View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19054_low_1 (Length: 3331)

Name: NF19054_low_1
Description: NF19054
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19054_low_1
NF19054_low_1
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (1-2635)||(41720818-41723451)
chr5 (1-1783)||(34354418-34356200)
chr5 (2063-3324)||(41718154-41719414)
chr5 (2849-3324)||(34352542-34353017)
chr5 (2297-2635)||(34359934-34360271)
chr5 (2297-2635)||(29585302-29585640)
chr5 (2297-2618)||(34352226-34352546)
chr5 (1779-2071)||(34359375-34359667)
chr5 (2833-3323)||(23318806-23319295)
chr5 (354-673)||(7778168-7778486)
chr5 (3243-3298)||(31502535-31502590)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-2070)||(48697661-48699730)
chr4 (1-2080)||(42268311-42270390)
chr4 (1-2070)||(30946023-30948092)
chr4 (2229-3324)||(48701134-48702228)
chr4 (2299-3324)||(42265883-42266907)
chr4 (2229-3324)||(30949496-30950607)
chr4 (488-1977)||(2001772-2003267)
chr4 (2229-2635)||(48697133-48697539)
chr4 (2299-2635)||(42270602-42270937)
chr4 (2298-2631)||(24520031-24520363)
chr4 (2229-2635)||(30945479-30945901)
chr4 (2346-2635)||(10427315-10427595)
chr4 (2783-3283)||(21514391-21514893)
chr4 (2833-3101)||(1999427-1999695)
chr4 (43-235)||(2001327-2001521)
chr4 (2429-2624)||(48782850-48783031)
chr4 (3152-3286)||(1999723-1999857)
chr4 (2385-2513)||(1979253-1979375)
chr4 (2692-2783)||(1979687-1979778)
chr4 (581-692)||(30165462-30165573)
chr4 (2486-2584)||(17248015-17248112)
chr4 (2558-2635)||(36615361-36615438)
chr4 (2558-2626)||(30165900-30165968)
chr4 (764-847)||(28608721-28608804)
chr4 (2533-2571)||(1979567-1979604)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (1-2080)||(9439921-9442001)
chr8 (2298-3324)||(9443405-9444430)
chr8 (380-1977)||(24594424-24596021)
chr8 (2298-2635)||(9439374-9439710)
chr8 (2803-3290)||(24597829-24598316)
chr8 (11-235)||(24596163-24596387)
chr8 (2712-2761)||(87218-87267)
chr8 (2712-2759)||(19803179-19803226)
chr8 (2564-2620)||(4799315-4799371)
chr8 (2036-2073)||(24594367-24594404)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-2080)||(27874539-27876618)
chr6 (186-2083)||(26976720-26978602)
chr6 (2229-3324)||(27878022-27879134)
chr6 (2586-3198)||(30967674-30968287)
chr6 (1047-1977)||(1472398-1473327)
chr6 (1014-1937)||(21964817-21965725)
chr6 (2297-2635)||(26976133-26976470)
chr6 (2298-2635)||(1234680-1235016)
chr6 (2299-2635)||(27873992-27874327)
chr6 (144-1033)||(18148080-18148970)
chr6 (1781-2068)||(18967256-18967543)
chr6 (2346-2635)||(18967912-18968192)
chr6 (2362-2635)||(30986552-30986827)
chr6 (2349-2591)||(30966683-30966923)
chr6 (2803-3287)||(8480156-8480640)
chr6 (2469-2966)||(23012182-23012667)
chr6 (1610-1732)||(18967120-18967241)
chr6 (52-235)||(8481374-8481557)
chr6 (2446-2632)||(21966677-21966860)
chr6 (477-673)||(8565162-8565358)
chr6 (3232-3324)||(30968283-30968375)
chr6 (2930-3172)||(8481005-8481247)
chr6 (352-553)||(8564961-8565161)
chr6 (1955-2071)||(21966493-21966604)
chr6 (2011-2071)||(30968569-30968629)
chr6 (2712-2761)||(16777060-16777109)
chr6 (2036-2073)||(1472341-1472378)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (1-2083)||(5819102-5821184)
chr3 (2298-3324)||(5822588-5823613)
chr3 (1046-2080)||(54544598-54545632)
chr3 (2229-3324)||(2816576-2817658)
chr3 (380-1977)||(42587735-42589332)
chr3 (2297-2635)||(5818515-5818852)
chr3 (1-314)||(2814859-2815172)
chr3 (2340-2635)||(54545902-54546198)
chr3 (2803-3323)||(42585440-42585960)
chr3 (1098-1455)||(25877805-25878161)
chr3 (1333-1778)||(25880583-25881030)
chr3 (2484-2635)||(24659138-24659287)
chr3 (1317-1516)||(25880379-25880578)
chr3 (11-235)||(42587369-42587593)
chr3 (2523-2629)||(4579254-4579360)
chr3 (2451-2623)||(31204781-31204950)
chr3 (2842-3180)||(25877355-25877693)
chr3 (2930-3293)||(47277124-47277494)
chr3 (1463-1649)||(25880165-25880348)
chr3 (2346-2484)||(24671173-24671301)
chr3 (2442-2599)||(35977103-35977258)
chr3 (2712-2761)||(5382624-5382673)
chr3 (2712-2766)||(13722392-13722446)
chr3 (2346-2471)||(4579126-4579241)
chr3 (2593-2649)||(25877086-25877142)
chr3 (2036-2073)||(42589352-42589389)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-2072)||(827887-829958)
chr2 (2474-3324)||(825632-826483)
chr2 (1092-2072)||(28714582-28715550)
chr2 (762-2073)||(13840763-13842061)
chr2 (2417-3324)||(13843110-13844014)
chr2 (2229-2628)||(5198664-5199062)
chr2 (2348-2715)||(15602905-15603272)
chr2 (2474-2635)||(830288-830450)
chr2 (2370-2630)||(28715816-28716070)
chr2 (341-699)||(13842067-13842424)
chr2 (2346-2639)||(30396909-30397191)
chr2 (2340-2424)||(830205-830291)
chr2 (2340-2424)||(825549-825635)
chr2 (2477-2624)||(31592923-31593068)
chr2 (2415-2542)||(8004167-8004292)
chr2 (2415-2632)||(13840245-13840456)
chr2 (2502-2617)||(12175768-12175881)
chr2 (778-817)||(17455350-17455389)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (900-2068)||(27877-29045)
scaffold0074 (2346-2635)||(27228-27508)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (2451-3324)||(8137771-8138645)
chr7 (683-1470)||(7506016-7506802)
chr7 (1204-2068)||(2323956-2324791)
chr7 (2637-3033)||(25441076-25441478)
chr7 (1463-1977)||(7504696-7505210)
chr7 (377-716)||(2324789-2325127)
chr7 (2346-2632)||(16183636-16183913)
chr7 (2340-2632)||(30235038-30235334)
chr7 (2415-2661)||(8139940-8140183)
chr7 (1507-2075)||(22509834-22510398)
chr7 (2479-2624)||(5102606-5102749)
chr7 (2522-2632)||(36528420-36528529)
chr7 (1847-1976)||(37957033-37957162)
chr7 (2712-2761)||(11712072-11712121)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1017-1589)||(34972958-34973530)
chr1 (505-949)||(34972298-34972738)
chr1 (2346-2635)||(46191266-46191544)
chr1 (2451-2632)||(30697120-30697300)
chr1 (2451-2635)||(4130215-4130399)
chr1 (498-673)||(11926865-11927040)
chr1 (1703-1938)||(34973589-34973826)
chr1 (1707-1862)||(41413628-41413783)
chr1 (365-453)||(11927124-11927212)
chr1 (2712-2761)||(2796411-2796460)
chr1 (2712-2761)||(42376095-42376144)
chr1 (2834-2910)||(46344296-46344372)
chr1 (2712-2761)||(14476165-14476214)
chr1 (2712-2761)||(23201147-23201196)
chr1 (3215-3308)||(46452552-46452644)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (2712-2761)||(28822-28871)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 2511; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 2511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2635
Target Start/End: Original strand, 41720818 - 41723451
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720818 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 41720917  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41720918 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 41721017  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721018 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatagtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 41721117  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721118 atcggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 41721217  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721218 acaagccatgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 41721317  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721318 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 41721417  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41721418 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 41721517  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41721518 ccggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcgttggatttacatcttgaacagctagatgtaaagactgcttttcttcatg 41721617  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41721618 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 41721717  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721718 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacagcagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 41721817  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41721818 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 41721917  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41721918 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacatgaagatttggctttctcaaaa 41722017  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722018 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 41722117  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722118 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 41722217  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722218 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 41722317  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722318 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 41722417  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722418 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 41722517  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41722518 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggaacaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcatat 41722617  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722618 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 41722717  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722718 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacgctgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 41722817  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaacacataagccataaagtcacct 2100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722818 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaacacataagccataaagtcacct 41722917  T
Q  2101 tttgttgatatgttttcacatggcagtaatacatgtttgacaaaagggctttgcaatttaccattcagattttcggtgccaacattgtcaacataaattg 2200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722918 tttgttgatatgttttcacatggcagtaatacatgtttgacaaaagggttttgcaatttaccattcagattttcggtgccaacattgtcaacataaattg 41723017  T
Q  2201 gttggcagtttggctattatctatggtaataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcat 2300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723018 gttggcagtttggctattatctatggtaataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcat 41723117  T
Q  2301 cccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctccta 2400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41723118 cccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctccta 41723216  T
Q  2401 gtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaa 2500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723217 gtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaa 41723316  T
Q  2501 gttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatttta 2600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723317 gttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatttta 41723416  T
Q  2601 gctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723417 gctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 41723451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 1635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1783
Target Start/End: Original strand, 34354418 - 34356200
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34354418 aaagccagtagattattcttctctacatgtgtttggttgtcctgtgtacgtgatgtacaactcccaagacagaacgaagttggacccaaagttcagaaaa 34354517  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354518 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttattgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 34354617  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354618 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctataatgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 34354717  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354718 accgatgcacggagaacaagaaccatatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 34354817  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354818 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 34354917  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34354918 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 34355017  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  34355018 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 34355117  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355118 ccggttgtcagacttactattatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 34355217  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34355218 gagaacttgaagaagaaatttagatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacctggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 34355317  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355318 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 34355417  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355418 tttgatggcaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagttcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 34355517  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355518 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 34355617  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355618 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 34355717  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355718 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 34355817  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34355818 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaaccttagg 34355917  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34355918 tgttgcagtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 34356017  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34356018 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaactgttgtagctctgtcaacgacagaagctgagtacatggcagctacccaag 34356117  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagt 1783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34356118 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaagagaaaattactgtgtattgtgacagt 34356200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 1182; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2063 - 3324
Target Start/End: Original strand, 41718154 - 41719414
Alignment:
Q  2063 tgtgaacatgtgtgaacacataagccataaagtcaccttttgttgatatgttttcacatggcagtaatacatgtttgacaaaagggctttgcaatttacc 2162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41718154 tgtgaacatgtgtgaacacataagccataaagtcaccttttgttgatatgttttcacatggcagtaatacatgtttgacaaaagggttttgcaatttacc 41718253  T
Q  2163 attcagattttcggtgccaacattgtcaacataaattggttggcagtttggctattatctatggtaataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacgg 2262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718254 attcagattttcggtgccaacattgtcaacataaattggttggcagtttggctattatctatggtaataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacgg 41718353  T
Q  2263 tcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatat 2362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41718354 tcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatat 41718452  T
Q  2363 agagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtat 2462  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41718453 agagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtatttgtactctccttgtag 41718552  T
Q  2463 ttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaata 2562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718553 ttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaata 41718652  T
Q  2563 ttgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgta 2662  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  41718653 ttgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagccgctggttcgta 41718752  T
Q  2663 gctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattc 2762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41718753 gctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattc 41718852  T
Q  2763 ttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttgg 2862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41718853 ttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagagaagttcaacgggagaaatttttccctatgg 41718952  T
Q  2863 aaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatg 2962  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41718953 aaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgtctagacgcaatagatggcagacctgcagatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatg 41719052  T
Q  2963 ataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaa 3062  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41719053 ataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatacactaataaa 41719152  T
Q  3063 attgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaac 3162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41719153 attgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacggatcacatcaac 41719252  T
Q  3163 accctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatg 3262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719253 accctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatg 41719352  T
Q  3263 atcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41719353 atcaactcatcatcaacattacaaataataacataactgatactcttcactttgatgatgtc 41719414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2849 - 3324
Target Start/End: Original strand, 34352542 - 34353017
Alignment:
Q  2849 atttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtg 2948  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34352542 atttttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcttagacgcaatagatggcagacctgcagatatcactgacgaaaagtg 34352641  T
Q  2949 gaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgg 3048  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34352642 gaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacggcaaaggagatttgg 34352741  T
Q  3049 gatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaa 3148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34352742 gatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaa 34352841  T
Q  3149 cggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagttt 3248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34352842 cggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggagaatgagcgtgctgaacttctacttcagagttt 34352941  T
Q  3249 accagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34352942 accagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctgatactcttcactttgatgatgtc 34353017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 315; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 2297 - 2635
Target Start/End: Original strand, 34359934 - 34360271
Alignment:
Q  2297 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttct 2396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34359934 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgagatttct 34360032  T
Q  2397 cctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 2496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34360033 cctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 34360132  T
Q  2497 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 2596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34360133 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttctacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 34360232  T
Q  2597 tttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34360233 tttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 34360271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2297 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 29585640 - 29585302
Alignment:
Q  2297 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttct 2396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29585640 tcatcccaaatcagtaacaacacaacaacaagtaaagcttgtctagagtagtgagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttct 29585541  T
Q  2397 cctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 2496  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29585540 cctagtttgtattagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctctttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 29585441  T
Q  2497 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 2596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29585440 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 29585341  T
Q  2597 tttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29585340 tttagctgcatgataatattttgttactctgatacctaa 29585302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 2297 - 2618
Target Start/End: Original strand, 34352226 - 34352546
Alignment:
Q  2297 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttct 2396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34352226 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgagatttct 34352324  T
Q  2397 cctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 2496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34352325 cctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 34352424  T
Q  2497 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 2596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34352425 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 34352524  T
Q  2597 tttagctgcgtgataatatttt 2618  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34352525 tttagctgcgtgataatatttt 34352546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1779 - 2071
Target Start/End: Original strand, 34359375 - 34359667
Alignment:
Q  1779 acagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagagga 1878  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34359375 acagtcagagtgccttacacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacattggcgttcaatatcattttgttcgagaagtagtggagga 34359474  T
Q  1879 gggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcg 1978  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34359475 gggaagcgtggatatgcaaaagattcacaccaatgataacctagcggatgtaatgacaaagccgatcaacgctgacaagtttatatggtgtcgatcctcg 34359574  T
Q  1979 tatggcctattggaaacgtagcaactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacat 2071  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34359575 tatggcctattggaaacgtagcaactggagttggcaaggtagagatactttgaatgctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacat 34359667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2833 - 3323
Target Start/End: Original strand, 23318806 - 23319295
Alignment:
Q  2833 aagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagata 2932  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||   || ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||   || ||||||||    
T  23318806 aagtttaatgggagtaatttctcactgtggaaattaaagataagggtggttctaa-aaaagaaaattgcgtagacgcaattgatggtgaacctgcagata 23318904  T
Q  2933 tcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagac 3032  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| || || ||| |    
T  23318905 tcaccgatcaaaagtggaaagagatggatgacaacgatgttgccaattttcacttagcaatgacaaactcggtattgtcaagtattgcagagaaaaagtc 23319004  T
Q  3033 agcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggt 3132  Q
     |||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||| ||||||||||  |||||  |    
T  23319005 tgcaaaggagatctaagatgctcttattaaattgtacgaggtcaaatcacttcacgcaagaattttcttaaaaaggaggttctacactctctgaatgtat 23319104  T
Q  3133 gaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaac 3232  Q
    || |||| |||  ||||  ||||||| || ||| | ||||| |||||| |||| ||||| || || ||| |||  ||||| |||||||| |||||  |||    
T  23319105 gagtccatatcaataacaaatcacataaataccataaatacactatttgctcagctcacagcctcagatgtcatgatagctgaaaatgaacgtgcaaaac 23319204  T
Q  3233 ttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgt 3323  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||| |  ||||||| |||||||||||    
T  23319205 ttctacttcagagtttacctcattcatatgaacaactcatcatcaacattacaaacaacaatattgctgactctcttcattttgatgatgt 23319295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 354 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 7778486 - 7778168
Alignment:
Q  354 caacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttt 453  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |  || ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7778486 caacgcctcaaacgcaaaaaccatcttggaaatcaaactatgttataatgaggcacaattcatattgtcttctaaccgaagaaggtgaaccttcaacttt 7778387  T
Q  454 tcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaa 553  Q
     || ||| |||| ||  |||   |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||    
T  7778386 -caagagacgttaaacagttaaaatgcttcttaatagatgataacaatgcatgaagatatgaaggacttacatagaaacaagacatgtgatcttgttgaa 7778288  T
Q  554 cttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaa 653  Q
    ||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  7778287 ctttcaaaaggtcaaaaagccattcgaaacaaatggatatacaagatcaaatgtgagggtagtgatgaagtggaaccgtatcgtccaagaccggtggtaa 7778188  T
Q  654 aaggatatgctcagaaagaa 673  Q
    ||  ||||||||| ||||||    
T  7778187 aataatatgctcataaagaa 7778168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3243 - 3298
Target Start/End: Complemental strand, 31502590 - 31502535
Alignment:
Q  3243 gagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatag 3298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31502590 gagtttacaagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataatatag 31502535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 1962; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 1962; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2070
Target Start/End: Complemental strand, 48699730 - 48697661
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699730 aaagccagtagattattcttctctgcatgtgtttggttgtcctgtgtacgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 48699631  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699630 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 48699531  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699530 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatagtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 48699431  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699430 atcggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 48699331  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699330 acaagccatgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 48699231  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48699230 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 48699131  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  48699130 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 48699031  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48699030 ccggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcgttggatttacatcttgaacagctagatgtaaagactgcttttcttcatg 48698931  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48698930 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 48698831  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698830 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 48698731  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698730 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 48698631  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698630 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 48698531  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698530 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 48698431  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698430 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 48698331  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698330 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 48698231  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698230 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 48698131  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48698130 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 48698031  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48698030 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggaacaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcatat 48697931  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697930 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 48697831  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697830 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacgctgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 48697731  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaaca 2070  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697730 aaccgaagtcggcaaggtagagagattttgagagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaaca 48697661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 1904; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2080
Target Start/End: Original strand, 42268311 - 42270390
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268311 aaagccagtagattattcttctctgcatgtgtttggttgtcctgtgtatgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 42268410  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268411 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 42268510  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268511 atgaactgcaaagtaagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctattgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 42268610  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42268611 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaataatggtgttcgtcgatcaacgcgtcaaacgcagaaaccatcttggcaatcagactatgttatg 42268710  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268711 acgagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 42268810  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42268811 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 42268910  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  42268911 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaaggctggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 42269010  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42269011 ccggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcgttggatttacatcttgaacagctagatgtaaagactgcttttcttcatg 42269110  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42269111 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 42269210  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269211 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacagcagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 42269310  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269311 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 42269410  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269411 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagatcttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 42269510  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269511 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 42269610  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269611 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 42269710  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269711 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 42269810  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269811 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 42269910  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42269911 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 42270010  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42270011 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggaacaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcatat 42270110  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  42270111 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggaaggaagcgtggatatgcagaag 42270210  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42270211 attcacactaatgataacctagcagatgcaatgacaaagtcgatcaacactgacaagtttatatggtgtcgatctttgtatggcctattggaaacgtagc 42270310  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 2080  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42270311 aactagagttggcaaggtagagagactttgaatactcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 42270390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 1886; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2070
Target Start/End: Complemental strand, 30948092 - 30946023
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30948092 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtctaggaaa 30947993  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947992 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 30947893  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947892 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttttaaagagactgctattctgcagatagaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 30947793  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30947792 atcggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaataatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccatcttggcaatcagactatgttatg 30947693  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30947692 acgggccacgatgcatattgtcttatagctgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcagatgcttctcaatggatgacagcaa 30947593  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30947592 tacatgaagaaatggaggccttacgtaagaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcgaaaagccattggaaacaaatgggtatataagat 30947493  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30947492 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 30947393  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30947392 ccggttgtcagacttactactattagagtagtgttggcaatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctagatgtaaagactgcttttcttcatg 30947293  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30947292 gagaacttgaagaagaaatttatatgcttcaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 30947193  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947192 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 30947093  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30947092 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatattggtggtaggccccaataaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 30946993  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946992 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 30946893  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946892 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 30946793  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946792 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 30946693  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946692 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 30946593  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946592 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 30946493  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946492 gtgttcacgcttacaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 30946393  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946392 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggaacaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 30946293  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946292 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 30946193  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946192 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacgctgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 30946093  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaaca 2070  Q
    ||| | ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30946092 aaccgaagtcggtaaggtagagagattttgagagctcacaaaagtgactttaagtgggagactgtgaaca 30946023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 984; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2229 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 48702228 - 48701134
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 2328  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48702228 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 48702129  T
Q  2329 taaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctattt 2428  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48702128 taaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagttagtattctcctattt 48702030  T
Q  2429 ataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt 2528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48702029 ataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt 48701930  T
Q  2529 ccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctgg 2628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701929 ccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctgg 48701830  T
Q  2629 tacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcg 2728  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701829 tacctaacagtggtatcagagccgctggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcg 48701730  T
Q  2729 gtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagat 2828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701729 gtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagat 48701630  T
Q  2829 agaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgca 2928  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48701629 agagaagttcaacgggagaaatttttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgtctagacgcaatagatggcagacctgca 48701530  T
Q  2929 gatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaaga 3028  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701529 gatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaaga 48701430  T
Q  3029 agacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaat 3128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701429 agacagcaaaggagatctgggatacactaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaat 48701330  T
Q  3129 gggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgct 3228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48701329 gggtgaatccacatccgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgct 48701230  T
Q  3229 gaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48701229 gaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacataactgatactcttcactttgatgatgtc 48701134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 950; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2299 - 3324
Target Start/End: Original strand, 42265883 - 42266907
Alignment:
Q  2299 atcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcc 2398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42265883 atcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagcttctcctgtgaggtttctcc 42265981  T
Q  2399 tagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtga 2498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42265982 tagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtga 42266081  T
Q  2499 aagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattt 2598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266082 aagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattt 42266181  T
Q  2599 tagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggta 2698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266182 tagctgcgtgataatattttgttactctggtatctaacagtggtatcagagccgctggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggta 42266281  T
Q  2699 agaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttg 2798  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266282 agaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttg 42266381  T
Q  2799 gtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataat 2898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266382 gtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagagaaattcaacgggagaaatttttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataat 42266481  T
Q  2899 tgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcgg 2998  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266482 tgcctagacgcaatagatggcagacctgcagatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcgg 42266581  T
Q  2999 actcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatatt 3098  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266582 actcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatacactaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatatt 42266681  T
Q  3099 cttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttct 3198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42266682 cttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacagatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacagcttct 42266781  T
Q  3199 gatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatag 3298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266782 gatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatag 42266881  T
Q  3299 ctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  42266882 ctgatactcttcactttgatgatgtc 42266907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 882; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2229 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 30950607 - 30949496
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaa- 2327  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||     
T  30950607 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaattagtaacaacaccataacaaa 30950508  T
Q  2328 gtaaagc---------ttgtt-----tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagt- 2412  Q
    ||||  |         |||||     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  30950507 gtaacacaacaactacttgttcttagtagaatagagagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctaggtagtgttagtg 30950408  T
Q  2413 -ttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactc 2511  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30950407 tttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactttccttgtatttagagagaggttctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactc 30950308  T
Q  2512 ttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgata 2611  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30950307 ttgccccgtggttttttccc-ttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcttatcttattttagctgcgtgata 30950209  T
Q  2612 atattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttag 2711  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30950208 atattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagctcctggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttag 30950109  T
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatg 2811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30950108 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattactccggtctagtttgaatgaaaaatatttggtgtaaaaccatg 30950009  T
Q  2812 gcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaa 2911  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30950008 gcagcgaaatttgagatagagaagttcaacgggagaaaattttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaa 30949909  T
Q  2912 tagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtc 3011  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949908 tagatggcagacctgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtc 30949809  T
Q  3012 aagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaagg 3111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949808 aagtattgctgaaaaaaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaagg 30949709  T
Q  3112 ctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatag 3211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30949708 ctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacagatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacagcttctgatttcaaaatag 30949609  T
Q  3212 cggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttca 3311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30949608 cggaaaatgagcgtgctgaacttctactccagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctgatactcttca 30949509  T
Q  3312 ctttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||||||||    
T  30949508 ctttgatgatgtc 30949496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 749; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 488 - 1977
Target Start/End: Original strand, 2001772 - 2003267
Alignment:
Q  488 tggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaat 587  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  2001772 tggatggcagcaatgcataaagaaatggaagccttacatagaaacaaaagttgggaacttgttcaacttcccaagggtcggaaagccatcgggaacaaat 2001871  T
Q  588 gggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaa 687  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  2001872 gggtatacaagatcaaacgagatagtaatgatcaagtagaacgatatcgtgcaagattggtggttaaagggtatgctcagaaagaatgtattgatttcaa 2001971  T
Q  688 tgagatattttccccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagact 787  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||  | |||||||| |||    
T  2001972 tgaaatattctccccagttgttagactcactaccatcagaatagttttggctatgtgtgctgcgtttgatttatatcttgaacaattagatgtaaaaact 2002071  T
Q  788 gcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttata------tgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttga 881  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2002072 gcttttcttcacggagagcttgaagaagaaatatatatatatatgctccaaccagaaggttttgaagaacaaggaaaggaaaacttggtttgcaggttga 2002171  T
Q  882 ccaaatctctgtatggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagacca 981  Q
    |||| ||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  2002172 ccaattctatgtacagtctaaaataggcgcctagatgttggtacaagagatttgattctttcatagttagccttggatacaacagacttaattcagacca 2002271  T
Q  982 ttgtacgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccag 1081  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |     
T  2002272 ttgtacatactacaataggtttggtaataatgattttatcattttgttgttgtttgtggatgacatgttggtggtaggacccaacaaagatcaagtctaa 2002371  T
Q  1082 gaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacagga 1181  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  2002372 gaattaaaggcacaattggctagggagttcgatatgaaggacttggggccagcaaacaagattttagggatgcaaattcatcgagatagaaaagatagga 2002471  T
Q  1182 agatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaa 1281  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||    
T  2002472 atatttggctttctcaaagaaattatttacgaaaagttttgcggcacttcaacatgcaagactgtaagccaatatctaccccacttcctatcaattataa 2002571  T
Q  1282 attatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgata 1381  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2002572 attatcctccagtatgaatcctagcaatgaagcagagaggatggaaatgtctcgagtaccctatgcatcagtggtgggaagccttatgtatgccatgata 2002671  T
Q  1382 tgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggt 1481  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  2002672 tgtacaaggccagacattgcacaagcagtgggagcggttagtcgatttatggcggatcctggtaaagagcattgggatgctgttaagagaatcctgagat 2002771  T
Q  1482 acattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaag 1581  Q
    | || |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  || || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2002772 atataaaaggaaccttagatgttgcattatgtttcagaggattggaatttattgtcaaaggttatgttgattcagattttgcaggtgatcttgataaaag 2002871  T
Q  1582 aaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggag 1681  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || |||||||| ||     
T  2002872 aagatctactactggttatgtgttcacacttgcaggaggagcagtaagttggttgtcaaaattacaatctgtcgtagctctatctactacagaagctgaa 2002971  T
Q  1682 tacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgaca 1781  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  2002972 tatatggcagctatgcaagcttgcaaggaagctatttggatacaaagactaatggaagaactcgggcacagtcaacaacaaattgttgtgtattgtgaca 2003071  T
Q  1782 gtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggaggg 1881  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||| || || || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  2003072 gttagagtgcattgcatattgcaaggaatccattctttcattcgagaacaaaacacatagatgttcaataccattttgttcgagaagtggtagagaaagg 2003171  T
Q  1882 aagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctc 1977  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| | |||||   ||| || |||  |||||||||||||||    
T  2003172 gagtgttgatatgcagaaaattcacaccaaagacaatttagcagatgttatgacaaagtcaatcaatgttgacaaatttacatggtgtcgatcctc 2003267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2229 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 48697539 - 48697133
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 2328  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697539 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtataaatagcatgtcccttgcattattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 48697440  T
Q  2329 taaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctattt 2428  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48697439 taaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagttagtattctcctattt 48697341  T
Q  2429 ataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtt-ttt 2527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48697340 ataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt 48697241  T
Q  2528 tccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctg 2627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48697240 tccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcttctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctg 48697141  T
Q  2628 gtacctaa 2635  Q
    ||||||||    
T  48697140 gtacctaa 48697133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2635
Target Start/End: Original strand, 42270602 - 42270937
Alignment:
Q  2299 atcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcc 2398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42270602 atcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagcttctcctgtgaggtttctcc 42270700  T
Q  2399 tagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtga 2498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42270701 tagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtga 42270800  T
Q  2499 aagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattt 2598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42270801 aagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattt 42270900  T
Q  2599 tagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42270901 tagctgcgtgataatattttgttactctggtatctaa 42270937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2298 - 2631
Target Start/End: Complemental strand, 24520363 - 24520031
Alignment:
Q  2298 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctc 2397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24520363 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctc 24520265  T
Q  2398 ctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 2497  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24520264 ctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 24520165  T
Q  2498 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 2597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24520164 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 24520065  T
Q  2598 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtac 2631  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24520064 ttagttgcgtgataatattttgttactctggtac 24520031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2229 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 30945901 - 30945479
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaa- 2327  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  30945901 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaattagtaacaacaccagaacaaa 30945802  T
Q  2328 gtaaagc---------ttgtt-----tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagt- 2412  Q
    ||||  |         |||||     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  30945801 gtaacacaacaactacttgttcttagtagaatagagagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctaggtagtgttagtg 30945702  T
Q  2413 -ttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactc 2511  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945701 tttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggttctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactc 30945602  T
Q  2512 ttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgata 2611  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30945601 ttgccccgtgatttttt-cccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcttctcttattttagctgcgtgata 30945503  T
Q  2612 atattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  30945502 atattttgttactctgatacctaa 30945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2635
Target Start/End: Original strand, 10427315 - 10427595
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  10427315 agtgagaggaaaaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgaggtttctcctagt--------gttagtattctcctatttc-aagagagag-ggtaa 10427404  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatt-tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 2544  Q
    ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10427405 tttgtctctccttgtatttagagagaagtcttgtaattgtcttccacttagtgaaagttatctactttttccccgtagttttttccccttatttgttgag 10427504  T
Q  2545 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10427505 gggtttccgcgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagttgcgtgataatattctgttactctggtacctaa 10427595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 2783 - 3283
Target Start/End: Complemental strand, 21514893 - 21514391
Alignment:
Q  2783 gaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaat 2882  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21514893 gaaaaaaaaatatttggtgcaaaaccatggcaacgaaatttgagatagagaagttcaatgggagaaatttttccttgtggaaattgtagataagggcaat 21514794  T
Q  2883 tttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttg 2982  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||  ||| | |||| |||||  ||||  ||||| |||||||||||||| |  || || ||||  ||||| ||||||    
T  21514793 tttgagaaaaaataattgcctaaacgtgataaaaggcaaacttgtggatacgactgatgaaaagtggaaagaaaatgaagacaatgttgttgcaaatttg 21514694  T
Q  2983 cacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgct--gaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatc 3080  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||  |  ||||| |||||| |||| |||||  | |  |||||| |||||||| ||||||||||||     
T  21514693 caccttgcaatggtggattcaatattgtcaagtattattgggaaaaaaagacaacaaatgagatacgaggcactctagtaaaattgaacgaggtcaaatt 21514594  T
Q  3081 actccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattt 3180  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||   |   |||  |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  21514593 acttcacaactgaatattcttaaaaataaggctctacactcttcgaatgagtgaatccaagacaacaacatatcacatcaataccctaaatacgttattt 21514494  T
Q  3181 tctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaaca 3280  Q
    |  ||||| ||  ||||  |||||| |||| |||||| |||| | | | ||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  21514493 ttccaacttacaacttcaaatttcagaataacggaaagtgagagagttaaacttctactttagtttttatcagatttgtatgataaactcatcgtcaaca 21514394  T
Q  3281 tta 3283  Q
    |||    
T  21514393 tta 21514391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2833 - 3101
Target Start/End: Original strand, 1999427 - 1999695
Alignment:
Q  2833 aagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagata 2932  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||    
T  1999427 aagtttaatgggagtaatttctcactttggaaattaaagataagggcggttctaagaaaagacaattgcctagatgcaattgatggcagacctgcaaata 1999526  T
Q  2933 tcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagac 3032  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| | || || ||| |    
T  1999527 tcactgatcaaaagtggaaagagatggatgacaacgctgttaccaatttgcacttagcaatggcaaattcggtattgtcaagtattccagagaaaaagtc 1999626  T
Q  3033 agcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattctt 3101  Q
     ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  1999627 tgcaaaggagatatgggatgctcttattaaattgtacgaggtcaagtcacttcacacaagaattttctt 1999695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 2001327 - 2001521
Alignment:
Q  43 tgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaatgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgc 142  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| ||  | || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2001327 tgtgtacgcaatgaacaactcccaagaaagaacaaaactagatccaaagtctagaaattgtatattcttgggttatgctgacaacgtgaaggggtatcgc 2001426  T
Q  143 ctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcaggg--atgtagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcact 235  Q
     |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2001427 ttgtgggatcccactgctcacaagcttgttgttagcagagatatgtagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtgagcagaaacatgacaacact 2001521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2429 - 2624
Target Start/End: Original strand, 48782850 - 48783031
Alignment:
Q  2429 ataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt 2528  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||         |||| ||  |||||    
T  48782850 ataagagagagtggtaattgtactc--catgtatttagagagaggtcatctaatttcttccacttagtgaaagttct---------ccccatg--ttttt 48782936  T
Q  2529 ccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttact 2624  Q
    ||| ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  48782937 ccctttatttgttgagaaatttccacgt-aaatattgtgtgttcagttcctgttttctcgtttcttattttaatcgcgtgataatattttgatact 48783031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3152 - 3286
Target Start/End: Original strand, 1999723 - 1999857
Alignment:
Q  3152 atcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttacc 3251  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1999723 atcacataaataccatgaatacactatttcctcaactcacagcctcagatttcacaatagctgaaaatgaacgtgcagaacttctacttcagagtttacc 1999822  T
Q  3252 agattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaa 3286  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1999823 tgattcatatgatcaactcatcatcaatattacaa 1999857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2385 - 2513
Target Start/End: Original strand, 1979253 - 1979375
Alignment:
Q  2385 tgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaattt 2484  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  1979253 tgtgaggtttctcctggttagtgctagt----attctcctgtttataagagagagtggtaaatataccctccttgcattt--agagaggtcgtgtaattt 1979346  T
Q  2485 cttccacttagtgaaagttctctactctt 2513  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1979347 cttcctcttactgaaagttatctactctt 1979375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2692 - 2783
Target Start/End: Original strand, 1979687 - 1979778
Alignment:
Q  2692 agtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttg 2783  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1979687 agtggtaagaaaaatcttagtttgttatatggttgcagtttagactaatattccacatcataaacgaattctaattattccagtctagtttg 1979778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 692
Target Start/End: Original strand, 30165462 - 30165573
Alignment:
Q  581 aacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcg 680  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||  | || |||  ||||||||| |||||| |||| |    
T  30165462 aacaaatgggtatacaagatcacacatgatggcaatgaccaagtggaaatatattgtgcaagactaatggtcaaataatatgctcaaaaagaatgtattg 30165561  T
Q  681 acttcaatgaga 692  Q
    ||||| ||||||    
T  30165562 acttccatgaga 30165573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2486 - 2584
Target Start/End: Original strand, 17248015 - 17248112
Alignment:
Q  2486 ttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctctttt 2584  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||| || |||| |||||||    
T  17248015 ttccacttaatgaaagttctatactcttatccggtggttttttccccttatttattaagggatttccatgt-aaatattgtgtatttagtttctctttt 17248112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2558 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 36615438 - 36615361
Alignment:
Q  2558 aaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36615438 aaataatgtatgttcggtttctcttttctcatatcttattttaactgtgcgataatattttattactctagtacctaa 36615361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2558 - 2626
Target Start/End: Original strand, 30165900 - 30165968
Alignment:
Q  2558 aaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactct 2626  Q
    ||||||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  30165900 aaatattatgtgttcaattcattttttctcatatcttattttagttgtgtgatattattttgttactct 30165968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 764 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28608804 - 28608721
Alignment:
Q  764 cttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaag 847  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||    
T  28608804 cttgaacaaatggatgtaaagactgcatttcttcatggagatttagatgaagagatctacatggttcaaccagaaggatttaag 28608721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2533 - 2571
Target Start/End: Original strand, 1979567 - 1979604
Alignment:
Q  2533 ttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgtt 2571  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1979567 ttatttgttgaggggtttccacgt-aaatattgtgtgtt 1979604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 1901; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 1901; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2080
Target Start/End: Complemental strand, 9442001 - 9439921
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442001 aaagccagtagattattcttctctgcatgtgtttggttgtcctgtgtatgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 9441902  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgca-gaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9441901 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcaagaa 9441802  T
Q  200 aatgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441801 aatgaactgcaaagtaagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctattgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctg 9441702  T
Q  300 aaccggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9441701 aaccggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaataatggtgttcgtcgatcaacgcgtcaaacgcagaaaccatcttggcaatcagactatgttat 9441602  T
Q  400 gacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagca 499  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441601 gacgagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagca 9441502  T
Q  500 atgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaaga 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441501 atgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaaga 9441402  T
Q  600 tcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttc 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9441401 tcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaaggctggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttc 9441302  T
Q  700 cccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcat 799  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9441301 tccggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgcttcgttggatttacatcttgaacagctagatgtaaagactgcttttcttcat 9441202  T
Q  800 ggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtc 899  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9441201 ggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtc 9441102  T
Q  900 taaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaag 999  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441101 taaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacagcagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaag 9441002  T
Q  1000 gtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttg 1099  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441001 gtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttg 9440902  T
Q  1100 gctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaa 1199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440901 gctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaa 9440802  T
Q  1200 agaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgag 1299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440801 agaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgag 9440702  T
Q  1300 tcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacatt 1399  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440701 tcctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacatt 9440602  T
Q  1400 gcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcag 1499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440601 gcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcag 9440502  T
Q  1500 gtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggtta 1599  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440501 gtgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggtta 9440402  T
Q  1600 tgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaa 1699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440401 tgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaa 9440302  T
Q  1700 gcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcaca 1799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9440301 gcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggaacaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcata 9440202  T
Q  1800 ttgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaa 1899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9440201 ttgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcattcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggaaggaagcgtggatatgcagaa 9440102  T
Q  1900 gattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtag 1999  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9440101 gattcacactaatgataacctagcagatgcaatgacaaagtcgatcaacactgacaagtttatatggtgtcgatcttcgtatggcctattggaaacgtag 9440002  T
Q  2000 caactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 2080  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9440001 caactggagttggcaaggtagagagactttgaatactcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 9439921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 935; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2298 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 9444430 - 9443405
Alignment:
Q  2298 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctc 2397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9444430 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctc 9444332  T
Q  2398 ctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 2497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444331 ctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 9444232  T
Q  2498 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 2597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444231 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 9444132  T
Q  2598 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggt 2697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444131 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagccgctggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggt 9444032  T
Q  2698 aagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatattt 2797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9444031 aagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatattt 9443932  T
Q  2798 ggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataa 2897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443931 ggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagagaaattcaacgggagaaatttttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataa 9443832  T
Q  2898 ttgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcg 2997  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443831 ttgtctagacgcaatagatggcagacctacagatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcg 9443732  T
Q  2998 gactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatat 3097  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443731 gactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatacactaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatat 9443632  T
Q  3098 tcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttc 3197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9443631 tcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacagatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacagcttc 9443532  T
Q  3198 tgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacata 3297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443531 tgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacata 9443432  T
Q  3298 gctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9443431 gctgatactcttcactttaatgatgtc 9443405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 786; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 380 - 1977
Target Start/End: Complemental strand, 24596021 - 24594424
Alignment:
Q  380 tggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatg--gttcgga 477  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||  ||||| || || || ||||| ||||| |||||  |||| |  | || ||    
T  24596021 tggcattcagactatgtaatgacaactcatgatgcatattgtcttttaaaagaagatggggagccatcaacctttcaggaggc--tgaaagaagctcaga 24595924  T
Q  478 tgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccatt 577  Q
    || |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  24595923 tgtttctctgtggatggcagcaatgcatgaagaaatggaagccttacatagaaacaaaacttgggaacttgtttaacttcccaagggtcggaaagccatc 24595824  T
Q  578 ggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggta 677  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||    
T  24595823 gggaacaaatgggtatacaagatcaaacgagatagtaatgatcaaatagaacgatatcgtgcaagactggtggttaaagggtatgctcagaaagaaagta 24595724  T
Q  678 tcgacttcaatgagatattttccccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctgga 777  Q
    | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  | ||    
T  24595723 tagatttcaatgaaatattctccccagttgttagactcacaactatcagaatagttttggctatgtgtgttgcgtttgatttacatcttgaacaattaga 24595624  T
Q  778 tgtaaagactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcagg 877  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24595623 tgtaaaaactgcttttcttcatggagagcttgaagaagaaatatatatgctccaaccagaaggttttgaagaacaaggaaaggaaaacttggtttgcaag 24595524  T
Q  878 ttgaccaaatctctgtatggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcag 977  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  24595523 ttgaccaaatctctgtacggtctaaaacaggcgcctagatgttggtacaagagatttgattctttcatagttagccttggatacaacagacttaattcag 24595424  T
Q  978 accattgtacgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagt 1077  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  24595423 accattgtacatactacaataggtttggtaataatgattttatcattttgttgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggacccaacaaagatcaagt 24595324  T
Q  1078 ccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagac 1177  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  24595323 ccaagaattaaaggcacaattggctagagagttcaatatgaaggacttggggccagcaaacaagattttagggatgcaaattcatcgagatagaaaagat 24595224  T
Q  1178 aggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaatt 1277  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  24595223 aggaatatttggctttctcaaagaaattatttacgaaaagttttgcggcgcttcaacatgcaagattgtaagccaatatctaccccacttcctatcaatt 24595124  T
Q  1278 ttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccat 1377  Q
     |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24595123 ataaattattctccagtatgaatcctagcaatgaagcagagaggatggaaatgtctcgagtaccctatgcatcagcggtgggaagccttatgtatgccat 24595024  T
Q  1378 gatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatg 1477  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  24595023 gatatttacaaggccagacattgcacaagcagtgggagcggttagtcgatttatggcggatcctggtaaaaaacattgggatgttgttaagagaatcctg 24594924  T
Q  1478 aggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgata 1577  Q
    || || || |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  || || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24594923 agatatataaaaggaaccttagatgttgcattatgtttcagaggattggaatttattgtcaaaggttatgttgattcagattttgcaggtgatcttgata 24594824  T
Q  1578 aaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagc 1677  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| | || |||||||| || || ||||||||    
T  24594823 aaagaagatctactactggttatgtgttcacacttgcaggaggagcgataagttgattgtcaaaattacaatctgtcgtagctctatctactacagaagc 24594724  T
Q  1678 ggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgt 1777  Q
     || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  24594723 tgaatatatggcagctacacaagcttgcaaggaagctatttggatacaaagactaatggaagaactcggccacagtcaacaacaaattgttgtgtattgt 24594624  T
Q  1778 gacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagagg 1877  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  24594623 gacagtcagagtgcattgcacattgcaaggaatccagtctttcattcgagaacaaaacacataggtgttcaataccattttgttcgagaagtggtagaga 24594524  T
Q  1878 agggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctc 1977  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| | |||||  |||| || |||  ||||||| |||||||    
T  24594523 aagggagtgttgatatgcagaaaattcacaccaaagacaatttagcagatgttatgacaaagtcaatcaatgctgacaaatttacatggtgtagatcctc 24594424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2298 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 9439710 - 9439374
Alignment:
Q  2298 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctc 2397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9439710 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctc 9439612  T
Q  2398 ctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 2497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9439611 ctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 9439512  T
Q  2498 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 2597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9439511 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 9439412  T
Q  2598 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9439411 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 9439374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2803 - 3290
Target Start/End: Complemental strand, 24598316 - 24597829
Alignment:
Q  2803 aaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcc 2902  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  24598316 aaaaccatggcaacaaaatttaagattgagaagtttaatgggagtaatttctcactgtggaaattaaagataagggcgattctaagaaaagacaattgcc 24598217  T
Q  2903 tagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactc 3002  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  24598216 tagatgcaattgatggcagacctgcagatatcaccgatcaaaagtggaaagagatggatgacaacgctgttgccaatttgcacttagcaatggcagattc 24598117  T
Q  3003 ggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattctta 3102  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  24598116 ggtattgtcaagtattgcagagaaaaagtctgcaaaggagatctgggatgctcttattaaattgtacgaggtcaagtcacttcacacaagaattttctta 24598017  T
Q  3103 aagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatt 3202  Q
    || || |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||  ||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || ||||    
T  24598016 aaaaggaggctctacactctccgaatgaatgaatccatatcaataacaaatcacataaataccatgaatacactatttgctcagctcacagcctcagatt 24597917  T
Q  3203 tcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataa 3290  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24597916 tcacaatagctgaaaatgaacgtgcagaacttctacttcagagtttacctgattcatatgatcaactcatcatcaatattacaaataa 24597829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24596387 - 24596163
Alignment:
Q  11 gattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaatgtatcttct 110  Q
    |||||||||||  | ||||| || || ||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||    
T  24596387 gattattcttccttacatgtgttcggatgtactgtgtacgcaatgtacaactcccaagaaagaacaaagctagatccaaagtctagaaaatgtatattct 24596288  T
Q  111 tgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaaatgaactgca 210  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24596287 tgggttatgctgacaacgtgaaagggtatcgcttatgggatcccactgctcacaagcttgttgttagcagagatgtagtctttgcagaaaatgaactgca 24596188  T
Q  211 aagtgagcagaaaaatgacagcact 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  24596187 aagtgagcagaaacatgacaacact 24596163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Original strand, 87218 - 87267
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  87218 tatgctctgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaatt 87267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2759
Target Start/End: Original strand, 19803179 - 19803226
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaa 2759  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19803179 tatgctctgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaa 19803226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Target Start/End: Original strand, 4799315 - 4799371
Alignment:
Q  2564 tgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgt 2620  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4799315 tgtgtgttcaatttctcttttctcatctcttattttagcagtgtgataatattttgt 4799371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2036 - 2073
Target Start/End: Complemental strand, 24594404 - 24594367
Alignment:
Q  2036 tcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgt 2073  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24594404 tcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaagatgt 24594367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 1900; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 1900; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2080
Target Start/End: Complemental strand, 27876618 - 27874539
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876618 aaagccagtagattattcttctctgcatgtgtttggttgtcctgtgtacgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 27876519  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876518 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 27876419  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876418 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatagtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 27876319  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876318 atcggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 27876219  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876218 acaagccatgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 27876119  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27876118 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 27876019  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27876018 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggaatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 27875919  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27875918 acggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgtttttcttcatg 27875819  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27875818 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtaaagtct 27875719  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27875718 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttaagaccattgaacgtactacaaaagg 27875619  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27875618 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatattggtggtaggccccaaaaaagatcgagtccaagaattgaaggcacagttgg 27875519  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875518 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 27875419  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875418 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 27875319  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875318 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 27875219  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875218 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 27875119  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875118 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 27875019  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27875018 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 27874919  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27874918 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggaacaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcatat 27874819  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27874818 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcattcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggaaggaagcgtggatatgcagaag 27874719  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27874718 attcacactaatgataacctagcagatgcaatgacaaagtcgatcaacactgacaagtttatatggtgtcgatctttgtatggcctattggaaacgtagc 27874619  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 2080  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874618 aactagagttggcaaggtagagagactttgaatactcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 27874539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 1656; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 186 - 2083
Target Start/End: Complemental strand, 26978602 - 26976720
Alignment:
Q  186 tagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtga 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978602 tagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtaagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctattgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtga 26978503  T
Q  286 ttcttctgaagctgaaccggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaa 385  Q
    ||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26978502 ttcttctgaagctgaacc---------------agaaccagatgatgtcaataatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccatcttggcaa 26978418  T
Q  386 tcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctc 485  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978417 tcagactatgttatgacgagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaaattttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctc 26978318  T
Q  486 aatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaa 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978317 aatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaa 26978218  T
Q  586 atgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttc 685  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26978217 atgggtatacaagatcaaacgtaatggcaatgataaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttc 26978118  T
Q  686 aatgagatattttccccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaaga 785  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26978117 aatgagatattttctccggttgtcagacttactactatcaaagtagtgttggcgatgtgtgctgcgttggatttacatcttgaacagctagatgtaaaga 26978018  T
Q  786 ctgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26978017 ctgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaa 26977918  T
Q  886 atctctgtatggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgt 985  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977917 atctctgtacggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgt 26977818  T
Q  986 acgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaat 1085  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26977817 acgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgggtccaagaat 26977718  T
Q  1086 tgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagat 1185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977717 tgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagat 26977618  T
Q  1186 ttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaatta 1285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26977617 ttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagattgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaatta 26977518  T
Q  1286 tcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgta 1385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977517 tcctcaggtatgagtcctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgta 26977418  T
Q  1386 caagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacat 1485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977417 caagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacat 26977318  T
Q  1486 taaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaa 1585  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26977317 taaaggaacctcaggtgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaa 26977218  T
Q  1586 tctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtaca 1685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26977217 tctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaactgttgtagctctgtcaacgacagaagctgagtaca 26977118  T
Q  1686 tggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtca 1785  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  26977117 tggcagctacccaagcatgcaaggaagctatctgggtgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggagaaaattactgtgtattgtgacagtca 26977018  T
Q  1786 gagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagt 1885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  26977017 gagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggtgttcaatatcattttgttcgagaagtagtggaggagggaagc 26976918  T
Q  1886 gtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcc 1985  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26976917 gtggatatgcaaaagattcacactaatgataacctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgacaagtttatatggtgtcgatcctcgtatggcc 26976818  T
Q  1986 tattggaaacgtagcaactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaacacat 2083  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976817 tattggaaacgtagcaactgaagttggcaaagtagagaaactttgaatgctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaacacat 26976720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 926; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2229 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 27879134 - 27878022
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaa- 2327  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  27879134 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaattagtaacaacaccagaacaaa 27879035  T
Q  2328 gtaaagc---------ttgtt-----tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagt- 2412  Q
    ||||  |         |||||     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  27879034 gtaacacaacaactacttgttcttagtagaatagagagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctaggtagtgttagtg 27878935  T
Q  2413 -ttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactc 2511  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878934 tttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactc 27878835  T
Q  2512 ttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgata 2611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878834 ttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgata 27878735  T
Q  2612 atattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttag 2711  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878734 atattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagcccctggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttag 27878635  T
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatg 2811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878634 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatg 27878535  T
Q  2812 gcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaa 2911  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27878534 gcagcgaaatttgagatagagaagttcaacgggagaaatttttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgtctagacgcaa 27878435  T
Q  2912 tagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtc 3011  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878434 tagatggcagacctgcagatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtc 27878335  T
Q  3012 aagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaagg 3111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878334 aagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatacactaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaagg 27878235  T
Q  3112 ctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatag 3211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27878234 ctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatag 27878135  T
Q  3212 cggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttca 3311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27878134 cggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacataactgatactcttca 27878035  T
Q  3312 ctttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||||||||    
T  27878034 ctttgatgatgtc 27878022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2586 - 3198
Target Start/End: Original strand, 30967674 - 30968287
Alignment:
Q  2586 tcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaac 2685  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30967674 tcgtctcttattttagctgcttgataatattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagcctttagttcgtagctgttattccgctgcgataaac 30967773  T
Q  2686 tagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggttt-aaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttga 2784  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30967774 tagtggtgtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttggagttttaaactgatcttccacatcataaaagaattcttattactctggtctagtttga 30967873  T
Q  2785 aagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattt 2884  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30967874 atgaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaattcgagatagagaagttcaacgggagaaatttttccctgtggaaattgaagataagggcaattt 30967973  T
Q  2885 taagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgca 2984  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967974 taagaaaagataattgcctagacacaatagatggcagacctgcagatatcactgttgaaaagcggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgca 30968073  T
Q  2985 cctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactc 3084  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968074 cctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacattaaaggagatctgggatattctaataaaattgtacgaggtcaaatcactc 30968173  T
Q  3085 cacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctc 3184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968174 cacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacgaatcacatcaacaccctgaatacgctattttctc 30968273  T
Q  3185 aactcacggcttct 3198  Q
    |||||| |||||||    
T  30968274 aactcatggcttct 30968287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1047 - 1977
Target Start/End: Complemental strand, 1473327 - 1472398
Alignment:
Q  1047 tgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagatttt 1146  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1473327 tgttggtggtaggacccaacaaagatcaagtccaagaattaaaggcacaattggccagggagtttgatatgaaggacttgggtccagcaaacaagatttt 1473228  T
Q  1147 agggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgt 1246  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |  | ||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  1473227 agggatgcaaattcatcgagatagaaaagataggaatatttggctttctcaaagaaattatttccgaaaagttttgcggcacttcaacatgcaagactgt 1473128  T
Q  1247 aagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatg 1346  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1473127 aagccaatatctaccccacttcctatcaattataaattatcttccggtatgaatcctagcaatgaagcagagaggatggaaatgtctcgagtaccctatg 1473028  T
Q  1347 catcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaa 1446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1473027 catcagcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaaggtcagacattgcacaagcagtgggagcggttagtcgatttatggcggatcctggtaa 1472928  T
Q  1447 agagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttat 1546  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  || || |  ||||  ||||||    
T  1472927 agagcattgggatgctgttaagagaatcctgagatatataaaaggaaccttagatgttgcattatgtttcagaggattggaatttatcgtcaaaggttat 1472828  T
Q  1547 gttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttac 1646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1472827 gttgattcagattttgcaggtgatcttgataaaagaagatctactactggttatgtgttcacacttgcaggaggagcagtaagttggttgtcaaaattac 1472728  T
Q  1647 aaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgg 1746  Q
     ||  || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||     
T  1472727 -aattgtcgtagctctctctactacagaagctgaatatatggcagctacgcaagcttgcaaggaagctatttggatacaaagactaatggaagaactcgt 1472629  T
Q  1747 gcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgtt 1846  Q
    |||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||| || || || |||||||  |||    
T  1472628 gcacagtcaacaacaaattgttgtgtattgtgacagtcagagtgcattgcacattgcatgtaatccagtctttcattcgagaacaaaacacatagatgtt 1472529  T
Q  1847 caatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatca 1946  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||    
T  1472528 caataccattttgttcgagaagtagtagagaaaaggagtgttgatatgcagaaaattcacaccaaagacaatttagcagatgttatgacaaagtcaatca 1472429  T
Q  1947 acactgataagtttgtatggtgtcgatcctc 1977  Q
    |  |||| || |||  |||||||||||||||    
T  1472428 atgctgacaaatttacatggtgtcgatcctc 1472398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1014 - 1937
Target Start/End: Original strand, 21964817 - 21965725
Alignment:
Q  1014 attttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcga 1113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  21964817 attttatcactttactgttgtatgtggattacatgttggtggtaggccccaacaaagacctagttcatgaattgaatacatagttggctagggagttcaa 21964916  T
Q  1114 tatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaagaattatctaagg 1213  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| | ||||||||     
T  21964917 tatgaaagacttgggactaataaacaagattttagagatgtacat-caccgagacagaaaagataggaagatttagct--ctcaaaagcactatctaaga 21965013  T
Q  1214 aaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaag 1313  Q
    ||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21965014 aaagtcttgtgacgcttaaaaatgcaagattgttagccaatctctaccccacttcttgtgaattttaaattatccttcggtatgagtcctaacaatgaag 21965113  T
Q  1314 tggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtggg 1413  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21965114 aagagaggatgaaaatgtctcgagtatcgtatatattcgcggttggaagccttatgtatgtcatgatatgtaaaagaccagacattgcacaagcagtggg 21965213  T
Q  1414 agtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgt 1513  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||       ||||  ||| |    
T  21965214 agtagttagtcggtttatggcagattc-ggtaaagagcatcagaatgttggtaaaagaa-caagaggtacattaaaggaacc-------ttgcaatat-t 21965303  T
Q  1514 ttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttg 1613  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||     
T  21965304 ttcggaggattaaagttaactatcaggggttatattgattcgaattttgcacttgatcatgataatagaaaatcaactattggatatgtgttcacgcttc 21965403  T
Q  1614 caggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagc 1713  Q
    || || ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||   ||||| | |||||||   |||||||| |||| |    
T  21965404 caagatgagcagtaagttggttacccaagttacaaactattgtagctctgtcaacgtcaaaagcttcgtacaagacagctaccttagcatgcatggaaac 21965503  T
Q  1714 tatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatcca 1813  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21965504 tatttggatgcgaaggttaattgagcaacttaggcataagcagcaacgaattattgtgtat--tgacagtcagagtaccttgcacatttcaaggaatcca 21965601  T
Q  1814 gcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatg 1913  Q
     ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||   |||||||||||    
T  21965602 acttttcattcaagaacggagcacacaggcgttcaatattattttgtttgagaagtagtgaaggaatgaagggtggatatgcagaatgctcacaccaatg 21965701  T
Q  1914 ataatctagcagatgtaatgacaa 1937  Q
    |||| |||| ||||||||||||||    
T  21965702 ataacctagaagatgtaatgacaa 21965725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 2297 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 26976470 - 26976133
Alignment:
Q  2297 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttct 2396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26976470 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttct 26976372  T
Q  2397 cctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 2496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976371 cctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 26976272  T
Q  2497 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 2596  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976271 gaaagttctctactcttgccccttggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 26976172  T
Q  2597 tttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26976171 tttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 26976133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2298 - 2635
Target Start/End: Original strand, 1234680 - 1235016
Alignment:
Q  2298 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctc 2397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1234680 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctc 1234778  T
Q  2398 ctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 2497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1234779 ctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 1234878  T
Q  2498 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 2597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1234879 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 1234978  T
Q  2598 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1234979 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 1235016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2299 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 27874327 - 27873992
Alignment:
Q  2299 atcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcc 2398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27874327 atcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagcttctcctgtgaggtttctcc 27874229  T
Q  2399 tagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtga 2498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874228 tagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtga 27874129  T
Q  2499 aagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattt 2598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27874128 aagttctctactcttgccccgtggttttttccctttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcttctcttattt 27874029  T
Q  2599 tagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27874028 tagatgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 27873992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 144 - 1033
Target Start/End: Complemental strand, 18148970 - 18148080
Alignment:
Q  144 tgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaaga 243  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  || | |||||||| ||||| |||| |||||  |||||    
T  18148970 tgtgagattccactacccgcaaggttgttgttatcatggatgtagtctttgtagaaaatgagttgtagagtgagcataaaaaagacaacactttcaaaga 18148871  T
Q  244 gactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctgaaccggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggt 343  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |  ||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  18148870 gattgcaatagtgcatatggaagaaaaattcaaggaaagtgattcttctgaagctgaatcagagcacgatgtgcaagaaccaaatgcggtcaatggtggt 18148771  T
Q  344 gttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaac 443  Q
    |   ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    | ||| | ||||| ||||  | |||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  18148770 gcctgtcgatcaacatgtcaggcgcagaaaccatctcaatagtcaaaatatgtaatgaagatccaaaatgcatattgtcttctaatggaagaaggtgaac 18148671  T
Q  444 cgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatggga 543  Q
    | |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  || | |||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  18148670 cttcaaattttcaagaggcgttgaagaattcatatttttttaaatatatgacaataatgcatgaagaaatggaggccctacaaagaaacaagacatggga 18148571  T
Q  544 gcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaaga 643  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||| |||||   |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  18148570 gcttgttaaactttcaaagggtcaaaaagacattggaaagaaatgaacatacgagatcaaacatgattgtaatgatctagttgaacaatatcgtgcaaga 18148471  T
Q  644 ctggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttccccggttgttagacttactactat-cagagtagtgttggcgatg 742  Q
    || |||| |||||||||| || ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||| |||    
T  18148470 ctagttgcaaaaggatattcttagacagaaggtgttgactttaatgagatattttctccggttgttagactcactacaatacag-gtaatgttggcaatg 18148372  T
Q  743 tgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggat 842  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||| | | |||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||    
T  18148371 tgtgttgcattggatttacatcttgaatagttagatgtaaagagtgtttttctacctagagagcttgaagaagaaattcatgtgctccaatcgaaagcat 18148272  T
Q  843 ttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtctaaagc-aggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctt 941  Q
    ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||    
T  18148271 ttaaataataagcaaaagaaaaattggtttgcaggttaactaaatctatgtatggtttaaatcaaggcgcccataggttggtacaagacaattgattctt 18148172  T
Q  942 tcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttg 1033  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| | |||  ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18148171 tcataattagtttcgattacaacaaactaatttctcactgttgtacatactacaaaaggttttatggtaatgattttatcattttgctgttg 18148080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1781 - 2068
Target Start/End: Original strand, 18967256 - 18967543
Alignment:
Q  1781 agtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagg 1880  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18967256 agtcagagtgccttacacattgcaaggaatccaacttttcattcaaggacgaaacacataggcgttaaatatcattttgttcgacaagtagtggaggagg 18967355  T
Q  1881 gaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgta 1980  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  18967356 gaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtgatgacaaaaccaatcaatgctgacaagtttatatggtgtcgatcctccta 18967455  T
Q  1981 tggcctattggaaacgtagcaactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaa 2068  Q
    |||||||||| |||| |||||||  || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18967456 tggcctattgaaaacatagcaacatgaatgggtaaggtagagagattttggaagctcgcaaaagtagctttaagtgggagattgtgaa 18967543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2635
Target Start/End: Original strand, 18967912 - 18968192
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||  | ||||||| | |||    
T  18967912 agtgagaggaaaaatataaagaggaaatatagtttctcttgtgaggtttctcctagt--------gttagtattctcctatttc-atgagagag-gctaa 18968001  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatt-tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 2544  Q
    ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18968002 tttgtctctccttgtatttagagagaagtcttgtaattgtcttccacttagtgaaagttttctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 18968101  T
Q  2545 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18968102 gggtttccacgtaaaatattatgtattcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 18968192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2362 - 2635
Target Start/End: Original strand, 30986552 - 30986827
Alignment:
Q  2362 tagagagaaa-aattagtttctcctg-tgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttg 2459  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30986552 tagagagaaagaaatagtttctcctcatgaggtttctcctaggtagtgtcagt----attcttctatttacaagagagagtggtaattgtactctccttg 30986647  T
Q  2460 tatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtgg--ttttttccccttatttgttgagggg---tttccac 2554  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||   |||||||    
T  30986648 catttagagagaggtcctgcaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttttttccttatttgttgaggggtactttccac 30986747  T
Q  2555 gtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30986748 gt-aaatattgtgcgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctacgtgataatattttgttactctgatacctaa 30986827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2349 - 2591
Target Start/End: Original strand, 30966683 - 30966923
Alignment:
Q  2349 gagagaaaaaatatagagagaaa-aattagtttctcct-gtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaat 2446  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| | |  | |||    ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30966683 gagagaaaaaatatagagagaaagaaatagtttctacttgtgaggtttctcctaggtagcctcagt----attcttctatttacaagagagagtggtaat 30966778  T
Q  2447 tgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttt-ttccccttatttgttgagg 2545  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  30966779 tgtactctccttgcatttagagagaggttctgcaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtgattttatttcccttatttgttgatg 30966878  T
Q  2546 ggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtct 2591  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966879 ggtttccacgt-aaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtct 30966923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2803 - 3287
Target Start/End: Complemental strand, 8480640 - 8480156
Alignment:
Q  2803 aaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcc 2902  Q
    ||||||||| || | |||||| | || || ||||| || | ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8480640 aaaaccatgacaacaaaatttaatattgagaagtttaatgagagtaatttttcattgtggaaattaaagataagggcgattctaagaaaagataattgcc 8480541  T
Q  2903 tagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactc 3002  Q
    |||| |||||  |||| |||  |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |   || ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  8480540 tagatgcaatttatggtagatatgcaaatatcactgattaaaagtggaaaaagatggatgacaacgttttttccaatttgcacttagcaattgcagactc 8480441  T
Q  3003 ggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattctta 3102  Q
    |||||| ||||||||| | || || ||| | |||| |||||||| ||||  | | || ||||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  8480440 ggtattttcaagtattacagagaaaaagtctgcaagggagatctaggatgttattattaaattgtacaaggtgaagtcacttcacacaagaattttctta 8480341  T
Q  3103 aagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatt 3202  Q
    ||  | || || |||||||| ||||||  ||||| || |||   |||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||  | || ||||    
T  8480340 aaatggagtctttacactctccgaatgaatgaatacatatcgacaacaaatcacataaacaccatgaatacactatttgctcagctcacaacatcagatt 8480241  T
Q  3203 tcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaa 3287  Q
    |||  ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8480240 tcatgatagctgaaaataaacgtgcagaacttctacttcagagtttacctgattcatatgatcaactcatcatcaacattacaaa 8480156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2469 - 2966
Target Start/End: Complemental strand, 23012667 - 23012182
Alignment:
Q  2469 agaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgt 2568  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||| || | ||||||||||||| || |||||    
T  23012667 agaggtcttgaaatttctctcacttagtgaaagttctctactcttgccca-tggtttttccccttaatttgt-gacgagtttccacgtaaa-taatgtgt 23012571  T
Q  2569 gttcagttcctctttt-ctcgtctcttattttagctgcgtgataata-ttttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctg 2666  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||| || | ||  ||  ||||| |||| |||||| ||    
T  23012570 gttcaattcttctttttctcgtctcttattttagttgcgtgataatattttttttactttgttacccaacaatgtcatttgagccattggctcgtagttg 23012471  T
Q  2667 ttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttat 2766  Q
    || |||| |    | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||       |||| || |    
T  23012470 ttgttccacatcaacaaacaagtgcagtggtaagaaaaaacttagtatgctttgtggttacagtttagcctgatcttccacatc-------aattttttt 23012378  T
Q  2767 tattccggtctagttt---gaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttgga 2863  Q
    ||||||  | ||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||      ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23012377 tattccaatttagtttggagaaataaaaatatttggtataaaaccatgacagcaaaattcgag------aagttgaatgggagaaatttttccctatgga 23012284  T
Q  2864 aattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatga 2963  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| ||  || || ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||    
T  23012283 aattgaatataatggcaattttgataaaagataatttcctaaacgcaatagat-gcccacatgtagatatcacagaagaaaagttgaaagagatggaaga 23012185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1610 - 1732
Target Start/End: Original strand, 18967120 - 18967241
Alignment:
Q  1610 cttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaagg 1709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  18967120 cttgcaggaggagcagtaagttggttatccaagttacaa-ctgttgtagctctgtcaacgacagaagctgagtacattgcagctacccaagcatgcaatg 18967218  T
Q  1710 aagctatttggatgcaaaggtta 1732  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  18967219 aagctatttggatgcaaacgtta 18967241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8481557 - 8481374
Alignment:
Q  52 gatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaatgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggat 151  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| |||   || |||||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  8481557 gatgtacatctcccaagacagaacaaagacagatccaaagtctaaaaaatgtatattcttgggttatactgacaagatgaaggggtatcgcttgtgggat 8481458  T
Q  152 cccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcact 235  Q
    ||||||   |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8481457 cccactattcgcaagcttgttgttggcagagatgtagtctttgcagaaaatgaactgcaaagtgagcagaaacatgacaacact 8481374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2446 - 2632
Target Start/End: Original strand, 21966677 - 21966860
Alignment:
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgagg 2545  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  21966677 ttgtactctctttgaaattagagagaggtcttataatttcttccatttagtgaaagttctctactcttgccccat-gatttttccctttatttattgagg 21966775  T
Q  2546 ggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacc 2632  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21966776 ggtttccacat-aaatattttatgtttagttcctcttttctcatatgtta-tttagctgcgtgataatgtttcgttactttggtacc 21966860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 673
Target Start/End: Original strand, 8565162 - 8565358
Alignment:
Q  477 atgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccat 576  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||    
T  8565162 atgcttcttaatggatgataataatgcatgaagatatgaaggacttacatagaaacaagacatgtgagcttgttgaacttccaaaaggtcaaaaagtcat 8565261  T
Q  577 tggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaa 673  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||   |||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||    
T  8565262 tcgaaacaaatggatatacaagatcaaatgtgagggttgtgatcaagtgaaaccgtatcgtccaagactcgtggtaaattaatatgctcagaaagaa 8565358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3232 - 3324
Target Start/End: Original strand, 30968283 - 30968375
Alignment:
Q  3232 cttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  30968283 cttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatatctgatactcttcacttttatgatgtc 30968375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2930 - 3172
Target Start/End: Original strand, 8481005 - 8481247
Alignment:
Q  2930 atatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaa 3029  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |   ||||| |||| ||| |||||||||| |||| | || | ||| ||||||   | || ||    
T  8481005 atatcactgatcaaaagtggaaagagatggatgacaacgatattgccgattttcacttagcaatggcagacttgatactttcatgtattgtatagaataa 8481104  T
Q  3030 gacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatg 3129  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  8481105 gactgcaagggagatctaggatactcttattaaattgtacgaggtcaagtcacttcaaacaataattttcttgaaaaggaggctctacactctccgaatg 8481204  T
Q  3130 ggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaata 3172  Q
      |||||||| |||  ||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  8481205 aatgaatccatatcaataacaaatcacataaacaccatgaata 8481247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 553
Target Start/End: Original strand, 8564961 - 8565161
Alignment:
Q  352 atcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaact 451  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||  || ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  8564961 atcaacgcctcaaacgcaaaaaccatcttggaaatcaaactatgttacgatgaggcacaattcatatagtcttctaactgaacaaggtgaaccttcaact 8565060  T
Q  452 tttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttg 551  Q
    || || |||||||| ||  |||   |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  8565061 tt-caagaggcgttaaacagttaaaatgcttcttaatggatgataacaacgcatgaagatatgaaggacttacatagaaacaagacatctgagcttgttg 8565159  T
Q  552 aa 553  Q
    ||    
T  8565160 aa 8565161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1955 - 2071
Target Start/End: Original strand, 21966493 - 21966604
Alignment:
Q  1955 aagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagcaact-ggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaa 2053  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || |||    
T  21966493 aagtttgtatggtgtcgatcctcgtatg------ttgaaacgtagcaataaggagttggcaaggtagagagattttgaaatcttacaaaagtggctgtaa 21966586  T
Q  2054 gtgggagattgtgaacat 2071  Q
    |||||| |||||||||||    
T  21966587 gtgggatattgtgaacat 21966604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2011 - 2071
Target Start/End: Original strand, 30968569 - 30968629
Alignment:
Q  2011 ggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacat 2071  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30968569 ggcaaggtagagagattttgagtgctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacat 30968629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Complemental strand, 16777109 - 16777060
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16777109 tatgctctgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaatt 16777060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2036 - 2073
Target Start/End: Complemental strand, 1472378 - 1472341
Alignment:
Q  2036 tcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgt 2073  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1472378 tcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaagatgt 1472341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 1895; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 1895; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2083
Target Start/End: Complemental strand, 5821184 - 5819102
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821184 aaagccagtagattattcttctctgcatgtgtttggttgtcctgtgtatgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 5821085  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5821084 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 5820985  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820984 atgaactgcaaagtaagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctattgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 5820885  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5820884 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaataatggtgttcgtcgatcaacgcgtcaaacgcagaaaccatcttggcaatcagactatgttatg 5820785  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820784 acgagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 5820685  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820684 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 5820585  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5820584 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 5820485  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5820484 ccggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcgttggatttacatcttgaacagctagatgtaaagactgcttttcttcatg 5820385  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5820384 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 5820285  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820284 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 5820185  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820184 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 5820085  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5820084 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 5819985  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819984 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 5819885  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819884 cctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 5819785  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819784 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 5819685  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819684 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 5819585  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5819584 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaactgttgtagctctgtcaacgacagaagctgagtacatggcagctacccaag 5819485  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819484 catgcaaggaagctatctggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggagaaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 5819385  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  5819384 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgagaagtagtggaggagggaagcgtggatatgcaaaag 5819285  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819284 attcacactaatgataacctagcagttgtaatgacaaagccgatcaacactgacaagtttatatggcgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 5819185  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaacacat 2083  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5819184 aactgaagttggcaaagtagagaaactttgaatgctcacaaaagtaactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaacacat 5819102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 955; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2298 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 5823613 - 5822588
Alignment:
Q  2298 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctc 2397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5823613 catcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctc 5823515  T
Q  2398 ctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 2497  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823514 ctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtg 5823415  T
Q  2498 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 2597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823414 aaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatt 5823315  T
Q  2598 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggt 2697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823314 ttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagccgctggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggt 5823215  T
Q  2698 aagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatattt 2797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823214 aagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatattt 5823115  T
Q  2798 ggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataa 2897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823114 ggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagagaagttcaacgggagaaatttttccctatggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataa 5823015  T
Q  2898 ttgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcg 2997  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823014 ttgtctagacgcaatagatggcagacctgcagatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcg 5822915  T
Q  2998 gactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatat 3097  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822914 gactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatacactaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatat 5822815  T
Q  3098 tcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttc 3197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5822814 tcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacagcttc 5822715  T
Q  3198 tgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacata 3297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5822714 tgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacata 5822615  T
Q  3298 gctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5822614 gctgatactcttcactttgatgatgtc 5822588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 899; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1046 - 2080
Target Start/End: Original strand, 54544598 - 54545632
Alignment:
Q  1046 atgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattt 1145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544598 atgttggtggtaggccccaacaaagatcgggtctaagaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattt 54544697  T
Q  1146 tagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactg 1245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54544698 tagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagattg 54544797  T
Q  1246 taagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtat 1345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544798 taagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtat 54544897  T
Q  1346 gcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggta 1445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544898 gcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggta 54544997  T
Q  1446 aagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggtta 1545  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54544998 aagagcattggaatgttgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggtta 54545097  T
Q  1546 tgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagtta 1645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545098 tgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacacttgccggaggagcagtaagttggttgtccaagtta 54545197  T
Q  1646 caaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcg 1745  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545198 caaactgttgtagctctgtcaacgacagaagctgagtacatggcagctacccaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcg 54545297  T
Q  1746 ggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgt 1845  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54545298 ggcacaagcaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgcattgcacattgcaaggaattcaacttttcattcaaggacgaaacacataggcgt 54545397  T
Q  1846 tcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatc 1945  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54545398 tcaatatcattttattcgagaagtagtagaggaaggaagcgtggatatgcagaagattcacactaatgataacctagcagatgtaatgacaaagccgatc 54545497  T
Q  1946 aacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagcaactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagt 2045  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  54545498 aacactgacaagtttatatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacatagcaactgaagttggcaaggtagagaggctttgaatgctcacaaaagt 54545597  T
Q  2046 gactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 2080  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54545598 gactttaagtgggagattgtgaacatgtgtgaaca 54545632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 840; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2229 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 2817658 - 2816576
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 2328  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2817658 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtatacatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 2817559  T
Q  2329 taaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctattt 2428  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||              ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2817558 taaaacttgtttagggtaatgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcct--------------agtttgtattagttagtattctcctattt 2817473  T
Q  2429 ataagagagag--tggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttt 2526  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2817472 ataagagagagagtggtgattgtactctccttgtatttagagagagttcttgtaatttcttccacttagtgagagttctttactcttgccctgtggtttt 2817373  T
Q  2527 ttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactct 2626  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2817372 ttccc-ttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcttctcttattttagctgcgtgataatattttgttactct 2817274  T
Q  2627 ggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttg 2726  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2817273 ggtacctaacagtggtatcaaagccgctggttcgtagttgttattccgcagtaataaactagtggtgtggtaagaaaaatcttagtatgctatgtggttg 2817174  T
Q  2727 cggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgag 2826  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2817173 tggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaatgaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgag 2817074  T
Q  2827 atagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttg 2926  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2817073 atagagaagttcaacgggagaaatttttccttttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacctg 2816974  T
Q  2927 cagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaa 3026  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2816973 cagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagatatggtggactcggtattgtcaagtattgaagaaaa 2816874  T
Q  3027 gaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcga 3126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2816873 gaagacagcaaaggagatctgggatactttaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcga 2816774  T
Q  3127 atgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtg 3226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2816773 atgggtgaatccacatccgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacagcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtg 2816674  T
Q  3227 ctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2816673 ctgaacttctactttagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctgatactcttcactttgatgatgtc 2816576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 775; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 380 - 1977
Target Start/End: Original strand, 42587735 - 42589332
Alignment:
Q  380 tggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatg--gttcgga 477  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||  |||| |  | |  ||    
T  42587735 tggcattcagactatgtaatgacaactcatgatgcatattgtcttttaacagaagatggggagccatcaacctttcaggaggc--tgaaagaagctaaga 42587832  T
Q  478 tgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccatt 577  Q
    || |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  42587833 tgtttctctgtggatggcagcaatgcatgaagaaatggaagccttacatagaaacaaaacttgggaacttgttcaacttcccaagggtcggaaagccatc 42587932  T
Q  578 ggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggta 677  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  42587933 gggaacaaataggtatacaagatcaaacgagatagtaatgatcaagtagaacgatatcgtgcaagactggtggttaaagggtatgctcaaaaagaaggta 42588032  T
Q  678 tcgacttcaatgagatattttccccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctgga 777  Q
    | || |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| || || ||||||| ||| || |||||||||||||||||  | ||    
T  42588033 tagatttcaataaaatattctccccagttgttagactcacaactatcagaatagttttagctatgtgtgttgcgtttgatttacatcttgaacaattaga 42588132  T
Q  778 tgtaaagactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcagg 877  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42588133 tgtaaaaacttcttttcttcatggagagcttgaagaagaaatatatatgctccaaccagaaggttttgaagaacaaggaaaggaaaacttggtttgcagg 42588232  T
Q  878 ttgaccaaatctctgtatggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcag 977  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  42588233 ttgaccaaatctctatacggtctaaaacaggcgcctagatgttggtacaagagatttgattctttcatagttagccttggatacaacagacttaattcag 42588332  T
Q  978 accattgtacgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagt 1077  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  42588333 accattgtacatactacaataggtttggtaataatgattttatcattttgttgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggacccaacaaagatcaagt 42588432  T
Q  1078 ccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagac 1177  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  42588433 ccaagaattaaatgcacaattggctagggagttcgatatgaaggacttggggccagcaaacaagattttagggatgcaaattcatcgagatagaaaagat 42588532  T
Q  1178 aggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaatt 1277  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| || | |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  42588533 aggaatatttggctttctcaaagaaattatttacgaaaagttntgcggcgcttcaacatgcaagattgtaagccaatatctaccccacttcctatcaatt 42588632  T
Q  1278 ttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccat 1377  Q
     ||||||||||||  |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42588633 ataaattatcctccagtatgaatcctagcaatgaatcagagaggatagaaatgtctcgagtaccctatgcatcagtggtgggaagccttatgtatgccat 42588732  T
Q  1378 gatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatg 1477  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42588733 gatatgtacaaggccagacattgcacaagcagtgggagcggttagtcgatttatggcggatcctggtaaagaacattgggatgctgttaagagaatcctg 42588832  T
Q  1478 aggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgata 1577  Q
    || || || |||||||||| || |||||| |||||| || ||||||  || || | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42588833 agatatataaaaggaaccttagatgttgcattatgtgtcagaggattggaatttattgtcaaaggttatgttgattcagattttgcaggtgatcttgata 42588932  T
Q  1578 aaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagc 1677  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || ||||||||    
T  42588933 aaagaagatctactgctggttatgtgttcacacttgcaggaggagcggtaagttggttgtcaaaattacaatctgtcgtagctctatctactacagaagc 42589032  T
Q  1678 ggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgt 1777  Q
     || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  42589033 tgaatatatggcagctacgcaagcttgcaaggaagctatttggatacaaagactaatggaagaactcgggcacagtcaacaacaaattgttgtgtattgt 42589132  T
Q  1778 gacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagagg 1877  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  42589133 gacagtcatagtgcattgcacattgcaaggaatccagtctttcattcgagaacaaaacacataggtgttcaataccattttgttcgagaagtggtagaga 42589232  T
Q  1878 agggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctc 1977  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||| | |||||  |||| || |||  ||||||| |||||||    
T  42589233 aagggagtgttgatatgcagaaaattcacaccaaagacaatttagcagatattatgacaaagtcaatcaatgctgacaaatttacatggtgtagatcctc 42589332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 2297 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 5818852 - 5818515
Alignment:
Q  2297 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttct 2396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5818852 tcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaagtaaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttct 5818754  T
Q  2397 cctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 2496  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5818753 cctagtttgtgttagttagtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagt 5818654  T
Q  2497 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 2596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5818653 gaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttattagttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttat 5818554  T
Q  2597 tttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5818553 tttagttgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 5818515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2815172 - 2814859
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  2815172 aaagccagtagattattcttctctacatgtgtttggttgtcctgtgtatgtgatgtacaactctcaagaaagaacaaagttggacccaaagtctaagaaa 2815073  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2815072 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtggggtcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 2814973  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  2814972 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcatttctaaagagactgctatagtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttcagaatcaga 2814873  T
Q  301 accggtgcacgaag 314  Q
    | | ||||||||||    
T  2814872 atcagtgcacgaag 2814859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2340 - 2635
Target Start/End: Original strand, 54545902 - 54546198
Alignment:
Q  2340 tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagt--ttgtattctcctatttataagagag 2437  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  54545902 tagaatagtgagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctaggtagtgttagtgtttgtattctcctatttataagagag 54546001  T
Q  2438 agtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatt 2537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54546002 agtggtaattgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcatccacttagtgaaagttctctactctagccccgtggttttttccccttatt 54546101  T
Q  2538 tgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54546102 tgttgaggggtttccacgt-aaatattgtatgttcagttcctcttttctcatctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 54546198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2803 - 3323
Target Start/End: Original strand, 42585440 - 42585960
Alignment:
Q  2803 aaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcc 2902  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  42585440 aaaaccatggcaacaaaatttaagattgagaagtttaatgggagtaatttctcactgtggaaattaaagataagggcagttctaagaaaagacaattgcc 42585539  T
Q  2903 tagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactc 3002  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  42585540 tagatgcaattgatggcagacctgcagatatcactgatcaaaagtggaaagagatggatgacaacgttgttgccaatttgcacttagcaatggcagattc 42585639  T
Q  3003 ggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattctta 3102  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  42585640 ggtattatcaagtattgcagagaaaaagtctgcaaaggagatctgggatgctcttattaaattgtacgaggtcaagtcacttcacacaagaattttctta 42585739  T
Q  3103 aagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatt 3202  Q
    || || |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||  ||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || ||||    
T  42585740 aaaaggaggctctacactctccgaatgaatgaatccatatcaataacaaatcacataaataccatgaatacactatttgctcagctcacagcctcagatt 42585839  T
Q  3203 tcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaa 3302  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | | |    
T  42585840 tcacaatagctgaaaatgaacgtgcagaacttctacttcagagtttacctgattcatatgatcaactcatcatcaatattacaaataacaatattgttga 42585939  T
Q  3303 tactcttcactttgatgatgt 3323  Q
      ||||||| |||||||||||    
T  42585940 ctctcttcattttgatgatgt 42585960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1098 - 1455
Target Start/End: Original strand, 25877805 - 25878161
Alignment:
Q  1098 tggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctca 1197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25877805 tggctagggagttcgatatgaaggactctgggccagaaaacaagattttaaggatgcaaattcaccgagatagaaaagataggaagattttgctttctca 25877904  T
Q  1198 aaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatg 1297  Q
    ||  |||||| || | ||||| || |  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || || | |||| ||||||||||||| || ||    
T  25877905 aacaaattatatacgaaaagtttttctacacttcaacat-caagactgtaagccaatatctaccccattttctatcaattataaattatcctcaagtctg 25878003  T
Q  1298 agtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagaca 1397  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25878004 aatcctagcaatgaagcggagaggatgaaaatgtctcaagtaccctatgcatcagcagtgggaagtcttatgtatgacatgatatgtacaagactagaca 25878103  T
Q  1398 ttgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattg 1455  Q
    |||||||||||||| ||    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25878104 ttgcacaagcagtgagaacaattagtcgatttatggcggatcctggtaaagagcattg 25878161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1333 - 1778
Target Start/End: Original strand, 25880583 - 25881030
Alignment:
Q  1333 tcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatg 1432  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  25880583 tcgagtaccttatgcatcagcggtgggaaaccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagcaattagtcgatttatg 25880682  T
Q  1433 gcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaa---ggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagt 1529  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||| || || |||   | |||||||| |||||| |||||||||    |||  || |    
T  25880683 gcggatcctggtaaagagcattgagatgttattaaaagaatcgtgagatatataaaaaaggaaacctcagatgttgcattatgtttc---agattggaat 25880779  T
Q  1530 taactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgat---aaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagt 1626  Q
    | | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  25880780 ttattgtaaagggttatgtagattcagattttgcaggagatcttgataaaaaaaaaaaatctactaccggttatgtgttcatacttgcaggaggagcaat 25880879  T
Q  1627 aagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaa 1726  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||| ||||| || || ||| | || || || || | | |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  25880880 aagttggttgtcaaaattacaaattgttgtcgctctatctactacatatgctgaatatattgtacctacgcaagcttgctaggaagctatttggatacaa 25880979  T
Q  1727 aggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtg 1778  Q
    ||| ||||||| ||| || ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  25880980 aggctaatggaagaa-tcaggcacaatcaacaacaaattgttgtgtattgtg 25881030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2484 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 24659287 - 24659138
Alignment:
Q  2484 tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttt 2583  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24659287 tcttccacttagtgaaagttct--actcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatgttgtgtgttcagttcctcttt 24659190  T
Q  2584 tctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24659189 tctcatctcttattttagctgtgtgataatattttattactctggtacctaa 24659138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1317 - 1516
Target Start/End: Original strand, 25880379 - 25880578
Alignment:
Q  1317 agaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagt 1416  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25880379 agaggatgaaaatgtctcgagtaccttatgcatcagcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtggaagt 25880478  T
Q  1417 ggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttc 1516  Q
      ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||| |||| || || ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  25880479 aattagtcgatttatggcggatcctggtaaagagcattgggatggtatcaaaagaatcctgagatatataaaaggaacctcagatgttgtattatgtttc 25880578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 42587369 - 42587593
Alignment:
Q  11 gattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaatgtatcttct 110  Q
    |||||||||||  | ||||| || || ||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||    
T  42587369 gattattcttccttacatgtgttcggatgtactgtgtacgcaatgtacaactcccaagaaagaacaaagctagatccaaagtctagaaaatgtatattct 42587468  T
Q  111 tgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaaatgaactgca 210  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587469 tgggttatgctgacaacgtgaaagggtatcgcttgtgggatcccactgctcacaagcttgttgttagcagagatgtagtctttgcagaaaatgaactgca 42587568  T
Q  211 aagtgagcagaaaaatgacagcact 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  42587569 aagtgagcagaaacatgacaacact 42587593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2523 - 2629
Target Start/End: Original strand, 4579254 - 4579360
Alignment:
Q  2523 ttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgtta 2622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4579254 ttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagttgcgtgataatattttgtta 4579353  T
Q  2623 ctctggt 2629  Q
    |||||||    
T  4579354 ctctggt 4579360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2451 - 2623
Target Start/End: Complemental strand, 31204950 - 31204781
Alignment:
Q  2451 ctctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgcc-ccgtggttttttccccttatttgttgaggggtt 2549  Q
    |||||||| |||||||||||  ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31204950 ctctccttatatttagagag--gttttgtaatttttcccacttagtgaaagttctctactattgcctccgtgattttttcctcttatttgttgaggggtt 31204853  T
Q  2550 tccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttac 2623  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31204852 tccacgt-aaatattgtgagttcagttcctctttt-tcatctcttcttttaactgcgtgctaatattttgttac 31204781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2842 - 3180
Target Start/End: Original strand, 25877355 - 25877693
Alignment:
Q  2842 gggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacg 2941  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||   || ||||||||||  |||| | |||| || | ||||| || | |||| ||||||||||      
T  25877355 gggagtaatttctcactgtgaaaattaaagataagggatgttctaagaaaagactattgtcgagacacagttgatggtaggcatgcaaatatcactgatc 25877454  T
Q  2942 aaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaagga 3041  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||  || || |||    ||| |||    
T  25877455 aaaagtgaaaagagatggatgacaatgttattgccaatttgcacttagtaatggcagactcgatattgtcaagtattggagagaaaaagttttcaaggga 25877554  T
Q  3042 gatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccaca 3141  Q
    |||||||||  ||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||  |||||||| |    
T  25877555 gatctgggacgctctttttaaattgtacgaggtcaagtcacttcacacaagaattttcttaaaaaggaggctctatactctttgaatgaatgaatccata 25877654  T
Q  3142 tctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattt 3180  Q
    ||  ||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  25877655 tcaataacaaatcacataaacaccatgaatacactattt 25877693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2930 - 3293
Target Start/End: Complemental strand, 47277494 - 47277124
Alignment:
Q  2930 atatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcg-----gtattgtcaagtattgctgaa 3024  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| | |||      |||||||||||||||  |||     
T  47277494 atatcattgacgaaaaatggaaagagatagatgatattattgttgccaatttgcacctagcaatggcaggctcaacacagtattgtcaagtatttatgag 47277395  T
Q  3025 aaga---agacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactc 3121  Q
    ||||   | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  ||||| | ||||| | |||||| |||||  |||| | |||||||     
T  47277394 aagattaatacaacaaaggagatatgtgatactctaataaaattatacgagatataatcatttcacaataaaatattattaaaaggaagacactacactt 47277295  T
Q  3122 ttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatga 3221  Q
    || ||| |||||||||||| ||   |||  ||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||||  |||||  ||| | || ||||||||||||    
T  47277294 tttgaacgggtgaatccacgtca--aacatatcacat-aacaccttgaatatgcaattttctcatctcacaacttctcgttttagaaaagcggaaaatga 47277198  T
Q  3222 gcgtgc--tgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataa 3293  Q
    | |||   |||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  47277197 gtgtgtgttgaacttctacttctgagttaaccatctttgtatgatcacctcatcatcaacattaccaacaataa 47277124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1463 - 1649
Target Start/End: Original strand, 25880165 - 25880348
Alignment:
Q  1463 gttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttg 1562  Q
    |||||||||||| |||| || || ||||||||||||  |||||  |||||||||  |   || || || | ||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  25880165 gttaagagaatcctgagatatataaaaggaacctcaaatgttgtattatgtttctaa---tcggaatttattgtcaagggttttgttaattcagatttta 25880261  T
Q  1563 caggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaa 1649  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  25880262 taggtgatcgtgataaaagaatatctaataccggttatgtgttcacacttgcaagaggagcaataagttggttgtcaaaattacaaa 25880348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2484
Target Start/End: Complemental strand, 24671301 - 24671173
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  24671301 agtgagaggaaaaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgaggtttctcctagt--------gttagtattctcctattt-caagagagag-ggtaa 24671212  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaattt 2484  Q
    ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24671211 tttgtctctccttgtatttagagagaagtcttgtaattt 24671173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2442 - 2599
Target Start/End: Original strand, 35977103 - 35977258
Alignment:
Q  2442 gtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttc-tctactcttgccccgtggttttttccccttatttgt 2540  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||  |||  ||||||||  ||| |||    
T  35977103 gtaattgttctctccttgtatttagagagaagtcttgtaattttttccacttagtgaaaactcttttactcttgccaagtgagtttttccc--tatatgt 35977200  T
Q  2541 tgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatttt 2599  Q
    ||| || |||  |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  35977201 tgatggttttttacgt-aaatattgtttgttcaatttctcttttctcacctcttatttt 35977258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Complemental strand, 5382673 - 5382624
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5382673 tatgctctgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaatt 5382624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2766
Target Start/End: Complemental strand, 13722446 - 13722392
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttat 2766  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13722446 tatgctctgtggttgtagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaattattat 13722392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2471
Target Start/End: Original strand, 4579126 - 4579241
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||        |||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  4579126 agtgagaggaaaaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgaggtttctcatag--------agttagtattctcctattt-cacgagagag-ggtaa 4579215  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagaga 2471  Q
    ||   |||||||||||||||||||||    
T  4579216 tttgtctctccttgtatttagagaga 4579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2593 - 2649
Target Start/End: Original strand, 25877086 - 25877142
Alignment:
Q  2593 ttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagag 2649  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25877086 ttattttagttgcgtaataatattatgttattctggtacctaacagtggtatcagag 25877142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2036 - 2073
Target Start/End: Original strand, 42589352 - 42589389
Alignment:
Q  2036 tcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgt 2073  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42589352 tcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaagatgt 42589389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 1856; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 1856; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 2072
Target Start/End: Original strand, 827887 - 829958
Alignment:
Q  1 aaagccagtagattattcttctctgcatgtttttggttgtcctgtgtacgtgatgtacagctcccaaggaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827887 aaagccagtagattattcttctctgcatgtgtttggttgtcctgtgtacgtgatgtacaactcccaagaaagaacgaagttggacccaaagtccaggaaa 827986  T
Q  101 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactgcccgcaaggttgttgttagcagggatgtagtctttgcagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  827987 tgtatcttcttgggttatgctgacaatgttaaggggtatcgcctgtgggatcccactacccgcaaggttgttgttagcagggatctagtctttgcagaaa 828086  T
Q  201 atgaactgcaaagtgagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctatcgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828087 atgaactgcaaagtaagcagaaaaatgacagcacttctaaagagactgctattgtgcagatggaagaaaaatccaaagaaagtgattcttctgaagctga 828186  T
Q  301 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaatgatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  828187 accggtgcacgaagaacaagaaccagatgatgtcaataatggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccatcttggcaatcagactatgttatg 828286  T
Q  401 acaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaa 500  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  828287 acgagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatgatccagatgcttctcaatggatgacagcaa 828386  T
Q  501 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828387 tgcatgaagaaatggaggccttacataggaacaagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagat 828486  T
Q  601 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttcc 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  828487 caaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggaatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtattgacttcaatgagatattttct 828586  T
Q  701 ccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 800  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828587 ccggttgtcagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatg 828686  T
Q  801 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtct 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  828687 gagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtacggtct 828786  T
Q  901 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828787 aaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaagg 828886  T
Q  1001 tttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 1100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828887 tttgatgataatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttgg 828986  T
Q  1101 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaa 1200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  828987 ctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaatatttggctttctcaaaa 829086  T
Q  1201 gaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 1300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829087 gaattatttaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagt 829186  T
Q  1301 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 1400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829187 cctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattg 829286  T
Q  1401 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcagg 1500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  829287 cacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgttgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaaccccagg 829386  T
Q  1501 tgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttat 1600  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  829387 tgttgcggtatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcaggataaaagaaaatctactactggttat 829486  T
Q  1601 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaag 1700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  829487 gtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttatccaagttacaaactgttgtagctctgtcaacgacagaagctgagtacatggcagctacccaag 829586  T
Q  1701 catgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 1800  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829587 catgcaaggaagctatctggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggagaaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacat 829686  T
Q  1801 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  829687 tgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcgttcaatatcattttgttcgagaagtagtagaggaaggaagcgtggatatgtagaag 829786  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagc 2000  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  829787 attcacactaatgataacctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgacaagtttatatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacatagc 829886  T
Q  2001 aactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatg 2072  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  829887 aactggagttggcaaggtagagagactttgaatgctcacaaaagtagctttaagtgggatattgtgaacatg 829958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 768; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2474 - 3324
Target Start/End: Original strand, 825632 - 826483
Alignment:
Q  2474 tcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttt-ttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttc 2572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  825632 tcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttttccccttatttgttgagtggtttccacgtaaaatattgtgtgttc 825731  T
Q  2573 agttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattc 2672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  825732 agttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaacagtggtatcagagccgctggttcgtagctgttattc 825831  T
Q  2673 cgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattcc 2772  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  825832 cgctgtgataaactagtgaagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattgttcc 825931  T
Q  2773 ggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaaga 2872  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  825932 ggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagattgagaagttcaacgggagaaatttttcgctatggaaattgaaga 826031  T
Q  2873 taagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgt 2972  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  826032 taagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacctgcagatatcactgatgaaaagtggaaagagatggatgataattccgt 826131  T
Q  2973 tgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatactctaataaaattgtacgag 3072  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826132 tgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagatctgggatacactaataaaattgtacgag 826231  T
Q  3073 gtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaata 3172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  826232 gtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatccgtaacagatcacatcaacacccttaata 826331  T
Q  3173 cgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcat 3272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826332 cgctattttctcaactcacagcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcat 826431  T
Q  3273 catcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  826432 catcaacattacaaataataacatagctgatactcttcactttgatgatgtc 826483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1092 - 2072
Target Start/End: Original strand, 28714582 - 28715550
Alignment:
Q  1092 cacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggct 1191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |    
T  28714582 cacagttggttagggagttcgatatgaaagacttgggaccaacaaacaagattttagggatgtaaattcactgagatagaaaagatagaaagatttggtt 28714681  T
Q  1192 ttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctca 1291  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  28714682 ttctcaaaagaattgtataaggaaagtcttgcggcacttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccactttctatgaattttaaactatccaca 28714781  T
Q  1292 ggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagac 1391  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28714782 tgtatgagtcctagcaatgaagcagagaggatgtaaatgtctcgaataccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagat 28714881  T
Q  1392 cagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaagg 1491  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28714882 cagagattgcacaattagtgggagtggttagtcggtttatgacagatccttataaagagcattggaatgttgttaagagaatcatgaggtacattaaagg 28714981  T
Q  1492 aacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctact 1591  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  28714982 aacctcatgtgttgcaatatgtttcggaggatcagagttaattgtcatgggttatgttgattcagattttgccggtgatcatgatgaaagaaaatctttt 28715081  T
Q  1592 actggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcag 1691  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28715082 actggttacgtgttcatgcttgcgagaggagcagtaagttggttatccaagttacaaactgttgtagctatgtcaacgtcagaagctgagtacatggcag 28715181  T
Q  1692 ctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgc 1791  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  28715182 ctacccaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggtactcgggcacaagcaggagcaaattactgtgtattgtgatagttatagtgc 28715281  T
Q  1792 cttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggac 1891  Q
    ||||||          |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||| |     
T  28715282 cttgca----------aatccaacttttcgttcaaggatgaagcacataggtgttcaatatcattttgttcgagtagt-gtggaggaggg-agtgtgaat 28715369  T
Q  1892 atgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattgg 1991  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  28715370 atgcataagattcacaccaatgataacctagcagatgtaatgacaaagtcgatcaatgctgacaagtttctatagtgtcgatcctcatatggcctattga 28715469  T
Q  1992 aaacgtagcaactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatg 2072  Q
    ||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |  || | ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28715470 aaatgtagcaacggaagttggcgaggtagagagattttgaattctaaaaaatgtagctttaagtgggagattgtgaacatg 28715550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 762 - 2073
Target Start/End: Complemental strand, 13842061 - 13840763
Alignment:
Q  762 atcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaaga 861  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  || ||| ||||||||||    
T  13842061 atcttgaacaactagatgtaaagactgctttttttcatggtgaaattgaagaagacatttatatgctccaaccagaaagatccaaagaagaaggaaaaga 13841962  T
Q  862 aaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattac 961  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||   |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||    
T  13841961 aaacttagtttgtaggttgactaaatctttgtacggctgaaagcaggtgtccatatgttgctacaagatatttaattctttgataattagccttcattac 13841862  T
Q  962 aacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggcc 1061  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| || |||||||| |    
T  13841861 aacagactgagtttaggccattgtacgtactgcaaatttttttatgataacgattttatcattttgttgttgtgtatggacgacatattggtggtaggac 13841762  T
Q  1062 ccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattca 1161  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13841761 ccaacaaagattgagtcgaggaattgcagacaaaattggctagtgtgttcgatat----gacttgggaccagcaaacaagattttaaggatacaaattca 13841666  T
Q  1162 ccg-agacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctac 1260  Q
      | | ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  13841665 ttgtataca-aaaagacaagaagatttacctttctcaaaatgattatctatggaaagtcttgcgatactttaacatgcaagattgtaa-ctaatctctac 13841568  T
Q  1261 ctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtggga 1360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  13841567 ctcacttcctgtgaattttaaattattcgtaggtatcagtcctagaaatgaagtagtgaggatggagatgtctcgagtaccgtatgcattgatggtggaa 13841468  T
Q  1361 agccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatg 1460  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | | ||  |||     
T  13841467 agccttatgtattccatgatatgtacaagaccagacactacacaaatagtgggagtggttagtcggtttatggcatatcctggtaaatatcctttaaat- 13841369  T
Q  1461 ctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattt 1560  Q
     ||||||  ||||  |||| || || |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13841368 ttgttaaatgaattttgagatatatcaaagaaacctcaagtgttgcaatatgtttcggaggatcagagttaaatgacaagggttatgttgattcagattt 13841269  T
Q  1561 tgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagct 1660  Q
    | || ||||||||||||| | |||||   |||||| ||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||     |||||||    
T  13841268 tacaagtgatcatgataatataaaat---ctactgattatgtgttcacgtttatacgaggagcggtaagttggttatccaagttagaa-----tgtagct 13841177  T
Q  1661 ctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaac 1760  Q
     ||||||||||| || | |||||||||||| || | || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |    
T  13841176 ttgtcaacgaca-aaactgagtacatggcatcttcccatgcttgcaaggaagttatttgaatgcaaaggttaatggaggaacttgggcacaaacaacatc 13841078  T
Q  1761 aaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgt 1860  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  13841077 aaattactatgtattgtgacaattagaatgcctttcacattgcaagaaattca-tttttcattcaaggacaaaacacataagtgttcaatatcattttgt 13840979  T
Q  1861 tcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagttt 1960  Q
    ||   ||||||| || || |||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  13840978 tc-aaaagtagtcgacgaaggaagtatggatgtgcagaagattcagacaagtgataacctaacggatgtggtgacaaaaccgatcaatgctaataagttt 13840880  T
Q  1961 gtatggtgtcgatcct----cgtatggcctattggaaacgtagcaactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtg 2056  Q
    |||||| |||||||||     ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  13840879 gtatggcgtcgatcctgggaagtatgacctattggaaacatagcaacaagagttggcaaggcagagaaattttagaagctcacaaaagtagatttaagtg 13840780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2417 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 13844014 - 13843110
Alignment:
Q  2417 attctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgcc 2516  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |    
T  13844014 attctcctatttttaaaatagagtggtaattttattcttcttgtatttataaaggggtcctgtaatttcttccacttaatgaaaattctatacttttaac 13843915  T
Q  2517 ccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttc-ctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatat 2615  Q
    |  |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||  || |||||||    |||| ||||  | |||||||||||    
T  13843914 ctataattttt-ctccttatttgttgaggggtttccacgtaaa-tattgtgt--tcatttttcttttttctcaaaacttactttacttacgtgataatat 13843819  T
Q  2616 tttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatg 2715  Q
    ||| |||||||| || | |  |||||||| |||||| |||| ||||    ||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13843818 tttattactctgatagccacaagtggtattagagccattggctcgtgatagttgttccgctgtagcaaactggtggagtggtaagaaaaatattagtatg 13843719  T
Q  2716 ctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatatttggtgtaaaaccatggcag 2815  Q
     | |||||||||  | || | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||  || | || || ||||||||| | |||||||||||||||| ||     
T  13843718 ttatgtggttgcaatatagattgattttccacatcaaaaaaaaattcttattatttaggaccagctt-aaagaaaaaaagttggtgtaaaaccatgacat 13843620  T
Q  2816 cgaaatttgagatagaaaagttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaataga 2915  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||    
T  13843619 cgaaatttgagatagaaaagttcaacaggagaaattcttccctttggaaattgaagatacaagcaattttaagaaaagataattgtgtagacacaattga 13843520  T
Q  2916 tggcagacttgcagatatcactgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagt 3015  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  13843519 tggcaaacttgcaaatatcactgacgaaaagtaaaaagagatagatgataacgttgttgccaatttgcaccttgcaatggtagactcgatattgtcaagt 13843420  T
Q  3016 attgctgaaaagaagacagcaaagg-agatctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctc 3114  Q
    |||| |||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||  | ||||||    
T  13843419 attgttgaaaagaaggcaacaaaggaagatctaggacactctaataaaattgtacgaggtcaaataacttcataacataatattcttaaatgggaggctc 13843320  T
Q  3115 tacactcttcgaatgggtgaatccacatctgtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcgg 3214  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| |    
T  13843319 tacactcttagaatgagtgaatccacatcaataacatatcacattaagaccttgaatacactattttctcaacttacaacttctgatttcataatagcag 13843220  T
Q  3215 aaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactt 3314  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||    
T  13843219 aaaatgagcatgttgaacttctacttcatagtatatcaaatttgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataacaatatagttgacactcttcactt 13843120  T
Q  3315 tgatgatgtc 3324  Q
    ||||||||||    
T  13843119 tgatgatgtc 13843110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2229 - 2628
Target Start/End: Complemental strand, 5199062 - 5198664
Alignment:
Q  2229 ataaatgaaaatggttgaggcatggcttttacggtcctataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 2328  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199062 ataaatgcaattggttggggcatggctctttcactagtataaatagcatgtcccttgcaccattctactcatcccaaatcagtaacaacacaagaacaag 5198963  T
Q  2329 taaagcttgtttagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctattt 2428  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5198962 taaagcttgtttaga-tagtgagagaaaaaatatagagaggaaaaatagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagttagtattctcctattt 5198864  T
Q  2429 ataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt 2528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198863 ataagagagagtggtatttgtactctccttgtagttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt 5198764  T
Q  2529 ccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctgg 2628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198763 ccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctgg 5198664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2348 - 2715
Target Start/End: Original strand, 15602905 - 15603272
Alignment:
Q  2348 tgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaatt 2447  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15602905 tgagaggaaaaatatagaaagaaaaattagatttttctatgaggtttctcttagtaagtgttagttagtattctcctatttacaagatagaatggtaatt 15603004  T
Q  2448 gtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgagggg 2547  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603005 gtacactccatgcatttagagagaggtcttgtaatttcttctacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgagggg 15603104  T
Q  2548 tttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcag 2647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||   ||| || |||| ||||||    
T  15603105 tttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttatttcaattgcgtgataatattttcttactctcacacccaacagtgctatcag 15603204  T
Q  2648 agcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatg 2715  Q
    || | ||||||||||  |||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15603205 agtcattggttcgtaattgttattccgatgcaaaaaactggtggagtggtaagaaatatcttagtatg 15603272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2474 - 2635
Target Start/End: Original strand, 830288 - 830450
Alignment:
Q  2474 tcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttt-ttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttc 2572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830288 tcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctccactcttgccccgtggtttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttc 830387  T
Q  2573 agttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830388 agttcctcttttctcgtctcttattttaactgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 830450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2370 - 2630
Target Start/End: Original strand, 28715816 - 28716070
Alignment:
Q  2370 aaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagaga 2469  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||    ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28715816 aaaaatagtttctcttgtaaggtttctcctaggtagtgttagt----attctcctatttataggaaacggtggtaattgtactctccttgcatttagaga 28715911  T
Q  2470 gaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtg 2569  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28715912 gatgtcctgtaatttcttccactttgtgaaagttctctattcttctcttgtgg-tttttccccttatttaatgaggggtttccacgt-aaatattgtgtg 28716009  T
Q  2570 ttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggta 2630  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  28716010 ttcaattcctcttttgtcgtctcttattttaaatgtgtgataatattttgttactctggta 28716070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 341 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 13842424 - 13842067
Alignment:
Q  341 ggtgttcgtcgatcaacgcgtcagacgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtg 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || | | ||||||||| ||| | | | |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  13842424 ggtgttcgtcgatcaatgcgtcagatgcataaaccatcctagtaatcagactctgtcacggcgagccacaatgcatattgtcttctagctgaagaagatg 13842325  T
Q  441 aaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcggatgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatg 540  Q
    | || | || || ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||| |    
T  13842324 agcctttaaattatcaagaggtgttgaattgttcgtatgcttctcaatggatgaaaa-agtgcatgaagaaattaaagccttacatagaaacaagacaag 13842226  T
Q  541 ggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgca 640  Q
     || ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  13842225 agatcttgttgaacttctaaaggctcgaaaatccatcgaaaacaaatggatatacaagataaaatgtgatggaaatgatcaagtgagacgatatcgtgca 13842126  T
Q  641 agactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttc 699  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  13842125 agattgattgtcaaaggatatactcagaaaagaggtattgatttcaatgagatattttc 13842067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2639
Target Start/End: Complemental strand, 30397191 - 30396909
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||        |||  |||||||||||||  || | |||| |||||    
T  30397191 agtgagaggaacaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgagatttctcctagt--------gttaatattctcctatttc-aacatagag-ggtaa 30397102  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaa-gttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 2544  Q
    ||   |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  30397101 tttgtctctccttgtatatagaaagaggtcttgtaatttcttccacttagtgaaaagttctctactctcgccctgtgatttttttcccttatttgttgag 30397002  T
Q  2545 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagt 2639  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  30397001 gggtttcaacg-aaaatat-gtgtgttcagttcgtcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgctactctggcacccaatagt 30396909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2340 - 2424
Target Start/End: Original strand, 830205 - 830291
Alignment:
Q  2340 tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgtta--gtttgtattctcct 2424  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  830205 tagaatagtgagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctaggtagtgttagtgtttgtattctcct 830291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2340 - 2424
Target Start/End: Original strand, 825549 - 825635
Alignment:
Q  2340 tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgtta--gtttgtattctcct 2424  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  825549 tagaatagtgagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgcgaggtttctcctaggtagtgttagtgtttgtattctcct 825635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2477 - 2624
Target Start/End: Complemental strand, 31593068 - 31592923
Alignment:
Q  2477 tgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagtt 2576  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||  |||    
T  31593068 tgtaatttctttcggttagtgaaagttctctactcttatct-gtggttttttttc-ttatttattgagagatttccacgtaaattattgtatgttatgtt 31592971  T
Q  2577 cctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttact 2624  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  31592970 cctcttttctcgtctcttattctatctgtgtgataatattatgttact 31592923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2415 - 2542
Target Start/End: Original strand, 8004167 - 8004292
Alignment:
Q  2415 gtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttg 2514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||||| |||| || |     
T  8004167 gtattctcctatttataagagagagtg-taattgtactcttcttacatttaaagagaggttttataatttcttccattcagtgaaagttttctagtcata 8004265  T
Q  2515 ccccgtggttttttccccttatttgttg 2542  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8004266 ccccgttg-tttttcctcttatttgttg 8004292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2415 - 2632
Target Start/End: Complemental strand, 13840456 - 13840245
Alignment:
Q  2415 gtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttg 2514  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  |||| || ||| || ||||||||||    
T  13840456 gtattcttttatttttaagagagaattgtaattgtactctccttatatttagagagaggttttgtaattt-ttttacttggtaaaaattttctactcttg 13840358  T
Q  2515 ccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataata 2614  Q
    | || ||  |||| |||||| ||||||||||  ||  || || ||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||  | ||||||||||    
T  13840357 ctccatg--ttttcccccttgtttgttgaggaattctcatgt-aaatat--tgtgttcggttcctcctttctcatcttttattataattacgtgataata 13840263  T
Q  2615 ttttgttactctggtacc 2632  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13840262 ttttgttattctggtacc 13840245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2502 - 2617
Target Start/End: Complemental strand, 12175881 - 12175768
Alignment:
Q  2502 ttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttag 2601  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||  |||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| || ||| |||||||||    
T  12175881 ttctctactcttgtccaattgttttttcca-ttatttattgagatgtttccaca-aaaatattgtgtgttcaatttcttttttatcatcttttattttag 12175784  T
Q  2602 ctgcgtgataatattt 2617  Q
     |||||||||||||||    
T  12175783 ttgcgtgataatattt 12175768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 778 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 17455389 - 17455350
Alignment:
Q  778 tgtaaagactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaa 817  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17455389 tgtaaagactgcttttgttcatggagaacttgaagaagaa 17455350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 965; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 965; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 900 - 2068
Target Start/End: Complemental strand, 29045 - 27877
Alignment:
Q  900 taaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaag 999  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29045 taaagcaggcgcccagatgttggtgcaagagatttgattctttcataattagcctcaattacaacagacttagttcagaccattgtacgtactacaaaag 28946  T
Q  1000 gtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttg 1099  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28945 gtttgatggcaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttggtggtaggacccaacaaaggtcgagtccgggaattgaaggcacaattg 28846  T
Q  1100 gctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaa 1199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28845 gctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaa 28746  T
Q  1200 agaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgag 1299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28745 agaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctaccccacttcttgtgaattttaaattatcctcatgtatgag 28646  T
Q  1300 tcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacatt 1399  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28645 tcctagcaatgaagcggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacatt 28546  T
Q  1400 gcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcag 1499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28545 gcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcgg 28446  T
Q  1500 gtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggtta 1599  Q
     ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28445 atgttgcaatatgtttcagaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgtaggtgatcatgataaaagaaaatctactactgatta 28346  T
Q  1600 tgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaa 1699  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345 tgtgttcacactttcaggaggagcagtaagttggttatccaagttacaaactgttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaa 28246  T
Q  1700 gcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcaca 1799  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245 gcatgcaaggaagctatttggttgcaaaggtttatggaggaactcgtgcacaagcaggattaaattactgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcaca 28146  T
Q  1800 ttgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaa 1899  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28145 ttgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaaacacataggcgttcaatatcattttgttcgagaagtagtggaggagggaagtgtggacatgcagaa 28046  T
Q  1900 gattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtag 1999  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28045 gattcacaccaatgataatctagtagatgtgattacaaaaccaatcaatgctgacaagtttatatggtgtcgatcctcctatggcctattggaaacgtag 27946  T
Q  2000 caactggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaa 2068  Q
    ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27945 caacatgaatgggcaaggtaaagagattttggaagctcgcaaaagtagctttaagtgggagattgtgaa 27877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2635
Target Start/End: Complemental strand, 27508 - 27228
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  27508 agtgagaggaaaaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgaggtttctcctagt--------gttagtattcacctatttc-aagagaga-tggtaa 27419  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatt-tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 2544  Q
    ||   ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418 tttgtctctccttgtatttagagagaagtattgtaattgtcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 27319  T
Q  2545 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318 gggtttccacgtaaagtattgtgtgttcagtttctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 27228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 495; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2451 - 3324
Target Start/End: Complemental strand, 8138645 - 8137771
Alignment:
Q  2451 ctctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggttt 2550  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  8138645 ctctccttgtatttagagggaggtcttgtaatttcttccatttagtgaaagttctctaatcttgcctcgtggttttctccccttgtttgttaaggggttt 8138546  T
Q  2551 ccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaatagtggtatcagagc 2650  Q
    |||| |||  || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  8138545 ccacataat-tactgtgtgttaagtttttcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatactttgatactctgctacccaacagtggtattagagc 8138447  T
Q  2651 ccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatc 2750  Q
    | ||||||||| |  ||||||| || |     |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8138446 cattggttcgttgtcgttattctgccgc----aactggtcgagtggtaagaaaaatcttagtatgctatttggttgtggtttagactgaacttccacatc 8138351  T
Q  2751 agaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaatat-----ttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaagttcaacggga 2845  Q
    | ||||||||||||| ||||  | | |||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  8138350 ataaaagaattcttactattttgatatagtttgagagaaaaataaaataattggtgtaaaaccatggcagcgaaattttagatagagaagttcaacgaga 8138251  T
Q  2846 gaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaaga-taattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatcactgacgaaa 2944  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  8138250 gaaatttttccctattgaaattgaagataagggcaattttaagaaaaaaataattgcatagacgcaatagatggcagacctgcagatatcactaacaaaa 8138151  T
Q  2945 agtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctagcaatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacagcaaaggagat 3044  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8138150 agtggaaaaagatggaagataatgttgttgccaacctgcacctagcaatggcagactgggtattgtcaagtattgctgaaaagaagacaacaaacgagat 8138051  T
Q  3045 ctgggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccacaacagaatattcttaaagagaaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacatct 3144  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8138050 cggggatactctaataaaattgtacgaggtcaaatcactccgcaacagaatattcttaaagaggaggctctacactcttcgaatgggtgaatccacattc 8137951  T
Q  3145 gtaacggatcacatcaacaccctgaatacgctattttctcaactcacggcttctgatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgctgaacttctacttcaga 3244  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8137950 ataacagatcacatcaacaccctgaatacggtattttctaaaatcccaacttctaatttcaaaatagcggaaaatgagcgtgtggaacttctacttcaga 8137851  T
Q  3245 gtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactcttcactttgatgatgtc 3324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8137850 gtttaccatatttgtatgatcaactcatcatcaacattccaaataataacatagctgatactcttcactttgataatgtc 8137771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 683 - 1470
Target Start/End: Complemental strand, 7506802 - 7506016
Alignment:
Q  683 ttcaatgagatattttccccggttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaa 782  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||    
T  7506802 ttcaatgaaatattctccccagttgttagactcattaccatcagaatagttttggctatgtgtgctgcgtttgatttacatcttgaacaattagatgtaa 7506703  T
Q  783 agactgcttttcttcatggagaacttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaaggaaaagaaaacttggtttgcaggttgac 882  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7506702 aaactgcttttcttcatggacagcttgaagaagaaatatatatgctc-aaccagaaggttttgaagaacaaggaaaggaaaacttggtttgcatgttgac 7506604  T
Q  883 caaatctctgtatggtctaaagcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataattagcctcgattacaacagacttagttcagaccat 982  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  7506603 caaatctttgtacggtctaaaacatgcgcctagatgttggtacaagagatttgattctttcatagttagccttgaatacaacagacttaattcagaccat 7506504  T
Q  983 tgtacgtactacaaaaggtttgatggtaatgattttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccagg 1082  Q
    ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  7506503 tgtacatactacaataggtttggtgataatgattttatcattttgttattgtatgtggatgacatgttggtggtaggacccaacaaagatcaagtccaag 7506404  T
Q  1083 aattgaaggcacagttggctagggagttcgatatgaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaa 1182  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7506403 aattaaaggcataattggctagggagttcgatatgaagaacttggggtcagcaaacaagattttagggatgcaaattcatcgagatagaaaagataggaa 7506304  T
Q  1183 gatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaa 1282  Q
     ||||||||||||||||  |||||| || | ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||    
T  7506303 tatttggctttctcaaagaaattatttacgaaaaattttgcggcgcttcaacatgcaaaactgtaagccaatatctaccccacttcctatcaattataaa 7506204  T
Q  1283 ttatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatat 1382  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506203 ttatcctctagtatgaatcctagcaatgaagtagataggatggaaatgtctcgagtaccctatgcatcagcggtgggaagccttatgtatgccatgatat 7506104  T
Q  1383 gtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagag 1470  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7506103 gtacaaggccagacattgcacaagcagtgggagcggctagtcaatttatggcggatcctggtaaagagcattgggatgttgttaagag 7506016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1204 - 2068
Target Start/End: Complemental strand, 2324791 - 2323956
Alignment:
Q  1204 ttatctaaggaaagtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcct 1303  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2324791 ttatctaaggaaagtcttctaacgcttcaacatgcaagactgtaagccagcctctaccccacttcctttgaattttaaattatcctcaagtatgagtcct 2324692  T
Q  1304 agcaatgaagtggagaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcac 1403  Q
    || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||              
T  2324691 agtaatgaagcagagaggatggaaatatctcgagtaccgtatgcataggtggtgggaagccttttgtatgtcatggtatgcacaagacca---------- 2324602  T
Q  1404 aagcagtgggagtggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgt 1503  Q
                ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  2324601 ------------tggttggtcggtttatggcggatcttggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgatgtatataaaaggaacctcaggtgt 2324514  T
Q  1504 tgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtg 1603  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2324513 tgcaatatgtttcggaggatcagagttaaccgttgggggatttcttgagtcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatctactactagttatgtg 2324414  T
Q  1604 ttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcat 1703  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2324413 ttcacacttgcaggaggagttgtaagttagttatccaagttacaaactgttgtagctttgtcaacgacagaagctaagtacatggcagctacccaagcat 2324314  T
Q  1704 gcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgc 1803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | | ||||||||| |||||||       || |||||||    
T  2324313 gcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaagcaggagaaaatcactttgtattgtggcagtcag------gtggacattgc 2324220  T
Q  1804 aaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagatt 1903  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  2324219 aaggaatccatcttttcattcaaagacaaagaacattgacgttc-atatcattttgttcgagaagtagtaaaggagggaagtgtggatatgcagaagatc 2324121  T
Q  1904 cacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagcaac 2003  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||   |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2324120 cacaccaatgataccctagcagatgtgatgacaaagccaatcaatgctaccaagtttatatggtgtcgatcatcgtatggactattggaaacgtagcaac 2324021  T
Q  2004 tggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaa 2068  Q
      || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2324020 atgaatgggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtggctttaagtgggagattgtgaa 2323956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2637 - 3033
Target Start/End: Original strand, 25441076 - 25441478
Alignment:
Q  2637 agtggtatcagagcccttggttcgtagctgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtttaaac 2736  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25441076 agtggtatcagagccattgatttgtagttgttattccgctgtgataaactagtggagtggtaagaaaaatcttagtatgctctgtggttgcggtgtaaac 25441175  T
Q  2737 tgatcttccacatcagaaaagaattcttattattccggtctagtttgaaagaaaaa--tatttggtgtaaaaccatggcagcgaaatttgagatagaaaa 2834  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25441176 tgatctttcacatcataaaagaattcttattattcctgtctagtttgaagaaaaaacatatttggtgaaaaaccatggcagcgaaatttgagatagagaa 25441275  T
Q  2835 gttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgcaatagatggcagacttgcagatatc 2934  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  25441276 gttcaatgggagaaattttttcctatggaaattgaagataagggaaattttaagagaagataattgcctagatgcgatagatgtcagacctgcagatatc 25441375  T
Q  2935 actgacgaaaagtggaaagagatggatgataatgccgttgccaatttgcacctag----caatggcggactcggtattgtcaagtattgctgaaaagaag 3030  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25441376 actgacggaaagtggaaagagatggatgataatgtcgtcgccaatttgcacatcgacgccaatgacggactcagtattgtcaagtattgctgaaaagaag 25441475  T
Q  3031 aca 3033  Q
    |||    
T  25441476 aca 25441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1463 - 1977
Target Start/End: Complemental strand, 7505210 - 7504696
Alignment:
Q  1463 gttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttg 1562  Q
    |||||||||||| |||| || || |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  || || | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7505210 gttaagagaatcctgagatatataaaaggaaccttagatgttgcattatgtttcagaggattggaatttattgtcaaaggttatgttgattcagattttg 7505111  T
Q  1563 caggtgatcatgataaaagaaaatctactactggttatgtgttcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctct 1662  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||   || ||||||||    
T  7505110 caggtgatcttgataaaagaagatctactactggttatgtgttcacacttgcaggaggagcggtaagttgattgtcaaaattacaatttgtcgtagctct 7505011  T
Q  1663 gtcaacgacagaagcggagtacatggcagctactcaagcatgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaa 1762  Q
     || || |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||  ||  |||||    
T  7505010 atctactacagaagctgaatatatggcagctacgcaagcttgcaaggaagctatttggatacaaagactaatggaagaactcgtgcacagtcaacaacaa 7504911  T
Q  1763 attattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgcaaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttc 1862  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || || || |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  7504910 attgttgtgtattgtgacagtcagagtgcattgcacattgcaaggaatccagtctttcattcgagaacaaaacacatagatgttcaataccattttgttc 7504811  T
Q  1863 gcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatcaacactgataagtttgt 1962  Q
    | ||||| |||||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || |||      
T  7504810 gagaagtggtagagaaagggagtgttgatatgcaaaaaattcacaccaaagacaatttagcagatgttatgacaaagtcaatcaatactgacaaatttac 7504711  T
Q  1963 atggtgtcgatcctc 1977  Q
    |||||||||||||||    
T  7504710 atggtgtcgatcctc 7504696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 377 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 2325127 - 2324789
Alignment:
Q  377 tcttggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttttcatgaggcgttgaatggttcgg 476  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  2325127 tcttggtaatccgactatgttatgacgagcctcgatgcatatggtcttataactgaagaaggtgaacctttaacttttcaagaggcgttgaacggttcag 2325028  T
Q  477 atgcttctcaatggatgacagcaatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccat 576  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2325027 atgtttctcaatggatgacaacaatgcttgaagaaatggaggccttacatagaaacaagataggggaacttgttgaacttccaaagggacggaaagccat 2324928  T
Q  577 tggaaacaaatgggtatacaagatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggt 676  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2324927 tggaaacaaatggatagacaagatcaaacgtgatggaaatgatcaagtggaacggtatcgttcaagattgatggtaaaaggatatactcagaaagaaggt 2324828  T
Q  677 atcgacttcaatgagatattttccccggttgttagactta 716  Q
    || |||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2324827 attgactttgatgagatatttt-tccggttgtcagactta 2324789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2632
Target Start/End: Complemental strand, 16183913 - 16183636
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16183913 agtgagaggaaaaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgaggtttctcctagt--------gttagtattctcctatttc-aagagagag-ggtaa 16183824  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatt-tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 2544  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16183823 tttgtctctccttgtatttagagagaggtcttgtaattgtcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 16183724  T
Q  2545 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacc 2632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16183723 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacc 16183636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2340 - 2632
Target Start/End: Original strand, 30235038 - 30235334
Alignment:
Q  2340 tagagtagtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctg-tgaggtttctcctagtttgtgttagt--ttgtattctcctatttataagaga 2436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30235038 tagagtagtgagaggaaaaatatagagagaaaaattagtttctccttatgaggtttctcttacgtagtgttagtgtttgtattctcctatttataagaga 30235137  T
Q  2437 gagtggtaattgtactctccttgtatttag-agagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggtttttt-cccctt 2534  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  30235138 gagtggtaattgtactctccttataaataggagagaggtcctgtaatttcttctagttattgaaagttttctactcttatcccgtggtttttttcccctt 30235237  T
Q  2535 atttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacc 2632  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  30235238 attcgttgaggggtttccacgtaaa-tattgtgtgttcagttcctcttttctcattttttattttagctgtgtaataatattttgctactctggtacc 30235334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2415 - 2661
Target Start/End: Complemental strand, 8140183 - 8139940
Alignment:
Q  2415 gtattctcctatttataagagagagtggtaattgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttg 2514  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  8140183 gtattctcctatttc-aagagagag-ggtaatttgtctctccttgtattaagagagaggtcttataatttcttccactgagtgaaagttttctaatctta 8140086  T
Q  2515 ccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataata 2614  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  8140085 ccccatggttttctccccttatttgttgaggggtttccacataaa-tattgtgcgttcagtttctcttttctcatctcttattttagctgtgtgataata 8139987  T
Q  2615 ttttgttactctggtacctaatagtggtatcagagcccttggttcgt 2661  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  8139986 ttttgttactctggtacccaacagtggtattagagccattggttcgt 8139940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1507 - 2075
Target Start/End: Original strand, 22509834 - 22510398
Alignment:
Q  1507 gttatgtttcggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgat--aaaagaaaatctactactggttatgtgt 1604  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || || ||||| |||||     |    
T  22509834 gttatgtttcggaggatcaaagttaaccattaggtgttatgttgattcagattttgaaggtgatcatgattgaaaaaaatatatactattggtt-----t 22509928  T
Q  1605 tcacgcttgcaggaggagcagtaagttggttgtccaagttacaaacggttgtagctctgtcaacgacagaagcggagtacatggcagc-tactcaagcat 1703  Q
    ||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| | ||||   || ||||||| ||  |||| | |  |    
T  22509929 tcacatttgtaagaggagcagtaatttggttgtccaagttaccaattgttgaagctctgtcaacaagagaaattgaatacatggaagtatact-aggttt 22510027  T
Q  1704 gcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgc 1803  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22510028 gcaaggaagctatttggatgataaggttaatggaggaactcgcgcacaagtatcaacaaattactttgtattgtgatagtcagagtgtcttgcacatttc 22510127  T
Q  1804 aaggaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagatt 1903  Q
    ||| |||||| ||||  |||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||     ||| || |||||||||  |||||| |||| |||||||    
T  22510128 aagcaatccaactttgtattccaagacgatgcacaaaggcgttcaataccatttttttgtattagttgtggaggagggacatgtggatatgccgaagatt 22510227  T
Q  1904 cacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaag-ccgatcaacactgataagtttgtatggtgtcgatcctcgtatggcctattggaaacgtagcaa 2002  Q
    || ||  ||||||| | ||||||||| |||| |||| |  ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||  |||| ||| ||    
T  22510228 caaactgatgataaccaagcagatgtgatgaaaaagtctaatcaatattgataagtttatatggtgtcaatccctctgtggcctattcaaaacatagaaa 22510327  T
Q  2003 ctggagttggcaaggtagagagattttggaagctcacaaaagtgactttaagtgggagattgtgaacatgtgt 2075  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |  |||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  22510328 caggagttggcaaggtagagatattttgaaagctcccaaaaatagctttaatt--gagatagtgaacatgtgt 22510398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2479 - 2624
Target Start/End: Complemental strand, 5102749 - 5102606
Alignment:
Q  2479 taatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcc 2578  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||| ||| || ||| ||    
T  5102749 taatttctcccacttagtaaaagttatctactcttgctccatgg-tttttccccttatttgttga-gggttttcatgt-aaatattatgtatttagtccc 5102653  T
Q  2579 tc-ttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttact 2624  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5102652 tctttttctcatcttttattttagttgagtgataatattttgttact 5102606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2522 - 2632
Target Start/End: Complemental strand, 36528529 - 36528420
Alignment:
Q  2522 gttttttccccttatttgttgaggggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgtt 2621  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||  || ||||||    
T  36528529 gttttttttccttattcgtggaggggtttccacgtaaa-tattgtgtgttcaattcctctattctcatctcttattttagttgcgtaattttactttgtt 36528431  T
Q  2622 actctggtacc 2632  Q
    |||||| ||||    
T  36528430 actctgatacc 36528420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1847 - 1976
Target Start/End: Original strand, 37957033 - 37957162
Alignment:
Q  1847 caatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaagattcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaagccgatca 1946  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  || |||  |||||||  ||| ||||||||| | || |    
T  37957033 caatatcattatgtttgcgaagtagtagaggaaggaagtgtggacatgcaatagattcacaataaagattgtctagcaagtgtgatgacaaagtcaatta 37957132  T
Q  1947 acactgataagtttgtatggtgtcgatcct 1976  Q
    |   |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37957133 atggtgataagtttatatgatgtcgatcct 37957162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Original strand, 11712072 - 11712121
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11712072 tatgctctgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaataatt 11712121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-149; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1017 - 1589
Target Start/End: Original strand, 34972958 - 34973530
Alignment:
Q  1017 ttatcattttgctgttgtatgtggatgacatgttagtggtaggccccaacaaagatcgagtccaggaattgaaggcacagttggctagggagttcgatat 1116  Q
    |||| |||||| | |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||   ||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  34972958 ttattattttgttattgtatatggacgacatgttggtgttaggccccaacaaatattaggtccaagtattgaaggcacaattggttagggaattcaatat 34973057  T
Q  1117 gaaagacttgggaccagcaaacaagattttagggatgcaaattcaccgagacagaaaagacaggaagatttggctttctcaaaagaattatctaaggaaa 1216  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34973058 gaaagacttgggactagcaaaccaggttttagcgatgcaaactcaccaagacagaaaagacaagaagatttggctttcttaaatgaattatctaaggaaa 34973157  T
Q  1217 gtcttgcgccgcttcaacatgcaagactgtaagccaatctctacctcacttcctgtgaattttaaattatcctcaggtatgagtcctagcaatgaagtgg 1316  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  34973158 gtcttacggtacttcaacatgcaagactgtaatccaatctctaccctacttccagtgagttttaaattatcctcatgtatgagtcctaacaatgaagcgg 34973257  T
Q  1317 agaggatggaaatgtctcgagtaccgtatgcatcggcggtgggaagccttatgtatgccatgatatgtacaagaccagacattgcacaagcagtgggagt 1416  Q
    | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||    
T  34973258 atagggtagaaatgtcttgagtaccgtatgcatcggcaatgagaagccttatgtatgtctttatatgtacaagacaagacattgaacaaacagcgagagt 34973357  T
Q  1417 ggttagtcggtttatggcggatccgggtaaagagcattggaatgctgttaagagaatcatgaggtacattaaaggaacctcaggtgttgcgttatgtttc 1516  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||   |||| |||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  34973358 ggttagtcagtttgtggaggatcctagtaaagagcatcaaaatgatgtcgatagaattatgaggtacaataaaggaacctcaggtgttgcaatatgattc 34973457  T
Q  1517 ggaggatcagagttaactgtcaggggttatgttgattcagattttgcaggtgatcatgataaaagaaaatcta 1589  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34973458 ggaggatcaaatttaactgttaggggttatgtcgattcagattttgcagatgatcataataaaagaaaatcta 34973530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 505 - 949
Target Start/End: Original strand, 34972298 - 34972738
Alignment:
Q  505 tgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaagatcaaa 604  Q
    ||||||||| || |||||| ||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  34972298 tgaagaaatagaagccttatatagatacaagacatgatagcttgttgaacttccaaagggtcgaaaagtcattagaaacaaatgggcatgcaagatcaaa 34972397  T
Q  605 cgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaaggtatcgacttcaatgagatattttccccgg 704  Q
    |||  || |||||||||||||||||  |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||     | |    
T  34972398 cgtcgtgacaatgatcaagtggaacaatatcatgcaagactactggtaaaagtatatgctcataaagaaggtattgacttcaatgtattatt-----cag 34972492  T
Q  705 ttgttagacttactactatcagagtagtgttggcgatgtgtgctgcattggatttacatcttgaacagctggatgtaaagactgcttttcttcatggaga 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  34972493 ttgttagacttactactatcagagtagtggcggctatgtgtgttgcattgtatttacatcttgaacatctagatgcaaagagtgtttttcttcatggaga 34972592  T
Q  805 acttgaagaagaaatttatatgctccaaccggaaggatttaaggaacaagg-aaaagaaaacttggtttgcaggttgaccaaatctctgtatggtctaaa 903  Q
     |||||| | ||||||||||| ||  ||| ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||||||    
T  34972593 gcttgaaaaggaaatttatatactataactggaaggattcaaagaagaaggaaaaaaaaaacttggtttgtaggttgactgaatctatgtacgatctaaa 34972692  T
Q  904 gcaggcgcccagatgttggtacaagagatttgattctttcataatt 949  Q
     || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34972693 acatgcacccaaatgttggtacatgagatttgattctttcgtaatt 34972738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2346 - 2635
Target Start/End: Original strand, 46191266 - 46191544
Alignment:
Q  2346 agtgagagaaaaaatatagagagaaaaattagtttctcctgtgaggtttctcctagtttgtgttagtttgtattctcctatttataagagagagtggtaa 2445  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  46191266 agtgagaggaaaaatatagagaggaaatatagtttctcctgtgaggtttctcctagt--------gttagtattctcctatttc-aagagagag-ggtaa 46191355  T
Q  2446 ttgtactctccttgtatttagagagaggtcctgtaatt-tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgag 2544  Q
    ||   |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46191356 tttgtctctccttctatttagagagaagtcttgtaattgtcttccacttagtgaaagttctctactcttgtcccgtggttttttccccttatttgttgag 46191455  T
Q  2545 gggtttccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46191456 gggtttccacgtaaaatat--tgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcatgataatattttgttactctggttcctaa 46191544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2451 - 2632
Target Start/End: Complemental strand, 30697300 - 30697120
Alignment:
Q  2451 ctctccttgtatttagagagaggtcctgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggttt 2550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30697300 ctctccttgtatttagaaagaggtcttgtaatttcttccacttagtgaaagttctctactcttgccacgtggctttttccccttatttgttgaggggttt 30697201  T
Q  2551 ccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacc 2632  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30697200 ccacgt-aaatattttgtgttaagttcctcttttctcgtctcttatgttagctgcgtgataatattttgttactctagtacc 30697120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2451 - 2635
Target Start/End: Original strand, 4130215 - 4130399
Alignment:
Q  2451 ctctccttgtatttagagagaggtcctgtaatt-tcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccccttatttgttgaggggtt 2549  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4130215 ctctccttgtatttagagagaagtcttgtaattatcttccacttagtgaaagttctctactcttgccccgtggttttttccctttatttgttgagggatt 4130314  T
Q  2550 tccacgtaaaatattgtgtgttcagttcctcttttctcgtctcttattttagctgcgtgataatattttgttactctggtacctaa 2635  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4130315 tccacgt-aaattttgtgtgttcagttcctcttttctcgtcacttattttagttgcgtgataatattttgttactcaagtacctaa 4130399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 498 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 11927040 - 11926865
Alignment:
Q  498 caatgcatgaagaaatggaggccttacataggaataagacatgggagcttgttgaacttccaaagggtcggaaagccattggaaacaaatgggtatacaa 597  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11927040 caatgcatgaagatacgaaggacttacaaagaaacaagacatgtgagcttgttgaacttccaaaaggtcagaaagccattcgaaacaaatggatatacaa 11926941  T
Q  598 gatcaaacgtgatggcaatgatcaagtggaacggtatcgtgcaagactggttgtaaaaggatatgctcagaaagaa 673  Q
    ||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11926940 gatcaaatgtgagggtagtgatcaagtggaaccgtatcgtccaagaccggtggtaaaataatatgctcagaaagaa 11926865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1703 - 1938
Target Start/End: Original strand, 34973589 - 34973826
Alignment:
Q  1703 tgcaaggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattg 1802  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||  || | ||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||    
T  34973589 tgcaaggaagctgtttggatgcaaaggttaatggagggacttagacacaagcatcaagacattattgtgtattatgaaagttaaagtgtcttgcacattg 34973688  T
Q  1803 caaggaatccagctttt--cattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttcgcgaagtagtagaggagggaagtgtggacatgcagaag 1900  Q
     | | |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || | |||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  34973689 tatgaaatccaacttttttcattcaaggacgaagcaaataggcatttaatatcattttatttgagaagtagtggaagagagaagtgtggatatgctgaag 34973788  T
Q  1901 attcacaccaatgataatctagcagatgtaatgacaaa 1938  Q
    |||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||||    
T  34973789 attcacactaatgataacctaaaagatgtgacgacaaa 34973826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1707 - 1862
Target Start/End: Complemental strand, 41413783 - 41413628
Alignment:
Q  1707 aggaagctatttggatgcaaaggttaatggaggaactcgggcacaaacaggaacaaattattgtgtattgtgacagtcagagtgccttgcacattgcaag 1806  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||   |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  41413783 aggaagctattttgatgcaaatgttaattgaggaactcaaacacagacaataacaaattattgtatattgtgatagttagagtgtcttgcacattgcaag 41413684  T
Q  1807 gaatccagcttttcattcaaggacgaagcacataggcgttcaatatcattttgttc 1862  Q
     |||||||| || ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41413683 taatccagccttccattcaaggacaaggcatgtaggcgttcaatatcattttgttc 41413628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11927212 - 11927124
Alignment:
Q  365 acgcagaaaccgtcttggcaatcagactatgttatgacaagccacgatgcatattgtcttataactgaagaaggtgaaccgtcaacttt 453  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11927212 acgcaaaaaccatcttggaaatcaaactatgttatgatgaggcacaattcatattgtcttctaaccgaagaaggtgaaccttcaacttt 11927124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Complemental strand, 2796460 - 2796411
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2796460 tatgctctgtggttgcagtttaatgtgatcttccacatcagaaaagaatt 2796411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Original strand, 42376095 - 42376144
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42376095 tatgctttgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaatt 42376144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2834 - 2910
Target Start/End: Complemental strand, 46344372 - 46344296
Alignment:
Q  2834 agttcaacgggagaaatttttccctttggaaattgaagataagggcaattttaagaaaagataattgcctagacgca 2910  Q
    |||||||  |||||||||||||| | || |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  46344372 agttcaattggagaaatttttccttgtgaaaatcgaagataaatgcaattttaagaaaccataattgcctagacgca 46344296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Complemental strand, 14476214 - 14476165
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14476214 tatgctctatggttgcagtttaatcggatcttccacatcagaaaagaatt 14476165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Original strand, 23201147 - 23201196
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23201147 tatgctatgtggttgcagtttaatatgatcttccacatcagaaaagaatt 23201196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3215 - 3308
Target Start/End: Original strand, 46452552 - 46452644
Alignment:
Q  3215 aaaatgagcgtgctgaacttctacttcagagtttaccagattcgtatgatcaactcatcatcaacattacaaataataacatagctaatactct 3308  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||  ||| |||||||||    
T  46452552 aaaatgagtgtgctaaacttctacttcatagtttattaga-tcctatgatgaactcatcatcaacattaaaaacaacaatgtagttaatactct 46452644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2712 - 2761
Target Start/End: Complemental strand, 28871 - 28822
Alignment:
Q  2712 tatgctctgtggttgcggtttaaactgatcttccacatcagaaaagaatt 2761  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28871 tatgctctgtggttgcagtttaatctgatcttccacatcagaaaagaatt 28822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University