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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1910_low_23 (Length: 415)

Name: NF1910_low_23
Description: NF1910
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1910_low_23
NF1910_low_23
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (17-402)||(29910173-29910559)
chr2 (21-367)||(14271809-14272145)
chr2 (17-355)||(18577514-18577832)
chr2 (45-392)||(35875838-35876167)
chr2 (45-392)||(35883327-35883656)
chr2 (45-392)||(36723040-36723369)
chr2 (21-123)||(33402970-33403072)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (17-395)||(15775-16154)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (17-402)||(9417958-9418343)
chr8 (17-395)||(24097335-24097718)
chr8 (17-381)||(24268411-24268779)
chr8 (17-395)||(7836495-7836874)
chr8 (17-395)||(7807070-7807451)
chr8 (61-392)||(31576535-31576871)
chr8 (17-248)||(997143-997374)
chr8 (19-392)||(12766000-12766359)
chr8 (45-392)||(42713831-42714161)
chr8 (19-381)||(20028519-20028863)
chr8 (19-381)||(20036280-20036624)
chr8 (354-395)||(988048-988089)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (17-401)||(11222005-11222381)
chr5 (17-401)||(42733681-42734057)
chr5 (17-402)||(26649164-26649545)
chr5 (17-402)||(26920749-26921130)
chr5 (17-380)||(2641039-2641403)
chr5 (264-402)||(26649558-26649697)
chr5 (264-402)||(26921143-26921282)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (17-392)||(26907713-26908089)
chr1 (17-395)||(35755891-35756270)
chr1 (17-395)||(5382704-5383076)
chr1 (17-283)||(23550195-23550458)
chr1 (340-395)||(23550488-23550543)
chr1 (55-103)||(10632920-10632969)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (17-395)||(25514728-25515106)
chr4 (17-391)||(50065953-50066328)
chr4 (17-381)||(11480919-11481286)
chr4 (17-395)||(28069470-28069846)
chr4 (22-381)||(50518315-50518678)
chr4 (45-381)||(9243794-9244131)
chr4 (45-381)||(7580473-7580810)
chr4 (45-243)||(34495225-34495423)
chr4 (17-216)||(28257581-28257779)
chr4 (88-325)||(9204009-9204249)
chr4 (88-325)||(9208228-9208468)
chr4 (24-129)||(9245624-9245729)
chr4 (189-325)||(9275520-9275655)
chr4 (316-392)||(28257413-28257489)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (17-402)||(7786573-7786949)
chr3 (17-391)||(36433913-36434288)
chr3 (28-395)||(9308197-9308565)
chr3 (156-392)||(23484855-23485084)
chr3 (19-392)||(13329567-13329922)
chr3 (239-395)||(46280172-46280329)
chr3 (17-212)||(13978313-13978509)
chr3 (17-104)||(9294433-9294520)
chr3 (19-128)||(23484740-23484850)
chr3 (303-392)||(13953365-13953456)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (17-401)||(9735577-9735953)
chr7 (88-395)||(4314283-4314591)
chr7 (17-392)||(32816671-32817042)
chr7 (19-392)||(2890405-2890777)
chr7 (114-392)||(48712737-48713008)
chr7 (17-381)||(8980592-8980956)
chr7 (19-66)||(4314588-4314635)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (17-381)||(14097432-14097790)
chr6 (17-380)||(2850192-2850556)
chr6 (19-203)||(17513876-17514061)
chr6 (288-392)||(17513735-17513841)
[»] scaffold0753 (2 HSPs)
scaffold0753 (53-381)||(2892-3221)
scaffold0753 (45-342)||(846-1147)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (24-381)||(2590-2951)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (17-225)||(11410-11617)
[»] scaffold0135 (7 HSPs)
scaffold0135 (88-325)||(2092-2332)
scaffold0135 (88-325)||(6307-6547)
scaffold0135 (88-325)||(10522-10762)
scaffold0135 (88-325)||(14737-14977)
scaffold0135 (88-325)||(18952-19192)
scaffold0135 (88-325)||(23167-23407)
scaffold0135 (88-325)||(27382-27622)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (19-381)||(449-793)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (241-332)||(3501-3592)
scaffold0186 (48-195)||(3353-3499)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (303-392)||(5505-5596)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 29910173 - 29910559
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| |    
T  29910173 ataattcaaggttaattaaccaagaatgtattgtcatcacatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttttctttatgaggatgcctct 29910272  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29910273 tacactcaaaattattttcatcatttcatcaaaatgataaaaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 29910372  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29910373 gatattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttgaagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 29910472  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  29910473 ttcaaaatatgatttgtagaatagaaataaatcacaggaattttgactttgagaaaagtttatcatgttcctaccaatatcattctg 29910559  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Original strand, 14271809 - 14272145
Alignment:
Q  21 ttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  14271809 ttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacatcatcaactctgatgaaagaatgttctcaagatgaggatgcatattaca 14271908  T
Q  121 ctcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgtta 220  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14271909 ctctaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaacaaattcatgaataaattatttattaagtcattcattaatgata 14272008  T
Q  221 ttgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattca 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  14272009 ttgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcat-----------gatggtccaagaatcttcaatcactattca 14272097  T
Q  321 agatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttga 367  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14272098 agatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttga 14272145  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 355
Target Start/End: Original strand, 18577514 - 18577832
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||                 
T  18577514 ataattcaaggttaattaattgagaatctattgtcatctcatatagaaaagaacattatcaactccgatgaaataatgttctcatga------------- 18577600  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
      |  | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18577601 --cgtttaaaattattcccatcatttcatcaaaatgattagaatcaattttcaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtaattcattaat 18577698  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||| ||| |||| |  |  |||||||||||||||    
T  18577699 aatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatca------tggagattatatcataaaagacttatgatggtataggaatcttccatcacta 18577792  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaa 355  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  18577793 ttaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaa 18577832  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 392
Target Start/End: Original strand, 35875838 - 35876167
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35875838 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 35875937  T
Q  144 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 243  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                     |||| |||| |||||| |||    
T  35875938 atcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaa 35876016  T
Q  244 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-aa 341  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| ||    
T  35876017 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaa 35876116  T
Q  342 ataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  35876117 atcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 35876167  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 392
Target Start/End: Original strand, 35883327 - 35883656
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35883327 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 35883426  T
Q  144 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 243  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                     |||| |||| |||||| |||    
T  35883427 atcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaa 35883505  T
Q  244 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-aa 341  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| ||    
T  35883506 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaa 35883605  T
Q  342 ataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  35883606 atcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 35883656  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 392
Target Start/End: Original strand, 36723040 - 36723369
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36723040 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 36723139  T
Q  144 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 243  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                     |||| |||| |||||| |||    
T  36723140 atcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaa 36723218  T
Q  244 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-aa 341  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| ||    
T  36723219 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaa 36723318  T
Q  342 ataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  36723319 atcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 36723369  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 33402970 - 33403072
Alignment:
Q  21 ttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  33402970 ttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacatcatcaactccaatgaaagaatgttctcaagatgaggatgcatgttaca 33403069  T
Q  121 ctc 123  Q
    |||    
T  33403070 ctc 33403072  T

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Target: scaffold0091 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16154 - 15775
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  16154 ataagtcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaaagaacatcatcaactccgatgaaacaatgttctcaagatgaggatgcatat 16055  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16054 tacactctaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaattaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattatgtcattcattaat 15955  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15954 gatattgattggagaaatatcaaagaagaaaatacatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcacta 15855  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15854 ttcaagatataatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 15775  T

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Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 9417958 - 9418343
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  9417958 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatatcatatagaagagaaaattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaagatgcatat 9418057  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9418058 tacactcgaaattattctaatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcataaatgaattatttattaagtcgttcattaat 9418157  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  9418158 gatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaatatttatgatggtccaagaatcttccatcac-a 9418256  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  9418257 ttcaagatataatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttaagaaaggtttatcatgttcctacaaatatcattctg 9418343  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24097718 - 24097335
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24097718 ataatccaaggttcattaaccgagaaggtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctgatgaaagaattttctcatgataaggatggctat 24097619  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24097618 tacacttgaaattattctcatcatttcatcaaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaatccataaatgaattattcattaagtcattcattcat 24097519  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  24097518 gatgttgattggagaattatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcatacaagacttagcatgatccaagaatcatccatcacta 24097419  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaa----tcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  24097418 ttcaagatatgatttggagaatagaaatcaattactcaaatgaattttgactttgagaaaagtctttcatgttcctacaaatat 24097335  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 24268411 - 24268779
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || | ||||| |||    
T  24268411 ataattcaaggttaattaaccgagaatttattgtcatctcatatagaagcgaacattatcaactccgatgaaagaatgatctcataatgaagatgcatat 24268510  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24268511 tacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattataatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 24268610  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca--c 314  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||       
T  24268611 gatattgattgaaaaaatataaaagaagaaaattcatgatcacatgcttgatgattctatcgtaaaagatttaggatgatcgaagaatcttccatcattt 24268710  T
Q  315 tattcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    | || |||||||||||  | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24268711 ttttaaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaacgaatttttactttgagagaggtttctcat 24268779  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Original strand, 7836495 - 7836874
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7836495 ataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcatat 7836594  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7836595 tacactggaaattattatcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 7836694  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||| | ||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||| ||||| |||| || |||||||    
T  7836695 gatattgatcggagaatgatcaaagaaaaaaaatcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatactcatgatggtccaagaatcctctatcacta 7836794  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaataa-aataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7836795 ttcaatatatgatttggagaacaacaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttccaacaaatat 7836874  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Original strand, 7807070 - 7807451
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||| |||    
T  7807070 ataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcctatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcacgatgagaatgcatat 7807169  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7807170 tacactagaaattattctcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 7807269  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaag--aagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcac 314  Q
    | ||||||| | ||||  |||||||  || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | |||| || || |||| || |||||    
T  7807270 gatattgatcggagaatgatcaaagaaaaaaaaaatcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatactcatgatggtctaagaatcctctatcac 7807369  T
Q  315 tattcaagatatgatttgaagaataa-aataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7807370 tattcaatatatgatttggagaacaacaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttccaacaaatat 7807451  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31576871 - 31576535
Alignment:
Q  61 agaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaat 160  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31576871 agaagcgaacattatcaactccgatgaaagaatgatctcataatgagtatgcatattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaat 31576772  T
Q  161 caattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcata 260  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31576771 caactttgaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcaca 31576672  T
Q  261 tacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactatt---caagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaa 355  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||    
T  31576671 tgcttgaagattctatcataaaagatttaggatgattgaagaatcttccatcatttttttaaaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaa 31576572  T
Q  356 ttttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  31576571 tttttactttgagagaggtttctcatattcttacaaa 31576535  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 997143 - 997374
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  997143 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcgtcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcatat 997242  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  997243 tacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 997342  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaa 248  Q
    | ||||||| | ||||  ||||||||||||||    
T  997343 gatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaa 997374  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 392
Target Start/End: Original strand, 12766000 - 12766359
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  12766000 aattcaaggttaattaaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 12766099  T
Q  118 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||         |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  12766100 acactcgaaattattctcatcg--------aaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaataaattattcattaagtcattcattaat- 12766190  T
Q  218 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 317  Q
            || |||| |||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  12766191 --------tggagaactatcaaggaagacaaatcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagacttaggatgatccaagaatcttccatcatttt 12766282  T
Q  318 tcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12766283 tcaagatataatttgggagaatagaaatcaataaaaggaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 12766359  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42714161 - 42713831
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttc 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42714161 tattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttc 42714062  T
Q  144 atcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 243  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||                     |||| |||| |||||| |||    
T  42714061 atcgaaataattagaatcaactttgaggagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaa 42713983  T
Q  244 gaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataa-aagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatt-tgaagaata-a 340  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |  || |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||  | |||||| |    
T  42713982 gaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaaacataagatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaataga 42713883  T
Q  341 aataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  42713882 aatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 42713831  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 381
Target Start/End: Original strand, 20028519 - 20028863
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  20028519 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 20028618  T
Q  118 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 217  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                   
T  20028619 acactcgaaattattctcattacctcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 20028703  T
Q  218 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 317  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |   |||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  20028704 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacaaaggatggtccaagaatcttccatcatttt 20028797  T
Q  318 tcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    | |||||||||||  | | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  20028798 ttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaatttttaccttgagaaaagtttctcat 20028863  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 381
Target Start/End: Original strand, 20036280 - 20036624
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  20036280 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 20036379  T
Q  118 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 217  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||                  
T  20036380 acactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaatcaaccgatgaatgaattattcattaa-------------- 20036465  T
Q  218 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 317  Q
           ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  ||||||| || || |||||||||||| | |    
T  20036466 -------ttggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatggtcaaagaatcttccatcatttt 20036558  T
Q  318 tcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    | |||||||||||  | | |||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  20036559 ttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaaattttaccttgagaaaagtttctcat 20036624  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 395
Target Start/End: Original strand, 988048 - 988089
Alignment:
Q  354 aattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  988048 aattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 988089  T

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Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 401
Target Start/End: Original strand, 11222005 - 11222381
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11222005 ataattcacggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgacgaaagaatggtctcatgataaggatgcatat 11222104  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11222105 tacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcattaat 11222204  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | |||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||| |||||| ||||||||    
T  11222205 gatattg---------atatcaaaaaagaaaattcatgatcatatacttggagattatatcataaaagacttatgatagtccaagaatcttacatcacta 11222295  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattct 401  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11222296 ttcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattct 11222381  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42734057 - 42733681
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  42734057 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcatgatgaggatgcatat 42733958  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  42733957 tacactcgaaattattatcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcattaat 42733858  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | |||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||| |||||| ||||||||    
T  42733857 gatattg---------atatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattatatcataaaagacttatgatagtccaataatcttacatcacta 42733767  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattct 401  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42733766 ttcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaaaaggtttatcatcttcctacaaatatcattct 42733681  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 26649164 - 26649545
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
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T  26649164 ataattcaaggttaattaagcgagagtgtattgtcatctcatatagaagagaacattattaactccggtgaaagaatgttctcatgatgaagatgcatat 26649263  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26649264 tacacttgaaattagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaacttt------aaatcaattcatgaatgaattacttattaagtcattcattaat 26649357  T
Q  217 gttattgattgaagaaa-tatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcact 315  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  26649358 gatattgattggagaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgtttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcact 26649457  T
Q  316 attcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26649458 attaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctg 26649545  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 26920749 - 26921130
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  26920749 ataattcaaggttaattaagcgagagtgtattgtcatctcatatagaagagaacattattaactccggtgaaagaatgttctcatgatgaagatgcatat 26920848  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26920849 tacacttgaaattagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaacttt------aaatcaattcatgaatgaattacttattaagtcattcattaat 26920942  T
Q  217 gttattgattgaagaaa-tatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcact 315  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  26920943 gatattgattggagaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgtttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcact 26921042  T
Q  316 attcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921043 attaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctg 26921130  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 2641039 - 2641403
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  2641039 ataattaaaggttaatttaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattattaactccgatgaaagaatgttctcatgatggggatgcatat 2641138  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2641139 tacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaaatcattcatttat 2641238  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| || || |||     
T  2641239 gatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcacgatcatatgctttgagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctattactg 2641338  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctca 380  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2641339 ttcaagatatgatttggagaacagaaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaagtttctca 2641403  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 264 - 402
Target Start/End: Original strand, 26649558 - 26649697
Alignment:
Q  264 ttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgac 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26649558 ttggagattctatcataaaagatttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgac 26649657  T
Q  363 tttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26649658 tttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctg 26649697  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 264 - 402
Target Start/End: Original strand, 26921143 - 26921282
Alignment:
Q  264 ttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgac 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26921143 ttggagattctatcataaaagatttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgac 26921242  T
Q  363 tttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921243 tttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatatcattctg 26921282  T

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Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26908089 - 26907713
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||    
T  26908089 ataatttaatgttaatcaaccgagaatgtatcgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaaggttctcatgatgaagatgcatat 26907990  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907989 tacactcaaaattat-ctcatcatttcatcaaaatgatcagaatcaactttgaagagaaaccaaatcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 26907891  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || || |||||| ||||||||    
T  26907890 gatattgattggagaaatatcatagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatagtctaagaatctttcatcacta 26907791  T
Q  317 ttcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26907790 ttcaagatatgttttgggagaatataaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaatgtttctcatgttcctacaaa 26907713  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35756270 - 35755891
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  35756270 ataattaaaggttagttaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatgttttcatgatgaggatgcatat 35756171  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35756170 tacactagaaattattctcatcatttcataaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 35756071  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||| || |||||||    
T  35756070 gatattgatctgagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatatttatgatggtctaagaatcctctatcacta 35755971  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35755970 ttcaagatatgatttggagaacataaatcaatcaaagaaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 35755891  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5383076 - 5382704
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5383076 ataattcaaggttaattaacgaagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcatat 5382984  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5382983 tacactcgaaatcagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataagttatttattaattcactcattaat 5382884  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  5382883 gatattgtttggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggaggttctatcataaaagacttatgatggtccaagaatctttcatcacta 5382784  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  5382783 ttcaagatatgatttggagagtagaaatcaatcaaaggaattgtgattttgagaaaggtttctcacgttcctaaaaatat 5382704  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 23550195 - 23550458
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |   ||||| |||    
T  23550195 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatggt---gatgcatat 23550291  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23550292 tacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagataaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 23550391  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaa 283  Q
    | ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23550392 gatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataaaa 23550458  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 395
Target Start/End: Original strand, 23550488 - 23550543
Alignment:
Q  340 aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23550488 aaatcaatcaaagaaattttaactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 23550543  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10632969 - 10632920
Alignment:
Q  55 tcatatagaagagaa-cattatcaactctaatgaaagaatgttctcatga 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10632969 tcatataaaagagaaacattatcaactcttatgaaataatgttctcatga 10632920  T

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Target: chr4 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Original strand, 25514728 - 25515106
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25514728 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatc-catatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcatat 25514826  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    |||||   ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25514827 tacacctgaaattattctcattattttatcaaaatgattagaatcaactttaaagagaaatcaattcattaatgaattatttattaagtcattcatttat 25514926  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||| |  |||||||    
T  25514927 gatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataatatacttatgatggtccaaaaatcctatatcacta 25515026  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25515027 ttcaagatatgatttggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 25515106  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 50066328 - 50065953
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50066328 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactatgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcatat 50066229  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    |||||   ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50066228 tacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaattattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 50066129  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| || | || |||||||    
T  50066128 gatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgattatatgctttgagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaaccctctatcacta 50066029  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaa 391  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50066028 ttcaaggtatgatttggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaa 50065953  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 11480919 - 11481286
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  11480919 ataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactccgatgaaataatgttctcatgatgaggatgcatat 11481018  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11481019 tacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagataaactagttcatgaatgaattatttattaagccattcattaat 11481118  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca-ct 315  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |    
T  11481119 gatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgtttgaagattctatcataaaagatttaggatgattgaagaatcttccatcattt 11481218  T
Q  316 attcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
     || |||||||||||| | |||| | |||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11481219 ttttaagatatgatttaggagaaaagaaaacaatcaaatgaatttttactttgagagaggtttctcat 11481286  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 395
Target Start/End: Original strand, 28069470 - 28069846
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
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T  28069470 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccaatgaaagaatgttctcatgat--ggatgcatat 28069567  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
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T  28069568 tacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcataaatgaattatttattaagtcattcatttat 28069667  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||| | ||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||| ||| | | | |||| ||||  |||| || |||||||    
T  28069668 gatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaactcatgaacatatgctttgaaattctatcatgaaataatcatgatggtccaggaatcctcaatcacta 28069767  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    |||||  ||||||||| |||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28069768 ttcaa-ttatgatttggagaacagtaattaatcaaagaaattttgactttgagagaggtttctcatgttcctacaaatat 28069846  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50518678 - 50518315
Alignment:
Q  22 tcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaga-gaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattaca 120  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||  ||||||| | |||||    
T  50518678 tcaaggttaattaatcaagaaggtattgtcatctcatataaaaaaagaacattatcaactccgatgaaagaacattctcatgaagaggatgcttcttaca 50518579  T
Q  121 ctcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgtta 220  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50518578 ctcaagattattctcatcatttgattaaaatgattagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgata 50518479  T
Q  221 ttgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca-ctattc 319  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||   |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||     
T  50518478 ttgatggaaaaaatatcaaaaaagaaaatttgggatcatatgcttgaagatactatcataaaagatttaggatgatcgaagaatcttccatcattttttt 50518379  T
Q  320 aagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  50518378 aagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaataaatttttattttgagagaggttcctcat 50518315  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 381
Target Start/End: Original strand, 9243794 - 9244131
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 144  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||  |||| ||||| ||||||||||| | | ||||    
T  9243794 tattgtcatctcatatagaagataacattatcaactctggtgaaataatgttctcattatgaagatgtttatttcactcgaaattattctcgttatttca 9243893  T
Q  145 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaat---gaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaag 241  Q
     ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9243894 acaaaatgattaggattaattttgaagagaaaccaattcatgaatattgaattattcattgagttattcattaatgatattgattgaagaattatcaaag 9243993  T
Q  242 aagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaata- 339  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||    |||||||| ||||||||| ||||||||     
T  9243994 atgaaaattcatgatcatatgcatggagattctatcataaaatacttaggatgatccaaaaaattgcc----ctattcaaaatatgatttggaagaatag 9244089  T
Q  340 aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9244090 aaatcaaacaaagcaattttgacattgagaaaggtttctcat 9244131  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 381
Target Start/End: Original strand, 7580473 - 7580810
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||| | ||||  ||||||||   || |||||||||| | ||||    
T  7580473 tattgtcatctcatatagaagagaacattattaactcttatgaaagaatattctgaagatgaagatgtttattacacctgaatttattctcattatttca 7580572  T
Q  145 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaag 244  Q
    | |||||| |  ||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||     
T  7580573 taaaaatggttggaatcaactttgaaaagaaactaatttgtgaataaattattcattgagtcattcattattgatattgatccaagaattatcaaataa- 7580671  T
Q  245 aaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatat-gatttgaagaata-aaa 342  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||    
T  7580672 aaaattcatgatcatatgcatggagattctatcaaaatggacttaggatgatccaataattgttcatcattattcaagttatagcttggaagaatagaaa 7580771  T
Q  343 taaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7580772 tcaaacaaagcaattttgactttgagaaaggtttctcat 7580810  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34495423 - 34495225
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 144  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  34495423 tattgtcttctcatatagatgagaacattatcaactttgatgaaagaatattctcatgatgaagatgattattacacttgaaattattctcattacttca 34495324  T
Q  145 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  34495323 tcaaaatgataagaatcaactttgaagagataccaatccaggaataaattattcattaagtcattcattaatgatattgattggagaattatcaaagaa 34495225  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28257779 - 28257581
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  28257779 ataatttaaggttaattgaccaagaagatattgttttctcgtatagaagagaacattatcaactttaatgaaagaatgttctcatgatgaagatgactat 28257680  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28257679 tacactcgaaaatattctcattacttcatcgaaatgatta-tatcaactttgaagagaaactaattcatgaatgagttattcattaagtcgttcattaat 28257581  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 9204009 - 9204249
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9204009 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 9204108  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  9204109 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 9204208  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  9204209 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9204249  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 9208228 - 9208468
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9208228 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattagcatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 9208327  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  9208328 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 9208427  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  9208428 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9208468  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 129
Target Start/End: Original strand, 9245624 - 9245729
Alignment:
Q  24 aaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactc 123  Q
    |||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  9245624 aaggttaattgaccaataagatattgtcgtctcatatagaagagaaaattatcaactctgattgaagaatattctcatgatgaatatgtttattacactc 9245723  T
Q  124 aaaatt 129  Q
     |||||    
T  9245724 gaaatt 9245729  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 9275520 - 9275655
Alignment:
Q  189 tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagattt 288  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  ||||| | ||    
T  9275520 tgaattattcataaagttattcattaatga-attgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatactt 9275618  T
Q  289 aggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    |||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  9275619 aggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9275655  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28257489 - 28257413
Alignment:
Q  316 attcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  28257489 attcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgac--tgaaaaaagtttctcatgttcctacaaa 28257413  T

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Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7786949 - 7786573
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||| |||    
T  7786949 ataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcgtgatgaagatgcatat 7786857  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7786856 tacactcgaaatttgtctcatcatttcattaaaaagattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaattcattcattaat 7786757  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  7786756 gatattggttgaggaaatatcaa---agaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcacta 7786660  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattctg 402  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7786659 ttcacgatatgatttgaaaaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttcttatgttcctacaaatatcattctg 7786573  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36434288 - 36433913
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  36434288 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaatagaacattatcaactccggtgaaagaatgttctcattatgaggatgcatat 36434189  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36434188 tacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaaaagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttat 36434089  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | | ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||| || |||||||    
T  36434088 gatgttgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcgtaaaatacttatgatggtccaagaatcctctatcacta 36433989  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaa 391  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36433988 ttcaagatatgatttggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaa 36433913  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 395
Target Start/End: Original strand, 9308197 - 9308565
Alignment:
Q  28 ttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||    
T  9308197 ttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcatattacacaagaaa 9308296  T
Q  128 ttattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattg 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  9308297 ttattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatttatgatattgatcg 9308396  T
Q  228 aagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatg 327  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| || |||||||||||| ||||     
T  9308397 gagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttaagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctatcactattcaaaatata 9308496  T
Q  328 atttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  9308497 atttggagaagagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttttcatgttcctacatatat 9308565  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 392
Target Start/End: Original strand, 23484855 - 23485084
Alignment:
Q  156 agaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatga 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||         || |||| |||||| ||||| || ||||||    
T  23484855 agaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaataaattatttattaagtcattcattaat---------tggagaactatcaaggaagacaaatcatga 23484945  T
Q  256 tcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaagg 353  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||| | |||||| |||| ||| |||||    
T  23484946 tcatatgcatgaagattctatcataaaagacttaggatgatccaagaatcttcaatcatttttcaagatataatttgggagaatagaaatcaataaaagg 23485045  T
Q  354 aattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23485046 aatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 23485084  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13329922 - 13329567
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | | ||||  ||||    
T  13329922 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttctatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaatgttctcatggtgaagatgattatt 13329823  T
Q  118 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 217  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                   
T  13329822 acactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattcgaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 13329738  T
Q  218 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 317  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |  |||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  13329737 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgaaccaagaatcttccatcatttt 13329644  T
Q  318 tcaagatatgatttg-aagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    | ||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  13329643 ttaagatatgattcgcgagaatagaaatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagattctcatgttcttacaaa 13329567  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 46280329 - 46280172
Alignment:
Q  239 aagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaa- 337  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46280329 aagaagaaaattcatgatcatatggtttgagactctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctatcactattcaagatatgatttggagaac 46280230  T
Q  338 taaaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatat 395  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46280229 aaaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaagtttctcatgttcctacaaatat 46280172  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13978509 - 13978313
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgccta 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||| |||| | ||||  ||    
T  13978509 ataattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttctcatataaaagagaaccttatcaactttgatgaaaagaatggtctcgtgatgatgatgatta 13978410  T
Q  116 ttacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcat 212  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||||   ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13978409 ttacacttgaaattattcttattacttcacggaaatgattagaatcaactttgaagataaacaaatccatgaatgaactattcattaagtcattcat 13978313  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9294520 - 9294433
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgat 104  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9294520 ataattaaaagttaattaaccaagaatgtattgtcatcctatatataatagaacattatcaactccgatgaaaaaatgttctcatgat 9294433  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 23484740 - 23484850
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatg-aaagaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  23484740 aattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 23484839  T
Q  118 acactcaaaat 128  Q
    |||||| ||||    
T  23484840 acactcgaaat 23484850  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13953456 - 13953365
Alignment:
Q  303 atcttccatcactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13953456 atcttccatcatttttcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 13953365  T

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Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 401
Target Start/End: Original strand, 9735577 - 9735953
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  9735577 ataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcatgatgaggatgcatat 9735676  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9735677 tacactcgaaactattctcatcatttcatcaaaacggttagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcattaat 9735776  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | |||||         |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9735777 gatattg---------atatcaaagaagaaaatttatgatcatatgcttggagattatatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttacatcacta 9735867  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaatataattct 401  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  9735868 ttcaagatatgaattggagaatagaaatcaatcaaatgaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaatatcattct 9735953  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 88 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4314591 - 4314283
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4314591 aagaatgttctcttgatgaggatgcatattacactcgaaattattatcataatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatga 4314492  T
Q  188 atgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatt 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  4314491 atgaattatttatcaagtcattctttaatgatattgattggagaattatcaaagaagaaaattgatgatcatatgcttggagattatatcataaaagact 4314392  T
Q  288 taggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcc 386  Q
    || |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4314391 tatgatggtccaagaatcttatatcactattcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaaagaatttttactttcagaaaggtttctcatattcc 4314292  T
Q  387 tacaaatat 395  Q
    |||||||||    
T  4314291 tacaaatat 4314283  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Original strand, 32816671 - 32817042
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaa-tgttctcatgataaggatgccta 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||| || |||||| ||||  |     
T  32816671 ataattcaaggttaattaaccaagaagatggtgtcttctcatatagaagagaaccttatcaactttgatgaaaaaaatgttttcttgataaagatgattg 32816770  T
Q  116 ttacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaa 215  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  32816771 tcacactcgaaattattctcattacttcatcaaaataattagaatcaactctgaagaaaaaccaatccatgaatgaattatgaattaagtcattcatta- 32816869  T
Q  216 tgttattgattgaagaaatatcaaa--gaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 313  Q
            |||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32816870 --------attggagaatgatcatatggatgaaaattcatgatcatatgcacggaggttctatcataaaagagttaggaagatccaagaatcttccatca 32816961  T
Q  314 ctattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32816962 ttattcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaataaatttttaatttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 32817042  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 392
Target Start/End: Original strand, 2890405 - 2890777
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaac---tctaatgaaag-aatgttctcatgataaggatgcct 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||   | | ||||||  ||||||||| |||||| |||   |    
T  2890405 aattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacgttatcaacaactttgatgaaaataatgttctcgtgataaagattatt 2890504  T
Q  115 attacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatta 214  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2890505 gttacactcgaaattattctcattacttcatcaaaataattagaatcaactctgaagaaaaatcaatccatgaatgaattattcattaagtcattaatta 2890604  T
Q  215 atgttattgattgaagaaatatcaaa--gaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatc 312  Q
    ||         || ||||  |||| |  |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2890605 at---------tggagaatgatcatatggaagaaaattcatgatcatatgtacgaagattctatcataaaagacttaggaagatccaaaaatcttccatc 2890695  T
Q  313 actattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2890696 attattcaagatatgatttaggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 2890777  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48713008 - 48712737
Alignment:
Q  114 tattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatt 213  Q
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T  48713008 tattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaagtcattcatt 48712909  T
Q  214 aatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatca 313  Q
    |||         || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48712908 aat---------tggagaattatcaaggaagaaaattcataatcatatgcatgaagattctatcataataaacttaggatgatccaagaatctgccatca 48712818  T
Q  314 ctattcaagatatgat-ttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
     ||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  48712817 ttattcaaaatatgatctgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttacttagagaaaggtttctcatgttcttacaaa 48712737  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8980956 - 8980592
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||| | ||| | ||||  |||    
T  8980956 ataattcaaagttaattgaccaagaaaatattgtcatctcatatagaagagaacataatta-ctcttatgaaagaatattctgaagatgaagatgtttat 8980858  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    |||||   || |||||||||| | ||||| |||||| |   |||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8980857 tacacctgaatttattctcattatttcataaaaatggttgaaatcaactttgaaaagaaactaatttgtgaataaattattcattcagtcattcattaat 8980758  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||| | |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||  | ||||| ||    
T  8980757 gatattgatcggagaattatcaaataa-aaaattcttgatcatatgcatggagattctatcaaaatggacttaggatgatccaataattgttcatcatta 8980659  T
Q  317 ttcaagatat-gatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    |||||| ||| | || |||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8980658 ttcaagttatagcttggaagaatagaaatcaaacaaaacaattttgactttgagaaagatttctcat 8980592  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 4314635 - 4314588
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaga 66  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4314635 aattcaaggttagttaaccgagaatgtattatcatctcatatagaaga 4314588  T

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Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 381
Target Start/End: Original strand, 14097432 - 14097790
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
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T  14097432 ataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcgtaatgaggatgcatat 14097524  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
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T  14097525 tacactcgaaatcaatctcatcatttcatcaaaatgattagaattaactttgaagagaaaccaattcatgaacgaattatttattaagtcagtcattaat 14097624  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
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T  14097625 gatattggttggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcacta 14097724  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14097725 ttcaagatatgatttggagaatagaaatcaatcaaagaaattttgactttccgaaaggtttctcat 14097790  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 2850192 - 2850556
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |    
T  2850192 ataattcaaggttaattaatcaagaaggtattatcatcttatatagaagagaacatcatcaactctgatgaaagaacgttctcataaagaggatgcctct 2850291  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2850292 tacactcgagattattctcatcatttgattaaaaggattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcactcattaat 2850391  T
Q  217 gttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcacta 316  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |     
T  2850392 gatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttgaagattctatcataaaagatttaagatgatcgaagaatcttccatcattt 2850491  T
Q  317 ttcaagatatgatttgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctca 380  Q
    || |||||||| || | |||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2850492 tttaagatatggttgggagaatagaaatcaatcaaaggaatatttactttgagaaaggtttctca 2850556  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17514061 - 17513876
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  17514061 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatcaagatgattatt 17513962  T
Q  118 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaa 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  17513961 acactcaaaattattctcattacttcatcgaaataatttgaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaa 17513876  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17513841 - 17513735
Alignment:
Q  288 taggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttc 385  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17513841 taggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaagaaatttttactttgagaaaggtttctcatgttc 17513742  T
Q  386 ctacaaa 392  Q
     ||||||    
T  17513741 ttacaaa 17513735  T

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Target: scaffold0753 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0753
Description:

Target: scaffold0753; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3221 - 2892
Alignment:
Q  53 tctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatg 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| ||    
T  3221 tctcatatagaagataacattatcaactctgatgtaagaatgctctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattg 3122  T
Q  153 ataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaa---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaat 249  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  3121 attaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaatattgaattattcattgagttattcattaatgatattgattgaataattatcaaagatgaaaat 3022  T
Q  250 tcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaata-aaataaat 347  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||     
T  3021 tcatgatcatatgcatggagattctatcataaaatacttaggacgatccaaaaaatttcc----ctattcaaaatatgatttggaagaatagaaatcaaa 2926  T
Q  348 caaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2925 caaaacaattttgacattgagaaaggtttctcat 2892  T

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Target: scaffold0753; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 846
Alignment:
Q  45 tattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttca 144  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  1147 tattgtcgtctcaaatagaagagaaaattatcaactctgatggaagaatgttctcatgatgaagatggttattacactcgaaattattctcattatttca 1048  T
Q  145 tcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaa---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaag 241  Q
    || | ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||   | ||||||| || |||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  1047 tctatatgattaggttcaatttttaagagaaaccaattcataaatattaaattattcataaagttattcattaataatattaattggagaattatcaaag 948  T
Q  242 aagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgattt-gaagaataa 340  Q
    | |||| ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| | | || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  947 atgaaacttcattatcatatgcatggatattctatcgtaaaatacttaggatgatccaagagttttacatcaccattcaatatatgatttggaagaataa 848  T
Q  341 aa 342  Q
    ||    
T  847 aa 846  T

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Target: scaffold0959 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 381
Target Start/End: Original strand, 2590 - 2951
Alignment:
Q  24 aaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactc 123  Q
    |||||||||| ||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||   ||| ||||||    
T  2590 aaggttaattgaccaataagatattgtcgtctcatatagaagagaacattatcaactctgatggaagaatgttctcatgatgaagatttttatgacactc 2689  T
Q  124 aaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaa---tgaattatttattaagtcattcattaatgtta 220  Q
    ||| |||||||| | | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||| |||||||||||  |    
T  2690 aaagttattctccttatttcatcacaatgattaggatcaattttaaagagaaaccaattcatgaatattgaattattcataaagt-attcattaatgaca 2788  T
Q  221 ttgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattca 320  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||| | |||||||||||||  |||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  2789 tttattgaagaattatcaaagatgaaacttccttatcatatgcatggagattctatcgaaaaatacttaggatgatccaagagttttccatcactattca 2888  T
Q  321 agatatgattt-gaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| || ||||  ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  2889 agatatgatttggaagaatacaaatcaaacaaaccaatttcgacattgaaaaaggtttttcat 2951  T

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Target: scaffold0482 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11617 - 11410
Alignment:
Q  17 ataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttctcatgataaggatgcctat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||| |||    
T  11617 ataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcctatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcacgatgagaatgcatat 11518  T
Q  117 tacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaat 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11517 tacactagaaattattctcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaaatcattcatgaatgaattatttattaagtca-tcatttat 11419  T
Q  217 gttattgat 225  Q
    | |||||||    
T  11418 gatattgat 11410  T

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Target: scaffold0135 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 7)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 2092 - 2332
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2092 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 2191  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  2192 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 2291  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  2292 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 2332  T

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Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 6307 - 6547
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6307 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 6406  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  6407 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 6506  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  6507 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 6547  T

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Target: scaffold0135; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 10522 - 10762
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10522 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 10621  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  10622 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 10721  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  10722 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 10762  T

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Target: scaffold0135; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14977
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14737 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 14836  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  14837 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 14936  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  14937 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 14977  T

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Target: scaffold0135; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 18952 - 19192
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18952 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 19051  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  19052 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 19151  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  19152 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 19192  T

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Target: scaffold0135; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 23167 - 23407
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23167 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 23266  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  23267 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 23366  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  23367 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 23407  T

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Target: scaffold0135; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 27382 - 27622
Alignment:
Q  88 aagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatga 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27382 aagaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatga 27481  T
Q  188 a---tgaattatttattaagtcattcattaatgttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaag 284  Q
    |   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||  |||||     
T  27482 atattgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaat 27581  T
Q  285 atttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagata 325  Q
    | |||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||    
T  27582 acttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 27622  T

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Target: scaffold0206 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 381
Target Start/End: Original strand, 449 - 793
Alignment:
Q  19 aattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatgaaa-gaatgttctcatgataaggatgcctatt 117  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||    
T  449 aattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattatt 548  T
Q  118 acactcaaaattattctcatcacttcatcaaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatg 217  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||                   
T  549 acactcgaaattattctcattacctcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta--------------- 633  T
Q  218 ttattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactat 317  Q
          |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |   |||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  634 ------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacaaaggatggtccaagaatcttccatcatttt 727  T
Q  318 tcaagatatgatt-tgaagaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcat 381  Q
    | |||||||||||  | | |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  728 ttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaatttttaccttgagaaaagtttctcat 793  T

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Target: scaffold0186 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 332
Target Start/End: Original strand, 3501 - 3592
Alignment:
Q  241 gaagaaaattcatgatcatatacttggagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcactattcaagatatgatttg 332  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  3501 gaagaaaatccatgatcatatgctcgaagattctatcataaaagacttaggatgatcaaagaatctttcatcattactcaaaatatgatttg 3592  T

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Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 3353 - 3499
Alignment:
Q  48 tgtcatctcatatagaagagaacattatcaactctaatg-aaagaatgttctcatgataaggatgcctattacactcaaaattattctcatcacttcatc 146  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||| ||| || ||||||||| |||   | |||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  3353 tgtcttctcatatagaagacaacattatcaattttgatgaaaataatattatcatgataaagataattgttacactcgaaattattttcattacttcatc 3452  T
Q  147 aaaatgataagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaatta 195  Q
     |||| || |||||||| | |||||| ||||  || |||||||||||||    
T  3453 gaaataattagaatcaactctgaagaaaaac--atccatgaatgaatta 3499  T

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Target: scaffold0771 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5596 - 5505
Alignment:
Q  303 atcttccatcactattcaagatatgatttga-agaata-aaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatcttcctacaaa 392  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5596 atcttccatcatttttcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 5505  T

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