View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19183_low_4 (Length: 426)

Name: NF19183_low_4
Description: NF19183
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19183_low_4
NF19183_low_4
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (18-415)||(38968295-38968690)
chr5 (18-379)||(19228189-19228545)
chr5 (18-379)||(42537343-42537705)
chr5 (18-379)||(512289-512645)
chr5 (18-415)||(42941968-42942360)
chr5 (18-415)||(7757524-7757916)
chr5 (18-375)||(8580027-8580378)
chr5 (98-379)||(8701741-8702021)
chr5 (18-415)||(28876843-28877234)
chr5 (131-379)||(17658631-17658878)
chr5 (18-325)||(14260-14562)
chr5 (18-371)||(28241325-28241671)
chr5 (98-337)||(40624473-40624720)
chr5 (98-337)||(20422215-20422463)
chr5 (221-340)||(5197371-5197490)
chr5 (221-328)||(19040685-19040792)
chr5 (221-325)||(27673224-27673328)
chr5 (223-328)||(30705536-30705641)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (18-379)||(36977796-36978154)
chr7 (18-379)||(47672602-47672958)
chr7 (18-379)||(39460728-39461084)
chr7 (18-415)||(47776533-47776926)
chr7 (18-378)||(37340504-37340859)
chr7 (18-415)||(27453100-27453492)
chr7 (18-415)||(17835277-17835668)
chr7 (18-379)||(9494313-9494679)
chr7 (18-379)||(10517181-10517536)
chr7 (18-379)||(34738564-34738922)
chr7 (18-371)||(15073754-15074100)
chr7 (101-371)||(42507553-42507821)
chr7 (131-379)||(14689575-14689822)
chr7 (98-325)||(17741019-17741255)
chr7 (221-340)||(5541096-5541215)
chr7 (221-337)||(556205-556321)
chr7 (223-340)||(16675186-16675303)
chr7 (223-340)||(17649554-17649671)
chr7 (208-340)||(46740103-46740234)
chr7 (221-328)||(41880888-41880995)
chr7 (221-328)||(48403755-48403862)
chr7 (225-328)||(35609984-35610087)
chr7 (237-328)||(45257401-45257492)
chr7 (258-328)||(9370958-9371028)
chr7 (221-288)||(17465329-17465396)
chr7 (221-288)||(17587818-17587885)
chr7 (18-68)||(42507849-42507899)
chr7 (291-328)||(17462862-17462899)
chr7 (291-328)||(17590315-17590352)
chr7 (221-270)||(41734561-41734610)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (18-415)||(51683400-51683794)
chr4 (18-415)||(55407268-55407664)
chr4 (18-379)||(48256088-48256445)
chr4 (18-379)||(50274934-50275290)
chr4 (18-415)||(21022370-21022761)
chr4 (18-414)||(50901681-50902070)
chr4 (95-378)||(37021601-37021883)
chr4 (18-332)||(67792-68100)
chr4 (18-375)||(40357802-40358153)
chr4 (18-371)||(30726267-30726613)
chr4 (18-371)||(1089110-1089456)
chr4 (18-371)||(1308640-1308986)
chr4 (98-332)||(46436521-46436753)
chr4 (98-364)||(14315650-14315925)
chr4 (18-340)||(21538008-21538334)
chr4 (18-340)||(10752983-10753309)
chr4 (18-340)||(10966752-10967078)
chr4 (98-346)||(14297401-14297658)
chr4 (221-379)||(11050040-11050198)
chr4 (98-340)||(11083562-11083813)
chr4 (221-340)||(50023099-50023218)
chr4 (221-340)||(41933179-41933298)
chr4 (221-340)||(50030217-50030336)
chr4 (221-328)||(9892836-9892943)
chr4 (221-328)||(41798563-41798670)
chr4 (100-325)||(4719949-4720163)
chr4 (221-332)||(30704421-30704532)
chr4 (208-340)||(44679631-44679762)
chr4 (221-340)||(3184354-3184473)
chr4 (221-340)||(3185440-3185559)
chr4 (221-340)||(3185648-3185767)
chr4 (225-328)||(6181358-6181461)
chr4 (225-328)||(49090822-49090925)
chr4 (221-328)||(49165431-49165538)
chr4 (18-82)||(8109593-8109657)
chr4 (225-328)||(31422099-31422203)
chr4 (237-329)||(50193893-50193985)
chr4 (304-332)||(21537947-21537975)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (18-379)||(49195964-49196320)
chr3 (18-373)||(20917540-20917889)
chr3 (18-373)||(20926502-20926851)
chr3 (18-379)||(42756353-42756707)
chr3 (18-379)||(30255519-30255875)
chr3 (18-415)||(44229915-44230305)
chr3 (18-415)||(42165363-42165754)
chr3 (18-415)||(47073688-47074082)
chr3 (18-379)||(4007840-4008196)
chr3 (18-379)||(48888936-48889290)
chr3 (18-415)||(50963154-50963545)
chr3 (18-376)||(50216398-50216753)
chr3 (18-415)||(3975906-3976298)
chr3 (18-379)||(48563142-48563483)
chr3 (40-379)||(42805779-42806107)
chr3 (18-331)||(596959-597266)
chr3 (18-311)||(3501477-3501767)
chr3 (18-267)||(51807169-51807413)
chr3 (221-340)||(16611475-16611594)
chr3 (221-340)||(22047659-22047778)
chr3 (223-341)||(17567619-17567737)
chr3 (221-340)||(41612765-41612884)
chr3 (221-340)||(20351042-20351161)
chr3 (221-328)||(52390964-52391071)
chr3 (100-325)||(31045165-31045388)
chr3 (221-328)||(2274482-2274589)
chr3 (221-328)||(29009257-29009364)
chr3 (221-340)||(36127834-36127953)
chr3 (225-328)||(42903758-42903861)
chr3 (225-328)||(46389363-46389466)
chr3 (225-328)||(50480352-50480455)
chr3 (225-328)||(54386525-54386628)
chr3 (221-325)||(4178201-4178305)
chr3 (225-328)||(49144031-49144133)
chr3 (225-328)||(34045778-34045880)
chr3 (225-328)||(46701593-46701696)
chr3 (221-325)||(4172203-4172307)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (18-379)||(35258390-35258745)
chr1 (19-415)||(23275585-23275980)
chr1 (18-379)||(51320914-51321270)
chr1 (95-379)||(45825149-45825433)
chr1 (18-379)||(52802330-52802687)
chr1 (38-414)||(31783210-31783585)
chr1 (25-379)||(19527060-19527409)
chr1 (18-379)||(47502515-47502859)
chr1 (98-379)||(49857463-49857740)
chr1 (18-371)||(30890262-30890608)
chr1 (98-371)||(19925018-19925289)
chr1 (18-214)||(29622105-29622297)
chr1 (221-340)||(50343525-50343644)
chr1 (18-190)||(11183378-11183549)
chr1 (221-340)||(21141425-21141544)
chr1 (208-340)||(47656256-47656386)
chr1 (104-325)||(17514267-17514497)
chr1 (221-340)||(97504-97623)
chr1 (221-328)||(2365634-2365741)
chr1 (222-340)||(2424924-2425040)
chr1 (95-186)||(11196153-11196244)
chr1 (221-328)||(19156413-19156520)
chr1 (222-340)||(22524534-22524650)
chr1 (17-156)||(22524326-22524460)
chr1 (221-333)||(38127045-38127158)
chr1 (225-328)||(3731949-3732052)
chr1 (221-328)||(13639591-13639698)
chr1 (225-328)||(26876059-26876162)
chr1 (18-65)||(45825087-45825134)
chr1 (95-156)||(2425114-2425175)
chr1 (225-297)||(8474187-8474259)
chr1 (18-61)||(19924957-19925000)
chr1 (250-324)||(25166976-25167050)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (95-415)||(6320044-6320363)
chr6 (17-379)||(24088299-24088658)
chr6 (18-415)||(31768900-31769297)
chr6 (221-325)||(21601002-21601106)
chr6 (221-340)||(24722326-24722445)
chr6 (221-340)||(26423395-26423514)
chr6 (98-364)||(3381049-3381313)
chr6 (221-340)||(3501567-3501686)
chr6 (225-328)||(6201550-6201653)
chr6 (225-328)||(11688517-11688620)
chr6 (221-328)||(22301578-22301685)
chr6 (221-328)||(27617113-27617220)
chr6 (225-328)||(30829220-30829323)
chr6 (101-186)||(30424143-30424228)
chr6 (18-48)||(6320371-6320401)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (18-379)||(39846503-39846862)
chr8 (18-379)||(34822534-34822893)
chr8 (106-415)||(5303702-5304010)
chr8 (22-415)||(43188253-43188641)
chr8 (18-379)||(40076776-40077123)
chr8 (18-415)||(43211706-43212097)
chr8 (18-379)||(39938733-39939089)
chr8 (95-364)||(39601988-39602256)
chr8 (18-415)||(15036209-15036601)
chr8 (19-415)||(39252210-39252594)
chr8 (18-379)||(41249606-41249946)
chr8 (18-375)||(45064441-45064782)
chr8 (18-371)||(489155-489501)
chr8 (18-349)||(42485086-42485410)
chr8 (95-379)||(2984395-2984678)
chr8 (98-340)||(24249759-24249999)
chr8 (18-215)||(25864620-25864812)
chr8 (98-332)||(37327080-37327292)
chr8 (221-340)||(35552063-35552182)
chr8 (221-340)||(20857683-20857802)
chr8 (221-335)||(45128147-45128261)
chr8 (225-328)||(25095-25198)
chr8 (225-328)||(1052926-1053029)
chr8 (221-340)||(5677468-5677587)
chr8 (225-328)||(23021889-23021992)
chr8 (225-328)||(26659848-26659951)
chr8 (237-340)||(34371450-34371553)
chr8 (18-80)||(35026687-35026749)
chr8 (131-187)||(22495216-22495272)
chr8 (221-325)||(22495315-22495419)
chr8 (119-165)||(35026740-35026786)
chr8 (18-68)||(39601903-39601953)
chr8 (18-52)||(5304009-5304043)
chr8 (305-340)||(34370133-34370168)
chr8 (98-155)||(45128025-45128082)
chr8 (304-332)||(2984681-2984709)
chr8 (18-74)||(45127949-45128005)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (18-415)||(39947799-39948192)
chr2 (18-415)||(28468841-28469232)
chr2 (18-415)||(45428790-45429182)
chr2 (18-415)||(32955840-32956228)
chr2 (18-371)||(21998390-21998737)
chr2 (18-371)||(17420767-17421114)
chr2 (18-311)||(25965012-25965308)
chr2 (18-275)||(7185228-7185481)
chr2 (18-215)||(45137112-45137305)
chr2 (232-415)||(45136784-45136956)
chr2 (221-340)||(25515366-25515484)
chr2 (221-340)||(29401160-29401279)
chr2 (223-340)||(36655906-36656023)
chr2 (221-334)||(45284570-45284683)
chr2 (221-334)||(45291933-45292046)
chr2 (221-340)||(10828581-10828700)
chr2 (221-328)||(20938294-20938401)
chr2 (225-328)||(3940297-3940400)
chr2 (225-328)||(5352367-5352470)
chr2 (221-328)||(15831526-15831633)
chr2 (225-328)||(30496515-30496618)
chr2 (225-328)||(43978922-43979025)
chr2 (307-415)||(22686863-22686970)
chr2 (225-328)||(43539306-43539409)
chr2 (101-186)||(35464313-35464398)
chr2 (18-68)||(42505584-42505634)
chr2 (101-190)||(31367308-31367397)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (18-379)||(15140-15495)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (95-375)||(250-528)
scaffold0293 (18-52)||(561-595)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (18-330)||(7618-7925)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (18-201)||(8404-8582)
scaffold0155 (230-332)||(10761-10863)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (221-340)||(18489-18608)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (223-340)||(4210-4327)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (100-324)||(251048-251270)
scaffold0007 (249-297)||(246180-246228)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-184)||(40746-40907)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (18-74)||(18112-18168)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-74)||(54676-54732)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 38968295 - 38968690
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||             |||||||||||||||||||||||    
T  38968295 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttcttttt--aaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 38968392  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968393 gggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 38968492  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968493 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 38968592  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38968593 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgtttttttggttagtttaggttacgggaattatgatg 38968690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19228545 - 19228189
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||             || |||||||||||||||||||    
T  19228545 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttttaaaaaaa----tatagtagtttgcatgtggtta 19228450  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19228449 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 19228350  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228349 tt-tgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 19228251  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19228250 ttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 19228189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 42537343 - 42537705
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnn--ttagagtagtttgcatgtggt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||                |||||||||||||||||| ||    
T  42537343 attatcacaagcaagttgtatcaatcattttaatgataatgttggtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaataaaaattagagtagtttgcatgttgt 42537442  T
Q  116 tatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtg 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537443 tagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtg 42537542  T
Q  216 acttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattt 315  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42537543 gctt-tgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattattt 42537641  T
Q  316 agttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537642 agttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 42537705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 512645 - 512289
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||              ||||||||||||||||||||||    
T  512645 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaaaaaa----tagagtagtttgcatgtggtta 512550  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  512549 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggc 512450  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  512449 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgtttgatcaaatacctcaatgaaaattatattgcttatttag 512351  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  512350 ttagtttaggttatgaaaattatagaaatgatgttaattatagtttagttaagtgtatattg 512289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42942360 - 42941968
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  42942360 attatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaaa---ttagagtagtttgcatgtggtta 42942264  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |    
T  42942263 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgctgtttaaatcataatatggc 42942164  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  42942163 tt-tgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgatt-tttag 42942066  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42942065 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 42941968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 7757524 - 7757916
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  7757524 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 7757619  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  7757620 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggt 7757719  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7757720 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 7757818  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7757819 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatagaaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 7757916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8580378 - 8580027
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  8580378 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 8580283  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  8580282 gggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtagc 8580183  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8580182 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 8580084  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580083 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 8580027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8702021 - 8701741
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8702021 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtagttgcatatgt 8701922  T
Q  198 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701921 tgtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 8701823  T
Q  298 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8701822 aaattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 8701741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 28876843 - 28877234
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  28876843 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 28876938  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| | || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||      
T  28876939 gggttgaattcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattaaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtggg 28877038  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28877039 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 28877137  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28877138 ttagttt-ggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 28877234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 131 - 379
Target Start/End: Original strand, 17658631 - 17658878
Alignment:
Q  131 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtgg 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  17658631 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgtggcctatgttgtttaaatcataatgtggttt-tgaatggtgg 17658729  T
Q  231 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtta 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658730 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtta 17658829  T
Q  331 tggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658830 tggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 17658878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14562 - 14260
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  14562 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 14467  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14466 gggttgatttcaaaattgaaaatttgatgattgcatgcgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 14367  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14366 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattttattgattatttag 14268  T
Q  318 ttagttta 325  Q
    ||||||||    
T  14267 ttagttta 14260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28241671 - 28241325
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  28241671 attatcacaagtaagttgtaccaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagtttttaaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 28241577  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  28241576 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggc 28241477  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28241476 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 28241378  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241377 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 28241325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40624720 - 40624473
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40624720 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 40624622  T
Q  198 tgttaaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    |||| |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40624621 tgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttt-tgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaat 40624523  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaat 337  Q
    |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40624522 gccttaataacaattttattgattatttagttagtttagattatgaaaat 40624473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 337
Target Start/End: Original strand, 20422215 - 20422463
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20422215 gagtagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgacaatttgatgattggatgtgtagtgtatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgt 20422314  T
Q  198 tgttaaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    | || |||| ||          ||||| | || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20422315 tatttaaatgatgttctagtataatgt-agttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgataaaat 20422413  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaat 337  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20422414 gccccaatgacaattattttgattatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 5197371 - 5197490
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5197371 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 5197470  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5197471 gtttaggttatggatatgat 5197490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19040792 - 19040685
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  19040792 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattgattatttagtta 19040693  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  19040692 gtttaggt 19040685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27673328 - 27673224
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27673328 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 27673229  T
Q  321 gttta 325  Q
    |||||    
T  27673228 gttta 27673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 328
Target Start/End: Original strand, 30705536 - 30705641
Alignment:
Q  223 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 322  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30705536 aatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagt 30705635  T
Q  323 ttaggt 328  Q
    ||||||    
T  30705636 ttaggt 30705641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 36977796 - 36978154
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |  ||||||||||||||||||||    
T  36977796 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttttaaaaaaaatct--gagtagtttgcatgtggtta 36977893  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36977894 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgac 36977993  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977994 tt-tgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 36978092  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36978093 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 36978154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47672958 - 47672602
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             ||| |||||||||||||||||||    
T  47672958 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattatagtagtttgcatgtggtta 47672863  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  47672862 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtataatctatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 47672763  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672762 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 47672664  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47672663 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 47672602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 39460728 - 39461084
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  39460728 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 39460823  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  39460824 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctattttgtttaaatcataatgtggc 39460923  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39460924 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 39461022  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461023 ttagtttaggttatggatatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 39461084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 47776533 - 47776926
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  47776533 attatcacaagtaaggtgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaaa---ttagagtagtttgcatgtggtta 47776629  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  47776630 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 47776729  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||    
T  47776730 tt-tgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttag 47776828  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  47776829 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 47776926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 37340504 - 37340859
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||            ||| ||||||||| |||||||||    
T  37340504 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaacaataatgttagtttgtttaggtttatttttttaaaaaaa----ttatagtagtttggatgtggtta 37340599  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37340600 ggattgattttaaaattgacaatttgatgatttcatgtgtagtttatgaattgaaaaatgaatgtacttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 37340699  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340700 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 37340798  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37340799 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgctgttaattatagtttggttaagagtatatt 37340859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27453492 - 27453100
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              |||||||||||||||||||||||    
T  27453492 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttt----aaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 27453397  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
      ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27453396 gagttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggc 27453297  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  27453296 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcattgacaattttattgattatttag 27453198  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27453197 tcagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 27453100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 17835277 - 17835668
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  17835277 attatcacaagtaagttgt-tcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 17835371  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17835372 aggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 17835471  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17835472 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 17835570  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17835571 ttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 17835668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9494679 - 9494313
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttt-------tnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |            ||||||||||||||||    
T  9494679 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaaataaaataaaaaaattagagtagtttgcat 9494580  T
Q  111 gtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcata 210  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9494579 gtggtttgggttgattttaaaattgaaaatttgatggttgcatgtgtaatttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcata 9494480  T
Q  211 atgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgat 310  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9494479 atgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcgtcaatgaaaattatattgat 9494381  T
Q  311 tatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9494380 tatttagttagtttaggttatgg-aatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 9494313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 10517181 - 10517536
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  10517181 attatcacaagtaagctgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaa-----ttagagtagtttgtatgtggtta 10517275  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10517276 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 10517375  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10517376 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 10517474  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517475 ttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 10517536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 34738564 - 34738922
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  34738564 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttt--aaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 34738661  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34738662 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggc 34738761  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||    
T  34738762 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgctcacaaagtgtttgataaaatgtctcgatgacaattttattgattatgtag 34738860  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34738861 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 34738922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15074100 - 15073754
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  15074100 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatattaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 15074006  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  15074005 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggc 15073906  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15073905 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 15073807  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073806 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 15073754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 101 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42507821 - 42507553
Alignment:
Q  101 tagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||     |||| ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42507821 tagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattaacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagt 42507722  T
Q  201 taaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 300  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  42507721 ttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaa 42507623  T
Q  301 ttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507622 ttttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 42507553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 131 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14689822 - 14689575
Alignment:
Q  131 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtgg 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||| ||||| ||||    
T  14689822 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagctt-tgaatagtgg 14689724  T
Q  231 caaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtta 330  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14689723 caaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttatgtta 14689624  T
Q  331 tggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14689623 tggaaatgataaaaatgatgttaattattgtttggttaagtgtatattg 14689575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17741255 - 17741019
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||     |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  17741255 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgaagattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 17741156  T
Q  198 tgttaaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    | || |||| ||          ||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17741155 tatttaaatgatgtttaagtataatgtggttt-tgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaat 17741057  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttta 325  Q
     ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17741056 tcccaaatgagaattatattgattatttagttagttta 17741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5541215 - 5541096
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5541215 tgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 5541116  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5541115 gtttaggttatggatatgat 5541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 556321 - 556205
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  556321 tgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatttattatttagtta 556222  T
Q  321 gtttaggttatggaaat 337  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  556221 gtttatgttatgaaaat 556205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675303
Alignment:
Q  223 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 322  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  323 ttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  16675286 ttaggttatggatatgat 16675303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649671
Alignment:
Q  223 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 322  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  323 ttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  17649654 ttaggttatggatatgat 17649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740103
Alignment:
Q  208 ataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||| ||||    
T  46740234 ataatgtgattt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttatt 46740136  T
Q  308 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  46740135 gattatttaattagtttaggtcatggatatgat 46740103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 41880888 - 41880995
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  41880888 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 41880987  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  41880988 gtttaggt 41880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 48403755 - 48403862
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48403755 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattgattatttagtta 48403854  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  48403855 gtttaggt 48403862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 35610087 - 35609984
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35610087 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 35609988  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  35609987 aggt 35609984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 328
Target Start/End: Original strand, 45257401 - 45257492
Alignment:
Q  237 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 328  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45257401 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 45257492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9371028 - 9370958
Alignment:
Q  258 atactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9371028 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 9370958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17465396 - 17465329
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 288  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17465396 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 288
Target Start/End: Original strand, 17587818 - 17587885
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 288  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17587818 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17587885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 42507899 - 42507849
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtt 68  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42507899 attatcacaagtaacttgtgtcaaacattttaatgttaatgttaatttgtt 42507849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462862
Alignment:
Q  291 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 328  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17462862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 328
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590352
Alignment:
Q  291 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 328  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17590352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Original strand, 41734561 - 41734610
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacac 270  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41734561 tgaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacac 41734610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 51683400 - 51683794
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  51683400 attatcacaagtaagttatatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttt--aaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 51683497  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  51683498 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggc 51683597  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683598 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 51683696  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51683697 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 51683794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 55407664 - 55407268
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              |||||||||||||||||||||||    
T  55407664 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 55407565  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55407564 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggc 55407465  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55407464 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcgaatgcctcattgaaaattatattgattatttag 55407366  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55407365 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttcgttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 55407268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48256445 - 48256088
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  48256445 attatcacaagtaaattgtatcaatcattttaatgataatattagtttgcttaggtttatttttttaaaaaaaa---ttagagtagtttgcatgtggtta 48256349  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  48256348 gggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggc 48256249  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256248 tt-tgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 48256150  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256149 ttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 48256088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 50274934 - 50275290
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  50274934 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttaattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 50275029  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  50275030 gggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcagaatgtggc 50275129  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  50275130 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatgtag 50275228  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50275229 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattg 50275290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21022761 - 21022370
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||             | |||||||||| |||||||||    
T  21022761 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttttaaaaaaa----ttgagtagtttgtatgtggtta 21022666  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21022665 gggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 21022566  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21022565 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 21022467  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21022466 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 21022370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Original strand, 50901681 - 50902070
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||| ||||||||||    
T  50901681 attatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttt-----aaaaaaaattagagtagtttacatgtggtta 50901775  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  50901776 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaattcataatgtggc 50901875  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  50901876 tt-tgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaattttattgatt-tttag 50901973  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgat 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| |||||    
T  50901974 ttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgat 50902070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 95 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37021883 - 37021601
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37021883 ttagagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcata 37021784  T
Q  195 tgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37021783 tgttgtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaa 37021685  T
Q  295 tgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 378  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021684 tgacaattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 37021601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 67792 - 68100
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  67792 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatga-aatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 67886  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  67887 gggttgattttaaaattgacaatttaatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgataatgtggc 67986  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67987 tt-tgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 68085  T
Q  318 ttagtttaggttatg 332  Q
    |||||||||||||||    
T  68086 ttagtttaggttatg 68100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40358153 - 40357802
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  40358153 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 40358058  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  40358057 gggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgga 40357958  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40357957 tt-tgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 40357859  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357858 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 40357802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30726613 - 30726267
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||| ||||||    
T  30726613 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagtttttaaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatttggtta 30726519  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  30726518 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcacgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggc 30726419  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30726418 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 30726320  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30726319 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatactttggttaagt 30726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1089456 - 1089110
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  1089456 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagtttttttaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 1089362  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||| |    
T  1089361 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcaagtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtttaaataataatgtggc 1089262  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1089261 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 1089163  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089162 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 1089110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1308986 - 1308640
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  1308986 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 1308892  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||| |    
T  1308891 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtttaaattataatgtggc 1308792  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1308791 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 1308693  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308692 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 1308640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 332
Target Start/End: Original strand, 46436521 - 46436753
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  46436521 gagtagtttgcacgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattaataaacgaatgtagttgttgcttatgc 46436619  T
Q  198 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
    |||| |||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46436620 tgtttaaatgatattgtgg-ttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgg 46436718  T
Q  298 aaattatattgattatttagttagtttaggttatg 332  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436719 caattttattgattatttagttagtttaggttatg 46436753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 364
Target Start/End: Original strand, 14315650 - 14315925
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315650 gagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 14315749  T
Q  198 tgttaaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    |||| |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  14315750 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttt-tgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaat 14315848  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg 364  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14315849 gcccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttg 14315925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21538334 - 21538008
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||             || |||||||||||||||||||    
T  21538334 attatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagtttttttaaaaata----ta-agtagtttgcatgtggtta 21538240  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcat-------- 209  Q
     |||||||     ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||            
T  21538239 gggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgggtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgatgtttaatg 21538140  T
Q  210 --aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 307  Q
      ||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21538139 ataatgtggttt-tgaatgatgccaaatgaacacaatttgaatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatatt 21538041  T
Q  308 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21538040 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 21538008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10753309 - 10752983
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||            |  ||||||||||||||||||||    
T  10753309 attatgacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagttttttaaaaaa-----tatgagtagtttgcatgtggtta 10753215  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcat-------- 209  Q
     |||||||     ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||            
T  10753214 gggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatg 10753115  T
Q  210 --aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 307  Q
      ||||||  || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10753114 ataatgtggttt-tgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatatt 10753016  T
Q  308 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10753015 gattatttaattagtttaggttattgaaatgat 10752983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10967078 - 10966752
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||            |  ||||||||||||||||||||    
T  10967078 attatgacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagttttttaaaaaa-----tatgagtagtttgcatgtggtta 10966984  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcat-------- 209  Q
     |||||||     ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||            
T  10966983 gggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatg 10966884  T
Q  210 --aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 307  Q
      ||||||  || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10966883 ataatgtggttt-tgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatatt 10966785  T
Q  308 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10966784 gattatttaattagtttaggttattgaaatgat 10966752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 346
Target Start/End: Original strand, 14297401 - 14297658
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14297401 gagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 14297500  T
Q  198 tgttaaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    |||| |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  14297501 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttt-tgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaat 14297599  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaat 346  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14297600 gcccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaat 14297658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 221 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11050198 - 11050040
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11050198 tgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattgattatttagtta 11050099  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  11050098 gtttaggttatggaaatgatggagaggatgttaatgatagtttgataaagtgtatattg 11050040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11083813 - 11083562
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11083813 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 11083714  T
Q  198 tgttaaaatcat----------aatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    |||| |||| ||          ||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||    
T  11083713 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttt-tgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgacaaaat 11083615  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11083614 gcccaaatgaaaattgtactgattattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50023218 - 50023099
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50023218 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 50023119  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  50023118 gtttaggttatggatatgat 50023099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41933298 - 41933179
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41933298 tgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgattattgagtta 41933199  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  41933198 gtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50030336 - 50030217
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  50030336 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactgattatttagtta 50030237  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  50030236 gtttaggttatggatatgat 50030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9892943 - 9892836
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9892943 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 9892844  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  9892843 gtttaggt 9892836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41798670 - 41798563
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || || | |||||||||||||||||    
T  41798670 tgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattgattatttagtta 41798571  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||| ||||    
T  41798570 gttaaggt 41798563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4720163 - 4719949
Alignment:
Q  100 gtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || || |    
T  4720163 gtagtttgcatgtggttagggtttacgtaagaattgacattttgatgattgcgtgtgtagtttatgaattggtaaatgaatgtaattgatgtttaagtag 4720064  T
Q  200 ttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 299  Q
              ||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  4720063 ----------aatgtgattt-tgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaa 4719975  T
Q  300 attatattgattatttagttagttta 325  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||    
T  4719974 attgcattgattatttacttagttta 4719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Original strand, 30704421 - 30704532
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30704421 tgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagtta 30704520  T
Q  321 gtttaggttatg 332  Q
    ||||||||||||    
T  30704521 gtttaggttatg 30704532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679631
Alignment:
Q  208 ataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||  |||    
T  44679762 ataatgtgattt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcatt 44679664  T
Q  308 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44679663 gattatttagttagtttaggttatagatatgat 44679631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 3184354 - 3184473
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  3184354 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattttttatttagtta 3184453  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  3184454 gtttgggttatggatatgat 3184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3185559 - 3185440
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  3185559 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattttttatttagtta 3185460  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  3185459 gtttgggttatggatatgat 3185440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3185767 - 3185648
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  3185767 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattttttatttagtta 3185668  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  3185667 gtttgggttatggatatgat 3185648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6181461 - 6181358
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6181461 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 6181362  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  6181361 aggt 6181358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 49090822 - 49090925
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  49090822 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 49090921  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  49090922 aggt 49090925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 49165431 - 49165538
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49165431 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 49165530  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  49165531 gtttaggt 49165538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 8109593 - 8109657
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttatttttt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8109593 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttt 8109657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 31422099 - 31422203
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg-atcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtt 323  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31422099 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagtt 31422198  T
Q  324 taggt 328  Q
    |||||    
T  31422199 taggt 31422203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 329
Target Start/End: Original strand, 50193893 - 50193985
Alignment:
Q  237 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtt 329  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50193893 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttacttagtttaggtt 50193985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21537975 - 21537947
Alignment:
Q  304 tattgattatttagttagtttaggttatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537975 tattgattatttagttagtttaggttatg 21537947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49196320 - 49195964
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  49196320 attatcacaagtaagttgtatcaatcactttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 49196225  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49196224 aggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggc 49196125  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49196124 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcttcaatgaaaattatattgattatttag 49196026  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49196025 ttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaattgtatattg 49195964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20917889 - 20917540
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  20917889 attatcacaagtaagttgtatcaatcatcttaatgata-tgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 20917795  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20917794 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggc 20917695  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917694 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 20917596  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917595 ttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 20917540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20926851 - 20926502
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  20926851 attatcacaagtaagttgtatcaatcatcttaatgata-tgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 20926757  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20926756 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggc 20926657  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926656 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 20926558  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926557 ttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgt 20926502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 42756353 - 42756707
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  42756353 attatcacaagtcagttgtatcaatcattttaataataatgttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 42756448  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |    
T  42756449 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatggatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtcgc 42756548  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42756549 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat--tattgattatttag 42756645  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42756646 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 42756707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30255875 - 30255519
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  30255875 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataaggttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 30255780  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30255779 gggttgattttaaagttgacaatttgatgattgcatgtttagtttgtgaattgctaaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 30255680  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30255679 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttag 30255581  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30255580 ttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 30255519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 44229915 - 44230305
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||               | |||||||||||||||||||||    
T  44229915 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattt------aaaaaaaaatcagagtagtttgcatgtggtta 44230008  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  44230009 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaaacataatgtggc 44230108  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44230109 tt-tgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 44230207  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44230208 ttggtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 44230305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 42165363 - 42165754
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||             ||||||||||||| |||||||||    
T  42165363 attatcacaagtaagttgtgtccatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttt-----aaaaaaaattagagtagtttgtatgtggtta 42165457  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  42165458 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 42165557  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42165558 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 42165656  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42165657 ttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 42165754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 47074082 - 47073688
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||              |||||||||||| |||||||||    
T  47074082 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaaaataaa--tagagtagtttgtatgtggtta 47073985  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  47073984 gggttgattttaaaattgacaatttgatgaatgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtggc 47073885  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47073884 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 47073786  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  47073785 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 47073688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4008196 - 4007840
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  4008196 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 4008101  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  4008100 gggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 4008001  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4008000 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 4007902  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4007901 ttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 4007840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 48888936 - 48889290
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttt---tnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtgg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     |            ||||||||||||||||||||    
T  48888936 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaagtttatttaaaaataaaaataaaaaattagagtagtttgcatgtgg 48889035  T
Q  115 ttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgt 214  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48889036 ttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgt 48889135  T
Q  215 gacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatt 314  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48889136 gactt-tgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaaggcctcaatgaaaattatattgattatt 48889234  T
Q  315 tagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889235 tagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 48889290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 50963154 - 50963545
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  50963154 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 50963249  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  50963250 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 50963349  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||  |||||||||    
T  50963350 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgataaaatgcctcagtgacaattttataaattatttag 50963448  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50963449 ttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 50963545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50216753 - 50216398
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  50216753 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgtaaatttgtttaggttgatttttttatttttaaa--ttagagtagtttgcatgtggtta 50216656  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  50216655 gggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggt 50216556  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| | |    
T  50216555 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatgtgg 50216457  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtata 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216456 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtata 50216398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 3975906 - 3976298
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  3975906 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 3976001  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  3976002 gggttgatttaaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattggcaattgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggc 3976101  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3976102 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 3976200  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3976201 ttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 3976298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 48563142 - 48563483
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              |||||||||||||||||||||||    
T  48563142 attatcataagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttt---aaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 48563238  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |                |||||| ||||||||||||| |    
T  48563239 aggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtctatgaattgataaatata----------------gttgtttaaatcataatgtgtc 48563322  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563323 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 48563421  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563422 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 48563483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 40 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42806107 - 42805779
Alignment:
Q  40 aatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||            ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  42806107 aatcattttaatgataatgttagtttgtttatgtttattttttaaaagaaaaa--ttagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgataa 42806010  T
Q  140 tttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaac 239  Q
    ||        ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42806009 tt--------gcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaac 42805919  T
Q  240 acaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatga 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805918 acaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatga 42805819  T
Q  340 tagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42805818 tagaaatgatgttaattatagtttgattaggtgtatattg 42805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 331
Target Start/End: Original strand, 596959 - 597266
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  596959 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttttttaaa-----ttagagtagtttgcatgtggtta 597053  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  597054 gggttgatttaaatattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcccatgttgtttaaatcataatgtggc 597153  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  597154 tt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 597252  T
Q  318 ttagtttaggttat 331  Q
    |||| |||||||||    
T  597253 ttagcttaggttat 597266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3501767 - 3501477
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||             ||||||||||||| |||||||||    
T  3501767 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttt--aaaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggtta 3501670  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  3501669 gggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggg 3501570  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgatt 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  3501569 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Original strand, 51807169 - 51807413
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  51807169 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgtcagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 51807264  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  51807265 tgattgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggc 51807364  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807365 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 16611475 - 16611594
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16611475 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 16611574  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16611575 gtttaggttatggatatgat 16611594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22047778 - 22047659
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22047778 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 22047679  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  22047678 gtttaggttatggatatgat 22047659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17567737 - 17567619
Alignment:
Q  223 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 322  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17567737 aatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagt 17567638  T
Q  323 ttaggttatggaaatgata 341  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  17567637 ttaggttatggatatgata 17567619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 41612765 - 41612884
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  41612765 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatctagtta 41612864  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  41612865 gtttagtttatggatatgat 41612884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 20351042 - 20351161
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaa-tgcctcaatgaaaattatattgattatttagtt 319  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20351042 tgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtt 20351140  T
Q  320 agtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  20351141 agtttaggttatggatatgat 20351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 52391071 - 52390964
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  52391071 tgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattgattatttagtta 52390972  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  52390971 gtttaggt 52390964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31045388 - 31045165
Alignment:
Q  100 gtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    || ||    
T  31045388 gtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttataaattgataaacgaatgtagttaatgtaattgatg 31045289  T
Q  200 ttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 299  Q
    || || | | ||||||  || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |    
T  31045288 tttaagtaa-aatgtggttt-tgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgaga 31045191  T
Q  300 attatattgattatttagttagttta 325  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||    
T  31045190 attgcatttattatttagttagttta 31045165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2274589 - 2274482
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2274589 tgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 2274490  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  2274489 gtttaggt 2274482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 29009257 - 29009364
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29009257 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 29009356  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  29009357 gtttaggt 29009364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 36127834 - 36127953
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  36127834 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttgattatttggtta 36127933  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  36127934 gtttaggctatggatatgat 36127953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42903861 - 42903758
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42903861 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 42903762  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  42903761 aggt 42903758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 46389363 - 46389466
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  46389363 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 46389462  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  46389463 aggt 46389466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50480455 - 50480352
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50480455 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 50480356  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  50480355 aggt 50480352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 54386525 - 54386628
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  54386525 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 54386624  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  54386625 aggt 54386628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Original strand, 4178201 - 4178305
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4178201 tgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagtta 4178300  T
Q  321 gttta 325  Q
    |||||    
T  4178301 gttta 4178305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 49144133 - 49144031
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  49144133 tggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 49144035  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  49144034 aggt 49144031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 34045778 - 34045880
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34045778 tggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 34045876  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  34045877 aggt 34045880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46701696 - 46701593
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  || ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  46701696 tggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 46701597  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  46701596 aggt 46701593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Original strand, 4172203 - 4172307
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4172203 tgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagtta 4172302  T
Q  321 gttta 325  Q
    |||||    
T  4172303 gttta 4172307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35258745 - 35258390
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  35258745 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaataataatgttagtttgtttaggtttattttt-----aaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 35258651  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35258650 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatttagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 35258551  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258550 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 35258452  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35258451 ttagtttaggttatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 35258390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23275980 - 23275585
Alignment:
Q  19 ttatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggttat 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||              |||||||||||||||||||||||     
T  23275980 ttatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 23275881  T
Q  119 ggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgact 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23275880 ggttgatttttaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgact 23275781  T
Q  219 tatgaatgg-tggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275780 t-tgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 23275682  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23275681 tcagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 23275585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 51320914 - 51321270
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatca--atcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggt 115  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               ||||||||||||||||||||    
T  51320914 attatcacaagtaagttgaataataatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttt------aaaaaaaaatagagtagtttgcatgtggt 51321007  T
Q  116 tatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtg 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51321008 tagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtg 51321107  T
Q  216 acttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattt 315  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321108 actt-tgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattt 51321206  T
Q  316 agttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321207 agttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 51321270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Original strand, 45825149 - 45825433
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825149 ttagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 45825248  T
Q  195 tgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttt-gcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825249 tgttgttaaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca 45825347  T
Q  294 atgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825348 atgaaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 45825433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 52802330 - 52802687
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  52802330 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttttaaaaaaa---ttagagtagtttgcatgtggtta 52802426  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||     
T  52802427 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaagaattgataaatgaatgtagttgttgcttatgttgtttaagtcataatgtgat 52802526  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  52802527 tt-tgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattgtttag 52802625  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52802626 ttagtttaggctatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 52802687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31783585 - 31783210
Alignment:
Q  38 tcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgac 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||            ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31783585 tcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtttattttttataaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgac 31783486  T
Q  138 aatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatga 237  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31783485 aatttgatgattgtatgtgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttctttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatga 31783387  T
Q  238 acacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31783386 acacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagattatggaaat 31783287  T
Q  338 gatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgat 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| |||||    
T  31783286 gatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgat 31783210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19527409 - 19527060
Alignment:
Q  25 caagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggttatggttta 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||              |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19527409 caagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaagttgatttt----aaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttatggttga 19527314  T
Q  125 ttttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19527313 ttttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctt-tgaa 19527215  T
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||    
T  19527214 tggtggcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatgtagttaattt 19527115  T
Q  325 aggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19527114 aggttatgaaaatgatagaaatgatgttagttatagtttggttaagtgtatattg 19527060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Original strand, 47502515 - 47502859
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  47502515 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 47502610  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  47502611 gagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 47502710  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47502711 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttggtaaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 47502809  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||   |||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502810 ttag---aggtt---------atagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 47502859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49857740 - 49857463
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||     |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857740 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgataattttatcattgcatgtgtagtttatgttttgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 49857641  T
Q  198 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
    |||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  49857640 tgtttaaatgagaatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaa--- 49857545  T
Q  298 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49857544 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 49857463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 30890262 - 30890608
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  30890262 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 30890356  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  30890357 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggc 30890456  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30890457 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 30890555  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890556 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 30890608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 98 - 371
Target Start/End: Original strand, 19925018 - 19925289
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19925018 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgt 19925117  T
Q  198 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
     ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  19925118 agtttaaattataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatga 19925216  T
Q  298 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19925217 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 19925289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29622297 - 29622105
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  29622297 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 29622202  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgt 214  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29622201 gggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50343644 - 50343525
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50343644 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 50343545  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  50343544 gtttaggttatggatatgat 50343525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 11183378 - 11183549
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||               |||||||||||||||||||||||    
T  11183378 attatcacaagtaagttgtatcaattattttaatgattatgttagtttgtttaggtttatttaa-aaaaaagaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 11183476  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 190  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11183477 gagttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagttgttg 11183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 21141425 - 21141544
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21141425 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 21141524  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21141525 gtttaggttatggatatgat 21141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 340
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656386
Alignment:
Q  208 ataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  47656256 ataatgtgattt-tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 47656354  T
Q  308 gattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47656355 gattatttagttagttt-ggttatggatatgat 47656386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17514497 - 17514267
Alignment:
Q  104 tttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaa 203  Q
    |||||||||||||| |||||||     |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    || |||| |    
T  17514497 tttgcatgtggttagggtttataaatgaattgacattttgaagattacgtgtgtagtttatgaattgataaatgaatatagttgttgtaattgatgttta 17514398  T
Q  204 aat----------cataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca 293  Q
    |||           ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  17514397 aatgatgtataagtataatgtg-gttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaa 17514299  T
Q  294 atgaaaattatattgattatttagttagttta 325  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17514298 ataaaaattatattgattatttagttaattta 17514267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 97623 - 97504
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  97623 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattgtttatttagtta 97524  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  97523 gtttaggttatggatatgat 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 2365634 - 2365741
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2365634 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 2365733  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  2365734 gtttaggt 2365741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2425040 - 2424924
Alignment:
Q  222 gaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttag 321  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  2425040 gaatggagccaaataaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatttatttag 2424943  T
Q  322 tttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2424942 tttaggttatggatatgat 2424924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Original strand, 11196153 - 11196244
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11196153 ttagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagtt 11196244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 19156413 - 19156520
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19156413 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 19156512  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  19156513 gtttaggt 19156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 22524534 - 22524650
Alignment:
Q  222 gaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttag 321  Q
    |||||| | ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22524534 gaatggagccaaataaacataatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttag 22524631  T
Q  322 tttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||| | ||||| |||||    
T  22524632 tttagatcatggatatgat 22524650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 22524326 - 22524460
Alignment:
Q  17 aattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||| ||||||||||||||    
T  22524326 aattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttt-----aaaaaaattagagtggtttgcatgtggtt 22524420  T
Q  117 atggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 156  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22524421 agggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtg 22524460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38127158 - 38127045
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtt 319  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38127158 tgaatggtggcaaaaaaaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttagtt 38127059  T
Q  320 agtttaggttatgg 333  Q
    ||||||||||||||    
T  38127058 agtttaggttatgg 38127045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3732052 - 3731949
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3732052 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 3731953  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  3731952 aggt 3731949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13639698 - 13639591
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13639698 tgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 13639599  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  13639598 gtttaggt 13639591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 26876059 - 26876162
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26876059 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 26876158  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  26876159 aggt 26876162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Original strand, 45825087 - 45825134
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagttt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825087 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagttt 45825134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2425175 - 2425114
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2425175 ttagagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtg 2425114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 8474187 - 8474259
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  8474187 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Original strand, 19924957 - 19925000
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgtta 61  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19924957 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgtta 19925000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Original strand, 25166976 - 25167050
Alignment:
Q  250 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  25166976 tatgtttcatactttgcactcaaagtgtttgataaaattcctaaatgaggattacattgatttttttgttagttt 25167050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 95 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 6320363 - 6320044
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320363 ttagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 6320264  T
Q  195 tgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6320263 tgttgttaaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgtttgatcaaatgcctcaa 6320165  T
Q  295 tgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  6320164 tgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtt 6320065  T
Q  395 taggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  6320064 taggttacgagaattatgatg 6320044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24088658 - 24088299
Alignment:
Q  17 aattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtt 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||    
T  24088658 aattatcacaaataagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaaaaaaaa--tagagtagtttgcatgtggtt 24088561  T
Q  117 atggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtga 216  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||     
T  24088560 agtgttgattttaaaattgacaatttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtgg 24088461  T
Q  217 cttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattta 316  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24088460 ctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgatcaaatgtctcaatgaaaattatattgattattta 24088362  T
Q  317 gttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24088361 gttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatgatagtttgattaggtgtatattg 24088299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 31768900 - 31769297
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  31768900 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttttttaaaaa---ttagagtagtttgcatgtggtta 31768996  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgc----atgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatg 213  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31768997 gggttgattttaaaatcgacaatttgatgattgcttgcatgtgtggtttaggaattgacaaatgaatgtagttgttgcttatgttgtttaaatcataatg 31769096  T
Q  214 tgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattat 313  Q
    ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  31769097 tggttt-tgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattat 31769195  T
Q  314 ttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||    
T  31769196 ttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatga 31769295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Original strand, 21601002 - 21601106
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21601002 tgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattgattatttagtta 21601101  T
Q  321 gttta 325  Q
    |||||    
T  21601102 gttta 21601106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 24722326 - 24722445
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24722326 tgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattgattatttagtta 24722425  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  24722426 gtttaggttatggatatgat 24722445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 26423395 - 26423514
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  26423395 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgtttatttagtta 26423494  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  26423495 gtttatgttatggatatgat 26423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 364
Target Start/End: Original strand, 3381049 - 3381313
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  3381049 gagtaatttgcatgtggttaggttttataagtgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgcattgatgaatgaatatagttgttgcctatgc 3381148  T
Q  198 tgttaaaatca-------taatgt---gacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 287  Q
    ||||  ||| |       | ||||   ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3381149 tgtttcaatgaatgtagtttatgtattgataaatgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaat 3381248  T
Q  288 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg 364  Q
    |||||||            |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3381249 gcctcaa------------tgattatttaattagtttatgttatggaaatgattaaaatgatgttaattatagtttg 3381313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 3501567 - 3501686
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  3501567 tgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattgtttatttagtta 3501666  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  3501667 gtttaggttatggatatgat 3501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 6201550 - 6201653
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6201550 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 6201649  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  6201650 aggt 6201653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 11688517 - 11688620
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11688517 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 11688616  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  11688617 aggt 11688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 22301578 - 22301685
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22301578 tgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 22301677  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  22301678 gtttaggt 22301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 27617113 - 27617220
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  27617113 tgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattgattatttagtta 27617212  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  27617213 gtttaggt 27617220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30829323 - 30829220
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30829323 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 30829224  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  30829223 aggt 30829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30424228 - 30424143
Alignment:
Q  101 tagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 186  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |   |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30424228 tagtgtgcatgtggttagagtttatgtatgaattgacattttgatgattgcatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagtt 30424143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 6320401 - 6320371
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcatttt 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320401 attatcacaagtaagttgtatcaatcatttt 6320371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39846862 - 39846503
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            | |||||||||||||||||||||    
T  39846862 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttataaaaaaaaaat-agagtagtttgcatgtggtta 39846764  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39846763 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 39846664  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  39846663 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgataaactgtctccatgacaattttattgattatttag 39846565  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846564 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 39846503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34822893 - 34822534
Alignment:
Q  18 attatcacaagta--agttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggt 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||    
T  34822893 attatcacaagtataagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaaa---ttagagtagtttgcatgtggt 34822797  T
Q  116 tatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtg 215  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34822796 tagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttggttaaatcataatgtg 34822697  T
Q  216 acttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattt 315  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822696 gctt-tgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattattt 34822598  T
Q  316 agttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822597 agttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatattaattatagtttggttaagtgtatattg 34822534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 106 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5304010 - 5303702
Alignment:
Q  106 tgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaa 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5304010 tgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttcatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaa 5303911  T
Q  206 tcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattata 305  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303910 tcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattata 5303812  T
Q  306 ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacggg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |    
T  5303811 ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgag 5303712  T
Q  406 aatgatgatg 415  Q
    ||| ||||||    
T  5303711 aattatgatg 5303702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 415
Target Start/End: Original strand, 43188253 - 43188641
Alignment:
Q  22 tcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggttatggt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||    
T  43188253 tcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttatggt 43188348  T
Q  122 ttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgacttat 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  43188349 tgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctt-t 43188447  T
Q  222 gaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttag 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43188448 gaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaattttattgattatttagttag 43188547  T
Q  322 tttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43188548 tttatgttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 43188641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 40077123 - 40076776
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  40077123 attatcagaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 40077028  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40077027 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattatatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagctgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 40076928  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076927 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 40076829  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||         | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076828 ttagtttaggtt---------acagaaatgatgataattatagtttggttaagtgtatattg 40076776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 43211706 - 43212097
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||            ||||||||||||| ||||| |||    
T  43211706 attaccacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgttttggttgatttttttaaaaaa-----ttagagtagtttgtatgtgctta 43211800  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  43211801 gggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 43211900  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43211901 tt-tgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 43211999  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43212000 ttagtttaggttaaggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 43212097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39939089 - 39938733
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||            |||||||||||| ||||||||||    
T  39939089 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaa----ttagagtagtttacatgtggtta 39938994  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  39938993 gggttgattttaaaattgataatttgatgattacatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatggggc 39938894  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||    
T  39938893 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatgtag 39938795  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39938794 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 39938733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 95 - 364
Target Start/End: Original strand, 39601988 - 39602256
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39601988 ttagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgccta 39602087  T
Q  195 tgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39602088 tgttgtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaa 39602186  T
Q  295 tgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg 364  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39602187 tgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatattttg 39602256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15036601 - 15036209
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||            ||||||| ||||| |||||||||    
T  15036601 attatcacaaataagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtttatttttttaaaaaaa----ttagagtggtttgtatgtggtta 15036506  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15036505 gggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttcaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 15036406  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15036405 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 15036307  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatga-tgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15036306 ttagttta-gttatggaaatgatagaaattagggttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 15036209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 415
Target Start/End: Original strand, 39252210 - 39252594
Alignment:
Q  19 ttatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggttat 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||             ||||||||||||| |||||||||     
T  39252210 ttatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttt-aaaaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggtta- 39252307  T
Q  119 ggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgact 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39252308 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggct 39252407  T
Q  219 tatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagt 318  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39252408 t-tgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 39252506  T
Q  319 tagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39252507 tagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggtcaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 39252594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41249946 - 41249606
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  41249946 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttttttaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 41249851  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41249850 gggtagattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 41249751  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                | |||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  41249750 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcac----------------attgccgcaatgacaattttattgattatgtag 41249668  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41249667 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattg 41249606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 375
Target Start/End: Original strand, 45064441 - 45064782
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  45064441 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 45064536  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  45064537 gggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcttaatgtggc 45064636  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45064637 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaat----------ttttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 45064725  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064726 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 45064782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 489501 - 489155
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  489501 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaaatttttaaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 489407  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | ||||      |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  489406 ggttttacaaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggc 489307  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  489306 tt-tgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 489208  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489207 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 489155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42485410 - 42485086
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  42485410 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 42485316  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  42485315 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggc 42485216  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42485215 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 42485117  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42485116 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 42485086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Original strand, 2984395 - 2984678
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcct- 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||  | ||| ||||||||| ||| |   |     
T  2984395 ttagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgttaa-gatgttatagatgaatgtaattgatctttg 2984493  T
Q  194 -atgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 292  Q
     ||| | || || | ||||||||  || |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2984494 aatgatttttaagt-ataatgtggttt-tgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 2984591  T
Q  293 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2984592 aacgacaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtatattg 2984678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 340
Target Start/End: Original strand, 24249759 - 24249999
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  24249759 gagtagtttgcatgtggttagggttgatataggaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 24249858  T
Q  198 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
    |||| || | ||||||||  || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24249859 tgtttaagt-ataatgtggttt-tgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatga 24249956  T
Q  298 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24249957 gaattatattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgat 24249999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25864812 - 25864620
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  25864812 attatcacaagtaagttgtattaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaatattagagtagtttgcatgtggtta 25864717  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtg 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25864716 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtag-ttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtg 25864620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 332
Target Start/End: Original strand, 37327080 - 37327292
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                  
T  37327080 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgta-------------- 37327164  T
Q  198 tgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
          ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37327165 ------aatgataatgtgattt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 37327257  T
Q  298 aaattatattgattatttagttagtttaggttatg 332  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327258 caattttattgattatttagttagtttaggttatg 37327292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 35552063 - 35552182
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35552063 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 35552162  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  35552163 gtttaggttatggatatgat 35552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 20857683 - 20857802
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20857683 tgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 20857782  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20857783 gtttaggttatggatatgat 20857802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Original strand, 45128147 - 45128261
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  45128147 tgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattgattattgagtta 45128246  T
Q  321 gtttaggttatggaa 335  Q
    |||||||||||||||    
T  45128247 gtttaggttatggaa 45128261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25198 - 25095
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25198 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 25099  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  25098 aggt 25095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 1052926 - 1053029
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1052926 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattgattatttagttagttt 1053025  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  1053026 aggt 1053029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Original strand, 5677468 - 5677587
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  5677468 tgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattgattatcgagtaa 5677567  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5677568 gtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23021992 - 23021889
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23021992 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 23021893  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  23021892 aggt 23021889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 26659848 - 26659951
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26659848 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 26659947  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  26659948 aggt 26659951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34371553 - 34371450
Alignment:
Q  237 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaa 336  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34371553 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggttatggata 34371454  T
Q  337 tgat 340  Q
    ||||    
T  34371453 tgat 34371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Original strand, 35026687 - 35026749
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttatttt 80  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  35026687 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttt 35026749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 187
Target Start/End: Original strand, 22495216 - 22495272
Alignment:
Q  131 aattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttg 187  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22495216 aattgacattttgatggttgcatgtgtagtttacgaattgataaatgaatgtagttg 22495272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 325
Target Start/End: Original strand, 22495315 - 22495419
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | |||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||    
T  22495315 tgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgattatttactta 22495414  T
Q  321 gttta 325  Q
    |||||    
T  22495415 gttta 22495419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Original strand, 35026740 - 35026786
Alignment:
Q  119 ggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatg 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35026740 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatg 35026786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 39601903 - 39601953
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtt 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39601903 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtt 39601953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 5304043 - 5304009
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatg 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5304043 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatg 5304009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34370168 - 34370133
Alignment:
Q  305 attgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34370168 attgattatttagttagtttaggttatggatatgat 34370133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 45128025 - 45128082
Alignment:
Q  98 gagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| | ||||||||||||||||    
T  45128025 gagtagtttgcatgtggttatggttgatgtaggaattgaaattttgatgattgcatgt 45128082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 332
Target Start/End: Original strand, 2984681 - 2984709
Alignment:
Q  304 tattgattatttagttagtttaggttatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2984681 tattgattatttagttagtttaggttatg 2984709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 45127949 - 45128005
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtt 74  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  45127949 attatcacaagtaagtagcattaatcaatttaatcttaatgttagtttgtttaggtt 45128005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 39947799 - 39948192
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  39947799 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatatgtttaggttgattttttttaaaaaaa---ttagagtagtttgtatgtggtta 39947895  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39947896 gggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 39947995  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39947996 tt-tgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 39948094  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39948095 ttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 39948192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 28468841 - 28469232
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  28468841 attatcacaagtaagttgtgtcaatcatttgaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 28468936  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28468937 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtaattgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 28469036  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28469037 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 28469135  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28469136 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 28469232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Original strand, 45428790 - 45429182
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||             ||||||||||||| |||||||||    
T  45428790 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgattttt---aaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggtta 45428886  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |    
T  45428887 gggttgatttaaaaaatgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctacgtagtttaaatcataatgtggc 45428986  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45428987 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 45429085  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45429086 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 45429182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32956228 - 32955840
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| ||||||||     
T  32956228 attatcacaagtaagttgtgccaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaaa---ttagagtagtttgtatgtggttt 32956132  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  32956131 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtacttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggc 32956032  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    ||||||||||||    
T  32956031 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat----ttgattatttag 32955937  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32955936 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgg-taagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 32955840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 21998390 - 21998737
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  21998390 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 21998485  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  21998486 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagtaattgataattgaatttatttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggc 21998585  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21998586 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 21998684  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998685 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 21998737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 17420767 - 17421114
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||    
T  17420767 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttagaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggtta 17420862  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  17420863 gggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgatcattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggg 17420962  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17420963 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatcaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 17421061  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 371  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421062 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 17421114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 25965012 - 25965308
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnt----tagagtagtttgcatgtg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||                   ||||||||||||||||||    
T  25965012 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaataaaaaaaatagagtagtttgcatgtg 25965111  T
Q  114 gttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatg 213  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25965112 gttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtttcctatgttgtttaaatcataatg 25965211  T
Q  214 tgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgatt 311  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  25965212 tggctt-tgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgataattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 7185228 - 7185481
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||              |||||||||||| |||||||||    
T  7185228 attatcacaagtaagttgtgtcaataattttaatgttaatgttgatttgtttaggttgatttttaaaaaaaaaaa---tagagtagtttgtatgtggtta 7185324  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7185325 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 7185424  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185425 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45137305 - 45137112
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||             |||||||||||||||||||||||    
T  45137305 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgatagtgttagtttgtttaggtttattttt----aaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggtta 45137210  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtg 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  45137209 aggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttcttgcctatgttatttaaatcataatgtg 45137112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 232 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136784
Alignment:
Q  232 aaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttat 331  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||           |||||||||||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatt-----------tagtttaggttat 45136868  T
Q  332 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacgggaatgatgatg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45136867 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatg 45136784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25515484 - 25515366
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25515484 tgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattgattattgagtta 25515386  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25515385 gtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29401279 - 29401160
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29401279 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 29401180  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  29401179 gtttagcttatggatatgat 29401160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36656023 - 36655906
Alignment:
Q  223 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 322  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36656023 aatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattgattatttagttagt 36655924  T
Q  323 ttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||| |||||    
T  36655923 ttaggttatggatatgat 36655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 45284570 - 45284683
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45284570 tgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattgattatttagtta 45284669  T
Q  321 gtttaggttatgga 334  Q
    |||||| |||||||    
T  45284670 gtttagattatgga 45284683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 45291933 - 45292046
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45291933 tgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattgattatttagtta 45292032  T
Q  321 gtttaggttatgga 334  Q
    |||||| |||||||    
T  45292033 gtttagattatgga 45292046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10828700 - 10828581
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10828700 tgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtta 10828601  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10828600 gtttaggttatggatatgat 10828581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 20938294 - 20938401
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20938294 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 20938393  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  20938394 gtttaggt 20938401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3940400 - 3940297
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3940400 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 3940301  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  3940300 aggt 3940297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 5352367 - 5352470
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5352367 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 5352466  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  5352467 aggt 5352470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Original strand, 15831526 - 15831633
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15831526 tgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagtta 15831625  T
Q  321 gtttaggt 328  Q
    ||||||||    
T  15831626 gtttaggt 15831633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30496618 - 30496515
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30496618 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 30496519  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  30496518 aggt 30496515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Original strand, 43978922 - 43979025
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43978922 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 43979021  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  43979022 aggt 43979025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 415
Target Start/End: Original strand, 22686863 - 22686970
Alignment:
Q  307 tgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgnnnnnnnggttagtttaggttacggga 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||| ||    
T  22686863 tgattatttagttagtttag-ttatggaaatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgaga 22686961  T
Q  407 atgatgatg 415  Q
    || ||||||    
T  22686962 attatgatg 22686970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 43539409 - 43539306
Alignment:
Q  225 tggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43539409 tggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattgattatttagttagttt 43539310  T
Q  325 aggt 328  Q
    ||||    
T  43539309 aggt 43539306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35464398 - 35464313
Alignment:
Q  101 tagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 186  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |   |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35464398 tagtttgcatgtggttaggatttatgtatgaattgacattctgatgattgcatgtgtagtttatgaatttataaatgaatgtagtt 35464313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 42505634 - 42505584
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtt 68  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42505634 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtt 42505584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 190
Target Start/End: Original strand, 31367308 - 31367397
Alignment:
Q  101 tagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |   |||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  31367308 tagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgcatatatagtttatgaatttataaatgaatttatttgttg 31367397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15495 - 15140
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  15495 attatcataagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaa-----ttagagtagtttgtatgtggtta 15401  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15400 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttattgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 15301  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15300 tt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttag 15202  T
Q  318 ttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15201 ttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattg 15140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 95 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 250
Alignment:
Q  95 ttagagtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgccta 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  528 ttagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgccta 429  T
Q  195 tgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaa 294  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  428 tgtagtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaacgtgtttgataaaatgtctcaa 330  T
Q  295 tgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 375  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  329 tgacaattttattaattatttagttagttta-gttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 595 - 561
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatg 52  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  595 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 330
Target Start/End: Original strand, 7618 - 7925
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| |||||||||    
T  7618 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaa----ttagagtagtttgtatgtggtta 7713  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtgac 217  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7714 gggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggc 7813  T
Q  218 ttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttag 317  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  7814 tt-tgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattttttag 7912  T
Q  318 ttagtttaggtta 330  Q
    |||||||||||||    
T  7913 ttagtttaggtta 7925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 8404 - 8582
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||            |||||||||||||||||||||||    
T  8404 attatcacaagtaagttgcatcaattattttaatgataatgttagtttgtttaggtttaatttttaaaaaaa-----ttagagtagtttgcatgtggtta 8498  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 201  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499 gggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtt 8582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 230 - 332
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10863
Alignment:
Q  230 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttaggtt 10860  T
Q  330 atg 332  Q
    |||    
T  10861 atg 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18608 - 18489
Alignment:
Q  221 tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtta 320  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18608 tgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta 18509  T
Q  321 gtttaggttatggaaatgat 340  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  18508 gtttaggttatggatatgat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4327 - 4210
Alignment:
Q  223 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 322  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4327 aatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattgattattgagttagt 4228  T
Q  323 ttaggttatggaaatgat 340  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  4227 ttagggtatgaaaatgat 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 251270 - 251048
Alignment:
Q  100 gtagtttgcatgtggttatggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 199  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  |   ||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||    
T  251270 gtagtttgcatatggttagggtttacgtatgaattggcattttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatg 251171  T
Q  200 ttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 299  Q
    ||  ||  | ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||  ||||||   |||||||    
T  251170 tt-taagaagaatgtg-gttttgaatggtgtcaaattaacacaataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatgctcaaatgaaa 251073  T
Q  300 attatattgattatttagttagttt 324  Q
    |||  |||||||||||| |||||||    
T  251072 attgcattgattatttacttagttt 251048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 297
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  249 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40907 - 40746
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttattttttnnnnnnnnnnnnttagagtagtttgcatgtggtta 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | |||||             | ||||||||||||||||||||    
T  40907 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaa-----ttgagtagtttgcatgtggtta 40813  T
Q  118 tggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgaagtttatgaattgataaatgaatgtag 184  Q
     | |||||     |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40812 ggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtag 40746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18168 - 18112
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18168 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggtt 18112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 54676 - 54732
Alignment:
Q  18 attatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  54676 attatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggtt 54732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University