View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19136_high_2 (Length: 511)

Name: NF19136_high_2
Description: NF19136
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19136_high_2
NF19136_high_2
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (273-497)||(2041-2265)
scaffold0234 (273-497)||(10932-11156)
scaffold0234 (227-264)||(2490-2527)
scaffold0234 (227-264)||(11381-11418)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (273-501)||(25706-25934)
scaffold0186 (227-264)||(26159-26196)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (273-497)||(17684189-17684413)
chr6 (273-497)||(17691160-17691384)
chr6 (273-497)||(27296892-27297116)
chr6 (273-497)||(27380972-27381196)
chr6 (273-497)||(27471355-27471579)
chr6 (273-497)||(11651986-11652210)
chr6 (273-497)||(29309153-29309377)
chr6 (273-497)||(29316113-29316336)
chr6 (275-496)||(16559193-16559414)
chr6 (273-493)||(25536915-25537135)
chr6 (273-497)||(188697-188921)
chr6 (273-497)||(16394165-16394389)
chr6 (339-480)||(13359010-13359152)
chr6 (273-497)||(27508347-27508567)
chr6 (273-497)||(1586108-1586328)
chr6 (273-497)||(16789153-16789373)
chr6 (273-497)||(22859888-22860108)
chr6 (273-483)||(27527947-27528153)
chr6 (279-475)||(10359073-10359264)
chr6 (276-497)||(14074565-14074782)
chr6 (273-497)||(8612997-8613221)
chr6 (273-453)||(18019885-18020061)
chr6 (273-487)||(2669556-2669768)
chr6 (273-428)||(8510186-8510338)
chr6 (273-412)||(20736413-20736549)
chr6 (384-497)||(33317055-33317167)
chr6 (274-497)||(17120505-17120724)
chr6 (277-400)||(21994674-21994794)
chr6 (356-419)||(28172899-28172963)
chr6 (341-480)||(28756145-28756283)
chr6 (273-412)||(5758565-5758701)
chr6 (77-133)||(9536873-9536929)
chr6 (75-133)||(12836874-12836932)
chr6 (336-394)||(17850321-17850379)
chr6 (273-369)||(22560311-22560404)
chr6 (227-264)||(27381421-27381458)
chr6 (227-264)||(27471804-27471841)
chr6 (227-264)||(29308891-29308928)
chr6 (227-264)||(29315851-29315888)
chr6 (232-264)||(189146-189178)
chr6 (232-264)||(16566489-16566521)
chr6 (232-264)||(17684638-17684670)
chr6 (232-264)||(25537328-25537360)
chr6 (279-400)||(4073664-4073781)
chr6 (75-133)||(12411254-12411312)
chr6 (307-400)||(19218540-19218630)
chr6 (99-129)||(28099353-28099383)
chr6 (79-133)||(31412228-31412282)
chr6 (227-264)||(17691609-17691646)
chr6 (232-264)||(11651729-11651761)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (273-497)||(24695186-24695410)
chr5 (273-497)||(19714218-19714442)
chr5 (273-497)||(18569581-18569805)
chr5 (274-497)||(19706939-19707161)
chr5 (323-501)||(27347252-27347428)
chr5 (277-497)||(17298621-17298839)
chr5 (390-497)||(24701950-24702057)
chr5 (277-497)||(17285470-17285688)
chr5 (273-375)||(39538851-39538953)
chr5 (273-497)||(22941332-22941552)
chr5 (273-497)||(20941109-20941329)
chr5 (273-497)||(25805385-25805605)
chr5 (274-497)||(31096899-31097118)
chr5 (273-497)||(31981-32201)
chr5 (273-497)||(12789663-12789883)
chr5 (273-497)||(23546004-23546224)
chr5 (273-485)||(20100255-20100463)
chr5 (273-497)||(24933306-24933526)
chr5 (273-410)||(18806483-18806618)
chr5 (273-410)||(18806663-18806798)
chr5 (273-410)||(18806843-18806978)
chr5 (273-497)||(12764990-12765214)
chr5 (277-497)||(5097737-5097953)
chr5 (273-497)||(7865430-7865654)
chr5 (273-497)||(9811733-9811957)
chr5 (273-497)||(12703874-12704098)
chr5 (412-501)||(28719471-28719558)
chr5 (277-501)||(26129689-26129909)
chr5 (281-497)||(18829281-18829497)
chr5 (273-497)||(26245184-26245404)
chr5 (416-497)||(39538954-39539035)
chr5 (277-364)||(22546872-22546956)
chr5 (79-133)||(10592033-10592087)
chr5 (88-133)||(5123488-5123533)
chr5 (227-264)||(18570032-18570069)
chr5 (79-133)||(31113440-31113494)
chr5 (227-264)||(24695635-24695672)
chr5 (228-262)||(19707389-19707423)
chr5 (98-132)||(22402074-22402108)
chr5 (228-262)||(31886533-31886567)
chr5 (88-133)||(22187988-22188033)
chr5 (273-364)||(31651917-31652004)
chr5 (227-264)||(39537963-39538000)
chr5 (88-132)||(30784976-30785020)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (273-497)||(8858430-8858654)
chr4 (273-497)||(18262475-18262699)
chr4 (273-497)||(18269336-18269560)
chr4 (273-497)||(55612946-55613170)
chr4 (273-497)||(868860-869084)
chr4 (273-497)||(19926480-19926704)
chr4 (273-497)||(26963903-26964127)
chr4 (273-497)||(26970726-26970950)
chr4 (273-497)||(10621053-10621277)
chr4 (277-497)||(5707587-5707807)
chr4 (277-497)||(5714215-5714435)
chr4 (273-497)||(8845466-8845690)
chr4 (273-497)||(10628132-10628356)
chr4 (273-497)||(28392854-28393078)
chr4 (273-497)||(5667849-5668071)
chr4 (273-497)||(35223823-35224047)
chr4 (273-497)||(4426336-4426548)
chr4 (273-497)||(10677303-10677526)
chr4 (273-497)||(10890943-10891166)
chr4 (273-501)||(20311555-20311781)
chr4 (273-497)||(15461579-15461799)
chr4 (273-497)||(34975633-34975853)
chr4 (273-497)||(2677095-2677315)
chr4 (273-497)||(15815103-15815323)
chr4 (273-497)||(18111043-18111263)
chr4 (273-497)||(26531695-26531915)
chr4 (273-481)||(19365601-19365806)
chr4 (273-497)||(1941806-1942026)
chr4 (273-497)||(3369023-3369243)
chr4 (273-497)||(17299959-17300179)
chr4 (273-497)||(20244019-20244239)
chr4 (273-396)||(21453961-21454083)
chr4 (273-497)||(4675983-4676203)
chr4 (273-497)||(18163244-18163464)
chr4 (277-497)||(30040489-30040705)
chr4 (273-497)||(5870500-5870720)
chr4 (273-480)||(19362492-19362695)
chr4 (273-481)||(5616477-5616681)
chr4 (273-497)||(9487633-9487853)
chr4 (280-497)||(11421096-11421309)
chr4 (273-481)||(5528495-5528699)
chr4 (273-481)||(9538041-9538244)
chr4 (277-395)||(32636570-32636685)
chr4 (75-133)||(9012376-9012434)
chr4 (76-132)||(38766196-38766252)
chr4 (273-412)||(4546162-4546298)
chr4 (369-419)||(24701361-24701411)
chr4 (79-133)||(31307047-31307101)
chr4 (273-497)||(32646523-32646745)
chr4 (227-264)||(868598-868635)
chr4 (77-133)||(35334077-35334133)
chr4 (79-133)||(51626287-51626341)
chr4 (227-264)||(5707321-5707358)
chr4 (227-264)||(5713949-5713986)
chr4 (388-469)||(9937745-9937826)
chr4 (227-264)||(10621502-10621539)
chr4 (227-264)||(10628581-10628618)
chr4 (227-264)||(12357137-12357174)
chr4 (227-264)||(19926929-19926966)
chr4 (227-264)||(26963641-26963678)
chr4 (227-264)||(26970464-26970501)
chr4 (227-264)||(55612684-55612721)
chr4 (232-264)||(4426772-4426804)
chr4 (92-132)||(13948586-13948626)
chr4 (329-400)||(33888672-33888743)
chr4 (230-264)||(5668295-5668329)
chr4 (79-133)||(46016255-46016309)
chr4 (277-322)||(56516323-56516368)
chr4 (232-264)||(5616219-5616251)
chr4 (132-160)||(12357042-12357070)
chr4 (232-264)||(18262218-18262250)
chr4 (232-264)||(28393303-28393335)
chr4 (100-132)||(45994629-45994661)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (273-497)||(6110327-6110551)
chr3 (273-497)||(8490758-8490982)
chr3 (273-497)||(16482203-16482427)
chr3 (273-497)||(10579075-10579299)
chr3 (273-497)||(15357306-15357530)
chr3 (273-497)||(15600604-15600828)
chr3 (273-497)||(15607149-15607373)
chr3 (273-497)||(10572312-10572536)
chr3 (273-497)||(15341939-15342163)
chr3 (273-497)||(17780838-17781062)
chr3 (273-497)||(18520238-18520462)
chr3 (273-493)||(18522926-18523146)
chr3 (277-497)||(32056619-32056839)
chr3 (273-497)||(13211565-13211789)
chr3 (273-497)||(13248870-13249094)
chr3 (273-501)||(17199900-17200128)
chr3 (273-497)||(17136616-17136840)
chr3 (273-497)||(13517074-13517294)
chr3 (273-497)||(1647241-1647465)
chr3 (273-497)||(16200693-16200917)
chr3 (273-497)||(29925234-29925458)
chr3 (273-497)||(29974387-29974611)
chr3 (273-497)||(21034320-21034540)
chr3 (273-497)||(15846536-15846756)
chr3 (273-497)||(21398874-21399094)
chr3 (273-497)||(12299992-12300212)
chr3 (273-497)||(20147554-20147774)
chr3 (273-497)||(25978728-25978948)
chr3 (273-497)||(55427103-55427323)
chr3 (273-497)||(14890473-14890693)
chr3 (273-463)||(15526835-15527021)
chr3 (312-497)||(28088227-28088408)
chr3 (273-497)||(11787669-11787889)
chr3 (1-62)||(36748637-36748698)
chr3 (273-399)||(14147103-14147226)
chr3 (273-497)||(15317176-15317393)
chr3 (277-479)||(24253130-24253328)
chr3 (344-459)||(30464147-30464261)
chr3 (86-133)||(30995953-30996000)
chr3 (79-133)||(8757450-8757504)
chr3 (79-133)||(27763827-27763881)
chr3 (227-264)||(15357755-15357792)
chr3 (227-264)||(15601053-15601090)
chr3 (227-264)||(15607598-15607635)
chr3 (227-264)||(29924972-29925009)
chr3 (227-264)||(29974125-29974162)
chr3 (306-423)||(32280388-32280507)
chr3 (75-132)||(55123204-55123261)
chr3 (228-264)||(1647694-1647730)
chr3 (228-264)||(10579524-10579560)
chr3 (228-264)||(17781287-17781323)
chr3 (228-264)||(19089914-19089950)
chr3 (228-264)||(32057069-32057105)
chr3 (79-133)||(1642712-1642766)
chr3 (79-133)||(48204292-48204346)
chr3 (227-264)||(6110065-6110102)
chr3 (227-264)||(8490489-8490526)
chr3 (227-264)||(10572761-10572798)
chr3 (227-264)||(13248608-13248645)
chr3 (227-264)||(18640915-18640952)
chr3 (232-264)||(13211308-13211340)
chr3 (232-264)||(13516817-13516849)
chr3 (232-264)||(16482652-16482684)
chr3 (232-264)||(17200353-17200385)
chr3 (232-264)||(18510928-18510960)
chr3 (232-264)||(18519984-18520016)
chr3 (232-264)||(18522669-18522701)
chr3 (232-264)||(18534762-18534794)
chr3 (336-400)||(36138033-36138097)
chr3 (79-131)||(40318430-40318482)
chr3 (75-129)||(20861358-20861412)
chr3 (79-133)||(25224805-25224859)
chr3 (79-133)||(38331234-38331288)
chr3 (75-128)||(44941242-44941294)
chr3 (336-400)||(36142816-36142880)
chr3 (75-131)||(39950320-39950376)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (273-497)||(18252293-18252517)
chr1 (273-497)||(18532234-18532458)
chr1 (273-497)||(27131130-27131353)
chr1 (273-497)||(27310297-27310521)
chr1 (277-497)||(16358755-16358975)
chr1 (273-497)||(3855639-3855863)
chr1 (273-497)||(22641594-22641817)
chr1 (273-497)||(36816354-36816577)
chr1 (273-497)||(27277278-27277501)
chr1 (305-497)||(9916497-9916688)
chr1 (273-369)||(21171081-21171177)
chr1 (273-497)||(19706439-19706659)
chr1 (273-497)||(28134723-28134943)
chr1 (273-497)||(43802365-43802585)
chr1 (273-497)||(20391239-20391459)
chr1 (273-497)||(9456198-9456418)
chr1 (273-497)||(20779645-20779865)
chr1 (273-497)||(22670257-22670477)
chr1 (273-497)||(42816989-42817209)
chr1 (273-477)||(634016-634216)
chr1 (276-497)||(22612577-22612794)
chr1 (273-497)||(8727749-8727969)
chr1 (274-497)||(23507164-23507385)
chr1 (273-481)||(29096804-29097008)
chr1 (326-497)||(47667485-47667654)
chr1 (384-497)||(28145723-28145835)
chr1 (79-133)||(49071683-49071737)
chr1 (273-397)||(21881475-21881596)
chr1 (79-133)||(16756188-16756242)
chr1 (79-133)||(18428123-18428177)
chr1 (277-419)||(12014084-12014224)
chr1 (277-330)||(22657108-22657161)
chr1 (77-125)||(7242787-7242834)
chr1 (228-264)||(36816802-36816838)
chr1 (88-132)||(42297432-42297476)
chr1 (273-400)||(51997361-51997485)
chr1 (327-410)||(24301691-24301774)
chr1 (79-133)||(15642561-15642615)
chr1 (350-430)||(12006332-12006413)
chr1 (227-264)||(18252031-18252068)
chr1 (227-264)||(18532683-18532720)
chr1 (227-264)||(27131578-27131615)
chr1 (273-322)||(35930664-35930713)
chr1 (232-264)||(16359204-16359236)
chr1 (232-264)||(21171402-21171434)
chr1 (232-264)||(27310746-27310778)
chr1 (336-395)||(10852402-10852461)
chr1 (273-324)||(26923553-26923604)
chr1 (227-264)||(22657390-22657428)
chr1 (79-133)||(36806717-36806771)
chr1 (104-132)||(6607700-6607728)
chr1 (228-264)||(27277724-27277760)
chr1 (279-358)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (273-496)||(21940928-21941151)
chr8 (273-497)||(15326461-15326685)
chr8 (273-497)||(15506830-15507054)
chr8 (277-497)||(22171754-22171974)
chr8 (273-497)||(6094386-6094610)
chr8 (273-497)||(24642912-24643135)
chr8 (356-497)||(28548393-28548534)
chr8 (277-382)||(24797224-24797328)
chr8 (277-497)||(8371253-8371469)
chr8 (273-430)||(14983710-14983864)
chr8 (273-497)||(12562205-12562425)
chr8 (273-497)||(21969415-21969635)
chr8 (273-497)||(22659494-22659714)
chr8 (273-497)||(25611277-25611497)
chr8 (273-497)||(27007517-27007737)
chr8 (273-497)||(27014660-27014880)
chr8 (273-497)||(27880487-27880707)
chr8 (273-497)||(28020668-28020888)
chr8 (273-497)||(22130609-22130829)
chr8 (273-497)||(21916758-21916978)
chr8 (273-497)||(26240566-26240786)
chr8 (273-497)||(45534273-45534493)
chr8 (273-497)||(6430968-6431188)
chr8 (273-412)||(8781959-8782095)
chr8 (279-481)||(38232115-38232315)
chr8 (390-487)||(24796731-24796826)
chr8 (273-400)||(18835432-18835556)
chr8 (294-481)||(20535226-20535409)
chr8 (273-497)||(2962932-2963156)
chr8 (79-133)||(4125005-4125059)
chr8 (79-133)||(2744039-2744093)
chr8 (384-502)||(36970439-36970556)
chr8 (384-501)||(2375411-2375528)
chr8 (88-133)||(7839243-7839288)
chr8 (228-264)||(6094125-6094161)
chr8 (228-264)||(24642651-24642687)
chr8 (79-133)||(8521804-8521857)
chr8 (348-470)||(29645675-29645797)
chr8 (100-133)||(39086858-39086891)
chr8 (97-133)||(12958084-12958120)
chr8 (232-264)||(21940671-21940703)
chr8 (228-264)||(24636856-24636892)
chr8 (75-131)||(30936112-30936168)
chr8 (98-133)||(13468745-13468780)
chr8 (436-497)||(8968015-8968076)
chr8 (97-133)||(19715724-19715761)
chr8 (232-264)||(28554889-28554921)
chr8 (336-456)||(32872609-32872729)
chr8 (437-485)||(41368106-41368154)
chr8 (437-485)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (273-497)||(7370-7594)
scaffold0433 (233-264)||(7114-7145)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (273-497)||(6654-6878)
scaffold0390 (273-497)||(13670-13894)
scaffold0390 (227-264)||(7103-7140)
scaffold0390 (227-264)||(14119-14156)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (273-493)||(15152706-15152926)
chr7 (273-497)||(29328047-29328271)
chr7 (273-497)||(11535782-11536006)
chr7 (277-497)||(12751093-12751313)
chr7 (273-497)||(11542700-11542924)
chr7 (280-497)||(12738806-12739023)
chr7 (273-497)||(13392413-13392637)
chr7 (273-497)||(18561270-18561485)
chr7 (273-503)||(18257559-18257786)
chr7 (273-497)||(2365185-2365407)
chr7 (273-497)||(2204634-2204854)
chr7 (273-497)||(8465081-8465301)
chr7 (273-497)||(18400186-18400406)
chr7 (273-497)||(18407170-18407390)
chr7 (277-497)||(41680968-41681184)
chr7 (273-497)||(48808496-48808716)
chr7 (273-497)||(15729833-15730053)
chr7 (273-497)||(18139338-18139558)
chr7 (273-497)||(19230970-19231190)
chr7 (273-485)||(30254220-30254428)
chr7 (273-497)||(34128655-34128875)
chr7 (277-485)||(47166871-47167075)
chr7 (278-497)||(18259124-18259339)
chr7 (273-475)||(24443349-24443547)
chr7 (273-475)||(25845498-25845696)
chr7 (273-475)||(25845917-25846115)
chr7 (275-497)||(28130645-28130863)
chr7 (273-497)||(10668901-10669122)
chr7 (273-411)||(31190524-31190659)
chr7 (349-486)||(39112138-39112275)
chr7 (273-459)||(19393462-19393644)
chr7 (273-412)||(19388634-19388774)
chr7 (273-497)||(14591932-14592153)
chr7 (273-497)||(16011523-16011744)
chr7 (309-497)||(15169290-15169474)
chr7 (273-397)||(22969032-22969153)
chr7 (348-423)||(22948499-22948574)
chr7 (79-133)||(31492209-31492263)
chr7 (75-129)||(37339710-37339764)
chr7 (79-133)||(29059911-29059965)
chr7 (77-131)||(35707954-35708008)
chr7 (227-264)||(11536231-11536268)
chr7 (98-131)||(20207605-20207638)
chr7 (100-133)||(28665196-28665229)
chr7 (227-264)||(29327785-29327822)
chr7 (232-264)||(11543149-11543181)
chr7 (228-264)||(12738538-12738574)
chr7 (232-264)||(18258011-18258043)
chr7 (232-264)||(18561013-18561045)
chr7 (232-262)||(12750832-12750862)
chr7 (97-131)||(36821079-36821113)
chr7 (99-132)||(45778971-45779004)
chr7 (228-264)||(13392153-13392189)
chr7 (232-264)||(15148148-15148180)
chr7 (232-264)||(15152449-15152481)
chr7 (97-133)||(19477249-19477284)
chr7 (343-407)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (273-497)||(18551-18774)
scaffold0220 (227-264)||(18289-18326)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (277-497)||(21329968-21330188)
chr2 (273-497)||(18796769-18796993)
chr2 (273-503)||(18620067-18620296)
chr2 (273-497)||(36270429-36270650)
chr2 (275-483)||(6991847-6992054)
chr2 (277-497)||(20978142-20978360)
chr2 (273-497)||(30174459-30174679)
chr2 (273-497)||(24250032-24250252)
chr2 (279-485)||(18822352-18822556)
chr2 (273-485)||(15342014-15342222)
chr2 (273-497)||(24229215-24229435)
chr2 (334-497)||(17241034-17241196)
chr2 (273-499)||(29800553-29800775)
chr2 (350-497)||(22183206-22183354)
chr2 (273-412)||(19616517-19616653)
chr2 (273-399)||(40301034-40301156)
chr2 (350-430)||(36799745-36799826)
chr2 (277-400)||(21626836-21626955)
chr2 (77-133)||(25423850-25423906)
chr2 (277-472)||(41316305-41316496)
chr2 (430-497)||(41661694-41661761)
chr2 (76-133)||(17981603-17981660)
chr2 (227-264)||(21330417-21330454)
chr2 (228-264)||(19692705-19692741)
chr2 (336-412)||(28740910-28740986)
chr2 (75-131)||(14551582-14551638)
chr2 (77-132)||(18105342-18105396)
chr2 (79-133)||(5394502-5394556)
chr2 (99-133)||(17655767-17655801)
chr2 (276-322)||(19279554-19279600)
chr2 (79-133)||(31579210-31579264)
chr2 (79-133)||(37179982-37180036)
chr2 (79-133)||(42745097-42745151)
chr2 (85-133)||(9438123-9438171)
chr2 (101-133)||(37092198-37092230)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (277-478)||(1260-1461)
scaffold0657 (227-264)||(994-1031)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (273-497)||(230111-230335)
scaffold0008 (232-264)||(230509-230541)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (273-501)||(5792-6013)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (273-485)||(12961-13169)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (273-497)||(265-485)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (273-497)||(67374-67594)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (273-497)||(3675-3895)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (273-497)||(119812-120032)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (273-497)||(26624-26844)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (273-459)||(130262-130444)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (307-497)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (273-469)||(8813-9005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (273-497)||(39988-40208)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (273-400)||(8387-8511)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (278-400)||(83111-83230)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (273-497)||(11526-11750)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (227-264)||(8472-8509)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (79-133)||(29133-29187)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (277-373)||(11328-11421)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (384-497)||(53955-54066)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (79-133)||(26437-26491)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (88-128)||(27215-27255)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2265 - 2041
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2265 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 2166  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 2066  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2065 gttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11156 - 10932
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11156 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 11057  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11056 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 10957  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10956 gttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2527 - 2490
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2527 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 2490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11418 - 11381
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 11381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25934 - 25706
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25934 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 25835  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 25735  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25734 gttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26196 - 26159
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 26159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17684413 - 17684189
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684413 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 17684314  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684313 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 17684214  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17684213 gttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17691384 - 17691160
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691384 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 17691285  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691284 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 17691185  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17691184 gttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 27296892 - 27297116
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296892 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 27296991  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296992 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 27297091  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27297092 gttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27381196 - 27380972
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381196 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 27381097  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381096 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 27380997  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27380996 gttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27471579 - 27471355
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471579 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 27471480  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471479 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 27471380  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27471379 gttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 11651986 - 11652210
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11651986 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgta 11652085  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652086 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 11652185  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11652186 gttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 29309153 - 29309377
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309153 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 29309252  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309253 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 29309352  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29309353 gttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 29316113 - 29316336
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316113 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 29316212  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316213 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 29316311  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29316312 gttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 275 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  275 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  375 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 474  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  475 tgatgggtactccatgaatcat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 273 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25537135 - 25536915
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25537135 ttaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgacagtggtgta 25537036  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537035 ttccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgattataaagttg 25536936  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaat 493  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25536935 gttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 188921 - 188697
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188921 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 188822  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  188821 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttg 188722  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
     ||||||| |||||||| |||||||    
T  188721 attgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16394389 - 16394165
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16394389 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgta 16394290  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16394289 ttccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttg 16394190  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16394189 gttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 339 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13359152 - 13359010
Alignment:
Q  339 tgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccatt 437  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || |     
T  13359152 tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgta 13359053  T
Q  438 caaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 480  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13359052 caaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27508567 - 27508347
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  27508567 ttaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 27508471  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  27508470 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttg 27508372  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  27508371 gttgatgggtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1586328 - 1586108
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  1586328 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 1586232  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  1586231 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 1586133  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  1586132 gttgatgggtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 16789153 - 16789373
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  16789153 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 16789249  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  16789250 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 16789348  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  16789349 gttgatgggcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22860108 - 22859888
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  22860108 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 22860012  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  22860011 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 22859913  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  22859912 gttgatgggcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 273 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 27528153 - 27527947
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  27528153 ttaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 27528057  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  27528056 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttg 27527958  T
Q  473 gttgatgggta 483  Q
    |||||||||||    
T  27527957 gttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 279 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10359264 - 10359073
Alignment:
Q  279 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccac 378  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  10359264 gtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccac 10359169  T
Q  379 ccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 475  Q
     ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||    
T  10359168 tcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 497
Target Start/End: Original strand, 14074565 - 14074782
Alignment:
Q  276 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||      
T  14074565 ggagtaatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatat 14074661  T
Q  376 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 475  Q
      | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| |||||||    
T  14074662 tgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggtt 14074760  T
Q  476 gatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  14074761 gatgggtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 8612997 - 8613221
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  8612997 ttaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagt 8613094  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||      
T  8613095 gtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataaca 8613193  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8613194 ttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18020061 - 18019885
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  18020061 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 18019965  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 453  Q
    |  | | ||| ||||||||| |||||||  | ||||||| | || || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  18019964 tatcgctcttagacctgaaatcactatgatctctagatg-tcgactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaa 18019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 487
Target Start/End: Original strand, 2669556 - 2669768
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||| |  || || ||||||| |||||||||||||| | || ||||    
T  2669556 ttaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgtttaa-gtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgt 2669652  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    |||||||  || ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||     
T  2669653 attccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtc 2669752  T
Q  472 ggttgatgggtactcc 487  Q
     |||||| ||||||||    
T  2669753 agttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 428
Target Start/End: Original strand, 8510186 - 8510338
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||| || || |||||||||||| |||||| |    
T  8510186 ttagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgtcattagttactctcatagtgatggtggtgca 8510282  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 428  Q
    || ||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510283 ttacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20736549 - 20736413
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  20736549 ttaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatagtgta 20736453  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    |  ||| ||| ||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  20736452 tatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 497
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  384 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 483  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  484 ctccatgaatcatg 497  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17120724 - 17120505
Alignment:
Q  274 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 373  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    
T  17120724 taggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtat 17120628  T
Q  374 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 473  Q
      | | ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | ||||| || |||| |||||    
T  17120627 atcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaaggataaccataacgttgg 17120529  T
Q  474 ttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120528 ttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 400
Target Start/End: Original strand, 21994674 - 21994794
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  |    
T  21994674 gagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcacaatgataatggtgtatatc 21994770  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    || ||| |||||||||| ||||||    
T  21994771 actcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 419
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  356 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  341 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  441 acgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgg 480  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5758701 - 5758565
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  5758701 ttaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattataatagtgta 5758605  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5758604 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 5758565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9536929 - 9536873
Alignment:
Q  77 tataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9536929 tataaatttgatatcctccgagcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 9536873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Original strand, 12836874 - 12836932
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12836874 ggtataaaccgggtatcctccgcgcgcaactggggagactaatccctcaagcattgtgg 12836932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17850379 - 17850321
Alignment:
Q  336 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 394  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850379 aagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22560404 - 22560311
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560404 ttaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27381458 - 27381421
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381458 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 27381421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27471841 - 27471804
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471841 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 27471804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 29308891 - 29308928
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308891 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 29308928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 29315851 - 29315888
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315851 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 29315888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 189178 - 189146
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189178 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 189146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16566521 - 16566489
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566521 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 16566489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17684670 - 17684638
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684670 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 17684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25537360 - 25537328
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537360 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 25537328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 400
Target Start/End: Original strand, 4073664 - 4073781
Alignment:
Q  279 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccac 378  Q
    |||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| ||   |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||     
T  4073664 gtaatatttatatttgattgacctaccgtgagaatactacataatat--gttatgaaaatt--cataagatattctcataatgataacgatgtataccaa 4073759  T
Q  379 ccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
     ||| ||||| |||||||||||    
T  4073760 tcttagacctaaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12411312 - 12411254
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12411312 ggtataaaccgggtatcccccgcgcgcaactgtggagactaatccctcaagcattgtgg 12411254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 400
Target Start/End: Original strand, 19218540 - 19218630
Alignment:
Q  307 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  19218540 tgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacctgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28099383 - 28099353
Alignment:
Q  99 cgcaactgcggagactaatccctcgagcatt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28099383 cgcaactgcggagactaatccctcgagcatt 28099353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31412282 - 31412228
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31412282 taaatcggatatcctccgtgcgcaactgtggagactaatttctcgagcattgtgg 31412228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17691646 - 17691609
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17691646 caaggcatttctttattgattttgttttctttcaaaat 17691609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 11651729 - 11651761
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11651729 catttctttattgattttgatttgtttcaaaat 11651761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24695410 - 24695186
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695410 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 24695311  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695310 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 24695211  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24695210 gttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19714442 - 19714218
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19714442 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgta 19714343  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714342 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttg 19714243  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  19714242 gttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18569805 - 18569581
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18569805 ttaggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgta 18569706  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569705 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattg 18569606  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  18569605 gttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 274 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19707161 - 19706939
Alignment:
Q  274 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19707161 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtat 19707062  T
Q  374 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 473  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19707061 tccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttgg 19706963  T
Q  474 ttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19706962 ttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 323 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347252
Alignment:
Q  323 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 422  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  423 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17298839 - 17298621
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17298839 gagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattc 17298743  T
Q  376 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 475  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  17298742 cacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggtt 17298643  T
Q  476 gatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17298642 gatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 390 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  390 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  490 gaatcatg 497  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17285688 - 17285470
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||| | | | ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17285688 gagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattc 17285592  T
Q  376 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 475  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  17285591 cactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggtt 17285492  T
Q  476 gatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17285491 gatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 273 - 375
Target Start/End: Original strand, 39538851 - 39538953
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39538851 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtata 39538950  T
Q  373 ttc 375  Q
    |||    
T  39538951 ttc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 22941332 - 22941552
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  22941332 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 22941428  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  22941429 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 22941527  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  22941528 gttgatgggtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 20941109 - 20941329
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  20941109 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 20941205  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  20941206 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 20941304  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  20941305 gttgatgggtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25805605 - 25805385
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  25805605 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 25805509  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | |||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  25805508 tatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 25805410  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  25805409 gttgatgggtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 497
Target Start/End: Original strand, 31096899 - 31097118
Alignment:
Q  274 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    
T  31096899 taggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtat 31096995  T
Q  374 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 473  Q
      | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||    
T  31096996 atcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttgg 31097094  T
Q  474 ttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  31097095 ttgatgggtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 31981 - 32201
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  31981 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 32077  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  32078 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 32176  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  32177 gttgatgggcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12789883 - 12789663
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  12789883 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 12789787  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |  | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  12789786 tactgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 12789688  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12789687 gttgatgggtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 23546004 - 23546224
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  23546004 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 23546100  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  23546101 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 23546199  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  23546200 gttgatgggcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20100463 - 20100255
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  20100463 ttaggagtaatacttatactggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgta 20100367  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  20100366 taccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttg 20100268  T
Q  473 gttgatgggtact 485  Q
    |||||||||||||    
T  20100267 gttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24933526 - 24933306
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  24933526 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 24933430  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  24933429 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 24933331  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  24933330 gttgatgggtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18806618 - 18806483
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18806618 ttagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgt 18806522  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806521 attccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18806798 - 18806663
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18806798 ttagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgt 18806702  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806701 attccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18806978 - 18806843
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18806978 ttagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatgt 18806882  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806881 attccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12765214 - 12764990
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||||| | ||    
T  12765214 ttaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagt 12765117  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |    
T  12765116 gtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacg 12765018  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12765017 ttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Original strand, 5097737 - 5097953
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  5097737 gagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatc 5097833  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
     | ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  5097834 gctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttg 5097932  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||   ||||||||||    
T  5097933 atgggtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 7865654 - 7865430
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |   | |||||||||||||||||| | ||||| | ||    
T  7865654 ttaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagt 7865557  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||| || ||||      
T  7865556 gtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataaca 7865458  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7865457 ttggttgatgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 9811957 - 9811733
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |   | ||||||||||| |||||| | ||||| | ||    
T  9811957 ttaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagt 9811860  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |    
T  9811859 gtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacg 9811761  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9811760 ttggttgatgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12704098 - 12703874
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |   | ||||||||||| |||||| | ||||| | ||    
T  12704098 ttaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagt 12704001  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| || || || |||| |    
T  12704000 gtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacg 12703902  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12703901 ttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  412 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26129909 - 26129689
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| ||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||  |    
T  26129909 gagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagtat--gttatgaaaa-tgtaataagatattctcacattgataatggtgtatatc 26129813  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    || ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | ||| || |||| ||||| |     
T  26129812 actcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaagataaccataacgttggcta 26129714  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129713 atgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18829497 - 18829281
Alignment:
Q  281 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacc 379  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  18829497 aatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataagttattctcataatgataagtggtgtattccatc 18829401  T
Q  380 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg---ttg 476  Q
     || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||  ||  ||| | |||||||||||||||||   |||    
T  18829400 atttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtcatctataaaatgatgactataaagttggttattg 18829302  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  18829301 atgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 26245184 - 26245404
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| | || || | |||||    
T  26245184 ttaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgta 26245280  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||| ||||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||  ||||    
T  26245281 tatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttg 26245379  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  26245380 gttgatgggtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 497
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  416 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22546956 - 22546872
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546956 gagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatactacata--aaaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10592087 - 10592033
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10592087 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcagagactaatccctcgagcattgtgg 10592033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 5123488 - 5123533
Alignment:
Q  88 tatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5123488 tatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 5123533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18570069 - 18570032
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18570069 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18570032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31113494 - 31113440
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31113494 taaatcgggtatccttcgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagtattgtgg 31113440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24695672 - 24695635
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695672 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 24695635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19707423 - 19707389
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707423 aagacatttctttattgattttgttttatttcaaa 19707389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22402108 - 22402074
Alignment:
Q  98 gcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22402108 gcgcaactgcggagattaatccctcgagcattgtg 22402074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 262
Target Start/End: Original strand, 31886533 - 31886567
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaa 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31886533 aagacatttctttagtgattttgttttgtttcaaa 31886567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 22187988 - 22188033
Alignment:
Q  88 tatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22187988 tatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctctagtattgtgg 22188033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31652004 - 31651917
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 364  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||| |  | ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31652004 ttaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 39537963 - 39538000
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39537963 caagccatttctttaatgattttgttttgtttcaaaat 39538000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 30784976 - 30785020
Alignment:
Q  88 tatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30784976 tatcctccgcgcgcaactgcggagactaatcccttgaacattgtg 30785020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 8858430 - 8858654
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858430 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 8858529  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858530 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 8858629  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8858630 gttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18262475 - 18262699
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262475 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18262574  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262575 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18262674  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18262675 gttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18269336 - 18269560
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269336 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18269435  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269436 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18269535  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18269536 gttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 55612946 - 55613170
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612946 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 55613045  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613046 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 55613145  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  55613146 gttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 868860 - 869084
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  868860 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgta 868959  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868960 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 869059  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  869060 gttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19926704 - 19926480
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926704 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 19926605  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926604 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 19926505  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19926504 gttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 26963903 - 26964127
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963903 ttagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 26964002  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964003 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 26964102  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26964103 gttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 26970726 - 26970950
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970726 ttagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 26970825  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970826 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 26970925  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26970926 gttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10621277 - 10621053
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10621277 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtt 10621178  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621177 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttg 10621078  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10621077 gttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Original strand, 5707587 - 5707807
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707587 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 5707686  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707687 atccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 5707786  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5707787 atgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Original strand, 5714215 - 5714435
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714215 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 5714314  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714315 atccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 5714414  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5714415 atgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 8845466 - 8845690
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8845466 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgta 8845565  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8845566 ttccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttg 8845665  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8845666 gttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10628356 - 10628132
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10628356 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtt 10628257  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628256 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttg 10628157  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10628156 gttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28393078 - 28392854
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393078 ttagaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 28392979  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392978 ttccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 28392879  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  28392878 gttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 5668071 - 5667849
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5668071 ttaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 5667972  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5667971 ttccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttg 5667874  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  5667873 gttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 35223823 - 35224047
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35223823 ttaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgta 35223922  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35223923 ttccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttg 35224022  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    
T  35224023 gttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4426548 - 4426336
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||            |||||||||||||||||||||    
T  4426548 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgta 4426461  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4426460 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttg 4426361  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4426360 gttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10677526 - 10677303
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10677526 ttaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 10677427  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||||||    
T  10677426 tttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-ataaagttg 10677328  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  10677327 gtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10891166 - 10890943
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10891166 ttaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 10891067  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||||||    
T  10891066 tttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-ataaagttg 10890968  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  10890967 gtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 273 - 501
Target Start/End: Original strand, 20311555 - 20311781
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  | |||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  20311555 ttaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttatgtaac-tatcatacattattctcatagtgataagtggtgt 20311651  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20311652 attccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtc 20311751  T
Q  472 ggttgatgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311752 ggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 15461579 - 15461799
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  15461579 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 15461675  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  15461676 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 15461774  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  15461775 gttgatgggtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 34975633 - 34975853
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  34975633 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 34975729  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  34975730 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 34975828  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  34975829 gttgatgggtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 2677095 - 2677315
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  2677095 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 2677191  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  2677192 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 2677290  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  2677291 gttgatgggcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 15815103 - 15815323
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  15815103 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 15815199  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  15815200 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 15815298  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  15815299 gttgatgggcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18111263 - 18111043
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  18111263 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 18111167  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  18111166 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 18111068  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  18111067 gttgatgggcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 26531695 - 26531915
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  26531695 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 26531791  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  26531792 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 26531890  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  26531891 gttgatgggcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 273 - 481
Target Start/End: Original strand, 19365601 - 19365806
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgt 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  19365601 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgt 19365697  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    || |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  19365698 ataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgtt 19365796  T
Q  472 ggttgatggg 481  Q
     ||| |||||    
T  19365797 agttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 1941806 - 1942026
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | |||||    
T  1941806 ttaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgta 1941902  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  1941903 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 1942001  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  1942002 gttgatgggtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3369243 - 3369023
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  3369243 ttaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 3369147  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  3369146 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 3369048  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  3369047 gttgatgggtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17300179 - 17299959
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  17300179 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 17300083  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  17300082 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 17299984  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| | |||  ||||||||||    
T  17299983 gttgatgagcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 20244019 - 20244239
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  20244019 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 20244115  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  20244116 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 20244214  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  20244215 gttgatgggtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 273 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21454083 - 21453961
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21454083 ttaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcataagatattttcattgtgatagtggtgta 21453985  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccac 396  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  21453984 tgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4676203 - 4675983
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  4676203 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 4676107  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  4676106 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 4676008  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  4676007 gttgatgggtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18163244 - 18163464
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  18163244 ttagaagtaatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 18163340  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  18163341 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 18163439  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  18163440 gttgatgggtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 5870500 - 5870720
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  ||||    
T  5870500 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgta 5870596  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||    
T  5870597 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttg 5870695  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||    
T  5870696 gttgatgagtacttgatgaatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 480
Target Start/End: Original strand, 19362492 - 19362695
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  19362492 ttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgta 19362588  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||| |||  ||||||||||||||||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  19362589 taccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacggtg 19362687  T
Q  473 gttgatgg 480  Q
    ||| ||||    
T  19362688 gttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 481
Target Start/End: Original strand, 5616477 - 5616681
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||    
T  5616477 ttagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgataatggtgta 5616573  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||    
T  5616574 taccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttg 5616672  T
Q  473 gttgatggg 481  Q
    ||| |||||    
T  5616673 gttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 9487633 - 9487853
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  9487633 ttaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 9487729  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||    
T  9487730 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataaccataacattg 9487828  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  9487829 gttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 497
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  280 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 379  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  380 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 479  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  480 ggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5528699 - 5528495
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5528699 ttaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcataatgataatggtgta 5528603  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| |||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||    
T  5528602 taacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacaggataaccataatgttg 5528504  T
Q  473 gttgatggg 481  Q
    ||| |||||    
T  5528503 gttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 481
Target Start/End: Original strand, 9538041 - 9538244
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||     
T  9538041 ttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggcgt- 9538136  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
     ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  9538137 gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataaccataacgttg 9538235  T
Q  473 gttgatggg 481  Q
    ||| |||||    
T  9538236 gttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 395
Target Start/End: Original strand, 32636570 - 32636685
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  32636570 gagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatacc 32636666  T
Q  377 acccttcgacctgaaacca 395  Q
    || || |||| ||||||||    
T  32636667 actctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9012434 - 9012376
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9012434 ggtataaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 9012376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38766252 - 38766196
Alignment:
Q  76 gtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38766252 gtataaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 38766196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 412
Target Start/End: Original strand, 4546162 - 4546298
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  4546162 ttaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 4546258  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    |  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4546259 tatcgctctttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 419
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  369 tgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 31307047 - 31307101
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31307047 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 31307101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32646745 - 32646523
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||  ||| |||||| | |  |||| | || |||| | |||||||| |||||||    
T  32646745 ttaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaaggttatgtataa-gtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgt 32646649  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||     
T  32646648 attttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtc 32646549  T
Q  472 ggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646548 ggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 868598 - 868635
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868598 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 868635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Original strand, 35334077 - 35334133
Alignment:
Q  77 tataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35334077 tataaaccggatatccttcacgcgcaactgcggagactaatccctcgagtattgtgg 35334133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 51626287 - 51626341
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  51626287 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatctctcgagcactgtgg 51626341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 5707321 - 5707358
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707321 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 5707358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 5713949 - 5713986
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713949 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 5713986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937745
Alignment:
Q  388 tgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaag 9937745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10621539 - 10621502
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621539 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 10621502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10628618 - 10628581
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628618 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 10628581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 12357137 - 12357174
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357137 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 12357174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19926966 - 19926929
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926966 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 19926929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 26963641 - 26963678
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963641 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 26963678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 26970464 - 26970501
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970464 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 26970501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 55612684 - 55612721
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612684 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 55612721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4426804 - 4426772
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426804 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 4426772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 132
Target Start/End: Original strand, 13948586 - 13948626
Alignment:
Q  92 ttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13948586 ttccgcgcgcaactgcagagactaatccctcgagcattgtg 13948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 400
Target Start/End: Original strand, 33888672 - 33888743
Alignment:
Q  329 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888672 ttatgtaaagtgtgataagataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5668329 - 5668295
Alignment:
Q  230 gacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668329 gacatttctttgttgattttgttttgtttcaaaat 5668295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 46016309 - 46016255
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  46016309 taaatcgggtatcctccacgcgcaactacggagactaattcttcgagcattgtgg 46016255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Original strand, 56516323 - 56516368
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516323 gagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 5616219 - 5616251
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5616219 catttctttattcattttgttttgtttcaaaat 5616251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 160
Target Start/End: Original strand, 12357042 - 12357070
Alignment:
Q  132 ggtgttggaataagccctaatagccaatc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357042 ggtgttggaataagccctaatagccaatc 12357070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 18262218 - 18262250
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18262218 catttctttattgattttgtttcgtttcaaaat 18262250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28393335 - 28393303
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28393335 catttctttattgattttgatttgtttcaaaat 28393303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45994661 - 45994629
Alignment:
Q  100 gcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45994661 gcaactgcggagactaatctctcgagcattgtg 45994629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 6110327 - 6110551
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110327 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 6110426  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110427 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 6110526  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6110527 gttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 8490758 - 8490982
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490758 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 8490857  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490858 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 8490957  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8490958 gttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16482427 - 16482203
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482427 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 16482328  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482327 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 16482228  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16482227 gttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10579299 - 10579075
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579299 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 10579200  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579199 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 10579100  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10579099 gttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15357530 - 15357306
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357530 ttaggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15357431  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357430 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15357331  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15357330 gttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15600828 - 15600604
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600828 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15600729  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600728 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15600629  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  15600628 gttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15607373 - 15607149
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607373 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15607274  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607273 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15607174  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  15607173 gttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10572536 - 10572312
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572536 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 10572437  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572436 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 10572337  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10572336 gttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15342163 - 15341939
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342163 ttaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15342064  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342063 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15341964  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15341963 gttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17781062 - 17780838
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781062 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 17780963  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17780962 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttg 17780863  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17780862 gttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18520238 - 18520462
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520238 ttaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18520337  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18520338 ttccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttg 18520437  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18520438 gttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 493
Target Start/End: Original strand, 18522926 - 18523146
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522926 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18523025  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523026 tttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18523125  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaat 493  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18523126 gttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 32056839 - 32056619
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056839 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 32056740  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056739 acccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 32056640  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  32056639 atggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 13211565 - 13211789
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13211565 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgta 13211664  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211665 ttccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 13211764  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13211765 gttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 13248870 - 13249094
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13248870 ttaggagtaatatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgta 13248969  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248970 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 13249069  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13249070 gttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 273 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 17200128 - 17199900
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200128 ttaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 17200029  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17200028 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttg 17199929  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199928 gttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 17136616 - 17136840
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136616 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 17136715  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136716 ttccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 17136815  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  17136816 gttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 13517074 - 13517294
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  13517074 ttaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggcc-- 13517171  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517172 --ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 13517269  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  13517270 gtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1647465 - 1647241
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1647465 ttaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgta 1647366  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1647365 ttccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttg 1647266  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  1647265 gttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 16200693 - 16200917
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200693 ttaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgta 16200792  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16200793 ttcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttg 16200892  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200893 gttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 29925234 - 29925458
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925234 ttaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 29925333  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  29925334 ttccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttg 29925433  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925434 gttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 29974387 - 29974611
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974387 ttaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 29974486  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  29974487 ttccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttg 29974586  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974587 gttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 21034320 - 21034540
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  21034320 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 21034416  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  21034417 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 21034515  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  21034516 gttgatgggtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15846756 - 15846536
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  15846756 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 15846660  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  15846659 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 15846561  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  15846560 gttgatgggtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 21398874 - 21399094
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  ||||    
T  21398874 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattcttacaatgataataatgta 21398970  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  21398971 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 21399069  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  21399070 gttgatgggtacttgatgaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 12299992 - 12300212
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  12299992 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 12300088  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  12300089 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 12300187  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12300188 gttgatgggtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20147774 - 20147554
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  20147774 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 20147678  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  20147677 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 20147579  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  20147578 gttgatgggcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25978948 - 25978728
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  25978948 ttaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 25978852  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  25978851 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 25978753  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  25978752 gttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 55427103 - 55427323
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  55427103 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 55427199  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  55427200 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 55427298  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  55427299 gttgatgggtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 14890473 - 14890693
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  14890473 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 14890569  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| ||||||||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||    
T  14890570 tattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttg 14890668  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  14890669 gttgatgggtacttgatgaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 463
Target Start/End: Original strand, 15526835 - 15527021
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||| | | || || |||||||    
T  15526835 ttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgttaatggtgta 15526931  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgact 463  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15526932 taccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacagcatgact 15527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 497
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088408
Alignment:
Q  312 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 411  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  412 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
     |||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088324 -tggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 11787669 - 11787889
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  11787669 ttaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcacaatgataatattgta 11787765  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||| ||||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  |||| || |||| ||||    
T  11787766 tatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatggataaccataacgttg 11787864  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  11787865 gttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 36748698 - 36748637
Alignment:
Q  1 ttaactcttaatctactttaatctcttagatcaaactagttaaactaccaaacaccccaacc 62  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36748698 ttaactcttaaactactttaatctcttatatctaactagttaaactaccaaacaccctaacc 36748637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 399
Target Start/End: Original strand, 14147103 - 14147226
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  14147103 ttaggaggaatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagtat--gttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgta 14147199  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactat 399  Q
    |  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  14147200 tatcactcttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15317393 - 15317176
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  15317393 ttaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 15317297  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
       | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  |||| |  |||| ||||    
T  15317296 aatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttg 15317201  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||    
T  15317200 gttgacgggtacttgatgaatcatg 15317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24253328 - 24253130
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||  || |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24253328 gagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttatttaagga-tcataagttattctcatagtgataacggtgtattcc 24253232  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||   | ||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||| ||||    
T  24253231 aca-ttcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttgtcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttg 24253133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 459
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464261
Alignment:
Q  344 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 443  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  444 ttgtccgtaacaggat 459  Q
    ||||| |||| |||||    
T  30464246 ttgtctgtaaaaggat 30464261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Original strand, 30995953 - 30996000
Alignment:
Q  86 gatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30995953 gatatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 30996000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8757504 - 8757450
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8757504 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 8757450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27763881 - 27763827
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763881 taaaccggatatcctctgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 27763827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15357792 - 15357755
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357792 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 15357755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15601090 - 15601053
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601090 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 15601053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15607635 - 15607598
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607635 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 15607598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 29924972 - 29925009
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29924972 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 29925009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 29974125 - 29974162
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974125 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 29974162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 423
Target Start/End: Original strand, 32280388 - 32280507
Alignment:
Q  306 atgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tatgt 401  Q
    ||||||||| |||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||    
T  32280388 atgagaataatacatagtga--gtcatgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgt 32280485  T
Q  402 accctagatgttggagtcgagt 423  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  32280486 accctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 55123261 - 55123204
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    |||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55123261 ggtataaatcaggtatcctccgcgcgcaactgcgaagactaatccctcgagcattgtg 55123204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1647730 - 1647694
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647730 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 1647694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10579560 - 10579524
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579560 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 10579524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17781323 - 17781287
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781323 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 17781287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19089950 - 19089914
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089950 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 19089914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32057105 - 32057069
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057105 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 32057069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1642766 - 1642712
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1642766 taaatcggatatcctccgcgcgcaactgcggaaactaatccctcaagtattgtgg 1642712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 48204292 - 48204346
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48204292 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcggaaactaatcccttgagcattgtgg 48204346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 6110065 - 6110102
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110065 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 6110102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 8490489 - 8490526
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490489 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 8490526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10572798 - 10572761
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572798 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 10572761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 13248608 - 13248645
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248608 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 13248645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18640952 - 18640915
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640952 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18640915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 13211308 - 13211340
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211308 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 13211340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 13516817 - 13516849
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516817 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 13516849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16482684 - 16482652
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482684 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 16482652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17200385 - 17200353
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200385 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 17200353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 18510928 - 18510960
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510928 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18510960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 18519984 - 18520016
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18519984 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18520016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 18522669 - 18522701
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522669 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18522701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 18534762 - 18534794
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534762 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18534794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  336 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 131
Target Start/End: Original strand, 40318430 - 40318482
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40318430 taaaacgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgaacattgt 40318482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20861412 - 20861358
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcatt 129  Q
    ||||||||  || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20861412 ggtataaactgggtatcctccgcgcacaactgcggagactaatccctcgagcatt 20861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25224859 - 25224805
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25224859 taaaccgggtatcctccgcgtgcaactgcggagactaatcccttgagcattgtgg 25224805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38331288 - 38331234
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38331288 taaatcgggtatcctccgcgtgcaactgcggagactaatccctcaaacattgtgg 38331234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 128
Target Start/End: Original strand, 44941242 - 44941294
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcat 128  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44941242 ggtataaactggatatcctccgcgcgcaactgcggagactaat-cctcgagcat 44941294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  336 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39950376 - 39950320
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    ||||||||| || |||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39950376 ggtataaattgggtatcctccgcatgcaactgcggagactaatccttcgagcattgt 39950320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18252293 - 18252517
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252293 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18252392  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252393 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18252492  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18252493 gttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18532458 - 18532234
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532458 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18532359  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532358 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18532259  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18532258 gttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27131353 - 27131130
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131353 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 27131254  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131253 ttccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 27131155  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27131154 gttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27310521 - 27310297
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27310521 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgta 27310422  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27310421 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttg 27310322  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27310321 gttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16358975 - 16358755
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358975 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 16358876  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16358875 acccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttg 16358776  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16358775 atgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3855863 - 3855639
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3855863 ttaggagtaatatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgta 3855764  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3855763 ttccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 3855664  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  3855663 gttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22641817 - 22641594
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22641817 ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgta 22641719  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22641718 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttg 22641619  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  22641618 gtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 36816577 - 36816354
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  36816577 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaa-attatcatagtgatggtggtgta 36816479  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  36816478 ttccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttg 36816379  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||| |||||||||  |||||||    
T  36816378 gttgataggtactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27277501 - 27277278
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277501 ttaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgta 27277403  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  27277402 ttccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttg 27277303  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277302 gttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 305 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916497
Alignment:
Q  305 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactatgta 402  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  403 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 273 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21171177 - 21171081
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171177 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19706659 - 19706439
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  19706659 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 19706563  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  19706562 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 19706464  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  19706463 gttgatgggtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28134943 - 28134723
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  28134943 ttaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 28134847  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  28134846 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 28134748  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  28134747 gttgatgggtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43802585 - 43802365
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  43802585 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 43802489  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  43802488 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 43802390  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  43802389 gttgatgggtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20391459 - 20391239
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  20391459 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgta 20391363  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | || | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  20391362 taccgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 20391264  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  20391263 gttgatgggtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 9456198 - 9456418
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  9456198 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 9456294  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  9456295 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 9456393  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  9456394 gttgatgggcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20779865 - 20779645
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  20779865 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 20779769  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  20779768 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 20779670  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  20779669 gttgatgggcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22670477 - 22670257
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  22670477 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 22670381  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  22670380 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 22670282  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  22670281 gttgatgggcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42817209 - 42816989
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  42817209 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 42817113  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  42817112 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 42817014  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  42817013 gttgatgggcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 477
Target Start/End: Original strand, 634016 - 634216
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  634016 ttaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 634112  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  634113 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 634211  T
Q  473 gttga 477  Q
    |||||    
T  634212 gttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 497
Target Start/End: Original strand, 22612577 - 22612794
Alignment:
Q  276 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||      
T  22612577 ggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatat 22612673  T
Q  376 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 475  Q
    | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||| |||||||    
T  22612674 cgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggtt 22612772  T
Q  476 gatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| ||||  ||||||||||    
T  22612773 gatggctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 8727749 - 8727969
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  8727749 ttagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgta 8727845  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||    
T  8727846 tatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattg 8727944  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    | | |||||||||  ||||||||||    
T  8727945 gctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 497
Target Start/End: Original strand, 23507164 - 23507385
Alignment:
Q  274 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| ||  || ||| || |||  | |||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  23507164 taggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacgttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagta 23507260  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| |||||||||||||| | |    
T  23507261 tgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcg 23507360  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  23507361 atttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 481
Target Start/End: Original strand, 29096804 - 29097008
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  29096804 ttaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcataatgataatggtgtt 29096900  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||  |||| || |||| ||| |  | ||||||||||| || |||| ||||| || |||| ||||    
T  29096901 tcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat-atggactcaagtgttttatttcgattcaaacgttatctgtaataggataaccataacgttg 29096999  T
Q  473 gttgatggg 481  Q
    ||| |||||    
T  29097000 gttaatggg 29097008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 47667654 - 47667485
Alignment:
Q  326 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc 425  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || |||||    
T  47667654 aagttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgc 47667557  T
Q  426 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47667556 tttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  384 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 483  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  484 ctccatgaatcatg 497  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 49071737 - 49071683
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49071737 taaatcggatatcttccgcacgcaactgcggagactaatctctcgagcattgtgg 49071683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21881596 - 21881475
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||| || || ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  21881596 ttaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataacggtgta 21881500  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccact 397  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881499 taccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16756242 - 16756188
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756242 taaatcgagtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 16756188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 18428123 - 18428177
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18428123 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcagagactaatccctcgagcattgtgg 18428177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12014224 - 12014084
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattc 375  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | | ||||   ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  12014224 gagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtattt 12014128  T
Q  376 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc 419  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014127 cacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22657161 - 22657108
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 330  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657161 gagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 125
Target Start/End: Original strand, 7242787 - 7242834
Alignment:
Q  77 tataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgag 125  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7242787 tataaatcgg-tatcttccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgag 7242834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36816838 - 36816802
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816838 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 36816802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 42297432 - 42297476
Alignment:
Q  88 tatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42297432 tatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 42297476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 400
Target Start/End: Original strand, 51997361 - 51997485
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| ||||| || | ||    
T  51997361 ttaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgataatgatata 51997457  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    | |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997458 taccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24301774 - 24301691
Alignment:
Q  327 agttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagat 410  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| || ||||  ||||||||    
T  24301774 agttatgttaagtatcataagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatgatccctagat 24301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15642615 - 15642561
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15642615 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcggagaataatctctcgagcattgtgg 15642561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  350 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 430  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 18252031 - 18252068
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252031 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18252068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18532720 - 18532683
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532720 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18532683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27131615 - 27131578
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131615 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 27131578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 35930664 - 35930713
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930664 ttaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16359236 - 16359204
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359236 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 16359204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21171434 - 21171402
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171434 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 21171402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27310778 - 27310746
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310778 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 27310746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  336 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 395  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26923604 - 26923553
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 324  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26923604 ttaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22657428 - 22657390
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattga-ttttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22657428 caagacatttctttattgatttttgttttgtttcaaaat 22657390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36806771 - 36806717
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36806771 taaaccgggtatcctccgcgtgcaactgcagagactaatccctcgagcattgtgg 36806717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 132
Target Start/End: Original strand, 6607700 - 6607728
Alignment:
Q  104 ctgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6607700 ctgcggagactaatccctcgagcattgtg 6607728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27277760 - 27277724
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27277760 aagacatttctttgttgtttttgttttgtttcaaaat 27277724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  279 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 358  Q
    |||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 273 - 496
Target Start/End: Original strand, 21940928 - 21941151
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940928 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 21941027  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941028 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 21941127  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcat 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21941128 gttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 15326461 - 15326685
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326461 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15326560  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326561 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15326660  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15326661 gttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 15506830 - 15507054
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506830 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15506929  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506930 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15507029  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15507030 gttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Original strand, 22171754 - 22171974
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171754 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 22171853  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171854 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 22171953  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22171954 atgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 6094386 - 6094610
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094386 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 6094485  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6094486 ttccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttg 6094585  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6094586 gttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 24642912 - 24643135
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642912 ttaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgta 24643010  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24643011 ttccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttg 24643110  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24643111 gttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 356 - 497
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  356 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  456 ggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24797328 - 24797224
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24797328 gagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattcc 24797230  T
Q  377 accctt 382  Q
    ||||||    
T  24797229 accctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8371469 - 8371253
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  |    
T  8371469 gagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatc 8371373  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
     | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||||    
T  8371372 gctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttg 8371274  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  8371273 atgggtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 273 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 14983864 - 14983710
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14983864 ttaggagtaatatt-atattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgt 14983769  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 430  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983768 attccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 12562205 - 12562425
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  12562205 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 12562301  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  12562302 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 12562400  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12562401 gttgatgggtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 21969415 - 21969635
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  21969415 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 21969511  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  21969512 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 21969610  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  21969611 gttgatgggtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22659714 - 22659494
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  22659714 ttaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 22659618  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  22659617 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttg 22659519  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  22659518 gttgatgggtacttgatgaatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 25611277 - 25611497
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  25611277 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcataagatattctcacaatgataataatgta 25611373  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||  ||||    
T  25611374 tatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttg 25611472  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  25611473 gttgatgggcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27007737 - 27007517
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  27007737 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 27007641  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  27007640 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 27007542  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  27007541 gttgatgggcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27014880 - 27014660
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  27014880 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 27014784  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  27014783 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 27014685  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  27014684 gttgatgggcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27880707 - 27880487
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  27880707 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 27880611  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  27880610 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 27880512  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  27880511 gttgatgggcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 28020888 - 28020668
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  28020888 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 28020792  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  28020791 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 28020693  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  28020692 gttgatgggcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22130829 - 22130609
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  22130829 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 22130733  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||    
T  22130732 tatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttg 22130634  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  22130633 gttgatgggcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 21916758 - 21916978
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  21916758 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 21916854  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||  |||    
T  21916855 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttg 21916953  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  21916954 gttgatgggcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 26240566 - 26240786
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  ||||    
T  26240566 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgattataatgta 26240662  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |||| ||||    
T  26240663 tatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttg 26240761  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  26240762 gttgatgggtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 45534493 - 45534273
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  45534493 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 45534397  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||| || |||| ||||    
T  45534396 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttg 45534298  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  45534297 gttgatgggtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 6430968 - 6431188
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  6430968 ttaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 6431064  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  6431065 tatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 6431163  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  6431164 gttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8782095 - 8781959
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  8782095 ttaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgta 8781999  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  8781998 taccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatgt 8781959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 38232315 - 38232115
Alignment:
Q  279 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattcca 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  38232315 gtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattcca 38232219  T
Q  378 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 477  Q
     |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  38232218 tcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttga 38232119  T
Q  478 tggg 481  Q
    ||||    
T  38232118 tggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  390 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactcc 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 400
Target Start/End: Original strand, 18835432 - 18835556
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18835432 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgataatggtgta 18835528  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    |  ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18835529 tatcactcttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535226
Alignment:
Q  294 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 393  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  394 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 481  Q
    |||||||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535312 cactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2963156 - 2962932
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  |||||| |   | |||||||||||||||||| | ||||| | |     
T  2963156 ttaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagc 2963059  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    ||||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | || ||||| || |||| |    
T  2963058 gtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaaaggataaccataacg 2962960  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962959 ttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 4125005 - 4125059
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4125005 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 4125059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2744093 - 2744039
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2744093 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 2744039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 502
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  384 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 483  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  484 ctccatgaatcatgatgat 502  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 501
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  384 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 483  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  484 ctccatgaatcatgatga 501  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 133
Target Start/End: Original strand, 7839243 - 7839288
Alignment:
Q  88 tatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7839243 tatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 7839288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 6094125 - 6094161
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094125 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 6094161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 24642651 - 24642687
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642651 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 24642687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8521857 - 8521804
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8521857 taaatcgggtatcttccgcgcgcaactg-ggatactaatccctcgagcattgtgg 8521804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 470
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645797
Alignment:
Q  348 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgt 447  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||| || | | ||||||   | |||||| |||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaacttctacgtatcctagatataggattcaatttctttgtagacgttcaaatgttgt 29645774  T
Q  448 ccgtaacaggatgactataaagt 470  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  29645775 ttgtaaaaggatgactataaagt 29645797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39086891 - 39086858
Alignment:
Q  100 gcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39086891 gcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 39086858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 133
Target Start/End: Original strand, 12958084 - 12958120
Alignment:
Q  97 cgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12958084 cgcgctactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 12958120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 21940671 - 21940703
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940671 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 21940703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 24636856 - 24636892
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24636856 aagacatttctttcttgattttgttttgtttcaaaat 24636892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30936168 - 30936112
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    |||||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30936168 ggtataaaccgggtaacatccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgaacattgt 30936112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 133
Target Start/End: Original strand, 13468745 - 13468780
Alignment:
Q  98 gcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13468745 gcgcaactgcggagactaatccttcgagcattgtgg 13468780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  436 ttcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 133
Target Start/End: Original strand, 19715724 - 19715761
Alignment:
Q  97 cgcgcaactgcggagactaat-ccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19715724 cgcgcaactgcggagactaatcccctcgagcattgtgg 19715761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 28554889 - 28554921
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28554889 catttctttattgattttgtttagtttcaaaat 28554921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32872729 - 32872609
Alignment:
Q  336 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacca 435  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |  |||||||||||| || ||| ||||| | |||| ||| ||||||         
T  32872729 aagtatcataaattattatcatagtgatattggtgtatgtcacccttcaatttgaaaccactatctatccttgatgtagaagtcaagtactttgttgttg 32872630  T
Q  436 ttcaaacgttgtccgtaacag 456  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  32872629 ttcaaacgttgtccataacag 32872609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  437 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 485  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  437 tcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtact 485  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 7370 - 7594
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7370 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 7469  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470 ttccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 7569  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7570 gttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 264
Target Start/End: Original strand, 7114 - 7145
Alignment:
Q  233 atttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7114 atttctttattgattttgttttgtttcaaaat 7145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 6878 - 6654
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 6779  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6778 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttg 6679  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6678 gttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13894 - 13670
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 13795  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13794 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 13695  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13694 gttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7140 - 7103
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7140 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 7103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14156 - 14119
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 14119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 493
Target Start/End: Original strand, 15152706 - 15152926
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152706 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 15152805  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152806 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 15152905  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaat 493  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15152906 gttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 29328047 - 29328271
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328047 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 29328146  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328147 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 29328246  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  29328247 cttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11536006 - 11535782
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11536006 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgta 11535907  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535906 ttccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 11535807  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11535806 gttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Original strand, 12751093 - 12751313
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751093 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 12751192  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751193 acccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 12751292  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  12751293 atggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11542924 - 11542700
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11542924 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgta 11542825  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11542824 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttg 11542725  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11542724 gttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 280 - 497
Target Start/End: Original strand, 12738806 - 12739023
Alignment:
Q  280 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738806 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 12738905  T
Q  380 cttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatg 479  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738906 gttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatg 12739005  T
Q  480 ggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12739006 ggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 13392413 - 13392637
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392413 ttaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 13392512  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||    
T  13392513 ttccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattg 13392612  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13392613 gttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18561270 - 18561485
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||    
T  18561270 ttaggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgta 18561360  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561361 ttccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18561460  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
     ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561461 attgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 273 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18257786 - 18257559
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||| |||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18257786 ttaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagtat--gtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgta 18257689  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  18257688 tatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttg 18257590  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 503  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257589 gttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 2365185 - 2365407
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  2365185 ttaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacataggaa--gttatgtaaa-tgtcataagttattctcattgtgataagtggtgt 2365281  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||     
T  2365282 atttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaacagattgactataaagtc 2365381  T
Q  472 ggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365382 ggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 2204634 - 2204854
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  2204634 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 2204730  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  2204731 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 2204829  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  2204830 gttgatgggcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 8465081 - 8465301
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  8465081 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 8465177  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  8465178 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttg 8465276  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  8465277 gttgatgggtacttgatgaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18400186 - 18400406
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  18400186 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 18400282  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  18400283 tatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 18400381  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  18400382 gttgatgggcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18407170 - 18407390
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  18407170 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 18407266  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  18407267 tatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 18407365  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  18407366 gttgatgggcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 41681184 - 41680968
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  41681184 gagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 41681088  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
     | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||    
T  41681087 gctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttg 41680989  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    || ||||||  ||||||||||    
T  41680988 attggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 48808716 - 48808496
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  48808716 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 48808620  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  48808619 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 48808521  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  48808520 gttgatgggcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 15729833 - 15730053
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  15729833 ttagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 15729929  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |    | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  15729930 tattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 15730028  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  15730029 gttgatgggtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18139558 - 18139338
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  18139558 ttaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgta 18139462  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  18139461 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttg 18139363  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  18139362 gttgatgggtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 19230970 - 19231190
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  19230970 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 19231066  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| ||||    
T  19231067 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttg 19231165  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  19231166 gttgatgggtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 485
Target Start/End: Original strand, 30254220 - 30254428
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  30254220 ttaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 30254316  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |   || ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  30254317 tattactcttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 30254415  T
Q  473 gttgatgggtact 485  Q
    |||||||||||||    
T  30254416 gttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 34128655 - 34128875
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||||| |  |||||||||||||||||| | | ||| | |||||    
T  34128655 ttaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattataatagtgta 34128751  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  34128752 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 34128850  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  34128851 gttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 47167075 - 47166871
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  47167075 gagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 47166979  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
     | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||    
T  47166978 gctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttg 47166880  T
Q  477 atgggtact 485  Q
    |||||||||    
T  47166879 atgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18259339 - 18259124
Alignment:
Q  278 agtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 377  Q
    ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |     
T  18259339 agtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcg 18259243  T
Q  378 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 477  Q
    | ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||    
T  18259242 ctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 18259144  T
Q  478 tgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  18259143 tgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24443547 - 24443349
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | || || ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  24443547 ttaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgta 24443451  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| ||| |||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  24443450 taacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttg 24443352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25845696 - 25845498
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||    
T  25845696 ttaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgta 25845600  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| ||||    
T  25845599 taccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttg 25845501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 273 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25846115 - 25845917
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||    
T  25846115 ttaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgta 25846019  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| ||||    
T  25846018 taccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttg 25845920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 497
Target Start/End: Original strand, 28130645 - 28130863
Alignment:
Q  275 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| |||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||     
T  28130645 aggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaataataatagtgtata 28130741  T
Q  375 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 474  Q
     ||  ||| ||||||||| |||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||    
T  28130742 tcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggt 28130840  T
Q  475 tgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  28130841 tgatgggtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 10669122 - 10668901
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgt 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||    
T  10669122 ttaggagtaatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgt 10669026  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    ||  | | ||| |||||||||||||||||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| |||    
T  10669025 atatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgtt 10668927  T
Q  472 ggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10668926 ggttgatgggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31190659 - 31190524
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31190659 ttaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgta 31190563  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatg 411  Q
    |  |||  || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  31190562 tatcactgttagacctgaaaccactaagatccctagatg 31190524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 486
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  349 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 448  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  449 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactc 486  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 19393644 - 19393462
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  19393644 ttaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgta 19393548  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 459  Q
    |  ||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  19393547 tatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaaaaggat 19393462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 412
Target Start/End: Original strand, 19388634 - 19388774
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  19388634 ttaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtggtaatagtg 19388732  T
Q  371 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19388733 tataccactcttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 14591932 - 14592153
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  14591932 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgataatagtgta 14592028  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  14592029 tatcactcttagacttgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 14592128  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    | | |||||||||  ||||||||||    
T  14592129 gctaatgggtacttgatgaatcatg 14592153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 16011523 - 16011744
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  16011523 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgataataatgta 16011619  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |   |  | | |||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  16011620 tatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatgtggacttacatttctttattgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttg 16011719  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    | | |||||||||  ||||||||||    
T  16011720 gctaatgggtacttgatgaatcatg 16011744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  309 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctag 408  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||  ||| ||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  409 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||| || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 397
Target Start/End: Original strand, 22969032 - 22969153
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||| || || ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  22969032 ttaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataacggtgta 22969128  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccact 397  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969129 taccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  348 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 423  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31492263 - 31492209
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31492263 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 31492209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 129
Target Start/End: Original strand, 37339710 - 37339764
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcatt 129  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37339710 ggtataaatcgggtatcctccgtgcgcaactgcggagactaatccctcgagcatt 37339764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29059965 - 29059911
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29059965 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatccctcaagcattgtgg 29059911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35708008 - 35707954
Alignment:
Q  77 tataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    |||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35708008 tataaaccgggtatcctccacgcgcaactgcagagactaatccctcgagcattgt 35707954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11536268 - 11536231
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536268 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 11536231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20207638 - 20207605
Alignment:
Q  98 gcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20207638 gcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 20207605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28665229 - 28665196
Alignment:
Q  100 gcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28665229 gcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 28665196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 29327785 - 29327822
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327785 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 29327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11543181 - 11543149
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543181 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 11543149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 12738538 - 12738574
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12738538 aagacatttctttattgattttattttgtttcaaaat 12738574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18258043 - 18258011
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18258043 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18258011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 18561013 - 18561045
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561013 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18561045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 262
Target Start/End: Original strand, 12750832 - 12750862
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750832 catttctttattgattttgttttgtttcaaa 12750862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 131
Target Start/End: Original strand, 36821079 - 36821113
Alignment:
Q  97 cgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36821079 cgcgcaactgcagagactaatccctcgagcattgt 36821113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 45779004 - 45778971
Alignment:
Q  99 cgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45779004 cgcaactgcggagactaatccctcgagtattgtg 45778971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 13392153 - 13392189
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13392153 aagacatttctttgttgactttgttttgtttcaaaat 13392189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 15148148 - 15148180
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15148148 catttctttattgagtttgttttgtttcaaaat 15148180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Original strand, 15152449 - 15152481
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152449 catttctttattgagtttgttttgtttcaaaat 15152481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 133
Target Start/End: Original strand, 19477249 - 19477284
Alignment:
Q  97 cgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19477249 cgcgcaactgcggagactaatccctc-agcattgtgg 19477284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984372
Alignment:
Q  343 ataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtacccta 407  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtacccta 29984372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18551 - 18774
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 18650  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18651 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 18750  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  18751 gttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 18289 - 18326
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289 caaggcatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 18326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 21330188 - 21329968
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330188 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 21330089  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330088 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttg 21329989  T
Q  477 atgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  21329988 atggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 18796769 - 18796993
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18796769 ttaggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgta 18796868  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18796869 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagttt 18796968  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18796969 gttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 273 - 503
Target Start/End: Original strand, 18620067 - 18620296
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18620067 ttaggagtaatatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatggtgatattggtgta 18620165  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||    
T  18620166 tcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttg 18620265  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 503  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18620266 gttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 36270429 - 36270650
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||  ||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  36270429 ttaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatagaaaa--ttatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgt 36270525  T
Q  372 attccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtt 471  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  36270526 attc-acccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtc 36270624  T
Q  472 ggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36270625 ggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 6992054 - 6991847
Alignment:
Q  275 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtat 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  ||||| || ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  6992054 aggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgtaa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtat 6991958  T
Q  374 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |    
T  6991957 tccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcg 6991858  T
Q  473 gttgatgggta 483  Q
    |||||||||||    
T  6991857 gttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 497
Target Start/End: Original strand, 20978142 - 20978360
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattc 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20978142 gagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatggaaaa--ttatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattc 20978238  T
Q  376 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 475  Q
    ||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||    
T  20978239 cactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagtactttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgatt 20978338  T
Q  476 gatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| |||||||  |||||||    
T  20978339 gatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 30174459 - 30174679
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  30174459 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 30174555  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  30174556 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 30174654  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  30174655 gttgatgggcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24250252 - 24250032
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  24250252 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 24250156  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  24250155 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 24250057  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  24250056 gttgatgggcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 279 - 485
Target Start/End: Original strand, 18822352 - 18822556
Alignment:
Q  279 gtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattcca 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |||||| ||||  ||  |||  |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  18822352 gtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattcca 18822448  T
Q  378 cccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttga 477  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  18822449 cccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaa 18822548  T
Q  478 tgggtact 485  Q
    ||||||||    
T  18822549 tgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15342222 - 15342014
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15342222 ttaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcacaatgatagtggtgta 15342126  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  15342125 tgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacaggatgaccataacgttg 15342027  T
Q  473 gttgatgggtact 485  Q
    ||| |||||||||    
T  15342026 gttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24229435 - 24229215
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  24229435 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgta 24229339  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| | | |||||||||||||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  24229338 tatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 24229240  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||    
T  24229239 gttgaagggtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  334 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 433  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  434 cattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 273 - 499
Target Start/End: Original strand, 29800553 - 29800775
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||    
T  29800553 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgta 29800649  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||| ||||    
T  29800650 taccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttg 29800748  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatgat 499  Q
    ||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  29800749 gttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22183354 - 22183206
Alignment:
Q  350 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 448  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||     
T  22183354 attctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtt 22183255  T
Q  449 cgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183254 tgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 412
Target Start/End: Original strand, 19616517 - 19616653
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||| ||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||    
T  19616517 ttaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgta 19616613  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19616614 tatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40301156 - 40301034
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  40301156 ttagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgataatgatgta 40301061  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactat 399  Q
    | |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301060 taccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  350 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 400
Target Start/End: Original strand, 21626836 - 21626955
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||    
T  21626836 gagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgataatagtgtctacc 21626931  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    ||  || ||||||||| |||||||    
T  21626932 actgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25423906 - 25423850
Alignment:
Q  77 tataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25423906 tataaatcgggtatcctccacgcgcaactgctgagactaatccctcgagcattgtgg 25423850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41316496 - 41316305
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || | || ||    
T  41316496 gagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataacggagaatacc 41316400  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  41316399 attcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactataaagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 497
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  430 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17981660 - 17981603
Alignment:
Q  76 gtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17981660 gtataaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatctctcgagcattgtgg 17981603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21330454 - 21330417
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330454 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 21330417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19692741 - 19692705
Alignment:
Q  228 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692741 aagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 19692705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  336 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgt 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14551638 - 14551582
Alignment:
Q  75 ggtataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgt 131  Q
    |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14551638 ggtataaatcgagtatcctctgcgcgcaactgcggagattaatccctcgagcattgt 14551582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 132
Target Start/End: Original strand, 18105342 - 18105396
Alignment:
Q  77 tataaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtg 132  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18105342 tataaaccggatatcctccgcgcgcaactgc-gagactaatccctcgagtattgtg 18105396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5394556 - 5394502
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5394556 taaatcgagtatcctccgcgtgcaactgcggagactaatcccacgagcattgtgg 5394502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17655801 - 17655767
Alignment:
Q  99 cgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17655801 cgcaactgcggagactaatccctcgagccttgtgg 17655767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 322
Target Start/End: Original strand, 19279554 - 19279600
Alignment:
Q  276 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279554 ggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 31579210 - 31579264
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31579210 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggaaactaattcctcgagcattgtgg 31579264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 37179982 - 37180036
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37179982 taaatcgggtatcctccgcgcgcaagtgcgtagactaatccctcgagtattgtgg 37180036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 42745097 - 42745151
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42745097 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgctgagactaatccctcgaccattgtgg 42745151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Original strand, 9438123 - 9438171
Alignment:
Q  85 ggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9438123 ggatatcctccgcgcgcaactgtggaaactaatccctcaagcattgtgg 9438171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 133
Target Start/End: Original strand, 37092198 - 37092230
Alignment:
Q  101 caactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37092198 caactgcggagactaatccctcgagcactgtgg 37092230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 277 - 478
Target Start/End: Original strand, 1260 - 1461
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1260 gagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 1359  T
Q  377 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttg 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1360 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttg 1459  T
Q  477 at 478  Q
    ||    
T  1460 at 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Original strand, 994 - 1031
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  994 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 1031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 230335 - 230111
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230335 ttaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 230236  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  230235 ttctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaaacgttgtctgtaacaagatgacaataaagttg 230136  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230135 gttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 230541 - 230509
Alignment:
Q  232 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230541 catttctttattgattttgttttgtttcaaaat 230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 273 - 501
Target Start/End: Original strand, 5792 - 6013
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||              
T  5792 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcatagtgc--------- 5882  T
Q  372 attccaccctt-cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 470  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5883 attccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 5982  T
Q  471 tggttgatgggtactccatgaatcatgatga 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5983 tggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13169 - 12961
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  13169 ttaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgta 13073  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||    
T  13072 tatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttg 12974  T
Q  473 gttgatgggtact 485  Q
    |||||||||||||    
T  12973 gttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 265 - 485
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  265 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 361  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||| ||||    
T  362 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttg 460  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  461 gttgatgggtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 67594 - 67374
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||| | ||||| | |||||    
T  67594 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgta 67498  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  67497 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 67399  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  67398 gttgatgggtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3895 - 3675
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  3895 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 3799  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  3798 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 3700  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  3699 gttgatgggcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 119812 - 120032
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  119812 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 119908  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  119909 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttg 120007  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||    
T  120008 gttgatgggcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Original strand, 26624 - 26844
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  26624 ttaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatagtgta 26720  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| ||||| || |||| ||||    
T  26721 tatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttg 26819  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    | | |||||||||| ||||||||||    
T  26820 gataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 130444 - 130262
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  130444 ttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 130348  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggat 459  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  130347 tatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggat 130262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 497
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  307 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 406  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  407 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 469
Target Start/End: Original strand, 8813 - 9005
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8813 ttaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataatggtgta 8909  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    | |||| | | ||||||||||||| |||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8910 taccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40208 - 39988
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || |  ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40208 ttaggagtaatatttataccggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgta 40112  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttg 472  Q
    |   || ||| ||| |||||||||||||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||    
T  40111 tataactcttagacttgaaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttg 40013  T
Q  473 gttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    | | |||| ||||  ||||||||||    
T  40012 gctaatggttacttgatgaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 400
Target Start/End: Original strand, 8387 - 8511
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  8387 ttaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcacaatgataataatgta 8483  T
Q  373 ttccacccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    |  | | ||| |||||||||||||||||    
T  8484 tatcgctcttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 83230 - 83111
Alignment:
Q  278 agtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca 377  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  83230 agtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagtat--gttacgaag-gtgtcataagatattatcatagtcatattggtgtactcca 83134  T
Q  378 cccttcgacctgaaaccactatg 400  Q
    | ||| |||||||||||| ||||    
T  83133 ctcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11750 - 11526
Alignment:
Q  273 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | |||||   ||    
T  11750 ttaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatgataacagt 11653  T
Q  370 gtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaag 469  Q
    |||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| |    
T  11652 gtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacg 11554  T
Q  470 ttggttgatgggtactccatgaatcatg 497  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11553 ttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8509 - 8472
Alignment:
Q  227 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8509 caagacatttctttattgattttgttttgtttcaaaat 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 29133 - 29187
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29133 taaatcgggtatcctccgcgcgcaactgtggagactaatcccacgagcattgtgg 29187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 373
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  277 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 373  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 384 - 497
Target Start/End: Original strand, 53955 - 54066
Alignment:
Q  384 gacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggta 483  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  53955 gacctgaaaccactatgatccctaggtgt-ggactcaagtgctttatg-ccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 54052  T
Q  484 ctccatgaatcatg 497  Q
    ||  ||||||||||    
T  54053 cttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26491 - 26437
Alignment:
Q  79 taaatcggatatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcattgtgg 133  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26491 taaaccgggtatcctccgcgcgcaactgcggagactaatctctcgaacattgtgg 26437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 128
Target Start/End: Original strand, 27215 - 27255
Alignment:
Q  88 tatcttcctcgcgcaactgcggagactaatccctcgagcat 128  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27215 tatcctccgcgcgcaactgcgaagactaatccctcgagcat 27255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University