View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19165_high_16 (Length: 312)

Name: NF19165_high_16
Description: NF19165
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19165_high_16
NF19165_high_16
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-312)||(1660329-1660640)
chr6 (1-307)||(16103789-16104095)
chr6 (1-312)||(17786680-17786992)
chr6 (54-312)||(18421101-18421359)
chr6 (1-310)||(21412014-21412323)
chr6 (1-310)||(22364852-22365161)
chr6 (1-292)||(16378879-16379170)
chr6 (1-259)||(16646508-16646766)
chr6 (1-259)||(14149881-14150139)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-312)||(21847121-21847432)
chr8 (1-312)||(20649139-20649450)
chr8 (1-165)||(16415771-16415935)
chr8 (1-307)||(21193341-21193647)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (1-312)||(15000274-15000584)
chr4 (1-310)||(15289501-15289810)
chr4 (8-253)||(18272713-18272958)
chr4 (38-107)||(28266083-28266152)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1-311)||(27045-27355)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (1-312)||(240-551)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (1-312)||(12675-12986)
scaffold0467 (1-276)||(1-276)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-312)||(7780-8091)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (1-312)||(6201-6515)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (1-312)||(3360-3671)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (1-312)||(22281356-22281667)
chr2 (1-310)||(25131710-25132020)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (1-312)||(20928689-20929000)
chr1 (1-312)||(20528688-20528999)
chr1 (1-292)||(20827825-20828116)
chr1 (8-310)||(22128853-22129156)
chr1 (6-302)||(41214284-41214580)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (1-312)||(23509209-23509520)
chr5 (1-310)||(24584734-24585043)
chr5 (8-310)||(21828347-21828649)
chr5 (1-59)||(33314011-33314069)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-292)||(315-606)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (1-312)||(6149433-6149744)
chr3 (1-312)||(15943175-15943486)
chr3 (1-307)||(25768464-25768770)
chr3 (1-308)||(17201885-17202192)
chr3 (1-292)||(30150606-30150897)
chr3 (1-310)||(8270981-8271290)
chr3 (1-259)||(13963988-13964246)
chr3 (7-259)||(22149379-22149631)
chr3 (10-310)||(17321176-17321476)
chr3 (256-309)||(5224953-5225006)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (3-312)||(27427-27736)
scaffold0008 (1-312)||(130830-131144)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-312)||(8733-9044)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (1-312)||(3270-3581)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-312)||(25828-26138)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (1-307)||(4720-5025)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-310)||(97174-97483)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (110-312)||(3168-3370)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-304)||(8806-9109)
scaffold0021 (1-174)||(91151-91324)
scaffold0021 (1-259)||(20273-20531)
scaffold0021 (1-259)||(29849-30107)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (130-312)||(73069-73251)
scaffold0011 (130-312)||(77450-77632)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (1-157)||(12124-12280)
scaffold0465 (194-308)||(12007-12121)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (1-292)||(27104144-27104435)
chr7 (1-259)||(27173890-27174148)
chr7 (1-292)||(7827509-7827800)
chr7 (215-312)||(16575123-16575220)
chr7 (215-312)||(16590442-16590539)
chr7 (10-310)||(4443541-4443841)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (1-259)||(4204-4461)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (200-312)||(16637-16749)
scaffold0162 (1-89)||(16550-16638)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-310)||(25047-25355)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-310)||(35519-35828)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (6-292)||(5377-5663)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-72)||(2225-2296)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (8-130)||(32401-32523)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-42)||(24612-24653)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1660640 - 1660329
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1660640 tgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 1660541  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1660540 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcaccgcccaactcaagcctgcccttggcattgatc 1660441  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1660440 caccagtactctgcttcctcagcaaacatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 1660341  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  1660340 cccaagtctgtg 1660329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 16103789 - 16104095
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16103789 tgtagggaaaaaacctggaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgcttccttgattcaaattcagaaactcaacctccttcttagt 16103888  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||| |||    
T  16103889 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcagctttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatttcaagtcttcctttggcattagtc 16103988  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16103989 caccagtgctccgcttcctcagcaagcacatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtcaccatagcttggaaaatccgctccataccctgca 16104088  T
Q  301 cccaagt 307  Q
    |||||||    
T  16104089 cccaagt 16104095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 17786680 - 17786992
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17786680 tgtaaggataaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatattcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 17786779  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||    
T  17786780 cctcaagtcttcagggaaatatttcctcaagaattcgaccttgaacttagcctaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtc 17786879  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctga-ccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgc 299  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17786880 caccagtgcccttcttcctcagctagcatatgagtcgctagtctgagccttctggtcatttcccgtaaccatagctcggaaaatccgttccataccctgc 17786979  T
Q  300 acccaagtctgtg 312  Q
    |||||||||||||    
T  17786980 acccaagtctgtg 17786992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 54 - 312
Target Start/End: Original strand, 18421101 - 18421359
Alignment:
Q  54 gacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggccc 153  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18421101 gacatgatcccttgttatagattcagaaactcaatctccttgttggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaacctggaacttagccc 18421200  T
Q  154 aggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctg 253  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18421201 aggtcacaacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtccaccagtgctctgcttccttagcaagcatatgagtcgctagtctgaccttctg 18421300  T
Q  254 gtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtctgtg 312  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18421301 gtcatccctcgtcaccatagatcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtctgtg 18421359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21412323 - 21412014
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| || ||||||||| | ||    
T  21412323 tgtacggacaaaacttcgaaagctcctcaaacttcgcctcatactcggctacagacatgcttccctgcttcaggttcagaaattccacctccttcctagt 21412224  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||  || || ||| |||| |||    
T  21412223 tctcaaatcttcagggaaatacttccttaagaattctgctttgaacttcgcccaggtcacaacttctcctcccatctcaaatcttcctttgacattagtc 21412124  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  21412123 caccagtactcagcctcctcagcaagcatatgagtcgccaatctggccttttggtcatctcccgtcaccatagcacgaaatatccgctccatgccctgca 21412024  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
    ||||||||||    
T  21412023 cccaagtctg 21412014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22365161 - 22364852
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||  ||||  ||||| || |||||| ||||    
T  22365161 tgtatggaaaaaatctcgaaagctcttcaaacttcgccgtatactcagctacagacatgctcccttgctacaagttcaagaactctacttccttcctggt 22365062  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| | ||| |||    
T  22365061 cctcaaaccttcagggaaatacttcctcaagaactcaactttgaactttgcccaagtcacaacttctccaccaatctcaagtcttcccttagaattagtc 22364962  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||| |  || |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  22364961 caccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgagtaaccaacctgaccttctagtcatcacttgtcaccatagcacggaatatcctctctatgccctgca 22364862  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
    ||||||||||    
T  22364861 cccaagtctg 22364852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16379170 - 16378879
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  16379170 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 16379071  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  16379070 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 16378971  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||    
T  16378970 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccat 16378879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16646766 - 16646508
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  16646766 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 16646667  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || |||  ||||||| | | ||| ||||| ||  | ||  | | |||||| || ||||| |||||||||    
T  16646666 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagtcttgaacgttgtccaagtcacaacccctccatcaatctcaagtcttcccttagcattggtc 16646567  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  16646566 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatc 16646508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 14149881 - 14150139
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||| | ||    
T  14149881 tgtacggacaaaacctcgacagctcctcaaacatcgccgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaagttcaagaactccacctccttcctagt 14149980  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || ||  | || ||||||||||| || ||   ||||||||| ||||| ||||| || || || || | ||||||  | ||||| ||||| |||    
T  14149981 cctcaaatcctctagaaagtacttcctcaaaaactcggtcttgaacttagcccaagtcacaacctctccaccaatctcaagttttcccttagcattagtc 14150080  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||| || |||||| | | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14150081 caccaatactcggcctcctcaacaaacatgtgagtagccaacctgaccttctgatcatc 14150139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21847432 - 21847121
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21847432 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcaccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 21847333  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21847332 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcacaacaccaccttccaactcaagtctgcccttggcattggtc 21847233  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21847232 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatcaccagtaaccatagcttggaaaatccgctccattccctgca 21847133  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  21847132 cccaagtctgtg 21847121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20649450 - 20649139
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20649450 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgttttaaattcagaaactcaacctccttcttggt 20649351  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  20649350 cctcaagtcttcagggaaacacttcctcaagaattcaactttgaacttcgcccaggtcacaacatcacctcccaactcaagtcttcctttggcattagtc 20649251  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  20649250 cacaagtgctctgcttcctcagcaagcatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtcaccatagctcgaaaaacccgctccatgccctgca 20649151  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  20649150 cccaagtctgtg 20649139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 16415771 - 16415935
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16415771 tgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatattcggctacagacatgatccattgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 16415870  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacat 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16415871 cctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagccgaggtcaccacat 16415935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21193647 - 21193341
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21193647 tgtacggacaaaacctcgaaagcttctcgaacttcgccgcatactcggctacagagatgctcccttacttcaagttcagaaacgctacctccttcctggt 21193548  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || || ||  | | |||||| || |||||||||||||||    
T  21193547 cctcaaatcttcagggaaatacttcctcaagaactcagctttgaacttcgcccaagtcacgacttccccaacaatctcaagtcttcccttggcattggtc 21193448  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| || || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  || |||| |||||| |||||||    
T  21193447 caccaatattcggcctcctcagcaagcatatgagtcgtcaatctgaccttctggtcatcactcgtcaccatagcacaaaatatcctctccatgccctgca 21193348  T
Q  301 cccaagt 307  Q
    |||||||    
T  21193347 cccaagt 21193341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 15000274 - 15000584
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000274 tgtagggacaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgtatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 15000373  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000374 cctcaagtcttccgggaa-tacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcaccccccaactcaagcctgcccttggcattggtc 15000472  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000473 caccagtactctgcttcctcagctaacatatgagtcgctagtctgaccttctagtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 15000572  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  15000573 cccaagtctgtg 15000584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15289810 - 15289501
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||  |||| |||||  ||||| || |||||| | ||    
T  15289810 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttacttcaaattcaagaactccacttccttcctagt 15289711  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  15289710 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 15289611  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| |||||| || ||||    
T  15289610 cgccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccatgccttgca 15289511  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
     ||| |||||    
T  15289510 accatgtctg 15289501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Original strand, 18272713 - 18272958
Alignment:
Q  8 acaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || | |||| | ||||| ||     
T  18272713 acaaaacctcgatagctcctcaaacgtcgccgcatactcagctatggacatgctcccttgcttcaagttcaagaactccactttcttcctagtccttaaa 18272812  T
Q  108 tcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagt 207  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  18272813 tcttctggaaaatacttcctcaaaaactcagctttgaactttgcccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattagtccaccaat 18272912  T
Q  208 actctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctg 253  Q
    |||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||    
T  18272913 actcggcctcctcagcaagcatgtgggtagcaaacctgaccttctg 18272958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28266152 - 28266083
Alignment:
Q  38 cgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28266152 cgcatactcggctacagacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 28266083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 27045 - 27355
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27045 tgtagggacaaaacctagaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 27144  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  27145 cctcaagtctttcgggaaataattcctcaagaattcaaacttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattggtc 27244  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27245 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgctaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctgca 27344  T
Q  301 cccaagtctgt 311  Q
    |||||||||||    
T  27345 cccaagtctgt 27355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 240 - 551
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  240 tgtagggacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 339  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  340 cctcaagtcttacgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccacgtcaccacataacctcccaactcaagccttcctttggcattagtc 439  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  440 catcagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccataccctgca 539  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||| ||||    
T  540 cccaagtatgtg 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12986 - 12675
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12986 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgtttccttgtttcagattcagaaactcaatttccttcttggt 12887  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| | |    
T  12886 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccagttcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagcc 12787  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  12786 caccagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctaga 12687  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  12686 cccaagtctgtg 12675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 276 - 1
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  276 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgtttccttgtttcagattcagaaactcaatttccttcttggt 177  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| | |    
T  176 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccagttcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagcc 77  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctc 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76 caccagtgctctgcttcctcagctagcatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8091 - 7780
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||     
T  8091 tgtagggacaaaacctcaaaagttcctcgaacttcgccacatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaacttcatctccttcttggc 7992  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7991 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacatagcccaggtcacctcatcacctcccaactcaagcctgcctttggcattggtc 7892  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7891 cactagtgctatgcttcctcagctagcatatgagtcgctagtttgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctaca 7792  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  7791 cccaagtctgtg 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6515 - 6201
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagc---tcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttctt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6515 tgtagggacagaacctcgaaagtaattcctcgaacttcgccgcatactcggccacagacatgattccttgcttcagattcagaaactcaacctccttctt 6416  T
Q  98 ggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattg 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6415 ggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatttcccaactcaagccttcccttggcattg 6316  T
Q  198 gtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccct 297  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6315 gtccactagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccct 6216  T
Q  298 gcacccaagtctgtg 312  Q
    |||||||||||||||    
T  6215 gcacccaagtctgtg 6201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3671
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3360 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 3459  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||    
T  3460 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaataattaagctttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtc 3559  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3560 cactagttctctgcttcctcagcaagcatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtcaccatagctcggaaaatccgctccataccctgca 3659  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||| ||||    
T  3660 cccaagtttgtg 3671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 22281356 - 22281667
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22281356 tgtagggacaaaacttcgaaagttcctcgaacttcgctgcatactcgactacagacatgattccttacttcagattcaaaaactcaatctccttcttggt 22281455  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  22281456 cctcaagtctttcgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggttaccacatcacctcccatctcaagccttcctttggcattggtc 22281555  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22281556 caccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctgca 22281655  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  22281656 cccaagtctgtg 22281667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 25131710 - 25132020
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttc-gccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttgg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || || |||||  ||||||| ||||  || |  ||||| || |||||  | |    
T  25131710 tgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttttgtcgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaagtttaagaactctacttcctttctag 25131809  T
Q  100 tcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggt 199  Q
    ||||||| || ||  | || |||||||| || || |||  ||||||| | ||||| ||||| || || || || | ||| || || ||||| ||||| ||    
T  25131810 tcctcaaatcctcttgaaagtacttcctaaaaaactcagtcttgaaccttgcccaagtcacaacctctccgccgatctcgagtctccccttagcatttgt 25131909  T
Q  200 ccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgc 299  Q
    |||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||| |||||| || |||    
T  25131910 ccaccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagctaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacggaagatcctctccatgccttgc 25132009  T
Q  300 acccaagtctg 310  Q
    ||||| |||||    
T  25132010 acccatgtctg 25132020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 20928689 - 20929000
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20928689 tgtagggacaaaaccttgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgattcctttcttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 20928788  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20928789 cctcaagtcttcggggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatctcccatctcaagccttcccttggcattggtc 20928888  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| | ||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20928889 caccaatgctctgcttcctcagtcaacttatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgttccattccctaca 20928988  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  20928989 cccaagtctgtg 20929000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 20528688 - 20528999
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20528688 tgtagggaaaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctatagacatgattccttacttcagattcagaaactcaatgtccttcttggt 20528787  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| |||    
T  20528788 cctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatctcccatctcaagccttcctttggcattagtc 20528887  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  20528888 caccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgctagtctaaccttctggtcatcttccgtaaccatagcttggaaaatccgctccatcctctgca 20528987  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  20528988 cccaagtctgtg 20528999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20828116 - 20827825
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  20828116 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 20828017  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  20828016 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 20827917  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||    
T  20827916 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccat 20827825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22129156 - 22128853
Alignment:
Q  8 acaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 107  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||| | ||||||||     
T  22129156 acaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcaaccacggacatgctcccttgcttcaagttcaagaactccacttccttcctagtcctcaaa 22129057  T
Q  108 tcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagc-ctgcccttggcattggtccaccag 206  Q
    || || || || ||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||| || ||  | || | |||||||  |  |||| ||||| ||||||||     
T  22129056 tcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaacttagcccaagtcacaacctcttcaccaatctcaagcttttgccttagcattagtccaccaa 22128957  T
Q  207 tactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaag 306  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || ||||||| ||| || |||| |||||| || |||||||| |    
T  22128956 tactcggcctcctcagcaatcatatgagtagccaacctgaccttttgatcatcactagtcaccatagttcgaaagatcctctccatgccttgcacccacg 22128857  T
Q  307 tctg 310  Q
    ||||    
T  22128856 tctg 22128853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41214580 - 41214284
Alignment:
Q  6 ggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctca 105  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||  | |||||||    
T  41214580 ggacaaaacctcaaaagctcttcaaacatcgcagcatactcagccacagacatgctcccttgcttcaagttcaagaactccacttcctttctagtcctca 41214481  T
Q  106 agtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccacca 205  Q
    | || || || ||  |||||||||| || |||  ||||||| | ||||| ||||| || || || || | ||| || || ||||| ||||| ||| ||||    
T  41214480 aatcctcaggaaaggacttcctcaaaaactcagtcttgaaccttgcccaagtcacaacctctccaccgatctcgagtctccccttagcattcgtctacca 41214381  T
Q  206 gtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacc 302  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  41214380 atactcagcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacggaagatcctctccattccttgcacc 41214284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 23509209 - 23509520
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| || ||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23509209 tgtatggacaaaacctcaaaagttcctcgaacttcaccacatgcttggctacagacatgattccttgcttcagattcagaaactcaatcgccttcttggt 23509308  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  23509309 cctcaagtcttcggggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaacttaagccttcctttggcattggtc 23509408  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23509409 caccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctgca 23509508  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  23509509 cccaagtctgtg 23509520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 24584734 - 24585043
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  24584734 tgtagggacaaaaccttgcaagctccttaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 24584833  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || |||   |||||| | | ||| ||||| || || ||  | | |||||| || ||||| |||||||||    
T  24584834 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagttttgaacattgtccaagtcacaacctctccatcaatctcaagtcttcccttagcattggtc 24584933  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| |||||| || ||||    
T  24584934 caccaatactcagcctcctcagcaagcatctgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccatgccttgca 24585033  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
     ||| |||||    
T  24585034 accatgtctg 24585043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 310
Target Start/End: Original strand, 21828347 - 21828649
Alignment:
Q  8 acaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||  ||||||  ||||  ||||  ||||| || |||||  | ||||||||     
T  21828347 acaaaacctcgaaagctcctcaaactttgctgcatactcagcgacagacatactcccttacttcaagttcaagaactccacttcctttctagtcctcaaa 21828446  T
Q  108 tcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagt 207  Q
    || || || || || ||| |||| || ||   ||||||| | ||||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| ||||| ||||||||      
T  21828447 tcctcaggaaagtatttcatcaaaaactcggtcttgaacctagcccaagtcacaacctctccaccgacctcaagtctccccttagcattagtccaccaaa 21828546  T
Q  208 actctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagt 307  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| ||    
T  21828547 actcagcttcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacggaagatcctctccatgccttgcagccatgt 21828646  T
Q  308 ctg 310  Q
    |||    
T  21828647 ctg 21828649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 33314069 - 33314011
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatg 59  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33314069 tgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcagctactgacatg 33314011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 315
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  606 tgtagagacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggctaccgacatgattccttgcttcagatttagaaactcaatctccttcttggt 507  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||    
T  506 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacgtagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgtttgtc 407  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  406 caccagtgctctgcttcttcagctagcatatgagttgcaagtttgaccttctagtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6149744 - 6149433
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6149744 tgtaggggcaaaacctcgaaagttcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 6149645  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||    
T  6149644 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttaaacttcgcccaggtcaccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtc 6149545  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6149544 caccagtgctctgcttcctcagcaagcatatgagtcgctagcctgaccttctggtcacctcctgtcaccatagctcggaaaatccgctccataccctgca 6149445  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||| ||||    
T  6149444 cccaagtttgtg 6149433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15943486 - 15943175
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15943486 tgtagggacaaaacctcgaaagttcctcgaacttcgccgcatactcggccactgacaagattccttgctttagattcagaaactcaatctcattcttggt 15943387  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15943386 cctcaagtcttccgggaaatacttccttaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcaccttccaactcaagccttcccttggcattggtc 15943287  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  15943286 caccagtgctccgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctaaccttttggtcatctcctgtaaccatagctcggaaaatctgctccatcccttgca 15943187  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  15943186 cccaagtctgtg 15943175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 25768464 - 25768770
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||   ||||| || ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25768464 tgtacggacaaaaccttgaaagctcctcaaacttttctgcatacgtagctacagatatgcttccttgtttcaagttcagaaactcaacctccttcctggt 25768563  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  25768564 cctcaaatcttcagggaaatacttcctcaagaactcagctttgaacttcgcccaggtcacaacttctcctcccaactcaagtcttcctttggcattagtc 25768663  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| |  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||    
T  25768664 caccaatgttcggcctcctcagcaagcatatgagtcgccaatctgaccttttggtcatcactcgtcaccatagcacggaatatcctctctatgccctgca 25768763  T
Q  301 cccaagt 307  Q
    |||||||    
T  25768764 cccaagt 25768770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 17201885 - 17202192
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||| ||||  ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  17201885 tgtacggacaaaacctcaaaagctcctcaaacttcgccacatacacagctatggacatgctcccttgcttcaagttcaggaactccacttccttcctggt 17201984  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||    
T  17201985 cctcaaatcttcaggaaaatacttcctcaagaactcagctttgaactttgcccaagtcacaacttctccaccaatctcaagtcttcccttagcattagtc 17202084  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||||| || || |||| |||||| |||||||    
T  17202085 cactaatactcggcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgttcatcactcgtcaccatagcacgaaatatcctctccatgccctgca 17202184  T
Q  301 cccaagtc 308  Q
    ||||||||    
T  17202185 cccaagtc 17202192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 30150606 - 30150897
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  30150606 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 30150705  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  30150706 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 30150805  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||    
T  30150806 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccat 30150897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8271290 - 8270981
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  8271290 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 8271191  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  8271190 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 8271091  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| || ||||| |  || |||||||| || || |||| |||||| || ||||    
T  8271090 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgcgagtagccaacctcaccttttgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccatgccttgca 8270991  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
     ||| |||||    
T  8270990 accatgtctg 8270981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13964246 - 13963988
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  13964246 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacggacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 13964147  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| | |||||| | | ||| ||||| || || ||  | | |||||| || ||||| |||||||||    
T  13964146 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaaccttgtccaagtcacaacctctccatcaatctcaagtcttcccttagcattggtc 13964047  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  13964046 caccaatactcagcctcctcaacaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatc 13963988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22149631 - 22149379
Alignment:
Q  7 gacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaa 106  Q
    |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||  || |  || || ||| ||||| | ||||||||    
T  22149631 gacaaaaccttgcaaactcttcaaacttcgccgcatactcggccacagacatacttccttgcttcaagtttaagaattctaccaccttccttgtcctcaa 22149532  T
Q  107 gtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccag 206  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| |||||||| || ||  ||| |||||| || || |||||||| |||||| |     
T  22149531 atcttccgaaaaatacttcctcaagaactcggccttgaaccttgcccaagtcaccacctccccctccatctcaagtcttcctttggcattagtccactaa 22149432  T
Q  207 tactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22149431 tactctgcctcctcagcaagcatatgagtagccaacctaaccttctggtcatc 22149379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17321476 - 17321176
Alignment:
Q  10 aaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||| ||||||  | ||  ||||  ||||| || |||||  | || ||||| ||    
T  17321476 aaaacctcgaaagctcttcaaactttgctgcatactcagccacggacatgctcccttactgcaagttcaagaactccacttcctttctagttctcaaatc 17321377  T
Q  110 ttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagtac 209  Q
     || || || ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || || || || | ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17321376 ctctggaaagtacttcctcaaaaactcaaccttgaaccttgcccaagtcacaacctctccacctatctcgagtctccccttagcattcgtccaccaatac 17321277  T
Q  210 tctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtct 309  Q
    || || |||| ||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  17321276 tcagcctccttagcaagcatgtggttagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacggaagatcctctccatgccttgcacccatgtct 17321177  T
Q  310 g 310  Q
    |    
T  17321176 g 17321176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 5224953 - 5225006
Alignment:
Q  256 catctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtct 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5224953 catctcccgtaaccatagcttggaaaatccgctccatcccctgcacccaagtct 5225006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 312
Target Start/End: Original strand, 27427 - 27736
Alignment:
Q  3 tagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27427 tagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcc 27526  T
Q  103 tcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtcca 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||    
T  27527 tcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaatttgactttgaacttagcccaggtccccacatcacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtcca 27626  T
Q  203 ccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacc 302  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27627 ccagtgctttgcttcctcagcaagcatataagtcgctagtctgaccttctggtcatctctcgtgaccgtagctcggaaaatccgctccatcccctgcacc 27726  T
Q  303 caagtctgtg 312  Q
    ||||| ||||    
T  27727 caagtttgtg 27736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 131144 - 130830
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagc---tcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttctt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  131144 tgtagggacagaacctcgaaagtaattcctcgaacttcgccgcatactcggccacagacatgattccttgcttcagattcagaaactcaacctccttctt 131045  T
Q  98 ggtcctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattg 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  131044 ggtcctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcatctcccaattcaagccttcccttggcattg 130945  T
Q  198 gtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccct 297  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  130944 gtccactagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctaaccttttggtcatcttccgtaacaatagctcagaaaatccgctccattccct 130845  T
Q  298 gcacccaagtctgtg 312  Q
    |||||||||||||||    
T  130844 gcacccaagtctgtg 130830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9044 - 8733
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9044 tgtagggacaaaacctagacagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacctccttattggt 8945  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||  | |||    
T  8944 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcatgtcttcctttggcgctagtc 8845  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8844 caccagtgctctgcctcctcagtcaacatatgagtcgctagcctgaccttctggtcatcttccgtaaccatagctcggaaaatccgctccataccctgca 8745  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
     |||||||||||    
T  8744 tccaagtctgtg 8733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3581 - 3270
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3581 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctatagacatgcttccttgtttcagattcaaaaactcaacctccttcttggt 3482  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||    
T  3481 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcagctttgaacttttcccaggtcacaacttcacctcccatatcaagtcttcccttggcattagtc 3382  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  3381 caccagtgctccgcttcctcagtaagcatatgagtcgccaatctaaccttctggtcatctcccgtcaccatagcatggaatatccgctccatgccctgca 3282  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  3281 cccaagtctgtg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 25828 - 26138
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25828 tgtaaggacaaaacctcgaaagcttcttaaacttcgccgcatactcggctacaaacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttagt 25927  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||| |||    
T  25928 tctcaagtcttcagggaaatacttcc-caagaattcaactttgaacttagcccaagtcaccacattacctcccatctcaagtcttcctttggcattagtc 26026  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26027 caccagtgctctgcttcctcaacaagcatatgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcctgtcaccatagctcggaaaatccaccccataccctgca 26126  T
Q  301 cccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||||||    
T  26127 cccaagtctgtg 26138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5025 - 4720
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5025 tgtaggggcaaaacctcgaaggttcctcaaacttcgccgcatactcggcgaaagacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 4926  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| |||    
T  4925 cctcaagtcttcagggaaatacttcctctagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccatctcaa-ccttcctttgacattagtc 4827  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
     || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  4826 aactagtgctctgcttcctcagcaagcatttgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcctgtgaccacagctcagaaaatctgttccatgccctgca 4727  T
Q  301 cccaagt 307  Q
    |||||||    
T  4726 cccaagt 4720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 97174 - 97483
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  97174 tgtacggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgcctcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcaaaaactcaacctccttcttggt 97273  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| || ||  | || |||||||| || |  |||||||| |||    
T  97274 cctcaagtcttcagggaaatatttcctcaagaattcagctttgaactttgtccaggtcacaacttcttcaccaaactcaagtcttcttttggcattagtc 97373  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |    
T  97374 caccactgctcagcttcctcagcaagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtcaccatagcacggaatatccgctccatgctctgta 97473  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
    ||||||||||    
T  97474 cccaagtctg 97483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 312
Target Start/End: Original strand, 3168 - 3370
Alignment:
Q  110 ttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagtac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  3168 ttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcccttggcattggtccaccaatgc 3267  T
Q  210 tctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtct 309  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3268 tctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctaaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatcccctgcacccaagtct 3367  T
Q  310 gtg 312  Q
    |||    
T  3368 gtg 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8806 - 9109
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8806 tgtacggataaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 8905  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||  || || |||||||| |||    
T  8906 cctcaagtcttcagggaaatacttcatcaagaattcagctttgaacttcgcccaggtcacaactttacctcccatctcaattcttcctttggcattagtc 9005  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||  ||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | |||||||    
T  9006 caatagtgctcagcttcctcaacaagcatacgagtcgccagtttgaccttctgatcacctcccgtcaccatagcaccgaatatccgctccgtgccctgca 9105  T
Q  301 ccca 304  Q
    ||||    
T  9106 ccca 9109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 91151 - 91324
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  91151 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctacagacatgatcccatgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 91250  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctccca 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  91251 cctcaagtcttcagggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctccca 91324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20531 - 20273
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||| | ||    
T  20531 tgtacggacaaaacctcacaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaagttcaagaactccacttccttcctagt 20432  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||| | |||||| |  || || | |||||| || ||||| ||||| |||    
T  20431 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaacctagcccaaggcaccacctatccaccaatctcaagtcttcccttagcattagtc 20332  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  20331 caccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctaaccttctgatcatc 20273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30107 - 29849
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||| | ||    
T  30107 tgtacggacaaaacctcacaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatactcccttgcttcaagttcaagaactccacttccttcctagt 30008  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | ||||| | |||||| |  || || | |||||| || ||||| ||||| |||    
T  30007 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaacctagcccaaggcaccacctatccaccaatctcaagtcttcccttagcattagtc 29908  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  29907 caccaatactcggcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctaaccttctgatcatc 29849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 73251 - 73069
Alignment:
Q  130 agaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  73251 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgttagtccaccagtgctctgcttcctcggctagcat 73152  T
Q  230 atgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  73151 atgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgcgctataccctgcacccaagtctgtg 73069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 77632 - 77450
Alignment:
Q  130 agaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagtactctgcttcctcagctagcat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  77632 agaattcaaccttgaacttagcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagccttcctttggcgttagtccaccagtgctctgcttcctcggctagcat 77533  T
Q  230 atgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  77532 atgagtcgctagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgcgctataccctgcacccaagtctgtg 77450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12280 - 12124
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12280 tgtagggacaaaacctcgaaagttgctcgaacttcgccgcatactcggctacagacatgattccttgtttcagattcagaaactcaatctccttcttggt 12181  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggt 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12180 cctcaagtcttcggggaaatacttcctcaataattcaaccttgaacttagcccaggt 12124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12121 - 12007
Alignment:
Q  194 attggtccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatt 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12121 attggtccaccagtgctctgcttcctcagtcaacatatgagtcgccagtctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccatc 12022  T
Q  294 ccctgcacccaagtc 308  Q
    |||||||||||||||    
T  12021 ccctgcacccaagtc 12007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27104435 - 27104144
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  27104435 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 27104336  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  27104335 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 27104236  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||    
T  27104235 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccat 27104144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 27173890 - 27174148
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  27173890 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 27173989  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  27173990 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 27174089  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  27174090 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatc 27174148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 7827509 - 7827800
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  7827509 tgtaggggcaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 7827608  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| | | ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| |||||||||    
T  7827609 cctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttgtccaagtcacaacctctccaccaatctcaagtcttcccttagcattggtc 7827708  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||    
T  7827709 caccaatactcagcctcctcagcaagcatgtgagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccat 7827800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16575220 - 16575123
Alignment:
Q  215 ttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16575220 ttcctcagcaagcatatgagttgccagtctgaccttctggtcatctcccatcaccatggcatggaatatccgctccatgccctgcacctaagtctgtg 16575123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 312
Target Start/End: Original strand, 16590442 - 16590539
Alignment:
Q  215 ttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtctgtg 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16590442 ttcctcagcaagcatatgagttgccagtctgaccttctggtcatctcccatcaccatggcatggaatatccgctccatgccctgcacctaagtctgtg 16590539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 4443541 - 4443841
Alignment:
Q  10 aaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaagtc 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||  || |  ||||| || |||||  |  ||||||| ||    
T  4443541 aaaacctcgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacagacatgctcccttgcttcaagtttaagaactccacttcctttctattcctcaaatc 4443640  T
Q  110 ttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccaccagtac 209  Q
     || || || ||||||||||| || | |  ||||||| | ||||| ||| | || || |  || | |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4443641 ctctggaaagtacttcctcaaaaacttagtcttgaaccttgcccaagtcccaacctctctgccgatctcaagtcttcccttagcattcgtccaccaatac 4443740  T
Q  210 tctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgcacccaagtct 309  Q
    || || |||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  4443741 tcggcctcctcagcaagcatgtaggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcatagaagatcctctccatgccctgcacccatgtct 4443840  T
Q  310 g 310  Q
    |    
T  4443841 g 4443841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4461 - 4204
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| |||||| ||||| || |||||| | ||    
T  4461 tgtagggacaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacagacatactcccttgcttcaaattcaggaactccacttccttcctagt 4362  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
     ||||| || || || || ||||||||||| || ||| |||||||| |   ||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||    
T  4361 tctcaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagccttgaaccttatccaagtcacaacctccccaccaatctcaagtcttcccttagcattagtc 4262  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatc 259  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |||||    
T  4261 caccaatactctgcttccttagctaccatgtgagtc-ccaaccttaccttctgatcatc 4204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 312
Target Start/End: Original strand, 16637 - 16749
Alignment:
Q  200 ccaccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgc 299  Q
    |||||||| ||| || | |||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16637 ccaccagtgctccgccttctcacctagcatatgagttgctagtctgaccttatggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccataccctgc 16736  T
Q  300 acccaagtctgtg 312  Q
    |||||||||||||    
T  16737 acccaagtctgtg 16749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16550 - 16638
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacc 89  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16550 tgtagggacaaaacctagacagctcctgaaacttcgccgcatactcggctacagacatgcttccttgtttcagattcagaaactcaacc 16638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25355 - 25047
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||| | ||    
T  25355 tgtacggacaaaacctcggaagctcctcaaacttcgccgcatactcggccacgaacatgctcccttgcttcaagttcaagaactccacttccttcctagt 25256  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||  || || || || | |||||| || || || |||||||||    
T  25255 ccttaaatcctctggaaagtacttcctcaaaaactcagctttgaacttagcccaagtca-aacttctccaccaatctcaagtcttccattagcattggtc 25157  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||  |||| ||||| || |||||||| ||||| |  || | |||||| ||||| |||| | |||| || ||||    
T  25156 caccaatactcggcctcctcggcaagcattagagtagccaacctcaccttctgatcatcactagtcatcatagcacggaagatccaccccatgccttgca 25057  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
    |||| |||||    
T  25056 cccatgtctg 25047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35828 - 35519
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||  ||||||| |||| |||||  ||||| || |||||  | ||    
T  35828 tgtatggacaaaacctcgaaagctcctcaaactttgctgcatactcagccacagacatactcccttgcttcaaattcaagaactccacttcctttctagt 35729  T
Q  101 cctcaagtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtc 200  Q
     ||||| || || || || || ||| |||| || ||   ||||||| | ||||| ||||| || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||    
T  35728 actcaaatcctcaggaaagtatttcgtcaaaaactcggtcttgaacctagcccaagtcacaacctctccaccgacctcaagtctccccttagcattagtc 35629  T
Q  201 caccagtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccattccctgca 300  Q
    |||||  |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  35628 caccaaaactcagcttcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacggaagatcctctccatgccttgca 35529  T
Q  301 cccaagtctg 310  Q
    |||| |||||    
T  35528 cccatgtctg 35519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5663 - 5377
Alignment:
Q  6 ggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctca 105  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||  | || ||||    
T  5663 ggacaaaaccacgaaagctcttcaaactttggcgcatactcagccactgacatgctcccttgcttcaagttcaagaactccacttcctttctagttctca 5564  T
Q  106 agtcttccgggaaatacttcctcaagaattcaaccttgaacttggcccaggtcaccacatcacctcccaactcaagcctgcccttggcattggtccacca 205  Q
    | || || || || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || || || || |  ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  5563 aatcctctggaaagtatttcctcaaaaactcaaccttgaaccttgcccaagtcacgacctctccaccgacttcaagtctccccttagcattcgtccacca 5464  T
Q  206 gtactctgcttcctcagctagcatatgagtcgccaatctgaccttctggtcatctcccgtaaccatagctcggaaaatccgctccat 292  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||    
T  5463 atactcagcctcctcagcaagcatgtgggtagccaacctgaccttctgatcatcactagtcaccatagcacgaaagatcctctccat 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2296
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttca 72  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||    
T  2225 tgtacggacaaatcctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcagccacggacatgctcccttgcttca 2296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32523 - 32401
Alignment:
Q  8 acaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcatactcggctaccgacatgatcccttgtttcagattcagaaactcaacctccttcttggtcctcaag 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||  ||||| ||||||| ||||  ||||  ||||| || || ||||  ||||||||     
T  32523 acaaaacctcgcaagctcctcaaattttgccgcatactcagccacgaacatgctcccttgcttcaagttcaagaactccacttctttctgagtcctcaaa 32424  T
Q  108 tcttccgggaaatacttcctcaa 130  Q
    || || || || |||||||||||    
T  32423 tcctctggaaagtacttcctcaa 32401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 24612 - 24653
Alignment:
Q  1 tgtagggacaaaacctcgaaagctcctcaaacttcgccgcat 42  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24612 tgtaggggcaaaaccttgcaagctcctcaaacttcgccgcat 24653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University