View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19053_low_4 (Length: 439)

Name: NF19053_low_4
Description: NF19053
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19053_low_4
NF19053_low_4
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (16-439)||(38024843-38025266)
chr3 (28-439)||(38031295-38031704)
chr3 (90-413)||(50911863-50912186)
chr3 (53-439)||(55084570-55084958)
chr3 (95-439)||(50909787-50910132)
chr3 (42-437)||(38028736-38029131)
chr3 (50-437)||(38040051-38040439)
chr3 (42-437)||(38036763-38037159)
chr3 (95-439)||(38033743-38034092)
chr3 (245-413)||(38043881-38044049)
chr3 (218-414)||(50904785-50904981)
chr3 (246-421)||(48840698-48840872)
chr3 (251-297)||(50913480-50913526)
chr3 (175-215)||(38034963-38035003)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (28-439)||(21607264-21607674)
chr8 (126-437)||(21604724-21605035)
chr8 (327-421)||(21634603-21634697)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (246-415)||(1756749-1756918)
chr5 (251-415)||(1754672-1754836)
chr5 (251-405)||(1754243-1754397)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (245-420)||(17970277-17970452)
chr4 (233-415)||(27415590-27415769)
chr4 (233-417)||(27570039-27570223)
chr4 (223-438)||(27444763-27444978)
chr4 (236-408)||(27425781-27425953)
chr4 (223-421)||(27557445-27557643)
chr4 (233-415)||(27420374-27420556)
chr4 (253-415)||(27468319-27468481)
chr4 (253-415)||(27503908-27504070)
chr4 (253-415)||(27514877-27515039)
chr4 (293-415)||(27412690-27412812)
chr4 (244-438)||(27431117-27431311)
chr4 (228-414)||(27526105-27526291)
chr4 (228-437)||(27486944-27487153)
chr4 (228-437)||(27523373-27523582)
chr4 (224-408)||(27497321-27497505)
chr4 (251-406)||(27498399-27498554)
chr4 (253-415)||(27475571-27475733)
chr4 (251-421)||(27479885-27480055)
chr4 (251-413)||(27485937-27486099)
chr4 (251-415)||(27478875-27479039)
chr4 (253-415)||(27508838-27509000)
chr4 (228-414)||(27513769-27513955)
chr4 (253-415)||(27524510-27524672)
chr4 (246-439)||(27502775-27502968)
chr4 (234-415)||(27563338-27563519)
chr4 (251-414)||(27501301-27501464)
chr4 (223-438)||(27554265-27554480)
chr4 (251-421)||(27505688-27505858)
chr4 (228-421)||(27469421-27469614)
chr4 (251-415)||(27506682-27506846)
chr4 (251-407)||(27556379-27556535)
chr4 (233-405)||(27565953-27566125)
chr4 (251-421)||(27423206-27423376)
chr4 (251-437)||(27476671-27476857)
chr4 (253-403)||(27489946-27490096)
chr4 (251-407)||(27411456-27411612)
chr4 (251-407)||(27414304-27414460)
chr4 (251-407)||(27424514-27424670)
chr4 (251-407)||(27559240-27559396)
chr4 (296-415)||(27585717-27585836)
chr4 (251-407)||(27567239-27567395)
chr4 (248-387)||(27527142-27527281)
chr4 (251-406)||(27571607-27571762)
chr4 (356-426)||(27460567-27460637)
chr4 (251-406)||(27419072-27419227)
chr4 (350-421)||(27502121-27502192)
chr4 (251-421)||(27446131-27446301)
chr4 (356-414)||(27466910-27466968)
chr4 (359-420)||(27495628-27495689)
chr4 (251-407)||(27421931-27422091)
chr4 (356-439)||(27473981-27474064)
chr4 (285-439)||(27507781-27507935)
chr4 (359-415)||(27600645-27600701)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (245-420)||(3073547-3073722)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38025266 - 38024843
Alignment:
Q  16 attttaacagctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025266 attttaacagctattttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaac 38025167  T
Q  116 aaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcattta 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025166 aaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcattta 38025067  T
Q  216 caagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025066 caagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcata 38024967  T
Q  316 cttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38024966 cttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagac 38024867  T
Q  416 attttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38024866 attttcatggaaattacttctcgc 38024843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38031704 - 38031295
Alignment:
Q  28 attttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaac 127  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031704 attttctaacaaatgaatttcaaagatact--tgaaatctataaatacactgtccttcttcacaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaac 38031607  T
Q  128 atttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaag 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031606 atttttcttaaatcagagaaattcagttttttcatcaaaacatttgaaatgggtttccatttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaag 38031507  T
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031506 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 38031407  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38031406 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagacattttcatggaa 38031307  T
Q  428 attacttctcgc 439  Q
    ||||||||||||    
T  38031306 attacttctcgc 38031295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 90 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 50912186 - 50911863
Alignment:
Q  90 caacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgttt 189  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50912186 caacttcacaaatcactcgagcaaacaaatatagaaagattttgctgaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaatatttgaaatgggtttccgttt 50912087  T
Q  190 acctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatg 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  50912086 acctgccattagacgaacttcatttacaggtagccaagcatcatcaaaagttgtgaatgtgccaaagggctatcttgcggtatatgttggagacaagatg 50911987  T
Q  290 aagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtg 389  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50911986 aaacggtttgtgatccccaagtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacttgttgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtg 50911887  T
Q  390 gcctcacgattccttgcacagaag 413  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  50911886 gcctaacaattccttgcacagaag 50911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 439
Target Start/End: Original strand, 55084570 - 55084958
Alignment:
Q  53 aaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattca 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  55084570 aaactcttgaaaactataaatacattgtcctctttcacaacttcacaaattactcaggcaaacaaatttagatacctttttcttaaatctgataaattca 55084669  T
Q  153 gttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgt 249  Q
    | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55084670 gcttgttattcaaaacatttgaaatgg-tttccgtttacctgcagctattagaaggacttcatttacgggtagccaaacatcatcaaaatctgtgaatgt 55084768  T
Q  250 accaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagt 349  Q
     ||||| || | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||    
T  55084769 gccaaaagggtgtcttgcagtgtatgttggagagaaaatgaagcggtttgtgatccctatgtcttacttgaaccaaccatcatttcaagacttgttgagt 55084868  T
Q  350 caagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  55084869 cgggcggaggaagaatttggatacgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgttttctttcatattacttctcgc 55084958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 95 - 439
Target Start/End: Original strand, 50909787 - 50910132
Alignment:
Q  95 tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttt-tttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacct 193  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || || || ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50909787 tcacaaatcactcaagcaatcaaacttggatacttttatcttacatctgagaaattcatcttatttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacca 50909886  T
Q  194 gc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatga 290  Q
    ||   |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||   ||||   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  50909887 gcagctattagacgagcttcatttagcagtagccaaacatca---aaagtattgaatgtgccaaagggttatcttgcagtgtatgttggagagcaaatgc 50909983  T
Q  291 agcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtgg 390  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50909984 tgcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacttgttgaatcaagtggaggaagaatttggatatgatcatccaatgggtgg 50910083  T
Q  391 cctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  50910084 cctcacaattccttgcacagaagatgtcttcttgcaaattacttctcgc 50910132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38029131 - 38028736
Alignment:
Q  42 ggatttcaaagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaat 140  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||  |||||||||| |||||||| |||  ||  | ||| || ||||| ||    
T  38029131 ggatttcaaa-aaactcttggaaactataaatacagtgtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaagcaatcaatcttttatacacttatcttatat 38029033  T
Q  141 ctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaa 237  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||   ||    
T  38029032 ctgagaaattcatcttgttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcattcagcagtagccaaacatca---aa 38028936  T
Q  238 agctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaa 337  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38028935 agtattgaatgtgccaaagggctatcttgcagtgtacgttggagagcaaatgaagcgatttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaa 38028836  T
Q  338 aacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 437  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  38028835 aacctgttgagtcaagccgaggaagaatttggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaagacgttttcttgcatattacttctc 38028736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38040439 - 38040051
Alignment:
Q  50 aagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaa 148  Q
    |||||||||||| || ||||||||| | | |||||| || ||||  |||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  38040439 aagaaactcttgtaaactataaatatagtgtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaaacaatcaaacttatatacatttatcttacatctgagaaa 38040340  T
Q  149 ttcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtga 245  Q
    ||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||   ||||   |||    
T  38040339 ttcatcttgttcatcaaaacatttgaaatgggttttcgtttatctgcagctattagacgggcttcattcagcagtagccaaacatca---aaagtattga 38040243  T
Q  246 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 345  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  38040242 atgtgccaaagggctatcttgcagtgtacgttggagagcaaatgaagcgatttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacctgtt 38040143  T
Q  346 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 437  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  38040142 gagtcaagccgaggaagaattcggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaagacgttttcttgcatattacttctc 38040051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 38037159 - 38036763
Alignment:
Q  42 ggatttcaaagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaact-tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaat 140  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| | | |||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||    
T  38037159 ggatttcaaa-aaactcttggaaactataaatataatgtcctccttcacaacaatcacaaatcactcaagcaaacaaacttatatacatttatcttacat 38037061  T
Q  141 ctgagaaattcagttttttcttcaaaacatt-tgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaa 236  Q
     |||||||||||  || |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||| ||||  ||||||||| ||||    |    
T  38037060 ttgagaaattcatcttgttcttcaaaaaaaactgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcctttagcagtagccaaacatcc---a 38036964  T
Q  237 aagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttca 336  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38036963 aagtattgaatgtgccaaagggctatcttgcagtgtacgttggagagcaaatgaaacggtttgttgtccccatgccatacttgaaccaagcttcatttca 38036864  T
Q  337 aaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttct 436  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||| || | |||||||||    
T  38036863 aaatttgttgagtcaagccgaggaagaattcggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaatacgttttcttgcatattacttct 38036764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 95 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38034092 - 38033743
Alignment:
Q  95 tcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaacatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacat-ttgaaatgggtttccgtttacct 193  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| || ||||| |||||||||||||   || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  38034092 tcacaaatcactcaagcaatcaaacttatatacacttatcttacatctgagaaattcgtcttgttcttcaaaaaaaattgaaatgggtttccgtttacct 38033993  T
Q  194 ---gctattagacgaacttcatttacaagtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatga 290  Q
       |||||||||||  ||||||| |  ||||| ||   | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  38033992 gcagctattagacgggcttcattcagcagtagtca---aacatcaaaagcattgaatgtgccaaagggctatcttgcagtgtacattggagagcaaatga 38033896  T
Q  291 agcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcaccc----aatgg 386  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    |||||    
T  38033895 agcggtttgttatccccacgtcatacttgaaccaagcttcatttcaaaacttgttgagtcaagccgaggaagaatttggatatgaccatccaattaatgg 38033796  T
Q  387 gtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    | ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  38033795 gcggcatcacaattccctgcacagaagatgttttcttgcatattacttctcgc 38033743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 38043881 - 38044049
Alignment:
Q  245 aatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttat 344  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||      
T  38043881 aatgtgccaaagagctatcttgcagtgtactttggagaggaaatgaagcggtttgtgatccctatgtcatacttgaatcaaacttcgtttcaagacttgc 38043980  T
Q  345 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaag 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  38043981 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcatccaatgggcggcctcacaattccttgcaccgaag 38044049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 50904981 - 50904785
Alignment:
Q  218 agtagccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatact 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  50904981 agtagccaagcatcaacaaaagcgacaaatgtgccaaagggatatcttgcagtgtacgttggagaagaaatgaagcggtttgtgatccatatgtcctact 50904882  T
Q  318 tgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 414  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50904881 tgaaccaaacttcatttcaagacttgttgagtcgagcagaggatgaattcggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccttgcagagaaga 50904785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48840872 - 48840698
Alignment:
Q  246 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 345  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  48840872 atgtgccaaagggatatcttgcattgtacgtcggagaggagatgaagcgatttgtaatccccatgccatacttgaaccaagcctcatttcaagacttgtt 48840773  T
Q  346 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48840772 gagt-aagtggagaaagaatttggatatgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgttttc 48840698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 297
Target Start/End: Original strand, 50913480 - 50913526
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtt 297  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  50913480 ccaaaaggctatcttgcagtgtatgttggagagaaaatgaagaggtt 50913526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Original strand, 38034963 - 38035003
Alignment:
Q  175 aatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcattta 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38034963 aatgggttttcgtttacctgctattagacgatcatcattta 38035003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21607674 - 21607264
Alignment:
Q  28 attttctaacaactggatttcaaagaaactcttgaaatctataaatacattatcctccatcgcaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaac 127  Q
    |||||||||||| || |||||||| | |  ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21607674 attttctaacaaatgaatttcaaa-agatacttgaaatctataaatacactgtcctccttcacaacttcacaaatcattcaagcaaacaaatttagaaac 21607576  T
Q  128 atttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaag 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21607575 atttttcttaaatcagagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgctattagacgaacttcatttacaagtagccaag 21607476  T
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21607475 catcatcaaaagttgtgaatgtaccaaagggatatcttgcggtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccgagc 21607376  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaa 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21607375 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacggttccttgcacagaagatattttcatggaa 21607276  T
Q  428 attacttctcgc 439  Q
    ||||||||||||    
T  21607275 attacttctcgc 21607264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 126 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21605035 - 21604724
Alignment:
Q  126 acatttttcttaaatctgagaaattcagttttttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgc---tattagacgaacttcatttacaagtag 222  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |  |||||    
T  21605035 acatttatcttatatctgagaaattcatcttgttcttcaaaacatttgaaatgggtttccgtttacctgcagctattagacgggcttcattcagcagtag 21604936  T
Q  223 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 322  Q
    |||| |||||   ||||   ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21604935 ccaaacatca---aaagtattgaatgtgccaaagggctatcttgcagtgtaagtaggagagcaaatgaagcgatttgttatccccacgtcatacttgaac 21604839  T
Q  323 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttca 422  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||     
T  21604838 caagcttcatttcaaaacatgttgagtcaagacgaggaagaattaggatatgaccatccaatgggcggcctcacaattccttgcacagaagacgttttct 21604739  T
Q  423 tggaaattacttctc 437  Q
    || | ||||||||||    
T  21604738 tgcatattacttctc 21604724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 421
Target Start/End: Original strand, 21634603 - 21634697
Alignment:
Q  327 cttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  21634603 cttcgtttcaagacttgctgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcatcgaatgggcggcttcacaattccttgcaccgaagatgttttc 21634697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1756918 - 1756749
Alignment:
Q  246 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||    
T  1756918 atgtaccaaagggctatcttgcagtgaatgttggagagaaacagaagcggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccatcgtttcaatacttgtt 1756819  T
Q  346 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1756818 gagtcaagctgaagaagaatttggatatgatcaccccatgggtggcctcaccattccttgcaccgaagat 1756749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 415
Target Start/End: Original strand, 1754672 - 1754836
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||  ||| ||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||  ||| |||||||    
T  1754672 ccaaagggctatgttgcagtgtatattggagagaaacagaaacggcatgtgatcccaatatcatacttgaatcaaccatcgtttcaatccttgttgagtc 1754771  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1754772 aagctgcggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattctttgcacagaagat 1754836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 1754397 - 1754243
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||  | |       
T  1754397 ccaaaaggatatctagctgtatatgttggagaagaaatgaagcggtttgtgatccccgtatcatacttgaaccaatcgtcatttcaaaaattgctaaaca 1754298  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttg 405  Q
    || | |||||| | |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  1754297 aatctgaggaacagtttgaatatgatcatccgatgggtggtctcactattccttg 1754243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 420
Target Start/End: Original strand, 17970277 - 17970452
Alignment:
Q  245 aatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttat 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||      
T  17970277 aatgtgccaaagggatatcttgcggtgtacgttggagaggaaatgaagcggtttgtgatccctacgtcatacttgaaccaaacttcatttcaatacttgc 17970376  T
Q  345 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatatttt 420  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17970377 tgagtcgggcagaggaagaattcggatacgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgtttt 17970452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 415
Target Start/End: Original strand, 27415590 - 27415769
Alignment:
Q  233 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 332  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  27415590 tcaaaagttgtggatgtgccaaagggatatcttgcagtgtatgttggaaaacaaa---agcgatttgtgatccccatatcatacttgaaccaaccatcgt 27415686  T
Q  333 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27415687 ttcaagacttgttgagtcaagctgaggaagagtttggatatgatcattccatgggtggcctcaccattccttgcacagaagat 27415769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27570223 - 27570039
Alignment:
Q  233 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 332  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||||| | |||||||| | |||| |||| |    
T  27570223 tcaaaagctgtggatgtgccaaagggatatcttgcagtatatgttggagagaaacagacgcggtatgtgatccccgtatcatacttaagccaaccttcat 27570124  T
Q  333 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatat 417  Q
    ||||| ||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27570123 ttcaagacttgctgagtcaagctgaggaagagttcggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcaccgaagatat 27570039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27444978 - 27444763
Alignment:
Q  223 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 322  Q
    |||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |    
T  27444978 ccaaacatcttcaaaaggcgtggatgtgccaaagggatatcttgcagtatacgttggagaggaaatgaagaggtttgtgatcccaatatcatacttgagc 27444879  T
Q  323 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttca 422  Q
    ||| | || |||||| | ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||     
T  27444878 caatcatcatttcaagaattattgaatcaagccgaggaacaattcggatatgaccatccaatgggtggtctcacaattccttgcagagaagacgttttct 27444779  T
Q  423 tggaaattacttctcg 438  Q
    | || |||||||||||    
T  27444778 tagatattacttctcg 27444763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 408
Target Start/End: Original strand, 27425781 - 27425953
Alignment:
Q  236 aaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttc 335  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| | || ||||    
T  27425781 aaagctgtggacgtgccaaagggatatcttgcagtatatgttggagagaaacaaaagcggtatgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccatcatttc 27425880  T
Q  336 aaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcac 408  Q
    || ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  27425881 aagacttattgagtcaatttgaggaagagtttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcac 27425953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 421
Target Start/End: Original strand, 27557445 - 27557643
Alignment:
Q  223 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 322  Q
    ||||||||| ||||| | |||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27557445 ccaagcatcttcaaagggtgtggatgtgccaaggggatatcttgccgtatatgttggagaggaaatgaagaggtttgtgatcccaatgtcatacttaaac 27557544  T
Q  323 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    ||| | || |||||| | ||  ||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  27557545 caaccatcatttcaagaattgctgaatcaagctgaggaacaatttgaatatgttcatccaatgggtggtctcactattccatgcagagaagatgttttc 27557643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 415
Target Start/End: Original strand, 27420374 - 27420556
Alignment:
Q  233 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 332  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | |||||| | |||||||||| |||| |||| |    
T  27420374 tcaaaatctgtggacgtgccaaagggatatcttgcagtatatgttggagagaaacagacgcggtatttaatccccgtatcatacttgagccaaccttcat 27420473  T
Q  333 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||||  |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27420474 ttcaaggcttgctgagtcaagttgaggaagagtttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcacggaagat 27420556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27468481 - 27468319
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || ||  |||||||||  ||||  | |||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27468481 aaagggctatgttgcggtgtatgttggagagaaactggtgcggtttgtagtccctgtatcatacttaaaccaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27468382  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27468381 tccgaggaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcacggaagat 27468319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Original strand, 27503908 - 27504070
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||| || | || |||||||||||| || ||  |||||||||  | ||  | ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27503908 aaagggctatgtttccgtgtatgttggagagaaattggcgcggtttgtagttcctgtatcatacttgaaccaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27504007  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27504008 gccgaggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccttgcaccgaagat 27504070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Original strand, 27514877 - 27515039
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || ||  |||||||||  ||||  | ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27514877 aaagggctatgttgcggtgtatgttggagagaaactggtgcggtttgtagtccctgtatcatacttgaatcaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27514976  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27514977 tccgaggaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgtacagaagat 27515039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 293 - 415
Target Start/End: Original strand, 27412690 - 27412812
Alignment:
Q  293 cggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcc 392  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27412690 cggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccattatttcaagacttattgagtcaagctgaagaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcc 27412789  T
Q  393 tcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  27412790 tcaccattccttgcacggaagat 27412812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27431311 - 27431117
Alignment:
Q  244 gaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaactta 343  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||| | || |||||| | ||     
T  27431311 gaatgtgccaaagggatatattgcagtatatgttggggatgaaatgaagaggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaccgtcatttcaagaattg 27431212  T
Q  344 ttgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcg 438  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |  | |||||||||||    
T  27431211 ttgaatcaagccgaggaacaatttggatatgaccatccaaccggtggtctcacaattccttgcagagaagacgttttcttaaatattacttctcg 27431117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27526291 - 27526105
Alignment:
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |    
T  27526291 catcttcaaaaggtgtcgatgttccaaagggatatctagcagtgtatgttggagagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaac 27526192  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 414  Q
     || || ||| | || ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27526191 ctcattccaagaattgttgagccaagctgaggaacaatttgaatatgatcatccaacgggtggtctcactattccttgcagagaaga 27526105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 437
Target Start/End: Original strand, 27486944 - 27487153
Alignment:
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||| |    
T  27486944 catcttcaaaagctgtggacgttccaaagggatatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgatccctttatcatacttaaaccaacc 27487043  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaa 427  Q
     || |||||| | || ||||  ||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| | ||     
T  27487044 atcgtttcaagaattgttgaaccaagctgaagaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtcttactattccttgcaaagaagacattttcttagat 27487143  T
Q  428 attacttctc 437  Q
    ||||||||||    
T  27487144 attacttctc 27487153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27523582 - 27523373
Alignment:
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||| |    
T  27523582 catcttcaaaagctgtggacgttccaaagggctatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatatttgaaccaaac 27523483  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaa 427  Q
    ||| || ||| | || |||||  |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| | ||     
T  27523482 ttcattccaagaattgttgagcgaagccgaggaacaatttgaatatgaccatccaatgggtggtctaactattccttgcaaagaagacattttcttagat 27523383  T
Q  428 attacttctc 437  Q
    ||||||||||    
T  27523382 attacttctc 27523373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27497505 - 27497321
Alignment:
Q  224 caagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaacc 323  Q
    ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||   ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  27497505 caagcatcatcaaaatctgtagaagttccaaagggctatgttgcagtgtatgttggagataaacaaaagcggtttgtgatccctatctcatacttaaacc 27497406  T
Q  324 aagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcac 408  Q
    || | |  |||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  27497405 aaccattgtttcaatatttgttgagtcaagctgaggaagagtttggatatgatcatcccacaggtggcctcaccattccttgcac 27497321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 406
Target Start/End: Original strand, 27498399 - 27498554
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | || || ||| |||| ||||  |    
T  27498399 ccaaagggatatctagcagtatatgttggagaggaaatgaaacgttttgtgatccctatatcatacttgaaccaaccatcgttccaagacttgttgaacc 27498498  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgc 406  Q
    |||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27498499 aagccgaggaacaattcgaatatgatcatccaatgggtggtctcactattccttgc 27498554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27475733 - 27475571
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| || ||  |||||||||  | ||  | ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  27475733 aaagggctatgttgccgtgtatgttggagagaaattggcgcggtttgtagttcctgtatcatacttgaatcaaccttcatttcaagacttgttgagtcaa 27475634  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  27475633 gccgaggaagagtttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgctccgaagat 27475571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 421
Target Start/End: Original strand, 27479885 - 27480055
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||| | || || ||||| || ||||  |    
T  27479885 ccaaaaggctatctagcagtatacgtaggagagaaaatgaagcgttttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaacatcattccaaaagttgttgaacc 27479984  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  27479985 aagctgaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcagagaagacattttc 27480055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27486099 - 27485937
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  |   ||    
T  27486099 ccaaagggctatgttgcagtgtatgttggagagaaacagaagcggtttgttgtcccaatatcatacttgaaccaaccattgtttcaagaattgctacatc 27486000  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaag 413  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27485999 aagcggaagaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgcactgaag 27485937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27479039 - 27478875
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  |   ||    
T  27479039 ccaaagggctatgttgcagtgtatgttggagagaaacagaagcggtttgttgtcccaatatcatacttgaaccaaccattgtttcaagaattgctacatc 27478940  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  27478939 aagcggaagaagaatttggatatgatcatcccatgggtggcctcaccattccttgctccgaagat 27478875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Original strand, 27508838 - 27509000
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||  | ||  ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||     
T  27508838 aaagggctatgttgcagtgtatgttggagagaaactgacgcgttttgtcgttcctgtgtcatatttgaaccaaccttcatttcaagacttgttgaatcag 27508937  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27508938 gctgaggaagagtttggatatgatcatccaacgggtggcctcaccattccatgctccgaagat 27509000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 27513955 - 27513769
Alignment:
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    |||| |||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |    
T  27513955 catcttcaaaagctgttgacgtgccaaaaggatatctagcagtgtatgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgatcccaatatcatacttgaaccaaac 27513856  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 414  Q
     || || ||| | || ||||  ||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27513855 ctcgttccaagaattgttgaaccaagctgaagaacaatatgaatatgatcatccaatgggtggtctcactattccttgcagagaaga 27513769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Original strand, 27524510 - 27524672
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||  |  | ||  | ||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||    
T  27524510 aaagggctacgttgcagtgtatgttggagagaaactgacgcggttcatagttcctgtatcatatttgaaccaaccttcatttcaagacttgttgaatcaa 27524609  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27524610 gctgaggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccgtgcaccgaagat 27524672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27502968 - 27502775
Alignment:
Q  246 atgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttatt 345  Q
    |||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||  |    
T  27502968 atgtgccaaaaggatatcttgccgtttatgtaggagagaagatgaagcggtttgtgattccaatgtcatatttgaatcaaacttcatttcaagacttgct 27502869  T
Q  346 gagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||   ||||||| ||||| | || || |||||||||    
T  27502868 gagccaagctgtggaagaatttggatatgaccatccaatgggtggtcttactattccttgtgaagaagattttttcgtagatatcacttctcgc 27502775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27563519 - 27563338
Alignment:
Q  234 caaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctt 333  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||   ||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||| | |  ||    
T  27563519 caaaagttgtggacgtgccaaagggctatcttgcagtgtacgttggagataaacaaaagagaattgtgatccccgtatcatacttgaaccaaacattgtt 27563420  T
Q  334 tcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||| | ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27563419 tcaagatttgctgagtcaagccgaagaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcactgaagat 27563338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 414
Target Start/End: Original strand, 27501301 - 27501464
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |  |||||| |||| ||||  |    
T  27501301 ccaaagggatgtctagcagtatatgttggagaggaaatgaaacggtttgtgatcccaatatcatacttaaaccaaccattgtttcaagacttgttgaacc 27501400  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 414  Q
    |||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  27501401 aagccgaggaacaatttgaatacgatcatccaacgggtggtctcactattccttgtagagaaga 27501464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 438
Target Start/End: Original strand, 27554265 - 27554480
Alignment:
Q  223 ccaagcatcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaac 322  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | || || |  || | |    
T  27554265 ccaagcatcttcaaaaggagtggatgtgccaaagggataccttgcagtatatgttggagaggaaatgaagcggtttgtgatatcaatttctttgttaagc 27554364  T
Q  323 caagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttca 422  Q
    ||| | || |||||| | ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||| | ||||||  |||||     
T  27554365 caaccatcgtttcaagaattgctgaatcaagctgaggaacaatttggatatgatcatccaacgggtagtctcacaattccttgtagagaagacgttttct 27554464  T
Q  423 tggaaattacttctcg 438  Q
    | || |||||||||||    
T  27554465 tagatattacttctcg 27554480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27505858 - 27505688
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| | || || ||| | || ||||  |    
T  27505858 ccaaaggggtatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaacctcattccaagaattgttgaacc 27505759  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  27505758 aagctgaggaacaatttgaatatgaccatccaatgggtggtctcactattccttgcagagaagagattttc 27505688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 421
Target Start/End: Original strand, 27469421 - 27469614
Alignment:
Q  228 catcatcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagc 327  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |    
T  27469421 catcttcaaaagctgtggacgttccaaagggatatctagcagtgtacgtaggagagaaaatgaagcggtttgtgatccctatatcatatttgaagcaaac 27469520  T
Q  328 ttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
     || || ||| |  | ||||| ||||| || ||| |||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  27469521 atcattacaagaactgttgagccaagctgaagaacaatttgaatatgaacatccaatgggtggtctaactattccttgcagagaagaaattttc 27469614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 415
Target Start/End: Original strand, 27506682 - 27506846
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |  |||||| | ||  |   ||    
T  27506682 ccaaagggctatgttgcagtatatgtcggagagaaacagacgcggtttgtgatcccaatatcatacttaaaccaaccattgtttcaagaattgctacatc 27506781  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27506782 aagcggaagaagaatttggatatgatcatcccatgggtggactcaccattccttgcactgaagat 27506846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27556535 - 27556379
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| |||||| | ||| |   ||    
T  27556535 ccaaaaggctatctcgcagtttatgttggagaaaaaatgaagcgatttgtgattcccatttcattattgaaccaaccttcatttcaagaattactacatc 27556436  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27556435 aagcagaagaagaatttggatatgatcattctatgggtggtctcacaattccatgca 27556379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27566125 - 27565953
Alignment:
Q  233 tcaaaagctgtgaatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcct 332  Q
    ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||   ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | |  |    
T  27566125 tcaaaagttgtggacgtgccaaagggatatcttgcagtgtatgttggagagaaacaaaagcgatttgtgatccccatatcatacctgaaccaaccattgt 27566026  T
Q  333 ttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttg 405  Q
    ||||| ||||  |||  ||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27566025 ttcaagacttgctgatacaagttgaggaagagcatggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattccttg 27565953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 421
Target Start/End: Original strand, 27423206 - 27423376
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||| || ||  ||  |||  ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| | || |||||||    
T  27423206 ccaaagagatatcttgctgtatatgttggatagaaacagacacggcatgtgatccgcatatcatacttgaaccaaccttcatttcaagaattgttgagtc 27423305  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27423306 aagccgaggaagagtttggttacaatcatcccatgggtggcctcaccgttccttgcacggaagatgttttc 27423376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 437
Target Start/End: Original strand, 27476671 - 27476857
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| | || || ||| |  |  |||| |    
T  27476671 ccaaagggatatctagcagtgtatgttggtgagaaaatgaagcggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaacctcattccaagaactgctgagcc 27476770  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctc 437  Q
    ||   |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  27476771 aaagtgaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctaactattccttgcagagaagacattttcttggatattacctctc 27476857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 403
Target Start/End: Original strand, 27489946 - 27490096
Alignment:
Q  253 aaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaa 352  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||   || ||||||||  ||||  |||||||||| ||| || | || |||||| | || |||| ||||    
T  27489946 aaagggctatgttgtagtgtatgttggagagaaacaaaaacggtttgtagtccctgtgtcatacttaaacaaaccatcatttcaagatttgttgaatcaa 27490045  T
Q  353 gcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattcct 403  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27490046 gccgaggaagagtttggatatgatcatccaatgggtggcctcaccattcct 27490096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27411612 - 27411456
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||  ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | | ||    
T  27411612 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgagacggttcgtgattccagtatcatacttgaaccaaccatcgtttcaagaattactaaatc 27411513  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  27411512 aagcagaagaagaatttggatatgatcatcctatgggtggtctcacaattccttgca 27411456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27414460 - 27414304
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |||||||| || ||  | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | | ||    
T  27414460 ccaaaaggctatcttgcagtctacgttggagataaaatgagacggtttgtgattcctgtatcatacttgaaccaaccctcatttcaagaattactaaatc 27414361  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27414360 aatcagaagaagaatttggatatgatcatccaatgggtggtcttacaattccgtgca 27414304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27424670 - 27424514
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||| |||||| | ||  | | ||    
T  27424670 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatcaaatgaggcggtttgtgattccagtatcatacttgaaccaaccttcatttcaagaattgctaaatc 27424571  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27424570 aatctgaagaagaatatggatatgatcatccaatgggtggtcttaccattccgtgca 27424514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27559396 - 27559240
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| | ||| | || || || ||||  ||||| ||| |||| |||||| | ||||| || |    
T  27559396 ccaaaaggctatctcgcagtttatgttggagacaaaatgaagagatttctgattcctatttcattattgaatcaatcttcatttcaatagttattaagcc 27559297  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27559296 aatcagaagaagagtttggatatgatcatccaatgggtggtctcacaattccttgca 27559240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 415
Target Start/End: Original strand, 27585717 - 27585836
Alignment:
Q  296 tttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctca 395  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  27585717 tttgtgatccccgtatcatacttgaaccaaccattgtttcaagatttgatgagtcaagccgaagaagagtttggatatgatcatccaatgggaggtctca 27585816  T
Q  396 cgattccttgcacagaagat 415  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27585817 ccattccttgcacagaagat 27585836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Original strand, 27567239 - 27567395
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||  ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | | ||    
T  27567239 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgagacggttcgtgattccagtatcatacttgaaccaaccatcgtttcaagaattactaaatc 27567338  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27567339 aaacagaagaagaatttggttatgatcatccaatgggtggtctcacaattccttgca 27567395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 387
Target Start/End: Original strand, 27527142 - 27527281
Alignment:
Q  248 gtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattga 347  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||| | || |||| | | ||  |||    
T  27527142 gtaccaaagggctatcttgcggtgtatgttggagataaacagaaacggtttgtgatcccaatatcacacttaaaccaaccatcgtttctagagttgctga 27527241  T
Q  348 gtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatggg 387  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27527242 gtcaagctgaggaagagtttggatatgatcatcccatggg 27527281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 406
Target Start/End: Original strand, 27571607 - 27571762
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||| || || ||  | ||||| |||| |||  | || |||||| | ||| | | ||    
T  27571607 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgaggcggttcgtgattccagtatcatatttgagccagccatcgtttcaagaattactaaatc 27571706  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgc 406  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27571707 aatcagaagaagaatttggatatgatcatccaatgggtggtctcacaattccttgc 27571762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 27460567 - 27460637
Alignment:
Q  356 gaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatgga 426  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  27460567 gaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcagagaagacattttcttgga 27460637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27419227 - 27419072
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||| || || ||  | ||||| |||| |||  | || |||||| | ||| | | ||    
T  27419227 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgaggcggttcgtgattccagtatcatatttgagccagccatcgtttcaagaattactaaatc 27419128  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgc 406  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  27419127 aatcagaagaagaatttggatatgatcatccaatgggtggtcttacaattccttgc 27419072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27502192 - 27502121
Alignment:
Q  350 caagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  27502192 caagctgaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctaactattccttgcagagaagacattttc 27502121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 421
Target Start/End: Original strand, 27446131 - 27446301
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |  ||||  ||||| ||| |||| |||||| | |  || || |    
T  27446131 ccaaaaggctatcttgcggtttatgttggagaaaaaatgaagcgatttgtgattccaacttcattattgaatcaaccttcatttcaagagtcgttaagcc 27446230  T
Q  351 aagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttc 421  Q
    || |||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  27446231 aatcagaagaagagtttgaatatgatcatcgaatggatggtctctcgattccttgcagtgaagatgttttc 27446301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 414
Target Start/End: Original strand, 27466910 - 27466968
Alignment:
Q  356 gaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaaga 414  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27466910 gaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcactattccttgcagagaaga 27466968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Original strand, 27495628 - 27495689
Alignment:
Q  359 gaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatatttt 420  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27495628 gaagagtttggatttaatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcagagaagatatttt 27495689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27422091 - 27421931
Alignment:
Q  251 ccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtc 350  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||   |||||| ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | |  |||||| | ||| | | ||    
T  27422091 ccaaaaggctatctcgcagtctatgttggagatagaatgaaacggttcgtgattccagtatcatacttgaaccaaccattatttcaagaattactaaatc 27421992  T
Q  351 aagcagaggaagaatt----tggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgca 407  Q
    ||||||| ||||||||    |||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  27421991 aagcagaagaagaatttggatggatacgatcatccaacgggtggtctcacaattccttgca 27421931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 439
Target Start/End: Original strand, 27473981 - 27474064
Alignment:
Q  356 gaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||  ||||| | || || |||||||||    
T  27473981 gaggaacaatttgaatatgatcatccaatgggtggtctcaccattccttgcggagaagacgttttcttagacatcacttctcgc 27474064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27507935 - 27507781
Alignment:
Q  285 aaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttattgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaat 384  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||  ||||| | ||  | || || || |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  27507935 aaatgaagcggtttgtaattccaatgtcatatttgaatcaaacttcacttcaagagttgctcagccaggctgtcgaagaatttggatatgaccatccaat 27507836  T
Q  385 gggtggcctcacgattccttgcacagaagatattttcatggaaattacttctcgc 439  Q
    |||||| || || ||||||||   ||||||| ||||| | || || |||||||||    
T  27507835 gggtggtcttacaattccttgtgaagaagatcttttcttagatatcacttctcgc 27507781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 415
Target Start/End: Original strand, 27600645 - 27600701
Alignment:
Q  359 gaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagat 415  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  27600645 gaagaatttggttacaatcatccaatgggtggtctcacaattccttgcaaagaagat 27600701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 420
Target Start/End: Original strand, 3073547 - 3073722
Alignment:
Q  245 aatgtaccaaagggctatcttgcagtatatgttggagagcaaatgaagcggtttgttatccccatgtcatacttgaaccaagcttcctttcaaaacttat 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||      
T  3073547 aatgtgccaaagggatatcttgcggtgtacgttggagaggaaatgaagcggtttgtgatccctacgtcatacttgaaccaaacttcatttcaatacttgc 3073646  T
Q  345 tgagtcaagcagaggaagaatttggatatgatcacccaatgggtggcctcacgattccttgcacagaagatatttt 420  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3073647 tgagtcgggcagaggaagaattcggatacgatcatccaatgggtggcctcacaattccttgcacagaagatgtttt 3073722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University