caaatacctccccgggtcctttaagttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagattggtcctttaagtttgaagtttgtttc 1695805  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  1695806 aaataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 1695885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48074515 - 48074337
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48074515 caaatacctccccggatcctttaagttttatgtttgtttcagataggtcctttaagtttctaag-tttaagataagtcctttaagtttcgagtttgtttc 48074417  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  48074416 agatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagttttgagtttgtttcagatatgtcctttctatcaa 48074337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 263
Target Start/End: Original strand, 29386099 - 29386273
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgcccttt-aagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaa 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29386099 tcctttaaatttcacgtttgtttcaaattggtcctttaagtttataaagtttcagataagtccttttaagtttcgagtttgtttcggataggtcatttaa 29386198  T
Q  189 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||    
T  29386199 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagccctttctatcaaatcaactttg 29386273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20492104 - 20491959
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-cttta 187  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20492104 gatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcagataggtccttta 20492005  T
Q  188 agtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20492004 agtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttatttc 20491959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1102980 - 1102801
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||    
T  1102980 aaatacctctccggatcctttaagtttcatatttgttttagatagaccctttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaagtttgaagtttgtttcg 1102881  T
Q  176 gataggt-ctttaagtttctaagg-tttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  1102880 gataggtcctttaagtttctaaggttttcagataggtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtcatttctatcaa 1102801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4765205 - 4765016
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  4765205 caaatacctcccagggtcctttaagtttcacgtttgtttcagataggttctttaagtttctaaggttttaaataggttctttaagtttcgagtttgtttc 4765106  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    || ||| ||||||||||||||||    
T  4765105 ggatatgtcctttaagtttctaagatttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcagataaatcctttttatcaaatcaactttg 4765016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 4974820 - 4974985
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgt 171  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||  |||||||    
T  4974820 ggtcaagtacctccccgagtcctttaaattttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggttttagataggtcctttaagtttgaagtttgt 4974919  T
Q  172 ttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4974920 ttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcaga 4974985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Original strand, 18030203 - 18030347
Alignment:
Q  86 ccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctt 185  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||| |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18030203 ccggatcctttaagtttcatgtctatttcaaatagatcttttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctt 18030302  T
Q  186 taagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgt 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  18030303 taagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagttttgagtttgt 18030347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 1102617 - 1102788
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtt 191  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  1102617 ctttaaatttcatgtttgttttagataggtcctttaaatttctaaggtttcagacatgttctttaagtttcgagtttgtttcagataggccctttaagtt 1102716  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  1102717 tctaagatttcagataggtcctttaagtttcgagtttatttcagataagtcatttctatcaaatcaactttg 1102788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38823846 - 38823704
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  38823846 aggtcaaatacctccccgggtcctttaagttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttccaaagtttcagataggtcctttaagtttagagtttg 38823747  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcc 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823746 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcc 38823704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29987580 - 29987421
Alignment:
Q  78 atacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcgga 177  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||   ||||||||||| |    
T  29987580 atacctccccgggtcctttaagttttatgtttgtttcagataaatcctttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagttggaagtttgtttcgaa 29987481  T
Q  178 taggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29987480 taggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcaga 29987421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 4764820 - 4764984
Alignment:
Q  72 ggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgttt-catatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||| | |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||  ||||||    
T  4764820 ggtcaaatatctccccgagtcctttaagtttcatgttttttttcagatagatcctttaagtttctaagatttcaaataggtcctttaagtttgtagtttg 4764919  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4764920 tttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttca 4764984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15615492 - 15615382
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatca 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  15615492 tttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcatttctatca 15615393  T
Q  253 aatcaactttg 263  Q
    |||||||||||    
T  15615392 aatcaactttg 15615382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43142978 - 43142804
Alignment:
Q  90 atcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaa 188  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43142978 atcctttaaatttaacgtttgttttaaataggtcatttaaatttctaaggtttcagatacatcatttaaatttcgagtttgtttcagataggtcctttaa 43142879  T
Q  189 gtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  43142878 gtttctaagatttcagataggtcctttgagtttagagtttgtttcggataggtcttttctatcaaatcaactttg 43142804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Original strand, 4964921 - 4965033
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  4964921 cctttaagttttgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcaagtttgtttcagataggtcctttctat 4965020  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    || ||||||||||    
T  4965021 cagatcaactttg 4965033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42371812 - 42371668
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-ttt 186  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||    
T  42371812 ggatcctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcctttaaatttccaaggtttcagatatgtcctttaagtgtcgagtttgtttcagatatgtcattt 42371713  T
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtt 231  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42371712 gtgtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtt 42371668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 49588031 - 49588159
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcag 204  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49588031 gtttgtttcagataaatcctttaattttttaaggttttagatatgtcttttaagtttcgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcag 49588130  T
Q  205 ataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49588131 atagatcctttaagttccaagtttgtttc 49588159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29386445 - 29386306
Alignment:
Q  95 ttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttc 193  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29386445 ttaagtttcatgtttgtttcagatagatcatttaagtttctaaagtttcagataggtcttttaagtttggagtttgtttcgaataggtcttttaagtttc 29386346  T
Q  194 taaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29386345 taaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttatttc 29386306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39834353 - 39834191
Alignment:
Q  93 ctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtt 191  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  39834353 ctttaagtttcacgtttgttttagatagatcttttaagtttataaggtttcagataggtcctttatgttttgagtttgttttagataggtcatttaagtt 39834254  T
Q  192 tctaaggtttcagataggtcc-tttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  39834253 tctaaggtttcagataggtccttttaagtttcgagtttgtttcagataggtcctttctatcaa 39834191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Original strand, 18088085 - 18088197
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  18088085 cctttaagttttgagtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtactttaagtttcgagtttgtttcagataggtcatttctat 18088184  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    |||||||||||||    
T  18088185 caaatcaactttg 18088197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Original strand, 43142662 - 43142774
Alignment:
Q  125 tttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttca 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  43142662 tttaagtttctaaggtttcagatatgttttttaagtttcgagtttgtttcggatagatcttttaagtttctaaggtgtcagatatgtcctttaagtttcg 43142761  T
Q  224 agtttgtttcaga 236  Q
    ||||| |||||||    
T  43142762 agtttatttcaga 43142774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18088392 - 18088231
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||||||  | | |||||||||||| | |||||||| | |||  || |||||||||||||| ||||  ||| | | || |||||| |||||||    
T  18088392 aggtcaaatacctccactggtcctttaagtttcatgtttgttttagataaatcatttaagtttctaagatttcaaataggtc-ttcaagtttggagtttg 18088294  T
Q  171 tttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18088293 tttcggataggtcctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaaatttcaagtttgttt 18088231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 175
Target Start/End: Original strand, 5739368 - 5739473
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  5739368 aaggtcaaatatctccctggatcctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagttt 5739467  T
Q  170 gtttcg 175  Q
    ||||||    
T  5739468 gtttcg 5739473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 236
Target Start/End: Original strand, 15615219 - 15615352
Alignment:
Q  107 tttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggttt--cggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttc 202  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  | | || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15615219 tttgtttcagatagatccttttaagtttctaaggtttttcaggtaggttctttaagtttcgattttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttc 15615318  T
Q  203 agataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15615319 aaatagatcctttaagtttcgagtttgtttcaga 15615352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 47824479 - 47824560
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47824479 cctttaagtttcacgtttgtttcagaaaggtctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 47824560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49113264 - 49113161
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49113264 tcctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagacatgtcctttaagtttcgagtttgtttcggatagatcctttaag 49113165  T
Q  190 tttc 193  Q
    ||||    
T  49113164 tttc 49113161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5739596 - 5739491
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5739596 caaatatctccccggatcttttaagtttcacgtttgtttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttc 5739497  T
Q  175 ggatag 180  Q
     |||||    
T  5739496 agatag 5739491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Original strand, 5277299 - 5277449
Alignment:
Q  83 tctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatg-ccctttaagtttcgagtttgtttcggatagg 181  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||| | |||||||||||||||     
T  5277299 tctccgggtcctttaagtttcctgtttgtttcagatagatcttttaagtttctgaggtttcagataggtccttttaagttttgtgtttgtttcggataga 5277398  T
Q  182 t-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  5277399 tcctttaagtttctaaggttcccgataggt-ctttaagttttgagtttgttt 5277449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 5739390 - 5739472
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5739390 cctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 5739472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 183
Target Start/End: Original strand, 18088082 - 18088176
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18088082 gatcctttaagttttgagtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtactttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 18088176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5739577 - 5739476
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatca 252  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||    
T  5739577 tttaagtttcacgtttgtttcagatagatcttttaagtttctaaggtttcagataggttctttaagtttcgagtttgtttcagatagatcatttctatca 5739478  T
Q  253 aa 254  Q
    ||    
T  5739477 aa 5739476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15615480 - 15615407
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15615480 gtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcagata 15615407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20492027 - 20491950
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20492027 gtttgtttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttatttcggataggtc 20491950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20492101 - 20492016
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20492101 cctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttcaga 20492016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 32712182 - 32712267
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32712182 tttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaagatttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggata 32712267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45721565 - 45721472
Alignment:
Q  88 ggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatagg 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45721565 ggatcctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcttttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttcgagtttgtttcgtatagg 45721472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3339239 - 3339155
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3339239 cctttaagtttcacttttgtttcagatagatctttaagtttctaatgtttcaaataggtcctttaagtttcgagtttgtttcaga 3339155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41811026 - 41810946
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttca 234  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  41811026 tttaagtttcatgtttgtttcagatagatctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttgcttca 41810946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 20491718 - 20491800
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20491718 cctttaagtttcatgtttgttttggatagatcttttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 20491800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45721561 - 45721479
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt-aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45721561 cctttaagtttcacgtttgtttcagatatgtcttttaagtttctaaggtttcatataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 45721479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Original strand, 4974899 - 4974988
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4974899 tcctttaagtttgaagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagttttgagtttgtttcagatag 4974988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29987507 - 29987415
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29987507 tcctttaagttggaagtttgtttcgaataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 29987415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 15057243 - 15057322
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15057243 tttaagtttcaagtttgtttcggatatgttctttaagtttctaagattttagataggtcctttaggtttcgagtttgttt 15057322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 18087995 - 18088127
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagtt 191  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  18087995 tttaagtttaacgtttgtttaagataggtccttttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagttttgagtttgtttcagatagatcctttaagtt 18088094  T
Q  192 tctaag---gtttcagataggtcctttaagtttc 222  Q
    | | ||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  18088095 t-tgagtttgtttcagatagatcctttaagtttc 18088127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Original strand, 20491717 - 20491812
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||||| | ||||||||   |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20491717 tcctttaagtttcatgtttgttttggatagatcttttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataagtcttt 20491812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 183
Target Start/End: Original strand, 4964918 - 4965012
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||||   |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  4964918 gatcctttaagttttgagtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcaagtttgtttcagataggtc 4965012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4975073 - 4975015
Alignment:
Q  205 ataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4975073 ataggtcttttaagtttcaagtttgtttcagatatgtcatttctatcaaatcaactttg 4975015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 259
Target Start/End: Original strand, 32712182 - 32712288
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatca 252  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | || ||||||| |    
T  32712182 tttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttctaagatttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcggatatatcttttctatta 32712281  T
Q  253 aatcaac 259  Q
    |||||||    
T  32712282 aatcaac 32712288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3339240 - 3339149
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3339240 tcctttaagtttcacttttgtttcagatagatc-tttaagtttctaatgtttcaaataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 3339149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29386374 - 29386294
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29386374 gtttgtttcgaataggtcttttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttatttcggatagatcttt 29386294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Original strand, 45721204 - 45721299
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtcttt 186  Q
    ||||||||||||   | |||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45721204 tcctttaagtttcgagcttgtttcggatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcttt 45721299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4965148 - 4965046
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||    ||||||||||    
T  4965148 cctttaagtttcatgtttgttttagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaaattttgagtttgtttcagatagatcatttctat 4965049  T
Q  251 caa 253  Q
    |||    
T  4965048 caa 4965046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 47824476 - 47824561
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcg 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  47824476 gatcctttaagtttcacgtttgtttcagaaaggtc-tttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcg 47824561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49113263 - 49113181
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  49113263 cctttaagtttcatgtttatttcagatagatcctttaagtttctaaggtttcagacatgtcctttaagtttcgagtttgtttc 49113181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 233
Target Start/End: Original strand, 18030242 - 18030291
Alignment:
Q  184 tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18030242 tttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 18030291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 18088007 - 18088079
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18088007 gtttgtttaagataggtccttttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagttttgagtttgtttcaga 18088079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Original strand, 42371407 - 42371496
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42371407 tttaagtttcacatttgtttcagataggacctttaattttctaatgttttagataagtcctttaagtttcgagtttgttttggataggtc 42371496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 183
Target Start/End: Original strand, 15615282 - 15615358
Alignment:
Q  107 tttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15615282 tttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcaaatagatcctttaagtttcgagtttgtttcagataggtc 15615358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 39834065 - 39834157
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   ||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39834065 tcctttaagtttcgagtttgttttggataggtcctttaagtttttaaagtttcagatatgtcctttaagtttcgagtttgttttagataggtc 39834157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41811033 - 41810951
Alignment:
Q  87 cggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  41811033 cggatcatttaagtttcatgtttgtttcagatagatc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaaatttcgagtttg 41810951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42371808 - 42371713
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcattt 246  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  42371808 cctttaaatttcatgtttgtttcagatagatcctttaaatttccaaggtttcagatatgtcctttaagtgtcgagtttgtttcagatatgtcattt 42371713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49588402 - 49588340
Alignment:
Q  151 ccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggtttcagataggtc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49588402 ccctttaagtttcaagtttgtttcagatatgtccttttaagtttctaaggtttcagataggtc 49588340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38823825 - 38823743
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38823825 cctttaagttttatgtttgtttcagatagatcctttaagtttccaaagtttcagataggtcctttaagtttagagtttgtttc 38823743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4965149 - 4965060
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  4965149 tcctttaagtttcatgtttgttttagatagatcatttaagtttctaaggtttcagataggtcttttaaattttgagtttgtttcagatag 4965060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 43142703 - 43142776
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43142703 gtttgtttcggatagatcttttaagtttctaaggtgtcagatatgtcctttaagtttcgagtttatttcagata 43142776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 49588091 - 49588164
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||||||||||||||    
T  49588091 gtttgtttcggataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaagttccaagtttgtttcggata 49588164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 183
Target Start/End: Original strand, 18030268 - 18030359
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||||   |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18030268 tcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcaaataggtcctttaagttttgagtttgtgtcggataggtc 18030359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41542782 - 41542710
Alignment:
Q  76 aaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggata 148  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  41542782 aaatacctccccggatcctttaaatttcacgtttgtttcagataggtcatttaactttctaaagtttcagata 41542710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 183
Target Start/End: Original strand, 48074119 - 48074174
Alignment:
Q  128 aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48074119 aagtttttaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 48074174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 48074119 - 48074165
Alignment:
Q  187 aagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48074119 aagtttttaaagtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgtttc 48074165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Original strand, 41524609 - 41524711
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| | |||| |  ||||||||| |||||||||||||| |   ||||| |||  ||||||||||    
T  41524609 caaatacctcttcggatcctttaattttcatgtttgttttagatagat--tttaagtttttaaggtttcggataggtattttaaatttgaagtttgtttc 41524706  T
Q  175 ggata 179  Q
    |||||    
T  41524707 ggata 41524711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18030616 - 18030544
Alignment:
Q  107 tttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18030616 tttgtttcagataagtcctttaaatttctaaggtttcagatatattatttaagtttcgagtttgttttggata 18030544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49588401 - 49588310
Alignment:
Q  92 cctttaagtttaacgtttgtttcatatagttccttt-aagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  49588401 cctttaagtttcaagtttgtttcagatatgtccttttaagtttctaaggtttcagata-ggtctttatgttttgagtttttttcggataggtc 49588310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 15615204 - 15615289
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc--tttaagtttctaaggttt--cagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15615204 cctttaagtttcgtatttgtttcagatagatccttttaagtttctaaggtttttcaggtaggttctttaagtttcgattttgtttc 15615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32712370 - 32712318
Alignment:
Q  182 tctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  32712370 tctttaagtttttaaggttttagataggt--tttaagtttcgagtttgtttcaga 32712318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 42371407 - 42371486
Alignment:
Q  154 tttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgttt 232  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  42371407 tttaagtttcacatttgtttcagataggacctttaattttctaatgttttagataagtcctttaagtttcgagtttgttt 42371486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41542766 - 41542706
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtc 211  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41542766 cctttaaatttcacgtttgtttcagataggtcatttaactttctaaagtttcagataggtc 41542706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 49113185 - 49113141
Alignment:
Q  139 gtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49113185 gtttcggatagatcctttaagtttcgagtttgtttctgataggtc 49113141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24014 - 23847
Alignment:
Q  94 tttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaagttt 192  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24014 tttaagtttcacgtttgtttcagatagatcctttaaatttctaaggtttcagatagatcctttcagtttcaagtttgtttcggataggttctttaagttt 23915  T
Q  193 ctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaact 260  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  23914 ttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgcttcagataggtcatttctatcaaatcaact 23847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Original strand, 23648 - 23814
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||| | |||| || ||||||||| ||||||||| |||| | | ||||| |||  ||||||    
T  23648 aggtcaaatacctcatcagatcctttaagtttcatgtttgttttagatagatcatttaagtttttaaggtttcagataagtcatttaaatttaaagtttg 23747  T
Q  171 tttcggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23748 tttcggataggtcctttaaatttctcaggtttcagatatgtcatttaagtttcaagtttgtttcaga 23814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23959 - 23865
Alignment:
Q  89 gatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc 183  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23959 gatcctttcagtttcaagtttgtttcggataggttctttaagtttttaaggtttcagataggtcctttaagtttcgagtttgcttcagataggtc 23865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 5)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22547 - 22358
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||||||    
T  22547 caaatacctctctgggtcttttaagtttaacgtttgtttcagataggtcctttaaatttctaaagtttcagatagattctttaagtttcgagtttgtttc 22448  T
Q  175 ggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22447 gaatatgtcctttaaatttctaaggtttcagatatgttttttaagttacgagtttgtttcagataggtcatttctatcaaatcaactttg 22358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23511 - 23399
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  23511 aggtcaaatacctccccgggtcctttaagtttcgagtttgtttcaaatagatcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttggagtttg 23412  T
Q  171 tttcggataggtc 183  Q
    |||||||||||||    
T  23411 tttcggataggtc 23399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23490 - 23408
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23490 cctttaagtttcgagtttgtttcaaatagatcctttaagtttctaagatttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 23408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 22211 - 22314
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggt-ctttaag 189  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22211 tcctttaagtttcatatttgtttcagatagatcctttaagtttctaagtcttcagatagttcctttaagtatggagtttgtttcggataggtcctttaag 22310  T
Q  190 tttc 193  Q
    ||||    
T  22311 tttc 22314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 22212 - 22294
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  22212 cctttaagtttcatatttgtttcagatagatcctttaagtttctaagtcttcagatagttcctttaagtatggagtttgtttc 22294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 263
Target Start/End: Original strand, 11714 - 11905
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  11714 caaatacctcactggatcctttaagtttcatgtttgtttcagatagatcctttaagtttcgaaggtttcagataggtcctttaagtttggagtttgtttc 11813  T
Q  175 ggataggt-ctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagct--gtcatttctatcaaatcaactttg 263  Q
    ||||| || |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |   || ||||||||||||||||||||    
T  11814 ggataagtcctttaaatttcttagatttcatatatgtcctttaagtttcgagtttgtttcagatataaatcctttctatcaaatcaactttg 11905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22159 - 21992
Alignment:
Q  70 aaggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagttt 169  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||| | | | || |  ||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  22159 aaggccaaatacctccccgggtcctttaagtttcatgtttatcttagattgaccctttaagtttctaaagtttcagataggtcatttaagtttcgagttt 22060  T
Q  170 gtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  22059 gtttcgtataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaaatttcgagtttgtttcaga 21992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 181
Target Start/End: Original strand, 21813 - 21919
Alignment:
Q  75 caaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttc 174  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  21813 caaatacctctctaggtcctttaagtttcacgtttgtttcggataggtcctttaagtttctacggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttc 21912  T
Q  175 ggatagg 181  Q
    |||||||    
T  21913 ggatagg 21919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 233
Target Start/End: Original strand, 21830 - 21912
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttc 233  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21830 cctttaagtttcacgtttgtttcggataggtcctttaagtttctacggtttcagataggtcatttaagtttcgagtttgtttc 21912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22063 - 21989
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggatag 180  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22063 gtttgtttcgtataggtcctttaagtttctaaggtttcagatagatcctttaaatttcgagtttgtttcagatag 21989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Original strand, 32253 - 32365
Alignment:
Q  152 cctttaagtttcgagtttgtttcggataggtc-tttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcagagctgtcatttctat 250  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||    
T  32253 cctttaagtttcgagtttctttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagataagtcctttctat 32352  T
Q  251 caaatcaactttg 263  Q
    |||||||| ||||    
T  32353 caaatcaaatttg 32365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32495 - 32425
Alignment:
Q  166 gtttgtttcggataggtctttaagtttctaaggtttcagataggtcctttaagtttcaagtttgtttcaga 236  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32495 gtttgtttcagatagatctttaagtttctaaggtttcagatatgtcatttaagtttgaagtttgtttcaga 32425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 32252 - 32340
Alignment:
Q  91 tcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggata 179  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32252 tcctttaagtttcgagtttctttcagataggtcctttaagtttctaaggtttcagataagtcctttaagtttcgagtttgtttcagata 32340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32495 - 32409
Alignment:
Q  106 gtttgtttcatatagttcctttaagtttctaaggtttcggatatgccctttaagtttcgagtttgtttcggataggtctttaagtttc 193  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32495 gtttgtttcagatagatc-tttaagtttctaaggtttcagatatgtcatttaagtttgaagtttgtttcagataggtctttaagtttc 32409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 134
Target Start/End: Original strand, 32201 - 32264
Alignment:
Q  71 aggtcaaatacctctccggatcctttaagtttaacgtttgtttcatatagttcctttaagtttc 134  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  32201 aggtcaaatacctccctgggtcctttaagtttaacgtttgttacagataagtcctttaagtttc 32264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University