View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19164_high_5 (Length: 322)

Name: NF19164_high_5
Description: NF19164
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19164_high_5
NF19164_high_5
[»] chr5 (89 HSPs)
chr5 (17-310)||(37705852-37706145)
chr5 (47-310)||(17072827-17073090)
chr5 (47-310)||(25904047-25904310)
chr5 (19-310)||(17818562-17818852)
chr5 (47-304)||(34530744-34531001)
chr5 (41-310)||(40221460-40221729)
chr5 (87-310)||(18511284-18511507)
chr5 (47-310)||(24126800-24127063)
chr5 (87-310)||(25804009-25804232)
chr5 (44-310)||(10529171-10529437)
chr5 (53-310)||(10474395-10474652)
chr5 (87-310)||(16092272-16092495)
chr5 (47-310)||(31472685-31472948)
chr5 (44-304)||(39854425-39854684)
chr5 (45-310)||(4236571-4236836)
chr5 (45-310)||(21947969-21948233)
chr5 (45-310)||(25921545-25921810)
chr5 (45-310)||(26097675-26097939)
chr5 (47-302)||(39398073-39398327)
chr5 (47-310)||(1189681-1189949)
chr5 (46-288)||(31179464-31179707)
chr5 (46-291)||(31545023-31545269)
chr5 (46-291)||(31542678-31542923)
chr5 (46-291)||(38882048-38882294)
chr5 (79-311)||(6756470-6756700)
chr5 (87-304)||(18466668-18466885)
chr5 (87-304)||(18468995-18469212)
chr5 (87-291)||(2174903-2175107)
chr5 (46-310)||(31466051-31466314)
chr5 (87-310)||(6745053-6745275)
chr5 (45-300)||(12556006-12556260)
chr5 (45-310)||(2818407-2818673)
chr5 (80-310)||(16776135-16776364)
chr5 (53-310)||(18509390-18509648)
chr5 (45-310)||(18596589-18596852)
chr5 (87-304)||(27912520-27912737)
chr5 (47-261)||(20042994-20043208)
chr5 (47-265)||(20044954-20045172)
chr5 (45-310)||(36402400-36402665)
chr5 (87-291)||(15552229-15552434)
chr5 (87-304)||(27910435-27910651)
chr5 (47-309)||(695833-696083)
chr5 (87-291)||(6747290-6747493)
chr5 (45-251)||(26098382-26098588)
chr5 (87-291)||(34477143-34477349)
chr5 (87-291)||(21684542-21684746)
chr5 (125-310)||(658425-658610)
chr5 (55-299)||(2954368-2954613)
chr5 (87-291)||(34479508-34479714)
chr5 (53-304)||(6661264-6661511)
chr5 (54-283)||(21288715-21288949)
chr5 (77-304)||(9020197-9020419)
chr5 (181-310)||(20505913-20506042)
chr5 (170-310)||(41585816-41585956)
chr5 (182-300)||(39798126-39798244)
chr5 (170-291)||(4410090-4410211)
chr5 (145-291)||(10586873-10587020)
chr5 (165-310)||(2723964-2724100)
chr5 (90-310)||(20053834-20054042)
chr5 (45-185)||(20507659-20507799)
chr5 (145-310)||(17413239-17413402)
chr5 (47-310)||(36208524-36208783)
chr5 (199-291)||(10749796-10749889)
chr5 (185-310)||(15143547-15143673)
chr5 (199-291)||(3373227-3373320)
chr5 (199-291)||(10757273-10757365)
chr5 (19-271)||(42770690-42770934)
chr5 (199-291)||(15354665-15354757)
chr5 (199-291)||(15356941-15357033)
chr5 (199-291)||(23665140-23665232)
chr5 (199-291)||(23793355-23793447)
chr5 (199-291)||(38960222-38960314)
chr5 (133-262)||(4754188-4754312)
chr5 (154-260)||(34033691-34033797)
chr5 (247-310)||(42770954-42771017)
chr5 (206-291)||(23741949-23742034)
chr5 (133-241)||(2144706-2144811)
chr5 (87-143)||(4410045-4410101)
chr5 (122-241)||(29748370-29748485)
chr5 (47-97)||(2723911-2723961)
chr5 (45-142)||(41585946-41586043)
chr5 (154-241)||(15224911-15224997)
chr5 (203-310)||(4897828-4897936)
chr5 (154-262)||(31782578-31782690)
chr5 (185-262)||(35430259-35430338)
chr5 (200-238)||(1170811-1170849)
chr5 (200-238)||(2298145-2298183)
chr5 (200-238)||(35385596-35385634)
chr5 (200-241)||(10627364-10627405)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (47-310)||(13057173-13057436)
chr6 (47-310)||(25477253-25477516)
chr6 (34-310)||(3390345-3390621)
chr6 (47-310)||(3629936-3630199)
chr6 (53-310)||(3632010-3632267)
chr6 (47-310)||(13039733-13039996)
chr6 (45-310)||(32279974-32280238)
chr6 (46-310)||(11983101-11983365)
chr6 (54-310)||(14458839-14459093)
chr6 (45-310)||(15530195-15530459)
chr6 (46-309)||(15541213-15541476)
chr6 (45-310)||(9019903-9020168)
chr6 (47-310)||(3233802-3234065)
chr6 (44-310)||(28241393-28241659)
chr6 (47-310)||(24338519-24338783)
chr6 (45-291)||(14507266-14507512)
chr6 (45-310)||(15532753-15533018)
chr6 (44-310)||(1230321-1230587)
chr6 (87-304)||(4816309-4816526)
chr6 (45-294)||(30728916-30729165)
chr6 (45-291)||(12195605-12195852)
chr6 (87-291)||(20915446-20915651)
chr6 (87-291)||(19704659-19704864)
chr6 (55-310)||(22490626-22490882)
chr6 (87-310)||(30967220-30967443)
chr6 (47-310)||(12161629-12161889)
chr6 (87-290)||(26065005-26065205)
chr6 (87-290)||(26084974-26085174)
chr6 (87-291)||(2628976-2629179)
chr6 (45-310)||(30034675-30034944)
chr6 (87-291)||(26932652-26932857)
chr6 (45-310)||(3027926-3028187)
chr6 (46-276)||(19227514-19227744)
chr6 (79-310)||(15719665-15719884)
chr6 (53-310)||(17012029-17012282)
chr6 (145-309)||(14466399-14466564)
chr6 (47-195)||(32447502-32447651)
chr6 (167-291)||(5273306-5273431)
chr6 (188-310)||(1069791-1069913)
chr6 (54-196)||(13870608-13870749)
chr6 (133-304)||(16455504-16455672)
chr6 (45-192)||(1072067-1072214)
chr6 (45-176)||(17852519-17852650)
chr6 (134-309)||(15367101-15367272)
chr6 (45-213)||(15346368-15346524)
chr6 (80-309)||(19696453-19696681)
chr6 (184-310)||(12186144-12186271)
chr6 (199-291)||(26066214-26066307)
chr6 (183-310)||(26945258-26945386)
chr6 (45-159)||(8995456-8995570)
chr6 (47-160)||(10584105-10584213)
chr6 (199-291)||(33308988-33309080)
chr6 (199-291)||(33311257-33311349)
chr6 (199-291)||(26068485-26068578)
chr6 (199-291)||(29754799-29754892)
chr6 (145-299)||(20526885-20527037)
chr6 (154-241)||(22858096-22858181)
chr6 (79-310)||(25078630-25078856)
chr6 (185-299)||(7542465-7542581)
chr6 (186-310)||(28037802-28037927)
chr6 (185-240)||(11138423-11138479)
chr6 (256-309)||(15346535-15346588)
chr6 (45-104)||(15367013-15367079)
chr6 (200-238)||(3577658-3577696)
chr6 (121-178)||(4595048-4595102)
chr6 (200-238)||(13878727-13878765)
chr6 (200-238)||(13883475-13883513)
chr6 (200-238)||(16785919-16785957)
chr6 (200-238)||(26887368-26887406)
chr6 (200-238)||(31248858-31248896)
chr6 (200-238)||(35201470-35201508)
chr6 (156-227)||(6843217-6843287)
chr6 (154-214)||(30445602-30445661)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (19-310)||(39715366-39715656)
chr3 (47-310)||(43423533-43423796)
chr3 (47-304)||(3314608-3314865)
chr3 (48-310)||(43421485-43421747)
chr3 (45-310)||(53917734-53917999)
chr3 (47-310)||(1626753-1627016)
chr3 (78-310)||(28102072-28102304)
chr3 (45-310)||(1313332-1313596)
chr3 (53-300)||(6561740-6561987)
chr3 (44-310)||(4308351-4308617)
chr3 (47-310)||(880521-880785)
chr3 (47-310)||(5926834-5927097)
chr3 (45-310)||(51943293-51943557)
chr3 (45-310)||(45882861-45883126)
chr3 (45-310)||(53915566-53915831)
chr3 (87-310)||(38890004-38890227)
chr3 (46-310)||(11170327-11170591)
chr3 (46-310)||(22114375-22114639)
chr3 (46-288)||(35777344-35777587)
chr3 (47-310)||(53468526-53468788)
chr3 (44-310)||(43228212-43228478)
chr3 (46-310)||(18096970-18097235)
chr3 (87-304)||(18099246-18099463)
chr3 (45-310)||(28761499-28761763)
chr3 (47-278)||(28100143-28100374)
chr3 (87-310)||(30005805-30006028)
chr3 (45-291)||(455825-456076)
chr3 (45-291)||(458202-458453)
chr3 (48-310)||(10956097-10956359)
chr3 (44-310)||(43226007-43226272)
chr3 (46-291)||(3859451-3859696)
chr3 (47-283)||(28180948-28181182)
chr3 (45-283)||(12268061-12268301)
chr3 (46-291)||(6065884-6066131)
chr3 (87-310)||(25533406-25533629)
chr3 (87-310)||(27101251-27101474)
chr3 (87-310)||(42990268-42990491)
chr3 (48-310)||(10958393-10958655)
chr3 (44-310)||(51727077-51727342)
chr3 (87-291)||(746721-746926)
chr3 (47-310)||(889843-890104)
chr3 (45-291)||(4103984-4104234)
chr3 (46-291)||(5191576-5191821)
chr3 (53-304)||(24979637-24979888)
chr3 (47-310)||(36011751-36012014)
chr3 (47-310)||(54691644-54691906)
chr3 (45-293)||(18162586-18162833)
chr3 (46-291)||(6063534-6063782)
chr3 (87-291)||(10621618-10621823)
chr3 (87-303)||(47148972-47149188)
chr3 (45-310)||(48361741-48362005)
chr3 (87-291)||(50493963-50494168)
chr3 (87-310)||(9604677-9604899)
chr3 (45-304)||(26720470-26720728)
chr3 (45-300)||(32264119-32264378)
chr3 (87-291)||(38210334-38210539)
chr3 (48-310)||(51674836-51675087)
chr3 (87-310)||(10084459-10084682)
chr3 (87-310)||(29956650-29956873)
chr3 (113-291)||(28413120-28413299)
chr3 (44-310)||(35918013-35918285)
chr3 (20-300)||(23636924-23637200)
chr3 (99-291)||(25388882-25389074)
chr3 (127-310)||(1321483-1321666)
chr3 (47-310)||(31151271-31151530)
chr3 (45-293)||(15780782-15781041)
chr3 (47-310)||(53591119-53591371)
chr3 (136-310)||(6484372-6484547)
chr3 (87-310)||(10191380-10191602)
chr3 (20-299)||(23633357-23633630)
chr3 (46-291)||(5522715-5522949)
chr3 (30-310)||(53597148-53597423)
chr3 (87-239)||(42992250-42992402)
chr3 (133-310)||(13420256-13420429)
chr3 (47-271)||(28137415-28137628)
chr3 (54-304)||(32219026-32219265)
chr3 (55-310)||(54884089-54884341)
chr3 (145-291)||(7606676-7606822)
chr3 (144-310)||(4666535-4666703)
chr3 (171-304)||(6231849-6231981)
chr3 (174-304)||(25688237-25688367)
chr3 (141-310)||(17795280-17795445)
chr3 (141-310)||(19103720-19103885)
chr3 (88-215)||(41849117-41849244)
chr3 (133-310)||(561847-562021)
chr3 (133-310)||(25635394-25635568)
chr3 (123-310)||(1673975-1674159)
chr3 (48-176)||(6231374-6231502)
chr3 (47-177)||(47701798-47701928)
chr3 (46-191)||(11163073-11163218)
chr3 (184-291)||(5886261-5886367)
chr3 (184-291)||(5899734-5899840)
chr3 (187-310)||(11168165-11168288)
chr3 (45-227)||(24177201-24177380)
chr3 (201-310)||(3306839-3306948)
chr3 (48-177)||(27635830-27635959)
chr3 (19-105)||(6484281-6484367)
chr3 (95-299)||(36871382-36871583)
chr3 (48-159)||(3306724-3306835)
chr3 (167-263)||(4560401-4560497)
chr3 (133-227)||(25633933-25634024)
chr3 (122-241)||(13419883-13419997)
chr3 (253-310)||(47701741-47701798)
chr3 (155-310)||(14634512-14634665)
chr3 (162-244)||(31021281-31021362)
chr3 (247-310)||(24181504-24181567)
chr3 (45-119)||(1321363-1321437)
chr3 (185-262)||(1620580-1620657)
chr3 (167-212)||(7606828-7606873)
chr3 (185-225)||(7768632-7768672)
chr3 (247-310)||(27635728-27635791)
chr3 (266-310)||(25634030-25634074)
chr3 (185-262)||(11066652-11066731)
chr3 (200-238)||(6303310-6303348)
chr3 (200-238)||(10094218-10094256)
chr3 (200-238)||(10100235-10100273)
chr3 (200-238)||(10201098-10201136)
chr3 (200-238)||(16462203-16462241)
chr3 (200-238)||(22626128-22626166)
chr3 (200-238)||(27544273-27544311)
chr3 (200-238)||(47883026-47883064)
chr3 (78-131)||(4560514-4560567)
chr3 (87-119)||(6719358-6719390)
[»] chr1 (97 HSPs)
chr1 (27-310)||(18307033-18307316)
chr1 (19-310)||(6756443-6756733)
chr1 (47-310)||(11457549-11457812)
chr1 (17-310)||(9241160-9241453)
chr1 (17-310)||(31422947-31423241)
chr1 (47-310)||(50076746-50077009)
chr1 (47-309)||(50078896-50079158)
chr1 (45-310)||(16428595-16428860)
chr1 (45-293)||(13215023-13215271)
chr1 (45-310)||(38925552-38925817)
chr1 (54-310)||(17186202-17186458)
chr1 (47-310)||(18839531-18839794)
chr1 (44-310)||(12302579-12302850)
chr1 (48-310)||(25251349-25251611)
chr1 (78-310)||(50307620-50307853)
chr1 (46-310)||(51749982-51750246)
chr1 (54-291)||(20302410-20302647)
chr1 (45-310)||(41646862-41647127)
chr1 (46-310)||(10399902-10400166)
chr1 (47-309)||(31489859-31490119)
chr1 (47-310)||(50248646-50248909)
chr1 (45-310)||(6995774-6996039)
chr1 (45-310)||(17324710-17324975)
chr1 (45-310)||(3579690-3579957)
chr1 (53-301)||(39462469-39462717)
chr1 (87-310)||(47906254-47906477)
chr1 (45-310)||(28998327-28998592)
chr1 (45-310)||(29004043-29004308)
chr1 (72-310)||(31425089-31425331)
chr1 (53-304)||(14098050-14098301)
chr1 (46-304)||(6822958-6823215)
chr1 (46-291)||(16226110-16226356)
chr1 (53-310)||(2617466-2617723)
chr1 (45-310)||(2949305-2949570)
chr1 (45-310)||(15823488-15823753)
chr1 (87-310)||(25127856-25128079)
chr1 (87-310)||(15294908-15295131)
chr1 (46-291)||(20291400-20291645)
chr1 (45-310)||(48665113-48665385)
chr1 (87-310)||(21948262-21948484)
chr1 (45-310)||(28207140-28207405)
chr1 (45-291)||(28840620-28840868)
chr1 (87-304)||(39932057-39932274)
chr1 (87-291)||(47179697-47179902)
chr1 (54-309)||(17324016-17324269)
chr1 (87-310)||(24325648-24325870)
chr1 (45-304)||(31735601-31735864)
chr1 (46-291)||(13761780-13762025)
chr1 (45-291)||(28842435-28842683)
chr1 (95-291)||(46431800-46431996)
chr1 (96-310)||(40133937-40134151)
chr1 (87-291)||(9463336-9463541)
chr1 (78-302)||(17318868-17319086)
chr1 (87-291)||(47177346-47177551)
chr1 (45-310)||(2510399-2510667)
chr1 (46-302)||(6823827-6824091)
chr1 (20-310)||(42922151-42922437)
chr1 (87-291)||(9459509-9459714)
chr1 (73-294)||(4131470-4131692)
chr1 (47-310)||(14183666-14183923)
chr1 (46-291)||(51752308-51752552)
chr1 (87-291)||(27337032-27337235)
chr1 (17-310)||(8347347-8347636)
chr1 (45-310)||(47451590-47451849)
chr1 (87-291)||(27339223-27339427)
chr1 (20-310)||(18800647-18800932)
chr1 (31-310)||(49495285-49495552)
chr1 (134-294)||(15669484-15669641)
chr1 (80-302)||(8349134-8349352)
chr1 (149-310)||(16432440-16432601)
chr1 (170-310)||(25248626-25248766)
chr1 (170-291)||(16231630-16231752)
chr1 (188-310)||(16429042-16429164)
chr1 (53-292)||(26520205-26520449)
chr1 (72-310)||(13125532-13125768)
chr1 (183-304)||(6115183-6115304)
chr1 (199-291)||(23785935-23786028)
chr1 (185-310)||(30738704-30738830)
chr1 (45-310)||(30790475-30790733)
chr1 (195-284)||(51757623-51757712)
chr1 (48-142)||(25248756-25248850)
chr1 (185-310)||(26613314-26613440)
chr1 (133-241)||(27916529-27916632)
chr1 (185-262)||(155788-155865)
chr1 (182-310)||(16561545-16561674)
chr1 (247-310)||(23816030-23816093)
chr1 (145-227)||(26332719-26332798)
chr1 (145-310)||(28279309-28279473)
chr1 (46-143)||(16231544-16231641)
chr1 (185-241)||(26332632-26332688)
chr1 (53-227)||(13127790-13127959)
chr1 (185-294)||(49959129-49959240)
chr1 (185-241)||(14353047-14353104)
chr1 (79-119)||(6115344-6115384)
chr1 (200-239)||(4144826-4144865)
chr1 (200-238)||(2232597-2232635)
chr1 (200-241)||(14997040-14997081)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (19-300)||(1225138-1225419)
chr8 (19-310)||(27910987-27911277)
chr8 (19-310)||(27957406-27957696)
chr8 (47-310)||(27106969-27107232)
chr8 (45-310)||(14419263-14419528)
chr8 (47-309)||(30480576-30480838)
chr8 (45-310)||(13858557-13858821)
chr8 (45-310)||(14807749-14808014)
chr8 (45-304)||(32339303-32339566)
chr8 (48-310)||(36865538-36865798)
chr8 (47-293)||(14477276-14477522)
chr8 (45-304)||(4424016-4424275)
chr8 (45-310)||(15072708-15072974)
chr8 (47-310)||(5372250-5372512)
chr8 (45-291)||(27829295-27829541)
chr8 (45-310)||(15809213-15809481)
chr8 (87-310)||(608774-608997)
chr8 (45-291)||(27826984-27827230)
chr8 (45-310)||(15067979-15068244)
chr8 (46-291)||(18810707-18810952)
chr8 (45-310)||(28251639-28251904)
chr8 (47-263)||(33541507-33541723)
chr8 (46-291)||(44720842-44721088)
chr8 (95-291)||(43079650-43079847)
chr8 (87-291)||(24873271-24873476)
chr8 (87-291)||(43082013-43082218)
chr8 (45-310)||(3874004-3874273)
chr8 (87-291)||(28283310-28283514)
chr8 (47-304)||(25952521-25952777)
chr8 (45-310)||(41384743-41385007)
chr8 (87-286)||(22684752-22684951)
chr8 (20-310)||(15185787-15186072)
chr8 (45-310)||(41382671-41382925)
chr8 (22-224)||(26775176-26775378)
chr8 (20-304)||(31162186-31162466)
chr8 (78-310)||(21480545-21480765)
chr8 (79-241)||(5622879-5623041)
chr8 (47-310)||(21482322-21482573)
chr8 (47-210)||(35872555-35872713)
chr8 (137-310)||(15956051-15956220)
chr8 (46-291)||(18812892-18813126)
chr8 (145-304)||(43530213-43530372)
chr8 (77-304)||(3005710-3005932)
chr8 (170-299)||(181622-181754)
chr8 (75-265)||(37214317-37214517)
chr8 (145-310)||(31573798-31573961)
chr8 (45-147)||(3886153-3886255)
chr8 (122-219)||(31035144-31035238)
chr8 (19-95)||(14419784-14419860)
chr8 (87-158)||(12517248-12517319)
chr8 (143-227)||(2468261-2468341)
chr8 (185-310)||(31578350-31578476)
chr8 (252-310)||(2468202-2468260)
chr8 (182-299)||(31035252-31035370)
chr8 (45-142)||(181535-181632)
chr8 (200-285)||(13985176-13985262)
chr8 (200-244)||(2267161-2267205)
chr8 (185-304)||(17847661-17847782)
chr8 (185-227)||(33839077-33839120)
chr8 (45-119)||(2468361-2468435)
chr8 (200-238)||(9021251-9021289)
chr8 (200-238)||(16752666-16752704)
chr8 (200-238)||(16757411-16757449)
chr8 (200-238)||(17799568-17799606)
chr8 (200-238)||(28327908-28327946)
chr8 (200-238)||(28332631-28332669)
chr8 (200-238)||(28895502-28895540)
chr8 (200-262)||(30423212-30423274)
chr8 (45-128)||(43530122-43530209)
chr8 (185-241)||(13985954-13986011)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (22-310)||(16453282-16453570)
chr4 (47-310)||(19095880-19096144)
chr4 (47-310)||(12395917-12396180)
chr4 (47-310)||(12400879-12401142)
chr4 (19-294)||(36378262-36378537)
chr4 (45-310)||(22802806-22803071)
chr4 (45-310)||(48486315-48486580)
chr4 (47-310)||(38928249-38928513)
chr4 (45-310)||(24888792-24889057)
chr4 (78-310)||(37313138-37313370)
chr4 (44-310)||(14633315-14633579)
chr4 (72-310)||(33415560-33415797)
chr4 (44-310)||(40637069-40637335)
chr4 (45-304)||(5198416-5198675)
chr4 (45-304)||(24878985-24879244)
chr4 (45-304)||(24880447-24880706)
chr4 (45-310)||(619519-619784)
chr4 (45-310)||(22800934-22801199)
chr4 (45-310)||(40091487-40091752)
chr4 (45-310)||(47274723-47274987)
chr4 (87-310)||(8631491-8631714)
chr4 (45-291)||(51015242-51015488)
chr4 (46-291)||(11434952-11435197)
chr4 (53-310)||(41997496-41997753)
chr4 (48-309)||(56030443-56030704)
chr4 (45-309)||(36919657-36919924)
chr4 (45-291)||(44599928-44600175)
chr4 (45-310)||(36921565-36921832)
chr4 (87-310)||(13543997-13544220)
chr4 (87-310)||(5637537-5637760)
chr4 (87-310)||(24348256-24348479)
chr4 (45-291)||(22044481-22044727)
chr4 (45-291)||(22046776-22047022)
chr4 (87-310)||(3824642-3824863)
chr4 (45-310)||(14787503-14787770)
chr4 (44-304)||(47868396-47868656)
chr4 (46-291)||(16934233-16934479)
chr4 (46-291)||(18847150-18847396)
chr4 (53-310)||(19322701-19322954)
chr4 (45-291)||(9148247-9148495)
chr4 (87-291)||(11006327-11006532)
chr4 (87-291)||(11008656-11008861)
chr4 (87-291)||(18709254-18709458)
chr4 (87-291)||(37089462-37089666)
chr4 (87-291)||(38409243-38409447)
chr4 (47-305)||(18409424-18409681)
chr4 (122-289)||(26086069-26086236)
chr4 (87-291)||(22782828-22783033)
chr4 (44-310)||(6764834-6765105)
chr4 (53-291)||(9176564-9176803)
chr4 (47-277)||(3937314-3937543)
chr4 (46-291)||(16931879-16932125)
chr4 (87-291)||(22780463-22780668)
chr4 (44-291)||(2484963-2485211)
chr4 (87-304)||(7941359-7941578)
chr4 (87-291)||(22132482-22132684)
chr4 (46-291)||(9174236-9174482)
chr4 (47-310)||(18537547-18537806)
chr4 (53-304)||(52942537-52942776)
chr4 (73-304)||(18534911-18535138)
chr4 (47-267)||(6132871-6133090)
chr4 (87-291)||(31849689-31849894)
chr4 (125-310)||(36380425-36380610)
chr4 (87-291)||(22134707-22134909)
chr4 (45-310)||(17662317-17662575)
chr4 (47-210)||(38270158-38270321)
chr4 (45-310)||(8756324-8756587)
chr4 (47-210)||(24446756-24446914)
chr4 (87-304)||(47210830-47211035)
chr4 (163-310)||(16455355-16455502)
chr4 (133-310)||(27499129-27499303)
chr4 (133-310)||(38890298-38890472)
chr4 (45-278)||(53405123-53405358)
chr4 (20-310)||(15032621-15032898)
chr4 (45-185)||(5100993-5101133)
chr4 (191-310)||(2891433-2891552)
chr4 (137-309)||(30136640-30136809)
chr4 (47-159)||(2891314-2891427)
chr4 (197-310)||(13547302-13547415)
chr4 (146-310)||(28453782-28453943)
chr4 (54-261)||(10112876-10113080)
chr4 (184-310)||(12102221-12102348)
chr4 (143-300)||(47150976-47151131)
chr4 (43-310)||(40999022-40999286)
chr4 (133-241)||(9863795-9863898)
chr4 (253-310)||(4215510-4215567)
chr4 (185-310)||(25357772-25357902)
chr4 (247-310)||(5635548-5635611)
chr4 (155-241)||(10114435-10114519)
chr4 (184-304)||(31983606-31983727)
chr4 (154-310)||(3982249-3982411)
chr4 (247-291)||(11437561-11437605)
chr4 (19-118)||(16455257-16455356)
chr4 (19-92)||(36380344-36380417)
chr4 (154-241)||(38208825-38208911)
chr4 (253-304)||(5101133-5101184)
chr4 (122-241)||(9022380-9022495)
chr4 (200-293)||(16185924-16186018)
chr4 (200-262)||(5336903-5336964)
chr4 (200-238)||(7050401-7050439)
chr4 (200-238)||(11853549-11853587)
chr4 (20-141)||(16186079-16186199)
chr4 (200-238)||(55822265-55822303)
chr4 (185-241)||(54906722-54906779)
chr4 (203-239)||(16489352-16489388)
chr4 (203-239)||(25699752-25699788)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (47-310)||(21678020-21678283)
chr7 (47-310)||(21679981-21680244)
chr7 (47-310)||(44724533-44724796)
chr7 (47-310)||(20137181-20137444)
chr7 (47-304)||(11355212-11355469)
chr7 (47-310)||(39146059-39146322)
chr7 (47-310)||(4296006-4296271)
chr7 (45-310)||(443547-443812)
chr7 (45-300)||(13099558-13099813)
chr7 (54-310)||(24748555-24748811)
chr7 (45-310)||(27306302-27306566)
chr7 (48-310)||(37412198-37412462)
chr7 (45-310)||(42331069-42331336)
chr7 (47-310)||(25276095-25276358)
chr7 (72-310)||(24258442-24258680)
chr7 (45-310)||(31435119-31435384)
chr7 (45-310)||(38393934-38394203)
chr7 (72-310)||(21592215-21592453)
chr7 (34-310)||(42223097-42223375)
chr7 (45-310)||(35581-35846)
chr7 (87-304)||(20297356-20297573)
chr7 (87-310)||(48457647-48457870)
chr7 (45-310)||(44516-44781)
chr7 (46-291)||(1049386-1049631)
chr7 (87-304)||(18345535-18345752)
chr7 (87-310)||(9679053-9679276)
chr7 (46-291)||(40836833-40837078)
chr7 (87-291)||(1047015-1047219)
chr7 (47-310)||(9680768-9681037)
chr7 (87-310)||(7470094-7470317)
chr7 (87-310)||(7472052-7472275)
chr7 (87-310)||(20626032-20626255)
chr7 (87-310)||(20629923-20630146)
chr7 (87-310)||(20642342-20642565)
chr7 (80-310)||(27832705-27832936)
chr7 (87-310)||(28487547-28487770)
chr7 (45-291)||(31156001-31156248)
chr7 (45-310)||(11757176-11757447)
chr7 (45-310)||(20299406-20299677)
chr7 (48-310)||(21990106-21990367)
chr7 (87-291)||(7351742-7351947)
chr7 (20-304)||(22828711-22828995)
chr7 (45-310)||(28485514-28485783)
chr7 (87-310)||(1849975-1850198)
chr7 (87-291)||(7349363-7349568)
chr7 (87-310)||(3878571-3878794)
chr7 (46-291)||(25542484-25542727)
chr7 (78-286)||(26804554-26804765)
chr7 (45-301)||(3035669-3035932)
chr7 (92-310)||(40946327-40946545)
chr7 (20-310)||(20091617-20091903)
chr7 (46-294)||(22251638-22251878)
chr7 (20-309)||(7188470-7188755)
chr7 (97-310)||(43253589-43253801)
chr7 (162-310)||(7092284-7092432)
chr7 (19-310)||(24817426-24817711)
chr7 (45-211)||(18567565-18567731)
chr7 (122-310)||(24813571-24813755)
chr7 (162-310)||(7094532-7094679)
chr7 (48-304)||(24465503-24465748)
chr7 (45-250)||(22392425-22392618)
chr7 (171-291)||(38396713-38396833)
chr7 (199-291)||(2935374-2935467)
chr7 (122-250)||(11081540-11081663)
chr7 (199-291)||(1606486-1606578)
chr7 (244-310)||(22393873-22393939)
chr7 (122-299)||(6048903-6049077)
chr7 (199-291)||(9027284-9027376)
chr7 (199-291)||(22137184-22137276)
chr7 (199-291)||(40552211-40552303)
chr7 (154-241)||(11084438-11084523)
chr7 (199-291)||(22108173-22108265)
chr7 (199-291)||(40549933-40550025)
chr7 (155-310)||(6332283-6332437)
chr7 (247-310)||(26295601-26295664)
chr7 (247-304)||(6348936-6348993)
chr7 (185-241)||(16297166-16297222)
chr7 (45-170)||(30906264-30906387)
chr7 (93-154)||(38396316-38396377)
chr7 (161-241)||(12310157-12310236)
chr7 (154-241)||(26210603-26210688)
chr7 (184-238)||(2120881-2120937)
chr7 (200-241)||(21369642-21369683)
chr7 (188-241)||(40281519-40281572)
chr7 (87-142)||(7094662-7094717)
chr7 (200-238)||(3320194-3320232)
chr7 (200-238)||(3324942-3324980)
chr7 (200-238)||(7069780-7069818)
chr7 (200-238)||(7074787-7074825)
chr7 (200-238)||(15541139-15541177)
chr7 (200-238)||(25351353-25351391)
chr7 (200-238)||(25357047-25357085)
chr7 (200-238)||(25405393-25405431)
chr7 (200-238)||(25410130-25410168)
chr7 (200-238)||(42006663-42006701)
chr7 (133-178)||(6348859-6348903)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (45-294)||(40032146-40032395)
chr2 (48-304)||(15539553-15539809)
chr2 (47-304)||(28196557-28196814)
chr2 (45-310)||(42923581-42923848)
chr2 (47-310)||(19007560-19007823)
chr2 (48-310)||(6264221-6264479)
chr2 (55-308)||(34979653-34979906)
chr2 (53-299)||(3022089-3022335)
chr2 (47-310)||(17849037-17849300)
chr2 (45-291)||(42064433-42064679)
chr2 (47-310)||(11739632-11739895)
chr2 (47-310)||(45239049-45239316)
chr2 (46-304)||(19504424-19504681)
chr2 (46-291)||(13910135-13910380)
chr2 (46-291)||(27104718-27104962)
chr2 (45-310)||(21520765-21521032)
chr2 (44-310)||(45280056-45280323)
chr2 (45-310)||(6258889-6259152)
chr2 (45-304)||(23452315-23452578)
chr2 (48-304)||(19502089-19502345)
chr2 (45-310)||(42452701-42452964)
chr2 (80-310)||(44289140-44289370)
chr2 (47-310)||(11578181-11578439)
chr2 (45-310)||(22287408-22287673)
chr2 (47-310)||(14837193-14837450)
chr2 (78-310)||(17848394-17848623)
chr2 (47-310)||(31732849-31733100)
chr2 (87-291)||(35215676-35215881)
chr2 (87-291)||(35218053-35218258)
chr2 (46-291)||(24162313-24162548)
chr2 (45-310)||(43623652-43623905)
chr2 (45-310)||(18800386-18800639)
chr2 (19-310)||(22874034-22874313)
chr2 (47-224)||(22163106-22163282)
chr2 (87-227)||(38020162-38020302)
chr2 (137-310)||(28459262-28459435)
chr2 (45-200)||(22407591-22407746)
chr2 (122-310)||(17897318-17897502)
chr2 (122-310)||(20146681-20146866)
chr2 (177-304)||(5375424-5375550)
chr2 (19-291)||(37963030-37963290)
chr2 (137-310)||(27136197-27136368)
chr2 (199-291)||(36558954-36559047)
chr2 (199-291)||(36561231-36561324)
chr2 (199-291)||(45332271-45332364)
chr2 (183-310)||(40699429-40699557)
chr2 (87-182)||(5377629-5377724)
chr2 (45-241)||(35107218-35107407)
chr2 (170-269)||(38414194-38414291)
chr2 (48-141)||(38020064-38020157)
chr2 (145-237)||(43139395-43139484)
chr2 (200-302)||(20589763-20589866)
chr2 (253-310)||(22407526-22407583)
chr2 (145-241)||(27583480-27583573)
chr2 (263-310)||(22707825-22707872)
chr2 (45-111)||(12342681-12342747)
chr2 (253-310)||(7463020-7463077)
chr2 (185-262)||(17921754-17921833)
chr2 (184-310)||(15693958-15694087)
chr2 (184-241)||(26345661-26345718)
chr2 (145-241)||(35028595-35028688)
chr2 (262-310)||(23870951-23870999)
chr2 (185-227)||(34575265-34575308)
chr2 (20-95)||(40699203-40699278)
chr2 (200-238)||(2736205-2736243)
chr2 (200-238)||(2740941-2740979)
chr2 (200-238)||(17462436-17462474)
chr2 (200-238)||(20054909-20054947)
chr2 (200-238)||(22712660-22712698)
chr2 (200-238)||(22717369-22717407)
chr2 (200-262)||(28458949-28459011)
chr2 (200-238)||(39680045-39680083)
chr2 (200-238)||(39686983-39687021)
chr2 (200-238)||(45567409-45567447)
chr2 (185-241)||(7502975-7503032)
chr2 (185-241)||(30720754-30720811)
chr2 (247-284)||(38020312-38020349)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (44-310)||(183713-183977)
scaffold0005 (45-310)||(51960-52227)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (53-310)||(79144-79401)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (45-310)||(3948-4212)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (45-310)||(14970-15235)
scaffold0131 (87-310)||(14454-14677)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (45-291)||(69382-69632)
scaffold0025 (87-198)||(73207-73318)
scaffold0025 (166-209)||(73160-73203)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (44-310)||(41555-41821)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (45-310)||(11545-11810)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (46-291)||(6151-6397)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (46-291)||(2832-3077)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (47-310)||(79812-80075)
scaffold0004 (200-238)||(188386-188424)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (87-291)||(34-239)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (20-310)||(15894-16180)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (87-291)||(29164-29368)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (88-304)||(2036-2251)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (47-274)||(35593-35819)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (54-310)||(16723-16975)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (47-310)||(85184-85446)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (56-310)||(1715-1958)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (163-291)||(1543-1671)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (53-300)||(4773-5016)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (44-215)||(993-1169)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (199-291)||(22221-22313)
scaffold0140 (199-291)||(24496-24588)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (200-238)||(224819-224857)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 89)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37706145 - 37705852
Alignment:
Q  17 gtcagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706145 gtcagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttag 37706046  T
Q  117 aaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706045 aaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 37705946  T
Q  217 agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705945 agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 37705852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073090
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||     
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 17073090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904310
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttac 25904310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17818852 - 17818562
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  17818852 cagatttgttacaattttatgggagttacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaa 17818754  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  17818753 aggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgag 17818654  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17818653 tctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 17818562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530744
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaa 34530744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 41 - 310
Target Start/End: Original strand, 40221460 - 40221729
Alignment:
Q  41 gagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  40221460 gagttacttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 40221559  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40221560 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagat 40221659  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40221660 tgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 40221729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18511507 - 18511284
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18511507 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 18511408  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18511407 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccg 18511308  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  18511307 ttgatatctcttttgtaaagttac 18511284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127063
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 24127063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804232
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  25804209 ttgatttctcttttgtaacgttac 25804232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10529437 - 10529171
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |    
T  10529437 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttt 10529338  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10529337 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 10529238  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10529237 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 10529171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10474652 - 10474395
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10474652 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 10474553  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||  ||||      
T  10474552 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgag 10474453  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10474452 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttac 10474395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092272
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttac 16092272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472685
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||      
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| | |||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttac 31472685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 304
Target Start/End: Original strand, 39854425 - 39854684
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  39854425 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 39854523  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |    
T  39854524 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgg 39854623  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39854624 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 39854684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 4236571 - 4236836
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4236571 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4236670  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  4236671 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 4236770  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  4236771 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 4236836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 21947969 - 21948233
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21947969 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 21948067  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||    
T  21948068 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggg 21948167  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21948168 actttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttac 21948233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25921810 - 25921545
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  25921810 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 25921711  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  25921710 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 25921611  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  25921610 actctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 25921545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 26097675 - 26097939
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |    
T  26097675 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgga 26097774  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |   | ||    
T  26097775 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 26097939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398073
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |      
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt 302  Q
     ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 39398073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189681
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 141  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  142 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  242 agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttac 1189681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179464
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 288  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179507 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 31179464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545269
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31545122  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  31545123 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattggg 31545222  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 31545269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31542923
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31542777  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31542778 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31542877  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31542878 actttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgat 31542923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882294
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38882147  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  38882148 tagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 38882247  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38882248 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 38882294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756700
Alignment:
Q  79 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 178  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6756470 taaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 6756569  T
Q  179 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756570 tgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 6756669  T
Q  279 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttaca 311  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6756670 gtaa--cattgatatcttttttgtaaggttaca 6756700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 18466668 - 18466885
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18466668 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 18466767  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466768 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18466867  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  18466868 ttgatttctcttttgtaa 18466885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 18468995 - 18469212
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaaccca 18469194  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  18469195 ttgatttctcttttgtaa 18469212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 2174903 - 2175107
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2174903 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 2175002  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175003 gattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 2175102  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  2175103 ttgat 2175107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31466051
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtat 31466215  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  31466214 agagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 31466115  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31466114 ctttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttac 31466051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745275
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttac 6745275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12556260 - 12556006
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  12556260 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 12556161  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |     
T  12556160 tagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattgga 12556061  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  12556060 gttttgg-tagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 12556006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2818673 - 2818407
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  2818673 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgta 2818574  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  | |    
T  2818573 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgg 2818474  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  2818473 gactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 2818407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Original strand, 16776135 - 16776364
Alignment:
Q  80 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16776135 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggttt 16776234  T
Q  180 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 279  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16776235 gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 16776334  T
Q  280 taacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  16776335 taa-ccattgatttctcttttgtaacgttac 16776364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18509648 - 18509390
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag-ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 151  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||| | || |||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18509648 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18509549  T
Q  152 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||    
T  18509548 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgg 18509449  T
Q  252 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||    
T  18509448 gtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttac 18509390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 18596589 - 18596852
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  18596589 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaagac--aacaacaaaactagggtttgta 18596686  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18596687 tagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 18596852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 27912520 - 27912737
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||    
T  27912520 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggtt 27912619  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912620 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27912719  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  27912720 ttgatttctcttttgtaa 27912737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  247 tttggatagaattag 261  Q
    |||||||||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||      
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  247 tttggatagaattaggcgg 265  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36402665 - 36402400
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||  || || ||||||||||||    
T  36402665 tacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgta 36402566  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |     
T  36402565 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattgga 36402466  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36402465 actttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttac 36402400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552434
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  15552429 attgat 15552434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 27910435 - 27910651
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaa-ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27910633  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  27910634 ttgatttctcttttgtaa 27910651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 309
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696083
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
              ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 696083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747493
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggtt 6747388  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 6747488  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  6747489 ttgat 6747493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26098588 - 26098382
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||    
T  26098588 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgta 26098489  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  26098488 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggg 26098389  T
Q  245 gttttgg 251  Q
    |||||||    
T  26098388 gttttgg 26098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477143
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  285 cattgat 291  Q
    |||||||    
T  34477149 cattgat 34477143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684542
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  21684546 ttgat 21684542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658425
Alignment:
Q  125 caacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  225 ggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 658425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 299
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954613
Alignment:
Q  55 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 154  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||  || ||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  155 ctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||| |    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttt 2954613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479508
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  285 cattgat 291  Q
    |||||||    
T  34479514 cattgat 34479508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6661511 - 6661264
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||   |||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  6661511 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagttt 6661413  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  | ||||||     
T  6661412 gt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttggg 6661316  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6661315 tacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 6661264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21288949
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtt------tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||| | ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaac 21288949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Original strand, 9020197 - 9020419
Alignment:
Q  77 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 176  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||| || |  | |||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9020197 tgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggaggcaaca-caaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactaggg 9020293  T
Q  177 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 276  Q
    ||  ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9020294 ttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattc 9020391  T
Q  277 ttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9020392 ttgtaacccattgatatctcttttgtaa 9020419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 181 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505913
Alignment:
Q  181 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  281 aacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttac 20505913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585816
Alignment:
Q  170 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  270 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttac 41585816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 300
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798244
Alignment:
Q  182 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgta 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  282 acccattgatatccctttt 300  Q
    |||||||||| || |||||    
T  39798226 acccattgatttctctttt 39798244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 291
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410211
Alignment:
Q  170 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  270 cttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgat 4410211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587020
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||      
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgat 10587020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724100
Alignment:
Q  165 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcg 264  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt---------ggtagaattaggcg 2724054  T
Q  265 ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattac 2724100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 310
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054042
Alignment:
Q  90 atagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 189  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||  ||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  190 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||| ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt---tg--gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  290 atatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttac 20054042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20507799 - 20507659
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  || ||||||||    
T  20507799 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgta 20507700  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 185  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507699 tagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413239
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  245 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||| | ||||||||||   | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 17413239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208783
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||  |     
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  246 ttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 36208783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749889
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 10749889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143673
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 283  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  284 ccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttac 15143673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373227
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 3373227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757365
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 10757365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 271
Target Start/End: Original strand, 42770690 - 42770934
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || | |    
T  42770690 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttgga 42770788  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    | ||||| |||||  || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  42770789 aggcaac-acaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttcattcaccatgggaa--actattaggactgag 42770881  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 271  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||| || ||||||    
T  42770882 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354665
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 15354665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356941
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 15356941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665232
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 23665232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793355
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 23793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960222
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgat 38960222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 262
Target Start/End: Original strand, 4754188 - 4754312
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||      
T  4754188 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactg 4754282  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  4754283 gaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033691
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttgg 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  252 atagaatta 260  Q
     ||||||||    
T  34033699 gtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Original strand, 42770954 - 42771017
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  42770954 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttac 42771017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741949
Alignment:
Q  206 tattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 23741949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2144811 - 2144706
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttac 230  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  2144811 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgc 2144717  T
Q  231 gtgaagagatt 241  Q
    | |||||||||    
T  2144716 gggaagagatt 2144706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 143
Target Start/End: Original strand, 4410045 - 4410101
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4410045 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748485
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 220  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtc 29748464  T
Q  221 tcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||| ||| ||| |||||    
T  29748465 tcttggtcacgggaatagatt 29748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggg 97  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41586043 - 41585946
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||   ||| |||||| ||||||||||    
T  41586043 tacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224911
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | | |||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagatt 15224911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 310
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897936
Alignment:
Q  203 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttg 301  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||  |||||||| || |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  302 taaggttac 310  Q
    ||| |||||    
T  4897928 taaagttac 4897936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31782690 - 31782578
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |    
T  31782690 tctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gggaat 31782592  T
Q  249 tggatagaattagg 262  Q
    ||| ||||||||||    
T  31782591 tgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 262
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170849
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 1170849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298145
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385596
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35385596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627405
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 10627405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057436
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 13057436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477516
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||     
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 25477516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 3390345 - 3390621
Alignment:
Q  34 tttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatc 133  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |    
T  3390345 tttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac 3390444  T
Q  134 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3390445 tagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaga 3390544  T
Q  234 aagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3390545 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3390621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629936
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3629936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3632267 - 3632010
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3632267 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 3632168  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||     
T  3632167 gtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttggg 3632068  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3632067 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 3632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13039996
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |      
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 13039996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 32279974 - 32280238
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||||| | |||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32279974 tacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgta 32280072  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32280073 tagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 32280172  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32280173 acttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 32280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983101
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11983266  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  11983265 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 11983166  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  11983165 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 11983101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458839
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 14458839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15530459 - 15530195
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15530459 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 15530360  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  15530359 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 15530260  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15530259 gctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttac 15530195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15541476 - 15541213
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  15541476 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 15541377  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  15541376 agagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattggga 15541277  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15541276 ctttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 15541213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 9019903 - 9020168
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9019903 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9020002  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  9020003 tagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattggg 9020102  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9020103 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 9020168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233802
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 3233802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28241659 - 28241393
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28241659 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 28241560  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  28241559 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28241460  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  28241459 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 28241393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338519
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacacta-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||| |     
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 24338519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14507512 - 14507266
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || || | |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14507512 tacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 14507413  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  14507412 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 14507313  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14507312 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 14507266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15533018 - 15532753
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15533018 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgta 15532919  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  15532918 taaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattggg 15532819  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15532818 acttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1230587 - 1230321
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1230587 ttactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 1230488  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  | |    
T  1230487 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgg 1230388  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  1230387 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 1230321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816309
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  4816326 ttgatttctcttttgtaa 4816309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728916
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  |||||||||| || |||||||||    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgta 30729066  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||    
T  30729065 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggg 30728966  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 294  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30728965 gctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatc 30728916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12195852 - 12195605
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12195852 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 12195753  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12195752 tagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 12195653  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |  ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195652 gactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgat 12195605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915446
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20915452  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  20915451 attgat 20915446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19704864 - 19704659
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| |||||    
T  19704864 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggtt 19704765  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704764 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 19704665  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  19704664 attgat 19704659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 310
Target Start/End: Original strand, 22490626 - 22490882
Alignment:
Q  55 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggttta-gaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22490626 ataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg 22490725  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| |    
T  22490726 cctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggt 22490825  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22490826 agaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattac 22490882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 30967220 - 30967443
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  30967220 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 30967319  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30967320 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 30967419  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  30967420 ttgatttctcttttgtaacgttac 30967443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161629
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||  |      
T  12161790 gagtttgtctctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| | || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 12161629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 290
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065205
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  287 ttga 290  Q
    ||||    
T  26065202 ttga 26065205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 290
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085174
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  287 ttga 290  Q
    ||||    
T  26085171 ttga 26085174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2629179 - 2628976
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  2629179 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggtt 2629081  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  2629080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaaccca 2628981  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  2628980 ttgat 2628976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30034944 - 30034675
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||  ||| |||    
T  30034944 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtt 30034845  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||      
T  30034844 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 30034675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26932857 - 26932652
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  26932857 gagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggtt 26932758  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932757 gattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26932658  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  26932657 attgat 26932652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3028187 - 3027926
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||  |||| || | || |||||| |||| ||||||||||||    
T  3028187 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaaggcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgag 3027992  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3027991 actttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3027926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19227645  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  19227644 agagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 19227545  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattc 276  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19227544 ctttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 79 - 310
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15719884
Alignment:
Q  79 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  179 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 278  Q
       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  279 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15719884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012282
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  152 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttg 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  251 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  17012224 g-tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 17012282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 309
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466564
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    |  ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 14466564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273306
Alignment:
Q  167 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  266 gagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgat 5273306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069791
Alignment:
Q  188 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  288 tgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttac 1069791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16455672 - 16455504
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||     
T  16455672 ctagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacgg 16455576  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
     |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16455575 aaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaa 16455504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1072214 - 1072067
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  1072214 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgta 1072115  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 192  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072114 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 176
Target Start/End: Original strand, 17852519 - 17852650
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  17852519 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 17852618  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 176  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852619 tagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 309
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367272
Alignment:
Q  134 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 233  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  234 aagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||||||     ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagtta 15367272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Original strand, 15346368 - 15346524
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||         |||| ||||||||||||    
T  15346368 tacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaa-------ttcaaa-ctagggtttgta 15346459  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 213  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346460 taaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 309
Target Start/End: Original strand, 19696453 - 19696681
Alignment:
Q  80 aaaccttgagatagaggg--ggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 176  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19696453 aaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactaggg 19696549  T
Q  177 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttatt 275  Q
    ||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||  |  ||||| ||||||||||   | |||||||||    
T  19696550 ttcaa--attgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttatt 19696647  T
Q  276 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  19696648 cttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagtta 19696681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186144
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |  ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  283 cccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttac 12186144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066214
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 26066214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945386
Alignment:
Q  183 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  282 acccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttac 26945386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Original strand, 8995456 - 8995570
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8995456 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 8995555  T
Q  145 tagagtttgtctctt 159  Q
    |||||||||||||||    
T  8995556 tagagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584213
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  147 gagtttgtctcttg 160  Q
    ||||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309080
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgat 33309080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311349
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgat 33311349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068485
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgat 26068485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754799
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 29754799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 299
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527037
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  20526885 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaag 20526981  T
Q  245 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttt 299  Q
      ||| | ||||||||||   | ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20526982 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttt 20527037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22858096
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagatt 22858096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25078856 - 25078630
Alignment:
Q  79 taaaccttgagatagag-ggggctgaaat-aaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 176  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  25078856 taaaccttgagagagagaggggccgaaaacaaaggtttagaaacata-caacaa-tctagggtttgta--gagttta-ctcttggcaacaaacattaggg 25078762  T
Q  177 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga-gacttatt 275  Q
    ||  |   |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||  | |||  | ||||||||||   || ||||||||    
T  25078761 ttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-tagaattaggtttgaagacttatt 25078665  T
Q  276 cttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  25078664 cttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 25078630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542465
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 282  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  283 cccattgatatcccttt 299  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  7542481 ccctttgatatctcttt 7542465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037802
Alignment:
Q  186 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  || |||||  |  ||||| ||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  285 cattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttac 28037802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138479
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagat 11138479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 15346535 - 15346588
Alignment:
Q  256 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15346535 aattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagtta 15346588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Original strand, 15367013 - 15367079
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacatt-------acatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367013 tacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 15367079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577658
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 178
Target Start/End: Original strand, 4595048 - 4595102
Alignment:
Q  121 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4595048 gcaacaacaaaactagggtttgta--gagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878765
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883513
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13883513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785957
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16785957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887368
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248858
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31248858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201470
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Original strand, 6843217 - 6843287
Alignment:
Q  156 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6843217 tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtctcttggt 6843287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 30445602 - 30445661
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggat 214  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30445602 tctcttggcaacaaacactacgg-ttga-gattgattcaccttggagaaacactattaggat 30445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 39715366 - 39715656
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  39715366 cagatttgttacaatttcatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagag 39715464  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715465 aggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgag 39715564  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39715565 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttac 39715656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423533
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 43423533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 304
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314865
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||     
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 3314865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421485
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 43421485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53917999 - 53917734
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  53917999 tacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 53917900  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  53917899 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 53917734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626753
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||      
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 1626753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28102304 - 28102072
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28102304 gtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 28102205  T
Q  178 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28102204 ttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 28102105  T
Q  278 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28102104 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 28102072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 1313332 - 1313596
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  1313332 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgta 1313430  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  1313431 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttac 1313596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 300
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6561987
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 6561987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4308617 - 4308351
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4308617 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4308518  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  4308517 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 4308418  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  4308417 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 4308351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880521
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 880521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926834
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttac 5926834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 51943293 - 51943557
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51943293 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51943392  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51943393 tagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||| |||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttac 51943557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 45882861 - 45883126
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45882861 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 45882960  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  45882961 tagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 45883060  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  45883061 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 45883126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53915831 - 53915566
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |   |||||||||| ||||||||||||    
T  53915831 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgta 53915732  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  53915731 tagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttac 53915566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890227
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  38890204 ttgatttctcttttgtaacgttac 38890227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170591
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11170426  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||     
T  11170427 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctggga 11170526  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  11170527 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 11170591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114375
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 22114540  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  22114539 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 22114440  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  22114439 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 22114375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 288
Target Start/End: Original strand, 35777344 - 35777587
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35777344 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 35777443  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35777444 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 35777543  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 288  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777544 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468526
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||      
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 53468526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Original strand, 43228212 - 43228478
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  43228212 ttactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgt 43228311  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  43228312 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43228411  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  43228412 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 43228478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18097235 - 18096970
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt-gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| |  ||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18097235 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 18097136  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  18097135 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 18097036  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  18097035 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttac 18096970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18099463 - 18099246
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18099463 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 18099364  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099363 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18099264  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  18099263 ttgatttctcttttgtaa 18099246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28761763 - 28761499
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  28761763 tacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 28761664  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |    
T  28761663 tatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgag 28761565  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28761564 actttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 28761499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattctt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006028
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttac 30006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 455825 - 456076
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  455825 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 455924  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaga 239  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  455925 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 456024  T
Q  240 ttagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456025 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 456076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 458202 - 458453
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  458202 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 458301  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaga 239  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  458302 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 458401  T
Q  240 ttagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    || ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458402 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 458453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956097
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||    
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 10956097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Original strand, 43226007 - 43226272
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  43226007 ttactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgt 43226105  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  43226106 atagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43226205  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  43226206 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 43226272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859696
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3859550  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  3859551 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3859651 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgat 3859696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||      
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12268301 - 12268061
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaat-ctagggtttgt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  12268301 tacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgt 12268202  T
Q  144 atagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12268201 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 12268102  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 283  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268101 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065884
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6066032  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6066031 tagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 6065932  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 6065884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533629
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25533605  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  25533606 ttgatttctcttttgtaacgttac 25533629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101251
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttac 27101251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990491
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttac 42990491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958393
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |     |    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||    
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 10958393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51727342 - 51727077
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  51727342 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgt 51727243  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |      
T  51727242 atagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctga 51727144  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  51727143 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 51727077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 746721 - 746926
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  746721 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 746820  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746821 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 746920  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  746921 attgat 746926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889843
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||  |||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttgggg 889908  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttac 889843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4104234 - 4103984
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4104234 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4104135  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  4104134 tgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 4103984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5191821
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||   | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 5191675  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  5191676 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5191775  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5191776 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgat 5191821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Original strand, 24979637 - 24979888
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    ||||||||||| || ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24979637 ctataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 24979736  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||     
T  24979737 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttggg 24979836  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||    
T  24979837 tagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaa 24979888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012014
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |      
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 36012014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691644
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| || | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||     
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttac 54691644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 293
Target Start/End: Original strand, 18162586 - 18162833
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatca-gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||| | |||||| | |||||||||||   ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18162586 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 18162683  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18162684 atagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18162783  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 293  Q
    |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162784 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatat 18162833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063534
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6063683  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  6063682 atagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6063583  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063582 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 6063534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621618
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  10621623 attgat 10621618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148972
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  186 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149088 tgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47148990  T
Q  286 attgatatcccttttgta 303  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  47148989 attgatatctcttttgta 47148972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48362005 - 48361741
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  48362005 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 48361907  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  48361906 tagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 48361807  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||    
T  48361806 gcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttac 48361741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 50493963 - 50494168
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  50493963 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 50494062  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50494063 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 50494162  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  50494163 attgat 50494168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604677
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  9604700 ttgatttctcttttgtaacgttac 9604677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 26720470 - 26720728
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26720470 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 26720569  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||    
T  26720570 tagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctggg 26720668  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  26720669 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaa 26720728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32264378 - 32264119
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaa----ccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||    | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  32264378 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtt 32264279  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||      
T  32264278 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 32264179  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    | |   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32264178 tggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 32264119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210539
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  38210534 attgat 38210539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674836
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
           | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttac 51674836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10084682 - 10084459
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10084682 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10084583  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10084582 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10084483  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  10084482 ttgatttctcttttgtaacgttac 10084459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956873
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttac 29956873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 113 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413120
Alignment:
Q  113 ttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 212  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  213 attg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 28413120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35918285 - 35918013
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||  | |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35918285 ttactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 35918186  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 237  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35918185 atagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaaga 35918086  T
Q  238 gattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || | ||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  35918085 gactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 35918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 300
Target Start/End: Original strand, 23636924 - 23637200
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || |||||||||| | | || ||||  |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||     
T  23636924 agatttgtttcaattttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaag 23637023  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23637024 c-caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagt 23637119  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    |||||| | | | ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23637120 ctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 291
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389074
Alignment:
Q  99 gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 198  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-g 25388980  T
Q  199 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25388981 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgat 25389074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 310
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321666
Alignment:
Q  127 acaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  227 ttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 1321666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151530
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttac 31151530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 293
Target Start/End: Original strand, 15780782 - 15781041
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15780782 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 15780881  T
Q  145 tagagtt-----------tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 233  Q
    |||||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15780882 tagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacggg 15780981  T
Q  234 aagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 293  Q
    |||||  |  |  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15780982 aagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatat 15781041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591371
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| |||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttac 53591371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484547
Alignment:
Q  136 gggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtga 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  235 agagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttac 6484547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10191602 - 10191380
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  10191602 gagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10191503  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10191502 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10191404  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || || || ||||||||| |||||    
T  10191403 ttcatttctcttttgtaacgttac 10191380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 299
Target Start/End: Original strand, 23633357 - 23633630
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||     
T  23633357 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaag 23633456  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  23633457 c-caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagt 23633550  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttt 299  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  23633551 ctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctcttt 23633630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522715
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||      
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-- 5522852  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
             ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  5522851 ---------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5522761  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522760 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 5522715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Original strand, 53597148 - 53597423
Alignment:
Q  30 caattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaaca 129  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||   |||||| |    
T  53597148 caattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaaga 53597245  T
Q  130 aatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 229  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53597246 aaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 53597342  T
Q  230 cgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     | ||| |||||  | |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  53597343 tgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttac 53597423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 42992250 - 42992402
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaga 42992402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13420429 - 13420256
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13420429 ctagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 13420334  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  13420333 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 13420256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagact 271  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 304
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219265
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||           ||||||    
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttg 32219114  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||      
T  32219115 tctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaa 32219265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 310
Target Start/End: Original strand, 54884089 - 54884341
Alignment:
Q  55 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 154  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||    
T  54884089 ataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgt 54884186  T
Q  155 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 254  Q
     |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||     |||| |||    
T  54884187 ttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaata 54884286  T
Q  255 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||    
T  54884287 gaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttac 54884341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606676
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgat 7606676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 310
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666703
Alignment:
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||      
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttac 4666703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 304
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231981
Alignment:
Q  171 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagatt-gggatttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  271 ttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 6231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688237
Alignment:
Q  174 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagactta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  274 ttcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 25688237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795445
Alignment:
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  17795280 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 17795445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103885
Alignment:
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  19103720 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 19103885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  88 agatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 187  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  188 attcaccttgggaaacactattaggatt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 562021 - 561847
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  562021 ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgt 561925  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| |||||    
T  561924 gaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttac 561847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Original strand, 25635394 - 25635568
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  25635394 ctagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgg 25635490  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  25635491 gaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttac 25635568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674159
Alignment:
Q  123 aacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 222  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  223 ttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac 1674159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 177  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| | |||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11163172  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 191  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163173 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886367
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  284 ccattgat 291  Q
    ||||||||    
T  5886360 ccattgat 5886367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899840
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaac 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  284 ccattgat 291  Q
    ||||||||    
T  5899833 ccattgat 5899840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 310
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168288
Alignment:
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttac 11168288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 227
Target Start/End: Original strand, 24177201 - 24177380
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    |||||| ||| |||||||||||    
T  24177201 tacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagatgt-caacaagaaaactagggtttgt 24177299  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177300 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 310
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306948
Alignment:
Q  201 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  301 gtaaggttac 310  Q
    |||| |||||    
T  3306939 gtaaagttac 3306948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635830
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggt 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Original strand, 6484281 - 6484367
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484281 cagatttgttacatttttatgggagttacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 6484367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871382
Alignment:
Q  95 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 194  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacc 36871488  T
Q  195 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatat 293  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  294 cccttt 299  Q
    | ||||    
T  36871387 ctcttt 36871382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 159
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306835
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  148 agtttgtctctt 159  Q
    ||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  167 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 227
Target Start/End: Original strand, 25633933 - 25634024
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633933 ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419997
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  222 cttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||| |||  ||||||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagagatt 13419997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47701798 - 47701741
Alignment:
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47701798 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 47701741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634512
Alignment:
Q  155 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 254  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||  |  ||||| ||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  255 gaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||||   | ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttac 14634512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31021362 - 31021281
Alignment:
Q  162 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  31021362 caacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttgatcacatgaagagattagg 31021281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Original strand, 24181504 - 24181567
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  24181504 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttac 24181567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Original strand, 1321363 - 1321437
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1321363 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620580
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  167 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 212  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27635791 - 27635728
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  27635791 tttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 27635728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 310
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634074
Alignment:
Q  266 gagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttac 25634074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 262
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094218
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10094218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100235
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201098
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462241
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626128
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22626128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544311
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883026
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4560567 - 4560514
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||    
T  4560567 gtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaa 4560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6719390 - 6719358
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6719390 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 6719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 97)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Original strand, 18307033 - 18307316
Alignment:
Q  27 ttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaaca 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  18307033 ttacaattttatgggagctatttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaca 18307132  T
Q  127 acaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 226  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307133 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18307232  T
Q  227 ttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  18307233 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttac 18307316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 6756443 - 6756733
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || || ||||||    
T  6756443 cagatttgttacaattttatgagagttacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaa 6756542  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 217  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756543 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 6756642  T
Q  218 gtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  6756643 g--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttac 6756733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457549
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 11457549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9241453 - 9241160
Alignment:
Q  17 gtcagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaaggttta 115  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  9241453 gtcagatttgttccaattttatgggggttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaa-ggttta 9241355  T
Q  116 gaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 215  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9241354 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggatt 9241255  T
Q  216 gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  9241254 gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 9241160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31423241 - 31422947
Alignment:
Q  17 gtcagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttag 116  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31423241 gtcagatttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 31423142  T
Q  117 aaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 215  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31423141 aaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaatt 31423042  T
Q  216 gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31423041 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttac 31422947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076746
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttac 50076746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078896
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 50078896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 16428595 - 16428860
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16428595 tacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 16428694  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16428695 tagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 16428794  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16428795 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 16428860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 293
Target Start/End: Original strand, 13215023 - 13215271
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13215023 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 13215122  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13215123 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13215222  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 293  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 13215271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38925817 - 38925552
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38925817 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38925718  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  38925717 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 38925618  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38925617 actttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 38925552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17186458 - 17186202
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17186458 tataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 17186359  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||| |    
T  17186358 tctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggt 17186259  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  17186258 agaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttac 17186202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839794
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |      
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 18839794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12302850 - 12302579
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctaggg 138  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12302850 ttacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactaggg 12302751  T
Q  139 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12302750 tttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 12302651  T
Q  239 attagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  12302650 attgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttac 12302579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251349
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttac 25251349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50307853 - 50307620
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 176  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307853 gtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggg 50307754  T
Q  177 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50307753 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattc 50307654  T
Q  277 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  50307653 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 50307620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750246
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51750081  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  51750082 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 51750181  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  51750182 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 51750246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 291
Target Start/End: Original strand, 20302410 - 20302647
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20302410 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 20302509  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| |    
T  20302510 tctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggt 20302609  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302610 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 20302647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 41646862 - 41647127
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41646862 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41646961  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  41646962 tagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcg 41647061  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  41647062 actttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 41647127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10400166 - 10399902
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | ||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  10400166 actttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 10400067  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  10400066 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 10399967  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  10399966 ctttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 10399902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 309
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490119
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |      
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 31490119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248646
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |      
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttac 50248646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6996039 - 6995774
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6996039 tacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6995940  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6995939 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttac 6995774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17324975 - 17324710
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  17324975 tacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgta 17324876  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17324875 tagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 17324710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3579957 - 3579690
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg--ctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  3579957 tacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttg 3579858  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  3579857 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattg 3579758  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3579757 gggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3579690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Original strand, 39462469 - 39462717
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39462469 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 39462568  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  39462569 gtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 39462668  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttg 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39462669 tagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttg 39462717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 47906254 - 47906477
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  47906254 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 47906353  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906354 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47906453  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  47906454 ttgatttctcttttgtaacgttac 47906477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28998592 - 28998327
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  28998592 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 28998493  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  28998492 tagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttac 28998327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29004308 - 29004043
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  29004308 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 29004209  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  29004208 tagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttac 29004043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31425331 - 31425089
Alignment:
Q  72 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctc-ttggcaacaaaca 170  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31425331 atcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaaca 31425232  T
Q  171 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag---tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcggga 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  31425231 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 31425132  T
Q  268 gacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31425131 ggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 31425089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14098301 - 14098050
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||   ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098301 ctataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagttt 14098202  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||     
T  14098201 gtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttggg 14098102  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14098101 tagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 14098050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 304
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823215
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6823057  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  6823058 agagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 6823156  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  6823157 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaa 6823215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226356
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16226209  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16226210 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 16226309  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226310 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 16226356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Original strand, 2617466 - 2617723
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2617466 ctataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 2617565  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||     
T  2617566 gtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 2617665  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2617666 tagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 2617723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2949570 - 2949305
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  2949570 tacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 2949471  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||    
T  2949470 tagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 2949305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 15823488 - 15823753
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15823488 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 15823587  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  15823588 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 15823687  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  15823688 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttac 15823753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128079
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttgg-tagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  286 attgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttac 25128079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294908
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  15294931 ttgatttctcttttgtaacgttac 15294908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291645
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  || || | |||  ||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 20291645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 48665113 - 48665385
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggc------tgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctaggg 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||       ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48665113 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 48665212  T
Q  139 tttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgtgaaga 237  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48665213 tttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  238 gattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 48665385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21948484 - 21948262
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  21948484 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 21948385  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948384 gattcacctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 21948286  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  21948285 ttgatttctcttttgtaacgttac 21948262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28207405 - 28207140
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  28207405 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtg 28207306  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  28207305 taaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggg 28207206  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  28207205 gctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 28207140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 28840620 - 28840868
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||  || |||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  28840620 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttg 28840719  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  28840720 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 28840819  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840820 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 28840868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 39932057 - 39932274
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  39932057 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 39932156  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932157 gattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 39932256  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  39932257 ttgatttctcttttgtaa 39932274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 47179697 - 47179902
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  47179697 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47179796  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179797 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47179896  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  47179897 attgat 47179902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 309
Target Start/End: Original strand, 17324016 - 17324269
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| || |||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  17324016 tataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttg 17324113  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |   ||||| |    
T  17324114 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggt 17324213  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17324214 aaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 17324269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 24325648 - 24325870
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24325648 gagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 24325746  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325747 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 24325846  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  24325847 ttgatttctcttttgtaatgttac 24325870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31735864 - 31735601
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacct----tgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31735864 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 31735765  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||      
T  31735764 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaa 31735601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762025
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtat 13761879  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  13761880 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtga 13761979  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761980 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 13762025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 28842435 - 28842683
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28842435 tacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 28842534  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |     
T  28842535 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctg 28842634  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842635 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 28842683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431800
Alignment:
Q  95 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 194  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  195 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 46431800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134151
Alignment:
Q  96 ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 195  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  196 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcc 295  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  296 cttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||| |||||    
T  40134137 cttttgtaaagttac 40134151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9463541 - 9463336
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||    
T  9463541 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9463442  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463441 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9463342  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  9463341 attgat 9463336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 302
Target Start/End: Original strand, 17318868 - 17319086
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318868 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 17318967  T
Q  178 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 277  Q
    | || |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17318968 tggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattct 17319061  T
Q  278 tgtaacccattgatatcccttttgt 302  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||    
T  17319062 tgtaacttattgatatctcttttgt 17319086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 47177346 - 47177551
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||    
T  47177346 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47177445  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47177446 gattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 47177545  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  47177546 attgat 47177551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2510667 - 2510399
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2510667 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtt 2510568  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2510567 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttac 2510399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 302
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824091
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    |||||| ||||  |||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6823926  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgtgaaga 237  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||| |||||    
T  6823927 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaaga 6824026  T
Q  238 gattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgt 302  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6824027 gattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Original strand, 42922151 - 42922437
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || ||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  42922151 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaag 42922250  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
      |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42922251 t-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 42922346  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42922347 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 42922437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9459714 - 9459509
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||    
T  9459714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggtt 9459615  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459614 gattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccc 9459515  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  9459514 attgat 9459509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131470
Alignment:
Q  73 tcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaaca 170  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  171 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 270  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| |||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  271 ttattcttgtaacccattgatatc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatc 4131470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183666
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaat-gcaaca-caaa-ctagggtttgtata 14183827  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttac 14183666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752552
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||    
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtat 51752407  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  51752408 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 51752506  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752507 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 51752552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27337235 - 27337032
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27337037  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  27337036 ttgat 27337032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8347636 - 8347347
Alignment:
Q  17 gtcagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggttta 115  Q
    ||||||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  8347636 gtcagatttgttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggttta 8347538  T
Q  116 gaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 215  Q
    |||   |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8347537 gaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgatt 8347442  T
Q  216 gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||  |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8347441 gagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 8347347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 47451590 - 47451849
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  47451590 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgta 47451689  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  47451690 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 47451783  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  47451784 gctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 47451849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27339427 - 27339223
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27339427 gagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27339328  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  |  |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27339327 gattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaaccca 27339228  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  27339227 ttgat 27339223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18800932 - 18800647
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||     
T  18800932 agattttttccaattttatgag-gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaag 18800834  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
      |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18800833 t-caacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagt 18800738  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||| ||| | ||||||| |   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18800737 ctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttac 18800647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49495552 - 49495285
Alignment:
Q  31 aattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaa 130  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||        |||    
T  49495552 aattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaat-------caa 49495460  T
Q  131 atctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 230  Q
    | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||    
T  49495459 a-ctagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcac 49495365  T
Q  231 gtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49495364 ggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 49495285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15669641 - 15669484
Alignment:
Q  134 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtg 233  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15669641 tagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 15669545  T
Q  234 aagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 294  Q
    ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669544 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 15669484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8349352 - 8349134
Alignment:
Q  80 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8349352 aaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttg 8349255  T
Q  180 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 279  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8349254 g--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttg 8349157  T
Q  280 taacccattgatatcccttttgt 302  Q
    |||| ||||| |||| |||||||    
T  8349156 taactcattggtatctcttttgt 8349134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 310
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432601
Alignment:
Q  149 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttt 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||     ||    
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactt 16432539  T
Q  249 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16432540 tgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttac 16432601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248626
Alignment:
Q  170 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggttttggatagaattaggcgggag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttgg-tagaattaggcgggag 25248668  T
Q  269 acttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 25248626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 291
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231752
Alignment:
Q  170 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggag 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  269 acttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgat 16231752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429164
Alignment:
Q  188 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  288 tgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttac 16429164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520205
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataaa-ggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 150  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  151 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||| ||||||||| ||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  245 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 292  Q
      ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13125768 - 13125532
Alignment:
Q  72 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg-tatagagtttgtctcttggcaacaaaca 170  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| |||| | ||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13125768 atcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaaca 13125671  T
Q  171 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggaga 269  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | |||    
T  13125670 ctagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaga 13125573  T
Q  270 cttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  13125572 cttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 13125532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115183
Alignment:
Q  183 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 282  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  283 cccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    || ||||||||| |||||||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaa 6115183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786028
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 23786028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738704
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| || |||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  284 ccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttac 30738704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30790733 - 30790475
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||      
T  30790733 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaac-aaacaataaa-ctagggttt-- 30790638  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
     ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||       
T  30790637 -tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatgga 30790543  T
Q  244 ggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30790542 gactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 30790475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 284
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757712
Alignment:
Q  195 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 51757712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    |||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613314
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||  || ||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  284 ccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || |||||||| |||||| || |||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttac 26613314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Original strand, 27916529 - 27916632
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  27916529 ctagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacat 27916623  T
Q  233 gaagagatt 241  Q
    |||||||||    
T  27916624 gaagagatt 27916632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 262
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561674
Alignment:
Q  182 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  || |||||  |  ||||| ||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  281 aacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttac 16561674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Original strand, 23816030 - 23816093
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  23816030 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 23816093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26332798 - 26332719
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332798 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 310
Target Start/End: Original strand, 28279309 - 28279473
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |    
T  28279309 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgg 28279405  T
Q  244 ggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||| | ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||    
T  28279406 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttac 28279473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231641
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332632
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagatt 26332632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127790
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    ||||||||||| || ||  ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
      || ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127861 c-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 294
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959240
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag-ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| | |  |||||||| |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  283 cccattgatatc 294  Q
    ||| ||||||||    
T  49959229 ccctttgatatc 49959240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353104
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagatt 14353104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  79 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144826
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 4144826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232635
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997081
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagatt 14997081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 1225138 - 1225419
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1225138 cagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1225237  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225238 agacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 1225337  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  1225338 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 1225419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 27910987 - 27911277
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27910987 cagatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27911086  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911087 g-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27911185  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  27911186 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttac 27911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 27957406 - 27957696
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27957406 cagatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27957505  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957506 g-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27957604  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  27957605 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttac 27957696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106969
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttac 27106969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14419528 - 14419263
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14419528 tacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgta 14419429  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14419428 tagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 14419329  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  14419328 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttac 14419263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480576
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||     
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 30480576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13858821 - 13858557
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13858821 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 13858722  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  13858721 tagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggg 13858622  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  13858621 gctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttac 13858557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 14807749 - 14808014
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14807749 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 14807848  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  14807849 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 14807948  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  14807949 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 14808014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 32339303 - 32339566
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32339303 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 32339402  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32339403 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 32339566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865798
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||| |       
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaac 36865734  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttac 36865798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 4424016 - 4424275
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4424016 tacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4424115  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  4424116 tagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 4424215  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4424216 gctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaa 4424275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 15072708 - 15072974
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15072708 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgta 15072807  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga-gattag 243  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |    
T  15072808 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgg 15072907  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15072908 gactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 15072974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372250
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||      
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttac 5372250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 27829295 - 27829541
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27829295 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 27829394  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  27829395 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 27829494  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829495 accttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 27829541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 15809213 - 15809481
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15809213 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 15809312  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  15809313 tgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 15809481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 608774 - 608997
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 608973  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  608974 ttgatttctcttttgtaacgttac 608997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 27826984 - 27827230
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27826984 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 27827083  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||    
T  27827084 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctggg 27827183  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827184 accttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 27827230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 15067979 - 15068244
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  15067979 tacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgta 15068078  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  |    
T  15068079 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgag 15068178  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15068179 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 15068244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 18810707 - 18810952
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18810707 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18810806  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||     
T  18810807 agagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctggga 18810906  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810907 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 18810952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28251904 - 28251639
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28251904 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 28251805  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  28251804 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28251705  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  28251704 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttac 28251639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541507
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||      
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  247 tttggatagaattaggc 263  Q
    ||| | |||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721088
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtat 44720941  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  44720942 agagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 44721041  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44721042 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 44721088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079847
Alignment:
Q  95 gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 194  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  195 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 43079847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24873476 - 24873271
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  24873476 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggtt 24873377  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24873376 gattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccg 24873277  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  24873276 attgat 24873271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082218
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  43082213 attgat 43082218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 3874004 - 3874273
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||  |||    
T  3874004 tacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtt 3874103  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||      
T  3874104 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 3874273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28283514 - 28283310
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28283514 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggtt 28283415  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28283414 gattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccca 28283315  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  28283314 ttgat 28283310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 304
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952777
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |      
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
     |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaa 25952777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 41384743 - 41385007
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  41384743 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgta 41384841  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  41384842 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||| | |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 41385007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684752
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15186072 - 15185787
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||||    
T  15186072 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaa 15185973  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
       || |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15185972 gaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagt 15185873  T
Q  220 --ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      |||||||||||| |||||||       ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15185872 ctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttac 15185787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 41382671 - 41382925
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  41382671 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgta 41382770  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41382771 tagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac-----------ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 41382925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Original strand, 26775176 - 26775378
Alignment:
Q  22 attttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacg 121  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  26775176 atttgttacaattttatgagggttacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 26775275  T
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26775276 caacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtct 26775375  T
Q  222 ctt 224  Q
    |||    
T  26775376 ctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Original strand, 31162186 - 31162466
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aaaggtttagaa 118  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  31162186 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa 31162285  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    ||  | |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31162286 aca-agcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 31162380  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31162381 tctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaa 31162466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Original strand, 21480545 - 21480765
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21480545 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggtt 21480635  T
Q  178 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 277  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21480636 t---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattct 21480732  T
Q  278 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21480733 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 21480765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5623041 - 5622879
Alignment:
Q  79 taaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5623041 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtt 5622942  T
Q  179 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5622941 tgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagatt 5622879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482573
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtata 21482413  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||     
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 21482573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 310
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956220
Alignment:
Q  137 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  237 agattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15956220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 18812892 - 18813126
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||             
T  18812892 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag--------- 18812982  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
      |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  |     
T  18812983 --agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtga 18813080  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813081 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 18813126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 304
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530372
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaa 43530372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005710
Alignment:
Q  77 tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaaca-aataacaaa-ctagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  176 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttatt 275  Q
    ||| ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  276 cttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3005738 cttgtaatccattgatatctcttttgtaa 3005710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 299
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181754
Alignment:
Q  170 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacgtg--aagagattagggttttggatagaattaggcggg 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |  |||||| | ||  ||||| |||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  267 agacttattcttgtaacccattgatatcccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctcttt 181754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37214517 - 37214317
Alignment:
Q  75 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatct-------------------agggtttgtatagagtttgtc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||                   |||||||||||||||||||||    
T  37214517 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtc 37214418  T
Q  156 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatag 255  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| |||    
T  37214417 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtag 37214327  T
Q  256 aattaggcgg 265  Q
    ||||||||||    
T  37214326 aattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573798
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  245 gttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttac 31573798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3886255 - 3886153
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3886255 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 3886156  T
Q  145 tag 147  Q
    |||    
T  3886155 tag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14419860 - 14419784
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag 95  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  14419860 cagatttgctacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12517319 - 12517248
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctct 158  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12517319 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578350
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  284 ccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  |||||||| ||||||||| |||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttac 31578350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2468260 - 2468202
Alignment:
Q  252 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2468260 atagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttac 2468202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 299
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035370
Alignment:
Q  182 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||| | ||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  281 aacccattgatatcccttt 299  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  31035352 aaccctttgatatctcttt 31035370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Original strand, 181535 - 181632
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  181535 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267161
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattagg 2267161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 304
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847782
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 281  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  282 acccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | || |||||||| |||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa 17847782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2468435 - 2468361
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  2468435 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021251
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 9021251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752666
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757411
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16757411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327946
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28327946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332669
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 28332669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895540
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Original strand, 43530122 - 43530209
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaac 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  43530122 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac 43530209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985954
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagatt 13985954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 16453282 - 16453570
Alignment:
Q  22 attttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  16453282 atttgttacaattttatgggagttacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaagg 16453381  T
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453382 caacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 16453481  T
Q  222 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16453482 cttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 16453570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096144
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19096080 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 19096144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395917
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 12395917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400879
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 12400879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 36378262 - 36378537
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  36378262 cagatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaa 36378361  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  36378362 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaag 36378461  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 294  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36378462 tctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatc 36378537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22803071 - 22802806
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22803071 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 22802972  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22802971 tagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22802872  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22802871 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttac 22802806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 48486315 - 48486580
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  48486315 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 48486414  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48486415 tagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 48486514  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  48486515 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttac 48486580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928249
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 38928249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 24888792 - 24889057
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  24888792 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgta 24888891  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24888892 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactagg 24888991  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24888992 actttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 24889057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37313370 - 37313138
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313370 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 37313271  T
Q  178 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattct 277  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37313270 ttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattct 37313171  T
Q  278 tgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  37313170 tgtaacccattaatatctcttttgtaaagttac 37313138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Original strand, 14633315 - 14633579
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14633315 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 14633413  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14633414 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgg 14633512  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  14633513 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 14633579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33415797 - 33415560
Alignment:
Q  72 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33415797 atcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacac 33415699  T
Q  172 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33415698 taaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagact 33415599  T
Q  272 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33415598 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 33415560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Original strand, 40637069 - 40637335
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40637069 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 40637168  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||      
T  40637169 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattga 40637268  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  40637269 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 40637335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 5198416 - 5198675
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5198416 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgta 5198515  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  5198516 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggg 5198615  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5198616 gctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 5198675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 24878985 - 24879244
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24878985 tacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 24879084  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24879085 tagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 24879184  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24879185 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 24879244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Original strand, 24880447 - 24880706
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||| | |||||| | ||||||||||||||  |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24880447 tacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 24880546  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24880547 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 24880646  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24880647 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 24880706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 619784 - 619519
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||| |||||||||| |    
T  619784 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgca 619685  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||    
T  619684 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattggg 619585  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  619584 tctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttac 619519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22801199 - 22800934
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  22801199 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 22801100  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |    
T  22801099 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgag 22801000  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22800999 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 22800934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40091752 - 40091487
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||     
T  40091752 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtt 40091653  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  40091652 tagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 40091553  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40091552 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttac 40091487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 47274723 - 47274987
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47274723 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47274822  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||    
T  47274823 ta-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctggg 47274921  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47274922 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 47274987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8631714 - 8631491
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  8631714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 8631615  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631614 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8631515  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  8631514 ttgatttctcttttgtaacgttac 8631491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 51015242 - 51015488
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51015242 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51015341  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  51015342 tagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 51015441  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015442 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 51015488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435197
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11435051  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||     
T  11435052 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctagga 11435151  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435152 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 11435197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Original strand, 41997496 - 41997753
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41997496 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 41997595  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  | ||||||     
T  41997596 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttggg 41997695  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  41997696 tagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttac 41997753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 309
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030704
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgtta 56030704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36919924 - 36919657
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttga--gatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36919924 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 36919825  T
Q  143 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  36919824 gataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 36919725  T
Q  242 agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
     ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36919724 gggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgtta 36919657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44600175 - 44599928
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44600175 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 44600076  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44600075 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 44599976  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44599975 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 44599928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36921832 - 36921565
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36921832 tacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 36921734  T
Q  143 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  36921733 tatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 36921634  T
Q  242 agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36921633 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttac 36921565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 13543997 - 13544220
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  13543997 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 13544095  T
Q  186 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544096 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 13544195  T
Q  286 attgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  13544196 attgatatctcttttgtaaagttac 13544220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5637760 - 5637537
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  5637760 gagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 5637661  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5637660 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccca 5637561  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  5637560 ttgatttctcttttgtaacgttac 5637537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 24348256 - 24348479
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  24348256 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggtt 24348355  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24348356 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaaccca 24348455  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  24348456 ttgatttctcttttgtaacgttac 24348479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22044727 - 22044481
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22044727 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22044628  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22044627 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22044528  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22044527 actttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgat 22044481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22047022 - 22046776
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||| | | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22047022 tacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22046923  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22046922 tagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22046823  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046822 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22046776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824642
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3824666  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  3824665 ttgatttctcttttgtaacgttac 3824642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14787770 - 14787503
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14787770 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 14787671  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14787670 tatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 14787503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 304
Target Start/End: Original strand, 47868396 - 47868656
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47868396 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 47868495  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |      
T  47868496 atagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 47868595  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47868596 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 47868656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934233
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16934380  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16934379 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16934280  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934279 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 16934233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847396
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||    |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18847249  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18847250 agagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggg 18847349  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847350 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 18847396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19322954
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  |||||     
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 19322954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 9148247 - 9148495
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  9148247 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttg 9148346  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  9148347 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 9148446  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148447 ggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 9148495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006327
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11006333  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  11006332 attgat 11006327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008656
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  11008661 attgat 11008656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709254
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  18709258 ttgat 18709254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37089666 - 37089462
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  37089666 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggtt 37089567  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089566 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 37089467  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  37089466 ttgat 37089462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 38409243 - 38409447
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38409243 gagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38409342  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38409343 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaaccca 38409442  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  38409443 ttgat 38409447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409424
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-aggg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||      
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaag 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18409482 ttttgg-tagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaag 18409424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 122 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26086069
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  222 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 289  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 26086069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782828
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  22782833 attgat 22782828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Original strand, 6764834 - 6765105
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6764834 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6764933  T
Q  144 atagagtttgtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    ||||||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6764934 atagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagag 6765033  T
Q  239 attagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  6765034 gctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 6765105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9176803 - 9176564
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9176803 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 9176704  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg 251  Q
    ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  9176703 gtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 9176604  T
Q  252 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176603 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 9176564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagactttt-atcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||     
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattct 277  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931879
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16932026  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16932025 agagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16931926  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931925 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 16931879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780463
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  22780468 attgat 22780463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2485211 - 2484963
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagataga-gggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2485211 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 2485112  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  2485111 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 2485012  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485011 ggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgat 2484963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 7941359 - 7941578
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgaggg 184  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| |||    
T  7941359 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtggg 7941458  T
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941459 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7941558  T
Q  285 cattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||| || |||||||||    
T  7941559 cattgatttctcttttgtaa 7941578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22132684 - 22132482
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  22132684 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggtt 22132587  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132586 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22132487  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  22132486 ttgat 22132482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9174482 - 9174236
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9174482 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 9174383  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  9174382 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgag 9174283  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9174282 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgat 9174236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537547
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agg 244  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18537611 cttttgg-tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 18537547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52942776 - 52942537
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacatt--acatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagt 150  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52942776 ctataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 52942678  T
Q  151 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttg 250  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             || ||||    
T  52942677 ttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------------gggtttg 52942591  T
Q  251 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52942590 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18535138 - 18534911
Alignment:
Q  73 tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18535138 tcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacac 18535042  T
Q  172 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 271  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18535041 tagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 18534944  T
Q  272 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18534943 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 18534911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 267
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  || |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaac-aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  247 tttggatagaattaggcggga 267  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31849894 - 31849689
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacact-agggtttgagggt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||    
T  31849894 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggt 31849795  T
Q  186 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31849794 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaaccc 31849695  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  31849694 attgat 31849689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380610
Alignment:
Q  125 caacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  225 ggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttac 36380610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134707
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  22134711 ttgat 22134707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17662575 - 17662317
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17662575 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 17662476  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    |||           ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  17662475 tgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 17662317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8756587 - 8756324
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||   |||||| |||  |||| |||||    
T  8756587 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgt 8756489  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgtgaagagatta 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  8756488 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattg 8756392  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  8756391 agactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 8756324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 210  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47211035 - 47210830
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |        
T  47211035 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg---- 47210940  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210939 --------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 47210848  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  47210847 ttgatttctcttttgtaa 47210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455502
Alignment:
Q  163 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  263 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 16455502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Original strand, 27499129 - 27499303
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27499129 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacga 27499228  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||||||    
T  27499229 taagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttac 27499303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38890472 - 38890298
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  38890472 ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgg 38890376  T
Q  233 gaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||  |  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38890375 gaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 38890298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 53405123 - 53405358
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag---ggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||| |||    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53405123 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 53405222  T
Q  142 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  53405223 gtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  242 agggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 278  Q
      |  ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattctt 53405358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15032898 - 15032621
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |   | ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||     
T  15032898 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaag 15032799  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
      |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||          ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  15032798 t-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagt 15032712  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15032711 ctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15032621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 185
Target Start/End: Original strand, 5100993 - 5101133
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  5100993 tacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 5101092  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 185  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101093 tagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891552
Alignment:
Q  191 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  291 tatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttac 2891552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 309
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136809
Alignment:
Q  137 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 236  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  237 agattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    | |||  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagtta 30136809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891427
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattaca-tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  146 agagtttgtctctt 159  Q
    ||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547415
Alignment:
Q  197 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  297 ttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| |||||    
T  13547402 ttttgtaaagttac 13547415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Original strand, 28453782 - 28453943
Alignment:
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  28453782 agagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      |||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttac 28453943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113080
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 151  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||||  |||| ||||||| | |||||  ||| ||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  152 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gtgaagagattagggttttg 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  251 gatagaattag 261  Q
    | |||||||||    
T  10113070 ggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102348
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| |   ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  283 cccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttac 12102348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47151131 - 47150976
Alignment:
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  47151131 tatagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattg 47151035  T
Q  243 gggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
     |  ||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47151034 agaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 47150976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40999286 - 40999022
Alignment:
Q  43 gttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacg-caacaacaaatctagggtt 140  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||  |||| ||||||  || |||||| ||| |||||| |    
T  40999286 gttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttaga--cgtcaacaagaaaactaggggt 40999190  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40999189 tgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 40999093  T
Q  241 tagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
       |  ||||| ||||||||||   |||||||   | ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  40999092 cgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 40999022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Original strand, 9863795 - 9863898
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgt 232  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||     
T  9863795 ctagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgg 9863889  T
Q  233 gaagagatt 241  Q
    |||||||||    
T  9863890 gaagagatt 9863898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Original strand, 4215510 - 4215567
Alignment:
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4215510 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 4215567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 310
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357902
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgg----atagaatt-aggcgggagacttattcttg 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||  |||||    |||||||| ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  280 taacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttac 25357902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5635611 - 5635548
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  5635611 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 5635548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Original strand, 10114435 - 10114519
Alignment:
Q  155 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  10114435 ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagatt 10114519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983606
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||  |  ||||| ||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  283 cccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||| ||||||||  ||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaa 31983606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982249
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  ||    
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  249 tggatagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| ||||||| ||   | ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttac 3982249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Original strand, 11437561 - 11437605
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437561 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 11437605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 16455257 - 16455356
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| | |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16455257 cagatttgttacaatttaatggtagttacttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Original strand, 36380344 - 36380417
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagata 92  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  36380344 cagatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Original strand, 5101133 - 5101184
Alignment:
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5101133 tagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaa 5101184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022495
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |     
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  221 tcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  9022475 tcttggtcacgggaagagatt 9022495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185924
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatat 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatat 16185924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gggacttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050401
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7050401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853587
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 11853587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16186199 - 16186079
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggct-gaaataaaggtttagaa 118  Q
    |||||| || |||||||| | | | ||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||    
T  16186199 agatttgttccaattttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaa 16186100  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggttt 141  Q
    ||  ||||||||| |||||||||    
T  16186099 ac-aaacaacaaa-ctagggttt 16186079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822303
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906779
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagatt 54906779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489388
Alignment:
Q  203 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 16489388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699788
Alignment:
Q  203 cactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 25699788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678283
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||      
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttac 21678283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680244
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||      
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttac 21680244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724796
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||      
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 44724796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137181
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||| | | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||      
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 20137181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 304
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355469
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |      
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaa 11355469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39146059
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |       
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac 39146059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4296006
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattac-atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  146 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 4296006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 443547 - 443812
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  443547 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 443646  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  443647 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttac 443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13099813 - 13099558
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13099813 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 13099714  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13099713 tagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttt 13099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 310
Target Start/End: Original strand, 24748555 - 24748811
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24748555 tataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttg 24748654  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |    
T  24748655 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggt 24748754  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24748755 agaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 24748811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27306566 - 27306302
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27306566 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-ta 27306468  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  27306467 tagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 27306368  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27306367 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttac 27306302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412198
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  148 agtttgtctcttg-gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||      
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc-ccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttac 37412198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42331336 - 42331069
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||    
T  42331336 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgta 42331237  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||     
T  42331236 tagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 42331069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276358
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |      
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttac 25276358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Original strand, 24258442 - 24258680
Alignment:
Q  72 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 171  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258442 atcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 24258541  T
Q  172 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |  ||||||||||||||||||| | |||    
T  24258542 tatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaact 24258641  T
Q  272 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24258642 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 24258680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31435384 - 31435119
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31435384 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31435285  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |     
T  31435284 tagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 31435185  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31435184 actttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 31435119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 38393934 - 38394203
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38393934 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38394033  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  38394034 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 38394203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21592453 - 21592215
Alignment:
Q  72 atcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21592453 atcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 21592354  T
Q  172 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagact 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  21592353 tagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 21592254  T
Q  272 tattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  21592253 tattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 21592215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Original strand, 42223097 - 42223375
Alignment:
Q  34 tttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagg-gggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaat 132  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||  |||||||||||     
T  42223097 tttatgagggtttcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaa 42223196  T
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42223197 ctagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 42223296  T
Q  232 tgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  42223297 ggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttac 42223375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 35581 - 35846
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||| |||||||||||     
T  35581 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtg 35680  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  35681 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 35780  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  35781 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 35846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 20297356 - 20297573
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20297356 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggtt 20297455  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297456 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaaccca 20297555  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  20297556 ttgatttctcttttgtaa 20297573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 48457647 - 48457870
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48457647 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 48457746  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457747 cattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 48457846  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  48457847 ttgatttctcttttgtaacgttac 48457870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 44516 - 44781
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  44516 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtg 44615  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||    
T  44616 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttggg 44715  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  44716 actttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049386
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  || || | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1049532  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  1049531 agagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 1049432  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049431 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 1049386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 87 - 304
Target Start/End: Original strand, 18345535 - 18345752
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  18345535 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggtt 18345634  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345635 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 18345734  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| || |||||||||    
T  18345735 ttgatttctcttttgtaa 18345752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 9679053 - 9679276
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggt 185  Q
    ||||||||||||||||||| || | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  9679053 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 9679151  T
Q  186 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679152 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9679251  T
Q  286 attgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  9679252 attgatatctcttttgtaaagttac 9679276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836833
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||  | ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40836979  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |     
T  40836978 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 40836879  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836878 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 40836833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1047015
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  1047019 ttgat 1047015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681037
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 141  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  142 gtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttac 9681037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7470317 - 7470094
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7470317 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7470218  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470217 gattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7470118  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  7470117 ttgatttctcttttgtaacgttac 7470094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7472275 - 7472052
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  7472275 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7472176  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7472175 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaaccca 7472076  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  7472075 ttgatttctcttttgtaacgttac 7472052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 20626032 - 20626255
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20626032 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20626131  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20626132 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20626231  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  20626232 ttgatttctcttttgtaacgttac 20626255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 20629923 - 20630146
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20629923 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20630022  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20630023 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20630122  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  20630123 ttgatttctcttttgtaacgttac 20630146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 20642342 - 20642565
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  20642342 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20642441  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20642442 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20642541  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  20642542 ttgatttctcttttgtaacgttac 20642565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27832936 - 27832705
Alignment:
Q  80 aaaccttgagatagagggg-gctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 178  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832936 aaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtt 27832837  T
Q  179 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattctt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27832836 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattctt 27832737  T
Q  279 gtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  27832736 gtaacccattgatatctcttctgtaaagttac 27832705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487770
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  28487747 ttgatttctcttttgtaacgttac 28487770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31156248 - 31156001
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31156248 tacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31156149  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  31156148 tagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgg 31156049  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156048 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 31156001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 11757176 - 11757447
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataa-aggtttagaaacgcaacaacaaatctagggt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  11757176 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 11757275  T
Q  140 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11757276 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  239 attagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 11757447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 20299406 - 20299677
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataa-aggtttagaaacgcaacaacaaatctagggt 139  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||   |||||||||| |||||||    
T  20299406 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 20299505  T
Q  140 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20299506 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  239 attagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 20299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990367
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 21990367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351742
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7351748  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  7351747 attgat 7351742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22828995 - 22828711
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || || ||||||| | | ||||||| |||||||||||| | ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  22828995 agatttgttccagttttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaa 22828896  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  22828895 ggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagt 22828796  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||||||||| | |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828795 ctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 22828711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 28485514 - 28485783
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28485514 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 28485613  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28485614 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttac 28485783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850198
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  | ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttac 1850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7349568 - 7349363
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  7349568 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7349469  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349468 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7349369  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  7349368 attgat 7349363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 3878571 - 3878794
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||    
T  3878571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggtt 3878670  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878671 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3878770  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| || ||||||||| |||||    
T  3878771 ttgatttctcttttgtaacgttac 3878794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542727
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 25542582  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||     
T  25542583 agagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 25542681  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542682 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgat 25542727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 78 - 286
Target Start/End: Original strand, 26804554 - 26804765
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacac---tag 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  26804554 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtag 26804653  T
Q  175 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26804654 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 26804753  T
Q  275 tcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||    
T  26804754 tcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 301
Target Start/End: Original strand, 3035669 - 3035932
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3035669 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 3035768  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg---tgaaga 237  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  3035769 tttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  238 gattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttg 301  Q
    |  | ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 3035932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 92 - 310
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946545
Alignment:
Q  92 agagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 191  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  192 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  292 atcccttttgtaaggttac 310  Q
     || ||||||||| |||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttac 40946545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20091903 - 20091617
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    |    
T  20091903 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga 20091804  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20091803 ggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaat 20091708  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20091707 ctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 20091617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251638
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 294  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 22251638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Original strand, 7188470 - 7188755
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  7188470 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag 7188569  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
      |||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7188570 t-caacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 7188665  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtta 309  Q
    |||||||| ||| ||| |||||  |  ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7188666 ctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagtta 7188755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43253801 - 43253589
Alignment:
Q  97 gggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 196  Q
    ||||||||| || | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43253801 gggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcacctt 43253703  T
Q  197 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  43253702 gggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 43253603  T
Q  297 ttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| |||||    
T  43253602 ttttgtaacgttac 43253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092284
Alignment:
Q  162 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattag 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  262 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 7092284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24817711 - 24817426
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttaga 117  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||||||   ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24817711 cagatttgttacaattttatgagggatactttaa-tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttaga 24817614  T
Q  118 aacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 217  Q
    |   |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  24817613 agt-caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattga 24817519  T
Q  218 gtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||    
T  24817518 gtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttac 24817426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 211
Target Start/End: Original strand, 18567565 - 18567731
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18567565 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 18567664  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 211  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567665 tagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813571
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  222 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttac 24813571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094532
Alignment:
Q  162 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattag 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  262 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 7094532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465748
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    |||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||| ||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaat-------caaa-ctagggtttgtata 24465594  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||      
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaa 24465748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Original strand, 22392425 - 22392618
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||        |||| ||||||||||||    
T  22392425 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaat-------caaa-ctagggtttgta 22392516  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  22392517 tagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatgagg 22392612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 291
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396833
Alignment:
Q  171 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagac 270  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  271 ttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgat 38396833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935467
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 2935467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 250
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081663
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtct 11081634  T
Q  222 cttggttacgtgaagagattagggttttg 250  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  11081635 cttgatcacgggaagagattaggattttg 11081663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606578
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgat 1606578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 310
Target Start/End: Original strand, 22393873 - 22393939
Alignment:
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22393873 ggttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 22393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 299
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049077
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatc 6048997  T
Q  221 tcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttt 299  Q
    ||||||| ||| ||||| |||  |  ||||||||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6048998 tcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatcccttt 6049077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027284
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgat 9027284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137276
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 22137276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552303
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 40552303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Original strand, 11084438 - 11084523
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11084438 tctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagatt 11084523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108265
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 22108265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550025
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgat 40550025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 6332283 - 6332437
Alignment:
Q  155 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 254  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  |  ||| | ||    
T  6332283 ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggta 6332380  T
Q  255 gaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  6332381 gaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttac 6332437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Original strand, 26295601 - 26295664
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26295601 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 26295664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Original strand, 6348936 - 6348993
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6348936 tttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaa 6348993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297166
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 16297166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30906387 - 30906264
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||  || |||||| |||| ||||||    
T  30906387 tacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaac-aaataacaaa-ctagagtttgt 30906290  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaaca 170  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30906289 atagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 154
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  93 gagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 154  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310157
Alignment:
Q  161 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Original strand, 26210603 - 26210688
Alignment:
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26210603 tctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagatt 26210688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120937
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369683
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagatt 21369683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281519
Alignment:
Q  188 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagatt 40281519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7094717 - 7094662
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320194
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3320194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324942
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3324942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069818
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7069818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074825
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7074825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351391
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25351391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357085
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25357085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405431
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25405431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410168
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25410168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006701
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 42006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 178
Target Start/End: Original strand, 6348859 - 6348903
Alignment:
Q  133 ctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6348859 ctagggtttgtatcgagtttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40032395 - 40032146
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40032395 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40032296  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  40032295 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttagg 40032196  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 294  Q
      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032195 actttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatc 40032146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539553
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 304
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196814
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||  | ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||     
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 28196814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42923848 - 42923581
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  42923848 tacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttg 42923749  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  42923748 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttac 42923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007823
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||     
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 19007823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264221
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||| |    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 6264221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 55 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979653
Alignment:
Q  55 ataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 154  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  155 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 254  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | ||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  255 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggtt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggtt 34979653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 3022089 - 3022335
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3022089 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttt 3022188  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |     
T  3022189 gtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttagg 3022288  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3022289 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttt 3022335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849300
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||| |||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |      
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 17849300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 42064433 - 42064679
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42064433 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 42064532  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  42064533 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42064632  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064633 actttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 42064679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739632
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||      
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttac 11739632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45239316 - 45239049
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 141  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| || | ||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  45239316 cttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 45239217  T
Q  142 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45239216 gtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 45239118  T
Q  242 agggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45239117 ggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 45239049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504424
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19504582  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  19504581 agagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctggga 19504483  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19504482 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 19504424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13910135
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13910281  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |      
T  13910280 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaa 13910181  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910180 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 13910135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27104962
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 27104817  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  27104818 agagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 27104916  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104917 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 27104962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21521032 - 21520765
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  21521032 tacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttg 21520933  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||    
T  21520932 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggcta 21520833  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21520832 ggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 21520765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45280323 - 45280056
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaac-gcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  45280323 ttactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttg 45280224  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  45280223 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 45280124  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  45280123 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 45280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6259152 - 6258889
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || ||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  6259152 tacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgta 6259053  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  6259052 tagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggg 6258955  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6258954 gctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 6258889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23452578 - 23452315
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||    |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23452578 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 23452479  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  23452478 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    | ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 23452315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19502089
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatag 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  148 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 247  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  248 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 19502089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 42452701 - 42452964
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  42452701 tacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 42452800  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  42452801 taaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 42452964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44289370 - 44289140
Alignment:
Q  80 aaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 179  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289370 aaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggttt 44289271  T
Q  180 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  || || |||||||| | || | |||||||||||    
T  44289270 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttg 44289171  T
Q  280 taacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  44289170 taacccgttgatatctcttttgtaagattac 44289140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578181
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||      
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 11578181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22287673 - 22287408
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22287673 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22287574  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||       
T  22287573 tagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgac 22287474  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  22287473 acttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttac 22287408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837450
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | |||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||  |      
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagac 14837386  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 14837450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 310
Target Start/End: Original strand, 17848394 - 17848623
Alignment:
Q  78 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactaggg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17848394 gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttggg 17848493  T
Q  177 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 276  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  17848494 tttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattc 17848590  T
Q  277 ttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17848591 ttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttac 17848623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732849
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||            || ||      
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggac 31732913  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 31732849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215676
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  35215781 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactc 35215682  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  35215681 attgat 35215676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35218053
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  286 attgat 291  Q
     |||||    
T  35218058 gttgat 35218053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162313
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 24162449  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          | ||     
T  24162448 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tggga 24162359  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162358 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 24162313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43623905 - 43623652
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43623905 tacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 43623806  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  43623805 tagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43623718  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43623717 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 43623652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18800639 - 18800386
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||          || ||||||||||||    
T  18800639 tacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgta 18800548  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  18800547 tagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggg 18800452  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18800451 gctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 18800386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 22874034 - 22874313
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| || | ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22874034 cagatttgtttcaattttatgagggttacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22874133  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    |        |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22874134 at-------caaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgag 22874221  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| || ||| |||||||||  || ||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22874222 tctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 22874313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 224  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459262
Alignment:
Q  137 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  237 agattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    || || ||| ||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttac 28459262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22407746 - 22407591
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22407746 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22407647  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 200  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407646 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897318
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 17897407  T
Q  222 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| | | ||| |||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  17897406 cttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttac 17897318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146681
Alignment:
Q  122 caacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtct 20146770  T
Q  222 cttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||| ||| ||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||    
T  20146769 cttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttac 20146681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375424
Alignment:
Q  177 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattc 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  277 ttgtaacccattgatatcccttttgtaa 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaa 5375424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37963290 - 37963030
Alignment:
Q  19 cagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaa 118  Q
    ||||||| || ||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  37963290 cagatttgttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 37963191  T
Q  119 acgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 218  Q
    |        |||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||    
T  37963190 at-------caaa-ctagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgag 37963103  T
Q  219 tctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    ||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37963102 tctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat 37963030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136197
Alignment:
Q  137 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaag 236  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  237 agattagggttttggatagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | ||| ||  ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 27136197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558954
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 36558954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561231
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 36561231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332271
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgat 45332271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699557
Alignment:
Q  183 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgta 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  282 acccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    | || |||||||| ||||||||| |||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttac 40699557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5377724 - 5377629
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 182  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377724 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 241
Target Start/End: Original strand, 35107218 - 35107407
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaag-gtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||| |  || |||  ||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||||    
T  35107218 tacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgt 35107315  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35107316 atagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 35107407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  170 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggaga 269  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 141
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  48 ttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggttt 141  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139484
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 43139484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589866
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatccctt 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  299 ttgt 302  Q
    ||||    
T  20589863 ttgt 20589866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22407583 - 22407526
Alignment:
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22407583 tagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 22407526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583480
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 27583480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707825
Alignment:
Q  263 cgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 22707825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 12342747 - 12342681
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg 111  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12342747 tacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagg 12342681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463020
Alignment:
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 7463020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 262
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg-ttttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694087
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt-tttggatagaattaggcggga-gacttattcttgt 280  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||||   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  281 aacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttac 15694087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 241
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345718
Alignment:
Q  184 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatt 26345718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 241
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028688
Alignment:
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagatt 35028688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 310
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23870999
Alignment:
Q  262 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttac 23870999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575265
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggt 34575265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 40699203 - 40699278
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagag 95  Q
    |||||| || ||||||| || | | ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  40699203 agatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736243
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2736243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2740979
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2740979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462474
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17462474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054909
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20054909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712660
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717369
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680083
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 39680083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687021
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 39687021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567447
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503032
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatt 7503032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720754
Alignment:
Q  185 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 241  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagatt 30720754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 284
Target Start/End: Original strand, 38020312 - 38020349
Alignment:
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020312 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 183977 - 183713
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  183977 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 183879  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  183878 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgg 183780  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  183779 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 183713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 51960 - 52227
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  51960 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 52059  T
Q  143 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatta 242  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  52060 tatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  243 gggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 52227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 310
Target Start/End: Original strand, 79144 - 79401
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagttt 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79144 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 79243  T
Q  153 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |  |||||     
T  79244 gtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttggg 79343  T
Q  253 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  79344 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 79401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 3948 - 4212
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3948 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4047  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||    
T  4048 ta-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctggg 4146  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4147 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 4212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 14970 - 15235
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  14970 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggttttta 15069  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  15070 taaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcag 15169  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15170 actttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14454
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  287 ttgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  14477 ttgatatctcttttgtaacgttac 14454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 69632 - 69382
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtt 140  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  69632 tacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 69533  T
Q  141 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 240  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  69532 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggt 69433  T
Q  241 tagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69432 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 69382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 73318 - 73207
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  73318 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 73219  T
Q  187 gattcaccttgg 198  Q
    ||||||||||||    
T  73218 gattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  166 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41821 - 41555
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41821 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 41722  T
Q  144 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattag 243  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  41721 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 41622  T
Q  244 ggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  41621 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 41555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11545
Alignment:
Q  45 tacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgta 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  11810 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 11711  T
Q  145 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11710 tagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
      ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 11545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6397
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  ||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtat 6250  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagg 244  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6251 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  245 gttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6351 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgat 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3077
Alignment:
Q  46 acttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtat 145  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2931  T
Q  146 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||     
T  2932 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttgga 3031  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3032 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80075
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| ||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  147 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  246 ttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
     ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  80012 ctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188386
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 34 - 239
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  286 attgat 291  Q
    ||||||    
T  234 attgat 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 15894
Alignment:
Q  20 agattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaa 119  Q
    |||||| || ||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  16180 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaag 16081  T
Q  120 cgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 219  Q
      |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16080 t-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 15985  T
Q  220 ctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15984 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 291
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29368
Alignment:
Q  87 gagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 186  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  187 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 286  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  287 ttgat 291  Q
    |||||    
T  29364 ttgat 29368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 304
Target Start/End: Original strand, 2036 - 2251
Alignment:
Q  88 agatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 187  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||    
T  2036 agatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttg 2134  T
Q  188 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2135 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccat 2234  T
Q  288 tgatatcccttttgtaa 304  Q
    | || || |||||||||    
T  2235 taatttctcttttgtaa 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 274
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||  | |||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||      
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16975 - 16723
Alignment:
Q  54 tataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttg 153  Q
    |||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16975 tataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggtttgaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg 16877  T
Q  154 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggat 253  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |  ||||| |    
T  16876 -ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggt 16780  T
Q  254 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16779 agaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 16723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85446
Alignment:
Q  47 cttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtata 146  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||  ||||||||||||||||| | ||  |||| || | |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  147 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |      
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  247 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttac 85446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1715
Alignment:
Q  56 taaatatagacattacatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgt 154  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  155 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggata 254  Q
           |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||    
T  1861 -------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  255 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatcccttttgtaaggttac 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 1715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1543
Alignment:
Q  163 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattagg 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  263 cgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgat 1543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 300
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5016
Alignment:
Q  53 ctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaagg-tttagaaacgcaa-caacaaatctagggtttgtatagagt 150  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | || ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa--gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgt 4869  T
Q  151 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt-agggtttt 249  Q
    || |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | | ||||    
T  4870 tt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagctttt 4966  T
Q  250 ggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatccctttt 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4967 gg-tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttt 5016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 993
Alignment:
Q  44 ttacttttgctataaatatagacattacatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaacgcaacaacaaatctagggtttgt 143  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1169 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 1070  T
Q  144 atagagtttgtctc-----ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 215  Q
    ||||||||||||||     || | ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1069 atagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22313
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgat 22313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24588
Alignment:
Q  199 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgat 24588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 238
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224857
Alignment:
Q  200 aaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University