View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19175_high_6 (Length: 699)

Name: NF19175_high_6
Description: NF19175
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19175_high_6
NF19175_high_6
[»] chr3 (107 HSPs)
chr3 (1-682)||(3617036-3617720)
chr3 (1-682)||(25637015-25637700)
chr3 (1-682)||(54634712-54635393)
chr3 (1-682)||(6716087-6716769)
chr3 (1-682)||(4600642-4601326)
chr3 (1-682)||(4598421-4599105)
chr3 (59-682)||(45282628-45283256)
chr3 (1-681)||(10055807-10056489)
chr3 (1-682)||(10210980-10211665)
chr3 (1-681)||(10058029-10058711)
chr3 (1-681)||(10060251-10060933)
chr3 (1-681)||(10062473-10063155)
chr3 (1-681)||(10064695-10065377)
chr3 (1-682)||(10208780-10209445)
chr3 (1-514)||(10066917-10067431)
chr3 (59-446)||(6718331-6718718)
chr3 (7-683)||(800694-801356)
chr3 (11-675)||(23200045-23200716)
chr3 (11-671)||(23197850-23198517)
chr3 (375-689)||(7779896-7780208)
chr3 (11-584)||(37408049-37408630)
chr3 (258-584)||(45095004-45095335)
chr3 (258-584)||(5260319-5260652)
chr3 (261-584)||(5258140-5258470)
chr3 (258-587)||(9636119-9636457)
chr3 (1-271)||(8477729-8478000)
chr3 (258-584)||(7762103-7762437)
chr3 (415-689)||(19683783-19684054)
chr3 (1-279)||(40372258-40372538)
chr3 (290-584)||(7764338-7764636)
chr3 (1-280)||(7167599-7167880)
chr3 (126-354)||(7782375-7782603)
chr3 (431-584)||(9581302-9581454)
chr3 (412-584)||(34491212-34491383)
chr3 (541-681)||(10067435-10067576)
chr3 (15-279)||(27352097-27352363)
chr3 (258-584)||(40734337-40734669)
chr3 (291-584)||(40735254-40735554)
chr3 (412-587)||(49199462-49199638)
chr3 (412-580)||(4569952-4570120)
chr3 (108-255)||(8738634-8738780)
chr3 (108-255)||(9090872-9091018)
chr3 (412-584)||(29196383-29196555)
chr3 (304-584)||(39153358-39153645)
chr3 (412-587)||(43401794-43401970)
chr3 (1-255)||(28501154-28501410)
chr3 (257-584)||(5236454-5236787)
chr3 (43-215)||(2671111-2671283)
chr3 (412-580)||(6095600-6095767)
chr3 (1-255)||(28503321-28503577)
chr3 (412-584)||(44331545-44331716)
chr3 (1-235)||(22172664-22172899)
chr3 (416-587)||(30236129-30236299)
chr3 (284-584)||(32744433-32744730)
chr3 (412-580)||(41819523-41819691)
chr3 (258-584)||(51398653-51398985)
chr3 (412-587)||(43403737-43403913)
chr3 (412-584)||(29813063-29813234)
chr3 (59-302)||(32143641-32143884)
chr3 (412-580)||(54593704-54593871)
chr3 (415-573)||(22835010-22835167)
chr3 (415-584)||(760850-761018)
chr3 (412-584)||(44700476-44700646)
chr3 (11-233)||(1306366-1306591)
chr3 (414-584)||(31314447-31314616)
chr3 (11-309)||(33386150-33386450)
chr3 (415-584)||(29682362-29682530)
chr3 (412-560)||(29810868-29811016)
chr3 (412-580)||(46860474-46860642)
chr3 (470-587)||(40913352-40913467)
chr3 (412-573)||(53921511-53921671)
chr3 (497-584)||(16499115-16499200)
chr3 (431-571)||(46173377-46173515)
chr3 (11-309)||(27453269-27453568)
chr3 (472-580)||(55301972-55302079)
chr3 (1-181)||(18656844-18657027)
chr3 (412-584)||(23391906-23392077)
chr3 (11-189)||(26928093-26928273)
chr3 (414-573)||(32891105-32891264)
chr3 (258-366)||(29812902-29813008)
chr3 (412-484)||(5433971-5434046)
chr3 (1-54)||(6718290-6718345)
chr3 (201-309)||(30709464-30709572)
chr3 (1-54)||(45282587-45282642)
chr3 (102-181)||(8512643-8512722)
chr3 (102-181)||(8517523-8517602)
chr3 (258-309)||(27974676-27974727)
chr3 (258-309)||(47923628-47923679)
chr3 (220-274)||(1306306-1306360)
chr3 (500-582)||(47304340-47304420)
chr3 (412-541)||(51352150-51352278)
chr3 (11-181)||(2672431-2672603)
chr3 (201-309)||(1735971-1736079)
chr3 (11-103)||(7782605-7782699)
chr3 (102-272)||(24968428-24968599)
chr3 (221-309)||(26928287-26928374)
chr3 (257-309)||(27986180-27986231)
chr3 (201-309)||(48438526-48438634)
chr3 (417-530)||(4055813-4055926)
chr3 (513-572)||(27305719-27305777)
chr3 (102-181)||(32475887-32475966)
chr3 (102-181)||(32480745-32480824)
chr3 (258-309)||(40592506-40592557)
chr3 (412-547)||(36018852-36018987)
chr3 (11-140)||(37726155-37726286)
chr3 (258-302)||(24694890-24694934)
chr3 (424-483)||(28253363-28253423)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (1-682)||(12647284-12647965)
chr2 (7-682)||(6266283-6266960)
chr2 (392-682)||(13655927-13656220)
chr2 (11-689)||(32289161-32289841)
chr2 (11-689)||(4484223-4484910)
chr2 (11-689)||(30832934-30833621)
chr2 (258-689)||(4503028-4503461)
chr2 (258-584)||(45099594-45099926)
chr2 (258-584)||(36205661-36205992)
chr2 (258-689)||(36987970-36988404)
chr2 (270-584)||(5723252-5723572)
chr2 (1-272)||(9295864-9296137)
chr2 (258-584)||(2334414-2334746)
chr2 (258-584)||(6595002-6595335)
chr2 (11-278)||(3492094-3492364)
chr2 (11-278)||(25409983-25410253)
chr2 (1-278)||(14291844-14292123)
chr2 (221-584)||(38312042-38312411)
chr2 (412-580)||(45726929-45727096)
chr2 (1-279)||(11098389-11098669)
chr2 (415-584)||(34139767-34139936)
chr2 (412-584)||(29867869-29868040)
chr2 (431-584)||(723741-723892)
chr2 (412-580)||(35446885-35447052)
chr2 (415-584)||(14633822-14633991)
chr2 (11-274)||(40739178-40739444)
chr2 (258-584)||(17057366-17057698)
chr2 (258-584)||(17085349-17085681)
chr2 (417-580)||(33648176-33648340)
chr2 (412-546)||(13121769-13121901)
chr2 (412-584)||(36773562-36773733)
chr2 (304-560)||(42362236-42362500)
chr2 (412-578)||(1631735-1631900)
chr2 (258-366)||(39284724-39284830)
chr2 (466-584)||(11067360-11067476)
chr2 (412-584)||(11151588-11151759)
chr2 (466-580)||(17490149-17490261)
chr2 (412-582)||(24398055-24398228)
chr2 (412-584)||(36318006-36318177)
chr2 (1-255)||(39811479-39811735)
chr2 (1-120)||(32247229-32247350)
chr2 (412-530)||(7815323-7815441)
chr2 (412-580)||(26353184-26353351)
chr2 (415-584)||(11690504-11690672)
chr2 (431-584)||(33162447-33162598)
chr2 (201-309)||(33528302-33528410)
chr2 (512-584)||(39284936-39285007)
chr2 (1-74)||(44310473-44310548)
chr2 (466-580)||(7451173-7451284)
chr2 (258-320)||(2837112-2837173)
chr2 (412-575)||(42288117-42288278)
chr2 (219-308)||(36757458-36757547)
chr2 (512-584)||(17450678-17450748)
chr2 (102-181)||(19344825-19344904)
chr2 (102-181)||(19349683-19349762)
chr2 (258-309)||(23078206-23078257)
chr2 (177-309)||(34389162-34389295)
chr2 (258-355)||(36318242-36318338)
chr2 (470-569)||(28671989-28672088)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (1-682)||(18392094-18392778)
chr7 (1-682)||(6592238-6592919)
chr7 (1-682)||(6594456-6595135)
chr7 (95-682)||(18388658-18389246)
chr7 (1-682)||(32060220-32060886)
chr7 (1-675)||(20343502-20344158)
chr7 (7-633)||(24789435-24790062)
chr7 (1-482)||(1562103-1562585)
chr7 (11-689)||(39730946-39731644)
chr7 (11-633)||(43504102-43504708)
chr7 (11-587)||(25766953-25767527)
chr7 (489-682)||(1560563-1560757)
chr7 (258-587)||(35853754-35854089)
chr7 (221-587)||(48408605-48408979)
chr7 (258-584)||(29990894-29991225)
chr7 (258-584)||(23554879-23555212)
chr7 (259-584)||(4178615-4178945)
chr7 (11-278)||(21646360-21646630)
chr7 (1-279)||(2058323-2058602)
chr7 (412-584)||(34310712-34310884)
chr7 (40-288)||(1532947-1533194)
chr7 (270-584)||(19502028-19502350)
chr7 (224-584)||(30024729-30025095)
chr7 (1-215)||(21640205-21640421)
chr7 (290-584)||(14069830-14070131)
chr7 (290-584)||(14379858-14380159)
chr7 (412-584)||(41317431-41317602)
chr7 (392-584)||(25615836-25616025)
chr7 (412-580)||(22269973-22270140)
chr7 (11-278)||(18409116-18409386)
chr7 (1-207)||(20357030-20357238)
chr7 (257-560)||(48491416-48491727)
chr7 (412-584)||(27347817-27347988)
chr7 (11-278)||(18413992-18414262)
chr7 (412-580)||(8359316-8359485)
chr7 (11-181)||(21811751-21811923)
chr7 (466-580)||(32358055-32358167)
chr7 (415-584)||(41649008-41649175)
chr7 (412-580)||(48599335-48599502)
chr7 (257-584)||(48489268-48489602)
chr7 (258-584)||(18126483-18126815)
chr7 (412-578)||(29608737-29608902)
chr7 (1-255)||(4873463-4873719)
chr7 (412-584)||(8153342-8153513)
chr7 (1-255)||(12406599-12406855)
chr7 (431-587)||(2390302-2390456)
chr7 (412-580)||(3258995-3259162)
chr7 (412-580)||(4508707-4508874)
chr7 (412-576)||(6431971-6432134)
chr7 (304-584)||(38671219-38671506)
chr7 (412-580)||(4253529-4253697)
chr7 (258-414)||(24514934-24515089)
chr7 (258-584)||(1113495-1113828)
chr7 (258-584)||(4586000-4586332)
chr7 (258-584)||(47676133-47676465)
chr7 (261-542)||(47673981-47674269)
chr7 (431-584)||(31732966-31733117)
chr7 (290-582)||(43864114-43864413)
chr7 (412-575)||(2360978-2361140)
chr7 (11-189)||(48408411-48408591)
chr7 (412-573)||(23565069-23565232)
chr7 (466-580)||(4510549-4510661)
chr7 (466-580)||(4512391-4512503)
chr7 (1-255)||(31109072-31109329)
chr7 (412-584)||(36146405-36146576)
chr7 (11-181)||(24023831-24024003)
chr7 (11-309)||(2479647-2479947)
chr7 (412-587)||(26417316-26417489)
chr7 (415-584)||(495980-496148)
chr7 (437-583)||(2759195-2759339)
chr7 (415-580)||(31105394-31105558)
chr7 (102-181)||(24265782-24265861)
chr7 (258-309)||(49092000-49092051)
chr7 (258-320)||(2761570-2761631)
chr7 (466-587)||(6359946-6360065)
chr7 (417-575)||(22328395-22328556)
chr7 (412-484)||(23343975-23344048)
chr7 (412-483)||(24525992-24526065)
chr7 (225-309)||(79699-79783)
chr7 (1-74)||(12397415-12397490)
chr7 (201-309)||(21989219-21989326)
chr7 (477-580)||(18396384-18396486)
chr7 (102-181)||(24260926-24261005)
chr7 (497-584)||(24525499-24525584)
chr7 (412-512)||(31518795-31518896)
chr7 (126-235)||(12397267-12397376)
chr7 (652-682)||(24790240-24790270)
chr7 (512-582)||(30814536-30814605)
chr7 (416-449)||(1360283-1360316)
chr7 (11-73)||(47264190-47264254)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-682)||(2502-3183)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (1-682)||(44203220-44203902)
chr1 (1-682)||(9036005-9036686)
chr1 (7-682)||(40281967-40282645)
chr1 (1-682)||(21053542-21054226)
chr1 (7-682)||(20622137-20622812)
chr1 (7-682)||(9986794-9987470)
chr1 (221-689)||(51765197-51765672)
chr1 (258-584)||(20762511-20762844)
chr1 (411-584)||(13316348-13316521)
chr1 (258-584)||(3189170-3189502)
chr1 (258-584)||(3197987-3198319)
chr1 (258-584)||(3206826-3207158)
chr1 (415-689)||(8550679-8550952)
chr1 (258-584)||(3156705-3157036)
chr1 (412-587)||(42297968-42298143)
chr1 (258-584)||(28220223-28220555)
chr1 (11-278)||(19365781-19366051)
chr1 (257-584)||(44454997-44455331)
chr1 (412-580)||(37168297-37168465)
chr1 (126-278)||(24202360-24202513)
chr1 (258-584)||(31659077-31659409)
chr1 (412-580)||(13547090-13547257)
chr1 (412-584)||(28265551-28265722)
chr1 (1-181)||(39445898-39446080)
chr1 (59-255)||(24793709-24793904)
chr1 (258-584)||(28223418-28223750)
chr1 (258-584)||(37503554-37503883)
chr1 (415-584)||(834164-834332)
chr1 (412-580)||(11348698-11348865)
chr1 (412-580)||(13549001-13549168)
chr1 (108-255)||(24786936-24787082)
chr1 (412-580)||(29136247-29136415)
chr1 (412-580)||(47255340-47255508)
chr1 (6-181)||(25439406-25439583)
chr1 (1-181)||(44023379-44023561)
chr1 (412-580)||(7482231-7482399)
chr1 (412-584)||(37033068-37033241)
chr1 (412-580)||(47115171-47115340)
chr1 (412-584)||(4552634-4552805)
chr1 (11-194)||(19360925-19361110)
chr1 (431-580)||(31925708-31925855)
chr1 (412-584)||(45644351-45644523)
chr1 (412-584)||(49918350-49918521)
chr1 (412-584)||(50169207-50169378)
chr1 (6-181)||(25444599-25444776)
chr1 (431-576)||(34603596-34603740)
chr1 (11-181)||(41391002-41391173)
chr1 (412-582)||(19754494-19754664)
chr1 (466-580)||(193666-193778)
chr1 (1-181)||(1054516-1054698)
chr1 (412-584)||(50167172-50167343)
chr1 (15-194)||(51765007-51765188)
chr1 (258-366)||(13316541-13316647)
chr1 (415-584)||(13659333-13659501)
chr1 (497-580)||(28242391-28242472)
chr1 (258-584)||(37559864-37560198)
chr1 (415-584)||(46064921-46065089)
chr1 (412-560)||(23555286-23555433)
chr1 (270-557)||(1833372-1833667)
chr1 (11-121)||(24202264-24202376)
chr1 (258-366)||(10925062-10925168)
chr1 (415-584)||(3847118-3847286)
chr1 (466-584)||(13137973-13138089)
chr1 (466-560)||(15820362-15820455)
chr1 (412-584)||(30476443-30476614)
chr1 (258-364)||(49918188-49918292)
chr1 (412-587)||(41360914-41361088)
chr1 (59-181)||(41398657-41398778)
chr1 (415-584)||(196904-197073)
chr1 (221-278)||(19358530-19358587)
chr1 (221-278)||(19361119-19361176)
chr1 (412-584)||(19752685-19752857)
chr1 (417-556)||(22079322-22079461)
chr1 (258-318)||(30476718-30476777)
chr1 (497-580)||(37876767-37876848)
chr1 (412-485)||(37879005-37879079)
chr1 (412-512)||(928043-928145)
chr1 (258-309)||(21536305-21536356)
chr1 (497-560)||(36683766-36683828)
chr1 (102-181)||(43988054-43988133)
chr1 (415-484)||(8871143-8871213)
chr1 (417-512)||(12318589-12318685)
chr1 (434-498)||(48382441-48382505)
chr1 (428-483)||(6378600-6378655)
chr1 (262-302)||(13598718-13598758)
chr1 (466-541)||(16455676-16455750)
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (1-682)||(10592846-10593528)
chr5 (1-682)||(25077708-25078391)
chr5 (1-682)||(25135677-25136360)
chr5 (1-682)||(40379680-40380361)
chr5 (1-682)||(40381891-40382572)
chr5 (1-682)||(16546218-16546903)
chr5 (1-682)||(16543996-16544681)
chr5 (1-675)||(22536197-22536850)
chr5 (126-682)||(29751059-29751615)
chr5 (7-682)||(29719974-29720632)
chr5 (220-682)||(29722332-29722792)
chr5 (7-682)||(9789123-9789800)
chr5 (7-633)||(18441595-18442224)
chr5 (11-633)||(26177479-26178103)
chr5 (11-633)||(26170370-26170983)
chr5 (250-689)||(16409313-16409752)
chr5 (258-584)||(25412601-25412932)
chr5 (258-584)||(13342900-13343232)
chr5 (259-689)||(30182429-30182861)
chr5 (258-584)||(36074039-36074373)
chr5 (258-680)||(13239591-13240016)
chr5 (12-282)||(24136198-24136470)
chr5 (258-584)||(32636663-32636995)
chr5 (427-584)||(37439157-37439313)
chr5 (1-255)||(43599060-43599316)
chr5 (1-255)||(43604552-43604808)
chr5 (1-255)||(43610044-43610300)
chr5 (1-255)||(27450152-27450407)
chr5 (1-255)||(27445309-27445564)
chr5 (412-580)||(213465-213633)
chr5 (126-278)||(35388016-35388169)
chr5 (412-580)||(40147261-40147428)
chr5 (270-584)||(13488053-13488374)
chr5 (258-573)||(30682930-30683249)
chr5 (412-582)||(28278316-28278485)
chr5 (258-584)||(28750652-28750985)
chr5 (270-584)||(42428427-42428748)
chr5 (108-236)||(43592634-43592761)
chr5 (1-181)||(30631764-30631946)
chr5 (283-584)||(39468546-39468854)
chr5 (6-181)||(28807083-28807260)
chr5 (415-601)||(33831683-33831866)
chr5 (270-584)||(533619-533940)
chr5 (1-210)||(1456640-1456850)
chr5 (7-175)||(29722161-29722332)
chr5 (7-120)||(29752266-29752381)
chr5 (412-580)||(5058047-5058212)
chr5 (11-199)||(16407654-16407844)
chr5 (108-255)||(31180591-31180738)
chr5 (1-181)||(15045096-15045277)
chr5 (1-175)||(29402552-29402728)
chr5 (258-584)||(42426232-42426564)
chr5 (412-578)||(27637615-27637781)
chr5 (304-580)||(16451965-16452247)
chr5 (304-580)||(31182857-31183138)
chr5 (76-278)||(38219752-38219949)
chr5 (415-584)||(8565943-8566111)
chr5 (201-309)||(15464845-15464952)
chr5 (412-580)||(27015531-27015690)
chr5 (412-557)||(13695713-13695859)
chr5 (415-584)||(538028-538196)
chr5 (221-321)||(16407848-16407947)
chr5 (11-199)||(16409090-16409280)
chr5 (426-580)||(16640941-16641091)
chr5 (416-584)||(38747009-38747176)
chr5 (418-582)||(316769-316933)
chr5 (11-309)||(9352820-9353118)
chr5 (415-569)||(9049354-9049506)
chr5 (512-584)||(19806463-19806534)
chr5 (108-180)||(37561058-37561130)
chr5 (102-181)||(2785778-2785857)
chr5 (102-181)||(33768587-33768666)
chr5 (102-181)||(33791719-33791798)
chr5 (11-121)||(15465000-15465112)
chr5 (258-307)||(14520543-14520592)
chr5 (7-103)||(29751617-29751715)
chr5 (258-318)||(37438987-37439046)
chr5 (108-180)||(37556236-37556308)
chr5 (258-309)||(11916707-11916758)
chr5 (515-575)||(4160702-4160762)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (1-679)||(5861-6542)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (1-682)||(16578415-16579099)
chr6 (1-682)||(16616281-16616965)
chr6 (1-682)||(16554456-16555140)
chr6 (1-682)||(16631012-16631696)
chr6 (1-682)||(6026836-6027516)
chr6 (1-682)||(34166668-34167350)
chr6 (120-682)||(25421014-25421576)
chr6 (1-682)||(33342001-33342686)
chr6 (59-682)||(16652759-16653383)
chr6 (1-681)||(34164446-34165128)
chr6 (7-682)||(27647476-27648122)
chr6 (7-680)||(411694-412369)
chr6 (7-689)||(3072652-3073334)
chr6 (392-679)||(13153893-13154182)
chr6 (221-689)||(6097342-6097800)
chr6 (12-587)||(2171525-2172090)
chr6 (1-279)||(6136266-6136545)
chr6 (1-234)||(25420799-25421034)
chr6 (270-584)||(31404671-31404992)
chr6 (270-584)||(5406196-5406516)
chr6 (270-584)||(5410521-5410841)
chr6 (7-215)||(13150857-13151068)
chr6 (258-584)||(30834532-30834865)
chr6 (258-584)||(5413391-5413721)
chr6 (258-584)||(16452325-16452658)
chr6 (11-283)||(5674242-5674516)
chr6 (11-278)||(22709362-22709632)
chr6 (258-584)||(33160348-33160683)
chr6 (412-587)||(3808701-3808877)
chr6 (245-584)||(9183028-9183373)
chr6 (412-580)||(21588931-21589098)
chr6 (412-580)||(21593664-21593831)
chr6 (415-580)||(17758026-17758191)
chr6 (412-580)||(2972940-2973107)
chr6 (412-580)||(17762990-17763158)
chr6 (1-164)||(30125020-30125185)
chr6 (1-255)||(11857310-11857565)
chr6 (59-215)||(5266454-5266610)
chr6 (483-584)||(5409066-5409164)
chr6 (414-580)||(26830124-26830289)
chr6 (59-235)||(28155133-28155309)
chr6 (415-580)||(5043630-5043795)
chr6 (1-177)||(14741928-14742106)
chr6 (329-584)||(16568953-16569193)
chr6 (412-580)||(22424826-22424995)
chr6 (1-235)||(22010191-22010427)
chr6 (415-584)||(26954283-26954450)
chr6 (412-580)||(28137409-28137576)
chr6 (412-584)||(33211182-33211353)
chr6 (1-100)||(34151830-34151931)
chr6 (1-181)||(6438899-6439081)
chr6 (466-580)||(26800642-26800755)
chr6 (7-122)||(6097860-6097977)
chr6 (466-587)||(603082-603201)
chr6 (102-235)||(16839092-16839225)
chr6 (412-557)||(3038926-3039071)
chr6 (76-181)||(6005822-6005927)
chr6 (108-177)||(14737177-14737246)
chr6 (412-530)||(4045423-4045542)
chr6 (102-181)||(33330038-33330117)
chr6 (102-181)||(33335535-33335614)
chr6 (258-320)||(5407176-5407237)
chr6 (258-320)||(5411501-5411562)
chr6 (126-200)||(6097803-6097877)
chr6 (258-366)||(33211408-33211514)
chr6 (1-54)||(16652718-16652773)
chr6 (102-181)||(5343880-5343959)
chr6 (177-309)||(18234394-18234528)
chr6 (126-279)||(26253698-26253852)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-682)||(3624-4308)
[»] chr4 (91 HSPs)
chr4 (1-682)||(7122269-7122953)
chr4 (1-682)||(8395193-8395874)
chr4 (1-682)||(8392984-8393665)
chr4 (1-672)||(5137877-5138552)
chr4 (1-672)||(5135651-5136327)
chr4 (296-682)||(7124785-7125172)
chr4 (7-623)||(31495274-31495893)
chr4 (11-584)||(13992289-13992866)
chr4 (270-580)||(29999806-30000123)
chr4 (1-189)||(7124491-7124681)
chr4 (258-584)||(56178633-56178965)
chr4 (1-279)||(24742295-24742575)
chr4 (258-584)||(5370079-5370415)
chr4 (292-584)||(48142914-48143215)
chr4 (258-582)||(52095361-52095691)
chr4 (270-584)||(9927455-9927775)
chr4 (416-587)||(2209717-2209889)
chr4 (258-582)||(37740465-37740794)
chr4 (1-255)||(51520793-51521048)
chr4 (11-235)||(28467990-28468217)
chr4 (412-577)||(41964415-41964580)
chr4 (290-584)||(12739547-12739848)
chr4 (258-584)||(26175633-26175965)
chr4 (412-580)||(46703500-46703669)
chr4 (1-255)||(56141513-56141770)
chr4 (224-584)||(34570411-34570777)
chr4 (6-181)||(45347324-45347501)
chr4 (258-584)||(5429518-5429850)
chr4 (59-207)||(29761048-29761196)
chr4 (430-584)||(12743922-12744074)
chr4 (430-584)||(12745311-12745463)
chr4 (412-584)||(36463386-36463557)
chr4 (412-587)||(26364236-26364410)
chr4 (412-584)||(47038408-47038577)
chr4 (414-587)||(12119540-12119714)
chr4 (431-580)||(6655976-6656123)
chr4 (412-580)||(8648139-8648306)
chr4 (1-255)||(9223901-9224157)
chr4 (1-255)||(9228688-9228944)
chr4 (412-580)||(12073392-12073560)
chr4 (1-181)||(18856125-18856307)
chr4 (412-580)||(40632445-40632612)
chr4 (412-580)||(41639426-41639593)
chr4 (466-580)||(50673848-50673960)
chr4 (126-309)||(31985236-31985419)
chr4 (412-580)||(37229722-37229890)
chr4 (412-587)||(54883020-54883194)
chr4 (412-580)||(6542180-6542349)
chr4 (412-582)||(36994524-36994693)
chr4 (414-584)||(46147388-46147557)
chr4 (415-580)||(379383-379548)
chr4 (412-580)||(4587958-4588126)
chr4 (412-560)||(8665408-8665556)
chr4 (412-584)||(27416962-27417133)
chr4 (412-584)||(45687179-45687351)
chr4 (466-584)||(48893635-48893751)
chr4 (258-584)||(52082660-52082986)
chr4 (466-587)||(50262694-50262814)
chr4 (290-542)||(12747794-12748054)
chr4 (412-582)||(54199906-54200074)
chr4 (419-580)||(5207843-5208003)
chr4 (177-309)||(5268852-5268986)
chr4 (412-584)||(5871820-5871991)
chr4 (431-540)||(12744087-12744195)
chr4 (466-572)||(35662496-35662600)
chr4 (60-181)||(45356861-45356982)
chr4 (258-366)||(52093887-52093993)
chr4 (1-181)||(3814422-3814603)
chr4 (1-181)||(5733062-5733245)
chr4 (38-177)||(18712296-18712435)
chr4 (415-584)||(52467351-52467519)
chr4 (431-540)||(12745476-12745584)
chr4 (438-575)||(26699447-26699585)
chr4 (466-580)||(31474206-31474318)
chr4 (201-309)||(54867490-54867598)
chr4 (177-309)||(8689149-8689282)
chr4 (258-309)||(10047692-10047743)
chr4 (177-309)||(36314882-36315016)
chr4 (177-309)||(36329091-36329225)
chr4 (486-584)||(13009441-13009536)
chr4 (1-68)||(18860450-18860519)
chr4 (212-320)||(29254287-29254394)
chr4 (258-309)||(6743150-6743201)
chr4 (497-584)||(29254580-29254665)
chr4 (412-580)||(51337064-51337231)
chr4 (270-320)||(36994375-36994425)
chr4 (417-498)||(44967910-44967992)
chr4 (293-366)||(54200129-54200201)
chr4 (412-530)||(24969112-24969230)
chr4 (416-484)||(48142473-48142542)
chr4 (412-498)||(55085445-55085532)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (1-682)||(3439090-3439772)
chr8 (1-682)||(42575223-42575907)
chr8 (59-682)||(25689604-25690224)
chr8 (1-679)||(15290145-15290791)
chr8 (1-679)||(15470514-15471160)
chr8 (11-689)||(2627331-2628011)
chr8 (258-584)||(34254327-34254657)
chr8 (258-584)||(17982492-17982825)
chr8 (258-689)||(31218096-31218530)
chr8 (258-584)||(34256503-34256833)
chr8 (270-680)||(42498044-42498459)
chr8 (258-584)||(19945355-19945689)
chr8 (258-584)||(44303693-44304027)
chr8 (258-583)||(1746216-1746547)
chr8 (1-255)||(4759536-4759791)
chr8 (1-271)||(36979741-36980012)
chr8 (1-255)||(30656025-30656280)
chr8 (1-255)||(18852629-18852884)
chr8 (12-272)||(1261428-1261692)
chr8 (214-584)||(15212582-15212957)
chr8 (258-584)||(43036262-43036594)
chr8 (1-255)||(18870023-18870278)
chr8 (1-215)||(33037289-33037505)
chr8 (258-584)||(12702631-12702967)
chr8 (11-278)||(26288234-26288504)
chr8 (11-278)||(26301491-26301761)
chr8 (11-278)||(26313485-26313755)
chr8 (1-255)||(7289429-7289686)
chr8 (258-584)||(27811117-27811449)
chr8 (412-580)||(42434992-42435159)
chr8 (1-181)||(10683741-10683923)
chr8 (412-584)||(3303667-3303838)
chr8 (412-580)||(4283524-4283691)
chr8 (412-584)||(33352150-33352321)
chr8 (412-580)||(18655400-18655567)
chr8 (1-181)||(39784327-39784509)
chr8 (414-584)||(40321082-40321251)
chr8 (245-584)||(4731484-4731829)
chr8 (6-255)||(6311677-6311928)
chr8 (258-560)||(30143181-30143488)
chr8 (415-584)||(1345368-1345536)
chr8 (466-584)||(5689326-5689442)
chr8 (412-584)||(40221745-40221916)
chr8 (412-580)||(8965692-8965859)
chr8 (258-355)||(19948554-19948650)
chr8 (415-542)||(44353796-44353923)
chr8 (487-584)||(4743211-4743306)
chr8 (415-584)||(6598975-6599143)
chr8 (415-584)||(6674428-6674596)
chr8 (414-587)||(10930193-10930365)
chr8 (415-554)||(40328782-40328922)
chr8 (466-584)||(41366612-41366727)
chr8 (412-574)||(18141821-18141981)
chr8 (412-530)||(9765745-9765863)
chr8 (412-542)||(30291606-30291737)
chr8 (466-580)||(11384040-11384152)
chr8 (245-366)||(4733631-4733754)
chr8 (412-587)||(19491693-19491867)
chr8 (220-278)||(31043131-31043189)
chr8 (412-574)||(1292471-1292631)
chr8 (11-120)||(31042921-31043032)
chr8 (1-177)||(25327666-25327844)
chr8 (258-309)||(5702215-5702266)
chr8 (258-309)||(7412651-7412702)
chr8 (102-181)||(35745794-35745873)
chr8 (108-279)||(10688710-10688882)
chr8 (1-34)||(25689563-25689596)
chr8 (466-580)||(4162552-4162663)
chr8 (258-309)||(4456339-4456390)
chr8 (258-309)||(4696343-4696394)
chr8 (497-580)||(4733792-4733873)
chr8 (466-575)||(10015136-10015241)
chr8 (466-575)||(18106087-18106191)
chr8 (292-366)||(33352022-33352095)
chr8 (11-161)||(7412787-7412939)
chr8 (126-233)||(31043017-31043125)
chr8 (425-492)||(41266982-41267051)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (11-689)||(11054-11740)
scaffold0491 (11-689)||(8628-9295)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (38-584)||(524-1087)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (259-689)||(434373-434807)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (551-682)||(4-135)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (412-587)||(11557-11732)
scaffold0286 (12-362)||(21953-22286)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (412-584)||(114602-114774)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (11-194)||(17444-17629)
scaffold0188 (221-288)||(17638-17705)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (412-580)||(18004-18171)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-181)||(761-943)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (468-580)||(10546-10656)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (412-582)||(20414-20583)
scaffold0066 (258-355)||(20648-20744)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (412-580)||(7327-7494)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (1-235)||(3339-3575)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (415-584)||(149094-149262)
scaffold0006 (177-302)||(2811-2938)
scaffold0006 (262-302)||(6003-6043)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-255)||(34556-34812)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (102-235)||(1844-1977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (102-235)||(148549-148682)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (108-177)||(8112-8181)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (102-181)||(13889-13968)
scaffold0197 (102-235)||(18769-18902)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (102-181)||(176555-176634)
[»] scaffold1455 (1 HSPs)
scaffold1455 (1-68)||(1711-1780)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (259-309)||(36568-36618)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (11-121)||(7924-8036)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 517; Significance: 0; HSPs: 107)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 3617036 - 3617720
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3617036 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 3617135  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3617136 gggtgcaaat-cgtgtcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataacggctggtcgttccttgggacggac 3617234  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggg-agagtttgaaga 296  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |    
T  3617235 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagtagaggttgga-a 3617333  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617334 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 3617433  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3617434 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct 3617533  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3617534 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttt 3617632  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617633 attgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 3617720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 25637015 - 25637700
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  25637015 ttgagattgtctttaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcgaggtgcga-gagctagggttgca 25637113  T
Q  98 ggg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637114 ggggtgcaaat-cgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 25637212  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggag-ggagagtttgaag 295  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  25637213 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaggag-gttggaag 25637311  T
Q  296 agagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagag 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||    
T  25637312 agagagagacttgggaaatcaaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 25637409  T
Q  396 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25637410 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccc 25637509  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25637510 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgct 25637609  T
Q  595 tttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattg-ttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637610 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 25637700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 54634712 - 54635393
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||    
T  54634712 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggcattgtgacacgatttcggggtgccgtgagctaag-ttgca 54634810  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||    
T  54634811 gggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcttttcttgggtggtac 54634910  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||    
T  54634911 gcaaatcatgacacgattgggaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagggagttggaagag 54635009  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635010 agagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 54635109  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635110 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 54635209  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635210 tttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 54635308  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635309 tgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 54635393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 6716087 - 6716769
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  6716087 ttgagattgtcttgaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgca 6716185  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  6716186 gggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 6716285  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||    
T  6716286 gcggatcgtgacacgatttggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagggttggaagag 6716384  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716385 agagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 6716484  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716485 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 6716584  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716585 tttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 6716683  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716684 tgttttcttcttccctccccttttatcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 6716769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 4601326 - 4600642
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4601326 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 4601227  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttg-ggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601226 gggtgcaaat-cgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 4601128  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggg--agagtttgaa 294  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||     
T  4601127 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaaggaaagagttgga- 4601029  T
Q  295 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  4601028 -agagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 4600932  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4600931 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatt 4600832  T
Q  494 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4600831 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtg 4600733  T
Q  593 ctt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4600732 tttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgatt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 4600642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 4599105 - 4598421
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4599105 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 4599006  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttg-ggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4599005 gggtgcaaat-cgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 4598907  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagag-tttgaag 295  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |     
T  4598906 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattgaaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaaggagagagttgga- 4598808  T
Q  296 agagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagag 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||    
T  4598807 agagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgt--agag 4598710  T
Q  396 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4598709 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattc 4598610  T
Q  495 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  4598609 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgt 4598511  T
Q  594 tt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4598510 ttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 4598421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 682
Target Start/End: Original strand, 45282628 - 45283256
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45282628 atcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtt 45282726  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  45282727 aagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-t 45282825  T
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagag 354  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282826 aaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagagagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagag 45282925  T
Q  355 tatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcata 454  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45282926 tatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcata 45283025  T
Q  455 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc---ttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagca 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  45283026 gtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagta 45283125  T
Q  552 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcaca 649  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| || ||    
T  45283126 ggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctca 45283223  T
Q  650 cttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283224 ctagtttcctagattagatctaggtggtgtttt 45283256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 10055807 - 10056489
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10055807 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10055906  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055907 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 10056005  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  10056006 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 10056103  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  10056104 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 10056201  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10056202 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 10056301  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  10056302 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 10056400  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10056401 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10056489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 10210980 - 10211665
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  10210980 ttgagattgtctttaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttaggatgccgtgagttagggttgcag 10211079  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211080 gggtgcaaat-cgtggcacgattttgggaaaatcatgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 10211178  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga--gagtttgaa 294  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||| ||| |    
T  10211179 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtaaaagaggttgga 10211278  T
Q  295 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  10211279 -agagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 10211375  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10211376 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatt 10211475  T
Q  494 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10211476 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtg 10211574  T
Q  593 ctt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10211575 tttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 10211665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 10058029 - 10058711
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10058029 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10058128  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10058129 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgta 10058227  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  10058228 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 10058325  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  10058326 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 10058423  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10058424 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 10058523  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  10058524 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 10058622  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10058623 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10058711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 10060251 - 10060933
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10060251 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10060350  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10060351 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgta 10060449  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  10060450 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 10060547  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  10060548 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 10060645  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10060646 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 10060745  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  10060746 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 10060844  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10060845 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10060933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 10062473 - 10063155
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10062473 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10062572  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10062573 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgta 10062671  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  10062672 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 10062769  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  10062770 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 10062867  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10062868 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 10062967  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  10062968 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 10063066  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10063067 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10063155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 10064695 - 10065377
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10064695 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10064794  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10064795 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgta 10064893  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  10064894 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 10064991  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  10064992 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 10065089  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10065090 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 10065189  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  10065190 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 10065288  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10065289 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10065377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 10208780 - 10209445
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10208780 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcatgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10208879  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10208880 gggtgcaaat-cgtggcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaaatatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 10208978  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga--gagtttgaa 294  Q
    ||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||| ||| |    
T  10208979 cgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagtaaaagaggttgga 10209058  T
Q  295 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  10209059 -agagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 10209155  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  10209156 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagt 10209255  T
Q  494 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  10209256 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctcttt-gtg 10209354  T
Q  593 ctt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10209355 tttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 10209445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 10066917 - 10067431
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10066917 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 10067016  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067017 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 10067115  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  10067116 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 10067213  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  10067214 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 10067311  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10067312 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 10067411  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttg 514  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  10067412 ttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 59 - 446
Target Start/End: Original strand, 6718331 - 6718718
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6718331 atcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgtt 6718429  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  6718430 aagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcggatcgtgacacgatttgaaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-t 6718528  T
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
     ||||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718529 aaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagggttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagta 6718628  T
Q  357 tctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6718629 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 683
Target Start/End: Original strand, 800694 - 801356
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||| ||||||    
T  800694 ttgtcttcgaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcggggtgc 800792  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||  || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |    
T  800793 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcacca 800892  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
    ||||||||| |    ||||| |||||||||||||  | |||  || | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||            ||||||    
T  800893 atcgtgacacggcctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtagagggctaatatttaagtgttcttgtgcatatttgaagg------------agagag 800979  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  800980 aaacttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaa 801078  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatccct 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  801079 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct 801177  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  801178 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctt 801275  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttt 683  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||   ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  801276 tgttttcttcttccctctccttttatcttgtg--tattg---tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgttttt 801356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 23200716 - 23200045
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||  |||||| || ||||||||||| ||     
T  23200716 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgctgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 23200618  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||  ||| |  |||||    
T  23200617 tcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacttacgtaccaatcg 23200518  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||    
T  23200517 tgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactggtatttaagtgtttttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaac 23200420  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||    
T  23200419 ttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 23200321  T
Q  404 tgagtgt------cttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcc 494  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23200320 tgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagag-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-c 23200223  T
Q  495 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  23200222 tttttgtaagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtc 23200126  T
Q  595 tttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcaca-cttgtttcctagattagatctaggtg 675  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23200125 tttgttttcttcttccctctccttttatcttatgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtg 23200045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 23198517 - 23197850
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  23198517 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 23198419  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  23198418 tcgtgacacgatttggaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 23198319  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||    
T  23198318 tgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaac 23198221  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||    
T  23198220 ttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 23198122  T
Q  404 tgagtgt------cttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcc 494  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23198121 tgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagag-ttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-c 23198024  T
Q  495 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  23198023 tttttgtaagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtc 23197927  T
Q  595 tttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcaca-cttgtttcctagattagatcta 671  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||    
T  23197926 tttgttttcctcttctctctccttttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatcta 23197850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 375 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779896
Alignment:
Q  375 tgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaat 473  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  474 ttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgg 573  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgg 7780011  T
Q  574 gtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtg-tgtcacacttgtttcctagattagatctag 672  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  7780010 gtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatctag 7779913  T
Q  673 gtggtgtttttgatgat 689  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  7779912 gtgctgtttttgttgat 7779896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 584
Target Start/End: Original strand, 37408049 - 37408630
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| | | |||| |||||| || ||||||||||  ||     
T  37408049 cttcaaatttgtggtttggaagaacaaagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgattttgtagtgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 37408147  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||  | ||||||  | ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || ||| |  |||||    
T  37408148 tcgtggcacgatt-gtgtaaatcgtgacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgtatcaatcg 37408245  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    || || |||| ||||| |||| ||| ||||  | | |  ||||||| |||  |||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||| ||    
T  37408246 tggcacgatttggaaa-tcgtaacaagattttatctgctgaagactggtatataagtgttcttgtgaagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaac 37408344  T
Q  306 ttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | |||||||||    || || ||| ||    
T  37408345 ttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaattat 37408442  T
Q  404 tgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 493  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37408443 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 37408541  T
Q  494 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37408542 tcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct 37408630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 45095004 - 45095335
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  45095004 taagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 45095100  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttg 448  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45095101 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-g 45095199  T
Q  449 ttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |    
T  45095200 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcta 45095297  T
Q  547 gagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095298 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45095335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5260652 - 5260319
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  5260652 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 5260556  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5260555 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 5260456  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  5260455 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctc 5260359  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5260358 caaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5260319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5258470 - 5258140
Alignment:
Q  261 gtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatct 359  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5258470 gtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tct 5258374  T
Q  360 cttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgt 449  Q
    |||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  5258373 cttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gt 5258275  T
Q  450 tcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccag 547  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5258274 tctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccag 5258177  T
Q  548 agcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5258176 agtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5258140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9636457 - 9636119
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636457 taagtgttctt-tgcagattttgaagagtgagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt 9636360  T
Q  356 atctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaaa--ggtagaaattagggt 445  Q
     ||||||||||    ||| || | ||||||||||   || || |||||||||||||||||||       |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  9636359 ctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggt 9636260  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9636259 t-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcct 9636163  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9636162 ccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctctt 9636119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8478000 - 8477729
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  ||||     
T  8478000 ttgacattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgct 8477902  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||    
T  8477901 ggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtac 8477802  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtg 271  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8477801 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtg 8477729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 7762103 - 7762437
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagaga--cttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagag 354  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7762103 taagtgttctt-tgcaaattttgaaggaaagcttgaagagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagag 7762200  T
Q  355 tatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggt 445  Q
    | ||||||||||    ||| || |  |||||||||   || || ||||||||||||||||       |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7762201 t-tctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggt 7762299  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7762300 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcct 7762396  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762397 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 7762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683783
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19683957  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccc 611  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |    
T  19683956 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--c 19683862  T
Q  612 tctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgt-ttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    ||||||| |||||| || |||| | ||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19683861 tctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgttattgttgat 19683783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 40372258 - 40372538
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  40372258 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 40372356  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  40372357 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacggac 40372456  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    |||||||||| || |||  || ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  40372457 gcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 40372538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 290 - 584
Target Start/End: Original strand, 7764338 - 7764636
Alignment:
Q  290 ttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggt-ataaaacatgggaaacacctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |  |||||| | |||||||||    
T  7764338 ttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattagatt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacacctt 7764435  T
Q  388 gtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttg 479  Q
    |   || || |||||||||||||||||       ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||    
T  7764436 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttg 7764532  T
Q  480 taac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 578  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7764533 taactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaa 7764630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7167880 - 7167599
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  7167880 ttgatattggcttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacaatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 7167782  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  7167781 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcagac 7167682  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttgg 280  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||    ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  7167681 gcaaatcgtgacacgatt-tgaaaatcatggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttgg 7167599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7782603 - 7782375
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacaagattaggaaaat 223  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||  || ||||    
T  7782603 aaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtgccttgggacgaacgtaccaatcgtgacacgatctgg-aaat 7782505  T
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-g 322  Q
    ||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7782504 cgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggacagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggag 7782406  T
Q  323 caactctagggtttagggttctttgattagag 354  Q
     ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7782405 taactctaggttttagag-tctttgattagag 7782375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Original strand, 9581302 - 9581454
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9581302 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 9581398  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581399 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34491310 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 541 - 681
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067576
Alignment:
Q  541 cctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgc 636  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgc 10067533  T
Q  637 tttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10067534 tt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 10067576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 279
Target Start/End: Original strand, 27352097 - 27352363
Alignment:
Q  15 aaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgt 111  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| |||||| |  ||||||    | || ||||    
T  27352097 aaatttgtggtctcgaagaacagaaaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagcttgt-ttgcagaacaccaaatcgt 27352195  T
Q  112 ggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaa 211  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  27352196 ggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaattatcactgataaggactggtcataccttgggacggacgcaaatcgtgacac 27352295  T
Q  212 gattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    |||| || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||  ||  |||||||||||||||||||    
T  27352296 gatttgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctaatatatattgtgttcttgtgcagatttg 27352363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 40734337 - 40734669
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggc-aactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  40734337 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagacagaaacttggaaaatcaaaggagataactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 40734433  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40734434 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt 40734533  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  40734534 -gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 40734630  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40734631 caaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 584
Target Start/End: Original strand, 40735254 - 40735554
Alignment:
Q  291 tgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggt-ataaaacatgggaaacaccttg 388  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||    
T  40735254 tgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttg 40735351  T
Q  389 taaa-gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttctt 478  Q
     ||| | || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||    
T  40735352 gaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttatt 40735450  T
Q  479 gtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtga 577  Q
    ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  40735451 gtaaccagtttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtca 40735547  T
Q  578 acaatct 584  Q
     ||||||    
T  40735548 gcaatct 40735554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199462
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199540 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 49199462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570120
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4570050 catt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 8738634 - 8738780
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8738634 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtg 8738733  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  8738734 acatgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagtctagta 8738780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 9090872 - 9091018
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  9090872 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtg 9090971  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  9090972 acatgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagtctagta 9091018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 29196457  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29196456 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 304 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 39153645 - 39153358
Alignment:
Q  304 acttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttg--taaagagagaa 399  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||  | ||  || ||    
T  39153645 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaat-gaaaa 39153549  T
Q  400 tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttg 489  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||    
T  39153548 tcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttg 39153450  T
Q  490 tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  39153449 tatcccttta-taagaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401794
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43401794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 28501154 - 28501410
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||  |||||    
T  28501154 ttgatattggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttgca 28501252  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||   | || |||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||    
T  28501253 ggacaccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-aaccttgggtcagac 28501351  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  28501352 gcaaatcatgacacgatcttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 28501410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5236787 - 5236454
Alignment:
Q  257 ttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  | | ||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5236787 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagtggggcttgaagagagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 5236689  T
Q  356 atctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggt 445  Q
     ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5236688 -tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 5236590  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||  |||||| |||     
T  5236589 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgataatggattcgagagatcaatctttcc- 5236494  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5236493 ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatct 5236454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 2671111 - 2671283
Alignment:
Q  43 gtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatc 141  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||||  | |||| ||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||     
T  2671111 gtgacacgattttggcatcgtgacatgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgcaggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatt 2671209  T
Q  142 gtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagatt 215  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  2671210 tagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacacgatt 2671283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095600
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | || ||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6095669 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 28503321 - 28503577
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||  ||||     
T  28503321 ttgatattggcttcaaatttgtggcctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttgct 28503419  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||| | |||    
T  28503420 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-aaccttgggtcagac 28503518  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  28503519 gcaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 28503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaact 44331642  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44331643 tatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22172664 - 22172899
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||| ||  |||||    
T  22172664 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagccagt-ttgca 22172762  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||  | |      
T  22172763 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaaggatctctgataaggactggtc-aaccttggttccgtt 22172861  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  22172862 gcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgatt 22172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 416 - 587
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236299
Alignment:
Q  416 tgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  30236227 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 284 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 32744730 - 32744433
Alignment:
Q  284 gagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaa 381  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | |||    
T  32744730 gagagcttcaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaa 32744633  T
Q  382 caccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttg 479  Q
    ||| |||   || || ||||||||||| | ||| ||||||||  |||| || ||||||||||  ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||    
T  32744632 cacattggtgagtgaaaatcattgagtattttg-tgagattgaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 32744536  T
Q  480 taac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 578  Q
    |||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32744535 taactcatttgtatcacttt-gtaagaactc-tttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaa 32744439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819523
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||||  ||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  41819593 tcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 51398653 - 51398985
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| || || |||||||||||||     
T  51398653 taagtgttctt-tgtagattttgaaggagaggttgaagagatagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagt-ctttgattagagtt 51398750  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    | ||||||||    ||| || | |||||||||| |  || || ||||||||||||||||| |       |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  51398751 t-tcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt 51398849  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    |||||||| |    
T  51398850 -gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatttatctctcccc 51398946  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  51398947 cagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 51398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403737
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | |||| |||||  ||||| ||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggctt-gttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaac 43403816  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403815 tcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43403737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813234
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaact 29813160  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||   ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29813161 cattt-atagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatgtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32143884 - 32143641
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||| | |   ||||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  32143884 atcgtgacacgattttgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgtt 32143786  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    |||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  | |||  ||||||| |||    
T  32143785 aagttttcaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcgtgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagttgaagacttgta 32143687  T
Q  256 cttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
     |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  32143686 tttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag-ttgaagagagaga 32143641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593871
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54593802 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 22835070  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgg 573  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  22835069 t-gatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 760850 - 761018
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  760850 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 760947  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  760948 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatct 761018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44700548 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1306591 - 1306366
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||| | || | |||||| || ||||||||||| ||     
T  1306591 cttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgtcgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 1306493  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  1306492 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 1306393  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacga 233  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||    
T  1306392 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacga 1306366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 584
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314616
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||     
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaactc- 31314543  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  31314544 tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 31314616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 33386150 - 33386450
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  33386150 cttcaaatttgtggtccgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 33386248  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||||| |   ||||||||||||||  | |||||| || ||||||| | |  |||||||  |||||||  |||||| || ||| |  |||||    
T  33386249 tcgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataagg-ttggtcgtatcttgggtcgtacgtatcaatcg 33386347  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||| || |||| ||| |||||||  | |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||    
T  33386348 tgacacgatttgg-aaattgtggcacgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattttggagtagagcttgaagagagagaaac 33386446  T
Q  306 ttgg 309  Q
    ||||    
T  33386447 ttgg 33386450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 29682362 - 29682530
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29682362 gtgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 29682459  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29682460 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 560
Target Start/End: Original strand, 29810868 - 29811016
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29810868 ttggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29810965  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  29810966 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860642
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  46860572 catt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaaca 46860642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 587
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913467
Alignment:
Q  470 taatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccga 568  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt-ggaccga 40913448  T
Q  569 actgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  40913449 actgggtcaacaatctctt 40913467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgg 573  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||    
T  53921573 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 584
Target Start/End: Original strand, 16499115 - 16499200
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16499115 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 571
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173515
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggag 46173473  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaact 571  Q
    ||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  46173474 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27453568 - 27453269
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||| ||||||| ||     
T  27453568 cttcaaatttgtggtctgaaagagcagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgtagggtgccaaa 27453470  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| || ||||  |   ||||||||||||||  | |||||| || ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  27453469 tcgtgacatgattgtgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggt-tggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcg 27453371  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||    
T  27453370 tgacacgatttggaaa-tcgtggcacgattttatcagttgaagactagtttttaagtgttcttgtgcagtttttga-agagagcttgaagagagagaaac 27453273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301972
Alignment:
Q  472 atttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaac 570  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||   |||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaac 55301982  T
Q  571 tgggtgaaca 580  Q
    | ||||||||    
T  55301981 ttggtgaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18657027 - 18656844
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |  ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||   | | |||||    
T  18657027 ttgatattggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgaagcaagtttgca 18656928  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||  || || ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18656927 ggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 18656844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391906
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23391979 c-tttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 23391906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 26928093 - 26928273
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  26928093 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26928191  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttg 189  Q
    ||||| ||| || | |   ||||||||||||||  | |||||| |||||||||| | |  ||||||||| |||||| |||||    
T  26928192 tcgtgacacaatcttgtggaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttg 26928273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 573
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactc- 32891202  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgg 573  Q
     |||||||||||||| ||||   ||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||||    
T  32891203 gttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Original strand, 29812902 - 29813008
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||| |||     
T  29812902 taagtgttctt-tgtagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattaaagt- 29812998  T
Q  357 tctcttgggt 366  Q
    ||||||||||    
T  29812999 tctcttgggt 29813008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 484  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 6718290 - 6718345
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  6718290 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 6718345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Original strand, 30709464 - 30709572
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  30709464 aatcgtgtcacgatttggaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaca 30709563  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  30709564 gaaacttgg 30709572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 45282587 - 45282642
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  45282587 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattt 45282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8512722 - 8512643
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8512722 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 8512643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8517602 - 8517523
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8517602 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 8517523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 27974676 - 27974727
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27974676 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 27974727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 47923628 - 47923679
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47923628 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 47923679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1306360 - 1306306
Alignment:
Q  220 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1306360 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcag 1306306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 582
Target Start/End: Original strand, 47304340 - 47304420
Alignment:
Q  500 gtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47304340 gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaat 47304420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| | || | ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||    
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttc-tttgtaataactca 51352180  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctc 541  Q
     |||| ||||||||  ||||  |||||||||    
T  51352179 -ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 2672431 - 2672603
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |  |||||||  |||||||||  |||||||||| ||    ||||||  |||| | | |||| ||  ||||| |    
T  2672431 cttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgtaatcgtgacacgatcggagatgccgggagccaagtttgctggaagcaaaat 2672530  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2672531 cgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 2672603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Original strand, 1735971 - 1736079
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1735971 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttatgcagattttgaaggagagtttggagagaga 1736070  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  1736071 gaaacttgg 1736079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7782699 - 7782605
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||| || |||||||||||    
T  7782699 cttcaaatttgtggtctagaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgcggtgagct-ggtttgcagggtgc 7782605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24968599 - 24968428
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaa 201  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||   ||| ||||| |  ||||    
T  24968599 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc-aacctggggaccgttgcaa 24968501  T
Q  202 atcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt-aagtgttcttgtgc 272  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||| |||||||    ||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  24968500 atcgtgccacgatctagggaaatcgtggcacgatttcttcagggcaagactagtatttaaagtgttcttgtgc 24968428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 309
Target Start/End: Original strand, 26928287 - 26928374
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||||||||||||||  | |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  26928287 aatcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagag-ttgaagagagaaaaacttgg 26928374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 309
Target Start/End: Original strand, 27986180 - 27986231
Alignment:
Q  257 ttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27986180 ttaagtgttcttgtgcagatttgga-agagagttggaagagagagaaacttgg 27986231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48438634 - 48438526
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||  |||||  |||||||  ||  |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||    
T  48438634 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacagccgaagactgctatataagtgttcttgtgcaaattttgaaggagagcttgaatagaga 48438535  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  48438534 gaaacttgg 48438526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055813
Alignment:
Q  417 gagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct--tttgtatcccttttgtaagaa-ctcatt 512  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| | | |||||||| || | ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctcttt-gtaagaaactcatt 4055830  T
Q  513 tgatagtggattgaagag 530  Q
     |||||||||||||||||    
T  4055829 -gatagtggattgaagag 4055813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactg 572  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32475966 - 32475887
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32475966 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 32475887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32480824 - 32480745
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32480824 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 32480745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 40592506 - 40592557
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40592506 taagtgttcttgtgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgg 40592557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018987
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccag 547  Q
    |||||  ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  36018950 tcatt--atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37726286 - 37726155
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||  ||     
T  37726286 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgatatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 37726188  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgat 140  Q
    ||||| |||||||| |   ||||||||||||||    
T  37726187 tcgtgacacgattttgtggaatcgtgacacgat 37726155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 302
Target Start/End: Original strand, 24694890 - 24694934
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  24694890 taagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagaga 24694934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253363
Alignment:
Q  424 ggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 483  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaac 28253363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 12647965 - 12647284
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647965 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 12647866  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647865 gggtgcaaat-cgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccataaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 12647767  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaaga 296  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |    
T  12647766 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttgga--a 12647669  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  12647668 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 12647571  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12647570 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct 12647471  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12647470 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttt 12647372  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647371 attgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 12647284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Original strand, 6266283 - 6266960
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaag--gaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  6266283 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacatggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 6266381  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||  || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |    
T  6266382 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttactcgttaagtttccatgataaggaatggtcgtttcttgggacgaacgcacca 6266481  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
    ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  6266482 atcgtgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagg-agagtgggaagagagag 6266579  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6266580 agacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaat 6266679  T
Q  401 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266680 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatccctttt 6266779  T
Q  500 gtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttg 598  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6266780 gtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttg 6266877  T
Q  599 ttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6266878 ttttcttcttccctctccgtttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgtttt 6266960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 392 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655927
Alignment:
Q  392 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgta 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 13656121  T
Q  492 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13656120 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 13656021  T
Q  592 gctt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656020 gtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 13655927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Original strand, 32289161 - 32289841
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  32289161 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 32289259  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    || || |||||| | |   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||    
T  32289260 tcttgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgctccaatcg 32289359  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| ||   || ||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| ||    
T  32289360 tgacacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagg-gagatggaagagagagaaac 32289457  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||   || || ||||||    
T  32289458 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagag-tctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 32289556  T
Q  404 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgt 501  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  32289557 tgagtgtcttggtgagatt-ggaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgt 32289654  T
Q  502 aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 601  Q
    ||||||||| ||||||||  |||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  32289655 aagaactca-ttgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttt 32289753  T
Q  602 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  32289754 tcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 32289841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 4484910 - 4484223
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||  ||||||||||| ||     
T  4484910 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaa 4484812  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||| |     ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||    
T  4484811 tcgtgacacgatcttaaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcg 4484712  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||    
T  4484711 tgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaag-agagttggaagagagagaaac 4484614  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || |  ||||||    
T  4484613 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcat 4484515  T
Q  404 tgagtgtcttg------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 493  Q
    |||||||||||      |||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4484514 tgagtgtcttgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 4484416  T
Q  494 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  4484415 tcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaa--tctttggtgt 4484319  T
Q  594 ttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttg-ctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4484318 ctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcac-tttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 4484223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Original strand, 30832934 - 30833621
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | || ||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  30832934 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 30833032  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  30833033 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 30833132  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||| ||| ||    
T  30833133 tgacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggt-gagctggaagagaaagaaac 30833230  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    |||||| | |||||| |||   || |  ||||||    
T  30833231 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcat 30833329  T
Q  404 tgagtgtcttg------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 493  Q
    |||||||||||      |||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  30833330 tgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatc 30833428  T
Q  494 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  30833429 tcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 30833525  T
Q  594 ttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  30833526 ctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 30833621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 258 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 4503461 - 4503028
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  4503461 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt- 4503365  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||||||||| |       ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4503364 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt 4503265  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4503264 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 4503169  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtg 644  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||| ||||||||| ||| || ||||||      
T  4503168 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttg-tgttttgtgct 4503074  T
Q  645 tcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4503073 tttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgat 4503028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 45099594 - 45099926
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  45099594 taagtgttctt-tgtagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 45099690  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45099691 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 45099790  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45099791 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 45099886  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099887 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45099926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 36205992 - 36205661
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  36205992 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 36205896  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36205895 tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt- 36205797  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| || || |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  36205796 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gacagcggattggagagttcaatctatcctcc 36205700  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205699 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36205661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 258 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 36988404 - 36987970
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  36988404 taagtgttctt-tgcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 36988308  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  36988307 tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt- 36988209  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    ||||   |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  36988208 gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcc 36988111  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgt 645  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||| |||||| || |||| ||||||||  |    
T  36988110 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggctttgtgctt 36988015  T
Q  646 cacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
      ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  36988014 ttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 36987970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5723572 - 5723252
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  5723572 tgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttg 5723475  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac 460  Q
      |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  5723474 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaac 5723376  T
Q  461 ttgtcaa-gctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaag 558  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| |||    
T  5723375 ttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaag 5723278  T
Q  559 tttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5723277 tttggaccgaactgggtgaacaatct 5723252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 9295864 - 9296137
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  9295864 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 9295962  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  9295963 ggatgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtcggac 9296062  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt-aagtgttcttgtgc 272  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9296063 gcaaatcgtgacacga-tctgaaaatcgtgacacgattgcttcagaggaagactagtatttaaagtgttcttgtgc 9296137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 2334746 - 2334414
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  2334746 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggta-tttgattagagt- 2334650  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||| ||||||     
T  2334649 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt- 2334551  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  2334550 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcc 2334453  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2334452 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct 2334414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 6595335 - 6595002
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  6595335 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 6595239  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||| |   ||| || | |||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||       |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  6595238 tctcttgggctgggaaaaattgtaaacactttggagagtgagaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt 6595139  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  6595138 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcctc 6595042  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6595041 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 6595002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3492364 - 3492094
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  |||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  3492364 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaattgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 3492266  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  3492265 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattctgaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 3492166  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||| || | || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3492165 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 3492094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25410253 - 25409983
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||| | || ||||||||||| ||     
T  25410253 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagat-ggtttgcagggtgccaaa 25410155  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  25410154 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaatggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 25410055  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||| || | || |||||||||||| |||  | |||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||    
T  25410054 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcagaggaaggatgatatttaagtgttcttgtgcagattt 25409983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14292123 - 14291844
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| | |||| ||||||||  |||||    
T  14292123 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatctcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 14292025  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||  | ||    
T  14292024 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtaccactgataaggactggtcataccttgggttgtac 14291925  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||    ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  14291924 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagattt 14291844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 584
Target Start/End: Original strand, 38312042 - 38312411
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    |||||||||||||||   ||||  |||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38312042 aatcgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaatttgggaaatcaaagg 38312140  T
Q  321 -ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg--- 414  Q
     || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    |||||| | | |||||||||   || || |||||||||||||||||       
T  38312141 aggtaactttagggttgagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 38312238  T
Q  415 ----gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
        ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |    
T  38312239 attggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagatc 38312336  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38312337 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727096
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45727027 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 11098389 - 11098669
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  11098389 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatagtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 11098487  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||  | ||    
T  11098488 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcaaaccttgggttgtac 11098587  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||    |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||    
T  11098588 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagcatatattgtgttcttgtgcagatttg 11098669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34139936 - 34139767
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  34139936 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcat 34139838  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34139837 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868040
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29867966  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  29867967 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 29868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 723892 - 723741
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  723892 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 723796  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  723795 agatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446885
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35446954 catt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14633991 - 14633822
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  14633991 gtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactca- 14633894  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  14633893 tagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 14633822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40739444 - 40739178
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgg-atgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  40739444 cttcaaatttgtggtctggaagaacagacaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgttatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 40739346  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||| | |   ||| ||||||| ||  | |||||| |||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  40739345 tcgtgacacgatcttgtggaattgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagttttcaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtatcaatcg 40739246  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40739245 tgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattttatcagttgaagacttgtatttaagtgttcttgtgcag 40739178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 17057698 - 17057366
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||| ||||||| | ||| |||||||||||||     
T  17057698 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt- 17057602  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    ||| || | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  17057601 tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt 17057502  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | |  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  17057501 -gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 17057405  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17057404 cagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17057366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 17085681 - 17085349
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||| ||||||| | ||| |||||||||||||     
T  17085681 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagtttgaagagagagaaaatttggaaatcaacggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt- 17085585  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    ||| || | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  17085584 tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt 17085485  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | |  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  17085484 -gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 17085388  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17085387 cagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17085349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 580
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648340
Alignment:
Q  417 gagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 514  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||| |    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcatt-g 33648274  T
Q  515 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  33648275 atagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 546
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc-tttgtatctc-tttgtagaaactca 13121866  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13121867 -ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtag-aaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36773660 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 560
Target Start/End: Original strand, 42362236 - 42362500
Alignment:
Q  304 acttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  42362236 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 42362333  T
Q  401 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgt 490  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  42362334 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 42362432  T
Q  491 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  42362433 atcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631735
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 578  Q
    |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1631802 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Original strand, 39284724 - 39284830
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  39284724 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 39284820  T
Q  357 tctcttgggt 366  Q
    ||||||||||    
T  39284821 tctcttgggt 39284830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 584
Target Start/End: Original strand, 11067360 - 11067476
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  11067360 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattt-ataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgga 11067456  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  11067457 ccgaactcggtcaacaatct 11067476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151588
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 11151662  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11151661 c-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490149
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttgga 17490165  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||| ||||    
T  17490164 ccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398228
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||| || ||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  24398155 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36318006
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36318079 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 39811479 - 39811735
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || | ||| | | |||||    
T  39811479 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtgaccgtaagc-aagtttgca 39811577  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  39811578 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggacttgtc-tgccttggggccgtt 39811676  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  39811677 gcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 39811735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 32247350 - 32247229
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||| |    
T  32247350 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgctg 32247251  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatt 120  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  32247250 gatgcaaaatcgtggcacgatt 32247229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgtaagaactc 7815343  T
Q  510 atttgatagtggattgaagag 530  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  7815342 attt-atagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353351
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||| | ||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtat-ctttttgtaagtactc 26353282  T
Q  510 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    | |||||||||||||| ||||  || |||||||   |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26353283 a-ttgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggtaaaca 26353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 11690504 - 11690672
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||      
T  11690504 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaaatc-g 11690600  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| |  | |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  11690601 ttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 11690672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 33162598 - 33162447
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  33162598 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tctgtaagaactca-ttgatagtggattagag 33162502  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||  |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33162501 agatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 33162447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Original strand, 33528302 - 33528410
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||  ||||   |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  33528302 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacaactgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagaga 33528401  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  33528402 gaaacttgg 33528410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 584
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 44310473 - 44310548
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc 74  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  44310473 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttc 44310548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451284
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga 7451269  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
     |||||||||||||||    
T  7451270 -cgaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2837173 - 2837112
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    ||||||||||| || | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2837173 taagtgttctt-tgtaaattttgaaggagagtttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 2837112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288117
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| | |||| |||| | |||||||||| |||||| || |||||||  | ||||||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttc-tttgtaagagct 42288181  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggt 575  Q
    || |||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  42288180 ca-ttgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 308
Target Start/End: Original strand, 36757458 - 36757547
Alignment:
Q  219 aaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttg 308  Q
    |||||||||||||||||   ||||  |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||    
T  36757458 aaaatcgtgacacgattttgacagctgaagactgttatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttg 36757547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 512 - 584
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctccac-agagtaggtcaagtt-ggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19344904 - 19344825
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19344904 gcaaaatcatggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 19344825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19349762 - 19349683
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19349762 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 19349683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 23078206 - 23078257
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  23078206 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttgg 23078257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34389295 - 34389162
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  34389295 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggaaaa-cgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 34389197  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| || |||||| |||| | |||||| ||||||    
T  34389196 attttgaaggagagcttgatgtgagagaaacttgg 34389162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36318338 - 36318242
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  36318338 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggtaaaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaatg-tctttgattagagt 36318242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 569
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  470 taatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccga 568  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||| | || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcact-gacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccga 28672087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 500; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18392778 - 18392094
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||||    
T  18392778 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcag 18392679  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392678 ggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 18392579  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga----gagtttgaa 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||| |||    
T  18392578 caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagttggaa 18392479  T
Q  295 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||    
T  18392478 gagagaga--cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--ga 18392383  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18392382 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcc 18392283  T
Q  495 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18392282 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgt 18392184  T
Q  594 tt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392183 ttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 18392094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6592919 - 6592238
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6592919 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 6592820  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592819 gggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 6592721  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||    
T  6592720 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga-ag 6592622  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6592621 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 6592524  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6592523 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccctt 6592424  T
Q  498 ttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt- 595  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  6592423 ttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttta 6592325  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592324 ttgttttcttcttccctccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 6592238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6595135 - 6594456
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6595135 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaaaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 6595036  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595035 gggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 6594937  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  ||    
T  6594936 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-gttgga--ag 6594840  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6594839 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 6594742  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6594741 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccctt 6594642  T
Q  498 ttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt- 595  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  6594641 ttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttta 6594543  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594542 ttgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 6594456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18389246 - 18388658
Alignment:
Q  95 gcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389246 gcagggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 18389147  T
Q  195 gacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga----gagtt 290  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||    
T  18389146 gacgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagagtaaaggagtt 18389047  T
Q  291 tgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgta 390  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18389046 ggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta 18388949  T
Q  391 aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 490  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18388948 --gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 18388851  T
Q  491 atcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttg 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18388850 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt- 18388752  T
Q  590 gtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388751 gtgtttattgttttcttcttccctctctttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 18388658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 32060886 - 32060220
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32060886 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 32060787  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060786 gggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 32060688  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga-gagtttgaaga 296  Q
    |||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |    
T  32060687 gcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggaagaggttgga-a 32060609  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060608 gagagagacttgggaaatcaaagggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 32060509  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc- 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  32060508 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccc 32060409  T
Q  496 -ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  32060408 tttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctcttt-gtgt 32060310  T
Q  594 tt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    || ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060309 ttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 32060220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 675
Target Start/End: Original strand, 20343502 - 20344158
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||     
T  20343502 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcc 20343600  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  20343601 ggatgcaaaatcgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 20343700  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagttt--gaag 295  Q
    ||| |||||                    |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  20343701 gcagatcgt--------------------gacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttttggaag 20343779  T
Q  296 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20343780 agagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 20343879  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343880 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 20343979  T
Q  495 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343980 cttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 20344078  T
Q  595 tttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtg 675  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344079 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtg 20344158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 633
Target Start/End: Original strand, 24789435 - 24790062
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||||||||    
T  24789435 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagt-ttgcagggtgc 24789533  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 203  Q
     || |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||    
T  24789534 caaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaat 24789633  T
Q  204 cgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
    | ||||| |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||| | |||||||    
T  24789634 cttgacacgatttggaaa-tcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaagg-agaggttgga-agagaga 24789730  T
Q  303 gacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24789731 gacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatc 24789830  T
Q  402 attgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttg 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24789831 attgagtgtcttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttg 24789930  T
Q  501 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgt 599  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  24789931 taaaaactc-tttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtt 24790028  T
Q  600 tttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgt 633  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24790029 tttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt 24790062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1562585 - 1562103
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |  | |    |  | ||   |    
T  1562585 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcgtgtttctttttttttgttttttg 1562486  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||   || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1562485 ggttttaaatcgtgtcacgattttggtaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgtgacggacg 1562386  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaagag 297  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1562385 caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtatttatgtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttggaagag 1562286  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1562285 agagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 1562188  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562187 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Original strand, 39730946 - 39731644
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  39730946 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 39731044  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||| | |   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||    
T  39731045 tcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgtaccaatcg 39731144  T
Q  206 tgacaagattaggaaa------------------atcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggaga 287  Q
    ||||| |||  |||||                  ||||||||||||||  | ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | |||    
T  39731145 tgacacgatctggaaatcgtgacacgatctgaaaatcgtgacacgattttatcaatggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-aga 39731243  T
Q  288 gtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacacc 385  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    |||||| | |||||||    
T  39731244 gttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacacc 39731342  T
Q  386 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac- 483  Q
    |||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  39731343 ttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaact 39731441  T
Q  484 cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 583  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39731442 cttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa-- 39731538  T
Q  584 tctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  39731539 tctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttat 39731637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 43504708 - 43504102
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  43504708 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 43504610  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    ||||| ||||||   || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||           
T  43504609 tcgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacagatgcacc----- 43504515  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagactt 307  Q
                 |||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||    
T  43504514 -------------aatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcctgtgcagatttgaaga-agggttggaagagagagaaactt 43504429  T
Q  308 gggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattg 405  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  43504428 gggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcg 43504330  T
Q  406 agtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttgta 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  43504329 agtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgta 43504231  T
Q  503 agaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 602  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43504230 agaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtttt 43504133  T
Q  603 cttcttccctctccttgtatcttgtgattgt 633  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43504132 cctcttccctctccttttatcttgtgcttgt 43504102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 25767527 - 25766953
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaaggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattc 109  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || ||    
T  25767527 cttcaaatttgtggtctggaa--ag--aaatcgtgacacaaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaatc 25767433  T
Q  110 gtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtg 207  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||   ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||||    
T  25767432 gtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggacaggtcgtgccttgtgacgtacgtaccaatcgtg 25767333  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagactt 307  Q
    ||| || | || ||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||    
T  25767332 acacgacttgg-aaatcgtgacacgattttatcaatggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag-ctgaagagagagaaactt 25767235  T
Q  308 gggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattga 406  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||    
T  25767234 gagaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctttgg---gaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattga 25767139  T
Q  407 gtgtcttg----gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttt 498  Q
    ||||||||     ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25767138 gtgtcttgttcattgagattggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttt 25767040  T
Q  499 tgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25767039 tg-aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctctt 25766953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 489 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560563
Alignment:
Q  489 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctc-tt 1560659  T
Q  589 ggtgcttttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560658 ggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 1560563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 258 - 587
Target Start/End: Original strand, 35853754 - 35854089
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||     
T  35853754 taagtgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttaggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt- 35853850  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35853851 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt- 35853949  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35853950 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcc 35854047  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35854048 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 35854089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 221 - 587
Target Start/End: Original strand, 48408605 - 48408979
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48408605 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagcg-gaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 48408702  T
Q  321 g-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg---- 414  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||        
T  48408703 gagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 48408801  T
Q  415 ---gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||    
T  48408802 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataac 48408900  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48408901 tcatt-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttctt 48408979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 29990894 - 29991225
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagggg-caactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  29990894 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagtttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 29990990  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttg 448  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  29990991 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-g 29991089  T
Q  449 ttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  29991090 ttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttc-taataactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcca 29991187  T
Q  547 gagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991188 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29991225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 23554879 - 23555212
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||| | ||| |||||||||||||     
T  23554879 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaaggt-ctttgattagagt- 23554975  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||| ||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23554976 tctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt 23555075  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  23555076 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctc 23555172  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555173 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 23555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 259 - 584
Target Start/End: Original strand, 4178615 - 4178945
Alignment:
Q  259 aagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtat 357  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4178615 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-t 4178711  T
Q  358 ctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttg 448  Q
    |||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4178712 ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-g 4178810  T
Q  449 ttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||| | |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4178811 ttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattgaacagttcaatctctcctcca 4178907  T
Q  547 gagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4178908 gagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct 4178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21646630 - 21646360
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||| || | ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  21646630 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacaaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 21646532  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||  |||||||    
T  21646531 tcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataagaactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcg 21646432  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    || || |||  || ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21646431 tgccacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 21646360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2058602 - 2058323
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  | |||| ||||||||  ||||||    
T  2058602 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttgaggtgccgtgagctagt-ttgcag 2058504  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||    
T  2058503 gacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacg 2058404  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    |||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  2058403 caaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 2058323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310786 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Original strand, 1532947 - 1533194
Alignment:
Q  40 atcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacg 138  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| | | |||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  1532947 atcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgaggtgccatgagctagt-ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacg 1533045  T
Q  139 atcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattgga 238  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  || |||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||      
T  1533046 attgtgaaacttactcgttaagtatccttgataaggactggttataccttgggacatacacaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgct 1533144  T
Q  239 acagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttggagggagag 288  Q
     ||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1533145 tcagaggaaggctagtatatatagtgttcttgtacagattt-gagggagag 1533194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Original strand, 19502028 - 19502350
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  19502028 tgcagattttgaaggagagcttaaagagagacaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttg 19502125  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg--tagaaattagggtttgttcatagtga 458  Q
      |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||| |  ||||||||| |||| |||  | ||||    
T  19502126 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtga 19502224  T
Q  459 acttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||    
T  19502225 gcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtca 19502322  T
Q  557 agtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19502323 agtttggaacgaagtgggtgaacaatct 19502350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 30025095 - 30024729
Alignment:
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-gg 322  Q
    ||||||||||||   ||||  |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30025095 cgtgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttctt-tgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagg 30024997  T
Q  323 caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaa-catgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg------ 414  Q
     |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||| | | | ||||||||||    || || |||||||||||||||||          
T  30024996 taactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 30024899  T
Q  415 -gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||     
T  30024898 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc- 30024802  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  30024801 tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 30024729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21640421 - 21640205
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  21640421 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 21640323  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  21640322 ggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtcatgccttggaacggac 21640223  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagatt 215  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  21640222 gcaaatcgtgacacgatt 21640205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 290 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14070131 - 14069830
Alignment:
Q  290 ttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataa-aacatgggaaacacctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||     ||||| | |||||||||    
T  14070131 ttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggtaacattgtaaacacctt 14070034  T
Q  388 gtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttct 477  Q
    |    || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14070033 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttct 14069935  T
Q  478 tgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  14069934 tgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtc 14069838  T
Q  577 aacaatct 584  Q
    ||||||||    
T  14069837 aacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 290 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14380159 - 14379858
Alignment:
Q  290 ttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataa-aacatgggaaacacctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||     ||||| | |||||||||    
T  14380159 ttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggtaacattgtaaacacctt 14380062  T
Q  388 gtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttct 477  Q
    |    || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14380061 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttct 14379963  T
Q  478 tgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  14379962 tgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtc 14379866  T
Q  577 aacaatct 584  Q
    ||||||||    
T  14379865 aacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41317504 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 392 - 584
Target Start/End: Original strand, 25615836 - 25616025
Alignment:
Q  392 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-ttt 488  Q
    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  25615836 agagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccattt 25615931  T
Q  489 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25615932 gtatca-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct 25616025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270140
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
     ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22270071 gatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 22270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18409386 - 18409116
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  18409386 cttcaaatttgtgttctggaagaacagagaaatcgtaacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtggtgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 18409288  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    || || |||||| | |  |||||||||||||||  | |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  18409287 tcatgacacgatcttgagaaatcgtgacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 18409188  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18409187 tgacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttctcgtgcagattt 18409116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 20357030 - 20357238
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  20357030 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 20357128  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || ||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | |||    
T  20357129 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcaaaccttgggtcagac 20357228  T
Q  198 gcaaatcgtg 207  Q
    ||||||||||    
T  20357229 gcaaatcgtg 20357238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 560
Target Start/End: Original strand, 48491416 - 48491727
Alignment:
Q  257 ttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48491416 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgataaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 48491514  T
Q  356 atctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggt 445  Q
     ||||||||||    |||||| | |||||| |||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48491515 -tctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 48491613  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  48491614 t-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gaaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccc 48491710  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||||  ||||||||||    
T  48491711 ccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347988
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27347915 catt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27347988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18414262 - 18413992
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||| | | |||| |||||| || |||||||| || ||     
T  18414262 cttcaaatttatggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtggcacgattttgtggtgccgtgagct-ggtttgcagggcgccaaa 18414164  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || ||||||| |||||||  | |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | |||||    
T  18414163 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtaacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcg 18414064  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||| || | || |||||||||||| |||  | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18414063 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacaattttatcattggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 18413992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359316
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  8359387 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 21811751 - 21811923
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |  |||||||  |||||||||  |||||||||| || |  |||||| ||||| | | |||||||||||||| |    
T  21811751 cttcaaatttgtggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgccatcgtgacacgatctgagatgccgtgagcaatgtttgcagggtgcaaaat 21811850  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21811851 cgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctagttaagtatctctgataaggactggtc 21811923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358055
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 32358071  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||||||||    
T  32358070 ccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 41649175 - 41649008
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |    
T  41649175 gtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaactca-t 41649079  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41649078 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599335
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48599404 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 584
Target Start/End: Original strand, 48489268 - 48489602
Alignment:
Q  257 ttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  48489268 ttaagtgttcttgtgcagattttgaagaagagattgaagatagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggt-ctttgattagagt 48489366  T
Q  356 atctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggt 445  Q
     ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || ||||||| | |||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48489367 -tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 48489465  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | |  |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  48489466 t-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gcaataactcattc-atagtggattggagagatcaatctctccc 48489562  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48489563 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 48489602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 18126483 - 18126815
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  18126483 taagtgttctt-tgcagattttgaagaagagcttgaatagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 18126579  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtt 446  Q
    |||| |||||    |||||| | ||||| ||||    || || ||||||||||||| |||       |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18126580 tctcatgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt 18126679  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||    |||||||||| |    
T  18126680 -gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggaggaatcaatctctcccc 18126776  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  18126777 cagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct 18126815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 578
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608902
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 578  Q
    |||| |||||||||||| |||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29608835 catt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4873719 - 4873463
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || | || |||  |||||    
T  4873719 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtaagatagt-ttgca 4873621  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | |      
T  4873620 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-ttccttgggtccgtt 4873522  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  4873521 gcaaatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 4873463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8153440 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12406855 - 12406599
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || ||||||||  |||||    
T  12406855 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagt-ttgca 12406757  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
     |  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  12406756 agacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgtt 12406658  T
Q  198 gcaaatcgtgacaaga-ttaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| || || || |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  12406657 gcaaatcgtgacacgatttggggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 12406599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 587
Target Start/End: Original strand, 2390302 - 2390456
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||    
T  2390302 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatat-atagtggattggag 2390398  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2390399 agatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctctt 2390456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259162
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3259093 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508707
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4508777  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| || ||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4508776 catt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaagtt-ggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 576
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    | || |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 38671506 - 38671219
Alignment:
Q  304 acttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  38671506 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaat 38671409  T
Q  401 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgt 490  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||    
T  38671408 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgt 38671310  T
Q  491 atcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38671309 atcacttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 38671219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253529
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  510 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    | |||||| ||||||  ||||  ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  4253597 a-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 24515089 - 24514934
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  24515089 taagtgttctt-tgcagattttgaaggggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 24514993  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 414  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  24514992 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 1113495 - 1113828
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||  ||||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  1113495 taagtgtttctgtgcagattttgaagaagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 1113592  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||| |   |||||| | ||||| ||| |   || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  1113593 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattaggg-t 1113691  T
Q  447 tgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
    ||||| | |||| |||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||| |    
T  1113692 tgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtagattggagagatcaatctctcccc 1113789  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  1113790 catattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct 1113828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 4586000 - 4586332
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||| | |||||||||||||     
T  4586000 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagttagaagagagaaaaacttgggaaatcaaaggatgtaactttagggttgaggct-ctttgattagagt- 4586096  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || |  |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4586097 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt 4586196  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  4586197 -gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 4586293  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |  | |||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  4586294 catattatgtcaa-cttggaccgaactgggtcgacaatct 4586332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 47676465 - 47676133
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggc-aactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  47676465 taagtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 47676369  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || ||||| |||||||||||       ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47676368 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt 47676269  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || ||||  |||||||||| |    
T  47676268 -gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-atgatagtggaatggagagatcaatctctcccc 47676172  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |  |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47676171 catattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 47676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 47674269 - 47673981
Alignment:
Q  261 gtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatct 359  Q
    |||||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  | |||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  47674269 gtgttctt-tgcagattttgaagaggagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcaaggttgaaggt-ctttgattagagt-tct 47674173  T
Q  360 cttgggtat-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgt 449  Q
    |||||||   ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  47674172 cttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gt 47674074  T
Q  450 tcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 542  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  47674073 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 47673981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 31733117 - 31732966
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  31733117 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatactggattggag 31733021  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||  |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31733020 agatcaatctctcccccaaattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 582
Target Start/End: Original strand, 43864114 - 43864413
Alignment:
Q  290 ttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacacctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    |||||| | |||||||||    
T  43864114 ttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 43864211  T
Q  388 gtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttct 477  Q
    |    || || |||||||||||||||||       |||||||||| |||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||     
T  43864212 gggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcc 43864310  T
Q  478 tgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  43864311 tgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaactaatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtc 43864407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 2361043  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggt 575  Q
    || |||||||||||||  |||   |||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 ca-ttgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 48408411 - 48408591
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  48408411 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 48408509  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttg 189  Q
    ||||| |||||| | |  |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||    
T  48408510 tcgtgacacgatcttgagaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggactggtcgtaccttg 48408591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23565232 - 23565069
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa---ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaa 506  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||||||||  |||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  23565232 ttggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaa 23565134  T
Q  507 ctcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgg 573  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||    
T  23565133 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4510661 - 4510549
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  4510661 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaactcatt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4510565  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4510564 ccgtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4512503 - 4512391
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  4512503 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaactcatt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttgga 4512407  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4512406 ccgtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 31109072 - 31109329
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgcca-tgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||   ||||  | ||||| | |||||    
T  31109072 ttgaaattggcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtggcacgatttcaagtgcctgtaagctaagtttgca 31109171  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || |||||||||   ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  31109172 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtataactgataaggacttgtc-tgccttggggccgtt 31109270  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  31109271 gcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 31109329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146405
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  | |||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttc-tgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 36146479  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |||||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  36146478 ca-ttgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 36146405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 24023831 - 24024003
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccat-gagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||   || ||  |||||||  |||||||  || ||     
T  24023831 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtggcacgatttcaagtggcagagagctagt-ttgcaggacgccaaa 24023929  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24023930 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtc 24024003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2479947 - 2479647
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaattt-cggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |  |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||| || ||||||||||  ||     
T  2479947 cttcaaatttgtggtttgtaagaacagagaaattgtgacacgattttggcatcgtgacacgattttctaatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 2479849  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||  | ||||||  | ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || |||||  ||||     
T  2479848 tcgtgtcacgattttgtgaaatcgttacacgattttcaaacttgttggttaagttttcaggataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacgcatcaatca 2479750  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    || || |||| |||||| |||| |||||||  | |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||    
T  2479749 tggcatgatttggaaaa-cgtggcacgattttatcagttgaagactagtatataagtgttcttgtgcagattttggagaagagcttgaagagagagaaac 2479651  T
Q  306 ttgg 309  Q
    ||||    
T  2479650 ttgg 2479647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Original strand, 26417316 - 26417489
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  26417316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 26417413  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    | || |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||   |||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  26417414 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttctt 26417489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 495980
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| | | || |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  496050 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct 495980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759195
Alignment:
Q  437 aattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtaca 534  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggagatatca 2759243  T
Q  535 atctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 583  Q
    |||||| | |||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2759242 atctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatc 2759195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105394
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||     
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaactca- 31105462  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31105461 ttgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31105394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 24265782 - 24265861
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24265782 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 24265861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49092051 - 49092000
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49092051 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 49092000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2761631 - 2761570
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2761631 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagataaacttgggaaatcaaagg 2761570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359946
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| | ||| |  |||||||| |||||    
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttgga 6359969  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
     |||||||||| |||||| ||||    
T  6359968 tcgaactgggtcaacaatttctt 6359946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22328556 - 22328395
Alignment:
Q  417 gagattgggaa-aaaggt-agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| ||| |    
T  22328556 gagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtca-t 22328458  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggt 575  Q
    | ||||||||||  ||||  |||||||||| | |||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  22328457 taatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 484
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344048
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 484  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 23344048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 483  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 79783 - 79699
Alignment:
Q  225 gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||||||||||   ||||  |||||||| ||  || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  79783 gtgacacgattctgacagttgaagactactatatatgtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 79699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12397490 - 12397415
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc 74  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||    
T  12397490 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgcgacacgattttggtatcgtgacacgatttc 12397415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21989326 - 21989219
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||||||   ||||  |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  21989326 aatcgtgtcatgatttggaaaat-gtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgaga 21989228  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  21989227 gaaacttgg 21989219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Original strand, 18396384 - 18396486
Alignment:
Q  477 ttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||     
T  18396384 ttgtaacattttgtatctctttataaagaattcatt-gatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggta 18396482  T
Q  577 aaca 580  Q
    ||||    
T  18396483 aaca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 24260926 - 24261005
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24260926 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 24261005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525499
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  |||||||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  24525584 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct 24525499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 512
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518896
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  509 catt 512  Q
    ||||    
T  31518893 catt 31518896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12397376 - 12397267
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaaga-ttaggaaaatc 224  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |  ||||||||||||| || || || |||||    
T  12397376 aaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgttgcaaatcgtgacacgatttggggaaatc 12397278  T
Q  225 gtgacacgatt 235  Q
    ||| |||||||    
T  12397277 gtggcacgatt 12397267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 652 - 682
Target Start/End: Original strand, 24790240 - 24790270
Alignment:
Q  652 tgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790240 tgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 24790270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 512 - 582
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814605
Alignment:
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 30814605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1360316 - 1360283
Alignment:
Q  416 tgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgt 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1360316 tgagattgggaaaaaggtagaaattaggttttgt 1360283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 47264254 - 47264190
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaattt 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  47264254 cttcaaatttgtggtttggaagaatagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattt 47264190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3183 - 2502
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3183 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 3084  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3083 gggtgcaaat-cgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtattcttgataaggactggtcgttccttgggacggac 2985  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaaga 296  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |    
T  2984 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggagagagttgga--a 2887  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  2886 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 2789  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2788 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct 2689  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  2688 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttttgtgttt 2590  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2589 attgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 497; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 44203220 - 44203902
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||||    
T  44203220 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcag 44203319  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203320 gggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 44203418  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg--gagagtttgaag 295  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||      
T  44203419 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggtgagagttgga-- 44203516  T
Q  296 agagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagag 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||    
T  44203517 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 44203614  T
Q  396 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44203615 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccc 44203714  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44203715 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtt 44203813  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203814 tattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 44203902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 9036005 - 9036686
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  9036005 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgca 9036103  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||    
T  9036104 gggtgcaaattcgtgtcactattttgttaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtgttac 9036203  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaa-ga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  9036204 gcagatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagag-gagtttgaaaga 9036301  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036302 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 9036401  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036402 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 9036501  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  9036502 tttgtaagaactc-tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatt 9036599  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036600 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 9036686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Original strand, 40281967 - 40282645
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  40281967 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaatagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttagtggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgc 40282065  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca-- 200  Q
     || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||      
T  40282066 caaatcgtgacacgattgtggtaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacc 40282165  T
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  40282166 aatcgtgacacgatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagaga 40282264  T
Q  301 gagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40282265 gaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaa 40282364  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282365 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 40282464  T
Q  499 tgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttg 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  40282465 tgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttg 40282562  T
Q  599 ttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282563 ttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 40282645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 21053542 - 21054226
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||  ||||||||  | |||    
T  21053542 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgcagtgagctagaat-gca 21053640  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
     ||||| || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21053641 aggtgccaaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgagacgga 21053740  T
Q  197 cgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaa 294  Q
     |||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  21053741 tgcaccaatcgtgacacgatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagtgagagttggaa 21053839  T
Q  295 gagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaag 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  21053840 gagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagag 21053939  T
Q  394 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtat 492  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  21053940 aaaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtat 21054039  T
Q  493 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 592  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21054040 cccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtg 21054137  T
Q  593 cttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054138 tatttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 21054226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20622812 - 20622137
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  | |||||||||    
T  20622812 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtct-gcagggtgc 20622714  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 203  Q
     || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||    
T  20622713 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtggtacgcaaat 20622614  T
Q  204 cgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-cttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||  |||| |||| | ||| ||  |||||||    
T  20622613 cgtggcatgatttggaaaatcgtgacacaattgcttcagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaaggg-gggttgga--agagaga 20622517  T
Q  303 gacttgggaaatcaaa-ggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 401  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  20622516 gacttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatc 20622417  T
Q  402 attgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatccc--ttt 498  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20622416 attgactgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttt 20622318  T
Q  499 tgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttg 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  20622317 tgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttg 20622220  T
Q  599 ttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622219 ttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 20622137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Original strand, 9986794 - 9987470
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||  ||||| |||| |||||| | |||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  9986794 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttgacatcgtaacacgatttcgtggtgccgtgagct-ggtctgcagtgtgc 9986892  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||  |    
T  9986893 caaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccataataaggactggtcataccttgggacggatgcacca 9986992  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||     
T  9986993 atcgtgacacgatctggaaa-tcgtgacacaattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggt-gagttggaagagagat 9987090  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9987091 agacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaat 9987190  T
Q  401 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9987191 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatccctttt 9987289  T
Q  500 gtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttg 598  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9987290 gcaagaactca-ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttg 9987387  T
Q  599 ttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987388 ttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 9987470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 221 - 689
Target Start/End: Original strand, 51765197 - 51765672
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51765197 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaagg-gagttggaagagtgagaaacttgggaaatcaaagg 51765295  T
Q  321 g-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 414  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   |||||| | ||||||||||   || |  |||||||||||||||||         
T  51765296 gagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttctt 51765394  T
Q  415 -gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
     ||  |||||||| |||  ||||||||||||||||    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51765395 ggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaact 51765494  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 608  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||    
T  51765495 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctctt 51765591  T
Q  609 ccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  51765592 ccctctccttttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 51765672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 20762511 - 20762844
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  20762511 taagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 20762607  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||||||| |||||       ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  20762608 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt 20762707  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  20762708 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttc-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccta 20762804  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20762805 cagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 20762844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 411 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  411 cttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316423 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 3189170 - 3189502
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  3189170 taagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt- 3189266  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||| || |||||||||||     
T  3189267 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 3189365  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  3189366 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatcc 3189463  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189464 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3189502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 3197987 - 3198319
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  3197987 taagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt- 3198083  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||| || |||||||||||     
T  3198084 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 3198182  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  3198183 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatcc 3198280  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198281 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3198319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 3206826 - 3207158
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  3206826 taagtgttctt-tgaagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt- 3206922  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||| || |||||||||||     
T  3206923 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 3207021  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  3207022 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatcc 3207119  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3207120 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3207158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550679
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 8550855  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttct-tcttcc 610  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||| |    
T  8550854 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgttttctctctt-c 8550759  T
Q  611 ctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
     ||||  | ||||||||| ||||   ||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  8550758 ttctctctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 8550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 3156705 - 3157036
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  3156705 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 3156801  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    |||||||||| |  |||||| | ||||||| ||   || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  3156802 tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt- 3156900  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  3156901 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccc 3156998  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3156999 atattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 3157036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297968
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298045 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 42297968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 28220555 - 28220223
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  28220555 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 28220459  T
Q  357 tctcttgggtataaaa-catgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    || ||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||       ||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  28220458 tctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt 28220359  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  28220358 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 28220262  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28220261 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 19365781 - 19366051
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  19365781 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 19365879  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||  ||||||||| |||||| | ||| |||| ||| |  |||||    
T  19365880 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaattttccaggataaggacaggtcgtacattgtgacgtacgtaccaatcg 19365979  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19365980 tgacacgacttggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19366051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 257 - 584
Target Start/End: Original strand, 44454997 - 44455331
Alignment:
Q  257 ttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44454997 ttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgtagagagagaaacttggtaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt 44455095  T
Q  356 atctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggt 445  Q
     | ||||||||    |||||| | ||||||||||    || || || ||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44455096 tt-tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt 44455194  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  44455195 t-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccc 44455291  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  44455292 ccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacgatct 44455331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168465
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168395 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Original strand, 24202360 - 24202513
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacaagattaggaaaat 223  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  |||||||||||| |||  || ||||    
T  24202360 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatatcttgggacgcacgttcaaatcgtgacacgatctgg-aaat 24202458  T
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24202459 cgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcatattt 24202513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 31659077 - 31659409
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  31659077 taagtgttctt-tgcagattttgagagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 31659173  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||| |   |||||| | ||||||||| |   || || ||||||||||||||       ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||      
T  31659174 tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggg-c 31659272  T
Q  447 tgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
    ||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||||      
T  31659273 tgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactta-ttgatagtggattggagagatcaatctctccct 31659370  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31659371 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31659409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547090
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13547159 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265551
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28265624 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39446080 - 39445898
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| | | ||||||    
T  39446080 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgcag 39445981  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |  || || |||||||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39445980 gacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcatgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtc 39445898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 255
Target Start/End: Original strand, 24793709 - 24793904
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  24793709 atcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtt 24793807  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  24793808 aagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 24793904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 28223750 - 28223418
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  28223750 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 28223654  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | | ||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  28223653 tctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt 28223554  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     | || |  |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  28223553 -gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 28223457  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28223456 catattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 28223418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37503883 - 37503554
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  37503883 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtgactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 37503787  T
Q  357 tctcttgggtat-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||| ||||||   |||| || | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37503786 tctattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt 37503687  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
     |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  37503686 -gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacctt--gtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccc 37503592  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||  | |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  37503591 agattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatct 37503554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834164
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 834235  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  834234 t-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348865
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11348796 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549001
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13549070 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Original strand, 24786936 - 24787082
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  24786936 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtg 24787035  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  24787036 acacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 24787082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136415
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29136345 catt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255340
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47255410 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 25439406 - 25439583
Alignment:
Q  6 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||  |||||| ||||| | | ||||||| |||    
T  25439406 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgcaggatgc 25439505  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  25439506 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 25439583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 44023379 - 44023561
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||| | | |||| |    
T  44023379 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctg 44023478  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    | |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  44023479 gatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 44023561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482231
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7482301 tcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37033143 tcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115340
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
     |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47115269 ccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552634
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaagaact 4552708  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4552707 catt-gataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 19360925 - 19361110
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  19360925 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 19361023  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 194  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  19361024 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacg 19361110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 31925855 - 31925708
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31925855 ggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 31925759  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31925758 agatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45644424 catt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918521
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  49918448 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 49918521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169207
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  50169280 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 50169207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 25444599 - 25444776
Alignment:
Q  6 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||  |||||| ||||| | | ||| ||| |||    
T  25444599 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagcaatcgtgacacgatttggtaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgtaggatgc 25444698  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  25444699 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 25444776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 576
Target Start/End: Original strand, 34603596 - 34603740
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34603596 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaactcatt-gatggtggattgaa 34603692  T
Q  528 gagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603693 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41391173 - 41391002
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||  |||||||  || || |    
T  41391173 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccagt-ttgcaggacgccaaat 41391075  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  41391074 cgtggcacgatcttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtc 41391002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754664
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  19754592 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaat 19754664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Original strand, 193666 - 193778
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  193666 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataactcatt-gatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttgga 193762  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||||||||    
T  193763 ccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 1054516 - 1054698
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||  |||||||||| ||||||| || |||   | |||| ||||| | | ||||||    
T  1054516 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgtcacgattttggaatcgtgatacgattggaggtgccgtgagccaagtttgcag 1054615  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1054616 gacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtc 1054698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167172
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50167245 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 51765007 - 51765188
Alignment:
Q  15 aaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || ||||    
T  51765007 aaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaatcgt 51765105  T
Q  112 ggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 194  Q
    | |||||| | |   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  51765106 gacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgtgacg 51765188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13316647 - 13316541
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  13316647 taagtgttctt-tgcagattttgaagatgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt- 13316551  T
Q  357 tctcttgggt 366  Q
    ||||||||||    
T  13316550 tctcttgggt 13316541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 13659501 - 13659333
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | || | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13659501 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 13659404  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13659403 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 497 - 580
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242472
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 37560198 - 37559864
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | | || ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |||| ||||| |||||||||||||     
T  37560198 taagtgttctt-tgcagattttgaagtaaagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaatgaggtaactttaaggttgagggt-ctttgattagagt- 37560102  T
Q  357 tctcttgggtat-aaaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    |||||||||| | ||||||| | |||||| || |   || || |||||||||||||||||       |||||||| |||||| || |||||||||| |||    
T  37560101 tctcttgggtttgaaaacattgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagtt 37560002  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
     |||| | ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  ||||||||||     
T  37560001 -gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactc-gttgatagtgaattggagagatcaatctctccc 37559905  T
Q  544 cc-agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  37559904 cctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 37559864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 46064921 - 46065089
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||    
T  46064921 gtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcat 46065018  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |  ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  46065019 tc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  23555335 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 557
Target Start/End: Original strand, 1833372 - 1833667
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggc-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |      
T  1833372 tgcagattttgaatgagagattgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttaaggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttggattg 1833469  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtga 458  Q
      |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||    
T  1833470 ggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtga 1833568  T
Q  459 a-cttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
    | ||  | ||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  ||||||    
T  1833569 atctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtca 1833666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 121
Target Start/End: Original strand, 24202264 - 24202376
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  24202264 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 24202362  T
Q  108 tcgtggcacgattt 121  Q
    ||||| ||||||||    
T  24202363 tcgtgacacgattt 24202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Original strand, 10925062 - 10925168
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||| |||     
T  10925062 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattatagt- 10925158  T
Q  357 tctcttgggt 366  Q
    ||||||||||    
T  10925159 tctcttgggt 10925168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 3847286 - 3847118
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847286 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaactcat 3847189  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  | |||||| | |||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  3847188 t-gatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaagtt-ggaccgaacttggtcaacaatct 3847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 13138089 - 13137973
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |  |||||    
T  13138089 aagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaacacatt-gatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattgga 13137993  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13137992 ccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 560
Target Start/End: Original strand, 15820362 - 15820455
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15820362 aagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttt-taagaactca-ttgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476443
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||  ||| |||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30476517  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||| ||||||| | ||  |||||||| | ||| |  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  30476516 catt-gatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 30476443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 364
Target Start/End: Original strand, 49918188 - 49918292
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| | || ||||||||||||||     
T  49918188 taagtgttctt-tgcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaagg-tctttgattagagt- 49918284  T
Q  357 tctcttgg 364  Q
    ||||||||    
T  49918285 tctcttgg 49918292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361088
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| | || |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 41361011  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |  ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| || ||||| |  |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  41361012 c-gttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatctt 41361088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41398778 - 41398657
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtta 158  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||  |||||||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||| |||    
T  41398778 atcgtgacacgatttgagatgccgtgagccagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcatta 41398680  T
Q  159 agtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  41398679 agtatcattgataaggactggtc 41398657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 197073 - 196904
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  197073 gtgagattgagaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatcccttt-gtaagaactcat 196976  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc-agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||    |||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  196975 t-gatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactggatcaacaatct 196904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 278
Target Start/End: Original strand, 19358530 - 19358587
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19358530 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19358587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 278
Target Start/End: Original strand, 19361119 - 19361176
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19361119 aatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 19361176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctc-tttgtaagaac 19752782  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||  ||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19752783 tca-ttgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 417 - 556
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  417 gagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttg 514  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactca-ttg 22079419  T
Q  515 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
    ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||| || ||||||    
T  22079420 atattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30476777 - 30476718
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaa 318  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30476777 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaa 30476718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 497 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 37876848 - 37876767
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37876848 tttgtaataactcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879005
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 485  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacct 37879005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 928145 - 928043
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  928145 ttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaact 928047  T
Q  509 catt 512  Q
    ||||    
T  928046 catt 928043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 21536305 - 21536356
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21536305 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttgg 21536356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 560
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683828
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36683766 tttgtaagaactcatt-gatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 43988054 - 43988133
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  43988054 gcaaaatcgtgccacgatcttggtaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 43988133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 8871213 - 8871143
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 484  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  | | | |||||||||||||||||||    
T  8871213 gtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaacc 8871143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318589
Alignment:
Q  417 gagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcatt 12318589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 498
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  434 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttt 498  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 483
Target Start/End: Original strand, 6378600 - 6378655
Alignment:
Q  428 aaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaac 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  6378600 aaaggtagaaattagggtttgttcatgttgaacattgt-aagctaattttttgtaac 6378655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13598758 - 13598718
Alignment:
Q  262 tgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  13598758 tgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagaga 13598718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 541
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455750
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctc 541  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tgtgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 492; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 10592846 - 10593528
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||| |||| ||||||    
T  10592846 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgattccgggtgccgtgagatagg-ttgcag 10592944  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  | |||    
T  10592945 ggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttcggtggtacg 10593044  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagaga 298  Q
    || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  10593045 cagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagtatgtaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagaga 10593144  T
Q  299 gagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593145 gagagacttgggaaatcaaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaga 10593244  T
Q  399 atcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593245 atcattgagtgtcttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 10593344  T
Q  499 tgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttg 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  10593345 tgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttg 10593443  T
Q  599 ttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593444 ttttctacttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 10593528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 25077708 - 25078391
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||   | |||| ||||||||||||| ||    
T  25077708 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacgcgattggaggtgccgtgagctagggttgtag 25077807  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077808 gggtgcaaat-cgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 25077906  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  25077907 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagaggttgga-ag 25078005  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078006 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 25078105  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25078106 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccctt 25078205  T
Q  498 ttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt- 595  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  25078206 ttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttta 25078304  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078305 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 25078391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 25135677 - 25136360
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||   | |||| ||||||||||||| ||    
T  25135677 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacgcgattggaggtgccgtgagctagggttgtag 25135776  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135777 gggtgcaaat-cgtgtcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 25135875  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  25135876 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggagaggttgga-ag 25135974  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135975 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 25136074  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25136075 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccctt 25136174  T
Q  498 ttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt- 595  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  25136175 ttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttta 25136273  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136274 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 25136360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 40379680 - 40380361
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||||    
T  40379680 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcag 40379779  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379780 ggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 40379879  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagaga 298  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||    
T  40379880 caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga-aga 40379978  T
Q  299 gagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40379979 gagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagaga 40380076  T
Q  399 atcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40380077 atcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttt 40380176  T
Q  499 tgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-t 596  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  40380177 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttat 40380275  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380276 tgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 40380361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 40381891 - 40382572
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||||    
T  40381891 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcag 40381990  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40381991 ggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 40382090  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagaga 298  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||    
T  40382091 caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga-aga 40382189  T
Q  299 gagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40382190 gagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagaga 40382287  T
Q  399 atcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40382288 atcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttt 40382387  T
Q  499 tgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-t 596  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  40382388 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttat 40382486  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382487 tgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 40382572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 16546218 - 16546903
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||||    
T  16546218 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcag 16546317  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546318 ggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 16546417  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaagag 297  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| | ||    
T  16546418 caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggcaagaggttgga-ag 16546516  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16546517 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 16546614  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16546615 aatcattgagtgtcttggtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct 16546714  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  16546715 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgttt 16546813  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctcct---tgtatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16546814 attgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgtttt 16546903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 16543996 - 16544681
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||   | |||  |||||||||||| |||    
T  16543996 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgctgtgagctagggttacag 16544095  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544096 ggtgcaaattcgtgacacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 16544195  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaagag 297  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| | ||    
T  16544196 caaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaaggcaagaggttgga-ag 16544294  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16544295 agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 16544392  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  16544393 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatccct 16544492  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  16544493 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgttt 16544591  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctcct---tgtatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16544592 attgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 16544681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 22536850 - 22536197
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  22536850 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgca 22536752  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  22536751 gggtgcaaaatcgtggcacaattgtgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 22536652  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttga--ag 295  Q
     || |||||                    |||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||    
T  22536651 acagatcgt--------------------gacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagag 22536573  T
Q  296 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||    
T  22536572 agagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctg--caga 22536475  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536474 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 22536375  T
Q  495 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22536374 cttttgtaagaactc-tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgct 22536277  T
Q  595 tttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtg 675  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536276 tttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtg 22536197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 126 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 29751615 - 29751059
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcg 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29751615 aaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacacgatttggaaaatcg 29751516  T
Q  226 tgacacgattggaacagaggaagactagtacttaa-gtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gc 323  Q
    |||||||||||    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29751515 tgacacgattgctttagaggaaggctagtatataaagtgttcttgtgcatctttgaagg-agagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagc 29751417  T
Q  324 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29751416 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattg 29751317  T
Q  424 ggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtgga 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29751316 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtgga 29751218  T
Q  523 ttgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttgta 621  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29751217 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttgttttcttcttccctctcctttta 29751119  T
Q  622 tcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||| ||   ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29751118 tcttgtgattg-tgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgtttt 29751059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Original strand, 29719974 - 29720632
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  | |||||||||    
T  29719974 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagctagtct-gcagggtgc 29720072  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 202  Q
     || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||      
T  29720073 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacc 29720172  T
Q  203 tcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
                      |||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  29720173 ------------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcaaatttgaagg-agagttggaagagagaga 29720253  T
Q  303 gacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 401  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29720254 aacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatc 29720353  T
Q  402 attgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720354 attgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttg 29720453  T
Q  501 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 600  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  29720454 taagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtt 29720551  T
Q  601 ttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720552 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 29720632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 220 - 682
Target Start/End: Original strand, 29722332 - 29722792
Alignment:
Q  220 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaag 319  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29722332 aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagg-agagttggaaaagagagaaacttgggaaatcaaag 29722430  T
Q  320 gg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtga 418  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29722431 ggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtga 29722530  T
Q  419 gattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgata 517  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29722531 gattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgata 29722629  T
Q  518 gtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcct 617  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29722630 gtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct 29722728  T
Q  618 tgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | ||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722729 tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 29722792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9789800 - 9789123
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  9789800 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 9789702  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||  || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |    
T  9789701 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgcgacgaacgcacca 9789602  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
     |||||||| ||   | |||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  9789601 ttcgtgacacgacctg-aaaatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagg-agagttggaagagagag 9789504  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||   || || ||    
T  9789503 aaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaa 9789405  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatccctt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9789404 tcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 9789306  T
Q  498 ttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctttt 597  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9789305 ttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtcttt 9789207  T
Q  598 gttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9789206 gttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgtttt 9789123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 18442224 - 18441595
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||| || |||||||||||    
T  18442224 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 18442126  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||  || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  18442125 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacgaacgcacca 18442026  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
    ||||||||| ||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  18442025 atcgtgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagg-agagttggaagagagag 18441928  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||   || || ||    
T  18441927 aaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaa 18441829  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatccctt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18441828 tcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 18441730  T
Q  498 ttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctttt 597  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18441729 ttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtcttt 18441631  T
Q  598 gttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgt 633  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  18441630 gttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgt 18441595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 633
Target Start/End: Original strand, 26177479 - 26178103
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  26177479 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26177577  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| ||||||   || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26177578 tcgtgacacgatcatgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacggacgcaccaatcg 26177677  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| ||   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| ||    
T  26177678 tgacacgacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgcgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaac 26177775  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    |||||||| ||||||||||   || || ||||||    
T  26177776 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 26177874  T
Q  404 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgt 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26177875 tgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgt 26177972  T
Q  502 aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 601  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26177973 aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 26178071  T
Q  602 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgt 633  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26178072 tcctcttccctctccttttatcttgtgcttgt 26178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 633
Target Start/End: Original strand, 26170370 - 26170983
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  26170370 cttcaaatttatggtatggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26170468  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| ||||||   || |||||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26170469 tcgtgacacgatcgtgggaaatcgtgacataatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacggacgcaccaatcg 26170568  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| ||   ||| | |||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||    
T  26170569 tgacacgacctggata-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaac 26170666  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||    |||||||| ||||||||||   || || ||||||    
T  26170667 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 26170765  T
Q  404 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 502  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||    
T  26170766 tgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgta 26170853  T
Q  503 agaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 602  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26170854 agaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtttt 26170952  T
Q  603 cttcttccctctccttgtatcttgtgattgt 633  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26170953 cctcttccctctccttttatcttgtgcttgt 26170983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 250 - 689
Target Start/End: Original strand, 16409313 - 16409752
Alignment:
Q  250 ctagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttga 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  16409313 ctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttga 16409410  T
Q  349 ttagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggttt 447  Q
    ||||||  ||||||||||    |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  16409411 ttagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt- 16409509  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16409510 gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcc 16409608  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgt 645  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||  |    
T  16409609 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tgttttatgctt 16409707  T
Q  646 cacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  16409708 ttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 16409752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 25412601 - 25412932
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     
T  25412601 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggt-ctttgattagagt- 25412697  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttg 448  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25412698 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-g 25412796  T
Q  449 ttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  25412797 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcca 25412894  T
Q  547 gagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25412895 gagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct 25412932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 13342900 - 13343232
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  13342900 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt- 13342996  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13342997 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 13343096  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13343097 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 13343192  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13343193 cagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct 13343232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 689
Target Start/End: Original strand, 30182429 - 30182861
Alignment:
Q  259 aagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtat 357  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  30182429 aagtgttctt-tgcagattttgaatgagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-t 30182525  T
Q  358 ctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttg 448  Q
    |||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  30182526 ctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-g 30182624  T
Q  449 ttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30182625 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcca 30182722  T
Q  547 gagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtc 646  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||| ||||||||| ||| || ||||||  |     
T  30182723 gagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttg-tgttttgtgcttt 30182817  T
Q  647 acac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  30182818 tcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 30182861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 36074373 - 36074039
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  36074373 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 36074277  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa----ggtagaaattaggg 444  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  36074276 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattaggg 36074177  T
Q  445 tttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 542  Q
    || |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36074176 tt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcc 36074081  T
Q  543 tccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36074080 tccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 36074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 258 - 680
Target Start/End: Original strand, 13239591 - 13240016
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||| || |||| ||||| |||||||||||||     
T  13239591 taagtgttctt-tgcagattttgaagtagagtttgaagagagagaaacttagaaaatcaaaggaggtaactttatggttgagggt-ctttgattagagt- 13239687  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13239688 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggttt 13239787  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
     ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  13239788 -ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcc 13239884  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgt 645  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||   ||||  |||||||| |||||| || |||| | ||||||| |    
T  13239885 agagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaa--tttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgttt 13239980  T
Q  646 cacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 680  Q
      ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239981 ttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 13240016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24136470 - 24136198
Alignment:
Q  12 ttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  24136470 ttcaaatttgtggtctggaagaacacagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacaatttcgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaat 24136372  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 208  Q
    |||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24136371 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtga 24136272  T
Q  209 caagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta-cttaagtgttcttgtgcagatttggag 282  Q
    || |||  || |||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||  | |||||||||||||||  |||||||    
T  24136271 cacgatctgg-aaatcgtggcacgattgtatcagaggaaagctagtatataaagtgttcttgtgcatttttggag 24136198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 32636663 - 32636995
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  32636663 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttggagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttaagggt-ctttgattagagt- 32636759  T
Q  357 tctcttgggta-taaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||       |||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  32636760 tctcttgggtagtgaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt 32636859  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  32636860 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccc 32636956  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32636957 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32636995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 584
Target Start/End: Original strand, 37439157 - 37439313
Alignment:
Q  427 aaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 524  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37439157 aaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggatt 37439253  T
Q  525 gaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439254 ggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43599316 - 43599060
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc--ggatgccatgagctagggttgc 96  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||  ||||    
T  43599316 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagt-ttgc 43599218  T
Q  97 agggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    |||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  43599217 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcaga 43599119  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  43599118 cgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagta 43599060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43604808 - 43604552
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc--ggatgccatgagctagggttgc 96  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||  ||||    
T  43604808 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagt-ttgc 43604710  T
Q  97 agggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    |||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  43604709 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcaga 43604611  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  43604610 cgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagta 43604552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 43610300 - 43610044
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc--ggatgccatgagctagggttgc 96  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||  ||||    
T  43610300 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcgtcgtgacacgatttcaagggggccgtgagctagt-ttgc 43610202  T
Q  97 agggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    |||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  43610201 aggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcaga 43610103  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  43610102 cgcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgattgcttcagaggaaggctagta 43610044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27450407 - 27450152
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||  |||||    
T  27450407 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttgca 27450309  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  27450308 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagac 27450210  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  27450209 gcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagta 27450152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27445564 - 27445309
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||  |||||    
T  27445564 ttgatattggcttcaaatttgtggtctagaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttgca 27445466  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  27445465 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagac 27445367  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  27445366 gcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagta 27445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213633
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35388169 - 35388016
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacaagattaggaaaat 223  Q
    |||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| |||  || ||||    
T  35388169 aaattgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcgtgacacgatctgg-aaat 35388071  T
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35388070 cgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 35388016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147428
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40147359 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Original strand, 13488053 - 13488374
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  13488053 tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttg 13488150  T
Q  369 -aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtga 458  Q
     ||||||| | ||||||||||    || || ||| |||||||||||||       || |||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||    
T  13488151 gaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtga 13488249  T
Q  459 acttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  ||||||    
T  13488250 acttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtca 13488347  T
Q  557 agtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |||||||||||||||| || |||||    
T  13488348 ag-ttggaccgaactgggtcaataatct 13488374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 258 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 30683249 - 30682930
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  30683249 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcagaggaggtaattttagggttgagggt-ctttgattagagt- 30683153  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  30683152 tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttc 30683053  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaa--ctcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
     ||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  30683052 ttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccc 30682959  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgg 573  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  30682958 ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278485
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28278414 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat 28278485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 28750985 - 28750652
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  28750985 taagtgttcttatgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 28750888  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||| |   |||||| | ||||||||| |   || || ||||||||||||||       ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  28750887 tctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-t 28750789  T
Q  447 tgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
    ||||| |  |||| ||| | ||| ||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  28750788 tgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtat-ctttttgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccc 28750691  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  28750690 cagattaggtcaag-ttggaccgaattgggtcaataatct 28750652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 42428748 - 42428427
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggc-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  42428748 tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttg 42428651  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtga 458  Q
      ||| || | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  42428650 ggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtga 42428552  T
Q  459 acttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  ||||||    
T  42428551 acttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtca 42428454  T
Q  557 agtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42428453 agtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43592761 - 43592634
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  43592761 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtg 43592663  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattg 236  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  43592662 acacgatttgggaaatcgtgacacgattg 43592634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30631946 - 30631764
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||| ||  |||||    
T  30631946 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagccagt-ttgca 30631848  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||  || || ||||| |||||||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30631847 ggacgccaaatcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtc 30631764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 39468854 - 39468546
Alignment:
Q  283 ggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaa 380  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||    |||||| | ||    
T  39468854 ggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttcattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaa 39468757  T
Q  381 acaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagct 470  Q
    ||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||    
T  39468756 acaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagct 39468658  T
Q  471 aatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaa 569  Q
    |||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||| ||  |||||| |||    
T  39468657 aatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaa 39468561  T
Q  570 ctgggtgaacaatct 584  Q
    |||||| ||||||||    
T  39468560 ctgggtcaacaatct 39468546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 28807083 - 28807260
Alignment:
Q  6 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||   |  |||||||  |||||||||  |||||||||| || |  |||||| ||||| | | |||||||||||    
T  28807083 attggcttcaaatttatggtctggaagaacagaggaatcgtgtcacgattttgcaatcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtttgcagggtgc 28807182  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28807183 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtc 28807260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 415 - 601
Target Start/End: Original strand, 33831683 - 33831866
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  33831683 gtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 33831780  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 601  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  33831781 t-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa--tctttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Original strand, 533619 - 533940
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||      
T  533619 tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaatttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttg 533716  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtga 458  Q
      |||||| | ||||||||||    || || |||||||| ||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | | ||||    
T  533717 ggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtga 533815  T
Q  459 acttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
     |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||| ||| |  ||||||    
T  533816 gcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtca 533913  T
Q  557 agtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  533914 agtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1456640 - 1456850
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||  || ||    
T  1456640 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttaca 1456738  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | ||     
T  1456739 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgcttgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttgggtcagat 1456837  T
Q  198 gcaaatcgtgaca 210  Q
    |||||||||||||    
T  1456838 gcaaatcgtgaca 1456850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 29722161 - 29722332
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||  ||||||| |  |||| |||||    
T  29722161 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgctgtgagcta-gtctgcatggtgc 29722259  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaactttctcgttaagtatccttgataagga 175  Q
     || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  29722260 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataagga 29722332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29752381 - 29752266
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  29752381 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgctgccgtgagcta-ggttgcagggtgc 29752283  T
Q  104 aaattcgtggcacgatt 120  Q
     || |||||||||||||    
T  29752282 caaatcgtggcacgatt 29752266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058212
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||   |||| |||||  |||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttct--gtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5058143 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 16407654 - 16407844
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  16407654 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttgacatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 16407752  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgc 199  Q
    ||||| |||||| | |   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  16407753 tcgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaccggtcgtaccttgggacgtacgc 16407844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31180738 - 31180591
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  31180738 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagagactttctcgttaagtatcactgataaggactggtc-aaccttgggtcagacgcaaatcgtg 31180640  T
Q  208 acaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||| | || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  31180639 acatgatcttgggaaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 31180591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15045277 - 15045096
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||  ||||||    
T  15045277 ttgatattggcttcaaatttgtagtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgatttgagatgccgtgagccagt-ttgcag 15045179  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  15045178 gacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtc 15045096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 29402552 - 29402728
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||   || |||||||||||  |||||    
T  29402552 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtggcacgatttcaagtggccatgagctagt-ttgca 29402650  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataagga 175  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  29402651 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataagga 29402728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 42426564 - 42426232
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  42426564 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaaaagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 42426468  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    |||||| | |    |||||| | ||||||||||    || || ||| |||||||||||||       ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42426467 tctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt 42426368  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  42426367 -gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 42426271  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||  |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42426270 ctgattaggtcaag-ttggactgaactaggtcaacaatct 42426232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637615
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |  ||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 578  Q
    |||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 580
Target Start/End: Original strand, 16451965 - 16452247
Alignment:
Q  304 acttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 401  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||  ||| || ||||    
T  16451965 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatc 16452062  T
Q  402 attgagtgtcttggt-------gagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 491  Q
    ||||||||||||| |       |||||||| |||| || ||||||||| | ||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  16452063 attgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 16452161  T
Q  492 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16452162 tctcttt-gtaagaactcattc-atagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 16452247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 580
Target Start/End: Original strand, 31182857 - 31183138
Alignment:
Q  304 acttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||| |   || || |||    
T  31182857 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaat 31182954  T
Q  401 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtat 492  Q
    ||||||||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||| || |||| | ||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31182955 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtat 31183053  T
Q  493 cccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  | |||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31183054 ccc-tttgtaagaactca-ttgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 31183138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38219949 - 38219752
Alignment:
Q  76 gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataagga 175  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||||| || ||||| |||||| | || |||| ||||||||||  | |||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  38219949 gatgccgtgagct-ggtttgtagggtgccaaatcgtgacacgatcttgggaaattgtgacacgattttcaaacttgcttgttaagtttccatgataagga 38219851  T
Q  176 ctggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgca 273  Q
    |||||||| ||||| |||| |||  | |||||||||| |||| || |||||||||||| |||  | ||||||||| |||||     ||||||||||||||    
T  38219850 ctggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatcgtgacacgatttgg-aaatcgtgacacaattttatcagaggaaggctagt-----agtgttcttgtgca 38219757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 8566111 - 8565943
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8566111 gtgagattgagaaaatgggtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcat 8566014  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8566013 t-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15464952 - 15464845
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  15464952 aatcgtgacacgatttggaaa-tcgtggcacgattttatcagtagaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagaga 15464854  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  15464853 gaaacttgg 15464845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015690
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||       | || |||||||| |||| ||||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat-------acccatttgtatctcttt-gtaagaactc 27015621  T
Q  510 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27015622 att-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  510 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaa 557  Q
    | || ||||||||||  ||||   | ||||||||||| || |||||||    
T  13695759 a-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 538028 - 538196
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| | || | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||     
T  538028 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca- 538124  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  538125 ttgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 538196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 321
Target Start/End: Original strand, 16407848 - 16407947
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16407848 aatcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtattcttgtgcagattttga-agagagttggaagagagagaaacttggaaaatcaaagg 16407946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 16409090 - 16409280
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||| | |||||| || ||||| ||||| ||     
T  16409090 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgtcgtgagct-ggtttgcaaggtgccaaa 16409188  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgc 199  Q
    | ||| |||||| | |   ||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  16409189 ttgtgacacgatcttgaggaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacattgggacgtacgc 16409280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640941
Alignment:
Q  426 aaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggat 523  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact----tgatagtggat 16640997  T
Q  524 tgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  16640996 tggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-tagggccgaactgggtaaaca 16640941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 584
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747176
Alignment:
Q  416 tgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||||||    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaa-aactcatt 38747106  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     ||||| |||||| ||||  ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  38747107 -gatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggtcaataatct 38747176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 582
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316933
Alignment:
Q  418 agattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttga 515  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaatta-ggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactca-ttga 316866  T
Q  516 tagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    || ||||| | || |  |||||||||| | |||| ||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  316867 taatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaat 316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 9352820 - 9353118
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |  |||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||| | | |||| |||||| || ||||||||||  ||     
T  9352820 cttcaaatttgtggtttgaaagaacagagaaatcgtgacgcgattgtggcatcgtgacacgattttgtaatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 9352918  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||||  | |||||| || ||||||| | |  |||||||  ||||||| ||||||| || ||  |  |||||    
T  9352919 tcgtggcacgattctgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggt-tggtcgtaccttgggtcgtacatatcaatcg 9353017  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    || || |||| |||||| |||| |||||||  | |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||    
T  9353018 tggcacgatttggaaaa-cgtggcacgattttatcagctgaagactggtatttaagtgttcttgtgcagattt--tgggagaggatgaagagagagaaac 9353114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049354
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||  | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgttttt-gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctc-tttgtaagaactca-t 9049410  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaa 569  Q
    ||| ||||||||| ||||  |||| ||||| ||| || |||| ||| ||||||||||    
T  9049409 tgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 584
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Original strand, 37561058 - 37561130
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggt 180  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37561058 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37561130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2785857 - 2785778
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2785857 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 2785778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33768666 - 33768587
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33768666 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33768587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33791798 - 33791719
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33791798 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33791719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15465112 - 15465000
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  15465112 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggtatcgtgacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 15465014  T
Q  108 tcgtggcacgattt 121  Q
    ||||| ||||||||    
T  15465013 tcgtgacacgattt 15465000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14520592 - 14520543
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagactt 307  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  14520592 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaactt 14520543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29751715 - 29751617
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| | || ||||| |||  ||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  29751715 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgaatttggcatcacgacacgatttcgtggtgccgtgagcta-ggttgcagggtgc 29751617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 318
Target Start/End: Original strand, 37438987 - 37439046
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaa 318  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37438987 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttggaaaatcaaa 37439046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Original strand, 37556236 - 37556308
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggt 180  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37556236 tcgtggcacgatcttgggaaattgtgacacgatctagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37556308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 11916707 - 11916758
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  11916707 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttgg 11916758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  515 atagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggt 575  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 679
Target Start/End: Original strand, 5861 - 6542
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||||    
T  5861 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggagtcgtgacacgattggaggtgccgtgagctagggttgcag 5960  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatt-tgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5961 ggtgcaaattcgtgtcacgattgtggcaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 6060  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  6061 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-gttggaagag 6159  T
Q  298 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6160 agagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agagag 6257  T
Q  398 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctt 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  6258 aatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatccctt 6357  T
Q  498 ttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  6358 ttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgttat 6456  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttg---tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 679  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6457 tgttttcttcttccctctccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgt 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16579099 - 16578415
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  16579099 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgca 16579001  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  16579000 gggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 16578901  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggag-agtttgaaga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||     
T  16578900 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaggagttggaagt 16578802  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16578801 gagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagaga 16578702  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578701 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16578602  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16578601 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatt 16578502  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578501 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 16578415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 16616281 - 16616965
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  16616281 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgca 16616379  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  16616380 gggtgcaaaatcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 16616479  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggag-agtttgaaga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||     
T  16616480 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagggtagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaggagttggaagt 16616578  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16616579 gagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagaga 16616678  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616679 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16616778  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16616779 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatt 16616878  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616879 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 16616965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 16554456 - 16555140
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || ||    
T  16554456 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttaca 16554554  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  16554555 gggtgcaaaattgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 16554654  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga-gagtttgaaga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| || || ||||| ||||     
T  16554655 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagt 16554753  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554754 gagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 16554853  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554854 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16554953  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16554954 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatt 16555053  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555054 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 16555140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 16631012 - 16631696
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || ||    
T  16631012 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacatgattttggtatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttaca 16631110  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  16631111 gggtgcaaaattgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 16631210  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggaggga-gagtttgaaga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| || || ||||| ||||     
T  16631211 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaattgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagt 16631309  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631310 gagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 16631409  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631410 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16631509  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16631510 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatt 16631609  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631610 tgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 16631696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 6026836 - 6027516
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||  || || ||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  6026836 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaatagggaaatcgtgacacgattgcggcattgtgacacgatttcgaggtgcga-gagctagggttgca 6026934  T
Q  98 ggg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6026935 ggggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacgga 6027033  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  6027034 cgcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga-a 6027132  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  6027133 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 6027230  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6027231 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccct 6027330  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6027331 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttt 6027429  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027430 attgttttcttcttccctc-cattttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 6027516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 34166668 - 34167350
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34166668 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 34166767  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34166768 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgta 34166866  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  34166867 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 34166964  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  34166965 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 34167062  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34167063 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 34167162  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34167163 ttttgtaaagaacttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtt 34167261  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167262 tattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgtttt 34167350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 682
Target Start/End: Original strand, 25421014 - 25421576
Alignment:
Q  120 ttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattagga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25421014 ttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacatgattggga 25421113  T
Q  220 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25421114 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagaaagaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaag 25421212  T
Q  320 gggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgag 419  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421213 gggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgag 25421312  T
Q  420 attgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatag 518  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421313 attgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatag 25421412  T
Q  519 tggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct 617  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||        
T  25421413 tggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttg 25421511  T
Q  618 tgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421512 tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 25421576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 33342686 - 33342001
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaag--gaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33342686 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacatggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacgcgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 33342587  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttg-ggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342586 gggtgcaaat-cgtggcacgatttctgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 33342488  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |    
T  33342487 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaatttgga-a 33342389  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  33342388 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 33342291  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  33342290 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactcc 33342191  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  33342190 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 33342092  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctcct---tgtatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342091 tattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 33342001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 682
Target Start/End: Original strand, 16652759 - 16653383
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16652759 atcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgtagggtgcaaagtcgtggaacgatttgggaaaatcgtgacacaatcgtgaaacttgctcgtt 16652857  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  16652858 aagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-t 16652956  T
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggaggga-gagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
     || |||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652957 aaattgttcttgtgcagatttgaagagaagagttggaagtgagagagacttggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 16653056  T
Q  357 tctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagt 456  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  16653057 tctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgt 16653156  T
Q  457 gaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  16653157 gaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtca 16653256  T
Q  557 agtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgt 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16653257 agtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tgctttgtgtttcacacttgt 16653355  T
Q  655 ttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653356 ttcctagattagatctaggtggtgtttt 16653383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 34164446 - 34165128
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34164446 ttgagtttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattctgggatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 34164545  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164546 gggtgcaaat-cgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 34164644  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||| |    
T  34164645 cgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagag-ggttgaa-a 34164742  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  34164743 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 34164840  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34164841 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 34164940  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  34164941 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 34165039  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34165040 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttt 34165128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 682
Target Start/End: Original strand, 27647476 - 27648122
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  27647476 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgc 27647574  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaat 203  Q
    ||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  | ||||| ||    
T  27647575 aaaatcgtggcacgattgtgagaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgatattgactggtcgtttcttgggtggtacgcagat 27647674  T
Q  204 cgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagag 303  Q
    |||                    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  27647675 cgt--------------------gacacgattgcaatagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagagagag 27647753  T
Q  304 acttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 402  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  27647754 acttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgt--agagagaatca 27647851  T
Q  403 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647852 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 27647951  T
Q  503 agaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 602  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27647952 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgtttt 27648049  T
Q  603 cttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||| |||||||       ||  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648050 cttcttccctctccttttatcttg-------tgtattgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 27648122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 680
Target Start/End: Original strand, 411694 - 412369
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||||  | |||||||||    
T  411694 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaatagggaaatcgtgacacgaatttggcattgtgacacaatttcgtggtgccgtgagctagtct-gcagggtgc 411792  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtg-aaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca-- 200  Q
     || ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||      
T  411793 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggacggatgcacc 411892  T
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||||||||||  | ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  411893 aatcgtgacacaatcaggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaaggcatgtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagggag--ttggaagagaga 411989  T
Q  301 gagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  411990 gaaacttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaa 412088  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  412089 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct 412187  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  412188 tttgtaagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatt 412286  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 680  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  412287 tgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttg-tgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 3073334 - 3072652
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||  | ||||||||    
T  3073334 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacaggaaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtctacagggtgc 3073236  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||   | |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||  |    
T  3073235 caaatcgtgacacgattgttggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgggatggatgcacta 3073136  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
    ||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||     
T  3073135 atcgttacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttggaag-agagttggaagagagaa 3073038  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  3073037 a--cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaa 3072941  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccct 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| ||    
T  3072940 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct 3072842  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  3072841 tttgtaagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctt 3072744  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||  |  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  3072743 tgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctatgtgctatttttgttgat 3072652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 392 - 679
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154182
Alignment:
Q  392 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgt 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13153893 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 13153992  T
Q  491 atcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttg 589  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13153993 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt- 13154091  T
Q  590 gtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 679  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13154092 gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgt 13154182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 221 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 6097800 - 6097342
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagg-gagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaag 319  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6097800 aatcgtgacacgattttatcaggggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggtgagagagt--agagagagaaacttgggaaatcaaag 6097703  T
Q  320 gg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtg 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||| ||||||    
T  6097702 ggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtg 6097603  T
Q  418 agattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgat 516  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||||||||||||| |||    
T  6097602 agattggaaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaagaactcatt-gat 6097515  T
Q  517 agtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcc 616  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  6097514 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc 6097415  T
Q  617 ttgtatcttgtgattgttgctttgtg-tgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| | |  |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6097414 ttgtatcttgtgattg-tgtattgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttttgttgat 6097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2172090 - 2171525
Alignment:
Q  12 ttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  |  |||||| || | || ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| || |    
T  2172090 ttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaat 2171992  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 208  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |            
T  2171991 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtttccaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtacc------ 2171898  T
Q  209 caagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttg 308  Q
                |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  2171897 ------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaaggt-gagctagaagagagagaaacttg 2171811  T
Q  309 ggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattga 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||    
T  2171810 ggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattga 2171712  T
Q  407 gtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttgtatccctt 497  Q
    ||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2171711 gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctctt 2171613  T
Q  498 ttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171612 t-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 2171525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6136545 - 6136266
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6136545 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggaatcgagacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 6136446  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg 198  Q
    ||   ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6136445 gggtgaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggaag 6136346  T
Q  199 caaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6136345 caaatcgtgacacaattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtatttaagt-ttcttgtgcagatttg 6136266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25420799 - 25421034
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25420799 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacaattttgggaccgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 25420898  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25420899 gggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 25420997  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25420998 gcaaatcgtgacatgattgggaaaatcgtgacacgat 25421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 31404992 - 31404671
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||      
T  31404992 tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttg 31404894  T
Q  369 -aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac 460  Q
     ||||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  31404893 gaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 31404795  T
Q  461 ttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaag 558  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31404794 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaag 31404697  T
Q  559 tttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31404696 tttggaccgaactgggtgaacaatct 31404671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5406516 - 5406196
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||      
T  5406516 tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttg 5406419  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac 460  Q
      |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  5406418 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 5406320  T
Q  461 ttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaag 558  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5406319 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 5406222  T
Q  559 tttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  5406221 tttgaaccgaactgggtgaacaatct 5406196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5410841 - 5410521
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||      
T  5410841 tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttg 5410744  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac 460  Q
      |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  5410743 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 5410645  T
Q  461 ttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaag 558  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5410644 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 5410547  T
Q  559 tttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  5410546 tttgaaccgaactgggtgaacaatct 5410521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 13150857 - 13151068
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcaggg-tgc 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  13150857 ttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcaggggtgc 13150956  T
Q  104 aaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 202  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150957 aaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 13151055  T
Q  203 tcgtgacaagatt 215  Q
    |||||||| ||||    
T  13151056 tcgtgacacgatt 13151068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 30834865 - 30834532
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||     
T  30834865 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt- 30834769  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||  | |||||| | |||||||| |   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30834768 tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 30834669  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30834668 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 30834572  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30834571 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct 30834532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5413721 - 5413391
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  5413721 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagatagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 5413625  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttg 448  Q
    ||||| ||||    |||||| | |||||| |||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5413624 tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-g 5413526  T
Q  449 ttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  5413525 ttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcca 5413428  T
Q  547 gagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5413427 gagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatct 5413391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 16452658 - 16452325
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  16452658 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagtaagcaactttagagtttagggt-ctttgattagagt- 16452562  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||  | |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16452561 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 16452462  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttg-tatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16452461 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 16452365  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452364 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 16452325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5674242 - 5674516
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| | || ||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  5674242 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacatgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 5674340  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    ||||| ||| || | || |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  5674341 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacgattttgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtg 5674440  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt-aagtgttcttgtgcagatttggagg 283  Q
    ||| |||  || ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5674441 acacgatctgg-aaatcgtgacacgattgtatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgcagatttggagg 5674516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22709632 - 22709362
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||| |||| ||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  22709632 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgaatttggcaacgtgacacgattttgtgatgccatgagct-ggtttgcagggtgccaaa 22709534  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac--gcaaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||||    
T  22709533 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacatacaaatcg 22709434  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22709433 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacgattttattagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 22709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 33160683 - 33160348
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagaga-cttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||| || |||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  33160683 taagtgttctt-tgcagattttgatggagagctggaagagagagaaaacttggggaatcaaaggaggtaactttagggttgagagt-ctttgattagagt 33160586  T
Q  356 atctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa-tcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattaggg 444  Q
     ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || || ||||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  33160585 -tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagag 33160487  T
Q  445 tttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 542  Q
    || |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  33160486 tt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatggtggattggagagatcaatctctcc 33160390  T
Q  543 tccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33160389 tccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 33160348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808701
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3808779 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctctt 3808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 9183373 - 9183028
Alignment:
Q  245 gaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttc 343  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |    
T  9183373 gaagactactatataagttttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-c 9183276  T
Q  344 tttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-t 433  Q
    |||||||||||| |||| |||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||| || |    
T  9183275 tttgattagagt-tctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggt 9183177  T
Q  434 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagt 531  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9183176 agaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagaga 9183080  T
Q  532 acaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9183079 tcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9183028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589098
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589029 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593831
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21593762 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 415 - 580
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758191
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17758124 t-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972940
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2973009 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtgaaca 2972940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763158
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17763088 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 30125020 - 30125185
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  30125020 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 30125118  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatc 164  Q
    ||  || || |||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  30125119 ggacgccaaatcgtggcacgattttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatc 30125185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11857565 - 11857310
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc-ggatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||| | |||||    
T  11857565 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagcta-gtttgca 11857467  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||   ||||||| | |      
T  11857466 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtaacactgataaggacttgtc-aaccttgggtccgtt 11857368  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  11857367 gcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 11857310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5266610 - 5266454
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||| ||    
T  5266610 atcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcatt 5266512  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagatt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  5266511 aagtatccttgataaggactggtcataccttgaaacggacgcaaatcgtgacacgatt 5266454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 483 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5409164 - 5409066
Alignment:
Q  483 ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5409164 ccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaat 5409068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830124
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26830191 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 235
Target Start/End: Original strand, 28155133 - 28155309
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtta 158  Q
    |||||||||| || |  |||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||    
T  28155133 atcgtgacacgatctgagatgccgtgagccaagtttgcagggtgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggtta 28155232  T
Q  159 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||| |  ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  28155233 agtatctctgataaggactggtc-aacctggggaccgttgcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 28155309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 580
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043795
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  5043728 t-gatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 14741928 - 14742106
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgc-catgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   ||  | ||||||||  |||||    
T  14741928 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggtcgtgagctagt-ttgca 14742026  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggact 177  Q
    ||  || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14742027 ggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 14742106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 584
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569193
Alignment:
Q  329 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 426  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  427 aaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggatt 524  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||| |||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaaccttt------------gtaagaactcatt-gatagtggatt 16569134  T
Q  525 gaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16569135 ggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424826
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---ttttgtatcccttttgtaagaa 506  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  507 ctcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  22424897 ctcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22010191 - 22010427
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || | || |||  |||||    
T  22010191 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtaagttagt-ttgca 22010289  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  22010290 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgtt 22010388  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  22010389 gcaaatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatt 22010427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaagaactcatt 26954353  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26954352 -gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137409
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 28137479  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28137478 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| | |||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33211255 cattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 34151830 - 34151931
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34151830 ttgagtttgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattctgggatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 34151929  T
Q  99 gg 100  Q
    ||    
T  34151930 gg 34151931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6439081 - 6438899
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||   |  |||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||| | | |||| |    
T  6439081 ttgaaattggcttcaaatttatggtctggaagaacatagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctg 6438982  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    | |||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  6438981 gatgcataatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtc 6438899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800755
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgg 563  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgg 26800738  T
Q  564 accgaactgggtgaaca 580  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26800739 accgaactggatgaaca 26800755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6097977 - 6097860
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  6097977 ttgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcctgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 6097879  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttg 122  Q
     || ||||| |||||||||    
T  6097878 taaatcgtgacacgatttg 6097860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 466 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 603201 - 603082
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| |||   |||||||||| | |||  |||||||||| |||    
T  603201 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaagtt-gga 603105  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  603104 ccgaactgggtcaacaatctctt 603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16839225 - 16839092
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaa 201  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| |  |||     
T  16839225 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcag 16839127  T
Q  202 atcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  16839126 atcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 16839092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038926
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 3038974  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaa 557  Q
    | ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||  |||||||    
T  3038973 c-tttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6005927 - 6005822
Alignment:
Q  76 gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataagga 175  Q
    |||||||||||| | | |||| ||  ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  6005927 gatgccatgagccaagtttgctggaagcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataagga 6005828  T
Q  176 ctggtc 181  Q
    ||||||    
T  6005827 ctggtc 6005822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 177
Target Start/End: Original strand, 14737177 - 14737246
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggact 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  14737177 tcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 14737246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 530
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  510 atttgatagtggattgaagag 530  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  4045523 a-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 33330038 - 33330117
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33330038 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33330117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 33335535 - 33335614
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  33335535 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 33335614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5407237 - 5407176
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5407237 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 5407176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5411562 - 5411501
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5411562 taagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaagg 5411501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6097877 - 6097803
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca 200  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  6097877 aaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctggggacgtacgca 6097803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33211514 - 33211408
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||  ||| |||| ||||||||||||||     
T  33211514 taagtgttctt-tgcagattgtgaaggagaagttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttacagttgaggg-tctttgattagagt- 33211418  T
Q  357 tctcttgggt 366  Q
    ||||||||||    
T  33211417 tctcttgggt 33211408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 16652718 - 16652773
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  16652718 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctgaaagaacagggaaatcgtgacacgattt 16652773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5343959 - 5343880
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5343959 gcaaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 5343880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18234528 - 18234394
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  18234528 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 18234429  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
     ||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  18234428 tttttgaaggagagcttgaagagaaagaaacttgg 18234394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 279
Target Start/End: Original strand, 26253698 - 26253852
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaat 223  Q
    |||||||||||||||  | |||||| || ||||||| | |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||| |  |||||||||| |||| || ||||    
T  26253698 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtactttgtgacgtacgtatcaatcgtgacacgatttgg-aaat 26253796  T
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    |||| |||||||  | |||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  26253797 cgtggcacgattttatcagttggagacttgtatttaagtgttcttgttcagttttg 26253852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 4308 - 3624
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  4308 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgccacgattttggaatcgtgacacgattttaggtgccgtgagctagggttgcag 4209  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208 gggtgcaaat-cgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 4110  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttg----gagggagagtttga 293  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||| ||    
T  4109 gcaaatcgtgacacaattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcctgtgcagatttgaagtgagagagagttgga 4010  T
Q  294 agagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaag 393  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||    
T  4009 --agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--ag 3914  T
Q  394 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3913 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatt 3814  T
Q  494 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3813 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtg 3715  T
Q  593 ctt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3714 tttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 3624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 7122269 - 7122953
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7122269 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtgtggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 7122368  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122369 gggtgcaaat-cgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 7122467  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggaga-gtttgaaga 296  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| |    
T  7122468 gcaaatcgtgacacgattgggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaaggttgaa-a 7122566  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122567 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 7122666  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7122667 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattcct 7122766  T
Q  497 tttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  7122767 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttcttt-gtgttt 7122865  T
Q  596 -ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122866 attgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 7122953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 8395193 - 8395874
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8395193 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 8395292  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  8395293 gggtgcaaat-cgtagcacgatttgggaaaatcgtgacacaatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 8395391  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagt-ttgaaga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||  ||| | |    
T  8395392 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttgga-a 8395489  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8395490 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gaga 8395587  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395588 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 8395687  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt- 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8395688 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttta 8395786  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctcc-ttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395787 ttgttttcttcttccctctccattgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 8395874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 8392984 - 8393665
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8392984 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 8393083  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  | ||    
T  8393084 gggtgcaaat-cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcttttcttgggtggtac 8393182  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagt-ttgaaga 296  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||  ||| | |    
T  8393183 gcagatcgtgacacgatttgggaaatcgtgacacgatttcaacagaggaaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagggttgga-a 8393280  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8393281 gagagagacctgggaaatcaaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gaga 8393378  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393379 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 8393478  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt- 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  8393479 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgttta 8393577  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctcc-ttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393578 ttgttttcttcttccctctccattgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 8393665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 672
Target Start/End: Original strand, 5137877 - 5138552
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5137877 ttgagattgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 5137976  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5137977 gggtgcaaat-cgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacgga 5138075  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  5138076 cgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga-a 5138174  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||    
T  5138175 gagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgt--agaga 5138272  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5138273 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 5138372  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  5138373 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 5138471  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt--gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctag 672  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5138472 tattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctag 5138552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 672
Target Start/End: Original strand, 5135651 - 5136327
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5135651 ttgagattgtcttcaaatttgtggcttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttggtatcgtgacgcgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 5135750  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5135751 gggtgcaaat-cgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacgga 5135849  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  5135850 cgcaaatcgtgacacgattggacaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggttgga-a 5135948  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttggg-tataaaacatgggaaacaccttgtaaagag 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  5135949 gagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgt--agag 5136046  T
Q  396 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5136047 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattc 5136146  T
Q  495 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  5136147 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgt 5136245  T
Q  594 tt-ttgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgatt--gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctag 672  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5136246 ttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctag 5136327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 296 - 682
Target Start/End: Original strand, 7124785 - 7125172
Alignment:
Q  296 agagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagag 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7124785 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 7124884  T
Q  396 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7124885 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattcc 7124984  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7124985 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtt 7125083  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    | ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125084 tattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgtttt 7125172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 31495893 - 31495274
Alignment:
Q  7 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  31495893 ttgtcttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgc 31495795  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--a 201  Q
     || ||||| |||||||  || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  31495794 caaatcgtgacacgattgtgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtttcttgggacgaacgcacca 31495695  T
Q  202 atcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagag 301  Q
    |||||||||  |   ||||| |||||||||||||  | ||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  31495694 atcgtgacacaacctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggagggctaatatttaagtgttcttgtgcagatttgaagg-agagttggaagagagag 31495597  T
Q  302 agacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaa 399  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  31495596 aaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaa 31495498  T
Q  400 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatccct 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  31495497 tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggatt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctct 31495399  T
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 596  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  31495398 tttgtaagaactcatt-gatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctt 31495301  T
Q  597 tgttttcttcttccctctccttgtatc 623  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31495300 tgttttcctcttccctctccttttatc 31495274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 13992866 - 13992289
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||| || ||||||||||| ||     
T  13992866 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgtcgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 13992768  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |  |||||    
T  13992767 tcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcatgataaggactggtcataccttgtgacgtacgtatcaatcg 13992668  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13992667 tgacacgatctggaaa-tcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagcttgaagagagagaaac 13992569  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||    
T  13992568 ttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 13992470  T
Q  404 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatccctttt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  13992469 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt-- 13992373  T
Q  500 gtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13992372 gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct 13992289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 270 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 30000123 - 29999806
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagggg-caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  30000123 tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttt 30000026  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac 460  Q
      |||||| | ||||||||||   || || |||| ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  30000025 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 29999927  T
Q  461 ttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaag 558  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29999926 atgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 29999828  T
Q  559 tttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29999827 tttggaccgaactgggtgaaca 29999806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 7124491 - 7124681
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7124491 ttgagtttgtcttcaaatttgtggtgtggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgtgacacgatttcggatgccgtgagctagggttgcag 7124590  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttg 189  Q
    || ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124591 gggtgcaaat-cgtggcacgattgtgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttg 7124681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 56178965 - 56178633
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||| |||||||||||||     
T  56178965 taagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt- 56178869  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  56178868 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt- 56178770  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  56178769 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcc 56178672  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178671 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 56178633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24742575 - 24742295
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  24742575 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 24742477  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  24742476 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacctgggaacggac 24742377  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    |||||||||| || |||  || ||||||||||||||||    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  24742376 gcaaatcgtgccacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 24742295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5370415 - 5370079
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagggg-caactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  5370415 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagaacttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattatagt- 5370319  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa----ggtagaaattaggg 444  Q
    ||||||||| |   |||||| | |||||| |||   || || |||||||||||||||||       |||||||||| |||||    ||||||||||||||    
T  5370318 tctcttgggctgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattaggg 5370219  T
Q  445 tttgttcatagtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctc 541  Q
    || |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||||    
T  5370218 tt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggactagagagatcaatctctc 5370122  T
Q  542 ctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5370121 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 5370079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 292 - 584
Target Start/End: Original strand, 48142914 - 48143215
Alignment:
Q  292 gaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgt 389  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||     
T  48142914 gaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 48143011  T
Q  390 aa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttctt 478  Q
       || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||    
T  48143012 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctt 48143110  T
Q  479 gtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtga 577  Q
    |||||| ||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48143111 gtaacccttttgtatctcttca-taagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtga 48143208  T
Q  578 acaatct 584  Q
    |||||||    
T  48143209 acaatct 48143215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 52095691 - 52095361
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||  |||||||||||||     
T  52095691 taagtgttctt-tgtagattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggga-ctttgattagagt- 52095595  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52095594 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt 52095495  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  52095494 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaaatc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctc 52095398  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095397 cagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat 52095361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 9927775 - 9927455
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||      
T  9927775 tgcagattttgaaggagggcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttg 9927678  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaa 459  Q
      |||||| | ||||||||||   || || ||||| ||||||||||       |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||    
T  9927677 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 9927579  T
Q  460 cttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaa 557  Q
    |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  9927578 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaa 9927481  T
Q  558 gtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||    
T  9927480 g-ttggaccgaactgagtcaacaatct 9927455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 416 - 587
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209889
Alignment:
Q  416 tgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    | |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209815 t-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 2209889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 582
Target Start/End: Original strand, 37740465 - 37740794
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  37740465 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcatgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggt-ctttgattagagt- 37740561  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttt 447  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||| || |||||||||||     
T  37740562 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt- 37740660  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  37740661 gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccc 37740758  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    |||   ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  37740759 agatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaat 37740794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51521048 - 51520793
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||  |||||    
T  51521048 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggggccgtgagctagt-ttgca 51520950  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || ||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| | |||    
T  51520949 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcatgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactgatc-taccttgggtcagac 51520851  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||   ||||||||| ||||||    
T  51520850 gcaaatcgtgacacgatttgggaaatcgtggcacaattgcttcagaggaaggctagta 51520793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 28467990 - 28468217
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  28467990 cttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtaacacgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 28468088  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||    
T  28468089 tcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgtacaaatcg 28468188  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||    
T  28468189 tgacacgacttgg-aaatcgtgacacgatt 28468217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 412 - 577
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtga 577  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12739848 - 12739547
Alignment:
Q  290 ttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacacctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | |||||||||    
T  12739848 ttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 12739751  T
Q  388 -gtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttct 477  Q
     |   || |  |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12739750 aggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttct 12739652  T
Q  478 tgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtg 576  Q
    |||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  12739651 tgtaacccatttgtatctattt-gtatgaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtc 12739555  T
Q  577 aacaatct 584  Q
    ||||||||    
T  12739554 aacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26175965 - 26175633
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||     
T  26175965 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattaaagt- 26175869  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggt-agaaattagggtt 446  Q
    ||| ||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26175868 tctgttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt 26175769  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  26175768 -gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 26175672  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26175671 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703669
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  46703598 tcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 56141513 - 56141770
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |  | | ||||||||  |||||    
T  56141513 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttggaggggtcgtgagctagt-ttgca 56141611  T
Q  98 gggtgc-aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    ||  || ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||    
T  56141612 ggacgccaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcaga 56141710  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
     ||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  56141711 tgcaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 56141770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34570777 - 34570411
Alignment:
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-gg 322  Q
    ||||||||||||   ||||  |||||||| ||  || |||||||| ||||||||| || |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34570777 cgtgacacgattttgacagctgaagactactatatatgtgttctt-tgcagattttgaaggagagctggaacagagagaaacttgggaaatcaaaggagg 34570679  T
Q  323 caactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg------ 414  Q
     | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||| ||||    || || |||||||||||||||||          
T  34570678 tagctttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt 34570581  T
Q  415 -gtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctt-ttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||    
T  34570580 ggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaagaactca 34570483  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  34570482 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 34570411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 45347324 - 45347501
Alignment:
Q  6 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||| |||||||||| |||   |||||| ||||| | | |||| || |||    
T  45347324 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacaaagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattagagatgccgtgagccaagtttgctggatgc 45347423  T
Q  104 aaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  45347424 aaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 45347501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 5429518 - 5429850
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  5429518 taagtgttctt-tgcagaccttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 5429614  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5429615 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt 5429714  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
      ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |    
T  5429715 a-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccc 5429811  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5429812 cagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29761196 - 29761048
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtt 157  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  29761196 atcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgtt 29761098  T
Q  158 aagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  29761097 aagtatccttgataaggactggtcataccttggtacggacgcaaatcgtg 29761048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 430 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12744074 - 12743922
Alignment:
Q  430 aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 527  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12744074 aggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 12743978  T
Q  528 gagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||  |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12743977 gagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 430 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12745463 - 12745311
Alignment:
Q  430 aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaa 527  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12745463 aggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattgga 12745367  T
Q  528 gagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||  |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12745366 gagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36463459 c-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364410
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||||  ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26364334 catta-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttctt 26364410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038408
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||| |||||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgttt-gtaaggactca 47038480  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47038479 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 587
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119714
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||    
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||| | |||| ||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12119640 ttt-atagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttctt 12119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 580
Target Start/End: Original strand, 6655976 - 6656123
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6655976 ggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 6656072  T
Q  529 agtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6656073 agatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648306
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8648237 catt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 9223901 - 9224157
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc-ggatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| ||||||| | |||||    
T  9223901 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagcta-gtttgca 9223999  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  9224000 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgtt 9224098  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||    ||||||||||||||||    
T  9224099 gcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacaatttcttcagaggaagactagta 9224157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 9228688 - 9228944
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || |||||| |  |||||    
T  9228688 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctcgt-ttgca 9228786  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  9228787 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgtt 9228885  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  9228886 gcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 9228944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073560
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  12073490 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18856307 - 18856125
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||| | | |||| |    
T  18856307 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctg 18856208  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    | |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18856207 gatgcaaaatcgtggcaagatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 18856125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632612
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40632543 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639593
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41639524 catc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673848
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 50673864  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||| ||||||||    
T  50673863 ccgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Original strand, 31985236 - 31985419
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaat 223  Q
    |||||||||||||||  | |||||| || ||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||| |||| ||||| |    
T  31985236 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagttttcaggataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgcatcaatcgtgacacgatttggaaa-t 31985334  T
Q  224 cgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| |||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  31985335 cgtggcacgattttatcagttgaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttga-agtgagcttgaagagagagaaacttgg 31985419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229722
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactc 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||  || |||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactc 37229791  T
Q  510 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37229790 attt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtaaaca 37229722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883194
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54883118 catt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttctt 54883194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542180
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaac 507  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  508 tcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    || || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6542250 tcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 6542180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994693
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccc-tttgtaagaact 36994621  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    || |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |  || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36994622 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 36994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc- 46147461  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46147460 tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 580
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379548
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  379481 t-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaaca 379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588126
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | || | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4588057 catt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttggaccaaactgggtaaaca 4588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 560
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtt 560  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8665506 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416962
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27417035 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687179
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggta-gaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45687252 catt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 48893751 - 48893635
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  48893751 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgga 48893655  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  48893654 ccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 52082986 - 52082660
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  52082986 taagtgttctt-tgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 52082890  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||| |   |||||| | ||||||||| |   || || ||||||||| ||||       ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  52082889 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactaggg-t 52082791  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
    ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| || ||||||||||       |||  || |||||||||    
T  52082790 tgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaaatc-tttgatagtg-------gagatcattctctcctc 52082700  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  52082699 cagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct 52082660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 466 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 50262814 - 50262694
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||   |||||| |||||||||| ||||||   |||||    
T  50262814 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgga 50262717  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50262716 ccgaactgggtgaacaatctctt 50262694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12748054 - 12747794
Alignment:
Q  290 ttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacacctt 387  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | |||||||||    
T  12748054 ttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 12747957  T
Q  388 -gtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttct 477  Q
     |   || |  |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  12747956 aggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttct 12747858  T
Q  478 tgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 542  Q
    |||||||  ||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  12747857 tgtaacccatttgtatctattt-gtatgaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199906
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 54199977  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    || ||||||||| |||  ||||  || ||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54199976 ca-ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaag-ttgga-cgaactgggtcaacaat 54199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207843
Alignment:
Q  419 gattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactcatttgat 516  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| ||||  ||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgtaagaactca-ttgat 5207906  T
Q  517 agtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5207905 agtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggtaaaca 5207843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Original strand, 5268852 - 5268986
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||  |||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  5268852 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 5268951  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5268952 attttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 5268986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5871991
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt-gcaagaact 5871917  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | ||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5871918 c-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggag 12744099  T
Q  529 agtacaatctct 540  Q
    ||  ||||||||    
T  12744098 agatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 572
Target Start/End: Original strand, 35662496 - 35662600
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  35662496 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttgga 35662592  T
Q  565 ccgaactg 572  Q
    ||||||||    
T  35662593 ccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Original strand, 45356861 - 45356982
Alignment:
Q  60 tcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaa 159  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||| || |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || |||||    
T  45356861 tcgtgacacgatttgagatgccgtgagccaagtttgctggatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaa 45356960  T
Q  160 gtatccttgataaggactggtc 181  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  45356961 gtatcactgataaggactggtc 45356982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 52093993 - 52093887
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  52093993 taagtgttctt-tgcaaattttgaaggacagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 52093897  T
Q  357 tctcttgggt 366  Q
    ||||||||||    
T  52093896 tctcttgggt 52093887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3814603 - 3814422
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || | ||| | | |||||    
T  3814603 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtgaccgtaagc-aagtttgca 3814505  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
     |  || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3814504 agacgccaaatcgtgtcacgatttggg-aaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 3814422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5733245 - 5733062
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |  ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||   | | |||||    
T  5733245 ttgatattggcttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgaagcaagtttgca 5733146  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||  || || ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5733145 ggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtc 5733062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 177
Target Start/End: Original strand, 18712296 - 18712435
Alignment:
Q  38 aaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgaca 136  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||   || || ||||||||  |||||||  || || |||||||||||| | || |||||||||||    
T  18712296 aaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgaca 18712394  T
Q  137 cgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggact 177  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  18712395 cgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 18712435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 52467519 - 52467351
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||  |    
T  52467519 gtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaataactt-t 52467423  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52467422 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12745584 - 12745476
Alignment:
Q  431 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaag 528  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12745584 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggag 12745488  T
Q  529 agtacaatctct 540  Q
    ||  ||||||||    
T  12745487 agatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699447
Alignment:
Q  438 attagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaa 535  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattt-ataatggattggagagatcaa 26699487  T
Q  536 tctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggt 575  Q
    |||||   |||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  26699486 tctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Original strand, 31474206 - 31474318
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  31474206 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttgga 31474302  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31474303 ccgaactgggtaaaca 31474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 54867598 - 54867490
Alignment:
Q  201 aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagaga 300  Q
    ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||   ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  54867598 aatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactactatataagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttgaagagaga 54867499  T
Q  301 gagacttgg 309  Q
    || ||||||    
T  54867498 gaaacttgg 54867490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Original strand, 8689149 - 8689282
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  8689149 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgccacgatttggaaaa-cgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 8689247  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| || |||||| |||||| |||||| ||||||    
T  8689248 attttgaaggagagcttgaagtgagagaaacttgg 8689282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10047743 - 10047692
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10047743 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 10047692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Original strand, 36314882 - 36315016
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  36314882 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 36314981  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| || |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  36314982 attttgaaggagagcttgaagagagataaacttgg 36315016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 309
Target Start/End: Original strand, 36329091 - 36329225
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  36329091 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 36329190  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| || |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  36329191 attttgaaggagagcttgaagagagataaacttgg 36329225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 486 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 13009536 - 13009441
Alignment:
Q  486 tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||| |  |||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  13009536 tttgtatcccttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaag-ttagaccgaactgtgtcaacaatct 13009441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18860519 - 18860450
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacac 68  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18860519 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacac 18860450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Original strand, 29254287 - 29254394
Alignment:
Q  212 gattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttggga 311  Q
    |||| |||||| ||||||||||||   ||||  |||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  29254287 gatttggaaaaacgtgacacgattttgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tgcagattttgaaggtgaggttgtagagagagaaacttggga 29254385  T
Q  312 aatcaaagg 320  Q
    |||||||||    
T  29254386 aatcaaagg 29254394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 6743150 - 6743201
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  6743150 taagtgttcttgtgcagattttgaagtagagcttgaagagagagaaacttgg 6743201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 584
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254665
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29254580 tttgtaagaactcgtt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 29254665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 51337064 - 51337231
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaatta-gggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| | |||| ||| | ||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51337064 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagctt-ttaagataatttattataacccttttgtatctctttt-taagaact 51337161  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    || ||||||||| |||  ||||  ||||||||||  || |  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51337162 ca-ttgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 51337231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 320
Target Start/End: Original strand, 36994375 - 36994425
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg 320  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36994375 tgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttggaaaatcaaagg 36994425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 417 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967910
Alignment:
Q  417 gagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 498  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | | || |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44967992 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccatttgtatctcttt 44967910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 54200201 - 54200129
Alignment:
Q  293 aagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggt 366  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  54200201 aagagagagaaacttaggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggt 54200129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 530
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 24969209  T
Q  509 catttgatagtggattgaagag 530  Q
     | |||||||||||||| ||||    
T  24969210 -aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142473
Alignment:
Q  416 tgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 484  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc 48142473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 55085532 - 55085445
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgt-aaccttttgtatcccttt 498  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  55085532 ttggtgagattggaaaataggtagaaattaagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctcttt 55085445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Original strand, 3439090 - 3439772
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcgga-tgccatgagctagggttgca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  3439090 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattgtggcatcgtgacacgatttcggggtgccgtgagctagg-ttgca 3439188  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  3439189 gggtgcaaaatcgtgacacgatttgggaaa-tcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtac 3439287  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagag 297  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  3439288 gcatatcgtggcacgattgggaaaatcgtgacacgatttcaacagaggaagactagta-taaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagag 3439386  T
Q  298 agagaga--cttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3439387 agagagagacttgagaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 3439486  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 494  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439487 gaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 3439586  T
Q  495 cttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3439587 cttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgct 3439685  T
Q  595 tttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439686 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 3439772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 42575907 - 42575223
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42575907 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggatcgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 42575808  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42575807 gggtgcaaat-cgtgtcacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtctttccttgggacgga 42575709  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagag--tttgaa 294  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |    
T  42575708 cgcaaatcgtgacacgattgggcaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagagagaggagttgga 42575609  T
Q  295 gagagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaaga 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||    
T  42575608 -agagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--aga 42575512  T
Q  395 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatc 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42575511 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatt 42575412  T
Q  494 ccttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42575411 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtg 42575313  T
Q  593 ctt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgatt-gttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42575312 tttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgtttggttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 42575223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 682
Target Start/End: Original strand, 25689604 - 25690224
Alignment:
Q  59 atcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgtta 158  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25689604 atcgtgacacgatttcgggtgccgtgagctagg-ttgcagggtgcaaaatcgtggcacgattgtgggaaatcgtcacacgatcgtgaaacttgctcgtta 25689702  T
Q  159 agtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25689703 agtatccttgataaggactggtcgttccttggtttgtacacaaatcgtgacacgattgagaaaatcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagtattt 25689802  T
Q  259 aagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggggcaa-ctctagggtttagggttctttgattagagtat 357  Q
    |||||||||||||||  |||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689803 aagtgttcttgtgcatctttgaaga-agaggttgga-agagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtat 25689900  T
Q  358 ctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtg 457  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25689901 ctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtg 25690000  T
Q  458 aacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaa 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25690001 aacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaa 25690099  T
Q  558 gtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgttt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || ||||||| || |||||||||    
T  25690100 gtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctccccttttatcttgtgagtg-tgttttgtgtttctcacttgttt 25690198  T
Q  657 cctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25690199 cctagattagatctaggtggtgtttt 25690224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 679
Target Start/End: Original strand, 15290145 - 15290791
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15290145 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggattgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 15290244  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15290245 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacgga 15290343  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    ||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                  
T  15290344 cgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag-------------- 15290409  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  15290410 -agagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 15290506  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15290507 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 15290606  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  15290607 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gtgtt 15290705  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 679  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15290706 tattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgt 15290791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 679
Target Start/End: Original strand, 15470514 - 15471160
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15470514 ttgagattgtcttcaaatttgtggtttggaagaacagggaaatcgtgacacgattttgggattgcgacacgatttcggatgccgtgagttagggttgcag 15470613  T
Q  99 gg-tgcaaattcgtggcacgattt-gggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15470614 gggtgcaaat-cgtgacacgattttgggaaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacgga 15470712  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaaga 296  Q
    ||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                  
T  15470713 cgcaaatc--------------------gtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaag-------------- 15470778  T
Q  297 gagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  15470779 -agagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agaga 15470875  T
Q  397 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15470876 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc 15470975  T
Q  496 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 594  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  15470976 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gtgtt 15471074  T
Q  595 t-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 679  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15471075 tattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgt 15471160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Original strand, 2627331 - 2628011
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||| || ||||| ||||| ||     
T  2627331 cttcaaatttgtggtctggaagaacagggaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgattccgtgagct-ggtttgcatggtgccaaa 2627429  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||  | | |    
T  2627430 tcgtgacacgattttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggattggtcgtttcttgtgacgtacgcaccatttg 2627529  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||  | ||| |||||||||||||  | |   ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  2627530 tgacacgatctgtaaa-tcgtgacacgattttatcgttggagggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttgaagg-agagttggaagagagagaaac 2627627  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2627628 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcat 2627726  T
Q  404 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatcccttttg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||    
T  2627727 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtg 2627825  T
Q  501 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 600  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  2627826 taagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctc-ttggtgtctttgtt 2627923  T
Q  601 ttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  2627924 ttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 2628011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34254657 - 34254327
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  34254657 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 34254561  T
Q  357 tctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgt 449  Q
    ||||||||||   | |||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34254560 tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gt 34254462  T
Q  450 tcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccag 547  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||    
T  34254461 tctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctag 34254364  T
Q  548 agcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254363 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34254327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 17982492 - 17982825
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  17982492 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 17982588  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17982589 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt 17982688  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17982689 -gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 17982785  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982786 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 17982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 689
Target Start/End: Original strand, 31218096 - 31218530
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  31218096 taagtgttctt-tgtagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 31218192  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31218193 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt 31218292  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31218293 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctc 31218389  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtg 644  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||   ||||  |||||||| ||||||||| ||  || ||||||      
T  31218390 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgctt-atgttttgtgct 31218484  T
Q  645 tcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  31218485 tttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgat 31218530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34256833 - 34256503
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  34256833 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagaaagataaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 34256737  T
Q  357 tctcttgggtataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgt 449  Q
    | ||||||||   |||||| | ||||||||||    | || |||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  34256736 tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gt 34256638  T
Q  450 tcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccag 547  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||    
T  34256637 tctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctag 34256540  T
Q  548 agcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256539 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34256503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 270 - 680
Target Start/End: Original strand, 42498044 - 42498459
Alignment:
Q  270 tgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtat 368  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||      
T  42498044 tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttg 42498141  T
Q  369 a-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtga 458  Q
      |||| | | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||    
T  42498142 ggaaacgttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtga 42498240  T
Q  459 acttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtca 556  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  42498241 acttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 42498338  T
Q  557 agtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtt 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| | ||||  |||||||| |||||| || |||| | ||||||| |  ||| ||| |    
T  42498339 agtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttccctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgat 42498434  T
Q  656 tcctagattagatctaggtggtgtt 680  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  42498435 tcctagattagatctaggtgttgtt 42498459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 19945689 - 19945355
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  19945689 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagacaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagt-ctttgattagagt- 19945593  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  19945592 tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt 19945493  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
     |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19945492 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttgg-aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcct 19945396  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19945395 cgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 19945355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 44303693 - 44304027
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagggg-caactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  44303693 taagtgttctt-tgcagattttgaaagagagcttgaagagagagaaacttgagaaatcaaaggaaacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt- 44303789  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa---ggtagaaattagggt 445  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  44303790 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggt 44303889  T
Q  446 ttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcct 543  Q
    | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44303890 t-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttt-taagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcct 44303986  T
Q  544 ccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44303987 ccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct 44304027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1746547 - 1746216
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||     
T  1746547 taagtgttctt-tgcagattttgaagaagagctggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtcctt-gattagagt- 1746451  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtt 446  Q
    |||||| |||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  1746450 tctctttggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggtt 1746351  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1746350 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctc 1746255  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 583  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746254 catagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 1746216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 4759536 - 4759791
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  4759536 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 4759634  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  4759635 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacggac 4759734  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  4759735 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtgacacgatttcttcagaggaagactagta 4759791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36980012 - 36979741
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  36980012 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 36979914  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||  | ||    
T  36979913 ggacgccaaatcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtcataccttgggttgtac 36979814  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtg 271  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36979813 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaaggctagtatttaagtgttcttgtg 36979741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30656280 - 30656025
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  30656280 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 30656182  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||    
T  30656181 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagac 30656082  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  30656081 gcaaatcgtgacacgatctgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 30656025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 18852629 - 18852884
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  18852629 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgatacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 18852727  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  18852728 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcagac 18852827  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  18852828 gcagatcgtgacacgatttgg-aaatcgtggcacgattgcttcagaggaagactagta 18852884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 272
Target Start/End: Original strand, 1261428 - 1261692
Alignment:
Q  12 ttcaaatttgtggtctggaagaaggaa--aatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |  ||||| || |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| || |    
T  1261428 ttcaaatttgtggtttggaagaacacagaaatcgcgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaat 1261526  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgt 206  Q
    |||| |||||| | || |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||  ||||||||    
T  1261527 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacatacgttcaaatcgt 1261626  T
Q  207 gacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactt-aagtgttcttgtgc 272  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1261627 gacacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagaggaaggctagtatttaaagtgttcttgtgc 1261692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 214 - 584
Target Start/End: Original strand, 15212582 - 15212957
Alignment:
Q  214 ttaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||  ||  ||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15212582 ttaggaaaat-gtgacacgattgtgacagctgaagactgctatataagtgttctt-tacagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaa 15212679  T
Q  314 tcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgt 410  Q
    ||||| | || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || ||||||||| |||    
T  15212680 tcaaatgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgt 15212777  T
Q  411 cttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttg 500  Q
    ||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |    
T  15212778 cttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-g 15212875  T
Q  501 taagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15212876 taagaactcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 15212957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 43036262 - 43036594
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  43036262 taagtgttctt-tgcagattttgaatgagaggttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt- 43036358  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43036359 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt 43036458  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  43036459 -gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctc 43036555  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43036556 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 43036594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 18870023 - 18870278
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||| | ||||||||  |||||    
T  18870023 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagatgtcgtgagctagt-ttgca 18870121  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  18870122 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggactggtcataccttgggtcagac 18870221  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  18870222 gcagatcgtgacacgatt-tgaaaatcgtggcacgattgcttcagagaaagactagta 18870278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33037289 - 33037505
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||    
T  33037289 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgca 33037387  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  33037388 ggacgccaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtcatgccttggaacggac 33037487  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagatt 215  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33037488 gcaaatcgtgacacgatt 33037505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12702967 - 12702631
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  12702967 taagtgttctt-tgcatattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggt-ctttgattagagt- 12702871  T
Q  357 tctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa------ggtagaaattag 442  Q
    ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || ||||||| |||||||||       ||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  12702870 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattag 12702771  T
Q  443 ggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctct 540  Q
    |||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  12702770 ggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctcttt-gtaagaactcatt-gatattggattggagagatcaatctct 12702674  T
Q  541 cctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    || | |||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12702673 cccctagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 12702631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26288504 - 26288234
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  26288504 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26288406  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| ||| || | || |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| |    
T  26288405 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatag 26288306  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    || || ||   || ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26288305 tgtcacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26288234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26301761 - 26301491
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  26301761 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26301663  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| ||| || | || |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| |    
T  26301662 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatag 26301563  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    || || ||   || ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26301562 tgtcacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26313755 - 26313485
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  26313755 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacatgattttgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 26313657  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcg 205  Q
    ||||| ||| || | || |||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  | ||| |    
T  26313656 tcgtgacacaatcttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatag 26313557  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    || || ||   || ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26313556 tgtcacgacctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 26313485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 7289429 - 7289686
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc--ggatgccatgagctagggttgc 96  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||  ||||||||||||  ||||    
T  7289429 ttgatattgacttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatagtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaagggagccatgagctagt-ttgc 7289527  T
Q  97 agggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgga 196  Q
    |||  || || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||  | ||    
T  7289528 aggacgccaaatcgtgacacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttggatcaga 7289626  T
Q  197 cgcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
     ||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  7289627 tgcaaatcgtgacacgatcttgggaaatcgtggcacgatttcttcagaggaagactagta 7289686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 258 - 584
Target Start/End: Original strand, 27811117 - 27811449
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||| || || | ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  27811117 taagtgttctt-tgcatattttgaaggaaagctggaagagagagaaaattgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggt-ctttgattagagt- 27811213  T
Q  357 tctcttgggtat-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtt 446  Q
    |||||| |||   ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27811214 tctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt 27811313  T
Q  447 tgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctc 544  Q
     |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  27811314 -gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaacccatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccc 27811410  T
Q  545 cagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27811411 cagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434992
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42435061 catt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 10683741 - 10683923
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||    
T  10683741 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgca 10683839  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10683840 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtc 10683923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303667
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 3303741  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3303740 catt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283691
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4283622 catt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 33352247  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33352248 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655567
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655498 catt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 39784327 - 39784509
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||| | | |||| |    
T  39784327 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctg 39784426  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    | |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   |||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  39784427 gatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatcactgataaggactggtc 39784509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 584
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||     
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactc- 40321178  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40321179 tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 584
Target Start/End: Original strand, 4731484 - 4731829
Alignment:
Q  245 gaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttc 343  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| || |||||| || |||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| || |||| ||||||| ||||| |    
T  4731484 gaagactactatataagtgttctt-tgtagattttgaaggagcggttgaagagagagaaacttgaaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-c 4731581  T
Q  344 tttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaagg-t 433  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| || |    
T  4731582 tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggt 4731680  T
Q  434 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagt 531  Q
    ||||||||||||| | || | |||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  4731681 agaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagaga 4731777  T
Q  532 acaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     | |||||||| |||||   ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  4731778 tcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatct 4731829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6311928 - 6311677
Alignment:
Q  6 attgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtg 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||||  |    
T  6311928 attggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcatgacacgattttggcatcgtgacacgatttcaaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacg 6311830  T
Q  103 caaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaa 202  Q
    | || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||   ||||||| | || |||||    
T  6311829 ccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggacttgtc-aaccttgggtcagatgcaaa 6311731  T
Q  203 tcgtgacaagatt-aggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    |||||||| ||||  || |||||||| ||| |||    ||||||||||||||||    
T  6311730 tcgtgacacgattgtgggaaatcgtggcacaatttcttcagaggaagactagta 6311677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 560
Target Start/End: Original strand, 30143181 - 30143488
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagta 356  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  30143181 taagtgttctt-tgtagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt- 30143277  T
Q  357 tctcttggg-tataaaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaatcattgagtgt-----cttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttg 448  Q
    ||||||||| |   |||||| | |||||| || |   || || |||||||| || |      ||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  30143278 tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgtgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttg 30143376  T
Q  449 ttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcca 546  Q
    ||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  30143377 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctccccca 30143474  T
Q  547 gagcaggtcaagtt 560  Q
    ||  ||||||||||    
T  30143475 gataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 1345536 - 1345368
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||  || |  |||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||    
T  1345536 gtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt-gaaagaactcat 1345439  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1345438 t-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct 1345368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 584
Target Start/End: Original strand, 5689326 - 5689442
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||   ||||||| |||||    
T  5689326 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttgga 5689422  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  5689423 ccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221916
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  40221843 cgtt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 40221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965692
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||| | ||| ||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctc-tttgtaagaactc 8965761  T
Q  510 atttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    | ||||||||| || | ||||   ||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8965760 a-ttgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19948650 - 19948554
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  19948650 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagag-tctttgattagagt 19948554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 542
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctcttt-gtaagaactcat 44353893  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 542  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  44353894 t-gatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 487 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743211
Alignment:
Q  487 ttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6599072  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6599073 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaagaactcat 6674525  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6674526 t-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930193
Alignment:
Q  414 ggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || | |||| || ||  |||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| ||    
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10930267 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 554
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactca 510  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  511 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggt 554  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  40328880 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366612
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  |||||||||| |||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaagtt-gga 41366632  T
Q  565 ccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  41366631 ccgaactgggacaacaatct 41366612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 574
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactggg 574  Q
    | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 530
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 9765842  T
Q  509 catttgatagtggattgaagag 530  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  9765843 ca-ttgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 542
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291737
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcc 542  Q
    | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  30291705 c-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc 30291737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Original strand, 11384040 - 11384152
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||   | ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  11384040 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaacccatt-gatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagtt-gga 11384136  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||||||||||    
T  11384137 ccgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 366
Target Start/End: Original strand, 4733631 - 4733754
Alignment:
Q  245 gaagactagtacttaagtgttcttgt-gcagatttggagggagagtttgaagagagagag--acttgggaaatc-aaaggggcaactctagggtttaggg 340  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||    
T  4733631 gaagactactatataagtgttctttttgcagattttgaaggagaggttgaagagagagagaaacttgggaaatcaaaagaggtaactttagggttgaggg 4733730  T
Q  341 ttctttgattagagtatctcttgggt 366  Q
     |||||||||||||| ||||||||||    
T  4733731 -tctttgattagagt-tctcttgggt 4733754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491693
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaa-aggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| | || |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgtaagaact 19491770  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |  ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||| || ||||| |  |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  19491769 c-gttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtc-atattggaccgaactaggtcaacaatatctt 19491693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 278
Target Start/End: Original strand, 31043131 - 31043189
Alignment:
Q  220 aaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagattt 278  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31043131 aaatcgtgacacgattttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattt 31043189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 412 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 1292534  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactggg 574  Q
    || |||||||||||||  |||    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 ca-ttgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 31042921 - 31043032
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  31042921 cttcaaatttgtggtctggaagaatagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtggtgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 31043019  T
Q  108 tcgtggcacgatt 120  Q
    ||||| |||||||    
T  31043020 tcgtgacacgatt 31043032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 25327666 - 25327844
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgcca-tgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||   || |  ||||||||  |||||    
T  25327666 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcttcgtggcacgatttcaagtggctgtgagctagt-ttgca 25327764  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggact 177  Q
    ||  || || || ||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  25327765 ggacgccaaatcatggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 25327844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 5702215 - 5702266
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5702215 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagaggttgaagagagagaaacttgg 5702266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7412702 - 7412651
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7412702 taagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 7412651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35745873 - 35745794
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35745873 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctatgataaggactggtc 35745794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 279
Target Start/End: Original strand, 10688710 - 10688882
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||   ||||||| | || ||||||||||    
T  10688710 tcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggacttgtc-aaccttgggtcagatgcaaatcgtg 10688808  T
Q  208 acaagatt-aggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtactta-agtgttcttgtgcagatttg 279  Q
    ||| ||||  || |||||||| ||| |||    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  10688809 acacgattgtgggaaatcgtggcacaatttcttcagaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagttttg 10688882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 25689563 - 25689596
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689563 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa 25689596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 580
Target Start/End: Original strand, 4162552 - 4162663
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  4162552 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactca-ttgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttgga 4162647  T
Q  565 ccgaactgggtgaaca 580  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  4162648 ccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4456390 - 4456339
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4456390 taagtgttcttgtgcagattttgaagaagagcttgaagagagagaaacttgg 4456339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 309
Target Start/End: Original strand, 4696343 - 4696394
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4696343 taagggttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 4696394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 580
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733873
Alignment:
Q  497 tttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4733792 tttgtaagaattcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 575
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015241
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt--taggaactca-ttgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttgga 10015230  T
Q  565 ccgaactgggt 575  Q
    |||||||||||    
T  10015231 ccgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106087
Alignment:
Q  466 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttgga 564  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc--ttttgtaagaactca-ttgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttgga 18106098  T
Q  565 ccgaactgggt 575  Q
    |||||||||||    
T  18106097 ccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 366
Target Start/End: Original strand, 33352022 - 33352095
Alignment:
Q  292 gaagagagagagacttgggaaatcaaag-gggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggt 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33352022 gaagagagagaaacttgggaaatcaaagaaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggt 33352095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7412939 - 7412787
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatt-tcggatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |   ||||| |||||| || ||||||||||  ||     
T  7412939 cttcaaatttgtggtttggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacacgattctgtaatgccgtgagct-ggtttgcagggtgtcaaa 7412841  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagt 161  Q
    |||||| || |||| |  |||||||||||||||  | |||||| || |||||||    
T  7412840 tcgtggtacaattttgtgaaatcgtgacacgattttcaaacttgctggttaagt 7412787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Original strand, 31043017 - 31043125
Alignment:
Q  126 aaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacg--caaatcgtgacaagattaggaaaat 223  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | |||||||||| || | || ||||    
T  31043017 aaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgacttgg-aaat 31043115  T
Q  224 cgtgacacga 233  Q
    ||||||||||    
T  31043116 cgtgacacga 31043125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 492
Target Start/End: Original strand, 41266982 - 41267051
Alignment:
Q  425 gaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtat 492  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  41266982 gaaaatggtagaaattaggttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttgtaactcttttgtat 41267051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 11740 - 11054
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  11740 cttcaaaattgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcatgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 11642  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcg 205  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  11641 tcgtgacacgatttgggaaa-tcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcaccaatcg 11543  T
Q  206 tgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagac 305  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  11542 tgacacgatctgg-aaatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttga-agagagttggaagagagagaaac 11445  T
Q  306 ttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttggg-tataaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 403  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |   |||||| | ||||||||||   || |  ||||||    
T  11444 ttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatgg-tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcat 11346  T
Q  404 tgagtg------tcttggtgagattgg--gaaaaaggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-ccttttgtatc 493  Q
    ||||||      |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11345 tgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatc 11247  T
Q  494 ccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 593  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  11246 tcttttgtaagaactc-gttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 11150  T
Q  594 ttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  11149 ctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttg-tggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 11054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 9295 - 8628
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  9295 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 9197  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtg 207  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||           
T  9196 tcgtgacatgatttgggaaa-tcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcacc----- 9103  T
Q  208 acaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagactt 307  Q
                 |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||    
T  9102 -------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaag-agagttggaagagagagaaactt 9017  T
Q  308 gggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattg 405  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    |||||| | ||| ||||||   || |  || |||||    
T  9016 gggaaatcaaagggagtaactctaggctttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccattg 8918  T
Q  406 agtgtcttg------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtatccc 495  Q
    |||||||||      |||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  8917 agtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctc 8819  T
Q  496 ttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 595  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  8818 ttttgtaagaactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtct 8722  T
Q  596 ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  8721 ttgttttcctcttccctcttcttttatcttgtgcttg-tggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgat 8628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 584
Target Start/End: Original strand, 524 - 1087
Alignment:
Q  38 aaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgaca 136  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||| | |   ||||||||||    
T  524 aaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagctagt-ttgcagggtgccaaatcgtgacacgatcttgaggaatcgtgaca 622  T
Q  137 cgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgat 234  Q
    ||||  | ||| || |||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  623 cgattttcaaatttgctcgttaagtttccaggatagggactggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaattgtgacacgatttggaaa-tcgtgacacgat 721  T
Q  235 tggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttg----------aagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gc 323  Q
    |  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||          |||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  722 tttatcagtggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagattttggaggagagcttggatgagctagaagagagagaaacttgggaaatcaaaggcagc 821  T
Q  324 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtata-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gt 416  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||      ||    
T  822 aactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggt 919  T
Q  417 gagattgggaaaaa--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatt 512  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   || ||||||||    
T  920 gagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg--aacaactcatt 1016  T
Q  513 tgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1017 -gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 259 - 689
Target Start/End: Original strand, 434373 - 434807
Alignment:
Q  259 aagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtat 357  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  434373 aagtgttctt-tgcagattttgaaggtgagcttgaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-t 434469  T
Q  358 ctcttgggtat-aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaa--ggtagaaattagggttt 447  Q
    |||||||||   ||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||     
T  434470 ctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt- 434568  T
Q  448 gttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcc 545  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  434569 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcc 434666  T
Q  546 agagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgt 645  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||| || ||||||  |    
T  434667 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tatttggtgtgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttg-tgttttgtgctt 434762  T
Q  646 cacac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtttttgatgat 689  Q
      ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  434763 ttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgat 434807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 551 - 682
Target Start/End: Original strand, 4 - 135
Alignment:
Q  551 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtgtcaca 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg-tgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcaca 102  T
Q  650 cttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103 cttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 412 - 587
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11732
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 11654  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 587  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11655 catt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 11732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 362
Target Start/End: Original strand, 21953 - 22286
Alignment:
Q  12 ttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaatt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  |  |||||| || | || ||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||  |||||||  || || |    
T  21953 ttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgggacatgaatttggcatcgtgacacgatttcgaggtgccgtgagctagt-ttgcaggacgccaaat 22051  T
Q  109 cgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtga 208  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |            
T  22052 cgtgacacgatcttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtacc------ 22145  T
Q  209 caagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttg 308  Q
                |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||    
T  22146 ------------aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt-gaaggtgagctagaagagagagaaacttg 22232  T
Q  309 ggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22233 ggaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 412 - 584
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaact 114699  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  114700 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17629
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||     
T  17444 cttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgatttcgtgatgccgtgagct-ggtttgcagggtgccaaa 17542  T
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacg 194  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17543 tcgtgacacgatcttgggaaatcgtgacatgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggattggtcgtaccttgtgacg 17629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Original strand, 17638 - 17705
Alignment:
Q  221 aatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttggagggagag 288  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17638 aatcgtgacacgattttatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattttgaaggagag 17705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18004
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaa-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18074 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 761
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatgccatgagctagggttgcag 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | |||| ||||| | | |||| |    
T  943 ttgaaattggcttcaaatttgtggtatggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacacgattggaggtgccgtgagccaagtttgctg 844  T
Q  99 ggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    | |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  843 gatgcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 580
Target Start/End: Original strand, 10546 - 10656
Alignment:
Q  468 gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggacc 566  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10546 gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgtt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggacc 10642  T
Q  567 gaactgggtgaaca 580  Q
    ||||||||| ||||    
T  10643 gaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20414
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaag-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 582  Q
    | ||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20485 c-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaat 20414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20744 - 20648
Alignment:
Q  258 taagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgggaaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20744 taagtgttctt-tgcagattttgaaggagagctagaagagagagaaactttggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt 20648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 580
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7494
Alignment:
Q  412 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 508  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 7424  T
Q  509 catttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 580  Q
    |||| |||||||||||| | ||  |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7425 catt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3339 - 3575
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaagaa--ggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcggatg-ccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||   || || ||||||||  ||| |    
T  3339 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaaaagagaaatcgtgacacgattttgacatcgtgacacgatttcaagtggccgtgagctagt-ttgaa 3437  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
    ||  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||   ||| ||||| |      
T  3438 ggacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcaatgataaggactagtc-aacctggggaccgtt 3536  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3537 gcagatcgtgacacgatctaggaaaatcgtgacacgatt 3575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 149262 - 149094
Alignment:
Q  415 gtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcat 511  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | || | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  149262 gtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt-gtaagaactcat 149165  T
Q  512 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctccagagcaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 584  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  149164 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2938 - 2811
Alignment:
Q  177 tggtcgttccttgggacggacgca--aatcgtgacaagattaggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagtacttaagtgttcttgtgcag 274  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||  |||||  |||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  2938 tggtcgtaccttgggtcgtacgcaccaatcgtgtcacgatttggacaaacgtgacacgattttaacagctgaagactgctatataagtgttcttgtgcag 2839  T
Q  275 atttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||    
T  2838 attttgaaggagagcttgaagagagaga 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 6003
Alignment:
Q  262 tgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagaga 302  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  6043 tgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagaga 6003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 34556 - 34812
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttc-ggatgccatgagctagggttgca 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  ||| | || |  | |||||    
T  34556 ttgatattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggcatcgtgacactatttcaagtggccgttag-tttgtttgca 34654  T
Q  98 gggtgcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggac 197  Q
     |  || || |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| | |      
T  34655 tgacgccaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggtccgtt 34753  T
Q  198 gcaaatcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgattggaacagaggaagactagta 255  Q
    ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||    ||||||||||||||||    
T  34754 gcagatcgtgacacgatctagggaaatcgtggcactatttcttcagaggaagactagta 34812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Original strand, 1844 - 1977
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaa 201  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||| |  |||     
T  1844 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcag 1942  T
Q  202 atcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  1943 atcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 1977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Original strand, 148549 - 148682
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaa 201  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||||| |  |||     
T  148549 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtc-aaccttgggaccgttgcag 148647  T
Q  202 atcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  148648 atcgtgacacgatctagggaaatcgtgacacgatt 148682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8181 - 8112
Alignment:
Q  108 tcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggact 177  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  8181 tcgtggcacgatcttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 8112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 13889 - 13968
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13889 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 13968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Original strand, 18769 - 18902
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaa 201  Q
    ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||| |  ||||    
T  18769 gcaaaatcgtgccacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaagactggtc-atcctggggaccgttgcaa 18867  T
Q  202 atcgtgacaagat-taggaaaatcgtgacacgatt 235  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||    
T  18868 atcgtgacacgatctaaggaaatcgtggcacgatt 18902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 181
Target Start/End: Original strand, 176555 - 176634
Alignment:
Q  102 gcaaattcgtggcacgatttgggaaaatcgtgacacgatcgtgaaactttctcgttaagtatccttgataaggactggtc 181  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  176555 gcaaaatcgtggcacgatcttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtc 176634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1455 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1455
Description:

Target: scaffold1455; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1780
Alignment:
Q  1 ttgagattgtcttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacac 68  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1711 ttgaaattggcttcaaatttgtggtctggaagaacagagaaatcgtgacacgattttggaatcgtgacac 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 309
Target Start/End: Original strand, 36568 - 36618
Alignment:
Q  259 aagtgttcttgtgcagatttggagggagagtttgaagagagagagacttgg 309  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36568 aagtgttcttgtgcagattttgaaggagagcttgaagagagagaaacttgg 36618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 121
Target Start/End: Original strand, 7924 - 8036
Alignment:
Q  11 cttcaaatttgtggtctggaaga--aggaaaatcgtgaaacgattttgggatcgtgacacaatttcg-gatgccatgagctagggttgcagggtgcaaat 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| |||| | || ||||||||||| ||     
T  7924 cttcaaatttgtggtctgaaagaacagagaaatcgtgacacgaatttggcatcgtgacacgattttgtgatgccgtgag-ttggtttgcagggtgccaaa 8022  T
Q  108 tcgtggcacgattt 121  Q
    ||||| ||||||||    
T  8023 tcgtgacacgattt 8036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University