View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19097_low_9 (Length: 515)

Name: NF19097_low_9
Description: NF19097
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19097_low_9
NF19097_low_9
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (119-311)||(29518493-29518685)
chr6 (119-310)||(32741170-32741361)
chr6 (120-309)||(29518912-29519101)
chr6 (141-309)||(2378118-2378286)
chr6 (153-309)||(3409251-3409407)
chr6 (143-309)||(35210196-35210362)
chr6 (120-295)||(16454913-16455088)
chr6 (120-299)||(2578420-2578598)
chr6 (142-309)||(3409652-3409819)
chr6 (133-309)||(14748332-14748504)
chr6 (119-308)||(1846741-1846929)
chr6 (132-309)||(3415450-3415629)
chr6 (119-299)||(16454577-16454757)
chr6 (142-309)||(3058218-3058385)
chr6 (143-301)||(2579872-2580030)
chr6 (141-299)||(2377756-2377914)
chr6 (153-309)||(26544041-26544197)
chr6 (120-295)||(2843560-2843736)
chr6 (152-299)||(16107680-16107827)
chr6 (132-301)||(10074352-10074521)
chr6 (143-310)||(1127351-1127518)
chr6 (130-301)||(593694-593867)
chr6 (143-301)||(10073991-10074149)
chr6 (127-300)||(2578819-2578991)
chr6 (122-299)||(5832007-5832182)
chr6 (130-296)||(2579479-2579645)
chr6 (120-301)||(10073593-10073772)
chr6 (158-298)||(1950200-1950340)
chr6 (146-298)||(6999799-6999951)
chr6 (119-299)||(2579086-2579261)
chr6 (193-296)||(32460630-32460733)
chr6 (147-301)||(10911565-10911720)
chr6 (144-299)||(16108065-16108208)
chr6 (176-295)||(9062383-9062501)
chr6 (127-301)||(12071675-12071849)
chr6 (143-301)||(12092482-12092640)
chr6 (149-306)||(5958613-5958766)
chr6 (127-301)||(12085018-12085191)
chr6 (176-301)||(6071132-6071257)
chr6 (182-301)||(8481927-8482045)
chr6 (142-297)||(17135068-17135223)
chr6 (146-301)||(31714671-31714823)
chr6 (185-286)||(2975567-2975668)
chr6 (228-281)||(35210498-35210551)
chr6 (150-197)||(3409405-3409452)
chr6 (189-233)||(22605301-22605345)
chr6 (182-233)||(11637760-11637811)
chr6 (119-173)||(2975033-2975087)
chr6 (218-264)||(14789279-14789325)
chr6 (189-233)||(21130103-21130147)
chr6 (119-294)||(30618594-30618766)
chr6 (151-209)||(10902438-10902496)
chr6 (183-225)||(11638053-11638095)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (310-502)||(34405208-34405405)
chr2 (134-309)||(36178596-36178771)
chr2 (120-309)||(5542602-5542791)
chr2 (145-309)||(37106180-37106344)
chr2 (119-310)||(37105915-37106106)
chr2 (119-299)||(6421387-6421567)
chr2 (133-309)||(14745657-14745833)
chr2 (119-309)||(5542974-5543164)
chr2 (130-309)||(41283462-41283641)
chr2 (135-299)||(15880265-15880429)
chr2 (119-301)||(962598-962779)
chr2 (119-301)||(42514649-42514831)
chr2 (120-283)||(36178148-36178311)
chr2 (142-301)||(35580723-35580881)
chr2 (119-299)||(6712978-6713160)
chr2 (143-294)||(15511495-15511646)
chr2 (133-299)||(36005870-36006035)
chr2 (142-285)||(6422126-6422269)
chr2 (145-296)||(33731653-33731804)
chr2 (150-309)||(14745300-14745460)
chr2 (120-288)||(23346250-23346417)
chr2 (144-301)||(38796619-38796778)
chr2 (146-301)||(40679632-40679787)
chr2 (119-309)||(1769884-1770074)
chr2 (142-299)||(40733519-40733676)
chr2 (162-297)||(28254258-28254391)
chr2 (145-301)||(28531316-28531472)
chr2 (18-118)||(34405403-34405503)
chr2 (120-301)||(7598228-7598409)
chr2 (148-301)||(37632602-37632755)
chr2 (194-309)||(36178320-36178435)
chr2 (148-309)||(7598601-7598754)
chr2 (120-290)||(40163349-40163520)
chr2 (157-299)||(5367457-5367599)
chr2 (121-239)||(6421793-6421911)
chr2 (142-299)||(40733885-40734041)
chr2 (144-301)||(29676903-29677065)
chr2 (153-301)||(12529038-12529186)
chr2 (194-301)||(16542449-16542556)
chr2 (143-293)||(29676543-29676687)
chr2 (193-301)||(31468800-31468904)
chr2 (130-301)||(16590888-16591054)
chr2 (119-301)||(30313178-30313359)
chr2 (142-299)||(29874022-29874179)
chr2 (213-298)||(31899496-31899581)
chr2 (133-247)||(3673122-3673236)
chr2 (189-293)||(37895107-37895211)
chr2 (185-298)||(31259658-31259774)
chr2 (183-301)||(33561491-33561609)
chr2 (223-301)||(38796298-38796376)
chr2 (133-229)||(3672773-3672869)
chr2 (142-239)||(6421688-6421785)
chr2 (184-301)||(30323464-30323581)
chr2 (143-298)||(9231252-9231407)
chr2 (183-301)||(37894732-37894850)
chr2 (244-301)||(36785664-36785721)
chr2 (156-248)||(36784273-36784365)
chr2 (131-301)||(29873525-29873695)
chr2 (196-285)||(28254165-28254254)
chr2 (193-301)||(33953821-33953929)
chr2 (185-300)||(31385738-31385853)
chr2 (120-211)||(31899080-31899170)
chr2 (120-237)||(35580414-35580534)
chr2 (119-259)||(30312831-30312972)
chr2 (194-298)||(12910231-12910335)
chr2 (194-301)||(41678419-41678527)
chr2 (145-298)||(3594180-3594333)
chr2 (253-299)||(6421306-6421352)
chr2 (188-247)||(25390313-25390372)
chr2 (183-234)||(28226404-28226455)
chr2 (239-286)||(42515031-42515078)
chr2 (183-301)||(33954302-33954419)
chr2 (202-259)||(2336666-2336723)
chr2 (265-301)||(3673085-3673121)
chr2 (183-231)||(8904498-8904546)
chr2 (183-230)||(28226726-28226772)
chr2 (185-234)||(13792536-13792585)
chr2 (265-301)||(3672719-3672755)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (133-309)||(44290814-44290991)
chr1 (133-309)||(44290448-44290624)
chr1 (143-310)||(3537599-3537766)
chr1 (143-310)||(41759474-41759641)
chr1 (131-299)||(17294579-17294748)
chr1 (141-301)||(41142372-41142533)
chr1 (146-309)||(48588491-48588654)
chr1 (147-310)||(3550711-3550871)
chr1 (142-299)||(26661521-26661678)
chr1 (144-301)||(41157375-41157532)
chr1 (142-301)||(41156991-41157150)
chr1 (119-301)||(31767137-31767319)
chr1 (119-309)||(50052000-50052189)
chr1 (141-293)||(14318875-14319027)
chr1 (133-301)||(34364507-34364675)
chr1 (133-300)||(40082408-40082574)
chr1 (141-299)||(11977282-11977440)
chr1 (151-301)||(34364925-34365075)
chr1 (152-299)||(37556113-37556260)
chr1 (142-301)||(29798199-29798358)
chr1 (127-301)||(3875315-3875489)
chr1 (141-299)||(34649440-34649598)
chr1 (120-301)||(45084382-45084557)
chr1 (174-307)||(32594747-32594880)
chr1 (121-301)||(37850579-37850758)
chr1 (143-309)||(32168698-32168853)
chr1 (142-309)||(45493973-45494145)
chr1 (143-301)||(5319965-5320123)
chr1 (119-301)||(22077471-22077653)
chr1 (158-304)||(38804370-38804516)
chr1 (143-297)||(9955911-9956067)
chr1 (119-301)||(66448-66630)
chr1 (122-299)||(26661877-26662054)
chr1 (119-298)||(37555733-37555910)
chr1 (141-301)||(24600312-24600472)
chr1 (142-301)||(39066200-39066358)
chr1 (119-301)||(41184382-41184583)
chr1 (222-309)||(3537226-3537313)
chr1 (120-301)||(24131965-24132143)
chr1 (181-309)||(44043810-44043943)
chr1 (142-295)||(5575110-5575261)
chr1 (142-276)||(22077109-22077243)
chr1 (132-301)||(66078-66247)
chr1 (151-291)||(5528762-5528902)
chr1 (119-301)||(22077805-22077986)
chr1 (149-300)||(22793279-22793431)
chr1 (122-301)||(19283434-19283613)
chr1 (153-299)||(45839629-45839779)
chr1 (153-301)||(30630648-30630796)
chr1 (135-230)||(11977015-11977110)
chr1 (153-301)||(44685456-44685605)
chr1 (133-301)||(21378049-21378199)
chr1 (120-231)||(50051666-50051776)
chr1 (127-301)||(1188571-1188746)
chr1 (154-274)||(4956218-4956340)
chr1 (183-259)||(10351202-10351278)
chr1 (183-301)||(1187404-1187522)
chr1 (144-286)||(44091909-44092051)
chr1 (269-309)||(50051777-50051817)
chr1 (254-301)||(35154150-35154197)
chr1 (242-301)||(50469180-50469239)
chr1 (235-301)||(4878803-4878869)
chr1 (207-252)||(41184152-41184197)
chr1 (143-202)||(4266798-4266855)
chr1 (186-246)||(35154046-35154106)
chr1 (236-309)||(4266875-4266948)
chr1 (183-219)||(12466365-12466401)
chr1 (269-301)||(22077248-22077280)
chr1 (233-292)||(30630912-30630972)
chr1 (249-301)||(47379891-47379943)
chr1 (143-230)||(47380167-47380254)
chr1 (143-301)||(5996872-5997029)
chr1 (182-228)||(9956212-9956258)
chr1 (144-260)||(9499020-9499136)
chr1 (183-219)||(31973375-31973411)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (121-309)||(3669679-3669867)
chr8 (147-309)||(3670052-3670214)
chr8 (120-309)||(30441073-30441266)
chr8 (134-299)||(3038281-3038446)
chr8 (133-310)||(1014234-1014412)
chr8 (133-299)||(34835211-34835377)
chr8 (120-310)||(20870550-20870742)
chr8 (134-299)||(34834878-34835043)
chr8 (153-301)||(45122067-45122215)
chr8 (151-309)||(1013879-1014037)
chr8 (121-299)||(37544469-37544646)
chr8 (133-301)||(6876852-6877021)
chr8 (133-299)||(40518071-40518239)
chr8 (142-298)||(147454-147610)
chr8 (147-294)||(9482608-9482755)
chr8 (130-276)||(9483174-9483320)
chr8 (143-301)||(9608745-9608903)
chr8 (119-291)||(18371969-18372142)
chr8 (133-301)||(9309355-9309522)
chr8 (144-299)||(33113368-33113523)
chr8 (133-299)||(34835476-34835643)
chr8 (133-299)||(34835742-34835909)
chr8 (130-299)||(30359273-30359443)
chr8 (145-299)||(40518584-40518738)
chr8 (131-301)||(45121898-45122068)
chr8 (142-299)||(1513914-1514071)
chr8 (143-299)||(25561815-25561972)
chr8 (142-287)||(45122638-45122783)
chr8 (127-307)||(40579490-40579670)
chr8 (143-301)||(5915872-5916025)
chr8 (147-299)||(30359611-30359763)
chr8 (141-294)||(70272-70425)
chr8 (142-301)||(45123006-45123165)
chr8 (151-309)||(6731896-6732045)
chr8 (143-301)||(8918764-8918922)
chr8 (120-301)||(41972158-41972341)
chr8 (145-301)||(5420651-5420807)
chr8 (120-294)||(18371637-18371807)
chr8 (133-301)||(9308977-9309149)
chr8 (144-297)||(18380020-18380171)
chr8 (150-299)||(45121663-45121811)
chr8 (142-294)||(6651510-6651653)
chr8 (127-298)||(32640515-32640682)
chr8 (142-307)||(32305478-32305636)
chr8 (153-301)||(147829-147968)
chr8 (132-226)||(40579258-40579352)
chr8 (119-301)||(4154644-4154824)
chr8 (223-310)||(41416251-41416336)
chr8 (150-301)||(9507777-9507933)
chr8 (164-278)||(9609108-9609222)
chr8 (188-298)||(43274824-43274934)
chr8 (121-301)||(9620656-9620834)
chr8 (183-299)||(8794113-8794229)
chr8 (197-297)||(18372988-18373085)
chr8 (229-298)||(18372785-18372854)
chr8 (193-299)||(18372656-18372758)
chr8 (128-223)||(41129066-41129161)
chr8 (152-297)||(43398077-43398225)
chr8 (142-219)||(8919143-8919220)
chr8 (152-301)||(12283873-12284021)
chr8 (229-298)||(18372342-18372411)
chr8 (211-298)||(3037776-3037865)
chr8 (228-291)||(25561729-25561792)
chr8 (183-301)||(4154321-4154438)
chr8 (196-296)||(20130454-20130553)
chr8 (134-207)||(43274626-43274699)
chr8 (122-201)||(18372262-18372342)
chr8 (175-301)||(5274775-5274901)
chr8 (120-224)||(20995393-20995497)
chr8 (133-190)||(3037959-3038016)
chr8 (257-298)||(18372485-18372526)
chr8 (209-265)||(18373236-18373292)
chr8 (202-298)||(40991756-40991852)
chr8 (163-220)||(16524446-16524503)
chr8 (193-230)||(12156708-12156745)
chr8 (244-301)||(20995502-20995559)
chr8 (224-301)||(33831978-33832055)
chr8 (183-247)||(40417756-40417820)
chr8 (202-243)||(11442911-11442952)
chr8 (133-165)||(3038042-3038074)
chr8 (269-301)||(18645713-18645745)
chr8 (150-206)||(34629708-34629764)
[»] chr5 (78 HSPs)
chr5 (130-309)||(6500443-6500621)
chr5 (120-301)||(40296292-40296473)
chr5 (120-310)||(27502013-27502203)
chr5 (121-301)||(3294993-3295172)
chr5 (130-309)||(6500815-6500993)
chr5 (121-298)||(3295323-3295498)
chr5 (133-301)||(15370099-15370267)
chr5 (121-309)||(32487386-32487573)
chr5 (147-310)||(18603124-18603287)
chr5 (142-308)||(41170627-41170793)
chr5 (133-309)||(624188-624364)
chr5 (144-304)||(36492218-36492378)
chr5 (157-301)||(13415774-13415918)
chr5 (130-298)||(25327938-25328106)
chr5 (133-299)||(42405588-42405752)
chr5 (142-301)||(41632782-41632941)
chr5 (127-300)||(299490-299664)
chr5 (122-309)||(9498634-9498820)
chr5 (136-294)||(11416970-11417128)
chr5 (130-299)||(1028504-1028673)
chr5 (118-299)||(6224198-6224379)
chr5 (147-291)||(34753029-34753173)
chr5 (130-301)||(36568556-36568725)
chr5 (142-301)||(12662651-12662810)
chr5 (152-299)||(26074614-26074761)
chr5 (135-310)||(623809-623984)
chr5 (150-299)||(26075168-26075318)
chr5 (152-301)||(26074155-26074304)
chr5 (128-275)||(15370428-15370575)
chr5 (147-289)||(33747783-33747925)
chr5 (143-301)||(35150007-35150164)
chr5 (163-310)||(5723811-5723958)
chr5 (144-299)||(24489207-24489360)
chr5 (166-304)||(29549278-29549416)
chr5 (151-296)||(38427553-38427697)
chr5 (180-299)||(26074818-26074938)
chr5 (120-299)||(300961-301132)
chr5 (142-301)||(26590909-26591068)
chr5 (142-299)||(35167837-35167994)
chr5 (119-298)||(2411010-2411189)
chr5 (120-298)||(35914852-35915029)
chr5 (226-310)||(7768841-7768925)
chr5 (120-215)||(26899995-26900089)
chr5 (193-300)||(36521946-36522053)
chr5 (172-298)||(36522266-36522392)
chr5 (206-299)||(42508614-42508707)
chr5 (119-214)||(38427306-38427402)
chr5 (221-299)||(26074320-26074398)
chr5 (183-301)||(31509623-31509742)
chr5 (120-298)||(41635170-41635346)
chr5 (169-287)||(31509745-31509864)
chr5 (165-217)||(795254-795306)
chr5 (183-234)||(13042606-13042657)
chr5 (220-299)||(39309686-39309764)
chr5 (183-299)||(13786041-13786157)
chr5 (206-299)||(42524719-42524811)
chr5 (143-243)||(13785632-13785732)
chr5 (183-243)||(32445943-32446003)
chr5 (163-230)||(9498343-9498410)
chr5 (187-234)||(13112604-13112651)
chr5 (165-244)||(36527117-36527196)
chr5 (241-298)||(6225047-6225104)
chr5 (261-309)||(5660290-5660338)
chr5 (176-264)||(19275566-19275653)
chr5 (147-199)||(24489583-24489635)
chr5 (183-221)||(13042784-13042822)
chr5 (183-221)||(13112782-13112820)
chr5 (259-301)||(35150747-35150789)
chr5 (259-301)||(35151038-35151080)
chr5 (252-310)||(22298956-22299015)
chr5 (183-234)||(36389016-36389067)
chr5 (189-219)||(5963765-5963795)
chr5 (118-196)||(35150810-35150887)
chr5 (145-243)||(42435486-42435583)
chr5 (189-230)||(34103625-34103666)
chr5 (120-179)||(795081-795141)
chr5 (266-298)||(13785732-13785764)
chr5 (189-233)||(41341523-41341567)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (119-301)||(1085592-1085774)
chr7 (119-309)||(37532987-37533176)
chr7 (119-309)||(37533340-37533530)
chr7 (134-301)||(23368-23535)
chr7 (133-294)||(11845198-11845359)
chr7 (130-301)||(7517580-7517751)
chr7 (132-299)||(30244272-30244439)
chr7 (130-301)||(22567026-22567196)
chr7 (146-307)||(29157559-29157720)
chr7 (141-301)||(40094772-40094932)
chr7 (131-299)||(45433243-45433411)
chr7 (136-299)||(6054562-6054725)
chr7 (119-299)||(30245079-30245255)
chr7 (151-301)||(36939741-36939891)
chr7 (142-301)||(24177435-24177594)
chr7 (120-295)||(34218011-34218186)
chr7 (134-299)||(45434638-45434803)
chr7 (119-299)||(47129097-47129276)
chr7 (175-301)||(7554025-7554151)
chr7 (154-299)||(45754718-45754862)
chr7 (146-309)||(14681502-14681663)
chr7 (153-293)||(19122740-19122879)
chr7 (133-296)||(30032572-30032735)
chr7 (130-301)||(8128428-8128599)
chr7 (121-301)||(36622960-36623140)
chr7 (182-301)||(22566702-22566820)
chr7 (143-301)||(118299-118459)
chr7 (145-298)||(9901648-9901799)
chr7 (181-301)||(16569196-16569316)
chr7 (181-301)||(16596346-16596466)
chr7 (133-280)||(37167808-37167949)
chr7 (142-301)||(40230290-40230449)
chr7 (142-301)||(41854635-41854793)
chr7 (166-298)||(24838724-24838857)
chr7 (122-259)||(30253534-30253667)
chr7 (175-301)||(1085280-1085407)
chr7 (119-220)||(47129450-47129550)
chr7 (146-298)||(20599317-20599471)
chr7 (152-301)||(36534795-36534942)
chr7 (121-213)||(37532729-37532821)
chr7 (180-301)||(43241495-43241616)
chr7 (149-298)||(41910592-41910749)
chr7 (145-255)||(28300255-28300366)
chr7 (213-301)||(28301613-28301701)
chr7 (228-301)||(30245494-30245567)
chr7 (228-301)||(30255339-30255412)
chr7 (231-301)||(30244701-30244771)
chr7 (233-301)||(36109007-36109075)
chr7 (144-218)||(28300569-28300644)
chr7 (196-296)||(44361517-44361616)
chr7 (120-200)||(30244453-30244533)
chr7 (120-200)||(30253671-30253751)
chr7 (183-234)||(21416181-21416232)
chr7 (119-200)||(30245256-30245337)
chr7 (184-232)||(23569043-23569091)
chr7 (183-301)||(4124128-4124246)
chr7 (264-307)||(14681281-14681324)
chr7 (251-301)||(40094502-40094552)
chr7 (189-234)||(21619091-21619136)
chr7 (154-233)||(40094424-40094503)
chr7 (152-206)||(4719305-4719359)
chr7 (249-299)||(36967335-36967385)
chr7 (156-218)||(45755010-45755072)
chr7 (122-259)||(15902342-15902478)
chr7 (183-301)||(37345916-37346036)
chr7 (141-246)||(37393114-37393218)
chr7 (120-180)||(5825562-5825621)
chr7 (189-233)||(27391815-27391859)
chr7 (194-234)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (130-309)||(50630740-50630919)
chr4 (142-310)||(55933121-55933289)
chr4 (141-310)||(41370348-41370517)
chr4 (133-301)||(25483336-25483504)
chr4 (130-299)||(36629239-36629408)
chr4 (122-301)||(44620660-44620838)
chr4 (141-304)||(50002423-50002586)
chr4 (133-301)||(54017583-54017751)
chr4 (153-301)||(52884695-52884844)
chr4 (133-301)||(3340807-3340975)
chr4 (127-299)||(39792842-39793014)
chr4 (114-301)||(36608630-36608817)
chr4 (131-301)||(10245920-10246089)
chr4 (144-301)||(1731646-1731803)
chr4 (130-299)||(39404020-39404189)
chr4 (153-286)||(54108928-54109060)
chr4 (144-299)||(39404400-39404555)
chr4 (119-292)||(44621011-44621181)
chr4 (119-301)||(22027935-22028117)
chr4 (143-299)||(36572021-36572177)
chr4 (142-301)||(22183261-22183420)
chr4 (119-292)||(44620362-44620532)
chr4 (119-301)||(49076806-49076986)
chr4 (160-301)||(4955332-4955473)
chr4 (181-309)||(49880152-49880280)
chr4 (141-291)||(54343004-54343147)
chr4 (144-299)||(34646648-34646803)
chr4 (144-298)||(50459724-50459878)
chr4 (119-295)||(20825842-20826019)
chr4 (133-282)||(54936215-54936363)
chr4 (130-301)||(2740700-2740869)
chr4 (153-301)||(52884887-52885038)
chr4 (150-301)||(32941128-32941279)
chr4 (141-283)||(18932745-18932887)
chr4 (142-301)||(22028366-22028527)
chr4 (143-298)||(49302907-49303064)
chr4 (148-295)||(20826223-20826370)
chr4 (143-300)||(16888814-16888971)
chr4 (120-300)||(16889511-16889691)
chr4 (146-301)||(4390102-4390257)
chr4 (142-302)||(54108537-54108695)
chr4 (120-301)||(34004560-34004739)
chr4 (133-301)||(49076439-49076604)
chr4 (175-286)||(45496820-45496931)
chr4 (143-301)||(3244449-3244607)
chr4 (192-301)||(2741071-2741180)
chr4 (119-247)||(23817653-23817783)
chr4 (183-299)||(41707503-41707618)
chr4 (178-309)||(6975489-6975620)
chr4 (130-261)||(43827480-43827610)
chr4 (142-301)||(3341128-3341287)
chr4 (119-250)||(31691203-31691336)
chr4 (147-299)||(43174508-43174661)
chr4 (120-301)||(51768035-51768216)
chr4 (155-299)||(19504707-19504842)
chr4 (130-301)||(54741165-54741334)
chr4 (120-255)||(18879852-18879987)
chr4 (144-299)||(45489331-45489485)
chr4 (141-301)||(3700365-3700517)
chr4 (142-301)||(28034229-28034388)
chr4 (193-288)||(54017750-54017845)
chr4 (164-299)||(40067045-40067181)
chr4 (141-280)||(48111694-48111833)
chr4 (142-279)||(3271806-3271948)
chr4 (183-296)||(760194-760306)
chr4 (212-301)||(10246347-10246436)
chr4 (249-310)||(50788087-50788148)
chr4 (160-259)||(15841383-15841482)
chr4 (235-293)||(44620304-44620362)
chr4 (118-276)||(39698917-39699077)
chr4 (133-209)||(43174233-43174309)
chr4 (235-301)||(44621426-44621492)
chr4 (169-298)||(34544107-34544239)
chr4 (142-295)||(45489711-45489864)
chr4 (127-187)||(11702281-11702341)
chr4 (169-301)||(23556890-23557022)
chr4 (183-234)||(11197293-11197344)
chr4 (235-299)||(44620946-44621011)
chr4 (119-238)||(11783527-11783646)
chr4 (213-301)||(11348396-11348484)
chr4 (183-295)||(15841023-15841134)
chr4 (119-191)||(19895406-19895477)
chr4 (183-234)||(10396198-10396249)
chr4 (183-234)||(10396483-10396534)
chr4 (147-221)||(41370738-41370812)
chr4 (182-234)||(922485-922537)
chr4 (194-233)||(1868119-1868158)
chr4 (185-243)||(11706584-11706641)
chr4 (189-235)||(51681604-51681650)
chr4 (272-309)||(18932887-18932924)
chr4 (147-188)||(23817457-23817498)
chr4 (187-247)||(2891864-2891924)
chr4 (253-301)||(45050601-45050649)
chr4 (132-176)||(45496675-45496719)
chr4 (183-234)||(11197003-11197054)
chr4 (278-309)||(18933103-18933134)
chr4 (203-246)||(45484774-45484817)
chr4 (183-257)||(31249896-31249970)
chr4 (183-225)||(41707279-41707321)
chr4 (185-223)||(50788034-50788072)
chr4 (260-301)||(11706636-11706677)
chr4 (205-238)||(29802604-29802637)
chr4 (264-309)||(41370693-41370738)
chr4 (183-219)||(34946151-34946187)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (142-309)||(22304561-22304728)
chr3 (128-299)||(43346775-43346947)
chr3 (120-301)||(32589704-32589884)
chr3 (142-299)||(35946524-35946681)
chr3 (130-299)||(37990626-37990795)
chr3 (131-301)||(29644890-29645060)
chr3 (119-299)||(37990952-37991133)
chr3 (132-301)||(42342377-42342546)
chr3 (142-301)||(12114561-12114720)
chr3 (120-301)||(29644558-29644739)
chr3 (145-301)||(15772854-15773010)
chr3 (142-301)||(33803251-33803410)
chr3 (152-310)||(39389061-39389219)
chr3 (133-299)||(52634678-52634843)
chr3 (151-309)||(39934963-39935123)
chr3 (133-301)||(54017806-54017974)
chr3 (142-301)||(25739424-25739583)
chr3 (142-301)||(54018197-54018356)
chr3 (146-299)||(32462903-32463057)
chr3 (142-301)||(41359764-41359919)
chr3 (127-299)||(25755396-25755568)
chr3 (145-301)||(42342092-42342248)
chr3 (120-301)||(15773192-15773375)
chr3 (142-301)||(21832344-21832501)
chr3 (160-309)||(4823647-4823796)
chr3 (142-310)||(50612446-50612619)
chr3 (142-299)||(22303954-22304104)
chr3 (121-299)||(3135432-3135617)
chr3 (169-294)||(3135099-3135224)
chr3 (143-301)||(31190017-31190167)
chr3 (141-301)||(53577364-53577524)
chr3 (146-301)||(45395656-45395811)
chr3 (130-301)||(1634302-1634473)
chr3 (120-299)||(32462536-32462715)
chr3 (154-301)||(39914252-39914399)
chr3 (143-299)||(45901715-45901872)
chr3 (142-300)||(53117974-53118131)
chr3 (143-301)||(8327904-8328066)
chr3 (151-299)||(49336694-49336843)
chr3 (142-301)||(44160546-44160702)
chr3 (150-301)||(9240149-9240300)
chr3 (141-309)||(37726496-37726656)
chr3 (146-243)||(22303662-22303759)
chr3 (130-299)||(33175646-33175820)
chr3 (135-298)||(11661954-11662117)
chr3 (147-309)||(51886553-51886709)
chr3 (148-291)||(42584829-42584970)
chr3 (169-301)||(47964544-47964676)
chr3 (177-275)||(33362327-33362425)
chr3 (142-227)||(41359490-41359575)
chr3 (194-309)||(3384317-3384432)
chr3 (246-309)||(22304238-22304301)
chr3 (120-301)||(39336208-39336387)
chr3 (209-298)||(7767380-7767469)
chr3 (142-231)||(54017547-54017636)
chr3 (142-301)||(47964914-47965073)
chr3 (183-299)||(11661537-11661638)
chr3 (193-298)||(46546375-46546480)
chr3 (245-301)||(43346650-43346706)
chr3 (142-192)||(22304302-22304352)
chr3 (175-259)||(39336002-39336086)
chr3 (191-251)||(52634990-52635050)
chr3 (130-197)||(8328374-8328441)
chr3 (154-259)||(12749211-12749316)
chr3 (183-299)||(25991405-25991521)
chr3 (183-234)||(53596027-53596078)
chr3 (183-234)||(53596342-53596393)
chr3 (119-173)||(9239941-9239995)
chr3 (134-221)||(43978856-43978947)
chr3 (189-246)||(17731950-17732007)
chr3 (189-246)||(19033181-19033238)
chr3 (169-298)||(25317161-25317290)
chr3 (183-234)||(53596542-53596593)
chr3 (187-234)||(48127859-48127906)
chr3 (142-219)||(7766782-7766857)
chr3 (269-301)||(12747878-12747910)
chr3 (189-233)||(16871005-16871049)
chr3 (189-233)||(17735037-17735081)
chr3 (189-233)||(19036306-19036350)
chr3 (131-170)||(41360125-41360164)
chr3 (189-234)||(16143505-16143550)
chr3 (189-230)||(16869843-16869884)
chr3 (235-296)||(36986040-36986101)
chr3 (235-296)||(37011479-37011540)
chr3 (202-238)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (141-299)||(512-670)
scaffold0702 (141-309)||(145-308)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (133-299)||(1096-1262)
scaffold0391 (119-254)||(1659-1802)
scaffold0391 (250-301)||(3092-3143)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (142-301)||(47360-47519)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (152-301)||(5396-5546)
scaffold0734 (152-301)||(5777-5931)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (181-301)||(5357-5477)
scaffold0078 (150-301)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (185-301)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (224-299)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (169-299)||(39459-39588)
scaffold0113 (176-299)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (223-307)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (223-263)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 119 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29518685 - 29518493
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29518685 ctgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggt 29518586  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518585 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaag 29518493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32741361 - 32741170
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32741361 ctgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggt 32741262  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741261 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 32741170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29519101 - 29518912
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29519101 tgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggta 29519002  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519001 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2378286 - 2378118
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2378286 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctctta 2378187  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378186 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 2378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409251
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 143 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35210362 - 35210196
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35210362 ggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttact 35210263  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210262 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16455088 - 16454913
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455088 tgttggattatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggca 16454989  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454988 ataggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 299
Target Start/End: Original strand, 2578420 - 2578598
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2578420 tgttgggtcatgaggggggctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggct 2578519  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2578520 atgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3409819 - 3409652
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409819 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 3409720  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409719 ttataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Original strand, 14748332 - 14748504
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14748332 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatggg 14748427  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748428 tcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 119 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1846929 - 1846741
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1846929 ctgttgggtcatg-gggaagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggc 1846831  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 308  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846830 aatggatttatgggtgctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 132 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3415629 - 3415450
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctaga--acaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3415629 aggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttat 3415530  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3415529 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaaca 3415450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16454757 - 16454577
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16454757 ctgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggc 16454658  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454657 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3058385 - 3058218
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3058385 gggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatac 3058286  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058285 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 2579872 - 2580030
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2579872 ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttact 2579971  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579972 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2377914 - 2377756
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377914 cgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 2377815  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377814 cttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544041
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2843736 - 2843560
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843736 tgttggatcatgaggggagttagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggca 2843637  T
Q  220 atgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843636 atgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107680
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Original strand, 10074352 - 10074521
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10074352 aggggagcctgggggactatccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 10074451  T
Q  232 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074452 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127351
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaacaa 1127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593867
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  228 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 10073991 - 10074149
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073991 ggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 10074090  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074091 tataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 300
Target Start/End: Original strand, 2578819 - 2578991
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2578819 tcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtt 2578918  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578919 tatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832182
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |    
T  5832007 ttgggtcatgaggggagc-ctggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-t 5832104  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832105 ggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 296
Target Start/End: Original strand, 2579479 - 2579645
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  | || ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2579479 tgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 2579578  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579579 gggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 10073593 - 10073772
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| |||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10073593 tgttgggtcacgaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagcca 10073692  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073693 atgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 158 - 298
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  158 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  258 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Original strand, 2579086 - 2579261
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |     
T  2579086 ctgttgggtcatgaggggagctcgggg-accgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagt 2579184  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
     |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579185 tatgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  293 acac 296  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911565
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  247 aggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108065
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 295
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  176 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 275  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  276 tgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Original strand, 12071675 - 12071849
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  12071675 tcatgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtt 12071774  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| ||||| |   |||||| |||||||| ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071775 tatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 12092482 - 12092640
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  12092482 ggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcact 12092581  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092582 tataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 306
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958766
Alignment:
Q  149 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcaca----caagagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacca 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Original strand, 12085018 - 12085191
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    |||||||||||||   || |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12085018 tcatgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttt 12085117  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| ||||| |   |||||| |||||||| ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085118 tatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6071257 - 6071132
Alignment:
Q  176 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 275  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||| | |    
T  6071257 acaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaa 6071158  T
Q  276 tgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6071157 tgtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481927
Alignment:
Q  182 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  282 acatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 297
Target Start/End: Original strand, 17135068 - 17135223
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||    ||||| |||||||  ||||||| |    
T  17135068 gggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgc 17135167  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 297  Q
    ||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135168 ttataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714671
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttat 31714726  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |    |||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714725 ataacgttcaacctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 284  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  285 ta 286  Q
    ||    
T  2975568 ta 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  228 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 233
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  182 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2975087 - 2975033
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2975087 ctgttggatcatgagaggagcgcgtgggacctgccacatcgaggctagaacaacc 2975033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 264
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 30618594 - 30618766
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||   |||||||  ||||||  |||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  30618594 ctgttgggtcacgaggggagccttggggaccacccacatt-aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagac 30618692  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    ||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618693 aa-cggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttcatcctccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 10902438 - 10902496
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 209  Q
    |||||||| |||  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902438 tccacatctaggtcagaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 225
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 310 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 34405405 - 34405208
Alignment:
Q  310 aggtggaaaatagtattgattccaatggacgaaaaacgatgaaatagagttgaaattttactagttattgagattttcctgaattcacatttccattagc 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34405405 aggtggaaaatagtattgattccaatggacgaaaaacgatgaaatagagttgaaattttactagttattgagattttcttgaattcacatttccattagc 34405306  T
Q  410 gtagtctaagaaagttgtaaagtaattaatggagtttattttataatagtgttggat-----atgaggtgtattagtgagtccacttgttataatatt 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405305 gtagtctaagaaagttgtaaagtaattaatggagtttattttataatagtgttggatatgatatgaggtgtattagtgagtccacttgttataatatt 34405208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 134 - 309
Target Start/End: Original strand, 36178596 - 36178771
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178596 gggagcgcgggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 36178695  T
Q  234 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178696 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaaca 36178771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Original strand, 5542602 - 5542791
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5542602 tgttggatcatggggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 5542701  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542702 ataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5542791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106180
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37106180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 119 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37106106 - 37105915
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37106106 ctgttgggtcacaaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggc 37106007  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37106006 aatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacccacaa 37105915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6421567 - 6421387
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6421567 ctgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggc 6421468  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421467 aatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Original strand, 14745657 - 14745833
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745657 ggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 14745756  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745757 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 119 - 309
Target Start/End: Original strand, 5542974 - 5543164
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5542974 ctgttggatcatggggggagctcaaggtaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggc 5543073  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543074 aataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5543164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 130 - 309
Target Start/End: Original strand, 41283462 - 41283641
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41283462 tgaggggagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttat 41283561  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283562 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15880429 - 15880265
Alignment:
Q  135 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880429 ggagctcggaggaacgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 15880330  T
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880329 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 962779 - 962598
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  962779 ctgttggatcatg-ggggagttcgggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagac 962681  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962680 aatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42514831 - 42514649
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42514831 ctgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggc 42514732  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514731 gatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 120 - 283
Target Start/End: Original strand, 36178148 - 36178311
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36178148 tgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggca 36178247  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 283  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178248 atgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 35580723 - 35580881
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  35580723 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcac 35580821  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580822 ttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6713160 - 6712978
Alignment:
Q  119 ctgttggatca-tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaag 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  6713160 ctgttggatcagtgagggaagttcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaa 6713061  T
Q  217 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713060 gcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 294
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 36005870 - 36006035
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36005870 ggggagctcgagagactgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 36005969  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005970 tcctcttacttataaggtgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 6422269 - 6422126
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6422269 gggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaa 6422170  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422169 ttataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731653
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 309
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745460
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgc-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaaca 14745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23346417 - 23346250
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  23346417 tgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggct 23346318  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 288  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346317 atgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 301
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796778
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679787
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1770074 - 1769884
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||  |||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || ||    
T  1770074 ctgttgggtcattgggggagctaggaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagc 1769975  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769974 tatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40733676 - 40733519
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||    
T  40733676 gggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttac 40733577  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733576 ttataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  162 gctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 261  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  262 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 297  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531472
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34405503 - 34405403
Alignment:
Q  18 aattagcggagtggaaaaatatgtttccccatcaaatgcaattagagattgtagtggaaaaacgcaatgcgatttgtgattgatgataggtactgtggag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405503 aattagcggagtggaaaaatatgtttccccatcaaatgcaattagagattgtagtggaaaaacgcaatgcgatttgtgattgatgataggtactgtggag 34405404  T
Q  118 g 118  Q
    |    
T  34405403 g 34405403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7598409 - 7598228
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  7598409 tgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggct 7598310  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598309 atgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 301
Target Start/End: Original strand, 37632602 - 37632755
Alignment:
Q  148 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37632602 ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataa 37632701  T
Q  248 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
      |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632702 aatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 309
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  294 cacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598601
Alignment:
Q  148 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  248 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaaca 7598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Original strand, 40163349 - 40163520
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggc 218  Q
    |||||| ||||  ||||||| | || |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  40163349 tgttgggtcatagggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagac 40163448  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 290  Q
    | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163449 actaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  157 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  257 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtcatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 6421812  T
Q  221 tgggtttatgggtcctctt 239  Q
    | |||||||||||||||||    
T  6421811 taggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40734041 - 40733885
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| | ||||||||    
T  40734041 gggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtagg-ttatgagccctcttac 40733943  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733942 ttataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676903
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg-----tcctct 238  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||     ||||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  239 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529186
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  294 cacttgca 301  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa------aaggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  293 acacttgca 301  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16591054 - 16590888
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16591054 tgaggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttat 16590955  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||      |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590954 gggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30313359 - 30313178
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30313359 ctgttgggtcacgaggagagcccgggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggc 30313260  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30313259 aatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 29874022 - 29874179
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  29874022 gggggaccgcccacatccaggccaaagcaaccgcacaagtgggatagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaa 29874121  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29874122 ttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  213 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3673236 - 3673122
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  3673236 ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatgga 3673137  T
Q  233 tcctcttacttataa 247  Q
    |||||||||||||||    
T  3673136 tcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 293
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  289 actca 293  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 298
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  282 acatataactcacactt 298  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561609
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 301
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796376
Alignment:
Q  223 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3672869 - 3672773
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3672869 ggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6421785 - 6421688
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 239  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421785 ggggtaccgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323464
Alignment:
Q  184 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  284 atataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894850
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37894832 catataactcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785721
Alignment:
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 248
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  156 atcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 248  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873695
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||  || |||||| | ||||| || | ||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T
Q  231 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29873625 agtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  196 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 285  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  293 acacttgca 301  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31385853 - 31385738
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 284  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || || |||||||  |||     
T  31385853 agagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttctaaccgatgtcagact 31385754  T
Q  285 tataactcacacttgc 300  Q
    | ||||||||||||||    
T  31385753 tctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 211
Target Start/End: Original strand, 31899080 - 31899170
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899080 tgttggatcatgaggggagcttgggg-accgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 35580414 - 35580534
Alignment:
Q  120 tgttggatcatga-ggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaa 215  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || | | | ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  35580414 tgttgggtcatgaaggggagctcgggggaaccgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaa 35580512  T
Q  216 ggcaatgggtttatgggtcctc 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  35580513 ggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30312972 - 30312831
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagca-agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30312972 ctgttgggtcacgaggggagctcgggggaccacccacattcaggccagagcaaccgcacaaattgagagagactacacacttttacccaaaaccttaagg 30312873  T
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
     |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312872 aaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  294 cactt 298  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 301
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678527
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  292 cacacttgca 301  Q
    ||||||||||    
T  41678518 cacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || | ||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  188 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515031
Alignment:
Q  239 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 33954302 - 33954419
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||  ||| || |||| |||||||||    
T  33954302 agagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacctcaacttttctatctgatgtggga 33954400  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33954401 catataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  202 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  265 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  265 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Original strand, 44290814 - 44290991
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290814 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 44290913  T
Q  232 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290914 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Original strand, 44290448 - 44290624
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290448 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 44290547  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290548 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 143 - 310
Target Start/End: Original strand, 3537599 - 3537766
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3537599 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttact 3537698  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  3537699 cataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaacaa 3537766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 143 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759474
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaacaa 41759474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17294748 - 17294579
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc-gcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294748 gaggggagctcgggcgaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 17294649  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294648 gggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41142533 - 41142372
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41142533 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttt 41142434  T
Q  240 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142433 acttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588654
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaaca 48588654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550711
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgccaaccaacaa 3550711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 26661521 - 26661678
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26661521 gggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcac 26661620  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661621 ttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157375
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41157150 - 41156991
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41157150 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttac 41157051  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157050 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 31767137 - 31767319
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31767137 ctgttgggtcatgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggc 31767236  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767237 attaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 119 - 309
Target Start/End: Original strand, 50052000 - 50052189
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  50052000 ctgttgggtcacgaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaa 50052098  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052099 aataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14319027 - 14318875
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  14319027 cgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttctta 14318928  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318927 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34364675 - 34364507
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  34364675 ggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacgga 34364576  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364575 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 133 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40082574 - 40082408
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  40082574 ggggagctcggaggactatccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat-ga 40082476  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082475 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11977440 - 11977282
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  11977440 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctctta 11977341  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977340 cttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34365075 - 34364925
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34365075 tccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 34364976  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364975 gttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556113
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  252 ttcaacctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29798358 - 29798199
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29798358 gggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttac 29798259  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798258 ttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Original strand, 3875315 - 3875489
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3875315 tcatgaggggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtt 3875414  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875415 tatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34649598 - 34649440
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |    
T  34649598 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgca 34649499  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649498 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084382
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  45084557 tgttgggtcatgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagac- 45084459  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084458 -----gttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 307
Target Start/End: Original strand, 32594747 - 32594880
Alignment:
Q  174 gcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32594747 gcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatct 32594846  T
Q  274 gatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594847 gatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 37850579 - 37850758
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||     
T  37850579 gttggatcatgaggggagctagggg-accgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacat 37850677  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850678 taggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 309
Target Start/End: Original strand, 32168698 - 32168853
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        
T  32168698 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct---- 32168793  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168794 --taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 309
Target Start/End: Original strand, 45493973 - 45494145
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45493973 gggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttac 45494072  T
Q  242 ttataa----ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494073 ttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaaca 45494145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320123
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 22077471 - 22077653
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22077471 ctgttgggtcacaaggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 22077570  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077571 tacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 304
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  158 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  258 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 304  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9956067 - 9955911
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt-atgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9956067 ggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttac 9955968  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 297  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955967 ttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 66448 - 66630
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  66448 ctgttgggtcatgaggggagcttggataaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggc 66547  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66548 catatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
Target Start/End: Original strand, 26661877 - 26662054
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| |||| ||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661877 ttgggtcacgaggggagctagggagaccatccgcatcaaggattgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 26661976  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26661977 cggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37555910 - 37555733
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||  ||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37555910 ctgttgggtcattgggggagctcgagcgaccg-ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37555812  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
     | || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555811 taaggattta-aggtcctcttacttataatgtattcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Original strand, 24600312 - 24600472
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  24600312 cggggaactgtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctctta 24600411  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600412 cttataatatgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 39066200 - 39066358
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||     
T  39066200 gggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttag 39066298  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066299 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 41184382 - 41184583
Alignment:
Q  119 ctgttggatca-tgaggggagcgcggggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac---cacactcttacccaaaac--- 210  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||       
T  41184382 ctgttggatcagtgaggggagctcggggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccgcacaagtaagagcgacaatatcacactcttacccaaaacctt 41184481  T
Q  211 -----------cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41184482 aaggctgaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 41184581  T
Q  300 ca 301  Q
    ||    
T  41184582 ca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 309
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537313
Alignment:
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 24131965 - 24132143
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| |||||||||| || | || || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  24131965 tgttgggtcatgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggca 24132061  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132062 atgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 309
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043943
Alignment:
Q  181 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  275 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaaca 44043943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5575261 - 5575110
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  5575261 gggggacattccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttac 5575164  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575163 ttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 22077109 - 22077243
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22077109 gggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttac 22077208  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  22077209 ttataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Original strand, 66078 - 66247
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  66078 aggggagctcgggggattgtctacatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgg 66175  T
Q  232 gtcctcttacttataaggtgttc-aacctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  66176 gtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 291
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 22077805 - 22077986
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  22077805 ctgttgggtcacaaggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggc 22077903  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22077904 tatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793279
Alignment:
Q  149 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  248 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 301
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283613
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19283434 ttgggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgat 19283533  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    | ||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283534 gagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839629
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  253 tc-----aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630796
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
      |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11977110 - 11977015
Alignment:
Q  135 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977110 ggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44685605 - 44685456
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgc-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||||  ||| ||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  44685605 cacatcgaggttagaactacccccacaagagagaaagacgtcacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggtt 44685507  T
Q  252 ttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44685506 ttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 21378049 - 21378199
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||                  ||||||||||||    
T  21378049 ggggagcgcaggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta------------------tgggtttatggg 21378130  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378131 tcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Original strand, 50051666 - 50051776
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  50051666 tgttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacatcgatgctagaacaaca-cataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagata 50051764  T
Q  220 atgggtttatgg 231  Q
    ||||||||||||    
T  50051765 atgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 301
Target Start/End: Original strand, 1188571 - 1188746
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcg-ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 225  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||  |||||| |||  ||| ||||| || |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  1188571 tcatgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagt 1188670  T
Q  226 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188671 ttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  154 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccg 274  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 1187404 - 1187522
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||    
T  1187404 agagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgaga 1187503  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1187504 catataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44092051 - 44091909
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| ||||    
T  44092051 gggaccgtctacatcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcactt 44091952  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 286  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091951 ataaagtgttcaacctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 309
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051817
Alignment:
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50051817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 301
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  254 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469239
Alignment:
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  207 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 4266798 - 4266855
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4266798 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaac--cacaagtaagagagacatcacactctta 4266855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  186 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  236 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 301
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 292
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 47380167 - 47380254
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||  ||||||| ||||| || |||||  |||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47380167 ggggaccacccacatctaggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 5996872 - 5997029
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||| | |||||||  ||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| | |    
T  5996872 ggggactgcccacatctcggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctcatt 5996970  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||  ||||||| |   ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996971 tataaaatgttcaagcaccacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  182 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9499136 - 9499020
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||||||||||  ||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||| ||||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||| || |    
T  9499136 gggaccgtccacatataggataaaacaaccacacaagtaaaagtgacaccacacttttatccaaaatttgaaggtaatgaatttataggtcatctaacat 9499037  T
Q  244 ataaggtgttcaacctt 260  Q
    ||||  |||||||||||    
T  9499036 ataaaatgttcaacctt 9499020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3669867 - 3669679
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669867 gttgggtcacgaggggagctagggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 3669768  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669767 tgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3669679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 147 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3670214 - 3670052
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3670214 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttata 3670115  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670114 aggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 120 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30441266 - 30441073
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| |||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441266 tgttgggtcacgaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30441167  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttactta----taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441166 atgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 30441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 3038281 - 3038446
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038281 gggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 3038380  T
Q  234 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038381 ccttttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Original strand, 1014234 - 1014412
Alignment:
Q  133 ggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||    
T  1014234 ggggagctcgggggaaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgg 1014333  T
Q  232 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014334 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaacaa 1014412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835211
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 310
Target Start/End: Original strand, 20870550 - 20870742
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20870550 tgttgggtcatgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggca 20870649  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20870650 gtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaacaa 20870742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34835043 - 34834878
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34835043 gggagcgcaagggatcatccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagt 34834944  T
Q  234 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834943 catcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122215
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014037
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 299
Target Start/End: Original strand, 37544469 - 37544646
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37544469 gttgggtcatgaggggaactcgggg-atcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaa 37544567  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544568 tggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 6876852 - 6877021
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  6876852 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatggg 6876951  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 301  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876952 tcatcttatttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40518239 - 40518071
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40518239 ggggagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatggg 40518140  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518139 tccatttacttataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 147610 - 147454
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  147610 gggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttat 147511  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147510 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 294
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 276
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9608903 - 9608745
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  9608903 gggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttact 9608804  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608803 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 18371969 - 18372142
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18371969 ctgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaag 18372068  T
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372069 caatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9309522 - 9309355
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||    
T  9309522 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaaggg 9309424  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309423 tcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113523
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835476
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835742
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30359443 - 30359273
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 228  Q
    |||||||||| || |||| || ||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30359443 tgaggggagctcgagggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggttta 30359344  T
Q  229 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359343 tgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518584
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 45121898 - 45122068
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45121898 gaggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatg 45121997  T
Q  231 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45121998 agtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 1513914 - 1514071
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1513914 gggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttac 1514013  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514014 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Original strand, 25561815 - 25561972
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25561815 ggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 25561914  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561915 ttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45122783 - 45122638
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45122783 gggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 45122684  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45122683 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 127 - 307
Target Start/End: Original strand, 40579490 - 40579670
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    ||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  40579490 tcatgtggggagcatggaggatcgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtt 40579589  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579590 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915872
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359611
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Original strand, 70272 - 70425
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70272 cgggagaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctctta 70371  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70372 cttataagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45123165 - 45123006
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 239  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  45123165 gggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctt 45123066  T
Q  240 acttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123065 actta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6732045 - 6731896
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||            
T  6732045 tccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact-------- 6731954  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6731953 -ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaaca 6731896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918922
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41972341 - 41972158
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaag 216  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| |    
T  41972341 tgttgggtcatg-ggggagttcgggagaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatg 41972243  T
Q  217 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972242 gcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420651
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 294
Target Start/End: Original strand, 18371637 - 18371807
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371637 tgttgggtcatgaggagagctcgggggaaccgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 18371736  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    | |||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371737 a-tgggtttatgggtcttcttacttaa----tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9309149 - 9308977
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9309149 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttat 9309051  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309050 gggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 297
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 299
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121811
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6651653 - 6651510
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||     
T  6651653 gggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta- 6651555  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
            | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6651554 --------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Original strand, 32640515 - 32640682
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcggg-ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 225  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640515 tcatgaggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 32640614  T
Q  226 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||| ||||||||||| ||     ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640615 ttatcggtcctcttaccta-----tgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32305636 - 32305478
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32305636 gggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttac 32305537  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305536 ttataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacatataactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147829
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 40579258 - 40579352
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579258 aggggagctcgggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 4154644 - 4154824
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||||| |||||  || ||||||   |||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4154644 ctgttgggtcatgaagggagtccgagggaccactcacatctaggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggc 4154741  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154742 aatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416336
Alignment:
Q  223 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaacaa 41416336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507777
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  250 tgttcaacctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 301  Q
    | |||||||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  164 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 263  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  264 tattttatccgatgt 278  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 298
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  188 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  288 aactcacactt 298  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 9620656 - 9620834
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||  ||||||||| || |||||||   |||| ||||||||||    
T  9620656 gttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaa 9620753  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| || |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620754 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  283 catataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 297
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  197 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  229 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 299
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  293 acacttg 299  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41129161 - 41129066
Alignment:
Q  128 catgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129161 catgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataag 248  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| |||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 297  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 8919143 - 8919220
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919143 gggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283873
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  229 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 298
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  211 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 298  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 291
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  228 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154438
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  4154420 catataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  196 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Original strand, 43274626 - 43274699
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274626 gggagctcgggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Original strand, 18372262 - 18372342
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcggggga-ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18372262 ttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgtccacatcgagactaaagcaaccgcacaagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5274901 - 5274775
Alignment:
Q  175 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 274  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||||| |     
T  5274901 cacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattca 5274802  T
Q  275 atgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274801 atgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 224
Target Start/End: Original strand, 20995393 - 20995497
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| |||||||||  | ||||||  ||| ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20995393 tgttgggtcacgaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 20995492  T
Q  220 atggg 224  Q
    |||||    
T  20995493 atggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 3037959 - 3038016
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagac 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3037959 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  257 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 265
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  209 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 265  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991756
Alignment:
Q  202 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  163 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 230
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  224 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Original strand, 40417756 - 40417820
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417756 agagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  202 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Original strand, 3038042 - 3038074
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggcta 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3038042 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggcta 3038074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 301
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Original strand, 34629708 - 34629764
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccca 206  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  34629708 gtccacatcaaggccataactaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccca 34629764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 78)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 130 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6500621 - 6500443
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6500621 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaa 6500522  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500521 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 40296292 - 40296473
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40296292 tgttgggtcatgagggaggcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggca 40296391  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296392 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 120 - 310
Target Start/End: Original strand, 27502013 - 27502203
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  27502013 tgttgggtcatgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggca 27502112  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502113 ataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 27502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Original strand, 3294993 - 3295172
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3294993 gttggatcatgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaa 3295092  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295093 tgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 130 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6500993 - 6500815
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6500993 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttat 6500894  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500893 gggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 298
Target Start/End: Original strand, 3295323 - 3295498
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3295323 gttggatcatgaggggagtgagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaa 3295421  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295422 ttggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15370267 - 15370099
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  15370267 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatggg 15370168  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370167 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32487573 - 32487386
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487573 gttgggtcatgggggaagcttgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaa 32487474  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487473 tgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 310
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603287
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaacaa 18603287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41170793 - 41170627
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170793 gggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 41170694  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170693 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 624364 - 624188
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  624364 ggggagctcggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatggg 624265  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624264 tcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 624188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 304
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492378
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 301
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415918
Alignment:
Q  157 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  257 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25328106 - 25327938
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25328106 tgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttat 25328007  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25328006 gggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 42405588 - 42405752
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  42405588 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgag 42405685  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405686 tccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41632941 - 41632782
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41632941 gggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttac 41632842  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632841 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 299664 - 299490
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgc-gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 225  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  299664 tcatgaggggagctccgggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagt 299565  T
Q  226 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299564 ttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 309
Target Start/End: Original strand, 9498634 - 9498820
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9498634 ttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacattgaggctagaccagca-cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaat 9498732  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9498733 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcacatttgcaaaccaaca 9498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 294
Target Start/End: Original strand, 11416970 - 11417128
Alignment:
Q  136 gagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 235  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11416970 gagcgagggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcc 11417069  T
Q  236 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417070 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Original strand, 1028504 - 1028673
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||    
T  1028504 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttat 1028603  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028604 gggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6224379 - 6224198
Alignment:
Q  118 gctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    ||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6224379 gctgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaagg 6224280  T
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224279 cgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753173
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 36568556 - 36568725
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36568556 tgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttac 36568653  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568654 gggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 12662651 - 12662810
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||    
T  12662651 gggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttac 12662750  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662751 ttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074614
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 26074662  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26074661 ttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 623984 - 623809
Alignment:
Q  135 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||    
T  623984 ggagctcgggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctc 623885  T
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623884 aacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacaa 623809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 299
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075318
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074304
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtg 26074254  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074255 ttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15370575 - 15370428
Alignment:
Q  128 catgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 227  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15370575 catgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggttt 15370476  T
Q  228 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15370475 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 289  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35150164 - 35150007
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  35150164 ggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttact 35150066  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150065 tataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723958
Alignment:
Q  163 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  263 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 5723958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 24489207 - 24489360
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  24489207 gggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttacta 24489304  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489305 ataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 166 - 304
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  166 gaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 265  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  266 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 304  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Original strand, 26074818 - 26074938
Alignment:
Q  180 gcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt 278  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26074818 gcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26074917  T
Q  279 gggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26074918 gggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 301132 - 300961
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| |||| |||||||  ||| ||||||| ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  301132 tgttgggtcattaggggagttcggaggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggca 301033  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| ||        |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301032 atggatt--------ctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 26590909 - 26591068
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  26590909 ggggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttac 26591008  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591009 ttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 35167837 - 35167994
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || |||    
T  35167837 gggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctac 35167936  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167937 ttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2411189 - 2411010
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    |||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |   |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  2411189 ctgttgaatcacaaggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggc 2411090  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411089 aataagtttatgggttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35915029 - 35914852
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| | || ||| |  | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| ||||    
T  35915029 tgttgggtcatgagcggagct-gggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggca 35914931  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35914930 atggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768841
Alignment:
Q  226 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaacaa 7768841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 215
Target Start/End: Original strand, 26899995 - 26900089
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 215  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26899995 tgttgggtcatg-ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 300
Target Start/End: Original strand, 36521946 - 36522053
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  36521946 cacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactc 36522045  T
Q  293 acacttgc 300  Q
    ||||||||    
T  36522046 acacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Original strand, 36522266 - 36522392
Alignment:
Q  172 ccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 271  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || |||    
T  36522266 ccgcacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctat 36522365  T
Q  272 ccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  36522366 ccaatgtgagacatataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  206 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38427402 - 38427306
Alignment:
Q  119 ctgttggatcat-gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 214  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427402 ctgttggatcatcgaagggagctcgggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509623
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 281  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  282 acatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 298
Target Start/End: Original strand, 41635170 - 41635346
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||  | | |||| |||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  41635170 tgttggatcatgaggggagtgaggg--acagtccacattaaagatagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagaca 41635267  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635268 atggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31509864 - 31509745
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 267  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  31509864 caaccgtacaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccactttt 31509765  T
Q  268 ttatccgatgtgggacatat 287  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  31509764 ctatccgatgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  165 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Original strand, 13786041 - 13786157
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |    
T  13786041 agagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaa 13786139  T
Q  283 cat-ataactcacacttg 299  Q
    ||| || |||||||||||    
T  13786140 cataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  206 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 243
Target Start/End: Original strand, 13785632 - 13785732
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  13785632 ggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattact 13785731  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  13785732 t 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  163 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  187 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 244
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  165 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660290
Alignment:
Q  261 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaaca 5660290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  176 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 264  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489583
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactc 199  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  259 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  259 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299015
Alignment:
Q  252 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaacaa 22299015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35150887 - 35150810
Alignment:
Q  118 gctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccaca 196  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||    
T  35150887 gctgttgggtcatg-ggggagcaagggggaccatccacatcgaggctaaaacaatcacactagtgagagagacaccaca 35150810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42435583 - 42435486
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  42435583 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacacttatgagagagacatcacactctgattcaaaaccttaaggtaat-agattatggatcctcttactt 42435486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 795081 - 795141
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcggggg-accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaa 179  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  795081 tgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgtctacatcgaggctaaaataaccacacaa 795141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785764
Alignment:
Q  266 ttttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacactt 13785764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 1085592 - 1085774
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1085592 ctgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 1085691  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085692 aatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 119 - 309
Target Start/End: Original strand, 37532987 - 37533176
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37532987 ctgttgggtcacgatgggagcgcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggc 37533085  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533086 aatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37533176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 119 - 309
Target Start/End: Original strand, 37533340 - 37533530
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533340 ctgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37533439  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533440 aatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 301
Target Start/End: Original strand, 23368 - 23535
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23368 gggagctcgggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggt 23467  T
Q  234 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23468 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11845359 - 11845198
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845359 ggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatggg 11845260  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845259 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7517751 - 7517580
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517751 tgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 7517652  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517651 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 132 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30244439 - 30244272
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30244439 aggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatga 30244340  T
Q  232 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244339 gtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 22567026 - 22567196
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22567026 tgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttat 22567125  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567126 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157559
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Original strand, 40094772 - 40094932
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40094772 cgggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctctta 40094871  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094872 cttataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 131 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433243
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  231 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6054725 - 6054562
Alignment:
Q  136 gagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 235  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6054725 gagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcc 6054626  T
Q  236 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054625 tcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30245255 - 30245079
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245255 ctgttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 30245160  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245159 aatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 301
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939891
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24177594 - 24177435
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24177594 gggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttac 24177495  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177494 ttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Original strand, 34218011 - 34218186
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34218011 tgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaca 34218110  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218111 atgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45434803 - 45434638
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  45434803 gggagcgagggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggt 45434704  T
Q  234 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434703 cctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 47129276 - 47129097
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  47129276 ctgttggatcatgaggggagctcgggg-accgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagc 47129178  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129177 gatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7554151 - 7554025
Alignment:
Q  175 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554151 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 7554052  T
Q  275 atgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7554051 atgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754718
Alignment:
Q  154 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 253  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  254 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681502
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 14681502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30032735 - 30032572
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  30032735 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatgga 30032636  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032635 tactcttacttataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 8128428 - 8128599
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8128428 tgaggggagtgcgggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttat 8128527  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128528 gggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622960
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtcatgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaa 36623041  T
Q  221 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36623040 tggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566820
Alignment:
Q  182 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  282 acatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566801 acatattactcacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 118299 - 118459
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  118299 ggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctctta 118398  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118399 cttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  181 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  281 gacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 301
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  181 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  281 gacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37167949 - 37167808
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  37167949 ggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatgga 37167850  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 280  Q
    ||||||||||       |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37167849 tcctcttact------ctgttcaacatttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 40230290 - 40230449
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40230290 ggggaaccgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttac 40230389  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230390 ttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41854793 - 41854635
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| |    
T  41854793 gggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgc 41854694  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854693 ttataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 298
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  166 gaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  265 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30253667 - 30253534
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30253667 ttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 30253572  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30253571 gagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085407
Alignment:
Q  175 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 274  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  275 atgtgggacat-ataactcacacttgca 301  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47129550 - 47129450
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129550 ctgttgggtcatgaggggagctcgggg-accgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 47129452  T
Q  219 aa 220  Q
    ||    
T  47129451 aa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599317
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534942
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Original strand, 37532729 - 37532821
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532729 gttggatcacgaggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  180 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 279  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  280 ggacatataactcacacttgca 301  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 298
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  149 cgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc--------ttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||| |||| |        ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Original strand, 28300255 - 28300366
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28300255 ggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttactt 28300354  T
Q  244 ataaggtgttca 255  Q
    ||||||||||||    
T  28300355 ataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 301
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  213 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  228 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  228 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  231 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 301
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  196 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30244533 - 30244453
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct 200  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244533 tgttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30253751 - 30253671
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct 200  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253751 tgttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30245337 - 30245256
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactct 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245337 ctgttgggtcataaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  184 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  264 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 301
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094503
Alignment:
Q  154 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 206
Target Start/End: Original strand, 4719305 - 4719359
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccca 206  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719305 ccacaacgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45755072 - 45755010
Alignment:
Q  156 atcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755072 atcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15902478 - 15902342
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||  ||||||| |||| ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||     
T  15902478 ttgggtcacgaggggagtccgggggaccacccacatccaggc-agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaac 15902380  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    | | ||||| ||  | | |||||||| |||||||||||    
T  15902379 gagcttatgtgtgatttcacttataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345916
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  283 c--atataactcacacttgca 301  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgca 37345916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37393218 - 37393114
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||    |||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||| |||| |||||    
T  37393218 cgggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttat-ggtcatctta 37393120  T
Q  241 cttata 246  Q
    ||||||    
T  37393119 cttata 37393114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 180
Target Start/End: Original strand, 5825562 - 5825621
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaag 180  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5825562 tgttgggtcatgaggg-agcttgggagaccgtccacatcaaggctagaacaaccgcacaag 5825621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 309
Target Start/End: Original strand, 50630740 - 50630919
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630740 tgaggggagctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 50630839  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50630840 gggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaaca 50630919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 310
Target Start/End: Original strand, 55933121 - 55933289
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933121 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 55933220  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933221 ttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 55933289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41370517 - 41370348
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370517 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 41370418  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370417 cttataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 41370348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25483504 - 25483336
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25483504 ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgga 25483405  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483404 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36629408 - 36629239
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36629408 tgaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 36629309  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629308 gggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 122 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44620838 - 44620660
Alignment:
Q  122 ttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44620838 ttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat 44620739  T
Q  222 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620738 -ggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 141 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50002586 - 50002423
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  50002586 cgggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctctta 50002487  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 304  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002486 cttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 54017583 - 54017751
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54017583 ggggagctagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54017682  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017683 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884695
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3340975 - 3340807
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3340975 ggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatggg 3340876  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340875 tcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 299
Target Start/End: Original strand, 39792842 - 39793014
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39792842 tcatgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtt 39792941  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792942 tacggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 301
Target Start/End: Original strand, 36608630 - 36608817
Alignment:
Q  114 ggaggctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 213  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608630 ggagggtgttgggtcacgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctt 36608729  T
Q  214 aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608730 aagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10246089 - 10245920
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  10246089 gaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat- 10245991  T
Q  231 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10245990 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 301
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731803
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39404189 - 39404020
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  39404189 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttat 39404090  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404089 gagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404400
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44621181 - 44621011
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44621181 ctgttggatcatgagaggagcg---gggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagac 44621085  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621084 aatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 22027935 - 22028117
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22027935 ctgttgggtcatgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggc 22028034  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028035 aatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572021
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 22183261 - 22183420
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22183261 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 22183360  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183361 ttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44620532 - 44620362
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44620532 ctgttggatcatgagaggagcg---gggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggc 44620436  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620435 aatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 301
Target Start/End: Original strand, 49076806 - 49076986
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  49076806 ctgttgggtcatgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggt 49076904  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076905 tatgggtttatgggttctcttac-tataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  160 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  260 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49880280 - 49880152
Alignment:
Q  181 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49880280 caagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgg 49880181  T
Q  281 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880180 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 141 - 291
Target Start/End: Original strand, 54343004 - 54343147
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  54343004 cgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctctta 54343096  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343097 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646803
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20826019 - 20825842
Alignment:
Q  119 ctgttggatcat-gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826019 ctgttggatcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagg 20825920  T
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    | |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825919 ctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 54936363 - 54936215
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936363 ggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54936265  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54936264 tcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740700
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaacc--acaagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884887
Alignment:
Q  153 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 301
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941279
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 283
Target Start/End: Original strand, 18932745 - 18932887
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18932745 cgggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 18932844  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 283  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932845 tttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtaggac 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 22028366 - 22028527
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22028366 gggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttac 22028465  T
Q  242 ttataaggtgttcaaccttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    | |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028466 taataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 49303064 - 49302907
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac- 241  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49303064 ggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 49302965  T
Q  242 -ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302964 tttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  148 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  248 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 300
Target Start/End: Original strand, 16888814 - 16888971
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  16888814 ggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttact 16888913  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888914 tataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 16889511 - 16889691
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16889511 tgttgggtcacgtggggagctcgagggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggca 16889610  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
     | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889611 gtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390257
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || |||||||||||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 54108695 - 54108537
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  54108695 gggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtcctttta 54108597  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108596 cttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 34004560 - 34004739
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |    
T  34004560 tgttgggtcatgagaggagctcgggagaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-a 34004658  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004659 atgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 49076439 - 49076604
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||| | ||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  49076439 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttatagg 49076535  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076536 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45496931 - 45496820
Alignment:
Q  175 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45496931 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccg 45496832  T
Q  275 atgtgggacata 286  Q
    ||||||||||||    
T  45496831 atgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Original strand, 3244449 - 3244607
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3244449 ggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 3244548  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244549 tataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 192 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  192 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  292 cacacttgca 301  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 247
Target Start/End: Original strand, 23817653 - 23817783
Alignment:
Q  119 ctgttggatcat-gaggggagcgc-gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 216  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817653 ctgttggatcatcgaggggagctatgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaag 23817752  T
Q  217 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23817753 gcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  283 catataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 309
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  178 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  278 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43827610 - 43827480
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  43827610 tgagggaagctcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttat 43827512  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 261  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  43827511 gggtcctcttatttataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3341287 - 3341128
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  3341287 gggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttac 3341188  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341187 ttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31691336 - 31691203
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaag 216  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31691336 ctgttgggtcattgggggagctcgaaggatcgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaag 31691237  T
Q  217 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31691236 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43174661 - 43174508
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  43174661 accgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttata 43174562  T
Q  247 aggtgttcaacctttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43174561 aggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 51768035 - 51768216
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||    
T  51768035 tgttgggtcatgagggaagtttgggagaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagaca 51768134  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768135 atgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504707
Alignment:
Q  155 catcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||    
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  255 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 54741165 - 54741334
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    |||||||||| || |||||| || |||  ||||||||||||||  |||  |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||    
T  54741165 tgaggggagcccgagggaccatctacactgaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtat 54741262  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741263 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18879987 - 18879852
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18879987 tgttgggtcattgggggagctcggaggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaa 18879888  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 255  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18879887 ataggtttataggtcatcttacttataaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 299
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489485
Alignment:
Q  144 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  244 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3700517 - 3700365
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| |||    
T  3700517 cgggagaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------cctttta 3700426  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700425 cttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28034388 - 28034229
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||    
T  28034388 gggggaccatccacatccagaccagagcaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcac 28034289  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28034288 ttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacatataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  164 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 262  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  263 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 280
Target Start/End: Original strand, 48111694 - 48111833
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||   |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||    
T  48111694 cgggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtcctttta 48111793  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111794 cttataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3271948 - 3271806
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3271948 gggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctt 3271849  T
Q  240 actt---ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 279  Q
    ||||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271848 acttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 760306 - 760194
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | | || ||| ||||||||||    
T  760306 agagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtggga 760208  T
Q  283 catataactcacac 296  Q
    ||||||||||||||    
T  760207 catataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  212 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788148
Alignment:
Q  249 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaacaa 50788148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 259
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  160 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Original strand, 39698917 - 39699077
Alignment:
Q  118 gctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aa 215  Q
    |||||||||| |||||| |||| |   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  ||    
T  39698917 gctgttggatgatgaggagagctcataggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaa 39699016  T
Q  216 ggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 276  Q
     |  | || ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  39699017 cgacacggatttatggatcctcttacttagaatatgttcaacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43174309 - 43174233
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174309 ggggagctcgggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34544239 - 34544107
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 267  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  34544239 caaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccactttt 34544140  T
Q  268 ttatccgatgtggg--acatataactcacactt 298  Q
     ||| ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  34544139 ctattcgatgtgagatatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 295
Target Start/End: Original strand, 45489711 - 45489864
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || ||||||    
T  45489711 gggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttac 45489810  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 295  Q
    ||||| | | ||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489811 ttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Original strand, 11702281 - 11702341
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 187  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11702281 tcatgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 301
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 268  Q
    ||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 11783527 - 11783646
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  11783527 ctgttgggtcatgaggggtgccagggggaccacccacatctaggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggc 11783626  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctct 238  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  11783627 aataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 301
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  213 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 295
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  283 catataactcaca 295  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19895477 - 19895406
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 191  Q
    ||||||| ||||| |||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19895477 ctgttgggtcatggggggagctatggggacca-ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  182 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 309
Target Start/End: Original strand, 18932887 - 18932924
Alignment:
Q  272 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18932887 ccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaaca 18932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 188
Target Start/End: Original strand, 23817457 - 23817498
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23817457 accgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  187 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  253 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45496719 - 45496675
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgca 176  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45496719 aggggagctcgagggaccgtctacatcgaggctagaacaaccgca 45496675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 309
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933134
Alignment:
Q  278 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  203 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 257  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 225
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 225  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 50788034 - 50788072
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788034 agagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  260 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  205 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370693
Alignment:
Q  264 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaaca 41370693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 219
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22304728 - 22304561
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304728 gggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttac 22304629  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304628 ttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaaca 22304561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 299
Target Start/End: Original strand, 43346775 - 43346947
Alignment:
Q  128 catgaggggagcg-cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43346775 catgaggggagcttcggaggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtt 43346874  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346875 tatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32589884 - 32589704
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  32589884 tgttggatcatgaagggagcgagggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggca 32589785  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589784 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35946681 - 35946524
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35946681 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttac 35946582  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946581 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Original strand, 37990626 - 37990795
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37990626 tgaggagagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 37990725  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990726 gagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 131 - 301
Target Start/End: Original strand, 29644890 - 29645060
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29644890 gaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 29644989  T
Q  231 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29644990 ggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 119 - 299
Target Start/End: Original strand, 37990952 - 37991133
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgagggg-agcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    ||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990952 ctgttgggtcatgagggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 37991051  T
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991052 cgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 132 - 301
Target Start/End: Original strand, 42342377 - 42342546
Alignment:
Q  132 aggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42342377 aggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgg 42342476  T
Q  232 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342477 gtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 12114561 - 12114720
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12114561 gggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttac 12114660  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114661 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 29644558 - 29644739
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||| ||| ||||||||   |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29644558 tgttgggtcacgaggggagtttgggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagaca 29644657  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644658 atgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15773010 - 15772854
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15773010 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactta 15772911  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772910 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 33803251 - 33803410
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33803251 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttac 33803350  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803351 ttatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389061
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  252 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 39389061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 52634843 - 52634678
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634843 ggggagctcgggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 52634744  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634743 t-ctcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 309
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935123
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaaca 39935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 301
Target Start/End: Original strand, 54017806 - 54017974
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  54017806 ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgag 54017905  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017906 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 25739424 - 25739583
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  25739424 gggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttac 25739523  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739524 ttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 54018197 - 54018356
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  54018197 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttac 54018296  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018297 ttataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 299
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463057
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  246 aaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 41359764 - 41359919
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359764 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 41359863  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359864 ttataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25755568 - 25755396
Alignment:
Q  127 tcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 226  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| ||    
T  25755568 tcatgaggggagttcgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatt 25755469  T
Q  227 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755468 tatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 301
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342248
Alignment:
Q  145 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15773375 - 15773192
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15773375 tgttggatcatgaggggagttaggaggatcgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaagg 15773276  T
Q  218 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773275 caatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 21832344 - 21832501
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  21832344 gggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttac 21832441  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832442 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823647
Alignment:
Q  160 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  260 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaaca 4823647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 310
Target Start/End: Original strand, 50612446 - 50612619
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcct 236  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| |||||    
T  50612446 gggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcct 50612545  T
Q  237 cttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612546 cttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 50612619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 22303954 - 22304104
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22303954 gggggacaatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttac 22304053  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304054 ttataag-------acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 299
Target Start/End: Original strand, 3135432 - 3135617
Alignment:
Q  121 gttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3135432 gttgggtcatgaggagagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaa 3135531  T
Q  221 tgggtttat--gggtcctcttac-----ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||  ||||||||||||     | |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135532 tgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31190167 - 31190017
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||    
T  31190167 ggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaact 31190076  T
Q  243 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190075 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 141 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 53577524 - 53577364
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  53577524 cgggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccactta 53577425  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
     || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577424 tttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395811
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 245  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 301
Target Start/End: Original strand, 1634302 - 1634473
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 229  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1634302 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttat 1634400  T
Q  230 gggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634401 gggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 299
Target Start/End: Original strand, 32462536 - 32462715
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  32462536 tgttggatcatgaggggagtttggggg-ccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagca 32462634  T
Q  220 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32462635 ataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914252
Alignment:
Q  154 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  254 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45901872 - 45901715
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 242  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  45901872 ggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttact 45901773  T
Q  243 tataaggtgttcaacc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901772 tataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 300
Target Start/End: Original strand, 53117974 - 53118131
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||    
T  53117974 gggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcac 53118072  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118073 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8328066 - 8327904
Alignment:
Q  143 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagca----agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 238  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  8328066 ggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctct 8327967  T
Q  239 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327966 tacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 299
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336843
Alignment:
Q  151 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaa-gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 44160546 - 44160702
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  44160546 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttat 44160642  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160643 ttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240149
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||| | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37726656 - 37726496
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||||    
T  37726656 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctctta 37726565  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726564 cttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303759
Alignment:
Q  146 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 299
Target Start/End: Original strand, 33175646 - 33175820
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 227  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33175646 tgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagttt 33175745  T
Q  228 at---gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175746 attatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11662117 - 11661954
Alignment:
Q  135 ggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |     
T  11662117 ggagctcgtgggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgagg 11662019  T
Q  234 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11662018 cctctcacttttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 51886709 - 51886553
Alignment:
Q  147 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| | |||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51886709 accgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttacttata 51886616  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886615 tgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 291
Target Start/End: Original strand, 42584829 - 42584970
Alignment:
Q  148 ccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 247  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42584829 ccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaagag--acaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataa 42584926  T
Q  248 ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 291  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42584927 ggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 301
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964676
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 268  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  177 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 275  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 41359490 - 41359575
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41359490 gggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 309
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384432
Alignment:
Q  194 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  294 cacttgcaaaccaaca 309  Q
    | |||||| |||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaaca 3384432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304238
Alignment:
Q  246 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 22304238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 301
Target Start/End: Original strand, 39336208 - 39336387
Alignment:
Q  120 tgttggatcatgaggggagcgc-gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 218  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  39336208 tgttggatcacgaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagc 39336304  T
Q  219 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336305 aatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  209 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Original strand, 54017547 - 54017636
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 231  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017547 gggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Original strand, 47964914 - 47965073
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||| |  | |||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  47964914 gggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcac 47965013  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47965014 ttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  283 catataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 298
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  193 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  293 acactt 298  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  245 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22304352 - 22304302
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304352 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 39336002 - 39336086
Alignment:
Q  175 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336002 cacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  191 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8328441 - 8328374
Alignment:
Q  130 tgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacac 197  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328441 tgaggggagttcgtgggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12749316 - 12749211
Alignment:
Q  154 acatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 253  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  12749316 acatccagactagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgtt 12749217  T
Q  254 caacct 259  Q
    ||||||    
T  12749216 caacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  283 catataactcacacttg 299  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9239995 - 9239941
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaacc 173  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9239995 ctgttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacc 9239941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 43978856 - 43978947
Alignment:
Q  134 gggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacact----cttacccaaaaccttaaggcaat 221  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  43978856 gggagctcgggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 268  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacactt 298  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  183 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  187 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Original strand, 7766782 - 7766857
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 219  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766782 gggggaccatctacatcgaggctagaacaaccatacaag--tgagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 301
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  269 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 170
Target Start/End: Original strand, 41360125 - 41360164
Alignment:
Q  131 gaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaaca 170  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41360125 gaggggagcccggggaaccgtccacatcgaggctagaaca 41360164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 234  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  189 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 230  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  235 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 296  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 238
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  202 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 238  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 141 - 299
Target Start/End: Original strand, 512 - 670
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512 cgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 611  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  612 cttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 141 - 309
Target Start/End: Original strand, 145 - 308
Alignment:
Q  141 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||    
T  145 cgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctctta 239  T
Q  241 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  240 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1262
Alignment:
Q  133 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 232  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1096 ggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgag 1195  T
Q  233 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1196 tcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Original strand, 1659 - 1802
Alignment:
Q  119 ctgttggatcatgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcaca--------agcaagagagacaccacactcttacccaaaac 210  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||         ||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1659 ctgttgggtcacgaggggagctagggggactgcccacatcgaggctagaacaaccacacttgtgtgagagagagagagacaccacactcttaccaaaaac 1758  T
Q  211 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1759 cttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 301
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47519 - 47360
Alignment:
Q  142 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47519 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttac 47420  T
Q  242 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47419 ttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5396
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  251 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5777
Alignment:
Q  152 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 246  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  247 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5357
Alignment:
Q  181 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  281 gacatataactcacacttgca 301  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4982
Alignment:
Q  150 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagg 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  250 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 301  Q
    | || |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 301
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17614
Alignment:
Q  185 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  283 catataactcacacttgca 301  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  224 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  169 caaccgcacaagcaagagagacacca-cactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 267  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  268 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39840
Alignment:
Q  176 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 275  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  276 tgtgggacatataactcacacttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2869
Alignment:
Q  223 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| ||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaa 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  223 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 263  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University