View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1914_low_9 (Length: 440)

Name: NF1914_low_9
Description: NF1914
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1914_low_9
NF1914_low_9
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (1-432)||(24116417-24116848)
chr3 (1-432)||(23689627-23690058)
chr3 (1-432)||(24061864-24062295)
chr3 (1-424)||(24108707-24109133)
chr3 (1-432)||(24614526-24614957)
chr3 (1-432)||(23693085-23693516)
chr3 (1-432)||(23711525-23711956)
chr3 (1-432)||(23729981-23730412)
chr3 (1-432)||(23748436-23748867)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (134-303)||(11390762-11390931)
chr6 (134-303)||(11419693-11419862)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 24116417 - 24116848
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116417 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 24116516  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116517 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 24116616  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116617 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgacttccgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 24116716  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24116717 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagtttttgtaggattagcttctccatt 24116816  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24116817 tgacatatttcttccggcatataaatataatc 24116848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23690058 - 23689627
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  23690058 acatgaaaccctacattgatataaacttgaaaatttcttaaagacttccatgattccctctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacgtgtgca 23689959  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23689958 caagacaacaagttttcctcagagtaccctgtacacatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 23689859  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23689858 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcagacaatggaatgatttgtcaagctgagttccgaaaagaaaaacaccatgttctccatgatcttgtcttc 23689759  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||| ||  ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23689758 atcagaagaaacacatgcctttacgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgcaggataagcttctccatt 23689659  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23689658 tgacatatttcttctggcatataaatataatc 23689627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24062295 - 24061864
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  24062295 acatgaaaccctacattgatataaacttgaaaatttcttaaagacttccatgattccctctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacgtgtgca 24062196  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24062195 caagacaacaagttttcctcagagtaccctgtacacatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 24062096  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24062095 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcagacaatggaatgatttgtcaagctgagttccgaaaagaaaaacaccatgttctccatgatcttgtcttc 24061996  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||| ||  ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24061995 atcagaagaaacacatgcctttacgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgcaggataagcttctccatt 24061896  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24061895 tgacatatttcttctggcatataaatataatc 24061864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 24108707 - 24109133
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgat---ataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacatta 97  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |     
T  24108707 acatgaaaccctagattgatgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtatccatctctacaaatttgaatgcacgaatccatcataacactg 24108806  T
Q  98 gcacaagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacgg 197  Q
    ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24108807 gcacaagacaataacttgtcctcagagtaccctgtacacatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacgg 24108906  T
Q  198 aacaagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtc 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24108907 aacaagcagcaatcattgaaggcttatagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgagttcagaaaagaaaaacaccatcttctccatgatcttatc 24109006  T
Q  298 ttcatcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctcc 397  Q
    |||||| |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24109007 ttcatcagataaaaggcatgtccttatgtttctaataagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctcc 24109106  T
Q  398 atttgacatatttcttctggcatataa 424  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24109107 atttgacatatttcttttggcatataa 24109133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24614957 - 24614526
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||    
T  24614957 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgattccatctccacaaatttgactgcacgacttgatcataacgttggca 24614858  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24614857 caagacaataacttttcctcggagtaccccgtacacatcttcaaatcattgctccaaaagggataccttccaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 24614758  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24614757 aagcagcaatcattgaaggcttatagtcgcacacaatggattgatttgtcaagctcagctcagagaagaaaaacaccatgttctccatgatcttgtcttg 24614658  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24614657 atcggataaaagacacgctctcatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaatatccaaccaagttcttgtaggataagcttctccatt 24614558  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24614557 tgacatatttcttccggcatataaatataatc 24614526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23693516 - 23693085
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  23693516 acatgaaaccctacattgatataaacttgaaaatttcataaaaacttccatgattccctctccacaaatttgaatgcacgattccatcataacatgggca 23693417  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| | || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  23693416 caagacaataacttatcctcggagtaccccgtacacattttcaaatcattgctccaaaagggataccttccaacaataaaccttgcaagatacacggcac 23693317  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23693316 aagcagcaatcatagaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgttaagctgagttcagaaaagaaaaacaccatgtgctccatgatcttgtcttc 23693217  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23693216 atccgataaattacatgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaactgttaaaatccaaccaagttcttgcaggataagcttctccatt 23693117  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23693116 tgacatatttcttctggcatataaatataatc 23693085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23711956 - 23711525
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  23711956 acatgaaaccctacattgatataaacttgaaaatttcataaaaacttccatgattccctctccacaaatttgaatgcacgattccatcataacatgggca 23711857  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| | || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  23711856 caagacaataacttatcctcggagtaccccgtacacattttcaaatcattgctccaaaagggataccttccaacaataaaccttgcaagatacacggcac 23711757  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23711756 aagcagcaatcatagaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgttaagctgagttcagaaaagaaaaacaccatgtgctccatgatcttgtcttc 23711657  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23711656 atccgataaattacatgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaactgttaaaatccaaccaagttcttgcaggataagcttctccatt 23711557  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23711556 tgacatatttcttctggcatataaatataatc 23711525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23730412 - 23729981
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  23730412 acatgaaaccctacattgatataaacttgaaaatttcataaaaacttccatgattccctctccacaaatttgaatgcacgattccatcataacatgggca 23730313  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| | || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  23730312 caagacaataacttatcctcggagtaccccgtacacattttcaaatcattgctccaaaagggataccttccaacaataaaccttgcaagatacacggcac 23730213  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23730212 aagcagcaatcatagaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgttaagctgagttcagaaaagaaaaacaccatgtgctccatgatcttgtcttc 23730113  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23730112 atccgataaattacatgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaactgttaaaatccaaccaagttcttgcaggataagcttctccatt 23730013  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23730012 tgacatatttcttctggcatataaatataatc 23729981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23748867 - 23748436
Alignment:
Q  1 acatgaaaccctagattgatataaacttgaaaatttcttaaaaacttccatgtgtccatctccacaaatttgaatgcacgatttcatcataacattagca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  23748867 acatgaaaccctacattgatataaacttgaaaatttcataaaaacttccatgattccctctccacaaatttgaatgcacgattccatcataacatgggca 23748768  T
Q  101 caagaccacaagttttcctcggagtaccctgtgcatatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaac 200  Q
    |||||| | || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  23748767 caagacaataacttatcctcggagtaccccgtacacattttcaaatcattgctccaaaagggataccttccaacaataaaccttgcaagatacacggcac 23748668  T
Q  201 aagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttc 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23748667 aagcagcaatcatagaaggcttgtagtcgcacacaatagaatgatttgttaagctgagttcagaaaagaaaaacaccatgtgctccatgatcttgtcttc 23748568  T
Q  301 atcggataaaagacacgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaaccgttaaaatccaaccaagttcttgtaggattagcttctccatt 400  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23748567 atccgataaattacatgcccttatgtttctaacaagaaaaacataaggtgttggaactgttaaaatccaaccaagttcttgcaggataagcttctccatt 23748468  T
Q  401 tgacatatttcttctggcatataagtataatc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23748467 tgacatatttcttctggcatataaatataatc 23748436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11390931 - 11390762
Alignment:
Q  134 catatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaacaagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcaca 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  11390931 catatcttcaaatcattgttccataaaggataccttccaataacaattcttgcacaatacacagcagaagcagcaatcatagaaggtttatagtcacaca 11390832  T
Q  234 caatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttcatc 303  Q
    |||| |||| || ||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11390831 caattgaataatgtgtcaagctcagctctgaaaagaaaaacaccatattttccatcatcttgtcttcatc 11390762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 11419693 - 11419862
Alignment:
Q  134 catatcttcaaatcattgctccaaaagggatacctttcaacaacaaaccttgcacaatacacggaacaagcagcaatcaatgaaggcttgtagtcgcaca 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  11419693 catatcttcaaatcattgttccataaaggataccttccaataacaattcttgcacaatacacagcagaagcagcaatcatagaaggtttatagtcacaca 11419792  T
Q  234 caatagaatgatttgtcaagctgactttcgaaaagaaaaacaccatattctccatgatcttgtcttcatc 303  Q
    |||| |||| || ||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11419793 caattgaataatgtgtcaagctcagctctgaaaagaaaaacaccatattttccatcatcttgtcttcatc 11419862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University