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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19185_low_26 (Length: 250)
Name: NF19185_low_26
Description: NF19185
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19185_low_26 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 39225867 - 39226100
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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| T |
39225867 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
39225966 |
T |
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| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
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| T |
39225967 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
39226066 |
T |
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| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
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| T |
39226067 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
39226100 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 39219341 - 39219575
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
39219341 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacataataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
39219440 |
T |
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| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaact-aaatgaaagaagaaatgagtttc |
199 |
Q |
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| T |
39219441 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaaatgaaagaagaaatgggtttc |
39219540 |
T |
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| Q |
200 |
ttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
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| T |
39219541 |
ttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
39219575 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 235279 - 235512
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
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| T |
235279 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacaactaataccttagggtgctagttgaaaggatattagatacgattaaatacttgtataattaatgacta |
235378 |
T |
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| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
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|
| T |
235379 |
atcaagatgggatccgtcaattcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccaaggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
235478 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
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| T |
235479 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
235512 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47114247 - 47114014
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
47114247 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacatctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
47114148 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
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| T |
47114147 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctataataaaatcaaaaccttagccagggaaagtaaatgaaagaagaaattagtttat |
47114048 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47114047 |
taaatcatatatgttaacttattagagtttgaca |
47114014 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 40056017 - 40055903
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40056017 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
40055918 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatcc |
115 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |
|
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| T |
40055917 |
atcaagatgggatcc |
40055903 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3190406 - 3190272
Alignment:
| Q |
5 |
gttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgactaatca |
104 |
Q |
| |
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|
| T |
3190406 |
gttatatattgtattttaattctaaacacctaatacgttagagtgttagttgaaaaaatattgggtaagattaaatatttatataactaataattgatta |
3190307 |
T |
|
| Q |
105 |
agatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttga |
139 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
3190306 |
agatgagatccgttaactcatggtaacgtgtttga |
3190272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5912155 - 5911922
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5912155 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
5912056 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5912055 |
atcaagatgggattcgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
5911956 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5911955 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
5911922 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5919090 - 5918857
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5919090 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
5918991 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5918990 |
atcaagatgggattcgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
5918891 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5918890 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
5918857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6750324 - 6750557
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6750324 |
acatgttatttattgtattttgattcttaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
6750423 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6750424 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccaaggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
6750523 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6750524 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
6750557 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35418321 - 35418088
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35418321 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
35418222 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35418221 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
35418122 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35418121 |
taagtcatatatgctaacttattagagtttgaca |
35418088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38485479 - 38485712
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38485479 |
acatattatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
38485578 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38485579 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
38485678 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38485679 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
38485712 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36101255 - 36101024
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36101255 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaa--ccttagggtgttagttgaaaggatattggatacgattaaatgtttgtataattaatgacta |
36101158 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36101157 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctagccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttat |
36101058 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36101057 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
36101024 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41195134 - 41194900
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41195134 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatacttatataattaatgacta |
41195035 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaa-tcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttc |
199 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41195034 |
atcaagatgagatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaattaaaaaccctgatcagggaaattgaatgaaagaagaaatgagtttc |
41194935 |
T |
|
| Q |
200 |
ttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41194934 |
ttaagtaatatatgttaacttattagagtttgaca |
41194900 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 10569877 - 10570110
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10569877 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacaattaaatgcttgtataattaatgacta |
10569976 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10569977 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
10570076 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10570077 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
10570110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 10566627 - 10566860
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
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| T |
10566627 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacaattaaatgcttgtataattaatgacta |
10566726 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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| T |
10566727 |
atcaagatgggatccgtcaactcttgataatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
10566826 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
10566827 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
10566860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29673731 - 29673498
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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| T |
29673731 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
29673632 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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| T |
29673631 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctagccagggaaactaaatgaaagaagaaacgagtttct |
29673532 |
T |
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| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
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| T |
29673531 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
29673498 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 8545855 - 8546091
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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| T |
8545855 |
acatgttatttattgtattttggttctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattgaatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
8545954 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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| T |
8545955 |
attaagatgagatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactgtatgataaaatcaaaaccctggccaaggaaattaaatgaaagaagaaatgagtttct |
8546054 |
T |
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| Q |
201 |
taa---gtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
8546055 |
taaatcatcatatatgttaacttattagagtttgaca |
8546091 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20283139 - 20283367
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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| T |
20283139 |
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20283233 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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| T |
20283234 |
atcaagatgagatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaactaaaacccttgtcagggaaattgattgaaagaagaaatgagtttct |
20283333 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
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| T |
20283334 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
20283367 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21561561 - 21561359
Alignment:
| Q |
16 |
tattttgattctgaacacctaataccttagggtg---ctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgactaatcaagatggga |
112 |
Q |
| |
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| T |
21561561 |
tattttgattcttaacatctaataccttagggtgttgctagttgaaaggatattagaaattattaaatacttgtataattaatgact------gatgaga |
21561468 |
T |
|
| Q |
113 |
tccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaa-tcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttcttaagtcatata |
211 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
21561467 |
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21561371 |
T |
|
| Q |
212 |
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223 |
Q |
| |
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| T |
21561370 |
tgttaacttatt |
21561359 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Original strand, 26463113 - 26463280
Alignment:
| Q |
70 |
tacgattaaatgcttgtataattaatgactaatcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccat |
169 |
Q |
| |
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| T |
26463113 |
tacggttaaatacttgtataattaattattaatcaatattggattcgtcatctcttggtaattagtttgagctctaagataaaattaaaaccatggttag |
26463212 |
T |
|
| Q |
170 |
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234 |
Q |
| |
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||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
26463213 |
ggaaattgaatgaatgaagaaataagtttctaaagtcgtactatatgttaacttattagagtttgaca |
26463280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 77
Target Start/End: Original strand, 26462973 - 26463044
Alignment:
| Q |
6 |
ttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgatta |
77 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
26462973 |
ttatttattgtaatttgactctcaaaacctaataccttaggttgctagtggatagtatattgaatatgatta |
26463044 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16861337 - 16861104
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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| T |
16861337 |
acatgttatttattgtattttgattatgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataatttatgacta |
16861238 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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| T |
16861237 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccagggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
16861138 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16861137 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
16861104 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 40769465 - 40769698
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
40769465 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatatttgatacgattaatttcttgtataattaatgacta |
40769564 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
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| T |
40769565 |
atcaagatgggatccgtcaattcttggtaatgagtttgaactctatgataaaattaaaaccctggccagggaaattgaatgaaagaagaaatgagtttct |
40769664 |
T |
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| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
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| T |
40769665 |
taagtcatataagttaacttattagagtttgaca |
40769698 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47019541 - 47019308
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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|
| T |
47019541 |
acatgttatttattgtattttgattctggacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataactaatgatta |
47019442 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47019441 |
atcaagatgggatccttcaacttttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccccggccagggaaattaaatgaaagaagaaatgagtttct |
47019342 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47019341 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
47019308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 24185489 - 24185643
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24185489 |
acatattatttattatattttgattctgaacacctaacaccttagggtgctagttgaaaggatattggatacaattaaatgcttgtataattaataacta |
24185588 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaac |
160 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24185589 |
atcaa-----gatccgtcaactcttggtaatgactttgaactctatgataaaattaaaac |
24185643 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20349755 - 20349968
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20349755 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggttctagttgaaaggataatgaatacgattaaatacttgtataattaatgacta |
20349854 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctggccatggaaactaaatgaaagaagaaatgagtttct |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20349855 |
atcaagatgtgatccatcaactattggtaatgatt--------------------aaaaccctggctagggaaattgtatgaaagaaggaatgagtttct |
20349934 |
T |
|
| Q |
201 |
taagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
20349935 |
taagttatatgtgttaacttattagagtttgaca |
20349968 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 234
Target Start/End: Original strand, 24188291 - 24188336
Alignment:
| Q |
189 |
aaatgagtttcttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24188291 |
aaatgagtttcttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
24188336 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39511176 - 39511137
Alignment:
| Q |
195 |
gtttcttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
39511176 |
gtttcttaagtcatatatgttaacttattagagtttgaca |
39511137 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 10267389 - 10267550
Alignment:
| Q |
1 |
acatgttatttattgtattttgattctgaacacctaataccttagggtgctagttgaaaggatattggatacgattaaatgcttgtataattaatgacta |
100 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
10267389 |
acatgttatttattgcattttgattctgatcacctaattccttagggttttagtttaaaggatattggatccgattaaatacttgtataattaatgacta |
10267488 |
T |
|
| Q |
101 |
atcaagatgggatccgtcaactcttggtaatgagtttgaactctatgataaaatcaaaaccctg |
164 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10267489 |
atcaagat--gacccgtcaactcttggtaatgaatttgagctctatgataaaattaagaccctg |
10267550 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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