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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19168_high_7 (Length: 439)

Name: NF19168_high_7
Description: NF19168
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19168_high_7
NF19168_high_7
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (23-392)||(24420488-24420872)
chr4 (80-392)||(24470821-24471138)
chr4 (119-392)||(24420392-24420665)
chr4 (117-392)||(24470959-24471234)
chr4 (78-390)||(24470531-24470849)
chr4 (17-363)||(24421093-24421454)
chr4 (122-390)||(24420778-24421046)
chr4 (17-392)||(24420872-24421262)
chr4 (17-371)||(24470269-24470638)
chr4 (78-376)||(24470291-24470595)
chr4 (142-390)||(24421210-24421458)
chr4 (15-387)||(24421021-24421408)
chr4 (96-369)||(24420751-24421024)
chr4 (317-392)||(24406527-24406602)
chr4 (117-387)||(24421165-24421435)
chr4 (125-381)||(24470488-24470744)
chr4 (78-363)||(24477374-24477665)
chr4 (83-371)||(24470488-24470782)
chr4 (197-392)||(24476790-24476976)
chr4 (142-392)||(24470265-24470515)
chr4 (240-336)||(24476885-24476981)
chr4 (15-390)||(24470315-24470705)
chr4 (236-392)||(24406425-24406587)
chr4 (87-387)||(24470684-24470989)
chr4 (117-387)||(24420637-24420907)
chr4 (117-390)||(24470288-24470561)
chr4 (117-361)||(24420327-24420571)
chr4 (15-369)||(24470699-24471067)
chr4 (179-371)||(24421277-24421469)
chr4 (236-376)||(24421320-24421460)
chr4 (142-390)||(24477491-24477739)
chr4 (179-371)||(24470254-24470446)
chr4 (236-376)||(24470263-24470403)
chr4 (263-354)||(24477065-24477156)
chr4 (146-371)||(24477462-24477687)
chr4 (15-75)||(24477485-24477545)
chr4 (117-211)||(24477064-24477158)
chr4 (377-417)||(24406379-24406419)
chr4 (377-417)||(24406481-24406521)
chr4 (15-287)||(24477402-24477689)
chr4 (236-347)||(24477630-24477741)
chr4 (204-336)||(24471142-24471274)
chr4 (30-70)||(24482157-24482197)
chr4 (323-391)||(24482187-24482255)
chr4 (38-150)||(24476990-24477108)
chr4 (164-247)||(24481477-24481559)
chr4 (35-70)||(24481821-24481856)
chr4 (15-75)||(24420580-24420640)
chr4 (161-276)||(24406499-24406614)
chr4 (35-78)||(24477116-24477159)
chr4 (35-70)||(24481647-24481682)
chr4 (35-70)||(24481923-24481958)
chr4 (35-70)||(24482055-24482090)
chr4 (161-267)||(24471147-24471253)
chr4 (142-174)||(24421495-24421527)
chr4 (142-174)||(24470196-24470228)
chr4 (323-363)||(24476729-24476769)
chr4 (319-371)||(24477291-24477343)
chr4 (29-69)||(24481852-24481892)
[»] scaffold0879 (8 HSPs)
scaffold0879 (146-363)||(4464-4681)
scaffold0879 (119-387)||(4485-4753)
scaffold0879 (80-345)||(4536-4807)
scaffold0879 (17-354)||(4512-4864)
scaffold0879 (15-276)||(4558-4834)
scaffold0879 (122-381)||(4536-4795)
scaffold0879 (236-387)||(4458-4609)
scaffold0879 (251-390)||(4425-4564)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (179-369)||(41899872-41900062)
chr2 (125-363)||(41899830-41900068)
chr2 (87-354)||(41900127-41900400)
chr2 (122-319)||(41899826-41900023)
chr2 (182-371)||(41900302-41900491)
chr2 (179-346)||(41900279-41900446)
chr2 (63-271)||(41899826-41900040)
chr2 (119-344)||(41900089-41900314)
chr2 (323-390)||(41900571-41900638)
chr2 (236-354)||(41900511-41900629)
chr2 (96-371)||(41900158-41900433)
chr2 (179-306)||(41900511-41900638)
chr2 (131-287)||(41900290-41900446)
chr2 (78-225)||(41899824-41899977)
chr2 (17-66)||(41899854-41899903)
chr2 (15-63)||(41899953-41900001)
chr2 (15-75)||(41900181-41900241)
chr2 (15-75)||(41900373-41900433)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (131-270)||(11879442-11879581)
chr1 (179-282)||(11879442-11879545)
chr1 (134-270)||(11882303-11882439)
chr1 (134-270)||(11891537-11891673)
chr1 (227-351)||(11879442-11879566)
chr1 (179-351)||(11902038-11902210)
chr1 (131-267)||(11902038-11902174)
chr1 (15-78)||(11902099-11902162)
chr1 (299-368)||(11879349-11879418)
chr1 (57-219)||(11879458-11879626)
chr1 (146-270)||(11882411-11882535)
chr1 (146-270)||(11891645-11891769)
chr1 (178-223)||(11902373-11902418)
chr1 (130-282)||(11904952-11905104)
chr1 (15-75)||(11879455-11879515)
chr1 (158-246)||(11879661-11879749)
chr1 (119-270)||(11902074-11902225)
chr1 (15-82)||(52818571-52818638)
chr1 (297-387)||(11879464-11879554)
chr1 (300-390)||(11902063-11902153)
chr1 (130-252)||(11905000-11905122)
chr1 (117-195)||(52821569-52821647)
chr1 (17-78)||(11879340-11879401)
chr1 (15-63)||(11879503-11879551)
chr1 (323-363)||(11881952-11881992)
chr1 (323-363)||(11891186-11891226)
chr1 (227-387)||(11902038-11902198)
[»] scaffold1918 (1 HSPs)
scaffold1918 (42-78)||(127-163)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24420872 - 24420488
Alignment:
Q  23 tccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatctcca---------tatgtttacaagtcaccaccacctccatctc 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||          ||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24420872 tccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctc 24420773  T
Q  114 cctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttc 207  Q
    ||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  24420772 cctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttc 24420673  T
Q  208 accacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccc 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24420672 accaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccc 24420573  T
Q  308 cctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24420572 cctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctcctt 24420488  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 80 - 392
Target Start/End: Original strand, 24470821 - 24471138
Alignment:
Q  80 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc-----atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccata 174  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24470821 ccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccata 24470920  T
Q  175 cgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtc 274  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24470921 cgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtc 24471020  T
Q  275 tataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtcttta 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  24471021 tataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccata 24471120  T
Q  375 agtcaccgccacctcctt 392  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  24471121 agtcacctccacctcctt 24471138  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24420665 - 24420392
Alignment:
Q  119 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 218  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24420665 cctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctc 24420566  T
Q  219 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 318  Q
    ||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24420565 catatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T
Q  319 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
        |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24420465 ctactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctcctt 24420392  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 392
Target Start/End: Original strand, 24470959 - 24471234
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 216  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470959 ctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcc 24471058  T
Q  217 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 316  Q
    ||||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  24471059 tccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctcca 24471158  T
Q  317 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    ||    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  24471159 tactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctcctt 24471234  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 390
Target Start/End: Original strand, 24470531 - 24470849
Alignment:
Q  78 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 171  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24470531 ctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctcc 24470630  T
Q  172 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 271  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  24470631 atatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatat 24470730  T
Q  272 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    ||||| ||||| || | ||| || || || || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  24470731 gtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtat 24470830  T
Q  372 ttaagtcaccgccacctcc 390  Q
     ||||||||| || |||||    
T  24470831 ataagtcaccacctcctcc 24470849  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24421454 - 24421093
Alignment:
Q  17 ccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccat---------ctccatatgtttacaagtcaccaccacctc 107  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24421454 ccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctc 24421355  T
Q  108 catctccctctcct------ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatc 201  Q
    ||||||| || |||      |||||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  24421354 catctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 24421255  T
Q  202 tccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctcct 301  Q
     || ||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || || || ||     
T  24421254 accctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatcccca 24421155  T
Q  302 tcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 363  Q
    || || || ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  24421154 tctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccacc 24421093  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24421046 - 24420778
Alignment:
Q  122 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 221  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24421046 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 24420947  T
Q  222 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 321  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24420946 atgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgt 24420847  T
Q  322 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  24420846 ttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctcc 24420778  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24421262 - 24420872
Alignment:
Q  17 ccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatc---------tccatatgtttacaagtcaccaccacctc 107  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||         ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24421262 ccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccac 24421163  T
Q  108 catctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatc 201  Q
    |||| || |||||      ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  24421162 catccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatc 24421063  T
Q  202 tccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctcct 301  Q
     || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||     
T  24421062 accctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatcccca 24420963  T
Q  302 tcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24420962 tctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctcctt 24420872  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 24470269 - 24470638
Alignment:
Q  17 ccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatctcc---------atatgtttacaagtcaccaccacctc 107  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||    
T  24470269 ccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctc 24470368  T
Q  108 catctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatc 201  Q
    |||| || || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |    
T  24470369 catcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaac 24470468  T
Q  202 tccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctcct 301  Q
     || ||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||    
T  24470469 accctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctcct 24470568  T
Q  302 tcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    ||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470569 tcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470638  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 376
Target Start/End: Original strand, 24470291 - 24470595
Alignment:
Q  78 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 171  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||| |||||| || || || || || || || ||    
T  24470291 ctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccacc 24470390  T
Q  172 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 271  Q
    ||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  24470391 atatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctat 24470490  T
Q  272 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    || || ||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24470491 gtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtct 24470590  T
Q  372 ttaag 376  Q
     ||||    
T  24470591 ataag 24470595  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24421458 - 24421210
Alignment:
Q  142 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 241  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24421458 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24421359  T
Q  242 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 341  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24421358 cctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24421259  T
Q  342 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  24421258 catcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctcc 24421210  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24421408 - 24421021
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatctcc---------atatgtttacaagt---caccacc 102  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||         |||||| || |||    |||||||    
T  24421408 cacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccacc 24421309  T
Q  103 acc---tccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgcca 199  Q
    |||   |||||| ||  | ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| || || || |||    
T  24421308 accctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctcca 24421209  T
Q  200 tctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctc 299  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || |    
T  24421208 tccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccc 24421109  T
Q  300 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  24421108 catcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 24421021  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24421024 - 24420751
Alignment:
Q  96 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 195  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  24421024 cacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccaccccc 24420925  T
Q  196 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 295  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |  || ||     
T  24420924 accatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccacca 24420825  T
Q  296 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 369  Q
    || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24420824 tcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgt 24420751  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24406602 - 24406527
Alignment:
Q  317 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406602 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406527  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24421435 - 24421165
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  24421435 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctccccc 24421336  T
Q  217 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 316  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || ||     
T  24421335 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccacct 24421236  T
Q  317 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 24421165  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 381
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470744
Alignment:
Q  125 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 224  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||     
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  225 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 324  Q
    |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || || ||| ||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  325 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 381  Q
     || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcacc 24470744  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24477665 - 24477374
Alignment:
Q  78 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 171  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||      | |||| ||||| |||| |||||| || ||||| | ||| || || ||    
T  24477665 ctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccacc 24477566  T
Q  172 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 271  Q
    ||| || || |||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  24477565 atatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatat 24477466  T
Q  272 gtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 363  Q
    ||||| |||   |||| ||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  || ||||||||||    
T  24477465 gtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcacccccaactcctccacc 24477374  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470782
Alignment:
Q  83 tatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||      |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| |    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  177 tttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 276  Q
    | || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  277 taagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    |||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtct 24470782  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24476976 - 24476790
Alignment:
Q  197 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 296  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |             
T  24476976 ccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccac--------- 24476886  T
Q  297 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  24476885 ctccttcaccccctcctccatatgtttatgaatctccacccccaccatctccttcacctcccccatcctatgtctataagtcacatccacctcctt 24476790  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 24470265 - 24470515
Alignment:
Q  142 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 241  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24470265 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24470364  T
Q  242 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 341  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24470365 cctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24470464  T
Q  342 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    || | || |||||||| || || ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24470465 caacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctcctt 24470515  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24476981 - 24476885
Alignment:
Q  240 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||    
T  24476981 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccacc 24476885  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Original strand, 24470315 - 24470705
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccat---------ctccatctccatatgtttacaag---tcaccacc 102  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||  | |||||||| || |||    |||||||    
T  24470315 cacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccacc 24470414  T
Q  103 ac---ctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgcca 199  Q
    ||   ||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| |  ||||||||  | || || || || || || || ||||||||||| || || || ||     
T  24470415 accctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctcct 24470514  T
Q  200 tctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctc 299  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||    
T  24470515 tccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctc 24470614  T
Q  300 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  24470615 catcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctcc 24470705  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24406587 - 24406425
Alignment:
Q  236 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa------at 329  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||      |     
T  24406587 ccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaagactccac 24406488  T
Q  330 ctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406487 ctccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406425  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 387
Target Start/End: Original strand, 24470684 - 24470989
Alignment:
Q  87 tttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 180  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  24470684 tttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtcta 24470783  T
Q  181 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 280  Q
    ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||  |||| |||||||| || |||    
T  24470784 caaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcc-tccccaccatatgtttacaag 24470882  T
Q  281 tcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcac 380  Q
    || || | ||| || ||||| || || || |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  |||||||    
T  24470883 tcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcac 24470982  T
Q  381 cgccacc 387  Q
    | |||||    
T  24470983 caccacc 24470989  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24420907 - 24420637
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 216  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||    
T  24420907 ctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctcc 24420808  T
Q  217 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 316  Q
     || ||||| || | ||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || ||||||    
T  24420807 accctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctcca 24420708  T
Q  317 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24420707 tacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24420637  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 390
Target Start/End: Original strand, 24470288 - 24470561
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  24470288 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctccccc 24470387  T
Q  217 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 316  Q
     |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  | || ||||| || || ||     
T  24470388 accatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccc 24470487  T
Q  317 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24470561  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24420571 - 24420327
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 216  Q
    ||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || || || || || || || ||||| ||||| || || ||  |||||||||||||    
T  24420571 ctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcc 24420472  T
Q  217 tccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctcca 316  Q
    ||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||     
T  24420471 tccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctcct 24420372  T
Q  317 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctcca 361  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24420371 tatatttacaagtctccacctccaccatctccatcacctcctcca 24420327  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 369
Target Start/End: Original strand, 24470699 - 24471067
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatct---------ccatatgtttacaagtcaccaccacc 105  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||         |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  24470699 cacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccaccccc 24470798  T
Q  106 tcca------tctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgcca 199  Q
     |||      || ||| |||| |||||||| || ||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  24470799 accatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcc-ccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccg 24470897  T
Q  200 tctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctc 299  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  | || | |||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |  || || || |    
T  24470898 tctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccc 24470997  T
Q  300 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 369  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  24470998 cttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 24471067  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421277
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  279 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24421369 agtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24421277  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421320
Alignment:
Q  236 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 335  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  336 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 376  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24421320  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24477739 - 24477491
Alignment:
Q  142 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 241  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  24477739 acctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccacca 24477640  T
Q  242 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 341  Q
    || ||||| |  || || || |||||| ||||||| || || || | |||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   |||||| ||||    
T  24477639 cctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccac 24477540  T
Q  342 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24477539 catctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24477491  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470446
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  279 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470354 agtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470446  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 376
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470403
Alignment:
Q  236 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 335  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  336 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 376  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470403  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24477156 - 24477065
Alignment:
Q  263 cctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 354  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24477156 cctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacc 24477065  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24477687 - 24477462
Alignment:
Q  146 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 245  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||  || || || |||||| || ||||||  |||||||| || |    
T  24477687 ccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctc 24477588  T
Q  246 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 345  Q
    | || ||||  || ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24477587 cgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatc 24477488  T
Q  346 tccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24477487 tccttcacctcccccaccatatgtct 24477462  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24477545 - 24477485
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctcc 75  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24477545 caccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctcc 24477485  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24477158 - 24477064
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcacca 211  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  24477158 ctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24406419 - 24406379
Alignment:
Q  377 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406419 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406379  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24406521 - 24406481
Alignment:
Q  377 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406521 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406481  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24477689 - 24477402
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccat---------ctccatctccatatgtttacaagtcaccaccacc 105  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||         ||||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  24477689 caccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcc 24477590  T
Q  106 tccatctccct------ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgcca 199  Q
    ||| ||||| |      | || |||||||| || |||   | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  24477589 tccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctcca 24477490  T
Q  200 tctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctc 287  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||||| |   || || | ||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24477489 tctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 24477402  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477630
Alignment:
Q  236 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 335  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  336 ccccaccatctc 347  Q
    | || |||||||    
T  24477641 cacctccatctc 24477630  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 336
Target Start/End: Original strand, 24471142 - 24471274
Alignment:
Q  204 cttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttc 303  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||    
T  24471142 cttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttc 24471241  T
Q  304 accccctcctccatatgtttacaaatctccacc 336  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24471242 accaccgcctccttatatttacaagtctccacc 24471274  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24482197 - 24482157
Alignment:
Q  30 cacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 70  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24482197 caccacctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 24482157  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24482255 - 24482187
Alignment:
Q  323 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 391  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24482255 tacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24477108 - 24476990
Alignment:
Q  38 cctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcct------ccatatgttt 131  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||| |    
T  24477108 cctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccaccatatctatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgtat 24477009  T
Q  132 acaagtcacaacctccacc 150  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  24477008 acaagtcaccacctccacc 24476990  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  164 ccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacca 247  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24481856 - 24481821
Alignment:
Q  35 cctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481856 cctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 24481821  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24420640 - 24420580
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctcc 75  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  24420640 caccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctcc 24420580  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24406614 - 24406499
Alignment:
Q  161 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 260  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| |    
T  24406614 ccaccaccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgc 24406515  T
Q  261 cccctccatatgtcta 276  Q
    | ||||| ||| ||||    
T  24406514 cacctccttatatcta 24406499  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24477159 - 24477116
Alignment:
Q  35 cctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatc 78  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24477159 cctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatc 24477116  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24481682 - 24481647
Alignment:
Q  35 cctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 70  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24481682 cctcctccatatgtgtataagtcaccacctcctcca 24481647  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24481958 - 24481923
Alignment:
Q  35 cctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24481958 cctcctccatacgtgtacaagtcaccacctcctcca 24481923  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24482090 - 24482055
Alignment:
Q  35 cctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcca 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24482090 cctcctccatacgtgtacaagtcaccacctcctcca 24482055  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 24471147 - 24471253
Alignment:
Q  161 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 260  Q
    ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24471147 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24471246  T
Q  261 cccctcc 267  Q
    | |||||    
T  24471247 cgcctcc 24471253  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24421527 - 24421495
Alignment:
Q  142 acctccaccttctccatccccaccacctccata 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421527 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24421495  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 174
Target Start/End: Original strand, 24470196 - 24470228
Alignment:
Q  142 acctccaccttctccatccccaccacctccata 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24470196 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24470228  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24476769 - 24476729
Alignment:
Q  323 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 363  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24476769 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccacc 24476729  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24477343 - 24477291
Alignment:
Q  319 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24477343 tgtttacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtct 24477291  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24481892 - 24481852
Alignment:
Q  29 tcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctcc 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24481892 tcaccacctcctccatatgtgtacaagtcacccccacctcc 24481852  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 8)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 363
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4681
Alignment:
Q  146 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 245  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  4464 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctc 4563  T
Q  246 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 345  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || || || || || || || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  4564 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T
Q  346 tccttcacctcctccacc 363  Q
     || ||||| ||||||||    
T  4664 cccatcaccccctccacc 4681  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 387
Target Start/End: Original strand, 4485 - 4753
Alignment:
Q  119 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 218  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  4485 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 4584  T
Q  219 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 318  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  4585 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 4684  T
Q  319 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  4685 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 4753  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 345
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4807
Alignment:
Q  80 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  174 acgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgt 273  Q
    |  |||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  274 ctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 345  Q
     ||||| || || |  || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 4512 - 4864
Alignment:
Q  17 ccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatc---------tccatatgtttacaagtcaccaccacctc 107  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||         ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4512 ccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccac 4611  T
Q  108 catctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatc 201  Q
    |||| || |||||      ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  4612 catccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatc 4711  T
Q  202 tccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctcct 301  Q
     || || || || || |||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| || || ||     
T  4712 accctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatcccca 4811  T
Q  302 tcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 354  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4812 tctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 276
Target Start/End: Original strand, 4558 - 4834
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccat---------ctccatatgtttacaagt------cacc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||         |||||||| |||||||||      ||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccacc 4657  T
Q  100 accacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgcca 199  Q
    |||| | ||||| ||| |||| |||||| | |||||||| |  |||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || || || || |||    
T  4658 accatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccaccccca 4757  T
Q  200 tctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtcta 276  Q
    ||||| || || ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4758 tctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtcta 4834  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 381
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4795
Alignment:
Q  122 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  222 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 321  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  322 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 381  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 4795  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 236 - 387
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4609
Alignment:
Q  236 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 335  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  336 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 4609  T

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Target: scaffold0879; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 390
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4564
Alignment:
Q  251 ccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctcctt 350  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  351 cacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctcc 4564  T

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Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41900062 - 41899872
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  41900062 tacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttaca 41899963  T
Q  279 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 369  Q
    ||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  41899962 agtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgt 41899872  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899830
Alignment:
Q  125 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 224  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||     
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  225 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 324  Q
    | |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41899968 tttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgttta 41899869  T
Q  325 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 363  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41899868 caagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41900400 - 41900127
Alignment:
Q  87 tttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 180  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||| ||||| || |  || || || ||||| || |||||||||||||| || ||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  181 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataag 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||  | |||    
T  41900300 caagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaag 41900201  T
Q  281 tcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 354  Q
    || || |  | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  41900200 tcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcacc 41900127  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41900023 - 41899826
Alignment:
Q  122 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 221  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  41900023 ccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccat 41899924  T
Q  222 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatat 319  Q
    ||   |||| ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41899923 atgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41900491 - 41900302
Alignment:
Q  182 aagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 281  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||    
T  41900491 aagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagt 41900392  T
Q  282 cccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    | || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  41900391 caccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtct 41900302  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900279
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || || |||||||  || || ||||||||||| |    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  279 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatct 346  Q
    | || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatct 41900279  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41900040 - 41899826
Alignment:
Q  63 ctcctccatctccatctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctcc 156  Q
    ||||| || ||||| | |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||      ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||    
T  41900040 ctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttcccc 41899941  T
Q  157 atccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttca 256  Q
     || || || |||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||  |||||    
T  41899940 gtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttca 41899841  T
Q  257 ccaccccctccatat 271  Q
    || || || ||||||    
T  41899840 cctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41900314 - 41900089
Alignment:
Q  119 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 218  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| |||| | ||| | | | ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |    
T  41900314 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgc 41900215  T
Q  219 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 318  Q
    | ||| |  ||| |||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41900214 cttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 41900115  T
Q  319 tgtttacaaatctccacccccaccat 344  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  41900114 tgtttacaaatctcctccaccaccat 41900089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900571
Alignment:
Q  323 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctcc 41900571  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41900629 - 41900511
Alignment:
Q  236 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  41900629 ccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctc 41900530  T
Q  336 ccccaccatctccttcacc 354  Q
    | || || ||||| |||||    
T  41900529 cacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41900433 - 41900158
Alignment:
Q  96 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 195  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||| || ||| |||||||||||| ||| || |||||||| || |  || || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  41900433 caccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacc 41900334  T
Q  196 gccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcct 295  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||||  | |||| ||||| | | ||  |||| |||||||| |  || ||     
T  41900333 tccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccacca 41900234  T
Q  296 tctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 371  Q
    || || ||||| ||||| || |||||  |||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41900233 tccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 41900158  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900511
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  279 agtcccctcttcctccttctccttcacc 306  Q
    | || ||||  ||||| ||||| |||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900290
Alignment:
Q  131 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 230  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  231 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctc 287  Q
      || || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 41900290  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41899977 - 41899824
Alignment:
Q  78 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||      |||||||||||  |||||||| |  || ||||| || || || || || |||||    
T  41899977 ctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctcc 41899878  T
Q  172 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatat 225  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  41899877 atatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatatat 41899824  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41899903 - 41899854
Alignment:
Q  17 ccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcc 66  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41899903 ccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctcc 41899854  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 41900001 - 41899953
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacc 63  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41900001 caccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccacc 41899953  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41900241 - 41900181
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctcc 75  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| | ||| |||||    
T  41900241 caccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctcc 41900181  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41900433 - 41900373
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctcc 75  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  41900433 caccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctcc 41900373  T

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Target: chr1 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 270
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  131 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 230  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  231 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 270  Q
     ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 282
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879545
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  279 agtc 282  Q
    ||||    
T  11879542 agtc 11879545  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 270
Target Start/End: Original strand, 11882303 - 11882439
Alignment:
Q  134 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 232  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11882303 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11882401  T
Q  233 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 270  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11882402 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 270
Target Start/End: Original strand, 11891537 - 11891673
Alignment:
Q  134 aagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatg 232  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||      
T  11891537 aagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccctactat-tacaaa 11891635  T
Q  233 tcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 270  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11891636 tcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 351
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879566
Alignment:
Q  227 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 326  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  327 aatctccacccccaccatctccttc 351  Q
    | || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttc 11879566  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 351
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902210
Alignment:
Q  179 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 278  Q
    |||||||| || || || ||| || |||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || |    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  279 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 351  Q
    |||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 267
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  131 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 230  Q
    |||||||||| ||| |||||  || | || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  231 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 267  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Original strand, 11902099 - 11902162
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatc 78  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11902099 caccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatc 11902162  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 368
Target Start/End: Original strand, 11879349 - 11879418
Alignment:
Q  299 ccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatg 368  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11879349 ccttcaccaccacctccttatgtttacaaatcgccacctcctccatccccatcacctccaccaccttatg 11879418  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Original strand, 11879458 - 11879626
Alignment:
Q  57 caccacctcctccatctccatctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcca------tatgtttacaagtcacaacctccacc 150  Q
    ||||| ||||| || | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||      ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11879458 caccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccacc 11879557  T
Q  151 ttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctcc 219  Q
     || || ||||||||||| ||||||   ||||||  |||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  11879558 ctcaccttccccaccaccaccatactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctcc 11879626  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 270
Target Start/End: Original strand, 11882411 - 11882535
Alignment:
Q  146 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 244  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11882411 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11882509  T
Q  245 ccatccccttcaccaccccctccata 270  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11882510 ccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 270
Target Start/End: Original strand, 11891645 - 11891769
Alignment:
Q  146 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 244  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11891645 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11891743  T
Q  245 ccatccccttcaccaccccctccata 270  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891744 ccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 223
Target Start/End: Original strand, 11902373 - 11902418
Alignment:
Q  178 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 223  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11902373 ttacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 282
Target Start/End: Original strand, 11904952 - 11905104
Alignment:
Q  130 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatcta 228  Q
    ||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||    
T  11904952 ttacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-ta 11905050  T
Q  229 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 282  Q
     | ||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||  |||||||||    
T  11905051 taagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtc 11905104  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 11879455 - 11879515
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctcc 75  Q
    |||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11879455 caccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctcc 11879515  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 246
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  158 tccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacc 246  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 270
Target Start/End: Original strand, 11902074 - 11902225
Alignment:
Q  119 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 218  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11902074 cctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctc 11902173  T
Q  219 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 270  Q
    | ||  | |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  11902174 cttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 52818638 - 52818571
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatctcca 82  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  52818638 caccaccatccccgtcacctccacctccttactattacaagtcacctccacctccatctccatctcca 52818571  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 387
Target Start/End: Original strand, 11879464 - 11879554
Alignment:
Q  297 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| |||||    
T  11879464 ctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccacc 11879554  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 390
Target Start/End: Original strand, 11902063 - 11902153
Alignment:
Q  300 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 390  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11902063 cttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctcc 11902153  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Original strand, 11905000 - 11905122
Alignment:
Q  130 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctac 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||  |||     
T  11905000 ttacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactat 11905099  T
Q  230 atgtcaccaccaccaccatcccc 252  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  11905100 aagtcaccagctccaccatcccc 11905122  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52821647 - 52821569
Alignment:
Q  117 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 195  Q
    |||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  52821647 ctccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 11879340 - 11879401
Alignment:
Q  17 ccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatc 78  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11879340 ccaccatcaccttcaccaccacctccttatgtttacaaatcgccacctcctccatccccatc 11879401  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 11879503 - 11879551
Alignment:
Q  15 caccaccatccccttcacctcctcctccatatgtgtacaagtcaccacc 63  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11879503 caccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccacc 11879551  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 363
Target Start/End: Original strand, 11881952 - 11881992
Alignment:
Q  323 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 363  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11881952 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11881992  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 363
Target Start/End: Original strand, 11891186 - 11891226
Alignment:
Q  323 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 363  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11891186 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11891226  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 387
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902198
Alignment:
Q  227 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 326  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  327 aatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 387  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |  |||||||| |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccacc 11902198  T

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Target: scaffold1918 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1918
Description:

Target: scaffold1918; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 127
Alignment:
Q  42 catatgtgtacaagtcaccacctcctccatctccatc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  163 catatgtgtacaagtcaccacctcctccatccccatc 127  T

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