View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19114_low_1 (Length: 443)

Name: NF19114_low_1
Description: NF19114
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19114_low_1
NF19114_low_1
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (17-443)||(6929-7355)
scaffold0400 (17-443)||(13229-13655)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (17-443)||(7573-7999)
scaffold0365 (17-443)||(13872-14298)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (17-441)||(14468246-14468670)
chr1 (17-443)||(14483192-14483618)
chr1 (17-443)||(14504423-14504849)
chr1 (17-443)||(15032893-15033319)
chr1 (17-443)||(15037460-15037886)
chr1 (17-443)||(14531990-14532416)
chr1 (17-443)||(15017556-15017982)
chr1 (17-443)||(15002548-15002974)
chr1 (17-443)||(15011441-15011867)
chr1 (17-443)||(14521869-14522295)
chr1 (17-443)||(15041025-15041454)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (125-443)||(17027330-17027647)
chr8 (125-443)||(17557822-17558139)
chr8 (17-62)||(17028662-17028707)
chr8 (17-62)||(17559098-17559143)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (17-440)||(14606348-14606771)
chr7 (17-440)||(16025525-16025948)
chr7 (17-278)||(16173163-16173424)
chr7 (17-443)||(15664487-15664913)
chr7 (17-443)||(17848969-17849395)
chr7 (17-189)||(15676322-15676494)
chr7 (29-441)||(16103332-16103744)
chr7 (17-193)||(17825343-17825519)
chr7 (17-89)||(31103426-31103498)
chr7 (17-89)||(31184506-31184578)
chr7 (378-443)||(15676682-15676747)
chr7 (17-89)||(31159617-31159689)
chr7 (17-89)||(31241720-31241792)
chr7 (17-89)||(31140785-31140857)
[»] scaffold0289 (2 HSPs)
scaffold0289 (17-443)||(4813-5239)
scaffold0289 (17-443)||(13646-14072)


Alignment Details
Target: scaffold0400 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7355 - 6929
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7355 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaattgtgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 7256  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7255 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactgcctttctccaagaactcataaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 7156  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7155 gtataacttcacaatgtttcgatgccggatttcagttaaagcttggatctcacttgcgaaagctttcagattggacgtctctccattttgtaatgaatgg 7056  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7055 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtggggaactctgctttgtaaacacttccgtgtcctcctatcccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 6956  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6955 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13655 - 13229
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |||||| |||||||||  |    
T  13655 gatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagaataaggcattagctatatctttaatgatattcaccctcttattccaatcaa 13556  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| |||||||| |||| ||  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||    
T  13555 attcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtacatgctacccttctccaaaaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagcc 13456  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||| | ||  ||| || |||| ||||     
T  13455 gtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcattattgaatgctttcatattagacatttcttcatgttctaataaatga 13356  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13355 agtttcttcacagctacaacttgacctgaaggcaactctgctttgtaaacatttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctg 13256  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  13255 tggcttcgattatgttctcatatacca 13229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7999 - 7573
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7999 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaattgtgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 7900  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7899 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactgcctttctccaagaactcataaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 7800  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7799 gtataacttcacaatgtttcgatgccggatttcagttaaagcttggatctcacttgcgaaagctttcagattggacgtctctccattttgtaatgaatgg 7700  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7699 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtggggaactctgctttgtaaacacttccgtgtcctcctatcccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 7600  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7599 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 7573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14298 - 13872
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||  ||| |||||| |||||||||  |    
T  14298 gatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagaataaggcattagctatatctttaatgatattcaccctcttattccaatcaa 14199  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| |||||||| |||| ||  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||    
T  14198 attcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtacatgctacccttctccaaaaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagcc 14099  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||| | ||  ||| || |||| ||||     
T  14098 gtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcattattgaatgctttcatattagacatttcttcatgttctaataaatga 13999  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13998 agtttcttcacagctacaacttgacctgaaggcaactctgctttgtaaacatttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctg 13899  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  13898 tggcttcgattatgttctcatatacca 13872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14468670 - 14468246
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |  |    
T  14468670 gatatatcgcgatgaacaattgatggtgagcgatcatgatgcatgtagtatagtgcattagctacatccttaatgacattcaccctcctattccagtcaa 14468571  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    || || | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14468570 acatagtagcttgctcatcttctttcaaaatcttgtccacgctacccttttccaagaactcataaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataacc 14468471  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  14468470 gcataacttcacaatgtttcgatgtcggatttctgttaaagcttggatctcacttgcaaatgctttcagattggacatttctccattttgtaatgaatgg 14468371  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14468370 agtttcttcacagctacaacttgacctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttctg 14468271  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacac 441  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  14468270 tggcttcaacaatgttttcatacac 14468246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14483618 - 14483192
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    |    
T  14483618 gatatatcgcgatgaactattgaaggtgagcgatcatgatgcatgtagtataaagcattagctacatctttaatggcaatcaccctcctattccagccaa 14483519  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    ||  | | ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14483518 acacagtagcttgctcatcgtctttcaaaatcttatccagactacccttctccaagaactcataaaccaaaaatgagtgcaatagatgtgaacaataccc 14483419  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  14483418 gtataacttcacaatgtttcgatgtcggatttctgctaaaggttggatctcacttgcaaaagctttcagattggacatttctccattttgtaatgaatgg 14483319  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  14483318 agtttcttcacagctacaacctgtcctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttttg 14483219  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| | ||||||||| |||||||    
T  14483218 tggcttcgataatgttctcgtacacca 14483192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14504849 - 14504423
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||  |    
T  14504849 gatatatcgcgatgaacaattgcaggtgagcgatcatgatgcatgtagtataaagcattagctacatctttaatggatttcaccctcttattccaatcaa 14504750  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    || || | ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14504749 acatagtggcttgctcatcgtctttcaaaatcttatccagactgcccttctccaagaactcataaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 14504650  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  14504649 gtataacttcacaatgtttcgatgtcggctttctgttaaagcttttatctcacttgcaaaagctttcaaattggacatttctccattttgtaatgaatgg 14504550  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14504549 agtttcttcacagctacaacctgtcctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcctccaaccccgatgagatgtttgttgtcaaactcttctg 14504450  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||    
T  14504449 tggcttctacaatattttcatacacca 14504423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15033319 - 15032893
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||  ||||||||||||||||  |    
T  15033319 gatatatcgcgatgaacaattgaaggtgaacaatcatgatgcatatagcataaagcattagctatatctttaataacatccaccctcctattccaatcaa 15033220  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  15033219 attcaggagcttgttcattgtccttcaaaatgatgtccatgctacccttctccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaaccc 15033120  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||  ||||||||||||||||     
T  15033119 gtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagctttcagattaggcatttcttcattttgtaatgaatga 15033020  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  15033019 agtttcttcacagctacaacttgacctgtgggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcctccaaccccaaggagatgcttgtcgtcaaaatcttcag 15032920  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  |||||||| |||||||    
T  15032919 tggcttcgattatgttctcgtacacca 15032893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15037886 - 15037460
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| || ||| |||||||||  |    
T  15037886 gatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagcataaagcattagctatatccttaatgatattcactctcttattccaatcaa 15037787  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| | | ||||||||||| ||||    
T  15037786 attcaccagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttcgccaagaattcataaaccaaaaacgagtgtagtcgatgtgaacaaaaccc 15037687  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||     
T  15037686 atataacttaacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagatttcagattagacatttcctcattttgtaatgaatga 15037587  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15037586 agtttcttcacagctacaacttgacctgtgggcaactctgctttgtaaacatttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttcag 15037487  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||    
T  15037486 tggcttcgataatgttctcatacacca 15037460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 14531990 - 14532416
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |    
T  14531990 gatatatctcgatgaacaataggaggtgagcagtcatgatgtagatagcataaagcattagctatatctttaatgacattcaccctcctattccaatcaa 14532089  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||    
T  14532090 attcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttttccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagcc 14532189  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||| ||     
T  14532190 gtataacttcacaatattgcgatgtcgaatttctttcaaagcatggatctcatttgtgaatgctttcagattagacatttcttcattttgtaatgagtga 14532289  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14532290 agtttcttcacagcaacaacttgacctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgccctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctg 14532389  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| | |||| |||| |||||||    
T  14532390 tggcttcgataatggtctcgtacacca 14532416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15017982 - 15017556
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||| |||||||||  |    
T  15017982 gatatatctcgatgaactataggaggggaacaatcatgatgcagatagcataaggcattagctatatctttaataatattcaccctcttattccaatcaa 15017883  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||    
T  15017882 attcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgatgtccacactacccttctccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtaaacaaaaccc 15017783  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||| ||||     
T  15017782 gtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatgaatctcatttgtgaaagctttcatattagacatttcttcattttgtaataaatga 15017683  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15017682 agtttcttcacagctacaacttgacctgaaggcaactctgctttgtaaacacttgcatgtcctccaaccccaatgagatgtttgttgtcaaaatcttccg 15017583  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||||    
T  15017582 tggcttcgattatgttctcatacacca 15017556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15002974 - 15002548
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||  |    
T  15002974 gatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagcataaagcattagctacatctttaatgatattcaccctcttattccaatcaa 15002875  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | |     ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||    
T  15002874 attcgccagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttcgccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagcc 15002775  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| | | | ||  ||||||||||||| ||     
T  15002774 gtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagctttcctatttggcatttcttcattttgtaatgagtga 15002675  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |  |||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15002674 agtttcttcacagctacaacttgacctgtaggcagttctgctttgtaaacatttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctg 15002575  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  |||||||| |||||||    
T  15002574 tggcttcgattatgttctcgtacacca 15002548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15011867 - 15011441
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||| |||||||||  |    
T  15011867 gatatatctcgatgaacaataggaggcgagcagtcatgatgcagatagaataaggcattagctatatctttaataatattcaccctcttattccaatcaa 15011768  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | |   ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||    
T  15011767 attcaccagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccaagctacccttctccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagcc 15011668  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| | | | ||  ||||||||||||| ||     
T  15011667 gtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagctttccgatttggcatttcttcattttgtaatgagtga 15011568  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  | |  |||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15011567 agtttcttcacagctacaacttgacctgtaggcagttctgctttgtaaacatttccatgtcctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctg 15011468  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  ||||||||||||||||    
T  15011467 tggcttcgattatgttctcatacacca 15011441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 14521869 - 14522295
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||| ||||||  |    
T  14521869 gatatatctcgatgaacaataggaggtgagcagtcatgatgtagatagaataaagcattagctatatctttaatgatattcaccctcctactccaatcaa 14521968  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | | | ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  14521969 attcactagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccaagctacccttctccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaaccc 14522068  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||    ||||||| ||  |||||||| ||||| ||    || |||||| ||| |||||||    
T  14522069 atataactttacaatgttgcgatgtcggatttctgtcaaagcactaatctcacctgcaaaagcttttagattagatacatctccatttggtagtgaatgg 14522168  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14522169 agtttcttcacagctaccacttgacctgttggcaactctgctttgtaaacacttccatgtactccaaccccgatgagattcttgttgtcaaaatcttctg 14522268  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||| |  || |||||||||||||    
T  14522269 tggcttcgatgatattctcatacacca 14522295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15041454 - 15041025
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||  |    
T  15041454 gatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgtagatagcataaagcattagctatatctttaatgacattcacccttctattccaatcaa 15041355  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    | | | | ||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  15041354 attcactagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttctccaagaattcataaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaaccc 15041255  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  ||||    |||| |||||  |||||||| ||||| ||    || |||||| ||| |||||||    
T  15041254 atataactttacaatgttgcgatgtcggatttctgtctaagcactaatctaacttgcaaaagcttttagattagatacatctccatttggtagtgaatgg 15041155  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagat---gcttgttgtcaaactctt 413  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||    |||| ||||||| ||||    
T  15041154 agtttcttcacagctaccacttgaccagtaggcaactctgctttgtaatcacttccatgtactccaaccccaatgagattgatcttgctgtcaaaatctt 15041055  T
Q  414 cagttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    |||| ||||| |  || |||||||||||||    
T  15041054 cagtggcttcgatgatattctcatacacca 15041025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17027647 - 17027330
Alignment:
Q  125 gcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccatataact 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17027647 gcttgctcattgtctttcaaaatattgtgaacactacctttctc-aggagctcataaactaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccgtataact 17027549  T
Q  225 tcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatggagtttctt 324  Q
    |  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  17027548 tagcaatgtttctatgtcggatttctgttaaagctttgatctcacttgcaaaagctttcaaattggacgtttctccacgttgtaatgaatggagtttctt 17027449  T
Q  325 caccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcagttgcttca 424  Q
    ||| ||||||||||||||  |  | |||||||||| |||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||     
T  17027448 cacagctacaacttgtccaataggcaactctgcttggtaaacacttccatgacctccaaccccaatgagatacttgttgtcaaactcttcggtggcttcg 17027349  T
Q  425 acaatgttctcatacacca 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17027348 ataatgttctcatacacca 17027330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 125 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17558139 - 17557822
Alignment:
Q  125 gcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccatataact 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17558139 gcttgctcattgtctttcaaaatattgtgaacactacctttctc-aggagctcataaactaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccgtataact 17558041  T
Q  225 tcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatggagtttctt 324  Q
    |  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  17558040 tagcaatgtttctatgtcggatttctgttaaagctttgatctcacttgcaaaagctttcaaattggacgtttctccacgttgtaatgaatggagtttctt 17557941  T
Q  325 caccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcagttgcttca 424  Q
    ||| ||||||||||||||  |  | |||||||||| |||  ||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||     
T  17557940 cacagctacaacttgtccaataggcaactctgcttggtaaacacttccatgacctccaaccccaatgagatacttgttgtcaaactcttcggtggcttcg 17557841  T
Q  425 acaatgttctcatacacca 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17557840 ataatgttctcatacacca 17557822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17028707 - 17028662
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17028707 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatcatgcatat 17028662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17559143 - 17559098
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17559143 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatcatgcatat 17559098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14606771 - 14606348
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |    
T  14606771 gatatatctcgatgaacaattggaggcgagcaatcatgatgcatgtagcataaagcattggctacatctttaatgacattcaccctcttattccaatcaa 14606672  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||   |  || |||||| ||| | ||    
T  14606671 atgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctctacaaactcataaaccaaaaatgacaactgtgaatgtgagcaaaatcc 14606572  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |   | || ||||||  || |||||||    
T  14606571 atacaacttcacaatattacgatgtcgaatttcggtcagagcttggatctcatttgtgaatgattttagatttggattttctccatttgctactgaatgg 14606472  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    || || ||||| || || ||||| |||||| | |||| |||||||||  ||||||| || ||||| || ||||||||||| || |  ||||| ||||| |    
T  14606471 agctttttcacagcaactacttgacctgtgtgcaactttgctttgtagacacttccatgccctccaactccaatgagatgtttttcatcaaaatcttctg 14606372  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcataca 440  Q
    | ||||| | ||||||||||||||    
T  14606371 tggcttccaaaatgttctcataca 14606348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16025948 - 16025525
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |    
T  16025948 gatatatctcgatgaacaattggaggcgagcaatcatgatgcatgtagcataaagcattggctacatctttaatgacattcaccctcttattccaatcaa 16025849  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||   |  || |||||| ||| | ||    
T  16025848 atgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctctacaaactcataaaccaaaaatgacaactgtgaatgtgagcaaaatcc 16025749  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |   | || ||||||  || |||||||    
T  16025748 atacaacttcacaatattacgatgtcgaatttcggtcagagcttggatctcatttgtgaatgattttagatttggattttctccatttgctactgaatgg 16025649  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    || || ||||| || || ||||| |||||| | |||| |||||||||  ||||||| || ||||| || ||||||||||| || |  ||||| ||||| |    
T  16025648 agctttttcacagcaactacttgacctgtgtgcaactttgctttgtagacacttccatgccctccaactccaatgagatgtttttcatcaaaatcttctg 16025549  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcataca 440  Q
    | ||||| | ||||||||||||||    
T  16025548 tggcttccaaaatgttctcataca 16025525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16173424 - 16173163
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | | |||||||| |    
T  16173424 gatatatctcgatgaacaattggaggcgagcaatcatggtgcatatagcataaagcattagctacatctttaatgacattcacccgctttttccaattaa 16173325  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||   |  || |||||| ||| | ||    
T  16173324 atgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctctacaaactcataaaccaaaaatgacaactgtgaatgtgagcaaaatcc 16173225  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaag 278  Q
    ||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16173224 atacagattcacaatattacgatgtcgaatttcagtcaaagcttggatctcatttgtgaaag 16173163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 15664487 - 15664913
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||| |||||| | ||||||   |    
T  15664487 gatatatctcgatgaacaattggaggggtgcaatcatggtgcatatagcataaagcattcgctatatctttaataacattcaccctctttttccaaccaa 15664586  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||  ||||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||      ||  ||||||||| | ||    
T  15664587 atgcaattgcttcttcatcatcattcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgtgtgtgaacaaaatcc 15664686  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| || ||||| || | | ||||||||||| |||  |||  ||| ||||  ||  ||||  ||||   || |||||||    
T  15664687 atatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcatttgcaaaacattttagatcagaattctccgcattcgttactgaatgg 15664786  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||| || || || || ||||| |||||| | |||| |||||||||  ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  15664787 agttttttaacagcaactacttgacctgtgggcaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctgctccaatgagatgcttgtcatcaaactcttccg 15664886  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15664887 ttgcttcaataatgttctcatacacca 15664913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17849395 - 17848969
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||  |    
T  17849395 gatatatctcgatgaacaatcggaggtgagcaatgatgatgcatataacatagagcattagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaa 17849296  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||     || |||  ||||| | ||    
T  17849295 atgcaattgcttgatcatcatctttcaaaatgttatctacacttccttttcccatgaaatcgtaaaccaaaaatgagaatcgtgaatgcaaacaaaatcc 17849196  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||| | ||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    ||  ||| |  || |||||||    
T  17849195 atacagcttcacaatgttacgatgtcgaatttctatcaaagcttggatctcacttgtgaaagattttaggctggaatcttcttcatctattactgaatgg 17849096  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||||   ||| | ||||||||  ||||||| || |||||||| || |||||||| || |  ||||| ||||| |    
T  17849095 agttttttcacagccactacttgacctgtgtccaacacggctttgtaaacacttccctgccctcctactccgatgagatgtttatcatcaaaatcttctg 17848996  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||||| |||  ||||||||||||    
T  17848995 tggcttcaataatactctcatacacca 17848969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 15676322 - 15676494
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||||  |    
T  15676322 gatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagtataaagcattagctacatctttaataacattcacccgcttattccaatcaa 15676421  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaa 189  Q
    |  ||||| |||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15676422 atgtaattacttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaa 15676494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16103744 - 16103332
Alignment:
Q  29 tgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattcaacttaattgctt 128  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| || ||| | |||||||  |||  ||||||||    
T  16103744 tgaacaattggaggcgagcaatcatgatgcatgtagcataaagcattagctacatctttaaggacattcactctcttgttccaatcaaacgcaattgctt 16103645  T
Q  129 ggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccatataacttcac 228  Q
      ||||  || |||||||| || |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||   |   | |||||| ||| | ||||  ||||||||    
T  16103644 cttcatcatccttcaaaattttctccaaactacctttctctacgaactcataaaccaaaaatgaaaactgagaatgtgagcaaaatccatgcaacttcac 16103545  T
Q  229 aatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatggagtttcttcacc 328  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||   | |||||||||   | ||||||||| || |||||     
T  16103544 aatattacgatgtctaatttcggttagagcttggatttcatttgtgaaagattttagattgggattttcaccatttgccactgaatggagctttttcaca 16103445  T
Q  329 gctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcagttgcttcaacaa 428  Q
    || || ||||| || ||| | |||| |||||||||  ||||||| || || || || ||||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16103444 gcaactacttggcccgtgtgcaactttgctttgtagacacttccatgccccccaacaccaattagatgtttctcatcaaaatcttctgtggcttccacaa 16103345  T
Q  429 tgttctcatacac 441  Q
    |||| ||| ||||    
T  16103344 tgttttcaaacac 16103332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 17825343 - 17825519
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |  |    
T  17825343 gatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatgatgatgcatataacatacagcattagctatatctttaatggcattcaccctcttattccagtcaa 17825442  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgag 193  Q
    |   ||||||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||||  ||| | | ||||| ||||||||||||    
T  17825443 atgcaattgcttcatcataatctttcaaaatgttatctacacttccttttcccatgtattcgtagaccaaaaatgag 17825519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31103498 - 31103426
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaa 89  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||    
T  31103498 gatatatcacgatgaataataggaggtgagcaatcatgatgcaagtaggacaaagcattggcgacacctttaa 31103426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31184578 - 31184506
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaa 89  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||    
T  31184578 gatatatcacgatgaacaataggaggtgagcaatcgtgatgcaagtaggacaaagcattggcgacacctttaa 31184506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 443
Target Start/End: Original strand, 15676682 - 15676747
Alignment:
Q  378 ctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcagttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||||    
T  15676682 ctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttatgtggcttcaattatgttctcatacacca 15676747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31159689 - 31159617
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaa 89  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||    
T  31159689 gatatatcacgatgaacaataggaggagaacaatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaa 31159617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31241792 - 31241720
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaa 89  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||    
T  31241792 gatatatcacgatgaacaataggaggagaacaatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaa 31241720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31140857 - 31140785
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaa 89  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||    
T  31140857 gatatatcacgatgaataataggaggagaacaatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaa 31140785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 4813 - 5239
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||| |||||| | ||||||   |    
T  4813 gatatatctcgatgaacaattggaggggtgcaatcatggtgcatatagcataaagcattcgctatatctttaataacattcaccctctttttccaaccaa 4912  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||      ||  ||||||||||| ||    
T  4913 atgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccagactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaatatcc 5012  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||  |||  ||| ||||  ||  | ||  |||||  || |||||||    
T  5013 atatagcttcacaatgttacaatgtcgaatttctgtcaaagctttgatctcatttgcaaaacattttagatcagaattttccgcatttgttattgaatgg 5112  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||| || || || || ||||| |||| | | ||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  5113 agttttttaacagcaactacttgacctgagggcaactctgctttgtaaacacttccttgcgctcctagtccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctg 5212  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  5213 tggcttcaataatgttctcatacacca 5239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Original strand, 13646 - 14072
Alignment:
Q  17 gatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatgatgcatatagcataaagcattagctacacctttaatggcatttaccctcctattccaattca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||| |||||| | ||||||   |    
T  13646 gatatatctcgatgaacaattggaggggtgcaatcatggtgcatatagcataaagcattcgctatatctttaataacattcaccctctttttccaaccaa 13745  T
Q  117 acttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactacctttctccaagaactcgtaaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataccc 216  Q
    |   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||      ||  ||||||||||| ||    
T  13746 atgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccagactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaatatcc 13845  T
Q  217 atataacttcacaatatttcgatgtcggatttcagttaaagcttggatctcacttgtgaaagctttcagattggacgtctcaccattttgtaatgaatgg 316  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||  |||  ||| ||||  ||  | ||  |||||  || |||||||    
T  13846 atatagcttcacaatgttacaatgtcgaatttctgtcaaagctttgatctcatttgcaaaacattttagatcagaattttccgcatttgttattgaatgg 13945  T
Q  317 agtttcttcaccgctacaacttgtcctgtgaggaactctgctttgtacccacttccgtgtcctcctaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcag 416  Q
    ||||| || || || || ||||| |||| | | ||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  13946 agttttttaacagcaactacttgacctgagggcaactctgctttgtaaacacttccttgcgctcctagtccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctg 14045  T
Q  417 ttgcttcaacaatgttctcatacacca 443  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||    
T  14046 tggcttcaataatgttctcatacacca 14072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University