View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1909_low_15 (Length: 221)

Name: NF1909_low_15
Description: NF1909
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1909_low_15
NF1909_low_15
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-218)||(22907258-22907476)
chr8 (1-122)||(5238184-5238306)
chr8 (1-122)||(24661292-24661414)
chr8 (1-122)||(43685643-43685765)
chr8 (1-219)||(16193760-16193980)
chr8 (1-218)||(43373512-43373731)
chr8 (1-214)||(6774290-6774505)
chr8 (1-214)||(24548986-24549201)
chr8 (1-218)||(16405019-16405235)
chr8 (5-207)||(17345581-17345784)
chr8 (1-207)||(24928835-24929043)
chr8 (1-89)||(21844604-21844692)
chr8 (1-89)||(21851997-21852085)
chr8 (107-201)||(23837214-23837308)
chr8 (1-89)||(30120854-30120942)
chr8 (32-218)||(222754-222943)
chr8 (32-218)||(736377-736566)
chr8 (32-218)||(860272-860461)
chr8 (5-89)||(16674428-16674512)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-218)||(26680201-26680419)
chr4 (1-218)||(15675133-15675352)
chr4 (1-218)||(31115629-31115848)
chr4 (1-122)||(10488659-10488781)
chr4 (1-122)||(16327970-16328092)
chr4 (1-218)||(13246430-13246649)
chr4 (1-218)||(54118288-54118507)
chr4 (1-154)||(10104294-10104449)
chr4 (1-218)||(10644219-10644439)
chr4 (1-89)||(122020-122108)
chr4 (120-218)||(111395-111493)
chr4 (1-89)||(13048265-13048353)
chr4 (107-201)||(41166083-41166177)
chr4 (173-218)||(10104449-10104494)
chr4 (1-218)||(47357654-47357874)
chr4 (107-194)||(15044851-15044938)
chr4 (107-219)||(52265645-52265758)
chr4 (107-171)||(13809647-13809711)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-218)||(37110-37328)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-218)||(7293017-7293235)
chr7 (1-122)||(11516324-11516446)
chr7 (1-122)||(15441608-15441730)
chr7 (1-122)||(30262173-30262295)
chr7 (1-218)||(47481075-47481294)
chr7 (1-213)||(11580783-11580997)
chr7 (1-218)||(16478994-16479213)
chr7 (1-218)||(18253879-18254098)
chr7 (1-218)||(36052667-36052883)
chr7 (1-218)||(13037058-13037277)
chr7 (1-216)||(16211768-16211985)
chr7 (1-218)||(13321014-13321235)
chr7 (1-218)||(3059966-3060185)
chr7 (1-89)||(13572808-13572896)
chr7 (1-89)||(10989541-10989629)
chr7 (1-81)||(13911056-13911136)
chr7 (1-89)||(25292382-25292470)
chr7 (1-88)||(2437590-2437677)
chr7 (1-85)||(296010-296094)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (1-218)||(16744159-16744377)
chr3 (1-218)||(17912526-17912744)
chr3 (1-218)||(15859068-15859287)
chr3 (1-122)||(2449282-2449404)
chr3 (1-219)||(51158062-51158282)
chr3 (1-207)||(13838905-13839113)
chr3 (1-218)||(15936671-15936890)
chr3 (1-218)||(14842605-14842824)
chr3 (9-215)||(15938521-15938729)
chr3 (1-218)||(2049810-2050029)
chr3 (1-214)||(15614838-15615053)
chr3 (1-218)||(12030191-12030410)
chr3 (109-218)||(47984650-47984759)
chr3 (109-218)||(48003224-48003333)
chr3 (1-218)||(16821139-16821359)
chr3 (109-218)||(47993937-47994046)
chr3 (109-218)||(48012510-48012619)
chr3 (2-89)||(13975766-13975853)
chr3 (2-89)||(45860937-45861024)
chr3 (1-89)||(55316351-55316439)
chr3 (2-89)||(13954934-13955021)
chr3 (1-89)||(41270207-41270295)
chr3 (101-218)||(12264932-12265049)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (1-218)||(19206-19425)
scaffold0195 (1-218)||(21290-21509)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (1-218)||(19794748-19794967)
chr2 (1-218)||(36982485-36982704)
chr2 (1-122)||(19689445-19689567)
chr2 (1-122)||(23820168-23820290)
chr2 (1-122)||(14906484-14906606)
chr2 (1-218)||(24341433-24341652)
chr2 (1-122)||(20015108-20015230)
chr2 (1-218)||(25265434-25265653)
chr2 (1-218)||(43643001-43643220)
chr2 (1-213)||(462743-462957)
chr2 (7-218)||(7507894-7508107)
chr2 (1-218)||(8891242-8891461)
chr2 (1-218)||(20627357-20627576)
chr2 (2-89)||(17396697-17396784)
chr2 (1-218)||(19886693-19886913)
chr2 (141-201)||(9636761-9636821)
chr2 (141-185)||(24884718-24884762)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (1-122)||(20623066-20623188)
chr5 (1-122)||(21233572-21233694)
chr5 (1-218)||(18531111-18531330)
chr5 (1-119)||(37052844-37052963)
chr5 (1-218)||(22053877-22054096)
chr5 (1-122)||(16536294-16536416)
chr5 (1-218)||(23506965-23507184)
chr5 (1-122)||(25900450-25900571)
chr5 (1-218)||(27182591-27182810)
chr5 (1-207)||(34939289-34939496)
chr5 (1-89)||(29188316-29188404)
chr5 (1-87)||(27009975-27010061)
chr5 (1-218)||(4200017-4200237)
chr5 (1-218)||(18778024-18778244)
chr5 (1-218)||(22366513-22366733)
chr5 (1-218)||(25426628-25426848)
chr5 (1-89)||(43443427-43443515)
chr5 (1-218)||(12374-12594)
chr5 (1-89)||(19500031-19500119)
chr5 (107-218)||(23493917-23494029)
chr5 (1-218)||(21073627-21073847)
chr5 (107-171)||(7728466-7728530)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-122)||(51452589-51452711)
chr1 (1-218)||(20445679-20445898)
chr1 (1-218)||(20531444-20531663)
chr1 (1-218)||(20893670-20893889)
chr1 (1-218)||(20931345-20931564)
chr1 (7-218)||(22227809-22228022)
chr1 (7-218)||(22232506-22232719)
chr1 (1-218)||(41394222-41394441)
chr1 (1-214)||(2116258-2116474)
chr1 (1-218)||(20913037-20913249)
chr1 (1-218)||(37844494-37844714)
chr1 (1-89)||(45051554-45051642)
chr1 (1-89)||(18601150-18601238)
chr1 (5-89)||(5072424-5072508)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-218)||(8849-9068)
scaffold0025 (1-218)||(148721-148940)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-122)||(22637-22759)
scaffold0141 (1-122)||(26892-27014)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-122)||(1626-1748)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-214)||(14626162-14626377)
chr6 (1-218)||(35009483-35009702)
chr6 (1-207)||(23153458-23153666)
chr6 (1-207)||(1657792-1657999)
chr6 (1-214)||(1650137-1650352)
chr6 (1-207)||(15862484-15862690)
chr6 (115-218)||(27740838-27740941)
chr6 (1-218)||(25175563-25175783)
chr6 (108-201)||(18381821-18381914)
chr6 (2-218)||(27654016-27654235)
chr6 (131-218)||(22361926-22362014)
chr6 (107-171)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-218)||(36957-37176)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-218)||(48187-48406)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (4-218)||(1124-1340)
scaffold0266 (1-216)||(3626-3843)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-218)||(13506-13725)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-218)||(107747-107966)
scaffold0026 (26-89)||(64585-64648)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-218)||(41648-41867)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-218)||(12115-12332)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-207)||(171916-172124)
scaffold0001 (1-207)||(177619-177827)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-214)||(9381-9596)
scaffold0215 (1-214)||(16279-16494)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-218)||(1000-1218)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-218)||(48598-48817)
scaffold0023 (1-89)||(36225-36313)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-218)||(123208-123427)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-212)||(272031-272244)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (1-218)||(8878-9097)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-218)||(5105-5324)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-214)||(2966-3182)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-218)||(34504-34724)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-218)||(6108-6326)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (7-218)||(5254-5466)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-207)||(247486-247694)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-218)||(128213-128431)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-214)||(41733-41948)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (120-218)||(9382-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (7-218)||(3722-3936)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-89)||(5660-5748)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-89)||(13357-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-89)||(167-255)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (1-218)||(578-797)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-218)||(26459-26678)
scaffold0162 (1-218)||(8224-8440)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (5-218)||(42997-43213)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (7-218)||(54416-54630)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-89)||(51226-51314)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (3-89)||(14095-14181)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-89)||(89498-89586)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-89)||(1336-1424)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (129-218)||(48514-48603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (107-194)||(197390-197477)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (141-218)||(104793-104871)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (140-201)||(2471-2532)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (130-194)||(2548-2612)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (164-216)||(3210-3262)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22907258 - 22907476
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22907258 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 22907357  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22907358 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtataca 22907457  T
Q  200 tattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22907458 tattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5238306 - 5238184
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5238306 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 5238207  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  5238206 atttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 24661292 - 24661414
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24661292 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 24661391  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  24661392 atttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43685765 - 43685643
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43685765 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 43685666  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  43685665 atttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 16193760 - 16193980
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  16193760 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 16193859  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  16193860 attttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 16193959  T
Q  199 atattcatggattgatgatgt 219  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  16193960 atattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43373512 - 43373731
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  43373512 tttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 43373611  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |    
T  43373612 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 43373711  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43373712 atattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6774290 - 6774505
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  6774290 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 6774389  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  6774390 attttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgc 6774489  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  6774490 atattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24549201 - 24548986
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||| | |||    
T  24549201 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtga 24549102  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  24549101 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 24549002  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  24549001 atattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16405019 - 16405235
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  16405019 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 16405118  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | |||||   | ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| |    
T  16405119 attttgctaagttgt---taaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgc 16405215  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    | ||||||| ||||||||||    
T  16405216 aaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17345784 - 17345581
Alignment:
Q  5 tatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatt 102  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||    
T  17345784 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt 17345685  T
Q  103 tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 202  Q
    ||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  17345684 tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 17345586  T
Q  203 tcatg 207  Q
    |||||    
T  17345585 tcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24928835 - 24929043
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  24928835 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 24928934  T
Q  100 attt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    |||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |    
T  24928935 atttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgc 24929034  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  24929035 atattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 21844604 - 21844692
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21844604 tttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 21851997 - 21852085
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21851997 tttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30120942 - 30120854
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  30120942 tttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  32 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 128  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  129 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  32 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 128  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  129 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  32 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 128  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  129 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 16674428 - 16674512
Alignment:
Q  5 tatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  16674428 tatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26680419 - 26680201
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26680419 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatga 26680320  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtataca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26680319 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtataca 26680220  T
Q  200 tattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26680219 tattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15675133 - 15675352
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  15675133 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 15675232  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  15675233 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatac 15675332  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15675333 atattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31115848 - 31115629
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| |||||||| |||  ||| | |||    
T  31115848 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtga 31115749  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  31115748 attttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatac 31115649  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  31115648 atattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10488781 - 10488659
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10488781 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 10488682  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  10488681 atttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 16327970 - 16328092
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16327970 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 16328069  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  16328070 atttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13246649 - 13246430
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  13246649 tttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 13246550  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  13246549 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 13246450  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  13246449 atattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 54118288 - 54118507
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  54118288 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 54118387  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  54118388 attttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 54118487  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  54118488 atattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 10104294 - 10104449
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  10104294 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 10104393  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 154  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104394 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10644439 - 10644219
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||| | |||    
T  10644439 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtga 10644340  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||| |     
T  10644339 atttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttg 10644240  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10644239 catattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 122108 - 122020
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  122108 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  120 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 13048265 - 13048353
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048265 tttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 201
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  173 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47357874 - 47357654
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  47357874 tttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtga 47357775  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  47357774 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatg 47357675  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  47357674 tatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 194  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 205  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  206 tggattgatgatgt 219  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 37110 - 37328
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37110 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 37209  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtataca 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37210 atttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtataca 37309  T
Q  200 tattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37310 tattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7293235 - 7293017
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7293235 tttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 7293136  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtataca 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7293135 atttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtataca 7293036  T
Q  200 tattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7293035 tattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11516446 - 11516324
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11516446 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 11516347  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  11516346 atttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 15441608 - 15441730
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15441608 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 15441707  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  15441708 atttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 30262173 - 30262295
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30262173 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 30262272  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  30262273 atttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 47481075 - 47481294
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||    
T  47481075 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tg 47481173  T
Q  99 aatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    |||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||     
T  47481174 aattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatg 47481273  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  47481274 catattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 11580783 - 11580997
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  11580783 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 11580882  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  11580883 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatac 11580982  T
Q  199 atattcatggattga 213  Q
    ||||||||| |||||    
T  11580983 atattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16478994 - 16479213
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  16478994 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 16479093  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  16479094 attttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgc 16479193  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16479194 atattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18253879 - 18254098
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  18253879 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 18253978  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |    
T  18253979 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgc 18254078  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18254079 atattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36052883 - 36052667
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  36052883 tttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 36052784  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |    
T  36052783 attttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 36052687  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  36052686 atattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13037058 - 13037277
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  13037058 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 13037157  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  13037158 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 13037257  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  13037258 atattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16211985 - 16211768
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  16211985 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 16211886  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |    
T  16211885 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgc 16211786  T
Q  199 atattcatggattgatga 216  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  16211785 atattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13321235 - 13321014
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggat 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||| | |    
T  13321235 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggt 13321137  T
Q  98 gaatttgac-atgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggta 195  Q
    ||||||  | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||     
T  13321136 gaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtt 13321037  T
Q  196 tacatattcatggattgatgatg 218  Q
    | || ||||||| ||||||||||    
T  13321036 tgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3060185 - 3059966
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc--aaatggatg 98  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| |||  |||||| ||    
T  3060185 tttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tg 3060087  T
Q  99 aattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||| |  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||     
T  3060086 aattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 3059987  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  3059986 catattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13572896 - 13572808
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13572896 tttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10989629 - 10989541
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  10989629 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 13911056 - 13911136
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  13911056 tttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 25292382 - 25292470
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292382 tttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2437677 - 2437590
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 88  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  2437677 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 296010 - 296094
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaatt 85  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  296010 tttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16744159 - 16744377
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16744159 tttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 16744258  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtataca 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16744259 atttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtataca 16744358  T
Q  200 tattcatggattgatgatg 218  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16744359 tgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 17912526 - 17912744
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17912526 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatga 17912625  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtataca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||    
T  17912626 atttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgca 17912725  T
Q  200 tattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17912726 tattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15859068 - 15859287
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  15859068 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 15859167  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  15859168 attttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 15859267  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15859268 atattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 2449282 - 2449404
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2449282 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 2449381  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  2449382 atttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 51158062 - 51158282
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  51158062 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 51158161  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  51158162 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 51158261  T
Q  199 atattcatggattgatgatgt 219  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  51158262 atattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13839113 - 13838905
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  13839113 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 13839014  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  13839013 attttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgc 13838914  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  13838913 atattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15936671 - 15936890
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  15936671 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 15936770  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |    
T  15936771 attttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgc 15936870  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15936871 atattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 14842605 - 14842824
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||    
T  14842605 tttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtga 14842704  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |    
T  14842705 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgc 14842804  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14842805 atattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Original strand, 15938521 - 15938729
Alignment:
Q  9 catgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgac 106  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||     
T  15938521 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgat 15938620  T
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcat 206  Q
    | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||    
T  15938621 aagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcat 15938720  T
Q  207 ggattgatg 215  Q
    |||||||||    
T  15938721 ggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2050029 - 2049810
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || ||||||||||||  ||| | |||    
T  2050029 tttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtga 2049930  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  2049929 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 2049830  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2049829 atattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614838
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||  ||| | |||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtga 15614954  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  15614953 attttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 15614854  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  15614853 atattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12030191 - 12030410
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||  ||| | |||    
T  12030191 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtga 12030290  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |    
T  12030291 attttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgc 12030390  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  12030391 atattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  109 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 208  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  209 attgatgatg 218  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  109 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 208  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  209 attgatgatg 218  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16821359 - 16821139
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  ||||||| |||| | |||    
T  16821359 tttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtga 16821260  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||| |     
T  16821259 atttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttg 16821160  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  16821159 catattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  109 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 208  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  209 attgatgatg 218  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  109 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 208  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  209 attgatgatg 218  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975853
Alignment:
Q  2 ttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860937
Alignment:
Q  2 ttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 55316439 - 55316351
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  55316439 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955021
Alignment:
Q  2 ttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgc 13955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 41270295 - 41270207
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  41270295 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 218
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265049
Alignment:
Q  101 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 200  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  201 attcatggattgatgatg 218  Q
    | | ||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19425 - 19206
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  19425 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 19326  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  19325 attttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgc 19226  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  19225 atattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21509 - 21290
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  21509 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 21410  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  21409 attttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgc 21310  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  21309 atattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19794748 - 19794967
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  19794748 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 19794847  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |    
T  19794848 attttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgc 19794947  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19794948 atattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 36982485 - 36982704
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  36982485 tttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 36982584  T
Q  100 attt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  36982585 attttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgc 36982684  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  36982685 atattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 19689445 - 19689567
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19689445 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 19689544  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  19689545 atttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23820290 - 23820168
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23820290 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 23820191  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  23820190 atttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 14906484 - 14906606
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14906484 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 14906583  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  14906584 atttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 24341433 - 24341652
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  24341433 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 24341532  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||    
T  24341533 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatac 24341632  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  24341633 atattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20015230 - 20015108
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20015230 tttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 20015131  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20015130 atttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25265434 - 25265653
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  25265434 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 25265533  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |    
T  25265534 attttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgc 25265633  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  25265634 atattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43643001 - 43643220
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  43643001 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 43643100  T
Q  100 atttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  43643101 atttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgc 43643200  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43643201 atattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 462957 - 462743
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||    
T  462957 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tg 462859  T
Q  99 aa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    || ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  |||||||||||| | ||||||||     
T  462858 aattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatg 462759  T
Q  198 catattcatggattga 213  Q
    |||||||||| |||||    
T  462758 catattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  7 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 104  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  105 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 202  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  203 tcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8891461 - 8891242
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  8891461 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 8891362  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  8891361 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 8891262  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  8891261 atattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20627357 - 20627576
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||    
T  20627357 tttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtga 20627456  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||| || | | || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||      
T  20627457 attttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgg 20627556  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20627557 atattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396784
Alignment:
Q  2 ttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19886693 - 19886913
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || ||| |||||||||| ||||||| |||  | |||    
T  19886693 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 19886792  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  19886793 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 19886892  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19886893 catattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  141 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  141 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20623188 - 20623066
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20623188 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 20623089  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20623088 atttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 21233572 - 21233694
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21233572 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 21233671  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  21233672 atttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18531111 - 18531330
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| ||    
T  18531111 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tg 18531209  T
Q  99 aatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    |||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||    
T  18531210 aattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgctcgggtata 18531309  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  18531310 catattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37052963 - 37052844
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37052963 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 37052864  T
Q  100 atttgacatgttgtagttga 119  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  37052863 atttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22053877 - 22054096
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  22053877 tttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 22053976  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||    
T  22053977 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctac 22054076  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22054077 atattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16536416 - 16536294
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16536416 tttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 16536317  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  16536316 atttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23507184 - 23506965
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  23507184 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 23507085  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |    
T  23507084 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 23506985  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  23506984 atattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 25900450 - 25900571
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25900450 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 25900549  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  25900550 a-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27182591 - 27182810
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  27182591 tttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 27182690  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |    
T  27182691 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgc 27182790  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27182791 atattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34939496 - 34939289
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-g 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  34939496 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatgg 34939397  T
Q  99 aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  34939396 attttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgc 34939298  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  34939297 atattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 29188316 - 29188404
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  29188316 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27010061 - 27009975
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 87  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27010061 tttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4200017 - 4200237
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| ||| |||| | |||    
T  4200017 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtga 4200116  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||| |     
T  4200117 atttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgcttgggtttg 4200216  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  4200217 catattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18778024 - 18778244
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  18778024 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtga 18778123  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  18778124 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 18778223  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18778224 catattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22366513 - 22366733
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  22366513 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtga 22366612  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  22366613 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 22366712  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22366713 catattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25426848 - 25426628
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||    
T  25426848 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 25426749  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  25426748 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 25426649  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25426648 catattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 43443427 - 43443515
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  43443427 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12594 - 12374
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || ||| |||||||||| ||||||| || | | |||    
T  12594 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 12495  T
Q  100 atttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  12494 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 12395  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12394 catattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19500119 - 19500031
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  19500119 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 205  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  206 tggattgatgatg 218  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21073627 - 21073847
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||    
T  21073627 tttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtga 21073726  T
Q  100 att--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    |||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  21073727 atttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 21073826  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21073827 catattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 51452711 - 51452589
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51452711 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 51452612  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  51452611 atttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20445898 - 20445679
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||| | |||    
T  20445898 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtga 20445799  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  20445798 attttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 20445699  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20445698 atattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20531663 - 20531444
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||| | |||    
T  20531663 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtga 20531564  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  20531563 attttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 20531464  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  20531463 atattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 20893670 - 20893889
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  20893670 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 20893769  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  20893770 attttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgc 20893869  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  20893870 atattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20931564 - 20931345
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||    
T  20931564 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtga 20931465  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||| ||   |||||||| |    
T  20931464 attttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgc 20931365  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  20931364 atattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  7 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 104  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  105 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 204  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  205 atggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  7 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 104  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  105 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 204  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  205 atggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41394441 - 41394222
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  41394441 tttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 41394342  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  41394341 attttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgc 41394242  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41394241 atattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2116474 - 2116258
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||| | |||    
T  2116474 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtga 2116375  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  2116374 attttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatg 2116275  T
Q  198 catattcatggattgat 214  Q
    |||||||||| ||||||    
T  2116274 catattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20913249 - 20913037
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||    
T  20913249 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtga 20913150  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||||| || | |||||||| |    
T  20913149 attttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgc 20913057  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  20913056 atattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 37844494 - 37844714
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tgaaaattgtgca-aatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||||||||||||  |||  |||    
T  37844494 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatg 37844593  T
Q  99 aatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    |||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||     
T  37844594 aattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatg 37844693  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  37844694 catattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 45051642 - 45051554
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051642 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 18601150 - 18601238
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  18601150 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 5072424 - 5072508
Alignment:
Q  5 tatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  5072424 tatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9068 - 8849
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  9068 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 8969  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  8968 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatac 8869  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  8868 atattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 148940 - 148721
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  148940 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 148841  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||      
T  148840 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgt 148741  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  148740 atattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22759 - 22637
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22759 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 22660  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  22659 atttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27014 - 26892
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27014 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 26915  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  26914 atttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 1626 - 1748
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1626 tttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 1725  T
Q  100 atttgacatgttgtagttgaatt 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  1726 atttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14626162 - 14626377
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  14626162 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tg 14626260  T
Q  99 aatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    |||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  14626261 aattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatg 14626360  T
Q  198 catattcatggattgat 214  Q
    |||||||||| ||||||    
T  14626361 catattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 35009483 - 35009702
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  35009483 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtga 35009582  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  35009583 attttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgc 35009682  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  35009683 atattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23153666 - 23153458
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  23153666 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 23153567  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  23153566 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattacttgggtatac 23153467  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  23153466 atattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 1657792 - 1657999
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-g 98  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  1657792 tttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatgg 1657891  T
Q  99 aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  1657892 attttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgc 1657990  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  1657991 atattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1650137 - 1650352
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  1650137 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 1650236  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  1650237 attttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgc 1650336  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  1650337 atattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15862690 - 15862484
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-g 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |    
T  15862690 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatgg 15862591  T
Q  99 aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |    
T  15862590 attttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgc 15862493  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  15862492 atattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  115 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 214  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  215 gatg 218  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25175783 - 25175563
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||    
T  25175783 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtga 25175684  T
Q  100 atttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    ||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | ||||||||     
T  25175683 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 25175584  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25175583 catattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  108 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 27654016 - 27654235
Alignment:
Q  2 ttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||    
T  27654016 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaa 27654115  T
Q  101 tttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    |||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |    
T  27654116 tttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 27654215  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  27654216 atattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 218
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  131 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 36957 - 37176
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  36957 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 37056  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  37057 attttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 37156  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  37157 atattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48406 - 48187
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  48406 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 48307  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |    
T  48306 attttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgc 48207  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48206 atattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1340 - 1124
Alignment:
Q  4 gtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-t 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| |    
T  1340 gtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 1241  T
Q  102 ttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
    |||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||||| || | |||||| | ||||    
T  1240 ttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcata 1141  T
Q  202 ttcatggattgatgatg 218  Q
    |||||| ||||||||||    
T  1140 ttcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 3626 - 3843
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||       
T  3626 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaa 3725  T
Q  99 aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| |||| || | |||||||| |    
T  3726 attttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgc 3825  T
Q  199 atattcatggattgatga 216  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  3826 atattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13725 - 13506
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  13725 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatga 13626  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |    
T  13625 attttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgc 13526  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  13525 atattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 107966 - 107747
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || | |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||    
T  107966 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtga 107867  T
Q  100 attt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    |||| || | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |    
T  107866 attttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgc 107767  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  107766 atattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64648
Alignment:
Q  26 tgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41867 - 41648
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| ||    
T  41867 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tg 41769  T
Q  99 aa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    || ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||     
T  41768 aattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatg 41669  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  41668 catattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12332 - 12115
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  12332 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 12233  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||||| || | |||||||| |    
T  12232 attttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatgaataattgcttgggtatgc 12135  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12134 atattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 172124 - 171916
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  172124 tttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 172025  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| |    
T  172024 attttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgc 171925  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  171924 atattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 177827 - 177619
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  177827 tttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 177728  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| |    
T  177727 attttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgc 177628  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  177627 atattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9381 - 9596
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||| | |||    
T  9381 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtga 9480  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  9481 attttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 9580  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  9581 atattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16279 - 16494
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||  ||| | |||    
T  16279 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtga 16378  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  16379 attttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgc 16478  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16479 atattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1000 - 1218
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  1000 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatga 1099  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| || | |||||||| |    
T  1100 attttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgc 1198  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1199 atattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48817 - 48598
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  | | | |||    
T  48817 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtga 48718  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  48717 attttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 48618  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  48617 atattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36313 - 36225
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  36313 tttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 123208 - 123427
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  123208 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 123307  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||| |    
T  123308 attttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgc 123407  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  123408 atattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 272244 - 272031
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||    
T  272244 tttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtga 272145  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  272144 attttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 272045  T
Q  199 atattcatggattg 212  Q
    ||||||||| ||||    
T  272044 atattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9097 - 8878
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  9097 tttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 8998  T
Q  100 attt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    |||| |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || | |||||||| |    
T  8997 attttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgc 8898  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  8897 atattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5105 - 5324
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  5105 tttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 5204  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |    
T  5205 attttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgc 5304  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  5305 atattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3182 - 2966
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  3182 tttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 3083  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | ||| ||||     
T  3082 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatg 2983  T
Q  198 catattcatggattgat 214  Q
    |||||||||| ||||||    
T  2982 catattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 34504 - 34724
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||    
T  34504 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtga 34603  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtata 197  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||    ||||||||     
T  34604 attttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatg 34703  T
Q  198 catattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34704 catattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6108 - 6326
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||  ||| | |||    
T  6108 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtga 6207  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  ||||||||| || | |||||||| |    
T  6208 attttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgc 6306  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6307 atattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  7 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-ttt 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  104 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 203  Q
    |    ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  204 catggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 247486 - 247694
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc--aaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  || |||       
T  247486 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaa 247585  T
Q  99 aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  247586 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 247685  T
Q  199 atattcatg 207  Q
    |||||||||    
T  247686 atattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 128213 - 128431
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc--aaatggatg 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| ||||||||||||  || |||       
T  128213 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcga 128312  T
Q  99 aatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  ||||||||| || | |||||||| |    
T  128313 attttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattgattgggtatgc 128411  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  128412 atattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41948 - 41733
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||    
T  41948 tttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtga 41849  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||| |    
T  41848 attttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgc 41749  T
Q  199 atattcatggattgat 214  Q
    ||||||||| ||||||    
T  41748 atattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  120 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  7 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgt-agaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-ttt 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||| | |||| |||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  104 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 203  Q
    |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  204 catggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5748 - 5660
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5748 tttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 13357 - 13445
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13357 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 167
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  255 tttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 578 - 797
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||    
T  578 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtga 677  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  678 attttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgc 777  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||||| | ||||| ||||    
T  778 atattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 26459 - 26678
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatga 99  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |  ||| | |||    
T  26459 tttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtga 26558  T
Q  100 atttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    ||||  | | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||| |    
T  26559 attttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgc 26658  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    ||||| ||| ||||| ||||    
T  26659 atattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 8224 - 8440
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatga 99  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||    
T  8224 tttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 8323  T
Q  100 a-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatac 198  Q
    | ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |    
T  8324 attttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgc 8420  T
Q  199 atattcatggattgatgatg 218  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  8421 atatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43213 - 42997
Alignment:
Q  5 tatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaattt 103  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  43213 tatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattggtgaattt 43114  T
Q  104 gac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
      |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||| | ||||    
T  43113 ctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcata 43014  T
Q  202 ttcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  43013 ttcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54416
Alignment:
Q  7 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 103  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  104 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 202  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  203 tcatggattgatgatg 218  Q
    | ||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 51226 - 51314
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51226 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 14095 - 14181
Alignment:
Q  3 tgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14095 tgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 89498 - 89586
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| ||||||||||||    
T  89498 tttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1424
Alignment:
Q  1 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 89  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  1336 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  129 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197477
Alignment:
Q  107 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 194  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 197477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 218
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  141 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  140 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  130 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 194  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3210
Alignment:
Q  164 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 216  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University