View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1907_low_38 (Length: 232)

Name: NF1907_low_38
Description: NF1907
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1907_low_38
NF1907_low_38
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (1-214)||(16904954-16905167)
chr4 (1-214)||(46256048-46256261)
chr4 (1-214)||(52434638-52434851)
chr4 (1-214)||(16917890-16918103)
chr4 (1-214)||(30824924-30825137)
chr4 (1-214)||(33139473-33139686)
chr4 (1-216)||(45976990-45977205)
chr4 (1-207)||(44376088-44376294)
chr4 (1-214)||(31965971-31966184)
chr4 (1-214)||(35760595-35760808)
chr4 (1-214)||(37590806-37591019)
chr4 (1-214)||(48118536-48118746)
chr4 (1-214)||(37651680-37651893)
chr4 (1-214)||(41387140-41387353)
chr4 (1-214)||(53143264-53143477)
chr4 (1-214)||(12090461-12090675)
chr4 (4-214)||(47142802-47143012)
chr4 (1-214)||(39058359-39058572)
chr4 (1-190)||(52098216-52098406)
chr4 (1-190)||(31628513-31628702)
chr4 (1-216)||(54624971-54625179)
chr4 (1-167)||(45782478-45782644)
chr4 (1-153)||(50229769-50229922)
chr4 (122-176)||(50229712-50229766)
chr4 (59-109)||(34684603-34684653)
chr4 (162-214)||(18209686-18209738)
chr4 (157-207)||(19745228-19745278)
chr4 (157-207)||(19794528-19794578)
chr4 (54-91)||(6481589-6481626)
chr4 (177-214)||(26724134-26724171)
chr4 (55-91)||(23935032-23935068)
chr4 (55-91)||(37997852-37997888)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (1-214)||(26948812-26949025)
chr3 (1-218)||(31488425-31488642)
chr3 (1-214)||(4584436-4584649)
chr3 (1-214)||(20671263-20671476)
chr3 (1-214)||(36076456-36076669)
chr3 (1-216)||(39146454-39146669)
chr3 (1-214)||(12264214-12264427)
chr3 (1-214)||(38653929-38654142)
chr3 (1-214)||(43363613-43363826)
chr3 (1-214)||(49672576-49672789)
chr3 (1-214)||(1941722-1941935)
chr3 (1-214)||(21098318-21098531)
chr3 (1-214)||(34121369-34121582)
chr3 (1-214)||(3898436-3898649)
chr3 (1-214)||(45557886-45558099)
chr3 (1-214)||(49506351-49506564)
chr3 (1-214)||(54073041-54073257)
chr3 (1-214)||(49478222-49478435)
chr3 (1-211)||(55041588-55041804)
chr3 (1-174)||(24119221-24119394)
chr3 (32-214)||(40014655-40014837)
chr3 (50-183)||(26051335-26051469)
chr3 (110-214)||(6460170-6460273)
chr3 (1-58)||(26052236-26052293)
chr3 (151-207)||(37099708-37099764)
chr3 (55-109)||(50724402-50724456)
chr3 (55-109)||(50788392-50788446)
chr3 (59-91)||(43566806-43566838)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-214)||(11725204-11725417)
chr8 (1-214)||(15961146-15961359)
chr8 (1-214)||(18841918-18842131)
chr8 (1-214)||(28582869-28583082)
chr8 (1-214)||(30473886-30474099)
chr8 (4-210)||(44836926-44837132)
chr8 (1-214)||(6299022-6299235)
chr8 (1-214)||(10477951-10478164)
chr8 (1-214)||(18175395-18175608)
chr8 (1-214)||(18997714-18997927)
chr8 (1-214)||(32110863-32111076)
chr8 (1-214)||(35122324-35122537)
chr8 (1-214)||(44832188-44832401)
chr8 (1-215)||(18568879-18569093)
chr8 (1-214)||(995817-996030)
chr8 (1-190)||(39257457-39257646)
chr8 (1-211)||(11142475-11142691)
chr8 (1-214)||(24408890-24409103)
chr8 (1-190)||(40026814-40027003)
chr8 (1-217)||(28274214-28274429)
chr8 (22-214)||(39997726-39997918)
chr8 (1-183)||(18210657-18210839)
chr8 (1-177)||(19412845-19413022)
chr8 (1-168)||(19240677-19240844)
chr8 (1-168)||(19313861-19314028)
chr8 (1-164)||(24004779-24004942)
chr8 (1-105)||(23353688-23353792)
chr8 (1-183)||(25875323-25875514)
chr8 (158-214)||(23353624-23353680)
chr8 (1-47)||(18481929-18481975)
chr8 (166-214)||(19241005-19241053)
chr8 (166-214)||(19314189-19314237)
chr8 (57-108)||(33155317-33155368)
chr8 (156-207)||(405363-405414)
chr8 (156-207)||(17695602-17695653)
chr8 (59-91)||(13702362-13702394)
chr8 (55-95)||(28979075-28979115)
chr8 (1-33)||(39997676-39997708)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (1-214)||(21669995-21670208)
chr7 (1-214)||(16376547-16376760)
chr7 (1-216)||(43933544-43933759)
chr7 (1-214)||(21804574-21804787)
chr7 (1-214)||(38163341-38163554)
chr7 (1-214)||(40968905-40969118)
chr7 (1-214)||(42242156-42242369)
chr7 (1-214)||(3840643-3840856)
chr7 (1-214)||(13786184-13786397)
chr7 (1-214)||(21656642-21656855)
chr7 (1-214)||(33916949-33917162)
chr7 (1-214)||(21341837-21342050)
chr7 (1-202)||(24924093-24924294)
chr7 (1-214)||(27138530-27138743)
chr7 (1-214)||(15109667-15109880)
chr7 (1-214)||(27903419-27903632)
chr7 (1-214)||(31373470-31373683)
chr7 (1-214)||(17178239-17178453)
chr7 (1-183)||(21753525-21753707)
chr7 (22-190)||(39030278-39030446)
chr7 (156-207)||(31097881-31097932)
chr7 (1-35)||(31096714-31096748)
chr7 (156-204)||(32661038-32661086)
chr7 (151-183)||(40673661-40673693)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-214)||(10584730-10584943)
chr6 (1-214)||(13533781-13533994)
chr6 (1-214)||(15044736-15044949)
chr6 (1-214)||(12597267-12597480)
chr6 (1-214)||(17202446-17202659)
chr6 (1-214)||(19997679-19997892)
chr6 (4-214)||(3592910-3593120)
chr6 (1-214)||(33645956-33646169)
chr6 (1-214)||(28099599-28099812)
chr6 (1-214)||(2005442-2005655)
chr6 (1-214)||(2266782-2267003)
chr6 (1-149)||(17594830-17594979)
chr6 (1-113)||(8539614-8539726)
chr6 (91-214)||(1405565-1405688)
chr6 (1-114)||(25448763-25448876)
chr6 (77-180)||(33035523-33035626)
chr6 (157-214)||(8539723-8539780)
chr6 (156-207)||(8657073-8657124)
chr6 (162-214)||(162671-162723)
chr6 (155-214)||(6300711-6300770)
chr6 (155-214)||(6307521-6307580)
chr6 (59-91)||(5134444-5134476)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (1-214)||(19596365-19596578)
chr2 (1-217)||(31424023-31424239)
chr2 (1-214)||(8700275-8700488)
chr2 (1-214)||(41664524-41664737)
chr2 (1-214)||(6120566-6120779)
chr2 (1-214)||(18351565-18351778)
chr2 (1-214)||(41663251-41663464)
chr2 (1-216)||(26231259-26231474)
chr2 (1-214)||(44902096-44902308)
chr2 (6-214)||(42055216-42055426)
chr2 (1-214)||(20544839-20545052)
chr2 (1-214)||(34007716-34007924)
chr2 (1-214)||(36279457-36279669)
chr2 (1-183)||(999264-999446)
chr2 (1-214)||(42441974-42442191)
chr2 (1-175)||(16214838-16215012)
chr2 (63-214)||(27944798-27944949)
chr2 (50-190)||(692228-692368)
chr2 (156-207)||(31572450-31572501)
chr2 (2-33)||(19596634-19596665)
chr2 (59-91)||(3179377-3179409)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (1-221)||(34110666-34110886)
chr5 (1-214)||(20655051-20655264)
chr5 (1-214)||(20874702-20874915)
chr5 (1-214)||(34107340-34107553)
chr5 (1-214)||(38246867-38247080)
chr5 (1-214)||(16526308-16526521)
chr5 (1-209)||(1396003-1396211)
chr5 (1-214)||(5479210-5479423)
chr5 (1-214)||(10729444-10729657)
chr5 (1-211)||(33375776-33375988)
chr5 (1-214)||(2398944-2399155)
chr5 (1-214)||(17373163-17373379)
chr5 (1-177)||(27647944-27648120)
chr5 (1-207)||(25099245-25099451)
chr5 (1-207)||(25158335-25158541)
chr5 (1-198)||(24223182-24223379)
chr5 (1-180)||(29275638-29275817)
chr5 (1-174)||(6940545-6940718)
chr5 (1-181)||(33570342-33570522)
chr5 (3-167)||(14141156-14141320)
chr5 (1-161)||(1394541-1394701)
chr5 (1-157)||(17913755-17913911)
chr5 (66-214)||(40177120-40177268)
chr5 (160-214)||(8179755-8179809)
chr5 (54-91)||(18101954-18101991)
chr5 (59-91)||(4316976-4317008)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (1-219)||(38913744-38913962)
chr1 (1-214)||(4266395-4266608)
chr1 (1-214)||(34888688-34888901)
chr1 (1-214)||(23482709-23482922)
chr1 (4-214)||(1231813-1232023)
chr1 (1-211)||(35614081-35614291)
chr1 (1-214)||(7333958-7334171)
chr1 (1-214)||(9216045-9216258)
chr1 (1-214)||(2951368-2951581)
chr1 (1-214)||(18706511-18706723)
chr1 (1-214)||(38444645-38444858)
chr1 (1-190)||(50151074-50151263)
chr1 (1-214)||(52687116-52687328)
chr1 (1-214)||(18855235-18855447)
chr1 (1-176)||(39727994-39728169)
chr1 (1-177)||(35614830-35615005)
chr1 (1-173)||(19764593-19764765)
chr1 (62-216)||(50326076-50326230)
chr1 (62-214)||(31018202-31018354)
chr1 (1-121)||(2590349-2590468)
chr1 (1-125)||(19768478-19768602)
chr1 (99-183)||(5061335-5061419)
chr1 (122-214)||(29942153-29942245)
chr1 (166-214)||(52957055-52957103)
chr1 (54-111)||(9166563-9166620)
chr1 (155-207)||(29387896-29387948)
chr1 (55-91)||(50575954-50575990)
chr1 (156-207)||(28947463-28947514)
chr1 (155-201)||(14009849-14009895)
chr1 (173-214)||(2590466-2590507)
chr1 (55-91)||(24168585-24168621)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (1-214)||(19361-19574)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-214)||(46288-46501)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-214)||(149052-149265)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (45-214)||(6063-6232)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (45-214)||(6073-6242)
[»] scaffold0836 (1 HSPs)
scaffold0836 (64-214)||(5280-5430)
[»] scaffold0896 (1 HSPs)
scaffold0896 (156-207)||(1086-1137)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16905167 - 16904954
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16905167 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 16905068  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16905067 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 16904968  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16904967 gggtggaaagtcta 16904954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 46256048 - 46256261
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46256048 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagatacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttccaattccaacat 46256147  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  46256148 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 46256247  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  46256248 gggtggaaagtcta 46256261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 52434638 - 52434851
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52434638 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 52434737  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52434738 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 52434837  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  52434838 gggtggaaagtcta 52434851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16918103 - 16917890
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918103 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 16918004  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16918003 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 16917904  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
     |||||||||||||    
T  16917903 aggtggaaagtcta 16917890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30825137 - 30824924
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825137 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 30825038  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30825037 ctgcatatatttggaaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 30824938  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  30824937 gggtggaaagtcta 30824924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33139686 - 33139473
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33139686 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaatacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataaatgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 33139587  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33139586 ctgcatatatttgggacaacatatttaattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactaaatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 33139487  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  33139486 gggtggaaagtcta 33139473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45977205 - 45976990
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45977205 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 45977106  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  45977105 ctgcatatatttaggaccacatatttcattctctttgatatgcattgatatttatttttatctactacatctacgatgtatatgacccgtgcagcagcac 45977006  T
Q  201 gggtggaaagtctaat 216  Q
    || |||||||||||||    
T  45977005 ggatggaaagtctaat 45976990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44376294 - 44376088
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44376294 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 44376195  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44376194 ctgcatatatttgtgaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 44376095  T
Q  201 gggtgga 207  Q
    |||||||    
T  44376094 gggtgga 44376088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31966184 - 31965971
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31966184 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 31966085  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31966084 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttatgtataataaatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 31965985  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  31965984 gggtggaaagtcta 31965971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 35760595 - 35760808
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35760595 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataattgtggtgtttgaggttcgaattccaacat 35760694  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  35760695 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatacattgagatttatttttatctactatatctacaatgtatatgactcgtgcggcagcac 35760794  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  35760795 gggtggaaaatcta 35760808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37591019 - 37590806
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37591019 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacatgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaatttcaacat 37590920  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37590919 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgattttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 37590820  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  37590819 gggtggaaagtcta 37590806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48118746 - 48118536
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48118746 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattggtaaaaattaatatttttaaggtgaatacgtgtggtgtttgaggttcgaattccaacat 48118647  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  48118646 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgt---ctacatctacaatgtatatgactcgtgcggcagcac 48118550  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  48118549 gggtggaaagtcta 48118536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 37651680 - 37651893
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37651680 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtttgaggttcgaattccaacat 37651779  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37651780 ctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttcatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 37651879  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  37651880 gggtggaaagtcta 37651893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41387140 - 41387353
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  41387140 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgatcgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaatttcagcat 41387239  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41387240 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtacggcagcac 41387339  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    || |||||||||||    
T  41387340 ggatggaaagtcta 41387353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 53143477 - 53143264
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53143477 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 53143378  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53143377 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctattatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 53143278  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||| ||| ||||    
T  53143277 gggtgaaaaatcta 53143264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12090675 - 12090461
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaa-tgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12090675 gacatataattttaacaaaagaaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatattttttggttgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 12090576  T
Q  100 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagca 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12090575 tctacatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagca 12090476  T
Q  200 cgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  12090475 cgggtggaaagtcta 12090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47143012 - 47142802
Alignment:
Q  4 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47143012 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaatcgataaaaattaatatttttaaggtgaataagcatggtgtctgaggttcgaattctaacatctg 47142913  T
Q  104 catatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacggg 203  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  47142912 catatatttgagaccacatatgtcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgaccagtgcggcagcacggg 47142813  T
Q  204 tggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||    
T  47142812 tggaaagtcta 47142802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39058572 - 39058359
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39058572 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacatgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtatctgaggttcgaattccaacat 39058473  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39058472 cttgatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatatattaaaatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 39058373  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
     |||||||| ||||    
T  39058372 aggtggaaaatcta 39058359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52098406 - 52098216
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaatt-aatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  52098406 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaatttaatatttttaaggtgaataagtgttgtgtctgaagtttgaattccaaca 52098307  T
Q  100 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  52098306 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactatatttacagtgtatatgacccgt 52098216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31628702 - 31628513
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31628702 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaaataatatttttaagatgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 31628603  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31628602 ctgcatatatttgagaccacatatttaattctctttgatatgcattgagatatgtttttgtctacaacatctacaatgtatatgacccgt 31628513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 54624971 - 54625179
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54624971 gacatataattttaacaaa-gaatgaagtaaca------tgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 54625063  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||    
T  54625064 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattaagatttgtttttgtctactacgtctacaatgtatataacccgtgcgacatcac 54625163  T
Q  201 gggtggaaagtctaat 216  Q
      ||||||| ||||||    
T  54625164 atgtggaaaatctaat 54625179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45782644 - 45782478
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45782644 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 45782545  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctacta 167  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45782544 cttcatatatttaggaccacatatttcattctctttgatatatattgagatttatttttgtctacta 45782478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 50229922 - 50229769
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaa-ttaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50229922 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacactattgataaaaaattaatatttttaaggtgaataagtatggtgtctgaggttcgaattccaaca 50229823  T
Q  100 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagattt 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50229822 tctgcatatattttggaccacatgtttcattctctttgatatgcattgagattt 50229769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50229766 - 50229712
Alignment:
Q  122 tatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50229766 tatttcattctctttgatatgcattgagatttttttttgtctactacatctacaa 50229712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 34684653 - 34684603
Alignment:
Q  59 taaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatata 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34684653 taaggtgaataagtggggtgtctgaggttcgaattccaacctctgcatata 34684603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 214
Target Start/End: Original strand, 18209686 - 18209738
Alignment:
Q  162 ctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18209686 ctactacattttgaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 18209738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Original strand, 19745228 - 19745278
Alignment:
Q  157 tttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  19745228 tttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggccgcacgggtgga 19745278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19794578 - 19794528
Alignment:
Q  157 tttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  19794578 tttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggccgcacgggtgga 19794528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Original strand, 6481589 - 6481626
Alignment:
Q  54 atttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6481589 atttttaaggtgaataagtggggcgtctgaggttcgaa 6481626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 214
Target Start/End: Original strand, 26724134 - 26724171
Alignment:
Q  177 tgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26724134 tgtatataacccgtgcggcagcacgggtgaaaagtcta 26724171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 91
Target Start/End: Original strand, 23935032 - 23935068
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23935032 tttttaaggagaataagtggggtgtctgaggttcgaa 23935068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 91
Target Start/End: Original strand, 37997852 - 37997888
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37997852 tttttaaggtgaataagtggggtgtctggggttcgaa 37997888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26948812 - 26949025
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26948812 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaagttaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 26948911  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26948912 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 26949011  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  26949012 gggtggaaagtcta 26949025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31488425 - 31488642
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31488425 gacatataattttaacaaaagaataaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 31488524  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31488525 ctgcatatatttgggacaacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtgcggcagcac 31488624  T
Q  201 gggtggaaagtctaatat 218  Q
    || |||||||||||||||    
T  31488625 ggatggaaagtctaatat 31488642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4584649 - 4584436
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4584649 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 4584550  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4584549 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 4584450  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  4584449 gggtggaaagtcta 4584436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20671263 - 20671476
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20671263 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 20671362  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  20671363 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgactcgtgtggcagcac 20671462  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20671463 gggtggaaagtcta 20671476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36076669 - 36076456
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36076669 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaagttcgaattccaacat 36076570  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36076569 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttaatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 36076470  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  36076469 gggtggaaagtcta 36076456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 39146454 - 39146669
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146454 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 39146553  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  39146554 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcaacac 39146653  T
Q  201 gggtggaaagtctaat 216  Q
     | |||||||||||||    
T  39146654 agatggaaagtctaat 39146669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 12264214 - 12264427
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264214 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 12264313  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12264314 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 12264413  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  12264414 gggtggaaagtcta 12264427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38654142 - 38653929
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38654142 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 38654043  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38654042 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 38653943  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  38653942 gggtggaaagtcta 38653929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43363826 - 43363613
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43363826 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 43363727  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43363726 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 43363627  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  43363626 gggtggaaagtcta 43363613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 49672576 - 49672789
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49672576 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 49672675  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  49672676 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 49672775  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  49672776 gggtggaaagtcta 49672789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1941935 - 1941722
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1941935 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtgatgtctgaggttcgaattccaacat 1941836  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1941835 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 1941736  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  1941735 gggtggaaagtcta 1941722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21098318 - 21098531
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098318 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 21098417  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21098418 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctattatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 21098517  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21098518 gggtggaaagtcta 21098531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 34121369 - 34121582
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34121369 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 34121468  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34121469 ctgcatatatttgggaccacgtatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 34121568  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34121569 gggtggaaagtcta 34121582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 3898436 - 3898649
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3898436 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 3898535  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3898536 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttaatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 3898635  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  3898636 gggtggaaagtcta 3898649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45558099 - 45557886
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45558099 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaatacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaatttcaacat 45558000  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  45557999 ctgcatatacttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatatatatgacctgtacggtagcac 45557900  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
     |||||||||||||    
T  45557899 tggtggaaagtcta 45557886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49506564 - 49506351
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49506564 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaccacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 49506465  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  49506464 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagtac 49506365  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  49506364 gggtggaaagtcta 49506351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 54073041 - 54073257
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54073041 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 54073140  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatg---tatataacccgtacggcag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| ||||||    
T  54073141 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtactatatgacccgtgcggcag 54073240  T
Q  198 cacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  54073241 cacgggtggaaagtcta 54073257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 49478222 - 49478435
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49478222 gacatataattttaataaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 49478321  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  49478322 ttgcatatatttgggaccacatatttcattatctttgatatgtattgagatttgtttttatctactacgtctacaatgtaaatgactcgtgcggcagcac 49478421  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  49478422 gggtggaaagtcta 49478435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 55041804 - 55041588
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaat------taatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55041804 gacatataattttaacaaaagagtgaagtaacacacgattgataaaaataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattc 55041705  T
Q  95 caacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacgg 194  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  55041704 aaacatctgcatatatttggaaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcgg 55041605  T
Q  195 cagcacgggtggaaagt 211  Q
     ||||||||||||||||    
T  55041604 tagcacgggtggaaagt 55041588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 24119221 - 24119394
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24119221 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggtttgaattccaacat 24119320  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctac 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24119321 ctgcatatatttgggaccatatatttcattatctttaatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctac 24119394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40014837 - 40014655
Alignment:
Q  32 cacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40014837 cacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattc 40014738  T
Q  132 tctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40014737 tctttgatatgcattgagatttgtttttgtttattatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 40014655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26051469 - 26051335
Alignment:
Q  50 taatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttggg-accacatatttcattctctttgatatgcattga 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051469 taatatttttaaggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacctcagcatatatttggggaccacatatttcattctctttgatatgcattga 26051370  T
Q  149 gatttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051369 gatttgtttttgtctactacatctacaatgtatat 26051335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6460273 - 6460170
Alignment:
Q  110 tttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaa 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6460273 tttgggaccacatattttattct-tttgatatgtattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaa 6460175  T
Q  210 gtcta 214  Q
    |||||    
T  6460174 gtcta 6460170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26052293 - 26052236
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26052293 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttt 26052236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 207
Target Start/End: Original strand, 37099708 - 37099764
Alignment:
Q  151 tttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37099708 tttacttttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 37099764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 50724456 - 50724402
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatata 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||    
T  50724456 tttttaaggtgaataagtggggtgtccgaggttcgaaccccaacccctgcatata 50724402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 109
Target Start/End: Original strand, 50788392 - 50788446
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatata 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||  |||||||||    
T  50788392 tttttaaggtgaataagtggggtgtccgaggttcgaaccccaacccctgcatata 50788446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 91
Target Start/End: Original strand, 43566806 - 43566838
Alignment:
Q  59 taaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43566806 taaggtgaataagtggggtgtctgaggttcgaa 43566838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 11725204 - 11725417
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11725204 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 11725303  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  11725304 ctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcagcagcac 11725403  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  11725404 gggtggaaagtcta 11725417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15961146 - 15961359
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15961146 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 15961245  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15961246 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 15961345  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15961346 gggtggaaagtcta 15961359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18841918 - 18842131
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18841918 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacatacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgagattcgaattccaacat 18842017  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  18842018 ctgcatatattttggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagaac 18842117  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18842118 gggtggaaagtcta 18842131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 28582869 - 28583082
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28582869 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 28582968  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28582969 ctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatacattgagatttgtttttatctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 28583068  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  28583069 gggtggaaaatcta 28583082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30474099 - 30473886
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30474099 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 30474000  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30473999 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 30473900  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  30473899 gggtggaaagtcta 30473886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 44836926 - 44837132
Alignment:
Q  4 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44836926 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 44837025  T
Q  104 catatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacggg 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44837026 catatatttaggaccacatattttattctctttgatatgtattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtgcggcagcacggg 44837125  T
Q  204 tggaaag 210  Q
    |||||||    
T  44837126 tggaaag 44837132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6299235 - 6299022
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6299235 gacatataattttaacaaaggaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 6299136  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6299135 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 6299036  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  6299035 gggtggaaagtcta 6299022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10477951 - 10478164
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10477951 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 10478050  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10478051 ctgcatatatttgtgaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 10478150  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  10478151 gggtggaaagtcta 10478164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18175395 - 18175608
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18175395 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgtttgataataattaatatttttttggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 18175494  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18175495 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 18175594  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18175595 gggtggaaagtcta 18175608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18997714 - 18997927
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18997714 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 18997813  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18997814 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 18997913  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  18997914 gggtggatagtcta 18997927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32111076 - 32110863
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32111076 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 32110977  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32110976 ctgcatatatttggaaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 32110877  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  32110876 gggtggaaagtcta 32110863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35122537 - 35122324
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35122537 gacatataattttaataaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgagattcgaattccaacat 35122438  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||     
T  35122437 ctgcatatattttggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcgacagcag 35122338  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  35122337 gggtggaaagtcta 35122324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44832401 - 44832188
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44832401 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 44832302  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  44832301 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcaacac 44832202  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  44832201 gggtggaaagtcta 44832188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18568879 - 18569093
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18568879 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaagatgaataagtgtggtgtttgaggttcgaattccaacat 18568978  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  18568979 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgagatatgtttttgtctacaacatctacaatgtatatgacccgtgcggtagcac 18569078  T
Q  201 gggtggaaagtctaa 215  Q
    |||||||||||||||    
T  18569079 gggtggaaagtctaa 18569093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 996030 - 995817
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  996030 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaagttaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 995931  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  995930 atgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 995831  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  995830 gggtggaaagtcta 995817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 39257457 - 39257646
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39257457 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 39257556  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39257557 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgt 39257646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 11142475 - 11142691
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataa------aaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142475 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattc 11142574  T
Q  95 caacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacgg 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  11142575 caacatctgcatatatttgggagcacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgatccgtgcgg 11142674  T
Q  195 cagcacgggtggaaagt 211  Q
    |||||||||||||||||    
T  11142675 cagcacgggtggaaagt 11142691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24408890 - 24409103
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24408890 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtatgatgttcgaattccaacat 24408989  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  24408990 ctgcatatatttgggaccacatatttcattatctttgatatgcattaagatttgtttttatctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcaacac 24409089  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    |||| |||||||||    
T  24409090 gggtagaaagtcta 24409103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 40026814 - 40027003
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40026814 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 40026913  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40026914 ctgcatatatttgggaccacatatttcattatctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgt 40027003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28274429 - 28274214
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28274429 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 28274330  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | || ||||    
T  28274329 ctgcgtatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctgctacatctacaatgtatatgatccgtgc-gccgcac 28274231  T
Q  201 gggtggaaagtctaata 217  Q
    || ||||||||||||||    
T  28274230 ggatggaaagtctaata 28274214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 22 - 214
Target Start/End: Original strand, 39997726 - 39997918
Alignment:
Q  22 aatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39997726 aatgaagtaacacacgattgataaaaattaatattttaaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttggaaccaca 39997825  T
Q  122 tatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39997826 tatttcattctctttgatatacattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaattcta 39997918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18210839 - 18210657
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18210839 gacatataactttaacaaaagaaggaaataacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 18210740  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18210739 ctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactatatctacaatgtatat 18210657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 19412845 - 19413022
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaa-gaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19412845 gacatataattttaacaaaaagaatgaagtaacacacgatggataaaaattaatatttttaaggtgaataactgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 19412944  T
Q  100 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19412945 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaat 19413022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 19240677 - 19240844
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19240677 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacaccattgataaaaattaatatttttaacgtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 19240776  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactac 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19240777 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactac 19240844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 19313861 - 19314028
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19313861 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacaccattgataaaaattaatatttttaacgtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 19313960  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactac 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19313961 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactac 19314028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24004942 - 24004779
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24004942 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacatgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaatttcaacat 24004843  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtcta 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24004842 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgattttgtcta 24004779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23353792 - 23353688
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23353792 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacaccattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtggggtgtctgaggttcgaattccaacat 23353693  T
Q  101 ctgca 105  Q
    |||||    
T  23353692 ctgca 23353688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25875514 - 25875323
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgt--------------ggtgtctgaggt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||    
T  25875514 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgttttattctctttaatatgtctgaggt 25875415  T
Q  87 tcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    |||||||||| ||||||||||     |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25875414 tcgaattccagcatctgcata-----gggagcacatgttttattctctttaatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacgatgtatat 25875323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23353680 - 23353624
Alignment:
Q  158 ttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23353680 ttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 23353624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 18481975 - 18481929
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18481975 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaa 18481929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 19241005 - 19241053
Alignment:
Q  166 tacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19241005 tacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcgcgggtggaaagtcta 19241053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 19314189 - 19314237
Alignment:
Q  166 tacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19314189 tacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcgcgggtggaaagtcta 19314237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33155368 - 33155317
Alignment:
Q  57 tttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatat 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  33155368 tttaaggtgaataagtgtcgtgtctgggattcgaactccaacatctgcatat 33155317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 405414 - 405363
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  405414 ttttgtctactatacttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 405363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 17695602 - 17695653
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17695602 ttttatctactacacttacaatgtatattacccgtgcggcagcacgggtgga 17695653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 91
Target Start/End: Original strand, 13702362 - 13702394
Alignment:
Q  59 taaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13702362 taaggtgaataagtgaggtgtctgaggttcgaa 13702394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28979115 - 28979075
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattcc 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  28979115 tttttaaggtgaataagtgaggtgtccggggttcgaattcc 28979075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 39997676 - 39997708
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaaca 33  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39997676 gacatataatttttacaaaagaatgaagtaaca 39997708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21669995 - 21670208
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21669995 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 21670094  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  21670095 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacctgtgcggcagcac 21670194  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21670195 gggtggaaagtcta 21670208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16376760 - 16376547
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376760 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 16376661  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16376660 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 16376561  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16376560 gggtggaaagtcta 16376547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43933759 - 43933544
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43933759 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 43933660  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||    
T  43933659 ctgcatatatttgggaccacatattttattctcttttatatgcattgagatttttttttgtctactacatctacaatgtatatgacccttgcggtagcac 43933560  T
Q  201 gggtggaaagtctaat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  43933559 gggtggaaagtctaat 43933544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21804787 - 21804574
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804787 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 21804688  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21804687 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 21804588  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21804587 gggtggaaagtcta 21804574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38163554 - 38163341
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38163554 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 38163455  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38163454 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 38163355  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  38163354 gggtggaaagtcta 38163341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 40968905 - 40969118
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40968905 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 40969004  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40969005 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttgtgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 40969104  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  40969105 gggtggaaagtcta 40969118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42242369 - 42242156
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42242369 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 42242270  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42242269 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 42242170  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  42242169 gggtggaaagtcta 42242156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3840856 - 3840643
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3840856 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 3840757  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  3840756 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgactcgtgcggcagcac 3840657  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  3840656 gggtggaaagtcta 3840643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13786184 - 13786397
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13786184 gacatataattttaacaaaaaaatgaagtaagacgcgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 13786283  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13786284 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 13786383  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  13786384 gggtggaaagtcta 13786397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21656642 - 21656855
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21656642 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 21656741  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  || |||||    
T  21656742 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctacttcatctacagtgtatatgacccgtgtggtagcac 21656841  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21656842 gggtggaaagtcta 21656855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33917162 - 33916949
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33917162 gacatataattttaacaaaagaatgaaataacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 33917063  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33917062 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 33916963  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  33916962 gggtggaaagtcta 33916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21341837 - 21342050
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341837 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 21341936  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21341937 ctgcatatatttgagactacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctattatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 21342036  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21342037 gggtggaaagtcta 21342050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24924093 - 24924294
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24924093 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaatttaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcaaattccaacat 24924192  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24924193 ctacatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 24924292  T
Q  201 gg 202  Q
    ||    
T  24924293 gg 24924294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27138743 - 27138530
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27138743 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 27138644  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  27138643 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctagaatgtatatgacctgtgcggcagcac 27138544  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  27138543 gggtggaaagtcta 27138530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15109880 - 15109667
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15109880 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaattgataaaaattaatacttttaagatgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 15109781  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||  |||||    
T  15109780 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgtccggtgcgatagcac 15109681  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15109680 gggtggaaagtcta 15109667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27903632 - 27903419
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27903632 gacatagaattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattggtaaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 27903533  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  27903532 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatatatatgacccgtgcggcagcac 27903433  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  27903432 gggtggaaagtcta 27903419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 31373470 - 31373683
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31373470 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaatacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaatttcaacat 31373569  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31373570 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctattatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 31373669  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  31373670 gggtggaaagtcta 31373683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17178453 - 17178239
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaa-ggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17178453 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacccgattgataaaaattaatattttttttggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 17178354  T
Q  100 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  17178353 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgaattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccatgcggcagca 17178254  T
Q  200 cgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  17178253 cgggtggaaagtcta 17178239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21753707 - 21753525
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  21753707 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctaaggttcgaattttaacat 21753608  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21753607 ctgcatatatttgagaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatat 21753525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39030446 - 39030278
Alignment:
Q  22 aatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccaca 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39030446 aatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccaca 39030347  T
Q  122 tatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39030346 tgttttattctctttgatatgcattgaaatttgtttttgtctactacatctacaatatatatgacccgt 39030278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 31097881 - 31097932
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31097881 ttttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 31097932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 31096714 - 31096748
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacaca 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31096714 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacaca 31096748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Original strand, 32661038 - 32661086
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggt 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  32661038 ttttgtctactacacttacaatgtatatgactcgtgcggcagcacgggt 32661086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40673693 - 40673661
Alignment:
Q  151 tttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40673693 tttatttttgtctactacatttacaatgtatat 40673661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10584943 - 10584730
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10584943 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtagtgtctgaggttcgaattccaacat 10584844  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  10584843 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattaagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccatatggcagcac 10584744  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  10584743 gggtggaaagtcta 10584730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 13533781 - 13533994
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13533781 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 13533880  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13533881 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatacattgagatttgtttttatctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 13533980  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  13533981 gggtggaaaatcta 13533994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15044736 - 15044949
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044736 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaaaacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 15044835  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  15044836 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgaaatttatttttgtctactacatctacaatgtatatgacctgtgcggcagcac 15044935  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15044936 gggtggaaagtcta 15044949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12597480 - 12597267
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12597480 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 12597381  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12597380 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 12597281  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  12597280 gggtggaaagtcta 12597267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 17202446 - 17202659
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17202446 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 17202545  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  17202546 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgtgatttgtatttgtctactacatctacaatgtatatgacttgtgcggcagcac 17202645  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  17202646 gggtggaaagtcta 17202659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19997679 - 19997892
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19997679 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 19997778  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19997779 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 19997878  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19997879 gggtggaaagtcta 19997892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 3592910 - 3593120
Alignment:
Q  4 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3592910 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattcataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 3593009  T
Q  104 catatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacggg 203  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3593010 aatatatttgggatcacatatttcattctcttggatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacggg 3593109  T
Q  204 tggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||    
T  3593110 tggaaagtcta 3593120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 33645956 - 33646169
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33645956 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 33646055  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33646056 ctgcatatatttggaaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 33646155  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  33646156 gggtggaaagtcta 33646169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28099812 - 28099599
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28099812 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 28099713  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28099712 cagcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctattatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 28099613  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  28099612 gggtggaaagtcta 28099599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2005442 - 2005655
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005442 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 2005541  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  2005542 ctgcatatatttaagaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactgcatctacaatgtatatgacccgtgcggccgcac 2005641  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    | ||||||||||||    
T  2005642 gagtggaaagtcta 2005655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2266782 - 2267003
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtgg--------tgtctgaggttcgaat 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||        ||||||||||||||||    
T  2266782 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtcgtggtgtctgaggttcgaat 2266881  T
Q  93 tccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  2266882 tccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgc 2266981  T
Q  193 ggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2266982 ggcagcacgggtggaaagtcta 2267003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 17594830 - 17594979
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaatt-aatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaaca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  17594830 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacatacgattgataaaaatttaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaagtttgaatttcaaca 17594929  T
Q  100 tctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgag 149  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17594930 tctccatatatttgggaccacatatttcattttctttgatatgcattgag 17594979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 8539614 - 8539726
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539614 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 8539713  T
Q  101 ctgcatatatttg 113  Q
    |||||||||||||    
T  8539714 ctgcatatatttg 8539726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1405688 - 1405565
Alignment:
Q  91 attccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1405688 attccaacatctgcatatatttgggatcacatatttcattctctttaatatacattgagatttgtttttatctactacatctacaatgtatatgacccgt 1405589  T
Q  191 acggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  1405588 gcggcagcacgggtggaaaatcta 1405565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 25448763 - 25448876
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25448763 gacatataattttaacaaaaaaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatatttttggtgaataagcgtggtgtctgagtttcgaattccaacat 25448862  T
Q  101 ctgcatatatttgg 114  Q
    || |||||||||||    
T  25448863 ctacatatatttgg 25448876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Original strand, 33035523 - 33035626
Alignment:
Q  77 tgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaa 176  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33035523 tgtctgagattcgaattccagcatctgcatatatttgagaccacatgttttattctctttgacatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaa 33035622  T
Q  177 tgta 180  Q
    ||||    
T  33035623 tgta 33035626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 8539723 - 8539780
Alignment:
Q  157 tttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8539723 tttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 8539780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8657124 - 8657073
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8657124 ttttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 8657073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 162723 - 162671
Alignment:
Q  162 ctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  162723 ctactacattttgaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 162671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6300770 - 6300711
Alignment:
Q  155 tttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  6300770 tttttgcctactagatatacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgcatagtcta 6300711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6307580 - 6307521
Alignment:
Q  155 tttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  6307580 tttttgcctactagatatacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgcatagtcta 6307521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 91
Target Start/End: Original strand, 5134444 - 5134476
Alignment:
Q  59 taaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5134444 taaggtgaataagtggggtgtctgaggttcgaa 5134476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19596578 - 19596365
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19596578 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 19596479  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19596478 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttaatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 19596379  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19596378 gggtggaaagtcta 19596365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 31424023 - 31424239
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31424023 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 31424122  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  31424123 ctacatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgactcgtgcggcagcac 31424222  T
Q  201 gggtggaaagtctaata 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  31424223 gggtggaaagtctaata 31424239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8700275 - 8700488
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8700275 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaaaaaatgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 8700374  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8700375 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgaaatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 8700474  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  8700475 gggtggaaagtcta 8700488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41664524 - 41664737
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41664524 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 41664623  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41664624 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 41664723  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  41664724 gggtggaaagtcta 41664737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6120566 - 6120779
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6120566 gacatatagttttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 6120665  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6120666 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 6120765  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  6120766 gggtggaaagtcta 6120779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18351565 - 18351778
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18351565 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtttgaggttcgaattccaacat 18351664  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18351665 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 18351764  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18351765 gggtggaaagtcta 18351778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 41663251 - 41663464
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41663251 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 41663350  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  41663351 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccatgcggcagcac 41663450  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  41663451 gggtggaaagtcta 41663464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26231474 - 26231259
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26231474 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaagatgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 26231375  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  26231374 ctgaatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatgcattgaaatttgtttttgtctactacatctacaatgtatataacctgtgcggtagcac 26231275  T
Q  201 gggtggaaagtctaat 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  26231274 gggtgaaaagtctaat 26231259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 44902096 - 44902308
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44902096 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaatta-tattttttttgtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 44902194  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44902195 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 44902294  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  44902295 gggtggaaagtcta 44902308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 42055216 - 42055426
Alignment:
Q  6 ataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgca 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42055216 ataatcttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgca 42055315  T
Q  106 tatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacg--gcagcacggg 203  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||    
T  42055316 tatatttgggatcacctatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggtgtagcacggg 42055415  T
Q  204 tggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||    
T  42055416 tggaaagtcta 42055426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20544839 - 20545052
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  20544839 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaccacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgttttaggttcgaattctaacat 20544938  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20544939 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctaccatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 20545038  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20545039 gggtggaaagtcta 20545052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34007924 - 34007716
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34007924 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgatttataaaaattaatatttttaaggtggataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 34007825  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     |||||    
T  34007824 cggcatatatttgggactacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatggatattacccgt-----agcac 34007730  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34007729 gggtggaaagtcta 34007716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36279669 - 36279457
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36279669 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtatctgagattcgaattccaacat 36279570  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  | ||||    
T  36279569 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatacattgatatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgactcgtgctac-gcac 36279471  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  36279470 gggtggaaagtcta 36279457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 999446 - 999264
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  999446 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 999347  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  999346 ctacatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttatctactacatctacaaagtatat 999264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 42441974 - 42442191
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcg------aattc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||      |||||    
T  42441974 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacac--gattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattcgaattc 42442071  T
Q  95 caacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacgg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  42442072 caacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcgg 42442171  T
Q  195 cagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    || |||||||||||||||||    
T  42442172 caacacgggtggaaagtcta 42442191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 16214838 - 16215012
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16214838 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattaataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgttagaggttcgaattcctacat 16214937  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctaca 175  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214938 ttgcatatattttggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctaca 16215012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27944949 - 27944798
Alignment:
Q  63 gtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtc 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27944949 gtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtc 27944850  T
Q  163 tactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27944849 tactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 27944798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 692368 - 692228
Alignment:
Q  50 taatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  692368 taatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccatatatttcattctctttgatatgcattgag 692269  T
Q  150 atttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  692268 atttgtttttgtctactacatttacaatgtatatgacccgt 692228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 31572450 - 31572501
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31572450 ttttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 31572501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 19596665 - 19596634
Alignment:
Q  2 acatataattttaacaaaagaatgaagtaaca 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19596665 acatataattttaacaaaagaatgaagtaaca 19596634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3179409 - 3179377
Alignment:
Q  59 taaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3179409 taaggtgaataagtggggtgtctgaggttcgaa 3179377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 34110666 - 34110886
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34110666 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 34110765  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34110766 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 34110865  T
Q  201 gggtggaaagtctaatatgtt 221  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  34110866 gggtggaaagtctagtatgtt 34110886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20655264 - 20655051
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20655264 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacaattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 20655165  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20655164 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 20655065  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20655064 gggtggaaagtcta 20655051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20874702 - 20874915
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20874702 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 20874801  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20874802 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 20874901  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20874902 gggtggaaagtcta 20874915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34107553 - 34107340
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34107553 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 34107454  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34107453 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 34107354  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34107353 gggtggaaagtcta 34107340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38247080 - 38246867
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38247080 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 38246981  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38246980 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 38246881  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  38246880 gggtggaaagtcta 38246867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16526521 - 16526308
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16526521 gacatataattttaacaaaagaacgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 16526422  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16526421 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 16526322  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  16526321 gggtggaaagtcta 16526308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1396003 - 1396211
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1396003 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgactgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 1396102  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  1396103 ctgcagatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctgctacatctgcaatgtatatgacccgtgcggcagcac 1396202  T
Q  201 gggtggaaa 209  Q
    |||||||||    
T  1396203 gggtggaaa 1396211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5479210 - 5479423
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5479210 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtagtgtctgaggttcgaattccaacat 5479309  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||    
T  5479310 ctacatatatttgggatcacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcgacaacac 5479409  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
     |||| ||||||||    
T  5479410 aggtgaaaagtcta 5479423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10729657 - 10729444
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10729657 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaaataatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 10729558  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10729557 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctcttggatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 10729458  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  10729457 gggtggaaagtcta 10729444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 33375776 - 33375988
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33375776 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 33375875  T
Q  101 ctgcatatatttggg--accacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagc 198  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33375876 ctgcatatatttgggacaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagc 33375975  T
Q  199 acgggtggaaagt 211  Q
    |||||||||||||    
T  33375976 acgggtggaaagt 33375988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2399155 - 2398944
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2399155 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacac--gattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 2399058  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2399057 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 2398958  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2398957 gggtggaaagtcta 2398944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17373379 - 17373163
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17373379 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 17373280  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatg---tatataacccgtacggcag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||| ||||||    
T  17373279 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtactatatgacccgtgcggcag 17373180  T
Q  198 cacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  17373179 cacgggtggaaagtcta 17373163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 27647944 - 27648120
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647944 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 27648043  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaat 177  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27648044 ctgtatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaat 27648120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25099451 - 25099245
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25099451 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggcgaataagtgtggtgcctgaggttcgaattccaacat 25099352  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25099351 ctgcatatatttgtgaccacatgttttattctctttgatatgcattcagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 25099252  T
Q  201 gggtgga 207  Q
    |||||||    
T  25099251 gggtgga 25099245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25158541 - 25158335
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25158541 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggcgaataagtgtggtgcctgaggttcgaattccaacat 25158442  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25158441 ctgcatatatttgtgaccacatgttttattctctttgatatgcattcagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 25158342  T
Q  201 gggtgga 207  Q
    |||||||    
T  25158341 gggtgga 25158335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24223379 - 24223182
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24223379 gacatatacttttaacaaaagaatgaagtaacacacgattggtaaagagtaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 24223280  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24223279 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttcatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacgatgtatatgacccgtgcggcagc 24223182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 29275638 - 29275817
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29275638 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaagttaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 29275737  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgta 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  29275738 ctgcatatatttgggaccacatgtttcattctctttgatatgcattgaaatttgtttttgtctattacatctacaatgta 29275817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6940718 - 6940545
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6940718 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacatacgattgataaaaattaatatttttcaggtgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 6940619  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6940618 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctac 6940545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33570522 - 33570342
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33570522 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 33570423  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33570422 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttggtatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtat 33570342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14141320 - 14141156
Alignment:
Q  3 catataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141320 catataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatct 14141221  T
Q  103 gcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14141220 gcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctacta 14141156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1394701 - 1394541
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1394701 gacatataaatttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaacaagtgtggtgtttgaggttcgaattccaacat 1394602  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1394601 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgt 1394541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17913755 - 17913911
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17913755 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaagattaatatttttaaggtgaataagtgtggtatttgaggttcgaattccaacat 17913854  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttattt 157  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913855 ctacatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttattt 17913911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Original strand, 40177120 - 40177268
Alignment:
Q  66 aataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctac 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40177120 aataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctcttttatatgcattgagatttgtttttgtctac 40177219  T
Q  166 tacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40177220 tatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 40177268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8179809 - 8179755
Alignment:
Q  160 gtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8179809 gtctactacatctacaatatatatgatccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 8179755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Original strand, 18101954 - 18101991
Alignment:
Q  54 atttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18101954 atttttaaggtgaataagtggggtgtctggggttcgaa 18101991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 91
Target Start/End: Original strand, 4316976 - 4317008
Alignment:
Q  59 taaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4316976 taaggtgaataagtgtggtgtttgaggttcgaa 4317008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38913962 - 38913744
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38913962 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 38913863  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38913862 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 38913763  T
Q  201 gggtggaaagtctaatatg 219  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  38913762 gggtggaaagtctagtatg 38913744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 4266395 - 4266608
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4266395 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 4266494  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4266495 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 4266594  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  4266595 gggtggaaagtcta 4266608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34888901 - 34888688
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34888901 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 34888802  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34888801 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 34888702  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  34888701 gggtggaaagtcta 34888688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23482922 - 23482709
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23482922 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttcaggtgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 23482823  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  23482822 ctgcatatatttgggaccacatatttcatgctctttgatatgcattgagatttgtatttgtctactacatctacaatgtatatgactcgtgcggcagcac 23482723  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  23482722 gggtggaaagtcta 23482709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 1231813 - 1232023
Alignment:
Q  4 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231813 atataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctg 1231912  T
Q  104 catatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacggg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1231913 catatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacggg 1232012  T
Q  204 tggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||    
T  1232013 tggaaagtcta 1232023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 35614081 - 35614291
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35614081 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttcaggtgaataagtgtggtgtcttaagttcgaattccaacat 35614180  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  35614181 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatttacaatgtatatgacccgtgcggtagcac 35614280  T
Q  201 gggtggaaagt 211  Q
    |||||||||||    
T  35614281 gggtggaaagt 35614291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 7333958 - 7334171
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7333958 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttatggtgaataagtgtggtgtctgaggtttgaattccaacat 7334057  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  7334058 ctgcatatatttgggaccacatattttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctaccatctatataacccgtgcagcagcac 7334157  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  7334158 gggtgaaaagtcta 7334171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9216045 - 9216258
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9216045 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtaaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 9216144  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9216145 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttatctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 9216244  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  9216245 gggtggaaagtcta 9216258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2951581 - 2951368
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2951581 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 2951482  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2951481 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttttttttgtttattatatttacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 2951382  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2951381 gggtggaaagtcta 2951368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18706723 - 18706511
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18706723 gacatataattttaacaaaagaatgaagttacacacgattgataaaaattaatatttttcaggtgaataagtgtggtgtatgaggttcgaattccaacat 18706624  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  18706623 ctgcatatattt-ggaccacatatttcattctctttgatatgcattaagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgactcgtgcggcagcac 18706525  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18706524 gggtggaaagtcta 18706511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 38444645 - 38444858
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38444645 gacatataattttatcaaaagaatgaagtaacacattattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaagttcgaatttcaacat 38444744  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||    
T  38444745 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatatgacccatgcggcatcac 38444844  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  38444845 gggtggaaagtcta 38444858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 50151074 - 50151263
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50151074 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 50151173  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  50151174 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgt 50151263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52687328 - 52687116
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52687328 gacatataattttaataaaaaaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgt-tgaggttcggattccaacat 52687230  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  52687229 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttcataggcattgagatttgtttttgtatactacatctacaatgtatatgacccgtgcgacagcac 52687130  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  52687129 gggtggaaagtcta 52687116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18855447 - 18855235
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18855447 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaatacatgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaatttcaacat 18855348  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18855347 ctacatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagattt-gatttgtctactgcatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 18855249  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  18855248 gggtggaaagtcta 18855235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 39727994 - 39728169
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727994 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 39728093  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39728094 ctgcatatatttgggaccacatgttttattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaa 39728169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 35614830 - 35615005
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35614830 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttt-aaggtaaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 35614928  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaat 177  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35614929 ctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatgcattaagatttgtttttgtctactacatttacaat 35615005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19764765 - 19764593
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19764765 gacatgtaattttaacaaaataatgaagtaacacacgattcataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattcaaacat 19764666  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatcta 173  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19764665 ttgcatatatttgggaccacatatttcattctttttaatatgcattgagatttgtttttgtatactacatcta 19764593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 50326076 - 50326230
Alignment:
Q  62 ggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgt 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50326076 ggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgt 50326175  T
Q  162 ctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtctaat 216  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50326176 ctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtctaat 50326230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31018354 - 31018202
Alignment:
Q  62 ggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgt 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31018354 ggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgt 31018255  T
Q  162 ctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31018254 ctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 31018202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 2590349 - 2590468
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2590349 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggtt-gaattcgaacat 2590447  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccaca 121  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  2590448 ctgcatatatttggaaccaca 2590468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 19768478 - 19768602
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19768478 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaaataatatttttaagatgaataagtgtggtgtctgaggttcgaaattcaacat 19768577  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatt 125  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||    
T  19768578 ctacatgtatttggaaccacatatt 19768602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 5061335 - 5061419
Alignment:
Q  99 atctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5061335 atctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtatat 5061419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 29942153 - 29942245
Alignment:
Q  122 tatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29942153 tatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 29942245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 52957055 - 52957103
Alignment:
Q  166 tacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52957055 tacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggagagtcta 52957103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 9166620 - 9166563
Alignment:
Q  54 atttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||    
T  9166620 atttttaaggtgaattagtgtggtgtccgaggttcaaactccgacctctgcatatatt 9166563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29387948 - 29387896
Alignment:
Q  155 tttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  29387948 tttttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggcagtacgggtgga 29387896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 50575990 - 50575954
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50575990 tttttaaggtgaataagtgaggtgtctgaggttcgaa 50575954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28947514 - 28947463
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28947514 ttttgtctactacacttataatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 28947463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 201
Target Start/End: Original strand, 14009849 - 14009895
Alignment:
Q  155 tttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacg 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  14009849 tttttgtctactacatttacaatttatatgacccgtgcggcagcacg 14009895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Original strand, 2590466 - 2590507
Alignment:
Q  173 acaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2590466 acaatgtatatgactcgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 2590507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 91
Target Start/End: Original strand, 24168585 - 24168621
Alignment:
Q  55 tttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24168585 tttttaaggtgaataagtggggtgtctggggttcgaa 24168621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 19361 - 19574
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaagacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 19460  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19461 ctgcatatatttgggaccacatatttaattatctttaatatgcattgagatttgtttttgtctactacatctacaatgtataggacccgtacggcagcac 19560  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  19561 gggtggaaagtcta 19574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 46288 - 46501
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46288 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttttggtgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 46387  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  46388 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcac 46487  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  46488 gggtggaaagtcta 46501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 149265 - 149052
Alignment:
Q  1 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  149265 gacatataattttaacaaaagaatgaagtaacacacgattgataaaaattaatatttttaaggtgaataagtgttgtgtttgatgttcgaattccaacat 149166  T
Q  101 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  149165 ctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtctactatatctacaatttatatgacccgtgcggcagcac 149066  T
Q  201 gggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||||||||||    
T  149065 gggtggaaagtcta 149052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6232 - 6063
Alignment:
Q  45 aaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgca 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232 aaaattaatatttttaagatgaataagtgtggtgtttgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatgca 6133  T
Q  145 ttgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6132 ttgagatatgtttttgtctacaacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaaatcta 6063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6242 - 6073
Alignment:
Q  45 aaaattaatatttttaaggtgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgca 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6242 aaaattaatatttttaagatgaataagtgtggtgtttgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgagaccacatatttcattctctttgatatgca 6143  T
Q  145 ttgagatttatttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6142 ttgagatatgtttttgtctacaacatctacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtggaaaatcta 6073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0836 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0836
Description:

Target: scaffold0836; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5430 - 5280
Alignment:
Q  64 tgaataagtgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttatttttgtct 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5430 tgaataagcgtggtgtctgaggttcgaattccaacatctgcatatatttgggaccacatatttcattctctttgatatgcattgagatttgtttttgtct 5331  T
Q  164 actacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtggaaagtcta 214  Q
    | || |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5330 attatatctacaatgtatatgtcccgtgcggcagcacgggtggaaagtcta 5280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0896 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0896
Description:

Target: scaffold0896; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1137
Alignment:
Q  156 ttttgtctactacatctacaatgtatataacccgtacggcagcacgggtgga 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1086 ttttgtctactacacttacaatgtatatgacccgtgcggcagcacgggtgga 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University