View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19046_high_6 (Length: 394)

Name: NF19046_high_6
Description: NF19046
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19046_high_6
NF19046_high_6
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (9-388)||(25483676-25484055)
chr6 (9-388)||(25539160-25539539)
chr6 (9-388)||(26056539-26056918)
chr6 (9-388)||(26076509-26076888)
chr6 (9-388)||(25580339-25580718)
chr6 (9-388)||(26143485-26143864)
chr6 (9-384)||(26656586-26656961)
chr6 (9-384)||(26762557-26762932)
chr6 (9-358)||(26862227-26862576)
chr6 (9-257)||(25511640-25511888)
chr6 (9-388)||(26647096-26647475)
chr6 (9-388)||(26753064-26753443)
chr6 (9-384)||(26884691-26885066)
chr6 (9-355)||(27337281-27337627)
chr6 (9-355)||(27398021-27398367)
chr6 (9-360)||(27530487-27530838)
chr6 (9-360)||(25492505-25492856)
chr6 (9-360)||(27717685-27718036)
chr6 (9-352)||(26623924-26624267)
chr6 (9-352)||(26729901-26730244)
chr6 (9-360)||(31285204-31285555)
chr6 (9-368)||(27215089-27215448)
chr6 (9-360)||(27610306-27610657)
chr6 (9-349)||(27679606-27679946)
chr6 (9-360)||(28786883-28787234)
chr6 (9-360)||(28793004-28793355)
chr6 (9-349)||(26803102-26803442)
chr6 (9-349)||(27705590-27705930)
chr6 (12-349)||(27426801-27427138)
chr6 (9-360)||(27603890-27604241)
chr6 (9-360)||(28781746-28782097)
chr6 (9-360)||(27697772-27698123)
chr6 (9-364)||(27592207-27592562)
chr6 (9-349)||(27676806-27677146)
chr6 (159-365)||(26824459-26824665)
chr6 (303-388)||(25511555-25511640)
chr6 (162-245)||(28140295-28140378)
chr6 (168-244)||(26937790-26937866)
chr6 (162-237)||(28097782-28097857)
chr6 (174-237)||(28227720-28227783)
chr6 (9-124)||(28235446-28235561)
chr6 (168-262)||(28297085-28297179)
chr6 (48-262)||(28514894-28515108)
chr6 (48-124)||(28296965-28297041)
chr6 (176-262)||(28326221-28326307)
chr6 (176-262)||(28503857-28503943)
chr6 (191-256)||(26849461-26849526)
chr6 (174-262)||(28243538-28243626)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (8-379)||(28126860-28127231)
chr1 (8-379)||(28163561-28163931)
chr1 (9-360)||(267526-267877)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (9-360)||(2725-3076)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (9-360)||(29273024-29273375)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (9-360)||(3898-4249)
scaffold0277 (109-360)||(12961-13212)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (9-360)||(18678742-18679093)
chr4 (12-349)||(18074417-18074754)
chr4 (9-360)||(18698582-18698933)
chr4 (9-349)||(18654659-18654999)
chr4 (9-349)||(18730686-18731026)
chr4 (109-349)||(18723367-18723607)
chr4 (152-262)||(5090282-5090392)
chr4 (11-76)||(5090138-5090203)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (12-349)||(60225-60562)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (109-360)||(8132-8383)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (162-254)||(3280410-3280502)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (174-237)||(28218-28281)
scaffold0038 (9-124)||(35608-35723)
scaffold0038 (174-262)||(43700-43788)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (173-254)||(16691618-16691699)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25484055 - 25483676
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484055 acatcatcaacaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 25483956  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  25483955 tttttgaaaggagcatcttttggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaag 25483856  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483855 aaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 25483756  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25483755 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaatcatgattgatattgttgga 25483676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25539539 - 25539160
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539539 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttttagatagtctttcctttatgattgttattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 25539440  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  25539439 tttttgaaaggagcttcttttggagatgtttcaagttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaacttcaaattgatcagcaac 25539340  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25539339 aaaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccaagtcaagaagc 25539240  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25539239 aatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacatataaaaaaacatgattgatattgttgga 25539160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26056918 - 26056539
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26056918 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctaactgaccgtcaaatttaacta 26056819  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26056818 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaat 26056719  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26056718 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagc 26056619  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26056618 aatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttgga 26056539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26076888 - 26076509
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26076888 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaacta 26076789  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26076788 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaat 26076689  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26076688 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccggtaccaaaaattcctaccatgcggacctcattctcagagcccatgtcaagaagc 26076589  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26076588 aatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttgga 26076509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25580718 - 25580339
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  25580718 acatcatcaaaaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctactaacttaaagtaaaatttaacta 25580619  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    || || ||||||| |  |  ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25580618 ttattaaaaggagataataatggagatgtttcaagttattaagaattgaaatctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaac 25580519  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25580518 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaccacatcctcagagcccatgtcaagaagc 25580419  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25580418 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatattgttgga 25580339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26143864 - 26143485
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||     
T  26143864 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttccttaatgattgaaattccctcactaacatctcctaacttatggttcaatttaactg 26143765  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    || || ||||||| |  | |||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26143764 ttcttaaaaggagatcttcctggagatgtttcaggttattatgacttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcaac 26143665  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143664 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccaaaaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 26143565  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26143564 aatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaaacatgattgatattgttgga 26143485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26656961 - 26656586
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |  | | ||||      
T  26656961 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacag 26656862  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26656861 tttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgac 26656762  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  26656761 aaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagc 26656662  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgt 384  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  26656661 aatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgt 26656586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26762932 - 26762557
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |  | | ||||      
T  26762932 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggaattccctcactaacatctcctaacttaatattcactctaacag 26762833  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26762832 tttttgaaaggagctcctcctggagatgtttcaaattattatgagctgaattctctctgacattgtgaagaaaacatacaccttcaaattgatcagcgac 26762733  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  26762732 aaaattataaattgctttggcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgagaacctcatccttagatcccttatcaagaagc 26762633  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgt 384  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  26762632 aatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgt 26762557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26862576 - 26862227
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||     
T  26862576 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcattctatttagtctttcctttataagtggaattccctcactagcatctcctaacttaatgttcaatttaactg 26862477  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26862476 tttttaaaagaagctccttctggagatgtttcaagctattatgagttgaattctctctaactttatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 26862377  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||  |||| |||||||||    
T  26862376 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttccccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtgtaccccttcatcagattccatatcaagaagc 26862277  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctac 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26862276 aatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggctac 26862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25511888 - 25511640
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25511888 acatcgtcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttataattggtattccctcactaacatcttctatctgaccgtcaaatttaacta 25511789  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  25511788 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgaattctctctgacattatgaagaaaacatacactttcaaattgatcagcaat 25511689  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagta 257  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25511688 agaattaaaaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctctagta 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26647475 - 26647096
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| || || | | ||||||  ||  | |||||||     
T  26647475 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactg 26647376  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26647375 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaac 26647276  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  |  | |||||||||    
T  26647275 aaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagc 26647176  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||| ||||||||    
T  26647175 aatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttgga 26647096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26753443 - 26753064
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| || || | | ||||||  ||  | |||||||     
T  26753443 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcacaaatatgtccaaacttaatgttcactttaactg 26753344  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26753343 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagttattatgagctgaattctctctgacattatgaagaaagcatacaccttcaaattgatcagcaac 26753244  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||  |  | |||||||||    
T  26753243 aaaattataaatcgctttggcaagtgttgatttacccaaacctccagtaccataaagtcctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagc 26753144  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||| ||||||||    
T  26753143 aatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaatgacacgattgatcttgttgga 26753064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26885066 - 26884691
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||| |     
T  26885066 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctatgtagtctttcctttatgagtggaattccctcactaacatctcctaacttaatgtttaatttaattg 26884967  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26884966 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaagttattatgagttgaattctccctgactttatgcagaaaacatacacattcaaattgatcagcaac 26884867  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | || | |||  || | |||||||||    
T  26884866 ataattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaattcctaccatgtgtaccccttcgttagattccttatcaagaagc 26884767  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgt 384  Q
    ||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||    
T  26884766 aattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaaaacaacacgattgattttgt 26884691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 27337281 - 27337627
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  |||||||  ||  | || ||||     
T  27337281 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactg 27337380  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  27337381 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaat 27337480  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  ||   |||||||||    
T  27337481 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagc 27337580  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggc 355  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337581 aattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27337627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Original strand, 27398021 - 27398367
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  |||||||  ||  | || ||||     
T  27398021 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcttcctacatagcctttccttaatgattggaattccctcagaaacatctcttaacttaatgttcagttgaactg 27398120  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  27398121 tttttgaaaggagctccttctggagatgtttcaagtttttacgagctgaattctctctaacattatgaagaaagcatactccttcaaattgatcagcaat 27398220  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||  ||   |||||||||    
T  27398221 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgattttcccaagcctctagtaccataaagtcctaccatgttgaccccttcatcagattcctcatcaagaagc 27398320  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggc 355  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27398321 aattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggc 27398367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27530487 - 27530838
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||| |||||     
T  27530487 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttgcttaatgattggaattccctgactaacacctcctaacttaatgtccaatctaactg 27530586  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |    ||| || ||| |||| ||||| |  |||||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  27530587 tttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatctgaagtcgaattcactctcacattttctagaaaacataaaacttcaaattgatcagcaat 27530686  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||       |||||| ||    
T  27530687 gaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacctatgcctccagtaccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcagatttttcatcaagatgc 27530786  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
      |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27530787 cctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacat 27530838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 25492505 - 25492856
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttct-aacttaccgtcaaatttaact 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||     
T  25492505 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctctctacatagtccttgttttatgattgcaattccctcactaaca-cttcttaacttaatgtctaatctaacc 25492603  T
Q  108 atttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaa 207  Q
    ||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||  |  ||||||| |||||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25492604 attttcgaaaggagtttttcctggagatctttcaagtttcttggagttgaattctctctcacatctcctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 25492703  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
      || ||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   || |||||    
T  25492704 tgaagttatagattgattttgcaagtgttgatttacctaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggaactcatcctcagatacctcatctagaag 25492803  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25492804 caatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacat 25492856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27717685 - 27718036
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || | ||||||   |||| || || |     
T  27717685 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtg 27717784  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  27717785 tttttaaaaggagctccttctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 27717884  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     |||||||||    
T  27717885 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 27717984  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27717985 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 27718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26624267 - 26623924
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||   || |||  |  |     
T  26624267 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26624168  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26624167 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26624068  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||     
T  26624067 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26623968  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtattt 352  Q
     |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  26623967 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtattt 26623924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26730244 - 26729901
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||   || |||  |  |     
T  26730244 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattgaaattccctcactaacatggtccaacttaatttccaatccagttg 26730145  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26730144 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26730045  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | ||||||||     
T  26730044 aaagttatagattgctcttgcaagtgttgatttgcccaagcctccaatcccatacattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagt 26729945  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtattt 352  Q
     |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  26729944 gatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtattt 26729901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31285555 - 31285204
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||   || |||  || |     
T  31285555 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccaattg 31285456  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||  |||     
T  31285455 ttttcaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataatccgtcaaattgatcaccaat 31285356  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | ||| | |  | ||   || | |||||||||    
T  31285355 aaaattatagattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctcctatcccataaagtcctaccatgtgtacccctttattagtttccttatcaagaagc 31285256  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  31285255 aatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacat 31285204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27215448 - 27215089
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||  |||||  |||  || |||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||      
T  27215448 acatcatcaagaatcaaaagaatcttcttttgacatagcattttttttatctttgtaatcccctcactaacacctcctaacttatcgtctaatctaaccg 27215349  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||   ||||| ||| | ||| || ||||||||||| || | |||||| |||||| | ||||  |  |||||| ||  ||||||||| ||||| ||||     
T  27215348 ttttcataaggatcttttcctgcaggtgtttcaagttatttaaagttgaattctctttcacatcttctagaaaatatgaaccttcaaactgatcagcaat 27215249  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  27215248 gaaattaaaaattgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagctccatgaagtcctaccatgtggacctcttccttagatcccttgtcaagaagc 27215149  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaa 368  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  27215148 aattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaaaa 27215089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27610306 - 27610657
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || | ||||||   |||| || || |     
T  27610306 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtg 27610405  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  27610406 tttttaaaaggagctcctcctgaagatgtttcaatttatttgaagttgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 27610505  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     |||||||||    
T  27610506 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 27610605  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||||| || || | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27610606 gatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 27610657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27679946 - 27679606
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||   || ||      |     
T  27679946 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacataatctttcctttatgactggaattccctcactaacatggtctaacttaatttccaaacctgttg 27679847  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  27679846 tttttaaaaggagcttctcttggagatatttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacatgaaccttcgaattgatctgcaac 27679747  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||||  |||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| || || |||   |||||||||    
T  27679746 aaaattatagatttgtcttgcaagtgttgatttccccaaacctccaatgccataaattccaaccatatggaccccatcatcggatccctcatcaagaagc 27679647  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27679646 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28787234 - 28786883
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | || || |     
T  28787234 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28787135  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| | ||     
T  28787134 tttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 28787035  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  28787034 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 28786935  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28786934 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 28786883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28793355 - 28793004
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | || || |     
T  28793355 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28793256  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||  | ||   || |||  ||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| | ||     
T  28793255 tttttaaaaggagcacctcctggagatgtttcaatctatttgaagctgaactctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 28793156  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  28793155 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 28793056  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28793055 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 28793004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26803442 - 26803102
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  ||||||||    |  |||  |  |     
T  26803442 acatcatcgagaatcaaaagaatcttatttctacacagtctttcctttataattggaatcccctcacaaacatgatctaacttgattttcaatccagttg 26803343  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    |||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26803342 tttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagttattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 26803243  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   |||||||||    
T  26803242 aaaattatagattgctcttgcaagtgctgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagc 26803143  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     ||||||||| || || ||| || || ||||||||||||||    
T  26803142 gatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggta 26803102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 27705590 - 27705930
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||  ||||||||    |   ||  |  |     
T  27705590 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacagcctttcctttatgaatggaatcccctcacaaacatgatctaactttattttcgatccagttg 27705689  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    |||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27705690 tttttagaagaagcttctcttggagatgtttcaagtcattttgagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 27705789  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||     
T  27705790 aaaattataaattgctcttgcaagtgttgatttacccaagcctccaatgccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagt 27705889  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27705890 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27705930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 27426801 - 27427138
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactattt 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||   |  | || || | | |    
T  27426801 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 27426900  T
Q  112 ttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | ||   || ||| |||||||| || |  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27426901 ttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaa 27427000  T
Q  212 attataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaat 311  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| ||    
T  27427001 attatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgat 27427100  T
Q  312 ttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27427101 ttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27427138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27603890 - 27604241
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |   || |||||||||||    |  ||||||||||||||| || ||||||||   |||| || || |     
T  27603890 acatcatcgagaatcaaaagaatcttcattgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaatttcaagttgaagtg 27603989  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  27603990 tttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 27604089  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     ||||||||     
T  27604090 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaaga 27604189  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||    
T  27604190 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacat 27604241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28782097 - 28781746
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||   || |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | || || |     
T  28782097 acatcatcgagaatcaaaagagtcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagttgaagtg 28781998  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
     |||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  28781997 cttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 28781898  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  ||| | ||     ||||||||    
T  28781897 taagttataaactgcttttacaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaagaagc 28781798  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28781797 gatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacat 28781746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27697772 - 27698123
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||   ||  ||  |  |     
T  27697772 acatcgtcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaattccgtcactaacatggtctaaattaatttccgatccagttg 27697871  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||   || ||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27697872 ttttaaaaaggagcttctcttggagatgttccaagttatttttagctgaattcattctcacattatgaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaac 27697971  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
     |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | |||||||      
T  27697972 caaattatagattgctcttgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccaaaaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaatt 27698071  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||||  || || | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27698072 gatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 27698123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Original strand, 27592207 - 27592562
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||  | || ||||| || ||||||  | ||||||||   |||| || || |     
T  27592207 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaatttcaagttgaagtg 27592306  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||   || |||  ||||| | ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  27592307 tttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 27592406  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| ||    |||||||||    
T  27592407 aaagttataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagc 27592506  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaa 364  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27592507 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatttaa 27592562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 27676806 - 27677146
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||  | || ||||| || ||||||  | ||||||||   |||| || || |     
T  27676806 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttccatgtagcctttcctttattttaggaattccttcgctaacacttcctaacttaatttcaagttgaagtg 27676905  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||   || |||  ||||| | ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  27676906 tttttaaaaggagctcctgctggagatttttcaagttatttgaagctgaactctctttcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 27677005  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||  ||||| ||    |||||||||    
T  27677006 aaaattataaattgctttcgcaagtgttgattttcccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatgatcagatccttcatcaagaagc 27677105  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27677106 gatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 27677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26824665 - 26824459
Alignment:
Q  159 ttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtac 258  Q
    |||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||| ||| |||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  26824665 ttctctctcacgttctcaagaaaacaaaaaacttcaaatttatcagcaatagaattaaaagttgcttttgcaagtgttgatttacctaaacctccaatac 26824566  T
Q  259 cataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctac 358  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |  | ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26824565 cgtaaagtcctaccatatggaccacatcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttggcaac 26824466  T
Q  359 atttaaa 365  Q
    || ||||    
T  26824465 atgtaaa 26824459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511555
Alignment:
Q  303 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgatattgttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgttcaaaaaaacatgattgatcttgttgga 25511555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28140378 - 28140295
Alignment:
Q  162 tctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttaccc 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  28140378 tctctcacattatgaagaaaacacaaacattcaaattgatcggcaataaaattataaattgcttgtgcaagtgttgttttaccc 28140295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26937866 - 26937790
Alignment:
Q  168 acattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacc 244  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  26937866 acattatgaagaaaacacaaactttcaaattgatcaccaatcaaattataaattgctcgtgcaagtgttgatttacc 26937790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Original strand, 28097782 - 28097857
Alignment:
Q  162 tctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28097782 tctctcacattgtgaaggaaacagacacattcaaattgaccagcaatgaaattataaaccgcttttgcaagtgttg 28097857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28227783 - 28227720
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28227783 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctataaaattataaactgcccttgcaagtgttg 28227720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28235561 - 28235446
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||     || |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| | |||| |||| |||||    
T  28235561 acatcatctagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaattccctcattgacatctcctaactcaacgtccaattcaacta 28235462  T
Q  109 tttttgaaaggagctt 124  Q
     ||| |||||||||||    
T  28235461 atttggaaaggagctt 28235446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 28297085 - 28297179
Alignment:
Q  168 acattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| | ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||    
T  28297085 acattgtgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctctggcaagtgttgtctttcccatccctccagtcccata 28297179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28515108 - 28514894
Alignment:
Q  48 ctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttct 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||| |  ||    |    
T  28515108 ctttgctttatgattggaattccctcgttgacatctcctaacttaacgtccaattcaactaatttggaaaggagcttttcctgtagatgctctaaaccat 28515009  T
Q  148 taagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccat 247  Q
        || ||| || || || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| | ||||||||||  || |||||    
T  28515008 atttagctgaattttcccttacattgtgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctctggcaagtgttgtctttcccat 28514909  T
Q  248 gcctccagtaccata 262  Q
     |||||||| |||||    
T  28514908 ccctccagtcccata 28514894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Original strand, 28296965 - 28297041
Alignment:
Q  48 ctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactatttttgaaaggagctt 124  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  28296965 ctttgctttatgattggaattccctcgttgacatctcctaacttaacgtccaattcaactaatttggaaaggagctt 28297041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28326307 - 28326221
Alignment:
Q  176 aagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28326307 aagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28326221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28503943 - 28503857
Alignment:
Q  176 aagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28503943 aagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28503857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26849526 - 26849461
Alignment:
Q  191 ttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagt 256  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  26849526 ttcaaattgatcagcaatcgaattataaactgcttgagcaagtgttgtttttcccattcctccagt 26849461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28243626 - 28243538
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  28243626 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 28243538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 28126860 - 28127231
Alignment:
Q  8 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||| |||  ||||    
T  28126860 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctgcatagcctttgttttatgattgcaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccaatccaact 28126959  T
Q  108 atttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaa 207  Q
     ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| || |   |||||||  ||||||| ||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28126960 gttttcaaaaggagcttttcttggagatgtttcaaattatatggagttgaaatctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 28127059  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | || |||||    
T  28127060 tgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccaataccataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaag 28127159  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgat 379  Q
    ||| |||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || |||||||    
T  28127160 caaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatgtaagaaaacacgattgat 28127231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 379
Target Start/End: Original strand, 28163561 - 28163931
Alignment:
Q  8 gacatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  |||  || |||||    
T  28163561 gacatcatcaagaatcaaaagaattttatttctatgtagcctttgttttatgattgtaattccctcactaacacctcctaacttaatgtccgatctaact 28163660  T
Q  108 atttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaa 207  Q
     |||   |||| ||||  | ||||||||||||||||||     ||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28163661 gtttcaaaaag-agctcttcctggagatgtttcaagttggatggagttgaattctctctcacatcttctagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaa 28163759  T
Q  208 caaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaag 307  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | || |||||    
T  28163760 tgaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaagcctccagtatcataaagtcctaccatgtggacctcatcatcatatcccttatcgagaag 28163859  T
Q  308 caatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaagcatgattgat 379  Q
    |||||||||||||| || | | || |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||    
T  28163860 caatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatgtaaaaaaacacgattgat 28163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 267526 - 267877
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||   || |||  |  |     
T  267526 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacatagcctttccttaatgattggaatgccctcactaacatggtctaacttaatttccaatccagttg 267625  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | | || ||| || ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||     
T  267626 tttttaaaaggagcttctcttggagatgtttcaagttacttatagctgaattttctctcacatcatgaagaaaacataatccttcaaattgatcagcaat 267725  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||| ||  | |||||||||    
T  267726 aaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcagatccattatcaagaagc 267825  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
    ||||||||||||| || | | |||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  267826 aatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacat 267877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 2725 - 3076
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || | ||||||   |||| || || |     
T  2725 acatcatcaagaatcaaaagaaccttctttctatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctccaaacttaatttcaagttgaagtg 2824  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  2825 tttttaaaaggagctccaactgaagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 2924  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |     |||||||||    
T  2925 aaaattataaattgcttttgcaagtgttgatttacccaatcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagc 3024  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  3025 gatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacat 3076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 29273024 - 29273375
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||   || |||  |  |     
T  29273024 acatcatcgagaatcaaaagaattttctttctacttagcctctcctttataattggaatcccctcactaacatgatctaacttaatttccaatccagttg 29273123  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||   || ||| |||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  29273124 tttttaaaaggagtttctcttggagatgtttcaagttatttttagctgaattctctctcacatcatgaagaaaacataaatcttcaaattgatcagcaaa 29273223  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| |||||  ||| | |||| ||||| ||  | |||||||||    
T  29273224 aaaattatagattgctcttgcaagggttgatttacccaagccaccaatcccataaattccaaccatatggatcccatcatcagatccattatcaagaagc 29273323  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29273324 gatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacat 29273375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 3898 - 4249
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |   || |||||||||||    |  ||||||||||||||| || ||||||||   |||| || || |     
T  3898 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgaatgcagcctttcctttatatgagaaattccctcactaacacctcctaacttaatttcaagttgaagtg 3997  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||| ||| ||||     
T  3998 tttttaaaaggagctcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattcatcagcaat 4097  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||  ||||| ||    |||||||||    
T  4098 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtgggctccatgatcagatccttcatcaagaagc 4197  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4198 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 4249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 360
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13212
Alignment:
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| | ||     
T  12961 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 13060  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  13061 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 13160  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13161 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 18678742 - 18679093
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | |  || |     
T  18678742 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18678841  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |  ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  18678842 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18678941  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |     |||||||||    
T  18678942 aaaattataaattgcttttgcaagtgttaatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagc 18679041  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18679042 gatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 18679093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18074754 - 18074417
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactattt 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||   |  | || || | | |    
T  18074754 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 18074655  T
Q  112 ttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | ||   || ||| |||||||| || |  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18074654 ttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaa 18074555  T
Q  212 attataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaat 311  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| ||    
T  18074554 attatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgat 18074455  T
Q  312 ttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18074454 ttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 18074417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 18698582 - 18698933
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | |   | |     
T  18698582 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgcagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtg 18698681  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |  ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  18698682 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18698781  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||  | |||||||||    
T  18698782 aaaattataaattgctttcgcaagtgttgatttacccatgcctccaatgccataaagtcctaacatgcggactccatcatcagatcctttatcaagaagc 18698881  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
      ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18698882 gctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacat 18698933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 18654659 - 18654999
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | |  || |     
T  18654659 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatataaggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgaaagtg 18654758  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |  ||   || ||| || ||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  18654759 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagatgaattttctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18654858  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    | |||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||| ||  | |||||||||    
T  18654859 acaattattaattgattttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccatcagatcctttatcaagaagc 18654958  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18654959 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18654999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 18730686 - 18731026
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    || ||||||||||||||| || ||||||||   |  | |   | |     
T  18730686 acatcatcgagaatcaaaagaatcttctttgtatgtagcctttcctttatatagggaattccctcactaacacctcctaacttaattttcagtgctagtg 18730785  T
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |  ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  18730786 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18730885  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||  | |||||||||    
T  18730886 aaaattataaattactttagcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccataagatcctttatcaagaagc 18730985  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18730986 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18731026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 349
Target Start/End: Original strand, 18723367 - 18723607
Alignment:
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |  ||   || ||| |||||||| || || | ||||||||||   | |||||||||||| ||||     
T  18723367 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaattgatttgaagctgaattctctctcacgttttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagcaat 18723466  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | | ||| ||  | |||||||||    
T  18723467 aaaattataaattccttttgcaagtgttgattttcccatgcctccaataccataaagtcctatcatgcggactccaccattagatcctttatcaagaagc 18723566  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
     |||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  18723567 gatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggta 18723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Original strand, 5090282 - 5090392
Alignment:
Q  152 agttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcct 251  Q
    |||||| || ||||| |||||  |||||||||| | || |||||||||||  ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  5090282 agttgaattttctctcacattgggaagaaaacaaagacattcaaattgatgagcaatgaaattgtaaattgcttttccaagtgtggttttacccattcct 5090381  T
Q  252 ccagtaccata 262  Q
    ||||| |||||    
T  5090382 ccagtcccata 5090392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 5090138 - 5090203
Alignment:
Q  11 atcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcact 76  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||   ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5090138 atcatcgagaatcaaaagaactttctttctttgtagccttttctttatgattggaattccctcact 5090203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 60562 - 60225
Alignment:
Q  12 tcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaactattt 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||   |  | || || | | |    
T  60562 tcatcgagaatcaaaagaatcttctttctacacaacctttcctttatgattgagattccctcactgacatctgctaacttaattttcagttgaagtgtct 60463  T
Q  112 ttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaa 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | ||   || ||| |||||||| || |  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  60462 ttgaaaggagcatctcctggaaacgtttcaagctatttgaagctgaattctctctgacttgttcaagaaaacataaaccttcaaattgatcagcaacaaa 60363  T
Q  212 attataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagcaat 311  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||| |||||  ||||| |||| ||||  |||   ||||||||| ||    
T  60362 attatagattgctcttgcaagtgttgatttacctgagcctccaatcccataaattccaaccatatggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgat 60263  T
Q  312 ttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggta 349  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||    
T  60262 ttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggta 60225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8383 - 8132
Alignment:
Q  109 tttttgaaaggagcttcttctggagatgtttcaagttcttaagagttgacttctctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaac 208  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| || ||   || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||   | |||||||||||| | ||     
T  8383 tttttaaaaggagttcctcctggagatgtttcaatttatttgaagctgaattctctctcacattttcaagaaaacatgagcattcaaattgatcagaaat 8284  T
Q  209 aaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccataaagtcctaccatgcggacctcatcctcagagcccatgtcaagaagc 308  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||    |||||||||    
T  8283 aaaattataaattgcttttccaagtgttgatttacccaagcctccagtaccataaagtcctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagc 8184  T
Q  309 aatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacat 360  Q
     ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8183 gatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacat 8132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3280502 - 3280410
Alignment:
Q  162 tctctaacattatgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  3280502 tctctcacattgtgaagaaaacatacacattcaaattgattagcaatgaaattataaactgctcttgcaagagttgtcttacccattcctcca 3280410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28281 - 28218
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttg 237  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28281 tgaagaaaacacaaaccatcaaattgatcggctataaaattataaactgcccttgcaagtgttg 28218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35723 - 35608
Alignment:
Q  9 acatcatcaagaatcaaaagaatcttctttctagatagtctttcctttatgattggtattccctcactaacatcttctaacttaccgtcaaatttaacta 108  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||     || |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| | |||| |||| |||||    
T  35723 acatcatctagaatcaacagaaccttctttcggtgaagcctttgctttatgattggaattccctcattgacatctcctaactcaacgtccaattcaacta 35624  T
Q  109 tttttgaaaggagctt 124  Q
     ||| |||||||||||    
T  35623 atttggaaaggagctt 35608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43788 - 43700
Alignment:
Q  174 tgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctccagtaccata 262  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||    
T  43788 tgaagaaaacataaacaatcaaattgatcagctatggaattataaactgctcttgcaagtgttgtctttcccattccaccagtcccata 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16691699 - 16691618
Alignment:
Q  173 atgaagaaaacatacaccttcaaattgatcggcaacaaaattataaactgcttttgcaagtgttgatttacccatgcctcca 254  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||   |||||||||| |||||| || ||||||    
T  16691699 atgaagaaaacacaaacattcaaattgatcagcaatcaaattataaattgctcgagcaagtgttgttttaccgattcctcca 16691618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University