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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1911_high_33 (Length: 321)
Name: NF1911_high_33
Description: NF1911
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1911_high_33 |
 |  |
|
| [»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (42 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 4
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
308 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaac |
209 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
208 |
ttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatca |
109 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
316 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108 |
tttattaacatttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
9 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttatc |
321 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
8 |
ttatc |
4 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6298
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6602 |
gacatatcaataacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaac |
6503 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6502 |
ttctcatactttgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatca |
6403 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
316 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6402 |
tttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
6303 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttatc |
321 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
6302 |
ttatc |
6298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7284254 - 7283950
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284254 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaac |
7284155 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
7284154 |
ttctcatactttgaacatacaattcaactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcacca |
7284055 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
316 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7284054 |
cttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaaaactaacccccttaccttaa |
7283955 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttatc |
321 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7283954 |
ttatc |
7283950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 3895089 - 3895376
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
3895089 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
3895188 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3895189 |
tgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaa |
3895288 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895289 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3895376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15822625 - 15822327
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822625 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatataccatt |
15822526 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822525 |
ttcatacattttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-caacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
15822427 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15822426 |
tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15822327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 44865294 - 44865582
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
44865294 |
aacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
44865392 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44865393 |
tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
44865492 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44865493 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttacctta |
44865582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 11287481 - 11287768
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287481 |
aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
11287580 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11287581 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaa |
11287680 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287681 |
ttaatcaattcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11287768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45452360 - 45452063
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
45452360 |
gacatatcaacaacaacgacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccat |
45452263 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452262 |
ttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
45452163 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45452162 |
cttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
45452063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 143703 - 143991
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
143703 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
143801 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
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| T |
143802 |
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143900 |
T |
 |
| Q |
226 |
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315 |
Q |
| |
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|
|
| T |
143901 |
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143991 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
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Target Start/End: Original strand, 35094890 - 35095166
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Q |
| |
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| T |
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attgatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatatactttgaacatgt |
35094988 |
T |
 |
| Q |
137 |
aattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
236 |
Q |
| |
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| T |
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aattcaactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaat |
35095087 |
T |
 |
| Q |
237 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
35095088 |
tcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12370023 - 12369735
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28 |
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127 |
Q |
| |
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aacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttcatactt |
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T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
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| T |
12369923 |
tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaa |
12369824 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
12369823 |
ttaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttacctta |
12369735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39046806 - 39046523
Alignment:
| Q |
28 |
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127 |
Q |
| |
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aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttca-catatactcatttttcaa---t |
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T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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| T |
39046711 |
tgaacatacaattcaactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
39046612 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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|
| T |
39046611 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39046523 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 319
Target Start/End: Original strand, 47289853 - 47290138
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133 |
Q |
| |
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| T |
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caattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaaca |
47289951 |
T |
 |
| Q |
134 |
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233 |
Q |
| |
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| T |
47289952 |
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47290050 |
T |
 |
| Q |
234 |
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319 |
Q |
| |
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|
| T |
47290051 |
aattcatccaattaagcatttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
47290138 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13863113 - 13862828
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
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| T |
13863113 |
aacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
13863014 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
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ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggaca |
13862914 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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|
| T |
13862913 |
attaatctattcacccaattaagc----ttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 12759051 - 12759340
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
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| T |
12759051 |
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12759150 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
12759151 |
tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
12759250 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12759251 |
ttaatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12759340 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26070447 - 26070161
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactt |
26070348 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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| T |
26070347 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
26070248 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
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| T |
26070247 |
ttaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
26070161 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26094234 - 26093948
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactt |
26094135 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26094134 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
26094035 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26094034 |
ttaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
26093948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12248304 - 12248015
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
12248304 |
aacaacatccattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatact |
12248205 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
12248204 |
ttaaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
12248105 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
12248104 |
agtaatcaatt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12248015 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16570189 - 16569902
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
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|
|
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatact |
16570090 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
16570089 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagca |
16569990 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
314 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
16569989 |
aataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
16569902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 16595473 - 16595760
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
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| T |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatact |
16595572 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
16595573 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagca |
16595672 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
314 |
Q |
| |
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| T |
16595673 |
aataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
16595760 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 49047857 - 49047569
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
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Q |
| |
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aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcatattt-caacatataccactctctcatact |
49047759 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
49047758 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaaca |
49047659 |
T |
 |
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227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
49047658 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcata-taacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 13377593 - 13377889
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Q |
| |
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13377593 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatact |
13377691 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
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|
| T |
13377692 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
13377791 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||| || |||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13377792 |
attaatcgatt-actcaatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatc |
13377889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17224121 - 17223824
Alignment:
| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
17224121 |
aacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatact |
17224023 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | || | |||||| |
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|
| T |
17224022 |
ttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaaca |
17223923 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattat |
320 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17223922 |
attaat-tatttactcaattaagcacttaatcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattat |
17223825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 13274851 - 13275129
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
13274851 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatat-----------accactttctcatact |
13274939 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
13274940 |
ttgaacatgaaattttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
13275039 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13275040 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13275129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16915111 - 16914866
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| | || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
16915111 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcata-attcaacatataacactttcacatact |
16915013 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
16915012 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatta-tcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac |
16914914 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
274 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16914913 |
aattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
16914866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 9838943 - 9839236
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
9838943 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
9839041 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
9839042 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
9839141 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9839142 |
attaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaatta |
9839236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 48356708 - 48357001
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| || |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
48356708 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcacatact |
48356806 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
48356807 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaaca |
48356906 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48356907 |
attaatcactt-actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
48357001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 9611371 - 9611665
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattg--agcatattttcaacatataccaacttctcatac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| || || |||||| || ||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
9611371 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataacactttcacatac |
9611469 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
9611470 |
tttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaac |
9611569 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9611570 |
aattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaatta |
9611665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 3049647 - 3049717
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3049647 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
3049717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14272009 - 14271787
Alignment:
| Q |
101 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
14272009 |
ttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag |
14271910 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tga |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
14271909 |
agcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattga |
14271813 |
T |
 |
| Q |
296 |
acactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14271812 |
attctaattcccttaccttaattatc |
14271787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 31501228 - 31501526
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| Q |
19 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaact |
117 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || | |
|
|
| T |
31501228 |
cataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattt |
31501326 |
T |
 |
| Q |
118 |
tctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcac |
217 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||| |||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
31501327 |
tcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaa |
31501426 |
T |
 |
| Q |
218 |
atatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgatta-tgatgaacactaacccccttacct |
313 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31501427 |
ctatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttacct |
31501524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 42056480 - 42056410
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28 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42056480 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
42056410 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Original strand, 2028986 - 2029055
Alignment:
| Q |
29 |
acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2028986 |
acaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
2029055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 2190375 - 2190307
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30 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2190375 |
caacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111460 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
111390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Original strand, 126479 - 126549
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126479 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |
|
|
| T |
16919623 |
aacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatatt |
16919721 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat |
162 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
16919722 |
ttgaacatgaaatttcaccaataacaattcgattat |
16919757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 32494237 - 32494167
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32494237 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 315
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54 |
atcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
28722200 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
28722298 |
T |
 |
| Q |
153 |
attcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcac |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| | ||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
28722299 |
attcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaaagattcactt-attcaattaagcat |
28722397 |
T |
 |
| Q |
253 |
tt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28722398 |
ttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
28722464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 111200 - 111163
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111200 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
111163 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34241317 - 34241101
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| Q |
101 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
34241317 |
ttcaacatatattactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattat |
34241218 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaac |
297 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
34241217 |
aacacgaattttatcaactatgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaat |
34241119 |
T |
 |
| Q |
298 |
actaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241118 |
tctaacccccttacctta |
34241101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Original strand, 25124407 - 25124482
Alignment:
| Q |
242 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25124407 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25124482 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 126739 - 126776
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284 |
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321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126739 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
126776 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32493977 - 32493940
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32493977 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
32493940 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Original strand, 1434 - 1738
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17 |
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116 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1434 |
gacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatataccaat |
1533 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1534 |
ttctcatactttgaacatataattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
1633 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
316 |
Q |
| |
|
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|
| T |
1634 |
cataggaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaa |
1733 |
T |
 |
| Q |
317 |
ttatc |
321 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
1734 |
ttatc |
1738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12349733 - 12349434
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| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12349733 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaac |
12349634 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349633 |
ttctcacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
12349534 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349533 |
tttatggacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12349434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 50112234 - 50111946
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
50112234 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
50112135 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50112134 |
tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaa |
50112035 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
50112034 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
50111946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 13817576 - 13817862
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
13817576 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccattt-tcatacac |
13817673 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13817674 |
tttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtac |
13817772 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13817773 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13817862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 54424076 - 54424364
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54424076 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactt |
54424175 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
54424176 |
tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
54424275 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424276 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
54424364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 317691 - 317405
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
317691 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcatattttca-cacatacccatttttcatactt |
317593 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
317592 |
tgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaa |
317493 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
317492 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
317405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 8631843 - 8632142
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8631843 |
gacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaac |
8631942 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8631943 |
ttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatca |
8632042 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8632043 |
cttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttacctta |
8632142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16996242 - 16995956
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
16996242 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactt |
16996144 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
16996143 |
tgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaataa |
16996044 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16996043 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16995956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16182128 - 16181842
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
16182128 |
aacaacaacaattgatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttggcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
16182031 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16182030 |
tttgaacatgtaatttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
16181932 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16181931 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16181842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19570871 - 19570586
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28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| |
|
|
| T |
19570871 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatactcattttcatacact |
19570773 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19570772 |
ttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaa |
19570674 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19570673 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
19570586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 17100720 - 17101004
Alignment:
| Q |
31 |
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130 |
Q |
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17100720 |
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17100819 |
T |
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131 |
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230 |
Q |
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17100820 |
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17100919 |
T |
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315 |
Q |
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| T |
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17101004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 17101405 - 17101689
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
130 |
Q |
| |
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| T |
17101405 |
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17101504 |
T |
 |
| Q |
131 |
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230 |
Q |
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| T |
17101505 |
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17101604 |
T |
 |
| Q |
231 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
17101605 |
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17101689 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22144455 - 22144167
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
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| T |
22144455 |
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22144357 |
T |
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| Q |
126 |
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225 |
Q |
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| T |
22144356 |
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22144258 |
T |
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| Q |
226 |
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315 |
Q |
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| T |
22144257 |
agttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22144167 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 14298474 - 14298773
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17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
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| T |
14298474 |
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14298573 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
14298574 |
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14298673 |
T |
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| Q |
217 |
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315 |
Q |
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| T |
14298674 |
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14298773 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 14304101 - 14304400
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| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
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| T |
14304101 |
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14304200 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
14304201 |
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14304300 |
T |
 |
| Q |
217 |
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315 |
Q |
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| T |
14304301 |
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14304400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6154514 - 6154226
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcata--c |
125 |
Q |
| |
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| T |
6154514 |
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6154416 |
T |
 |
| Q |
126 |
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225 |
Q |
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| T |
6154415 |
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6154317 |
T |
 |
| Q |
226 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
6154316 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
6154226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 14295502 - 14295790
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
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| T |
14295502 |
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14295601 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
Q |
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| T |
14295602 |
ttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
14295701 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
14295702 |
attaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14295790 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 14301129 - 14301417
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
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| T |
14301129 |
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14301228 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
Q |
| |
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| T |
14301229 |
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14301328 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
14301329 |
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14301417 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 35123749 - 35124047
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17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
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|
| T |
35123749 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacc--c |
35123846 |
T |
 |
| Q |
117 |
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215 |
Q |
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| T |
35123847 |
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35123946 |
T |
 |
| Q |
216 |
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314 |
Q |
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| T |
35123947 |
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35124046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439237
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gatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
140 |
Q |
| |
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| T |
34439513 |
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34439414 |
T |
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| Q |
141 |
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239 |
Q |
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| T |
34439413 |
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34439314 |
T |
 |
| Q |
240 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
34439313 |
tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 17938627 - 17938925
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gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
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| T |
17938627 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaac |
17938726 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
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| T |
17938727 |
ttctcatactttgaacatgcaattcaactaacaacaattcgcttaaccat-gctttatacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatca |
17938825 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
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| T |
17938826 |
ctcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17523072 - 17522780
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
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| T |
17523072 |
aacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttgttatactt |
17522973 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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| T |
17522972 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatgaacaa |
17522873 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
320 |
Q |
| |
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| T |
17522872 |
ataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
17522780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38528079
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76 |
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173 |
Q |
| |
|
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| T |
38527841 |
gcataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttca |
38527937 |
T |
 |
| Q |
174 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
273 |
Q |
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| T |
38527938 |
tacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaatagttgaaa |
38528037 |
T |
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| Q |
274 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
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| T |
38528038 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38528079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 55441032 - 55440803
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
55441032 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatact |
55440933 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
55440932 |
ttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
55440833 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
55440832 |
attaatcaattcacccaattaagcacttat |
55440803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 315
Target Start/End: Original strand, 3578158 - 3578440
Alignment:
| Q |
34 |
atcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaac |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3578158 |
atcaattgatcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactttgaac |
3578257 |
T |
 |
| Q |
133 |
atgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaat |
232 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3578258 |
atgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaattaat |
3578356 |
T |
 |
| Q |
233 |
caattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3578357 |
caatttacccaattaagcacttattcctac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttacctta |
3578440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53898649 - 53898440
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
53898649 |
gacatatcaacaacaacattaattgatcatgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca- |
53898551 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcat |
214 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53898550 |
ttttcatacactttgaacatttaatgcaactaac-acaattcaattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcat |
53898452 |
T |
 |
| Q |
215 |
cacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |
|
|
| T |
53898451 |
catttatgaaca |
53898440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19261022 - 19260839
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
19261022 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
19260923 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaattt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19260922 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11061189 - 11060902
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11061189 |
aacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatact |
11061090 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
11061089 |
ttgaacctgaaattcaactaacaacaatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaaca |
11060991 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11060990 |
aataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaattatgattatgatgaattccaacccccttacctta |
11060902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11329144 - 11328859
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11329144 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatact |
11329046 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
11329045 |
ttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattattaacaactttatgc-----aacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
11328951 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11328950 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11328859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 17139572 - 17139861
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
17139572 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattt-caacatataccattttctcatagt |
17139670 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
17139671 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
17139770 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17139771 |
cttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17139861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6146921 - 6146763
Alignment:
| Q |
36 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaaca |
133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6146921 |
caattgaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaaca |
6146823 |
T |
 |
| Q |
134 |
tgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcac |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146822 |
tgtaattcaactaa-tacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcac |
6146763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 16880190 - 16880477
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataatt-caccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16880190 |
aacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttg |
16880288 |
T |
 |
| Q |
130 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
229 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
16880289 |
aacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaatt |
16880388 |
T |
 |
| Q |
230 |
aatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16880389 |
aatcaatt-actcaattaaacacttgttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16880477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146664
Alignment:
| Q |
211 |
tcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt |
309 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6146769 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
6146670 |
T |
 |
| Q |
310 |
acctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6146669 |
acctta |
6146664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12560419 - 12560131
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12560419 |
aacaacatccattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttc-acatataccactttctcatact |
12560321 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
12560320 |
ttgaacatgaaatttctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
12560221 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12560220 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttacctta |
12560131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14059406 - 14059112
Alignment:
| Q |
18 |
acatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
14059406 |
acatagcaacaataacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcatattt-caacatatgtcatt |
14059308 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |
|
|
| T |
14059307 |
ttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaca |
14059208 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14059207 |
atcatgaacaattagtcaatt-agtcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataacccccttac |
14059112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527975
Alignment:
| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattaca |
279 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |
|
|
| T |
14528110 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
14528012 |
T |
 |
| Q |
280 |
a-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14527975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11196446 - 11196291
Alignment:
| Q |
77 |
cataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcata |
175 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11196446 |
cataattcaaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca--------acataaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcata |
11196355 |
T |
 |
| Q |
176 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattca |
239 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196354 |
cattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
11196291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12488909 - 12488662
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
12488909 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
12488811 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
12488810 |
ttgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaattatgaaca |
12488711 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt |
276 |
Q |
| |
|
|||||| || | | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
12488710 |
attaattaa-tgactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatt |
12488662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 39656594 - 39656817
Alignment:
| Q |
32 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
39656594 |
acatcaattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttga |
39656692 |
T |
 |
| Q |
131 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta |
230 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||||| |||| ||||||| |||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
39656693 |
acatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaatta |
39656792 |
T |
 |
| Q |
231 |
atcaattcatccaattaagcacttat |
256 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39656793 |
atc-atttactcaattaagcacttat |
39656817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Original strand, 17191607 - 17191901
Alignment:
| Q |
30 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
17191607 |
caacatcaattaaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt-caacataaatcactttctcatacttt |
17191705 |
T |
 |
| Q |
129 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaat |
228 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
17191706 |
gaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaat |
17191805 |
T |
 |
| Q |
229 |
taatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17191806 |
taatc-atttactcaattaagcaattgttcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
17191901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3576621 - 3576325
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
3576621 |
aacaacatcaatcaaacatgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcataca |
3576523 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| | || | |||||| |
|
|
| T |
3576522 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaaca |
3576423 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3576422 |
attaatcatttactc-aattaagcacttattcgtacaac-aattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
3576325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12349913 - 12349834
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaaca |
107 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12349913 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaactacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaaca |
12349834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 30207280 - 30207570
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
30207280 |
aacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
30207378 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||||| | |
|
|
| T |
30207379 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaata |
30207478 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30207479 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
30207570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 321
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17205041
Alignment:
| Q |
101 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
17204917 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-ga |
295 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
17204918 |
agcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttgttcgtac-cacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatgga |
17205015 |
T |
 |
| Q |
296 |
acactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17205016 |
attctaacccccttaccttaattatc |
17205041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 3992614 - 3992684
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992614 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
3992684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Original strand, 15876132 - 15876341
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| || || ||| ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15876132 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacttatgataatccaacaatttgagtatcatt-caagatatatcactttctcatact |
15876230 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| | |||||||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15876231 |
tggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaaca |
15876330 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaatt |
237 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
15876331 |
attaatcaatt |
15876341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14528195 - 14528118
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattc-accaattgagcatattttca |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14528195 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
14528118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784767
Alignment:
| Q |
101 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
47784876 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
47784777 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
47784776 |
agcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 2844255 - 2844325
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844255 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2844325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 16261517 - 16261587
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16261517 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
16261587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 38167978 - 38168048
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38167978 |
aacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
38168048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 53771105 - 53771175
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53771105 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
53771175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 30153006 - 30153076
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30153006 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 54685492 - 54685422
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685492 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
54685422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
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Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| |||||| | || |||||||||||| | || | |
|
|
| T |
14080666 |
catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaatta-tcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatct |
14080764 |
T |
 |
| Q |
220 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
314 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080765 |
atgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt |
14080862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23492437 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcata |
23492507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341945 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
33342015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| || || |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
9590937 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcataatt-catatcataccactttcacatact |
9590839 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || ||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||| | |||||||||| |||| | || |||||||| |
|
|
| T |
9590838 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaaca |
9590739 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||| || || || |||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9590738 |
attaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
9590648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7854046 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaacata |
7854116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17956175 - 17956109
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgag |
94 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956175 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33369017 - 33368822
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| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || || |
|
|
| T |
33369017 |
catactatgaacatgcaatttcaccaaccacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccacaattaaagcacgaatttcaacaacta |
33368918 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctt |
314 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| || ||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33368917 |
tgaacaaataattaatt-attcaaataagcacttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctt |
33368822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 45581695 - 45581765
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45581695 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
45581765 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 284 - 321
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7854306 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
7854343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15857194 - 15857157
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15857194 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
15857157 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11882240 - 11882113
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| Q |
189 |
catcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| || || |||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
11882240 |
catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga |
11882142 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11882141 |
ttatgatgaattctaacccccttacctta |
11882113 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 189 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13301491 - 13301360
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| Q |
189 |
catcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| || || |||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
13301491 |
catcataattagagcacgaaattcaacatctaagaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatga |
13301393 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13301392 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
13301360 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 189 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13312147 - 13312016
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| Q |
189 |
catcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
286 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||| || || |||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||| |
|
|
| T |
13312147 |
catcataattagagcacgaaattcaacatctaagaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatga |
13312049 |
T |
 |
| Q |
287 |
ttatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13312048 |
ttatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
13312016 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #67
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Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 12953028 - 12953210
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
12953028 |
aacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
12953126 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||| |||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12953127 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt |
12953210 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51961106 - 51961031
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| Q |
242 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51961106 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
51961031 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Original strand, 15517848 - 15517921
Alignment:
| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
255 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
15517848 |
aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcactta |
15517921 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
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Target Start/End: Complemental strand, 54038315 - 54038245
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54038315 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
54038245 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 2844515 - 2844552
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2844515 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
2844552 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 3992874 - 3992911
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3992874 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
3992911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17955915 - 17955878
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17955915 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
17955878 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54038055 - 54038018
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54038055 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
54038018 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 55513194 - 55513231
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55513194 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
55513231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 321
Target Start/End: Original strand, 15550919 - 15550959
Alignment:
| Q |
281 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15550919 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatc |
15550959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11891 - 11603
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
11891 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttcatactt |
11792 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11791 |
tgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaa |
11692 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11691 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagctta |
11603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 22755 - 23043
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
22755 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
22854 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22855 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
22954 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22955 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1016 - 717
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
1016 |
gacatatcaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccat |
917 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
916 |
ttttcatactttgaacatgtaattcatctaacaacaatccaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
817 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
816 |
catatgaacaatcaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7028 - 6749
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
7028 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
6931 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6930 |
tctgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaactattcataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
6831 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccc |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6830 |
aattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
6749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 55376780 - 55376494
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
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55376682 |
T |
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227 |
Q |
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| T |
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T |
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315 |
Q |
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55376494 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53704916 - 53704629
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127 |
Q |
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53704818 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
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| T |
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53704718 |
T |
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| Q |
228 |
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315 |
Q |
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| T |
53704717 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53704629 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 44055979 - 44056266
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
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| T |
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44056177 |
T |
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| Q |
228 |
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315 |
Q |
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| T |
44056178 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
44056266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8872654 - 8872372
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127 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
228 |
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311 |
Q |
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| T |
8872455 |
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8872372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 315
Target Start/End: Original strand, 16732237 - 16732520
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Q |
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| T |
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16732336 |
T |
 |
| Q |
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231 |
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| T |
16732337 |
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16732436 |
T |
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| Q |
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315 |
Q |
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| T |
16732437 |
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16732520 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23270117 - 23269829
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
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| T |
23270117 |
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23270019 |
T |
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| Q |
126 |
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225 |
Q |
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| T |
23270018 |
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23269920 |
T |
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| Q |
226 |
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315 |
Q |
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| T |
23269919 |
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23269829 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12837383 - 12837096
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
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| T |
12837383 |
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12837284 |
T |
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| Q |
128 |
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227 |
Q |
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| T |
12837283 |
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12837184 |
T |
 |
| Q |
228 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
12837183 |
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12837096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 30457967 - 30458255
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
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| T |
30457967 |
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30458066 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
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| T |
30458067 |
tgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
30458166 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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|
| T |
30458167 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
30458255 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 44346891 - 44347177
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatact |
126 |
Q |
| |
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||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || | ||| |
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| T |
44346891 |
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44346989 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
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| T |
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44347088 |
T |
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| Q |
227 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
44347089 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaactcccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45459049 - 45458769
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gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
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| T |
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45458950 |
T |
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| Q |
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216 |
Q |
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| T |
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45458850 |
T |
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| Q |
217 |
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296 |
Q |
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| T |
45458849 |
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45458769 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 34395310 - 34395609
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gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
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| T |
34395310 |
gacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccat |
34395409 |
T |
 |
| Q |
117 |
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214 |
Q |
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| T |
34395410 |
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34395507 |
T |
 |
| Q |
215 |
cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct |
313 |
Q |
| |
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| T |
34395508 |
catttatgaacaattaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttacct |
34395607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53907882 - 53907604
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
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Q |
| |
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53907882 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatactt |
53907784 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
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| T |
53907783 |
tgaacatacaatccaactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
53907684 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
53907683 |
tta--------atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaactacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53907604 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21959646 - 21959359
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
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| T |
21959646 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
21959547 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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| T |
21959546 |
tgag-atgtaattcaatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
21959448 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
21959447 |
tcaattaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21959359 |
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 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 100 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813442
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100 |
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199 |
Q |
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| T |
20813658 |
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20813559 |
T |
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| Q |
200 |
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298 |
Q |
| |
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| T |
20813558 |
gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
20813459 |
T |
 |
| Q |
299 |
ctaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20813458 |
ctaacccccttacctta |
20813442 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 820099 - 819826
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127 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | |
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| T |
820099 |
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820004 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
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|
|
| T |
820003 |
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819915 |
T |
 |
| Q |
228 |
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315 |
Q |
| |
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|
|
| T |
819914 |
ttaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
819826 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52265691 - 52265403
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| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52265691 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatact |
52265593 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
52265592 |
ttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaaca |
52265493 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52265492 |
attaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
52265403 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 27961035 - 27961324
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28 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
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|
| T |
27961035 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatattt-caacatatacc-acttcttcatac |
27961132 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
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| T |
27961133 |
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27961232 |
T |
 |
| Q |
226 |
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315 |
Q |
| |
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|
| T |
27961233 |
aattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
27961324 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13809693 - 13809405
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
13809693 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatattt-caacatataccattttctcatact |
13809595 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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||||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
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| T |
13809594 |
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13809495 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13809494 |
attaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13809405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30232679 - 30232391
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| Q |
28 |
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125 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||| |
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| T |
30232679 |
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30232582 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||| |
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| T |
30232581 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaatta-tcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac |
30232483 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30232482 |
aattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctta |
30232391 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 15044892 - 15045181
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28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15044892 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
15044990 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
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|
| T |
15044991 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
15045090 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15045091 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctta |
15045181 |
T |
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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18494503 - 18494224
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36 |
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133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| || |
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|
| T |
18494503 |
caattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacattt-caacatataccatttttctcatactttgatca |
18494405 |
T |
 |
| Q |
134 |
tgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatc |
233 |
Q |
| |
|
|| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18494404 |
tgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatc |
18494306 |
T |
 |
| Q |
234 |
aattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18494305 |
aatt-acacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18494224 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
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Target Start/End: Complemental strand, 47535254 - 47535042
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22 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
120 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||| |
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|
| T |
47535254 |
atcaacaacaacgtcaattgaacatgattcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatattt-caacatatatcactttct |
47535156 |
T |
 |
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
47535155 |
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47535056 |
T |
 |
| Q |
221 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
47535055 |
tgaacaattaatca |
47535042 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15109532 - 15109243
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15109532 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatact |
15109434 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| | | |||||| | |
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|
| T |
15109433 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactattatgaata |
15109334 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15109333 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctta |
15109243 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7186027 - 7185735
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| || || | ||| | || ||||||||| || ||| |||||| |
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|
| T |
7186027 |
aacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtgcacaatt-caacatatatcattttcacatact |
7185929 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||| |
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|
| T |
7185928 |
atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaaca |
7185829 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7185828 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaatta |
7185735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41166129 - 41165995
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
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|
| T |
41166129 |
aacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
41166031 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat |
162 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41166030 |
ttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |
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|
| T |
41256552 |
aacaacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatact |
41256454 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |
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|
| T |
41256453 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaaca |
41256355 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
41256354 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
41256263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 18276498 - 18276743
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Q |
| |
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|
| T |
18276498 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcacatgct |
18276596 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
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| T |
18276597 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaaca |
18276696 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
274 |
Q |
| |
|
|||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18276697 |
attaatcacat-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
18276743 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15013372 - 15013177
Alignment:
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121 |
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219 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| | || | |
|
|
| T |
15013372 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcat-tcaacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaact |
15013275 |
T |
 |
| Q |
220 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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| T |
15013274 |
atgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
15013177 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 14951826 - 14951896
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28 |
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98 |
Q |
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|
| T |
14951826 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15272503 - 15272433
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15272503 |
aacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15272433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 14901296 - 14901584
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| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||| ||||||||| || || |||||||||| |||||||| || |||||||||| |
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|
| T |
14901296 |
aacaacatcaattgaatatgattcttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatattta-aacatatatcactttctcatact |
14901394 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| |||||| |||| || ||||||||| ||||| | | || ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |
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|
| T |
14901395 |
tcaaacatgaaatttcaccaacaacaat-caattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaaca |
14901493 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
14901494 |
attaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacctta |
14901584 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5682704 - 5682648
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| Q |
42 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682704 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
5682648 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7964894 - 7964606
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
7964894 |
aacaaaatcaattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
7964796 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| |
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|
| T |
7964795 |
t-gaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaaca |
7964697 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7964696 |
attactcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
7964606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10104454 - 10104380
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| Q |
22 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10104454 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
10104380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25119398 - 25119328
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
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||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
25119398 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
25119328 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54118199 - 54118162
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284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54118199 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
54118162 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 40885758 - 40885676
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| Q |
22 |
atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttca |
104 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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40885758 |
atcaacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttca |
40885676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15675284 - 15675219
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15675284 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
15675219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 32898854 - 32899142
Alignment:
| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32898854 |
aacaacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
32898953 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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|
|
| T |
32898954 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
32899053 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32899054 |
ttaatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
32899142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 315
Target Start/End: Original strand, 18570353 - 18570630
Alignment:
| Q |
38 |
attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgta |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570353 |
attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgta |
18570452 |
T |
 |
| Q |
138 |
attcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaatt |
237 |
Q |
| |
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||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570453 |
atttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt |
18570552 |
T |
 |
| Q |
238 |
catccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570553 |
catccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18570630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 22440998 - 22441285
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
22440998 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatactt |
22441097 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22441098 |
ttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaa |
22441197 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22441198 |
ttaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22441285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 16086070 - 16086369
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16086070 |
gacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccat |
16086169 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086170 |
ttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatca |
16086269 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16086270 |
tttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16086369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 16106569 - 16106868
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
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|
| T |
16106569 |
gacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatactcat |
16106668 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16106669 |
ttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatca |
16106768 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
16106769 |
tttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16106868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 315
Target Start/End: Original strand, 18432697 - 18432994
Alignment:
| Q |
18 |
acatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaact |
117 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
18432697 |
acatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatt |
18432796 |
T |
 |
| Q |
118 |
tctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcac |
217 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
18432797 |
tttcatacttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcat |
18432896 |
T |
 |
| Q |
218 |
atatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18432897 |
ttatgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatac-aataattgaaaatttgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18432994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 248
Target Start/End: Original strand, 31628321 - 31628552
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
31628321 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaac |
31628420 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31628421 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatca |
31628520 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaa |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31628521 |
tttatgaacaattaatcaattcacccaattaa |
31628552 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
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Target Start/End: Complemental strand, 13014890 - 13014603
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129 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
13014890 |
caacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc- |
13014792 |
T |
 |
| Q |
130 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
229 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13014791 |
aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaatt |
13014692 |
T |
 |
| Q |
230 |
aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa--ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13014691 |
aatcaattcacccaatttagcacttttcatacaaacataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctta |
13014603 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 18777210 - 18777481
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127 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
18777210 |
aacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactt |
18777309 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18777310 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaa--- |
18777406 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777407 |
--------------caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18777481 |
T |
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Target: chr6; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 18399002 - 18399290
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
18399002 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatactattttctcatact |
18399100 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
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| T |
18399101 |
ttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
18399200 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399201 |
attagtcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttacctta |
18399290 |
T |
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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25367420 - 25367130
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| Q |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
25367420 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctcatact |
25367322 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat-tcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
25367321 |
ttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac |
25367222 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367221 |
aattaatcaattgct-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25367130 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22361948 - 22361654
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
22361948 |
aacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctcatact |
22361850 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
22361849 |
ttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaaca |
22361750 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22361749 |
attaatcatttgct-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
22361654 |
T |
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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 21623232 - 21623528
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126 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
21623232 |
aacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
21623330 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
21623331 |
ttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaaca |
21623430 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattga-aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21623431 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
21623528 |
T |
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Target: chr6; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 21411184 - 21410944
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175 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
21411184 |
gcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaacttcatg |
21411086 |
T |
 |
| Q |
176 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa |
274 |
Q |
| |
|
||| | |||| ||||| |||| |||||| |||| | | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21411085 |
cattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaa |
21410988 |
T |
 |
| Q |
275 |
tt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21410987 |
tttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21410944 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 18381866 - 18381684
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
18381866 |
aacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
18381768 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||| |||||||||| | |||||||| || ||| || |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18381767 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaatt |
18381684 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17083386 - 17083093
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttct |
120 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||| | ||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
17083386 |
atcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcaacatatatcattttca |
17083288 |
T |
 |
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | | || || |
|
|
| T |
17083287 |
catactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaatta-tcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaacta |
17083189 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083188 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaacccccttacctta |
17083093 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
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Target Start/End: Complemental strand, 17557127 - 17556909
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101 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
17557127 |
ttcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattag |
17557029 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaaaag-tgattatga-tgaac |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
17557028 |
agcacgaattt-aacaactatgaacaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacactagatgattatgattgaat |
17556931 |
T |
 |
| Q |
298 |
actaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17556930 |
tctaacccccttaccttaatta |
17556909 |
T |
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Target: chr6; HSP #18
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36 |
caattgatcatgaaa-cttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaaca |
133 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28195269 |
caattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacattt-catcatataccattttctcatactatgaaca |
28195171 |
T |
 |
| Q |
134 |
tgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagc |
203 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
28195170 |
tgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataattggagc |
28195101 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
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atcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atcaacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
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atataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcac |
205 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18629712 |
atataccactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcac |
18629614 |
T |
 |
| Q |
206 |
gaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaa |
302 |
Q |
| |
|
|||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
18629613 |
gaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaa |
18629515 |
T |
 |
| Q |
303 |
cccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
18629514 |
cccccttacctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
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| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089799 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
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146 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33324874 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
33324972 |
T |
 |
| Q |
246 |
taagcactta-tcatacaaataattgaa--aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33324973 |
taatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33325046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15742411 - 15742341
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15742411 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15742341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 23994987 - 23995057
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23994987 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
23995057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35136078 - 35135906
Alignment:
| Q |
146 |
aacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaa |
244 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
35136078 |
aacaacaattcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaa |
35135981 |
T |
 |
| Q |
245 |
ttaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35135980 |
ttaatcacttattcatac-aataattgaaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35135906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 25651301 - 25651435
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
25651301 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
25651399 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat |
162 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25651400 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat |
25651435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18002687 - 18002617
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18002687 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
18002617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 255
Target Start/End: Original strand, 29605607 - 29605739
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
29605607 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaatta-tcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta |
29605705 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
255 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
29605706 |
tgaacaaataatcactt-attcaattaagcactta |
29605739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35015348 - 35015278
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015348 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25744396 - 25744331
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattga |
93 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744396 |
aacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16887879 - 16887685
Alignment:
| Q |
124 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || ||||||| ||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| | |||| | ||||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
16887879 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatg |
16887781 |
T |
 |
| Q |
223 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16887780 |
aacaattaatcattt-attcaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16887685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 18583641 - 18583678
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583641 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
18583678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15079795 - 15079606
Alignment:
| Q |
124 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
223 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
15079795 |
actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcat-acaacatatcatcctagttagagcacgaattt-aacatctatga |
15079699 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15079698 |
ataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
15079606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 27740907 - 27740971
Alignment:
| Q |
32 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27740907 |
acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagca |
27740971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33538459 - 33538264
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||| || ||| || | ||||||||||||||| | || | |
|
|
| T |
33538459 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaatt--tcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagttagagcacgaattttaacaact |
33538362 |
T |
 |
| Q |
220 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33538361 |
atgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
33538264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 255
Target Start/End: Original strand, 22848172 - 22848304
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || || |
|
|
| T |
22848172 |
catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaacta |
22848271 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
255 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
22848272 |
tgaacaa-taatcaatt-attcaactaagcactta |
22848304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19983223 - 19983186
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19983223 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
19983186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35015088 - 35015051
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015088 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
35015051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35009637 - 35009569
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009637 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagca |
35009569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 21397156 - 21397444
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
21397156 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
21397254 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21397255 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
21397353 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21397354 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21397444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 4865330 - 4865613
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
130 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
4865330 |
aacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatactttga |
4865428 |
T |
 |
| Q |
131 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta |
230 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
4865429 |
acatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaatta |
4865528 |
T |
 |
| Q |
231 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4865529 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4865613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24183326 - 24183027
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183326 |
gacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccctt |
24183227 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183226 |
ttcatacactttgaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
24183127 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24183126 |
tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24183027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11337369 - 11337081
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11337369 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcatattttcaacatttaccatattctcatactt |
11337270 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
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| T |
11337269 |
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11337170 |
T |
 |
| Q |
228 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
11337169 |
ttaaccaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11337081 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
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Target Start/End: Original strand, 28261585 - 28261867
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Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |
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| T |
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aacaacaacaattgatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacacatat------ttttcatact |
28261678 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
Q |
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| T |
28261679 |
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28261778 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
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| T |
28261779 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 11584115 - 11584411
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaac---gcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcata |
124 |
Q |
| |
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||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |
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|
| T |
11584115 |
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11584214 |
T |
 |
| Q |
125 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaa |
224 |
Q |
| |
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| T |
11584215 |
cttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaa |
11584314 |
T |
 |
| Q |
225 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
11584315 |
caattaattaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatc |
11584411 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 20712140 - 20712428
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127 |
Q |
| |
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| T |
20712140 |
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20712239 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
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| T |
20712240 |
tgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatgaacaa |
20712338 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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| T |
20712339 |
ttaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20712428 |
T |
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Target: chr5; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 28 - 315
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127 |
Q |
| |
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| T |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcattttctcatactt |
1168288 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
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| T |
1168287 |
tgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaa |
1168188 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1168187 |
ttaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
1168100 |
T |
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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 19405601 - 19405891
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
19405601 |
aacaatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatact |
19405700 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
19405701 |
ttgaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaaca |
19405800 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
19405801 |
attaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
19405891 |
T |
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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
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Target Start/End: Complemental strand, 21646914 - 21646636
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caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacat |
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Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||| |
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| T |
21646914 |
caattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcatacatac-ccattttcatacacttttaacat |
21646816 |
T |
 |
| Q |
135 |
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234 |
Q |
| |
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|
| T |
21646815 |
gtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatca |
21646717 |
T |
 |
| Q |
235 |
attcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21646716 |
attcacccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
21646636 |
T |
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125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
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|
| T |
24475644 |
aacaacaacaattgatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
24475739 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
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| T |
24475740 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaac |
24475838 |
T |
 |
| Q |
226 |
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248 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24475839 |
aattaatcaattcatccaattaa |
24475861 |
T |
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Target: chr5; HSP #12
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |
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|
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaattgaacatattttca------------------tactt |
21906862 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21906863 |
tgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
21906962 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
276 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21906963 |
ttaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatt |
21907011 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 28 - 315
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatact |
3674024 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
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|||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
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| T |
3674025 |
ttgatcatgaaatttccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaaca |
3674124 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3674125 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3674215 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacatcaattgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
19862371 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |
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|
| T |
19862372 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaaca |
19862471 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
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| T |
19862472 |
attaatcactt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
19862569 |
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Target: chr5; HSP #15
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23981606 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcactta |
23981507 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat |
293 |
Q |
| |
|
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|
| T |
23981506 |
tgaacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
23981433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
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acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
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Q |
| |
|
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| T |
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acatcaattgaacatgaatctcaacataattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaa |
16595674 |
T |
 |
| Q |
132 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaa |
231 |
Q |
| |
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| T |
16595675 |
catgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattag |
16595774 |
T |
 |
| Q |
232 |
tcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
16595775 |
tcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16595860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 23493983 - 23494272
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
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| |
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||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| | | ||||||| |
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| T |
23493983 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcata-tctcaacatatacctattcttcatact |
23494081 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
23494082 |
ttgaacataaaattccactaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaaca |
23494181 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
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| T |
23494182 |
attaattgatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttacctta |
23494272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5451026 - 5450731
Alignment:
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5451026 |
aacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
5450928 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
5450927 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatgaaca |
5450828 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||| ||| | || | || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5450827 |
attaatcaatt-actcaattaagcatttatttatgc-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattat |
5450731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 7728484 - 7728774
Alignment:
| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7728484 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatact |
7728582 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || | ||| |||| ||| ||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
7728583 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattatgaaca |
7728682 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7728683 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
7728774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 28902255 - 28902545
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28902255 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
28902353 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||| | | || || ||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
28902354 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
28902453 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28902454 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28902545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 28938650 - 28938940
Alignment:
| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28938650 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
28938748 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||| | | || || ||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
28938749 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
28938848 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28938849 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28938940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 432527 - 432815
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
432527 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcattttctcatact |
432625 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| | || || ||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
432626 |
ttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatgatca |
432725 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
432726 |
attaatc-atttactcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21222791 - 21222497
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
21222791 |
aacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
21222693 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||| |||||| || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
21222692 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaaca |
21222593 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21222592 |
attaatcaat--actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccataccttaattatc |
21222497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 21650759 - 21650829
Alignment:
| Q |
28 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21650759 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21650829 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21310819 - 21310603
Alignment:
| Q |
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200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
21310819 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttag |
21310720 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21310719 |
agcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaat |
21310621 |
T |
 |
| Q |
298 |
actaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
21310620 |
tttaacccccttacctta |
21310603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 21617080 - 21617374
Alignment:
| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| | | |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
21617080 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcata-gttcaacatataacactttcatatact |
21617178 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt-tcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | | || |||||| |
|
|
| T |
21617179 |
tggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaac |
21617278 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21617279 |
aattaatccctt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
21617374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 23466521 - 23466787
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| Q |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
23466521 |
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23466599 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||| |||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
23466600 |
ttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaatta-tcataacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaaca |
23466698 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466699 |
attaatcaatt-acacaattaatcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2031874 |
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T |
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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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11342749 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
21297285 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttag |
21297186 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
297 |
Q |
| |
|
|| |||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21297185 |
aggacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaat |
21297087 |
T |
 |
| Q |
298 |
actaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297086 |
tctaacccccttacctta |
21297069 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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Q |
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|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21205000 |
attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || | |
|
|
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catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaacaacca |
22885898 |
T |
 |
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221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
255 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22885899 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
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| |
|
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|
|
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22054028 - 22053963
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22054028 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
22053963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 66 - 321
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20530
Alignment:
| Q |
66 |
caacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatt |
163 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20274 |
caacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
| Q |
164 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
20472 |
T |
 |
| Q |
264 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20473 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
20530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 74 - 370
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
74 |
gacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaat |
173 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
174 |
ttctcatactttgaacatgcaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatc---attagagcacgaatttcatca |
270 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271 |
tttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9784249 - 9783959
Alignment:
| Q |
23 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca |
122 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784249 |
tcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac---aaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctca |
9784153 |
T |
 |
| Q |
123 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9784152 |
tactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatg |
9784053 |
T |
 |
| Q |
223 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784052 |
aacaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9783959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 49967714 - 49968002
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||| || |
|
|
| T |
49967714 |
aacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatt |
49967813 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
49967814 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaa |
49967913 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967914 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaacccccttacctta |
49968002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22403293 - 22403005
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
22403293 |
aacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
22403195 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22403194 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
22403096 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403095 |
aattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22403005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 274
Target Start/End: Original strand, 21718281 - 21718537
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
21718281 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaat |
21718380 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21718381 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
21718480 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21718481 |
tccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
21718537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 35054820 - 35055108
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
35054820 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
35054919 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
35054920 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaa |
35055019 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat-tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35055020 |
ttaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
35055108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 308
Target Start/End: Original strand, 41212136 - 41212415
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
41212136 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatattttta-cacatacccatttttcatactt |
41212234 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41212235 |
tgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
41212334 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41212335 |
ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 131 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522247
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| Q |
131 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
| Q |
231 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35522332 |
atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
35522247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27329938 - 27329757
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
27329938 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatac |
27329841 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27329840 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaatta-tcataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
27329757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 16645976 - 16646266
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16645976 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaata-attcaacatatatcactttctcatact |
16646074 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
16646075 |
ttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16646174 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16646175 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16646266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 51627847 - 51627558
Alignment:
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51627847 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata-tttcaacatataccattttctcatact |
51627749 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||||||||||||||||| || | || ||||| ||| || ||| |||||| |||| |||||| |||| | | |||||||| |
|
|
| T |
51627748 |
ttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaaca |
51627649 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51627648 |
aataatcaatt-actcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
51627558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 16656702 - 16656992
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16656702 |
aacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatact |
16656800 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||| | | || || ||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
16656801 |
ttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
16656900 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16656901 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16656992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 20177239 - 20177535
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
20177239 |
aacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
20177337 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
20177338 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
20177437 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20177438 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttaaacatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccattaccttaattatc |
20177535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 35522509 - 35522432
Alignment:
| Q |
21 |
tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522509 |
tatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13376969 - 13376746
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| Q |
101 |
ttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaatt |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
13376969 |
ttcaacatatacca-cttcttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataatt |
13376872 |
T |
 |
| Q |
199 |
agagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-t |
293 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
13376871 |
agagcacgattctcatcatctatgaacaattaatcaatt-actaaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatt |
13376774 |
T |
 |
| Q |
294 |
gaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376773 |
gaattctaacccccttaccttaattatc |
13376746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37234043 - 37233750
Alignment:
| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
37234043 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcata-attcaacatatatcactttcatatact |
37233945 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || || |||||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
37233944 |
ttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaaca |
37233845 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||| ||| || | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233844 |
attactcactt-actcaattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
37233750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22143451 - 22143256
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| Q |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
22143451 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
22143352 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22143351 |
tgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
22143256 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
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| Q |
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gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
69 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784294 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaac |
9784242 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15861618 - 15861547
Alignment:
| Q |
27 |
aaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861618 |
aaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 17608992 - 17609281
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
17608992 |
aacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
17609090 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||||| | || ||||| || |
|
|
| T |
17609091 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatca |
17609190 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| |||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17609191 |
actaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
17609281 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #20
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170 |
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268 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
19603303 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataat |
19603400 |
T |
 |
| Q |
269 |
tgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19603401 |
tgaaaatttgcactaaa-tgattatgatgaattctagcccccttacctta |
19603449 |
T |
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98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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21860075 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21860145 |
T |
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| Q |
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44035162 |
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44035092 |
T |
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28 |
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126 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
21195078 |
aacaacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatact |
21195176 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
21195177 |
atgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
21195276 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21195277 |
attaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaaccccttacctta |
21195368 |
T |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8538000 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8537901 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8537900 |
tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
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T |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
8603239 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8603140 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
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T |
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Q |
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|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Q |
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|
|
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20445747 |
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Q |
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|
|
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Q |
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|
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
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|
| T |
255008 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccat |
254909 |
T |
 |
| Q |
117 |
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214 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
254908 |
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254811 |
T |
 |
| Q |
215 |
cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct |
313 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
254810 |
catatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacct |
254712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 261614 - 261316
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
261614 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccat |
261515 |
T |
 |
| Q |
117 |
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214 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
261514 |
tt-tcatacactttgaacatgtaattcaacta-ctacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcat |
261417 |
T |
 |
| Q |
215 |
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313 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
261416 |
catatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacct |
261318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 4627 - 4913
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
4627 |
aacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
4726 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
Q |
| |
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| T |
4727 |
ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaaca |
4826 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4827 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9527
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |
|
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| T |
9241 |
aacaacatcaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
9340 |
T |
 |
| Q |
127 |
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226 |
Q |
| |
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|
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| T |
9341 |
ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaaca |
9440 |
T |
 |
| Q |
227 |
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315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9441 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 60859 - 61159
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| | |
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|
| T |
60859 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccat |
60958 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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|
| T |
60959 |
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61058 |
T |
 |
| Q |
217 |
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314 |
Q |
| |
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| T |
61059 |
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61158 |
T |
 |
| Q |
315 |
a |
315 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
61159 |
a |
61159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 70805 - 70552
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
70805 |
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70706 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattca-taacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
70705 |
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70606 |
T |
 |
| Q |
227 |
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280 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70605 |
attaatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaa |
70552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79785
Alignment:
| Q |
176 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79925 |
catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
79826 |
T |
 |
| Q |
276 |
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315 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |
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|
| T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagctta |
79785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20573386 - 20573087
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| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
20573386 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacataccctt |
20573287 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573286 |
ttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
20573187 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573186 |
tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20573087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 41246722 - 41247009
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | || || ||||| |
|
|
| T |
41246722 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcctactt |
41246820 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
41246821 |
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41246920 |
T |
 |
| Q |
228 |
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315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41246921 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttacctta |
41247009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 37611732 - 37612020
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
37611732 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
37611830 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37611831 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
37611929 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37611930 |
aattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
37612020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22234986 - 22234700
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
22234986 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
22234889 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22234888 |
tttgagcatgtaattcaactaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
22234790 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234789 |
aattaatcaattcattcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22234700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561526
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| Q |
32 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaa |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
20561810 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20561711 |
T |
 |
| Q |
132 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaa |
231 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20561710 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaa |
20561611 |
T |
 |
| Q |
232 |
tcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561610 |
tcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20561526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 20481669 - 20481955
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
20481669 |
aacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttcatactt |
20481768 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20481769 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaa |
20481868 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481869 |
ataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
20481955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19993237 - 19992952
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
19993237 |
aacaacaacaattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
19993140 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19993139 |
tttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatgaac |
19993041 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19993040 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattg-aaattacaaaagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
19992952 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 21681066 - 21681356
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126 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21681066 |
aacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatact |
21681165 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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| T |
21681166 |
ttaaacatgaaattcaactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaaca |
21681265 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21681266 |
attaatcaattcaacaaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21681356 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122793
Alignment:
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140 |
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239 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
25122717 |
T |
 |
| Q |
240 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25122718 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25122793 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 20654084 - 20653944
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131 |
Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20654084 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaa |
20653985 |
T |
 |
| Q |
132 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttc |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20653984 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttc |
20653944 |
T |
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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21198335 - 21198040
Alignment:
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28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacatcaattgaacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
21198237 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
21198236 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaaca |
21198137 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
21198136 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatc |
21198040 |
T |
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Target: chr8; HSP #12
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
39446949 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataaca-cttcttcatac |
39446852 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
39446851 |
tttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaac |
39446752 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39446751 |
aattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39446660 |
T |
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 23837262 - 23837558
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28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
23837262 |
aacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagtt-caacatatatcactttctcatact |
23837360 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
23837361 |
ttgaacatgaaatttcaataacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaaca |
23837460 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat---tacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23837461 |
attaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatctatattaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
23837558 |
T |
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Target: chr8; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981622
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140 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
22981449 |
T |
 |
| Q |
141 |
caactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22981450 |
tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcat--catctgaacaattaatcaatt-ac |
22981546 |
T |
 |
| Q |
241 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22981547 |
ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22981622 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 20648008 - 20647882
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131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20648008 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20647909 |
T |
 |
| Q |
132 |
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158 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20647908 |
catgtaattcaactaacaacaattcaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #16
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
7000624 |
tcatcacatatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta |
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T |
 |
| Q |
311 |
c |
311 |
Q |
| |
|
| |
|
|
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7000524 |
c |
7000524 |
T |
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200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | |
|
|
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17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
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T |
 |
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agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatga-tg |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||| || |
|
|
| T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattg |
17285538 |
T |
 |
| Q |
295 |
aacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17285539 |
aattctaacccccttaccttaattatc |
17285565 |
T |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
26011558 |
aacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
26011656 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
26011657 |
ttgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
26011756 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26011757 |
attaatcactt-actcaattaaacacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaatta |
26011848 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
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aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcata-tttcaacatataccattttctcatact |
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T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
38533812 |
ttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattatgaaca |
38533911 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaatt |
237 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |
|
|
| T |
38533912 |
attagtcaatt |
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Target: chr8; HSP #20
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tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20529843 |
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20529748 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||| || ||| || || ||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
5854678 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatatact |
5854776 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
5854777 |
ttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
5854876 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5854877 |
attaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaatta |
5854971 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #22
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Q |
| |
|
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|
|
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15933460 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
15933461 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaaca |
15933560 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatg-aacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15933561 |
attaatcacttactc-aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaatta |
15933655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 29306481 - 29306776
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |
|
|
| T |
29306481 |
aacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcattttcacaaact |
29306579 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| || | || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
29306580 |
ttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaacatctatgaaca |
29306679 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccc-cttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29306680 |
atcaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccctcttaccttaatta |
29306776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 274507 - 274577
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
274507 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
274577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 641342 - 641272
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
641342 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
641272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 827148 - 827078
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
827148 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
827078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16039072 - 16039002
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16039072 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
16039002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 41507000 - 41506930
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41507000 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41506930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Original strand, 33528607 - 33528778
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| Q |
146 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| || || ||||||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
33528607 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaat |
33528705 |
T |
 |
| Q |
246 |
taagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33528706 |
taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
33528778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 39115339 - 39115409
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115339 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcata |
39115409 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 319
Target Start/End: Original strand, 22742921 - 22743122
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| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| || ||| | ||||||||||||| || || |
|
|
| T |
22742921 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaacaacta |
22743020 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaa |
316 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22743021 |
tgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaa |
22743119 |
T |
 |
| Q |
317 |
tta |
319 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
22743120 |
tta |
22743122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24717053 - 24716983
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24717053 |
aacaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16404931 - 16404894
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16404931 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc |
16404894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22736021 - 22735958
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22736021 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatt |
22735958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31194340 - 31194217
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| Q |
195 |
aattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgatta |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
31194340 |
aattagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaatttgcactaaaaatgatta |
31194243 |
T |
 |
| Q |
290 |
tgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31194242 |
tgatgaaaactaacccccttacctta |
31194217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27233120 - 27233047
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| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta |
255 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27233120 |
aaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaactaataatcactt-attcaattaagcactta |
27233047 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 274767 - 274804
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
274767 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
274804 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 641082 - 641045
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
641082 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
641045 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
826888 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc |
826851 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24716793 - 24716756
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24716793 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
24716756 |
T |
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Target: chr8; HSP #41
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Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23151918 - 23151810
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| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||| |||| || ||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
23151918 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaac |
23151819 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatca |
234 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
23151818 |
aattaatca |
23151810 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| | || |||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
38635731 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaa |
38635632 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38635631 |
agattcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
38635541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 39115599 - 39115635
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115599 |
tgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattat |
39115635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
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126 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||| |
|
|
| T |
15654 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttttatact |
15556 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
15555 |
ttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaaca |
15456 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15455 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatc |
15361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 118146 - 117857
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118146 |
aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118047 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
118046 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
117947 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
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|
|
| T |
117946 |
ttaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
117857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 109645 - 109356
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
109645 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatactt |
109546 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
109545 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
109446 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109445 |
ttaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
109356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 197 - 496
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccctt |
296 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
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||| | |||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
297 |
ttcatacacttgaaacatgaatttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
396 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
397 |
tttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaacccccttacctta |
496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10289
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9990 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc--c |
10087 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatact--ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcat |
214 |
Q |
| |
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|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
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| T |
10088 |
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10187 |
T |
 |
| Q |
215 |
cacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacct |
313 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |
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| T |
10188 |
catttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaagaattgaaaatttgcaataatgattattatgaattctaacccccttacct |
10287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 32465922 - 32466207
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
32465922 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttcatactt |
32466020 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32466021 |
tgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
32466120 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32466121 |
ttaatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaaaagtgattatgatgaagactaa-ccccttacctta |
32466207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23836888 - 23836601
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--ac |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| || |
|
|
| T |
23836888 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacataccca-ttttcatacac |
23836790 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23836789 |
tttgaacatgtaattccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
23836691 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23836690 |
aattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23836601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25876102 - 25875816
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
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|
| T |
25876102 |
aacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
25876005 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25876004 |
tttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
25875906 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25875905 |
aattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25875816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 25602077 - 25602377
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25602077 |
gacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaat |
25602176 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25602177 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatca |
25602276 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacct |
313 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25602277 |
tccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacct |
25602375 |
T |
 |
| Q |
314 |
ta |
315 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
25602376 |
ta |
25602377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36890868 - 36890581
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36890868 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatactt |
36890769 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36890768 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
36890669 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890668 |
ttaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
36890581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 271223 - 271521
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
271223 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccat |
271322 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
271323 |
ttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttca |
271422 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271423 |
tttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
271521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4448327 - 4448028
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |
|
|
| T |
4448327 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccat |
4448228 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4448227 |
ttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
4448128 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4448127 |
tttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4448028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 28974113 - 28974400
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28974113 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactt |
28974212 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28974213 |
tgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
28974312 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28974313 |
ttaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28974400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 76 - 315
Target Start/End: Original strand, 27261916 - 27262156
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76 |
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175 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
27261916 |
gcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttata |
27262014 |
T |
 |
| Q |
176 |
catctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaa |
273 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
27262015 |
catccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaa |
27262113 |
T |
 |
| Q |
274 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27262114 |
attgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
27262156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24571475 - 24571188
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
24571475 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatcattttctcatacc |
24571377 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
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|
| T |
24571376 |
ttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaaca |
24571277 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaa-attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24571276 |
attaatcaatt-acccaattaagcatttattcatac-aataattgaaacattgcaataatgattatgatgaattctaaccccctaacctta |
24571188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22580040 - 22579758
Alignment:
| Q |
30 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| | |
|
|
| T |
22580040 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac---aaagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatataacatttttctcatacct |
22579945 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||| ||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
22579944 |
tgatcataaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaa |
22579846 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22579845 |
ttaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22579758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Original strand, 68056 - 68351
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
68056 |
aacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatact |
68154 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
68155 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaaca |
68254 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
320 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
68255 |
attaatctattactc-aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
68351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31146360 - 31146073
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31146360 |
aacatcaattgaacaggaatcttattacaattcaacaac-acatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttg |
31146263 |
T |
 |
| Q |
130 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
229 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||| | || |||| |||||| |
|
|
| T |
31146262 |
aacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaatt |
31146163 |
T |
 |
| Q |
230 |
aatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31146162 |
aatcaatt-actcagttaagcacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31146073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Original strand, 43645957 - 43646254
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
43645957 |
aacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
43646055 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| || ||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||| | || | |||||| |
|
|
| T |
43646056 |
ttaaacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaactttgaaca |
43646155 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| |||||| |||||||| | | |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43646156 |
attaatc-atttactcaattaaacacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattatgactgaattctaacccccttaccttaattatc |
43646254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Original strand, 6879501 - 6879577
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttca |
104 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6879501 |
aacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtatattttca |
6879577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 319
Target Start/End: Original strand, 19666685 - 19666884
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| | | |||||||| |||||| | || || |
|
|
| T |
19666685 |
catactttgaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaacta |
19666784 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666785 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaat |
19666882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22775393 - 22775206
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| Q |
23 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
121 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22775393 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22775295 |
T |
 |
| Q |
122 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22775294 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22780771 - 22780584
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| Q |
23 |
tcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctc |
121 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| || | ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
22780771 |
tcaacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctc |
22780673 |
T |
 |
| Q |
122 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22780672 |
atactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21274240 - 21274174
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgag |
94 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21274240 |
aacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
21274174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 22274786 - 22274856
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22274786 |
aacaacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
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Target Start/End: Complemental strand, 23821714 - 23821534
Alignment:
| Q |
136 |
taattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23821714 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23821615 |
T |
 |
| Q |
236 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23821614 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23821534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830613
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| Q |
136 |
taattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23830793 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23830694 |
T |
 |
| Q |
236 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23830693 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23830613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19669199 - 19669003
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| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat |
219 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||| || ||||| ||| |||||| ||| || | |||||||| | |||| | || | |
|
|
| T |
19669199 |
catacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatct |
19669101 |
T |
 |
| Q |
220 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19669100 |
atgaacaattaatcattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttacctta |
19669003 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
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attgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284029 |
attgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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182 |
aacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca- |
279 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || |||||| |||||| || || | ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
19660098 |
aacatatcatcataattagagcacgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attccattaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacac |
19660196 |
T |
 |
| Q |
280 |
-aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19660197 |
taaagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttaattatc |
19660238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 140
Target Start/End: Original strand, 25305509 - 25305622
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaa-cgacaacgcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| |
|
|
| T |
25305509 |
aacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatac |
25305607 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaatt |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
25305608 |
tttgaacatgaaatt |
25305622 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
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284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19794660 |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 30 - 94
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| Q |
30 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgag |
94 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9653085 |
caacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
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Alignment:
| Q |
167 |
aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaat |
265 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25305634 |
aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttactc-aattaagcacttattcatacaac- |
25305731 |
T |
 |
| Q |
266 |
aattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25305732 |
aattgtaaaattatactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
25305791 |
T |
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Target: chr2; HSP #30
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28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
9636809 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcata-attcacaatatatcattttcacatact |
9636907 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat |
162 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9636908 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattat |
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T |
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284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
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|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
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22284279 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
22284316 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
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31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
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24341584 |
aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
24341519 |
T |
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281 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15633535 |
aagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatc |
15633575 |
T |
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Target: chr2; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 25265588 - 25265520
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265588 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagca |
25265520 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
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125 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
7235 |
aacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac |
7334 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7335 |
tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaac |
7434 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7435 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
7522 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 14938 - 15224
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
14938 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacac |
15035 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15036 |
tttgaacatgtaatctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaac |
15134 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15135 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 132433 - 132144
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| Q |
28 |
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127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
132433 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
132334 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
132333 |
tgaacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
132234 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
132233 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttacctta |
132144 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 319
Target Start/End: Original strand, 88341 - 88631
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30 |
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129 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
88341 |
caacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
88440 |
T |
 |
| Q |
130 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
229 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
88441 |
aacatgtaattcaactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaatt |
88540 |
T |
 |
| Q |
230 |
aatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
88541 |
aatcaattcacccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatta |
88631 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0021; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 11751 - 12041
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
11751 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatact |
11850 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
11851 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaaca |
11950 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11951 |
attaatcaattgacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctta |
12041 |
T |
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Target: scaffold0021; HSP #4
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Target Start/End: Original strand, 16022 - 16253
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caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacat |
186 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
187 |
gtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac-aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
282 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
16122 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
16220 |
T |
 |
| Q |
283 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16221 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 315
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25784
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| Q |
87 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacat |
186 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
187 |
gtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac-aattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
282 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
25653 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
25751 |
T |
 |
| Q |
283 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25752 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 112728 - 112441
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
112728 |
aacaacataaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactt |
112629 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
112628 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
112529 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
112528 |
ttaatcaattcacccaaataagtacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
112441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 103102 - 102815
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31 |
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129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
103102 |
aacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattc-caccatataccactttctcatactttg |
103004 |
T |
 |
| Q |
130 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
229 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||| |
|
|
| T |
103003 |
aacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaatt |
102904 |
T |
 |
| Q |
230 |
aatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
102903 |
aatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttacctta |
102815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 109654 - 109788
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
109654 |
aacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcata-tttcaacatataccactttctcatact |
109752 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat |
162 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109753 |
ttaaacatgaaatttcattaacaacaattcaattat |
109788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 85396 - 85683
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
85396 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactt |
85495 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
85496 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaa |
85595 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
85596 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
85683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 159363 - 159651
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
159363 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatact |
159462 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
159463 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
159562 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
159563 |
attaatcaattcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
159651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11548
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
11837 |
aacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacac |
11739 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11738 |
tttgaacatgtaattcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
11639 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11638 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Original strand, 1370 - 1667
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |
|
|
| T |
1370 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccat |
1469 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1470 |
ttttcatactttgaacatgtaattcaaccaccaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatca |
1569 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1570 |
tttatacacaattaatcaattcattcaattaaccacttttcatacaaataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgcctta |
1667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 48219 - 48496
Alignment:
| Q |
36 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
48219 |
caattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacata |
48317 |
T |
 |
| Q |
136 |
taattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48318 |
aaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
48417 |
T |
 |
| Q |
236 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48418 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
48496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 61667 - 61944
Alignment:
| Q |
36 |
caattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatg |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
61667 |
caattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacata |
61765 |
T |
 |
| Q |
136 |
taattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
61766 |
aaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
61865 |
T |
 |
| Q |
236 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
61866 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
61944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5429 - 5143
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
5429 |
aacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttcg-cacatacctattt-tcatacac |
5332 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5331 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaac |
5233 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5232 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
5143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9065 - 8776
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
9065 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatat-caacatatatcattttctcatact |
8967 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8966 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
8867 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8866 |
attaatcaattttcccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttacctta |
8776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 7633 - 7922
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
7633 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttcatactt |
7732 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacat-gtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7733 |
tgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaaca |
7832 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7833 |
attaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
7922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 25266 - 25563
Alignment:
| Q |
19 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25266 |
catatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatataccctttt |
25365 |
T |
 |
| Q |
119 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcaca |
218 |
Q |
| |
|
| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25366 |
cctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatt |
25465 |
T |
 |
| Q |
219 |
tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25466 |
tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 25013 - 25210
Alignment:
| Q |
19 |
catatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25013 |
catatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatataccctttt |
25112 |
T |
 |
| Q |
119 |
ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25113 |
cctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19844
Alignment:
| Q |
124 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
19844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24148
Alignment:
| Q |
124 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24245 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
24148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 253176 - 252903
Alignment:
| Q |
24 |
caaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
253176 |
caaaaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcat |
253077 |
T |
 |
| Q |
124 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
223 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
253076 |
actttgaaaatgtaattcaactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgc |
252977 |
T |
 |
| Q |
224 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
252976 |
acaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa |
252903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11762 - 11464
Alignment:
| Q |
17 |
gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
11762 |
gacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccat |
11663 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11662 |
ttttcatactttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
11563 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11562 |
tttatgaacaattaatcaattca-acaattaaacacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccatacctta |
11464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 9051 - 9339
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9051 |
aacaacatcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
9150 |
T |
 |
| Q |
128 |
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227 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
9151 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaa |
9250 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg--aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9251 |
ttaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataatgattatgataaattctaacccccttacctta |
9339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
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Target Start/End: Original strand, 4351 - 4635
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30 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tt |
127 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||| || |
|
|
| T |
4351 |
caacaacaattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccattt-tcatacactt |
4448 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4449 |
tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaa |
4547 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4548 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaacgtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 38362 - 38650
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
38362 |
aacaacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctt |
38461 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38462 |
tgaacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaa |
38561 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38562 |
ttaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38650 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24911 - 24623
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
24911 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactt |
24812 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
24811 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaa |
24712 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24711 |
ttaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24623 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Original strand, 95032 - 95109
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tatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
95032 |
tatcaacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
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Target: scaffold0016 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 164279 - 164565
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac-- |
125 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | || |||||| |
|
|
| T |
164279 |
aacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttca-cacatacccattt-tcatacac |
164376 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
164377 |
tttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaa |
164475 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164476 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
164565 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 162369 - 162299
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
162369 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
162299 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 166455 - 166385
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166455 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
166385 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 162109 - 162072
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
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|
|
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162109 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
162072 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 166195 - 166158
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166195 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
166158 |
T |
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Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 116487 - 116445
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| Q |
279 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
116487 |
aaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatc |
116445 |
T |
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Target: scaffold0075 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5005 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactg |
5104 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5105 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
5204 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt |
254 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5205 |
ttaattaattcacccaattaagcactt |
5231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
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Target Start/End: Original strand, 33726 - 34014
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33726 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactt |
33825 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
33826 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaa |
33925 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33926 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttaatcatac-agtaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
34014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 70677 - 70964
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
70677 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatact |
70776 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
70777 |
ttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaact |
70875 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70876 |
attaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70964 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 31098 - 31352
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18 |
acatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31098 |
acatatcagcaacaacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactacaaa-cataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccatt |
31196 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatca |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31197 |
ttcttatactttgaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatca |
31295 |
T |
 |
| Q |
217 |
catatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
274 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31296 |
tttatgaacaaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
31352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 97381 - 97088
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
97381 |
aacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
97283 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
97282 |
ttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaaca |
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T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcact-tatcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
97182 |
attaatc-actcactcaattaaacactaaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcatta |
97088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 21576 - 21862
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21576 |
aacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactt |
21675 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21676 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaatccaatta-tcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
21774 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21775 |
ttaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattataacccccttacctta |
21862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 315
Target Start/End: Original strand, 31278 - 31561
Alignment:
| Q |
31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttga |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31278 |
aacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttga |
31377 |
T |
 |
| Q |
131 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta |
230 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31378 |
acatttaattcaactaacaacaatccaatta-tcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaatta |
31476 |
T |
 |
| Q |
231 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31477 |
atcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47445
Alignment:
| Q |
206 |
gaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacc |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47554 |
gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacc |
47456 |
T |
 |
| Q |
305 |
cccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
47455 |
cccttacctta |
47445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 759 - 471
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
759 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactt |
660 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaa |
227 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
659 |
tgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
560 |
T |
 |
| Q |
228 |
ttaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
559 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Original strand, 1980 - 2263
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
1980 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaac-acatagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatact |
2078 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
2079 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagca |
2178 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2179 |
attaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttac |
2263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 46229 - 46521
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
46229 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatac |
46326 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaa |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
46327 |
tttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaa |
46426 |
T |
 |
| Q |
225 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46427 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaatta |
46521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Original strand, 40722 - 41010
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
40722 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatac |
40819 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaa |
224 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
40820 |
tttgatcatgaagtttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaa |
40919 |
T |
 |
| Q |
225 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
40920 |
caattaatcaattcacccaattaagcactattcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
41010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 79928 - 79998
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
79928 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
79998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 80188 - 80225
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80188 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc |
80225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 161 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3115 - 2961
Alignment:
| Q |
161 |
attcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcata |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3115 |
attcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcata |
3016 |
T |
 |
| Q |
261 |
caaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3015 |
caaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6251
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatac |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
6004 |
aacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatac |
6103 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6104 |
tttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
6203 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6204 |
aattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
6251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 572
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
642 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 146665 - 146848
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
146665 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactt |
146764 |
T |
 |
| Q |
128 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaattt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
146765 |
tgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt |
146848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 53410 - 53703
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||| | | |||||||| | || || ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
53410 |
aacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcata-attcaacatataacaccttcacatact |
53508 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
53509 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatgaaca |
53608 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53609 |
attaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
53703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 251
Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
85690 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta |
85788 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagca |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
85789 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:
Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 198 - 321
Target Start/End: Original strand, 8 - 131
Alignment:
| Q |
198 |
tagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaac |
297 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8 |
tagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaac |
107 |
T |
 |
| Q |
298 |
actaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108 |
actaacccccttaccttaattatc |
131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 315
Target Start/End: Original strand, 3385 - 3671
Alignment:
| Q |
30 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatacttt |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3385 |
caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttca-catataccactttctcatacttt |
3483 |
T |
 |
| Q |
129 |
gaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaat |
228 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
3484 |
gaacattaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaat |
3583 |
T |
 |
| Q |
229 |
taatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3584 |
taatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
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Target: scaffold0095; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 33911 - 33622
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28 |
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125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
33911 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataaca-cttcttcatac |
33814 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
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||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
33813 |
tttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaac |
33714 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33713 |
aattaatcaatt-actcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33622 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 77030 - 76734
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
77030 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctcatact |
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T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
76931 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaaca |
76832 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76831 |
attactcaatt-actcaattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
76734 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
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Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
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Target Start/End: Original strand, 7927 - 8157
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184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
| Q |
185 |
atgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-a |
281 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |
|
|
| T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
| Q |
282 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaacccccttacctta |
8157 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 197436 - 197143
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| Q |
28 |
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| | | |||||| || || ||||||| || |||| |||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
197436 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataatt-caacttataacactttcacatact |
197338 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| || || ||||| |
|
|
| T |
197337 |
ttgaacttgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaaca |
197238 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
197237 |
attaatcactt-atccaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
197143 |
T |
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Target: scaffold0243 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2499 - 2211
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
2499 |
aacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatgtcactttctcatact |
2401 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
2400 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatgatta |
2301 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2300 |
attaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 319
Target Start/End: Original strand, 69521 - 69814
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
69521 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatact |
69619 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
69620 |
ttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
69719 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
69720 |
attaatcactttct-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
69814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 2589 - 2795
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aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
2589 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatact |
2687 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
2688 |
ttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaaca |
2787 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
2788 |
attaatca |
2795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
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Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaacatata |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
701 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata |
618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7208 - 6912
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7208 |
aacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
7110 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
7109 |
ttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaaca |
7010 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
| |||| ||| | |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7009 |
acaaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaattatc |
6912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 93955 - 93728
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126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
93955 |
aacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaatttaacaac-acatagcatacttcaataatttgagcatattt-caacaaataccattttctcatact |
93858 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttc-atcacatatgaac |
225 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
93857 |
ttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagttatgaac |
93758 |
T |
 |
| Q |
226 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttat |
256 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
93757 |
aattaat-aatttacccaattaagcacttat |
93728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 55645 - 55715
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55645 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
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Target Start/End: Original strand, 35545 - 35838
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31 |
aacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttg |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
35545 |
aacatcaattgaacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactttg |
35643 |
T |
 |
| Q |
130 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
229 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| | | | ||||||||| |
|
|
| T |
35644 |
aacatgaaatttcactaacaacaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaacaatt |
35743 |
T |
 |
| Q |
230 |
aatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
|||| || | ||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35744 |
aatc-ttttactcaattaagcacctattcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatc |
35838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
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Target: scaffold0123; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Original strand, 8167 - 8363
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121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | || | |
|
|
| T |
8167 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatct |
8265 |
T |
 |
| Q |
220 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8266 |
atgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
8363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
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Target: scaffold0483; HSP #1
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28 |
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Q |
| |
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||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||| || |||||||||| |
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| T |
6725 |
aacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcatact |
6823 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatt |
210 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6824 |
ttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
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Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
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Target Start/End: Original strand, 32267 - 32344
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32267 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
32344 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcatattttcaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42036 |
aacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
41959 |
T |
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Target: scaffold0028 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
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Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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Target Start/End: Complemental strand, 89652 - 89584
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89652 |
aacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89584 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 79696 - 79891
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| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacat |
219 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| || | |||||| |||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||| | |||| |||||||||| | || | |
|
|
| T |
79696 |
catacttagaacatgcaatttcaccaccaacaactcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatct |
79794 |
T |
 |
| Q |
220 |
atgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
79795 |
atgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaataattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
79891 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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Target Start/End: Original strand, 31084 - 31377
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| ||| |||||| || || | ||||| || ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
31084 |
aacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcataatt-caacatataacactttcacatact |
31182 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaaca |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
31183 |
atgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaaca |
31282 |
T |
 |
| Q |
227 |
attaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31283 |
attaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
31377 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
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146 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
1513 |
T |
 |
| Q |
246 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1512 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
1440 |
T |
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Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8585
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| Q |
146 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaat |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
8658 |
T |
 |
| Q |
246 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
8585 |
T |
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Target: scaffold0234 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17595 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
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Target: scaffold0150 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
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Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
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Target Start/End: Original strand, 28600 - 28781
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatact |
126 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28600 |
aacaacatcaattgaacataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatact |
28698 |
T |
 |
| Q |
127 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaat |
209 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |||| | || ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28699 |
ttgaacatataatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
28781 |
T |
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Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
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Target: scaffold0409; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1242
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| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattac |
278 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1378 |
aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattac |
1281 |
T |
 |
| Q |
279 |
a--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1280 |
actaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
1242 |
T |
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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 9633 - 9497
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| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattac |
278 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9633 |
aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattac |
9536 |
T |
 |
| Q |
279 |
a--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9535 |
actaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9497 |
T |
 |
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Target: scaffold0597 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
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Target: scaffold0597; HSP #1
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1169 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
1099 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
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Target: scaffold0251; HSP #1
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13577 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
13507 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 21551 - 21481
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21551 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0175 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
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Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
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Target Start/End: Original strand, 15013 - 15083
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15013 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
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Target: scaffold0026; HSP #1
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| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca |
279 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | || |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
89894 |
aaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattaca |
89798 |
T |
 |
| Q |
280 |
--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
89797 |
ctaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctta |
89760 |
T |
 |
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Target: scaffold0833 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
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Target: scaffold0833; HSP #1
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gacatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaac |
69 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3352 |
gacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac |
3404 |
T |
 |
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Target: scaffold0706; HSP #1
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6734 |
aacaagatctattgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0686
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Target: scaffold0686; HSP #1
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| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6274 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
 |
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284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5808 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
5771 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #3
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| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6014 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc |
5977 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0574; HSP #1
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9698 |
aacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
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Target: scaffold0184; HSP #1
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28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31471 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 41373 - 41443
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41373 |
aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 70298 - 70201
Alignment:
| Q |
219 |
tatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70298 |
tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10157 - 10094
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaatt |
91 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10157 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 315
Target Start/End: Original strand, 10879 - 11014
Alignment:
| Q |
181 |
aaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca |
279 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
10879 |
aaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattata |
10976 |
T |
 |
| Q |
280 |
--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10977 |
ctaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22516 - 22323
Alignment:
| Q |
124 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcat-aacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatg |
222 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | || |||| |
|
|
| T |
22516 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattat-catcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatg |
22418 |
T |
 |
| Q |
223 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22417 |
aacaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:
Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 855
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||| | || || |
|
|
| T |
1052 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaacta |
953 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgat-gaacactaacccccttacctta |
315 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
952 |
tgaacaaataatcactt-atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0303 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:
Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 219 - 149
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
219 |
aacaacatttattgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcata |
149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43908 - 43688
Alignment:
| Q |
101 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattag |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
43908 |
ttcaacatatatcactttcatatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattag |
43809 |
T |
 |
| Q |
201 |
agcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaa |
296 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | || |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
43808 |
agcattaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
43711 |
T |
 |
| Q |
297 |
cactaacccccttaccttaatta |
319 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43710 |
ttctaacccccttaccttaatta |
43688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23762 - 23562
Alignment:
| Q |
121 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacata |
220 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| | || ||||| || |||||| ||| || ||||| ||||||||||||| || || |
|
|
| T |
23762 |
catactatgaacatgcaatttctccaacaacaattcaattatcaaaaatttcatgtatacaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaacta |
23663 |
T |
 |
| Q |
221 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
317 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23662 |
tgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaatcattatgattgaattctaacccccttatcttaat |
23564 |
T |
 |
| Q |
318 |
ta |
319 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
23563 |
ta |
23562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12711 - 12641
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12711 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 186716 - 186647
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
186716 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
186647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 193678 - 193609
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagcata |
98 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193678 |
aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
193609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 11148 - 11292
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| Q |
18 |
acatatcaaaaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaac |
116 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| | | ||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
11148 |
acatagcaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcata-attcaacatatatcact |
11246 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattat |
162 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11247 |
ttcacacactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattat |
11292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 321
Target Start/End: Original strand, 30418 - 30455
Alignment:
| Q |
284 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30418 |
tgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatc |
30455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 51380 - 51312
Alignment:
| Q |
28 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacgacaacgcataattcaccaattgagca |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51380 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca |
51312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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