View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1911_high_52 (Length: 244)

Name: NF1911_high_52
Description: NF1911
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1911_high_52
NF1911_high_52
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-239)||(20088-20327)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (1-239)||(15579284-15579523)
chr6 (1-239)||(28894883-28895122)
chr6 (1-239)||(35027536-35027769)
chr6 (56-239)||(12746338-12746521)
chr6 (1-231)||(33679598-33679829)
chr6 (53-239)||(11296449-11296635)
chr6 (119-218)||(7560591-7560690)
chr6 (119-218)||(2330896-2330995)
chr6 (119-218)||(2330233-2330332)
chr6 (119-216)||(31123033-31123130)
chr6 (1-40)||(7560769-7560808)
chr6 (1-39)||(12746295-12746333)
chr6 (172-218)||(17696245-17696291)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (1-239)||(33321326-33321565)
chr5 (1-239)||(2500410-2500649)
chr5 (1-239)||(33920620-33920857)
chr5 (5-234)||(26337464-26337693)
chr5 (1-239)||(9690238-9690478)
chr5 (1-239)||(35432878-35433115)
chr5 (119-218)||(25184989-25185088)
chr5 (109-221)||(36330329-36330443)
chr5 (119-217)||(4732249-4732346)
chr5 (98-147)||(16090911-16090961)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-239)||(26703893-26704132)
chr4 (1-239)||(56089717-56089956)
chr4 (1-239)||(19928380-19928619)
chr4 (1-239)||(13978610-13978849)
chr4 (48-239)||(15850698-15850889)
chr4 (119-218)||(23652884-23652983)
chr4 (119-155)||(14701511-14701547)
chr4 (173-218)||(11560470-11560515)
chr4 (119-155)||(3719973-3720009)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (1-238)||(3541570-3541808)
chr7 (15-239)||(12803666-12803891)
chr7 (2-238)||(26152630-26152866)
chr7 (1-239)||(43548670-43548909)
chr7 (1-239)||(38430871-38431109)
chr7 (1-239)||(44018195-44018435)
chr7 (49-239)||(6963813-6964003)
chr7 (92-221)||(28578318-28578449)
chr7 (119-218)||(748458-748556)
chr7 (177-218)||(20100305-20100346)
chr7 (119-155)||(2349079-2349115)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-239)||(13068-13307)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (5-239)||(52599-52834)
scaffold0083 (1-239)||(28798-29037)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (1-239)||(4249862-4250101)
chr3 (51-239)||(28326970-28327159)
chr3 (51-239)||(28330295-28330484)
chr3 (123-239)||(3305449-3305565)
chr3 (166-239)||(27054514-27054587)
chr3 (119-209)||(20536999-20537089)
chr3 (66-152)||(18551219-18551305)
chr3 (119-218)||(6173765-6173864)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (1-239)||(18391870-18392109)
chr1 (1-239)||(34553086-34553330)
chr1 (1-235)||(50197322-50197557)
chr1 (1-239)||(23441687-23441927)
chr1 (51-239)||(33897853-33898041)
chr1 (49-191)||(6195366-6195508)
chr1 (119-218)||(17903202-17903301)
chr1 (100-151)||(13795432-13795484)
chr1 (119-218)||(28917977-28918076)
[»] scaffold0911 (1 HSPs)
scaffold0911 (1-239)||(4042-4280)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (21-239)||(5827523-5827742)
chr8 (48-236)||(9466654-9466841)
chr8 (49-237)||(13331615-13331803)
chr8 (49-236)||(39660362-39660553)
chr8 (73-155)||(24903960-24904043)
chr8 (177-218)||(22653923-22653964)
chr8 (119-155)||(17013509-17013545)
chr8 (119-155)||(17543656-17543692)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (51-239)||(40678175-40678364)
chr2 (49-239)||(38316449-38316640)
chr2 (1-152)||(30994216-30994368)
chr2 (48-193)||(9748056-9748201)
chr2 (121-218)||(18011556-18011652)
chr2 (119-150)||(24385654-24385685)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (1-234)||(3735-3969)
[»] scaffold0637 (5 HSPs)
scaffold0637 (49-239)||(1785-1975)
scaffold0637 (49-152)||(975-1078)
scaffold0637 (1-182)||(1466-1648)
scaffold0637 (49-152)||(705-808)
scaffold0637 (49-182)||(1245-1378)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (100-214)||(468871-468987)


Alignment Details
Target: scaffold0273 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20327 - 20088
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  20327 aaaccctaattctttgtctataaaagtcagatgcgaccagaagcctagggtgcgattttggagacctaaacagagcatagacgacaccaggaagctgaag 20228  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20227 aacatgcagtggatctcacccaactcatagttggttctggtttatgtatgttcgatattttctatgtatttgattttttagttatgagtagctaaactct 20128  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20127 tagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 20088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15579523 - 15579284
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15579523 aaaccctaattttgtgtctataaaatccagaagcgaccataagcttagggtgcgattttggagacctaaatagagcatagacggcaccaggaaaccgcag 15579424  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15579423 aacacgcagtagatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgttttgttatgagtagctaaactct 15579324  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15579323 tagattaattaagctatgagataaatctttgcgatctgtg 15579284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28895122 - 28894883
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28895122 aaaccctaattctttgtctataaaagtcagatgcgaccaaaagcttagggtgcgattttggagacctaaacatagcatagacggcaccaggaagctgaag 28895023  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28895022 aacacgcggtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttctattatttctatgtatttaattgtttagttatgtgtatctaaactct 28894923  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28894922 tagattgattaagccataagatgaatctttgtgatctgtg 28894883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35027769 - 35027536
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  35027769 aaaccctaattctttgtctataaaagtcagatgcgaccagaagct-----gcgattttggagacctaaacagagcatagacggcaccaggaagctgaaga 35027675  T
Q  101 acacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35027674 acacgcagtggatctcacccatctcatagttggttctggtttatgtatgttcgctattttctatgtgtttgattgtttagttatgagtagctaagctctt 35027575  T
Q  201 agattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35027574 agattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 35027536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Original strand, 12746338 - 12746521
Alignment:
Q  56 tttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12746338 tttggagacctaaatagagcatagacgacaccaggaagccgaagaacacgcattggatttcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgttcact 12746437  T
Q  156 attttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12746438 attttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttaaattgattaagccatgagatggatctttgtgatctgtg 12746521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33679829 - 33679598
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||  || ||    
T  33679829 aaactctaattctttgtctataaaagtcagatgcaaccagaagcttagtatgcgattttagagacctaaacagagcatagacaacaccaggaagttgaag 33679730  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33679729 aacacgtaatggatctcacccaactaatagttggttctgatttatgtatgttatattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactct 33679630  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33679629 tagattgattaagccatgagatgaatctttgt 33679598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11296635 - 11296449
Alignment:
Q  53 gattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttc 152  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11296635 gattttggagacctaaatagagcatagacaacaccaggaagctgaagaacacactgtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttc 11296536  T
Q  153 actattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
      |  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11296535 tattatttctatgtatttggttgtttagttatgagtagctaaactcttaaattgattaagccatgtgatgaatctttgtgatctgtg 11296449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7560690 - 7560591
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |  || | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  7560690 ccaactcatagttggttcggatttatgtatgtttactcttgtaaatgtttatgattgtttagttatgagtagctaatctcttaggttgattgaaccatga 7560591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 2330896 - 2330995
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || | |||   | | || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2330896 ccaactcatagttagttcggatttatgtatgtttactcttgtttatgcttatgatcgttttgatatgagtagctaaactcttagattgattgagccatga 2330995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 2330233 - 2330332
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || | |||   | | || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2330233 ccaactcatagttggttcgaatttatgtatgtttactcttgtttatgcttatgatcgttttgatatgagtatctaaactcttagattgattgagccatga 2330332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Original strand, 31123033 - 31123130
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccat 216  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  || || | |||   | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  31123033 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttttctcttgtttatgcttatgattgtttagttatcagtagttaaactcttagtttgattgagccat 31123130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 7560808 - 7560769
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaa 40  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7560808 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgcggccaa 7560769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 12746295 - 12746333
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgacca 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12746295 aaaccctaattctttgtctataaaagtcagatgcgacca 12746333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 17696245 - 17696291
Alignment:
Q  172 attgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17696245 attgtttagctatgagtagctaagctcttagtttgattgagccatga 17696291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33321565 - 33321326
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  33321565 aaaccctaattctttgtctataaaagtcagatgtgaccaaaagcttagggtgcgattttggagacctaaacatagcatagacagcaccaggaagctgaag 33321466  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33321465 aacacgcggtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttctattatttctatgtatttaattgtttagttatgagtagctaaactct 33321366  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33321365 tagattgattaagtcatgagatgaatctttgtgatctgtg 33321326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2500649 - 2500410
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  2500649 aaaccctaattttgtgtctataaaagcgagaagcgaccagaagcttggggtgcgattttggagacctaaacagagcatagacgacaccaggaagctgaag 2500550  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2500549 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttgtgatttatgtatgttctattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactct 2500450  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2500449 tagattgattaagccatgagatgaatttttgtgatctgtg 2500410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 33920620 - 33920857
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcaga 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  33920620 aaactctaattctttgtctataaaagccaaatgcgaccagaagcttagg-gcaattttggagacctaaacagagcatagacgtcaccaggaagctgaaga 33920718  T
Q  101 acacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactctt 200  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33920719 acacgtggtggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgttcattattttctatgtatttgattgtttagttattagtagctaaactctt 33920818  T
Q  201 agattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33920819 agatcgattaagtcatgagatgaatctttgtgatctgtg 33920857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 26337464 - 26337693
Alignment:
Q  5 cctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacac 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | | | |||||    
T  26337464 cctaattctttgtctataaaagtcagatgcgaccagaagcttaggggagattttggagacctaaatagagcatagacgacaccaggaagccgaataacac 26337563  T
Q  105 gcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagat 204  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26337564 gcattcgatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttagat 26337663  T
Q  205 tgattaagccatgagataaatctttgtgat 234  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26337664 tgattaagccatgagacgagtctttgtgat 26337693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 9690238 - 9690478
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatctt-ag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| | | |    
T  9690238 aaaccctaattctttgtctataaaagtcatatgcgatcagaagctttagtgtgcgattttggagacctaaacatagcatagacgatactaggaagccgaa 9690337  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactc 198  Q
    || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  9690338 gagcacgcattggatctcacaaaactcatagttggttctggtttatgtatgtttactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaacta 9690437  T
Q  199 ttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9690438 ttagattgattgagccatgagatgaatctttgtgatttgtg 9690478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35433115 - 35432878
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatctta-ggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   ||    
T  35433115 aaaccctaattcgttgtctataaaagccagatgcgatcagaagcttatggttcgattttggagacctaaacagagcatagacggcaccagaaagcctaag 35433016  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    | |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35433015 agcacatagtagatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgc-cactattt-ctatgtatttgattgtttagttatgagtaaataaactct 35432918  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35432917 tagattgattaagccatgggatgaatctttgtgatctgtg 35432878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 25184989 - 25185088
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || | |||   | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25184989 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgtttactcttgtttatgcttatgattgtttagttatgagtggttaaactcttagtttgattgagccatga 25185088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Original strand, 36330329 - 36330443
Alignment:
Q  109 tggatctcac-ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattg-tttagttatgagtagctaaactcttagattg 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| |  || |||| ||| ||||||||||||| | || |||||||     
T  36330329 tggatctcacaccaactcatagttggttctgatttatgtatgttctattatttctatgttattaattgttttggttatgagtagcttagcttttagattc 36330428  T
Q  207 attaagccatgagat 221  Q
    | ||||| |||||||    
T  36330429 actaagcaatgagat 36330443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4732346 - 4732249
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatg 217  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| || | |||   | | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4732346 ccaactcatagttgatccggatttatgtatgttcactcttatttatgcttataattgtt-agctatgagtagctaaactcttagtttgattgagccatg 4732249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16090961 - 16090911
Alignment:
Q  98 agaacacgcagtggatct-cacccaactcatagttggttctgatttatgta 147  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16090961 agaacaagtagtggatcttcaaccaactcatagttggttctgatttatgta 16090911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26704132 - 26703893
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26704132 aaaccttaattttttgtctatagaagccagatgcgatcaaaagctttgtgtgcaattttagagacctaaacagagcatagacgacaccaggaaaccgcag 26704033  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26704032 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctaatttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttggttatgagtagctaaactct 26703933  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26703932 tagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 26703893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 56089956 - 56089717
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  56089956 aaaccctaattctttatctataaaagtcagatgcgaccagaagcttagggtgcgattttagagacctaaacagagcatagacggcaccaggaagctgaag 56089857  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56089856 aacacgcggtggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgttcgctattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactct 56089757  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  56089756 tagattgattaagccatgaaatgaatctttgtgatctgtg 56089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19928380 - 19928619
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatctta--ggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  19928380 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgcgatcagaagcttaagggggcgattttggagaccaaaacagagcatagacggcaccaggaagctgaa 19928479  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactc 198  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19928480 gaacacacggtggatctcacacaactcatagttggttctggtttatgtatgttcgctattttctatgta-ttgattgtttagttatgagtagctaaactc 19928578  T
Q  199 ttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  19928579 ttagattgattaagtaatgagatgaatctttgtgatctgtg 19928619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 13978610 - 13978849
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtg--cgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||  || || |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |    
T  13978610 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgtgatcagaagttttggggagcgattttggagacctaaatagagcatagacggcaccaggaagctgaa 13978709  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactc 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13978710 gaacacacggtggatctcacccaactcatagttggttctggtttatgtatgttcgctattttctatgta-ttgattgtttagttatgagtagctaaactc 13978808  T
Q  199 ttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13978809 ttagattgattaaaccatgagatgaatctttgtgatctgtg 13978849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 239
Target Start/End: Original strand, 15850698 - 15850889
Alignment:
Q  48 ggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgta 147  Q
    |||| |||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15850698 ggtgtgattttggagacctcaatagagcatagacaacaccaggaagctgaagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatatatgta 15850797  T
Q  148 tgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15850798 tgttctattatttctatgtatttgattgtttagttataagtagctaaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 15850889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 23652884 - 23652983
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  || |  | |||   | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23652884 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttttctctagtttatgcttatgattgtttagttatgagtatctaaactcttagtttgattgagccatga 23652983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Original strand, 14701511 - 14701547
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14701511 ccaactcatagttggttcggatttatgtatgttcact 14701547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Original strand, 11560470 - 11560515
Alignment:
Q  173 ttgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  11560470 ttgtttagttatgagtagctaaactcttggtttgattgagacatga 11560515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3720009 - 3719973
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3720009 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcact 3719973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3541808 - 3541570
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3541808 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgcgaccagaagcttagggtgcgatttcggagacctaaatagagcatagacggcaccaggaagctgaag 3541709  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3541708 aacacgcggtggatctcagcaaacttatagttggttctggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactct 3541609  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3541608 tagattgattaagtcatgagatgaatctttgtgatctgt 3541570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12803891 - 12803666
Alignment:
Q  15 tgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggt-gcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggat 113  Q
    ||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  12803891 tgtctataaaagccagatgcgatcagaagcttaggttgcgattttggagacctaaacagagcatagacagcaccagaaagctgaagaacatgcagtggat 12803792  T
Q  114 ctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagc 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12803791 ctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttctattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagc 12803692  T
Q  214 catgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12803691 catgagatgaatctttgtgatttgtg 12803666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 238
Target Start/End: Original strand, 26152630 - 26152866
Alignment:
Q  2 aaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  26152630 aaccctaattctttgtctataaaagtcagatgcgaccagaagcttagggtgaatttcggagacctaaacaaagcatagacgacaccaggaagctgaagaa 26152729  T
Q  102 cacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttc-actattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactctt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26152730 cacgcggtggatctcacccaactcatagttggtattgatttatgtatgttctattatttt-tatgtatttaattgtttagttatgagtagctaaactctt 26152828  T
Q  201 agattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26152829 agattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgt 26152866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 43548670 - 43548909
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43548670 aaaccctaattctttgtctataaaagtcaaatgcgatcagaagtttagggtgcgattttggagacctaaacatagcatagacggcaccaggaagctgaag 43548769  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43548770 aacacgcgatggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgcatgttctattatttctgtgtatttcattgtttagttatgagtagctaaactct 43548869  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43548870 tatattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 43548909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 38430871 - 38431109
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcaga 100  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||| |   |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  38430871 aaaccctaattttgtgtctattaaagccagaagcgaccagagattagggtgcgattttggagacctaaacatagcatagacaacaccaggaagctgaaga 38430970  T
Q  101 acacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38430971 acacgcagtggatctcacccaactcatagttggttttgatttatgtatgttctattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactctt 38431070  T
Q  201 agattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38431071 agattgattaagccatgagatgaatctttgtgatttgtg 38431109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44018435 - 44018195
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtg--cgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||    ||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| ||  |    
T  44018435 aaaccctaattctttgtctataaaagcaaaatgcgatcagaaggagaggcgggcgattttggagacaaaaacagagcatagaagacaccaggaagctaaa 44018336  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactc 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44018335 gaacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactc 44018236  T
Q  199 ttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44018235 ttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 44018195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 6963813 - 6964003
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6963813 gtgcgattttggagacctaaacagagcatagacaacaccaggaagttgaagagcacgcagtggatctcagccaactcatagttggttctgatttatgtat 6963912  T
Q  149 gttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6963913 gttctattatttctatgtattcgattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 6964003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28578449 - 28578318
Alignment:
Q  92 aactgcagaacacgcagtggatctcac-ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgt-ttagttatgagta 189  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   || ||| |  || ||||| |||||||||||||    
T  28578449 aactgaagaacatgcagtggatctcacaccaactcattgttggttctgatttatgtatgttcatttaattttatgttgttaattgtcttagttatgagta 28578350  T
Q  190 gctaaactcttagattgattaagccatgagat 221  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28578349 gctaaacttttagattgattgagccatgagat 28578318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 748556 - 748458
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||   | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  748556 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcactcttgtttatgcttataattg-ttagttatgagtagctaaattcttagtctgattgagccatga 748458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Original strand, 20100305 - 20100346
Alignment:
Q  177 ttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20100305 ttagctatgagtagctaaactcttagtttgattgagccatga 20100346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Original strand, 2349079 - 2349115
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2349079 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcact 2349115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 13068 - 13307
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  13068 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgcgatcagaagcttggtgggcgatttaggagacctaaacagagcatagacggcaccaggaagccgaag 13167  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168 aacacgcattggatctcaccaaactcattgttggttctggtttatgtatgttcattattttatatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactct 13267  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13268 tagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 13307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 52599 - 52834
Alignment:
Q  5 cctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaaca 103  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  52599 cctaattctttttctataaaagtcatatgcgaccaaaagcttagggtgcgattctggagacctaaacagagcatagacggcaccaggaagctgaagaaca 52698  T
Q  104 cgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttaga 203  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52699 cgcggtggatctcaccaaactcatagttggttcaggtttatgtatgttcgctattttctatttatttgattatttagttatgagtagctaaactcttaga 52798  T
Q  204 ttgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  52799 ttgattaagacatgagatgtatctttgtgatctgtg 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 28798 - 29037
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||| | ||| | ||||| ||||| ||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||   | ||    
T  28798 aaaccctaattttgtgtttttaaaatccagaagcgaccagaagcttggggtgcgattttggggacctaattagagcatagacgacaccaggaagtcgaag 28897  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28898 aacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttatggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattatttagttatgagtagctaaactct 28997  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28998 tagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 29037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 4249862 - 4250101
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcga--ttttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  4249862 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgcgatcagaagcttagg-gggattttttggagacctaaacatagcatagacgacaccaggaagctgaa 4249960  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactc 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4249961 gaacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgctcactattttctatgcatttgattgtgtagttatgagtagctaaactc 4250060  T
Q  199 ttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4250061 ttagattgattaagtcatgagatgaatctttgtgatctgtg 4250101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 28326970 - 28327159
Alignment:
Q  51 gcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca-gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatg 149  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28326970 gcgattttggagacaaaaacagagcatagaagacaccaggaagctaaaagaacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatg 28327069  T
Q  150 ttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28327070 ttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 28327159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 28330295 - 28330484
Alignment:
Q  51 gcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca-gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatg 149  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28330295 gcgattttggagacaaaaacagagcatagaagacaccaggaagctaaaagaacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatg 28330394  T
Q  150 ttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28330395 ttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 28330484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Original strand, 3305449 - 3305565
Alignment:
Q  123 ctcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagata 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3305449 ctcatagttggttctggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactcttagattgattaagccatgagatg 3305548  T
Q  223 aatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  3305549 aatctttgtgatctgtg 3305565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Original strand, 27054514 - 27054587
Alignment:
Q  166 tattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27054514 tatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 27054587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20537089 - 20536999
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgatt 209  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20537089 ccaactcatagttggtccagatttatgtatgtttactcttgtctatgtttataattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgatt 20536999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Original strand, 18551219 - 18551305
Alignment:
Q  66 taaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttc 152  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  18551219 taaacagagcatagacgacaccagaaagctgaagaacacgcagtggatatcacccaactcatagctgtttcaaatttatgtatgttc 18551305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6173864 - 6173765
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||| | | | || ||  ||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  6173864 ccaactcatagttggtccagatttatgtatgttcactcttatttatgtttataatcgtaaagccatgagtagctaaactcttggtatgattaagccatga 6173765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 18391870 - 18392109
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  18391870 aaaccctaattctttgtctataaaagccagatgcgatcagaagctttgtgtgcgattttggagacctaaacagagcatagacgacaccaggaagctgaag 18391969  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  18391970 aacacgcggtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttatattatttctatgtatttgatgttttagttatgagaagctaaactct 18392069  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18392070 taaattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 18392109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34553330 - 34553086
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| | |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  34553330 aaaccctaattctttgtctataaaattcagatgcgaccagaagcttagagaggatttttggagacctaaacagagcatagacgacaccaggaagctgaag 34553231  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcat-----agttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaa 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34553230 aacacgcggtggatctcacccaactcatagttgagttggttctggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagttaa 34553131  T
Q  195 actcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34553130 actcttagattgattaagcaatgagatgaatctttgtgatctgtg 34553086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50197557 - 50197322
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  50197557 aaaccctaattctttgtctattaaagtcagatgcgatcagaagcttaaagagcgattttggagacctaaacagagcatagacgacaccaggaagctaaag 50197458  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50197457 aacacgcggtggatctcacccagctcatagttggttctgatttatgtatgttctattatttctatgtatttaattgtttagttatgagtaactaaactct 50197358  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgatc 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50197357 tagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatc 50197322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23441927 - 23441687
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtg--cgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||    ||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| ||  |    
T  23441927 aaaccctaattctttgtctataaaagcaaaatgcgatcagaaggagaggggggcgattttggagacaaaaacagagcatagaagacaccaggaagctaaa 23441828  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactc 198  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23441827 gaacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactc 23441728  T
Q  199 ttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23441727 ttagattgattaagccatgatatgaatctttgtgatctgtg 23441687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 33897853 - 33898041
Alignment:
Q  51 gcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgt 150  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33897853 gcgattttggagacaaaaacagagcatagaagacaccaggaagctaaagaacacgcattggatctcaccaagctcatagttggttctggtttatgtatgt 33897952  T
Q  151 tcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33897953 tcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 33898041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Original strand, 6195366 - 6195508
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6195366 gtgcgattttggagacctaaacagagcatagacggcaccaagaagctgaagaacacgtggtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 6195465  T
Q  149 gttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagc 191  Q
    ||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6195466 gttctattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagc 6195508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17903301 - 17903202
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||   | | |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17903301 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcactcttatttatgcttataattgttaagccatgagtagctaaactcttagtttgattgagccatga 17903202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13795484 - 13795432
Alignment:
Q  100 aacacgcagtggatctcac-ccaactcatagttggttctgatttatgtatgtt 151  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13795484 aacacgcagtagatctcacaccaactcatagttggttttgatatatgtatgtt 13795432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 28917977 - 28918076
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||   | | |||||| ||  |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  28917977 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcactcttatttatgcttataattgttaagccatgagtagctaaactcttaatttaattgagccatga 28918076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 4042 - 4280
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||  | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||    
T  4042 aaaccctaattctttgtctataaaatccagatgcgatcagaagcttgaggggatttttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaagaagctaaaga 4141  T
Q  101 acacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactctt 200  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4142 acacgcagtggatctcgccaaactcatagttggttctggtttatgcatgttcgctaatttctatgtatttgattgtttagttatgagacgctaaactctt 4241  T
Q  201 agattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4242 agatagattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 5827523 - 5827742
Alignment:
Q  21 taaaagccagatgcgaccaaaatcttag-gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacc 119  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| | | ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  5827523 taaaagccagaagcgaccagaagctttgcgggcgattttgaagacctaaatagagcatagacgacactaggaagccgaagaacacgcattggatctcacc 5827622  T
Q  120 caactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgag 219  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5827623 aaactcatagttggttttggtttatgtatgttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtggctaaactcttagattgattaagccatgag 5827722  T
Q  220 ataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    || |||||||||||||||||    
T  5827723 atgaatctttgtgatctgtg 5827742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 9466654 - 9466841
Alignment:
Q  48 ggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9466654 ggtgcgattttggagacctaaacagagcatagacggcaacaggaagctgaagaacacacagtggatctcacccaactcatagttgcttctgatttatgta 9466753  T
Q  148 tgttcactatt-ttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatct 236  Q
    ||||   |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9466754 tgtt--atattattctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttaaattgattaagccatgagatgaatctttgtgatct 9466841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 13331615 - 13331803
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13331615 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacgacaccaggaagctgaagaacacgcggtggatctcacccaactcatagctggttctgatttacgtat 13331714  T
Q  149 gttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctg 237  Q
    ||||  |  ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13331715 gttctattatttatatgtatttgattgtttagttatgcgtagctaaactcttggattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctg 13331803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39660553 - 39660362
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttat---- 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||        
T  39660553 gtgcgattttggagacctaaacagagcaaagacggcatcaggaagctgaagaacgcgcggtggatctcacccaactcatagtacgttctgatttatatat 39660454  T
Q  145 gtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatct 236  Q
    ||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  39660453 gtatgttctattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagtcacgagatgaatctttatgatct 39660362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24904043 - 24903960
Alignment:
Q  73 agcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcac-ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||| | |||||||| |||| |||||| ||  || ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24904043 agcatagaagacaccaggagactgaagaacaagccctgaatctcataccaactcatagttggtccagatttatgtatgttcact 24903960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Original strand, 22653923 - 22653964
Alignment:
Q  177 ttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22653923 ttagctatgagtagctaaactcttagtttgattgagccatga 22653964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17013545 - 17013509
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17013545 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcact 17013509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Original strand, 17543656 - 17543692
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcact 155  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17543656 ccaactcatagttggtccggatttatgtatgttcact 17543692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40678364 - 40678175
Alignment:
Q  51 gcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca-gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatg 149  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40678364 gcgattttggagacaaaaacagagcatagaagacaccaggaagctaaaagaacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatg 40678265  T
Q  150 ttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40678264 ttcactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctgaactcttagattgattaagccatgagatgaatctttgtgatctgtg 40678175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38316640 - 38316449
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38316640 gtgcgattttggagacctaaactgagcatagacaacaccaggaagctgaagaacatgcagtgcatctcacccaactcattgttggttctgatttatgtat 38316541  T
Q  149 gttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttaga-ttgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||  |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38316540 gttctattatttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactattagatttgattaagccatgagatgaatctttgtgatatgtg 38316449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30994368 - 30994216
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttagg-tgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  ||    
T  30994368 aaaccctaattctttgtctataaaagtcagatgcgaccagaagcttagggtgcgattttggagacctaaacttagcataaacggcaccaggaagctaaag 30994269  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttc 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30994268 aacacgcggtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttc 30994216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9748201 - 9748056
Alignment:
Q  48 ggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgta 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  9748201 ggtgcgattttggagacctaaacagagcatagacgacaccaggaagttgaagaacacgcgttggatctcaccaaactcctagttgattctggtttatgta 9748102  T
Q  148 tgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagcta 193  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9748101 tgttcattattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagcta 9748056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 18011556 - 18011652
Alignment:
Q  121 aactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatga 218  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||   | | |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18011556 aactcatagttggtccggatttatgtatgttcactcttatttatgcttataattgtt-agctatgagtagctaaactcttagtttgattgagccatga 18011652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24385685 - 24385654
Alignment:
Q  119 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385685 ccaactcatagttggttctgatttatgtatgt 24385654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 3735 - 3969
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatctta-ggtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcag 99  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||| | ||  |||||| | ||||||| | | ||    
T  3735 aaaccctaattttgtgtctattaaagccagaagcggccaaaagcttgcggggcgattttggagacctaaatagagtgtagacgacgccaggaagccgaag 3834  T
Q  100 aacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactct 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3835 aacacgcattggatctcaccaaactcatagttggttctggtttatgtatgtttactattttctatgtatttgattgtttagttatgagtagctaaactct 3934  T
Q  200 tagattgattaagccatgagataaatctttgtgat 234  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3935 tagattaattaagccatgagaagaatctttgtgat 3969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 1785 - 1975
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  1785 gtgcgattttggagacctaaacagagcagagacgataccaggaagctaaagaacacgcaatggatttcacccaactcataattggttttgatttaagtat 1884  T
Q  149 gttcactattttctatatattttattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgattaagccatgagataaatctttgtgatctgtg 239  Q
    ||||  |  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1885 gttctattatttctatgcatttgattgtttagttatgagtagctaaactcttagattgatgaagccatgagatgaatctttatgatctgtg 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 975 - 1078
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  975 gtgcgattttggagacctaaacagagcatggacgacactaggaagctgaagaacacgcaatggatttcacccaacttatagttggttttgatttatgtat 1074  T
Q  149 gttc 152  Q
    ||||    
T  1075 gttc 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 1466 - 1648
Alignment:
Q  1 aaaccctaattctttgtctgtaaaagccagatgcgaccaaaatcttaggtg--cgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgca 98  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  1466 aaaccctaattttgtgtctataaaagccagaagcgaccagaga-ttaggtgtgcgatttcgaagacctaaaccgagcatagacgacaccaggaagctgaa 1564  T
Q  99 gaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgtttagtt 182  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |  |||||||  |||| |||||||||||    
T  1565 gaacacgcaatggatttcacccaacttatagttggttttgatttgtgtatgttctattatttctatgcatttgattgtttagtt 1648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 152
Target Start/End: Original strand, 705 - 808
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  705 gtgcgattttggagacctaaagagagcataaacgacaccaggaggctgaagaacacgcaatggatttcacccaactcaaagttggttttgatttatgtat 804  T
Q  149 gttc 152  Q
    ||||    
T  805 gttc 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 182
Target Start/End: Original strand, 1245 - 1378
Alignment:
Q  49 gtgcgattttggagacctaaacaaagcatagacggcaccaggaaactgcagaacacgcagtggatctcacccaactcatagttggttctgatttatgtat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1245 gtgcgattttggagacctaaatagagcatagacgacactaggaagctgaagaatacgcaatagatttcacccaactcgtagttggttttgatttatgtat 1344  T
Q  149 gttcactattttctatatattttattgtttagtt 182  Q
    ||||  |  |||||||  |||| |||||||||||    
T  1345 gttctattatttctatgcatttgattgtttagtt 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 468987 - 468871
Alignment:
Q  100 aacacgcagtggatctcac-ccaactcatagttggttctgatttatgtatgttcactattttctatatattttattgt-ttagttatgagtagctaaact 197  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |  || |||| |  || ||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  468987 aacacacagtggatctcacaccaactcatagttggtcctgatttatgtatgttttattattcctatgttgttaattgtcttagttaagagtagctaagct 468888  T
Q  198 cttagattgattaagcc 214  Q
     ||||||||||||||||    
T  468887 tttagattgattaagcc 468871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University