View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19149_low_1 (Length: 712)

Name: NF19149_low_1
Description: NF19149
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19149_low_1
NF19149_low_1
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (466-697)||(32096903-32097133)
chr5 (465-695)||(28531424-28531653)
chr5 (506-697)||(32094142-32094332)
chr5 (465-695)||(12692223-12692452)
chr5 (506-695)||(28525369-28525557)
chr5 (506-695)||(12686162-12686350)
chr5 (506-679)||(7389531-7389702)
chr5 (474-683)||(24054334-24054545)
chr5 (462-666)||(19066046-19066249)
chr5 (590-697)||(20500124-20500231)
chr5 (506-668)||(41297292-41297453)
chr5 (592-697)||(30772269-30772374)
chr5 (505-680)||(30384358-30384533)
chr5 (512-648)||(14610184-14610321)
chr5 (506-659)||(16215157-16215309)
chr5 (505-694)||(19059746-19059936)
chr5 (589-651)||(28542270-28542332)
chr5 (591-635)||(37896365-37896409)
chr5 (589-697)||(26509838-26509944)
chr5 (637-697)||(8706535-8706595)
chr5 (502-560)||(30772407-30772464)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (469-695)||(31002365-31002591)
chr2 (454-695)||(13456088-13456328)
chr2 (465-695)||(35090592-35090820)
chr2 (506-695)||(31008343-31008532)
chr2 (506-695)||(30965316-30965505)
chr2 (506-693)||(36750405-36750591)
chr2 (506-695)||(13462029-13462217)
chr2 (506-695)||(28682928-28683116)
chr2 (511-695)||(13149674-13149855)
chr2 (512-695)||(35084665-35084847)
chr2 (505-679)||(44716786-44716960)
chr2 (506-694)||(35438693-35438870)
chr2 (506-694)||(11048536-11048723)
chr2 (469-697)||(29833197-29833421)
chr2 (589-665)||(23343579-23343655)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (465-695)||(32890877-32891106)
chr8 (465-679)||(42992946-42993158)
chr8 (506-695)||(5542143-5542331)
chr8 (506-693)||(9935269-9935455)
chr8 (506-695)||(32897001-32897189)
chr8 (505-695)||(10705826-10706021)
chr8 (506-693)||(14417931-14418114)
chr8 (506-673)||(14799399-14799564)
chr8 (505-673)||(7771242-7771409)
chr8 (506-679)||(36818976-36819147)
chr8 (497-697)||(1882725-1882928)
chr8 (489-697)||(39735514-39735724)
chr8 (471-695)||(10700018-10700222)
chr8 (591-697)||(22219784-22219891)
chr8 (505-697)||(39727299-39727484)
chr8 (614-697)||(1171333-1171414)
chr8 (466-516)||(31373510-31373560)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (465-695)||(49151600-49151829)
chr3 (454-695)||(42197093-42197333)
chr3 (463-691)||(10766811-10767038)
chr3 (476-695)||(11846016-11846234)
chr3 (471-695)||(10244282-10244505)
chr3 (465-695)||(38455494-38455721)
chr3 (506-695)||(10760633-10760821)
chr3 (491-695)||(17593249-17593453)
chr3 (506-695)||(11839708-11839896)
chr3 (506-695)||(49157667-49157855)
chr3 (506-694)||(8331776-8331963)
chr3 (506-693)||(17055775-17055962)
chr3 (505-695)||(42191202-42191391)
chr3 (506-695)||(10238195-10238383)
chr3 (506-693)||(30051085-30051271)
chr3 (506-695)||(38449048-38449234)
chr3 (509-693)||(55003398-55003581)
chr3 (589-697)||(34300483-34300591)
chr3 (505-640)||(28964911-28965043)
chr3 (512-684)||(53069043-53069215)
chr3 (506-697)||(48128030-48128220)
chr3 (600-695)||(13445049-13445144)
chr3 (600-697)||(46656670-46656767)
chr3 (589-677)||(12108733-12108820)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (466-679)||(25343629-25343845)
chr6 (506-695)||(25354200-25354388)
chr6 (503-695)||(21782733-21782924)
chr6 (465-665)||(8662723-8662922)
chr6 (505-695)||(8650785-8650974)
chr6 (506-695)||(32035269-32035457)
chr6 (506-695)||(21190849-21191037)
chr6 (465-697)||(21196963-21197192)
chr6 (512-697)||(21770546-21770729)
chr6 (506-679)||(4580304-4580476)
chr6 (506-697)||(31756196-31756388)
chr6 (552-697)||(21783337-21783480)
chr6 (552-697)||(21789560-21789703)
chr6 (505-693)||(18778573-18778761)
chr6 (589-697)||(17581621-17581720)
chr6 (473-559)||(6098105-6098191)
chr6 (589-652)||(34603395-34603458)
chr6 (589-652)||(34724672-34724735)
chr6 (608-665)||(6097999-6098055)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (469-695)||(3817257-3817482)
chr7 (505-695)||(20238939-20239128)
chr7 (463-677)||(339377-339590)
chr7 (505-695)||(42767276-42767466)
chr7 (506-695)||(3811152-3811340)
chr7 (506-695)||(28420942-28421130)
chr7 (505-695)||(351774-351963)
chr7 (506-679)||(5979156-5979329)
chr7 (506-692)||(35147986-35148173)
chr7 (590-697)||(26383612-26383719)
chr7 (505-668)||(12804015-12804177)
chr7 (501-697)||(5849511-5849707)
chr7 (591-683)||(30219313-30219405)
chr7 (589-693)||(22741990-22742092)
chr7 (590-679)||(43539989-43540078)
chr7 (641-693)||(15843937-15843989)
chr7 (641-693)||(15861046-15861098)
chr7 (465-515)||(30219216-30219266)
chr7 (589-665)||(18666561-18666635)
chr7 (463-560)||(26381192-26381286)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (506-695)||(33458249-33458438)
chr4 (471-693)||(24287977-24288196)
chr4 (465-697)||(26963283-26963512)
chr4 (471-695)||(10739286-10739510)
chr4 (471-695)||(10953055-10953279)
chr4 (505-695)||(6257187-6257376)
chr4 (463-679)||(48160964-48161175)
chr4 (506-695)||(10733229-10733417)
chr4 (506-695)||(10946998-10947186)
chr4 (465-666)||(49976607-49976804)
chr4 (486-679)||(33461361-33461547)
chr4 (506-679)||(48167183-48167351)
chr4 (592-697)||(4632378-4632482)
chr4 (506-689)||(50168588-50168769)
chr4 (589-684)||(3769567-3769661)
chr4 (589-697)||(44831677-44831785)
chr4 (506-624)||(26956812-26956929)
chr4 (597-697)||(50427354-50427462)
chr4 (505-560)||(4632910-4632964)
chr4 (589-635)||(9237411-9237457)
chr4 (618-697)||(31986745-31986823)
chr4 (590-640)||(28704554-28704604)
chr4 (590-679)||(19686394-19686482)
chr4 (594-635)||(50156005-50156046)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (471-695)||(25387452-25387675)
chr1 (462-679)||(31051549-31051769)
chr1 (510-695)||(34739974-34740158)
chr1 (506-695)||(50306178-50306365)
chr1 (505-679)||(31058049-31058221)
chr1 (505-695)||(1078212-1078401)
chr1 (506-695)||(25381518-25381706)
chr1 (506-697)||(44409998-44410186)
chr1 (542-679)||(8092864-8093001)
chr1 (590-682)||(12183650-12183741)
chr1 (479-670)||(24963657-24963848)
chr1 (471-697)||(38151923-38152142)
chr1 (505-670)||(24926737-24926900)
chr1 (506-628)||(27955216-27955336)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (465-681)||(172832-173047)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (506-695)||(1176-1365)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (505-695)||(5523-5712)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (506-693)||(605-788)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (471-695)||(6511-6734)
scaffold0208 (589-695)||(12384-12490)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (597-697)||(1074-1174)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (589-662)||(5945-6017)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (589-679)||(38434-38522)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 466 - 697
Target Start/End: Original strand, 32096903 - 32097133
Alignment:
Q  466 atcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtac 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  32096903 atcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccatttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaa 32097002  T
Q  566 atcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatac 665  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  32097003 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag-gtattaggattac 32097101  T
Q  666 ctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32097102 ctgaataaagctttcatagcagtcctctcaac 32097133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 695
Target Start/End: Original strand, 28531424 - 28531653
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |     
T  28531424 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatg 28531522  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  28531523 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaata 28531622  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28531623 cctggataaagctttcaaggcagccctctca 28531653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 506 - 697
Target Start/End: Original strand, 32094142 - 32094332
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  32094142 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagattttataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32094241  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32094242 ataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag-gtattaggaatacctgaataaagctttcatagcagccctctcaac 32094332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 465 - 695
Target Start/End: Original strand, 12692223 - 12692452
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  ||    
T  12692223 aatcctaataaatcaaacatgaagacggctctgataccacttgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattata 12692321  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  12692322 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaata 12692421  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12692422 cctggataaagctttcaaggcagccctctca 12692452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 28525369 - 28525557
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  28525369 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28525467  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28525468 atcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 28525557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 12686162 - 12686350
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  12686162 tgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 12686260  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12686261 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 12686350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 7389531 - 7389702
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  7389531 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 7389629  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7389630 atcggatccacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 7389702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 474 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 24054545 - 24054334
Alignment:
Q  474 aaatcaaacatgaagacc-gctctgatacaacttgttggaaattt-aggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaat 571  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  || ||| ||    
T  24054545 aaatcaaacaaaaagacccgctctgataccacttgttgaaaattttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatctat 24054447  T
Q  572 agcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagag-tattaggaatacctgaa 670  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  24054446 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacctgga 24054347  T
Q  671 taaagctttcatg 683  Q
    |||||||||||||    
T  24054346 taaagctttcatg 24054334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 462 - 666
Target Start/End: Original strand, 19066046 - 19066249
Alignment:
Q  462 aaaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatc 561  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||||| ||     
T  19066046 aaaaatcccaataaatcaaacgcgaagaccgctctgataccactagttggaaatttaagtcttaa-taaaaacatatttcataaaccatgttcaacgatt 19066144  T
Q  562 gtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattagga 661  Q
     || |||| ||||||||||        |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  19066145 ataaatcattagcggaagcaaacaaaacattaagcatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattagga 19066244  T
Q  662 atacc 666  Q
    |||||    
T  19066245 atacc 19066249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 590 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20500124
Alignment:
Q  590 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagcc 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggcagcc 20500132  T
Q  690 ctctcaac 697  Q
    ||||||||    
T  20500131 ctctcaac 20500124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 506 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 41297453 - 41297292
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||        |||||||||| ||||||    
T  41297453 tgttggaaatttgggtcttaat-ataaagagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatg 41297355  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41297354 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatataaagaattagggtattaggaatacctg 41297292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 592 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 30772374 - 30772269
Alignment:
Q  592 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccct 691  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  30772374 tgaacatgattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataaagtttttatggcagccct 30772275  T
Q  692 ctcaac 697  Q
    ||||||    
T  30772274 ctcaac 30772269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 505 - 680
Target Start/End: Original strand, 30384358 - 30384533
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaa-caaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgatta 603  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||||| |||||    
T  30384358 ttgttggaaatttaggttttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacacgatta 30384457  T
Q  604 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttc 680  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  30384458 tgatcggatcta-gacatgtctgatttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttc 30384533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 512 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14610321 - 14610184
Alignment:
Q  512 aaatttaggtcttaattaaaaa-caaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcgg 610  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||| |||| ||||||||||||||  |  || ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  14610321 aaatttaggtcttaacaaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaattaatagcggaagcaaataaaccattgaacatgattatgatcgg 14610222  T
Q  611 atctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaat 648  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14610221 atttacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaat 14610184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 506 - 659
Target Start/End: Original strand, 16215157 - 16215309
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||| |||||||||  |  |||||||||||||||        |||| ||||||||||||    
T  16215157 tgttagaaatttaggtctttat-aaaaacagatttcataacacatattcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatg 16215255  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattag 659  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  16215256 attggatctacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagggtattag 16215309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 505 - 694
Target Start/End: Original strand, 19059746 - 19059936
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||| ||  || |||| ||| ||||||         ||| ||||||| |||    
T  19059746 ttgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacatatttcataaaacgtattcaacgattataaatcattaggggaagcaaacaaaatattaaacatgaatat 19059844  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg--aataaagctttcatggcagccctctc 694  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||   || |||||||  |||||||||||||    
T  19059845 aaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctggagatgaagctttggtggcagccctctc 19059936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 589 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 28542332 - 28542270
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattag 651  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28542332 cattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattag 28542270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 591 - 635
Target Start/End: Original strand, 37896365 - 37896409
Alignment:
Q  591 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37896365 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgattgatttatcaa 37896409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 26509944 - 26509838
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    |||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||     
T  26509944 cattgaacataattatgatataaactacgacatatttgattcatcaa-gatattaagaattag-gtattaggaatatatgaatgaagctttgatgacagt 26509847  T
Q  689 cctctcaac 697  Q
    |||||||||    
T  26509846 cctctcaac 26509838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 637 - 697
Target Start/End: Original strand, 8706535 - 8706595
Alignment:
Q  637 gatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  8706535 gatattaagaattagggtattaggaatacctgaattatgctttcatgacaaccatctcaac 8706595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 502 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 30772464 - 30772407
Alignment:
Q  502 aacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaat 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  30772464 aacttgttggaaatttagttcttaa-taaaaataaatttcataaaacatgttcaataat 30772407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 469 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 31002591 - 31002365
Alignment:
Q  469 ccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatc 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31002591 ccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatc 31002492  T
Q  569 aatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg 668  Q
    ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31002491 aatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctg 31002392  T
Q  669 aataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||    
T  31002391 aataaagcttttgtagcagccctctca 31002365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 454 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 13456328 - 13456088
Alignment:
Q  454 ttaaacataaaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgtt 553  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||    
T  13456328 ttaaacaaaataatcctaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgtt 13456230  T
Q  554 caacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagag 653  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |    
T  13456229 caacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattaggg 13456130  T
Q  654 tattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13456129 tattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 13456088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 465 - 695
Target Start/End: Original strand, 35090592 - 35090820
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |     
T  35090592 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttg-aaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatg 35090689  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  35090690 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaata 35090789  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35090790 cctggataaagctttcatggcagccctctca 35090820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 31008532 - 31008343
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  31008532 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 31008433  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  31008432 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctca 31008343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 30965505 - 30965316
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  30965505 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 30965406  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  30965405 atcggatctacgacatgtttgatttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacctgtataaatcttttgtagcagccctctca 30965316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 36750591 - 36750405
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  36750591 tgttggaaatttaagtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 36750493  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  36750492 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctct 36750405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 13462217 - 13462029
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||        |||||||| ||||||||    
T  13462217 tgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatg 13462119  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13462118 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 13462029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 28682928 - 28683116
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  28682928 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28683026  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  28683027 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctca 28683116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 511 - 695
Target Start/End: Original strand, 13149674 - 13149855
Alignment:
Q  511 gaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcgg 610  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  13149674 gaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 13149772  T
Q  611 atctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  13149773 atctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaagaatacctg-ataaaacttttgtagcagccctctca 13149855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 512 - 695
Target Start/End: Original strand, 35084665 - 35084847
Alignment:
Q  512 aaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcgga 611  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||    
T  35084665 aaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcgga 35084763  T
Q  612 tctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35084764 tctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcatggcagccctctca 35084847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 505 - 679
Target Start/End: Original strand, 44716786 - 44716960
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnn-cattgaacatgatta 603  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||||||||||  |  |  |||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  44716786 ttgttagaaatttaggtcttaat-aaaaacagatatcataaaacatgttcaacggttatcaatcaatagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgatta 44716884  T
Q  604 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44716885 tgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 44716960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 506 - 694
Target Start/End: Original strand, 35438693 - 35438870
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  35438693 tgttggaaatttaggccttaat--aaaacaaatttcataaaacatgttcaacagttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 35438790  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||         ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35438791 atcggatctacgacatgtttgatt---------tactaggaaatagggtattaggaatacctgtataaagctttcatggcagccgtctc 35438870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 506 - 694
Target Start/End: Original strand, 11048536 - 11048723
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |||||        |||||||||||||||||    
T  11048536 tgttggaaatttaggtctta-ttaaaaataaatttcataaaacatgtccaacaattatgaatcaatagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 11048634  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctc 694  Q
    || |||| |||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||| | | ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  11048635 attggatatacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagcttttatgacagccctctc 11048723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 469 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 29833421 - 29833197
Alignment:
Q  469 ccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatc 568  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| || ||| | |||| |||||||||||| || ||| ||  |||    
T  29833421 ccaataaatcaaacatgaagactgctctgatactacttgttagaaatttaggt-ataaatataaagagatttcataatacatgtttaataattgtgaatc 29833323  T
Q  569 aatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg 668  Q
    |||| ||||| |         ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||| |||||||||    
T  29833322 aataacggaaacaaataaaatattgaacataattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatc-aagataacaataattag-gtattaagaatacctg 29833225  T
Q  669 aataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
     || ||| ||| ||| || ||||||||||    
T  29833224 gatgaag-tttgatgacaaccctctcaac 29833197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 23343655 - 23343579
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatac 665  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||    
T  23343655 cattgaacatgaatatgaacgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagagttggggtattaggaatac 23343579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 32891106 - 32890877
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |     
T  32891106 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatg 32891008  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32891007 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaata 32890908  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  32890907 cctggataaagctttcaaggcaaccctctca 32890877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 679
Target Start/End: Original strand, 42992946 - 42993158
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |     
T  42992946 aatcccaataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgatggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatg 42993044  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42993045 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaata 42993143  T
Q  665 cctgaataaagcttt 679  Q
    |||  ||||||||||    
T  42993144 ccttgataaagcttt 42993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 5542143 - 5542331
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  5542143 tgttggaaatttaggttttaat-ataaatagattttataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 5542241  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5542242 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaagctttcaaggcagccctctca 5542331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9935455 - 9935269
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||| |||||||||    
T  9935455 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattatg 9935357  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  9935356 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaatctttcatagcagccctct 9935269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 32897189 - 32897001
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  32897189 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32897091  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  32897090 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctca 32897001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 10706021 - 10705826
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||        ||||||||||||||||    
T  10706021 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtaaatcaatagcgtaagcaaacaaaacattgaacatgattat 10705922  T
Q  605 gat------cggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  10705921 gattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctca 10705826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14418114 - 14417931
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||     |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  14418114 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgtttaactatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 14418019  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14418018 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctct 14417931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 506 - 673
Target Start/End: Original strand, 14799399 - 14799564
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  14799399 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 14799497  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataa 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14799498 atcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 14799564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 505 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 7771409 - 7771242
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  7771409 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 7771311  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataa 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7771310 gatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggataa 7771242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 36819147 - 36818976
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||        ||||||| |||||||||    
T  36819147 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatctcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaatatgattatg 36819049  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36819048 atcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 36818976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 497 - 697
Target Start/End: Original strand, 1882725 - 1882928
Alignment:
Q  497 gatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaac 596  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||     |||||||||||||||        ||||||||    
T  1882725 gataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaaacagatttcatagaacatgttcaacaattaagaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaac 1882824  T
Q  597 atgattatgatcggatctac-gacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg--aataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  1882825 atgaatatgaacggatctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggagatgaagctttcatggcagccctct 1882924  T
Q  694 caac 697  Q
    ||||    
T  1882925 caac 1882928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 489 - 697
Target Start/End: Original strand, 39735514 - 39735724
Alignment:
Q  489 accgctctgatacaacttgttggaaatttaggtctt-aat--taaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnn 585  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||| | |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||          
T  39735514 accgctctgataccacttgttggaaatttaggtttttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaata 39735613  T
Q  586 nnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggc 685  Q
        |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  39735614 aaatattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttgatttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacctggataaa-atttcatggc 39735712  T
Q  686 agccctctcaac 697  Q
    | ||||||||||    
T  39735713 aaccctctcaac 39735724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 471 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 10700222 - 10700018
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagacc-gctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatca 569  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |       
T  10700222 aataaatcaaacatgatgacccgagctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacatatttcataatacatgtttaacaatcgtaaa--- 10700126  T
Q  570 atagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctga 669  Q
           ||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||     
T  10700125 -------aa----------cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatatctgg 10700044  T
Q  670 ataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||| ||||  | ||||||||||||    
T  10700043 ataaaacttttgtagcagccctctca 10700018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 591 - 697
Target Start/End: Original strand, 22219784 - 22219891
Alignment:
Q  591 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacct-gaataaagctttcatggcagcc 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||    
T  22219784 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatggcagcc 22219883  T
Q  690 ctctcaac 697  Q
    ||||||||    
T  22219884 ctctcaac 22219891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 505 - 697
Target Start/End: Original strand, 39727299 - 39727484
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaat--taaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgatt 602  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||||| |||||||        ||||||||||||||    
T  39727299 ttgttggaaatttaggtcttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaataacggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 39727398  T
Q  603 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    ||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  39727399 atgatc---------acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaaaactttcttggcaaccctctcaac 39727484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 614 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1171414 - 1171333
Alignment:
Q  614 tacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1171414 tacgacatatttgatttatcaa-gataacaagaattag-gtattaggaatacctggttaaagcttttatggcagctctctcaac 1171333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 516
Target Start/End: Original strand, 31373510 - 31373560
Alignment:
Q  466 atcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31373510 atcccaataaatcaaacatgaagaccgttctgataccacttgttagaaatt 31373560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 49151829 - 49151600
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |     
T  49151829 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatg 49151731  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  49151730 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaata 49151631  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49151630 cctggataaagctttcaaggcagccctctca 49151600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 454 - 695
Target Start/End: Original strand, 42197093 - 42197333
Alignment:
Q  454 ttaaacataaaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgtt 553  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||    
T  42197093 ttaaacaaaataatcctaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgtt 42197191  T
Q  554 caacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagag 653  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |    
T  42197192 caacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattaggg 42197291  T
Q  654 tattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42197292 tattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 42197333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 463 - 691
Target Start/End: Original strand, 10766811 - 10767038
Alignment:
Q  463 aaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcg 562  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  10766811 aaaatctcaataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttggaaatttaggtctta-ttaaaaacaaatttcataatacatgttcaacaatta 10766909  T
Q  563 tacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaa 662  Q
    || ||||| |||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  10766910 taaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgaccggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaa 10767009  T
Q  663 tacctgaataaagctttcatggcagccct 691  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10767010 tacctggataaagctttcaaggcagccct 10767038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 476 - 695
Target Start/End: Original strand, 11846016 - 11846234
Alignment:
Q  476 atcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcg 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11846016 atcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaa-cagattttataatacatgttcaacaattataaatcaatagcg 11846114  T
Q  576 gaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaag 675  Q
    |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11846115 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacctggataaag 11846214  T
Q  676 ctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||  |  |||||||||||    
T  11846215 cttttgtaacagccctctca 11846234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 471 - 695
Target Start/End: Original strand, 10244282 - 10244505
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||    
T  10244282 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 10244380  T
Q  571 tagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaa 670  Q
    ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10244381 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 10244480  T
Q  671 taaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  10244481 taaagctttcaagacagccctctca 10244505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 465 - 695
Target Start/End: Original strand, 38455494 - 38455721
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||    |||| |||||||||||||||||||  ||    
T  38455494 aatcctaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccatttgttggaaatttcggtcttaatataaag---atttcataatacatgttcaacaattata 38455590  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38455591 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 38455690  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  38455691 cctggataaagctttcgaggcagccctctca 38455721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 10760633 - 10760821
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  10760633 tgttggaaatttaggtctta-ttaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 10760731  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10760732 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 10760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 491 - 695
Target Start/End: Original strand, 17593249 - 17593453
Alignment:
Q  491 cgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnnca 590  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||        ||    
T  17593249 cgctctgataacacttgtaggaaatttaggtcttaattaaaaatatatttcataatagatgttcaacaatcgtaaatcaatcgcggaagcaaacaaaaca 17593348  T
Q  591 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccc 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  17593349 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcgaggcagccc 17593448  T
Q  691 tctca 695  Q
    |||||    
T  17593449 tctca 17593453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 11839708 - 11839896
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  11839708 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcatgatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 11839806  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11839807 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 11839896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 49157855 - 49157667
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  49157855 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 49157757  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49157756 atcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 49157667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 506 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 8331963 - 8331776
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  8331963 tgttggaaatttagctcttaat-ataaatagattttataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 8331865  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctc 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8331864 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctc 8331776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Original strand, 17055775 - 17055962
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  17055775 tgttcgaaatttaggtcttaataaaaaacagttttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 17055874  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17055875 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctct 17055962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Original strand, 42191202 - 42191391
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||        |||||||| |||||||    
T  42191202 ttgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattat 42191300  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42191301 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 42191391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 10238195 - 10238383
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  10238195 tgttggaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 10238293  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  10238294 atcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctca 10238383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Original strand, 30051085 - 30051271
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||         |||||||||||||||     
T  30051085 tgttgaaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattata 30051183  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  30051184 atcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcattacagccctct 30051271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 38449048 - 38449234
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||    |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  38449048 tgttggaaatttcggtcttaatataaag---atttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 38449144  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  38449145 atcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcgaggcagccctctca 38449234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 509 - 693
Target Start/End: Original strand, 55003398 - 55003581
Alignment:
Q  509 tggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatc 608  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||    
T  55003398 tggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatc 55003496  T
Q  609 ggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  55003497 ggatctacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagggtattagaaatatctggataaagctttcatagcagccctct 55003581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 589 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 34300591 - 34300483
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34300591 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattaagctttcatggcaac 34300492  T
Q  689 cctctcaac 697  Q
    |||||||||    
T  34300491 cctctcaac 34300483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 505 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 28965043 - 28964911
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||     |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  28965043 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 28964947  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagata 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964946 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagata 28964911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 512 - 684
Target Start/End: Original strand, 53069043 - 53069215
Alignment:
Q  512 aaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcgga 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  53069043 aaatttaggtcttaat-aaaaacagattttataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 53069141  T
Q  612 tctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaatta-gagtattaggaatacctgaataaagctttcatgg 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53069142 tctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacctggataaaactttcatgg 53069215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 506 - 697
Target Start/End: Original strand, 48128030 - 48128220
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||  |  ||||||||||||| |        |||||||||||||||||    
T  48128030 tgttggaaatttaggtctcaat-aaaaacagatttcatgaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatg 48128128  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagta-ttaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  48128129 atcggttctacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagggtattttggaatacctg-ataaaactttcatggcagctctcacaac 48128220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 600 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 13445144 - 13445049
Alignment:
Q  600 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||| |||| ||||||    
T  13445144 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaaacattcatgacagctctctca 13445049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 600 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 46656767 - 46656670
Alignment:
Q  600 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  46656767 attatgatcggatctacgatatgtttgatttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcatgacaaccctctcaac 46656670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 589 - 677
Target Start/End: Original strand, 12108733 - 12108820
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagct 677  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  12108733 cattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaattag-gtattaagaatacctgaatgaagct 12108820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 25343845 - 25343629
Alignment:
Q  466 atcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataata----catgttcaacaatc 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||    
T  25343845 atcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttatatcttaattaaaaacaaatttcataatacatgcatgttcaacaatc 25343746  T
Q  562 gtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattagga 661  Q
    ||| ||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25343745 gtaaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatc-aagatattaagaattagagtattagga 25343647  T
Q  662 atacctgaataaagcttt 679  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  25343646 atacctagataaagcttt 25343629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 25354388 - 25354200
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  25354388 tgttggaaatttagatcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatg 25354289  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  25354288 atcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagccctctca 25354200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 503 - 695
Target Start/End: Original strand, 21782733 - 21782924
Alignment:
Q  503 acttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgatt 602  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  21782733 acttgttagaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 21782831  T
Q  603 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21782832 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatagctggataaagctttcaaggcagccctctca 21782924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 465 - 665
Target Start/End: Original strand, 8662723 - 8662922
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |     
T  8662723 aatcccaataaatcaaacataaagaccgctctgataccacttgttgtaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatg 8662821  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  8662822 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaata 8662921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Original strand, 8650785 - 8650974
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  8650785 ttgttgtaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 8650883  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8650884 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 8650974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 32035269 - 32035457
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  32035269 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32035367  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  32035368 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctca 32035457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 21190849 - 21191037
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  21190849 tgttggaaatttaggtctta-ttataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 21190947  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21190948 atcggatctacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 21191037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 465 - 697
Target Start/End: Original strand, 21196963 - 21197192
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||  |     
T  21196963 aatcctaataaatcaaacataaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcat-agtaaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatg 21197061  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||| |||||    
T  21197062 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatt--agtattatgaata 21197159  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21197160 cctggataaatcttttatggcagccctctcaac 21197192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 512 - 697
Target Start/End: Original strand, 21770546 - 21770729
Alignment:
Q  512 aaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcgga 611  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||         |||||||||| | ||||| ||||    
T  21770546 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgatcaacaatcgtaaattaatagaggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacgga 21770645  T
Q  612 tctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21770646 tctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatt--agtattaggaatatctgaataaagcttttatggcagccctctcaac 21770729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 4580304 - 4580476
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  4580304 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 4580402  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4580403 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 4580476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 697
Target Start/End: Original strand, 31756196 - 31756388
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaa-caaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||| | |||||||        ||||||||||||||||    
T  31756196 tgttggaaatttaggtcttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacaacggaagcaaataaaacattgaacatgattat 31756295  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31756296 aatcggatctacgacatgtttgaattatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcatgacagccctctcaac 31756388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 552 - 697
Target Start/End: Original strand, 21783337 - 21783480
Alignment:
Q  552 ttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattag 651  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||        |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||      
T  21783337 ttcaacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatt-- 21783434  T
Q  652 agtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21783435 agtattaggaatacctgaataaagcttttatggcacccctctcaac 21783480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 552 - 697
Target Start/End: Original strand, 21789560 - 21789703
Alignment:
Q  552 ttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattag 651  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||        |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||      
T  21789560 ttcaacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatt-- 21789657  T
Q  652 agtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21789658 agtattaggaatacctgaataaagcttttatggcacccctctcaac 21789703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 505 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 18778761 - 18778573
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataata-catgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgatta 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||  |  |||||||||||||||        | |||||||| ||||    
T  18778761 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaa-caaatttcataaaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacgttgaacataatta 18778663  T
Q  604 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaatta-gagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18778662 tgatcggatctacgacgtatttgatttatc-aatatattaagaattaggggttttaggaatacctggataaaactttcatggcagccctct 18778573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17581720 - 17581621
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||         ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17581720 cattgaacatgattattataggatctacgacatgtttgatttaccaa---------gaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatgacagc 17581630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 473 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6098191 - 6098105
Alignment:
Q  473 taaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaa 559  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6098191 taaatcaaacatgaagattgctctcataccacttgttgaaaacttaggtcttaataaaaaacaaatttcataaaacatgttcaacaa 6098105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 589 - 652
Target Start/End: Original strand, 34603395 - 34603458
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattaga 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  34603395 cattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaaggatattaacaattaga 34603458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 589 - 652
Target Start/End: Original strand, 34724672 - 34724735
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattaga 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  34724672 cattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatttatcaaggatattaacaattaga 34724735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 6098055 - 6097999
Alignment:
Q  608 cggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatac 665  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  6098055 cggatctacgacgtgtttgatttatc-aagatgttaagaattagggtattaggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 469 - 695
Target Start/End: Original strand, 3817257 - 3817482
Alignment:
Q  469 ccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatc 568  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||    
T  3817257 ccaatagatcaaacataaacaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatc 3817355  T
Q  569 aatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg 668  Q
    ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3817356 aatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctg 3817455  T
Q  669 aataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||    
T  3817456 gataaagctttcaaggcaaccctctca 3817482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 20239128 - 20238939
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  20239128 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatttcataaaacatgttcaacaatcatacatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 20239030  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20239029 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 20238939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 463 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 339590 - 339377
Alignment:
Q  463 aaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcg 562  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||| ||||||||||||||      
T  339590 aaaatctcaataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttggaaatttagctcttaat-ataaagagatttcataaaacatgttcaacaatta 339492  T
Q  563 tacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaa 662  Q
    |  |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  339491 tgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaa 339392  T
Q  663 tacctgaataaagct 677  Q
    |||||| ||||||||    
T  339391 tacctggataaagct 339377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Original strand, 42767276 - 42767466
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||         |||||||||||||||    
T  42767276 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattat 42767375  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  42767376 gatcggatctacgacatatttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttttgtagcagccctctca 42767466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 3811152 - 3811340
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  3811152 tgttggaaatgtaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 3811250  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  3811251 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctca 3811340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 28420942 - 28421130
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  28420942 tgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28421040  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28421041 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 28421130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 351963 - 351774
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||        ||||||||||||||||    
T  351963 ttgttggaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 351865  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  351864 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 351774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Original strand, 5979156 - 5979329
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||         ||||||||||||||||    
T  5979156 tgttgaaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttgaacaatcgtaaatcaatagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatg 5979255  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5979256 attggatctacgacatgtttgatttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttt 5979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 692
Target Start/End: Original strand, 35147986 - 35148173
Alignment:
Q  506 tgttggaaattt-aggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||        ||||||||||||||||    
T  35147986 tgttggaaattttatgtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 35148084  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaatta-gagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctc 692  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35148085 gatcggatctacgacacgtttgatttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacctggataaagctttcatggtagccctc 35148173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 590 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 26383719 - 26383612
Alignment:
Q  590 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagcc 689  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26383719 attgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagctttgatggcagcc 26383620  T
Q  690 ctctcaac 697  Q
    ||||||||    
T  26383619 ctctcaac 26383612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 505 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12804177 - 12804015
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||  |  |||||||||||||||        ||||||||||||  ||    
T  12804177 ttgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacat 12804079  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctg 668  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  12804078 gaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacctg 12804015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 501 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 5849707 - 5849511
Alignment:
Q  501 caacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatac-atgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatg 599  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||  |  |||||||||||||||        ||||||||||     
T  5849707 caacctgttgcaaatttaggtcttaat-aaaaacaaattttataaaattatgttcaatgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacata 5849609  T
Q  600 attatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  5849608 aatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatacctggatgaagctttaatgacagctctctcaac 5849511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 591 - 683
Target Start/End: Original strand, 30219313 - 30219405
Alignment:
Q  591 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatg 683  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30219313 ttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaagaattatggtattaggaatatctggataaagctttcatg 30219405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 693
Target Start/End: Original strand, 22741990 - 22742092
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||| || ||||| |  |||||||    
T  22741990 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattgaggattag-gtattaggaatacctggatgaagctatggtggcagc 22742087  T
Q  689 cctct 693  Q
    |||||    
T  22742088 cctct 22742092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 590 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 43540078 - 43539989
Alignment:
Q  590 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  43540078 attgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagcttt 43539989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 641 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15843989 - 15843937
Alignment:
Q  641 ctaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  15843989 ctaagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctct 15843937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 641 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15861098 - 15861046
Alignment:
Q  641 ctaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  15861098 ctaagaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctct 15861046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 515
Target Start/End: Original strand, 30219216 - 30219266
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaat 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||    
T  30219216 aatcccaataaatcaaacatgaataccgctctgataccacgtgttagaaat 30219266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 18666561 - 18666635
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatac 665  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  18666561 cattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataattaga-cattaggaatac 18666635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 26381286 - 26381192
Alignment:
Q  463 aaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaat 560  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||| |||  |||| | |||| |||| ||||||||||||||    
T  26381286 aaaatcccaataaatcaaatatgaaca-cgctctgatatcactcattagaaatttaggtctaaat--aaaatagatttcataagacatgttcaacaat 26381192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 33458249 - 33458438
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  33458249 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatatatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 33458348  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  33458349 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcttagcagccctctca 33458438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 471 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 24288196 - 24287977
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| | |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||    
T  24288196 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat---aaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 24288100  T
Q  571 tagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaa 670  Q
    ||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24288099 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctgga 24288000  T
Q  671 taaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  24287999 taaaactttcatagcagccctct 24287977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 465 - 697
Target Start/End: Original strand, 26963283 - 26963512
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |     
T  26963283 aatcctaacaaatcaaacatgaagaccgctctgatactacttgttggaaatttaggtcttaa-taaaaacaaatttcataaaacatgttcaacgattatg 26963381  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||    
T  26963382 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatt--agtattaggaata 26963479  T
Q  665 cctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26963480 cctggataaagcttttatggtagccctctcaac 26963512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 471 - 695
Target Start/End: Original strand, 10739286 - 10739510
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagacc-gctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatca 569  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||    
T  10739286 aataaaccaaacatgtagacctgctctgataccacttgttggacatttagctcttaac-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatca 10739384  T
Q  570 atagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctga 669  Q
    ||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  10739385 atagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgg 10739484  T
Q  670 ataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10739485 ataaacctttcaaggcagccctctca 10739510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 471 - 695
Target Start/End: Original strand, 10953055 - 10953279
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagacc-gctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatca 569  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||    
T  10953055 aataaaccaaacatgtagacctgctctgataccacttgttggacatttagctcttaac-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatca 10953153  T
Q  570 atagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctga 669  Q
    ||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  10953154 atagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgg 10953253  T
Q  670 ataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10953254 ataaacctttcaaggcagccctctca 10953279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Original strand, 6257187 - 6257376
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||        ||||||||||||||||    
T  6257187 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 6257285  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6257286 gatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttcgtagcagccctctca 6257376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 463 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 48161175 - 48160964
Alignment:
Q  463 aaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcg 562  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||||||||| ||      
T  48161175 aaaatctcaataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttagaaatttaggtcttaat-aaaaatagatttcataaaatatgttcaactatga 48161077  T
Q  563 tacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaa 662  Q
       |||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48161076 ---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaa 48160981  T
Q  663 tacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||||||||||||    
T  48160980 tacctgaataaagcttt 48160964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 10733229 - 10733417
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  10733229 tgttggacatttagctcttaac-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 10733327  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10733328 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctca 10733417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 10946998 - 10947186
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  10946998 tgttggacatttagctcttaac-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 10947096  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10947097 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctca 10947186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 465 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 49976804 - 49976607
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |     
T  49976804 aatcccaataaatcaaacatgaagaccactctgataccacttgttagaaatttagattttaa-taaaaacaaatttcataaaacatattcaacaattatg 49976706  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     ||| |||||| ||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||    
T  49976705 aatcgatagcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagga---taataattagagtattaggaata 49976609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 486 - 679
Target Start/End: Original strand, 33461361 - 33461547
Alignment:
Q  486 aagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnn 585  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||| |||||||| ||||||         
T  33461361 aagaccgctctgatacca-ttgttagaaatttaaatcttaattaaaaacatattttata-----tgttcaacaatcgtaaatcaatagtggaagcaaaca 33461454  T
Q  586 nnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33461455 aaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttt 33461547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 506 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 48167351 - 48167183
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||||||||| ||     |||||||||||||||        |||||||||| ||||||    
T  48167351 tgttagaaatttaggtcttaat-aaaaatagatttcataaaatatgttcaactatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 48167256  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48167255 atcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttt 48167183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 592 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632378
Alignment:
Q  592 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccct 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcatgacaaccct 4632384  T
Q  692 ctcaac 697  Q
     |||||    
T  4632383 ttcaac 4632378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 506 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 50168769 - 50168588
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||| ||| ||||||||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  50168769 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaccagattacataaaacacgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 50168671  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagcc 689  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  50168670 atcgaatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattag-gtataaggaatacctggttgaggctttcatggcagcc 50168588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 589 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 3769661 - 3769567
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatgg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  3769661 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggatattaataattag-gtattaggaatacttgaatgaggctttgatgg 3769567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 589 - 697
Target Start/End: Original strand, 44831677 - 44831785
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||  || ||||||| ||  || |    
T  44831677 cattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctagatgaagctttgataacaac 44831776  T
Q  689 cctctcaac 697  Q
    |||||||||    
T  44831777 cctctcaac 44831785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 624
Target Start/End: Original strand, 26956812 - 26956929
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||  |  |||||||||||||||        |||||||||| | ||||    
T  26956812 tgttggaaatttaggtcttaa-taaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatg 26956910  T
Q  606 atcggatctacgacatgtt 624  Q
    | |||||||||||||||||    
T  26956911 aacggatctacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 50427462 - 50427354
Alignment:
Q  597 atgattatgatcggatctacgacatgttt--------gatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  50427462 atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagggtattaggaatacctggatatagcgttcatggaagc 50427363  T
Q  689 cctctcaac 697  Q
    |||||||||    
T  50427362 cctctcaac 50427354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 505 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 4632964 - 4632910
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaat 560  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  4632964 ttgttggaaatttaggtcttaa-taaaaacagatttcataaaacatgttcaacaat 4632910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 589 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9237457 - 9237411
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 635  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9237457 cattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaa 9237411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 697
Target Start/End: Original strand, 31986745 - 31986823
Alignment:
Q  618 acatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  31986745 acatgtttgatttatcaaggataacaataattag-gtattaggaatatctgaatgaagttttgatggcggccctttcaac 31986823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 28704604 - 28704554
Alignment:
Q  590 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagata 640  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28704604 attgagcatgaatatgatcagatctacaacatgtttgatgtatcaaagata 28704554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 590 - 679
Target Start/End: Original strand, 19686394 - 19686482
Alignment:
Q  590 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||| |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19686394 attgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaagcatattaagaattcgggtattatgaata-ctgaacaaagcttt 19686482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 50156046 - 50156005
Alignment:
Q  594 aacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 635  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50156046 aacataattaagatcggatatacgacatgtttgatttatcaa 50156005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 471 - 695
Target Start/End: Original strand, 25387452 - 25387675
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaa 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||   |  |||||    
T  25387452 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatatagatcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaaatatgaatcaa 25387550  T
Q  571 tagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaa 670  Q
    ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25387551 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 25387650  T
Q  671 taaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||| |   |||||||||||    
T  25387651 taaagctttaaaaacagccctctca 25387675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 462 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 31051769 - 31051549
Alignment:
Q  462 aaaaatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttata-----atacatgttcaa 556  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||| |||| |||     ||||||||||||    
T  31051769 aaaaatctcaatagatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttaggaatttaggtcttaat-ataaacagatttcatatcataatacatgttcaa 31051671  T
Q  557 caatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtat 656  Q
    |||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  31051670 caatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtat 31051572  T
Q  657 taggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    || ||||||||| ||||| ||||    
T  31051571 taagaatacctggataaaacttt 31051549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 510 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 34740158 - 34739974
Alignment:
Q  510 ggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcg 609  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||| ||||  |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  34740158 ggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcatcaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcg 34740060  T
Q  610 gatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34740059 gatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttcaaggcagccctctca 34739974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 50306365 - 50306178
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||||||||||||     
T  50306365 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattata 50306267  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50306266 atcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 50306178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 505 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 31058221 - 31058049
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  31058221 ttgttagaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 31058123  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||    
T  31058122 gatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattaagaattagggtattaagaatacttggataaaacttt 31058049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 1078401 - 1078212
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  1078401 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattattaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 1078303  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||    
T  1078302 gatcggatctacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttttgtaacagccctctca 1078212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 25381518 - 25381706
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  25381518 tgttggaaatataggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 25381616  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||    
T  25381617 atcggatctacgaaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctca 25381706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 506 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 44410186 - 44409998
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||  |  |||||||||||||||        |||||||||| | ||||    
T  44410186 tgttggaaatttaggtcttact-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatg 44410088  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44410087 aacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatt--agtattaggaatacctggataaagcttttatggcagccctctcaac 44409998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 542 - 679
Target Start/End: Original strand, 8092864 - 8093001
Alignment:
Q  542 ataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatac 641  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  8092864 ataatacatattcaacaatcgtaaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatat 8092963  T
Q  642 taagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8092964 taagaatttgggtatgaggaatacctggataaagcttt 8093001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 590 - 682
Target Start/End: Original strand, 12183650 - 12183741
Alignment:
Q  590 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcat 682  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12183650 attgaacataattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaatttgagtattaggaatacctgaataaagctttcat 12183741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 479 - 670
Target Start/End: Original strand, 24963657 - 24963848
Alignment:
Q  479 aaacatgaagacc-gctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcgga 577  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| |   |  ||||||||||||    
T  24963657 aaacatgaagacatgctctaataccatttgttgaaaatttagatcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgaatatgaatcaatagcgga 24963755  T
Q  578 agcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaa 670  Q
    |||        |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24963756 agcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacctgaa 24963848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 697
Target Start/End: Original strand, 38151923 - 38152142
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagac-cgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatca 569  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||  |||| | |||| |||| ||||||||||||||  |  ||||    
T  38151923 aataaatcaaacatgaagactcgctctgataccacttgttagaaatccaagtcttaat--aaaatagatttcataaaacatgttcaacaattattaatca 38152020  T
Q  570 atagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctga 669  Q
    | |||||||||         |||||||||||| |      ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38152021 acagcggaagcaaacaaaatattgaacatgatca------gatctacgacatgtttgatttatcaaacatattaagaattagggtattaggaatacctga 38152114  T
Q  670 ataaagctttcatggcagccctctcaac 697  Q
    || || |||| ||| ||  |||||||||    
T  38152115 atgaaactttgatgacaatcctctcaac 38152142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 505 - 670
Target Start/End: Original strand, 24926737 - 24926900
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||| ||  |  |||||||||||||||        |||||||||| | |||    
T  24926737 ttgttgaaaatttaggtcttaat-aaaaacagattc-ataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatat 24926834  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaa 670  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24926835 gaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacctgaa 24926900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 27955336 - 27955216
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| || |||| || |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  27955336 tgttagaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgtttaataatcata-atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 27955239  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgat 628  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  27955238 atcggatctacaacatgtttgat 27955216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 465 - 681
Target Start/End: Original strand, 172832 - 173047
Alignment:
Q  465 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgta 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||||| |||||  |     
T  172832 aatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatactacttgttgaaaatttaggtcttaat-ataaacaggtttcataaaacatgttctacaattatg 172930  T
Q  565 catcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaata 664  Q
     |||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  172931 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaata 173030  T
Q  665 cctgaataaagctttca 681  Q
    | || ||||||||||||    
T  173031 catggataaagctttca 173047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 506 - 695
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1365
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||  ||||||||        |||||||||||||||||    
T  1176 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaaaggcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 1275  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  1276 atcggatctacgatatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctca 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 505 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 5712 - 5523
Alignment:
Q  505 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattat 604  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  5712 ttgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 5614  T
Q  605 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5613 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctca 5523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 506 - 693
Target Start/End: Original strand, 605 - 788
Alignment:
Q  506 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcgtacatcaatagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatg 605  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||     |||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  605 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgtttaactatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 700  T
Q  606 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctct 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  701 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctct 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 471 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 6734 - 6511
Alignment:
Q  471 aataaatcaaacatgaagaccgctctgatacaacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacaaattttataatacatgttcaacaatcg-tacatca 569  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||||||||   |  ||||    
T  6734 aataaatcaaacatgaagacggctctgataccacttgttggaaatttagctcttaat-ataaacaa-tttcataaaccatgttcaacaatttatgaatca 6637  T
Q  570 atagcggaagcnnnnnnnncattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctga 669  Q
    |||||||||||        ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||     
T  6636 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgactgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgg 6537  T
Q  670 ataaagctttcatggcagccctctca 695  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  6536 ataaagctttcaaggcagccctctca 6511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 589 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 12490 - 12384
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagc 688  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||     
T  12490 cattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatatctggataaagctttcaaggcagt 12391  T
Q  689 cctctca 695  Q
    |||||||    
T  12390 cctctca 12384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 597 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1174 - 1074
Alignment:
Q  597 atgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagctttcatggcagccctctcaa 696  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1174 atgattatgatcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcatggcagctctctcaa 1075  T
Q  697 c 697  Q
    |    
T  1074 c 1074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 589 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 6017 - 5945
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaa 662  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||    
T  6017 cattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattattaattag-gtattaggaa 5945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 38522 - 38434
Alignment:
Q  589 cattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaagatactaagaattagagtattaggaatacctgaataaagcttt 679  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  38522 cattgaacatagttatgatcggatctacaacatgtttg-tttatcaagaatattaataattag-gtattaggaatacctggatgaagcttt 38434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University