View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19062_high_27 (Length: 249)

Name: NF19062_high_27
Description: NF19062
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19062_high_27
NF19062_high_27
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (19-239)||(110713-110933)
scaffold0026 (19-236)||(21311-21527)
[»] chr7 (97 HSPs)
chr7 (19-239)||(14566228-14566448)
chr7 (19-239)||(18872386-18872606)
chr7 (19-239)||(16008604-16008824)
chr7 (19-239)||(11661332-11661551)
chr7 (19-239)||(18607513-18607733)
chr7 (19-244)||(14422005-14422231)
chr7 (43-239)||(42462009-42462205)
chr7 (19-179)||(147704-147864)
chr7 (37-239)||(9033204-9033407)
chr7 (43-239)||(130680-130878)
chr7 (43-237)||(16996284-16996477)
chr7 (37-235)||(11768777-11768977)
chr7 (19-239)||(16998652-16998872)
chr7 (19-239)||(14273574-14273794)
chr7 (19-239)||(46580516-46580736)
chr7 (105-239)||(38519432-38519566)
chr7 (55-239)||(11525440-11525625)
chr7 (110-239)||(20619440-20619570)
chr7 (110-239)||(10501355-10501484)
chr7 (110-239)||(14258510-14258639)
chr7 (110-239)||(16460697-16460826)
chr7 (110-239)||(16579818-16579947)
chr7 (110-239)||(16585716-16585845)
chr7 (110-239)||(20487601-20487730)
chr7 (110-239)||(32301347-32301476)
chr7 (110-239)||(14157036-14157165)
chr7 (107-239)||(1858760-1858892)
chr7 (37-239)||(17060282-17060485)
chr7 (19-229)||(38828298-38828507)
chr7 (107-239)||(25927180-25927309)
chr7 (45-186)||(9725526-9725667)
chr7 (19-213)||(13647492-13647688)
chr7 (37-234)||(17017326-17017523)
chr7 (107-239)||(13918454-13918586)
chr7 (113-239)||(9177600-9177726)
chr7 (110-215)||(14929152-14929257)
chr7 (110-215)||(15352618-15352723)
chr7 (118-232)||(16109453-16109567)
chr7 (139-232)||(837317-837410)
chr7 (139-232)||(1202497-1202590)
chr7 (165-239)||(8940309-8940383)
chr7 (154-239)||(15720055-15720140)
chr7 (19-232)||(34957407-34957617)
chr7 (139-239)||(833321-833421)
chr7 (139-239)||(1198501-1198601)
chr7 (155-216)||(10896687-10896748)
chr7 (155-216)||(15167285-15167346)
chr7 (107-215)||(48991266-48991372)
chr7 (37-231)||(16091826-16092019)
chr7 (19-232)||(29004057-29004268)
chr7 (107-214)||(15008427-15008533)
chr7 (146-225)||(18203887-18203965)
chr7 (19-73)||(18456254-18456308)
chr7 (113-239)||(20220124-20220248)
chr7 (113-225)||(1867929-1868040)
chr7 (165-225)||(38898181-38898241)
chr7 (188-239)||(18279367-18279418)
chr7 (188-239)||(18283330-18283381)
chr7 (19-66)||(30820862-30820909)
chr7 (19-66)||(36685856-36685903)
chr7 (107-177)||(2529982-2530052)
chr7 (150-232)||(13892661-13892742)
chr7 (188-239)||(33071-33122)
chr7 (188-239)||(70856-70907)
chr7 (188-239)||(74965-75016)
chr7 (188-239)||(12704750-12704801)
chr7 (188-239)||(12714828-12714879)
chr7 (188-239)||(12718632-12718683)
chr7 (188-239)||(12723543-12723594)
chr7 (188-239)||(16907292-16907343)
chr7 (188-239)||(39722230-39722281)
chr7 (188-239)||(45170097-45170148)
chr7 (188-230)||(26292368-26292410)
chr7 (19-195)||(709161-709336)
chr7 (199-239)||(15116540-15116580)
chr7 (196-239)||(15113003-15113046)
chr7 (188-239)||(16114205-16114256)
chr7 (188-239)||(16117358-16117409)
chr7 (183-239)||(8468777-8468833)
chr7 (165-213)||(15081900-15081948)
chr7 (19-50)||(832629-832660)
chr7 (19-50)||(1197809-1197840)
chr7 (19-50)||(8757002-8757033)
chr7 (19-50)||(13408187-13408218)
chr7 (19-50)||(13699495-13699526)
chr7 (19-62)||(14188898-14188941)
chr7 (19-62)||(14191692-14191735)
chr7 (188-239)||(14270036-14270087)
chr7 (196-239)||(16324110-16324153)
chr7 (19-62)||(16550610-16550653)
chr7 (19-62)||(16615009-16615052)
chr7 (21-64)||(17505612-17505655)
chr7 (21-64)||(17547559-17547602)
chr7 (19-62)||(48812241-48812284)
chr7 (149-186)||(14416246-14416283)
chr7 (121-177)||(1490117-1490173)
chr7 (107-214)||(2280047-2280155)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (19-239)||(37598723-37598943)
chr5 (19-239)||(28370862-28371082)
chr5 (20-239)||(42960602-42960822)
chr5 (37-239)||(23469863-23470064)
chr5 (19-167)||(38145344-38145492)
chr5 (43-235)||(25574334-25574525)
chr5 (43-235)||(25575527-25575718)
chr5 (43-235)||(25576720-25576911)
chr5 (19-226)||(30138769-30138976)
chr5 (19-239)||(6765888-6766107)
chr5 (37-239)||(21731319-21731522)
chr5 (155-239)||(22336627-22336711)
chr5 (155-239)||(22340165-22340249)
chr5 (37-239)||(21328073-21328276)
chr5 (138-239)||(22107394-22107495)
chr5 (37-239)||(21809439-21809642)
chr5 (37-228)||(26740505-26740695)
chr5 (37-239)||(26732692-26732893)
chr5 (119-239)||(10816462-10816582)
chr5 (38-239)||(15796479-15796682)
chr5 (110-239)||(33895587-33895706)
chr5 (119-232)||(23538495-23538608)
chr5 (155-216)||(22750264-22750325)
chr5 (155-216)||(19511516-19511577)
chr5 (37-160)||(20572025-20572149)
chr5 (108-225)||(27988857-27988978)
chr5 (172-239)||(18356256-18356323)
chr5 (19-74)||(18418803-18418858)
chr5 (19-225)||(29448078-29448284)
chr5 (172-239)||(20910910-20910977)
chr5 (111-225)||(22178152-22178266)
chr5 (188-239)||(10753328-10753379)
chr5 (188-239)||(15236871-15236922)
chr5 (188-239)||(15236926-15236977)
chr5 (188-239)||(19472811-19472862)
chr5 (188-239)||(20295811-20295862)
chr5 (19-66)||(31456197-31456244)
chr5 (174-239)||(41861449-41861515)
chr5 (150-232)||(43243243-43243324)
chr5 (22-66)||(21554988-21555032)
chr5 (22-66)||(21557654-21557698)
chr5 (19-62)||(263260-263303)
chr5 (19-50)||(17812811-17812842)
chr5 (19-74)||(22412398-22412452)
chr5 (19-50)||(24277212-24277243)
chr5 (19-50)||(24384970-24385001)
chr5 (188-239)||(40723678-40723729)
chr5 (147-232)||(33473295-33473379)
chr5 (113-169)||(2154593-2154648)
chr5 (19-59)||(17011132-17011172)
chr5 (113-169)||(20901988-20902043)
chr5 (107-214)||(22144134-22144242)
chr5 (108-214)||(25743807-25743913)
chr5 (147-186)||(27869281-27869321)
chr5 (113-157)||(40725996-40726040)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (19-239)||(23371313-23371533)
chr3 (19-239)||(51300621-51300841)
chr3 (19-239)||(14763567-14763787)
chr3 (19-235)||(10833945-10834160)
chr3 (19-178)||(9533416-9533575)
chr3 (45-239)||(9577684-9577876)
chr3 (19-232)||(8928271-8928483)
chr3 (37-241)||(37427772-37427976)
chr3 (19-239)||(14966228-14966448)
chr3 (19-239)||(52989564-52989783)
chr3 (37-239)||(15246078-15246281)
chr3 (45-239)||(15265199-15265394)
chr3 (41-239)||(324294-324492)
chr3 (37-239)||(15206996-15207199)
chr3 (110-239)||(14179430-14179559)
chr3 (110-239)||(14670982-14671111)
chr3 (110-239)||(14682481-14682610)
chr3 (110-239)||(43889558-43889687)
chr3 (19-230)||(16643240-16643451)
chr3 (113-239)||(28194751-28194878)
chr3 (110-239)||(16796545-16796674)
chr3 (37-239)||(32402819-32403020)
chr3 (19-213)||(43550283-43550477)
chr3 (110-239)||(12339765-12339894)
chr3 (110-239)||(12469960-12470089)
chr3 (37-239)||(21837484-21837685)
chr3 (113-239)||(54876322-54876448)
chr3 (107-239)||(5223363-5223495)
chr3 (110-228)||(10542364-10542482)
chr3 (19-213)||(50242985-50243179)
chr3 (138-239)||(18700267-18700368)
chr3 (107-239)||(15465134-15465266)
chr3 (113-239)||(17691644-17691769)
chr3 (43-157)||(29172492-29172606)
chr3 (116-211)||(44494893-44494988)
chr3 (19-94)||(18892961-18893036)
chr3 (118-232)||(34852596-34852710)
chr3 (113-218)||(23318650-23318754)
chr3 (163-239)||(3265000-3265076)
chr3 (163-239)||(36527803-36527879)
chr3 (109-215)||(316202-316309)
chr3 (19-94)||(18889735-18889810)
chr3 (165-239)||(11914003-11914077)
chr3 (155-216)||(38311759-38311820)
chr3 (37-221)||(13919408-13919591)
chr3 (107-219)||(12378003-12378114)
chr3 (155-216)||(20248741-20248803)
chr3 (118-224)||(14568899-14569007)
chr3 (82-232)||(16839575-16839723)
chr3 (188-241)||(15617339-15617392)
chr3 (21-74)||(24153052-24153105)
chr3 (188-241)||(30065911-30065964)
chr3 (19-111)||(2248576-2248668)
chr3 (188-239)||(4107488-4107539)
chr3 (188-239)||(4111340-4111391)
chr3 (188-239)||(4588864-4588915)
chr3 (188-239)||(7109665-7109716)
chr3 (188-239)||(7113600-7113651)
chr3 (188-239)||(11070035-11070086)
chr3 (188-239)||(11165620-11165671)
chr3 (188-239)||(15964936-15964987)
chr3 (188-239)||(15968860-15968911)
chr3 (188-239)||(15972784-15972835)
chr3 (188-239)||(22321631-22321682)
chr3 (188-239)||(22336686-22336737)
chr3 (188-239)||(27409735-27409786)
chr3 (188-239)||(28949691-28949742)
chr3 (188-239)||(55022834-55022885)
chr3 (150-232)||(14647688-14647769)
chr3 (188-226)||(19775745-19775783)
chr3 (191-236)||(14568814-14568859)
chr3 (188-239)||(11854700-11854751)
chr3 (19-66)||(31224560-31224607)
chr3 (111-214)||(37251100-37251202)
chr3 (154-232)||(13436348-13436425)
chr3 (118-214)||(2051138-2051235)
chr3 (19-195)||(6805567-6805742)
chr3 (19-50)||(3394608-3394639)
chr3 (21-64)||(10554668-10554711)
chr3 (19-50)||(13523017-13523048)
chr3 (191-230)||(14499301-14499340)
chr3 (19-62)||(16979313-16979356)
chr3 (121-184)||(17046305-17046368)
chr3 (19-50)||(18367364-18367395)
chr3 (19-62)||(35961493-35961536)
chr3 (188-239)||(37439727-37439778)
chr3 (19-50)||(42324827-42324858)
chr3 (145-239)||(43926019-43926114)
chr3 (19-61)||(22652236-22652278)
chr3 (147-232)||(41764-41848)
chr3 (118-214)||(52523666-52523763)
chr3 (199-239)||(11300532-11300572)
chr3 (113-169)||(17248221-17248276)
chr3 (112-239)||(22110285-22110412)
chr3 (113-157)||(24340657-24340701)
chr3 (113-157)||(37642199-37642243)
chr3 (188-235)||(54520962-54521010)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (19-239)||(19662261-19662481)
chr2 (19-239)||(9241986-9242206)
chr2 (19-239)||(6260984-6261205)
chr2 (18-239)||(21073332-21073553)
chr2 (19-239)||(30643887-30644107)
chr2 (43-239)||(34137000-34137196)
chr2 (76-233)||(21237818-21237976)
chr2 (19-239)||(21081577-21081797)
chr2 (19-239)||(34874053-34874273)
chr2 (37-224)||(18546803-18546991)
chr2 (19-239)||(27472479-27472699)
chr2 (110-239)||(19201906-19202036)
chr2 (19-213)||(22173634-22173828)
chr2 (110-239)||(23069215-23069344)
chr2 (19-239)||(18358575-18358794)
chr2 (107-239)||(31345176-31345308)
chr2 (110-239)||(9784741-9784869)
chr2 (37-239)||(23287423-23287625)
chr2 (37-239)||(26392442-26392643)
chr2 (43-215)||(43947236-43947408)
chr2 (118-232)||(22703165-22703279)
chr2 (165-239)||(23707275-23707349)
chr2 (165-239)||(24671055-24671129)
chr2 (165-239)||(24918170-24918244)
chr2 (165-239)||(24681474-24681548)
chr2 (119-232)||(13101577-13101691)
chr2 (155-216)||(6482838-6482899)
chr2 (155-216)||(6486305-6486366)
chr2 (19-108)||(41301579-41301668)
chr2 (37-214)||(23004835-23005012)
chr2 (107-214)||(20520121-20520227)
chr2 (111-239)||(23791334-23791463)
chr2 (188-244)||(41531095-41531151)
chr2 (188-239)||(1283353-1283404)
chr2 (188-239)||(12901603-12901654)
chr2 (188-239)||(24628570-24628621)
chr2 (188-239)||(27379524-27379575)
chr2 (188-239)||(27383570-27383621)
chr2 (188-239)||(27601760-27601811)
chr2 (188-239)||(30345082-30345133)
chr2 (188-230)||(24649330-24649372)
chr2 (121-199)||(24834804-24834882)
chr2 (188-239)||(10101736-10101787)
chr2 (107-214)||(24697534-24697641)
chr2 (111-214)||(25108974-25109077)
chr2 (19-74)||(34858991-34859046)
chr2 (18-64)||(2524334-2524380)
chr2 (195-239)||(22459579-22459623)
chr2 (165-213)||(24642807-24642855)
chr2 (19-62)||(21915025-21915068)
chr2 (19-62)||(34492098-34492141)
chr2 (107-157)||(22413064-22413114)
chr2 (111-157)||(23207420-23207466)
chr2 (21-62)||(20590930-20590971)
chr2 (113-170)||(24529508-24529564)
chr2 (121-177)||(26903427-26903483)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (19-239)||(18212792-18213012)
chr4 (19-239)||(24047140-24047360)
chr4 (37-235)||(32306854-32307052)
chr4 (45-235)||(14852742-14852933)
chr4 (43-238)||(26050340-26050534)
chr4 (45-239)||(13591793-13591987)
chr4 (19-239)||(10056698-10056918)
chr4 (37-236)||(40907134-40907333)
chr4 (19-213)||(51463673-51463867)
chr4 (110-239)||(17048066-17048195)
chr4 (19-203)||(630509-630693)
chr4 (108-224)||(16043087-16043203)
chr4 (110-239)||(15041893-15042023)
chr4 (110-239)||(15112401-15112531)
chr4 (43-215)||(15791857-15792030)
chr4 (19-213)||(23803070-23803264)
chr4 (118-230)||(40906983-40907094)
chr4 (37-225)||(17333352-17333542)
chr4 (19-213)||(12611106-12611297)
chr4 (43-195)||(26789441-26789594)
chr4 (37-239)||(14825528-14825730)
chr4 (118-232)||(4831475-4831589)
chr4 (118-232)||(4834770-4834884)
chr4 (152-238)||(26045268-26045353)
chr4 (118-232)||(14047706-14047820)
chr4 (165-239)||(14746570-14746644)
chr4 (118-230)||(30146455-30146567)
chr4 (166-239)||(14185039-14185112)
chr4 (107-214)||(52243122-52243230)
chr4 (111-214)||(46640388-46640490)
chr4 (111-214)||(53082084-53082186)
chr4 (188-239)||(4561425-4561476)
chr4 (188-239)||(5757029-5757080)
chr4 (188-239)||(9556494-9556545)
chr4 (188-239)||(10712820-10712871)
chr4 (188-239)||(10926590-10926641)
chr4 (188-239)||(12487675-12487726)
chr4 (188-239)||(14757513-14757564)
chr4 (188-239)||(14954258-14954309)
chr4 (188-239)||(25689834-25689885)
chr4 (188-239)||(27533990-27534041)
chr4 (188-230)||(33742351-33742393)
chr4 (188-239)||(15497045-15497096)
chr4 (188-239)||(17810236-17810287)
chr4 (121-236)||(19738310-19738425)
chr4 (121-195)||(27996016-27996090)
chr4 (188-235)||(49547748-49547796)
chr4 (19-50)||(10704913-10704944)
chr4 (19-50)||(10918683-10918714)
chr4 (121-184)||(15365185-15365248)
chr4 (21-64)||(16277935-16277978)
chr4 (19-62)||(28385646-28385689)
chr4 (21-64)||(53387545-53387588)
chr4 (19-58)||(56115442-56115481)
chr4 (19-60)||(15884021-15884062)
chr4 (147-232)||(28385480-28385564)
chr4 (188-235)||(14048717-14048765)
chr4 (188-235)||(36038010-36038058)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (19-239)||(4476884-4477104)
chr6 (29-239)||(23838234-23838444)
chr6 (37-239)||(18453242-18453444)
chr6 (37-239)||(20136730-20136931)
chr6 (37-239)||(22195938-22196139)
chr6 (19-239)||(15817364-15817582)
chr6 (19-239)||(14979228-14979448)
chr6 (19-226)||(25619563-25619770)
chr6 (110-239)||(19773474-19773603)
chr6 (111-239)||(28103831-28103959)
chr6 (38-239)||(18177531-18177734)
chr6 (38-239)||(18199275-18199478)
chr6 (107-239)||(23414944-23415076)
chr6 (37-225)||(33443122-33443307)
chr6 (110-239)||(22805992-22806120)
chr6 (110-226)||(15705375-15705491)
chr6 (37-239)||(16493206-16493409)
chr6 (38-239)||(18204137-18204340)
chr6 (22-213)||(20556702-20556893)
chr6 (108-236)||(23539032-23539160)
chr6 (37-224)||(20224018-20224205)
chr6 (37-224)||(22118002-22118189)
chr6 (19-213)||(25754972-25755166)
chr6 (107-239)||(27556702-27556834)
chr6 (115-218)||(18896252-18896354)
chr6 (128-238)||(20182854-20182962)
chr6 (128-238)||(22153029-22153137)
chr6 (113-239)||(23076791-23076918)
chr6 (42-224)||(23527970-23528150)
chr6 (37-232)||(25738448-25738641)
chr6 (113-239)||(35008209-35008336)
chr6 (113-218)||(19362507-19362611)
chr6 (113-225)||(23538884-23538996)
chr6 (119-230)||(29416845-29416956)
chr6 (19-177)||(25752838-25752996)
chr6 (107-214)||(18706391-18706497)
chr6 (38-182)||(17105849-17105993)
chr6 (37-214)||(18696573-18696749)
chr6 (188-239)||(11566826-11566877)
chr6 (188-239)||(14472235-14472286)
chr6 (188-239)||(16760259-16760310)
chr6 (43-90)||(17229780-17229827)
chr6 (188-239)||(18917357-18917408)
chr6 (188-239)||(18955854-18955905)
chr6 (188-239)||(19870554-19870605)
chr6 (19-66)||(20734052-20734099)
chr6 (188-239)||(22862910-22862961)
chr6 (188-239)||(22949072-22949123)
chr6 (188-239)||(22953028-22953079)
chr6 (188-239)||(23395032-23395083)
chr6 (188-239)||(23871516-23871567)
chr6 (188-239)||(23875472-23875523)
chr6 (188-239)||(23989884-23989935)
chr6 (19-74)||(27851394-27851449)
chr6 (188-230)||(8243834-8243876)
chr6 (188-230)||(12618935-12618977)
chr6 (150-232)||(14594210-14594291)
chr6 (188-226)||(31477901-31477939)
chr6 (121-190)||(15896045-15896114)
chr6 (188-239)||(1644672-1644723)
chr6 (150-232)||(7429909-7429990)
chr6 (37-103)||(20078033-20078099)
chr6 (19-100)||(16133276-16133357)
chr6 (19-100)||(19443886-19443967)
chr6 (19-50)||(611155-611186)
chr6 (188-239)||(15875443-15875494)
chr6 (19-50)||(18658621-18658652)
chr6 (121-184)||(19656075-19656138)
chr6 (19-74)||(29848111-29848165)
chr6 (147-232)||(23956099-23956183)
chr6 (113-157)||(8227445-8227489)
chr6 (113-169)||(19847929-19847984)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (19-239)||(9562-9781)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (19-239)||(28312574-28312794)
chr1 (19-239)||(20437833-20438054)
chr1 (43-239)||(21043146-21043342)
chr1 (43-239)||(22124345-22124541)
chr1 (38-239)||(20958168-20958369)
chr1 (52-239)||(14800589-14800781)
chr1 (52-239)||(14809463-14809655)
chr1 (37-239)||(52940736-52940937)
chr1 (19-239)||(13881222-13881442)
chr1 (37-239)||(27653081-27653283)
chr1 (110-239)||(48603512-48603641)
chr1 (45-215)||(47190684-47190855)
chr1 (155-239)||(16372057-16372141)
chr1 (19-229)||(2332816-2333025)
chr1 (19-213)||(45574647-45574841)
chr1 (110-239)||(635914-636043)
chr1 (111-239)||(41781522-41781649)
chr1 (19-203)||(22130671-22130854)
chr1 (113-239)||(21533808-21533933)
chr1 (118-232)||(32649778-32649892)
chr1 (111-239)||(48520571-48520699)
chr1 (118-232)||(29534615-29534729)
chr1 (138-241)||(16381239-16381346)
chr1 (111-239)||(50614048-50614177)
chr1 (111-239)||(50621876-50622005)
chr1 (111-214)||(41049968-41050070)
chr1 (19-232)||(20031496-20031707)
chr1 (188-239)||(1010687-1010738)
chr1 (188-239)||(1925220-1925271)
chr1 (196-239)||(12271614-12271657)
chr1 (188-239)||(20228900-20228951)
chr1 (188-239)||(20924234-20924285)
chr1 (188-239)||(21407319-21407370)
chr1 (188-239)||(23819389-23819440)
chr1 (129-184)||(11945571-11945626)
chr1 (128-186)||(20329122-20329181)
chr1 (188-239)||(43543188-43543239)
chr1 (111-214)||(50686698-50686801)
chr1 (188-239)||(51326852-51326903)
chr1 (188-239)||(52639505-52639556)
chr1 (174-239)||(20454548-20454614)
chr1 (188-239)||(16375549-16375601)
chr1 (19-58)||(294443-294482)
chr1 (107-170)||(16758780-16758843)
chr1 (19-50)||(21180931-21180962)
chr1 (19-50)||(24815458-24815489)
chr1 (19-62)||(29764244-29764287)
chr1 (111-157)||(16368219-16368265)
chr1 (107-157)||(35261009-35261059)
chr1 (45-94)||(48520773-48520822)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (19-239)||(132976-133196)
scaffold0019 (19-141)||(133770-133892)
scaffold0019 (110-224)||(29285-29390)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (37-239)||(18026-18228)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (19-179)||(2333-2493)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (43-239)||(221072-221267)
scaffold0012 (188-239)||(189468-189519)
scaffold0012 (113-214)||(225492-225593)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (19-179)||(27941495-27941655)
chr8 (37-239)||(22253024-22253226)
chr8 (37-238)||(17086012-17086213)
chr8 (43-239)||(20501966-20502162)
chr8 (37-235)||(23667872-23668071)
chr8 (45-239)||(37515765-37515959)
chr8 (19-239)||(19808203-19808423)
chr8 (19-239)||(17460893-17461113)
chr8 (19-226)||(22237860-22238067)
chr8 (110-239)||(5083085-5083215)
chr8 (110-239)||(17438148-17438278)
chr8 (43-239)||(22995903-22996100)
chr8 (107-239)||(23659467-23659599)
chr8 (110-239)||(18833622-18833751)
chr8 (19-213)||(25484080-25484274)
chr8 (110-226)||(25363134-25363250)
chr8 (37-239)||(22963278-22963474)
chr8 (107-239)||(14397791-14397923)
chr8 (107-239)||(23943922-23944054)
chr8 (54-224)||(16799561-16799732)
chr8 (43-213)||(28397635-28397805)
chr8 (164-239)||(23409855-23409930)
chr8 (107-225)||(19154814-19154932)
chr8 (43-239)||(17439370-17439567)
chr8 (37-225)||(20533267-20533455)
chr8 (107-229)||(14103152-14103275)
chr8 (113-239)||(37116408-37116535)
chr8 (154-239)||(23914097-23914183)
chr8 (113-221)||(35026797-35026903)
chr8 (155-216)||(44476753-44476814)
chr8 (155-216)||(44480015-44480076)
chr8 (41-213)||(2418737-2418906)
chr8 (82-232)||(21329095-21329243)
chr8 (111-214)||(17266925-17267028)
chr8 (110-184)||(21346164-21346239)
chr8 (37-156)||(22525659-22525778)
chr8 (19-74)||(41680740-41680795)
chr8 (155-216)||(8728620-8728682)
chr8 (165-239)||(16401983-16402063)
chr8 (113-221)||(22419349-22419455)
chr8 (150-234)||(34950611-34950694)
chr8 (121-236)||(13665189-13665304)
chr8 (121-236)||(13724464-13724579)
chr8 (188-239)||(18862736-18862787)
chr8 (188-239)||(19278374-19278425)
chr8 (188-239)||(21410914-21410965)
chr8 (188-239)||(21805406-21805457)
chr8 (188-239)||(21828105-21828156)
chr8 (85-232)||(21967476-21967621)
chr8 (188-239)||(21972676-21972727)
chr8 (188-239)||(21976761-21976812)
chr8 (111-214)||(22364748-22364850)
chr8 (188-239)||(43251777-43251828)
chr8 (165-213)||(19936956-19937004)
chr8 (150-232)||(21980265-21980346)
chr8 (150-232)||(21985248-21985329)
chr8 (150-232)||(22000284-22000365)
chr8 (188-237)||(1327017-1327066)
chr8 (151-232)||(11251625-11251705)
chr8 (111-239)||(24353081-24353209)
chr8 (19-50)||(15635786-15635817)
chr8 (147-186)||(18024465-18024504)
chr8 (19-50)||(20454654-20454685)
chr8 (19-50)||(20455411-20455442)
chr8 (19-50)||(20460389-20460420)
chr8 (154-232)||(16197943-16198020)
chr8 (150-208)||(22005262-22005319)
chr8 (196-237)||(22525620-22525662)
chr8 (154-232)||(25658189-25658266)
chr8 (147-232)||(11774959-11775043)
chr8 (113-157)||(13508019-13508063)
chr8 (113-157)||(13597551-13597595)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (37-237)||(17564-17764)
scaffold0293 (107-239)||(20139-20271)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (37-235)||(55543-55742)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (86-239)||(1954-2107)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (59-239)||(36240-36420)
scaffold0107 (37-239)||(9943-10145)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (43-239)||(707-902)
scaffold0010 (107-170)||(60643-60706)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (43-239)||(625-821)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (96-239)||(3927-4071)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (37-235)||(29282-29481)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (37-237)||(75687-75887)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (19-236)||(1715-1932)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (19-239)||(219-439)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (19-239)||(105140-105358)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (110-239)||(142641-142771)
scaffold0020 (107-239)||(169678-169810)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (107-239)||(477-609)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (110-239)||(3016-3146)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (110-239)||(6091-6220)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (110-239)||(21226-21355)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (110-239)||(126015-126144)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (110-239)||(998-1128)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (37-233)||(19505-19701)
scaffold0106 (165-239)||(15225-15299)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (110-239)||(20810-20939)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (107-239)||(24526-24658)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (37-236)||(11209-11407)
scaffold0040 (37-236)||(22309-22507)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (110-239)||(7491-7619)
scaffold0111 (110-239)||(14610-14738)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (110-239)||(2602-2732)
scaffold0507 (111-219)||(7991-8100)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (19-239)||(15802-16019)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (20-213)||(269-462)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (118-239)||(10223-10344)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (110-239)||(912-1041)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (110-239)||(8091-8220)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (38-235)||(86-283)
scaffold1419 (113-153)||(1-41)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (19-213)||(12221-12415)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (107-239)||(39312-39444)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (113-239)||(30391-30518)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (110-239)||(7420-7550)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (107-239)||(17633-17765)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (107-239)||(31183-31315)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (110-226)||(6684-6800)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (107-239)||(67321-67452)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (143-238)||(15030-15125)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (37-239)||(206383-206585)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (37-239)||(3186-3388)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (110-239)||(120068-120197)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (20-213)||(82235-82432)
scaffold0037 (188-239)||(80426-80477)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (43-215)||(1785-1960)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (37-208)||(3687-3857)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (107-239)||(10533-10666)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (37-239)||(22338-22540)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (37-239)||(13979-14181)
scaffold0005 (111-214)||(267747-267849)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (107-203)||(123-219)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (118-232)||(146252-146366)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (19-232)||(28967-29178)
scaffold0080 (19-232)||(34432-34643)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (121-218)||(16861-16957)
scaffold0046 (116-218)||(26016-26117)
scaffold0046 (19-62)||(22375-22418)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (118-232)||(48394-48508)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (138-239)||(7894-7995)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (124-235)||(6098-6210)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (121-224)||(29747-29851)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (107-229)||(589-712)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (107-230)||(4625-4748)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (113-239)||(97066-97193)
scaffold0006 (113-239)||(106344-106471)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (165-239)||(1279-1353)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (19-161)||(6331-6471)
scaffold0123 (43-214)||(623-793)
scaffold0123 (38-225)||(25182-25367)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (116-218)||(57898-57999)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (165-239)||(53825-53899)
scaffold0022 (113-239)||(128904-129031)
scaffold0022 (111-157)||(78464-78510)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (106-239)||(85605-85739)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (37-206)||(2285-2454)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (107-235)||(332380-332507)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (19-232)||(152816-153027)
scaffold0001 (82-232)||(163004-163152)
scaffold0001 (121-195)||(446597-446671)
scaffold0001 (147-232)||(168675-168759)
scaffold0001 (147-232)||(176029-176113)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (165-232)||(626-693)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (165-244)||(6889-6968)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (165-238)||(4256-4329)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (165-226)||(15070-15131)
scaffold0306 (19-62)||(4433-4476)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (171-239)||(3317-3385)
scaffold0108 (37-90)||(3385-3438)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (169-239)||(6932-7002)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-225)||(6215-6329)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (113-239)||(65-192)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (188-239)||(58810-58861)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (111-225)||(18170-18284)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (107-214)||(16028-16136)
scaffold0357 (163-239)||(2722-2799)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (188-239)||(414-465)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (188-239)||(3966-4017)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (110-184)||(13430-13502)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (188-239)||(359-410)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (188-239)||(5192-5243)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (188-239)||(12386-12437)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (188-239)||(11592-11643)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (188-239)||(32751-32802)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (188-239)||(36033-36084)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (188-239)||(36177-36228)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (188-239)||(207593-207644)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (111-225)||(38392-38506)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (150-232)||(208992-209073)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (188-239)||(14178-14229)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (192-239)||(67397-67444)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (188-239)||(61703-61754)
scaffold0029 (188-239)||(80679-80730)
scaffold0029 (188-239)||(65619-65670)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (19-65)||(6284-6330)
scaffold0737 (111-214)||(1730-1832)
[»] scaffold0301 (3 HSPs)
scaffold0301 (150-223)||(16541-16613)
scaffold0301 (85-223)||(12077-12213)
scaffold0301 (85-223)||(15229-15365)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (19-62)||(4433-4476)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (19-62)||(11100-11143)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (19-62)||(3548-3591)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (19-50)||(19250-19281)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (121-236)||(24839-24954)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (153-232)||(24280-24358)
scaffold0098 (153-232)||(35150-35228)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (41-103)||(8376-8438)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (121-195)||(46788-46862)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (113-157)||(11607-11651)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (188-235)||(3163-3211)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (113-157)||(17961-18005)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (113-157)||(38190-38234)


Alignment Details
Target: scaffold0026 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 110933 - 110713
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110933 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 110834  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110833 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 110734  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  110733 gatgtttatgtgctgcctatg 110713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21527 - 21311
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatat-aatatgat 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| || | || ||| ||||| || |  || |||| || ||||| || || || |||||    
T  21527 tttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtagaaacaaag-ttgtttataatagtaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgat 21429  T
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgatta-tcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||| || | |||| |||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||| |  |    
T  21428 ta-atgttgttagtgatgtgatatagttatttatggattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattt-acgttgttatgttgt 21331  T
Q  217 gagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21330 gagctgtttatgtgctgcct 21311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 97)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14566448 - 14566228
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566448 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 14566349  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566348 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 14566249  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14566248 gatgtttatgtgctgcctatg 14566228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18872606 - 18872386
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872606 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 18872507  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18872506 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 18872407  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18872406 gatgtttatgtgctgcctatg 18872386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16008824 - 16008604
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16008824 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatt 16008725  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008724 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 16008625  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  16008624 gatgtttatgtgttgcctatg 16008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11661551 - 11661332
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661551 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccct-ggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 11661453  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661452 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 11661353  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11661352 gatgtttatgtgctgcctatg 11661332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18607733 - 18607513
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607733 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 18607634  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18607633 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatttttatatattga 18607534  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18607533 gatgtttatgtgctgcctatg 18607513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14422231 - 14422005
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422231 tttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 14422132  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422131 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 14422032  T
Q  218 agatgtttatgtgctgcctatgctact 244  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  14422031 aggtgtttatgtgctgcctatgttact 14422005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42462205 - 42462009
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42462205 tgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgttgttagtaatgtgatata 42462106  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42462105 gttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 42462009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 147864 - 147704
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147864 tttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 147765  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  147764 tgatgttgtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033407
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaataatgt 9033303  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  9033304 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgttgcc 9033403  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  9033404 tatg 9033407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130878
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcag-atataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatat 130779  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  130780 agttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttctgtgctgcctatg 130878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996284
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 16996378  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996377 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 16996284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768977
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgt 11768876  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg--attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11768877 gatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatgattatgtgctgc 11768976  T
Q  235 c 235  Q
    |    
T  11768977 c 11768977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16998872 - 16998652
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||| || |  ||||| |  ||||  ||| ||||||||||||    
T  16998872 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagcagttataatatgatt 16998773  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16998772 taatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 16998673  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  16998672 gatgtttaagtgctgcctatg 16998652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14273794 - 14273574
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  14273794 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 14273695  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14273694 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 14273595  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  14273594 gatgtttacgtgctgcctatg 14273574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 46580516 - 46580736
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  46580516 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 46580615  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46580616 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 46580715  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  46580716 gatgtttacgtgctgcctatg 46580736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38519566 - 38519432
Alignment:
Q  105 gatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38519566 gatataatatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 38519467  T
Q  205 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38519466 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 38519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 239
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525625
Alignment:
Q  55 tggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgca 154  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgttattagtaatttgatatattggtatatgca 11525539  T
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11525540 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctatg 11525625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20619570 - 20619440
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  20619570 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 20619471  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20619470 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 20619440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 10501355 - 10501484
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10501355 aatatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 10501454  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10501455 atatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 10501484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14258639 - 14258510
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14258639 aatatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 14258540  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14258539 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 16460697 - 16460826
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16460697 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 16460796  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16460797 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16460826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16579947 - 16579818
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16579947 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgtt 16579848  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16579847 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16579818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 16585716 - 16585845
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  16585716 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgtt 16585815  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16585816 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16585845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20487730 - 20487601
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  20487730 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 20487631  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20487630 atgtcttgagatatttatgtgctgcctatg 20487601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301347
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 32301377  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32301376 atatcttgagatgtttacgtgttgcctatg 32301347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 14157036 - 14157165
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14157036 aatatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 14157135  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14157136 atatcttgagatgtttatgtgttgtctatg 14157165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 1858760 - 1858892
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1858760 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 1858859  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1858860 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1858892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060485
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||| || |  |||||||   ||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 17060381  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17060382 caaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgca 17060481  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  17060482 tatg 17060485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38828507 - 38828298
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |  | |||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  38828507 tttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatcctcgggttatgagtgaatgtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatgatt 38828408  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
     |||||||||| | | | | || ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38828407 -gatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattattatatcttg 38828310  T
Q  218 agatgtttatgt 229  Q
    |||||| |||||    
T  38828309 agatgtctatgt 38828298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 25927180 - 25927309
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25927180 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttg---ttgattatcatttgatatt 25927276  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25927277 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 25927309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Original strand, 9725526 - 9725667
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  9725526 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 9725625  T
Q  145 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 186  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9725626 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgat 9725667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13647688 - 13647492
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatat--ga 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||| || |  ||||| |  | ||  |   ||||||||  ||    
T  13647688 tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctattataatatatga 13647589  T
Q  117 tttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13647588 tttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017523
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||| |  | |||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 17017425  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 234  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||    
T  17017426 aatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatgttattatatctggatatgttaatgtgctgc 17017523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 13918454 - 13918586
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||     
T  13918454 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatatc 13918553  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  13918554 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 13918586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177726
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattattata 9177699  T
Q  213 tcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    | | || ||||| ||||||||| ||||    
T  9177700 tttggatatgttaatgtgctgcatatg 9177726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 14929251  T
Q  210 atatct 215  Q
     |||||    
T  14929252 gtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtt 15352717  T
Q  210 atatct 215  Q
     |||||    
T  15352718 gtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 16109453 - 16109567
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16109453 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgctatatctt 16109551  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16109552 gagatgtctatgtgct 16109567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 837317 - 837410
Alignment:
Q  139 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  837317 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 837410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 1202497 - 1202590
Alignment:
Q  139 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1202497 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 1202590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940309
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 8940309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720055
Alignment:
Q  154 attatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatg 15720055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34957617 - 34957407
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
T  34957617 tttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggt-taggaatgaaggtttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgataaaagatggtt 34957519  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
     || ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  34957518 -gaggttgttaatgttatggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtaggg-ttgactatcatttgatattgtcatattttga 34957421  T
Q  219 gatgtttatgtgct 232  Q
    ||||| ||||||||    
T  34957420 gatgtctatgtgct 34957407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 833321 - 833421
Alignment:
Q  139 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  833321 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctaccta 833419  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  833420 tg 833421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 1198501 - 1198601
Alignment:
Q  139 tatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1198501 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctaccta 1198599  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  1198600 tg 1198601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48991372 - 48991266
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  48991372 tataatatgatttaatgttgatagtaatt-gatatatt-gtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatatt 48991275  T
Q  207 gttatatct 215  Q
     ||||||||    
T  48991274 attatatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091826
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||| ||||| ||  |||||||| |||||     
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgttgttaataatgt 16091920  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgc 231  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||    
T  16091919 tacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattatcatttgatattattatatttggatatgttaatgtgc 16091826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29004268 - 29004057
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||  ||| | |  |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
T  29004268 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtttattaaaatgttgttgatgttcagtgagtctgataaaagatggtt 29004169  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
     || ||||||| |  |    || ||||| | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29004168 -gaggttgttaatgttatagtaaatttgcaaatgtcttatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttga 29004071  T
Q  219 gatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||||||||||    
T  29004070 gatgtttatgtgct 29004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Original strand, 15008427 - 15008533
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  || ||||||||    
T  15008427 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatatt 15008525  T
Q  207 gttatatc 214  Q
    ||||||||    
T  15008526 gttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  146 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Original strand, 18456254 - 18456308
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggtt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18456254 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggtt 18456308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 20220124 - 20220248
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |   ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  20220124 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttata 20220220  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  20220221 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 20220248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868040
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | || |||  || ||||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttata 1868027  T
Q  213 tcttgagatgttt 225  Q
    || |||| |||||    
T  1868028 tcatgagctgttt 1868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898241
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 225  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18279418 - 18279367
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18279418 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 18279367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18283381 - 18283330
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18283381 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 18283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 30820862 - 30820909
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30820862 tttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat 30820909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 36685856 - 36685903
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36685856 tttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat 36685903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Original strand, 2529982 - 2530052
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 177  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2529982 tataatatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13892742 - 13892661
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  13892742 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 13892661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33122 - 33071
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  33122 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 33071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 70856 - 70907
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  70856 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 70907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 74965 - 75016
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  74965 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 75016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 12704750 - 12704801
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12704750 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12704801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12714879 - 12714828
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12714879 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12714828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12718683 - 12718632
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12718683 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12718632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12723594 - 12723543
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12723594 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12723543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 16907292 - 16907343
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  16907292 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 16907343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39722281 - 39722230
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  39722281 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 39722230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 45170097 - 45170148
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  45170097 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 45170148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26292410 - 26292368
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26292410 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 26292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 709161 - 709336
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagata-taatatgat 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||  || |||| ||||| || |  || |||| || ||||| || | ||| ||||     
T  709161 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaagttgtttataatattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatga- 709258  T
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattat 195  Q
    || ||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  709259 ttaatgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttat 709336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116540
Alignment:
Q  199 ttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 15116540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15113003
Alignment:
Q  196 catttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatg 15113003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16114256 - 16114205
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  16114256 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatg 16114205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16117409 - 16117358
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  16117409 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatg 16117358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8468833 - 8468777
Alignment:
Q  183 tgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8468833 tgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatg 8468777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Original strand, 15081900 - 15081948
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  15081900 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 832629 - 832660
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  832629 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 832660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 1197809 - 1197840
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1197809 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 1197840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 8757002 - 8757033
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8757002 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 8757033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13408218 - 13408187
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13408218 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13408187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 13699495 - 13699526
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699495 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13699526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 14188898 - 14188941
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14188898 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 14191692 - 14191735
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14191692 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 14270036 - 14270087
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14270036 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatg 14270087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16324153 - 16324110
Alignment:
Q  196 catttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16324153 cattcgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatg 16324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 16550610 - 16550653
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16550610 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggtag 16550653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16615052 - 16615009
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16615052 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggtag 16615009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 17505612 - 17505655
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17505612 taagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17547602 - 17547559
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17547602 taagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48812284 - 48812241
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  48812284 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 186
Target Start/End: Original strand, 14416246 - 14416283
Alignment:
Q  149 tatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 186  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14416246 tatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgat 14416283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Original strand, 1490117 - 1490173
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 177  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1490117 atgttgttaataatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatatatgatgtt 1490173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Original strand, 2280047 - 2280155
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||||| || |||||||| | || ||| || || | ||||||  ||||||||||    
T  2280047 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatat 2280146  T
Q  206 tgttatatc 214  Q
    | |||||||    
T  2280147 tattatatc 2280155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 37598723 - 37598943
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598723 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 37598822  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37598823 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 37598922  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37598923 gatgtttatgtgctgcctatg 37598943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 28370862 - 28371082
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28370862 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatc 28370961  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370962 tgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 28371061  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28371062 gatgtttatgtgctgcctatg 28371082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42960822 - 42960602
Alignment:
Q  20 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg-taggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960822 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 42960723  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42960722 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 42960623  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  42960622 gatgtttatgtgttgcctatg 42960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469863
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttagtaatgt 23469965  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469964 gatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata-tggtatatcttgagatgtttatgtgctgcct 23469866  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  23469865 atg 23469863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 38145344 - 38145492
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  38145344 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgactgagtcagatataatataatt 38145443  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38145444 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 25574334 - 25574525
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25574334 tgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 25574433  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25574434 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 25574525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 25575527 - 25575718
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25575527 tgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 25575626  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25575627 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 25575718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 25576720 - 25576911
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |   |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25576720 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatagtaatgtgatata 25576819  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576820 gttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 25576911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 30138769 - 30138976
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  30138769 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 30138868  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30138869 taatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 30138968  T
Q  219 gatgttta 226  Q
    ||||||||    
T  30138969 gatgttta 30138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6766107 - 6765888
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||| || || || || |  ||||  | | |||| |||||||    
T  6766107 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgttata-tatgatt 6766009  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6766008 taatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttga 6765909  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  6765908 gatgtttaagtgccgcctatg 6765888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 21731319 - 21731522
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataat-atgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||   | ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  21731319 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 21731418  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21731419 agatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgc 21731517  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  21731518 ctatg 21731522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336627
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22336627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340165
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22340165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 21328073 - 21328276
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||  | |||| | ||||||||||||| | | |||||    
T  21328073 atgttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgttataaataatg 21328172  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||    
T  21328173 tgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgctatatctgaatatgtttttgtgctgcc 21328272  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  21328273 tatg 21328276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Original strand, 22107394 - 22107495
Alignment:
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22107394 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgccta 22107493  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  22107494 tg 22107495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 21809439 - 21809642
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataat-atgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||   | ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  21809439 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 21809538  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 234  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21809539 tgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgc 21809637  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  21809638 ctatg 21809642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 228
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740695
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |  |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||||| |||||| ||| ||||     
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgatagaaatgt 26740604  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26740605 gatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgtttatg 26740695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 26732692 - 26732893
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |  |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||||| |||||| ||| ||||     
T  26732692 atgtagtgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgatagaaatgt 26732791  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  26732792 gatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgtcgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcct 26732890  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  26732891 atg 26732893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10816582 - 10816462
Alignment:
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10816582 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttg 10816484  T
Q  218 agatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  10816483 agatgtctatgtgctacctatg 10816462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15796682 - 15796479
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||| || ||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  15796682 tgttgtgagatgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactactgctgctgtttcagtaagcctgatataa-atgatttgatgttgctaataatgt 15796584  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgc 234  Q
    |||||| |||||||| || |||| | ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  15796583 gatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgc 15796484  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  15796483 ctatg 15796479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 33895587 - 33895706
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||       ||||||||||||    
T  33895587 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg---ttg-------tttgatattgtt 33895676  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33895677 gtatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 33895706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23538608 - 23538495
Alignment:
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    |||||||||||   ||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23538608 tgatgttgttaacgatgtggtatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatgatttgatattgttatatcttg 23538510  T
Q  218 agatgtttatgtgct 232  Q
    |||||| ||||||||    
T  23538509 agatgtctatgtgct 23538495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572025
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatata-atatgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||  ||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgttgttagtaatg 20572050  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgt 160  Q
      ||||| |||||||||||||||||    
T  20572049 taatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 27988857 - 27988978
Alignment:
Q  108 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata--tttgtatatgcatt-atgtggattatataagatgtttaa--gttgatattgattatcatttga 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  27988857 ataagatgattt-atgttgttaagaatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttga 27988955  T
Q  203 tattgttatatcttgagatgttt 225  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  27988956 tattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356256
Alignment:
Q  172 gatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18356256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18418858 - 18418803
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18418858 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 18418803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29448284 - 29448078
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||   || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||    
T  29448284 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgttataatatgatt 29448185  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  29448184 tgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 29448085  T
Q  219 gatgttt 225  Q
    | |||||    
T  29448084 gctgttt 29448078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 239
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910977
Alignment:
Q  172 gatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20910977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 22178152 - 22178266
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||| |    
T  22178152 atatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtca 22178251  T
Q  211 tatcttgagatgttt 225  Q
    |||| |||| |||||    
T  22178252 tatcatgagctgttt 22178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10753379 - 10753328
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10753379 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttgcctatg 10753328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 15236871 - 15236922
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15236871 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 15236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 15236926 - 15236977
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15236926 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 15236977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 19472811 - 19472862
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19472811 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19472862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20295862 - 20295811
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  20295862 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 20295811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 31456244 - 31456197
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31456244 tttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaat 31456197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Original strand, 41861449 - 41861515
Alignment:
Q  174 tgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  41861449 tgttgaagttgatggtgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatg 41861515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 43243243 - 43243324
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  43243243 atgcattatgtggattacgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 43243324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 21554988 - 21555032
Alignment:
Q  22 aagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21554988 aagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttgagttaggaat 21555032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 21557654 - 21557698
Alignment:
Q  22 aagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21557654 aagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat 21557698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 263303 - 263260
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  263303 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17812842 - 17812811
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17812842 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 17812811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22412452 - 22412398
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22412452 tttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga-tcttggggtaggaatggaggttg 22412398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 24277212 - 24277243
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277212 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24277243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24385001 - 24384970
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385001 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24384970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 40723678 - 40723729
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  40723678 ttgattatcatttaatattgatatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 40723729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Original strand, 33473295 - 33473379
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  33473295 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 33473379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 169  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 17011172 - 17011132
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttgggg 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  17011172 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggg 17011132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 169  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22144242 - 22144134
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||| |||| |||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || | ||||||  || |||||||    
T  22144242 tataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatat 22144143  T
Q  206 tgttatatc 214  Q
    |||||||||    
T  22144142 tgttatatc 22144134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25743913 - 25743807
Alignment:
Q  108 ataatatgatttgatgttgttagtaatgaga--tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgata 204  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||   |||||||  | ||||||    
T  25743913 ataagatgatttggtgttgttattaatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattatttgtgatgttttaagttg---ttgattactacttgata 25743817  T
Q  205 ttgttatatc 214  Q
    ||||||||||    
T  25743816 ttgttatatc 25743807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Original strand, 27869281 - 27869321
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgat 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27869281 tatatgcattatgtggattatataacatgatttaagttgat 27869321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725996
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 40725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 23371313 - 23371533
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371313 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 23371412  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371413 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 23371512  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23371513 gatgtttatgtgctgcctatg 23371533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51300841 - 51300621
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300841 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 51300742  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51300741 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 51300642  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51300641 gatgtttatgtgctgcctatg 51300621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 14763567 - 14763787
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14763567 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatt 14763666  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763667 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 14763766  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14763767 gatgtttatgtgctgcctatg 14763787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 10833945 - 10834160
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833945 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 10834044  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834045 tgatgttgttagtaatgagatata-ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 10834143  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcc 235  Q
    ||||||||| |||||||    
T  10834144 gatgtttatttgctgcc 10834160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9533575 - 9533416
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9533575 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatt 9533476  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9533475 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9577876 - 9577684
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 144  Q
    |||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9577876 agttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatt 9577777  T
Q  145 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  9577776 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaga--tttatgtgttgcctatg 9577684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 8928271 - 8928483
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |    
T  8928271 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-t 8928369  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928370 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttg 8928468  T
Q  218 agatgtttatgtgct 232  Q
    |||||| ||||||||    
T  8928469 agatgtctatgtgct 8928483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427772
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagata-taatatgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttgttcagagagtctgaaaataagatgatt-gatgttgttagtaatg 37427878  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37427877 tgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 37427778  T
Q  236 tatgct 241  Q
    | ||||    
T  37427777 tgtgct 37427772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14966448 - 14966228
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  14966448 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 14966349  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14966348 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 14966249  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  14966248 gatgtttacgtgctgcctatg 14966228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 52989564 - 52989783
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  52989564 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggg-taggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 52989662  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52989663 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 52989762  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  52989763 gatgtttacgtgctgcctatg 52989783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246078
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgt 15246182  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||    
T  15246181 gatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcc 15246082  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  15246081 tatg 15246078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15265394 - 15265199
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  15265394 agttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgtgatataat 15265295  T
Q  145 tgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||    
T  15265294 tgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgctgcctatg 15265199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 324492 - 324294
Alignment:
Q  41 tgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  | ||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  324492 tgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaata 324393  T
Q  141 tatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  324392 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 324294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15206996
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttattaatgt 15207100  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||| || |||||  ||| |||||    
T  15207099 gatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatatttatatgtctggatatgttattgtactgcc 15207000  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  15206999 tatg 15206996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14179559 - 14179430
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14179559 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 14179460  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14179459 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14179430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14671111 - 14670982
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  14671111 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 14671012  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671011 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14670982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14682610 - 14682481
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  14682610 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgtt 14682511  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682510 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14682481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 43889558 - 43889687
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43889558 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 43889657  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43889658 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 43889687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16643451 - 16643240
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||   |||  | |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  16643451 tttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 16643352  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  16643351 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaa 16643252  T
Q  219 gatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||||||    
T  16643251 gatgtttatgtg 16643240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194751
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttat 28194779  T
Q  212 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28194778 atcttgagatgtttatgtgctgtctatg 28194751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16796674 - 16796545
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16796674 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 16796575  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16796574 atatcttgaaatgtttacgtgctgcctatg 16796545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32403020
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||     
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatata-tatgatttgttgttgcgagtaatgt 32402917  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  32402918 gatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattgattattatttgatattgttatatcttgagacg-ttatgtgctgtc 32403016  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  32403017 tatg 32403020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 43550283 - 43550477
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  43550283 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 43550382  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  43550383 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12339894 - 12339765
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12339894 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 12339795  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12339794 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 12339765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12470089 - 12469960
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12470089 aatatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 12469990  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12469989 atatcttgagatgttcacgtgctgcctatg 12469960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837484
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| | |||||  | | || |||||||||| ||| || ||||||||     
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatagtaatgt 21837586  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21837585 aataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 21837487  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  21837486 atg 21837484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876448
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 54876421  T
Q  213 tcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||    
T  54876422 tcttgagatgtttacgtgctgtctatg 54876448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5223495 - 5223363
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5223495 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 5223396  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  5223395 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 5223363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 10542364 - 10542482
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  10542364 aatatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 10542463  T
Q  210 atatcttgagatgtttatg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10542464 atatcttgagatgtttatg 10542482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50243179 - 50242985
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||   |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  50243179 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 50243080  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  50243079 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Original strand, 18700267 - 18700368
Alignment:
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18700267 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 18700366  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  18700367 tg 18700368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15465266 - 15465134
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15465266 tataatataatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatatt 15465167  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15465166 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15465134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691769
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||    
T  17691644 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgataatcatttgatgttattata 17691743  T
Q  213 tcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||    
T  17691744 tc-tgagatgtttacgtgctgcctatg 17691769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 157
Target Start/End: Original strand, 29172492 - 29172606
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29172492 tgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttgatagtattgtgatata 29172591  T
Q  143 tttgtatatgcatta 157  Q
     ||||||||||||||    
T  29172592 attgtatatgcatta 29172606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44494988 - 44494893
Alignment:
Q  116 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttat 211  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44494988 atttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattattat 44494893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18893036 - 18892961
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgtt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18893036 tttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 18892961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 34852596 - 34852710
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34852596 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 34852694  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34852695 gagatgtctatgtgct 34852710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318754
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttata 23318748  T
Q  213 tcttga 218  Q
    ||||||    
T  23318749 tcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 3265000 - 3265076
Alignment:
Q  163 attatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3265000 attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatg 3265076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36527879 - 36527803
Alignment:
Q  163 attatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36527879 attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatg 36527803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 316309 - 316202
Alignment:
Q  109 taatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattg 207  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  316309 taatgtgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattg 316210  T
Q  208 ttatatct 215  Q
    ||||||||    
T  316209 ttatatct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18889810 - 18889735
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgtt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18889810 tttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattatagtactgttgatgtt 18889735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914077
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatg 11914077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919408
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||| || |  | |||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||  |||  |||     
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagcgatgt 13919492  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagat 221  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  13919491 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12378114 - 12378003
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  12378114 tataatatgatttaatgttgatagtaatttaatatatt-gtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatatt 12378016  T
Q  207 gttatatcttgag 219  Q
    |||||||| ||||    
T  12378015 gttatatcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 224
Target Start/End: Original strand, 14568899 - 14569007
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatat--ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatct 215  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||     
T  14568899 ttgatgttgttgttaatgtgatatataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgactgtcacttgatattgttatatca 14568998  T
Q  216 tgagatgtt 224  Q
    |||| ||||    
T  14568999 tgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Original strand, 16839575 - 16839723
Alignment:
Q  82 tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||| || |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16839575 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gaggttgttaatattttggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaag 16839673  T
Q  182 ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
     | || |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  16839674 -taatgttgattatcatttggtattgtcattgtttgagatgtctatgtgct 16839723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15617392 - 15617339
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgct 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  15617392 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 15617339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 24153052 - 24153105
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24153052 taagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttg 24153105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30065964 - 30065911
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgct 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  30065964 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 30065911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 2248576 - 2248668
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||  ||| | || |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  2248576 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaagtttattaaaatattgttgatgttcagtaagtctgatataa 2248668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 4107488 - 4107539
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4107488 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4107539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 4111340 - 4111391
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4111340 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4111391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 4588864 - 4588915
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4588864 ttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 4588915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7109716 - 7109665
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7109716 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 7109665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7113651 - 7113600
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  7113651 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 7113600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11070086 - 11070035
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11070086 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11070035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 11165620 - 11165671
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11165620 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11165671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15964987 - 15964936
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15964987 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15964936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15968911 - 15968860
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15968911 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15968860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15972835 - 15972784
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  15972835 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15972784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22321682 - 22321631
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22321682 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22321631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22336737 - 22336686
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22336737 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22336686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 27409735 - 27409786
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27409735 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27409786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28949742 - 28949691
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  28949742 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 28949691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 55022885 - 55022834
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  55022885 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 55022834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 14647688 - 14647769
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  14647688 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 14647769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19775783 - 19775745
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775783 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 19775745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Original strand, 14568814 - 14568859
Alignment:
Q  191 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14568814 attatcatttgatattcttatatcttgagatgtatatgtgctgcct 14568859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11854751 - 11854700
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11854751 ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11854700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 31224560 - 31224607
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  31224560 tttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaat 31224607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 37251100 - 37251202
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||| || |||| || || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  37251100 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 37251198  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  37251199 tatc 37251202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13436425 - 13436348
Alignment:
Q  154 attatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  13436425 attatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 13436348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051235
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatc 214  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 6805567 - 6805742
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatat-aatatgat 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| || | || ||| ||||| || |  || |||| || ||||| || || || |||||    
T  6805567 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtagaaacaaag-ttgtttataataataatgttgttcagagagtctgaaattaagatgat 6805665  T
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattat 195  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  6805666 ta-atgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttat 6805742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 3394608 - 3394639
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394608 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 3394639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 10554711 - 10554668
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10554711 taagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 13523017 - 13523048
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13523017 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13523048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14499340 - 14499301
Alignment:
Q  191 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14499340 attatcattggatattgttatatcctgagatgtttatgtg 14499301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16979356 - 16979313
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16979356 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16979313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17046368 - 17046305
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    |||||||||||| || |||||| || || |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17046368 atgttgttagtattgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatatatgatgttgaagttg 17046305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 18367364 - 18367395
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367364 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18367395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 35961493 - 35961536
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  35961493 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 37439727 - 37439778
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  37439727 ttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 37439778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 42324827 - 42324858
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42324827 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 42324858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43926019
Alignment:
Q  145 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||  || ||| |||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatg 43926019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22652278 - 22652236
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggta 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  22652278 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41848 - 41764
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||| ||||    
T  41848 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tattgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatatgct 41764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523763
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatc 214  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || | ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 52523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300572
Alignment:
Q  199 ttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11300572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 169  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 239
Target Start/End: Original strand, 22110285 - 22110412
Alignment:
Q  112 tatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttat 211  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||  || ||| |||| |||||| | | || | ||||||  ||||||||||||||||    
T  22110285 tatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgatgttga-gatgctgttgatttgcatttgatattgttat 22110383  T
Q  212 atcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  22110384 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 22110412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340701
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 24340701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642243
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 37642243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54521010 - 54520962
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tgtttatgtgctgcc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54521010 ttgattaccatttgatgttgttatatcttgagattgtttgtgtgctgcc 54520962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 19662261 - 19662481
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662261 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 19662360  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662361 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 19662460  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19662461 gatgtttatgtgctgcctatg 19662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9242206 - 9241986
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9242206 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttgaatgagtaagatataatatgatt 9242107  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9242106 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 9242007  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9242006 gatgtttatgtgctgcctatg 9241986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 6260984 - 6261205
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6260984 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatt 6261083  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtata-tgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6261084 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 6261183  T
Q  218 agatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  6261184 agacgtttatgtgctgcctatg 6261205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 239
Target Start/End: Original strand, 21073332 - 21073553
Alignment:
Q  18 atttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073332 atttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgat 21073431  T
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073432 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 21073531  T
Q  218 agatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  21073532 agatgtttatgtgctgcatatg 21073553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 30643887 - 30644107
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30643887 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatacaatt 30643986  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643987 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatttgatattgttatatcttga 30644086  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  30644087 gacgtttatgtgctgcctatg 30644107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34137196 - 34137000
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  34137196 tgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgttactagtaatgtgatata 34137097  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34137096 attgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttgcctatg 34137000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21237976 - 21237818
Alignment:
Q  76 ttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21237976 ttatagtactgttaatgttcagtgagtctgatatactataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 21237877  T
Q  176 tttaagttgat-attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctg 233  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21237876 tttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctg 21237818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 21081577 - 21081797
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  21081577 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatt 21081676  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  21081677 taatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtttttatatcttta 21081776  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  21081777 gatgtttacgtgctgcctatg 21081797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 34874053 - 34874273
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  34874053 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatt 34874152  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | ||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34874153 taatgttgaaagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 34874252  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  34874253 gatgtttaagtgccgcctatg 34874273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546991
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttagtaatgt 18546902  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||    
T  18546903 gatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27472699 - 27472479
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||  |||| || |  | ||| |  ||||  | | || |||||||||    
T  27472699 tttaagagtatttaacttatgttatgagttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatt 27472600  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27472599 taatgttgatagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 27472500  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||||| |||||    
T  27472499 gatgtttacgtgctgtctatg 27472479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 19201906 - 19202036
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  19201906 aatatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 19202005  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19202006 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 19202036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 22173634 - 22173828
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  22173634 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 22173733  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  22173734 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069344
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 23069314  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23069315 atatcttgagatgtttacgtgctacctatg 23069344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 18358575 - 18358794
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |   |||| |  | ||  | | |||| |||||||    
T  18358575 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgttata-tatgatt 18358673  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18358674 taatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttga 18358773  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| || | |||||||    
T  18358774 gatgtttaagtaccgcctatg 18358794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31345308 - 31345176
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31345308 tataatatgaattagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 31345209  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  31345208 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 31345176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9784869 - 9784741
Alignment:
Q  110 aatatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgt 208  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||| ||||    
T  9784869 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggt--tgttgattatcattggatgttgt 9784772  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784771 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 9784741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287423
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || |  |||||||  |||  || | ||||| || |||| | | || ||||||||     
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatgatagtaatgt 23287526  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcc 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23287525 gatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcc 23287427  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  23287426 tatg 23287423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392442
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  |||||||  |||| |  | ||| | ||||| | |||||| ||| || |     
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaaggt 26392544  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  26392543 gatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaag-tattgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcct 26392445  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  26392444 atg 26392442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 43947236 - 43947408
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatg-ttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  43947236 tgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtttgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatat 43947334  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt-taagttgatattgattatcatttgatattgttatatct 215  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  43947335 a-ttgtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22703279 - 22703165
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22703279 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 22703181  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22703180 gagatgtctatgtgct 22703165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707349
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 23707349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671055
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatg 24671055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918170
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 24918170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681474
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 24681474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Original strand, 13101577 - 13101691
Alignment:
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgg-attatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgat-attgttatatctt 216  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13101577 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgataatttttatatctt 13101675  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13101676 gagatgtctatgtgct 13101691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Original strand, 41301579 - 41301668
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41301579 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgata 41301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004835
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||| |||||||| | ||||||| | |||     
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgttgttaatgatgt 23004913  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatc 214  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23004912 taaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Original strand, 20520121 - 20520227
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  || ||||||||    
T  20520121 tataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatt 20520219  T
Q  207 gttatatc 214  Q
    ||||||||    
T  20520220 gttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23791463 - 23791334
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||||||  |||||| || || | ||||||  ||||||||||| |||    
T  23791463 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattttta 23791364  T
Q  211 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  23791363 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 23791334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Original strand, 41531095 - 41531151
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgctact 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  41531095 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttact 41531151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1283404 - 1283353
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1283404 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1283353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 12901603 - 12901654
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12901603 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12901654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 24628570 - 24628621
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  24628570 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 24628621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 27379524 - 27379575
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27379524 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27379575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 27383570 - 27383621
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27383570 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27383621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27601811 - 27601760
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  27601811 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27601760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 30345082 - 30345133
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  30345082 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 30345133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24649372 - 24649330
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24649372 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 24649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 199
Target Start/End: Original strand, 24834804 - 24834882
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  24834804 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaaattgttattgtttatcatt 24834882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 10101736 - 10101787
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  10101736 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatg 10101787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Original strand, 24697534 - 24697641
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || ||| |||| || |||| || || | |||| |  |||||||||||    
T  24697534 tataatatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatatt 24697633  T
Q  207 gttatatc 214  Q
    ||||||||    
T  24697634 gttatatc 24697641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25109077 - 25108974
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || |  | |||||| |  |||||||||||||    
T  25109077 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgtta 25108978  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  25108977 tatc 25108974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 34858991 - 34859046
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  34858991 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttg 34859046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 2524334 - 2524380
Alignment:
Q  18 atttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 64  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2524334 atttaagagtatttaacctatgttgtgagttgacctttagggtagga 2524380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 239
Target Start/End: Original strand, 22459579 - 22459623
Alignment:
Q  195 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22459579 tcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttgcctatg 22459623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Original strand, 24642807 - 24642855
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24642807 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21915068 - 21915025
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  21915068 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 34492098 - 34492141
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  34492098 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 157
Target Start/End: Original strand, 22413064 - 22413114
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22413064 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 22413114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23207466 - 23207420
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23207466 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 23207420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Original strand, 20590930 - 20590971
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20590930 taagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtag 20590971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 170
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529564
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 170  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatata 24529564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26903483 - 26903427
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  26903483 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgtt 26903427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18213012 - 18212792
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18213012 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 18212913  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212912 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 18212813  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18212812 gatgtttatgtgctgcctatg 18212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 24047140 - 24047360
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047140 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 24047239  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24047240 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttaa 24047339  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24047340 gatgtttatgtgctgcctatg 24047360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32307052
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatagtaatgt 32306953  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32306954 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 32307052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 14852742 - 14852933
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14852742 agttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatt 14852841  T
Q  145 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14852842 tgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 14852933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 238
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050534
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatagtaatgtgatata 26050439  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26050440 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctat 26050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Original strand, 13591793 - 13591987
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  13591793 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatatagt 13591892  T
Q  145 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13591893 tgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcctatg 13591987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10056918 - 10056698
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  10056918 tttaagagtatttaacatatgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 10056819  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10056818 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 10056719  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  10056718 gatgtttacgtgctgcctatg 10056698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40907333 - 40907134
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||  | |||  ||||| |||||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||     
T  40907333 atgttatgagttgatccttgtgctaggaatgaaagtttattataatactgttgatgttcgatgagtctgatataagatgttttgatgttgttaatgatgt 40907234  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40907233 gaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcct 40907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 51463673 - 51463867
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||| || | |||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  51463673 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatt 51463772  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  51463773 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 17048066 - 17048195
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17048066 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 17048165  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17048166 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 17048195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 630509 - 630693
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  630509 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 630608  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgat 203  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  630609 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgat 630693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16043203 - 16043087
Alignment:
Q  108 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattg 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16043203 ataagatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 16043104  T
Q  208 ttatatcttgagatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||    
T  16043103 ttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 15041893 - 15042023
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  15041893 aatatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15041992  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15041993 tatatcttaagatgtttatgtgctgcatatg 15042023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15112531 - 15112401
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  15112531 aatatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattga 15112432  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15112431 tatatcttaagatgtttatgtgctgcatatg 15112401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15792030 - 15791857
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15792030 tgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgtgatat 15791932  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatct 215  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15791931 agttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 23803070 - 23803264
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  23803070 tttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 23803169  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  23803170 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgattttatgttgttatat 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40906983
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttg 40906996  T
Q  218 agatgtttatgtg 230  Q
    |||||||||||||    
T  40906995 agatgtttatgtg 40906983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333352
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  |||||||  ||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgttagtaatgt 17333443  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa--gttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17333442 aatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12611297 - 12611106
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||| || |  ||||| |   |||  |   ||||||||||||    
T  12611297 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctattataatatgatt 12611198  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  12611197 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26789594 - 26789441
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||| ||||||  || ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26789594 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgttgttaataatgtgatat 26789496  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggatt-atataagatgtttaagttgatattgattat 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26789495 atttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattat 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825528
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 14825631  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta-tgtgctgc 234  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  14825630 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct--agatttttattgtgctgc 14825533  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  14825532 ctatg 14825528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 4831475 - 4831589
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4831475 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 4831573  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  4831574 gagatgtctatgtgct 4831589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Original strand, 4834770 - 4834884
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4834770 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 4834868  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  4834869 gagatgtctatgtgct 4834884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045353
Alignment:
Q  152 gcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctat 26045353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14047820 - 14047706
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047820 ttgatattgttaatgatgtggtatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 14047722  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14047721 gagatgtctatgtgct 14047706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746644
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatg 14746644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30146567 - 30146455
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30146567 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 30146469  T
Q  217 gagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||| ||||||    
T  30146468 gagatgtctatgtg 30146455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185039
Alignment:
Q  166 atataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatg 14185039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Original strand, 52243122 - 52243230
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || | |||| | |||||||||||    
T  52243122 tataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatat 52243221  T
Q  206 tgttatatc 214  Q
    |||||||||    
T  52243222 tgttatatc 52243230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 46640388 - 46640490
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||| || || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  46640388 atatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgtta 46640486  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  46640487 tatc 46640490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 53082084 - 53082186
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  53082084 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 53082182  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  53082183 tatc 53082186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 4561425 - 4561476
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4561425 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4561476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 5757029 - 5757080
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  5757029 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 5757080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9556545 - 9556494
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  9556545 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 9556494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10712871 - 10712820
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  10712871 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 10712820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10926641 - 10926590
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  10926641 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 10926590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12487726 - 12487675
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12487726 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 12487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 14757513 - 14757564
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  14757513 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 14757564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 14954258 - 14954309
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  14954258 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 14954309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25689885 - 25689834
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25689885 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 25689834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27534041 - 27533990
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  27534041 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 27533990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33742393 - 33742351
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33742393 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 33742351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 15497045 - 15497096
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15497045 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 15497096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17810287 - 17810236
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  17810287 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatg 17810236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19738425 - 19738310
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgaga 220  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||   || |  ||||||| |  |||||    
T  19738425 atgttgatagtaatgttatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgaga 19738326  T
Q  221 tgtttatgtgctgcct 236  Q
    ||||||||||||||||    
T  19738325 tgtttatgtgctgcct 19738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27996090 - 27996016
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattat 195  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  27996090 atgttgttagtaatgtgatacaattatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttat 27996016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 49547748 - 49547796
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  49547748 ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagattgtttgtgtgctgcc 49547796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10704944 - 10704913
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10704944 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 10704913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10918714 - 10918683
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10918714 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 10918683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15365248 - 15365185
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  15365248 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgaattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 15365185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 16277935 - 16277978
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16277935 taagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28385689 - 28385646
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  28385689 tttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 53387545 - 53387588
Alignment:
Q  21 taagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtagga 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  53387545 taagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 56115442 - 56115481
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggg 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  56115442 tttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttggg 56115481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 15884021 - 15884062
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggt 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  15884021 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28385564 - 28385480
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  28385564 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 28385480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14048765 - 14048717
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tgtttatgtgctgcc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14048765 ttgattaccatttgatgttgttatatcttgagattgtttgtgtgctgcc 14048717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36038058 - 36038010
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tgtttatgtgctgcc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36038058 ttgattaccatttgatgttgttatatcttgagattgtttgtgtgctgcc 36038010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4477104 - 4476884
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4477104 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttgatgttgagtgagtcagttataatataatt 4477005  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477004 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 4476905  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4476904 gatgtttatgtgctgcctatg 4476884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23838444 - 23838234
Alignment:
Q  29 tttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838444 tttaacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggaggttgattatagtactgttgaggttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtt 23838345  T
Q  129 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838344 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatg 23838245  T
Q  229 tgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||    
T  23838244 tgctgcctatg 23838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453242
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttagtaatgt 18453345  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18453344 gatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 18453245  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  18453244 atg 18453242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20136931 - 20136730
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |  |||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  20136931 atgttatgagttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgt 20136832  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20136831 gatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 20136733  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  20136732 atg 20136730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 22195938 - 22196139
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |  |||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  22195938 atgttatgagttgatccttagggtaggaatgaaggttggttataatactgctattgttcagagagtctgatacaagatgatttgatgttgttagttatgt 22196037  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22196038 gatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 22196136  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  22196137 atg 22196139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 15817364 - 15817582
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||  || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  15817364 tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgatt 15817461  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15817462 tgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttga 15817561  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  15817562 gatgtttacgtgctgcatatg 15817582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 14979228 - 14979448
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||  ||||  | |  ||| | |  ||||  | | ||||||||||||    
T  14979228 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtgaagctgttataatatgatt 14979327  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  14979328 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaa 14979427  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  14979428 gatgtttaagtgatgcctatg 14979448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 25619563 - 25619770
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||  | |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||    
T  25619563 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgatgttgttataatatgatt 25619662  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  25619663 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaa 25619762  T
Q  219 gatgttta 226  Q
    ||||||||    
T  25619763 gatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 19773474 - 19773603
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19773474 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgtt 19773573  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19773574 atatcttgagatgtttacgtgctgcatatg 19773603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 28103831 - 28103959
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28103831 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtta 28103930  T
Q  211 tatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28103931 taccttgagatgtttacgtgctgcctatg 28103959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Original strand, 18177531 - 18177734
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18177531 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgt 18177629  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgc 234  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |    
T  18177630 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttc 18177729  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  18177730 ctatg 18177734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Original strand, 18199275 - 18199478
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18199275 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataa-atgatttgatgttgttaataatgt 18199373  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgc 234  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |    
T  18199374 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttc 18199473  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  18199474 ctatg 18199478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23415076 - 23414944
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23415076 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 23414977  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23414976 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23414944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443122
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||| || | |||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 33443208  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 225  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33443207 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttg---ttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22805992
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttgattatcatttgatattgtt 22806022  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22806021 atatcttgtgatgtttacgtgctgcctatg 22805992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 15705375 - 15705491
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15705375 aatatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 15705474  T
Q  210 atatcttgagatgttta 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  15705475 atatcttgagatgttta 15705491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16493409 - 16493206
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataat-atgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||   | ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  16493409 atgttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttaatgtccagtgagtttaaaatatttatgaattgaggttgttagtaatg 16493310  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 234  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16493309 tgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgc 16493211  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  16493210 ctatg 16493206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18204340 - 18204137
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| | |||||| ||||  ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  18204340 tgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaa-atgatttgatgttgttaataatgt 18204242  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgc 234  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |    
T  18204241 gatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttc 18204142  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  18204141 ctatg 18204137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 20556702 - 20556893
Alignment:
Q  22 aagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||  |||| || |  ||||| |  | ||  |   ||||||||||||| |    
T  20556702 aagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgagaagctattataatatgatttaa 20556801  T
Q  122 tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  20556802 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23539160 - 23539032
Alignment:
Q  108 ataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattg 207  Q
    |||| ||||||| |||||  || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  23539160 ataagatgatttaatgttaataataaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttaattatcatttgatattg 23539061  T
Q  208 ttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23539060 ttatatcttgagatgtatatgtgctgcct 23539032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224018
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || || |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 20224106  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 224  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  20224105 aatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118002
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || || |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 22118090  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 224  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  22118089 aatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25755166 - 25754972
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||| || |  ||||| |   |||  |   ||||||||||||    
T  25755166 tttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctttgaagctattataatatgatt 25755067  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  25755066 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27556834 - 27556702
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  27556834 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgatcatcatttgatgtt 27556735  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  27556734 gttatatattgagatgtttacgtgtcgcctatg 27556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896354
Alignment:
Q  115 gatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatc 18896350  T
Q  215 ttga 218  Q
    ||||    
T  18896351 ttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182854
Alignment:
Q  128 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 227  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 20182865  T
Q  228 gtgctgcctat 238  Q
    |||||||||||    
T  20182864 gtgctgcctat 20182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153137
Alignment:
Q  128 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 227  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 22153126  T
Q  228 gtgctgcctat 238  Q
    |||||||||||    
T  22153127 gtgctgcctat 22153137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23076918 - 23076791
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||    
T  23076918 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattata 23076819  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  23076818 tctggatatgttttatgtactgcctatg 23076791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 224
Target Start/End: Original strand, 23527970 - 23528150
Alignment:
Q  42 gtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||| || | || ||| | || |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  23527970 gtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatgttactgttgttgctcagagagcctgaaataagatgatttgatgttgatagtaatgtgatgt 23528069  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 224  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  23528070 agttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcgtcctttg--attgttacatcttgagatgtt 23528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25738641 - 25738448
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||  ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |  |      
T  25738641 atgttatgagttgatccttgggttaggaatgaagatttattaaaatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatgatt-gatgttgttaatgctat 25738543  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25738542 ggtatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttgag-ttgattattaattgatattgtcatatcttgagatgtctatgtgct 25738448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35008336 - 35008209
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||    
T  35008336 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattata 35008237  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  35008236 tctggatatgttttatgtactgcctatg 35008209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362507
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttata 19362513  T
Q  213 tcttga 218  Q
    ||||||    
T  19362512 tcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538884
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttata 23538897  T
Q  213 tcttgagatgttt 225  Q
    || |||| |||||    
T  23538896 tcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 29416845 - 29416956
Alignment:
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    ||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29416845 tgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttaattatcatttgatattgttatatcttg 29416943  T
Q  218 agatgtttatgtg 230  Q
    |||||| ||||||    
T  29416944 agatgtctatgtg 29416956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25752996 - 25752838
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||| || |  ||||| |   |||  |   ||||||||||||    
T  25752996 tttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctattataatatgatt 25752897  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtt 177  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25752896 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18706497 - 18706391
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||||| || |||||||| |  |||||||||    
T  18706497 tataatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatt-tgctttgatatt 18706399  T
Q  207 gttatatc 214  Q
    ||||||||    
T  18706398 gttatatc 18706391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17105993 - 17105849
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||| |||||||| |||| ||| |  | || |||| |||| |||||||||||| ||| | |    
T  17105993 tgttgtgagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttgttcagtaaccctgacataaaatgaattgatgttgttaataacgtg 17105894  T
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagt 182  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  17105893 atatagttgtatatgaattatgtgaattatgtatgatgttaaagt 17105849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696573
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttgttaataatgt 18696650  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatc 214  Q
    ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||  || || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  18696649 gatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 18696573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11566877 - 11566826
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11566877 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11566826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14472286 - 14472235
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  14472286 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 14472235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16760310 - 16760259
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  16760310 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 16760259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 90
Target Start/End: Original strand, 17229780 - 17229827
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttga 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17229780 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 17229827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 18917357 - 18917408
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  18917357 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 18917408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 18955854 - 18955905
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18955854 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18955905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19870605 - 19870554
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19870605 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19870554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 20734052 - 20734099
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaat 66  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20734052 tttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaat 20734099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22862961 - 22862910
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22862961 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22862910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22949123 - 22949072
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  22949123 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 22949072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22953079 - 22953028
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  22953079 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 22953028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23395083 - 23395032
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  23395083 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 23395032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23871567 - 23871516
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23871567 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23871516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23875523 - 23875472
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23875523 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23875472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23989935 - 23989884
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  23989935 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 23989884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27851449 - 27851394
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  27851449 tttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8243876 - 8243834
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8243876 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 8243834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 230
Target Start/End: Original strand, 12618935 - 12618977
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12618935 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtg 12618977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 14594210 - 14594291
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  14594210 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 14594291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Original strand, 31477901 - 31477939
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31477901 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 31477939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15896114 - 15896045
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg 190  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||    
T  15896114 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaaaatgtaagatgttcaagttgttattg 15896045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1644723 - 1644672
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  1644723 ttgattatcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgtcgcctatg 1644672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7429990 - 7429909
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  7429990 atgcattatgtgaattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 7429909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 103
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078099
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtc 103  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactatcgatgttcagtgagtc 20078099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 16133276 - 16133357
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |  |  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  16133276 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttatgtgtgaaggtttattataatactgttgatgttcagtga 16133357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Original strand, 19443886 - 19443967
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |  |  |||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  19443886 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttatgcgtgaaggtttattataatactgttgatgttcagtga 19443967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 611186 - 611155
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611186 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 611155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15875494 - 15875443
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15875494 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatg 15875443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18658652 - 18658621
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658652 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18658621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 184
Target Start/End: Original strand, 19656075 - 19656138
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  19656075 atgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttg 19656138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 29848111 - 29848165
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  29848111 tttaagagtatttaatccatgttgtgagttga-tcttgggataggaatagaagttg 29848165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23956183 - 23956099
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  23956183 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 23956099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227489
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 8227489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatat 169  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 9562 - 9781
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9562 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 9661  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 9760  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  9761 gatgtctatgtgctgcctatg 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28312794 - 28312574
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28312794 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagccagatataatatgatt 28312695  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312694 tgatgtttttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 28312595  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  28312594 gatgtttatgtgctgtctatg 28312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 20437833 - 20438054
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20437833 tttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 20437932  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20437933 tgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttg 20438032  T
Q  218 agatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  20438033 aggtgtttatgtgctgcctatg 20438054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 21043146 - 21043342
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21043146 tgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 21043245  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21043246 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 21043342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22124541 - 22124345
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22124541 tgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 22124442  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22124441 gttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22124345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20958369 - 20958168
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 137  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||  |||||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20958369 tgttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttagtaatgtg 20958270  T
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20958269 atatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgtttatgtgctgccta 20958170  T
Q  238 tg 239  Q
    ||    
T  20958169 tg 20958168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14800781 - 14800589
Alignment:
Q  52 ccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtta-gtaatgagatatat----ttg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    |||    
T  14800781 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14800682  T
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14800681 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatg 14800589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14809655 - 14809463
Alignment:
Q  52 ccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgtta-gtaatgagatatat----ttg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    |||    
T  14809655 ccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttaagtaacgtgatatatatagttg 14809556  T
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14809555 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatg 14809463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940937
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || |  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgt 52940835  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52940836 gatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatg-ttatgtgctgcct 52940934  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  52940935 atg 52940937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 13881222 - 13881442
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||  | |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  13881222 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 13881321  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  13881322 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaa 13881421  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  13881422 gatgtttatgtgatgcctatg 13881442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653283
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  | ||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 27653180  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27653181 attatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcct 27653280  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  27653281 atg 27653283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48603641 - 48603512
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48603641 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 48603542  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48603541 agatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 48603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47190855 - 47190684
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47190855 agttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttagtaatgtgatatag 47190757  T
Q  144 ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatc-atttgatattgttatatct 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  47190756 ttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatttcctctttgatattgttatatct 47190684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372057
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 16372057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 2332816 - 2333025
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  || |  |||||  ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  2332816 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttttgagtgaaggtttattataatactgtcgatgttcagtgagtctgatataagataatt 2332915  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
     |||||||||| | | | | || ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332916 -gatgttgttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttg 2333013  T
Q  218 agatgtttatgt 229  Q
    |||||| |||||    
T  2333014 agatgtctatgt 2333025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 45574647 - 45574841
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  45574647 tttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 45574746  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  45574747 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttcttatat 45574841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 635914 - 636043
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  635914 aatatgatttgatgttgttagcaatgtgat-tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgt 636012  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  636013 tatatcttgaaatatttatgtgctgcctatg 636043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 41781522 - 41781649
Alignment:
Q  111 atatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||    
T  41781522 atatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggt--tgttgattatcatttgatgttgtt 41781619  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41781620 atatcttgaaatgtttatgtgctgcctatg 41781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 22130671 - 22130854
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  22130671 tttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctactataatatgatt 22130770  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgat 203  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  22130771 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgat-gtgattatgatttgat 22130854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 21533808 - 21533933
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21533808 atgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttata 21533906  T
Q  213 tcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    || | ||| |||||||| |||| ||||    
T  21533907 tcctaagaagtttatgtactgcgtatg 21533933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32649892 - 32649778
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649892 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 32649794  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  32649793 gagatgtctatgtgct 32649778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48520699 - 48520571
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||| |||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  48520699 atatgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgtt 48520600  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  48520599 atatc-tgagatgttcatgttctacctatg 48520571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29534729 - 29534615
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||  | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29534729 ttgatgttgttaatgatgtggtatattttcaaatgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatatcgttatatctt 29534631  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  29534630 gagatgtctatgtgct 29534615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381239
Alignment:
Q  138 atatatttgtatatgcatt-atgtggattatataagatgtttaa--gttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgatg 16381247  T
Q  234 cctatgct 241  Q
     |||||||    
T  16381246 tctatgct 16381239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 50614048 - 50614177
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  50614048 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 50614147  T
Q  211 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  50614148 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 50614177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 50621876 - 50622005
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  50621876 atatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 50621975  T
Q  211 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  50621976 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 50622005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 41049968 - 41050070
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| || || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  41049968 atatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 41050066  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  41050067 tatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 20031496 - 20031707
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | |  |||||||||| |||||||| |||| || |||  |    
T  20031496 tttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaattaaggtttattaaaatgttgttgatgttcagtgagtctgataaaagatg-gt 20031594  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||| ||||||| |  |    || ||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| |||| |||     
T  20031595 tgaggttgttaatcttatagtaaatttgcaaatgccttatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttgg 20031693  T
Q  219 gatgtttatgtgct 232  Q
    ||||| | ||||||    
T  20031694 gatgtctgtgtgct 20031707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1010738 - 1010687
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  1010738 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 1010687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 1925220 - 1925271
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  1925220 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1925271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12271657 - 12271614
Alignment:
Q  196 catttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12271657 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 12271614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 20228900 - 20228951
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  20228900 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 20228951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 20924234 - 20924285
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20924234 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20924285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21407370 - 21407319
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21407370 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21407319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 23819389 - 23819440
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  23819389 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23819440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945571
Alignment:
Q  129 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttg 11945571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329122
Alignment:
Q  128 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgat 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgat 20329122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43543239 - 43543188
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43543239 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 43543188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50686801 - 50686698
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||| |||||||    
T  50686801 atatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgtta 50686702  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  50686701 tatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51326903 - 51326852
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51326903 ttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatg 51326852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 52639556 - 52639505
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  52639556 ttgattatcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 52639505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Original strand, 20454548 - 20454614
Alignment:
Q  174 tgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  20454548 tgttgaagttgatgttgattgtcatttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatg 20454614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 16375549 - 16375601
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttga-tattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  16375549 ttgattatcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 16375601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 294482 - 294443
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggg 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  294482 tttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttggg 294443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16758843 - 16758780
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 170  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  16758843 tataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 21180931 - 21180962
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180931 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 21180962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 24815458 - 24815489
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815458 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24815489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 29764244 - 29764287
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  29764244 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 157
Target Start/End: Original strand, 16368219 - 16368265
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16368219 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 16368265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 157
Target Start/End: Original strand, 35261009 - 35261059
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  35261009 tataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcatta 35261059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 48520822 - 48520773
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgtt 94  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  48520822 agttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgctgatgtt 48520773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 133196 - 132976
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133196 tttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 133097  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133096 tgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttga 132997  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  132996 aatgtttatgtgctgcatatg 132976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 133770 - 133892
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133770 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 133869  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  133870 tgatgttgttagtaatgagatat 133892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29285
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||         || ||||||||||||||||||||||    
T  29390 aatatgatttactgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagtatttaagatg---------atgttgattatcatttgatattgtt 29300  T
Q  210 atatcttgagatgtt 224  Q
    ||||||||| |||||    
T  29299 atatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18228
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatattgttagtaatgt 18125  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18126 gatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcct 18225  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  18226 atg 18228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 2333 - 2493
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 2432  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2433 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221267
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttagtaatgtgatata 221171  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  221172 gttgtatatgcattatgtggattatataaga-ctttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 221267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 189468 - 189519
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  189468 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 189519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225492
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttat 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || | ||||||  ||||||||||| ||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt-gcatttgatattattat 225495  T
Q  212 atc 214  Q
    |||    
T  225494 atc 225492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 27941495 - 27941655
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27941495 tttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 27941594  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27941595 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253226
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttagtaatgt 22253123  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22253124 gataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtgctacct 22253223  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  22253224 atg 22253226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 17086012 - 17086213
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17086012 atgttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatagtaatgt 17086111  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17086112 gatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 17086211  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  17086212 at 17086213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 20501966 - 20502162
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  20501966 tgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttagtaatatgacata 20502065  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20502066 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatg 20502162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23667872
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgt 23667972  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatatt-gattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23667971 gatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatggttatgtgctgcc 23667872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37515959 - 37515765
Alignment:
Q  45 agttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | |||||   |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  37515959 agttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttagtaatgtgatataat 37515860  T
Q  145 tgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37515859 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcctatg 37515765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 19808203 - 19808423
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  19808203 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatt 19808302  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19808303 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 19808402  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||||| |||||    
T  19808403 gatgtttacgtgctgtctatg 19808423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 17460893 - 17461113
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||    
T  17460893 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatt 17460992  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  17460993 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcta 17461092  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  17461093 gatgtttatgtgtttcctatg 17461113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 22237860 - 22238067
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  22237860 tttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 22237959  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22237960 taatgttgatagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 22238059  T
Q  219 gatgttta 226  Q
    ||||||||    
T  22238060 gatgttta 22238067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 5083085 - 5083215
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  5083085 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgt 5083184  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5083185 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 5083215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 17438148 - 17438278
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  17438148 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 17438247  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17438248 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 17438278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22996100 - 22995903
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatata-atatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| | |||| | |||||||||||||   | ||||| |||||    
T  22996100 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaataatgtgatat 22996001  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||    
T  22996000 agttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctgaatatgttattgtgctgcctatg 22995903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23659599 - 23659467
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23659599 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtt 23659500  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  23659499 gttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatg 23659467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18833751 - 18833622
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  18833751 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgt 18833652  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18833651 tatatc-tgagatgtttatgtgctgcctatg 18833622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 25484080 - 25484274
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   ||||||||||||    
T  25484080 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatt 25484179  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  25484180 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttattatat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 25363134 - 25363250
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25363134 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 25363233  T
Q  210 atatcttgagatgttta 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  25363234 atatcttgagatgttta 25363250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 22963278 - 22963474
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||| |  |||||     ||||||  |||||||||||| ||||||     
T  22963278 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaagttgattatagtactgctaatgttcatagagtc-----taatat--tttgatgttgttggtaatgt 22963370  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattga-ttatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22963371 gatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcc 22963470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 14397791 - 14397923
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  14397791 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttgattatcaattgatatt 14397890  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  14397891 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 14397923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 23943922 - 23944054
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  23943922 tataatatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatatt 23944021  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  23944022 attatatctggatatgttaatgtgctgcatatg 23944054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16799732 - 16799561
Alignment:
Q  54 ttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 153  Q
    |||||||| |||| |||| || ||||| || |  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16799732 ttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgc 16799633  T
Q  154 attatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtt 224  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16799632 attatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28397805 - 28397635
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttga-tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28397805 tgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaataatgtgatat 28397707  T
Q  142 atttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  28397706 a-ttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409855
Alignment:
Q  164 ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 23409855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 19154814 - 19154932
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  19154814 tataatatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatatt 19154913  T
Q  207 gttatatcttgagatgttt 225  Q
     |||||||| || ||||||    
T  19154914 attatatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 17439370 - 17439567
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||| |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  17439370 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatata 17439469  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  17439470 tttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 17439567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 225
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533455
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||  | |  |||||||  ||||  | | |||||| ||||||  ||||| ||||||||     
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttgatagtaatgt 20533366  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 225  Q
     ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  20533367 aatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatcatcacttgatattattatatctggatatgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 14103152 - 14103275
Alignment:
Q  107 tataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14103152 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 14103251  T
Q  206 tgttatatcttgagatgtttatgt 229  Q
    ||||||||||| || |||| ||||    
T  14103252 tgttatatcttaagttgttaatgt 14103275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37116535 - 37116408
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  37116535 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 37116436  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  37116435 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 37116408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914097
Alignment:
Q  154 attatgtggatta-tataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 23914097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026903
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |   ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgatattgttata 35026894  T
Q  213 tcttgagat 221  Q
    |||||||||    
T  35026895 tcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 213
Target Start/End: Original strand, 2418737 - 2418906
Alignment:
Q  41 tgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 140  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  || |||| ||||| |||||||| |||| |||  | | ||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2418737 tgtgagttgatccttgggttaggaaatgaagttgtttatattactgttgttgttcagtatgcctgac-taagatgatttgatgttgttaacaatgtgata 2418835  T
Q  141 tatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2418836 tgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttca--agatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21329243 - 21329095
Alignment:
Q  82 tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||| || |  | || ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21329243 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gaggttgttaatattatggtaaatttgcaaatgcattatgtggataatgtatgatgtttaag 21329145  T
Q  182 ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    | | | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21329144 tag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 21329095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 17266925 - 17267028
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||   | |||||||| ||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  17266925 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 17267024  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  17267025 tatc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 184
Target Start/End: Original strand, 21346164 - 21346239
Alignment:
Q  110 aatatgatttgat-gttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21346164 aatatgatttgattgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525659
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||| ||||||     
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgttgttggtaatgt 22525679  T
Q  137 gatatatttgtatatgcatt 156  Q
     |||||||||||||||||||    
T  22525678 catatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 41680740 - 41680795
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttg 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41680740 tttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  155 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 16401983 - 16402063
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttga------tattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16401983 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16402063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 221
Target Start/End: Original strand, 22419349 - 22419455
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |   ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  22419349 atgatttaatgttgtcaataatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgaaattgttata 22419446  T
Q  213 tcttgagat 221  Q
    |||||||||    
T  22419447 tcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34950694 - 34950611
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 234  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  34950694 atgcattatgtggattaagtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgttatattttgggatgtctatgtgctgc 34950611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 13665189 - 13665304
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgaga 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||   ||||  ||||||| |  ||||     
T  13665189 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattgacgttgttatgttatgagt 13665288  T
Q  221 tgtttatgtgctgcct 236  Q
    ||||||||||||||||    
T  13665289 tgtttatgtgctgcct 13665304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 13724464 - 13724579
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgaga 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||   ||||  ||||||| |  ||||     
T  13724464 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgcggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattgacgttgttatgttatgagt 13724563  T
Q  221 tgtttatgtgctgcct 236  Q
    ||||||||||||||||    
T  13724564 tgtttatgtgctgcct 13724579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 18862736 - 18862787
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18862736 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18862787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 19278374 - 19278425
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  19278374 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19278425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21410965 - 21410914
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21410965 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21410914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21805457 - 21805406
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21805457 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21805406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 21828105 - 21828156
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  21828105 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21828156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Original strand, 21967476 - 21967621
Alignment:
Q  85 tgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||| ||||| || |  | || ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21967476 tgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gatgatgttaatattatggtaaattcgtcaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag 21967574  T
Q  185 atattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
     | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  21967575 -tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 21967621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 21972676 - 21972727
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21972676 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 21976761 - 21976812
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21976761 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21976812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22364850 - 22364748
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||||||||||    
T  22364850 atatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgtta 22364752  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  22364751 tatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43251828 - 43251777
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  43251828 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 43251777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Original strand, 19936956 - 19937004
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19936956 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 21980265 - 21980346
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  21980265 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatcttttgggatgtctatgtgct 21980346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 21985248 - 21985329
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  21985248 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatcttttgggatgtctatgtgct 21985329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Original strand, 22000284 - 22000365
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  22000284 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatcttttgggatgtctatgtgct 22000365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 1327017 - 1327066
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 237  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1327017 ttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgccta 1327066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Original strand, 11251625 - 11251705
Alignment:
Q  151 tgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| | | | |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  11251625 tgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgtcgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 11251705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24353209 - 24353081
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||  || ||| |||| ||||||| || || | ||||||  || ||||||||||||    
T  24353209 atatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgtta 24353111  T
Q  211 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  24353110 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 24353081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 15635786 - 15635817
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635786 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 15635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024504
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 186  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgat 18024504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20454685 - 20454654
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454685 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 20454654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20455442 - 20455411
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455442 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 20455411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20460420 - 20460389
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460420 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 20460389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16198020 - 16197943
Alignment:
Q  154 attatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| || |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16198020 attatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactagcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 16197943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Original strand, 22005262 - 22005319
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  22005262 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgt 22005319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22525662 - 22525620
Alignment:
Q  196 catttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgccta 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22525662 catttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgccta 22525620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 25658189 - 25658266
Alignment:
Q  154 attatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  25658189 attatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttgagatatctatgtgct 25658266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11775043 - 11774959
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  11775043 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 11774959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508063
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 13508063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597595
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 13597595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17564
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttggtaatgt 17665  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17664 gatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcct 17565  T
Q  237 a 237  Q
    |    
T  17564 a 17564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 20139 - 20271
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  20139 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttgattagcatttgatatt 20238  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20239 gttaaatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55742
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttagtaatgt 55642  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55643 gatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 55742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2107 - 1954
Alignment:
Q  86 gttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttga 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107 gttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttga 2008  T
Q  186 tattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2007 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36240
Alignment:
Q  59 gtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattat 158  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattat 36321  T
Q  159 gtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 gtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 36240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10145
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgt 10042  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
     |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10043 aatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 10142  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  10143 atg 10145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 707
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  902 tgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttagtaatgtgatata 804  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  803 gttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 170
Target Start/End: Original strand, 60643 - 60706
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatata 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  60643 tataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Original strand, 625 - 821
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||| ||| || | |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  625 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatata 724  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  725 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgtttatatgctgcctatg 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4071 - 3927
Alignment:
Q  96 agtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgatta 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4071 agtgagtcatatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgatta 3972  T
Q  195 tcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3971 tcatttggtaatgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29481
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttagtaatgt 29381  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29382 gatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagtttatgtgctgcc 29481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 75687 - 75887
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | || || |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  75687 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataatactgttgttatttagagagtctaatacaagatgatttgatgttgttagtaatgt 75786  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75787 gataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 75886  T
Q  237 a 237  Q
    |    
T  75887 a 75887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 1715 - 1932
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||    | ||||||||||||    
T  1715 tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaaatgttataatatgatt 1814  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1815 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttga 1914  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1915 gatgtttacgtgctgcct 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 219
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||    
T  439 tttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatt 340  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 240  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  239 tatgtttacgtgttgcctatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 105358 - 105140
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||  || |  ||||| |   |||  | | ||||||||||||    
T  105358 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatatgatt 105261  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  105260 tgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttga 105161  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  105160 gatgtttacgtgctgcctatg 105140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 142771 - 142641
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  142771 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 142672  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142671 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 142641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 169678 - 169810
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| || ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  169678 tataatatgatttaatatttataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtt 169777  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  169778 gttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 169810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 477
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  609 tataatataatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttaattatcatttgatatt 510  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  509 gttatatcttgagatgtttacgtgctccctatg 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3146 - 3016
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  3146 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 3047  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3046 tatatcttgagatgtttatgtgctacctatg 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 6091 - 6220
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  6091 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtt 6190  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21355 - 21226
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21355 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 21256  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 21226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 126144 - 126015
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  126144 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 126045  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  126044 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 126015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 998
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  1128 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattct 1029  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1028 tatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 233
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19701
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||     
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataataatgt 19604  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataaga-tgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19605 gatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttgattattgtttgacattgttatat-ttgagatgtttctgtgctg 19701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15299
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 15299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20939 - 20810
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20939 aatatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 20840  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20839 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 24526 - 24658
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24526 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtt 24625  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  24626 gttatatcttgaaatgtttaagtgttgcctatg 24658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11209
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatag-tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| || ||||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  11407 atgttatgagctgatccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatg 11309  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11308 tgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcc 11210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22507 - 22309
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatag-tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatg 135  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| || ||||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  22507 atgttatgagctgatccttggggtaggaatgaaggttggttataaatactgttgttgttcagagagtctgaaataagaagatta-atgttattagtaatg 22409  T
Q  136 agatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22408 tgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcc 22310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7619 - 7491
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  7619 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 7520  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7519 tatatctt--gatgtttatgtgctgcctatg 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14738 - 14610
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  14738 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgt 14639  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14638 tatatctt--gatgtttatgtgctgcctatg 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 2602 - 2732
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || |     
T  2602 aatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatgga 2701  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2702 tatatcttgagatgtttatgtgctgactatg 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Original strand, 7991 - 8100
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||  || |||||||| | ||||||||| || | |||| | |||||||||||| ||    
T  7991 atatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattatt 8090  T
Q  210 atatcttgag 219  Q
    ||||| ||||    
T  8091 atatcatgag 8100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16019 - 15802
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| |  ||||  | | ||||| ||        
T  16019 tttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagctgttataacata--- 15923  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15922 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 15823  T
Q  219 gatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||| | ||||||    
T  15822 gatgtttacgtgttacctatg 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 462 - 269
Alignment:
Q  20 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgattt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   |||||||||||||    
T  462 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagcttttataatatgattt 363  T
Q  120 gatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
     |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  362 aatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttgattatgatttgatgttgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10223
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatgattattatttgatattgttacatcttg 10245  T
Q  218 agatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  10244 agatgtttatgtgctgcttatg 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 912
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1041 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 942  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  941 atatcttgagatgtttatgtgctgtctatg 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8220 - 8091
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8220 aatatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 8121  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8120 atatcttgagatgtttatgtgttgcatatg 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 86
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 137  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||| |||| ||| || | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  283 tgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgttaataatgtg 185  T
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tgtttatgtgctgcc 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  184 atataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatgtttatcatttgatattgttatatcttgagattgtttgtgtgctgcc 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 1
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgc 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  41 atgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12415 - 12221
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  |||| || |  ||||| |  |||| ||   ||||||||| ||    
T  12415 tttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaatctattataatatggtt 12316  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
    | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  12315 taatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39444 - 39312
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39444 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 39345  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  39344 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 39312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30391
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgttat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttat 30419  T
Q  212 atcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30418 gtcttgagatgtttatgtgatgcctatg 30391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 7420 - 7550
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat-attgattatcatttgatattgt 208  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  7420 aatatgattatatgctgttagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattga 7519  T
Q  209 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7520 tatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 7550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17633
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17765 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatatt 17666  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  17665 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 17633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31315 - 31183
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  31315 tataatatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatatt 31216  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  31215 gttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 31183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6800 - 6684
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6800 aatatgatttgaggttgatggtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 6701  T
Q  210 atatcttgagatgttta 226  Q
    |||||||||||||||||    
T  6700 atatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 67452 - 67321
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  67452 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtt 67353  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  67352 gttatatcttg-ggtgtttacgtgctgcttatg 67321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15125
Alignment:
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctat 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 15125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 206383 - 206585
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||   ||| |  | ||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  206383 atgttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttagtaatgt 206482  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcc 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  206483 aatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcc 206581  T
Q  236 tatg 239  Q
    ||||    
T  206582 tatg 206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3388
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||  || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttgatagtaatgt 3285  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  3286 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttgattatcatttaatgttgttatataataagatatttaagtgctgcct 3385  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  3386 atg 3388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 120197 - 120068
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 209  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  120197 aatacgatttgatgttgatgataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttgattatcatttgatattgtt 120098  T
Q  210 atatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  120097 atatcttgagatgtttacgtgttgcctatg 120068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 82432 - 82235
Alignment:
Q  20 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgattt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||  |||| || |  ||||| |  ||||  |   | |||||||||||    
T  82432 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattgtaatatgattt 82333  T
Q  120 gatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcat----tatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatat 213  Q
     |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  82332 aatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 80426 - 80477
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  80426 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 80477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1960 - 1785
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttg-agtgagtcagat-ataatatgatttgatgttgttagtaatgagata 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || | ||||  |||||  || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||    
T  1960 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttaatgctgtaaatgtttcagagagtctgattataatatagtttgatgttgttaatgatgtgata 1861  T
Q  141 tatttgtatatgcattatgtggattat-ataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860 tatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3687
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |  |||||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||| ||||||||     
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttgatagtaatgt 3758  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgt 208  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || |||||||||||    
T  3757 aatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttgatt-tcctttgatattgt 3687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10666 - 10533
Alignment:
Q  107 tataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10666 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 10567  T
Q  206 tgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10566 tgttacatctagagatgtttatgtgttgcctatg 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22338
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 22441  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta-tgtgctgc 234  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  22440 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct--agatttttattgtgctgc 22343  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  22342 ctatg 22338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14181
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||  || |  |||||||  |||| || | | |||| |||||| |||||| ||||||||     
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttgatagtaatgt 14078  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta-tgtgctgc 234  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  14079 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct--agatttttattgtgctgc 14176  T
Q  235 ctatg 239  Q
    |||||    
T  14177 ctatg 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 267849 - 267747
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||| || || |  | ||||||  |||||||||||||||    
T  267849 atatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatattgttgatttgcatttgatattgtta 267751  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  267750 tatc 267747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 123
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgat 203  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  219 tataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgat 123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 146366 - 146252
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  146366 ttgatgttgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 146268  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  146267 gagatgtctatgtgct 146252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29178 - 28967
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | | |||||||||||||||||||| |||| || |||  |    
T  29178 tttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatgctgttgatgttgagtgagtctgataaaagatg-gt 29080  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29079 tgaggttgttaatgttacggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttga 28981  T
Q  219 gatgtttatgtgct 232  Q
    ||| | ||||||||    
T  28980 gatatctatgtgct 28967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34643 - 34432
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | | |||||||||||||||||||| |||| || |||  |    
T  34643 tttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattaaaatgctgttgatgttgagtgagtctgataaaagatg-gt 34545  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||| ||||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34544 tgaggttgttaatgttacggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttga 34446  T
Q  219 gatgtttatgtgct 232  Q
    ||| | ||||||||    
T  34445 gatatctatgtgct 34432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16957
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26117
Alignment:
Q  116 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatct 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttgattgtc-cttgatattgttatatct 26114  T
Q  216 tga 218  Q
    |||    
T  26115 tga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 22375 - 22418
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22375 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48394
Alignment:
Q  118 ttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgga-ttatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatctt 216  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508 ttgatattgttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatctt 48410  T
Q  217 gagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| ||||||||    
T  48409 gagatgtctatgtgct 48394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7995 - 7894
Alignment:
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatg-tttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcct 236  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7995 atatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgttgcct 7897  T
Q  237 atg 239  Q
    |||    
T  7896 atg 7894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6098
Alignment:
Q  124 ttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tg 222  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatgtttatcatttgatattgttatatcttgatattg 6111  T
Q  223 tttatgtgctgcc 235  Q
    ||| |||||||||    
T  6110 tttgtgtgctgcc 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29851 - 29747
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatattt-gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgag 219  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29851 atgttgatagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggat 29752  T
Q  220 atgtt 224  Q
    |||||    
T  29751 atgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 589 - 712
Alignment:
Q  107 tataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  589 tataatatgattttaatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 688  T
Q  206 tgttatatcttgagatgtttatgt 229  Q
    ||||||||||| || |||| ||||    
T  689 tgttatatcttaagttgttaatgt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 4625 - 4748
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  4625 tataatatgatttaatgatgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgattatcatatgatatt 4724  T
Q  207 gttatatcttgagatgtttatgtg 230  Q
     |||||||| || ||||| |||||    
T  4725 attatatctggatatgttaatgtg 4748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 97193 - 97066
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  97193 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 97094  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  97093 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 97066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 106471 - 106344
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  106471 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 106372  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  106371 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1353
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatg 1353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6471 - 6331
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||  | |||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  6471 tttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataatactgttgatgttcggtgagtctgatat-atatgatt 6373  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtg 161  Q
    || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6372 tggtgttgttaataatgtgatata-ttgtatatgcattatgtg 6331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 793 - 623
Alignment:
Q  43 tgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatata 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  793 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatgtgatata 694  T
Q  143 tttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatc 214  Q
      |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  693 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25182
Alignment:
Q  38 tgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgag 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||  |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||| | ||||||||||||| | ||||| |    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttgtaa-taatgtg 25269  T
Q  138 atatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttt 225  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  || ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgttt 25182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57898
Alignment:
Q  116 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatct 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatct 57901  T
Q  216 tga 218  Q
    |||    
T  57900 tga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53899
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 53899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 128904 - 129031
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  128904 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttata 129003  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  129004 tcatgaattgttttatgtactgcctatg 129031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 78510 - 78464
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  78510 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 78464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 85739 - 85605
Alignment:
Q  106 atataatatgatttga-tgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 204  Q
    |||||||||||||| | ||| | || ||||| |||||| | ||||| ||||||  || |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  85739 atataatatgattttaatgtcgatattaatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttgattattatttgatg 85640  T
Q  205 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  85639 ttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 85605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2454
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatga 136  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||| || |  ||||||   ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||||||      
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaattt 2384  T
Q  137 gatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatatt 206  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||    
T  2385 aatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgtagttgattatcgcttgatatt 2454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 332507 - 332380
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattg-attatcatttgatat 205  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||| | ||| | |||||||    
T  332507 tatattatgattttatgttgaaagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaattatgtttaagttgatgttgaaatatta-ttgatat 332409  T
Q  206 tgttatatcttgagatgtttatgtgctgcc 235  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  332408 tg-tatatcttgagatgttgatgtgctgcc 332380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 152816 - 153027
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatt 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || || | |    
T  152816 tttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaatcaaggtttattaaaatactgttgatgtttagtgagtctgataaaagat-agt 152914  T
Q  119 tgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttga 218  Q
    ||| | ||||| |  |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||| |||||||||  ||||| |||| ||||    
T  152915 tgaggatgttaatgttatggtaaatttgcaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgagtatcatttggcattgtcatattttga 153013  T
Q  219 gatgtttatgtgct 232  Q
    ||||| ||||||||    
T  153014 gatgtctatgtgct 153027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Original strand, 163004 - 163152
Alignment:
Q  82 tactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || |  | || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  163004 tactgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gatgttgttaatattatggtaaatttgaaaatgcattatgtggattatgtatgatgtttaag 163102  T
Q  182 ttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    | | | | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  163103 tag-tgtagattatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 163152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 446671 - 446597
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattat 195  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  446671 atgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttat 446597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 168759 - 168675
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  168759 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 168675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 176113 - 176029
Alignment:
Q  147 tatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  176113 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 176029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 626
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6968
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgctact 244  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttact 6968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4329
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctat 238  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctat 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15070
Alignment:
Q  165 tatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4433
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  4476 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3317
Alignment:
Q  171 agatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatg 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3385
Alignment:
Q  37 atgttgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttga 90  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 3385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 239
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7002
Alignment:
Q  169 taagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatg 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6329
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||| |    
T  6215 atatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtca 6314  T
Q  211 tatcttgagatgttt 225  Q
    |||| |||| |||||    
T  6315 tatcatgagctgttt 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 65
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttata 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  192 atgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttata 93  T
Q  213 tcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    || |||  || ||||||| |||||||||    
T  92 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 58810 - 58861
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  58810 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 58861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 18170 - 18284
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||||||| |    
T  18170 atatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtca 18269  T
Q  211 tatcttgagatgttt 225  Q
    |||| |||| |||||    
T  18270 tatcatgagctgttt 18284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16136
Alignment:
Q  107 tataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataag-atgtttaagttgatattgattatcatttgatat 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| || || | ||||||  ||||||||||    
T  16028 tataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatat 16127  T
Q  206 tgttatatc 214  Q
    |||||||||    
T  16128 tgttatatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2799 - 2722
Alignment:
Q  163 attatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  2799 attatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatg 2722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 465 - 414
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  465 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 3966 - 4017
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  3966 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 184
Target Start/End: Original strand, 13430 - 13502
Alignment:
Q  110 aatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13430 aatatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 410 - 359
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  410 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 5192 - 5243
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  5192 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 5243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12437 - 12386
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12437 ttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 11592 - 11643
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11592 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 32751 - 32802
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  32751 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 32802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 36033 - 36084
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  36033 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 36084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 36177 - 36228
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  36177 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 36228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 207593 - 207644
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  207593 ttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatg 207644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38506 - 38392
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||| |  ||||||||||||| |    
T  38506 atatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtca 38407  T
Q  211 tatcttgagatgttt 225  Q
    |||| |||| |||||    
T  38406 tatcatgagctgttt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 209073 - 208992
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  209073 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 208992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14229
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  14178 ttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgtcgcctatg 14229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 239
Target Start/End: Original strand, 67397 - 67444
Alignment:
Q  192 ttatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  67397 ttatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 67444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 61703 - 61754
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  61703 ttgattatcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 61754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 80730 - 80679
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  80730 ttgattatcatttaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 80679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 65619 - 65670
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  65619 ttgattatcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgtcgcctatg 65670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Original strand, 6284 - 6330
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaa 65  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6284 tttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 1730 - 1832
Alignment:
Q  111 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 210  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||| |||| || || || | ||||||  |||||||||||||||    
T  1730 atatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 1828  T
Q  211 tatc 214  Q
    ||||    
T  1829 tatc 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Original strand, 16541 - 16613
Alignment:
Q  150 atgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 223  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  16541 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 16613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 12077 - 12213
Alignment:
Q  85 tgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||||| || |  |||| |||||   |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  12077 tgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gagggtgttaatattatgataaatttgccaatgcattacgtggattatgtatgatgtttaagtag 12175  T
Q  185 atattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 223  Q
     | |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  12176 -tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 12213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 15229 - 15365
Alignment:
Q  85 tgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttg 184  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||||| || |  |||| |||||   |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  15229 tgttgatgttcagtgagtctgatataagatggtt-gagggtgttaatattatgataaatttgccaatgcattacgtggattatgtatgatgtttaagtag 15327  T
Q  185 atattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 223  Q
     | |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  15328 -tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 15365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4433
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  4476 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 11143 - 11100
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  11143 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 3548 - 3591
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtag 62  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3548 tttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 19250 - 19281
Alignment:
Q  19 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19250 tttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 19281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 24839 - 24954
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgaga 220  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||   || |  ||||||| |  ||||     
T  24839 atgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagc 24938  T
Q  221 tgtttatgtgctgcct 236  Q
    ||||||||||||||||    
T  24939 tgtttatgtgctgcct 24954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24358 - 24280
Alignment:
Q  153 cattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  24358 cattatgtggattatgtgtgatgtttaagtag-tgttgattgtcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 24280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35228 - 35150
Alignment:
Q  153 cattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 232  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  35228 cattatgtggattatgtgtgatgtttaagtag-tgttgattgtcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 35150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8438 - 8376
Alignment:
Q  41 tgtgagttgacccttggggtaggaatagaggttggttatagtactgttgatgttgagtgagtc 103  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  8438 tgtgagttgatccgtggggtaggaatggaggttgcttataatattgtcgatgttcagtgagtc 8376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Original strand, 46788 - 46862
Alignment:
Q  121 atgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattat 195  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||||    
T  46788 atgttgttagtgatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttat 46862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11607
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 11607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3211 - 3163
Alignment:
Q  188 ttgattatcatttgatattgttatatcttgaga-tgtttatgtgctgcc 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3211 ttgattaccatttgatgttgttatatcttgagattgtttgtgtgctgcc 3163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18005
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 18005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38234
Alignment:
Q  113 atgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcatta 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcatta 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University