View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1910_low_48 (Length: 305)

Name: NF1910_low_48
Description: NF1910
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1910_low_48
NF1910_low_48
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (24-299)||(7146625-7146900)
chr3 (14-290)||(23601347-23601623)
chr3 (28-299)||(6176759-6177030)
chr3 (24-299)||(2813781-2814056)
chr3 (27-289)||(29308994-29309257)
chr3 (14-281)||(25873411-25873678)
chr3 (24-299)||(30167626-30167901)
chr3 (55-283)||(9378712-9378940)
chr3 (25-243)||(49732270-49732488)
chr3 (33-268)||(28675241-28675476)
chr3 (25-107)||(32004565-32004647)
chr3 (159-243)||(13448197-13448281)
chr3 (33-111)||(24227408-24227486)
chr3 (24-106)||(53946374-53946456)
chr3 (24-107)||(14868258-14868341)
chr3 (24-61)||(6517892-6517929)
chr3 (54-107)||(13448093-13448145)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (24-299)||(43627082-43627358)
chr2 (24-290)||(33547456-33547722)
chr2 (24-286)||(13549708-13549970)
chr2 (24-299)||(9949545-9949820)
chr2 (24-286)||(22052211-22052473)
chr2 (24-229)||(26681465-26681670)
chr2 (24-286)||(31085931-31086193)
chr2 (24-220)||(31594138-31594334)
chr2 (24-223)||(35694217-35694416)
chr2 (24-286)||(45421102-45421364)
chr2 (96-283)||(26180222-26180409)
chr2 (54-284)||(31774298-31774528)
chr2 (24-88)||(32145487-32145550)
chr2 (24-102)||(26490731-26490809)
chr2 (25-82)||(41578120-41578177)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (24-299)||(2871775-2872049)
chr8 (24-289)||(16421301-16421565)
chr8 (34-301)||(412645-412911)
chr8 (24-290)||(7451936-7452202)
chr8 (25-160)||(35405329-35405464)
chr8 (194-299)||(35405459-35405564)
chr8 (24-117)||(28542587-28542680)
chr8 (25-241)||(19385049-19385265)
chr8 (24-111)||(12218486-12218573)
chr8 (158-217)||(30501686-30501745)
chr8 (65-126)||(39483194-39483255)
chr8 (27-82)||(30261272-30261330)
chr8 (178-238)||(34642101-34642161)
chr8 (198-286)||(39482996-39483084)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (24-299)||(32353578-32353853)
chr1 (24-281)||(48073731-48073988)
chr1 (24-299)||(38231271-38231546)
chr1 (24-285)||(3692211-3692472)
chr1 (24-286)||(37530148-37530412)
chr1 (35-299)||(14119359-14119624)
chr1 (24-290)||(36928751-36929017)
chr1 (24-290)||(36305368-36305634)
chr1 (25-283)||(4644598-4644856)
chr1 (25-243)||(21527746-21527964)
chr1 (25-243)||(14365962-14366179)
chr1 (24-264)||(47115872-47116112)
chr1 (28-135)||(25639908-25640015)
chr1 (30-243)||(48266055-48266268)
chr1 (25-107)||(52336247-52336329)
chr1 (25-107)||(9528226-9528308)
chr1 (54-284)||(30970904-30971134)
chr1 (27-100)||(41503381-41503454)
chr1 (34-82)||(37960185-37960233)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (24-299)||(15673409-15673684)
chr6 (28-299)||(23347747-23348018)
chr6 (24-289)||(13755049-13755314)
chr6 (24-286)||(8873120-8873382)
chr6 (24-286)||(25317438-25317700)
chr6 (24-286)||(26204932-26205194)
chr6 (14-286)||(19348848-19349113)
chr6 (25-243)||(33629683-33629900)
chr6 (159-250)||(1682765-1682856)
chr6 (36-244)||(19256641-19256849)
chr6 (183-273)||(4406755-4406845)
chr6 (24-82)||(4596470-4596528)
chr6 (177-222)||(14528110-14528155)
chr6 (24-70)||(20765914-20765960)
chr6 (177-222)||(14532836-14532881)
chr6 (156-244)||(4474414-4474502)
chr6 (188-244)||(33745843-33745899)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (24-299)||(23873757-23874032)
chr4 (28-299)||(8487262-8487533)
chr4 (24-299)||(55298207-55298479)
chr4 (24-289)||(2630982-2631247)
chr4 (14-290)||(20673283-20673561)
chr4 (24-186)||(12776602-12776763)
chr4 (24-165)||(33312983-33313124)
chr4 (24-299)||(7663519-7663794)
chr4 (30-283)||(23279197-23279450)
chr4 (25-243)||(47540510-47540728)
chr4 (25-238)||(8655415-8655628)
chr4 (34-141)||(25875129-25875236)
chr4 (25-243)||(3130316-3130534)
chr4 (28-211)||(1121013-1121196)
chr4 (25-107)||(5817654-5817736)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (24-299)||(13439637-13439912)
chr7 (24-273)||(28326940-28327189)
chr7 (24-290)||(30385784-30386049)
chr7 (24-282)||(45235534-45235792)
chr7 (24-283)||(12379022-12379281)
chr7 (28-200)||(3632391-3632561)
chr7 (123-286)||(45942534-45942697)
chr7 (24-283)||(15654002-15654261)
chr7 (27-283)||(46623291-46623547)
chr7 (20-281)||(3104483-3104744)
chr7 (27-283)||(43104898-43105154)
chr7 (24-111)||(21277520-21277607)
chr7 (25-107)||(9546322-9546404)
chr7 (24-111)||(38730087-38730175)
chr7 (24-139)||(19728071-19728186)
chr7 (24-102)||(31025977-31026055)
chr7 (176-241)||(39474359-39474424)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (24-286)||(6264492-6264754)
chr5 (24-285)||(34480540-34480801)
chr5 (24-299)||(32917901-32918176)
chr5 (24-215)||(34858058-34858249)
chr5 (24-286)||(15499940-15500202)
chr5 (25-243)||(10487243-10487461)
chr5 (177-286)||(31862330-31862439)
chr5 (34-244)||(587110-587320)
chr5 (164-274)||(6020462-6020572)
chr5 (24-102)||(4399461-4399539)
chr5 (28-102)||(3199605-3199679)
[»] scaffold0287 (1 HSPs)
scaffold0287 (28-200)||(13524-13694)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (24-299)||(7259-7534)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (25-241)||(134975-135191)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (25-241)||(312802-313018)
scaffold0002 (25-241)||(328256-328472)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (25-117)||(22676-22768)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (74-111)||(12339-12376)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 7146625 - 7146900
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7146625 tagcaaatacccaaacaaacaagggggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 7146724  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7146725 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 7146824  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7146825 ttgcaaaaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 7146900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 23601347 - 23601623
Alignment:
Q  14 ataaacacagtagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctaga 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23601347 ataaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgagtcccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaga 23601446  T
Q  114 gacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaa 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23601447 gacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaa 23601546  T
Q  214 gccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 290  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23601547 gccagattagttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 23601623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6177030 - 6176759
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6177030 caatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagcttaat 6176931  T
Q  128 cttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgc 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6176930 cttatctagtaaacaagagatgagggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacataaaagccatattagttgc 6176831  T
Q  228 ataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6176830 ataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 6176759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2814056 - 2813781
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2814056 tagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccattgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacaact 2813957  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2813956 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccagactacccaggcacatagaagtcatattag 2813857  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  2813856 ttgcataaacgaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatttgaaatattatct 2813781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 29308994 - 29309257
Alignment:
Q  27 ccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29308994 ccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagcttaa 29309093  T
Q  127 tcttatctagtaaacaagggat-gggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagtt 225  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||    
T  29309094 tcttagctagtaaacaagagatggggggtaacaacatgattaaacatacggttgttacgctcattccacacaacccagacacatagaagtcatattagtt 29309193  T
Q  226 gcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309194 gcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 29309257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25873678 - 25873411
Alignment:
Q  14 ataaacacagtagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctaga 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25873678 ataaaaacattagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaagatagcttttttagctttcagccaacctaaa 25873579  T
Q  114 gacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaa 213  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  25873578 gacatcaacttaaccttatcaagtaaacacgggatgggggtaacaacatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaa 25873479  T
Q  214 gccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaa 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25873478 gccatatgagttgcataaaagaacgcctagcagcaccaccacctgccaaatgagtgaactgtaaaaaa 25873411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30167901 - 30167626
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  30167901 tagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgccgggtaccataaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaacatct 30167802  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||  || ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30167801 taactttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccatataag 30167702  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||| ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||    
T  30167701 ttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacccgtcaaataagtaaactgaagaaaatgatcggaaatattatct 30167626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 283
Target Start/End: Original strand, 9378712 - 9378940
Alignment:
Q  55 accaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggt 154  Q
    ||||||| || || || |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||  |||||||| ||    
T  9378712 accaccattgttgtgtaccaataacaaaggtagcttttttaacttttagccaacctaaagacaacatcttaaccttgtctaataaacgggggatgggagt 9378811  T
Q  155 aacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccacca 254  Q
    |||||||| ||||||||  || |  || | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||    
T  9378812 aacaacattattaaacagacgatagtttcattcattccaaacaacccaggcacacagaagtcatatgagttgcataaaagaacgactatcattaccacca 9378911  T
Q  255 cctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    | | ||| |||||| |||||||| |||||    
T  9378912 cttgtcatatgagtaaactgtaacaaatg 9378940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49732488 - 49732270
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||    
T  49732488 agcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatctt 49732389  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| || |  ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  49732388 gaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcgttccacacaacccgggcacagagaagccaaataagt 49732289  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49732288 tgcataaaagaacgtctag 49732270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28675476 - 28675241
Alignment:
Q  33 cccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttat 132  Q
    ||||||||||| | |||  | |||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |    
T  28675476 cccaaacaaactaaaggactcgaccaccactactgcgtaccgaaaacaaaagtagcttttttaactttcaaccagcctaaagacaacatcttaaccttgt 28675377  T
Q  133 ctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaa 232  Q
    |||  || | ||| ||||| |||||||||| |||||| |  || ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  28675376 ctaacaatcgaggaatgggagtaacaacattattaaataggcgattatttcgttaattccacacaacacagacacacagaagtcaaatgagttgcataaa 28675277  T
Q  233 agaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagt 268  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||    
T  28675276 agaacgtctagctttaccatcacctatcatatgagt 28675241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Original strand, 32004565 - 32004647
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  32004565 agcctatacccaaacatacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagttcttttagctttcaaccaa 32004647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 13448197 - 13448281
Alignment:
Q  159 acatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13448197 acattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaactcaggcacagagaagccaaataagttgcataaaagaacgtctag 13448281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 111
Target Start/End: Original strand, 24227408 - 24227486
Alignment:
Q  33 cccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 111  Q
    |||||||| |||| ||||   |||||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  24227408 cccaaacagacaaaagggcacgaccaccattgctgagtactaaaaacaaaagtaatttttttagctttcaaccaaccta 24227486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 53946456 - 53946374
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaacca 106  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  53946456 tagccaatgcccaaacaaaccaaaggatttgaccaccacatctgagttcctaaaacaaaagttacatttttagctttcaacca 53946374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14868341 - 14868258
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  14868341 tagccaaagcccaaacaaaccataggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcatttttagctttcagccaa 14868258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 6517929 - 6517892
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccacca 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6517929 tagccaatatccaaacaaacaagagggcttgaccacca 6517892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 107
Target Start/End: Original strand, 13448093 - 13448145
Alignment:
Q  54 gaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13448093 gaccaccactgttgagtaccaaacacaaaagtag-ttttttagctttcaaccaa 13448145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 43627082 - 43627358
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagctttt-ttagctttcaaccaacctagagacatcagc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43627082 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaatgtagctttttttagctttcaaccaacctagagacaacagc 43627181  T
Q  123 ttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43627182 ttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataa 43627281  T
Q  223 gttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  43627282 gttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatatgaaatattatct 43627358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 33547456 - 33547722
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33547456 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 33547555  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  33547556 taaccttatcaagtaaacaggggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattag 33547655  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33547656 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaa 33547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 13549708 - 13549970
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||| || ||    
T  13549708 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttaactttaagtcaacctaaagacaacatct 13549807  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13549808 taatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccacacaacccaggcacaaagaagccaaataag 13549907  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13549908 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatc 13549970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9949820 - 9949545
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  9949820 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtgtcaaaaacaaaggtagcttttttagcttttagccaacctaaagacatcaact 9949721  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9949720 taaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaaccacatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataag 9949621  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  9949620 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccaccagccaaaagagtgaactgtaaaaaatgatcggaaatattatct 9949545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 22052211 - 22052473
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||    
T  22052211 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaagtagcttttttagctttaagccaacctaaagacaacaact 22052310  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||| | ||||||| |||| |||||||| || ||    
T  22052311 taatcttatctaataaacaatggatgggggtaacaacatgattaaactgacggttatttcgttcattccagataacccagacacatagaagccaaatgag 22052410  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22052411 ttgcaaaaaagaccgtctagcaacaccaccacctgacaaatgagtaaactgaagaaaatgatc 22052473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Original strand, 26681465 - 26681670
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  26681465 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacaacaact 26681564  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  26681565 taaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattag 26681664  T
Q  224 ttgcat 229  Q
    ||||||    
T  26681665 ttgcat 26681670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31086193 - 31085931
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||    
T  31086193 tagcctatatccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgtataccaaaaacaaatgtagcttttttagctttcaactaacctaaagacaacgtct 31086094  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  31086093 taatcttgtctaataaacacgggatgggagtaacaacattattaaacatgcggttatttcgttaattccaaacaacccaggcacacaaaaggcatatgag 31085994  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31085993 ttgcataaaagaacgtctagcattaccaccacctgacaaatgagtaaactgtaaaaaatgatc 31085931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Original strand, 31594138 - 31594334
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  31594138 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacatcaatt 31594237  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatat 220  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31594238 taaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatat 31594334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Original strand, 35694217 - 35694416
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |  ||    
T  35694217 tagccaatatccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagtttttttagctttcagctaacctaaagacagcgtct 35694316  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||    
T  35694317 taatcttatctagtaaacaagggatggggataacaacatgattaaacacacggttatttcgttcattccaaacaactcaagcacgtagaagccatgtaag 35694416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 45421102 - 45421364
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  45421102 tagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgctgggtaccataaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaacatct 45421201  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||  || ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45421202 taactttgtctaacaaacgtggaatgtgagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccatataag 45421301  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||| || || | |||||||||    
T  45421302 ttgcataaaagaacgtctagaaacattaccacctgtcaaataagtaaattgaataaaatgatc 45421364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26180409 - 26180222
Alignment:
Q  96 gctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaa 195  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||  |||||||| |||||||||| |||| | |  || ||||| |||||||| || |    
T  26180409 gctttcagctaacctaaagacatcatcttaaccttgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattataaaggcgattatttcgtttatttcata 26180310  T
Q  196 caacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||  ||| || |||||||||||    
T  26180309 caactcaggcacacagaagccatatgagttgcagaaaagaacgcctagcattaccaccacctgccaaaaaagtaaattgtaaaaaatg 26180222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Original strand, 31774298 - 31774528
Alignment:
Q  54 gaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatggggg 153  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  |||  | || ||||||||||||| | | |||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| || ||||| |    
T  31774298 gaccaccactgctgagttccataagtaaaaatggcatttttagctttcagcaatcctaaagacaacatcttaaccttatcaagcaaacagggaatgggag 31774397  T
Q  154 taacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccacc 253  Q
    ||| |||||  |||||||  ||  |||| |  | |||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| | ||||   ||| ||    
T  31774398 taataacatttttaaacaagcgactattgccctcattccacacaactcaagcacaaagaagtcagatgagttgcatgaaagaacatttagctttaccgcc 31774497  T
Q  254 acctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatga 284  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31774498 acctgtcatatgagtgaactgcaaaaaatga 31774528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 32145487 - 32145550
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagc 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  32145487 tagcctatacccaaacaaacaagagggctagacca-cactgctgtgtaccaaaaacaaaggtagc 32145550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26490809 - 26490731
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 102  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||  |  |||||||||||||||    
T  26490809 tagccaatacccaaacaagccaaagggcttgactaccacttctgagtaccaaatacaaacatgacttttttagctttca 26490731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 41578177 - 41578120
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaa 82  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||||    
T  41578177 agccgatacccaaacaaacaagcgggctcgaccaccacatatgagtcccaaaaacaaa 41578120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 2871775 - 2872049
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2871775 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagatagcagct 2871874  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871875 taatcttatctagtaaacaaggtatgggg-taacaacatgattaaacatctgattattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 2871973  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2871974 ttgcataaaagaacgtccagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 2872049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16421565 - 16421301
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16421565 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagatagcagct 16421466  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  16421465 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaatatgattaaacaaacggttgttacgctcattccacacaacccaaacacatagaagccatattag 16421366  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16421365 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactg-gaaaaatgatctga 16421301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 412911 - 412645
Alignment:
Q  34 ccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatc 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  412911 ccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgaattccaaaaacaaaggtagtttttttagctttcagccaacctaaagacagcaacttaatcttatc 412812  T
Q  134 tagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  412811 tagtaaacaagggatgggg-taacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacaaagaagcaatattagttgcataaaa 412713  T
Q  234 gaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatctac 301  Q
    || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  412712 gaccgtttgacaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatcggaaatattatctac 412645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 7451936 - 7452202
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  7451936 tagccaatacccaaataaacaagagggcttgaccaccactgttgggtaccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaaggacaacatct 7452035  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    | | ||| ||||  ||||  |||||||| || | ||||| ||||||||  || |||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7452036 ttaccttgtctaacaaacgggggatgggagttataacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaacccagtcacaaagtagccatataag 7452135  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  7452136 ttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatgatctgaa 7452202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Original strand, 35405329 - 35405464
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    |||    
T  35405329 agccaatactcaaacaaacaagagggtttgatcaccactgctgaattccaaaaacaaaggtagcttttttagcttttagccaacctaaagacaatgtctt 35405428  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaac 160  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35405429 aatcttttctaataaacaagggatgggggcaacaac 35405464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 299
Target Start/End: Original strand, 35405459 - 35405564
Alignment:
Q  194 aacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagta 293  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  35405459 aacaacccagacacatagaaaccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgaaaaaaatgatcggaaata 35405558  T
Q  294 taatct 299  Q
    | ||||    
T  35405559 ttatct 35405564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Original strand, 28542587 - 28542680
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagaca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28542587 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgaaagccaaaaacaaaacaagcttttttagctttcaaccatcctaaagaca 28542680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19385265 - 19385049
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  |||| || |||    
T  19385265 agcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccgaacacaaaagtagcttttttagcttttaaccaagataaggacaacatctt 19385166  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| | |||| | ||||||    
T  19385165 gaccttgtctaagaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacacaggcacagataagctaaataagt 19385066  T
Q  225 tgcataaaagaacgtct 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  19385065 tgcataaaagaacgtct 19385049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 12218573 - 12218486
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 111  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12218573 tagccaatacccagacaaagaaaagggcatgaccaccactgctgagtaccaaaaataaagatagcttttctagctttcaaccaaccta 12218486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 217
Target Start/End: Original strand, 30501686 - 30501745
Alignment:
Q  158 aacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagcca 217  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  30501686 aacattattaaacagacggttattacgttcattccacaaaacccaagcacaaagaagcca 30501745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 39483255 - 39483194
Alignment:
Q  65 ctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaa 126  Q
    |||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39483255 ctgagtaccaaaaataaaagtgacttttttagctttcagccaccctagagacatcaacttaa 39483194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 30261272 - 30261330
Alignment:
Q  27 ccaatacccaaacaaaca---agagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaa 82  Q
    ||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30261272 ccaatacccaaacaaacagctaaagggcttgaccaccactactgagtaccaaaaacaaa 30261330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34642161 - 34642101
Alignment:
Q  178 tattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacg 238  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  34642161 tattacgttcattccacactacccagacacataggagccatataagttgtatgaaagaacg 34642101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39483084 - 39482996
Alignment:
Q  198 acccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    ||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  39483084 acccatgcacaaagaagccatattagttgcatgaaagaccctctagctttgccaccacttgtcatatgagtaaactgcaataaatgatc 39482996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32353853 - 32353578
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32353853 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 32353754  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32353753 taatcttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacataattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattag 32353654  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32353653 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactataaaaaatgatctgaaatattatct 32353578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 24 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48073988 - 48073731
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48073988 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 48073889  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  48073888 taaccttatcaagtaaacaggggatgggggtaacaacgtgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattag 48073789  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaa 281  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48073788 ttgcataaaagaacgtctaacagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaa 48073731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 38231271 - 38231546
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38231271 tagccaatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgatgagtcccaaaaacgaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 38231370  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  38231371 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaactcaggcacatagaagtcatattag 38231470  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38231471 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaaaaagtgaaatgtaaaaaatgatatgaaatattatct 38231546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Original strand, 3692211 - 3692472
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692211 tagccaatactcaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagct 3692310  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3692311 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaacggttgctacgctcattccacacaacccaggcacatagaagccatattag 3692410  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3692411 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactggaaaaaatgat 3692472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 37530148 - 37530412
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  37530148 tagccaatatccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacatcaact 37530247  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  37530248 taaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaacgattattaagttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattag 37530347  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagc--aacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37530348 ttgcataaaagaacgtctagcagaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 37530412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 299
Target Start/End: Original strand, 14119359 - 14119624
Alignment:
Q  35 caaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctaga-gacatcagcttaatcttatc 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  14119359 caaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtttcgaaaacaaaggtaacttttttagctttcagccaacctaaaagacaacatcttaatcttatc 14119458  T
Q  134 tagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaa 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  14119459 tagtaaacaagggacgggggtaacaacatgattaaacagacgattatttcgttcattccaaacaacccagacacataaaagccatattagttgcataaaa 14119558  T
Q  234 gaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  14119559 gaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcggaaatattatct 14119624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 36928751 - 36929017
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  36928751 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttaaccaccactgttgggtaccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaaggacaacatct 36928850  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    | | ||| ||||  |||| ||||||||| || | ||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36928851 ttaccttgtctaacaaacgagggatgggagttataacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaagcacaaagtagccaaataag 36928950  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||    
T  36928951 ttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaattgaagaaaatgatctgaa 36929017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 36305368 - 36305634
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  36305368 tagccaatagccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgttgggtactgaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaacctaaggacaacatct 36305467  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    | | ||| ||||  ||||   | ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36305468 ttaccttgtctaacaaacggagaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccagacacaaagtagccatataag 36305567  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||    
T  36305568 ttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctgtcaaataagtaaattgaagaaaatgatctgaa 36305634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 4644598 - 4644856
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||    
T  4644598 agcctatacccaaacacacaagagggcacgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagctttttttgctttcaaccaacctaaggacaacatctt 4644697  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  ||||  || ||||  || |  |||| ||||||||   | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  4644698 gaccttgtctaacaaactgggaatggaagttattacattattaaacagatgattatttcgttcattccacacaacccaggcacagagaagccaaacaagt 4644797  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  4644798 tgcataaaagaacgtctagaattagcaccatctgtcaaataagtaaactgtagaaaatg 4644856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 21527746 - 21527964
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  || | || |||    
T  21527746 agcctatacccaaacacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggataacatctt 21527845  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21527846 gaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacagtcgattatttcgctcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagt 21527945  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21527946 tgcataaaagaacgtctag 21527964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14366179 - 14365962
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||    
T  14366179 agcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaa-atagcttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatctt 14366081  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  14366080 gaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaagcacagagaagctaaataagt 14365981  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14365980 tgcataaaagaacgtctag 14365962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 264
Target Start/End: Original strand, 47115872 - 47116112
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||| || ||    
T  47115872 tagcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgggtaccaaaagcaaaaatagcttttttagctttcaaccattctaaggacaacatct 47115971  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    | | ||| |||   ||||| || ||| | || |  |||| ||||||||  || |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  47115972 ttaccttgtctgacaaacagggaatgagagttattacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaactcaggcacaaaaaagtcatataaa 47116071  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||    
T  47116072 ttgcataaaagaacgtctagaattaacaccacctgtcaaat 47116112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25640015 - 25639908
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| || |||||     
T  25640015 caatacccaaacaaacaagagggtatgaccaccactgctgggtaccaaaaacaaaagtagcttttctagctttcaactaacttaaggacaacatcttaac 25639916  T
Q  128 cttatcta 135  Q
    ||||||||    
T  25639915 cttatcta 25639908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48266268 - 48266055
Alignment:
Q  30 atacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatct 129  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| || ||| | ||    
T  48266268 atacccaaacacacaagagggtatgaccaccactgctaagtatcaaacacaaaagtagtttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatcttgacct 48266169  T
Q  130 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcat 229  Q
    |  |||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  48266168 tgcctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccagacacagagaagccaaataagttgcat 48266069  T
Q  230 aaaagaacgtctag 243  Q
    |||| ||| |||||    
T  48266068 aaaataacatctag 48266055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Original strand, 52336247 - 52336329
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  52336247 agcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaaatagcttttttatctttcaaccaa 52336329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9528308 - 9528226
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  9528308 agcctatacccaaacacataagaggacaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagattttttaactttcaaccaa 9528226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30971134 - 30970904
Alignment:
Q  54 gaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatggggg 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||  |  | |||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||  || | ||| || ||||| |    
T  30971134 gaccaccactgctgagttccaaaagtaaaaatgacatttttagcttgcagccaacctaaagacaataacttaatcttataaagcagacagggaatgggag 30971035  T
Q  154 taacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccacc 253  Q
    ||| |||||  |||||||  ||  |||| || | || ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| | ||||   ||| ||    
T  30971034 taaaaacattgttaaacaatcgactattgcgctcatgccacacaacccaagcacaaaggagccagatgagttgcatgaaagaacatttagctttaccgcc 30970935  T
Q  254 acctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatga 284  Q
    ||||  || |||||||||||| || ||||||    
T  30970934 acctgccatatgagtgaactgaaacaaatga 30970904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41503454 - 41503381
Alignment:
Q  27 ccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagcttt 100  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  41503454 ccaatgcccaaacaaaccataggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcttgtttagcttt 41503381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 37960233 - 37960185
Alignment:
Q  34 ccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaa 82  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  37960233 ccaaacaaacaagcgggttcgaccaccacatatgagtcccaaaaacaaa 37960185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 15673409 - 15673684
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15673409 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagct 15673508  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15673509 taatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaaaatgattaaacaaacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattag 15673608  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15673609 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 15673684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23348018 - 23347747
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23348018 caatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacaacttaat 23347919  T
Q  128 cttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgc 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23347918 cttatctggtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacataaaagccatattagttgc 23347819  T
Q  228 ataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23347818 ataaaagaacgtctagcaacaccaccgcctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 23347747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Original strand, 13755049 - 13755314
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13755049 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagtt 13755148  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  13755149 taatcttatctagtaaacaatggatgggggtaacaacctgattaaacatacggttgttacgctcattccacacaacccagacacatagaagtcatattag 13755248  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13755249 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 13755314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8873382 - 8873120
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  8873382 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgttgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacatcaact 8873283  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  8873282 taaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattag 8873183  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8873182 ttgcataaaagaacgtctaacagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 8873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 25317438 - 25317700
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||    
T  25317438 tagccaatatccaaacaaacaagagggcttgacgaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagtttttttaactttaagccaacctaaagacaacatct 25317537  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | || |||||| ||||| || |||||||||||||| || ||    
T  25317538 taatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacctgattaaagagacggttatttctttcattccacacaactcatgcacaaagaagccaaattag 25317637  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25317638 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatc 25317700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Original strand, 26204932 - 26205194
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||    
T  26204932 tagccaatatccaaacaaacaagagggcttgacgaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagtttttttaactttaagccaacctaaagacaacatct 26205031  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | || |||||| ||||| || |||||||||||||| || ||    
T  26205032 taatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacctgattaaagagacggttatttctttcattccacacaactcatgcacaaagaagccaaattag 26205131  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26205132 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatc 26205194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Original strand, 19348848 - 19349113
Alignment:
Q  14 ataaacacagtagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctaga 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          | |||||||| |    
T  19348848 ataaagacattagccaatacccatacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttta---------agccaacctaaa 19348938  T
Q  114 gacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaa 213  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19348939 gacaacatcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaccatgattaaacatacggttatttcgttcattccaaacaacccaggcacagagaa 19349038  T
Q  214 gccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaa--ctgtaaaaaatgatc 286  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  19349039 gccatattagttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaattgtgtaaaaaatgatc 19349113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 33629683 - 33629900
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||  ||    
T  33629683 agcctatactcaaacacacaagagggcatgaccaccactgttgagtaccaaacacaaaagtag-ttttttagctttcaaccaagctaaggacaacaattt 33629781  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  ||||  || ||||| || |  | || ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33629782 gaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattatattattaaacaggcgattatttcgttaattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagt 33629881  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33629882 tgcataaaagaacgtctag 33629900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Original strand, 1682765 - 1682856
Alignment:
Q  159 acatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacacc 250  Q
    |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1682765 acattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagttgcataaaagaacgtctagcaccacc 1682856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 244
Target Start/End: Original strand, 19256641 - 19256849
Alignment:
Q  36 aaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatcta 135  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| ||| ||||    
T  19256641 aaacaaacaatatggttcgaccaccacggttgagtaccatacacaaaaataggttttatagctttcaaccatcctaaagacaacatattaaccttgtcta 19256740  T
Q  136 gtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaaga 235  Q
     |||||  || || |  |||||||||| |||||| |  |  ||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  19256741 ataaacggggaatagacgtaacaacattattaaagaggcaattatttcgttcattccaaacaacctagacacacagaagccaaatgagttgcataaaaga 19256840  T
Q  236 acgtctagc 244  Q
     ||||||||    
T  19256841 gcgtctagc 19256849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 4406755 - 4406845
Alignment:
Q  183 cgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaact 273  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||    
T  4406755 cgttcattccacacaacccaggcacaaagaagtcatattagctgcagaaacgaacgtctagctttaccaccacctatcatatgagtaaact 4406845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 82
Target Start/End: Original strand, 4596470 - 4596528
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaa 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  4596470 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccgctgttgagagccaaaaacaaa 4596528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 14528110 - 14528155
Alignment:
Q  177 ttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataa 222  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14528110 ttattacgttcattccacacaaccaaggcacaaagaagccatataa 14528155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 70
Target Start/End: Original strand, 20765914 - 20765960
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagt 70  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  20765914 tagccgatacccaaacaaacaatagggttcgaccaccactgttgagt 20765960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 14532836 - 14532881
Alignment:
Q  177 ttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataa 222  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14532836 ttattacgttcattccacacaaccaaggcacaaagaagtcatataa 14532881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 4474414 - 4474502
Alignment:
Q  156 acaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagc 244  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||   |||| || ||||| | |||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||    
T  4474414 acaacattattaaacatgtggttattacgttcggtccacacgacccaagtacaaagaagccagatgagctgcataaaggaacgtttagc 4474502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Original strand, 33745843 - 33745899
Alignment:
Q  188 attccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagc 244  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||    
T  33745843 attccacacaacccaagcacaaagaagccatatgagctgaagaaatgaacgtctagc 33745899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23874032 - 23873757
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23874032 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 23873933  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23873932 taatcttatcaagtaaacaggggatgggggtcacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattag 23873833  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23873832 ttgcataaaagaacgtctagcagcacctccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaaatattatct 23873757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8487533 - 8487262
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8487533 caatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagcttaat 8487434  T
Q  128 cttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgc 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  8487433 cttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcagtccaaacaacccaggcacataaaagccatattagttgc 8487334  T
Q  228 ataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  8487333 ataaaagaacgtctagcaacaccaccacctgtcaaataagtgaactgtaagaaatgatctgaaatattatct 8487262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 55298207 - 55298479
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  55298207 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacaact 55298306  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  55298307 taatcttatcaagtaaacaggggataggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattag 55298406  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  55298407 ttgcataaaagaacgt---gcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatct 55298479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 289
Target Start/End: Original strand, 2630982 - 2631247
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2630982 tagccaatacctaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcctaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagct 2631081  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2631082 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaacggttgttacgctcattccacacaacccatgcacatagaagccatattag 2631181  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctga 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2631182 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactggaaaaaatgatctga 2631247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 20673283 - 20673561
Alignment:
Q  14 ataaacacagtagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctaga 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  20673283 ataaaaacattagcaaatacccaaacaaacaagagagcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggaagcttttttagctttataccaacctaga 20673382  T
Q  114 gacatcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaa 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20673383 gacagcagcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattatgttcattccaaacaacctaggcacatagaa 20673482  T
Q  214 gccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatc-aaatgagtgaactgt-aaaaaatgatctgaa 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20673483 gccatattagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccaactgtcaaaatgagtgaactgtaaaaaaatgatctgaa 20673561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12776763 - 12776602
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12776763 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagctcttttagctttcaaccaacctagagacagcagct 12776664  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12776663 taatcttatctagtaaacaagggat-ggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgtt 12776602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Original strand, 33312983 - 33313124
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33312983 tagccaatgcccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaagtaacttttttaactttcaaccaacctaaagacagcagct 33313082  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33313083 taatcttatctagtaaacaagggatgggagtaacaacatgat 33313124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7663794 - 7663519
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  7663794 tagccaatacccaaacaaacaagagagcatgaccaccactgatgggtaccaaaaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaacatct 7663695  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7663694 taaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccatataag 7663595  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||| || || | ||||||||| ||| ||| ||||    
T  7663594 ttgcataaaagaacgtctagaaacaaaaccacctgtcaaataagtaaaatgaataaaatgatcggaaatattatct 7663519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 283
Target Start/End: Original strand, 23279197 - 23279450
Alignment:
Q  30 atacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatct 129  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||| ||  | || ||||| ||    
T  23279197 atacccaaacaaacaagagggcaagaccaccactgttgggtaccgaaaacaaaagtagcttttttaccttttagccaccctaaaggaaacatcttaacct 23279296  T
Q  130 tatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcat 229  Q
    | |||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23279297 tgtctaataaacgggggatgggagtaacaacattattaaacagacgattatttcgttcgttccacacaacccacacacaaagaagccatataagttgcat 23279396  T
Q  230 aaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    |||||| | |||||    | ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23279397 aaaagagcatctagagtgagcactacctgtcaaataagtaaactgtaaaaaatg 23279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 47540510 - 47540728
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||| || |||    
T  47540510 agcctatacccaaacacacaagagggcatgaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaagttaaggacaacatctt 47540609  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  ||||  |  ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47540610 gaccttgtctaacaaacgggaaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagt 47540709  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47540710 tgcataaaagaacgtctag 47540728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8655628 - 8655415
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || |||    
T  8655628 agcctatacccaaacacatgagagggtaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatctt 8655529  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8655528 gaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattccacacaacccaggcacagagaagccaaataagt 8655429  T
Q  225 tgcataaaagaacg 238  Q
    ||||||||||||||    
T  8655428 tgcataaaagaacg 8655415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25875236 - 25875129
Alignment:
Q  34 ccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||    
T  25875236 ccaaacaaacaaaagggtttgaccaccactgatgcgtgccaaaaacaaaggtagtttttttagctttcaaccaacctaaagacaacatcttaaccttgtc 25875137  T
Q  134 tagtaaac 141  Q
    || |||||    
T  25875136 taataaac 25875129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3130534 - 3130316
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||  ||    
T  3130534 agcctatacccaaacacacaagagggcaagaccaccactgttgagtatcaaacacaaaagtagtttttttagctttcaaccaagctaaggacaacaattt 3130435  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||| ||||  || |  || ||| | || |  |||| ||||||||  || |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3130434 gaccttgtctaacaagcggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattttgttcattccacacaacccaggcacaaagaagccaaataagt 3130335  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3130334 tgcataaaagaacgtctag 3130316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1121196 - 1121013
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  |||| || ||| |     
T  1121196 caatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgttgggtaccaaaaacaaagatagcttttttaattttcaatcaacctaaggacaacatctttac 1121097  T
Q  128 cttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaag 211  Q
    ||| ||||  ||||  |||||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  1121096 cttgtctaacaaacgggggatgtgagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaatccaggcacaaag 1121013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5817736 - 5817654
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5817736 agcctatacccaaacacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagtttttttagctttcaaccaa 5817654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 13439637 - 13439912
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13439637 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaacactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 13439736  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13439737 taaccttatcaagtaaacaggggatgggggtaacaacgtgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagccagattag 13439836  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  13439837 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgagctgaaatattatct 13439912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 273
Target Start/End: Original strand, 28326940 - 28327189
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28326940 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccgccactgctgagtcccaaaaacaaatatagcttttttagctttcaaccaacctagagacagcagct 28327039  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28327040 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacattcggttattacgttcattccaaacaacccaagcacaaagaagccaaataag 28327139  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaact 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28327140 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctatcaaatgagtgaact 28327189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 290
Target Start/End: Original strand, 30385784 - 30386049
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30385784 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccgcccctgctgaatcccaaaaacaaatgtagcatttttagctttcaaccaacctagagacaacaact 30385883  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30385884 taatcttgtctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataag 30385983  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaa 290  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30385984 ttgcat-aaagaatgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaacatgatctgaa 30386049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 282
Target Start/End: Original strand, 45235534 - 45235792
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||    
T  45235534 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccacgactgagttccaaaaacaaaggtagcttttttagcattcagccaacctaaagacatcgtct 45235633  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  45235634 taatcttttctaataaacaagggatggggataacaacatgattaaacaaacggttatttcattcattccaaacaacccagacacatggaagccatattag 45235733  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  45235734 ttgcataaaagaacgtctagcaattccaccacctgtcaaatgagtaaactgtcaaaaat 45235792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12379281 - 12379022
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  12379281 tagcctatgcccaaacaaacaagcgggtttgaccaccattgctgtgttccaaaaacaaagttagcttttttagctttcagccaacctaaagacaacaact 12379182  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||  || |||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||  |  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  12379181 taacattgtctaataaacaggggatgggagtaactacattattaaacaggcatttatttcgttcattccacacaacgcaggcacacagaagccatacgag 12379082  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  12379081 ttgcataaaagaacgtctagctttaccaccacctgtaaaataagtaaactgtaaaaaatg 12379022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 3632391 - 3632561
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3632391 caatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaagataacttttttagctttcaactaacctaaagacaacagcttaat 3632490  T
Q  128 cttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacc 200  Q
    |||||||| | ||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3632491 cttatctaat-aacaaagaat-ggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 3632561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 286
Target Start/End: Original strand, 45942534 - 45942697
Alignment:
Q  123 ttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataa 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  45942534 ttaatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacaaatggttatttcgttcattccacacaacccagacacaaagaagccaaatta 45942633  T
Q  223 gttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45942634 gttgcataaaagaatgtgtagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatc 45942697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15654261 - 15654002
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||    
T  15654261 tagccaatacccaagcaaacaagagggcatgaccatcactgctgggtaccaaaaacaaaagtagttttattagctttcaaccatcctaaagacaacatct 15654162  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    | | ||| ||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15654161 ttaccttgtctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacagacgattatttcgttcattccacacaactcatgcacaaagaagccatataag 15654062  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  15654061 ttgcataaaagaacgtctagaaacagcaccacctatcaaataagtaaactgaagaaaatg 15654002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Original strand, 46623291 - 46623547
Alignment:
Q  27 ccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||    
T  46623291 ccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactactgggtaccaaaaacaaaagtagcttttttagctttcaaccatcctaaggacaacatcttaa 46623390  T
Q  127 tcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttg 226  Q
     ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46623391 ccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattatttcgttcatttcacacgacccatgcacaaagaagccatataagttg 46623490  T
Q  227 cataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||    
T  46623491 cataaaagaacgtctagaaacaacaccacctgtcaaataagtaaactgaagaaaatg 46623547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 281
Target Start/End: Original strand, 3104483 - 3104744
Alignment:
Q  20 acagtagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatc 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  3104483 acagtagcctatatccaaacaaacaagagggttagaccaccattgttgtgtaccatgaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacaac 3104582  T
Q  120 agcttaatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccata 219  Q
    | ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||||| |  || || || |||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  3104583 atcttaaccttgtctagcaaacatggaatgggagttataacatcattaaataggcgattgtttcgttcattccaaacaacacaggcacacataagacata 3104682  T
Q  220 taagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaa 281  Q
      ||||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  3104683 atagttgcataaaagaacgtctagcattagcaccacttgtcaaatgaataaactgtaaaaaa 3104744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Original strand, 43104898 - 43105154
Alignment:
Q  27 ccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||    
T  43104898 ccaatacccaaacaaacaagagggtttgactaccactgctcagagccaaaaacaaaacaagcttttttagctttcaaccatcctaaagaaaacatcttaa 43104997  T
Q  127 tcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttg 226  Q
     ||| |||| |||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||  || || ||  ||| ||||||||||| ||| || || | |||||| || ||||     
T  43104998 ccttgtctaataaacggggaatgggagtaaccacattattaaacaggcgattgttttgttcattccaaacaagccaagcgcacaaaagccaaatgagtta 43105097  T
Q  227 cataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatg 283  Q
    ||||||||  |||| |||   |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  43105098 cataaaagcccgtcgagctctaccaccacctgtcaaatgagtaaactgcagaaaatg 43105154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21277607 - 21277520
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21277607 tagccaatacccaaacaaacaagagggcatgaccaccactgctgggtaccaaaaacaaagatagcttttttagctttcaaccaaccta 21277520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Original strand, 9546322 - 9546404
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaa 107  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9546322 agcctatacccaaacacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaa 9546404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Original strand, 38730087 - 38730175
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagctttttt-agctttcaaccaaccta 111  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||  || || ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38730087 tagccgataaccaagcaaacaagagggttaaaccaccactattgtgtaccaaaaataaaagtagtttttttcagctttcaaccaaccta 38730175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 139
Target Start/End: Original strand, 19728071 - 19728186
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| |||  ||| ||| | || ||    
T  19728071 tagccaaagcccaaacaaaccataggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcatttttagctttcagccacgctaaagataacaact 19728170  T
Q  124 taatcttatctagtaa 139  Q
    |||| ||||| |||||    
T  19728171 taattttatcaagtaa 19728186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 31026055 - 31025977
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 102  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  31026055 tagccaatgcccaaacaagccaaaggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcatttttagctttca 31025977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39474424 - 39474359
Alignment:
Q  176 gttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtct 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||  | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  39474424 gttattacgttcattccaaactagccaaacgcaaagaagccataaaagttgaagaaaagaacgtct 39474359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6264754 - 6264492
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  6264754 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaagtagcttttttagctttcaaccaacctaaagacaacaact 6264655  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  6264654 taaccttataaagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatattag 6264555  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264554 ttgcataaaagaacgtttagcagcaccaccacctgtcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 6264492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 285
Target Start/End: Original strand, 34480540 - 34480801
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  34480540 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtgccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcagccaacctaaagacatcaact 34480639  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34480640 taaccttatcaagtaaacaagggatgggggtaaccacatgattaaacagacgattattacgttcattccaaacaacccagacacatagaagccatataag 34480739  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgat 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  34480740 ttgcataaaagaacgtctagcagcaccaccacctgccaaaagagtgaactgtaaaaaatgat 34480801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 32917901 - 32918176
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||    
T  32917901 tagccaatacccaaacaaacaagaggacttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaggtagcttttttaactttaagccaacctaaagacaacatct 32918000  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  32918001 taatcttatctaataaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacagacggttatttcgttcattccaaacaacccaggcacatagaagccaaattag 32918100  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  32918101 ttgcataaaagaccgtctagcaacaccaccacctgtcaaatgagtaaactgtaaaaaatgatcagaaatattatct 32918176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34858249 - 34858058
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34858249 tagccaatacccaaacaaacaagagggcttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacaacagct 34858150  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagc 215  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858149 taatcttatcaagtaaacaggggataggggtaacaacatggttaaacatacggttattacgttcattccaaacaacccaggcacaaagaagc 34858058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15500202 - 15499940
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | ||    
T  15500202 tagccaatactcaaataaacaagagggtttgaccaccactgctgagttccaaaaacaaaagtagcttttttagctttaagccaacctaaagacaataact 15500103  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| | ||||||| |||| |||||||| || ||    
T  15500102 taatcttatctaataaacaattgatgggggtaacaacatgattaaacagatggttatttcgttcattccagataacccagacacatagaagccaaatgag 15500003  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatc 286  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15500002 ttgcaaaaaagaccgtctagcaacaccaccacctgacaaatgagtaaactgaagaaaatgatc 15499940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10487461 - 10487243
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||    
T  10487461 agcctatacccaaacacataagagggcaagaccaccactgttgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagctttcaaccaagctaaggacaacatctt 10487362  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||||||||  ||||   | ||||  || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10487361 gaccttatctaacaaacggagaatggaagttattacattattaaacagacgattatttcgctcattccacacaacccaggcacaaagaagccaaataagt 10487262  T
Q  225 tgcataaaagaacgtctag 243  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10487261 tgcataaaagaacgtctag 10487243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 286
Target Start/End: Original strand, 31862330 - 31862439
Alignment:
Q  177 ttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgta 276  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    ||||||||| ||| |||||| ||||| |    
T  31862330 ttattatgttcattccacaaaacccagacacaaagaagccatattagttgcatgaaagaccgtctagctttgccaccacctgtcatatgagtaaactgca 31862429  T
Q  277 aaaaatgatc 286  Q
    | ||||||||    
T  31862430 ataaatgatc 31862439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Original strand, 587110 - 587320
Alignment:
Q  34 ccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaatcttatc 133  Q
    |||||||||||| ||||   ||| |||| || || || ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||  || ||    
T  587110 ccaaacaaacaaaagggcacgactaccattgttgtgtaccaaaaacaaaagtagtttttttaggtttcaaccaacctaatgacaacatcttaactttgtc 587209  T
Q  134 tagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaa 233  Q
    || |||   ||| ||||| ||||||||||   |||| |  || ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||| |||    
T  587210 taataagagaggaatgggagtaacaacatttctaaagaggcgattattacgttcgttccatacaactcaagcacacaaaagccaaatgagttgcatgaaa 587309  T
Q  234 gaacgtctagc 244  Q
    || ||||||||    
T  587310 gagcgtctagc 587320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 6020462 - 6020572
Alignment:
Q  164 attaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaa 263  Q
    ||||||||  || |||||||| | |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||   ||| |||||| ||| |    
T  6020462 attaaacaagcgattattacgctcattccacacaacccagacataaaggagccatataagttgctgaaaagaacatctagctttacctccacctgtcata 6020561  T
Q  264 tgagtgaactg 274  Q
    |||||||||||    
T  6020562 tgagtgaactg 6020572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Original strand, 4399461 - 4399539
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 102  Q
    |||| ||| ||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4399461 tagctaatgcccaaacaaaccataggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcttttttagctttca 4399539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3199679 - 3199605
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttca 102  Q
    |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3199679 caatgcccaaacaaaccataggacttgaccaccacatctgagttccaaaaacaaaagtggcatttttagctttca 3199605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0287 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:

Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13694 - 13524
Alignment:
Q  28 caatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagcttaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13694 caatacccaaacaaacaagagggcgtgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaagataacttttttagctttcaactaacctaaagacaacagcttaat 13595  T
Q  128 cttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacc 200  Q
    |||||||| | ||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13594 cttatctaat-aacaaagaat-ggggtaacaacatgattaaacatacggttattacgttcattccaaacaacc 13524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Original strand, 7259 - 7534
Alignment:
Q  24 tagccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  7259 tagccaatacccaaacaaacaagagagcatgaccaccactgatgggtaccaaaaacaaaagtagcttttctagctttcaaccaacctaaggacaacatct 7358  T
Q  124 taatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataag 223  Q
    ||| ||| ||||  ||||  || ||| | || |  |||| ||||||||  || ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7359 taaccttgtctaacaaacggggaatgagagttattacattattaaacagacgattattgcgttcattccacacaacccatgcacaaagaagccatataag 7458  T
Q  224 ttgcataaaagaacgtctagcaacaccaccacctatcaaatgagtgaactgtaaaaaatgatctgaagtataatct 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||| || || | ||||||||| ||| ||| ||||    
T  7459 ttgcataaaagaacgtctagaaacaaaaccacctgtcaaataagtaaaatgaataaaatgatcggaaatattatct 7534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 135191 - 134975
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || |||    
T  135191 agcctatacccaaacacatgagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatctt 135092  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  135091 gaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacagagaagccaaataagt 134992  T
Q  225 tgcataaaagaacgtct 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  134991 tgcataaaagaacgtct 134975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 313018 - 312802
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || |||    
T  313018 agcctatacccaaacacatgagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatctt 312919  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  312918 gaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacagagaagccaaataagt 312819  T
Q  225 tgcataaaagaacgtct 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  312818 tgcataaaagaacgtct 312802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 328472 - 328256
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagacatcagctt 124  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||| || |||    
T  328472 agcctatacccaaacacatgagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtagcttttttagccttcaaccaagctaaggacaacatctt 328373  T
Q  125 aatcttatctagtaaacaagggatgggggtaacaacatgattaaacatccggttattacgtttattccaaacaacccaggcacaaagaagccatataagt 224  Q
     | ||||||||  ||||  || ||||| || |  |||| ||||||||  || ||||| || | |||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  328372 gaccttatctaacaaacggggaatgggagttattacattattaaacaggcgattatttcgctcattcgacacaacccaagcacagagaagccaaataagt 328273  T
Q  225 tgcataaaagaacgtct 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  328272 tgcataaaagaacgtct 328256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22768 - 22676
Alignment:
Q  25 agccaatacccaaacaaacaagagggtttgaccaccactgctgagtcccaaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaacctagagaca 117  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  22768 agcctatacccaaatacataagagggcaagaccaccactgctgagtaccaaacacaaaagtggtttttttagctttcaatcaagctaaagaca 22676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 12376 - 12339
Alignment:
Q  74 aaaaacaaaggtagcttttttagctttcaaccaaccta 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12376 aaaaataaagatagcttttttagctttcaaccaaccta 12339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University