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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19094_low_9 (Length: 309)

Name: NF19094_low_9
Description: NF19094
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19094_low_9
NF19094_low_9
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-288)||(14173919-14174204)
chr4 (1-288)||(14178673-14178958)
chr4 (1-288)||(28606904-28607189)
chr4 (1-288)||(28611666-28611951)
chr4 (1-285)||(44161571-44161851)
chr4 (1-283)||(11104456-11104734)
chr4 (1-208)||(48826796-48827000)
chr4 (2-103)||(48708155-48708256)
chr4 (18-111)||(24726288-24726381)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-288)||(12930658-12930943)
chr8 (1-288)||(12935404-12935689)
chr8 (41-111)||(26504985-26505055)
chr8 (19-109)||(15588948-15589038)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (1-288)||(34907121-34907406)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (1-288)||(37040524-37040809)
chr7 (1-285)||(15290223-15290495)
chr7 (4-285)||(12098988-12099263)
chr7 (54-283)||(12082002-12082227)
chr7 (1-111)||(2757309-2757418)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (1-288)||(42911088-42911372)
chr5 (1-281)||(29106973-29107249)
chr5 (4-88)||(38997236-38997320)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (4-288)||(8539165-8539449)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (125-288)||(51302143-51302306)
chr3 (1-33)||(51302308-51302340)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (4-88)||(2100298-2100379)
chr6 (81-111)||(2100723-2100753)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14174204 - 14173919
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14174204 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 14174105  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14174104 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 14174007  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14174006 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 14173919  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14178958 - 14178673
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14178958 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 14178859  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14178858 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 14178761  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14178760 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 14178673  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 28606904 - 28607189
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28606904 caccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 28607003  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28607004 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 28607101  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28607102 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 28607189  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 28611666 - 28611951
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28611666 caccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 28611765  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28611766 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 28611863  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28611864 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 28611951  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44161851 - 44161571
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44161851 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tct 44161754  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44161753 ctccactctcttacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 44161656  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44161655 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctctacacaca 44161571  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11104734 - 11104456
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  11104734 caccaatatttaacatagaaaatcctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattct 11104636  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11104635 ctccactctcttacacacaa---agagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatag 11104539  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacaca 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11104538 agatgatatccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacaca 11104456  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 48826796 - 48827000
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48826796 caccaatatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 48826894  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    || | ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48826895 cttcgctctct--tacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatag 48826992  T
Q  201 agatgata 208  Q
    ||||||||    
T  48826993 agatgata 48827000  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 103
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
Q  2 accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc 101  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48708155 accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc 48708254  T
Q  102 tc 103  Q
    ||    
T  48708255 tc 48708256  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726381
Alignment:
Q  18 gaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct 111  Q
    ||||||| |||||||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  24726288 gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctct 24726381  T

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Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12930943 - 12930658
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930943 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 12930844  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12930843 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 12930746  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12930745 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 12930658  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12935689 - 12935404
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12935689 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 12935590  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12935589 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 12935492  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12935491 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 12935404  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Original strand, 26504985 - 26505055
Alignment:
Q  41 aaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct 111  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  26504985 aaaaccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatattctttcaactctct 26505055  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15589038 - 15588948
Alignment:
Q  19 aaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactct 109  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| || | |||||||||  ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  15589038 aaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaacattttctccactct 15588948  T

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Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 34907406 - 34907121
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34907406 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 34907307  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34907306 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 34907209  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34907208 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 34907121  T

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Target: chr7 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 37040524 - 37040809
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37040524 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatttt 37040623  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37040624 ctccactctctcacacacaca--agagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag 37040721  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37040722 agatgatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacag 37040809  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15290495 - 15290223
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15290495 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattct 15290396  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  15290395 ctccactctct--tacacacacaagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctat--tatttcagcacctagaagttatag 15290301  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  15290300 agatgatacccacccggtgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactcta------ttctcacacacttctacacaca 15290223  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12099263 - 12098988
Alignment:
Q  4 caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc 103  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12099263 caatattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctc 12099164  T
Q  104 cactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagaga 203  Q
    ||||||||            ||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  12099163 cactctct--tacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagaga 12099066  T
Q  204 tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacaca 285  Q
    |||||| ||| |  | ||||||  | | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  12099065 tgatactcactcaatctatttt--cgaga--ctctgaatttactcaacactctatttttcctttcacatacttctacacaca 12098988  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12082002
Alignment:
Q  54 aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagac 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||            |||||||||||||||||||||   ||||||    
T  12082227 aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaa--agagatacaatatagtgtttctaatgagac 12082131  T
Q  154 ctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacac 253  Q
       || |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  12082130 tcgctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacac 12082032  T
Q  254 tctatttttcttctcacacacttctacaca 283  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  12082031 tctaattttctgatcacacacttctacaca 12082002  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 2757309 - 2757418
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    |||||||||||||  || ||| |||| |||| || | |||||||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  2757309 caccaatatttaatatgaaaacccctttaatgcttaaggaaaaaccatgagacaaattttgaaaa-tattccactatatttaaaaatattgcactattct 2757407  T
Q  101 ctccactctct 111  Q
    |||||||||||    
T  2757408 ctccactctct 2757418  T

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Target: chr5 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 42911088 - 42911372
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42911088 caccaatatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattct 42911186  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42911187 ctccactctctcacacacaca--aaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatag 42911284  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42911285 agatgatacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacag 42911372  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 29106973 - 29107249
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29106973 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct 29107072  T
Q  101 ctccactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    |||||||||||            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  29107073 ctccactctct--tacacacacaagagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataa 29107169  T
Q  201 agatgata-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctaca 281  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  29107170 agatgataccccacccaatgtatttttcccacactctctggatttactcaaca--ctattttttctctcacacacttctaca 29107249  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 38997236 - 38997320
Alignment:
Q  4 caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 88  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38997236 caatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata 38997320  T

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Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8539449 - 8539165
Alignment:
Q  4 caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8539449 caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctc 8539350  T
Q  104 cactctctnnnnnnnnnnnnagagatacaatat---agtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatag 200  Q
    ||||||||            |||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  8539349 cactctcttacacacaca--agagatacaatattatagtgtttcc-gtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatag 8539253  T
Q  201 agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8539252 agatgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacag 8539165  T

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Target: chr3 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 125 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302143
Alignment:
Q  125 gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatattatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51302306 gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt 51302207  T
Q  225 ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcacacacttctacacacacag 288  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51302206 tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacag 51302143  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 51302340 - 51302308
Alignment:
Q  1 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51302340 caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac 51302308  T

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Target: chr6 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 88
Target Start/End: Original strand, 2100298 - 2100379
Alignment:
Q  4 caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 88  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2100298 caatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaac---ggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata 2100379  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 111
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100753
Alignment:
Q  81 aaagaatattacaatattctctccactctct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2100723 aaagaatattacaatattctctccactctct 2100753  T

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