View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1912_high_5 (Length: 386)

Name: NF1912_high_5
Description: NF1912
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1912_high_5
NF1912_high_5
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (18-374)||(22310-22669)
scaffold0174 (120-170)||(863-913)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (18-366)||(12245763-12246120)
chr7 (112-364)||(3193868-3194120)
chr7 (31-230)||(39293892-39294090)
chr7 (31-195)||(4482533-4482696)
chr7 (31-154)||(14278642-14278765)
chr7 (74-284)||(19065410-19065619)
chr7 (31-212)||(28718268-28718454)
chr7 (18-191)||(4072727-4072904)
chr7 (42-304)||(14302614-14302887)
chr7 (31-147)||(21677263-21677377)
chr7 (114-248)||(16370194-16370326)
chr7 (111-212)||(13460576-13460677)
chr7 (111-229)||(13452419-13452535)
chr7 (53-191)||(15980299-15980427)
chr7 (112-229)||(9322893-9323007)
chr7 (120-229)||(9641278-9641381)
chr7 (120-192)||(14938974-14939045)
chr7 (120-192)||(15366567-15366638)
chr7 (112-191)||(5617721-5617800)
chr7 (120-195)||(28388702-28388777)
chr7 (112-191)||(16915915-16915994)
chr7 (115-191)||(17229939-17230015)
chr7 (120-192)||(20587478-20587550)
chr7 (120-192)||(34242979-34243051)
chr7 (112-191)||(9058452-9058529)
chr7 (112-191)||(9609508-9609587)
chr7 (112-191)||(9837080-9837159)
chr7 (120-190)||(4437141-4437211)
chr7 (112-170)||(16917835-16917893)
chr7 (115-192)||(15628948-15629024)
chr7 (141-243)||(18920958-18921054)
chr7 (42-98)||(3135506-3135562)
chr7 (157-237)||(20912285-20912368)
chr7 (157-249)||(4598420-4598515)
chr7 (120-195)||(31499502-31499576)
chr7 (159-241)||(15305642-15305725)
chr7 (120-168)||(4444564-4444612)
chr7 (141-189)||(12753119-12753167)
chr7 (112-191)||(13388251-13388331)
chr7 (111-191)||(48345852-48345932)
chr7 (115-191)||(49049703-49049778)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (31-374)||(20270996-20271332)
chr2 (31-349)||(29111866-29112192)
chr2 (31-212)||(18533582-18533763)
chr2 (31-244)||(6092663-6092870)
chr2 (33-293)||(23614335-23614591)
chr2 (111-212)||(25593397-25593498)
chr2 (74-191)||(45620233-45620354)
chr2 (31-147)||(43640662-43640779)
chr2 (52-155)||(23170097-23170200)
chr2 (52-155)||(23581354-23581457)
chr2 (216-284)||(23172466-23172535)
chr2 (216-284)||(23583723-23583792)
chr2 (31-136)||(19435678-19435782)
chr2 (120-191)||(24868806-24868877)
chr2 (31-147)||(19657774-19657888)
chr2 (112-195)||(24272312-24272395)
chr2 (157-237)||(24301170-24301251)
chr2 (120-195)||(30994827-30994902)
chr2 (31-168)||(24839652-24839788)
chr2 (115-191)||(7319663-7319738)
chr2 (115-191)||(24296399-24296474)
chr2 (115-191)||(40642166-40642242)
chr2 (298-355)||(24839504-24839561)
chr2 (115-191)||(22581838-22581913)
chr2 (115-191)||(36892608-36892683)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (111-364)||(17858215-17858468)
chr6 (18-229)||(16131494-16131703)
chr6 (42-229)||(21929674-21929858)
chr6 (26-145)||(23219619-23219739)
chr6 (31-229)||(29162658-29162852)
chr6 (114-229)||(17375555-17375667)
chr6 (215-288)||(16374138-16374212)
chr6 (112-192)||(19852530-19852610)
chr6 (123-195)||(22467942-22468014)
chr6 (28-208)||(31163061-31163246)
chr6 (111-191)||(4174546-4174627)
chr6 (111-191)||(4230175-4230256)
chr6 (112-191)||(22846386-22846465)
chr6 (120-195)||(31469375-31469450)
chr6 (122-229)||(34965167-34965273)
chr6 (112-191)||(12310833-12310912)
chr6 (115-191)||(21621371-21621447)
chr6 (115-191)||(25649517-25649593)
chr6 (120-195)||(15006485-15006560)
chr6 (120-191)||(33540069-33540140)
chr6 (121-195)||(22595494-22595568)
chr6 (139-212)||(23219215-23219288)
chr6 (115-191)||(7829744-7829819)
chr6 (264-320)||(17375715-17375770)
chr6 (112-172)||(22364064-22364124)
chr6 (115-191)||(25917926-25918001)
chr6 (116-191)||(940958-941033)
chr6 (307-366)||(16131327-16131386)
chr6 (112-191)||(18383500-18383579)
chr6 (121-191)||(6092787-6092857)
chr6 (121-191)||(17085393-17085463)
chr6 (118-191)||(14150840-14150912)
chr6 (115-172)||(25369275-25369331)
chr6 (115-191)||(16889637-16889712)
chr6 (330-374)||(21929503-21929547)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (18-212)||(11600298-11600492)
chr8 (28-212)||(24237265-24237449)
chr8 (31-209)||(23879199-23879382)
chr8 (31-147)||(22319930-22320046)
chr8 (31-230)||(17264732-17264934)
chr8 (32-147)||(23216965-23217079)
chr8 (31-229)||(19333774-19333975)
chr8 (18-212)||(25608151-25608348)
chr8 (31-136)||(25293854-25293958)
chr8 (31-136)||(25755843-25755947)
chr8 (112-208)||(22884015-22884111)
chr8 (36-364)||(23350246-23350575)
chr8 (31-229)||(45561439-45561643)
chr8 (121-195)||(17500107-17500181)
chr8 (120-229)||(22499136-22499242)
chr8 (112-244)||(23118675-23118802)
chr8 (122-234)||(24906157-24906268)
chr8 (118-195)||(18263246-18263323)
chr8 (78-147)||(22311364-22311433)
chr8 (112-191)||(15931589-15931668)
chr8 (118-209)||(16000406-16000497)
chr8 (112-195)||(33170517-33170600)
chr8 (114-191)||(23835490-23835567)
chr8 (18-78)||(11542327-11542387)
chr8 (114-191)||(23229128-23229204)
chr8 (219-284)||(39116233-39116298)
chr8 (115-191)||(21695844-21695919)
chr8 (120-207)||(7468546-7468633)
chr8 (115-190)||(17283500-17283574)
chr8 (120-195)||(20708053-20708128)
chr8 (120-195)||(24266257-24266332)
chr8 (120-195)||(24554408-24554483)
chr8 (141-192)||(38531826-38531877)
chr8 (112-191)||(29296141-29296220)
chr8 (130-212)||(11542220-11542301)
chr8 (141-191)||(18769996-18770046)
chr8 (149-207)||(21200021-21200079)
chr8 (121-191)||(23154446-23154516)
chr8 (120-189)||(5851767-5851835)
chr8 (115-191)||(17731367-17731442)
chr8 (115-191)||(20479838-20479913)
chr8 (120-195)||(21233864-21233939)
chr8 (260-288)||(22883937-22883965)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (74-366)||(5418-5717)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (219-364)||(2561-2706)
scaffold0025 (112-191)||(51577-51656)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (31-374)||(14182149-14182501)
chr3 (31-212)||(17391227-17391408)
chr3 (216-364)||(14889959-14890107)
chr3 (31-212)||(25106095-25106275)
chr3 (31-212)||(15988776-15988956)
chr3 (31-212)||(8602526-8602706)
chr3 (31-195)||(37918655-37918820)
chr3 (31-147)||(15551643-15551759)
chr3 (31-229)||(17760551-17760752)
chr3 (31-229)||(19061871-19062072)
chr3 (34-191)||(6817384-6817546)
chr3 (78-230)||(5230400-5230550)
chr3 (18-244)||(38378016-38378232)
chr3 (31-147)||(31414393-31414508)
chr3 (64-209)||(40041355-40041502)
chr3 (111-244)||(10902677-10902805)
chr3 (114-284)||(14967991-14968167)
chr3 (31-154)||(38813153-38813275)
chr3 (112-195)||(41659868-41659951)
chr3 (42-136)||(12950893-12950986)
chr3 (115-208)||(11517291-11517383)
chr3 (118-229)||(43429368-43429476)
chr3 (120-195)||(6230494-6230569)
chr3 (120-195)||(14819681-14819756)
chr3 (120-195)||(17320410-17320485)
chr3 (115-184)||(18968349-18968418)
chr3 (157-249)||(24901769-24901863)
chr3 (120-200)||(4164081-4164160)
chr3 (18-82)||(5230324-5230388)
chr3 (120-191)||(33371202-33371273)
chr3 (120-168)||(11636798-11636846)
chr3 (157-249)||(11822588-11822683)
chr3 (112-191)||(12020188-12020267)
chr3 (112-191)||(17202903-17202982)
chr3 (123-195)||(4147531-4147603)
chr3 (115-191)||(11199395-11199470)
chr3 (112-191)||(34558132-34558211)
chr3 (157-187)||(7254467-7254497)
chr3 (115-189)||(14523258-14523331)
chr3 (141-191)||(40937888-40937938)
chr3 (207-248)||(4655297-4655338)
chr3 (146-191)||(18008979-18009024)
chr3 (159-249)||(20418962-20419053)
chr3 (155-253)||(31416123-31416215)
chr3 (115-191)||(14061090-14061165)
chr3 (115-191)||(15548773-15548848)
chr3 (115-191)||(39654108-39654183)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (28-229)||(54365826-54366025)
chr4 (31-230)||(5372868-5373070)
chr4 (70-225)||(41919030-41919182)
chr4 (80-229)||(12136091-12136238)
chr4 (31-154)||(15215988-15216110)
chr4 (111-366)||(19082781-19083041)
chr4 (33-147)||(9650155-9650270)
chr4 (114-212)||(24237135-24237233)
chr4 (117-244)||(12732393-12732514)
chr4 (112-195)||(50223991-50224074)
chr4 (112-189)||(19623872-19623949)
chr4 (122-229)||(17378031-17378136)
chr4 (114-284)||(17213700-17213868)
chr4 (120-229)||(13595864-13595967)
chr4 (120-192)||(5407412-5407484)
chr4 (114-206)||(10239268-10239360)
chr4 (120-192)||(38763040-38763112)
chr4 (31-136)||(15116045-15116148)
chr4 (112-229)||(47470166-47470282)
chr4 (120-195)||(19557597-19557671)
chr4 (121-191)||(7187767-7187837)
chr4 (112-190)||(12246069-12246147)
chr4 (112-170)||(41258177-41258234)
chr4 (111-191)||(42706970-42707050)
chr4 (120-195)||(13448875-13448949)
chr4 (111-191)||(14569666-14569751)
chr4 (122-191)||(18496321-18496389)
chr4 (215-284)||(9650007-9650078)
chr4 (26-78)||(41918924-41918976)
chr4 (120-191)||(7966435-7966506)
chr4 (141-191)||(20813895-20813945)
chr4 (141-191)||(30236416-30236466)
chr4 (18-78)||(12135982-12136042)
chr4 (151-191)||(37958913-37958953)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (31-195)||(13135-13299)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (18-212)||(19564-19758)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (18-170)||(33395152-33395304)
chr1 (31-212)||(20191974-20192154)
chr1 (49-229)||(78277-78455)
chr1 (18-229)||(20820662-20820861)
chr1 (111-244)||(25093058-25093186)
chr1 (111-195)||(40555629-40555713)
chr1 (120-229)||(40438121-40438228)
chr1 (111-195)||(5472220-5472303)
chr1 (112-191)||(17607189-17607267)
chr1 (120-170)||(46144051-46144101)
chr1 (120-193)||(52397924-52397997)
chr1 (112-172)||(21193445-21193505)
chr1 (112-195)||(41213496-41213578)
chr1 (120-195)||(49999184-49999259)
chr1 (121-195)||(5770042-5770115)
chr1 (112-190)||(37235787-37235865)
chr1 (120-192)||(18164438-18164511)
chr1 (120-195)||(29217355-29217431)
chr1 (121-195)||(21042046-21042119)
chr1 (215-271)||(16243914-16243971)
chr1 (115-190)||(17021821-17021896)
chr1 (165-230)||(33384157-33384220)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (18-191)||(256531-256703)
scaffold0009 (118-208)||(98797-98887)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (31-228)||(20456313-20456512)
chr5 (31-229)||(11963830-11964031)
chr5 (33-147)||(14345408-14345521)
chr5 (111-229)||(19872149-19872264)
chr5 (92-244)||(16837563-16837710)
chr5 (31-136)||(5453047-5453151)
chr5 (31-147)||(24227680-24227798)
chr5 (120-195)||(3420666-3420741)
chr5 (218-291)||(37482952-37483025)
chr5 (31-102)||(11765494-11765565)
chr5 (120-195)||(26561621-26561696)
chr5 (122-209)||(33628106-33628193)
chr5 (133-223)||(11765570-11765659)
chr5 (120-198)||(29912307-29912385)
chr5 (122-195)||(24082377-24082450)
chr5 (115-191)||(37189945-37190021)
chr5 (112-179)||(13793415-13793482)
chr5 (112-191)||(21615275-21615353)
chr5 (118-195)||(23236240-23236317)
chr5 (112-144)||(23412262-23412294)
chr5 (115-191)||(23453129-23453204)
chr5 (115-191)||(23460373-23460448)
chr5 (115-191)||(23464634-23464709)
chr5 (31-78)||(3671836-3671883)
chr5 (141-191)||(21392377-21392427)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (31-212)||(36938-37118)
scaffold0090 (31-146)||(6880-6997)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (43-195)||(22897-23048)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (70-212)||(11565-11706)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (112-212)||(55681-55781)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (18-212)||(121709-121903)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (18-183)||(15077-15247)
scaffold0231 (119-191)||(15705-15778)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (31-137)||(3198-3304)
[»] scaffold1923 (1 HSPs)
scaffold1923 (42-189)||(646-799)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (114-212)||(45432-45530)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (75-244)||(10481-10650)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (112-244)||(84631-84757)
scaffold0004 (112-192)||(25821-25901)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (65-155)||(40290-40381)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (111-366)||(4545-4803)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (120-212)||(4600-4691)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (112-208)||(4193-4289)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (120-191)||(1514-1585)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (120-195)||(5991-6066)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (120-195)||(25805-25879)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (120-195)||(36160-36235)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (112-179)||(29381-29448)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (18-78)||(8775-8835)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (122-190)||(19652-19720)
scaffold0021 (122-190)||(29228-29296)
scaffold0021 (115-191)||(9821-9896)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (120-244)||(1813-1930)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (120-195)||(6725-6800)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (120-195)||(3543-3618)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (122-192)||(130146-130214)
scaffold0022 (150-207)||(114164-114221)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (114-191)||(99023-99100)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (114-195)||(99390-99471)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (123-195)||(2874-2946)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (111-191)||(1947-2027)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (120-192)||(104221-104293)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (112-191)||(25440-25519)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (157-249)||(64372-64466)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (111-191)||(247625-247710)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (120-192)||(853-924)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (120-195)||(20383-20459)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (115-191)||(7244-7319)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (116-191)||(9629-9703)
[»] scaffold0613 (1 HSPs)
scaffold0613 (157-191)||(2961-2995)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (141-191)||(2852-2902)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (121-191)||(2920-2989)
scaffold0409 (121-191)||(11175-11244)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (112-190)||(11703-11780)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (141-191)||(59810-59860)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (150-191)||(5790-5831)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (150-195)||(18892-18937)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (115-191)||(14134-14209)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (112-168)||(33765-33821)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (120-192)||(199208-199279)


Alignment Details
Target: scaffold0174 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 374
Target Start/End: Original strand, 22310 - 22669
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaat--ttct-atgtttgt 114  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22310 tatggaacgggggataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatgctgcttatgtttgt 22409  T
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttat 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  22410 ttatgttgattgtgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgattgcctacctgtttgtatgaaagggtagacggagtgcaggagtagtttgcttat 22509  T
Q  215 ttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatt 314  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22510 ttgatgagttgcttgaggatagtgggagcttcctctgtttatcagtcagagtcttagattaggctctgattagatgtcagcctttatgatattatggatt 22609  T
Q  315 tgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatatattgatat 374  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22610 tgtttatgttatggggattttgcctatttgtcgggttttgaagattttatgtattgatat 22669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 863
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacct 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  913 ttgattatgattgatgtaaagcttacacccagtggttttgaccgcctacct 863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12246120 - 12245763
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| || ||||    
T  12246120 tatggaatgggggataataatcatgtgatgttagtattctaggagggatgtgtatgtatatgtgttatgcatgagatccttgaatgtttatgattattta 12246021  T
Q  118 tgtt-gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttt----tg-accgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg-- 209  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||      
T  12246020 tgtttgattatgattgatgtcaagctaacccc-agtggtctgtggtgtaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacgacatgcaagattagtttgat 12245922  T
Q  210 --cttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatatt 307  Q
      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  12245921 tgctttcttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttttccgttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcaatctttatgattct 12245822  T
Q  308 ctggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatat 366  Q
    |||||||| |||| ||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  12245821 ctggatttatttatgttatggagattttgcccatatgtcgggatttggagattttatat 12245763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 3193868 - 3194120
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtag--tttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||   ||||  ||||    
T  3193868 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccc-cagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtaggcggagtgcagacgtagtttttg 3193966  T
Q  210 cttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattct 309  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3193967 cttattcggtgagttgctcgaggatagcgagagcttcctctgtttaccagttagagtcttagattaggctctgatttggtgtcagtc-ttatgatattct 3194065  T
Q  310 ggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 364  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  3194066 ggatttatttatgttatggagatttcactcatttgtcgggttttggagattttat 3194120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Original strand, 39293892 - 39294090
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttct-atgtttgtttatgttgattatga 129  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  39293892 ataataatcatgcgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatacatgaaatccttgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatga 39293991  T
Q  130 ttgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg 229  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || || ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39293992 ttgatgtgaagcttagccccagtggttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggcagacgaagtgcatgattagtttgat--tttggtgagttgcttg 39294089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4482696 - 4482533
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4482696 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgat 4482598  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  4482597 tgatgtaaagcttacccccagtgatttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 4482533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 14278642 - 14278765
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14278642 ataataatcatatgatgctagtattctgggagggatggttatgtaaatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgat 14278741  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtgg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14278742 tgatgtgaagcttacccctagtgg 14278765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19065619 - 19065410
Alignment:
Q  74 tatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatt 173  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  19065619 tatatgtgatatgcatgaaatccttaaatgcttatgtttgtttatgatgattatgattgatgtgaagctaacccacagtggttttgaccgcctacttgtt 19065520  T
Q  174 tgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttaga-gtcttaga 272  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  ||| || ||||||||    
T  19065519 tgtattaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgctt-gtcggtgag-tgctcgaggatagcgggagctacctctatttttttgttcgatgtcttaga 19065422  T
Q  273 ttaggctctgat 284  Q
    ||||||||||||    
T  19065421 ttaggctctgat 19065410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28718454 - 28718268
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28718454 ataataatcatgtgatgctagaattctagaagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgat 28718356  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    | |||||||||||||||  ||||| |      | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || || ||||||||||    
T  28718355 taatgtgaagcttacccccagtggatctatgatggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgattagtttgctt 28718268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 4072727 - 4072904
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |||||    
T  4072727 tatggaatgagggataataatcatgtgatgttagtattttaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaacccttgaatgcttatgtt-gttta 4072825  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-----tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||      | |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4072826 tgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggtctgtggtggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 4072904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 304
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302887
Alignment:
Q  42 gtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatg-ttgattatgattgatgtgaag 140  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  14302614 gtgatgttaatattctaagagggatggttatgtatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatgtttataattgtttatgcttgaatatgattaatgtgaag 14302713  T
Q  141 cttacccttagtggt-----tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagt----agtttgcttatttggtgagttgcttgag 231  Q
     | ||||  ||||||      | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |      || || |  ||||||||||||||||     
T  14302714 ttaacccccagtggtctgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatg-gtagacgacatgcaggattgatcttttagcgtgcttggtgagttgcttgat 14302812  T
Q  232 gatagcgggagcttcctctgtttatcag-ttagagtcttagattaggctctgattagg-tgtcagcctttatgat 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||    
T  14302813 gatagcgggagcttcctatgtttacctgtttagagtcttagattaggatctgattaggatgttagtctttatgat 14302887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 21677263 - 21677377
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  21677263 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagg-atggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgat 21677360  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  21677361 tgatgtgaagcttaccc 21677377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 16370194 - 16370326
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctta 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||| ||     
T  16370194 tttatgctgattatgattgatgtgaagctaatccc-agtgggtttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacggagtgcaggagtagtttgtttg 16370292  T
Q  214 tttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcct 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16370293 tttggtgag-tgcttgaggatagcgggagcttcct 16370326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13460677 - 13460576
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||    
T  13460677 ttgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttgc 13460578  T
Q  211 tt 212  Q
    ||    
T  13460577 tt 13460576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13452535 - 13452419
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| || |||| ||||||    
T  13452535 ttgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttatccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaattggtagacaaagtgcaggagtggtttgc 13452436  T
Q  211 ttatttggtgagttgcttg 229  Q
    |  || |||||||||||||    
T  13452435 t--ttcggtgagttgcttg 13452419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 15980299 - 15980427
Alignment:
Q  53 attctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagt 152  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  15980299 attctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgatatccttgaattt----------ttatgttgataatgattgatgtgaagcttacccccagt 15980388  T
Q  153 ggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  15980389 ggtttcgaccgcctacctctttgtaaaaatgggtagacg 15980427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 9322893 - 9323007
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgct 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||  ||| ||||||||||| || || ||| |||||    
T  9322893 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatcgatgggtagacgaagtgcaggattag-ttgct 9322991  T
Q  212 tatttggtgagttgcttg 229  Q
      ||||||||||||||||    
T  9322992 --tttggtgagttgcttg 9323007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9641381 - 9641278
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||  | || |||||||||  ||||||    
T  9641381 ttgattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctacc----tgtatggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgct--tttggt 9641288  T
Q  220 gagttgcttg 229  Q
    ||||||||||    
T  9641287 gagttgcttg 9641278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14939045 - 14938974
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  14939045 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 14938974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15366638 - 15366567
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  15366638 ttgattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 15366567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5617800 - 5617721
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  5617800 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 5617721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28388777 - 28388702
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  28388777 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccaggggttttgaccgcctacctgtttatatggatgggtagacgaagt 28388702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16915994 - 16915915
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  16915994 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 16915915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 17229939 - 17230015
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  17229939 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgagtagacg 17230015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 20587478 - 20587550
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||    
T  20587478 ttgattttgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacga 20587550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 34242979 - 34243051
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  34242979 ttgattatgattgatgtaatgtttaccccgagtggttttgactgcctacctgtttgtatggatgggtagacga 34243051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 9058452 - 9058529
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  9058452 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttaccc-tagt-gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 9058529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9609587 - 9609508
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  9609587 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 9609508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9837159 - 9837080
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  9837159 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 9837080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4437211 - 4437141
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4437211 ttgattttgattgatgtaaatcttacccctagtgattttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagac 4437141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16917893 - 16917835
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacct 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16917893 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacct 16917835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15629024 - 15628948
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  15629024 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 15628948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 243
Target Start/End: Original strand, 18920958 - 18921054
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcggg 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || ||| ||||   |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18920958 cttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattag-ttgc---tttggtgagttgctt--ggatagcggg 18921051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3135562 - 3135506
Alignment:
Q  42 gtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatcctt 98  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3135562 gtgatgttagtattctaggagggatgtgtatgtatatgtgttatgcatgaaatcctt 3135506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Original strand, 20912285 - 20912368
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacct-atttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctta--tttggtgagttgcttgaggatagc 237  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  20912285 ttgaccgcctaccttattcgtatggatgagtagacggtgtgcatgactagtttgctttgctttggtgagttgcttgaggatagc 20912368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 4598420 - 4598515
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt----ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctc 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||| |    ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4598420 ttgaccacctacctatttgtatgaatggctagacggcgtgcaagagtatttttgttgcttgcttggtgag-tgcttgaggatagcgagagcttcctc 4598515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31499576 - 31499502
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  31499576 ttgattacgatcgatgtaaagcttacccc-agtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 31499502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15305725 - 15305642
Alignment:
Q  159 gaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt--ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcggga 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||  || || |||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15305725 gaccgcctacctatctgtatgaatgggtagacggcgtgcaggagtagttgttgattgtttggtgag-tgcttgaggatagaggga 15305642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4444612 - 4444564
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctac 168  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4444612 ttgattttgattgatgtaaatcttacccctagtggttttgatcgcctac 4444564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12753167 - 12753119
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtaga 189  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  12753167 cttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtaga 12753119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13388331 - 13388251
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggtttt-gaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  13388331 tgttcatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 13388251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48345932 - 48345852
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  48345932 ttgtttacgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatgattttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacg 48345852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 49049703 - 49049778
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  49049703 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 49049778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20271332 - 20270996
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgtt-gattatga 129  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||  |||| ||||| ||||||||    
T  20271332 ataataatcatgtgatgttagtactctaggagggatgggtatgtatatgtatcatgcatgaaatccttgaatgcttatgcctgtt-atgtttgattatga 20271234  T
Q  130 ttgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagta----gtttgcttatttggtgagttg 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||| |||| || || ||    ||||||||  |||| ||||||    
T  20271233 ttgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgttggtatgaataggtagacaaagtgcaggattactttgtttgcttgcttggcgagttg 20271134  T
Q  226 cttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatttgtttaagtta 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20271133 cttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattagg-----------tgtcagtctttatgatattatggatttgtttatgtta 20271045  T
Q  326 tagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatatattgatat 374  Q
    | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20271044 tggagattttgcccatatgtcgggttttggagattttatgtattgatat 20270996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29112192 - 29111866
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29112192 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaa-tcgttgaatgtctatgtttgtttatgttgattgtgat 29112094  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg- 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||  || |||||||||||||     
T  29112093 tgatgtgaagcttacccccagtggttttgacagcctgcctgtttgtatgaatgcgtagacgaagtgcatgattagtttgct--ttcggtgagttgcttgg 29111996  T
Q  230 --------aggatagcgggagct-tcctctgtttatcag---ttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatttgt 317  Q
             ||||||| ||||||   ||| | ||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  29111995 tgattgtttggatagctggagctaatctccg-ttatcggtttttagaatcttagattaggctctgattaggtgtcagtc-ttatgagattctggatttgt 29111898  T
Q  318 ttaagttatagggattttgcctatttgtcggg 349  Q
    ||| ||||| | ||||||||| || |||||||    
T  29111897 ttatgttatggagattttgcccatatgtcggg 29111866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18533763 - 18533582
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  18533763 ataataatcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgattatgttgattatgat 18533664  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  18533663 tgatgtgaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtattttgctt 18533582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6092870 - 6092663
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6092870 ataataatcatgtgatgctagtattataggagggatggttatgtatatgtgttatgcatg-aatccttgaatgcctgtgtttgtttatgttgattatgat 6092772  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttga 230  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||  |||||||||||||||      
T  6092771 tgatgtaaagcttaccc-cattggttttgaccgcctatctgtctatatggatgggtagacgaagtgcatgattagtttgct--tttggtgagttgctt-- 6092677  T
Q  231 ggatagcgggagct 244  Q
    ||||||||||||||    
T  6092676 ggatagcgggagct 6092663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 293
Target Start/End: Original strand, 23614335 - 23614591
Alignment:
Q  33 aataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattg 132  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23614335 aataatcatctgatgctagtat-ctaggagggatggttaggtat--gtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattg 23614431  T
Q  133 atgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgagg 232  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||  |  ||||||||||||  ||    
T  23614432 acgtgaatcttaccc-tagttgttttgaccgcctacctttttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgattagtttgct--tccggtgagttgctt--gg 23614526  T
Q  233 atagcgggagct-tcctctgtt---tatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtca 293  Q
    ||||||||||||   |||||||    ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23614527 atagcgggagctaatctctgttaccgattctttagagtcttaaattaggctctgattaggtgtca 23614591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25593498 - 25593397
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||    
T  25593498 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgtaggagtagtttgc 25593399  T
Q  211 tt 212  Q
    ||    
T  25593398 tt 25593397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Original strand, 45620233 - 45620354
Alignment:
Q  74 tatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-----tttgaccgcctac 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||      | ||||||||||    
T  45620233 tatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttat-ttgattatgattgatgtgaagctaaccctcagtggtctgtggtggaccgcctac 45620331  T
Q  169 ctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45620332 ctatttgtatgaatgggtagacg 45620354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43640779 - 43640662
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgtt---gattat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||   ||||||    
T  43640779 ataataatcatgtgatgctagtatt-taggagggatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttattttattgattat 43640682  T
Q  128 gattgatgtgaagcttaccc 147  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43640681 gattgatgtgaagcttaccc 43640662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 23170097 - 23170200
Alignment:
Q  52 tattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatg-ttgattatgattgatgtgaagcttaccctta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| || | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  23170097 tattctaggagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaagtt-tatgtttacttatgattaagtatgatcgatgtgaagctaaccccta 23170195  T
Q  151 gtggt 155  Q
    |||||    
T  23170196 gtggt 23170200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 23581354 - 23581457
Alignment:
Q  52 tattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatg-ttgattatgattgatgtgaagcttaccctta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| || | |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  23581354 tattctaggagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaagtt-tatgtttacttatgattaagtatgatcgatgtgaagctaaccccta 23581452  T
Q  151 gtggt 155  Q
    |||||    
T  23581453 gtggt 23581457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 23172466 - 23172535
Alignment:
Q  216 tggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcag-ttagagtcttagattaggctctgat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||    
T  23172466 tggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatctgtttagagtcttagtataggctctgat 23172535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 23583723 - 23583792
Alignment:
Q  216 tggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcag-ttagagtcttagattaggctctgat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||    
T  23583723 tggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatctgtttagagtcttagtataggctctgat 23583792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 19435678 - 19435782
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19435678 ataacaatcatgtgatgctagtattctaggagaggtggttatgtatatgtgttatgcatg-aatccttgaatgcttatatttgtttttgttgattatgat 19435776  T
Q  131 tgatgt 136  Q
    | ||||    
T  19435777 ttatgt 19435782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24868877 - 24868806
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  24868877 ttgattatgattgatgtaaagcttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 24868806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19657888 - 19657774
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||     
T  19657888 ataataatcatgtgttgctagtattctaggatagatggttatgtataattgttatgcatg-aatccttgaatgcctatgtctgtttatgtggattatga- 19657791  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc 147  Q
    |||||| | ||||||||    
T  19657790 tgatgtaatgcttaccc 19657774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24272395 - 24272312
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| | | |||||  ||| |||||||||||    
T  24272395 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctaatggttttgactgcctacttgtctgtattgatgggtagacgaagt 24272312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24301251 - 24301170
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacct-atttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgaggatagc 237  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||  || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24301251 ttgaccgcctaccttattcgtatggatgggtagacggtgtgcatgaatagtttgcttacttggtgagttgcttgaggatagc 24301170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 30994827 - 30994902
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||| |||  ||||||||||    
T  30994827 ttgattatgattgatgtaaagcttagccccagtggttttgaccgcctacctgactgtatggatggatagacgaagt 30994902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24839788 - 24839652
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||  || |||||| ||| |||||||   ||| ||||| |||||||||   | |||||   |||||||||||||||    
T  24839788 ataataattatgtgatgttagtattctgggaaggatgggtatttatatgtaatatgtatgaa-tccttgaatgcttgtgttttcatatgttgattatgat 24839690  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctac 168  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  24839689 tgatgtaaagcttacccccaatggtttcgaccgcctac 24839652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7319738 - 7319663
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7319738 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttaccctcagtgattttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 7319663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 24296399 - 24296474
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  24296399 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 24296474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 40642166 - 40642242
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  40642166 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttttccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 40642242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24839561 - 24839504
Alignment:
Q  298 ttatgatattctggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttgg 355  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  24839561 ttatgatattatggatttatttatgttatggagattttccccatttgtcgggttttgg 24839504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 22581838 - 22581913
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  22581838 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 22581913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 36892608 - 36892683
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  36892608 ttattttgattatgat-gatgtaatacttacccgcagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 36892683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 364
Target Start/End: Original strand, 17858215 - 17858468
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtag-tttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| || |||||| ||||    
T  17858215 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggtagacggagtgcaggagtagttttg 17858314  T
Q  210 cttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattct 309  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  17858315 cttattcggtgagtttctcgaggatagagggagcttcctctgtttaccagttagaatcttagattaggctctgattaggtgttagtc-ttatgatattct 17858413  T
Q  310 ggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 364  Q
    |||||| |||| || || | ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  17858414 ggatttatttatgtcatggagatttttaccatttgtcgggtttttgagattttat 17858468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16131703 - 16131494
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  16131703 tatggaatgggggataataattatgtgatgttagtattctaggagggatggatatgtatatgttttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttta 16131604  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||  ||||    
T  16131603 tgttgattatgattgatgtgaagcttatccccagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgct--tttg 16131506  T
Q  218 gtgagttgcttg 229  Q
    ||||||||||||    
T  16131505 gtgagttgcttg 16131494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21929858 - 21929674
Alignment:
Q  42 gtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagc 141  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  21929858 gtgatgatagtattctaggagagatggttatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcttatgtttgcttatgttgattatgattgatgtaaacc 21929760  T
Q  142 ttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg 229  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||  || |||||||||||||    
T  21929759 ttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaaatgcatgattagtttgct--ttcggtgagttgcttg 21929674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23219739 - 23219619
Alignment:
Q  26 gaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttc-tatgtttgtttatgttgat 124  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  23219739 gagggataataatcatgtgatgcttgtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaaatgcttatgtttgtttatgttgat 23219640  T
Q  125 tatgattgatgtgaagcttac 145  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23219639 tatgattgatgtgaagcttac 23219619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 29162658 - 29162852
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  29162658 ataatagtcatgtgatgatagtattctaggagggatgactatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattaggac 29162756  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg 229  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| || || ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29162757 tgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtggacgaagtgcaggactag-ttgct--tttggtgagttgcttg 29162852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 17375555 - 17375667
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctta 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||      
T  17375555 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgct-- 17375651  T
Q  214 tttggtgagttgcttg 229  Q
    || |||||||||||||    
T  17375652 ttcggtgagttgcttg 17375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16374212 - 16374138
Alignment:
Q  215 ttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcag-ttagagtcttagattaggctctgattagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16374212 ttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatctgtttagagtcttagattagactctgattagg 16374138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19852610 - 19852530
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  19852610 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacga 19852530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 22467942 - 22468014
Alignment:
Q  123 attatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  22467942 attatgattgatgtaaagcttaccctcagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagt 22468014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Original strand, 31163061 - 31163246
Alignment:
Q  28 ggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta-tgttgatta 126  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| ||||||||||||   |||||||| ||| | ||| |||    
T  31163061 ggaataataatcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgagttatgcataaaatccttgaatgcttatgtttgcttattcttgttta 31163160  T
Q  127 tgattgatgtgaagcttacccttagtggt-----tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagttt 208  Q
    ||||| |||||||||| | ||  ||||||      | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||    
T  31163161 tgattcatgtgaagctaatcc-cagtggtctatggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacaacgtgcaagaatagttt 31163246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 4174546 - 4174627
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  4174546 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 4174627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 4230175 - 4230256
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  4230175 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 4230256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22846465 - 22846386
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  22846465 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttatcccaagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 22846386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 31469375 - 31469450
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||    
T  31469375 ttgattatgattgatgtaaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtctctatggatgagtagacgaagt 31469450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34965273 - 34965167
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttaccctt-agtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||||||    
T  34965273 gattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacgtgcaagattagtttgct--tttggtg 34965176  T
Q  221 agttgcttg 229  Q
    |||||||||    
T  34965175 agttgcttg 34965167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 12310833 - 12310912
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||    
T  12310833 tgtttatgtggattatgattgatgtaaaacttaccctcagtggttttgaccgcctacctgtcggtatggatgggtagacg 12310912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21621447 - 21621371
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  21621447 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 21621371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25649593 - 25649517
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  25649593 ttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtttggatgggtagacg 25649517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 15006485 - 15006560
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  15006485 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagaggttttgaccgcctacatgtctgtacggatgagtagacgaagt 15006560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Original strand, 33540069 - 33540140
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  33540069 ttgattatgattgatgtaaagcttacgcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 33540140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Original strand, 22595494 - 22595568
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  22595494 tgattatgtttgatgtcaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 22595568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23219288 - 23219215
Alignment:
Q  139 agcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||    
T  23219288 agcttacccccagcggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagtttgctt 23219215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 7829744 - 7829819
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  7829744 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctaatggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 7829819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Original strand, 17375715 - 17375770
Alignment:
Q  264 agtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatttgttta 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  17375715 agtcttagattaggctttgattaggtgtcagtc-ttatgagattctggattttttta 17375770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 172
Target Start/End: Original strand, 22364064 - 22364124
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctat 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  22364064 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccctgtggttttgaccgcctacctat 22364124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25918001 - 25917926
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  25918001 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 25917926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Original strand, 940958 - 941033
Alignment:
Q  116 tatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||| |||||||| |||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  940958 tatgtggattatgaatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 941033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16131386 - 16131327
Alignment:
Q  307 tctggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatat 366  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  16131386 tctggatttgtttatgttgtggagattttgcccatatgtcgggatttggagattttatat 16131327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 18383500 - 18383579
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||  ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  18383500 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaacccgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 18383579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6092857 - 6092787
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  6092857 tgattatgtatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacg 6092787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 17085393 - 17085463
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  17085393 tgattatgtttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacg 17085463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14150912 - 14150840
Alignment:
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||||    
T  14150912 tgttgattatg-ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacg 14150840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Original strand, 25369275 - 25369331
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctat 172  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25369275 ttatgtcgattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctat 25369331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 16889637 - 16889712
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  16889637 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgaatgggtagacg 16889712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21929547 - 21929503
Alignment:
Q  330 gattttgcctatttgtcgggttttggagattttatatattgatat 374  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21929547 gattttgcccatatgtccggttttggagattttatgtattgatat 21929503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11600492 - 11600298
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11600492 tatggaatgagggataataataatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttta 11600393  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  11600392 tgtggattgtgattgatgtgaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcatgagtagtttgctt 11600298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24237449 - 24237265
Alignment:
Q  28 ggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattat 127  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24237449 ggaataataatcatgtgatgttagtattataggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatctttgaatgtttatgtttgtttatgttgattat 24237350  T
Q  128 gattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24237349 gattgatgtgaatcttacccccaatggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgctt 24237265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23879382 - 23879199
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  23879382 ataataatcatgagatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgtatgaaagccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgat 23879283  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt-----ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg 209  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||    
T  23879282 tgatgtgaagctaacccctagtggtttgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggtgtgcaagattagtttg 23879199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22320046 - 22319930
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22320046 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgat 22319947  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc 147  Q
    |||||| || |||||||    
T  22319946 tgatgtaaaacttaccc 22319930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17264934 - 17264732
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17264934 ataataatcatatgatgctagtattctaggaggggtgattatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgat 17264836  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagtt 224  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |      | |||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  17264835 tgatgtgaagcttacctccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacaaagtacatgactagtttgct--tttggtgagtt 17264738  T
Q  225 gcttga 230  Q
     |||||    
T  17264737 tcttga 17264732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23217079 - 23216965
Alignment:
Q  32 taataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgatt 131  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23217079 taataatcatgtgatactagtattttaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgatt 23216981  T
Q  132 gatgtgaagcttaccc 147  Q
    ||||||||||||||||    
T  23216980 gatgtgaagcttaccc 23216965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 19333774 - 19333975
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19333774 ataataatcatgtgatgctaggattttaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcctatgcttgtttatgttgattatgat 19333872  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagtt 224  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |      | || ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||  || ||||||||    
T  19333873 tgatatgaagtttacccctagtggatctgtgatggatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtttgct--ttcggtgagtt 19333970  T
Q  225 gcttg 229  Q
    |||||    
T  19333971 gcttg 19333975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25608348 - 25608151
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| || || |||   ||||||||||||    
T  25608348 tatggaatgggggataataatcatgtgatgctagtattataggagggatgtttatgtatatgtgctatgcatgaattc-ttaaatgcttatgtttgttta 25608250  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |      | |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||    
T  25608249 tgttgattatgattgatgtgaagcttaccc--agtggatctgtcatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcaagattagtttgct 25608152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25293958 - 25293854
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  25293958 ataacaatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatg-aatccttgaatacttatatttgtttatgttgattatgat 25293860  T
Q  131 tgatgt 136  Q
    ||||||    
T  25293859 tgatgt 25293854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25755947 - 25755843
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  25755947 ataacaatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatg-aatccttgaatacttatatttgtttatgttgattatgat 25755849  T
Q  131 tgatgt 136  Q
    ||||||    
T  25755848 tgatgt 25755843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22884111 - 22884015
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagttt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  22884111 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggttttgactgcctacctgtttgtatgaatgggtagacagagtgcaggagtagttt 22884015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23350575 - 23350246
Alignment:
Q  36 aatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttt----atgttgattatgatt 131  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||| || |||||| |||||||||   |||||||||||    |||||||||||||||    
T  23350575 aatcatgtgatgttagtattttaggagggatgtgtatgtatatgtgttatccatgaagtccttgaatgcttatgtttgttttcatatgttgattatgatt 23350476  T
Q  132 gatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgag 231  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||    |||||||| |||||  |    
T  23350475 gatgtgaagcttacccccaatgcttttgagcgcctacct-tttttatgaatgggtagacggtgtgcaggagtagtttgc----ttggtgag-tgctt--g 23350384  T
Q  232 gatagcgggagcttcctctgtt----tatcagttagagtcttagattaggctctga-ttagg-tgtcagcctttatgatattctggatttgtttaagtta 325  Q
    |||| ||| ||||  ||| |||    | || ||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||   |  ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  23350383 gataacggaagctatctccgttatcgtttctgtt-gagtcttagagtaggctctgatttaggatgtctatccgtatgatattatggatttatttatgtta 23350285  T
Q  326 tagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 364  Q
    | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23350284 tggagattttgcccatttgttgggttttggagattttat 23350246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 45561439 - 45561643
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta---tgttgattat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||   ||||||||||||   | ||||||||    
T  45561439 ataataatcatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcttatgtttgtttattttattgattat 45561537  T
Q  128 gattgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtga 221  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||| |      | |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || || ||||||  ||||||||    
T  45561538 gattaatgcgaagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattaatttgct--tttggtga 45561635  T
Q  222 gttgcttg 229  Q
    ||||||||    
T  45561636 gttgcttg 45561643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17500181 - 17500107
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  17500181 tgattatgtttgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagt 17500107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 22499136 - 22499242
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||  ||||||    
T  22499136 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatg-gtagacgaagtgcaggattagtttgct--tttggt 22499232  T
Q  220 gagttgcttg 229  Q
     |||||||||    
T  22499233 tagttgcttg 22499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 23118675 - 23118802
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgct 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  23118675 tgtttatgtggattatgattgatgtaaaagttacccccagtggttttgaccgcctacttgtccgtatggatgagtagacgaagtgcaggattag-ttgct 23118773  T
Q  212 tatttggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
      |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23118774 --tttggtgagttgctt--ggatagcgggagct 23118802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24906268 - 24906157
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggtttt-gaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtg 220  Q
    |||| |||||||||| || |||||||  ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||    
T  24906268 gattctgattgatgtaaatcttacccccagtggtttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgc--atttggtg 24906171  T
Q  221 agttgcttgaggat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  24906170 agttgcttggggat 24906157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Original strand, 18263246 - 18263323
Alignment:
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  18263246 tgttgattatgattgatgtatagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 18263323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22311433 - 22311364
Alignment:
Q  78 tgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccc 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22311433 tgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattaatgtaaagcttaccc 22311364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15931668 - 15931589
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  15931668 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctatatggatcagtagacg 15931589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16000497 - 16000406
Alignment:
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  16000497 tgttgattatgattgatgtgaagcttatttccagtggtttcaaccgcctacctgtttgtatgaatgtgtagacggagtgcaggagtagtttg 16000406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33170600 - 33170517
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||    
T  33170600 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacgccaagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgggtagacgaagt 33170517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23835567 - 23835490
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  23835567 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagacg 23835490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11542387 - 11542327
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatat 78  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11542387 tatggaatgggggataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatat 11542327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 23229128 - 23229204
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  23229128 tttatgtggattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtgtgtatggatgggtagacg 23229204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 284
Target Start/End: Original strand, 39116233 - 39116298
Alignment:
Q  219 tgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgat 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||  || ||||||||    
T  39116233 tgagttgcttgaggatagcggaagcttcctctgtttattgtttagagtcttagtatatgctctgat 39116298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21695919 - 21695844
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  21695919 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacg 21695844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7468633 - 7468546
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||     ||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  7468633 ttgattatgattgatgtaaagcttacctcccatggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagattagtt 7468546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17283574 - 17283500
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17283574 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagac 17283500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20708128 - 20708053
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  20708128 ttgattatgattgatgtagagcttactcccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 20708053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24266332 - 24266257
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| |||  ||||||||||    
T  24266332 ttgactatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatggatagacgaagt 24266257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 24554408 - 24554483
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  24554408 ttgattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttaaccgcttacctttctgtatggatgggtagacgaagt 24554483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38531877 - 38531826
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  38531877 cttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacga 38531826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29296220 - 29296141
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||  || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||    
T  29296220 tgtttatgtggagcattattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 29296141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11542301 - 11542220
Alignment:
Q  130 ttgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | | |||| ||| |||||| |||| || || ||||||||||    
T  11542301 ttgatgtgaagcttacccc-agtggtttcgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacaaagtgcatgattagtttgctt 11542220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Original strand, 18769996 - 18770046
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  18769996 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgtgtagacg 18770046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 207
Target Start/End: Original strand, 21200021 - 21200079
Alignment:
Q  149 tagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  21200021 tagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgatgtgcaagattagtt 21200079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 23154446 - 23154516
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||||    
T  23154446 tgattatgtttgatgtaatgcttatccctagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacg 23154516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5851835 - 5851767
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtaga 189  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||    
T  5851835 ttgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtaga 5851767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 17731367 - 17731442
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17731367 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgactacctatctgtatggatgtgtagacg 17731442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20479913 - 20479838
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  20479913 ttattttgattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20479838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 21233864 - 21233939
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacct-atttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||    
T  21233864 ttgattacgattgatgtaaaacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttttgtatggatgggtagatgaagt 21233939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22883965 - 22883937
Alignment:
Q  260 ttagagtcttagattaggctctgattagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883965 ttagagtcttagattaggctctgattagg 22883937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5418
Alignment:
Q  74 tatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggtttt-----gaccgcctac 168  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| |      ||||||||||    
T  5717 tatatgtgttatgaatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagttaacccccagtggtgtatggtggaccgcctac 5618  T
Q  169 ctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg----cttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttaga 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || || || |||||||    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5617 ctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgattagtttgtttgcttgcttggtgagttgcttgaggatagcaggagcttcctctgtttatcagttaga 5518  T
Q  265 gtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 364  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||| ||  | | || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5517 gtcttatattaggctctaattaggtgtcaatc-ttatgatattctggattt-attatgtgttggagaatttgcccatttgtcgggttttagagattttat 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2706 - 2561
Alignment:
Q  219 tgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatttgtt 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||    
T  2706 tgagttgcttaaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagtctttattatattcaggatttatt 2607  T
Q  319 taagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 364  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2606 tatgttatggagattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51656 - 51577
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  51656 tgtttatgtgaattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacg 51577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 374
Target Start/End: Original strand, 14182149 - 14182501
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14182149 ataataatcatgtgatgttagtattctaggagggatgagtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgat 14182248  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg- 229  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||  || |||||||||||||     
T  14182249 tgatgtgaagctaacccccaatggttttgaccgcctatctgtttgtatgaatgggtagacgaagtatagggttagtttcct--ttcggtgagttgcttgg 14182346  T
Q  230 --------aggatagcgggagct-tcctctgtttatcag---ttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggatttgt 317  Q
             ||||||| ||||||   ||| | ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  14182347 tgattgcttggatagcaggagctaatctccg-ttatcggtgtttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagtc-ttatgagattatggatttgt 14182444  T
Q  318 ttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatatattgatat 374  Q
    ||| ||||| | ||||||||| || | |||||||||| |||||| || |||||||||    
T  14182445 ttatgttatggagattttgcccatatctcgggttttgaagatttcatgtattgatat 14182501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17391408 - 17391227
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  17391408 ataataatcatgtgatgttagtattctaggaaggatgagtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttaatgttgattatgat 17391309  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  17391308 tgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgagtagtttgctt 17391227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 216 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14890107 - 14889959
Alignment:
Q  216 tggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgtcagcctttatgatattctggattt 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14890107 tggtgagtttcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatctgttagagtcttagattaggctctaattaggtgtcagtctttatgatattatggattt 14890008  T
Q  316 gtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttat 364  Q
     |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14890007 ttttatgttatggagattttgcccatttgtcgggttttggagattttat 14889959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 25106095 - 25106275
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  25106095 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgat 25106193  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  25106194 tgatgtgaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtttgtgtgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgctt 25106275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15988956 - 15988776
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15988956 ataataatcttgtgattatagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgtttatatttgcttatgttgattatgat 15988858  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  15988857 tgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctt 15988776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8602706 - 8602526
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8602706 ataataatcatatgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgat 8602608  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || |||| |||||    
T  8602607 tgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtctgctt 8602526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 37918655 - 37918820
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttct-atgtttgtttatgttgattatga 129  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  37918655 ataataatcatgtgatgctggtattttaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaattattgaaatgcttatgtttgtttatgttgattatga 37918754  T
Q  130 ttgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  37918755 ttgatgtaaagcttacccccagtggtttcgaccgcctaccagtttgtatgaatgggtaaacgaagt 37918820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 15551643 - 15551759
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15551643 ataataatcatgtgatgttattattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgat 15551742  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  15551743 tgatgtgaagcttaccc 15551759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 17760551 - 17760752
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17760551 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgttcatgttgattatgat 17760649  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagtt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |      | |||||  |||||||||||||||||| |||||||  || || || |||||||  | |||||||||||    
T  17760650 tgatgtgaagcttacccctagtggatctgtgatggaccggttacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttg--tttttggtgagtt 17760747  T
Q  225 gcttg 229  Q
    |||||    
T  17760748 gcttg 17760752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Original strand, 19061871 - 19062072
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19061871 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgatatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgttcatgttgattatgat 19061969  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagtt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |      | |||||  |||||||||||||||||| |||||||  || || || |||||||  | |||||||||||    
T  19061970 tgatgtgaagcttacccctagtggatctgtgatggaccggttacctatttgtatgaatgggtagacggcgtgcaggattagtttg--tttttggtgagtt 19062067  T
Q  225 gcttg 229  Q
    |||||    
T  19062068 gcttg 19062072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 191
Target Start/End: Original strand, 6817384 - 6817546
Alignment:
Q  34 ataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattga 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6817384 ataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgctatgcat-aaatccttgaatgcctatgtttatttatgttgattatgattga 6817482  T
Q  134 tgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||||| |||||| |      | |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6817483 tgtgaagcttacccctagtggatctttgatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacg 6817546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 230
Target Start/End: Original strand, 5230400 - 5230550
Alignment:
Q  78 tgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgta 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5230400 tgtgtgatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttacccgtagtggttttgaccgcctacctgtttgta 5230499  T
Q  178 tgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttga 230  Q
    || | | |||||| |||| || || |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  5230500 tggaagggtagacaaagtgcaggattagtttgct--tttggtgagtggcttga 5230550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 38378016 - 38378232
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  38378016 tatggaatgggggataataatcatgtcatgttagtattgtaggagggatgtttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttta 38378115  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttg 217  Q
    |||||||||||||      |||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||  ||||    
T  38378116 tgttgattatgat-----agaagcttatccccagtggttttgaccgcctacccgtttgtatgaatgagtagacggagtgcaggagtggttagct--tttg 38378208  T
Q  218 gtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  38378209 gtgag-tgctt--ggatagcgggagct 38378232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 31414393 - 31414508
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  31414393 ataataatcatgtgatgctagtattctacgagggatggttatgtatatgtgttatgcatg-aattcttgcatgtttatgtttgtttatgttgattatgat 31414491  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc 147  Q
    |||||| ||||||||||    
T  31414492 tgatgtaaagcttaccc 31414508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 40041355 - 40041502
Alignment:
Q  64 gatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatt-tctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagctta-cccttagtggttttgac 161  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||     
T  40041355 gatggttatgtatgtgtgttatgcatgaaatccttgaaatgtttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccccccagtggttttgag 40041454  T
Q  162 cgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg 209  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||    
T  40041455 cgcctacttgtttgtatgaatgggtagaccgagtgcaggagtagtttg 40041502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10902805 - 10902677
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | || |||||||||||    
T  10902805 ttgtttatgttgattatgattgatatgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggaatgcaggagtagtttgc 10902706  T
Q  211 ttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    |  ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  10902705 t--tttggtgag-tgctt--ggatagcgggagct 10902677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14968167 - 14967991
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagttt---- 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||  | ||||  | |        
T  14968167 tttatgttgattatgattgatgtgaaactaacccccagtggtctttgaccgtctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgtaggagtgatctttta 14968068  T
Q  209 gcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcag-ttagagtcttagattaggctctgat 284  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  14968067 gcttgtttggtgagttgctcgaggatagcaggagcttcctctgtttatctgtttagagtcttagaataggctctgat 14967991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 38813153 - 38813275
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  38813153 ataacaatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgcatg-aatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgat 38813251  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtgg 154  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||    
T  38813252 tgatgtaatacttacccctagtgg 38813275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41659951 - 41659868
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  41659951 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 41659868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12950986 - 12950893
Alignment:
Q  42 gtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgt 136  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12950986 gtgatgctagtattctaggatggatggttatgtatatgggttatgcatg-aatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgattgatgt 12950893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 208
Target Start/End: Original strand, 11517291 - 11517383
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagttt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11517291 ttatgttgattatgattgatgtgaagctaaccccaa-tgattttgaccgcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgagtagttt 11517383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 43429368 - 43429476
Alignment:
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttg 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||  ||| |||||||||||||| || ||| |||||  ||||    
T  43429368 tgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatagatgggtagacgaagtacaggattag-ttgct--tttg 43429464  T
Q  218 gtgagttgcttg 229  Q
    ||||||||||||    
T  43429465 gtgagttgcttg 43429476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 6230494 - 6230569
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  6230494 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 6230569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 14819681 - 14819756
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  14819681 ttgattatgattgatgtaaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagt 14819756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 17320410 - 17320485
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  17320410 ttgattatgattgatgtaaagcttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 17320485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18968418 - 18968349
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatga 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  18968418 ttatattgattatgattgatgtgaatcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatga 18968349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 24901769 - 24901863
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt---ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||   ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24901769 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacgacgtgcatgaatagtttgttgcttgcttggtgag-tgcttgaggatagcgggagctacctc 24901863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Original strand, 4164081 - 4164160
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaag 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4164081 ttgattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaag 4164160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 5230324 - 5230388
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgt 82  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5230324 tatggaatgggggataataatcatgtgatgctagtattctagaagggatggttatatatatgtgt 5230388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Original strand, 33371202 - 33371273
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  33371202 ttgattatgattgatgtaaagcttaccaccagtggttttgaccgcctaccggtctgtatggatgagtagacg 33371273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11636846 - 11636798
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctac 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11636846 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctac 11636798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11822683 - 11822588
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt----ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || |||||||    || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11822683 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtagaaggcgtgcaggagtagttttgtttcttgcttggtgag-tgcttgaggatagcgggagcttcctc 11822588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12020267 - 12020188
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  12020267 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 12020188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17202982 - 17202903
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  17202982 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 17202903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 4147531 - 4147603
Alignment:
Q  123 attatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||    
T  4147531 attatgattcttgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgaagt 4147603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 11199395 - 11199470
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  11199395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacg 11199470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34558211 - 34558132
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||    
T  34558211 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcccacctttctgtatggatgggtagacg 34558132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7254497 - 7254467
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7254497 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagta 7254467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Original strand, 14523258 - 14523331
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtaga 189  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  14523258 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 14523331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40937938 - 40937888
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  40937938 cttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 40937888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4655338 - 4655297
Alignment:
Q  207 ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcct 248  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4655338 ttgcttgtttggtgagttgcatgaggatagcaggagcttcct 4655297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Original strand, 18008979 - 18009024
Alignment:
Q  146 ccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  18008979 ccttagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgtatgggtagacg 18009024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20419053 - 20418962
Alignment:
Q  159 gaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt--ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || || ||||  || |||  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20419053 gaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacggcgtccatgaatagttgttacttgcttggtgag-tgctcgaggatagcgggagctacctc 20418962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 253
Target Start/End: Original strand, 31416123 - 31416215
Alignment:
Q  155 ttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtt 253  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  31416123 ttttgactgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcatgattag-ttgc---tttggtgagttgctt--ggatagcgggagctatctctgtt 31416215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 14061090 - 14061165
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  14061090 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgactacctgtctgtatggatgggtagacg 14061165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15548848 - 15548773
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  15548848 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 15548773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39654183 - 39654108
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  39654183 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 39654108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 54365826 - 54366025
Alignment:
Q  28 ggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattat 127  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  54365826 ggaataataatcatgtgatgttagtattctaggaggggtgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattat 54365925  T
Q  128 gattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgct 227  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||  ||||||||||||||    
T  54365926 gaatgatgtgaagcttaccccaagtggttttgacagcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattaatttgct--tttggtgagttgct 54366023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 230
Target Start/End: Original strand, 5372868 - 5373070
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5372868 ataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgat 5372967  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc--ttag---tggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttg 225  Q
    |||||||||||||||||   |||   ||   | |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || || || |||||||||  ||||||||||||    
T  5372968 tgatgtgaagcttaccccagtagatatgtgatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgactagtttgct--tttggtgagttg 5373065  T
Q  226 cttga 230  Q
    |||||    
T  5373066 cttga 5373070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 225
Target Start/End: Original strand, 41919030 - 41919182
Alignment:
Q  70 tatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacc 169  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41919030 tatatatatatgtcatgcatgatatccttgaatgcttgtgtttgtttatgttgattttgattgatgtaaagcttaccc-cagtggttttgaccgcctacc 41919128  T
Q  170 tatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttg 225  Q
    | | |||||| ||||||||||||||| || || || ||||||  ||||||||||||    
T  41919129 tgtctgtatggatgagtagacgaagtgcaggattaatttgct--tttggtgagttg 41919182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 12136091 - 12136238
Alignment:
Q  80 tgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatg 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  12136091 tgtcatgcatgaaatcctagaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaaggttaccaccaatggtttcgaccgcctacctgtctgtatg 12136190  T
Q  180 aatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg 229  Q
     ||| ||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  12136191 gatgggtagacgaagtgcaggattagtttgct--tttggtgagttgcttg 12136238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 15215988 - 15216110
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  15215988 ataataatcatgtgatgctagtattttaggagggatgtttatgtatatgtgttatgtatgaaatccttgaatgcttatg-ttgtttacgttgattatgat 15216086  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtgg 154  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  15216087 tgatgtgaagcttacacctagtgg 15216110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 366
Target Start/End: Original strand, 19082781 - 19083041
Alignment:
Q  111 ttgtttatgtt-gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt-- 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  || |||||||      
T  19082781 ttgtttatgtttgattatgattgatgtgaagctaactccgagtggtctttgaccgcctacctatttgtatgaacaggtagacgacgcgcatgagtagttg 19082880  T
Q  207 ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatc--agttagagtcttagattaggctctgattagg-tgtcagcctttatga 303  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||  ||    || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  19082881 ttgctagcttggtgag-tgcttgaggatagcgggagctatctccgttattcgtttttggagtcttagattaggctctgattaggatgtcagtctttatgt 19082979  T
Q  304 tattctggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatat 366  Q
    ||| ||||||||  ||| ||| | | |||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  19082980 tatgctggattt-attatgttgttgagattttacgcatatgtcgggatttggagattttatat 19083041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9650270 - 9650155
Alignment:
Q  33 aataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatg-ttgattatgatt 131  Q
    |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9650270 aatattcatgtgatgttaatattctaagagggatggttatgtatacgtgtcatgcatgaaatccttgagtgtttatgattgtttatgtttgattatgatt 9650171  T
Q  132 gatgtgaagcttaccc 147  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  9650170 gatgtcaagctaaccc 9650155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24237233 - 24237135
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  24237233 tttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagttgttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacgtggtgcagaagtagtttgctt 24237135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12732514 - 12732393
Alignment:
Q  117 atgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttattt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||    
T  12732514 atgtcgattatgattgatgtgaaacttacccc-agtgattttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacggagtgcaggagtagtttgct--ttt 12732418  T
Q  217 ggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12732417 ggtgag-tgctt--ggatagcgggagct 12732393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Original strand, 50223991 - 50224074
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  50223991 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 50224074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Original strand, 19623872 - 19623949
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtaga 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  19623872 tgtttatgttgattatgatttatgtgaagctaacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtaga 19623949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 17378031 - 17378136
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtga 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |  || |||||||||  || |||||    
T  17378031 gattatgattgatgtgaaacttacccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatcaatgggtagacgaagtgcgggattagtttgct--ttcggtga 17378128  T
Q  222 gttgcttg 229  Q
    ||||||||    
T  17378129 gttgcttg 17378136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 284
Target Start/End: Original strand, 17213700 - 17213868
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctta 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| || || ||| ||||||     
T  17213700 tttatggtgattatgattgatgtgaagctaatccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatggatagacagagtgcaggattag-ttgctt- 17213797  T
Q  214 tttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagtt-agagtcttagattaggctctgat 284  Q
     |||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||| ||| || ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17213798 gttggtgag-tgctcggggatagagggagctacctctatttttctgttcaatgtcttagattaggctctgat 17213868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 13595864 - 13595967
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||  | || |||||||||  ||||||    
T  13595864 ttgattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctacc----tgtatggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgct--tttggt 13595957  T
Q  220 gagttgcttg 229  Q
    ||||||||||    
T  13595958 gagttgcttg 13595967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5407484 - 5407412
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||    
T  5407484 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgagtagacga 5407412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 10239268 - 10239360
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt 206  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  10239268 tttatgtggattatgattgttgtaaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcaagattagt 10239360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38763112 - 38763040
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  38763112 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 38763040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 15116045 - 15116148
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15116045 ataacaatcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtttatgtgttatgcatg-attccttgaatgcttatatttg-ttatgttgattatgat 15116142  T
Q  131 tgatgt 136  Q
    ||||||    
T  15116143 tgatgt 15116148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 47470166 - 47470282
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctta--cccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | | |||||| ||| ||||||||||| || || ||| |||    
T  47470166 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccctagtggttttgaccacctacttgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattag-ttg 47470264  T
Q  210 cttatttggtgagttgcttg 229  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  47470265 ct--tttggtgagttgcttg 47470282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19557671 - 19557597
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||    
T  19557671 ttgattatgtttgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtcagtatggatg-gtagacgaagt 19557597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 7187767 - 7187837
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  7187767 tgattatgtttgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 7187837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Original strand, 12246069 - 12246147
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  12246069 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccctcggtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 12246147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Original strand, 41258177 - 41258234
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacct 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41258177 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccc-cagtggttttgaccgcctacct 41258234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42707050 - 42706970
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||| || | |||||| ||| |||||||    
T  42707050 ttgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgactatctgtctgtatggatgggtagacg 42706970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 13448875 - 13448949
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||    
T  13448875 ttgattatgattgatgtaaagcttaccc-tattgattttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgaagt 13448949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14569751 - 14569666
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggtttt-----gaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |      ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14569751 ttgtttttgttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacg 14569666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 191
Target Start/End: Original strand, 18496321 - 18496389
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  18496321 gattatgat-gatgtgatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 18496389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9650078 - 9650007
Alignment:
Q  215 ttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcag--ttagagtcttagattaggctctgat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||||||    
T  9650078 ttggtgagttgcttgaggatagcatgatcttcctctgtttatttgttttagagtcttagcataggctctgat 9650007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 41918924 - 41918976
Alignment:
Q  26 gaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatat 78  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41918924 gagggatattaatcatgtgatgctagtattctagaagggatggttatatatat 41918976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Original strand, 7966435 - 7966506
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  7966435 ttgattatgattgatgtaatgattacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 7966506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Original strand, 20813895 - 20813945
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  20813895 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 20813945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Original strand, 30236416 - 30236466
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  30236416 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 30236466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 12135982 - 12136042
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatat 78  Q
    ||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  12135982 tatggaatgggggataataatcatctgatgctagtattctacaagggattgttatatatat 12136042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 191
Target Start/End: Original strand, 37958913 - 37958953
Alignment:
Q  151 gtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  37958913 gtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 37958953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 13135 - 13299
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13135 ataataatcttgtgatgatagtattctaggaggcatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgat 13234  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  13235 tgatgtgaagcttacccatagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgaagt 13299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19758 - 19564
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttg-aatttctatgtttgttt 116  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  19758 tatggaatgtgggataataatcatgtgatgctagtactctaggagggatggttatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaaatgtttatgtttgttt 19659  T
Q  117 atgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  19658 atgttgattatgattgatgtgaagctta-acatagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgtgtagacggagtgcagtagtagtttgctt 19564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33395304 - 33395152
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  33395304 tatggaatgggggataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatacatgtgttatgcatgaaatctttgaatgcttatgtttgttta 33395205  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacct 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33395204 tgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacct 33395152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20192154 - 20191974
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20192154 ataataatcatgtgatgttagtattctaggaggaatggttatgtatatgtgttatgcatgaa-tctttgaatgcttatatttgtttatgttgatcatgat 20192056  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||    
T  20192055 tgatgtgaagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgtaggagtagtttgctt 20191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 78277 - 78455
Alignment:
Q  49 tagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccct 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||     
T  78277 tagtattctaggagggatggttatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttatccc 78376  T
Q  149 tagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttg 229  Q
    ||||| ||| | |||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  78377 tagtgttttcggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgactagtttgct--tttggtgagttgcttg 78455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20820861 - 20820662
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||          |||||    
T  20820861 tatggaatgggggataataatcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaat----------gttta 20820772  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||  | |||||||  | ||||    
T  20820771 tgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggttgacgaagtgcagaattagtttg--tttttg 20820674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25093186 - 25093058
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||    
T  25093186 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgccaacctgtttgtatgaatggatagacggagtgcaggagtagtttgc 25093087  T
Q  211 ttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    |  ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  25093086 t--tttggtgag-tgctt--ggatagcgggagct 25093058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40555713 - 40555629
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  40555713 ttgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 40555629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 40438121 - 40438228
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||| || || |||||||||  ||||||    
T  40438121 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtccgtatggatgggtagacggagtgcatgattagtttgct--tttggt 40438218  T
Q  220 gagttgcttg 229  Q
    ||||||||||    
T  40438219 gagttgcttg 40438228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 5472220 - 5472303
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||    
T  5472220 ttgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccc-cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggatagacgaagt 5472303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17607267 - 17607189
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  17607267 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttaccca-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacg 17607189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46144101 - 46144051
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46144101 ttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacct 46144051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52397997 - 52397924
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||    
T  52397997 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgccgacctgtctgtatggatgggtagacgaa 52397924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21193505 - 21193445
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctat 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21193505 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctat 21193445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Original strand, 41213496 - 41213578
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  41213496 tgtttatctggattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggtttggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 41213578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 49999184 - 49999259
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  49999184 ttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 49999259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Original strand, 5770042 - 5770115
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  5770042 tgattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 5770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Original strand, 37235787 - 37235865
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  37235787 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 37235865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18164511 - 18164438
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttaccct-tagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  18164511 ttgattatgattgatgtaaaacttaccccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 18164438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29217431 - 29217355
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttaccctt-agtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||    
T  29217431 ttgattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgaagt 29217355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21042119 - 21042046
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||    
T  21042119 tgattatgtttgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgaagt 21042046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16243971 - 16243914
Alignment:
Q  215 ttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagtt--agagtcttag 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  16243971 ttggtgagt-gcttgaggatagcgggagcttcctctatttatctgtttcagagtcttag 16243914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17021896 - 17021821
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  17021896 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtctgcctacctgtctgtatggatgggtagac 17021821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33384220 - 33384157
Alignment:
Q  165 ctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttga 230  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33384220 ctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagactagtttgct--tttggtgagttgcttga 33384157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 256531 - 256703
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  256531 tatggaatgggggataataatcatgtgaagttagtattctaggagggatggttatgtatatgtgttatgtatgaaatccttgaatgcttatgtttgttta 256630  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||| |||||||    
T  256631 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtgg-tttgaccgcctacctgtttggattaatgggtagacg 256703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Original strand, 98797 - 98887
Alignment:
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagttt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||    
T  98797 tgttgattatgattgatgtgaagcttaacccctgtggtttcgaccgcctacttgtttgtatgaatgggtagacagagtagatgagtagttt 98887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Original strand, 20456313 - 20456512
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20456313 ataataatcatgtgatgctagtattataggagggatggttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttatgttgattatgat 20456412  T
Q  131 tgatgtgaagcttaccc-ttag---tggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgc 226  Q
    |||||||||||||||||  |||   ||   | |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || || || |||||||||  |||||||||||||    
T  20456413 tgatgtgaagcttacccactagatctgtgatggaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggcgtgcatgactagtttgct--tttggtgagttgc 20456510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11964031 - 11963830
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11964031 ataataatcatgtgatgctagtagtctaggagggatgattatgtatatatgttatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgat 11963933  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggtt------ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagtt 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |      | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||  || || || |||||||||  |||||||||||    
T  11963932 tgatgtgaagcttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtttgtatgacttagtagacggggtgcaggattagtttgct--tttggtgagtt 11963835  T
Q  225 gcttg 229  Q
    |||||    
T  11963834 gcttg 11963830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 14345408 - 14345521
Alignment:
Q  33 aataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattg 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14345408 aataatcatgtgatgctagtattctaggagggatgattatgtatatgtgttatgcatgaa-tcctttaatgtctatgtttgtttatgttgattatgatta 14345506  T
Q  133 atgtgaagcttaccc 147  Q
    |||||||||||||||    
T  14345507 atgtgaagcttaccc 14345521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19872264 - 19872149
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| || || ||| ||||    
T  19872264 ttgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagttgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattag-ttgc 19872166  T
Q  211 ttatttggtgagttgcttg 229  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  19872165 t--tttggtgagttgcttg 19872149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Original strand, 16837563 - 16837710
Alignment:
Q  92 aatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  16837563 aatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattataattgatgtaaagtttactcccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacg 16837662  T
Q  192 aagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    |||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16837663 aagtgcaggagtagtttgct--tttggtgag-tgctt--ggatagcgggagct 16837710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Original strand, 5453047 - 5453151
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  5453047 ataacaatcatgtgatgctagtattctcggagggatggttatgtatatgtcttatgcatg-aatccttgaatgcttatatttgtttatgttgattatgat 5453145  T
Q  131 tgatgt 136  Q
    ||||||    
T  5453146 tgatgt 5453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 24227680 - 24227798
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta---tgttgattat 127  Q
    |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||   ||||||||||||   | ||||||||    
T  24227680 ataataataatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatgtgctatgcatg-aatccttgaatgcatatgtttgtttattttattgattat 24227778  T
Q  128 gattgatgtgaagcttaccc 147  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24227779 gattgatgtgaagcttaccc 24227798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 3420666 - 3420741
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  3420666 ttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgaagt 3420741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 291
Target Start/End: Original strand, 37482952 - 37483025
Alignment:
Q  218 gtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctctgattaggtgt 291  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37482952 gtgagtttcttgaggatggagggggcttcctctgtttatcagttagagtcttagattaggctatgattacgtgt 37483025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Original strand, 11765494 - 11765565
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaat 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11765494 ataataatcatgtgatgctagtattataggagggattgttatgtatatgtgttatgcatgaaatccttgaat 11765565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 26561621 - 26561696
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  26561621 ttgattatgattgatgtaaagcttaccctcagtggatttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 26561696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 209
Target Start/End: Original strand, 33628106 - 33628193
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttg 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||    
T  33628106 gattatgattgatgtaaagcttatcttcagtggttttgaccgtctacctatttgtataaatgggtagacgaagtgcaggattagtttg 33628193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 11765570 - 11765659
Alignment:
Q  133 atgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagt 223  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11765570 atgtgaagctaatccccagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtagatggagtgcaggagtagtttgctt-tttggtgagt 11765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29912385 - 29912307
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtaca 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29912385 ttgattatgattgatgtaaagcttacccctagtggtttggaccatctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtaca 29912307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24082450 - 24082377
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  24082450 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgactgcctacctatctgtatggatgggtagatgaagt 24082377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 37189945 - 37190021
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  37189945 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 37190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13793482 - 13793415
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatg 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13793482 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatg 13793415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21615353 - 21615275
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||    
T  21615353 tgtttatgttgattatgattgatgtaatacttaccc-cagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 21615275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Original strand, 23236240 - 23236317
Alignment:
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||  || ||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  23236240 tgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttagccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 23236317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23412294 - 23412262
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23412294 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctta 23412262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23453204 - 23453129
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  23453204 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 23453129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23460448 - 23460373
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  23460448 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 23460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23464709 - 23464634
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  23464709 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 23464634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3671883 - 3671836
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatat 78  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3671883 ataacaatcatgtgatgctagtattctaggatggatggttatatatat 3671836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21392427 - 21392377
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  21392427 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 21392377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 36938 - 37118
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||  |  ||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  36938 ataataatcatgtgatgttagtattctagaaatgatgggtaggtatatgtgttatgcatgagatccttgaatgcttat-tttgtttatgttgattatgat 37036  T
Q  131 tgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  37037 tgatgtgaagcttacccccagtagttttgaccgcctgcctatttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtttgctt 37118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 6880 - 6997
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttat---gttgattat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||    
T  6880 ataataatcatgtgatgctagtattttaggagggatggttatgtatatatactatgcatg-aatccttgaatgcctatgtttgtttatttcattgattat 6978  T
Q  128 gattgatgtgaagcttacc 146  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  6979 gattgatgtaaagcttacc 6997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 22897 - 23048
Alignment:
Q  43 tgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagct 142  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22897 tgatgctagtattctaggagagatggttatgtatatgtgctatgcatgaa-tccttgaatgcatatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaagct 22995  T
Q  143 tacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||    
T  22996 tacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatgaatgggtagacgaagt 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11706 - 11565
Alignment:
Q  70 tatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacc 169  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  11706 tatatatatatgttatgcatgaaatccttgaatgt-tatgtttgtttatgttgattatgattgatgtaaaactaacccctagtggttttgaccgcctacc 11608  T
Q  170 tatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    | |||||||||||| ||||||| | |  | |||||||||||||    
T  11607 tgtttgtatgaatgggtagacggattgtaggagtagtttgctt 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55781 - 55681
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgct 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  55781 tgtttatgtggattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtttctatgaatgagtagacgaagtgcaggagtagtttgct 55682  T
Q  212 t 212  Q
    |    
T  55681 t 55681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 121709 - 121903
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||   |||| |||||||    
T  121709 tatggaatgggggataataatcatgtgatgttagtattctaggagggacgggtatgtatatgtgctatgtatgaaattcttgaatgcttatgattgttta 121808  T
Q  118 tgtt-gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||    
T  121809 tatttgattatgattgatgtgaagctaaccca-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagaaggagtgcaggaatagtttgctt 121903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Original strand, 15077 - 15247
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgttta 117  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15077 tatggaatgggggataataatcatgtgatgttagtattctaggagggatgggtatgtatatatgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgttta 15176  T
Q  118 tgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-----tttgaccgcctacctatttgtatgaatg 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||      | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15177 tgttgattatgatttatgtgaagctaacccccagtggtctgtgatggaccgcctacctatttatatgaatg 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Original strand, 15705 - 15778
Alignment:
Q  119 gttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15705 gttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacg 15778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Original strand, 3198 - 3304
Alignment:
Q  31 ataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgat 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  3198 ataataatcacgtgagactagtattctaggagggatggttatgtatatttgttatgcatgaaatccttgaatgcttatgtttgtttattttgattatgat 3297  T
Q  131 tgatgtg 137  Q
    |||||||    
T  3298 tgatgtg 3304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1923 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1923
Description:

Target: scaffold1923; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 799 - 646
Alignment:
Q  42 gtgatgctagtattctaagagggatggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttat-gttgattatgattgatgtgaag 140  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  799 gtgatgttaatattctcagagggatggttatgcatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatgtttatggttgtttatatttgattatgattgatgtgaag 700  T
Q  141 cttacccttagtggt-----tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtaga 189  Q
     | ||||| ||||||      | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  699 ataaccctcagtggtctgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtaga 646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 45432 - 45530
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  45432 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccggtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaataggtagacggagtgcatgagtagtttgctt 45530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10650 - 10481
Alignment:
Q  75 atatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttg------accgcctac 168  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||      |||||||||    
T  10650 atatgtgttatgcatgaa-tccttgaatgcctatgtttgtttatgttgattatgattgatgtgaaacttacccccagtggatctgtgatgaaccgcctac 10552  T
Q  169 ctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  10551 ctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcaggagtagtatgct--tttggtgag-tgctt--ggatagcgggagct 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 84757 - 84631
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgct 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||| || || ||| ||||     
T  84757 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccctaagtggttttgaccgcctacccgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattag-ttgc- 84660  T
Q  212 tatttggtgagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
      |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  84659 --tttggtgagttgctt--ggatagcgggagct 84631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25901 - 25821
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||    
T  25901 tgtttatgtggattatgattgatataaatcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacga 25821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Original strand, 40290 - 40381
Alignment:
Q  65 atggttatatatatgtgtcatgcatgaaatccttgaatttctatgtttgtttatg-ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40290 atggttatgtatatgtgtcatgcatgaaatcctataatgtttatgattgtttatgtttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggt 40381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4545
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt--t 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||||  |    
T  4803 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagttaacccccagtgttctttgactgcctatctatttgtatgaatgggtagacgacgtgtaggggtagttgt 4704  T
Q  208 tgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctctgtttatc-agttagagtcttagattaggctctgattagg-tgtcagcctttatgata 305  Q
    ||||   ||| |||| | |||||||||||||||||||  ||| |||  ||   || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||    
T  4703 tgctagcttgttgag-tacttgaggatagcgggagctatctccgttattcgttttggagtcttagattaggctctgattaggatgtcagtctctatgtta 4605  T
Q  306 ttctggatttgtttaagttatagggattttgcctatttgtcgggttttggagattttatat 366  Q
    | || |||||| ||| | | | | |||||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  4604 tgctagatttg-ttatgctgttgagattttacccatatgtcgggatttggagattttatat 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 212
Target Start/End: Original strand, 4600 - 4691
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgctt 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||| || |||||||||||||    
T  4600 ttgattatgatttatgtgaagcttacacc-agtggttttgaccacctacctatttgtatgaattggtagacagagtgcaggagtagtttgctt 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4289 - 4193
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagttt 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||    
T  4289 tgtttatgatgattatgattgatgtaaagctaacccccagtggttctgactgcctacctgtttgtatgaatgggtaaacggagtgcaggagtagttt 4193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1585 - 1514
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  1585 ttgattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6066 - 5991
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  6066 ttgattatgattgatgtaaatcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 5991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 25805 - 25879
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  25805 ttgattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttggtatggatgggtagacgaagt 25879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36235 - 36160
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||    
T  36235 ttgattatgattgatgtaaagcttactctcagtggttttgaccgcctacatttctgtatggatgggtagacgaagt 36160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29448 - 29381
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatg 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29448 tgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatg 29381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 8835 - 8775
Alignment:
Q  18 tatggaacgaggaataataatcacgtgatgctagtattctaagagggatggttatatatat 78  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8835 tatggaatgggggataataatcatgtgatgctagtattctaggagggatggttatatatat 8775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Original strand, 19652 - 19720
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||    
T  19652 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtagac 19720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 190
Target Start/End: Original strand, 29228 - 29296
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||    
T  29228 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtagac 29296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9896 - 9821
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  9896 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 9821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 244
Target Start/End: Original strand, 1813 - 1930
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtttgcttatttggt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| || || ||| ||||   ||||||    
T  1813 ttgattatgattgatgtaaagtttacccc-agaggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgaagtgcaggattag-ttgc---tttggt 1907  T
Q  220 gagttgcttgaggatagcgggagct 244  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  1908 gagttgctt--ggatagcgggagct 1930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 6725 - 6800
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  6725 ttgattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 6800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 3543 - 3618
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||    
T  3543 ttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagt 3618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 130214 - 130146
Alignment:
Q  122 gattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  130214 gattatgattgatgtaaagcttaccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 130146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 207
Target Start/End: Original strand, 114164 - 114221
Alignment:
Q  150 agtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||    
T  114164 agtggttttgaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgatgtgcaggagtagtt 114221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 191
Target Start/End: Original strand, 99023 - 99100
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  99023 tttatgtggattatgattgatgtaatgtttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 99100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 99471 - 99390
Alignment:
Q  114 tttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||    
T  99471 tttatgtggattatgattgatgtaaagcttaatcccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgcatgggtagacgaagt 99390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 2874 - 2946
Alignment:
Q  123 attatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||| ||| ||||| |||||    
T  2874 attatgattgatgtaaagcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtatggatggatgggtagatgaagt 2946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 1947 - 2027
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||| || | |||||| ||| |||||||    
T  1947 ttgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgtctatctgtctgtatggatgggtagacg 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 104293 - 104221
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  104293 ttgattatgattgatgtaaagcttacttccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 104221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 25440 - 25519
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | ||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  25440 tgtttaagtggattatgattgatgtaatgcttacccccaattgttttgaccgcctacctatctgtatggatgcgtagacg 25519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64466
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagtacaagagtagt---ttgcttatttggtgagttgcttgaggatagcgggagcttcctc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || || || ||||   ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  64372 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacagcgtgcaggaatagtgtattgcttgcttggtgag-tgcttgaggatagcgggagctacctc 64466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 247625 - 247710
Alignment:
Q  111 ttgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggt-----tttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||      | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  247625 ttgtttttgttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggtctgtggtggaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacg 247710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 924 - 853
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  924 ttgattatgattaatgtaatgcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacga 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20383
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagctta-cccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  20459 ttgattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggattttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 20383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7244
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  7319 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 7244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9703 - 9629
Alignment:
Q  116 tatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  9703 tatgtggattatg-ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 9629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0613 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0613
Description:

Target: scaffold0613; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 191
Target Start/End: Original strand, 2961 - 2995
Alignment:
Q  157 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2961 ttgaccgcctacctatttgtatgaatgggtagacg 2995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2902 - 2852
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  2902 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 2920 - 2989
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  2920 tgattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacg 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 11175 - 11244
Alignment:
Q  121 tgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  11175 tgattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacg 11244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11780 - 11703
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagac 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  11780 tgtttatgtggattatgattgat-taatgcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 11703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 59860 - 59810
Alignment:
Q  141 cttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  59860 cttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 59810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5831 - 5790
Alignment:
Q  150 agtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  5831 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacg 5790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18937 - 18892
Alignment:
Q  150 agtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacgaagt 195  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  18937 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagt 18892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 14134 - 14209
Alignment:
Q  115 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacg 191  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  14134 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacg 14209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33821 - 33765
Alignment:
Q  112 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctac 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  33821 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgactgcctac 33765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 192
Target Start/End: Original strand, 199208 - 199279
Alignment:
Q  120 ttgattatgattgatgtgaagcttacccttagtggttttgaccgcctacctatttgtatgaatgagtagacga 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||  ||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  199208 ttgattatgattgatgtaatgcttaccc-cagtggttttgacatcctacctgtctgtatggatgggtagacga 199279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University