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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19149_low_4 (Length: 673)

Name: NF19149_low_4
Description: NF19149
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19149_low_4
NF19149_low_4
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (1-657)||(26249217-26249880)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 657
Target Start/End: Original strand, 26249217 - 26249880
Alignment:
Q  1 tttgtaacccttttatttttcatgaacttcatgtttttatcttttgggatattgagctatttgtttgtcaactcaactgaaaagaatgaaacannnnnnn 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  26249217 tttgtaacccttttatttttcatgaacttcatgtttttatcttttgggatattgagctatttgtttgtcaactcaactgaaaagaatgaaacattttttt 26249316  T
Q  101 nnnnatgaataatgaaacaaatcttgtaacatgacacaatgaatcatgaatatcattttgctctgcttcatggaacaggttcatacatgttatggtaatc 200  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26249317 t---atgaataatgaaacaaatcttgtaacatgacacaatgaatcatgaatatcattttgctctgcttcatggaacaggttcatacatgttatggtaatc 26249413  T
Q  201 atcacatggaaaatttagtttacattattattataactcatcacattcatgtgtgacaacttagtaaattcataatatcttattactatataattttaaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26249414 atcacatggaaaatttagtttacatta---ttataactcatcacattcatgtgtgacaacttagtaaattcataatatcttattactatataattttaaa 26249510  T
Q  301 tgcccacttattgatcatgattgtccgatttacatcaatgatcgactgaatacgaaatttgaatcaccagattttaaattaatggttgagattgatctgc 400  Q
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T  26249511 tgcccacttattgatcatgattgtccgatttacatcaatgatcgactgaatacgaaatttgaatcaccagattttaaattaatggttgagattgatctgc 26249610  T
Q  401 ggatgactaaattcaatttattaatacatgcaatgttgatcacaa------------agagagagaaatagagtttggcaaagaga-ctaaacataaaat 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||            |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26249611 ggatgacgaaattcaatttattaatacatgcaatgttgatcgcaaagagtgagaaatagagtgagaaatagagtttggcaaagagagctaaacataaaat 26249710  T
Q  488 aaaattatattcctttctagcagataagactgaatacatcatatgatcatacacaaccttatattccagaaattcatatataaannnnnnnaataaaaga 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||    
T  26249711 aaaattatattcctttctagcagataagactgaatacatcatatgatcatacacaaccttatattccagaaattcatatataaacccccccaataaaaga 26249810  T
Q  588 aattataattaaacatgaaaataaaagtaaaagttctcttagtagagaaaatttactataccattgtcct 657  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26249811 aataataattaaacatgaaaataatagtaaaagttctcttagtagagaacaattactataccattgtcct 26249880  T

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