View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19193_low_28 (Length: 410)

Name: NF19193_low_28
Description: NF19193
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19193_low_28
NF19193_low_28
[»] chr1 (208 HSPs)
chr1 (161-410)||(8796226-8796475)
chr1 (148-410)||(40416375-40416637)
chr1 (151-410)||(32404542-32404801)
chr1 (148-410)||(48431415-48431684)
chr1 (148-410)||(3818872-3819134)
chr1 (160-406)||(38868898-38869144)
chr1 (148-404)||(2544603-2544853)
chr1 (148-410)||(5338728-5338979)
chr1 (148-406)||(36339824-36340081)
chr1 (52-410)||(1210656-1211011)
chr1 (229-409)||(6025690-6025870)
chr1 (159-410)||(27847816-27848072)
chr1 (174-410)||(52561605-52561841)
chr1 (64-406)||(9599414-9599752)
chr1 (64-410)||(37462892-37463229)
chr1 (148-410)||(19908051-19908317)
chr1 (85-406)||(35828582-35828887)
chr1 (187-409)||(42501151-42501373)
chr1 (88-409)||(39140468-39140780)
chr1 (52-410)||(30202146-30202501)
chr1 (71-351)||(43423648-43423926)
chr1 (229-408)||(29577161-29577339)
chr1 (64-410)||(49347409-49347751)
chr1 (254-408)||(28511819-28511973)
chr1 (148-410)||(38807687-38807949)
chr1 (52-410)||(696180-696536)
chr1 (64-395)||(9509242-9509569)
chr1 (165-366)||(10569131-10569328)
chr1 (64-410)||(34792365-34792707)
chr1 (295-410)||(41560380-41560495)
chr1 (295-406)||(52532636-52532747)
chr1 (153-366)||(990518-990732)
chr1 (91-406)||(1661377-1661681)
chr1 (52-410)||(9592645-9593000)
chr1 (158-366)||(15577435-15577640)
chr1 (148-410)||(51602060-51602322)
chr1 (184-410)||(853797-854027)
chr1 (152-392)||(13827614-13827844)
chr1 (341-410)||(28090710-28090779)
chr1 (52-399)||(40419550-40419893)
chr1 (257-410)||(51812623-51812775)
chr1 (64-406)||(4001475-4001813)
chr1 (203-410)||(33560874-33561081)
chr1 (65-409)||(16822038-16822376)
chr1 (308-409)||(31274418-31274519)
chr1 (174-410)||(25979247-25979483)
chr1 (302-409)||(43375615-43375722)
chr1 (160-274)||(14225981-14226095)
chr1 (151-409)||(18469099-18469357)
chr1 (340-410)||(25715342-25715412)
chr1 (71-410)||(8671851-8672184)
chr1 (301-410)||(19936617-19936726)
chr1 (341-410)||(21769727-21769796)
chr1 (82-282)||(27703951-27704146)
chr1 (341-410)||(44941792-44941861)
chr1 (52-282)||(15085845-15086072)
chr1 (287-410)||(29128926-29129050)
chr1 (287-410)||(7124284-7124407)
chr1 (255-410)||(19908400-19908555)
chr1 (311-406)||(27072507-27072602)
chr1 (184-403)||(28528395-28528614)
chr1 (319-410)||(34444531-34444622)
chr1 (342-409)||(45510850-45510917)
chr1 (64-410)||(51440781-51441123)
chr1 (327-410)||(52921263-52921346)
chr1 (148-410)||(22090100-22090362)
chr1 (188-410)||(30833993-30834215)
chr1 (184-410)||(38877359-38877585)
chr1 (301-410)||(4590548-4590657)
chr1 (325-410)||(4707237-4707321)
chr1 (341-410)||(22175342-22175411)
chr1 (341-410)||(40568426-40568495)
chr1 (341-410)||(50257767-50257836)
chr1 (231-406)||(50846652-50846824)
chr1 (287-410)||(8203150-8203273)
chr1 (327-406)||(37311775-37311854)
chr1 (327-410)||(39318312-39318394)
chr1 (348-406)||(17269009-17269067)
chr1 (344-410)||(26113455-26113521)
chr1 (341-410)||(1290047-1290116)
chr1 (349-406)||(2429649-2429706)
chr1 (328-409)||(10200323-10200404)
chr1 (158-329)||(10272273-10272443)
chr1 (148-321)||(27637736-27637911)
chr1 (346-410)||(29577454-29577518)
chr1 (55-406)||(32082776-32083113)
chr1 (319-410)||(6084150-6084241)
chr1 (351-406)||(27704157-27704212)
chr1 (148-410)||(4029126-4029388)
chr1 (348-406)||(37294128-37294186)
chr1 (287-376)||(7762487-7762576)
chr1 (52-207)||(8391683-8391835)
chr1 (295-408)||(11941598-11941711)
chr1 (161-410)||(26016454-26016703)
chr1 (341-410)||(44751681-44751750)
chr1 (295-410)||(8676878-8676996)
chr1 (171-255)||(9002379-9002463)
chr1 (350-410)||(28533673-28533733)
chr1 (52-410)||(43240395-43240752)
chr1 (314-386)||(52900682-52900754)
chr1 (341-409)||(52981424-52981492)
chr1 (261-410)||(8342900-8343046)
chr1 (327-410)||(15086105-15086188)
chr1 (287-410)||(29807999-29808122)
chr1 (313-407)||(40920547-40920642)
chr1 (71-133)||(40920825-40920888)
chr1 (160-366)||(41611822-41612028)
chr1 (184-409)||(52160260-52160478)
chr1 (324-406)||(7133322-7133404)
chr1 (64-321)||(16943099-16943351)
chr1 (162-387)||(17815490-17815722)
chr1 (364-410)||(26299288-26299334)
chr1 (286-400)||(27520233-27520347)
chr1 (315-410)||(48861391-48861488)
chr1 (309-403)||(48865730-48865824)
chr1 (225-410)||(50806750-50806933)
chr1 (323-408)||(7082483-7082568)
chr1 (149-218)||(13827925-13827994)
chr1 (70-123)||(16273119-16273172)
chr1 (341-410)||(42337753-42337822)
chr1 (327-410)||(46423232-46423312)
chr1 (358-410)||(2914139-2914191)
chr1 (158-234)||(8343050-8343126)
chr1 (318-410)||(11584171-11584263)
chr1 (254-410)||(30396745-30396901)
chr1 (64-219)||(32231161-32231312)
chr1 (341-393)||(39896760-39896812)
chr1 (236-410)||(52073064-52073241)
chr1 (310-389)||(109030-109109)
chr1 (341-408)||(2694437-2694504)
chr1 (152-207)||(7921843-7921898)
chr1 (319-402)||(14557743-14557826)
chr1 (327-410)||(24020283-24020366)
chr1 (351-402)||(32112013-32112064)
chr1 (347-410)||(37429915-37429978)
chr1 (349-404)||(39123391-39123445)
chr1 (287-410)||(39515884-39516007)
chr1 (295-410)||(52292191-52292305)
chr1 (147-282)||(2499974-2500115)
chr1 (64-133)||(4379929-4379999)
chr1 (295-401)||(12930336-12930442)
chr1 (71-121)||(35672619-35672669)
chr1 (160-338)||(46388392-46388570)
chr1 (187-410)||(12231408-12231624)
chr1 (158-239)||(17275210-17275291)
chr1 (324-385)||(39776936-39776997)
chr1 (327-410)||(32079193-32079274)
chr1 (362-406)||(41165500-41165544)
chr1 (370-410)||(43481814-43481854)
chr1 (184-408)||(44008628-44008842)
chr1 (351-410)||(1704834-1704893)
chr1 (210-277)||(6573407-6573474)
chr1 (297-410)||(36623901-36624013)
chr1 (348-406)||(42539232-42539291)
chr1 (351-410)||(49377508-49377567)
chr1 (186-329)||(50771653-50771795)
chr1 (364-410)||(7210943-7210989)
chr1 (290-400)||(10799841-10799950)
chr1 (301-359)||(17267797-17267855)
chr1 (301-359)||(17275342-17275400)
chr1 (64-122)||(19936446-19936504)
chr1 (196-282)||(43375731-43375817)
chr1 (158-232)||(51812539-51812613)
chr1 (365-406)||(4318865-4318906)
chr1 (327-404)||(4415532-4415609)
chr1 (340-409)||(5113939-5114008)
chr1 (333-402)||(8391961-8392030)
chr1 (351-408)||(14225854-14225911)
chr1 (341-386)||(19822085-19822130)
chr1 (148-201)||(19936518-19936571)
chr1 (308-409)||(22319856-22319957)
chr1 (65-145)||(52442780-52442861)
chr1 (298-410)||(43934346-43934458)
chr1 (343-386)||(14299764-14299807)
chr1 (313-402)||(15438820-15438906)
chr1 (359-410)||(37430436-37430487)
chr1 (379-410)||(38758036-38758067)
chr1 (65-271)||(39422198-39422398)
chr1 (359-410)||(43598938-43598989)
chr1 (225-410)||(50636174-50636347)
chr1 (64-123)||(52633471-52633530)
chr1 (71-132)||(4590813-4590875)
chr1 (351-409)||(16943362-16943420)
chr1 (287-337)||(19969301-19969351)
chr1 (344-410)||(41017233-41017298)
chr1 (359-409)||(45935365-45935415)
chr1 (301-407)||(52633191-52633297)
chr1 (71-120)||(6641063-6641112)
chr1 (333-410)||(15706987-15707064)
chr1 (64-121)||(34827403-34827460)
chr1 (148-205)||(35672688-35672745)
chr1 (341-410)||(35672882-35672951)
chr1 (341-406)||(48801634-48801698)
chr1 (364-401)||(52815095-52815132)
chr1 (148-212)||(4380017-4380081)
chr1 (68-120)||(4781305-4781357)
chr1 (295-383)||(11331247-11331335)
chr1 (295-383)||(11489268-11489356)
chr1 (68-96)||(12230955-12230983)
chr1 (370-410)||(15784981-15785021)
chr1 (287-387)||(16142019-16142119)
chr1 (171-255)||(16272992-16273076)
chr1 (64-120)||(17143179-17143235)
chr1 (64-100)||(26016361-26016397)
chr1 (86-133)||(33561077-33561125)
chr1 (378-410)||(50830650-50830682)
chr1 (148-215)||(52073673-52073741)
chr1 (87-194)||(52561843-52561946)
[»] chr8 (165 HSPs)
chr8 (11-402)||(2518422-2518801)
chr8 (64-409)||(29520584-29520914)
chr8 (168-410)||(30559717-30559964)
chr8 (71-410)||(45419170-45419501)
chr8 (158-409)||(35643625-35643869)
chr8 (52-409)||(30783059-30783411)
chr8 (188-410)||(35914617-35914839)
chr8 (225-406)||(32931042-32931222)
chr8 (64-410)||(16917108-16917448)
chr8 (64-393)||(41971823-41972132)
chr8 (93-402)||(29700233-29700534)
chr8 (89-393)||(43904698-43905000)
chr8 (71-363)||(10079970-10080256)
chr8 (225-410)||(30198282-30198467)
chr8 (225-406)||(35362670-35362851)
chr8 (79-387)||(5908581-5908889)
chr8 (72-410)||(32043522-32043853)
chr8 (52-410)||(36565257-36565612)
chr8 (226-408)||(18742041-18742222)
chr8 (226-408)||(18747005-18747186)
chr8 (64-200)||(13171875-13172007)
chr8 (52-410)||(36545058-36545415)
chr8 (74-281)||(44681184-44681387)
chr8 (311-410)||(490502-490601)
chr8 (64-362)||(45512558-45512854)
chr8 (202-400)||(38391919-38392117)
chr8 (287-409)||(39967516-39967638)
chr8 (249-410)||(23492140-23492300)
chr8 (148-365)||(44373780-44373990)
chr8 (71-277)||(10824313-10824511)
chr8 (148-410)||(12491154-12491416)
chr8 (158-398)||(30748471-30748717)
chr8 (244-410)||(2216388-2216552)
chr8 (148-410)||(11523739-11524002)
chr8 (286-409)||(16035744-16035867)
chr8 (249-404)||(28169497-28169652)
chr8 (249-403)||(79132-79286)
chr8 (64-409)||(39051066-39051407)
chr8 (64-277)||(36143293-36143498)
chr8 (148-409)||(40813328-40813589)
chr8 (252-408)||(18737156-18737311)
chr8 (250-410)||(24399805-24399965)
chr8 (209-388)||(38178298-38178477)
chr8 (64-410)||(39953280-39953622)
chr8 (151-410)||(42854020-42854279)
chr8 (79-401)||(16705701-16706004)
chr8 (104-279)||(9695595-9695766)
chr8 (64-259)||(36395116-36395308)
chr8 (297-410)||(45041332-45041444)
chr8 (103-409)||(11733710-11734011)
chr8 (311-410)||(42584526-42584624)
chr8 (287-392)||(17491688-17491793)
chr8 (311-404)||(21425213-21425306)
chr8 (287-400)||(23023368-23023481)
chr8 (64-372)||(33827811-33828115)
chr8 (354-410)||(1928603-1928659)
chr8 (148-410)||(2796561-2796819)
chr8 (295-410)||(14459046-14459162)
chr8 (159-282)||(7046349-7046471)
chr8 (327-410)||(44529408-44529491)
chr8 (324-410)||(3473750-3473836)
chr8 (79-261)||(15853642-15853823)
chr8 (295-409)||(36069753-36069867)
chr8 (348-409)||(30689939-30690000)
chr8 (342-406)||(21121344-21121407)
chr8 (350-409)||(1313770-1313829)
chr8 (52-213)||(8879653-8879811)
chr8 (350-405)||(27556323-27556378)
chr8 (148-409)||(41444356-41444604)
chr8 (327-410)||(42469743-42469826)
chr8 (327-410)||(44047548-44047631)
chr8 (215-394)||(24558558-24558733)
chr8 (64-282)||(39760572-39760782)
chr8 (225-410)||(7531660-7531845)
chr8 (353-410)||(14742098-14742155)
chr8 (341-410)||(25473419-25473488)
chr8 (151-264)||(29645044-29645157)
chr8 (352-409)||(32276893-32276950)
chr8 (350-403)||(35646953-35647006)
chr8 (341-405)||(14903758-14903822)
chr8 (184-407)||(16715313-16715536)
chr8 (65-365)||(33511285-33511576)
chr8 (341-409)||(8255548-8255618)
chr8 (355-410)||(18741843-18741898)
chr8 (355-410)||(18746807-18746862)
chr8 (52-122)||(6510726-6510796)
chr8 (319-410)||(31715995-31716088)
chr8 (340-410)||(41031436-41031506)
chr8 (340-410)||(41031542-41031612)
chr8 (347-406)||(41212064-41212125)
chr8 (340-406)||(44699662-44699728)
chr8 (148-205)||(12611539-12611596)
chr8 (341-410)||(35323970-35324039)
chr8 (341-402)||(36143538-36143599)
chr8 (80-215)||(18474171-18474298)
chr8 (64-123)||(28300411-28300470)
chr8 (354-409)||(35320417-35320472)
chr8 (198-386)||(37826345-37826529)
chr8 (287-410)||(43733350-43733472)
chr8 (325-403)||(8932884-8932962)
chr8 (287-410)||(12611644-12611763)
chr8 (312-410)||(15215428-15215526)
chr8 (296-409)||(39388935-39389051)
chr8 (88-235)||(78988-79134)
chr8 (175-368)||(9904940-9905132)
chr8 (295-368)||(10108964-10109037)
chr8 (65-133)||(16252860-16252929)
chr8 (341-410)||(26363684-26363752)
chr8 (233-282)||(28238915-28238964)
chr8 (178-394)||(3079637-3079850)
chr8 (158-402)||(16994468-16994712)
chr8 (316-410)||(3638351-3638443)
chr8 (324-395)||(10824220-10824291)
chr8 (308-392)||(12966346-12966432)
chr8 (81-282)||(25985462-25985656)
chr8 (296-410)||(3802025-3802139)
chr8 (265-367)||(4011204-4011306)
chr8 (312-410)||(33076292-33076390)
chr8 (349-410)||(5127318-5127379)
chr8 (79-190)||(7103201-7103316)
chr8 (341-409)||(8879463-8879529)
chr8 (71-147)||(16351321-16351398)
chr8 (327-404)||(25300282-25300359)
chr8 (334-387)||(27480151-27480204)
chr8 (158-207)||(30113416-30113465)
chr8 (345-406)||(30812836-30812897)
chr8 (328-369)||(32276839-32276880)
chr8 (344-409)||(39702154-39702219)
chr8 (362-407)||(45512463-45512508)
chr8 (290-410)||(3645232-3645352)
chr8 (158-206)||(6483271-6483319)
chr8 (362-410)||(14742854-14742902)
chr8 (378-410)||(35085153-35085185)
chr8 (378-410)||(36394964-36394996)
chr8 (324-410)||(43350747-43350830)
chr8 (379-410)||(1064955-1064986)
chr8 (158-237)||(17491810-17491889)
chr8 (343-410)||(18473988-18474055)
chr8 (331-410)||(23996751-23996830)
chr8 (351-410)||(32569726-32569785)
chr8 (79-133)||(36069582-36069637)
chr8 (52-122)||(37077676-37077747)
chr8 (64-123)||(38667478-38667537)
chr8 (363-410)||(39651044-39651091)
chr8 (65-116)||(43732492-43732543)
chr8 (370-408)||(1335552-1335590)
chr8 (159-213)||(1549590-1549644)
chr8 (341-410)||(2027727-2027796)
chr8 (339-393)||(6878192-6878246)
chr8 (64-133)||(30456500-30456569)
chr8 (148-213)||(2776442-2776507)
chr8 (64-147)||(33666773-33666855)
chr8 (355-408)||(37808215-37808268)
chr8 (289-410)||(38901835-38901956)
chr8 (151-196)||(42493536-42493581)
chr8 (148-212)||(6510642-6510706)
chr8 (354-410)||(10668513-10668569)
chr8 (225-353)||(16971827-16971955)
chr8 (378-410)||(26055655-26055687)
chr8 (171-259)||(28300280-28300368)
chr8 (159-207)||(37077768-37077816)
chr8 (369-409)||(37077974-37078014)
chr8 (353-389)||(41035089-41035125)
chr8 (184-264)||(42584411-42584491)
chr8 (64-100)||(44681398-44681434)
[»] chr2 (155 HSPs)
chr2 (56-410)||(38434866-38435218)
chr2 (66-407)||(9556388-9556724)
chr2 (148-410)||(18958911-18959177)
chr2 (148-410)||(12141548-12141810)
chr2 (233-410)||(33504312-33504490)
chr2 (79-402)||(43751971-43752290)
chr2 (156-410)||(26784356-26784615)
chr2 (148-410)||(6218971-6219231)
chr2 (203-410)||(37470149-37470356)
chr2 (225-410)||(19235000-19235185)
chr2 (153-410)||(44437737-44437994)
chr2 (52-410)||(38429795-38430150)
chr2 (164-402)||(3481161-3481412)
chr2 (109-410)||(37481633-37481930)
chr2 (295-406)||(9496017-9496128)
chr2 (148-410)||(11412725-11412976)
chr2 (299-409)||(19336910-19337020)
chr2 (204-406)||(45436902-45437104)
chr2 (104-410)||(13240779-13241063)
chr2 (52-410)||(8180691-8181046)
chr2 (148-410)||(25834685-25834944)
chr2 (287-406)||(33287564-33287683)
chr2 (171-402)||(43832125-43832356)
chr2 (148-410)||(2610592-2610854)
chr2 (71-407)||(42092450-42092780)
chr2 (296-409)||(8197558-8197671)
chr2 (296-409)||(8202318-8202431)
chr2 (80-410)||(12734641-12734966)
chr2 (167-409)||(12026029-12026264)
chr2 (295-410)||(12882061-12882176)
chr2 (341-410)||(9531616-9531685)
chr2 (289-410)||(23915709-23915830)
chr2 (71-410)||(3866003-3866338)
chr2 (52-410)||(36183362-36183717)
chr2 (184-406)||(26850275-26850497)
chr2 (287-410)||(43573146-43573268)
chr2 (148-410)||(3243669-3243931)
chr2 (267-409)||(19855585-19855727)
chr2 (264-410)||(26670888-26671034)
chr2 (184-410)||(42543275-42543501)
chr2 (287-409)||(45543090-45543211)
chr2 (333-406)||(3720435-3720508)
chr2 (295-376)||(42149710-42149791)
chr2 (342-410)||(12520078-12520146)
chr2 (327-410)||(3635339-3635422)
chr2 (79-396)||(21834492-21834806)
chr2 (327-410)||(28508861-28508944)
chr2 (341-408)||(39709219-39709286)
chr2 (79-276)||(41858679-41858863)
chr2 (301-409)||(45077884-45077994)
chr2 (149-354)||(38860178-38860388)
chr2 (189-410)||(7326176-7326397)
chr2 (341-410)||(30306229-30306298)
chr2 (236-410)||(35755261-35755439)
chr2 (52-410)||(41763059-41763412)
chr2 (64-266)||(45077672-45077877)
chr2 (327-410)||(227372-227455)
chr2 (203-409)||(7431906-7432117)
chr2 (342-409)||(19863432-19863499)
chr2 (342-409)||(19867764-19867831)
chr2 (342-409)||(19872665-19872732)
chr2 (327-410)||(31959704-31959787)
chr2 (148-410)||(38452702-38452963)
chr2 (243-408)||(7134821-7134985)
chr2 (341-410)||(13443924-13443993)
chr2 (152-282)||(14197302-14197437)
chr2 (346-410)||(12474943-12475007)
chr2 (71-259)||(7825289-7825475)
chr2 (252-367)||(37452285-37452400)
chr2 (346-409)||(42549854-42549917)
chr2 (169-406)||(451668-451905)
chr2 (341-410)||(11992124-11992193)
chr2 (52-219)||(16097193-16097361)
chr2 (287-404)||(31254431-31254548)
chr2 (353-409)||(887082-887138)
chr2 (354-410)||(4807805-4807861)
chr2 (324-404)||(36366816-36366896)
chr2 (342-410)||(41197243-41197311)
chr2 (64-203)||(9647832-9647963)
chr2 (295-410)||(19024329-19024444)
chr2 (343-406)||(34931631-34931694)
chr2 (327-410)||(35643131-35643214)
chr2 (356-410)||(17670680-17670734)
chr2 (68-303)||(23714384-23714612)
chr2 (68-303)||(24102056-24102284)
chr2 (312-410)||(32402668-32402766)
chr2 (352-410)||(38328386-38328444)
chr2 (327-410)||(39029764-39029853)
chr2 (327-409)||(45367642-45367724)
chr2 (325-410)||(9394646-9394731)
chr2 (171-409)||(13592314-13592552)
chr2 (345-410)||(17429251-17429316)
chr2 (228-409)||(29548654-29548835)
chr2 (299-376)||(33625248-33625325)
chr2 (64-213)||(40759023-40759169)
chr2 (350-410)||(3030885-3030944)
chr2 (341-401)||(9996651-9996711)
chr2 (184-410)||(13474230-13474447)
chr2 (342-410)||(18424394-18424461)
chr2 (346-410)||(21281479-21281543)
chr2 (347-410)||(2515187-2515250)
chr2 (287-410)||(12489818-12489941)
chr2 (355-410)||(25384680-25384735)
chr2 (229-400)||(32364947-32365111)
chr2 (227-366)||(36869941-36870080)
chr2 (352-410)||(440924-440982)
chr2 (344-410)||(10516765-10516831)
chr2 (344-410)||(14444869-14444935)
chr2 (288-402)||(19224925-19225039)
chr2 (148-239)||(19337041-19337128)
chr2 (179-269)||(43260439-43260529)
chr2 (336-405)||(32443828-32443897)
chr2 (287-376)||(37282234-37282323)
chr2 (148-213)||(43238306-43238371)
chr2 (312-404)||(36650610-36650702)
chr2 (261-329)||(45640622-45640690)
chr2 (287-410)||(5759011-5759134)
chr2 (71-384)||(9578756-9579052)
chr2 (288-391)||(13149476-13149579)
chr2 (343-410)||(43610675-43610742)
chr2 (64-247)||(44411640-44411815)
chr2 (295-409)||(1626346-1626460)
chr2 (149-199)||(12882267-12882317)
chr2 (372-410)||(16521023-16521061)
chr2 (254-364)||(18188862-18188972)
chr2 (368-410)||(24214010-24214052)
chr2 (151-213)||(24583845-24583907)
chr2 (64-122)||(41779606-41779664)
chr2 (327-400)||(23997785-23997858)
chr2 (286-410)||(28960227-28960352)
chr2 (356-400)||(9554096-9554140)
chr2 (295-410)||(15836090-15836206)
chr2 (362-401)||(1830195-1830234)
chr2 (295-410)||(2377204-2377314)
chr2 (345-404)||(19334174-19334233)
chr2 (355-410)||(29968627-29968682)
chr2 (341-376)||(31764085-31764120)
chr2 (242-374)||(2377162-2377283)
chr2 (287-409)||(17581602-17581724)
chr2 (189-247)||(33594451-33594509)
chr2 (344-410)||(36993735-36993800)
chr2 (229-271)||(41022526-41022568)
chr2 (64-122)||(41779032-41779090)
chr2 (372-410)||(45483001-45483039)
chr2 (348-409)||(186149-186210)
chr2 (351-408)||(335730-335787)
chr2 (160-241)||(1456246-1456327)
chr2 (301-410)||(7615427-7615535)
chr2 (295-389)||(8491270-8491366)
chr2 (148-213)||(11017318-11017383)
chr2 (353-410)||(24583647-24583704)
chr2 (172-269)||(42149803-42149900)
chr2 (226-282)||(7615364-7615420)
chr2 (79-123)||(17581407-17581451)
chr2 (334-386)||(38264439-38264491)
[»] chr4 (230 HSPs)
chr4 (64-407)||(54470131-54470470)
chr4 (184-408)||(13805283-13805507)
chr4 (52-410)||(31959830-31960185)
chr4 (79-406)||(34233044-34233376)
chr4 (150-410)||(42639036-42639296)
chr4 (151-374)||(50680746-50680970)
chr4 (188-410)||(37488135-37488357)
chr4 (52-406)||(29398730-29399066)
chr4 (148-410)||(26037521-26037783)
chr4 (71-371)||(33709850-33710154)
chr4 (166-408)||(47372673-47372915)
chr4 (288-410)||(26024866-26024988)
chr4 (148-409)||(51421734-51421995)
chr4 (52-410)||(436140-436495)
chr4 (158-410)||(39708447-39708699)
chr4 (81-374)||(50662330-50662618)
chr4 (64-410)||(48174109-48174451)
chr4 (225-410)||(47147454-47147637)
chr4 (225-396)||(21945671-21945839)
chr4 (225-410)||(28351640-28351825)
chr4 (78-410)||(10208976-10209300)
chr4 (302-410)||(25574982-25575090)
chr4 (79-410)||(52569531-52569858)
chr4 (255-410)||(53540401-53540556)
chr4 (64-410)||(56375214-56375556)
chr4 (225-402)||(20105542-20105720)
chr4 (244-410)||(35690371-35690537)
chr4 (308-410)||(55007910-55008012)
chr4 (162-410)||(22420733-22420978)
chr4 (151-336)||(26356626-26356811)
chr4 (148-386)||(30621241-30621482)
chr4 (158-282)||(47611741-47611865)
chr4 (226-409)||(50967045-50967227)
chr4 (175-408)||(53518342-53518571)
chr4 (149-410)||(4440858-4441119)
chr4 (52-410)||(48622559-48622912)
chr4 (64-410)||(1777033-1777373)
chr4 (287-403)||(56439594-56439710)
chr4 (295-410)||(37042680-37042795)
chr4 (52-410)||(45204856-45205219)
chr4 (64-388)||(21106908-21107236)
chr4 (148-410)||(39100552-39100813)
chr4 (148-410)||(42293281-42293527)
chr4 (254-410)||(44860943-44861097)
chr4 (287-410)||(2557687-2557811)
chr4 (227-402)||(7681933-7682109)
chr4 (148-406)||(35555670-35555925)
chr4 (287-410)||(8598957-8599080)
chr4 (158-410)||(20601668-20601914)
chr4 (148-410)||(53707798-53708060)
chr4 (236-409)||(40018206-40018379)
chr4 (52-410)||(43433829-43434190)
chr4 (82-217)||(51252670-51252799)
chr4 (250-410)||(49987514-49987674)
chr4 (65-410)||(17900405-17900746)
chr4 (148-255)||(28497494-28497600)
chr4 (187-410)||(31961282-31961505)
chr4 (300-410)||(5306452-5306562)
chr4 (147-402)||(7092243-7092499)
chr4 (294-410)||(7544547-7544655)
chr4 (62-409)||(17666067-17666402)
chr4 (148-410)||(28236187-28236448)
chr4 (160-389)||(38903755-38903986)
chr4 (148-402)||(46372028-46372282)
chr4 (324-410)||(51438625-51438711)
chr4 (308-410)||(55388227-55388329)
chr4 (333-410)||(1095634-1095711)
chr4 (159-410)||(31339552-31339790)
chr4 (184-410)||(934447-934678)
chr4 (226-409)||(25967280-25967461)
chr4 (158-410)||(31897444-31897696)
chr4 (327-410)||(19969364-19969447)
chr4 (327-410)||(21528471-21528554)
chr4 (319-410)||(34208285-34208376)
chr4 (184-410)||(40932940-40933157)
chr4 (244-410)||(18966705-18966871)
chr4 (52-410)||(23906313-23906672)
chr4 (324-410)||(29209191-29209277)
chr4 (148-380)||(55768545-55768779)
chr4 (148-380)||(55832801-55833035)
chr4 (341-410)||(22873615-22873684)
chr4 (301-410)||(31459151-31459260)
chr4 (327-404)||(32479221-32479298)
chr4 (309-410)||(41192226-41192327)
chr4 (52-258)||(45185195-45185388)
chr4 (349-410)||(45209221-45209282)
chr4 (289-409)||(31403051-31403171)
chr4 (52-410)||(33190864-33191219)
chr4 (295-410)||(2589223-2589338)
chr4 (327-410)||(8286622-8286705)
chr4 (327-410)||(12494846-12494929)
chr4 (359-410)||(15661888-15661939)
chr4 (327-410)||(19154879-19154962)
chr4 (327-410)||(27450196-27450278)
chr4 (296-403)||(31043224-31043331)
chr4 (149-244)||(46715554-46715649)
chr4 (148-410)||(1793464-1793728)
chr4 (344-410)||(19061951-19062017)
chr4 (160-410)||(21879165-21879419)
chr4 (261-410)||(44719377-44719529)
chr4 (187-359)||(8459102-8459274)
chr4 (339-396)||(12443290-12443347)
chr4 (333-406)||(28467627-28467700)
chr4 (71-219)||(44047555-44047699)
chr4 (250-410)||(45184149-45184307)
chr4 (353-410)||(49939750-49939807)
chr4 (63-123)||(2588904-2588964)
chr4 (341-409)||(4548219-4548287)
chr4 (148-212)||(31459034-31459098)
chr4 (52-410)||(33227120-33227475)
chr4 (65-213)||(50471453-50471595)
chr4 (327-410)||(21237041-21237124)
chr4 (302-410)||(27049189-27049301)
chr4 (324-399)||(34379583-34379657)
chr4 (287-410)||(49738566-49738689)
chr4 (348-410)||(3979124-3979186)
chr4 (319-393)||(30480298-30480372)
chr4 (352-406)||(36255542-36255596)
chr4 (343-409)||(36799674-36799740)
chr4 (244-346)||(48033185-48033287)
chr4 (162-408)||(55579050-55579295)
chr4 (71-410)||(1380298-1380636)
chr4 (295-396)||(6843766-6843867)
chr4 (349-410)||(7947142-7947203)
chr4 (66-123)||(17668410-17668467)
chr4 (264-357)||(26024988-26025081)
chr4 (365-410)||(30634122-30634167)
chr4 (341-410)||(37798048-37798117)
chr4 (148-273)||(49738757-49738882)
chr4 (341-410)||(51811295-51811363)
chr4 (358-410)||(21359241-21359293)
chr4 (149-217)||(38570956-38571024)
chr4 (151-203)||(49987435-49987487)
chr4 (344-404)||(51176774-51176834)
chr4 (351-410)||(6957805-6957864)
chr4 (287-410)||(29801522-29801645)
chr4 (148-283)||(38266150-38266285)
chr4 (164-322)||(40268367-40268525)
chr4 (148-219)||(41192840-41192911)
chr4 (351-410)||(47265211-47265270)
chr4 (343-406)||(54935348-54935411)
chr4 (186-409)||(4136760-4136968)
chr4 (287-409)||(20999143-20999265)
chr4 (79-217)||(44360022-44360159)
chr4 (302-376)||(44384988-44385062)
chr4 (364-410)||(50238631-50238677)
chr4 (364-410)||(50238717-50238763)
chr4 (228-278)||(56439743-56439793)
chr4 (340-409)||(50853-50922)
chr4 (52-187)||(12494661-12494793)
chr4 (71-131)||(20105761-20105822)
chr4 (148-410)||(20591322-20591578)
chr4 (311-408)||(28486088-28486185)
chr4 (158-410)||(42285719-42285968)
chr4 (293-410)||(49686842-49686959)
chr4 (254-331)||(53517640-53517717)
chr4 (341-410)||(54963648-54963716)
chr4 (341-409)||(6958255-6958323)
chr4 (362-410)||(11400461-11400509)
chr4 (362-410)||(11410188-11410236)
chr4 (362-410)||(15665319-15665367)
chr4 (187-403)||(44667269-44667484)
chr4 (147-207)||(46583043-46583103)
chr4 (151-219)||(47265409-47265477)
chr4 (370-410)||(50862857-50862897)
chr4 (158-281)||(1427429-1427552)
chr4 (295-410)||(28550471-28550586)
chr4 (52-122)||(35690215-35690286)
chr4 (184-403)||(44686595-44686812)
chr4 (344-406)||(1965653-1965715)
chr4 (295-388)||(33225873-33225964)
chr4 (52-363)||(41009413-41009721)
chr4 (364-410)||(46236709-46236755)
chr4 (353-406)||(32633426-32633479)
chr4 (353-410)||(34585691-34585748)
chr4 (148-205)||(37773672-37773729)
chr4 (308-408)||(44047388-44047489)
chr4 (377-410)||(56130403-56130436)
chr4 (341-410)||(56225265-56225334)
chr4 (351-407)||(8284346-8284402)
chr4 (310-386)||(20605343-20605419)
chr4 (287-367)||(21214645-21214725)
chr4 (351-407)||(27338406-27338462)
chr4 (160-232)||(44860862-44860934)
chr4 (175-235)||(45176037-45176097)
chr4 (378-410)||(46153942-46153974)
chr4 (295-407)||(51841217-51841329)
chr4 (308-376)||(55028985-55029053)
chr4 (341-404)||(16875774-16875837)
chr4 (327-410)||(27983376-27983459)
chr4 (231-282)||(37948486-37948537)
chr4 (343-410)||(40424529-40424596)
chr4 (327-382)||(41729494-41729549)
chr4 (64-123)||(45423543-45423602)
chr4 (327-410)||(46582842-46582924)
chr4 (184-267)||(51550407-51550490)
chr4 (152-207)||(56225074-56225129)
chr4 (344-410)||(1989783-1989849)
chr4 (162-252)||(2589008-2589098)
chr4 (301-375)||(8835823-8835897)
chr4 (64-123)||(11389644-11389705)
chr4 (324-406)||(13296613-13296695)
chr4 (285-383)||(16003067-16003165)
chr4 (351-409)||(20192240-20192297)
chr4 (82-120)||(20998954-20998992)
chr4 (360-410)||(38585267-38585317)
chr4 (356-410)||(38809615-38809669)
chr4 (344-382)||(42489620-42489658)
chr4 (79-132)||(43070053-43070107)
chr4 (64-133)||(44667530-44667600)
chr4 (65-119)||(44860779-44860833)
chr4 (360-410)||(53517721-53517771)
chr4 (353-398)||(883388-883433)
chr4 (346-410)||(1211408-1211473)
chr4 (341-410)||(25427878-25427947)
chr4 (377-410)||(32630508-32630541)
chr4 (353-410)||(39446926-39446983)
chr4 (152-213)||(50286970-50287031)
chr4 (345-410)||(50869896-50869961)
chr4 (79-147)||(51841465-51841534)
chr4 (199-303)||(54934955-54935060)
chr4 (370-410)||(4879125-4879165)
chr4 (71-123)||(18966484-18966536)
chr4 (156-244)||(20605209-20605297)
chr4 (325-381)||(20863820-20863876)
chr4 (66-133)||(25967555-25967623)
chr4 (358-410)||(28348271-28348323)
chr4 (83-123)||(42618817-42618857)
chr4 (341-409)||(46226371-46226439)
chr4 (378-410)||(47372938-47372970)
[»] chr7 (193 HSPs)
chr7 (71-410)||(28627949-28628284)
chr7 (64-383)||(47848598-47848912)
chr7 (162-406)||(38135233-38135476)
chr7 (148-403)||(26741917-26742174)
chr7 (64-410)||(36136688-36137030)
chr7 (186-398)||(1569058-1569270)
chr7 (64-410)||(36101793-36102123)
chr7 (52-406)||(43281587-43281936)
chr7 (52-410)||(35906217-35906572)
chr7 (148-410)||(2885738-2886000)
chr7 (148-410)||(12841291-12841553)
chr7 (84-402)||(47796176-47796476)
chr7 (64-410)||(37617868-37618211)
chr7 (148-410)||(12966026-12966282)
chr7 (151-410)||(27893579-27893823)
chr7 (148-400)||(40169653-40169911)
chr7 (65-282)||(39811882-39812095)
chr7 (52-410)||(45836498-45836851)
chr7 (52-410)||(11593871-11594226)
chr7 (64-410)||(39906388-39906728)
chr7 (288-410)||(40979944-40980066)
chr7 (52-408)||(49029187-49029540)
chr7 (265-410)||(45601597-45601742)
chr7 (164-407)||(24549708-24549955)
chr7 (52-367)||(30200023-30200330)
chr7 (187-410)||(34341411-34341617)
chr7 (168-384)||(48202744-48202960)
chr7 (64-410)||(34869344-34869686)
chr7 (162-410)||(35713713-35713960)
chr7 (288-410)||(9210720-9210842)
chr7 (52-271)||(36514362-36514576)
chr7 (261-398)||(22174117-22174254)
chr7 (65-361)||(43282330-43282626)
chr7 (158-410)||(36652006-36652258)
chr7 (151-410)||(43491315-43491574)
chr7 (80-410)||(44855190-44855514)
chr7 (71-410)||(46355872-46356207)
chr7 (52-281)||(1740708-1740938)
chr7 (295-410)||(14057629-14057744)
chr7 (295-410)||(14367657-14367772)
chr7 (200-410)||(1011103-1011312)
chr7 (169-311)||(6420605-6420747)
chr7 (148-410)||(31682618-31682880)
chr7 (285-410)||(42187582-42187707)
chr7 (64-270)||(25579233-25579429)
chr7 (301-410)||(28541959-28542069)
chr7 (65-410)||(48735917-48736256)
chr7 (341-410)||(28208344-28208413)
chr7 (149-410)||(29650389-29650650)
chr7 (52-259)||(31005134-31005338)
chr7 (295-404)||(40391845-40391954)
chr7 (148-410)||(3457369-3457626)
chr7 (148-276)||(19262584-19262711)
chr7 (52-410)||(33349822-33350177)
chr7 (300-410)||(34926538-34926645)
chr7 (159-410)||(41483506-41483753)
chr7 (327-410)||(7273283-7273366)
chr7 (327-410)||(27648963-27649046)
chr7 (308-410)||(33731998-33732098)
chr7 (295-410)||(40138964-40139079)
chr7 (159-410)||(5418094-5418340)
chr7 (324-406)||(30814145-30814227)
chr7 (287-389)||(36239833-36239935)
chr7 (287-401)||(37976378-37976492)
chr7 (325-410)||(42969879-42969964)
chr7 (325-410)||(47852268-47852353)
chr7 (327-407)||(34035173-34035253)
chr7 (148-410)||(22349624-22349886)
chr7 (52-278)||(27021843-27022077)
chr7 (319-410)||(33103101-33103192)
chr7 (148-239)||(42187474-42187565)
chr7 (295-406)||(43281982-43282092)
chr7 (343-410)||(48515370-48515437)
chr7 (348-410)||(4604751-4604813)
chr7 (52-410)||(5335833-5336183)
chr7 (64-213)||(13859221-13859366)
chr7 (158-366)||(28562425-28562634)
chr7 (341-410)||(47652744-47652813)
chr7 (342-402)||(25891086-25891146)
chr7 (71-322)||(28020895-28021140)
chr7 (184-399)||(28858084-28858300)
chr7 (324-403)||(2882759-2882838)
chr7 (351-410)||(6375075-6375134)
chr7 (359-410)||(28708596-28708647)
chr7 (327-406)||(31681040-31681119)
chr7 (327-410)||(32631747-32631830)
chr7 (71-244)||(33072885-33073052)
chr7 (287-410)||(40149029-40149151)
chr7 (249-322)||(30814775-30814848)
chr7 (161-282)||(40008562-40008682)
chr7 (257-389)||(44401164-44401294)
chr7 (341-409)||(15682371-15682439)
chr7 (346-406)||(24376043-24376103)
chr7 (327-410)||(21078100-21078183)
chr7 (295-410)||(34745898-34746013)
chr7 (287-410)||(38103631-38103752)
chr7 (52-213)||(38606916-38607073)
chr7 (327-410)||(38607175-38607258)
chr7 (148-207)||(38920798-38920857)
chr7 (226-404)||(7220838-7221016)
chr7 (341-410)||(28355362-28355432)
chr7 (158-347)||(29653625-29653817)
chr7 (299-409)||(30664723-30664833)
chr7 (348-410)||(31869118-31869180)
chr7 (344-410)||(48515475-48515541)
chr7 (150-207)||(7189445-7189502)
chr7 (148-269)||(18605303-18605424)
chr7 (148-269)||(18637566-18637687)
chr7 (148-269)||(18651000-18651121)
chr7 (353-410)||(34029692-34029749)
chr7 (148-213)||(36869457-36869522)
chr7 (77-213)||(41948453-41948585)
chr7 (348-409)||(45054320-45054381)
chr7 (341-410)||(48919309-48919378)
chr7 (362-410)||(6263477-6263525)
chr7 (341-409)||(24177644-24177711)
chr7 (162-338)||(30144793-30144969)
chr7 (340-391)||(26332908-26332959)
chr7 (327-410)||(38900140-38900222)
chr7 (261-410)||(40830319-40830467)
chr7 (348-410)||(33871476-33871538)
chr7 (286-383)||(35922397-35922492)
chr7 (148-213)||(6374872-6374937)
chr7 (287-376)||(21517430-21517519)
chr7 (151-279)||(45841125-45841256)
chr7 (151-219)||(7273046-7273114)
chr7 (241-409)||(19119441-19119608)
chr7 (150-270)||(23720847-23720967)
chr7 (356-408)||(27021743-27021795)
chr7 (343-410)||(6682552-6682619)
chr7 (297-408)||(19262476-19262587)
chr7 (327-410)||(33073112-33073195)
chr7 (331-410)||(44951342-44951421)
chr7 (79-410)||(8492252-8492576)
chr7 (52-132)||(28542173-28542254)
chr7 (296-410)||(30914518-30914632)
chr7 (344-410)||(33281087-33281152)
chr7 (364-406)||(40630654-40630696)
chr7 (254-343)||(41461206-41461298)
chr7 (254-408)||(42177037-42177190)
chr7 (308-410)||(47604030-47604132)
chr7 (345-410)||(14593953-14594018)
chr7 (345-410)||(16013476-16013541)
chr7 (341-410)||(20158687-20158756)
chr7 (341-394)||(23404614-23404667)
chr7 (68-132)||(25826759-25826824)
chr7 (373-410)||(31005434-31005471)
chr7 (311-400)||(40415174-40415263)
chr7 (311-403)||(6072219-6072311)
chr7 (150-218)||(7220750-7220818)
chr7 (159-247)||(15310679-15310767)
chr7 (354-410)||(17759483-17759539)
chr7 (322-410)||(24425582-24425670)
chr7 (362-410)||(29312207-29312255)
chr7 (228-356)||(32368407-32368535)
chr7 (148-214)||(6429155-6429222)
chr7 (340-387)||(6807400-6807447)
chr7 (343-410)||(8519062-8519129)
chr7 (371-410)||(20525068-20525107)
chr7 (227-366)||(28359340-28359476)
chr7 (363-410)||(29318811-29318858)
chr7 (325-380)||(30997629-30997684)
chr7 (324-410)||(32879208-32879295)
chr7 (343-386)||(45903913-45903956)
chr7 (348-410)||(9796288-9796350)
chr7 (64-133)||(14593685-14593755)
chr7 (351-409)||(24777168-24777226)
chr7 (159-197)||(28542125-28542163)
chr7 (72-122)||(29653854-29653904)
chr7 (64-122)||(36651918-36651976)
chr7 (368-398)||(37439457-37439487)
chr7 (324-410)||(40008447-40008533)
chr7 (341-391)||(46938813-46938863)
chr7 (326-375)||(5577538-5577587)
chr7 (353-410)||(6807700-6807757)
chr7 (174-235)||(9797895-9797956)
chr7 (381-410)||(21244299-21244328)
chr7 (341-410)||(25731490-25731559)
chr7 (160-205)||(27021792-27021837)
chr7 (368-405)||(32789958-32789995)
chr7 (363-404)||(34614011-34614052)
chr7 (65-114)||(37595630-37595679)
chr7 (81-133)||(40139204-40139257)
chr7 (158-215)||(44176728-44176784)
chr7 (325-410)||(44779135-44779220)
chr7 (236-368)||(1531419-1531551)
chr7 (64-100)||(16013208-16013244)
chr7 (349-409)||(23087118-23087178)
chr7 (342-410)||(36245272-36245340)
chr7 (244-308)||(36245522-36245586)
chr7 (327-410)||(36869253-36869343)
chr7 (381-409)||(47155189-47155217)
chr7 (358-394)||(47700087-47700123)
[»] chr5 (156 HSPs)
chr5 (79-410)||(14667696-14668037)
chr5 (151-406)||(7359281-7359534)
chr5 (79-388)||(6888932-6889237)
chr5 (148-410)||(43475244-43475505)
chr5 (64-409)||(7678404-7678742)
chr5 (160-409)||(30588465-30588712)
chr5 (104-410)||(6859345-6859647)
chr5 (225-409)||(12576877-12577061)
chr5 (257-410)||(9235162-9235312)
chr5 (148-410)||(38684971-38685233)
chr5 (100-376)||(14749267-14749539)
chr5 (152-406)||(79521-79775)
chr5 (287-410)||(11675672-11675796)
chr5 (79-376)||(32516497-32516787)
chr5 (158-337)||(42199300-42199479)
chr5 (225-402)||(6788148-6788325)
chr5 (148-410)||(1287595-1287857)
chr5 (148-410)||(4496388-4496650)
chr5 (52-410)||(12492400-12492758)
chr5 (160-408)||(29938131-29938374)
chr5 (148-410)||(3301848-3302110)
chr5 (311-408)||(418052-418149)
chr5 (52-410)||(2075489-2075845)
chr5 (52-410)||(16347396-16347749)
chr5 (64-410)||(1275189-1275530)
chr5 (287-410)||(29922427-29922550)
chr5 (160-410)||(43557849-43558093)
chr5 (148-337)||(2712948-2713137)
chr5 (164-276)||(21093772-21093884)
chr5 (171-409)||(23979973-23980209)
chr5 (148-410)||(20456777-20457039)
chr5 (148-410)||(28976875-28977137)
chr5 (341-410)||(5558338-5558407)
chr5 (159-316)||(15489602-15489759)
chr5 (148-407)||(18350921-18351186)
chr5 (341-410)||(18855804-18855873)
chr5 (287-408)||(27998584-27998705)
chr5 (325-410)||(32442141-32442226)
chr5 (148-409)||(38684484-38684745)
chr5 (148-410)||(14665718-14665978)
chr5 (64-330)||(21952275-21952541)
chr5 (324-410)||(15252760-15252846)
chr5 (52-400)||(24178421-24178766)
chr5 (193-410)||(27799892-27800094)
chr5 (52-410)||(10639208-10639568)
chr5 (350-410)||(38132542-38132602)
chr5 (287-410)||(5303587-5303713)
chr5 (327-410)||(13561402-13561485)
chr5 (327-410)||(29816565-29816648)
chr5 (327-410)||(30213758-30213841)
chr5 (300-410)||(20367049-20367159)
chr5 (162-410)||(26884705-26884952)
chr5 (64-145)||(28186944-28187026)
chr5 (341-407)||(41833676-41833742)
chr5 (345-410)||(5860035-5860100)
chr5 (341-410)||(7640523-7640592)
chr5 (174-271)||(15986892-15986989)
chr5 (148-357)||(28676599-28676807)
chr5 (225-385)||(43035062-43035222)
chr5 (350-410)||(2915512-2915572)
chr5 (358-410)||(27386554-27386606)
chr5 (336-403)||(41108752-41108819)
chr5 (351-410)||(42576217-42576276)
chr5 (159-393)||(1525659-1525893)
chr5 (288-410)||(2090557-2090679)
chr5 (62-239)||(10082926-10083098)
chr5 (64-204)||(11002645-11002779)
chr5 (148-270)||(31636076-31636198)
chr5 (341-410)||(683717-683786)
chr5 (327-410)||(16913898-16913982)
chr5 (346-406)||(28985285-28985345)
chr5 (350-410)||(41894279-41894339)
chr5 (354-410)||(42272687-42272743)
chr5 (287-402)||(28025-28140)
chr5 (345-404)||(1104730-1104788)
chr5 (311-410)||(3442887-3442986)
chr5 (70-132)||(9234999-9235062)
chr5 (184-347)||(9917529-9917692)
chr5 (345-408)||(11069180-11069243)
chr5 (315-410)||(28411847-28411942)
chr5 (160-247)||(41833761-41833848)
chr5 (342-408)||(12534410-12534476)
chr5 (312-410)||(14911340-14911438)
chr5 (324-410)||(21193668-21193754)
chr5 (83-379)||(38341476-38341760)
chr5 (64-278)||(41109888-41110099)
chr5 (81-133)||(683980-684033)
chr5 (333-410)||(28276427-28276504)
chr5 (148-213)||(33667220-33667285)
chr5 (287-410)||(15588406-15588527)
chr5 (355-410)||(408510-408565)
chr5 (83-234)||(4026527-4026673)
chr5 (148-247)||(25937973-25938072)
chr5 (355-410)||(30639732-30639787)
chr5 (363-410)||(39322095-39322142)
chr5 (351-410)||(41200362-41200421)
chr5 (160-210)||(18131952-18132002)
chr5 (294-410)||(28186798-28186907)
chr5 (340-406)||(38830516-38830581)
chr5 (148-213)||(34273031-34273096)
chr5 (299-371)||(2066152-2066224)
chr5 (346-410)||(5987719-5987782)
chr5 (184-264)||(11675550-11675630)
chr5 (341-409)||(14330185-14330253)
chr5 (152-260)||(15588706-15588814)
chr5 (148-259)||(27249224-27249333)
chr5 (346-386)||(39668905-39668945)
chr5 (358-410)||(43423511-43423563)
chr5 (148-195)||(27897-27944)
chr5 (71-133)||(5305547-5305610)
chr5 (225-410)||(8081979-8082155)
chr5 (148-207)||(15168796-15168855)
chr5 (241-356)||(18698891-18699006)
chr5 (65-131)||(21093701-21093768)
chr5 (319-410)||(36551321-36551412)
chr5 (254-349)||(42199503-42199598)
chr5 (160-231)||(43522623-43522694)
chr5 (352-410)||(218068-218126)
chr5 (65-123)||(6368224-6368282)
chr5 (360-410)||(9234102-9234152)
chr5 (341-407)||(9400708-9400774)
chr5 (341-410)||(35118338-35118407)
chr5 (338-410)||(32006179-32006252)
chr5 (341-410)||(38501434-38501503)
chr5 (341-410)||(39040953-39041022)
chr5 (64-147)||(219727-219811)
chr5 (65-121)||(16134480-16134536)
chr5 (298-394)||(35615437-35615533)
chr5 (163-331)||(38578616-38578784)
chr5 (52-133)||(1287877-1287960)
chr5 (188-247)||(6368079-6368138)
chr5 (375-410)||(7367188-7367223)
chr5 (327-410)||(34273196-34273279)
chr5 (361-400)||(39766738-39766777)
chr5 (341-376)||(42504297-42504332)
chr5 (52-97)||(5848401-5848447)
chr5 (322-376)||(5928838-5928892)
chr5 (71-132)||(30588384-30588446)
chr5 (352-410)||(32366186-32366244)
chr5 (147-217)||(37065532-37065602)
chr5 (295-365)||(37918183-37918253)
chr5 (333-410)||(2645179-2645256)
chr5 (356-409)||(3448831-3448884)
chr5 (328-385)||(7593725-7593782)
chr5 (373-410)||(24391040-24391077)
chr5 (52-100)||(34272933-34272982)
chr5 (354-410)||(2713146-2713202)
chr5 (382-410)||(3000977-3001005)
chr5 (381-409)||(3775091-3775119)
chr5 (378-406)||(16014504-16014532)
chr5 (302-366)||(17340496-17340560)
chr5 (64-100)||(27998347-27998383)
chr5 (175-259)||(32759605-32759687)
chr5 (163-215)||(35685783-35685834)
chr5 (176-264)||(38501580-38501668)
chr5 (64-100)||(43558136-43558172)
[»] chr3 (172 HSPs)
chr3 (64-406)||(42510036-42510369)
chr3 (83-410)||(39600697-39601020)
chr3 (82-410)||(45289107-45289434)
chr3 (64-397)||(49841535-49841869)
chr3 (64-410)||(54128302-54128645)
chr3 (148-410)||(50960653-50960911)
chr3 (160-394)||(39235154-39235387)
chr3 (177-410)||(48508268-48508501)
chr3 (158-410)||(42026552-42026804)
chr3 (158-371)||(21200562-21200773)
chr3 (79-410)||(19757838-19758152)
chr3 (225-404)||(23534592-23534771)
chr3 (148-410)||(19676097-19676358)
chr3 (159-398)||(36303994-36304220)
chr3 (52-410)||(52138711-52139066)
chr3 (148-410)||(54364992-54365254)
chr3 (79-410)||(19736935-19737249)
chr3 (148-407)||(38430852-38431116)
chr3 (249-410)||(29475793-29475952)
chr3 (71-410)||(46431695-46432022)
chr3 (148-387)||(41842562-41842789)
chr3 (227-409)||(45486866-45487047)
chr3 (308-408)||(29601056-29601156)
chr3 (79-408)||(50249320-50249641)
chr3 (250-405)||(40116489-40116644)
chr3 (64-409)||(21997-22337)
chr3 (148-410)||(35033150-35033412)
chr3 (289-410)||(49042081-49042203)
chr3 (64-402)||(2340741-2341072)
chr3 (148-410)||(31454241-31454504)
chr3 (189-408)||(33755362-33755579)
chr3 (314-410)||(40116354-40116450)
chr3 (52-410)||(47233612-47233967)
chr3 (79-281)||(344856-345054)
chr3 (327-410)||(38060897-38060980)
chr3 (296-410)||(15296059-15296173)
chr3 (341-410)||(24541348-24541417)
chr3 (73-213)||(49503767-49503903)
chr3 (289-409)||(45493709-45493829)
chr3 (327-410)||(5169015-5169098)
chr3 (64-410)||(28245361-28245703)
chr3 (327-410)||(52156100-52156183)
chr3 (148-402)||(26490319-26490573)
chr3 (72-252)||(36820135-36820309)
chr3 (324-410)||(40991611-40991697)
chr3 (344-410)||(45374493-45374559)
chr3 (184-317)||(31261051-31261183)
chr3 (198-407)||(43308617-43308825)
chr3 (348-405)||(46148232-46148289)
chr3 (345-410)||(48734163-48734228)
chr3 (341-410)||(52927864-52927933)
chr3 (317-409)||(32170578-32170670)
chr3 (226-410)||(388278-388464)
chr3 (327-410)||(12096721-12096804)
chr3 (158-409)||(37351421-37351672)
chr3 (327-410)||(53262324-53262407)
chr3 (298-408)||(37534221-37534330)
chr3 (327-409)||(38850304-38850386)
chr3 (311-409)||(48712092-48712190)
chr3 (52-400)||(54278931-54279276)
chr3 (353-410)||(24778625-24778682)
chr3 (325-410)||(40106636-40106721)
chr3 (249-410)||(55244382-55244548)
chr3 (160-320)||(11581460-11581620)
chr3 (324-402)||(49888370-49888445)
chr3 (343-410)||(311325-311392)
chr3 (343-410)||(14415276-14415342)
chr3 (341-408)||(39208805-39208872)
chr3 (327-410)||(47555348-47555431)
chr3 (184-410)||(659565-659791)
chr3 (344-410)||(31566177-31566243)
chr3 (344-406)||(40273225-40273287)
chr3 (341-410)||(2133628-2133697)
chr3 (341-410)||(7895896-7895965)
chr3 (329-410)||(27795996-27796077)
chr3 (349-410)||(37083308-37083369)
chr3 (249-376)||(41482187-41482316)
chr3 (341-406)||(49045032-49045097)
chr3 (341-410)||(49503584-49503653)
chr3 (341-409)||(25191574-25191642)
chr3 (79-201)||(31337751-31337867)
chr3 (358-410)||(41529975-41530027)
chr3 (327-399)||(48953446-48953518)
chr3 (79-400)||(37227869-37228184)
chr3 (348-410)||(48532161-48532224)
chr3 (52-410)||(51447733-51448080)
chr3 (327-410)||(53519763-53519846)
chr3 (348-410)||(30797838-30797900)
chr3 (161-347)||(40981914-40982099)
chr3 (165-409)||(7278481-7278729)
chr3 (321-410)||(21862757-21862846)
chr3 (341-410)||(39781934-39782002)
chr3 (345-410)||(53266892-53266957)
chr3 (252-404)||(20262353-20262505)
chr3 (161-269)||(29374951-29375059)
chr3 (310-410)||(46140573-46140673)
chr3 (52-133)||(50621648-50621731)
chr3 (348-410)||(17022688-17022750)
chr3 (158-263)||(29600913-29601019)
chr3 (52-213)||(33272235-33272399)
chr3 (348-410)||(34844589-34844651)
chr3 (64-133)||(38054625-38054695)
chr3 (158-280)||(48734281-48734403)
chr3 (312-410)||(6988069-6988168)
chr3 (313-410)||(11284157-11284254)
chr3 (150-203)||(26388487-26388540)
chr3 (269-410)||(34719096-34719237)
chr3 (225-409)||(37598186-37598370)
chr3 (348-409)||(40122618-40122679)
chr3 (353-409)||(20208207-20208263)
chr3 (163-275)||(29928412-29928524)
chr3 (163-275)||(29977566-29977678)
chr3 (350-410)||(31146906-31146965)
chr3 (354-410)||(35420479-35420534)
chr3 (148-232)||(43694959-43695043)
chr3 (158-282)||(46140446-46140570)
chr3 (362-406)||(52882682-52882726)
chr3 (355-410)||(21428010-21428065)
chr3 (148-219)||(27917574-27917645)
chr3 (249-400)||(37228187-37228338)
chr3 (347-410)||(40672383-40672446)
chr3 (151-213)||(3987054-3987116)
chr3 (149-203)||(37534429-37534483)
chr3 (254-387)||(44133884-44134014)
chr3 (83-279)||(44395368-44395560)
chr3 (364-410)||(45834616-45834662)
chr3 (333-402)||(4472411-4472480)
chr3 (148-205)||(29817508-29817565)
chr3 (184-269)||(30572956-30573040)
chr3 (287-336)||(36820067-36820116)
chr3 (295-384)||(52678892-52678981)
chr3 (366-409)||(1512046-1512090)
chr3 (262-410)||(27893207-27893355)
chr3 (341-409)||(34610444-34610512)
chr3 (301-408)||(36049322-36049427)
chr3 (148-200)||(36868450-36868502)
chr3 (374-410)||(37102998-37103034)
chr3 (148-212)||(38850124-38850188)
chr3 (378-410)||(39512777-39512809)
chr3 (340-404)||(41971292-41971356)
chr3 (286-409)||(46367404-46367528)
chr3 (298-410)||(47804679-47804791)
chr3 (184-255)||(3870615-3870686)
chr3 (353-408)||(30332578-30332633)
chr3 (359-410)||(35481143-35481194)
chr3 (363-410)||(37102824-37102871)
chr3 (158-205)||(44134051-44134098)
chr3 (71-122)||(45236787-45236838)
chr3 (52-122)||(45728057-45728128)
chr3 (52-133)||(46568027-46568110)
chr3 (359-410)||(53214887-53214938)
chr3 (341-403)||(6780686-6780748)
chr3 (65-123)||(11663574-11663632)
chr3 (368-410)||(16844071-16844113)
chr3 (347-409)||(43694788-43694850)
chr3 (342-376)||(51027756-51027790)
chr3 (200-306)||(53998758-53998864)
chr3 (361-410)||(344788-344837)
chr3 (345-410)||(3987535-3987600)
chr3 (65-133)||(19676378-19676447)
chr3 (381-410)||(35032782-35032811)
chr3 (370-410)||(3186972-3187012)
chr3 (348-408)||(7120787-7120847)
chr3 (381-409)||(8566670-8566698)
chr3 (340-384)||(21323531-21323575)
chr3 (341-373)||(25562576-25562608)
chr3 (354-406)||(29919484-29919536)
chr3 (354-406)||(29928314-29928366)
chr3 (354-406)||(29968637-29968689)
chr3 (354-406)||(29977468-29977520)
chr3 (266-338)||(41452828-41452900)
chr3 (301-365)||(50237695-50237759)
[»] chr6 (100 HSPs)
chr6 (84-406)||(8364520-8364818)
chr6 (64-403)||(12133925-12134259)
chr6 (168-410)||(34521-34754)
chr6 (64-410)||(9593726-9594070)
chr6 (186-409)||(579460-579683)
chr6 (152-392)||(24665818-24666059)
chr6 (152-410)||(6293408-6293660)
chr6 (52-406)||(31818449-31818793)
chr6 (160-410)||(43068-43318)
chr6 (54-410)||(30031169-30031522)
chr6 (148-405)||(28026851-28027104)
chr6 (52-409)||(20427654-20428007)
chr6 (167-409)||(33997561-33997801)
chr6 (241-410)||(5095931-5096100)
chr6 (52-410)||(28085287-28085642)
chr6 (150-410)||(6906843-6907103)
chr6 (341-410)||(12890772-12890841)
chr6 (65-223)||(33083983-33084137)
chr6 (148-385)||(14389202-14389445)
chr6 (148-410)||(32755925-32756187)
chr6 (88-266)||(2079288-2079462)
chr6 (52-410)||(608070-608427)
chr6 (52-410)||(5258164-5258521)
chr6 (159-281)||(9749369-9749491)
chr6 (325-410)||(9706951-9707036)
chr6 (322-410)||(5983809-5983897)
chr6 (327-410)||(3206475-3206558)
chr6 (312-410)||(5897625-5897723)
chr6 (74-407)||(10617253-10617574)
chr6 (327-409)||(31819014-31819096)
chr6 (340-408)||(7513008-7513076)
chr6 (327-410)||(34934846-34934929)
chr6 (340-410)||(2079477-2079547)
chr6 (288-387)||(1747984-1748083)
chr6 (318-393)||(3210541-3210616)
chr6 (148-410)||(31831874-31832137)
chr6 (334-409)||(32097927-32098002)
chr6 (71-133)||(33998292-33998355)
chr6 (327-410)||(34143781-34143864)
chr6 (327-410)||(34156397-34156480)
chr6 (295-409)||(655411-655525)
chr6 (347-401)||(7337220-7337274)
chr6 (148-410)||(21870082-21870351)
chr6 (349-410)||(18130830-18130891)
chr6 (151-366)||(26291788-26291999)
chr6 (341-406)||(28891474-28891539)
chr6 (336-409)||(32068612-32068685)
chr6 (333-406)||(32080658-32080731)
chr6 (225-365)||(547075-547215)
chr6 (339-387)||(1911575-1911623)
chr6 (287-391)||(6055806-6055910)
chr6 (234-369)||(35199680-35199814)
chr6 (70-282)||(7150465-7150670)
chr6 (71-122)||(7513283-7513334)
chr6 (336-410)||(12119658-12119733)
chr6 (297-410)||(10098912-10099023)
chr6 (341-410)||(4245888-4245957)
chr6 (225-322)||(4948408-4948505)
chr6 (225-322)||(4955379-4955476)
chr6 (341-410)||(7492586-7492655)
chr6 (319-408)||(9568874-9568962)
chr6 (52-195)||(9706687-9706827)
chr6 (52-282)||(14030717-14030945)
chr6 (349-410)||(23888494-23888555)
chr6 (345-410)||(30789090-30789155)
chr6 (308-385)||(32400297-32400374)
chr6 (333-409)||(34939288-34939365)
chr6 (158-259)||(5897483-5897592)
chr6 (171-367)||(25493909-25494105)
chr6 (184-276)||(32913412-32913504)
chr6 (286-409)||(585992-586115)
chr6 (351-410)||(1615239-1615298)
chr6 (351-410)||(21089604-21089663)
chr6 (355-410)||(30642980-30643035)
chr6 (371-410)||(33730192-33730231)
chr6 (64-133)||(5129125-5129195)
chr6 (325-383)||(7634553-7634611)
chr6 (160-210)||(18905894-18905943)
chr6 (353-406)||(1008072-1008124)
chr6 (150-251)||(2689646-2689747)
chr6 (52-282)||(10100003-10100228)
chr6 (226-338)||(1747729-1747841)
chr6 (354-410)||(8021265-8021321)
chr6 (346-410)||(30856744-30856808)
chr6 (322-402)||(32945426-32945506)
chr6 (148-203)||(12890588-12890643)
chr6 (351-410)||(30679603-30679662)
chr6 (152-207)||(35043660-35043715)
chr6 (52-100)||(4948629-4948678)
chr6 (52-100)||(4955600-4955649)
chr6 (341-410)||(21351853-21351922)
chr6 (373-410)||(29900275-29900312)
chr6 (158-207)||(30679420-30679469)
chr6 (317-366)||(33080319-33080368)
chr6 (340-392)||(306421-306473)
chr6 (159-203)||(4948534-4948578)
chr6 (159-203)||(4955505-4955549)
chr6 (71-123)||(9568591-9568643)
chr6 (354-410)||(21886314-21886370)
chr6 (199-267)||(30718922-30718990)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (226-408)||(3846-4027)
scaffold0491 (355-410)||(3648-3703)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (148-410)||(964-1226)
[»] scaffold0018 (5 HSPs)
scaffold0018 (148-271)||(44023-44146)
scaffold0018 (71-410)||(31399-31734)
scaffold0018 (251-337)||(178509-178595)
scaffold0018 (64-123)||(44170-44229)
scaffold0018 (300-360)||(43528-43588)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (287-406)||(160344-160463)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (343-410)||(58242-58309)
scaffold0050 (288-393)||(45477-45582)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (327-409)||(14766-14848)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (341-409)||(4833-4901)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (334-410)||(6788-6864)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (260-410)||(66653-66804)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (341-410)||(528-597)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (341-410)||(16452-16521)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (341-410)||(28905-28974)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (148-331)||(11802-11984)
[»] scaffold0024 (3 HSPs)
scaffold0024 (335-407)||(48135-48207)
scaffold0024 (327-410)||(82901-82984)
scaffold0024 (52-212)||(82632-82789)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (327-410)||(25548-25631)
scaffold0157 (79-187)||(25684-25788)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (327-410)||(16761-16844)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (311-386)||(39486-39561)
[»] scaffold0373 (1 HSPs)
scaffold0373 (295-396)||(2331-2432)
[»] scaffold1858 (1 HSPs)
scaffold1858 (325-409)||(893-976)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (333-409)||(7629-7705)
scaffold0171 (148-253)||(7445-7550)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (184-329)||(346870-347015)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (339-398)||(43944-44003)
scaffold0057 (339-398)||(24516-24575)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (341-408)||(86627-86694)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (148-205)||(11817-11874)
scaffold0113 (364-410)||(11565-11611)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (342-402)||(26018-26078)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (354-400)||(1548-1594)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 208)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 161 - 410
Target Start/End: Original strand, 8796226 - 8796475
Alignment:
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8796226 agaaaacaaggtggaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcag 8796325  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796326 atcactagaggcagaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 8796425  T
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796426 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 8796475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 40416375 - 40416637
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40416375 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaaggagagtagatcagat 40416474  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
      |||||||||||||||| | || |||| ||||||    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||    
T  40416475 gcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatgagttggatcgaaatatg 40416574  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40416575 gtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtgggttaag 40416637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32404801 - 32404542
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||| |  |||| ||    
T  32404801 cacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatgga 32404702  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||  ||  ||| ||||||    
T  32404701 ggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtt 32404602  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32404601 tatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 32404542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48431684 - 48431415
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  48431684 tagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatcagat 48431585  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat-------taatgacttggattg 340  Q
     |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||       |||||| ||||||      
T  48431584 ggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttggatcc 48431485  T
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48431484 aaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataag 48431415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3819134 - 3818872
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||   |||||| ||||||| |||||||    
T  3819134 tagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaaagagagtagatcagat 3819035  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||| || ||| | ||||||||  ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  3819034 ggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatg 3818935  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3818934 gtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataag 3818872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 406
Target Start/End: Original strand, 38868898 - 38869144
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||   |||  ||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  38868898 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtagattctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtca 38868997  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
     |||| |||||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||  |||||| || ||||||| |||||||||    
T  38868998 aatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagcgattaatgggttggatagatatatggtatatgataga 38869097  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38869098 acattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 38869144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 404
Target Start/End: Original strand, 2544603 - 2544853
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||||    
T  2544603 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaaggagagtagatcagat 2544702  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    ||||||| | ||||||||||      ||||| | || || ||||| |||||  ||||||||    
T  2544703 ggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaacta-----taagatttggaaatcaatgagttggagcgaaatatg 2544796  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2544797 gtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 2544853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 5338728 - 5338979
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||||||||||| |||||||    
T  5338728 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcagat 5338827  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    ||||||| ||||           ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||    
T  5338828 ggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataag-----------agaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtg 5338916  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  5338917 atttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataag 5338979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36340081 - 36339824
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| | ||| ||| ||||||||| | ||  |||||||    
T  36340081 tagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaaggcgggttgatcagat 36339982  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||||||   ||||||||||||| ||||||||||    ||||||| | |||||||||| || ||||||| | || |||||||| |||||  |||| |||    
T  36339981 ggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagat-ttgaaattaatgagttggacagaaacatg 36339883  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36339882 gttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtggga 36339824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 1210656 - 1211011
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  1210656 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 1210750  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  1210751 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 1210850  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  1210851 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 1210950  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210951 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 1211011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 409
Target Start/End: Original strand, 6025690 - 6025870
Alignment:
Q  229 taaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaa 328  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  6025690 taaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaa 6025789  T
Q  329 tgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6025790 tgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataa 6025870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27848072 - 27847816
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27848072 gtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtc 27847973  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactt-taagagaaactacta----agaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    || |||  ||||| ||||||||||  |  |||| || |||||||||||||||    ||| |||| ||||  ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  27847972 agctcagaagaggtagaggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttat 27847873  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27847872 gatggaacattatgccgtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataag 27847816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 174 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561605
Alignment:
Q  174 gaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggca 273  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||| | | | |||| | |||||| ||||||| ||||| ||| |||| |  ||||| |    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  274 gaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 373  Q
    |||||||||    ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||| ||    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  374 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 52561605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9599752 - 9599414
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||| ||| ||     |||| |||||    
T  9599752 gatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaaca-----cctatagtag 9599658  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || | | | ||| || || | |  |||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  9599657 aaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagat 9599558  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||  ||||| ||||||||||    |||||||  ||||||||||| || |||| || ||||  ||||||| || |||  | |||||||||||||||||||     
T  9599557 cataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacg 9599458  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9599457 ttatggcgtaatttgatccatgtagctgaccttacttagtggga 9599414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37463229 - 37462892
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||  ||||||||||   |||||||||||     |||| |||||    
T  37463229 gatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagag--ttggggtagca-----cctatagtag 37463137  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||   || |||  |||||||||| |  ||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  37463136 aaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggat 37463040  T
Q  263 cacta-gaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    ||  | |||| ||||||  ||    ||||||| |||||||||| |  | ||| ||| ||||  ||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||    
T  37463039 caaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgatc-aaatatggtttatcatagaac 37462941  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37462940 attatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 37462892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19908317 - 19908051
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  19908317 tagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatttgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagat 19908218  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca-ataaaa----aactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaa 342  Q
     ||| |||| ||||||| || ||| ||||| ||||  | ||||    |||| ||||||| || | ||  |    | |||| |||||||| ||||||| ||    
T  19908217 ggag-atagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaattataactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaa 19908119  T
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19908118 atatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 19908051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35828887 - 35828582
Alignment:
Q  85 gtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggt 183  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  35828887 gtgtgataagactaggtgtgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagca-----cctatggtagaaaagatggtggaaaataggg 35828793  T
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  35828792 ttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtcagatccctagaggcagaggaaga-- 35828695  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagat-attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
              |   || |||||| || ||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||    
T  35828694 ----------tctggaaaaactattaggaaagat-ttgataattaatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatcca 35828606  T
Q  383 tgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  35828605 tgtaaccgaccccgcttagtggga 35828582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 409
Target Start/End: Original strand, 42501151 - 42501373
Alignment:
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata 286  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||  || | ||  |||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||        
T  42501151 ggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagaggaaaacctag 42501250  T
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  42501251 aaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaatccatgta 42501350  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  42501351 gccgaccctacttagtgggataa 42501373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 409
Target Start/End: Original strand, 39140468 - 39140780
Alignment:
Q  88 tggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggttta 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||| | |||| ||||||     |||| ||||||||||||||   ||||| || |||    
T  39140468 tggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagca-----cctatagtagaaaagatggcaaaaaattggctta 39140562  T
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||  | | |||||| | |||||| ||||||| || || |||||||| |  ||||| |||||||     ||    
T  39140563 ggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaac----ta 39140658  T
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||| || | ||||||||| || |||| || ||||  ||||| | ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39140659 aaaaagtt-atgagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgta 39140757  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39140758 gccgaccccacttagtgggataa 39140780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30202501 - 30202146
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||      
T  30202501 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagca-- 30202404  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  30202403 ---cctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 30202307  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    | || |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  30202306 acgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 30202207  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202206 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 30202146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 351
Target Start/End: Original strand, 43423648 - 43423926
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggt--aagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaag 167  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||     |||| ||||||||||    
T  43423648 atgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaaca-----cctatagtagaaaag 43423742  T
Q  168 atggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcacta 267  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||| |||||| |  |||| ||   |||||| |||||||    
T  43423743 atggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcacta 43423842  T
Q  268 gaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    |||| ||||||||||    ||||| |  |||||| || | ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  43423843 gaggtagaggaagacctagaaaaattacaagagagaccattaagaaagatctagagattagtgagttggatagaaatatggttt 43423926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 29577339 - 29577161
Alignment:
Q  229 taaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaa 328  Q
    |||||||| || ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||||  || | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29577339 taaggagattagatcagatggaagatagtaagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaa 29577240  T
Q  329 tgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29577239 tgagctggatcaaaatatggtt-atgatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggata 29577161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49347751 - 49347409
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||| |||||| | | ||||||||||     ||| |||||    
T  49347751 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcat-----ctatagtag 49347657  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  49347656 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 49347557  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  49347556 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 49347457  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347456 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 49347409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28511973 - 28511819
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||  | || |||||||| |||||   ||| |||||||||    
T  28511973 tagtcagatcactagaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttat 28511874  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28511873 gatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggata 28511819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38807949 - 38807687
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| |||||||| ||| |||||   ||| |  ||| ||||| |||||| | |||||    
T  38807949 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagat 38807850  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| ||||||||||  ||||  || |||||||   | |||||| |||||||||| | ||  || ||| ||||  | || || ||||||  |||||||    
T  38807849 ggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatg 38807750  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38807749 gtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataag 38807687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 696180 - 696536
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  696180 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 696274  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  696275 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatgg 696374  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||| | |  ||||| ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| || |||  |||||||||    
T  696375 aggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggt 696474  T
Q  350 ttatgatagaacatta-tggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  696475 ttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataag 696536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 395
Target Start/End: Original strand, 9509242 - 9509569
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||     |||| |||||    
T  9509242 gatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagca-----cctatagtag 9509336  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||  |    |||||   |||||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  9509337 aaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatat 9509436  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||    ||||||| ||||| |||||| || ||||||| || |   |||||| || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  9509437 tagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaaca 9509536  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9509537 ttatggcgtaattcgatccatgtagccgacccc 9509569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10569328 - 10569131
Alignment:
Q  165 aagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||| |||| ||| || |||| |||| || ||| ||||    
T  10569328 aagatggtgaaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagtacggagggtagattagatggagggtaatcaaatca 10569229  T
Q  265 ctagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatt 364  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  10569228 ctagaggcagaggaacacaaaaaaaa----taaaagaaactattaagaaagatctagagattaataagctggatagaaatatcgtatatgatagaacatt 10569133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34792707 - 34792365
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |  |||||||||| | | |||||||||     |||| |||||    
T  34792707 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagca-----cctatagtag 34792613  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  34792612 aaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 34792513  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| || |  | ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  34792512 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaaca 34792413  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34792412 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataag 34792365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 41560380 - 41560495
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || || | || |||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41560380 taagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 41560479  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||    
T  41560480 cacttagtgggataag 41560495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 52532747 - 52532636
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52532747 taagagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccc 52532648  T
Q  395 cacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||    
T  52532647 cacttagtggga 52532636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 990732 - 990518
Alignment:
Q  153 cctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagg 252  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||| ||  |||| |||||||||| || |||| ||      
T  990732 cctatagtagaaaagatggtaggaaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagacatatagattctgtagcaaggagagtagattagatggaat 990633  T
Q  253 atagtcagatcactagaggcagaggaag-acaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  |||||| | |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||    
T  990632 atagtcagatcactgtaggcagaggaagcacattggaaaactattagagaaactattgagatagatctagagattaatgagttggatcaacatatggttt 990533  T
Q  352 atgatagaacattat 366  Q
    |||||||||||||||    
T  990532 atgatagaacattat 990518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 406
Target Start/End: Original strand, 1661377 - 1661681
Alignment:
Q  91 taagactagatgagataggattagaaatga----caa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggttt 185  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||| |||||| | |||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  1661377 taagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagca-----cctatagtagaaaagatggtggaaaataggctc 1661471  T
Q  186 aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaat 285  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||   |||||| |||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||       
T  1661472 agatggtttgagcatgtagagagaagacctatagattc--tagtaatgagagctgatcagatggaggataattagatcactagaggtagatgaagac--- 1661566  T
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
          || |||||||||||| || ||||||| |||| ||||| || |||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||  |||    
T  1661567 ------ctataagagaaactattaggaaagatttagaaattaacgagttggaccgaaatgtggtttgtgatagaacattttggcgtaaattgatcactgt 1661660  T
Q  386 agccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  1661661 agttgaccccacttagtggga 1661681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 9592645 - 9593000
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  9592645 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 9592739  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  9592740 gcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 9592839  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     ||| || | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| || |||| |||| ||||    
T  9592840 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggt 9592939  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9592940 gtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataag 9593000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 366
Target Start/End: Original strand, 15577435 - 15577640
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  15577435 agtagaaaagatggtggaagctgggattaggtggtttgagcatgtatagagaagacatgcggattctgtagtaaggagagtagatcagat---ggatagt 15577531  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    || ||||||||||| |||||||||    ||||||   |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||| || ||||| | | |||||    
T  15577532 cacatcactagaggtagaggaagatctaaaaaaataataagagaaactattaagaaggatatagagattaatgagttggatagagatatgatatttgata 15577631  T
Q  358 gaacattat 366  Q
    |||||||||    
T  15577632 gaacattat 15577640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 51602060 - 51602322
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| ||||| |||||| |||| ||    
T  51602060 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaat 51602159  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | ||| |||| | ||  |  ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  51602160 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 51602259  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51602260 gtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 51602322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 854027 - 853797
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || ||  ||||||||||||||  | |||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  854027 ttaggtggtttaggcatgtagagagataacatgaagattatgtagtaaggagagtttaccagatgaagattagtcaaatcactagaggcagaggaagacc 853928  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc-- 381  Q
      ||||| || || ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||| |  | ||| | ||||||||||| |||||||| | ||| ||||      
T  853927 taaaaaatctatacgagaaactattaagaaggatctagagattagtgagttggatagggacatgatatatgatagaacgttatggcggagtttcatccat 853828  T
Q  382 --atgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  853827 gtatgtagccgaccccacttagtgggataag 853797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13827844 - 13827614
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagag 251  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||||||||||| |||| || ||     
T  13827844 acctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggaa 13827745  T
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaaga--tctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||         ||   ||| |||||| ||||||| |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  13827744 catagtcagatcactagaggcagaggaagac---------ct---agaaaaactattaagaaaaaagtctagagattaatgagttggatagaaatatggt 13827657  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
     ||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||| |||||    
T  13827656 atatgatagaacattatgacgttgtttcatctatgtatccgac 13827614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28090779 - 28090710
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090779 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28090710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 399
Target Start/End: Original strand, 40419550 - 40419893
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |      
T  40419550 taagtgtagcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaa-- 40419647  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       | || ||||||| ||||||| | || |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||| ||||||||||  |||||| |    
T  40419648 ---cttatagtagaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagttcagatgg 40419744  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||  ||| |||| |||||||| || || |||||   |||| || ||  |||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||   | | |||||    
T  40419745 aggggagttagataactagaggtaggggtagacatagaaaatctatacaagaaactattatgaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggt 40419844  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    || ||||||| || ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||    
T  40419845 ttttgatagatcactatggcgtcgttt-attcatgtagccgaccccactt 40419893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 410
Target Start/End: Original strand, 51812623 - 51812775
Alignment:
Q  257 tcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgat 356  Q
    |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  51812623 tcagatcactagaggcagacatagacc-taaaaaaccataagagaaacttttaagaaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgat 51812721  T
Q  357 agaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||| |||||||||||  || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  51812722 agaatattatgccgtaatttaatatatatatacgaccccactaagtgggataag 51812775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4001813 - 4001475
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  4001813 gatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 4001719  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||| |    
T  4001718 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggt 4001619  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||| |||||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  4001618 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacc 4001519  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
     |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4001518 ctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggga 4001475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33561081 - 33560874
Alignment:
Q  203 agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaa 302  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |    ||||||| |||| |||    
T  33561081 agagagaagacctgtagattctgtagtaaggagagtagatatgatggagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagtcctagaaaaactgtaagggaa 33560982  T
Q  303 actactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||  || ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | |  ||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  33560981 actattaagtaagatctagagattagcgagttggatataaatatggtatatcagagaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagt 33560882  T
Q  403 gggataag 410  Q
    ||||||||    
T  33560881 gggataag 33560874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16822376 - 16822038
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||       | ||| |||| | || | |||||    
T  16822376 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagtaaga-------gttaggatag-aacttacgtaga 16822285  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
     |||||||| |||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||   || |||||||||||||   |  |||| |||  |||||| ||     
T  16822284 caagatggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtataatttgtagtaaggagagatgactagatggagagtagtcaaatt 16822185  T
Q  264 actagaggcagaggaagac--aataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    |||||||||| ||||| ||  || ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| |  ||||| | |||||| ||||    
T  16822184 actagaggcaaaggaaaacgtaaaaaaaaactacaagagaaactagtaagaaagatgtagagattaatgagctggatagcgatatgatatatgattgaac 16822085  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16822084 attatggcg-gctttggtccatgtagtcgaccccacttagtgggataa 16822038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 308 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 31274519 - 31274418
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31274519 taagaaagatctagagatttatgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggat 31274420  T
Q  408 aa 409  Q
    ||    
T  31274419 aa 31274418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25979483 - 25979247
Alignment:
Q  174 gaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggca 273  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |   || |||||||||||| |||  || ||||| |||||| | |  ||||| |    
T  25979483 gaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcaggttaaaagaggta 25979384  T
Q  274 gaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 373  Q
    |||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25979383 gaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtca 25979284  T
Q  374 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979283 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 25979247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 302 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43375722 - 43375615
Alignment:
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  43375722 aactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttag 43375623  T
Q  402 tgggataa 409  Q
    ||||||||    
T  43375622 tgggataa 43375615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14226095 - 14225981
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||  ||||||    
T  14226095 tagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaggattcctgtagattttgtagtaaggagagtagatcacatggagcgtagtca 14225996  T
Q  260 gatcactagaggcag 274  Q
     ||||||||||||||    
T  14225995 aatcactagaggcag 14225981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18469357 - 18469099
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||| ||| || |||||  |||| | | |||||| | |||||||||||||| ||    
T  18469357 cacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatgga 18469258  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    | | |||| |||||  ||||| ||| ||||||    ||||| | |||||||||||  || |||| ||  |||  | ||||| ||||||  |||||| |||    
T  18469257 gaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtt 18469158  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18469157 tatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataa 18469099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25715412 - 25715342
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25715412 gaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataag 25715342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 8671851 - 8672184
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||||||    |||||     ||||||||| |||||||||| |    
T  8671851 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag---tggggg----tagcacctatagtagaaaagtt 8671943  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  | |  |||    
T  8671944 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 8672043  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    || ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||    
T  8672044 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagc 8672143  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  8672144 gtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataag 8672184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936726
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  401 gtgggataag 410  Q
    ||||||||||    
T  19936717 gtgggataag 19936726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21769796 - 21769727
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21769796 aaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataag 21769727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 27703951 - 27704146
Alignment:
Q  82 gatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaa-ttagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaata 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| |  ||||||| ||     | || ||||||||||||||||||||| |    
T  27703951 gatgtgtggtaagacttgatgagataagattagaaatgaccatgttagaaagagagatggggtaacac----cttatagtagaaaagatggtggaaaaca 27704046  T
Q  181 ggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaag 280  Q
     | ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  || ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27704047 tgcttatgtggtttggacatgtagagaaaagacct--agattatgtagcaaggagagtagatcagatggaggatgttcagatcactagaggcagaggaag 27704144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44941861 - 44941792
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44941861 aaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 44941792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 15085845 - 15086072
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  15085845 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 15085939  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| || || |||||| |||| || |    
T  15085940 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatgg 15086039  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    |||| |||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  15086040 aggagagtcagattaaaagaggtagaggaagac 15086072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 29128926 - 29129050
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaat-ccatgt 385  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||    
T  29128926 aaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgt 29129025  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  29129026 agccgaccccacttagtgagataag 29129050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 7124284 - 7124407
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||| ||  ||| |||||||||    
T  7124284 aaaaactataagagaaactattgagaaagatctattgattaatgaattggatagaaatatggtataggatagagcattatggtgtcgtttgatccatgta 7124383  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  7124384 gctgacctcacttagtgggataag 7124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19908555 - 19908400
Alignment:
Q  255 agtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatg 354  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| | |  ||  |||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||     
T  19908555 agtcaggtcactagaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttata 19908456  T
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||  |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19908455 atagaatcttattgcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataag 19908400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27072602 - 27072507
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27072602 gaaagatttagaaattaaagagttggacagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtggga 27072507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Original strand, 28528395 - 28528614
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| | ||  |||||||||| |||| |||| || ||||  ||||| ||| ||||| | || |||||||     
T  28528395 ttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagtaggggaagacc 28528494  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
      |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||   | | ||||||| ||||||| || ||||||||  ||| || |||    
T  28528495 taaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcat 28528594  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28528595 gtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Original strand, 34444531 - 34444622
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34444531 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 34444622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510850
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 45510850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51441123 - 51440781
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||| ||     |||| |||||    
T  51441123 gatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaaca-----cctatagtag 51441029  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | || |  ||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||  |    
T  51441028 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagt 51440929  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |   |||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| || |  | ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  51440928 taaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 51440829  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     || ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51440828 ctacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataag 51440781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 52921263 - 52921346
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52921263 aatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 52921346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 22090100 - 22090362
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||  |||| |  ||| ||||| | |||| |||| ||    
T  22090100 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaat 22090199  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  || || ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  22090200 ggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 22090299  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22090300 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataag 22090362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30834215 - 30833993
Alignment:
Q  188 gtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataa 287  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| || || ||   || ||||||||||| ||||||| || | |||||| |||  |||||| ||||||||||    |    
T  30834215 gtggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctaga 30834116  T
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    ||| || |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || | |||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  30834115 aaagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgtag 30834016  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||| || || | ||||||||    
T  30834015 cggacctcattttgagggataag 30833993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38877585 - 38877359
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||| ||| | || |||||| ||| |  |||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  38877585 ttaggtggtttaagcatgtagagagatgacctgtagattttgcagcaaggagggtagactagatggagtgtagtcaaatcactataggcagaggaagacc 38877486  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
        ||||||  ||| |||| ||  ||| |||||||| | ||||| || |||||| |  |||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38877485 taggaaaactacaagggaaagtatcaagtaagatctaaagattaacgagttggatagggatatagtatacgatagaacattatggcgtcatttgatccat 38877386  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38877385 gtagccgaacccacttagtgggataag 38877359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4590657 - 4590548
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| |||||||||| || | ||| |||| |||||| || ||||| | | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4590657 aaactattaagaaagatttatagattgatgagttggatagatatatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 4590558  T
Q  401 gtgggataag 410  Q
    ||||||||||    
T  4590557 gtgggataag 4590548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4707321 - 4707237
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4707321 ttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggataag 4707237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 22175342 - 22175411
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175342 aaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 22175411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40568495 - 40568426
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40568495 aaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 40568426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257836
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataag 50257836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 406
Target Start/End: Original strand, 50846652 - 50846824
Alignment:
Q  231 aggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatg 330  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    ||| |   | |||||||||| |  ||||||| | || ||||| |    
T  50846652 aggagagtagatcagatggaggataatcatatcactagaggcagaggaagacttggaaata---tcagagaaactatttggaaagatttggaaattaacg 50846748  T
Q  331 acttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    | ||| |   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  50846749 agttgaaccaaaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtggga 50846824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8203273 - 8203150
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||  |||| |  | ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  8203273 aaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggacggaggtatgatagaagatagaacattatggcgttgatttatccatgta 8203174  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  8203173 gccgaccccacttagtgtgataag 8203150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37311854 - 37311775
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311854 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 37311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 39318312 - 39318394
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39318312 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtgggataag 39318394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17269067 - 17269009
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17269067 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtggga 17269009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113455
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataag 26113455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1290116 - 1290047
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  1290116 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataag 1290047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2429706 - 2429649
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2429706 tttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtggga 2429649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10200404 - 10200323
Alignment:
Q  328 atgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10200404 atgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataa 10200323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 329
Target Start/End: Original strand, 10272273 - 10272443
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  | | ||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||| | ||||||| || |  |||    
T  10272273 agtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacctgt-ggattcgtaggaaggagaggagatcagatggatgggagt 10272371  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactt-taagagaaactactaagaaagatctagatattaat 329  Q
    || ||||||||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  10272372 caaatcactagaggtaggggaagac-ctagaaaacttataagagaaactattaagaaggatctagaaattaat 10272443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27637911 - 27637736
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| || |||||||||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||    
T  27637911 tagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcatat 27637812  T
Q  248 a--gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctag 321  Q
    |  |||   || || ||||||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  27637811 atggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctag 27637736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 410
Target Start/End: Original strand, 29577454 - 29577518
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29577454 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 29577518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32083113 - 32082776
Alignment:
Q  55 gtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagca 152  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||         
T  32083113 gtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagca----- 32083019  T
Q  153 cctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagg 252  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||  ||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||    
T  32083018 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagg 32082919  T
Q  253 atagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttta 352  Q
    | |||||| | |  ||||| ||||||||||            ||||| |||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||||||     
T  32082918 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacc-----------taaga-aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttt 32082831  T
Q  353 tgatagaacattatggc-gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32082830 tgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 32082776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Original strand, 6084150 - 6084241
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   || | ||||||||||||||||    
T  6084150 tagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataag 6084241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 406
Target Start/End: Original strand, 27704157 - 27704212
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27704157 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtggga 27704212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 4029126 - 4029388
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| ||| || |||| ||    
T  4029126 tagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaat 4029225  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| || |  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  4029226 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttg 4029325  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4029326 gtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 4029388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37294186 - 37294128
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37294186 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccatttagtggga 37294128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7762576 - 7762487
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7762576 aaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaattt 7762487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Original strand, 8391683 - 8391835
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  8391683 taagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 8391777  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  8391778 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagaga 8391835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11941711 - 11941598
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| |||| |||| ||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||     
T  11941711 taagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcct 11941612  T
Q  395 cacttagtgggata 408  Q
    ||||||||||||||    
T  11941611 cacttagtgggata 11941598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 410
Target Start/End: Original strand, 26016454 - 26016703
Alignment:
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| | |   ||  |||| ||||||| || |||||||  |||  ||||||    
T  26016454 agaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacctatgcattctgtagcaaggagattagatcagatgaaggggagtcag 26016553  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 360  Q
    ||||||||||| |   | ||||    ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| || ||   ||| ||||||| || |||||    
T  26016554 atcactagaggtaagagtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaatgatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttggtagaa 26016653  T
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||  ||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  26016654 cattgtggcgtcgtttgatacatgtagctgagcccacttagtggggtaag 26016703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 44751681 - 44751750
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44751681 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataag 44751750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8676996 - 8676878
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt---tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga 391  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8676996 taagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T
Q  392 ccccacttagtgggataag 410  Q
    | ||  |||||||| ||||    
T  8676896 ctccggttagtgggttaag 8676878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Original strand, 9002379 - 9002463
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggata 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  9002379 gtggaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggata 9002463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 28533673 - 28533733
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533673 ttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28533733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43240752 - 43240395
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaa-attggggtagcat 148  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||   |||||||||| | | |||||     |    
T  43240752 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtggggg----t 43240657  T
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||  || | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||  |||| | | || ||||| |||||| |||| ||     
T  43240656 agcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatg 43240557  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| ||| |  | |  | ||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| || || | ||||| ||||||  |||| |||    
T  43240556 gaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttgg 43240457  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43240456 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataag 43240395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  314 agatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52981492 - 52981424
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52981492 aaatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccttgtagccaaccccacttggtgggataa 52981424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8343046 - 8342900
Alignment:
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 360  Q
    ||||||||||  ||||||||||    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || | |||| |||    
T  8343046 atcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaa 8342947  T
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||   ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||    
T  8342946 cattatgacg---tttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataag 8342900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 15086105 - 15086188
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15086105 aatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 15086188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 29807999 - 29808122
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||| |||||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||  |||| || ||||||    
T  29807999 aaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgta 29808098  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  29808099 gccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40920642 - 40920547
Alignment:
Q  313 aagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc-acttagtgggat 407  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40920642 aagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaatattatggtgtcttttgattcatgtagtcgacccccacttagtgggat 40920547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40920888 - 40920825
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40920888 atgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagaga 40920825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 366
Target Start/End: Original strand, 41611822 - 41612028
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||| |   |||||| | | |||| || | ||||||| | ||||    
T  41611822 tagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagattaaatagaggtttgtca 41611921  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaaga-caataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    || ||  ||||| ||||||| | | |||||||| | ||||||| | |  ||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  41611922 gagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaa-tataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaatatggtttatcatag 41612020  T
Q  359 aacattat 366  Q
    ||||||||    
T  41612021 aacattat 41612028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52160478 - 52160260
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || |  ||||  ||| |||||||  |||||| |  |||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  52160478 ttaggtggtttggacatgtagatagaaaatttgtaaattttgtagtaacaagagtagactagatggagggtagtcaaatcactagaggcatatgaagaca 52160379  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       ||||||| ||||||||||||       ||||||||| ||||| || || ||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  |||| || |||    
T  52160378 gagaaaaactataagagaaacta-------agatctagaaattaacgagtttgatagaaatatgatatatgatagaatattatggtgacatttgatgcat 52160286  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
     ||||||||| || ||||||||||||    
T  52160285 atagccgacctcatttagtgggataa 52160260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7133404 - 7133322
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7133404 attaatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7133322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 321
Target Start/End: Original strand, 16943099 - 16943351
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||| ||||| |||| | ||||||||| |     |||| |||||    
T  16943099 gatgagaatattgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagta-----cctatagtag 16943193  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||  | |||| |||||||| |||||||  ||  | |||| ||    
T  16943194 aaaagatggtggaaactagattta-gtggtttgggcgtgtagggagaagacatttagattctgcagtatggagagtagatcagatgaagagtggtcaaat 16943292  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctag 321  Q
     |||||||||| | ||||||     ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16943293 aactagaggcaaaagaagacctaggaaagcgataagagaaactattaagaaagatctag 16943351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 387
Target Start/End: Original strand, 17815490 - 17815722
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaagga-------gagtaaatcagatagaggat 254  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | | | | ||| ||  |||||||| |       ||||||||||||| |||  |    
T  17815490 gaaaagatggtggaaactaggcttagttggtttgggcatgtagagagatggcttatagattatgtagtaagaactaagaagagtaaatcagatggagagt 17815589  T
Q  255 agtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatg 354  Q
    ||||| |||| | ||||||  |||||||    ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||| || ||| |||||||||| ||||    
T  17815590 agtcaaatcattggaggcaagggaagacctagaaaaattataagagaaactatttagaaagatctagtgattgatgagttagatagaaatatggtatatg 17815689  T
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    ||||| |||| ||| ||  ||| ||||||||||    
T  17815690 atagagcattttggtgtcgtttgatccatgtag 17815722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Original strand, 26299288 - 26299334
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299288 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 26299334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27520347 - 27520233
Alignment:
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||| ||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  27520347 aaaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgt 27520248  T
Q  386 agccgaccccactta 400  Q
    || ||||| ||||||    
T  27520247 agtcgacctcactta 27520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48861488 - 48861391
Alignment:
Q  315 gatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat--gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||| |||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48861488 gatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatttgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataag 48861391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48865824 - 48865730
Alignment:
Q  309 aagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| || |||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  48865824 aagaaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactcagtg 48865730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Original strand, 50806750 - 50806933
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||    ||||||  ||||||||||||  ||||| |||  ||| |    
T  50806750 gtagtaaggagggtagatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agaga 50806847  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  50806848 ttaatgcgttggataaaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataag 50806933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 408
Target Start/End: Original strand, 7082483 - 7082568
Alignment:
Q  323 tattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082483 tattaatgagttggaccgaaatatgatttattatagaacattttgtggtaaactgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 7082568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827925
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgta 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  13827994 agcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacctgta 13827925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16273172 - 16273119
Alignment:
Q  70 aatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16273172 aatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgagatgagattagaaatgacaa 16273119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 42337753 - 42337822
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42337753 aaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 42337822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 46423312 - 46423232
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46423312 aatgagttggatccaaatatggtttttgattgaacat---ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 46423232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2914191 - 2914139
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2914191 gaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 2914139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8343126 - 8343050
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaagga 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  8343126 agtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagacctgtggatttggtagtaagga 8343050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 410
Target Start/End: Original strand, 11584171 - 11584263
Alignment:
Q  318 ctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||| |||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  11584171 ctagagattaatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataag 11584263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30396901 - 30396745
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||   || |||  |||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||||| |  ||| | | |||    
T  30396901 tagtcaaataactagaggtaggggaagacacggaacaaccataagagaaactgttaagaaggatccagagattaatgagttggatagggatacgatatat 30396802  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |   ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30396801 gatagaacattatggtggcgtttgatccgtgtagccaaccccacttagtgggataag 30396745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32231312 - 32231161
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||||  | |||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  32231312 gatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 32231218  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
    ||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32231217 aaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtag 32231161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 393
Target Start/End: Original strand, 39896760 - 39896812
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39896760 aaatatggtttatgatataacattatggcgtaatttaattcatgtagtcgacc 39896812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52073241 - 52073064
Alignment:
Q  236 agtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaa---agat-ctagatattaatga 331  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||  ||||||| || |||   |||  ||||| ||||||||    
T  52073241 agtaaatcagat-gagagtagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactttaattgaaactattatgaatctagagactagagattaatga 52073143  T
Q  332 cttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
      ||||| |   |||| | ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52073142 gctggatagggctatgatatatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccacttggtgggataag 52073064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 109109 - 109030
Alignment:
Q  310 agaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  109109 agaaagatatagacattaatgagttggataaatatatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcc 109030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2694504 - 2694437
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2694504 aaatatagtttatgatagaacattatggtatagtttgatccatttagcagaccccacttagtgggata 2694437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921898
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagaga 7921898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 402
Target Start/End: Original strand, 14557743 - 14557826
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  14557743 tagaaattaatgagttggaccgaaatgtagtttatgatagaacattatggcgtattttgatccacgtggccgatcccacttagt 14557826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24020366 - 24020283
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24020366 aatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataag 24020283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 32112064 - 32112013
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32112064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagt 32112013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37429978 - 37429915
Alignment:
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37429978 ggtttatgatagcacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttaatgggataag 37429915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39123445 - 39123391
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39123445 tttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgacccc-cttagtgg 39123391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39516007 - 39515884
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||| |||||    
T  39516007 aaaaactatacgagaaactattaagaaaaacctagaaattaatgagttggatcaaaatatggattatggtagaacattatggcattgtttgatctatgta 39515908  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||  ||| || |||||| ||||||    
T  39515907 gctaaccacaattagtgagataag 39515884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 52292191 - 52292305
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||||||  | || |||||||| |||||   || ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| || ||||    
T  52292191 taagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacc-aattattgtttatgatagaaaattattgagtaatttgatccatgtaaccaaccc 52292289  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||    
T  52292290 cacttagtgggataag 52292305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2500115 - 2499974
Alignment:
Q  147 atagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgt------agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaa 240  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |      ||||| || || ||||| || | |||||| |||||||     
T  2500115 atagcccctatagtagaaaagatgatggaaaatatgtttaggtgatttgggcatatatagagagagagaaaacttgtagattacatagtaaagagagtag 2500016  T
Q  241 atcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    ||||| ||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||    
T  2500015 atcagttagaggataatcatgtcactagatgtagaggaagac 2499974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Original strand, 4379929 - 4379999
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4379929 gatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagaga 4379999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12930442 - 12930336
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||||| || || |||| || || | |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  12930442 taagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccc 12930343  T
Q  395 cacttag 401  Q
    |||||||    
T  12930342 cacttag 12930336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Original strand, 35672619 - 35672669
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac 121  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35672619 atgttgcatttaatgtgtggtaaaactagatgagataggattagaaatgac 35672669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 46388392 - 46388570
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||  |||| | |||| |||| |    
T  46388392 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagctcagttggagggtagtta 46388491  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggat 338  Q
     |||| || || || | |||| |    ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  46388492 aatcattatagacatatgaaggcctagaaaaactataagagaaacttttaagaatgatctagagattgatgagttggat 46388570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 410
Target Start/End: Original strand, 12231408 - 12231624
Alignment:
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata 286  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| | ||  ||| || |||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||| |||  |||||| ||        
T  12231408 ggtggtttgggcatgcaaagagaagacctatacattttgtcgtaaggagagtagatcaaattaagggtagtcaaatcactaaaggtggaggaatacttag 12231507  T
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||| || |       |||||||||| |||| || |    | ||||||||||    
T  12231508 aaaaactataagagagactattaagaaagatctcgagattaatgagttggatagaga-------tatgatagaatattacggtgacgatcaatccatgta 12231600  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12231601 gccgaccccacttagtaggataag 12231624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 239
Target Start/End: Original strand, 17275210 - 17275291
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagta 239  Q
    |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  17275210 agtagaaaagattgtggaaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaatccctgtagattttgtagtaaggagagta 17275291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 39776997 - 39776936
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  39776997 attaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32079274 - 32079193
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32079274 aatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacact--ggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccacttggtgggataag 32079193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 406
Target Start/End: Original strand, 41165500 - 41165544
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41165500 attatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 41165544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43481854 - 43481814
Alignment:
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43481854 gtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 43481814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 408
Target Start/End: Original strand, 44008628 - 44008842
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||         || |||||| | |||||| || | |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44008628 ttaggtggtttgggcatgtagagaaaaga---------tttgtagtatgaagagtagattaaatagcgggtagtcaaatcactagaggcagaggaagacc 44008718  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||| || ||||| |||||| |  || | || |||| |||||| |||| |||  |||| ||||||    
T  44008719 tagaaaaaatctaagagaaactatcgagaaagatctagagatcaatgagttggatagggattttgtgtatggtagaacgttat-gcgccatttgatccat 44008817  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
     ||||||| || |||||||| ||||    
T  44008818 ttagccgaacctacttagtgagata 44008842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 1704834 - 1704893
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  1704834 tatgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataag 1704893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6573474 - 6573407
Alignment:
Q  210 agacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  6573474 agacatgtagattttgtagtaaagagagtaaatcagatggagggtaattaaatcactagaggcagagg 6573407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36624013 - 36623901
Alignment:
Q  297 agagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc-gtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    |||||||||| ||  |||||| ||||   |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||     
T  36624013 agagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaatg--atccatgtagtcgaccct 36623916  T
Q  396 acttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||    
T  36623915 acttagtgggataag 36623901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42539291 - 42539232
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattat-ggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42539291 gtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccacttagtggga 42539232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 49377508 - 49377567
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  49377508 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgactccagttagtgggataag 49377567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 50771795 - 50771653
Alignment:
Q  186 aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaat 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| || |||||||| || |||||||       
T  50771795 aggtggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagaccta 50771697  T
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaat 329  Q
     ||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  50771696 gaaaaactataagcgaaactattaagaaggacctagagattaat 50771653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7210989 - 7210943
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7210989 tatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataag 7210943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10799950 - 10799841
Alignment:
Q  290 aactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||  || |||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| ||| ||||||||    
T  10799950 aactgtaagagaaactattagaaaagacttaaatattaatcagttggactgaaatatggtttat-acagaacattttgacgtagtttgatcaatgtagcc 10799852  T
Q  390 gaccccactta 400  Q
     ||||||||||    
T  10799851 taccccactta 10799841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17267855 - 17267797
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  17267855 aaactacaaagaaagatctagaaattaatgagttagatagaaatatggtatatgataga 17267797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 359
Target Start/End: Original strand, 17275342 - 17275400
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  17275342 aaactacaaagaaagatctagaaattaatgagttagatagaaatatggtatatgataga 17275400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 19936446 - 19936504
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  19936446 gatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgaca 19936504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43375817 - 43375731
Alignment:
Q  196 ggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  43375817 ggcatgtagagagaagacctatagattatgtagtaaagagagtagatcagatggtggatagtaaaatcactagaggcagagggagac 43375731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 232
Target Start/End: Original strand, 51812539 - 51812613
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| || |  ||||| ||| ||||||||    
T  51812539 agtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaag 51812613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318865
Alignment:
Q  365 atggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 4318865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 404
Target Start/End: Original strand, 4415532 - 4415609
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4415532 aatgagttggatctaaatatgattttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtgg 4415609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 5113939 - 5114008
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5113939 gaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataa 5114008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 8391961 - 8392030
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8391961 ttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14225911 - 14225854
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14225911 tatgatagaacagtatggtgtcgtttgatccatgtagccggccccacttagtgggata 14225854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 386
Target Start/End: Original strand, 19822085 - 19822130
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  19822085 aaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatccatgta 19822130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Original strand, 19936518 - 19936571
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatg 201  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19936518 tagcacctatagcaaaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22319957 - 22319856
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||| | || ||||||| || |||| ||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22319957 taagaaagatctagaagttaatgaactggatagagatatgatatacgatagaatatcatggtgtcgtttaatacatgcagccgatcccacttagtgggat 22319858  T
Q  408 aa 409  Q
    ||    
T  22319857 aa 22319856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52442861 - 52442780
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtag 145  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||    
T  52442861 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagttggggtag 52442780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43934458 - 43934346
Alignment:
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccac 397  Q
    ||||||||| |||||| |||||| | |||||| | |||||  |  ||||| |  |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||  |||||||    
T  43934458 gagaaactattaagaaggatctacaaattaattagttggaaagggatatgatagatgatagaacattatggcggcgtttgttccatgtagctaaccccac 43934359  T
Q  398 ttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||    
T  43934358 ttagtgggataag 43934346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14299807 - 14299764
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14299807 atatggtatatgatataacattatggcgtaatttgatccatgta 14299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438820
Alignment:
Q  313 aagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt 15438820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37430487 - 37430436
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37430487 aacattatggcgtagtttgatccatatagccgatcccacttagtgagataag 37430436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 379 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758036
Alignment:
Q  379 tccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataag 38758036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39422398 - 39422198
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | |||| |     || ||| || ||||||    
T  39422398 atgagaatgttgtgttagatgtgtggtaggattatatgagatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggag-----taacacatatagtaga 39422305  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    |||||| || |||| |||  |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||| || |||| || ||||  ||||| |||    
T  39422304 aaagatagtagaaactagacttaggt-gcttggacatgtagagagaagacatgtagattatgtagttaggagaatagatcatatggaggggagtcaaatc 39422206  T
Q  264 actagagg 271  Q
    || |||||    
T  39422205 accagagg 39422198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43598989 - 43598938
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  43598989 aacattatggcgtagtttgatccatgtagcagaccctacttactgggataag 43598938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Original strand, 50636174 - 50636347
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||           |||||| |||||| ||||| | ||||||| |    
T  50636174 gtagtaaggagagtagatcaaatggaggataatcagatcagtcgaggcagaggtagac-----------ttaaga-aaactattaagataaatctagaga 50636261  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| ||| |||||| |||  | |||||| ||||||||    
T  50636262 ttattgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataag 50636347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 52633530 - 52633471
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  52633530 gatgaggatgttgcgttgaatgtgcggtaagactagatgtgataagactagaaatgacaa 52633471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4590875 - 4590813
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagag 132  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590875 atgttgcgttgaatgtgcggtgagactagacaagataggattagaaatgacaatattagagag 4590813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 409
Target Start/End: Original strand, 16943362 - 16943420
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  16943362 tatgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataa 16943420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19969351 - 19969301
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgga 337  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19969351 aaaaactataagagaaactattaacaaagatctagagattaatgagttgga 19969301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41017298 - 41017233
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  41017298 tatggtttatgatagaacattatagcataatttggtcgatgtag-cgactccacttagtggaataag 41017233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 409
Target Start/End: Original strand, 45935365 - 45935415
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  45935365 aacattatggagtaatttgatccatgtaacggacctcacttagtgggataa 45935415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52633297 - 52633191
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| || ||||||| || | |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| | || |||  ||||||||| | ||| | ||||    
T  52633297 aaactattatgaaagatttatagattaatgaattgtatataaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgctta 52633198  T
Q  401 gtgggat 407  Q
    |||||||    
T  52633197 gtgggat 52633191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 120
Target Start/End: Original strand, 6641063 - 6641112
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatga 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  6641063 atgttgcgttggatgtgtggtatgactagatggcatagaattagaaatga 6641112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15707064 - 15706987
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||   ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  15707064 ttggatagaaatatggtgtttgattgaacattatgacgccgtttgatccacgcagccgtccccacttagtgggataag 15706987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34827460 - 34827403
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac 121  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  34827460 gatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgac 34827403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 35672688 - 35672745
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35672688 tagcacctatagtagaaaagacgatgagaaatagttttaggtggtttgggcatataga 35672745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 35672882 - 35672951
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||| || | | ||||||||||||||    
T  35672882 aaatatagtttatgatagaatgttatggtgtaatttgatcgatgtagctgatctcgcttagtgggataag 35672951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 48801698 - 48801634
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  48801698 aaatatggtttatgatagaacatta-cacataatttgatccatgtagctgatcccacttagcggga 48801634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 401
Target Start/End: Original strand, 52815095 - 52815132
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  52815095 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttag 52815132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 4380017 - 4380081
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataaga 212  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||   |||||||||| ||||    
T  4380017 tagcaactatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 120
Target Start/End: Original strand, 4781305 - 4781357
Alignment:
Q  68 agaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatga 120  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4781305 agaatgttacaatggatgtgtggaaatactagatgagacaggattaggaatga 4781357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11331335 - 11331247
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||    
T  11331335 taagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11489356 - 11489268
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||    
T  11489356 taagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 96
Target Start/End: Original strand, 12230955 - 12230983
Alignment:
Q  68 agaatgttgcattggatgtgtggtaagac 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12230955 agaatgttgcattggatgtgtggtaagac 12230983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15785021 - 15784981
Alignment:
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15785021 gtaatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataag 15784981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16142119 - 16142019
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||| | ||  |||||| ||||  ||||| | || |||  || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  16142119 aaaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgta 16142020  T
Q  387 g 387  Q
    |    
T  16142019 g 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16273076 - 16272992
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggata 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || ||||| ||   ||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  16273076 gtggaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggata 16272992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17143235 - 17143179
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   | ||| |||||||||||    
T  17143235 gatgagaatgttgcattggatgtgcgctaagactagacatggtagaattagaaatga 17143179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Original strand, 26016361 - 26016397
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26016361 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 26016397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33561125 - 33561077
Alignment:
Q  86 tgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33561125 tgtggtaagactaaatgggataggattggaaatgacaacattagagaga 33561077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50830682 - 50830650
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50830682 atccatgtagccgaccccacttagtggggtaag 50830650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52073741 - 52073673
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaa-taggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacat 215  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52073741 tagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacat 52073673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52561946 - 52561843
Alignment:
Q  87 gtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggttt 185  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||     |||  |||||||| |||| | ||||||||| ||    
T  52561946 gtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagca-----cctttagtagaaatgatgatagaaaataggctt 52561852  T
Q  186 aggtggttt 194  Q
    |||||||||    
T  52561851 aggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 165)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2518801 - 2518422
Alignment:
Q  11 cagagagttgggcagtgaagaaccaatatgagnnnnnnnnntaagtgtagcgggatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagatagga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518801 cagagagttgggcagtgaagaaccaatatgagaaaaaaaa-taagtgtagcgggatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagatagga 2518703  T
Q  111 ttagaaatgacaaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  2518702 ttagaaatgacaaattagagagaaaattggggt-----agcacctcaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaa 2518608  T
Q  211 gacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaa 310  Q
    ||| ||||| ||| |||| || ||||||| |||| || |||||||||| || ||||      |||||||| |  | ||||| | ||||| |||||| | |    
T  2518607 gacttgtagattttgtaggaaagagagtatatcaaattgaggatagtctgaacact------agaggaagtccttgaaaaattataagacaaactattga 2518514  T
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    | |||||||| | |||||| | || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  2518513 gcaagatctacagattaatcagtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagt 2518422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 409
Target Start/End: Original strand, 29520584 - 29520914
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||     ||| |||||    
T  29520584 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcat-----ctatagtag 29520678  T
Q  163 aaa-agatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||| | ||||||||||           ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  29520679 aaataaatggtggaaa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaa 29520767  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    |||| ||||| |||||||| | | ||||| || |||||||||||  || ||| ||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29520768 tcacaagaggtagaggaagcctagaaaaa-ctataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 29520866  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29520867 attatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataa 29520914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 168 - 410
Target Start/End: Original strand, 30559717 - 30559964
Alignment:
Q  168 atggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcacta 267  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30559717 atggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcacta 30559816  T
Q  268 gaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatg 367  Q
    |||  ||| ||||||   |||||||| ||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  30559817 gagatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatg 30559916  T
Q  368 gcgtaatttaatcc-----atgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| ||||     ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30559917 acgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataag 30559964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 45419170 - 45419501
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||     |||| ||||||||||||    
T  45419170 atgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagagaa--ttggggtagca-----cctatagtagaaaagat 45419262  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      ||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||   |||    
T  45419263 ggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaaga 45419360  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    || ||||||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||  |||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||||||     
T  45419361 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggt 45419460  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419461 gtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 45419501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35643869 - 35643625
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagta----aatcagatagagga 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||         |||||||| ||    |||||| | |||||    
T  35643869 agtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtag---------taaggagaatagatcaatcagctggagga 35643779  T
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35643778 tagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttat 35643679  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||   || | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35643678 gatagaaca--ctgccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataa 35643625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30783411 - 30783059
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    ||||||||| || |||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | | |  | | | | |||    
T  30783411 taagtgtagtggagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggata 30783312  T
Q  150 gca-cctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||     |||     
T  30783311 gcaacctatagtagaaaa-atggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattttgtagtaaagagagta-----gatg 30783220  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  30783219 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacgg 30783120  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30783119 tttataataaaacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccatctagtgggataa 30783059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35914839 - 35914617
Alignment:
Q  188 gtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataa 287  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |    
T  35914839 gtggtttgggcacgtagagagaagacctatagattttatagcaaggagagtaggtcagatggaggatagtcagatccctagagacagaggaagacataga 35914740  T
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||  |  | |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35914739 aaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 35914640  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  35914639 ctgaccccacttagtgagataag 35914617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 406
Target Start/End: Original strand, 32931042 - 32931222
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||| || ||||||| | || |    
T  32931042 gtagtaaggagactagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaa 32931141  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32931142 ttaatgagttggac-gaaatatggtgtatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 32931222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 16917108 - 16917448
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||||||| |    |||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||| |     || |||||||    
T  16917108 gatgagaatgttgcgttgactttgtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagta-----ccgaaagtag 16917202  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  16917203 aaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagattt-gtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaat 16917301  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||| ||| ||| ||||||    |||| || || | |||||||  ||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16917302 cactacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaaca 16917401  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || || |    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16917402 tt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataag 16917448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 41972132 - 41971823
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||       | |||  || ||||||| ||||    
T  41972132 gatgaggatgttgtattggatgtgtgataagatta-atgagatagaattagaaatgagaatattagagaga-------gttagggtaacacctaa-gtag 41972042  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||  ||| |||||||||| ||||| | || |||||||| ||    
T  41972041 aaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagacgtgtagattttctagcaaggagagtagatcaggtggacgatagtcaaat 41971942  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||||||||| |||         |||| ||   ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41971941 cactagaggcaaagg---------aaaacct---agaaaaactactaagaaagatttagagattaatgagttggactgaaatattgtttatgatagaaca 41971854  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||| ||||    
T  41971853 ttatgacttaatataattcatgtagctgacc 41971823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 402
Target Start/End: Original strand, 29700233 - 29700534
Alignment:
Q  93 agactagatgagataggattagaaatgacaaa-ttagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    |||||||||||     |||| |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  29700233 agactagatgagataggattagaaatgaaaatgttagagag----ttggggtagca-----cctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtgg 29700323  T
Q  192 tttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaa 291  Q
    ||||||||| |||||| |||||   | | ||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    |||||    
T  29700324 tttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggagagtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaa 29700423  T
Q  292 ctttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga 391  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||  | || || ||||| | |||   |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29700424 ctaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcggaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 29700523  T
Q  392 ccccacttagt 402  Q
    | |||||||||    
T  29700524 ctccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 43905000 - 43904698
Alignment:
Q  89 ggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatag---gtt 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  | |||| |||||||     ||| |||||||||||||| ||||||||    | |    
T  43905000 ggtaagactagatgaaataggataaaaaatgacaacattagagaggta-ttggcgtagcat-----ctatagtagaaaagatggaggaaaataataagct 43904907  T
Q  185 taggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaa 284  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| | | |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||||      
T  43904906 taggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacct 43904807  T
Q  285 taaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatg 384  Q
      ||| ||| ||||||||||   || || |||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43904806 agaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatg 43904707  T
Q  385 tagccgacc 393  Q
    |||||||||    
T  43904706 tagccgacc 43904698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10080256 - 10079970
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||     |||| |||||||||||    
T  10080256 atgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcat-----ctaa-gtagaaaagat 10080163  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    |||||||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||| |||||||||    
T  10080162 ggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactaga 10080064  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacat 363  Q
    || ||||||||||    | ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||    
T  10080063 ggtagaggaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatgatatttgatagaacat 10079970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30198467 - 30198282
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    ||||||| ||||||||| || |||||||||| | || |    
T  30198467 gtagtaacgagagtagatcagatgaaggatagtcagtacactagaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgaga 30198368  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30198367 ttaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataag 30198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35362851 - 35362670
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    |||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    ||||||| |  ||||||||| || ||||||| | || |    
T  35362851 gtagcaaggagagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaa 35362752  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35362751 ttaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtggga 35362670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 387
Target Start/End: Original strand, 5908581 - 5908889
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggt----- 172  Q
    ||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |     |||| |||||||||||||||         
T  5908581 ttggatgtgtttcaagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaa-----cctatagtagaaaagatggttgaaa 5908675  T
Q  173 -ggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagagg 271  Q
     ||||| |||  |||| ||||||||  || |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||     
T  5908676 tggaaactagacttagttggtttgg--atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtcagatcactagaga 5908773  T
Q  272 cagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 371  Q
    || ||||||||    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |   |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  5908774 cataggaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaaccttattgcgt 5908873  T
Q  372 aatttaatccatgtag 387  Q
    ||||  ||||||||||    
T  5908874 aattggatccatgtag 5908889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043853
Alignment:
Q  72 tgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatg 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||     |||| |||| ||||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatca-----cctatagtacaaaagatg 32043616  T
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagag 270  Q
    || |||| |||  || |||||||||| |||||||||| ||||| ||| | | | |||||||||||| || ||||||| ||||   |||| ||||||||||    
T  32043617 gtagaaactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagag 32043716  T
Q  271 gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcg 370  Q
    | || |||||||   |||||||| | ||||||||||  ||||| |||||| | || ||||| |||||   | | ||||||| |||||||||| ||||||     
T  32043717 gtaggggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc- 32043815  T
Q  371 taatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
       ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  32043816 -cgtttgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataag 32043853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36565612 - 36565257
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||      
T  36565612 taagtgtagcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagca-- 36565515  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||| |  ||| ||||| || ||| |||| || |    
T  36565514 ---cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatgg 36565418  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  36565417 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 36565318  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565317 gtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 36565257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18742222 - 18742041
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||   | ||    
T  18742222 tagtaaggagagtagataagatggaagatagtcagattgctagaggcagaggtagacc-taaaaaactataagagaaactatttagaaaaatcattagat 18742124  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  18742123 taatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggata 18742041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18747186 - 18747005
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||   | ||    
T  18747186 tagtaaggagagtagataagatggaagatagtcagattgctagaggcagaggtagacc-taaaaaactataagagaaactatttagaaaaatcattagat 18747088  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  18747087 taatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggata 18747005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13172007 - 13171875
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||      |||||||| |||||    
T  13172007 gatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttgggg-----aagcacctatagtag 13171913  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcat 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13171912 aaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcat 13171875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 36545058 - 36545415
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaa-attggggtagcat 148  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||     |    
T  36545058 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtggggg----t 36545153  T
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    | |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||     
T  36545154 aacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatg 36545253  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||||||||||  | |  ||| | ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||    
T  36545254 gaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg 36545353  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545354 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 36545415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681184
Alignment:
Q  74 ttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||     ||||||||| | |||||||||||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtgg-----tagcacctataatagaaaagatggt 44681293  T
Q  173 ggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggc 272  Q
    |||||||| | ||||  |||||||  || |||||| ||||| | ||| ||  | || || ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  44681292 ggaaaataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagacctatagattctgcagcaatgagagtagatcagatagatgacagtcatatcactagaggc 44681193  T
Q  273 agaggaaga 281  Q
    |||||||||    
T  44681192 agaggaaga 44681184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 410
Target Start/End: Original strand, 490502 - 490601
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  490502 gaaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 490601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45512854 - 45512558
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaa--aattggggtagcatagcacctaaagt 160  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||| |||||   | |||||||||||     |||| |||    
T  45512854 gatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagat-aggtagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagca-----cctatagt 45512761  T
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||  | ||| ||  |||||||| |||||| || |||| |  ||||||||     
T  45512760 agaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaa 45512661  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggat-tgaaatatggtttatgataga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||  | || |||||||| || |||   |||||||||||||||||||    
T  45512660 atcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgataga 45512561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38392117 - 38391919
Alignment:
Q  202 tagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagaga 301  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| |||||||||  ||||||  ||| ||||||| |||||| || |||||||||||    ||||||| || ||||    
T  38392117 tagagagaagacatgttgattctgtagtgaggagagtaggtcagatgaagggtagtcagctcactatagacagaggaagacctagaaaaactatatgaga 38392018  T
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    ||| | ||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  38392017 aaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgtaatttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39967638 - 39967516
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39967638 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatccatgta 39967539  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| |||||||| || |||||    
T  39967538 gccgatcccacttattgtgataa 39967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 410
Target Start/End: Original strand, 23492140 - 23492300
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||| |||||| |||||||||   ||||||||||  || |||||| | |||||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||     
T  23492140 gagggtagtcaaatcactagatatagaggaagacc-tagaaaactattagagaaactactcagaaagatgtagcgattaatgagttggatagaaatatga 23492238  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23492239 tatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataag 23492300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 365
Target Start/End: Original strand, 44373780 - 44373990
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||    
T  44373780 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagagtaaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaat 44373879  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | ||||       |||||| |||||||||||| || ||||||  |||| |||| ||| ||| |   |||||||    
T  44373880 agaggatagtcagatccctggaggcatatgaag-------aaaactataagagaaactattaggaaagacttagagattattgaattgaaccaaaatatg 44373972  T
Q  348 gtttatgatagaacatta 365  Q
     ||||||||| |||||||    
T  44373973 atttatgataaaacatta 44373990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10824511 - 10824313
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||||    ||| || ||||     |||||||||||||||||    
T  10824511 atgttgcattggacgtgtggtaagactagatgggatatgattagaaataaaaatattagagag----ttgaggcagca-----cctaaagtagaaaagat 10824421  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||   ||| ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||     
T  10824420 ggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtcagatcgctagt 10824321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12491416 - 12491154
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  12491416 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 12491317  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
      |||| |||||  | |  ||||| ||| ||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  12491316 gaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 12491217  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491216 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 12491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 398
Target Start/End: Original strand, 30748471 - 30748717
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||||||| | |||| |||| ||| ||| ||||    
T  30748471 agtagaaaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaatatagggtagt 30748570  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaag--------aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    || |||||||||  |||||||||||  | ||||||  |||||||||||| ||||        ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |    
T  30748571 caaatcactagaatcagaggaagaccttgaaaaaccgtaagagaaactattaagatttaaaaaaagatctag--attaatgagttggatagaaatatgat 30748668  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
     ||| || ||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30748669 atataattgaacattatgatgtcatttgatccatgtagctgaccccact 30748717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 2216388 - 2216552
Alignment:
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca-ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaa 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| ||||||   |    
T  2216388 agatggaggatagtcagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaaacat-aagagaaactattaagaa-gatttagagatcaatgagttggatccta 2216485  T
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2216486 atatg-tttatgatagaacattatagtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataag 2216552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11524002 - 11523739
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatagg-tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcaga 246  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| |    
T  11524002 tagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 11523903  T
Q  247 tagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatat 346  Q
    | ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |    
T  11523902 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 11523803  T
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11523802 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 11523739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16035867 - 16035744
Alignment:
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||| | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  16035867 aaaagactataagagaaactgttaagaaatatctagagattacttagttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgt 16035768  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16035767 agctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 404
Target Start/End: Original strand, 28169497 - 28169652
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||||||||| |||  | ||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  28169497 gaggatagtctgattgcaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatgg 28169596  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  28169597 tttatgataaaatattatggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtgg 28169652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 249 - 403
Target Start/End: Original strand, 79132 - 79286
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  79132 gagggtagtcaaatcactagaagcagaggaaggcttagaaacactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatgg 79231  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
      | ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  79232 cctgtgatagaacataatggcgtcgtttgatccatgtacccgaccccacttagtg 79286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 409
Target Start/End: Original strand, 39051066 - 39051407
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||| |||||| | |||||     ||| ||||||   | |    
T  39051066 gatgaggatgttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatagaattagaaatgacaatattcgagagagagttggg-----ataacacctatcattg 39051160  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||    
T  39051161 aaaagatggcagaaactcggtttaggtggtttgggtatgtagagaaaagtcatgtagattttgcagtgaggagagtaaatcagatggagagtagtcaaat 39051260  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||||||||||    ||||  | ||||||| | | ||||  || |||| | |||||||||||| |||| ||||||  | ||||| |  ||||||||||     
T  39051261 cactagaggcagtcctagaccctgaaaaactattaaagaacttattaaggaggatctagatattcatgagttggataaatatatgataaatgatagaact 39051360  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||  |||   ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39051361 ttacagcgacgtttgatccatgtagtcgaccccacttagtaggataa 39051407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 277
Target Start/End: Original strand, 36143293 - 36143498
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    | | |||||||     |||| || ||    
T  36143293 gatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattagagag----tcgaggtagca-----cctatagcag 36143383  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||  |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  36143384 aatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtcagat 36143483  T
Q  263 cactagaggcagagg 277  Q
    | ||||||| |||||    
T  36143484 cgctagaggtagagg 36143498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 409
Target Start/End: Original strand, 40813328 - 40813589
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  40813328 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 40813427  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | | ||| ||||||  |||| ||    
T  40813428 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttg 40813527  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    || | |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40813528 gtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 40813589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18737311 - 18737156
Alignment:
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||   | |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18737311 gatagtcagattgctagaggcagaggtagacc-taaaaaactataagagaaactatttagaaaaatcattagattaatgagttggattaaaatatggttt 18737213  T
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  18737212 atgatcgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcggccccaattagtgggata 18737156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24399965 - 24399805
Alignment:
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || ||    ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  24399965 aggatagtcaaattactagaggcagagcaaaacttagaaaaattataagagaaactattaagaaggatctcgagattaatgagttggattgaaatatggt 24399866  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||||  || |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  24399865 ttatgatagaatattatgatgtcatttgttctatgtagccaaccacacttagtggaataag 24399805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38178477 - 38178298
Alignment:
Q  209 aagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactact 308  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||| |    
T  38178477 aagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatt 38178378  T
Q  309 aagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||| | ||||| | ||| ||| ||| | || | |||||||||||    
T  38178377 aacaaagacctagacattaatgagttggatagagatatgatatatgacaaaaccttagggcattatctgatccatgtagc 38178298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39953622 - 39953280
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   ||||  ||||||||| |  | |||||||||| | |||||     |||||||||| |  ||    
T  39953622 gatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttggg-----atagcacctatatgag 39953528  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||   ||| | | | ||  ||||||||||||||| |||||||  |||  | ||||||    
T  39953527 aaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcagat 39953428  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||||||| || || ||||     ||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| || ||   ||| ||||||| |||| | |||    
T  39953427 cactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggaca 39953328  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39953327 ctatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 39953280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42854279 - 42854020
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| || ||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||    
T  42854279 cacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgga 42854180  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    ||| |||||| | |  ||||| ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||||||    
T  42854179 ggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtt 42854080  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42854079 tttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataag 42854020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 401
Target Start/End: Original strand, 16705701 - 16706004
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||     ||| |||| ||||||||||||| |    
T  16705701 ttggttgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttggagtagcat-----ctatagtaaaaaagatggtggaga 16705793  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcat--gtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcaga 275  Q
     |||| ||| || ||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||               |||| | ||||||||||||||| || |    
T  16705794 ctaggcttaagtagtttgggcatatgtagagagaagacctgtatattttgtagtaagg---------------gagggtggtcagatcactagagacaaa 16705878  T
Q  276 ggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat-gatagaacattatggcgtaat 374  Q
    |||||||   |||| | | |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||     
T  16705879 ggaagacctaaaaatattgtaagagaaactattaagaaaaagctagagattaatgagttggatcgaaatatggtatatggatggaacattatggcgtaa- 16705977  T
Q  375 ttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    || || ||||||||| |||||||||||    
T  16705978 ttgattcatgtagccaaccccacttag 16706004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 279
Target Start/End: Original strand, 9695595 - 9695766
Alignment:
Q  104 gataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgt 202  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||     |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  9695595 gatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagca-----cctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgt 9695689  T
Q  203 agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagga-tagtcagatcactagaggcagaggaa 279  Q
    ||||| ||| | ||||| ||  | ||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9695690 agagagaagtcctgtagattctgaagtaaagagagtagatgagata-aggagtagtcaaatcactagaggcagaggaa 9695766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36395308 - 36395116
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  36395308 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 36395214  T
Q  163 aaaagatggtggaaaatagg-tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||    
T  36395213 aaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtca 36395116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45041444 - 45041332
Alignment:
Q  297 agagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccca 396  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45041444 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccca 45041346  T
Q  397 cttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||    
T  45041345 cttagtgggataag 45041332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 409
Target Start/End: Original strand, 11733710 - 11734011
Alignment:
Q  103 agataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||     ||| ||||||   ||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||  | ||    
T  11733710 agataggattagaaatgacaacattagagaaagagttggg-----ataacacctatgatagaatagatggtggaaactagagttaagtggtttgatcttg 11733804  T
Q  202 tagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagaga 301  Q
    | |||| ||||  ||||| | | ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| || |||  |||    ||| |||  ||||||    
T  11733805 ttgagagaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatcacgtggaggatagtcagatcactagagacaaaggtggacctagaaatactacaagaga 11733904  T
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    |||||  |||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||| | |||||||| |    
T  11733905 aactataaagaaaaatctagagattaatgagttagatagaaatatggtatgtgatagagcattatggcgtcgtttgaaccat-tagctgcccccacttgg 11734003  T
Q  402 tgggataa 409  Q
    ||||||||    
T  11734004 tgggataa 11734011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 410
Target Start/End: Original strand, 42584526 - 42584624
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42584526 gaaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataag 42584624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17491793 - 17491688
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  | || |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17491793 aaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatgttgatccatgta 17491694  T
Q  387 gccgac 392  Q
    ||||||    
T  17491693 gccgac 17491688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 404
Target Start/End: Original strand, 21425213 - 21425306
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21425213 gaaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtgg 21425306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 400
Target Start/End: Original strand, 23023368 - 23023481
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||| | |||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||    
T  23023368 aaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttggataggaacatgatatatgatagaatattatgacgtcgtttgatccatgta 23023467  T
Q  387 gccgaccccactta 400  Q
     |||||||||||||    
T  23023468 accgaccccactta 23023481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33828115 - 33827811
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  |||||||| | |||| ||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||      ||| ||||     
T  33828115 gatgaggatgttgtgttggatgtctagtaaaactagataagataagactagaaatgacaacattatagagatagttggggtaacaa-----ctatagtat 33828021  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
     ||| || |||||||| | | ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||| |||| ||||| ||||   ||||    
T  33828020 taaatattgtggaaaacatgcttaggtgatttgagcatatagagataagacgtgtagatttcatagtaagatgagtagatcaaatagaagataaaaagat 33827921  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     || ||||| |  |||||||    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33827920 tacaagaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaaca 33827821  T
Q  363 ttatggcgta 372  Q
     |||| ||||    
T  33827820 atatgacgta 33827811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928603
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 1928603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 2796561 - 2796819
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| |  | | ||||| ||||||||||| ||    
T  2796561 tagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga---gac-tgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaat 2796656  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||| | ||| | | |||| ||    
T  2796657 ggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttg 2796756  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2796757 gtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataag 2796819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 14459046 - 14459162
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-cc 393  Q
    |||||||||||| || ||||||| | || |||||||| || ||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  14459046 taagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccc 14459145  T
Q  394 ccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||||||    
T  14459146 ccactttgtgggataag 14459162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 282
Target Start/End: Original strand, 7046349 - 7046471
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  7046349 gtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggtttgggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatcag-tggaggatagtc 7046447  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    | |||||||| |||| ||||||||    
T  7046448 aaatcactagcggcaaaggaagac 7046471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 44529408 - 44529491
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44529408 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 44529491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Original strand, 3473750 - 3473836
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||  | ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3473750 attaatgagttggaccggaatttggtttatgattgaatattatggcgaaatttaatccatttagccgaccccacttagtgggataag 3473836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15853823 - 15853642
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaa 178  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |   |||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  15853823 ttggatgtgtgataagaagatatgagataagattagaaatgaaaaattagagatagagttggggtgggc-agcacctatagtagaaaagatcgtgaaaaa 15853725  T
Q  179 taggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    | |||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||    ||||||  |||||||||||||    
T  15853724 tgggtttaggtggttttggtgtgtagagagaagaaatgtagattttatagtaatgagaaatgatcagactgaggatagtcaga 15853642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 409
Target Start/End: Original strand, 36069753 - 36069867
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||| ||||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||    
T  36069753 taagggaaactattaacaaatatttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacc 36069852  T
Q  395 cacttagtgggataa 409  Q
    |||||| ||| ||||    
T  36069853 cacttactggaataa 36069867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690000
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 30690000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 21121344 - 21121407
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21121344 aatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtggga 21121407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 350 - 409
Target Start/End: Original strand, 1313770 - 1313829
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1313770 ttatgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataa 1313829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8879811 - 8879653
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||      |    
T  8879811 taagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatggggg-----aa 8879717  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  8879716 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagac 8879653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 350 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27556378 - 27556323
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556378 ttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 27556323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41444604 - 41444356
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||      |||||| | ||| ||||| | ||||||             
T  41444604 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga------acatgtggattttgtagttaagagagt--------- 41444520  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac--aataaaaaactttaagagaaactactaagaaa-gatctagatattaatgacttggattgaaat 344  Q
     | |  | ||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||  || |||  ||||    
T  41444519 -gggtgtggtcaggtcactagaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaat 41444421  T
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||| | |||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  41444420 atggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaataa 41444356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42469826 - 42469743
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42469826 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataag 42469743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44047631 - 44047548
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44047631 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 44047548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 394
Target Start/End: Original strand, 24558558 - 24558733
Alignment:
Q  215 tgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaa 314  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||    | | ||||||||||    ||||||  ||||||||| || |||||||    
T  24558558 tgtagattttgtagtaagaatagtagatcagatggaggatagtcaaatca----aagtagaggaagaccgagaaaaacaataagagaaattattaagaaa 24558653  T
Q  315 gatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| |||   |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24558654 gatttagagattaatgagctggactgagtcatggttaacgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 24558733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39760782 - 39760572
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| | | ||||| |||||     ||||  ||||    
T  39760782 gatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagca-----cctatcgtag 39760688  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||||  ||||||| |    ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| || |||| ||||||||||| |||| || |||| |||||| ||    
T  39760687 aaaagaatgtggaaact----ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagatcatatggagggtagtcaaat 39760592  T
Q  263 cactagaggcagaggaagac 282  Q
    | ||||||| ||||||||||    
T  39760591 cgctagaggtagaggaagac 39760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7531845 - 7531660
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |  || ||||    ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||| |    
T  7531845 gtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagaga 7531746  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | ||||| |||||   | | ||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  7531745 taaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataag 7531660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14742155 - 14742098
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742155 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 14742098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25473488 - 25473419
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25473488 aaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 25473419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 264
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645157
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||  |    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagacctatagattttgtagtaaggacagtagatcagatgaa 29645143  T
Q  251 ggatagtcagatca 264  Q
    | ||| ||||||||    
T  29645144 gaatactcagatca 29645157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 409
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276950
Alignment:
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataa 32276950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 350 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35647006 - 35646953
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35647006 ttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtg 35646953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 405
Target Start/End: Original strand, 14903758 - 14903822
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  14903758 aaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggg 14903822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 407
Target Start/End: Original strand, 16715313 - 16715536
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| | |  |||||| |||||||| ||||||||||| |     
T  16715313 ttaggtggtttgggtacctagagagaagacatgtaggttctttagtaagtagagtagatcagatggggagtagtcaaatcactagtggcagaggaaggc- 16715411  T
Q  284 ataaaaaactt-taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
     || |||  || |||||||||| |  ||||| |||| ||| |||||||  || ||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||   ||| |||||    
T  16715412 ctagaaagtttataagagaaaccatcaagaaggatcaagagattaatgggtttgatagggatatgatatatgatagaacattatggcggtgtttgatcca 16715511  T
Q  383 tgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
     |||||||||||  |||||||||||    
T  16715512 cgtagccgaccctgcttagtgggat 16715536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 365
Target Start/End: Original strand, 33511285 - 33511576
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||    |||||||| ||     ||||  |||||    
T  33511285 atgaggatgttgcgcttgatgtgtggtaagactatatgagatatgattagaaatgaaaatattagagag----ttggggtaaca-----cctatggtaga 33511375  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    ||| ||| || |||||||  |||||||||||| | ||  ||||| ||||| | ||| ||  ||||| | ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  33511376 aaaaatgatgaaaaatagacttaggtggtttgagtatacagagagaagacctatagattctgtagttaagagagtagatca-attggagatagtcagatc 33511474  T
Q  264 actagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacat 363  Q
    || |||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||| || |||| |  |  | ||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  33511475 accagaggcagagcaagatctaaaaaaactataagagaaactattaggaaatacttgaagattaatgacttggaccaaaatatggttcatgatataacat 33511574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8255618 - 8255548
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc--gaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  8255618 aaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataa 8255548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741898
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataag 18741898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746862
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataag 18746862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6510796 - 6510726
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgggatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6510796 taagtgtagcgggatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgaca 6510726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Original strand, 31715995 - 31716088
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc--cgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  | |||||||||||||||||    
T  31715995 tagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataag 31716088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41031506 - 41031436
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41031506 gaaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataag 41031436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41031612 - 41031542
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41031612 gaaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataag 41031542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212125
Alignment:
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca--tgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtggga 41212125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 406
Target Start/End: Original strand, 44699662 - 44699728
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44699662 gaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtggga 44699728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 12611539 - 12611596
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||    
T  12611539 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgcgtatgtaga 12611596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 35323970 - 35324039
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35323970 aaatatggtatataataaaatattatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataag 35324039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 402
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143599
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagt 36143599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18474298 - 18474171
Alignment:
Q  80 tggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaa 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||          |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  18474298 tggatgtgtggtaaggctagatgtgatagaaatagaaatgacaatattagagagt---------tagagtagcacctatagtagaaatgatggtggaaac 18474208  T
Q  179 taggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacat 215  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18474207 taggcttagttggtttgagcatgtagagagaagacat 18474171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 28300470 - 28300411
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28300470 gatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagatgagataagattagaaatgacaa 28300411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35320472 - 35320417
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35320472 gatagaacattatggcttaatttaattaatgtagctgaccccacttagtgggataa 35320417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 386
Target Start/End: Original strand, 37826345 - 37826529
Alignment:
Q  198 catgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaa 297  Q
    ||||| |||| |||| || ||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||    | ||||| |||    
T  37826345 catgttgagagaagatatatagattttgaagtaaggaaagtagatcagatgaagagtagtcaaatcactagaggcagagggagacctagataaactataa 37826444  T
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||||| |    |||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| | |||| |||||||||    
T  37826445 gagaaactatt----aagatctagagattagcgagttggatagaaatatggtatatgatagagtattatggcatcatttgatccatgta 37826529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 43733350 - 43733472
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    |||||||  |||||||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||||  |||| || |||  ||||||||| ||||||||  ||| || ||||||    
T  43733350 aaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaacactatggcgtcgtttcattcatgta 43733448  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  43733449 gccgatcccacttagtgggataag 43733472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 403
Target Start/End: Original strand, 8932884 - 8932962
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8932884 ttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtg 8932962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 12611644 - 12611763
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    |||||| || ||||| |||| | |||||||| | |||| |||||| |||||| ||  ||| |||||||||    
T  12611644 aaaaactataagagaaactagtaaga----tctagagataaatgagttgggtagaaatatgatatatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgta 12611739  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  12611740 gccgatcccaattagtgggataag 12611763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15215526 - 15215428
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||| || ||||| || |||  ||||||||||| | |||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15215526 aaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 15215428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Original strand, 39388935 - 39389051
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg---gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |    | | || ||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||| ||    
T  39388935 aagagaaactattaggaaagatctagagattaatgagttggatagaaataagaaactatttggtagaagattatggcgtcgtttgatccatgtggccaac 39389034  T
Q  393 cccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||    
T  39389035 cccacttagtgggataa 39389051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 235
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79134
Alignment:
Q  88 tggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaata---ggt 183  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||| ||     |||| |||||||| |||||| |||| ||   ||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaaca-----cctacagtagaaatgatggtagaaattactaggc 79082  T
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggag 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  79083 ttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtagattttgtagtaaggag 79134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904940
Alignment:
Q  175 aaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcag 274  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | | |||||||  | | || ||||     |||| ||||| ||||  ||||| ||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaa-aaaaatagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  275 aggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    | ||||||    |||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatgg 9904940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 10108964 - 10109037
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10108964 taagagaaactaataagaaagatctagagattaacgagtttgatagagatatgttatatgatagaacattatgg 10109037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Original strand, 16252860 - 16252929
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16252860 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgagataaaattagaaatgacaacattagagaga 16252929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 26363684 - 26363752
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26363684 aaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28238964 - 28238915
Alignment:
Q  233 gagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28238964 gagagtatatcagataaaggatagtcagatcacaagaggcagaggaagac 28238915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3079850 - 3079637
Alignment:
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | | | ||| ||  |||||| |||| |||||||  |||  ||| | ||||||||||| | |||    
T  3079850 ataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctat-gattttgtgataaggaaagtagatcagatgaaggggagtgaaatcactagaggtaaagg 3079752  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||| ||||||  | ||||||| | |||||| ||||||||  ||  |||     
T  3079751 aagacc-tagataactataagagaaactattaagaaagatctggggattgatgagttggatacacatatggtatttgatag-acattatgaagtggtttg 3079654  T
Q  378 atccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||||||||    
T  3079653 atccatgtagccgaccc 3079637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16994712 - 16994468
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||| ||||||| ||||||| | || ||| || |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||  || | ||  ||| |  |    
T  16994712 agtaaaaaagatagtggaaactcggcttaagttgtttgacaatgtagagagaagacatgtagattccgtagtaaggcgagttgataatatgaagggttct 16994613  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    |  |||||| |||| ||||||||||    ||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||| | ||| |||    
T  16994612 cgaatcactggaggaagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttggattgagatatgatgtataata 16994513  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| |||||  ||  |||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  16994512 gaacgttatgatgttgtttggtacatgtagccgaacccacttagt 16994468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3638443 - 3638351
Alignment:
Q  316 atctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||  ||  |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3638443 atctagagattaatgagttggacagaaatatagtatatgatagaacattatg--gttgtttgttccatggagctgaccccacttagtgggataag 3638351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10824291 - 10824220
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10824291 attaatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgacccc 10824220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12966432 - 12966346
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgat--agaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  12966432 taagaaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccgac 12966346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985656
Alignment:
Q  81 ggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaat 179  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||     |||| ||||||||||||||| |||| |    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagag--ttggggtagca-----cctatagtagaaaagatggtagaaact 25985554  T
Q  180 aggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaa 279  Q
    ||  ||  ||| ||| ||||||| |||| |||||||||   ||| | |||||||||| || |||||||  |||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25985555 agacttgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaa 25985653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 410
Target Start/End: Original strand, 3802025 - 3802139
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    |||||| |||| || ||||||| || |  ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||    
T  3802025 aagagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacactatggagtaatttgattaatgtagtcgaaccc 3802124  T
Q  396 acttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||||    
T  3802125 atttagtgggataag 3802139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 367
Target Start/End: Original strand, 4011204 - 4011306
Alignment:
Q  265 ctagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatt 364  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||  | || |||  || |||||||||||    
T  4011204 ctagagacagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggataaagatgtggaatacgatagaacatt 4011303  T
Q  365 atg 367  Q
    |||    
T  4011304 atg 4011306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 410
Target Start/End: Original strand, 33076292 - 33076390
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| |   ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  33076292 aaagatttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtagttatccccacttagtgggataag 33076390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5127379 - 5127318
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  5127379 tttatgatagaacattacggcgtaatttgacccatgtaactaaccccacttggtgggataag 5127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 190
Target Start/End: Original strand, 7103201 - 7103316
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggta---gcatagcacctaaagtagaaaagatggtgg 174  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | |  |||||   |  ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7103201 ttggatgtgctgtaaaactagatgagataggattataaatgacaacattagagatagagtcagggtagacggttagcacctatagtagaaaagatggtag 7103300  T
Q  175 aaaataggtttaggtg 190  Q
    ||| |||| |||||||    
T  7103301 aaactaggcttaggtg 7103316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8879529 - 8879463
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  8879529 aaatatggtttatgatataacact--gacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataa 8879463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 147
Target Start/End: Original strand, 16351321 - 16351398
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca 147  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  16351321 atgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagca 16351398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 404
Target Start/End: Original strand, 25300282 - 25300359
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  25300282 aatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccacctagtgg 25300359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Original strand, 27480151 - 27480204
Alignment:
Q  334 tggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  27480151 tggatcgaaatgtggtttatgatagaacattatggtgtagtttgatccatgtag 27480204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30113465 - 30113416
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  30113465 agtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812836
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggga 30812836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 32276839 - 32276880
Alignment:
Q  328 atgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32276839 atgagttggattcaaatatggtttatgatagaacattatggc 32276880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 409
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702219
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataa 39702219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45512508 - 45512463
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45512508 attatggcataatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggat 45512463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 410
Target Start/End: Original strand, 3645232 - 3645352
Alignment:
Q  290 aactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| | |||| || ||||| | | |||||||| ||||||| ||   || ||||||||||||    
T  3645232 aactataagagaaactgttaagaaagacctagagattaatgagtaggatggagatatgatatgtgatagaatattatggtgtccattgatccatgtagcc 3645331  T
Q  390 gaccccacttagtgggataag 410  Q
    || || ||||| || ||||||    
T  3645332 gatcctacttaatgagataag 3645352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 206
Target Start/End: Original strand, 6483271 - 6483319
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagag 206  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  6483271 agtagaaaagagggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagag 6483319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14742902 - 14742854
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14742902 attatgacgtagtttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 14742854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35085185 - 35085153
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085185 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 35085153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36394996 - 36394964
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36394996 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 36394964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43350830 - 43350747
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |   || ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  43350830 attaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaactt---ggtgtaatttgatccaagtagccgaccccgctaagtgggataag 43350747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 379 - 410
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1064986
Alignment:
Q  379 tccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataag 1064986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17491889 - 17491810
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagag 237  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||  ||| |||||||||||||    
T  17491889 agtagaaaatatggtggacaataaacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctatacattttgtagtaaggagag 17491810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473988
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | |  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataag 18473988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 331 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23996830 - 23996751
Alignment:
Q  331 acttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  23996830 actttgatagaaatatggtacatgatataacattacggcgtaatttgatccatttaactgacctcccttagtgggataag 23996751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32569785 - 32569726
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32569785 tatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataag 32569726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 36069582 - 36069637
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36069582 ttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagaga 36069637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 37077676 - 37077747
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37077676 taagtgtggcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgaca 37077747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Original strand, 38667478 - 38667537
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38667478 gatgggaatgttgtgttggacgtgtggtaaaagtagatgagataggattagtaatgacaa 38667537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39651091 - 39651044
Alignment:
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39651091 ttatggtgtaatttgatccatatacccgaccccacttagtgggataag 39651044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 116
Target Start/End: Original strand, 43732492 - 43732543
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaa 116  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43732492 atgaggatgttacgttggatgtgtggtaagactagatgtgatagaattagaa 43732543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 408
Target Start/End: Original strand, 1335552 - 1335590
Alignment:
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1335552 gtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggata 1335590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1549644 - 1549590
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  1549644 gtagaaaagatgggggaaactaggcttaggtagtttgagcatgtagagagaagac 1549590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 2027727 - 2027796
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2027727 aaatatggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataag 2027796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 393
Target Start/End: Original strand, 6878192 - 6878246
Alignment:
Q  339 tgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  6878192 tgaaatatggtttataatataatattatggtctaatttaattcatgtagccgacc 6878246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30456569 - 30456500
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac-aaattagagaga 133  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  30456569 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacca-atgggatagaattagaaatgacgacattagagaga 30456500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2776507 - 2776442
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2776507 tagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33666855 - 33666773
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtgg-taagactagatgagataggattagaaatgacaaattagagagaaaattggggtagca 147  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| | |||||||||||    
T  33666855 gatgagaatattttattggatgtgtgggtaaggctagatgagataggattaagaatgac--ataagagagagagttggggtagca 33666773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37808268 - 37808215
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37808268 atagagcattatggtgtagtttgattcatgtagccgaccccatttagtgggata 37808215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38901956 - 38901835
Alignment:
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||| |||| ||||||| || |||  ||||||| |||||||| |||||   | | ||||||| ||||| |||| |||||||  |||| || ||||||||    
T  38901956 aaactataagggaaactattaggaagaatctagagattaatgatttggagaaagacatggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagc 38901857  T
Q  389 cgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||  ||||||||||||    
T  38901856 ggaccccatatagtgggataag 38901835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42493581 - 42493536
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgg 196  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  42493581 cacctatagtagaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6510706 - 6510642
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataaga 212  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6510706 tagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaaga 6510642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668513
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataag 10668513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16971955 - 16971827
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||| |||| | ||||||||| |||  |||| ||    ||||||| |||||||||| | |||||| ||| || | |    
T  16971955 gtagtaaggagagtatattagatgaagggtagtgaaatcactagatgcacgggaaaacttagaaaaactataagagaaacgattaagaaggatataaaga 16971856  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16971855 ttaatgagttggactgaaatatagtttat 16971827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Original strand, 26055655 - 26055687
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26055655 atccatgtagccgatcccacttagtgggataag 26055687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28300368 - 28300280
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||  | | |||||| ||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28300368 gtggaaaatatgtctaggtggttttgacatgttgagagtaaagatgtagattctgtagtaagaagagtatatcaaatagaggatagtca 28300280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Original strand, 37077768 - 37077816
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  37077768 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagaga 37077816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 409
Target Start/End: Original strand, 37077974 - 37078014
Alignment:
Q  369 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  37077974 cgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataa 37078014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41035125 - 41035089
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41035125 tgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagcc 41035089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Original strand, 42584411 - 42584491
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| | | |||||| | |||||| |||||||  ||| | |||||||||    
T  42584411 ttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatca 42584491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44681434 - 44681398
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44681434 gatgaggatgttgtattggatgtgtggtaagactaga 44681398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 155)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 410
Target Start/End: Original strand, 38434866 - 38435218
Alignment:
Q  56 tgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcac 153  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     |    
T  38434866 tgtagcggagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagca-----c 38434960  T
Q  154 ctaaagtagaaaagatggtggaaaatagg-tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagg 252  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |    |||||||||||||| |||| || ||||    
T  38434961 ctatagtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggagg 38435060  T
Q  253 atagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttta 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  38435061 atagtcagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggttta 38435160  T
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38435161 tgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataag 38435218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 66 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9556724 - 9556388
Alignment:
Q  66 tgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaa 164  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||     | || |||||||    
T  9556724 tgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaaca-----cttatagtagaa 9556630  T
Q  165 aagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |  |    
T  9556629 aa-atggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaacta 9556531  T
Q  265 ctagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatt 364  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  9556530 ctagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacatt 9556431  T
Q  365 atggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    | || ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9556430 agggtgtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggat 9556388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 18958911 - 18959177
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgg----gcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatc 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||| |||    
T  18958911 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtagatc 18959010  T
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||  | ||||||  | || |||||||| ||||||  |||    
T  18959011 agatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatcaaaa 18959110  T
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18959111 tatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 18959177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 12141548 - 12141810
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||    
T  12141548 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatcagat 12141647  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||||||||| || || ||||| ||||||||||    |||| || || ||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12141648 tgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaatatg 12141747  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  12141748 gtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaag 12141810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 410
Target Start/End: Original strand, 33504312 - 33504490
Alignment:
Q  233 gagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatt-aatga 331  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  33504312 gagagtagatcagatggagggtagtcagatcactagaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataa 33504411  T
Q  332 cttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33504412 gttggattgaaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataag 33504490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 43752290 - 43751971
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||     |||| |||||||||| |||| ||||    
T  43752290 ttggatgtgcggtaaaaccagatgggataagattagaactgaccatattagagagagagttggggtagca-----cctatagtagaaaaggtggtagaaa 43752196  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||| ||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  43752195 ataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcatagg 43752096  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||    ||||||| | |||||||||| || ||||||| | || |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||     
T  43752095 aagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttg 43751996  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  43751995 atccatgtggccgacctcacttagt 43751971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 156 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26784615 - 26784356
Alignment:
Q  156 aaagtagaaaagatggtggaa-----aataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||||||||||||||||||     | |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||| |||| | ||| ||||||||||| ||| || |||| ||    
T  26784615 aaagtagaaaagatggtggaatggaaactaggcttaggttgtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatgga 26784516  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||     
T  26784515 gggtagtcaaatcactagaggcagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggta 26784416  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||    
T  26784415 tatgataaaacattttggtttaatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggataag 26784356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 6218971 - 6219231
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||  |||||||||||||   |||| ||    
T  6218971 tagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatcaaat 6219070  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||  || ||| || ||| | |||| | || ||||||| |||| |||| ||| |||||  ||||||||    
T  6219071 ggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttagaaa-ctataatataaac-attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatg 6219168  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  6219169 gtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataag 6219231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37470356 - 37470149
Alignment:
Q  203 agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaa 302  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  37470356 agagagaagacttgtagattatgtattaaggagagtagattagatggaaggtagtcagatcactagtggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaa 37470257  T
Q  303 actactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  37470256 actattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggtgtagtttgatccatgtagctaatcccacttagt 37470157  T
Q  403 gggataag 410  Q
    ||||||||    
T  37470156 gggataag 37470149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19235185 - 19235000
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  19235185 gtagtaaagagagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaagatctagaga 19235086  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| || |||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19235085 ttaatgatttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataag 19235000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44437994 - 44437737
Alignment:
Q  153 cctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagg 252  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  ||| |||||||  || || |||| ||||    
T  44437994 cctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggagg 44437895  T
Q  253 atagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttta 352  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||    ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||   ||| |||||||     
T  44437894 ggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttt 44437795  T
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44437794 tgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 44437737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 38429795 - 38430150
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||| ||||      
T  38429795 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagca-- 38429892  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||  |||  |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  38429893 ---cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgg 38429989  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||| | |  ||| | ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||    
T  38429990 aggagagtcaggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 38430089  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38430090 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataag 38430150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 402
Target Start/End: Original strand, 3481161 - 3481412
Alignment:
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat- 262  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  3481161 aaagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatcagatggaggatagtcagatg 3481260  T
Q  263 -----------cactagaggcagaggaagaca-ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
               ||||||||| ||||||||||  | ||||||   | |||||||||| || ||||||| | || |||||  | |||||  ||||||||||     
T  3481261 gacagtcagatcactagaggaagaggaagacctagaaaaaaaaatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaacaagttggacagaaatatggtc 3481360  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3481361 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagt 3481412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481633
Alignment:
Q  109 gattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||       |||| |||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtt-----cctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagaga 37481836  T
Q  208 taagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactac 307  Q
     ||||| |||   ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||| | ||||||||||     
T  37481835 gaagacttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactat 37481736  T
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||||  ||||||||| | |||||||| ||||||| ||  ||| || ||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  37481735 taagaaagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccacgtagtcggat 37481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Original strand, 9496017 - 9496128
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9496017 taagagaaactattcagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccc 9496116  T
Q  395 cacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||    
T  9496117 cacttagtggga 9496128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 11412725 - 11412976
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||| ||  ||||||  ||||||| |||||||    
T  11412725 tagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtagattctgtagta--gagagtagatcagat 11412822  T
Q  248 aga-ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatat 346  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||         |||| ||   ||| |||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||    
T  11412823 ggaggggtagtcagatcactagagccagagg---------aaaacct---agaaaaactattaggaaagat-tagagattaatgagttggatccaaatat 11412909  T
Q  347 ggtttatga---tagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11412910 ggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataag 11412976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19337020 - 19336910
Alignment:
Q  299 agaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  19337020 agaaactataaagaaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccact 19336921  T
Q  399 tagtgggataa 409  Q
    || ||||||||    
T  19336920 tattgggataa 19336910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 406
Target Start/End: Original strand, 45436902 - 45437104
Alignment:
Q  204 gagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaa 303  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||||||     
T  45436902 gagagaagacatgtagattttgtattaaggagagtagatcagtttgaggataatcagatcactagaggcagaggaagacctataaaaattataagagaat 45437001  T
Q  304 ctactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    |||  | ||||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  45437002 ctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattacggtgtaatttgatctatgtagccaacctcactcagtg 45437101  T
Q  404 gga 406  Q
    |||    
T  45437102 gga 45437104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240779
Alignment:
Q  104 gataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |  |    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagca-agtatgt----tagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgt 13240969  T
Q  203 agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaa 302  Q
    ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||| |||      | ||||| ||| |||||||||||||||||||||         ||   ||| ||    
T  13240968 agagagaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatc------atgatagccaggtcactagaggcagaggaagac---------ct---agaaaa 13240887  T
Q  303 actactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||  ||||||    
T  13240886 actattaagaaagatctagagattaacgagttgaatcgaaatttggtttatgataaaccattatgccgttgtttgatccgtgtcgccgacccagcttagt 13240787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 8180691 - 8181046
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  8180691 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 8180785  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  8180786 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 8180885  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  || || |||||||||||    |||||| | ||| |||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  8180886 aggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 8180985  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180986 gtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 8181046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 25834685 - 25834944
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  25834685 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaat 25834784  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||||  || || | |  ||||| ||||||||||     |||||||||| |||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||    
T  25834785 ggagga--gttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactttaa-agaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 25834881  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25834882 gtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 25834944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Original strand, 33287564 - 33287683
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||    
T  33287564 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacatagtttgatccttgta 33287663  T
Q  387 gccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  33287664 gccaactccacttagtggga 33287683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 402
Target Start/End: Original strand, 43832125 - 43832356
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagag 270  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||||||| ||||||| |||  || ||| |||| ||||     
T  43832125 gtggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagttaggagagtagatcagatggagagtaatcaaatcagtagac 43832224  T
Q  271 gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcg 370  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||    ||||| | ||| ||||||||||||| ||    
T  43832225 gcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggataaggatatgatgtattatagaacattatgacg 43832324  T
Q  371 taatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  43832325 gcatttgatccatgtagctgacccaacttagt 43832356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 2610592 - 2610854
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||| |||| ||    
T  2610592 tagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaat 2610691  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     || || |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  2610692 ggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 2610791  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2610792 gtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataag 2610854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 407
Target Start/End: Original strand, 42092450 - 42092780
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaa-ttagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||      |||| | ||||||||||    
T  42092450 atgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagag--ttggggtagcg-----cctatactagaaaagat 42092542  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||| |||| || | ||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||  |||||| |    
T  42092543 ggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaattcactata 42092642  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    |  | ||| ||||    ||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||| |||||| | |||||| |  ||| | | |||||||||  ||| ||||    
T  42092643 gagacaggtagacctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggatagtgatacgatatatgatagaggattgtggc 42092742  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  42092743 gttgtttgatccatgtagctgaccctacttagtaggat 42092780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8197671 - 8197558
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||     
T  8197671 aagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccct 8197572  T
Q  396 acttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||    
T  8197571 acttagtgggataa 8197558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8202431 - 8202318
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||     
T  8202431 aagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccct 8202332  T
Q  396 acttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||    
T  8202331 acttagtgggataa 8202318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 410
Target Start/End: Original strand, 12734641 - 12734966
Alignment:
Q  80 tggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaa 178  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    |||||     ||||||||| |||||||||  |||| |||||    
T  12734641 tggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag---tggggg----tagcacctatagtagaaaaattggtagaaaa 12734733  T
Q  179 taggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggc-agagg 277  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||| | |  |||||  |||||    
T  12734734 taggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagg 12734833  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
     ||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  12734834 gagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttg 12734933  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12734934 atccatgtagtcgaccccacttagtgggataag 12734966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12026264 - 12026029
Alignment:
Q  167 gatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcact 266  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||    
T  12026264 gatggtggaaactaggcttaggtggtttgaccatgtagagagaagacctgtagattttgtactaaggagagtagatcagatggtgggtagtcacatcact 12026165  T
Q  267 agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
     ||||| ||  |||||    | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||       ||||||| || |||||    
T  12026164 ggaggcggattaagacctagagaaactataggagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatagaaa-------tatgataaaatattat 12026072  T
Q  367 ggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
      |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12026071 aacgtcgtttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 12026029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12882176 - 12882061
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||     
T  12882176 taagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacct 12882077  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||    
T  12882076 cacttagtgggataag 12882061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9531685 - 9531616
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531685 aaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 9531616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23915830 - 23915709
Alignment:
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  23915830 aaactataagagaaactattaagaaaaatctagagattaatgaggtggacagaactatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagc 23915731  T
Q  389 cgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| | || |||||||    
T  23915730 cgaccccacatggtcggataag 23915709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 3866003 - 3866338
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||| |||||| | | |||||||||     |||| |||| ||||| |    
T  3866003 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagca-----cctatagtaaaaaagtt 3866097  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||| | |||| ||||| |||||| |||| || ||||| || || || |  |||    
T  3866098 ggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaaga 3866197  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    || ||||||| ||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| |    
T  3866198 ggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgac 3866297  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3866298 atcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 3866338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 36183362 - 36183717
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||     ||    
T  36183362 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtagggg-----ta 36183456  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||   |||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| || | || |    
T  36183457 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatgg 36183556  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| || |    
T  36183557 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgat 36183656  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36183657 gtatgatagaacactatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 36183717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 406
Target Start/End: Original strand, 26850275 - 26850497
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| | ||  ||  |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||     
T  26850275 ttaggtggttcggccatgtagagagaagacctatatattatgtagtaaggagactagatcagatggaggatagtcaaatcactaaaggcagagaaaaacc 26850374  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       |||| || ||||||||  || ||||| | || |||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  26850375 tagaaaatctataagagaagttattaagatatatttagaaatttatgagttggac-gaaatatggtttatgataaaacattatggcgtaatttgttcgat 26850473  T
Q  384 g-tagccgaccccacttagtggga 406  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  26850474 gttagccaaccccacttagtggga 26850497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43573268 - 43573146
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| ||||||| || |  ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43573268 aaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatggcgtaatttgatccatgta 43573170  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43573169 gccgaccccacttagtgggataag 43573146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3243931 - 3243669
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| ||| || |||| ||    
T  3243931 tagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaat 3243832  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||||||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  || | ||    
T  3243831 ggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttg 3243732  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3243731 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataag 3243669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 409
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855727
Alignment:
Q  267 agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  367 ggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataa 19855727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 410
Target Start/End: Original strand, 26670888 - 26671034
Alignment:
Q  264 actagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacat 363  Q
    |||||||| ||||||||||    ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||| ||    
T  26670888 actagaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatat 26670987  T
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26670988 aatggtgtaatttgatccatgtagccgacactgcttagtgggataag 26671034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Original strand, 42543275 - 42543501
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||  ||||| ||||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||     
T  42543275 ttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacc 42543374  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||   | |  || ||| |||||||||  ||||||||  ||| || |||    
T  42543375 tagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcat 42543474  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42543475 gtagccggccccacttagtgggataag 42543501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45543211 - 45543090
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||  | ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  45543211 aaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtactttgatctatgta 45543113  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45543112 gccgaccccacttagtgggataa 45543090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3720508 - 3720435
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3720508 ttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3720435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42149791 - 42149710
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42149791 taagagaaactattaagaaagatctagagattattgagctggatagaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 42149710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520078
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 12520078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3635422 - 3635339
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635422 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 3635339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 396
Target Start/End: Original strand, 21834492 - 21834806
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtgg-aa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  | ||| | ||| ||     ||||||||| ||||  ||| || |||| ||    
T  21834492 ttggatgtgtggtaagactagatgagataagattagaaattacaacattgtaaagatagttgagg-----tagcacctatagtatgaaatattgtggaaa 21834586  T
Q  177 aataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagag 276  Q
    || |||||||||||||| || |||||| | | || |||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| | ||    
T  21834587 aaaaggtttaggtggttaggacatgtaaataaaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatag 21834686  T
Q  277 gaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
     ||||     ||||||| ||||| |||||| || |||| || || | |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| | || |||    
T  21834687 aaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagattaatgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatatttt 21834786  T
Q  377 aatccatgtagccgacccca 396  Q
      ||||||||| ||||||||    
T  21834787 ggtccatgtagtcgacccca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 28508861 - 28508944
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28508861 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28508944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 39709286 - 39709219
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39709286 aaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 39709219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 276
Target Start/End: Original strand, 41858679 - 41858863
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||              ||||||||||||||||||    
T  41858679 ttggatgtgtggtaagactgtatgagacgtgattagaaatgacaacattagagagagaattggggtag--------------tagaaaagatggtggaaa 41858764  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagag 276  Q
     | || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  41858765 ctgggcttagatggtttggacatgtagagagaagacatgtaggttctctagtaaagaaagtagatcggatagaggatagtcagatcgctgaaggcagag 41858863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 409
Target Start/End: Original strand, 45077884 - 45077994
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgac--ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45077884 aaactattaagaaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccact 45077983  T
Q  399 tagtgggataa 409  Q
    ||||| |||||    
T  45077984 tagtgagataa 45077994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 354
Target Start/End: Original strand, 38860178 - 38860388
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatg-----taggtttcgtagtaaggagagtaaatc 243  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||     ||| ||  |||| |||||||||| ||     
T  38860178 agcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacctgtactatagattatgtaggaaggagagtagatg 38860277  T
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
    |||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||    |||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| || | ||    
T  38860278 agatggagggtagtcaaattactagaggcagacgaagacttggaaaaatgataagagaaactattaagaaagatctagagattcatgagttgtatcgcaa 38860377  T
Q  344 tatggtttatg 354  Q
    |||||||||||    
T  38860378 tatggtttatg 38860388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7326397 - 7326176
Alignment:
Q  189 tggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaa 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||  |||| |||||  | |  ||||| |||||||||||    |    
T  7326397 tggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacatagga 7326298  T
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  7326297 aaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 7326198  T
Q  389 cgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  7326197 caaccccacttagtgggataag 7326176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 30306229 - 30306298
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30306229 aaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 30306298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35755439 - 35755261
Alignment:
Q  236 agtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagat----attaatga 331  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |    ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||     |||||||     
T  35755439 agtacatcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgg 35755340  T
Q  332 cttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35755339 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataag 35755261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41763412 - 41763059
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||      ||    
T  41763412 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggg------ta 41763319  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
     |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| | |||| |||| || |    
T  41763318 acacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatgg 41763219  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||| | |  | ||| ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||  ||| || || |  | ||| | ||||||  ||||||| |    
T  41763218 aggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgtt 41763120  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763119 ttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 41763059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 45077672 - 45077877
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaatta-----gagagaaaattggggtagcatagcacctaaa 158  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  || ||      |||||| | || | |||||||     ||| |    
T  45077672 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaattagaaatgtgaactttagagggagagagagtttgagtagcat-----ctata 45077766  T
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggttt---aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggata 255  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||   ||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45077767 gtagaaaagatggtggagagtagacttgggaggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggata 45077866  T
Q  256 gtcagatcact 266  Q
    |||||||||||    
T  45077867 gtcagatcact 45077877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 227372 - 227455
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  227372 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 227455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7432117 - 7431906
Alignment:
Q  203 agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcag-----aggaagacaataaaaaactttaa 297  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||     ||||| ||    ||||||| |      
T  7432117 agagagaagacttgtagattccttagtaaggagaataaattagatggagagtagtcagatcactagaggcaggcaagaggaaaacctagaaaaactattg 7432018  T
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccac 397  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||| ||| ||||| ||| |||| || |||| ||||||| | |||||| |||    
T  7432017 gagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtcatttgatccatgcaaccgacctcac 7431918  T
Q  398 ttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||    
T  7431917 ttagtgggataa 7431906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863499
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataa 19863499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867831
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataa 19867831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 409
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872732
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataa 19872732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 31959704 - 31959787
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31959704 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataag 31959787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38452963 - 38452702
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| ||| || |||| ||    
T  38452963 tagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaat 38452865  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  38452864 ggaggaaagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 38452765  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||| |||| ||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452764 gtgtatgataaaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 38452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7134985 - 7134821
Alignment:
Q  243 cagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaa 342  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||| |||    
T  7134985 cagatggaggacattcagatgactagaggaagaggaatacc-taaaaaactataagagaaagtactaagaaagatctaaaaattaatgggttggatcgaa 7134887  T
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
     |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||| |  | |||||||||||    
T  7134886 gtataatttatgatagaccattataacgtaatttgctctatgtagccgatcatatttagtgggata 7134821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13443993 - 13443924
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13443993 aaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataag 13443924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197302
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaatagg-tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtt-tc---gtagtaaggagagtaaatcaga 246  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||    ||||||||||||||  |||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagattctctaactagtaaggagagtaggtcaga 14197338  T
Q  247 tagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14197337 tggagagtagtcaaatcactagaggcaaaggaagac 14197302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12475007 - 12474943
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475007 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 12474943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 259
Target Start/End: Original strand, 7825289 - 7825475
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |   | | |  ||||||||| ||| | ||| ||    
T  7825289 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagt---gttggagtagcacctatagttgtaaatat 7825385  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   |||| ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  7825386 ggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtca 7825475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37452400 - 37452285
Alignment:
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||| | |||||| | ||| |||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  37452400 gatagtcagatcacaagaggaagaggaagacctagaaaaattataagaggagctattaagaaagaattagagattaatgagttggacagaaatatggttt 37452301  T
Q  352 atgatagaacattatg 367  Q
    ||||||||||||||||    
T  37452300 atgatagaacattatg 37452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549854
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataa 42549854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 451905 - 451668
Alignment:
Q  169 tggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactag 268  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  | |  |     
T  451905 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaa 451806  T
Q  269 aggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    ||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | | ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| |||||    
T  451805 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatgg 451706  T
Q  369 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  451705 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 451668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11992193 - 11992124
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11992193 aaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataag 11992124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16097361 - 16097193
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagaga---aaattggggtagc 146  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||   | | |||||        
T  16097361 taagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggg---- 16097266  T
Q  147 atagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
     ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16097265 gtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtag 16097193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 404
Target Start/End: Original strand, 31254431 - 31254548
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||  | |||  | ||||||    
T  31254431 aaaaactgtaagttaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatgatttatgacagaacattatggcacagtttggtacatgta 31254530  T
Q  387 gccgaccccacttagtgg 404  Q
    | |||||| |||||||||    
T  31254531 gtcgacccaacttagtgg 31254548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887082
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataa 887082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Original strand, 4807805 - 4807861
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807805 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 4807861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 404
Target Start/End: Original strand, 36366816 - 36366896
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||    
T  36366816 attaatgagttggaccgaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtatccaaccccatttagtgg 36366896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41197311 - 41197243
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  41197311 aatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataag 41197243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9647963 - 9647832
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||    ||||||      || ||||| |||||    
T  9647963 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacattatagag----ttgggg-----cagtacctatagtag 9647873  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  9647872 aaatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgta 9647832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 19024329 - 19024444
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||   | | ||||||||| |||||||||  ||| ||| || ||||||||||    
T  19024329 taagagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatataaatacaatatttgatagaactttatggcgtcgtttgatctatatagccgaccc 19024428  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||||    
T  19024429 cactcagtgggataag 19024444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 406
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931694
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtggga 34931694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 35643131 - 35643214
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643131 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataag 35643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670734
Alignment:
Q  356 tagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 17670734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23714612 - 23714384
Alignment:
Q  68 agaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaa 166  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |||||| |||   |||||      |||||| || |||||||||    
T  23714612 agaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagag--ttggg------tagcacatatagtagaaaa 23714521  T
Q  167 gatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcact 266  Q
    ||||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| || | ||  ||||| ||||||    
T  23714520 gatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatcact 23714421  T
Q  267 agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaa 303  Q
    ||| | ||| ||||||    ||||||| |||||||||    
T  23714420 agacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24102284 - 24102056
Alignment:
Q  68 agaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaa 166  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| | |||||| |||   |||||      |||||| || |||||||||    
T  24102284 agaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagag--ttggg------tagcacatatagtagaaaa 24102193  T
Q  167 gatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcact 266  Q
    ||||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||| || | ||  ||||| ||||||    
T  24102192 gatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatcact 24102093  T
Q  267 agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaa 303  Q
    ||| | ||| ||||||    ||||||| |||||||||    
T  24102092 agacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 410
Target Start/End: Original strand, 32402668 - 32402766
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  32402668 aaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38328444 - 38328386
Alignment:
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38328444 atgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 38328386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 39029764 - 39029853
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca------tgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029764 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccccacttagtgggataag 39029853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45367724 - 45367642
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45367724 aatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataa 45367642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9394731 - 9394646
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  9394731 ttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataag 9394646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13592552 - 13592314
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagag 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| | |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  | ||||    
T  13592552 gtggaaaatag-tttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttcaagag 13592454  T
Q  271 gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaaga--tctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    | | ||||||||    || |||| |||||||||||| | ||||| |  | || | |||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  13592453 gtataggaagacctagaagaactataagagaaacta-tcagaaaaaagtttatagattaagaagttgaatttaaatatggtttatgatagaacaatatga 13592355  T
Q  369 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    | || || ||||| ||||| | | |||||||| ||||||||    
T  13592354 cttacttcaatccgtgtagtcaaacccacttaatgggataa 13592314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 17429251 - 17429316
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17429251 atggtatatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataag 17429316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29548835 - 29548654
Alignment:
Q  228 gtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatta 327  Q
    ||||||| |||| |||| || |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  29548835 gtaaggatagtagatcaaatggagggtagtcaaatcacgagaagcagaggaagacctgaaaaaactataagagaaattattaagaaagatttagagatta 29548736  T
Q  328 atgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||  || ||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| |||  || ||||||  ||||  |||| |||||||||    
T  29548735 atgtgtttgatagaaatgtggtataatatagaaaattatgacgtagtttggtctatgtagttgaccatacttggtgggataa 29548654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33625325 - 33625248
Alignment:
Q  299 agaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33625325 agaaactattaagaaatatctagagattaatgagttggaaagtaatatggtttatgatagaacattatgaagtaattt 33625248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Original strand, 40759023 - 40759169
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||| || | ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||    |||||| || |||||    
T  40759023 gatgaggatgtttcactagatgtggtgtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggt----tagcacttatagtag 40759118  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40759119 aaaaaatggtggaaactagagttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 40759169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 3030885 - 3030944
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3030885 ttatgatacaacattatggcataattttatccatgtag-cgaccccacttagtgggataag 3030944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9996711 - 9996651
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9996711 aaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttag 9996651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13474447 - 13474230
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||| |  || ||  ||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13474447 ttaggtggtgtgcacatgtagagagaagacctacagattctgtagtaaggagagtagaccatgtagagtatagtcagatcactagaggcaaaggaagacc 13474348  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatc-tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
       ||||||| ||           ||||||||||  |||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |    
T  13474347 tagaaaaactatat----------taagaaagataatagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgataatacattatggcataatttgatcta 13474258  T
Q  383 tgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |  || |||| |||||||||||||||||    
T  13474257 ttgagtcgactccacttagtgggataag 13474230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18424461 - 18424394
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18424461 aatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataag 18424394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21281543 - 21281479
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  21281543 tggtttacgatagaacattatggcttaatttgatccatgcagccaaccccaattagtgggataag 21281479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2515250 - 2515187
Alignment:
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2515250 ggtttattatagaatattatggcgtactttgatctatctagccgaccccacttagtgggataag 2515187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12489941 - 12489818
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||   | | ||||||| ||||| |||| | ||||||  ||| || ||||||    
T  12489941 aaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgta 12489842  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12489841 gccgaccccacttagtgggataag 12489818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384735
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataag 25384735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32365111 - 32364947
Alignment:
Q  229 taaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaaga-caataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatta 327  Q
    |||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||        ||||| | || ||||    
T  32365111 taagaagagtagatcaaatggaggatagtcagatcactagaagcagaggaagaccaagaaaaaactatcagaaaaac--------aagatttggaaatta 32365020  T
Q  328 atgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||| |||||  | | ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  32365019 atgagttggaccggactattgtgtatgatagaacattatggtgtaatttgatcaatgtagctgacctcactta 32364947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 366
Target Start/End: Original strand, 36869941 - 36870080
Alignment:
Q  227 agtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatt 326  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||     ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  36869941 agtaaggagagtaaattagatggaggatagacaattcactagaggcataggaagagctagaaaaactataagagaaactaataagaaggatttagagatt 36870040  T
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
      |||  || ||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  36870041 tctgagatgcatatgaatatggtatatgatagaacattat 36870080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
Target Start/End: Original strand, 440924 - 440982
Alignment:
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  440924 atgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgactccacttagagggataag 440982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10516831 - 10516765
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  10516831 tatgatttatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataag 10516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 14444869 - 14444935
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14444869 tatggtttatgattgaatgttatggcgtactttgatccatgtagccatccccacttagtgggataag 14444935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 402
Target Start/End: Original strand, 19224925 - 19225039
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||  | ||| | | |||||||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||    
T  19224925 aaaactatatgagaaactattacgaaagatttagatattattgaattggatacatatacgatatatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtag 19225024  T
Q  388 ccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||||||||    
T  19225025 ccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19337128 - 19337041
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagta 239  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  19337128 tagcacctatagtagtaaagatggtggaaaataagcttaggt----tgggcatgtagagagaaggcatgtagattttgtagtatggagagta 19337041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260529
Alignment:
Q  179 taggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagggtagtcaaatcactaga 43260529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 405
Target Start/End: Original strand, 32443828 - 32443897
Alignment:
Q  336 gattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    |||| |||||| |||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32443828 gattcaaatatagtttataacaaaacattatggcataatttgatccatgtagccgactccacttagtggg 32443897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 376
Target Start/End: Original strand, 37282234 - 37282323
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37282234 aaaaactataagagaaactattacgaaagatttagctattagtgagttggattcaaatgtagtttataatagaacattattacgtaattt 37282323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43238371 - 43238306
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  43238371 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 404
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650702
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagctgactccatttagtgg 36650702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45640690 - 45640622
Alignment:
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaat 329  Q
    |||||||||||||||  |||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45640690 atcactagaggcagataaagacccaaaaaagctttaagagaaactattaagaaagatctagagattaat 45640622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5759134 - 5759011
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||   | | ||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| || || |||    
T  5759134 aaaaactattagagaaactaccaagaaggatctagagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggta 5759035  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  5759034 gctgaccccacttagttggataag 5759011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9579052 - 9578756
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaa-ttagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||  |||||||||   |||||||  || |     || ||||| ||||||    
T  9579052 atgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttagagagag--ttggggtgacaca-----tatagtagtaaagat 9578960  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    | || |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| ||| |||| |||||| || | ||  | |||||| ||| |||||||    
T  9578959 gatgtaaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtaaattttgtattaagtagagtagattaaatgaatgatagt-agaccactaga 9578861  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    | ||||| |||||         || |||||||||||| || |||| || || | |||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9578860 gtcagagaaagac---------ctataagagaaactatta-gaaaaatttacaaattaatgagttggatcctaatatggtttattatagaatattatggc 9578771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 391
Target Start/End: Original strand, 13149476 - 13149579
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| | | ||  |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||    
T  13149476 aaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatag 13149575  T
Q  388 ccga 391  Q
    ||||    
T  13149576 ccga 13149579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43610742 - 43610675
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43610742 atatggtatacgatagagctttatggcgtcgtttaatccatgtagccgaccccatttggtgggataag 43610675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Original strand, 44411640 - 44411815
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    |||  |     ||||||||| |||||    
T  44411640 gatgataatattgcgtttgatgtgttgtaagactagatgagatatgattacaaatgacaacattagagag----ttgaag-----tagcacctatagtag 44411730  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
     ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||  ||| ||||| ||||| | | | ||||| ||||||| |||||||    
T  44411731 gaaagatggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagacttgtagctgttgcagtaaagagagtagatcagat 44411815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 409
Target Start/End: Original strand, 1626346 - 1626460
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||| | ||| ||||||||||    |||  ||| |||||||| ||||| ||    
T  1626346 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgtataaaaatatgatatataatagaacattgcaacgttgtttgatccatgtggccgatcc 1626445  T
Q  395 cacttagtgggataa 409  Q
     ||||||||| ||||    
T  1626446 tacttagtggtataa 1626460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12882317 - 12882267
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggca 199  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12882317 agcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca 12882267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16521061 - 16521023
Alignment:
Q  372 aatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16521061 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 16521023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 364
Target Start/End: Original strand, 18188862 - 18188972
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||    ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |  ||    
T  18188862 tagtcaaatcactagaggcaaagggagacttagaaaaattataagagaaactattcagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatgatacat 18188961  T
Q  354 gatagaacatt 364  Q
     ||||||||||    
T  18188962 aatagaacatt 18188972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 410
Target Start/End: Original strand, 24214010 - 24214052
Alignment:
Q  368 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24214010 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccaccttgtgggataag 24214052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583845
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 24583845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41779664 - 41779606
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  41779664 gatgagaatgttgcattaaatgtgtgttaagactaggcgggataggattagaaatgaca 41779606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 400
Target Start/End: Original strand, 23997785 - 23997858
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  23997785 aatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28960352 - 28960227
Alignment:
Q  286 aaaaaact-ttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatg 384  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||| |||||   | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  ||| || ||||    
T  28960352 aaaaaactattaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatg 28960253  T
Q  385 tagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  28960252 tagtcgactccatttagtgggataag 28960227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9554140 - 9554096
Alignment:
Q  356 tagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9554140 tagaacattatggtgtagtttaattcatgtagccgaccccactta 9554096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 15836090 - 15836206
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaaga-tctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| || |||||| || ||||| | | |||| | || |||||  ||  |||  |||||||||||||||    
T  15836090 taagagaaactactaagaaaaaatgtagagattaacgagttggatagagatatgatatctgattggacgttatgttgttgtttggtccatgtagccgacc 15836189  T
Q  394 ccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||    
T  15836190 ccacttagtgggataag 15836206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1830234 - 1830195
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1830234 attatggtgtaatttaatccatgtagccaaccccacttag 1830195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 2377204 - 2377314
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||     |||||| | || |||    
T  2377204 taagataaactattaaaaaagatttagagaataatgagttggatccaactatggtatatgatagaacattatagcgtaat-----ccatgtcgtcggccc 2377298  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||||||    
T  2377299 cacttagtgagataag 2377314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334174
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccacttagtgg 19334174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29968682 - 29968627
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29968682 atagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgactccacttagtgggataag 29968627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31764120 - 31764085
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31764120 aaatatggtttatgacagaacattatggcgtaattt 31764085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Original strand, 2377162 - 2377283
Alignment:
Q  242 tcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattga 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||            ||||| |||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||||||  |    
T  2377162 tcagatggaggatagtcagatcactagagacagatgaagac-----------ctaagataaactattaaaaaagatttagagaataatgagttggatcca 2377250  T
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaat 374  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2377251 actatggtatatgatagaacattatagcgtaat 2377283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Original strand, 17581602 - 17581724
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||||||| || ||||| |||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||| |||| | || ||   || |||||    
T  17581602 aaaaactataagagagactattacgaaagatttacatatttatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgta 17581701  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    | ||| |||||||||| ||||||    
T  17581702 gtcgatcccacttagtaggataa 17581724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33594509 - 33594451
Alignment:
Q  189 tggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||    
T  33594509 tggtttgagcatgtagagagaagacatgtggatttggtagtaaggagaatagatcagat 33594451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 36993735 - 36993800
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  36993735 tatggattatgatatcacattatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataag 36993800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41022568 - 41022526
Alignment:
Q  229 taaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagagg 271  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41022568 taaggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcactagagg 41022526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41779090 - 41779032
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||  |||||||||||    
T  41779090 gatgagaatgttgcgttggatgtggggtaagactagtcgggatagggctagaaatgaca 41779032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45483039 - 45483001
Alignment:
Q  372 aatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45483039 aatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 45483001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 186210 - 186149
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  186210 gtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataa 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 335787 - 335730
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  335787 tatgatagaacattacggcataatttgatccatatagcaggccccacttagtaggata 335730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Original strand, 1456246 - 1456327
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaa 241  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| | |||||||||||||  | ||| ||| | |||||| ||||||||    
T  1456246 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttggacgtgtagagataagatctctagattttgaagtaagaagagtaaa 1456327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Original strand, 7615427 - 7615535
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| |||||||| | |||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||| | || ||||  ||| |||    
T  7615427 aaactattaagaaaggtttagagatgaatgaattggatagaaa-atggtatatgataaaacattatgtcgtcatttgatccgtctatccgataccaatta 7615525  T
Q  401 gtgggataag 410  Q
    ||||||||||    
T  7615526 gtgggataag 7615535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Original strand, 8491270 - 8491366
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg--gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||  | |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||    
T  8491270 taagagaaactattaagaaagatttagaggttaacaatttggattgaaatatgatatatatgatagaacattatgacgttgtttgatacatgtagcc 8491366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 11017318 - 11017383
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  11017318 tagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagac 11017383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24583704 - 24583647
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  24583704 tgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataag 24583647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42149900 - 42149803
Alignment:
Q  172 tggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||  | | ||| ||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||    
T  42149900 tggaaactaggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaatcctatagattctgtagtaaggagagtagatcagatgcaggatagccaaatcactaga 42149803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 7615364 - 7615420
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7615364 tagtaagtagagtatatctgatggaggataatcatatcactagaggcaaaggaagac 7615420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Original strand, 17581407 - 17581451
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  17581407 ttggatgtgtggtaagactagatatgataagattaaaaatgacaa 17581451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 386
Target Start/End: Original strand, 38264439 - 38264491
Alignment:
Q  334 tggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38264439 tggatcgaaatatggtttttgaccgaacgttatggcgtaatttgatccatgta 38264491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 230)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 407
Target Start/End: Original strand, 54470131 - 54470470
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||     |||| |||||    
T  54470131 gatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagca-----cctatagtag 54470225  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||    
T  54470226 aaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaat 54470325  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  54470326 tactagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagca 54470425  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54470426 ttattgcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggat 54470470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13805507 - 13805283
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||| |||| ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  13805507 ttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaaacc 13805408  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | || | |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  13805407 tagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccat 13805308  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  13805307 gtagccaaccccacttagtgggata 13805283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31960185 - 31959830
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  31960185 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 31960091  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  31960090 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 31959991  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||||| ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  31959990 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 31959891  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959890 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 31959830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34233376 - 34233044
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagaga--gaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtgga 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  || | |||||     |||||||||| |||||||||  | | |||    
T  34233376 ttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttggg-----atagcacctatagtagaaaaagttgggga 34233282  T
Q  176 aaataggtttagg-------tggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactag 268  Q
    |||| || |||||       |||||||| |||||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  34233281 aaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatcgtcagatcactag 34233182  T
Q  269 aggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    ||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||| || |||  ||||| |||||||||||||||||| | |    
T  34233181 aggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtag 34233082  T
Q  369 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34233081 cgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtggga 34233044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42639296 - 42639036
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | | | ||  || |||||| | |||||| |||| |    
T  42639296 gcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatgg 42639197  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||  ||||| ||||||||||| ||||||| |     |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  42639196 aggggagtcaaatcactagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggt 42639097  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     | |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42639096 atttgatagaacattatggcgtcgtgtaattcatgtagccaaccccgcttagtgggataag 42639036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 374
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680970
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttg-ggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||| |||  ||      
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatga 50680845  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  50680846 aggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattatttagaaagatctagagattaatgagttggatcggaatatggt 50680945  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaat 374  Q
    ||||||||  | |||||||||||||    
T  50680946 ttatgataacatattatggcgtaat 50680970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 410
Target Start/End: Original strand, 37488135 - 37488357
Alignment:
Q  188 gtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataa 287  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||  |||| | | |||||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| | ||||||||| ||||    |    
T  37488135 gtggttcgggcatgtagatagaagaccggtagatgttgtagtagggagagtagatcagatgcatgattgtcagatcaccataggcagaggtagacctaga 37488234  T
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37488235 aaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtag 37488334  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  37488335 ccagccccacttagtgggataag 37488357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 406
Target Start/End: Original strand, 29398730 - 29399066
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||| ||||| || | | ||| |     |||    
T  29398730 taagtgtagcggagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatattagggaaagagttgcg-----ata 29398823  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||  ||||| ||||||||| | | |||||    
T  29398824 gcacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatag 29398923  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||   ||| |||||  || ||||  | | || ||||| || |||||  |||||| |||    
T  29398924 aggatagtcaaatcactagaggcagaggaagac---------ct---agaaaaact--taggaaatgttttgaaattaacgagttggaacgaaataaggt 29399009  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  29399010 ttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtggga 29399066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26037783 - 26037521
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    | |||||| ||||| ||||  |  ||| ||||| |||||| |||||||    
T  26037783 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaagaagagtagatcagat 26037684  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||| | |  ||||||||||||| ||     |||||  |||||||||||| || ||||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||    
T  26037683 ggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagttggatccaaatatg 26037584  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26037583 gtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 26037521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 371
Target Start/End: Original strand, 33709850 - 33710154
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactaga--tga---gataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaa 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||     |||| |||||||    
T  33709850 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaaca-----cctatagtagaa 33709944  T
Q  165 aagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| | ||  ||||||| ||||||  ||||||  |||| |||||||||||    
T  33709945 aagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatcagaaggagggtagtcagatca 33710044  T
Q  265 ctagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt---tatgatagaac 361  Q
    |||||| ||| ||||  |    ||||||  || ||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  33710045 ctagagacaggggaatgcttataaaaaccatacgagaaactattaagactgatctagagattaatgagttggatagaaatatggttctatttgatagaac 33710144  T
Q  362 attatggcgt 371  Q
    ||||||||||    
T  33710145 attatggcgt 33710154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 408
Target Start/End: Original strand, 47372673 - 47372915
Alignment:
Q  166 agatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcac 265  Q
    |||||||||||| |||  || | |||||| |||||||||||  |||||  || | ||| |||| ||| |||||| || |||  |||| |||||| |||||    
T  47372673 agatggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcac 47372772  T
Q  266 tagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatta 365  Q
    |||||||||||| ||||   | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  47372773 tagaggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacatta 47372872  T
Q  366 tggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||| ||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47372873 tggagtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 288 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024866
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataag 26024866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 409
Target Start/End: Original strand, 51421734 - 51421995
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| || ||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||  |||| | | ||| || | |||||| |||| ||    
T  51421734 tagcacatatagtagattagatgatagaaaataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaat 51421833  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||| | |||||||||  ||||| |||||||||     ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||| |||    
T  51421834 ggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatg 51421933  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  51421934 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccaatctcacttagtgggataa 51421995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 436140 - 436495
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  436140 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 436234  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  436235 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 436334  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||||| ||| ||  |||| ||||    
T  436335 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggt 436434  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436435 gtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 436495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Original strand, 39708447 - 39708699
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||  ||| |  ||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||    
T  39708447 agtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagt 39708546  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||     |||||| |||||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  39708547 caggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 39708646  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39708647 gaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataag 39708699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 374
Target Start/End: Original strand, 50662330 - 50662618
Alignment:
Q  81 ggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaat 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||   |||||  |      |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  50662330 ggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagagt-ttgggcaa------cacctatagtagaaaagatggtggaaagt 50662422  T
Q  180 aggtttaggtggttt-gggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagga 278  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||   | |||||||||||| |||  ||  |||||||| ||||||||| | |||||||     
T  50662423 aggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaaggatagttagatcactaaatgcagaggt 50662522  T
Q  279 agacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaat 374  Q
    || |    ||||| | ||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50662523 agtcctagaaaaattataagagaaattatttaaaaagatctagagattaatgagtttgatcgaaatatggtttatgataacacattatggcgtaat 50662618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48174451 - 48174109
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||| | | |||||| ||     |||| |||||    
T  48174451 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaaca-----cctatagtag 48174357  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  48174356 aaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 48174257  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| ||||||| ||||    
T  48174256 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaaca 48174157  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48174156 ttatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataag 48174109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Original strand, 47147454 - 47147637
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |    
T  47147454 gtagtaaggagagtaaatcagatggagagtagtcggatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagaga 47147553  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  47147554 ttaatgagttggat--agatatgatatatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgggataag 47147637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21945839 - 21945671
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||||| | | |||||||| || ||||||| | || |    
T  21945839 gtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagatttggaaa 21945740  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccca 396  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21945739 ttaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaac---atggcgtattttgatccatgtagccaacccca 21945671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Original strand, 28351640 - 28351825
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |    
T  28351640 gtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaagatttagaga 28351739  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| ||||||  |||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28351740 ttattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaag 28351825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Original strand, 10208976 - 10209300
Alignment:
Q  78 attggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||||||| |     |||| ||||||||||||||  |||    
T  10208976 attggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag----ttggggtagaa-----cctatagtagaaaagatggcagaa 10209066  T
Q  177 aataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagag 276  Q
    | ||   |||| |||||||||||||||| || ||||| |||   |||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |    
T  10209067 actaaacttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtaggg 10209166  T
Q  277 ga--agacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaat 374  Q
    |   ||||    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||   | | ||||||| ||||||||||   ||||||  |    
T  10209167 ggggagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaaca--ctggcgtcgt 10209264  T
Q  375 ttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10209265 ttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataag 10209300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 302 - 410
Target Start/End: Original strand, 25574982 - 25575090
Alignment:
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  25574982 aactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttag 25575081  T
Q  402 tgggataag 410  Q
    |||||||||    
T  25575082 tgggataag 25575090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52569858 - 52569531
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||     |||| |||||||||| |||| ||||    
T  52569858 ttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagca-----cctatagtagaaaagttggtagaaa 52569764  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  | |  ||||| |||||    
T  52569763 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 52569664  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||     |||||| | | |||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||     
T  52569663 aagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 52569564  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569563 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 52569531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 410
Target Start/End: Original strand, 53540401 - 53540556
Alignment:
Q  255 agtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||| || ||||||  | || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  53540401 agtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatg 53540500  T
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  53540501 atagaacattatggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataag 53540556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 56375214 - 56375556
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||     |||| | |||    
T  56375214 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagca-----cctataatag 56375308  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| || | || ||||| |||||  |    
T  56375309 aaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagt 56375408  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  56375409 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 56375508  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56375509 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataag 56375556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20105720 - 20105542
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggat-agtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagat 323  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||     ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  20105720 gtagtaaggggagtagatcagatgaaggattagtcagatcactagaggcagatgtagatccagaaaaactataaaagaaacgactaagaaagatctagag 20105621  T
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  20105620 attgatgagttggactgaaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagt 20105542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 35690371 - 35690537
Alignment:
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||| || |||| || ||||  ||||||| || |||  ||     
T  35690371 agatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaat 35690470  T
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35690471 cagggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 35690537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 308 - 410
Target Start/End: Original strand, 55007910 - 55008012
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55007910 taagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 55008009  T
Q  408 aag 410  Q
    |||    
T  55008010 aag 55008012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22420978 - 22420733
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||  || || ||| ||| |||| |||||| || |||| ||| ||| ||| |    
T  22420978 gaaaagatggtggaagctaggcttaggtgatttggacatgtagagagaagatctgaagattttgtaataagaagagtagataagatggagaatattcaaa 22420879  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    ||||||||||||  ||||||     ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||  |||||||| |    
T  22420878 tcactagaggcaagggaagatttagaaaaactataaga--aacta-taagaaagatctagagattaatgagttggatagagatatggtaaatgatagagc 22420782  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22420781 attatggcgttgtttgatctatgtagttgaccccacttagtgggataag 22420733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 336
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgg 336  Q
    ||  ||||| ||||||||||| || |||||||    ||||||| |||||||||||  || ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30621482 - 30621241
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttc--------gtagtaaggagagta 239  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||| |||         ||| ||||||||| |    
T  30621482 tagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagattttctgattttgtattaaggagagca 30621383  T
Q  240 aatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggatt 339  Q
     |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||      | | | || ||||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||      
T  30621382 gatcagatagaggatacccaaatcactagaggtagaggaagacct----agagtcta-gagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggacc 30621288  T
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  30621287 gaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611865
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctagagattttgtaataaggagagtaaatcagatggaggagagt 47611840  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    |||| |  |||||||||||||||||    
T  47611841 cagacccttagaggcagaggaagac 47611865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 50967227 - 50967045
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||    ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  50967227 tagtaaggagagtaaaccaaatagagggtagtcagattattagaggcggagggagaactaaaaaaactacaagagaaactattaagaaaga-ctagagat 50967129  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
     ||||| ||||| || | |||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50967128 caatgagttggaatgcagtatggtatatgaaagaaaattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataa 50967045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518342
Alignment:
Q  175 aaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcag 274  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |   |||||| | |||||| ||||||| |||   ||||| ||||  ||||| ||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  275 aggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaat 374  Q
    |||||| |    ||||||| | ||| |||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  375 ttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53518374 ttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggata 53518342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 410
Target Start/End: Original strand, 4440858 - 4441119
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||  |||| |   || ||||| |||||| |||| ||     
T  4440858 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatg 4440957  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||    
T  4440958 gaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg 4441057  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4441058 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 4441119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48622912 - 48622559
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||||||    |||||     ||    
T  48622912 taagtgtagcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag---tggggg----ta 48622820  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||  |  ||| ||||| | || | |||| || |    
T  48622819 gcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatgg 48622720  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||  | ||  |||||| ||||  | ||||| || |||  |||| ||||    
T  48622719 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggt 48622620  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622619 gtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 48622559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1777373 - 1777033
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||||||     | || |  |||||||||| ||||     
T  1777373 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga-----gtggaa--atagcacctatagtaa 1777281  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||   ||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  1777280 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 1777181  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  1777180 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 1777081  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1777080 gtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataag 1777033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 56439710 - 56439594
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| | |||||||||| || ||||||| | || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  56439710 aaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatccatata 56439611  T
Q  387 gccgaccccacttagtg 403  Q
    ||| |||||||||||||    
T  56439610 gccaaccccacttagtg 56439594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37042795 - 37042680
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  37042795 taagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccc 37042696  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||||||    
T  37042695 gacttagtgggataag 37042680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45205219 - 45204856
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||  |||| | ||||||     ||    
T  45205219 taagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttggggg----ta 45205124  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatagg--tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttc-------gtagtaaggagagtaa 240  Q
    |  |||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |         || ||| | ||||||     
T  45205123 gtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtag 45205024  T
Q  241 atcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg 340  Q
    ||||||| ||||| || |||||||  |||||  |||||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| | ||||||      
T  45205023 atcagatggaggagag-cagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatcc 45204925  T
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45204924 aaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataag 45204856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 388
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21107236
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa----at-tagagagaaaattggggtagcatagcacctaaa 158  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    || || ||||| | ||| ||||| ||     ||| |    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtat-----ctata 21107002  T
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagaca---tgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatca-gatagaggat 254  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||    ||||| ||  ||||||||||||||  |||| ||| |||| |    
T  21107003 gtagaaaggatagttgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggt 21107102  T
Q  255 agtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatg 354  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||| | |||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  21107103 agtcagatcactggatgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatg 21107202  T
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||    
T  21107203 atagaactttatggcttagtttgatctatgtagc 21107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39100813 - 39100552
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| || ||||||| || | ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||   |||| |  ||| ||||| |||||| |||||||    
T  39100813 tagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatg-cgttgtaagaagagtagatcagat 39100715  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     || ||||||||| | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| | ||  | ||||| ||||||  ||||||     
T  39100714 ggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatatt 39100615  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39100614 gtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 39100552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42293527 - 42293281
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| || | ||| ||||||||||            
T  42293527 tagcacctatagtagaaaagatgatggaaactcggcttaggtggtttgggtatgtagaaagacgacatgtagattccatagcaaggagagta-------- 42293436  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
            |||| ||||||||||||| |||| ||    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||    
T  42293435 --------gtcaaatcactagaggcaaaggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatg 42293344  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||||| ||||| |   | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42293343 gtatatgatagagcattacgatatcatttaatctatgtagccggccccacttagtggaataag 42293281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 410
Target Start/End: Original strand, 44860943 - 44861097
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  44860943 tagtcaaaacactagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagggaaactattatgaaagatctagagat--atgacttggattgaaatatggtatat 44861040  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| || |||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44861041 gatggagcattatggtgttgtttaattcttgtagccgactccacttagtggaataag 44861097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2557811 - 2557687
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatta-tggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  2557811 aaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattattggtgtaatttgatccatgt 2557712  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| || ||| |||||||||||||    
T  2557711 agccaactccatttagtgggataag 2557687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7682109 - 7681933
Alignment:
Q  227 agtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatt 326  Q
    |||||||| |||| || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||    
T  7682109 agtaaggaaagtagattagatggagggtagtcacatcactagaggcagaggaagacctggaaaaactataagagaaactatcaagaaaaatctatagatt 7682010  T
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccg-accccacttagt 402  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| || |  ||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  7682009 aatgagttagatagaaatatggtatatgataggacattattgcatcgtttgatccatgtagctgaaccccacttagt 7681933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35555925 - 35555670
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||  ||||| ||||||||| || ||||    
T  35555925 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagattagat 35555826  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||||| |||  | |||||||||| || || ||||    ||||||| |||||||||||| |||||    |||||| || ||||| |||||   | | |||    
T  35555825 agaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaaga---gtctagagataaatgagttggagaaagacatg 35555729  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||  ||| || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  35555728 gtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtggga 35555670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8599080 - 8598957
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||| || ||||||    
T  8599080 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgtttgattcatgta 8598981  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  8598980 gccgacgccacttagtgggataag 8598957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20601914 - 20601668
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| |||||| || |||| ||||| |||    
T  20601914 agtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagt 20601815  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    ||| |||  ||||| ||| ||||||  | |||| || |||||||||| | || ||||| ||  |   | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  20601814 caggtcaaaagaggtagaagaagaccttgaaaa-ctataagagaaaccatta-gaaag-tcagg---tcaatgagttggattcaaatatgatttatgata 20601721  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  20601720 gaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataag 20601668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 53707798 - 53708060
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  53707798 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaat 53707897  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||||||||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  53707898 ggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 53707997  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  53707998 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataag 53708060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 40018379 - 40018206
Alignment:
Q  236 agtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttg 335  Q
    |||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |  |||||    ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||| |||    
T  40018379 agtagatcagatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaataaagacttagaaaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagatcaatgagttg 40018280  T
Q  336 gattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||| |  ||||| | ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40018279 gatagggatatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataa 40018206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 43433829 - 43434190
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca-t 148  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| |    | || |   |    
T  43433829 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggt 43433928  T
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||     
T  43433929 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatg 43434028  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | | | || ||| ||||  | ||||| | ||||  |||| ||     
T  43434029 gaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttga 43434128  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43434129 tgtaggatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataag 43434190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 51252799 - 51252670
Alignment:
Q  82 gatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaata 180  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||     |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  51252799 gatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagag--ttggggtagca-----cctctagtagaaaagatggtggaaacta 51252707  T
Q  181 ggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgt 217  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51252706 ggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagacatgt 51252670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 410
Target Start/End: Original strand, 49987514 - 49987674
Alignment:
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||  | || || |||||  |||||  || ||||||    
T  49987514 aggatagtcaattcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggt 49987613  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||| |||||||    
T  49987614 tcatgatagagcattatggcgtaattttatccttctagttgaccccacttagttggataag 49987674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 410
Target Start/End: Original strand, 17900405 - 17900746
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac-aaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||   | ||||||     ||||||||| ||||||    
T  17900405 atgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttgggg-----tagcacctatagtaga 17900499  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    ||||| ||| |||| |||  | | |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||  ||||  ||||||||| ||||||| |||   |||||||||    
T  17900500 aaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacctgtggattatgtagataggagagtagatcagatggagaggagtcagatc 17900599  T
Q  264 actagaggcagaggaagacaata-aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    | |||||| || ||  | |  || ||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| || ||||| ||| |   | | ||||||| | ||||| ||    
T  17900600 attagaggtag-gggtgtctgtagaaaaactttaagagaaactatcaggaaagatatagagataaatgagttgtagaaagacatggtttttaatagagca 17900698  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     ||||||||  ||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17900699 ctatggcgttgtttgattcatttagctgaccccacttagtgggataag 17900746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 255
Target Start/End: Original strand, 28497494 - 28497600
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  28497494 tagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagat 28497592  T
Q  248 agaggata 255  Q
     |||||||    
T  28497593 ggaggata 28497600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31961505 - 31961282
Alignment:
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||| ||||||||  || |||| |||   ||||| ||||||||||| || || ||||        
T  31961505 ggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctag 31961406  T
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||   | | ||||||  |||||||||| |||| |||  ||| || ||||||    
T  31961405 aaaaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgta 31961306  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  31961305 gccgacctcacttagtgggataag 31961282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 410
Target Start/End: Original strand, 5306452 - 5306562
Alignment:
Q  300 gaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  5306452 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccactt 5306551  T
Q  400 agtgggataag 410  Q
     ||||||||||    
T  5306552 ggtgggataag 5306562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7092499 - 7092243
Alignment:
Q  147 atagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcaga 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |  ||||| | |||||| ||||||    
T  7092499 atagcacctatagtagaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcaga 7092400  T
Q  247 tagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatat 346  Q
    | || || ||||||| ||  |||||  |||||||||  || | || | |||| |||| || || ||||||| ||||  ||||||  || |||  ||||||    
T  7092399 tggatgagagtcagaacataagaggtggaggaagac-ctagagaaatataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatat 7092301  T
Q  347 ggtttatg--atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    | ||||||  |||||| ||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7092300 gatttatgatatagaatattatagcataaattaatccatgtaaacgaccccacttagt 7092243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7544655 - 7544547
Alignment:
Q  294 ttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||       |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7544655 ttaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatcgaaatatg-------atagaacattatagcg-aatttgatccatgtagccgacc 7544564  T
Q  394 ccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||    
T  7544563 ccacttagtgggataag 7544547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17666402 - 17666067
Alignment:
Q  62 gggatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagt 160  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||  ||||| | |||||      ||| ||||| |||    
T  17666402 gggatgtgaatgttgcatttgatgtgtggtaaaactagatgagataagattatatatgacaacattgtagagatagttggg-----ttagtacctatagt 17666308  T
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |  ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||  |||||||| |||||| || | |||||| |||||||     
T  17666307 a-taaatattgtgaaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcat 17666209  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 360  Q
    || || ||||  | | ||||||    ||||| | |||||||||||| ||  |||||| || | |||||||| || |||  |||       ||||||||||    
T  17666208 attacaagagatatatgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagttagatgaaaa-------tatgatagaa 17666116  T
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    || |||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17666115 caatatgacgtatttcgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataa 17666067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 28236187 - 28236448
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||| |||||  |||| ||    
T  28236187 tagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaat 28236286  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     | ||| | |||  | |  |  || ||||||||||     |||||| | |||||||    ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  28236287 ggcggagaatcaagttaaaat-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 28236385  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28236386 gtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 28236448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 38903986 - 38903755
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagga---tag 256  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||    |||||   |||    
T  38903986 tagaaaagatggtggaaactcggcttagttggtttgagcatgtggagagaagacttgtagattttgtagtatggagagtagatcatgcggaggagggtag 38903887  T
Q  257 tcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgat 356  Q
    ||| ||  ||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| || ||| || ||||| | |||||     
T  38903886 tcaaatggctagaggcagatgaagacc-tagaaaactataagagaaactattaagaaagacctaaagattaatgagtttgatagagatatgatatatgac 38903788  T
Q  357 agaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    | ||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  38903787 ataacattatggcatcgtttgatccatgtagcc 38903755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 402
Target Start/End: Original strand, 46372028 - 46372282
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||| ||||| || || |||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||| |||| | |||||||    
T  46372028 tagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatcagat 46372127  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||||  || |||||||||||||| || || ||||    ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||   | | |||    
T  46372128 agaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatg 46372227  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| ||||||||||   | ||||  ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  46372228 gtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagt 46372282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Original strand, 51438625 - 51438711
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  51438625 attaatgagttggaatgaaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataag 51438711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 55388329 - 55388227
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55388329 taagaaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggat 55388230  T
Q  408 aag 410  Q
    |||    
T  55388229 aag 55388227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 410
Target Start/End: Original strand, 1095634 - 1095711
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  1095634 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataag 1095711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 410
Target Start/End: Original strand, 31339552 - 31339790
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    |||||||| ||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||| |||| ||  ||  |||||    
T  31339552 gtagaaaa-atggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtc 31339650  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    | ||||||||||||||||||||||    ||||||| || |||||             ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  31339651 a-atcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaatt-----------atctagagattaatgagttggatcgaaatatggtacatgatag 31339738  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31339739 aacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataag 31339790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 934678 - 934447
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat--agagga----tagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| | ||| || |||||||||||  ||| |||||||  |||| |    ||| || | |||||||||||||||    
T  934678 ttaggtggtttgggcaagtagagaggagacctctagattgcgtagtaaggaaggtagatcagatggagagtactagtaggcaaaacactagaggcagagg 934579  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    ||||| | ||||| || | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |   |||| | ||||||||||||||||||     ||||    
T  934578 aagactagaaaaa-ctattagagaaactattaagaaagttctagagattaatgagttggatagggttatgatatatgatagaacattatggttgcgttta 934480  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  934479 ttccatgtagccgaccccacttagatggataag 934447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25967461 - 25967280
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||  | || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  25967461 tagtaaggagagtagatcagatgaaggatagttaaatcactagagacagaggaagactttgaataactataagagaaactattaaaaaagatctagagat 25967362  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||| || ||||||  | ||||  | |||||| ||  ||||| ||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25967361 taacgaattggat--agatattatatatgattgagtattatagcgcagttttacccatgtagctgaccctacttagtgggataa 25967280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31897696 - 31897444
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||| |||||||||||  |||| ||| | ||  ||||| ||||||||  || |||| ||||  |||    
T  31897696 agtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgtagttaggagagtcgattagatggaggggagt 31897597  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    |||||||||||||| || || ||||    ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||   | | ||||||  |||||    
T  31897596 cagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgata 31897497  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||| ||   ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31897496 gaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataag 31897444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 19969364 - 19969447
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19969364 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 19969447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 21528471 - 21528554
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528471 aatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtggcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 21528554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34208376 - 34208285
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  34208376 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataag 34208285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40933157 - 40932940
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| ||  | ||||| ||||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  40933157 ttaggtggtttggacatttagagaaaagacctatagattctgcagtaaagagagtagatcagatggag--tagtcaaatcaccagaggcagaggaagacc 40933060  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
     || |||||   |||| |||||| ||||   | |||||| |||||||| |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||   ||| || |||    
T  40933059 -tagaaaac---aagaaaaactattaag---ggtctagagattaatgagttggatagggatatgatatatgatagaacattatggcggcgtttgatgcat 40932967  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40932966 gtagccgaccccacttggtgggataag 40932940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 410
Target Start/End: Original strand, 18966705 - 18966871
Alignment:
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
    |||| |||||||||   ||||||||||| ||| ||||||   ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||  |||||||| |    
T  18966705 agatggaggatagttcaatcactagaggtagaagaagacctaaaacaactataagagaaactattaagaaagatctacagattagtgagctggattgaga 18966804  T
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| | ||||| | ||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18966805 tatgatatatgacaaaacattatggcgccgtttgattcatgtagccgaccccactttgtgcgataag 18966871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23906672 - 23906313
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca-t 148  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| |    | || |   |    
T  23906672 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggt 23906573  T
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| || | ||     
T  23906572 agcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatg 23906475  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| |||||  | |  | ||| | | ||||||    ||||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||    
T  23906474 gaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg 23906375  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23906374 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 23906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29209277 - 29209191
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29209277 attaatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataag 29209191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 55768779 - 55768545
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagaca-tgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcaga 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |   | ||  ||| || ||||||||| || ||  ||    
T  55768779 tagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaaaaatctttaaattttgtggtaaggagaatagattgga 55768680  T
Q  247 tagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca-ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaata 345  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  | ||| |||||||  |||||||||  || | || ||||| ||||||  || ||    
T  55768679 tggaagataatcagatcactagaggcagaagaagacatagaaaaagatataaaagaaactgttaagaaagaattaaagatcaatgagttggatcaaagta 55768580  T
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatc 380  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  55768579 tggtgtatgatagaacattatagcgcaatttaatc 55768545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 55833035 - 55832801
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagaca-tgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcaga 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |   | ||  ||| || ||||||||| || ||  ||    
T  55833035 tagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaaaaatctttaaattttgtggtaaggagaatagattgga 55832936  T
Q  247 tagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca-ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaata 345  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  | ||| |||||||  |||||||||  || | || ||||| ||||||  || ||    
T  55832935 tggaagataatcagatcactagaggcagaagaagacatagaaaaagatataaaagaaactgttaagaaagaattaaagatcaatgagttggatcaaagta 55832836  T
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatc 380  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  55832835 tggtgtatgatagaacattatagcggaatttaatc 55832801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22873684 - 22873615
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22873684 aaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataag 22873615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459260
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||   |||||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  401 gtgggataag 410  Q
    ||||||||||    
T  31459251 gtgggataag 31459260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 404
Target Start/End: Original strand, 32479221 - 32479298
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32479221 aatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 32479298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 410
Target Start/End: Original strand, 41192226 - 41192327
Alignment:
Q  309 aagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41192226 aagaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggata 41192325  T
Q  409 ag 410  Q
    ||    
T  41192326 ag 41192327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45185388 - 45185195
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||  |||          
T  45185388 taagtgtagcggtgataagaatattgtgttggatgtgtagtaagactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagag--agtttaggt------ 45185297  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
           ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || |||| |    
T  45185296 -------aagtagaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagtatatgagatgg 45185204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45209282 - 45209221
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45209282 tttatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 45209221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 31403171 - 31403051
Alignment:
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||   || ||||||||||     
T  31403171 aaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagttggatagaaatgtggtatatgatagagcattatggtgttgcttgatccatgtaga 31403072  T
Q  389 cgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  31403071 cgaccccacttagtaggataa 31403051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33191219 - 33190864
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  33191219 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 33191125  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| |  |||  |||| || ||| |||| || |    
T  33191124 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatgg 33191025  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    || | |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||| ||  |||| ||||    
T  33191024 agaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggt 33190925  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33190924 gtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataag 33190864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 2589223 - 2589338
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||  ||||    
T  2589223 taagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccc 2589322  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||||    
T  2589323 cagttagtgggataag 2589338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 8286622 - 8286705
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8286622 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataag 8286705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 12494846 - 12494929
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12494846 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataag 12494929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661888
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 15661888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19154962 - 19154879
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19154962 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataag 19154879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27450278 - 27450196
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450278 aatgagttggatccaaatatgattt-tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 27450196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 403
Target Start/End: Original strand, 31043224 - 31043331
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||| || ||| ||||||    
T  31043224 aagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgacccc 31043323  T
Q  396 acttagtg 403  Q
    ||||||||    
T  31043324 acttagtg 31043331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46715649 - 46715554
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatca 244  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||  |||| |||||||||| ||||    
T  46715649 agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagatca 46715554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 1793464 - 1793728
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| | | |||| ||||| | |||| |||||||    
T  1793464 tagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagat 1793563  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaag----aaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
     |||||  |||  ||||  ||||| |||| |||||    ||||||| |||||||||| | |||     |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||    
T  1793564 ggagga--gtcgtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa 1793661  T
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  1793662 tatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataag 1793728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061951
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataag 19061951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21879419 - 21879165
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| ||   ||||||||||| || || |||| |||| |||| |    
T  21879419 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttggacatgcatagagaagacatgtagattctttagtaaggagaatagattagatggagggtagtga 21879320  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactact-aagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
     ||||| |||||  |||||||||     |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||| || ||||| | ||||||||    
T  21879319 aatcaccagaggtcgaggaagac-ccgtaaaactataagagaaactattcaagaaagatctagagatgaatgagttggatagagatatgatatatgatag 21879221  T
Q  359 a----acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |    || ||||  | | ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21879220 atcccactttatttcatcatttggtccatgtcgccgactccacttagtgggataag 21879165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44719529 - 44719377
Alignment:
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatta---atgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    |||| ||||||| |||||||||    ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   |||| || ||| |||||| ||| ||| |||    
T  44719529 atcattagaggctgaggaagacctagaaaaaatataaaagaaactattaagaaagatctaaatattattaatgagttagatagaaatacggtatataata 44719430  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44719429 gagcattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataag 44719377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8459274 - 8459102
Alignment:
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagga-tagtcagatcactagaggcagaggaagacaat 285  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| || | || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||       
T  8459274 ggtggtttggacatatagagagaagacatgtagattctgtaataaggagagtagattacat-gaggagtagtcaaatcactaaaggcagaggaagaccta 8459176  T
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
    ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||| ||  | ||||||| |||||||||    
T  8459175 aaaaaactaaaagataaactattaagaaaaatctagagattaaagagttgaatgaatatatggtatatgataga 8459102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 339 - 396
Target Start/End: Original strand, 12443290 - 12443347
Alignment:
Q  339 tgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccca 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  12443290 tgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatccca 12443347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 28467627 - 28467700
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28467627 ttggattcaaatacggtttacaatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcggaccccgcttagtggga 28467700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44047699 - 44047555
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||     |||| |||||||||| |    
T  44047699 atgttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagca-----cctatagtagaaaaggt 44047605  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
    ||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  44047604 ggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtag 44047555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45184307 - 45184149
Alignment:
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    ||||||| |||||  ||||| || |||||||  ||| |||||||| ||| ||| |   |||||    
T  45184307 aggatagtctaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataaga--aactattatgaaagataaagagattaatgagttgaatttactcatggt 45184210  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45184209 ttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 45184149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939750
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 49939750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Original strand, 2588904 - 2588964
Alignment:
Q  63 ggatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2588904 ggatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaa 2588964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Original strand, 4548219 - 4548287
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4548219 aaatttggtttatgatagaacactaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataa 4548287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 31459034 - 31459098
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataaga 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31459034 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 33227120 - 33227475
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  33227120 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 33227214  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| |  |||  |||| |||||| |||| || |    
T  33227215 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatgg 33227314  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    | || |||||  | |  ||||| ||| ||||||     |||||| | ||| |||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  33227315 aagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 33227414  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33227415 gtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataag 33227475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 213
Target Start/End: Original strand, 50471453 - 50471595
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaa-agtag 162  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||| || |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||      |||| |||||    
T  50471453 atgagaatgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagac--tcggggtagca------ctaatagtag 50471544  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  50471545 aaaagatggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 21237041 - 21237124
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21237041 aatgagttggatccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataag 21237124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27049301 - 27049189
Alignment:
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatc----catgtagccgaccccac 397  Q
    ||||| |||||||||| || | |||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     ||||||| ||||||||    
T  27049301 aactattaagaaagatttatagattaatgagttggttccaaatatggtttatgatcgaacattatggcgtaatttggtcatgtaatgtagctgaccccac 27049202  T
Q  398 ttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||    
T  27049201 ttagtgggataag 27049189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Original strand, 34379583 - 34379657
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  34379583 attaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaacttgat-catgtagccgaccccactt 34379657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49738689 - 49738566
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| |   || | | ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  49738689 aaaaactataataaaaactattaagaaggatctagaaattaatgagttggatagggttaggatatatgacagaacattatggcggtgtttgatccatgta 49738590  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  49738589 gccgaccccatttagtgggataag 49738566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979186
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataag 3979186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 393
Target Start/End: Original strand, 30480298 - 30480372
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30480298 tagagattaatgaattggactaaaatatggtttatgatagaattttatgacgtaatttgatccatgtagccgacc 30480372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36255596 - 36255542
Alignment:
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36255596 atgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtggga 36255542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799674
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataa 36799674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 346
Target Start/End: Original strand, 48033185 - 48033287
Alignment:
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| || ||||    
T  48033185 agattgaggatagttaaatcactagaggcagaggaagacttaagaaaactataagagaaactattaagaaatatctggaaattaatgatttgtatagaaa 48033284  T
Q  344 tat 346  Q
    |||    
T  48033285 tat 48033287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 408
Target Start/End: Original strand, 55579050 - 55579295
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||  | | |||||| | |||||||||  ||| ||||| ||||| |    
T  55579050 gaaaaaatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaa 55579149  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    |||  ||||| ||| ||||||    ||||||| ||| | |||||| |  ||||||| || |  || |||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  55579150 tcaaaagaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aac 55579248  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  55579249 attatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 1380298 - 1380636
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  ||   ||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||     ||| ||||||  |||||||| ||    
T  1380298 atgttgcattggatgtgttgttagacctgacacgatagaattagaatggacaacattagagagagagttggg-----ataacacctaccgtagaaaacat 1380392  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    | | |||| | || |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||  |||| | || ||||||    
T  1380393 gatagaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaaaacctgtagattttgtagtaaggacagtagattagatagagtgtagttaaattactaga 1380492  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt---ttatgatagaacattat 366  Q
    || | ||||||||     |||  |  ||||||||| |  || |||||| |||| |||||||| |||| | | || |||||   | |||||| ||||||||    
T  1380493 ggtataggaagacttgggaaatttgcaagagaaaccatcaaaaaagatttagagattaatgagttggttaggaacatggtatatgatgataaaacattat 1380592  T
Q  367 ggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | | |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1380593 gactttgtttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataag 1380636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 396
Target Start/End: Original strand, 6843766 - 6843867
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |  ||  |||||||||| ||||||    
T  6843766 taagagagactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatagaaatatgttatataatagaacattatggcattgttggatccatgtagtcgaccc 6843865  T
Q  395 ca 396  Q
    ||    
T  6843866 ca 6843867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Original strand, 7947142 - 7947203
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7947142 tttatgatagaacactatcatgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 7947203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17668467 - 17668410
Alignment:
Q  66 tgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17668467 tgagaatgttgcgttggatgtgtggtaaaactagatgagataagattataaatgacaa 17668410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26025081 - 26024988
Alignment:
Q  264 actagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  26025081 actagaggcagaggaagacctggtaaaactttttgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgata 26024988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30634167 - 30634122
Alignment:
Q  365 atggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30634167 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 30634122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 37798048 - 37798117
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37798048 aaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataag 37798117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49738882 - 49738757
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||| | || ||||||| |||| || |||| ||| |||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49738882 tagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagattttgtactaaggagagtaaatcagat 49738783  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggca 273  Q
    ||||   ||||| |||||||||||||    
T  49738782 agagatgagtcaaatcactagaggca 49738757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51811363 - 51811295
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51811363 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataag 51811295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21359293 - 21359241
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21359293 gaacattatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataag 21359241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38571024 - 38570956
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgt 217  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38571024 agcacctatagtacaaaagatagtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagacatgt 38570956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Original strand, 49987435 - 49987487
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49987435 cacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 404
Target Start/End: Original strand, 51176774 - 51176834
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51176774 tatggtttaggatagaacattatggcataatttgatccatgtagcggaccacacttagtgg 51176834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 6957805 - 6957864
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6957805 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 6957864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 29801522 - 29801645
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||||  || |||| || ||||| | ||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  29801522 aaaaactataagagaatttattaaggaaaatctataaattaatgagctggattgaaatatgatatatgattgaaaattatggcgtcgtttgatccatgta 29801621  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||| |||| |||| ||||||    
T  29801622 gctgacctcactcagtgagataag 29801645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 283
Target Start/End: Original strand, 38266150 - 38266285
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| | |||| | ||||||||||| || | ||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||| |  |||  ||||||||||| |||  ||    
T  38266150 tagcacctataatagagaggatggtggaaactaagcttaggtggtttgaccatgttgagataagtcttgtagatgccgtgataaggagagtagatcgtat 38266249  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  38266250 ggaggatagtcagaccattagaggcagaggtagaca 38266285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40268525 - 40268367
Alignment:
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    ||||||||||| || | || || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||| || | ||| ||| | |||| |||    
T  40268525 aaagatggtgggaactcggctttggtggcttgggcatgtagagagaagacctgtagattccgtataaaggagagtagattacataaaggtttgtcaaatc 40268426  T
Q  264 acta-gaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctaga 322  Q
    |||| | ||||||||||| |  || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40268425 actagggggcagaggaaggc-ctagaaaactataagagaaactattaagaaaaatctaga 40268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Original strand, 41192840 - 41192911
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  41192840 tagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtag 41192911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 47265270 - 47265211
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47265270 tatgatagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataag 47265211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 406
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935411
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtggga 54935411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4136968 - 4136760
Alignment:
Q  186 aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaat 285  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||  | |||||  |||      
T  4136968 aggtggtttgggcatgtagaaa-aagacatgtagattttgtaataaggggagtagatcatatgaagggtagtcaaatcactagacacggaggataacata 4136870  T
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
     ||||||  |||||||||||| |||||||||||     |||||||| ||||||||| |||| |       || ||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  4136869 gaaaaac--taagagaaactattaagaaagatc-----attaatgagttggattgagatatag-------tacaacattacggcgttgtttgatccatgt 4136784  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  4136783 agccgaccctacttagtgagataa 4136760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Original strand, 20999143 - 20999265
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||  | ||||||  |||| |||| ||||||| |||  ||| |||| ||||    
T  20999143 aaaaactataatataaactattaagaaagatctagagtttaatgagttgaataaatatatggcatatggtagagcattatgacgtcgtttgatccttgta 20999242  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  20999243 gccgaccccactcagtgggataa 20999265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Original strand, 44360022 - 44360159
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attaga----gagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtg 173  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    |||| | |||||||| ||     |||| |||||||||||||||     
T  44360022 ttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatca-----cctatagtagaaaagatggta 44360116  T
Q  174 gaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgt 217  Q
    |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44360117 gaaactagatt-aggttgtttgggcatgtagagagaagacatgt 44360159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Original strand, 44384988 - 44385062
Alignment:
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44384988 aactattaagaaagatctagagattaataagttggatattaatatggtttatgatagaacattatgatgtaattt 44385062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50238677 - 50238631
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238677 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 50238631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50238763 - 50238717
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238763 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 50238717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 278
Target Start/End: Original strand, 56439743 - 56439793
Alignment:
Q  228 gtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagga 278  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56439743 gtaaggagagtagatcagatggaggatagttagatcactagaggcagagga 56439793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 409
Target Start/End: Original strand, 50853 - 50922
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  50853 gaaatatggtttatgatagaacattatagcataacttgattcatgtagctgactccacttagtgcgataa 50922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 187
Target Start/End: Original strand, 12494661 - 12494793
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  12494661 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 12494755  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttag 187  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  12494756 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 12494793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20105822 - 20105761
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagaga 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20105822 atgttgcgatggatgtgtggtaagactagacgagatatgattagaaatgacaacattagaga 20105761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20591578 - 20591322
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||   ||| | |||| ||||| |||||| |||||||    
T  20591578 tagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagat 20591480  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||    | |||||| ||||||||||   | |||||| |||||||  | | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||    
T  20591479 ggaggagagtca----agtagaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatg 20591384  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||||  ||| |||||||| || ||| ||  ||||||   |||||||||||||    
T  20591383 g-ttatgatagaacacaatgacgtaatttgattcatatattcgaccctttttagtgggataag 20591322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Original strand, 28486088 - 28486185
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  28486088 gaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacctcggttagtgggata 28486185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42285968 - 42285719
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||  ||||| || |||| | ||||| | ||||  |||    
T  42285968 agtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatcag-tggaggggagt 42285870  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    ||||||||||||||  | || ||||    |||| || ||  |||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||   | | ||||||| |||||    
T  42285869 cagatcactagaggtgggggtagacctagaaaagctata--agaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgata 42285772  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| | |||||| |  ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42285771 gaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataag 42285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 410
Target Start/End: Original strand, 49686842 - 49686959
Alignment:
Q  293 tttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | || ||||||||  ||||| |  ||||| | |||||| ||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  49686842 tttaagagaaactattgaaaaatatattgagattaatgagctggatagggatatgatatatgatggaatattatggcgtcgtttgaaccatgtagccgac 49686941  T
Q  393 cccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49686942 cccacttagtgggataag 49686959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 331
Target Start/End: Original strand, 53517640 - 53517717
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatga 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||    
T  53517640 tagtcagatcactagaggcagaggaagacttagaaaaactgtaagagaaactatcaaaaaagaactagagattaatga 53517717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963716
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaacat-atggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataag 54963716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958255
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa 6958255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11400509 - 11400461
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11400509 attatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataag 11400461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11410236 - 11410188
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11410236 attatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataag 11410188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Original strand, 15665319 - 15665367
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15665319 attacggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 15665367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44667484 - 44667269
Alignment:
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata 286  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||  ||   ||| |||||||||| |||||||  |   |||||| ||||||||||||||| ||||||        
T  44667484 ggtggtctgagcatatagagaaaagacatgtatattctctaggaaggagagtagatcagatgtatagtagtcaaatcactagaggcagaagaagacctcg 44667385  T
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| || |||| |  ||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||| ||| |||||    
T  44667384 aaaaactatattagaaactatcaagaaaaatctagagattaacgagttgggta-aaatatgatatatgatagaacattttggtgtcgttttatctatgta 44667286  T
Q  387 gccgaccccacttagtg 403  Q
     |||| |||||||||||    
T  44667285 tccgatcccacttagtg 44667269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46583103 - 46583043
Alignment:
Q  147 atagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  46583103 atagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga 46583043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47265477 - 47265409
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47265477 cacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtag 47265409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 410
Target Start/End: Original strand, 50862857 - 50862897
Alignment:
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862857 gtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 50862897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1427552 - 1427429
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||| || |||||||||||| |||| | |  ||  |||    
T  1427552 agtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtggattttgtggtaaggagagtagatcatacaagggggagt 1427453  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaaga 281  Q
    || ||||||||||| || ||||||    
T  1427452 caaatcactagaggtaggggaaga 1427429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28550586 - 28550471
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||   ||||   |||||| ||| ||||||| |||||    
T  28550586 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccc 28550487  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||    
T  28550486 cacttattgggataag 28550471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 35690215 - 35690286
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35690215 taagtgtagccgagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgaca 35690286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44686812 - 44686595
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  ||   ||| |||||||||| |||||||  |   |||| | ||||||||||||||| ||||||     
T  44686812 ttaggtggtctgagcatatagagaaaagacatgtatattctctaggaaggagagtagatcagatgtatagtagttaaatcactagaggcagaagaagacc 44686713  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       ||||||| ||  ||||||||  |||||| ||||||| ||||| || |||| |  ||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||    
T  44686712 tcgaaaaactatattagaaactatcaagaaaaatctagagattaacgagttgggta-aaatatgatatatgatagaacattatggtgtcgttttatctat 44686614  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  44686613 gta-ccgatcccacttagtg 44686595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1965715 - 1965653
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1965715 tatgatttatgatagaataatatggcgtaatttgatccacgtagccgatcccatttagtggga 1965653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33225964 - 33225873
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  33225964 taagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtgatttgatcaatgtagc 33225873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41009721 - 41009413
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggga-tgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||   | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||     ||    
T  41009721 taagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatggggg-----ta 41009627  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggt-ggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    ||||||| |||||||||| ||||   |||||||  |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | |   || ||||| | | || |||||||     
T  41009626 gcacctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatg 41009527  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| |||||| |||  || || ||||||||||  |  |||||| |||||||||||| ||  || ||| ||||  | |||||  |||||| ||||||||    
T  41009526 gaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagac-ctggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatgg 41009428  T
Q  349 tttatgatagaacat 363  Q
    ||||||||| |||||    
T  41009427 tttatgatataacat 41009413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Original strand, 46236709 - 46236755
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46236709 tatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 46236755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633426
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtggga 32633426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585748
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataag 34585748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37773729 - 37773672
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37773729 tagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 37773672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 44047489 - 44047388
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata-gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||||| || ||| |||| |   ||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44047489 taagaaagatctagagattaatgagttggataataatatggtatatgataagagcataatggtgacgtttgattcatgtagccaaccccacttagtggga 44047390  T
Q  407 ta 408  Q
    ||    
T  44047389 ta 44047388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 410
Target Start/End: Original strand, 56130403 - 56130436
Alignment:
Q  377 aatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56130403 aatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 56130436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 56225265 - 56225334
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  56225265 aaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataag 56225334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 8284346 - 8284402
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  8284346 tatgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggat 8284402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 386
Target Start/End: Original strand, 20605343 - 20605419
Alignment:
Q  310 agaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  20605343 agaaagatctagggattaatgaactggatcagaatatggtttatgatcgaacgttatggcgtaatttgattcatgta 20605419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21214725 - 21214645
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatg 367  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | | |||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21214725 aaaaactataagagaaactattaagaaaggtctatagagtaatgagttggagagaaatatgatgtatgatagagcattatg 21214645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27338462 - 27338406
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27338462 tatgatagaacattatgacgtagttggatccatgtagccgaccctccttagtgggat 27338406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 232
Target Start/End: Original strand, 44860862 - 44860934
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaag 232  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||    
T  44860862 tagaaaagatggtggaaaccaggcttagatggtttgggcatgtatagagaagagctgtagattttgtagtaag 44860934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 45176037 - 45176097
Alignment:
Q  175 aaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggag 235  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  45176037 aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgaagtaaggag 45176097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Original strand, 46153942 - 46153974
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46153942 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 46153974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 51841329 - 51841217
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| ||| | || |||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||||||   ||| |||||| |||| |||||    
T  51841329 taagagaaactattaagaaggatttagaaattcaagagttggatagggatatgatatatgatacaacattatggcggtgtttgatccatatagctgaccc 51841230  T
Q  395 cacttagtgggat 407  Q
    | |||||||||||    
T  51841229 cgcttagtgggat 51841217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 376
Target Start/End: Original strand, 55028985 - 55029053
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  55028985 taagaatgatctagagattaatgagctagatagaaatatgttatatgatagaacattatggcgtcattt 55029053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16875837 - 16875774
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16875837 aaatatgatttatgatagaacattattatgtaacttgatccatgtagcagaccccactttgtgg 16875774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 27983376 - 27983459
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||| || | |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  27983376 aatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataag 27983459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 282
Target Start/End: Original strand, 37948486 - 37948537
Alignment:
Q  231 aggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  37948486 aggagagtagatcagatagagggtagtcagattgctagaggcagatgaagac 37948537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Original strand, 40424529 - 40424596
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  40424529 atatggtttataataaaatattatgacgtaatttaatctatgtagtcgacctcatttagtaggataag 40424596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41729549 - 41729494
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  41729549 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Original strand, 45423543 - 45423602
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  45423543 gatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaa 45423602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 46582924 - 46582842
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  46582924 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataag 46582842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 51550490 - 51550407
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||   ||| |||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  51550490 ttaggtggtttgggcatgtagagagaagatatgtggattctctagcaaggagagttgatcagatggaggggagtcagatcacta 51550407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Original strand, 56225074 - 56225129
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  56225074 acctatagtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagaga 56225129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 1989783 - 1989849
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  1989783 tatggtttatgataaaacattttggcgtaatttgattcatgcaatcgaccccacttattgcgataag 1989849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 252
Target Start/End: Original strand, 2589008 - 2589098
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagg 252  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||| || || ||| | ||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  2589008 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcagatggagg 2589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8835897 - 8835823
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatt 375  Q
    |||||| || ||||||| || || |||| || ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8835897 aaactattatgaaagatttaaatgttaaagagttgaatttgaatatggtttatgataaaacattatggcgtaatt 8835823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Original strand, 11389644 - 11389705
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga--tgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||||||||||    
T  11389644 gatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaactagacgggatataggattagaaatgacaa 11389705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 406
Target Start/End: Original strand, 13296613 - 13296695
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||| |||| |  |||||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  13296613 attaatgagttggaccgaaatacggtgtatggttaaacattatagcgtaatttgatgcatgcagccgacctcacttagtggga 13296695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 383
Target Start/End: Original strand, 16003067 - 16003165
Alignment:
Q  285 taaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||  ||| || ||||  | ||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  16003067 taaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaatttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 409
Target Start/End: Original strand, 20192240 - 20192297
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20192240 tatgatagaacattatgacgttatttgatcaa-gtagccgaccctacttagtgggataa 20192297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Original strand, 20998954 - 20998992
Alignment:
Q  82 gatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatga 120  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20998954 gatgtgttgtaagactagacgagataggattagaaatga 20998992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38585317 - 38585267
Alignment:
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  38585317 acattatggcgtaatttgatccatttagctgagcccacttagtggaataag 38585267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38809669 - 38809615
Alignment:
Q  356 tagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  38809669 tagaacattatggcatattttgatccatatagccaaccccacttaatgggataag 38809615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42489658 - 42489620
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42489658 tatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatcca 42489620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43070107 - 43070053
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagag 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43070107 ttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44667600 - 44667530
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44667600 gatgagaatgttgcgttggatatgcggtaatactagacaagatagtattagaagtgacaatattagagaga 44667530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 119
Target Start/End: Original strand, 44860779 - 44860833
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatg 119  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  44860779 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagatggaataagattagaaatg 44860833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Original strand, 53517721 - 53517771
Alignment:
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53517721 acattatggtgtcgtttaatccatgtagccgaccctacttagtggaataag 53517771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 883433 - 883388
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  883433 tgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccact 883388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1211473 - 1211408
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaa-tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1211473 tggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataag 1211408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25427947 - 25427878
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||| ||||| || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  25427947 aaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataag 25427878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32630541 - 32630508
Alignment:
Q  377 aatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32630541 aatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 32630508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39446983 - 39446926
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39446983 tgattgaacactatggcgttgtttaattcatgtaaccgaccccacttaatgggataag 39446926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 50286970 - 50287031
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  50286970 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagac 50287031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869896
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||  ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataag 50869896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51841534 - 51841465
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51841534 ttggatgtgtggtaagactagacaagatagaatatgaaacgacaatattagagagagaattggggcagca 51841465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Original strand, 54934955 - 54935060
Alignment:
Q  199 atgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaaga-caataaaaaactttaa 297  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||  ||||| ||||||||| |||| |  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||    
T  54934955 atgtagagagaagacttttagattctgtagtgaggagagtagatcaaaaggatgatagttagatcactagaggcagatgaagacctaaaaaaaactataa 54935054  T
Q  298 gagaaa 303  Q
    ||||||    
T  54935055 gagaaa 54935060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4879165 - 4879125
Alignment:
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4879165 gtaatttgatccatgtagccgacctcacttactgggataag 4879125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 123
Target Start/End: Original strand, 18966484 - 18966536
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  18966484 atgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaa 18966536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 20605209 - 20605297
Alignment:
Q  156 aaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatca 244  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||  || |||||||||||| ||||    
T  20605209 aaagttgaaaagatggtggaaactagaattttatggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatca 20605297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 381
Target Start/End: Original strand, 20863820 - 20863876
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 381  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20863820 ttaatgagttggaccgaaatatggtgaatgatagaatattatggcgtaatttgatcc 20863876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967555
Alignment:
Q  66 tgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac-aaattagagaga 133  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagaga 25967555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Original strand, 28348271 - 28348323
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28348271 gaacattatgatgtactttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataag 28348323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Original strand, 42618817 - 42618857
Alignment:
Q  83 atgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42618817 atgtgtgggaagactagacaagataggattagaaatgacaa 42618857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Original strand, 46226371 - 46226439
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| || |||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  46226371 aaatatggtttatgataaaatactatgacgaaatttaattcatgtagttgacctcacttattgggataa 46226439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Original strand, 47372938 - 47372970
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47372938 atccatgtagccgaccctacttagtgggataag 47372970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 193)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28628284 - 28627949
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| | | | ||| ||||||||||| |||| |||||||||  | |||| ||||||     |||| |||||||| |||    
T  28628284 atgttgccttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagca-----cctagagtagaaatgat 28628190  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28628189 ggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaaga 28628090  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    || ||||||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28628089 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggc 28627990  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28627989 gtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataag 28627949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 383
Target Start/End: Original strand, 47848598 - 47848912
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| || |||||||||| | ||||||||||      |||| |||||    
T  47848598 gatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcg-----cctatagtag 47848692  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  47848693 aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgat 47848792  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaata-aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |  ||||||| | |  ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  47848793 cactagaggcagaggaaga-actagaaaaactataagagaaacta-ttggaaagatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaac 47848890  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccat 383  Q
    |||||||  |||||| ||||||    
T  47848891 attatggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135233
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||  |||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    ||| |||||||||| ||||||    ||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtggga 38135233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26742174 - 26741917
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||| | ||| ||| || |||||||||||| |||||||    
T  26742174 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 26742075  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaacttt--aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaata 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |  |||| |||||| || |||| || | || || ||||| |||||  ||||||    
T  26742074 agagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaata 26741975  T
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||    
T  26741974 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtg 26741917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 36136688 - 36137030
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||  |||||||||| | |||||||||||     |||| |||||    
T  36136688 gatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagca-----cctatagtag 36136782  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||| || || | ||| | | |||||| | |||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  36136783 aaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagat 36136882  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||  ||| | ||||||||||    ||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36136883 cagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaaca 36136982  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| | ||||||| ||  || || |||| | | ||||||||||||||    
T  36136983 ttatagggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataag 36137030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 398
Target Start/End: Original strand, 1569058 - 1569270
Alignment:
Q  186 aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaat 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| | | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |       
T  1569058 aggttgtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtccta 1569157  T
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
     ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  1569158 gaaaaactataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgt 1569257  T
Q  386 agccgaccccact 398  Q
    || ||||||||||    
T  1569258 agtcgaccccact 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36102123 - 36101793
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||    |   ||||||||| | |||    
T  36102123 gatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgag-gaagagtg----aaggtagcacctataatag 36102029  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||| |||  | |||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  36102028 aaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcagat 36101929  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||||||||||||||||||         ||   ||| ||| || || ||||||| || | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36101928 cactagaggcagaggaagac---------ct---agaaaaattattatgaaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaaca 36101841  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36101840 ttatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataag 36101793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 406
Target Start/End: Original strand, 43281587 - 43281936
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggg-atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||  ||||||||||    |||||     ||    
T  43281587 taagtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagag---tggggg----ta 43281679  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  43281680 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgg 43281779  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||| | |  ||||| ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||    
T  43281780 aggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 43281879  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281880 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 43281936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35906572 - 35906217
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | | |||||||      
T  35906572 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagca-- 35906475  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  35906474 ---cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatgg 35906378  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| | ||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  35906377 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggt 35906278  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906277 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 35906217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2886000 - 2885738
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||| |  ||| ||| | |||||| |||||||    
T  2886000 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaagagtagatcagat 2885901  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||| |||  ||||| ||| ||||||     |||||| |||||||||| | ||  || ||| |||   | ||||| |||||   |||||||    
T  2885900 ggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagttggacccaaatatg 2885801  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2885800 gtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 2885738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12841553 - 12841291
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  12841553 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 12841454  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||| ||  |||| ||    
T  12841453 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttg 12841354  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841353 gtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 12841291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 47796476 - 47796176
Alignment:
Q  84 tgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attaga--gagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaata 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||| ||| ||      ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  47796476 tgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaa-----ctatagtagaaaaggtggttgaaaata 47796382  T
Q  181 ggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaag 280  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||                ||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  47796381 ggcgtaggtggtttgggcatgtatagat----------------gtagctaggagagtagatcagatggaggattgtcagatcactaggggcagatgaag 47796298  T
Q  281 acaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatc 380  Q
    ||    ||||| | |||||||| ||| || ||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  47796297 accgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatc 47796198  T
Q  381 catgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| |||||| ||| ||||||    
T  47796197 catgcagccgatcccgcttagt 47796176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 37617868 - 37618211
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  37617868 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 37617962  T
Q  163 aaaagatggt-ggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||      
T  37617963 aaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 37618062  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  37618063 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 37618162  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618163 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 37618211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 12966026 - 12966282
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||||||||||||| ||||  |    
T  12966026 tagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaagt 12966125  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
      ||  |||||| ||||||||||| |||   |||      |||||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  12966126 gaagactagtcaaatcactagaggaagacctaga------aaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatatg 12966219  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||||||| | ||||||| | |  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12966220 gtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataag 12966282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27893823 - 27893579
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||   ||||  ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  27893823 cacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga---aagatctgtagattttgtacttaggagagtagatcagatgga 27893727  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |         ||   ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||| ||    
T  27893726 ggatattcagatcactagagatagaggaagtc---------ct---agaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttt 27893639  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27893638 tatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataag 27893579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 400
Target Start/End: Original strand, 40169653 - 40169911
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||||||||| |||| ||    
T  40169653 tagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatcaaat 40169752  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaact------ttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattga 341  Q
     |||||| || ||||| || |||||||||||||||    |||||||       |||||||||||| |||||||||   ||| |||| | | |||||   |    
T  40169753 ggaggattgttagatccctggaggcagaggaagacccataaaaactataagactaagagaaactattaagaaagactcagagattagttagttggaccaa 40169852  T
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||| |||| |||||||||||||    
T  40169853 catatggtctatgatagaacattacagcgtaagttgatccgtgtaaccgaccccactta 40169911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39812095
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||      ||||||||   ||||    
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttgggg-----cagcacctatcataga 39811976  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    ||| |||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||   |||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||    
T  39811977 aaaaatggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggaggaaagccaaatc 39812076  T
Q  264 actagaggcagaggaagac 282  Q
    |||||||| || |||||||    
T  39812077 actagaggaagtggaagac 39812095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45836851 - 45836498
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||      
T  45836851 taagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagca-- 45836754  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  45836753 ---cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgg 45836657  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| ||| || | |   |||| ||||| ||||     | |||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||    
T  45836656 aggagagttaggttat--gaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 45836559  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836558 ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 45836498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 11593871 - 11594226
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||  ||| |||||| | | |||||||||      
T  11593871 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagca-- 11593968  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  | | ||||| |||||| |||| || |    
T  11593969 ---cctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatgg 11594065  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  11594066 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 11594165  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594166 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 11594226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39906728 - 39906388
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |  ||||||||     |||| |||||    
T  39906728 gatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagca-----cctatagtag 39906634  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||   ||| | |||| ||||| |||||| |||| || |||||  ||||  |    
T  39906633 aaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagga--gtcaagt 39906536  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  39906535 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 39906436  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906435 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 39906388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40980066 - 40979944
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40980066 aaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 40979967  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40979966 ccgaccccacttagtgggataag 40979944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 408
Target Start/End: Original strand, 49029187 - 49029540
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  49029187 taagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 49029281  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| |||||  || || |||| || |    
T  49029282 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatgg 49029381  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  49029382 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 49029481  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49029482 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggata 49029540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 410
Target Start/End: Original strand, 45601597 - 45601742
Alignment:
Q  265 ctagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatt 364  Q
    ||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  45601597 ctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacact 45601696  T
Q  365 atggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  45601697 atggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataag 45601742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24549955 - 24549708
Alignment:
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtt-----tcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || |  |     | | | |||||||||||| |||||| ||||  | ||    
T  24549955 aaagatgatggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggactattgttaggactaaggagagtaagtcagatggaggggattc 24549856  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||   ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24549855 aaatcactagaggtagaagaagacctgaaagaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatatggtatttgatag 24549756  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||  |||| ||||  ||| ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  24549755 aatcttattgcgtcgttt-atccatgtagcagatcccacttagtaggat 24549708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30200330 - 30200023
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    || ||||| ||      
T  30200330 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag----ttagggtaaca-- 30200237  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | | ||||| |  || ||  ||||||||||||  | ||||||| |    
T  30200236 ---cctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacctcgagattatgtagtaaggagatcatatcagatgg 30200140  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    ||  |||||| | |||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | || ||  ||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||||    
T  30200139 agagtagtcaaaacact-gagacagaggaagacataaaaaaactataaaaaaatcttttaagaaagatctagagattaatgagtttgatataaatatggt 30200041  T
Q  350 ttatgatagaacattatg 367  Q
     ||||||||| |||||||    
T  30200040 atatgatagaccattatg 30200023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34341617 - 34341411
Alignment:
Q  187 ggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata 286  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||| |||||||||| || | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||           
T  34341617 ggtggtttgggcatttagaaa-aagacttgtagattttgtagtaaggaaagaagattagatggaggatagtcagattactagaggcagaggaa------- 34341526  T
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
      |||||   |||||||||| ||||     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  34341525 --aaact---agagaaactattaagt----tctagagatgaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgta 34341435  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  34341434 gccgaccccatttagtggaataag 34341411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48202960 - 48202744
Alignment:
Q  168 atggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcacta 267  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||| ||    
T  48202960 atggtggaatctaggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcatta 48202861  T
Q  268 gaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatg 367  Q
     |||||||||||| |    ||||||| ||||||| |    |||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  48202860 taggcagaggaaggcctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaacattgtg 48202761  T
Q  368 gcgtaatttaatccatg 384  Q
    | | ||||| |||||||    
T  48202760 gtgcaatttgatccatg 48202744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 34869344 - 34869686
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  34869344 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 34869438  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||  |  ||| ||||| |||||| |||  || | ||| |||||  |    
T  34869439 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagt 34869538  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  34869539 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 34869638  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34869639 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataag 34869686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 410
Target Start/End: Original strand, 35713713 - 35713960
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||  ||| |||| | |    
T  35713713 gaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatctgatgaagggtagttata 35713812  T
Q  262 tcactagaggc---agaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    ||| ||||| |    |||||||||    ||||||| ||| ||||| || ||||||  ||||||||||   ||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  35713813 tcattagagaccaaggaggaagacctagaaaaactataacagaaattattaagaataatctagatat---tgagttgaatcgaaatattgtttatgatag 35713909  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||| | |||||||||||    
T  35713910 aacattatggcgtaattttatacattgagctgacccca-tcagtgggataag 35713960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9210842 - 9210720
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| |||||||||||  || |||| || ||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9210842 aaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtag 9210743  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  9210742 ctgaccccacttagtgggataag 9210720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36514576 - 36514362
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||      
T  36514576 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagag--ttggggtagca-- 36514481  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  36514480 ---cctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatag 36514384  T
Q  250 aggatagtcagatcactagagg 271  Q
    |||  |||||  ||||||||||    
T  36514383 aggggagtcaagtcactagagg 36514362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 398
Target Start/End: Original strand, 22174117 - 22174254
Alignment:
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||    
T  22174117 atcactagaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaa 22174216  T
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22174217 cattatggcgttgtttgatccatgtagccgaccccact 22174254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 361
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282626
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-att---agagagaaaattggggtagcatagcacctaaagt 160  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||     |||| |||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagca-----cctatagt 43282424  T
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  43282425 agaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcag 43282523  T
Q  261 atcactagag--gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    ||||| ||||  | |||||| |||    ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  43282524 atcacaagaggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactattaagtaagttcttgaggttattgagttggatcgaaatatggtttattatag 43282623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Original strand, 36652006 - 36652258
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  36652006 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagt 36652105  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    ||  | |  ||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || |||  |||  | ||||| ||| ||  |||| |||| |||||||    
T  36652106 caagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgata 36652205  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36652206 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 36652258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Original strand, 43491315 - 43491574
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| |||| ||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||  ||||||| ||    
T  43491315 cacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatgga 43491414  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaaga-tctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||     |||| | |||||||||| | || |||||| | ||||  | ||| | ||||||  ||||||| |    
T  43491415 ggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccatta-gaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgat 43491513  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491514 ttatgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 43491574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44855514 - 44855190
Alignment:
Q  80 tggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaa 178  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||     |||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  44855514 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggg-----atagtacctatagtagaaaagttggtagaaaa 44855420  T
Q  179 taggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagga 278  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  |||  |||| |||||| |||| || ||||| |||||  | |  ||| | ||||||    
T  44855419 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagagga 44855320  T
Q  279 agacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaa 378  Q
    ||||     |||||| | |||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||      
T  44855319 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgata--acactatggcgtaatttgg 44855222  T
Q  379 tccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855221 tccatgtagccgaccccacttagtgggataag 44855190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 46356207 - 46355872
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  || ||||||| ||| ||||     ||||||||| |||||||||| |    
T  46356207 atgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatggggg-----tagcacctatagtagaaaagtt 46356113  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | | || ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  | |  |||    
T  46356112 ggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 46356013  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    || ||||||| ||     |||||| | | |||||| | ||  || ||| || |  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| |    
T  46356012 ggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgcc 46355913  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46355912 atcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataag 46355872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 281
Target Start/End: Original strand, 1740708 - 1740938
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||| || |||||||||| |   | | | |  ||    
T  1740708 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactaggtggggtaagattagaaatgagaacattagagagagaga-gagtttgggta 1740806  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |  |||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  1740807 gcatctacagtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaaggagagtagatcagatgg 1740906  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaaga 281  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1740907 agggtagtcaaatcactagagccagaggaaga 1740938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 14057629 - 14057744
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  14057629 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccc 14057728  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||    
T  14057729 cacttagtaggataag 14057744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 14367657 - 14367772
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  14367657 taagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccc 14367756  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||    
T  14367757 cacttagtaggataag 14367772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 410
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011312
Alignment:
Q  200 tgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaaga 299  Q
    |||||||| ||||||| ||| | | |||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    ||||| | | |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  300 gaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    |||| || || |||| || || |  ||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T
Q  400 agtgggataag 410  Q
    |||||||||||    
T  1011302 agtgggataag 1011312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6420747 - 6420605
Alignment:
Q  169 tggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactag 268  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  6420747 tggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcactag 6420648  T
Q  269 aggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaag 311  Q
    ||||||||| ||||    ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6420647 aggcagaggtagacctataaaaactataagagatactattaag 6420605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31682880 - 31682618
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| |  |||  |||| |||||| |||| ||    
T  31682880 tagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaat 31682781  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  | || ||    
T  31682780 ggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatatttg 31682681  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31682680 gtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 31682618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 410
Target Start/End: Original strand, 42187582 - 42187707
Alignment:
Q  285 taaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatt-atggcgtaatttaatccat 383  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||| || |||| |||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42187582 taaaaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccat 42187680  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42187681 gtagccgaccccacttagtgggataag 42187707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25579429 - 25579233
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||| | ||||||||||    ||||| ||  ||||||| | || ||    
T  25579429 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactagat-----aggattagaaatgaccacattagagagag---tgggg-ag--tagcacccatagcag 25579341  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  || ||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||    
T  25579340 aaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaat 25579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28542069 - 28541959
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccactt 399  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  28542069 aaactattaagaaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccactt 28541970  T
Q  400 agtgggataag 410  Q
    ||| |||||||    
T  28541969 agttggataag 28541959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48735917
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac-aaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||| | ||||||     ||||||||| ||||||    
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttgggg-----tagcacctacagtaga 48736162  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    ||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||  ||||| ||| | ||  ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||    
T  48736161 aaagatgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg-gagtcagatc 48736063  T
Q  264 actagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacat 363  Q
    |||||||| || |  ||||  | ||||||| |||||||  ||| ||  |  | |||||| || ||||| || ||   | | ||||||||||| |||| |     
T  48736062 actagaggtagggctagaccttgaaaaactataagagaggctattagtagggttctagagataaatgagtttgagaaagacatggtttatga-agaatac 48735964  T
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48735963 tatggcgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataag 48735917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28208413 - 28208344
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208413 aaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28208344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 410
Target Start/End: Original strand, 29650389 - 29650650
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||     
T  29650389 agcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatg 29650488  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| |||||| | |  ||||| | ||||| ||   | |||||  |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| || |||  ||||||||    
T  29650489 gaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatgg 29650588  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650589 tttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 29650650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 259
Target Start/End: Original strand, 31005134 - 31005338
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  31005134 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtggggg-----ta 31005228  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  31005229 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 31005328  T
Q  250 aggatagtca 259  Q
    |||| |||||    
T  31005329 aggagagtca 31005338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40391954 - 40391845
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||| ||| |||| |||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  40391954 taagagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgaccc 40391855  T
Q  395 cacttagtgg 404  Q
    ||||||||||    
T  40391854 cacttagtgg 40391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 3457369 - 3457626
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| || |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||  |||||||    
T  3457369 tagcacttatagtagaaaagactgtg-aaactaggtttaggtggtttgggcattcagagagaagacatgtagatgttgtagtaatgagagtggatcagat 3457467  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||| |||||   |||||||||||||  |   |||    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | | |||||||| ||||||  ||||||     
T  3457468 ggagtatagt---atcactagaggcaatgattgacctagaaaaactataagaaaaactaattagaaagatcgaaagattaatgagttggatcaaaatatt 3457564  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||   ||| || |||||||||||||||    
T  3457565 gtttatgataaaacattatggcataatttgatcaatgtgagcga-cctacttagtgggataag 3457626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19262711 - 19262584
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  19262711 tagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagattt-gtagtaagaagagtagatcagat 19262613  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagag 276  Q
     |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19262612 ggagtgtagtcaaatcactagaggcagag 19262584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33350177 - 33349822
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||| | | ||||| |||      
T  33350177 taagtgtagcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgca-- 33350080  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  33350079 ---cctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 33349983  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  33349982 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 33349883  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||  ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33349882 gtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataag 33349822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34926645 - 34926538
Alignment:
Q  300 gaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||    || |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34926645 gaaactattaagaaagatctagagata---gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccactt 34926549  T
Q  400 agtgggataag 410  Q
    || ||||||||    
T  34926548 agcgggataag 34926538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 410
Target Start/End: Original strand, 41483506 - 41483753
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    |||||||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||| |  |||| ||| ||||||| |||| || |||| ||| |    
T  41483506 gtagaaaaaatgatggaaactcggcttaagtggtttgggcatgtagagaaatgacctttagatc-cgtactaaagagagtagatcatattgagggtagcc 41483604  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    | ||||| || ||||| |||||||  || ||||    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||  | ||||| | |||| |||    
T  41483605 aaatcaccaggggcaggggaagacc-tagaaaagg--aagagaaactattaagaaagatctagaaattaacgagttggatatagatatgatatatggtag 41483701  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41483702 aactttatggtgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 41483753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 7273283 - 7273366
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273283 aatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 7273366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 27648963 - 27649046
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648963 aatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 27649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 410
Target Start/End: Original strand, 33731998 - 33732098
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33731998 taagaaagatctaaagattaatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggc--aatttgatccatgtagccggtcccacttagtgggat 33732095  T
Q  408 aag 410  Q
    |||    
T  33732096 aag 33732098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40139079 - 40138964
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  40139079 taagagaaactattaagaaagatctagagattaatgcgtttgatagaaatatgacatatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccc 40138980  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||||||    
T  40138979 cacttagtgcgataag 40138964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 410
Target Start/End: Original strand, 5418094 - 5418340
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaatagg-tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||  |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  5418094 gtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagtagagtagatcaggtggaggatagt 5418193  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||        |||       |||||| ||||||||||  |||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5418194 cagatcactagaggcaaaggaagac------ctact-------aaactattaagaaagattaaga-gttaatgagttggaccgaaatatggtttatgata 5418279  T
Q  358 gaaca--------ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||        |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5418280 gaacattatggatttatggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataag 5418340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30814227 - 30814145
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814227 attaattagttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 30814145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 36239935 - 36239833
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| || |||| ||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36239935 aaaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgta 36239836  T
Q  387 gcc 389  Q
    |||    
T  36239835 gcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 401
Target Start/End: Original strand, 37976378 - 37976492
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  37976378 aaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgta 37976477  T
Q  387 gccgaccccacttag 401  Q
    ||| ||||| |||||    
T  37976478 gccaaccccgcttag 37976492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Original strand, 42969879 - 42969964
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42969879 ttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 42969964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Original strand, 47852268 - 47852353
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47852268 ttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataag 47852353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34035253 - 34035173
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34035253 aatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 34035173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 22349624 - 22349886
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||  |||  | || | ||||| |||||| |||| ||    
T  22349624 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaat 22349723  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataa-aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatat 346  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||| | ||  |||||| | |||||||| | ||| || ||| || |  | ||| | ||||||  |||| |    
T  22349724 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga-actaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataag 22349886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27022077 - 27021843
Alignment:
Q  52 taagtgtagcggga-tgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga---------aaattgg 140  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||         | |  |     
T  27022077 taagtgtagcggcaatgagaatgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagagagagagagagagaga 27021978  T
Q  141 ggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaa 240  Q
    | | |  ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   | ||   ||||||||| ||||     
T  27021977 gttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaaat---gattctatagtaaggacagtag 27021881  T
Q  241 atcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagga 278  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27021880 atctgatgggggatagtcagatcactagaggtagagga 27021843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Original strand, 33103101 - 33103192
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33103101 tagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 33103192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 239
Target Start/End: Original strand, 42187474 - 42187565
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagta 239  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||  |||||||||||||||    
T  42187474 tagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagattatgtagtaaggagagta 42187565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Original strand, 43281982 - 43282092
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| || |||||||||     
T  43281982 taagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcgtaatttgatctatctagccgacct 43282080  T
Q  395 cacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||    
T  43282081 cacttagtggga 43282092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515437
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataag 48515437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604813
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 4604813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 5335833 - 5336183
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||   ||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||     
T  5335833 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattagagagag--ttggggtagcat- 5335929  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
        ||| ||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| | ||  ||||| ||||||||| || |||| |    
T  5335930 ----ctatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatgg 5336025  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||  ||||| |||||| |||| || |||| ||  | ||||||  || |||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||   | | |||||    
T  5336026 aggggagtcaaatcactcgaggtaggggaaaaccttgaaaaac--tatgagatactattaagaatgatctagagattaatgagttggagaaagacatggt 5336123  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||| ||| | ||||||||  ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5336124 ttttgattgaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccga-cccacatagtgggataag 5336183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13859366 - 13859221
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  13859366 gatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 13859272  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13859271 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 13859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28562634 - 28562425
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| || ||||  ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  28562634 agtaaaaaagaatgtggaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatcagatagagaatagt 28562535  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg-tttatgat 356  Q
     |||| || ||||| |||||| |||    ||||| | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||| || ||||||   ||||||| ||||||||    
T  28562534 tagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaatatggttttatgat 28562435  T
Q  357 agaacattat 366  Q
    | ||||||||    
T  28562434 ataacattat 28562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 47652744 - 47652813
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47652744 aaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataag 47652813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891146
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 25891146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 322
Target Start/End: Original strand, 28020895 - 28021140
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||| |||| ||||||| || |||||||| | | |||||||||||     | ||  |||||||||||    
T  28020895 atgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagca-----cttatcgtagaaaagat 28020989  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||||||||| || |||| ||||  ||| | ||  |||||    
T  28020990 ggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagatttgtaggttctgtaataaggagagtagattagatggagg-gagttaaattgctaga 28021088  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctaga 322  Q
    || | ||||||||  ||||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||    
T  28021089 ggaaaaggaagac-ctaaaaaactataaaagaaacggttaagaaagatctaga 28021140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 399
Target Start/End: Original strand, 28858084 - 28858300
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaat-cagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | ||   ||||||| |||||| || ||||| ||| || |||| ||||||| || || || |||||    
T  28858084 ttaggtggtttgggcatgtagaaagatgacctgtggattctatagtaagaagagtagattcagatggagcattgtcaaatcactatagacaaagtaagac 28858183  T
Q  283 aataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
        ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||  | ||||||||||| |||||   | |||| ||| |    
T  28858184 ttagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctagagattaataagttggatagaaatattttatatgatagaacgttatgatctcatttgatcaa 28858283  T
Q  383 tgtagccgaccccactt 399  Q
    |||||||||||||||||    
T  28858284 tgtagccgaccccactt 28858300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2882838 - 2882759
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  2882838 attaatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtg 2882759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 6375075 - 6375134
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6375075 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 6375134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 410
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708647
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28708647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31681119 - 31681040
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31681119 aatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 31681040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 32631747 - 32631830
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32631747 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 32631830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 244
Target Start/End: Original strand, 33072885 - 33073052
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||    |||||     ||||||||| |||||||||| |    
T  33072885 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagag---tggggg----tagcacctatagtagaaaagtt 33072977  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatca 244  Q
    ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||  |||| | |||| ||||| |||||| ||||    
T  33072978 ggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatca 33073052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40149151 - 40149029
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |  ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  40149151 aaaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggtt-atgatagaacattatggcgcaatttgatctatgta 40149053  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||  |||||||||||||||||    
T  40149052 gccgaatccacttagtgggataag 40149029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30814848 - 30814775
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctaga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30814848 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaacactataagagaaactattaagaaagatctaga 30814775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40008682 - 40008562
Alignment:
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||| || | |||||||||| || |||| ||||||||| |     
T  40008682 agaaaagatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatgtagagataa-acctattgattttgttgaaaggagagtagattagatggaggatagttaa 40008584  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagac 282  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  40008583 atcattagaggtagaggaagac 40008562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 44401294 - 44401164
Alignment:
Q  257 tcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgat 356  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||    ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||  ||  ||||||| ||||||||    
T  44401294 tcagatcactagaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgat 44401197  T
Q  357 agaacattatggcgtaatttaatccatgtagcc 389  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44401196 agaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Original strand, 15682371 - 15682439
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15682371 aaatatgatttatgatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataa 15682439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24376103 - 24376043
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24376103 tggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtggga 24376043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 21078100 - 21078183
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  21078100 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgacttcatttagtgggataag 21078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 34745898 - 34746013
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| | || ||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  34745898 taagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgaccc 34745997  T
Q  395 cacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||    
T  34745998 cacttagtgggataag 34746013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38103752 - 38103631
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| ||||||| |||| || |||| |   ||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38103752 aaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaatttgatcc-tgta 38103655  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  38103654 gccgaccccagttagtgggataag 38103631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Original strand, 38606916 - 38607073
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||| ||||| | | ||||     ||    
T  38606916 taagtgtagcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtggggg-----ta 38607009  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  38607010 gcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 38607073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 38607175 - 38607258
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38607175 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaag 38607258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Original strand, 38920798 - 38920857
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38920798 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 38920857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 404
Target Start/End: Original strand, 7220838 - 7221016
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    ||||||  |||| |||| || ||| |||||| |||| ||    
T  7220838 tagtatggagagtagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagat 7220937  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    |||||  ||||||  | ||||  | | |||||||| |||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7220938 taatgtgttggataaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgg 7221016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 28355362 - 28355432
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag-ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  28355362 aaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccacttagtgggataag 28355432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29653817 - 29653625
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaagg---agagtaaatcagatagaggat 254  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||   | |||| |||||| ||  ||||||||    |||||  ||| |||  || ||    
T  29653817 agtagaaacgatggtgaaaactagatttaggttgtttgggcatgtatgaagaagatatgtagattatgtagtaagatgtagagttgatcggatgcagaat 29653718  T
Q  255 agtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    ||||| |||  ||||| |||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  29653717 agtcaaatcgttagagacagaagaagaccaagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttagatagaaatatg 29653625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 409
Target Start/End: Original strand, 30664723 - 30664833
Alignment:
Q  299 agaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||   || ||||||||||||| || | | || |||||| | |||||||||||||||| || |    
T  30664723 agaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcataacatggtttatgatacaatactttgacgtaatattatccatgtagccgacctcatt 30664822  T
Q  399 tagtgggataa 409  Q
    ||||| |||||    
T  30664823 tagtgagataa 30664833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869118
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 31869118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 48515475 - 48515541
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48515475 tatgatttatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataag 48515541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7189502 - 7189445
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7189502 gcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagaga 7189445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18605424 - 18605303
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   |||| |||||| || |||||||    
T  18605424 tagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatcagat 18605325  T
Q  248 agaggatagtcagatcactaga 269  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  18605324 cgaggagagtcaaatcactaga 18605303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 269
Target Start/End: Original strand, 18637566 - 18637687
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   |||| |||||| || |||||||    
T  18637566 tagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatcagat 18637665  T
Q  248 agaggatagtcagatcactaga 269  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  18637666 cgaggagagtcaaatcactaga 18637687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 269
Target Start/End: Original strand, 18651000 - 18651121
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   |||| |||||| || |||||||    
T  18651000 tagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatcagat 18651099  T
Q  248 agaggatagtcagatcactaga 269  Q
     ||||| ||||| |||||||||    
T  18651100 cgaggagagtcaaatcactaga 18651121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029692
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataag 34029692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36869522 - 36869457
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  36869522 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagac 36869457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 213
Target Start/End: Original strand, 41948453 - 41948585
Alignment:
Q  77 cattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtgga 175  Q
    |||||||||| || ||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| || | |||| ||||||     | || | ||||||||||||||||    
T  41948453 cattggatgtctgataaaactaaacgagatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagca-----cttacaatagaaaagatggtgga 41948547  T
Q  176 aaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41948548 aactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45054381 - 45054320
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45054381 gtttatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttggttggataa 45054320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 48919309 - 48919378
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48919309 aaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttaatgggataag 48919378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Original strand, 6263477 - 6263525
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263477 attatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 6263525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24177711 - 24177644
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24177711 aaatatggtttatgatagaacactatggcgtca-ttgatccatgtagccaaccccacttagtaggataa 24177644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 338
Target Start/End: Original strand, 30144793 - 30144969
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||   ||||| | |||||| ||||||| |||| | |||| |    
T  30144793 gaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagggtggtcaaa 30144892  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggat 338  Q
    ||||||||| || |  |||||    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30144893 tcactagagacaaaataagacctataaaaactattcgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat 30144969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26332959 - 26332908
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga 391  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26332959 gaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 38900140 - 38900222
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38900140 aatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataag 38900222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 410
Target Start/End: Original strand, 40830319 - 40830467
Alignment:
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggat-tgaaatatggtttatgataga 359  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| || ||  ||||| | |||||||||    
T  40830319 atcactagagacagaggaagacctagaaaatctataagagaaactattaagaaggatctagaaattaatgagttgtatatg--atatgatatatgataga 40830416  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| || |   ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  40830417 acattacggaggcgtttgatccatgtagccaacccctcctagtgggataag 40830467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Original strand, 33871476 - 33871538
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||| |||||||||||||    
T  33871476 gtttatgatagaacattatggcgtaatttcatccatgtaattgagcccagttagtgggataag 33871538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 383
Target Start/End: Original strand, 35922397 - 35922492
Alignment:
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  35922397 aaaaaacttt--gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 6374872 - 6374937
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  6374872 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac 6374937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21517519 - 21517430
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| | ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21517519 aaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45841256 - 45841125
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || | ||| ||||  ||| |||| ||||||  |||||||||| ||    
T  45841256 cacctataatagaaaagacggtggaaactaggtttagttggtttgggcatgcagtgagatgacctgtacattttgtagcaaggagcataaatcagatgga 45841157  T
Q  251 ggatagt---cagatcactagaggcagaggaa 279  Q
    |  ||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  45841156 gcgtagtcgccagatcactagagacagaggaa 45841125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Original strand, 7273046 - 7273114
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  7273046 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtag 7273114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119441
Alignment:
Q  241 atcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg 340  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  || |||||| | ||||||||||  ||||  |||||||| || ||||| || ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagacc-tagaaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    | | |||| || ||||| |||| |||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 19119441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 270
Target Start/End: Original strand, 23720847 - 23720967
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||| || || ||  ||||| ||||  | | ||||||||||| |||||||      
T  23720847 gcacctatagtagaaaagatggcggagactagccttaggtggtttgggcatgcagggaaaatgcatgtgggttgtggaataaggagagtagatcagatgt 23720946  T
Q  250 aggatagtcagatcactagag 270  Q
    ||| |||||| ||||||||||    
T  23720947 agggtagtcaaatcactagag 23720967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 27021795 - 27021743
Alignment:
Q  356 tagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27021795 tagaacattatggcacaatttgatccatgttgccgaccccacttagtgggata 27021743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Original strand, 6682552 - 6682619
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6682552 atatggtttatgatagaacattattttggtgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 6682619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19262587 - 19262476
Alignment:
Q  297 agagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccca 396  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||| |||||||| |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||   ||| || |||||| ||||| |||    
T  19262587 agagaaactatttagaagcatctagagattaatgagttggatagggatatgatatatgatagaacattatggcggtgtttgattcatgtaaccgacgcca 19262488  T
Q  397 cttagtgggata 408  Q
    ||| ||||||||    
T  19262487 cttggtgggata 19262476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 33073112 - 33073195
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33073112 aatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 33073195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 410
Target Start/End: Original strand, 44951342 - 44951421
Alignment:
Q  331 acttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||    
T  44951342 acttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatacttagtggtataag 44951421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8492576 - 8492252
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||  ||||| |||| | |||||||| ||     |||| |||| ||| |||||| ||||    
T  8492576 ttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaaca-----cctatagtaaaaatgatggtagaaa 8492482  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| | ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| | | ||||||   |||||| ||||||| |||||  || |||| |  ||||| ||||     
T  8492481 ataggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagaga 8492382  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    ||||| |  ||||| | ||| |   |||  || ||||||| ||||  |||| || ||||||  | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||     
T  8492381 aagaccacgaaaaattataata---actgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttg 8492285  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  8492284 atcaatgtaactaaccccacttagtgagataag 8492252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28542254 - 28542173
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagag 132  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  28542254 taagtgtagcggagatgagggtgttgcgttggatgtgtggtaagactag-tgggatagaattagaaatggcaatattagagag 28542173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30914632 - 30914518
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||| |||||||| |||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||    ||| |||||| | ||| |||||    
T  30914632 aagagaaactatcatgaaggatctagagattaatgagttggatagggatatgatatatgatagaactttatggcagcgtttgatccatattgccaacccc 30914533  T
Q  396 acttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||    
T  30914532 acttagtgggataag 30914518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281152
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccg-gaccacttagtgggataag 33281152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 406
Target Start/End: Original strand, 40630654 - 40630696
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630654 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 40630696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 343
Target Start/End: Original strand, 41461206 - 41461298
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaat---aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  41461206 tagtcaaatcactagaggcagaggaggacgacccaaaaaaactataagagaaactattaataaagatctagtgattaatgagttggatagaaa 41461298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 42177190 - 42177037
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||||    |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||  ||  ||||||||| |||    
T  42177190 tagtcaaatcattagaggtggaggaagacgtagaaaacctataagagaatctattaagaaagatctagagataaatgagtttcataaaaatatggtatat 42177091  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||| |||||||||| |||  ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  42177090 gattgaacattatgacgtcgtttgatctatgtaatcga-cccacttagtgggata 42177037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 410
Target Start/End: Original strand, 47604030 - 47604132
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||| |||||| | ||||| ||  ||| || |||||||  |||| |||||| ||||||    
T  47604030 taagaaagatctagatattaatgagtttgagagaaatatggtatataatagaatactatggtgttgtttgatacatgtagttgacctcacttaatgggat 47604129  T
Q  408 aag 410  Q
    |||    
T  47604130 aag 47604132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594018
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 14594018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013541
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 16013541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158687
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataag 20158687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 23404614 - 23404667
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  23404614 aaatatggtgtatgatagaacattatggtgtaattttatccgtatagccgaccc 23404667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25826824 - 25826759
Alignment:
Q  68 agaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagag 132  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25826824 agaatgttgtattggatatgtggtaagaccatacgagataggattagaaatgaaaacattagagag 25826759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 410
Target Start/End: Original strand, 31005434 - 31005471
Alignment:
Q  373 atttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005434 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 31005471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 400
Target Start/End: Original strand, 40415174 - 40415263
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    ||||||| ||||  ||||||| || |||  ||||||| |||||||| ||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40415174 gaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccactta 40415263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 403
Target Start/End: Original strand, 6072219 - 6072311
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||| || |||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  6072219 gaaagatctagagtttaattagttgaatcgaaatatgatttatgacagaatattatgacgtagtttgatacatgtagctgaccacacttagtg 6072311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 218
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220818
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgta 218  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacgtgta 7220818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 247
Target Start/End: Original strand, 15310679 - 15310767
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||||||| |||| | |||  ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15310679 gtagaaaagatggtggaaacttggtttaggttgtttttgcaggtagagagaagaaaggtaaattctgtagtaaggagagtagatcagat 15310767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Original strand, 17759483 - 17759539
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17759483 gatagaacactatggtgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 17759539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24425670 - 24425582
Alignment:
Q  322 atattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||   ||| ||||| ||||||||||    
T  24425670 atattaatgagttggatctaaatatggtttatagtagatcattatggtgtaatttgatccacgtagtaaaccacactttgtgggataag 24425582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Original strand, 29312207 - 29312255
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  29312207 attatggcgtaatttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataag 29312255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32368535 - 32368407
Alignment:
Q  228 gtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatta 327  Q
    ||||||||| || ||| |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||     |||| || |||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||    
T  32368535 gtaaggagaatagatcggatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaaggaagatctagaaaatctataagagaagctattaaggaagatttagagatta 32368436  T
Q  328 atgacttggattgaaatatggtttatgat 356  Q
     ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  32368435 gtgagttggatcgaaatatggtatatgat 32368407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6429222 - 6429155
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagat-ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagaca 214  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  6429222 tagcacctatagtagaaaaggcaggtgaaaaataggtttaggtggtttgggcatgccgagagaagaca 6429155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 387
Target Start/End: Original strand, 6807400 - 6807447
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  6807400 gaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtag 6807447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8519129 - 8519062
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  8519129 atatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgagataag 8519062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20525107 - 20525068
Alignment:
Q  371 taatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20525107 taatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataag 20525068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 366
Target Start/End: Original strand, 28359340 - 28359476
Alignment:
Q  227 agtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcact-agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||| ||| |    ||||| | ||||||||| || |||||    |||||| ||    
T  28359340 agtaaggagagtatatcagatggagggtagtcaaatcacttagaggtagagaaagtcctagaaaaattataagagaaaatattaaga----tctagagat 28359435  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
    |||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28359436 taattaattggatagaaaaatggtatatgatagaacattat 28359476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29318858 - 29318811
Alignment:
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29318858 ttatagcgtaatttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataag 29318811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30997684 - 30997629
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatc 380  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  30997684 ttaatgaattggatcgaaatatggtttacgattgaacattatgacctaatttaatc 30997629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32879295 - 32879208
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttat-gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  32879295 attaatgagttggatccaaatatggttaaaagatggaacattagggcgtaatttgatccttgtagccgaccctgcttagttggataag 32879208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 386
Target Start/End: Original strand, 45903913 - 45903956
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  45903913 atatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcaatgta 45903956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Original strand, 9796288 - 9796350
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9796288 gtttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgacctcacttaatgggataag 9796350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Original strand, 14593685 - 14593755
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  14593685 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagaga 14593755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 409
Target Start/End: Original strand, 24777168 - 24777226
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24777168 tatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataa 24777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28542163 - 28542125
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttggg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28542163 gtagaaaagatggtggaaaatagccttaggtggtttggg 28542125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29653904 - 29653854
Alignment:
Q  72 tgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  29653904 tgttgcgttggatgtgtggtaacactagacgggatagaattagaaatgaca 29653854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 36651918 - 36651976
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  36651918 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgaca 36651976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37439487 - 37439457
Alignment:
Q  368 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439487 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 37439457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40008533 - 40008447
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||| || | ||| | ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  40008533 attaatgagttggatagagacatgatatatgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataag 40008447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 46938863 - 46938813
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga 391  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  46938863 aaatatggtttatgatataatattatgacgtaatttgatacatgtagccga 46938813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5577587 - 5577538
Alignment:
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatt 375  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5577587 taatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatt 5577538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Original strand, 6807700 - 6807757
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||  | | || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6807700 tgatagaacattatggcgtcgtatgattcatgtaggtgaccccacttagtgggataag 6807757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797895
Alignment:
Q  174 gaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggag 235  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagattttgaagtaaggag 9797895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244299
Alignment:
Q  381 catgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataag 21244299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25731559 - 25731490
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  ||| |||||||||    
T  25731559 aaatatggtttcgaatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagcagacctcgtttaatgggataag 25731490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27021837 - 27021792
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27021837 tagaaaagatggtgaaaactaggcttaggtgggttgggcatgtaga 27021792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 32789995 - 32789958
Alignment:
Q  368 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32789995 gcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggg 32789958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Original strand, 34614011 - 34614052
Alignment:
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34614011 ttatggcgttagttaatccatgtagccgaccccacctagtgg 34614052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 37595630 - 37595679
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattag 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  37595630 atgagaatgttgcattgaatatgtagtaagactagacaagataggattag 37595679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40139257 - 40139204
Alignment:
Q  81 ggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40139257 ggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagaga 40139204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44176784 - 44176728
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||    
T  44176784 agtagaaaagatggt-gaaaatagatttatgtagtttgggcatatagagaaaagacat 44176728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Original strand, 44779135 - 44779220
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  44779135 ttaatgagttggatctgaatatggtttagcatagaataatatggcctaatttaatttatgtagccgaccccgcttaatggaataag 44779220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1531551 - 1531419
Alignment:
Q  236 agtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttg 335  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||  ||||| ||||||||||   |||||||| ||||  ||| || || |||| || ||||  ||||||| |||    
T  1531551 agtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttg 1531452  T
Q  336 gattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    ||   |||||||||||  |||||||||||||||    
T  1531451 gacccaaatatggtttgggatagaacattatgg 1531419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Original strand, 16013208 - 16013244
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16013208 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 16013244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23087178 - 23087118
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  23087178 tttatgatagaacaatatgacgtattttggtccatgtagtcgaccccactttgtgcgataa 23087118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36245340 - 36245272
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||    
T  36245340 aatatggtatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccacgtagtcgatcccacatagttggataag 36245272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36245586 - 36245522
Alignment:
Q  244 agatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactact 308  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||||||||||    
T  36245586 agatggagggtagtcacatcactagagacagaggaagacctataaaaactataagagaaactact 36245522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36869343 - 36869253
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatg-------tagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| || |||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||       |||||||||||||||| |||||||||    
T  36869343 aatgagttagattcaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataag 36869253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47155217 - 47155189
Alignment:
Q  381 catgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47155217 catgtagccgaccccacttagtgggataa 47155189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47700123 - 47700087
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47700123 gaaccttatggcgtaatttgatccatgtagccgaccc 47700087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 156)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Original strand, 14667696 - 14668037
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaa-attggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaa 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | |  | | | |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14667696 ttggatgtgtgataagactagatgaggtagaattagaaatgacaatattagagagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaa 14667795  T
Q  177 aataggtttaggtggtttggg--------catgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactag 268  Q
    |||||  ||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||    
T  14667796 aatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacattatgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactag 14667895  T
Q  269 aggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    |||||| ||||  |    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  14667896 aggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatgg 14667995  T
Q  369 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14667996 tgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataag 14668037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7359534 - 7359281
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7359534 cacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatgga 7359436  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  7359435 ggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaaatctagagattaataagttggatcgaaatatggtt 7359336  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7359335 tacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7359281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 388
Target Start/End: Original strand, 6888932 - 6889237
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||||||     | || ||  ||||||||||||||||    
T  6888932 ttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagca-----cgtatagaggaaaagatggtggaaa 6889026  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||  || ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  6889027 ataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagagg 6889126  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    ||| |    ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| | ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6889127 aaggcctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 6889226  T
Q  378 atccatgtagc 388  Q
    |||||||||||    
T  6889227 atccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 43475244 - 43475505
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  43475244 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcagat 43475343  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||||||||||||||||| ||| | | | | || ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  43475344 ggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaac-atagaaaaacttaagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatatg 43475442  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||||    
T  43475443 atttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataag 43475505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 409
Target Start/End: Original strand, 7678404 - 7678742
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagca-cctaaagta 161  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | | |  | | | | |||||| |||| ||||    
T  7678404 gatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatagta 7678503  T
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||| ||||||||||   || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||     ||| |||||||||||||    
T  7678504 gaaaa-atggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagta-----gatggaggatagtcaga 7678595  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||    
T  7678596 tcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aac 7678694  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678695 attatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 7678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 409
Target Start/End: Original strand, 30588465 - 30588712
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||| || |  | |||||||||||    
T  30588465 tagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagataa--tggaggatagtca 30588562  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
    | |||| |||| || ||||||||    ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30588563 ggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataataga 30588662  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30588663 acattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 410
Target Start/End: Original strand, 6859345 - 6859647
Alignment:
Q  104 gataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgt 202  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||     |||| |||  | |||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||    
T  6859345 gatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagca-----cctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgt 6859439  T
Q  203 agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaa 302  Q
    ||||| ||||| ||| | ||  ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||    
T  6859440 agagagaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaa 6859539  T
Q  303 actactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||| || ||||||| || | |||| | ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  6859540 actattaggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagt 6859639  T
Q  403 gggataag 410  Q
    ||||||||    
T  6859640 gggataag 6859647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12577061 - 12576877
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  12577061 gtagtaaggagagtagatcagatggagggtagtcctatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagaga 12576962  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12576961 ttaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataa 12576877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 410
Target Start/End: Original strand, 9235162 - 9235312
Alignment:
Q  257 tcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgat 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  9235162 tcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaact--aagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgat 9235259  T
Q  357 agaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9235260 agaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataag 9235312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 38684971 - 38685233
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  38684971 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaat 38685070  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||    
T  38685071 ggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 38685170  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38685171 gtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 38685233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 376
Target Start/End: Original strand, 14749267 - 14749539
Alignment:
Q  100 atgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggc 198  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |     ||||||||| |||||||||  |||| |||| |||  |||| |||||||| |    
T  14749267 atgagataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtg-----tagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggac 14749361  T
Q  199 atgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaag 298  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||  || |||||||||||  ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||    
T  14749362 atgtagagagaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataag 14749461  T
Q  299 agaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14749462 agaaactatcaagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 14749539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 406
Target Start/End: Original strand, 79521 - 79775
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagag 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||  ||||||||||||||  |||| || |||    
T  79521 acctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaaggagagtcgatcaaatggag 79620  T
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    ||| ||| |||||| |||||| |||||||||    ||||||| | ||| |||||| || ||| ||| | || ||||||||  ||||  ||||||||||      
T  79621 gatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatgagctggaccgaaatatggtgc 79720  T
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  79721 atgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtggga 79775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 11675672 - 11675796
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg-aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||| |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11675672 aaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgt 11675771  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  11675772 agccgaccccacttagttggataag 11675796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 376
Target Start/End: Original strand, 32516497 - 32516787
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||||||   |||| ||| ||     | || ||||||||||||||||||||    
T  32516497 ttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagag--ttggagtaaca-----cttatagtagaaaagatggtggaaa 32516589  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| ||||||||||| | | |||| ||| || |||||||| ||  |||||| |||||||| ||| |||  |||||| |||||| || ||||| |||||    
T  32516590 ataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagagg 32516689  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||    |||| |||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32516690 aagac-ctaaaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaattt 32516787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 337
Target Start/End: Original strand, 42199300 - 42199479
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| || |||  ||||    
T  42199300 agtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagt 42199399  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgga 337  Q
    || |||||||| || |||| |||||    ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42199400 caaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaagatctagatattaatgagttgga 42199479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 402
Target Start/End: Original strand, 6788148 - 6788325
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | | || ||||| || ||||||  | || |    
T  6788148 gtagtaaggagagtcgaccagatggaggatggtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaa 6788247  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  6788248 ttaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattatagcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagt 6788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1287857 - 1287595
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  1287857 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 1287758  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  1287757 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 1287658  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1287657 gtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 1287595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 4496388 - 4496650
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  4496388 tagcacctatagtagaaaagctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 4496487  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  4496488 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 4496587  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496588 gtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 4496650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12492758 - 12492400
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||| | | |||||||||      
T  12492758 taagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcac- 12492660  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
     |  ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  |||  |||| |||||| |||| || |    
T  12492659 -ctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatgg 12492561  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  12492560 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 12492461  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492460 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataag 12492400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 408
Target Start/End: Original strand, 29938131 - 29938374
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||| ||||| ||||| ||  || ||||||| |||| ||  |||  ||||||||||    
T  29938131 tagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggatagtca 29938230  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    |||||||    ||||||||| || ||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29938231 gatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg-taga 29938325  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29938326 acattttggtgtaagttggtccatgtagccgaccccactcagttggata 29938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 3301848 - 3302110
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| || || ||| | ||||| ||    
T  3301848 tagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaat 3301947  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||   | |||||  | |||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||    
T  3301948 ggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 3302047  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3302048 gtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 3302110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 418149 - 418052
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  418149 gaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtgggata 418052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2075845 - 2075489
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| | | |||||| ||      
T  2075845 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaaca-- 2075748  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  2075747 ---cctacagtagaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 2075651  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaag-atctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     | |||| | |||||||| | ||  |||| || ||||  | ||||| ||||||  |||| |||    
T  2075650 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg 2075551  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2075550 tgtatgatagaatactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataag 2075489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16347749 - 16347396
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |  |||||||||| |   |||||||||      
T  16347749 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagca-- 16347652  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  | | | ||| |||||| |||| || |    
T  16347651 ---cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatgg 16347555  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||| | |  ||||| ||||||||||     |||||| | | |||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||||    
T  16347554 aggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggt 16347455  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347454 ttatgatagaacact--ggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataag 16347396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 1275189 - 1275530
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||      ||||||||| |||||    
T  1275189 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggg------tagcacctatagtag 1275282  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||  |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  1275283 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 1275382  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  || || ||||||||||    ||||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  ||||| | ||| ||  |||| |||| | ||||||||||    
T  1275383 taacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaaca 1275482  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275483 ttatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 1275530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 29922427 - 29922550
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||  | ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29922427 aaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatggcgtaatttgatccatgta 29922526  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29922527 gccaacctcacttggtgggataag 29922550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43558093 - 43557849
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |   | |||||| |||||| || ||||| | ||| ||||    
T  43558093 tagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaagaagagtagattagataaatgatggtca 43557994  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
     ||||||||| |  || || |||    ||||||| ||||||||||       |||||| | || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43557993 tatcactagatg--gatgatgacctagaaaaactataagagaaaccgt----aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgataga 43557900  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43557899 acattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 43557849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 337
Target Start/End: Original strand, 2712948 - 2713137
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||  |||  |||||||||| |||||||    
T  2712948 tagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggagagtagatcagat 2713047  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgga 337  Q
     ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  2713048 ggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttgga 2713137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 276
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093884
Alignment:
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatc 263  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtcagatc 21093871  T
Q  264 actagaggcagag 276  Q
    |||||||| ||||    
T  21093872 actagagggagag 21093884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 409
Target Start/End: Original strand, 23979973 - 23980209
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagag 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||   ||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| || || ||||    
T  23979973 gtggaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagag 23980070  T
Q  271 gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcg 370  Q
    | | ||| ||||    || |||  |||||||||||| | |||| ||| || | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |     
T  23980071 gtataggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgaca 23980170  T
Q  371 taatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    || || ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23980171 tatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataa 23980209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 20456777 - 20457039
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  20456777 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 20456876  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||| | ||| ||  |||| ||    
T  20456877 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaatttg 20456976  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20456977 atgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 20457039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28977137 - 28976875
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||  |  ||| ||||| || ||| |||| ||    
T  28977137 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaat 28977038  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  28977037 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 28976938  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28976937 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 28976875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 5558338 - 5558407
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5558338 aaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 5558407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15489759 - 15489602
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    |||||||||||||| |||| |  | |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||     
T  15489759 gtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtattaaggagagtagattagatggaggatagtt 15489660  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaaga 316  Q
      ||||||||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15489659 gaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactattaagaaaga 15489602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18351186 - 18350921
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggca-tgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcaga 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  | | ||||||||||| |||| |    
T  18351186 tagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagattatgcaataaggagagtagatcaaa 18351087  T
Q  247 tagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatc-------tagatattaatgacttggatt 339  Q
      |||| || ||| ||||||||||| ||||||| |   || ||| || |||||||||||| ||||||| |||       |||| |||||||| ||||||     
T  18351086 aggagggtaatcaaatcactagagg-agaggaaca-tctagaaagctataagagaaactattaagaaaaatctagactatagagattaatgagttggata 18350989  T
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  18350988 gaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgacctcacatggtgggat 18350921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 18855804 - 18855873
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855804 aaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 18855873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Original strand, 27998584 - 27998705
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | || ||| | |||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||    
T  27998584 aaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttagataggaacatgatatatgatagaatattatgacgtcgtttgatccatgta 27998683  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggata 408  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  27998684 accgaccccacttagtgggata 27998705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32442226 - 32442141
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32442226 ttaatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataag 32442141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 409
Target Start/End: Original strand, 38684484 - 38684745
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| ||   |||  ||||||  ||||||||||| ||||| |||   ||   |||||||||||||| || ||||    
T  38684484 tagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaagacctgtgtattctatagtaaggagagtatattagat 38684583  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||  | ||  ||||||||| | | ||||||||    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  38684584 ggaggggattccaatcactagatgtaaaggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagttggatagaaatatg 38684683  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  38684684 gtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataa 38684745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 14665718 - 14665978
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||| ||| || | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  14665718 tagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaat 14665817  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||| | |||||| | |  ||||| ||||| ||||     |||||| | |||||||| | || |||  || ||||  | ||||| ||||||  |||||||    
T  14665818 ggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatg 14665917  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665918 gtttatgatagaac--tctggcgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 14665978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 330
Target Start/End: Original strand, 21952275 - 21952541
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aatt--agagagaaaattggggtagcatagcacctaaagt 160  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||  |||||||   |||||||| || | |||||| |||    
T  21952275 gatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacaca-cacctatagt 21952373  T
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |||||||||||  |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| ||| | ||| | ||   ||||||||||| || ||||||| ||||  |||||     
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaa 21952473  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatg 330  Q
    ||||||||||| || |||||||    ||||||  || ||||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  21952474 atcactagaggtaggggaagacctagaaaaac--tatgagaaactattgagaaggatctagagattaatg 21952541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15252846 - 15252760
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15252846 attaacgagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 15252760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 400
Target Start/End: Original strand, 24178421 - 24178766
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |   ||||||||||  |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  24178421 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 24178515  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  24178516 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 24178615  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| | ||    
T  24178616 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagt 24178715  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
     |||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24178716 gtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccgaccccactta 24178766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 410
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27800094
Alignment:
Q  193 ttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaac 292  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||| || |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||         |    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagac---------c 27799982  T
Q  293 tttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
    |   ||| |||||| ||||||||| || || |||||||  |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||    
T  27799983 t---agaaaaactattaagaaagaacttgagattaatgttttggatcgaactatggtt---gatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaac 27800076  T
Q  393 cccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27800077 cccacttagtgggataag 27800094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 10639208 - 10639568
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca-- 147  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||| |||||      
T  10639208 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacc 10639307  T
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||    ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |  | | ||||| |||||| | || ||    
T  10639308 tatagactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaat 10639407  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||||  ||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  10639408 ggagga--gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 10639505  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10639506 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataag 10639568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 38132542 - 38132602
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38132542 ttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataag 38132602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Original strand, 5303587 - 5303713
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatat--ggtttatgatagaacattatggcgtaattt-aatccat 383  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  5303587 aaaaactgtaagagaaactattgaaaaagatttagagtttaatgagttggatagaaatatatggtatatgatagaatattatggcgttgttttaatccat 5303686  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5303687 gtagccgatcccacttagtgggataag 5303713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13561485 - 13561402
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561485 aatgagttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 13561402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 29816565 - 29816648
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816565 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 29816648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 30213758 - 30213841
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30213758 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 30213841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 410
Target Start/End: Original strand, 20367049 - 20367159
Alignment:
Q  300 gaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  20367049 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccactt 20367148  T
Q  400 agtgggataag 410  Q
     || |||||||    
T  20367149 ggtaggataag 20367159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26884952 - 26884705
Alignment:
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| | | || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |     
T  26884952 gaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcggg 26884853  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaa-tatggtttatgatagaa 360  Q
    |||  ||||| |||||| ||      ||||||  |||| |||||| || ||||||| ||||  ||||||  | ||||  ||| |||| ||||||||||||    
T  26884852 tcaaaagaggtagaggatgagctaggaaaact--aagaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaa 26884755  T
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26884754 cactacgacgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataag 26884705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28187026 - 28186944
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  28187026 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagagaaggttggggtag 28186944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 341 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41833742 - 41833676
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  41833742 aaatatggtttatgatagaacattttggtgtaatttaatccatgtagctgaccccgcttagtgggat 41833676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860100
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataag 5860100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640523
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataag 7640523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15986989 - 15986892
Alignment:
Q  174 gaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagagg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||   |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15986989 gaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagagg 15986892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 357
Target Start/End: Original strand, 28676599 - 28676807
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||  || ||||||| | || || ||||    
T  28676599 tagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatattagat 28676698  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     |||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||    ||||||| |||||||||| | || ||||||  |||||||||| || || |||| ||||||     
T  28676699 ggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaattatgaaagaattagatattaacgagttagatt-aaatata 28676797  T
Q  348 gtttatgata 357  Q
     |||||||||    
T  28676798 atttatgata 28676807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 385
Target Start/End: Original strand, 43035062 - 43035222
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata-aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagat 323  Q
    |||||| |||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||  |  ||||||||| || |||| || | ||     
T  43035062 gtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaaga-actagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaa 43035160  T
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43035161 atttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2915572 - 2915512
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2915572 ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 2915512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386606
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 27386606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 336 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41108819 - 41108752
Alignment:
Q  336 gattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41108819 gattgaaatctggttcatgatagtacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtg 41108752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 42576217 - 42576276
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42576217 tatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataag 42576276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 393
Target Start/End: Original strand, 1525659 - 1525893
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||  ||   ||  | ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  1525659 gtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatggaggagagtc 1525758  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    ||||||||||||| || || ||||    |||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||| || ||||| |||||   | | ||||||| ||||||    
T  1525759 agatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatag 1525858  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    |||  ||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  1525859 aacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgacc 1525893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 410
Target Start/End: Original strand, 2090557 - 2090679
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| ||||||||| || || ||||||| ||||  |||||||  | |||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||     
T  2090557 aaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtac 2090656  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| | |||||||||||    
T  2090657 ccgaccccattgagtgggataag 2090679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10083098 - 10082926
Alignment:
Q  62 gggatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagt 160  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| ||     |||| |||    
T  10083098 gggatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatca-----cctatagt 10083005  T
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagta 239  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||||| |||||||    
T  10083004 agaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagta 10082926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11002779 - 11002645
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  | || |||     ||||||||| |||||    
T  11002779 gatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag--agttcggg-----tagcacctacagtag 11002687  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtag 204  Q
    |||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11002686 aaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31636198 - 31636076
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||  || | | | ||||||||||||||| || ||||    
T  31636198 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagat 31636099  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagag 270  Q
     | ||  ||||| ||||||||||    
T  31636098 ggtggggagtcaaatcactagag 31636076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 683786 - 683717
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  683786 aaatatggtttatgatagaacattatgttgtagtttgatccatgtagccaaccccacttagcgggataag 683717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16913982 - 16913898
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16913982 aatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataag 16913898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 406
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985345
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 28985345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 41894279 - 41894339
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41894279 ttatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 41894339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272743
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 42272743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 402
Target Start/End: Original strand, 28025 - 28140
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| | ||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  28025 aaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataatttgatacatgta 28124  T
Q  387 gccgaccccacttagt 402  Q
    || ||||||| |||||    
T  28125 gctgaccccatttagt 28140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1104788 - 1104730
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  1104788 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcaatg-agtcgaccccacttagtgg 1104730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3442986 - 3442887
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||   | | ||||||| |||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3442986 gaaagatctagagattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataag 3442887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Original strand, 9234999 - 9235062
Alignment:
Q  70 aatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9234999 aatgttgcattggatgtgtggtaagactagacgggataggattataaatgacaacattagagag 9235062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9917692 - 9917529
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||| ||||||| || |||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||     
T  9917692 ttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatgacc 9917593  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
       ||||||| | |||||||||| | |||||||| |||| || ||||| |||||| || |||||    
T  9917592 tagaaaaactattagagaaactatttagaaagatatagagatcaatgagttggatagagatatg 9917529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11069243 - 11069180
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  11069243 atggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgggata 11069180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 410
Target Start/End: Original strand, 28411847 - 28411942
Alignment:
Q  315 gatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| || |||||||||||   ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28411847 gatctagagataaatgacttggagaaaaacatgttttctgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataag 28411942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41833848 - 41833761
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||| || |||||||    
T  41833848 tagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagacctgtaggttctgttttaaggagaatagatcagat 41833761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 408
Target Start/End: Original strand, 12534410 - 12534476
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  12534410 aatatggtttataatagaacattatggcgtaatttgatccatttagttgaccccagttagtgggata 12534476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 410
Target Start/End: Original strand, 14911340 - 14911438
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14911340 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataag 14911438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21193754 - 21193668
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  21193754 attaaagagttggatagaaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataag 21193668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38341760 - 38341476
Alignment:
Q  83 atgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-----attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||      | ||||||| || |||||||||||      ||| |||||||||||  |||||||    
T  38341760 atgtgtggtaagactatacgagataggtttagaaatgacattagagactagagaggaagttggggtagcag-----ctatagtagaaaagacagtggaaa 38341666  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||        |||| | ||  ||||||||||| ||| | ||||| ||||  | ||  ||||||||||  ||| |    
T  38341665 ataggcttaggtggtttgggtatgttga--------atgttgattatgtagtaaggagggtagaccagatggagggcaatcgaatcactagagttagatg 38341574  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||    || |||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38341573 aagacttagaagaactataagagaaactattaagaa-gatatagagattaat---ttggatcgaagtatggtttatgatagaacattatgacgtaattta 38341478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41110099 - 41109888
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||       | | |||||||||||| |||      
T  41110099 gatgaaaatgttgcgctggatgtgtagtgagactagatggaataggattagaaatgacaacactagagaga-------gttggcatagcacctatagtta 41110007  T
Q  163 aaaagatggtgg---aaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||   ||| | |  ||||||||||||  |||||||||| ||| | | ||| ||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  41110006 aaaagatggtggtggaaactggccttaggtggtttgaacatgtagagagaaggcctatagattttgtagtaaggatagtagatcggatggaggatagtca 41109907  T
Q  260 gatcactagaggcagagga 278  Q
      ||||| |||||||||||    
T  41109906 attcactggaggcagagga 41109888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 684033 - 683980
Alignment:
Q  81 ggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  684033 ggatgtgtggtaagactagatgagatagaattagaaatgacaatattagagaga 683980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 410
Target Start/End: Original strand, 28276427 - 28276504
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28276427 ttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccacttagcgggataag 28276504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 33667220 - 33667285
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33667220 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15588527 - 15588406
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||||||||| ||   ||||| |||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  15588527 aaaaactataagagaaactattat--aagatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgta 15588430  T
Q  387 gccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  15588429 gccgaccctacttagtgggataag 15588406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408510
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 408510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4026673 - 4026527
Alignment:
Q  83 atgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatagg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  |  ||||| | |||||||| ||     | ||||||| ||||||||||||||| |||     
T  4026673 atgtgtggtaagactagatgagataagattaaaaacgagaacatgaagagagagttggggtaaca-----cgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagt 4026579  T
Q  183 tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaagga 234  Q
     ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  4026578 cttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaagga 4026527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 247
Target Start/End: Original strand, 25937973 - 25938072
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  25937973 tagcatctatagtagaaaaaatggtggaagaaaggtttaggtggtttgagcatatagagagaaaatttgttggttatgtagtaaggagagtagatcagat 25938072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30639787 - 30639732
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30639787 atagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataag 30639732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39322142 - 39322095
Alignment:
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39322142 ttatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 39322095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41200421 - 41200362
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41200421 tatgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataag 41200362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18132002 - 18131952
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18132002 tagaaaagatggtggaaaattgatttaggtggtttgagcatgtagagataa 18131952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28186907 - 28186798
Alignment:
Q  294 ttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| || |||||       |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  28186907 ttaagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggatagagatatg-------atagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgacc 28186815  T
Q  394 ccacttagtgggataag 410  Q
    | ||| | |||||||||    
T  28186814 ctactcaatgggataag 28186798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 406
Target Start/End: Original strand, 38830516 - 38830581
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38830516 gaaatatgatgtatgatagaacattatagcgtaattga-tccatgtagctgaccccacttagtggga 38830581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 34273031 - 34273096
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34273031 tagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 34273096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 2066152 - 2066224
Alignment:
Q  299 agaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2066152 agaaactactaaaaaagatctagagattaatgagttggataaaattatagtttacgatagaaaattatggcgt 2066224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 410
Target Start/End: Original strand, 5987719 - 5987782
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5987719 tggtttatgataca-cattatgacgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtggaataag 5987782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Original strand, 11675550 - 11675630
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  11675550 ttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatca 11675630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14330253 - 14330185
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||   |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14330253 aaatatggtttatgaccaaacattattgtgtaatttgattcatgtagccgaccccacatagtgggataa 14330185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15588814 - 15588706
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagag 251  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||| | ||||||  | | ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  15588814 acctatagaagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgatttgggtttgtagatagaagacacttggattttgtaataaggagagtagatcagatggag 15588715  T
Q  252 gatagtcag 260  Q
    | |||||||    
T  15588714 ggtagtcag 15588706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Original strand, 27249224 - 27249333
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  27249224 tagcacccatagtagaaaagaaagtggaaattaggcttaggtggtttgagcttgtagggagaagacctgtagattttgtagtaag--gagtagatcagat 27249321  T
Q  248 agaggatagtca 259  Q
     |||| ||||||    
T  27249322 ggagggtagtca 27249333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 386
Target Start/End: Original strand, 39668905 - 39668945
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39668905 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgta 39668945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43423563 - 43423511
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  43423563 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccttttagtgggataag 43423511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Original strand, 27897 - 27944
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttg 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27897 tagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttg 27944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 133
Target Start/End: Original strand, 5305547 - 5305610
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  5305547 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagaga 5305610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8082155 - 8081979
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaa-gagaaactactaagaaagatctagat 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||  ||||| ||||||||||    ||||||| ||| ||||||||||||    |||    |||    
T  8082155 gtagtaaggagagtagatcagatgaacgatagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataaagagaaactactag---aga----gat 8082063  T
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| || |||   |||||||||||    ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8082062 attaatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataag 8081979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Original strand, 15168796 - 15168855
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  15168796 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 356
Target Start/End: Original strand, 18698891 - 18699006
Alignment:
Q  241 atcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg 340  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| |||| ||| |||||| |    
T  18698891 atcagatggagagtagtcaaatcactagaggcagaggaatacctagaaaaactataagagaatgtatcaagaaagatctagagattagtgagttggatag 18698990  T
Q  341 aaatatggtttatgat 356  Q
    ||||||| | ||||||    
T  18698991 aaatatgttatatgat 18699006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 21093701 - 21093768
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagaga 131  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  21093701 atgaggatgttgcgttgtatgtgtggtaagactagatgtgatggaattagaaatgacaatattagaga 21093768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Original strand, 36551321 - 36551412
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||| ||| ||  ||||||||||| |  |||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36551321 tagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataag 36551412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 349
Target Start/End: Original strand, 42199503 - 42199598
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||    ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42199503 tagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaagatctagatattaatgagttggatagaaatatggt 42199598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Original strand, 43522623 - 43522694
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaa 231  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||    
T  43522623 tagaaaagatggtggaaaattgatttaggtggtttgagcatatagagataatacttgttgattttgtagtaa 43522694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 218126 - 218068
Alignment:
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  218126 atgaaagagcattatggcgtcattagatccatgtagccgaccccacctagtgggataag 218068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6368282 - 6368224
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6368282 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagaatagacgagatagaattagaaatgacaa 6368224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Original strand, 9234102 - 9234152
Alignment:
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9234102 acattatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataag 9234152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 407
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400774
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||| |||||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggat 9400774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35118407 - 35118338
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatag-aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  35118407 aaatatggtttatgataggaacatt-tagcgtaatttgatccatgtacccgacctcatttagtgggataag 35118338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32006252 - 32006179
Alignment:
Q  338 ttgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt-agtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||    
T  32006252 ttgaattatggtttataatggaacattaaggcgtaatttgatccatgtagccaaacccagttcagtgggataag 32006179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38501503 - 38501434
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38501503 aaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataag 38501434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 39040953 - 39041022
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  || | || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39040953 aaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataag 39041022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 219811 - 219727
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca 147  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  219811 gatgagaatgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagca 219727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16134536 - 16134480
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac 121  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16134536 atgaggatgttgtgttggatgtatggtaagactagatgagataaaattagaaatgac 16134480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 394
Target Start/End: Original strand, 35615437 - 35615533
Alignment:
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||||| | | ||| || |||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||||||    
T  35615437 gagaaactattcataaaaatttagagattaatgagttggataaaaatatagtttatgatagaacattatgacctaacttgattcatatagccgaccc 35615533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38578784 - 38578616
Alignment:
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||   |||| || ||| || ||||||| ||||| ||||| ||    
T  38578784 aaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagacatgtagattatatagttagcagattagatcagatcgaggagagtcaaat 38578685  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatga 331  Q
    ||||||| | || || ||||    |||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| || |||||    
T  38578684 cactagatgtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatctagaaataaatga 38578616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1287960 - 1287877
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagaga 133  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  1287960 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagaga 1287877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6368138 - 6368079
Alignment:
Q  188 gtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||||| ||||||||| | || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6368138 gtggtttgagcatgtagaaagaaaacatacaggttttgtagtaaggagagtaaatcagat 6368079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 375 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7367223 - 7367188
Alignment:
Q  375 ttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7367223 ttaatccatgtagccgacccgacttagtgggataag 7367188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 34273196 - 34273279
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  34273196 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataag 34273279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 400
Target Start/End: Original strand, 39766738 - 39766777
Alignment:
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39766738 cattatggcgtaattttatccatgtagccgacctcactta 39766777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42504332 - 42504297
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42504332 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaattt 42504297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5848447 - 5848401
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagact 97  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5848447 taagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagact 5848401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5928892 - 5928838
Alignment:
Q  322 atattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  5928892 atattaatgagttggattgaaatatgttttattgtaggacattatgacgtaattt 5928838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 132
Target Start/End: Original strand, 30588384 - 30588446
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagag 132  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30588384 atgttgcgtgggatgtgtggtaagatcaaatgagatatgattagaaatgacaatattagagag 30588446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
Target Start/End: Original strand, 32366186 - 32366244
Alignment:
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  32366186 atgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataag 32366244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 217
Target Start/End: Original strand, 37065532 - 37065602
Alignment:
Q  147 atagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  || |||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  37065532 atagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaagaaatgt 37065602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 365
Target Start/End: Original strand, 37918183 - 37918253
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatta 365  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||    
T  37918183 taagagaaactgtttagaaagatatagagattaatgagttggattgaaatattgtatttgataaaacatta 37918253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 410
Target Start/End: Original strand, 2645179 - 2645256
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||| |||||||| || |  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2645179 ttggatagaaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataag 2645256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 409
Target Start/End: Original strand, 3448831 - 3448884
Alignment:
Q  356 tagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  3448831 tagaacattatggcgtaatttgattcatgtagtggactccacttagtggcataa 3448884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 385
Target Start/End: Original strand, 7593725 - 7593782
Alignment:
Q  328 atgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  7593725 atgagttggactgaaataaagtttatgatagaacataatgacgtaatttgatccatgt 7593782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24391077 - 24391040
Alignment:
Q  373 atttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24391077 atttaatccaagtagcagaccccacttagtgggataag 24391040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Original strand, 34272933 - 34272982
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34272933 taagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactaga 34272982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713202
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||||| |  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataag 2713202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 410
Target Start/End: Original strand, 3000977 - 3001005
Alignment:
Q  382 atgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3000977 atgtagccgaccccacttagtgggataag 3001005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3775119 - 3775091
Alignment:
Q  381 catgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3775119 catgtagccgaccccacttagtgggataa 3775091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16014532 - 16014504
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16014532 atccatgtagccgaccccacttagtggga 16014504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17340560 - 17340496
Alignment:
Q  302 aactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17340560 aactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataacattat 17340496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Original strand, 27998347 - 27998383
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27998347 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 27998383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 32759605 - 32759687
Alignment:
Q  175 aaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||  |||||||| |||||| || | |||||| |||||||    
T  32759605 aaaataggtttaggtggtttggacatgtag-ggtaa-acatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtca 32759687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 35685783 - 35685834
Alignment:
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacat 215  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  35685783 aaaagatagtggaaaataagtttaggtggtttggg-atatagagagaagacat 35685834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501580
Alignment:
Q  176 aaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |  ||| ||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatca 38501580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558136
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 43558136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 172)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42510369 - 42510036
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaat-gacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagta 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || | ||| |||    |||||     |||||||||| ||||    
T  42510369 gatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggataggtttagaaattgataatactagggag----ttggg-----atagcacctatagta 42510279  T
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42510278 gaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaga 42510181  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    |||||||||||| ||||||||    ||||||| | |||||||| | || ||||||| | || || ||||| |||||   |||||||||||||||| ||||    
T  42510180 tcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatggtttatgattgaac 42510081  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42510080 attatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagaggga 42510036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39601020 - 39600697
Alignment:
Q  83 atgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatag 181  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |     |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  39601020 atgtgtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagta-----cctatagtagaaaagatggtggaaaacaa 39600926  T
Q  182 gtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaaga 281  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||  ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  39600925 gcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaaga 39600826  T
Q  282 caataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 381  Q
    |    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39600825 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatcc 39600726  T
Q  382 atgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || || || ||||||||| ||||||||||    
T  39600725 atctaaccaaccccactttgtgggataag 39600697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289107
Alignment:
Q  82 gatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaattagagagaaaa--ttggggtagcatagcacctaa--agtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||     ||||   ||||||||||||||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacacattagagagagagagttggggtagca-----cctattcagtagaaaagatggtggaaa 45289340  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||    
T  45289339 ataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagagg 45289240  T
Q  278 aaga-caataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||| | ||  |||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45289239 aagatctat-gaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataattt 45289141  T
Q  377 aatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45289140 gatccatgtcgccaaccccacttagtgggataag 45289107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 64 - 397
Target Start/End: Original strand, 49841535 - 49841869
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attag--agagaaaattggggtagca-tagcacctaaag 159  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||  ||||||||| |     
T  49841535 gatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcacctatat 49841634  T
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |  | |  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  49841635 tagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagacattgacttctt-tagtaaggagagtaaatcagatgaagggtagtca 49841733  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
     || |||||||| |||||||||| | |||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  49841734 aattactagaggtagaggaagaccagaaaaaaat--aagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgataga 49841831  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccac 397  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49841832 acattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 54128302 - 54128645
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||  ||||||||||   |||||||||||     |||| |||||    
T  54128302 gatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagca-----cctatagtag 54128396  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |   | |||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  54128397 aaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagat 54128496  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaact-ttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    |   ||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||  | ||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  54128497 cgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaac 54128596  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54128597 attatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataag 54128645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50960911 - 50960653
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  50960911 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctat--gtt--gtagaaagaagagtagatcagat 50960816  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||| ||||   ||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  50960815 ggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaatatg 50960716  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50960715 gtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataag 50960653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 394
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235387
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgataga 359  Q
    |||||  ||||| ||||||||||   |||||||| || || |||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccgaccc 39235387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 177 - 410
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508501
Alignment:
Q  177 aataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagag 276  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| | | || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||  ||||| ||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  277 gaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||     |||||| |||||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  377 aatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 48508501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42026804 - 42026552
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||   |||||||||||||| ||||||  ||||||| |    
T  42026804 agtagaaaagagggtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatcagacggaggataat 42026705  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |   ||| || |||||||||||| |||||  ||| |||  |||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  42026704 cacatccctagaggcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaatatggtatatgata 42026605  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  42026604 gaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataag 42026552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 371
Target Start/End: Original strand, 21200562 - 21200773
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| || |||  ||||    
T  21200562 agtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatcacatggagagtagt 21200661  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    || |||||||| || ||||||||||    ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||    
T  21200662 caaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaagatctagatattaatgagttggatagaaatatgg--tattata 21200759  T
Q  358 gaacattatggcgt 371  Q
    || |||||||||||    
T  21200760 gagcattatggcgt 21200773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Original strand, 19757838 - 19758152
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19757838 ttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggg--gca--gcacctatagtagaaaagatggtagaaa 19757933  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  | ||| |||||    
T  19757934 ataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatca-aaaaggtagagg 19758032  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||         ||   ||| |||||| || |||| || |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  19758033 aagac---------ct---agaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttg 19758120  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19758121 atccatgtag-cgaccccacttagtgggataag 19758152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23534771 - 23534592
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||| |||||||| || ||||||  |||| |    
T  23534771 gtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatcactagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagaga 23534672  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  23534671 ttaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttgtgg 23534592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19676358 - 19676097
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |   ||||||   |||| | |||||||    
T  19676358 tagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagat 19676259  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||    ||||||| |||||||||||| || |||| || ||||  ||||||| ||||||  |||||||    
T  19676258 agaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatg 19676160  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19676159 ctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 19676097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 398
Target Start/End: Original strand, 36303994 - 36304220
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |    ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  36303994 gtagaaaagatggtggaaactaggtt-agatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtc 36304092  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    |||| |||||||||||  | ||||         ||   ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  36304093 agattactagaggcagttgtagac---------ct---agtaaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatag 36304180  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36304181 gacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccact 36304220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 52138711 - 52139066
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  52138711 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 52138805  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||| ||| || || | || |    
T  52138806 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatgg 52138905  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  52138906 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 52139005  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139006 gtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 52139066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 54365254 - 54364992
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagata--agacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcag 245  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  | || ||||| ||   |  ||||||||||| ||||     
T  54365254 tagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatagctt-aggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataaggagagtagatcaa 54365156  T
Q  246 atagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaata 345  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||  | || |||||||  || ||   |||||    
T  54365155 atgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgtgttagaccaaaata 54365056  T
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54365055 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacac-tagtgggataag 54364992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Original strand, 19736935 - 19737249
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19736935 ttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggg--gca--gcacctatagtagaaaagatggtagaaa 19737030  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  | |||  ||||    
T  19737031 ataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatca-aaaaggttgagg 19737129  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||         ||   ||| |||||| || |||| || |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  19737130 aagac---------ct---agaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttg 19737217  T
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19737218 atccatgtag-cgaccccacttagtgggataag 19737249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 407
Target Start/End: Original strand, 38430852 - 38431116
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||| || || | | |||||| | |||||| |||||||    
T  38430852 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagat 38430951  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||    |||||||  ||||||||||| |  | ||| | ||||  ||||||| ||||||  |||||||    
T  38430952 ggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaatatg 38431051  T
Q  348 gtttatgatagaaca-----ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||||||||     ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  38431052 gtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccactaagtaggat 38431116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 410
Target Start/End: Original strand, 29475793 - 29475952
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||| || |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  29475793 gaggatagttggatcactagaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattg 29475890  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||||    
T  29475891 tttatgatagaaaactatggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataag 29475952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 46432022 - 46431695
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | || ||| |||   ||||||||||   ||  ||   ||||||||||     
T  46432022 atgttgcattggatgtgtggtaagactagacaggatagggttagaaatgactacatcagatagac--ttggggtagc---gcttctt--gtagaaaagac 46431930  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
      |||||| | || ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||  ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  46431929 aatggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagag--gatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcactaga 46431832  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    ||||||| |  | ||    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||  | |||||| |||||||  |||    
T  46431831 ggcagagaactagaa----aaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggatagagatattatatatgatggaacattgaggc 46431736  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||  ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46431735 gtcgtttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataag 46431695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41842789 - 41842562
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||   |||| ||  ||||||| ||||||| |||| ||    
T  41842789 tagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatcaaat 41842690  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||   |            ||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  41842689 ggaggatagtcagatcactaaagggagaggacagc------------taagaaaaactataaagatagatctagaggttaatgagttagattgaaatatg 41842602  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41842601 gtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45487047 - 45486866
Alignment:
Q  227 agtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatatt 326  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||    |||||    ||||||| |||||||||||| || ||||||  | || |||    
T  45487047 agtaaggagagtatatgagatggaggatagttagatcactagagaca----aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagatt 45486952  T
Q  327 aatgacttggattga---aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||   |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45486951 aatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataa 45486866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 308 - 408
Target Start/End: Original strand, 29601056 - 29601156
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29601056 taagaaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggat 29601155  T
Q  408 a 408  Q
    |    
T  29601156 a 29601156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 408
Target Start/End: Original strand, 50249320 - 50249641
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggat---tagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtgg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||      | || |||||||||||||||||    
T  50249320 ttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcg-----cgtatagtagaaaagatggtgg 50249414  T
Q  175 aaaataggtttaggtg---gtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagagg 271  Q
    ||| |||  |||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  50249415 aaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtcatatcaccagagg 50249514  T
Q  272 cagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 371  Q
     ||||||||||         ||  ||||||||||| ||| ||||||||  | || ||||| ||  |   ||||||| ||||||| ||||||||  ||| |    
T  50249515 tagaggaagac---------ctagaagagaaacta-taaaaaagatctcaaaataaatgagttaaaccaaaatatgatttatgagagaacattgcggctt 50249604  T
Q  372 aatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50249605 actttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggata 50249641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 40116644 - 40116489
Alignment:
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||||| |||||||||||| || || |||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  40116644 aggatagtcagatcactagagccaaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggt 40116545  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||| ||| | |||||||||    
T  40116544 ttatgatagaacattgtggcgtaattcgatctacgtagccaacctcgcttagtggg 40116489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 409
Target Start/End: Original strand, 21997 - 22337
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||  |||||||||| | | |||||||||     |||| |||||    
T  21997 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagca-----cctatagtag 22091  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| || | || ||||| |||| | |    
T  22092 aaaagttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggt 22190  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||||||||||   | |||||  | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22191 taaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 22290  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22291 ctatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataa 22337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 35033150 - 35033412
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  | | ||||| ||||||||||| ||    
T  35033150 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaat 35033249  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||   | |||||  |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||||    
T  35033250 ggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 35033349  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  35033350 gtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataag 35033412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 410
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042203
Alignment:
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt-atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  388 ccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  49042181 ccgaccccacttggtgagataag 49042203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2341072 - 2340741
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||||    ||||||     |||||||    ||||    
T  2341072 gatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttgggg-----tagcaccattcgtag 2340978  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||||||||| ||||  | ||| ||  |||||   ||||||| | || ||||||| |||||| ||    
T  2340977 aaaagatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaagatctatagattatgtagt---gagagtagagcaaatagagggtagtcaaat 2340881  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||| ||  |||| |||||     |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||  |    ||| | ||||||||||||    
T  2340880 cactaaagctagagaaagacctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtcggagagggtaatgatatatgatagaaca 2340781  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  2340780 ttatggcgttgtttgatccatgaagccaaccccacttagt 2340741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31454504 - 31454241
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||| ||||||||||| |||| |||  | ||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  31454504 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaagaaatgcggattctgtagttaggagagtagatcagat 31454406  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagag--gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaata 345  Q
     ||||  ||||| |||  |||||  | || ||| |||    ||||||| |||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||   | | |    
T  31454405 ggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaattaggatctagatattaatgaattggagaaagaca 31454306  T
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31454305 tggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataag 31454241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 33755579 - 33755362
Alignment:
Q  189 tggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaa 288  Q
    |||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    ||    
T  33755579 tggtttggacatgtagagcgaaggcctgtagattttgtacttaggagagtagatcagatggaggatggtcggatcactagaggcagaggaaaacctagaa 33755480  T
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |  |||| |||||||| |||||   | ||||||||  |||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  33755479 aaactataagagaaactattaggaaaaacttagagattaatgagttggaccaagatatggtt--tgagtgaacattatgacgtaatttgatcgatgtagc 33755382  T
Q  389 cgaccccacttagtgggata 408  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  33755381 caaccccacttagtgagata 33755362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116354
Alignment:
Q  314 agatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataag 40116354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 47233967 - 47233612
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||  |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||     ||    
T  47233967 taagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggagg-----ta 47233873  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| || || |||||| |||| || |    
T  47233872 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatgg 47233773  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||| | |  ||| |  || ||||||   | |||||| | |||||||| | ||  || ||  ||||  | ||||| || |||  |||||||||    
T  47233772 aggagagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggt 47233673  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47233672 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataag 47233612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 345054 - 344856
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||     | || ||||||||||||| | ||||    
T  345054 ttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagca-----cttatagtagaaaagatgttagaaa 344960  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
    ||||| ||| || |||||| |||||||||| | ||| ||||  |||  |||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||     
T  344959 ataggcttaagtagtttggtcatgtagagagaggacctgtaaattttttagtaatgagcgtagatcggatggaggatagtcagattacaagaggcagaga 344860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 38060897 - 38060980
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38060897 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 38060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 410
Target Start/End: Original strand, 15296059 - 15296173
Alignment:
Q  296 aagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccc 395  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  15296059 aagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccc 15296158  T
Q  396 acttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||    
T  15296159 acttagtgggataag 15296173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24541417 - 24541348
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24541417 aaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataag 24541348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49503903 - 49503767
Alignment:
Q  73 gttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatgg 171  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||| | ||  |||||||     |||| ||||||||||||||    
T  49503903 gttggattggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagca-----cctatagtagaaaagatgg 49503809  T
Q  172 tggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49503808 tagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 49503767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 289 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45493829 - 45493709
Alignment:
Q  289 aaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 388  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45493829 aaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattatggcgccattcaatccatgtagc 45493730  T
Q  389 cgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  45493729 cgaccccacttagtaggataa 45493709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 5169015 - 5169098
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5169015 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 5169098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Original strand, 28245361 - 28245703
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||    
T  28245361 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtag 28245455  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  28245456 aaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagt 28245555  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
     |  ||||| ||| ||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| ||| ||||||||    
T  28245556 taaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaaca 28245655  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28245656 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataag 28245703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52156183 - 52156100
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52156183 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 52156100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 402
Target Start/End: Original strand, 26490319 - 26490573
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||   | | | | |||||| | |||||| |||||||    
T  26490319 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagat 26490418  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||||| | ||| || |   ||||||| |||||| |   |||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||| | |||||| || |||  |||| ||    
T  26490419 agaggagaatcatattagatgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtg 26490518  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
     |||   |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26490519 atttcatatagaatattatggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagt 26490573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36820309 - 36820135
Alignment:
Q  72 tgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac-aaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatg 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||     ||||||||| | ||| |||||||    
T  36820309 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagag--agttgggg-----tagcacctatattagcaaagatg 36820217  T
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagagg 252  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||   ||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  36820216 gtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagattatgtagtaaggagggtagatcaaatagagg 36820135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 324 - 410
Target Start/End: Original strand, 40991611 - 40991697
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40991611 attaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataag 40991697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45374559 - 45374493
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45374559 tatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 45374493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31261183 - 31261051
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31261183 ttagatggtttgggcatgttgagagaagatatgtagattttgtagtaatgtgagtagatcagatggagg-tagtcaaatcactagaggcagaggaagacc 31261085  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagat 317  Q
       ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  31261084 tagaaaaactataagagaaactatcaagaaagat 31261051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 407
Target Start/End: Original strand, 43308617 - 43308825
Alignment:
Q  198 catgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaa 297  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||  || |||||| || || |||||    |||||||  ||    
T  43308617 catgtaaagaaaagacatgtagattttgtagtaatgagagtagatcagatggagg-tagtcaattctctagagacaaagtaagacctagaaaaactacaa 43308715  T
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccac 397  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||| || ||||| | ||||||||||||| || |||    || |||||||||||| |||||||    
T  43308716 gagaaactattaagaaaaatctagagattaatcagttggatagagatatgatatatgatagaacataattgcgccggttgatccatgtagccaaccccac 43308815  T
Q  398 ttagtgggat 407  Q
    || |||||||    
T  43308816 tttgtgggat 43308825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 405
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148289
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 46148289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48734228 - 48734163
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48734228 atggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 48734163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52927933 - 52927864
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927933 aaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 52927864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 409
Target Start/End: Original strand, 32170578 - 32170670
Alignment:
Q  317 tctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32170578 tctagagattaataagttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataa 32170670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 388464 - 388278
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca--ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagat 323  Q
    |||| ||||||||| |||| || || | ||||||||||| || |||| |||||||||   | |||||||| |||   |||||| | |||||| | ||||     
T  388464 tagtgaggagagtagatcaaattgatggtagtcagatcattaaaggcggaggaagacctgaaaaaaaactataacttaaactatttagaaagttttagag 388365  T
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |  ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  388364 attaatgagtaagatagaaatacggtatatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccacttagtgggataag 388278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12096804 - 12096721
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096804 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 12096721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 409
Target Start/End: Original strand, 37351421 - 37351672
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||   |   ||||||||||||||| ||||||| || |  ||     
T  37351421 agtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaagggagg 37351520  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata 357  Q
    || ||||||||||| || |||||||    ||||||| | |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||  ||||   | ||||||||| || ||    
T  37351521 caaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggagaaagatatggtttttgtta 37351620  T
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| || | |||  ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37351621 gaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataa 37351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 53262324 - 53262407
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53262324 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataag 53262407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37534330 - 37534221
Alignment:
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccac 397  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||  |    
T  37534330 gagaaactattaagaaagatcttgagattaatgaatttgattgaaatatagtttatgattgaacatt-tgtcgtaatttgatctatgtagctgacccttc 37534232  T
Q  398 ttagtgggata 408  Q
    |||||||||||    
T  37534231 ttagtgggata 37534221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 409
Target Start/End: Original strand, 38850304 - 38850386
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38850304 aatgaattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataa 38850386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48712190 - 48712092
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  48712190 gaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgggataa 48712092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 400
Target Start/End: Original strand, 54278931 - 54279276
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  54278931 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtagggg-----ta 54279025  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||  |||| |  ||| ||||  |||||| |||| || |    
T  54279026 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatgg 54279125  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||| ||| ||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  54279126 aggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 54279225  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  54279226 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccactta 54279276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778625
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 24778625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40106721 - 40106636
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40106721 ttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataag 40106636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 410
Target Start/End: Original strand, 55244382 - 55244548
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaact-ttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    ||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  55244382 gagggtagtcaaatcactagaggccaaggaagacctagaaaaactcttaagagaaattcttaagaaaaatctagagattaatgagttggatagaaatatg 55244481  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc----ccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||| ||||    || ||||||||||||||    
T  55244482 gtatatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgaagctgaccaaccccgcttagtgggataag 55244548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 320
Target Start/End: Original strand, 11581460 - 11581620
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||  |||||||| |||||| |||||||  |||  |||||    
T  11581460 tagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaagaagagtacatcagatgtaggtgagtca 11581559  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatcta 320  Q
     ||||||||||| |   ||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11581560 aatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatcta 11581620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 402
Target Start/End: Original strand, 49888370 - 49888445
Alignment:
Q  324 attaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49888370 attaatgagttggactgaaatatggtttatga---aacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagt 49888445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 311392 - 311325
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  311392 atatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataag 311325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14415342 - 14415276
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14415342 atatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataag 14415276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 341 - 408
Target Start/End: Original strand, 39208805 - 39208872
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  39208805 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggata 39208872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 47555431 - 47555348
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47555431 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 47555348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 410
Target Start/End: Original strand, 659565 - 659791
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||| |||||  | ||||  |||  |||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  659565 ttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagttgaccagagggagagtagtgaaatcactagaggcaaaggaagacc 659664  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
       ||||||| |||||||||| |  ||||   || || | |||||||| |||||| |  ||||  | |||||||||||||||||||    ||| ||||||    
T  659665 tagaaaaactgtaagagaaaccatcaagatgtatttacagattaatgagttggatagggatattatatatgatagaacattatggcagtgtttgatccat 659764  T
Q  384 gtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  659765 gtagccgaccccacttagtggggtaag 659791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566177
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 31566177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273225
Alignment:
Q  344 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 40273225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2133697 - 2133628
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2133697 aaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataag 2133628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7895965 - 7895896
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7895965 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataag 7895896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27796077 - 27795996
Alignment:
Q  329 tgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| | |||||||    
T  27796077 tgacttgtatcgaaatttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtacccaaccccacttattaggataag 27795996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37083369 - 37083308
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37083369 tttatgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataag 37083308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41482316 - 41482187
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaacttt-aagagaaactactaagaaaga-tctagatattaatgacttggattgaaatat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||| || |||||| | | || |||||||| ||| |   |||| |    
T  41482316 gaggacagtcggatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatct 41482217  T
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41482216 ggtttatgatagaacattatggcgtaattt 41482187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 406
Target Start/End: Original strand, 49045032 - 49045097
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49045032 aaatatagtttatgacagaacattatggccgaatttaatccatgtagccgaccccactcagtggga 49045097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 49503653 - 49503584
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49503653 aaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataag 49503584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Original strand, 25191574 - 25191642
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25191574 aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataa 25191642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31337867 - 31337751
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||      ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31337867 ttggatgtgtgataagactagatgggataggatta-aaatgacagcattagagagaaagttggg------tagcacctatagtagaaaagatggttgaaa 31337775  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatg 201  Q
     |||| ||| |||||||| |||||    
T  31337774 ctaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 410
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530027
Alignment:
Q  358 gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 41530027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 48953518 - 48953446
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactt 399  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48953518 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccgacgccactt 48953446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 400
Target Start/End: Original strand, 37227869 - 37228184
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||   |||| ||||||      |||  |||||||| |||| |||||    
T  37227869 ttggttgtgtggtaagactagacaatataggattagaaatgaccacattagagagag--ttggagtagcag-----ctatcgtagaaaaaatggcggaaa 37227961  T
Q  178 ataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagagg 277  Q
     | || |||||||||||  ||||||||||| || | |||||| ||  |||||||||| |||  |  |||  |||| |||||| ||||| ||||||||||     
T  37227962 ctcggcttaggtggtttctgcatgtagagaaaatagatgtagattatgtagtaaggacagttgaatagacggagggtagtcaaatcaccagaggcagaga 37228061  T
Q  278 aagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattta 377  Q
    |||||    ||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||| || |||  | ||||| |  ||| ||||||||||||||||  |||     
T  37228062 aagacctataaaaacgataagggaaactattaagaaagacttagaaattaatgagttagataaagatatgataaatggtagaacattatggcgtcgtttg 37228161  T
Q  378 atccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| || ||||| |||||||    
T  37228162 atccatttaaccgactccactta 37228184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Original strand, 48532161 - 48532224
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca-tgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48532161 gtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataag 48532224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51448080 - 51447733
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | |||      ||    
T  51448080 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtaggg------ta 51447987  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||   |||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |    
T  51447986 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgg 51447887  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||| |||||  | |  ||||       |||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  51447886 aggagagtcaagttaaaagag-------aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 51447794  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51447793 gtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataag 51447733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 53519763 - 53519846
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53519763 aatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataag 53519846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30797900 - 30797838
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30797900 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataag 30797838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Original strand, 40981914 - 40982099
Alignment:
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    ||||||||||||||||| |    ||||||  ||||||||||| |||| |||||| | || |||  |||| ||  ||||| |||||||| ||  ||||||     
T  40981914 agaaaagatggtggaaactcaacttaggtactttgggcatgttgagagaagacacggagattttatagtcagc-gagtacatcagatatagagtagtcaa 40982012  T
Q  261 atcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
    |||||||||| || ||||||||    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  40982013 atcactagagacaaaggaagacctagaaaaactataagagtaactattaagaaagatctagatattaatgtgttggatagatatatg 40982099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 409
Target Start/End: Original strand, 7278481 - 7278729
Alignment:
Q  165 aagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatca 264  Q
    ||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||  | || ||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||| || |    
T  7278481 aagatggtggaaactcggctcatgtggtttgggcatgtagagagcaaacctgtagattttgtagcaaggagagtagatcggatggagagtagtcaaatta 7278580  T
Q  265 ctagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaa-----atatggtttatgataga 359  Q
    ||| ||  |  |||| ||    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || ||||  || ||||| |     ||||| | ||| |||||    
T  7278581 cta-agatattggaaaacctagaaaaactataagagaaactgttacgaaagatctagagatcaatgggttagattggatcgggatatgatatattataga 7278679  T
Q  360 acattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7278680 acattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 7278729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21862846 - 21862757
Alignment:
Q  321 gatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | |  ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21862846 gatattaatgaattggatagaaatatgatattggatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataag 21862757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39782002 - 39781934
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39782002 aaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataag 39781934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 53266892 - 53266957
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  53266892 atggtttatgatagaatgttatggtgtaatttaatccatgtagccgatctcacttagtgagataag 53266957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20262505 - 20262353
Alignment:
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || |||  |||||||||||||| || ||||| |||| | || |||||||      
T  20262505 gatagtcaaagcactagaggcagaggaagaccaataaaaactataagataatctatcaagaaagatctagagatcaatgagttgggtagagatatggtaa 20262406  T
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    ||| |||||||||| || ||   || ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  20262405 atgctagaacattacggtgtcgattgatcaatgtagccaaccccactaagtgg 20262353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 269
Target Start/End: Original strand, 29374951 - 29375059
Alignment:
Q  161 agaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcag 260  Q
    |||||||||||| |||| | |  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||||| |    
T  29374951 agaaaagatggtagaaactcgacttaggtgatttgggcttgtagagaaaagacctgtagattttgtagtaaggagtgtagattagatggagaatagtctg 29375050  T
Q  261 atcactaga 269  Q
    |||||||||    
T  29375051 atcactaga 29375059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 410
Target Start/End: Original strand, 46140573 - 46140673
Alignment:
Q  310 agaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  46140573 agaaaaatctagagattaatgagtttgatagaaatatagcttacgatagaacattatggagttgtttgatccatgtagtcgaccccactttgtgagataa 46140672  T
Q  410 g 410  Q
    |    
T  46140673 g 46140673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50621731 - 50621648
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50621731 taagtgtagcggagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagaga 50621648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17022750 - 17022688
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17022750 gtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccgacctcatttagtgggataag 17022688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Original strand, 29600913 - 29601019
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggttt-aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatag 256  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||| || | ||||||||| || |||  ||||||||    
T  29600913 agtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagagagaagatctatagatttcataattaggagagtagatgagagggaggatag 29601012  T
Q  257 tcagatc 263  Q
    |||||||    
T  29601013 tcagatc 29601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33272399 - 33272235
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaa--ttggggtagca 147  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||| |   | |||||||||    
T  33272399 taagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagca 33272300  T
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
        |  || |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33272299 cct-atatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 33272235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34844651 - 34844589
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34844651 gtttatgatagaacattatggtataatatgatccatgtagccgaccccactaagtaggataag 34844589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38054695 - 38054625
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38054695 gatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagaga 38054625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48734403 - 48734281
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||     |||||| | |||||| ||||||| |||  ||||    
T  48734403 agtagaacagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagt 48734304  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaag 280  Q
     ||||||  ||||| ||||||||    
T  48734303 tagatcaaaagaggtagaggaag 48734281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 410
Target Start/End: Original strand, 6988069 - 6988168
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgata--gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  6988069 aaagatctagagattaatgagttggatagaa-tatggtatatgatatagatcattatggcgtcatttgatcaatgtagccgactccttttagtgggataa 6988167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 410
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284254
Alignment:
Q  313 aagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| || |  ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataag 11284254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 26388487 - 26388540
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26388487 gcacctataatagaaaagatggtagaaaataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34719237 - 34719096
Alignment:
Q  269 aggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatgg 368  Q
    ||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||| || || | ||||||| |||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||    
T  34719237 aggcagaggaagacctagaaaaactataaaagaaactattaggacaaatctagaaattaatgatttggattgagatacgatatatgatagagcattatgg 34719138  T
Q  369 cgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |  ||| || | ||| || |||||||||||| ||||||||    
T  34719137 cttcgtttgattcttgtggctgaccccacttagggggataag 34719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 37598370 - 37598186
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||  |||| | ||||| ||||||||| || |||    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |    
T  37598370 gtagtaagaagagtagatcagatgaagcgtagttaaatcaccagaggcagaagatgacctagaaaaactt-aagagaaactattaagatatatctagaga 37598272  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc-cacttagtgggataa 409  Q
    ||||||| |||||| |   |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  37598271 ttaatgagttggataggggtatgatatatgatagaacattatggcgtcatttgactcatgtagtcaaccctcatttagtgggataa 37598186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Original strand, 40122618 - 40122679
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40122618 gtttatgattgaacattatgacttaacttgatccatgtagccgaccccacttagttggataa 40122679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 409
Target Start/End: Original strand, 20208207 - 20208263
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20208207 tgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataa 20208263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29928524 - 29928412
Alignment:
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || || | ||| ||  ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  29928524 aaaatatgctggaaaataggcttaggtggtttagtcatgttgagaaaaaacctatagattatgtagtaacgagagcagatcagataaaggatagtcagat 29928425  T
Q  263 cactagaggcaga 275  Q
    | |||||| ||||    
T  29928424 ccctagagacaga 29928412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29977678 - 29977566
Alignment:
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || || | ||| ||  ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  29977678 aaaatatgctggaaaataggcttaggtggtttagtcatgttgagaaaaaacctatagattatgtagtaacgagagcagatcagataaaggatagtcagat 29977579  T
Q  263 cactagaggcaga 275  Q
    | |||||| ||||    
T  29977578 ccctagagacaga 29977566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 410
Target Start/End: Original strand, 31146906 - 31146965
Alignment:
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31146906 ttatgataaaacat-atggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataag 31146965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Original strand, 35420479 - 35420534
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35420479 gatagaacattatggcgtaatttggtccatgtag-cgaccccatttagtgggataag 35420534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43695043 - 43694959
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaag 232  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||    
T  43695043 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaag 43694959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 46140446 - 46140570
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagt 257  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||  |||||||  | || | ||||||| || ||||||    
T  46140446 agtagaaaagacggtggaaactagactcaggtggtttggacatatagagagaagacctgtagattctgtagtaaaaatagcagatcagattgatgatagt 46140545  T
Q  258 cagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    ||||||||||| || | ||||||||    
T  46140546 cagatcactaggggaataggaagac 46140570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 52882726 - 52882682
Alignment:
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52882726 attatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtggga 52882682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21428065 - 21428010
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  21428065 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgactccatttattgggataag 21428010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Original strand, 27917574 - 27917645
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  27917574 tagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtag 27917645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 400
Target Start/End: Original strand, 37228187 - 37228338
Alignment:
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    ||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||| ||||| || ||||||  | |||||     
T  37228187 gagggtagtcaaatcactagaggcagagaaagacctataaaaacgataagggaaactattaagaaagacttagaaattaacgagttggataaagatatga 37228286  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |  ||| ||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||||    
T  37228287 taaatggtagaacattatggcgtcgtttgatccatttaaccgactccactta 37228338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40672446 - 40672383
Alignment:
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40672446 ggtttttgataggtcattatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataag 40672383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Original strand, 3987054 - 3987116
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagac 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3987054 cacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 44134014 - 44133884
Alignment:
Q  254 tagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttat 353  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||    ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||  | ||| ||||||  ||| ||    
T  44134014 tagtcagatcactggaggcagatgaaaacct--aaaaattataagagaaactattaagatagatctaaagattaatgagatagatcgaaatacagttcat 44133917  T
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44133916 gatagagcattatggcgt-atttgatccatgtag 44133884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 279
Target Start/End: Original strand, 44395368 - 44395560
Alignment:
Q  83 atgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatag 181  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||     ||||  ||| ||||||||| ||||| |      
T  44395368 atgtgtggtaagacaa-atcacataggattagaaatgacaatattcgagaaagaatcggggtagca-----cctatcgtaaaaaagatggcggaaactct 44395461  T
Q  182 gtttaggtggtttgggcatgt-agagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaa 279  Q
      |||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||| | || | || ||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44395462 acttaggtagtttgagcatcttagagagaagacatgtcgattccatactaaggagagtagatcaaatggagggtagtcaaatcactagaggcagaggaa 44395560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45834662 - 45834616
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45834662 tatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 45834616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4472480 - 4472411
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  4472480 ttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagt 4472411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Original strand, 29817508 - 29817565
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  29817508 tagcacctatagtagaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30573040 - 30572956
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30573040 ttaggtggtttgatcatgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcagctcactaga 30572956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36820116 - 36820067
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgg 336  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36820116 aaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttgg 36820067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52678981 - 52678892
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatg 384  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||| ||| ||||||| || |||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  52678981 taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 409
Target Start/End: Original strand, 1512046 - 1512090
Alignment:
Q  366 tggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1512046 tggcgtaatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataa 1512090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 410
Target Start/End: Original strand, 27893207 - 27893355
Alignment:
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    ||||| |||| ||||||||||    ||| ||| |||||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |||||   | | ||| ||| ||| |||||    
T  27893207 tcacttgaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaac 27893306  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||| |  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27893307 actatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataag 27893355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Original strand, 34610444 - 34610512
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||| ||||| |||| |  |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34610444 aaatattgtttaggatatataattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataa 34610512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36049427 - 36049322
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||| || ||||||| || | |||||||| ||||||  ||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  36049427 aaactattaggaaagatttaaaaattaatgaattggatcaaaatatggcctatgattaaacactatagcgtaatttgat--atgtagccggccccactta 36049330  T
Q  401 gtgggata 408  Q
    ||||||||    
T  36049329 gtgggata 36049322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36868502 - 36868450
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcat 200  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36868502 tagcacctatggtagagaagatggtggaaagtaggcttaggtggtttgggcat 36868450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37103034 - 37102998
Alignment:
Q  374 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37103034 tttaatcaatgtagccgaccccacttagtgggataag 37102998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 38850124 - 38850188
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataaga 212  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38850124 tagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaga 38850188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 410
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512809
Alignment:
Q  378 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataag 39512809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41971356 - 41971292
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgg 404  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  41971356 gaaatatgatatatgatagaacattatgacgttgtttgatccatgtagccaactccacttagtgg 41971292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 46367528 - 46367404
Alignment:
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaaga-tctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatg 384  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| ||| | |||||| || ||||| ||||||    ||||| | ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  46367528 aaaaaattataagagaaactattaaaaaaaaatctagagatgaatgagttggataaggatatgatatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatg 46367429  T
Q  385 tagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||    
T  46367428 tagcctaccccacttaattggataa 46367404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 47804791 - 47804679
Alignment:
Q  298 gagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccac 397  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||| || || | ||| | ||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||| ||||| |||||    
T  47804791 gagaaacgattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagagacatgctatatgatagaacattatggcattgtttcatccttgttgccgatcccac 47804692  T
Q  398 ttagtgggataag 410  Q
    || || |||||||    
T  47804691 tttgtaggataag 47804679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3870686 - 3870615
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggata 255  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3870686 ttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagattctatagttaggagagtaaatcagatggaggata 3870615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332578
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggata 30332578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 410
Target Start/End: Original strand, 35481143 - 35481194
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35481143 aacattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataag 35481194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37102871 - 37102824
Alignment:
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37102871 ttatggtgtaatttgatccatgtagcctaccccacttcgtgggataag 37102824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44134098 - 44134051
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  44134098 agtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctaga 44134051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Original strand, 45236787 - 45236838
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  45236787 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgaca 45236838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 45728057 - 45728128
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  45728057 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgaca 45728128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Original strand, 46568027 - 46568110
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  46568027 taagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagaga 46568110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 53214938 - 53214887
Alignment:
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  53214938 aacattctggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataag 53214887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6780748 - 6780686
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  6780748 aaatatgatttcagatagaacgttatgacgtaatttgatccctgtagccgaccacacttagtg 6780686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 123
Target Start/End: Original strand, 11663574 - 11663632
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||    
T  11663574 atgaggatgtcgcgttggatgtgtggtaagattcgatgagatagaattagatatgacaa 11663632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 410
Target Start/End: Original strand, 16844071 - 16844113
Alignment:
Q  368 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16844071 gcgtaattcaatccatgtagccgaccccaccttgtgggataag 16844113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43694850 - 43694788
Alignment:
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43694850 ggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataa 43694788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 376
Target Start/End: Original strand, 51027756 - 51027790
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51027756 aatatggtttatgatagaacattatgacgtaattt 51027790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 53998864 - 53998758
Alignment:
Q  200 tgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaaga 299  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||  ||| |||||| |||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||    
T  53998864 tgtagagagaagatctgtagattctgtattaaggaaagtggatcaggtggaggatagtcagttcactagaggcaaaggaagacccagaaaaactataaga 53998765  T
Q  300 gaaacta 306  Q
    |||||||    
T  53998764 gaaacta 53998758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 344837 - 344788
Alignment:
Q  361 cattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  344837 cattatggtgtaatttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataag 344788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987600
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataag 3987600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676378
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagaga 133  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| | |||||  ||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagaga 19676378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35032811 - 35032782
Alignment:
Q  381 catgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35032811 catgtagccgaccccacttagtgggataag 35032782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 410
Target Start/End: Original strand, 3186972 - 3187012
Alignment:
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3186972 gtaatttaattcatgtagccgactccacttagtaggataag 3187012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 408
Target Start/End: Original strand, 7120787 - 7120847
Alignment:
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  7120787 gtttatgataaaatattatgacgtaatttgatccatataaccgataccacttagtgggata 7120847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 409
Target Start/End: Original strand, 8566670 - 8566698
Alignment:
Q  381 catgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566670 catgtagccgaccccacttagtgggataa 8566698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 384
Target Start/End: Original strand, 21323531 - 21323575
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatg 384  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21323531 gaaatatgatttatgatagaacgttaaggcataatttaatccatg 21323575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 373
Target Start/End: Original strand, 25562576 - 25562608
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25562576 aaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaa 25562608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 406
Target Start/End: Original strand, 29919484 - 29919536
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  29919484 gatagaatattatggcataatttgatcaatgtaaccgaccctacttagtggga 29919536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29928366 - 29928314
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  29928366 gatagaatattatggcataatttgatcaatataaccgaccccacttagtggga 29928314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 406
Target Start/End: Original strand, 29968637 - 29968689
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  29968637 gatagaatattatggcataatttgatcaatgtaaccgaccctacttagtggga 29968689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29977520 - 29977468
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  29977520 gatagaatattatggcataatttgatcaatataaccgaccccacttagtggga 29977468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41452900 - 41452828
Alignment:
Q  266 tagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggat 338  Q
    |||||||| || ||||||   ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41452900 tagaggcaaagcaagacatagaaaaactataagttaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat 41452828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50237759 - 50237695
Alignment:
Q  301 aaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatta 365  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50237759 aaactattaagaaagattcagagattattgagttggatagaaatattgtatatgatagaacatta 50237695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 100)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 406
Target Start/End: Original strand, 8364520 - 8364818
Alignment:
Q  84 tgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaatagg 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    |||| ||||||      ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  8364520 tgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagacag----ttggagtagcaa-----ctatagtagaaaaggtggttgaaaatagg 8364610  T
Q  183 tttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||                ||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8364611 cttaggtggtttgggcatgtagagat----------------gtagctaggagagtagatcagatggaggattgtcagatcactagaggaagatgaagac 8364694  T
Q  283 aataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcca 382  Q
       |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8364695 ctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcca 8364794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12134259 - 12133925
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtag 162  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  |     |||| |||||    
T  12134259 gatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacga-----cctatagtag 12134165  T
Q  163 aaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagat 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| ||||||| ||||  | ||  || |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  12134164 aaaagatggtggaaaataggcttacggggtttcggcacgtagagaaaagaactataaattccgtaataaggagagcaaatcaggtataggatagtcagat 12134065  T
Q  263 cactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaaca 362  Q
    ||||||||||| ||||||||    ||||||| ||| | ||| || || ||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  12134064 cactagaggcataggaagacctacaaaaactataatataaaatattaggaaag-tttagaaattaatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaaca 12133966  T
Q  363 ttatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtg 403  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12133965 ttatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtg 12133925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 168 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34754 - 34521
Alignment:
Q  168 atggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcacta 267  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||  | || || ||  ||||||| ||||||| ||||||         || |||||||||    
T  34754 atggtggaaaatagacttaggtgggttgggcatgtagagagaaagcttggagattatgtagtaacgagagtagatcaga---------gttagatcacta 34664  T
Q  268 gaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatg 367  Q
    |||||||||||||||    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34663 gaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatg 34564  T
Q  368 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34563 gcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataag 34521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9594070 - 9593726
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagca-tagcacctaaagta 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| |   || || |   |||||||   ||||    
T  9594070 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattagta 9593971  T
Q  162 gaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcaga 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |    
T  9593970 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaa 9593871  T
Q  262 tcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaac 361  Q
    |||  ||||| ||||||||||    ||||| | |||||||||||| || ||||||  |||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9593870 tca--agaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaac 9593773  T
Q  362 attatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||  ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||||    
T  9593772 attatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataag 9593726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 409
Target Start/End: Original strand, 579460 - 579683
Alignment:
Q  186 aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaat 285  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||   |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||       
T  579460 aggtagtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctc 579559  T
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  579560 aaaaaactgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgt 579659  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  579660 agccgatcccacttagtgggataa 579683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 392
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666059
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttc-gtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||  |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||| ||   || ||||  ||||||||||| ||||||| || ||||  | ||||| |||||| |||||||||||    
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccgac 24666059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 152 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6293660 - 6293408
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagag 251  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  6293660 acctatagtacaaaatatggtggaaactaggttcaggtggtttgggcatgtagagagaacacctgtagattatgtaataaggagagtaaatcagatgaag 6293561  T
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   ||      |||||||  || |||||||| || |||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  6293560 gatagtcaaatcactagaggaagatctag------aaaaactaaaatagaaactattaggaaatatctagatattaatgagttagatagaaatatggtat 6293467  T
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| |||||||||    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6293466 atgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataag 6293408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 406
Target Start/End: Original strand, 31818449 - 31818793
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||      | |||||||||      
T  31818449 taagtgtagcagagatgagaatgttgcattggatatgtgttaagattagatgagataagattagaaatgaaattattagag------tcggggtagca-- 31818540  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
       |||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||| | ||  | |||||||| |||| |||| || |    
T  31818541 ---cctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatcatatgg 31818636  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||    ||||||| |||||||||||| || ||||| | | || |||||||| ||||||  || ||||||    
T  31818637 agggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggt 31818736  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31818737 ttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcggga 31818793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43318 - 43068
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtca 259  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||  | ||| ||| ||||  || |||||| ||||| | |||||||||||    
T  43318 tagaaaaaatggtggaaactaggcttaggtggtctggccatgtagagagaagatttatagattttgtagcgagaagagtagatcaggt-gaggatagtca 43220  T
Q  260 gatcactagaggcagaggaaga-caataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatag 358  Q
    |||| |||||||||| |||||| | | || ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||||  |||||| |||||||||||    
T  43219 gatctctagaggcagcggaagacctagaacaacttttaagagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatatagtttatgatag 43120  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |  ||||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  43119 agtattatggtgtaattttatccatgtatccagcctcacttagtgggataag 43068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 410
Target Start/End: Original strand, 30031169 - 30031522
Alignment:
Q  54 agtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagc 151  Q
    |||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||  | | |||||||||        
T  30031169 agtgtagcggagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagca---- 30031264  T
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagag 251  Q
     |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  |||| |||||||||| |||||   ||| |  ||| ||||| |||||| |||| || |||    
T  30031265 -cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggag 30031363  T
Q  252 gatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggttt 351  Q
    || |||||| | |  ||||| ||||| ||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  30031364 gagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggttt 30031463  T
Q  352 atgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30031464 atgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataag 30031522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28027104 - 28026851
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |   |||||| | |||||| |||||||    
T  28027104 tagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggctt-ggtggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagat 28027006  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||| | || ||||||| || |  ||||||| ||| ||| |||||||    
T  28027005 ggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatg 28026906  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggg 405  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28026905 gtttatgat--aacattacggcgtaatttga-caatgtagccgaccccacttattggg 28026851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20428007 - 20427654
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  20428007 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 20427913  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  | |||| ||| |||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20427912 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatag 20427813  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    |||  |||||| | || |||||  |||||||||   | |||||| | |||||||| | | ||||| || ||||  ||||||| ||||||  |||||||||    
T  20427812 aggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaacca-ttagaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggt 20427714  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    || | |||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20427713 ttttaatagaatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataa 20427654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33997801 - 33997561
Alignment:
Q  167 gatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcact 266  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||   ||||| | ||| ||| |||||||||||  ||    |||| |||| |||||| | ||||    
T  33997801 gatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatgtagaaggaagacctatagattttgtagtaaggag--taggctagatggagggtagtcaaaacact 33997704  T
Q  267 agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| |||||||   ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  33997703 agaggcagaggaagaccttggaaaactataagagaaactattaagaaaagcctagagattaatgagttggatagaaatatggtacatgattgaacattat 33997604  T
Q  367 ggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| |||| ||| |||   || ||| |||||||||||||||    
T  33997603 ggcgtcatttgatctatgcgaccaaccacacttagtgggataa 33997561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 410
Target Start/End: Original strand, 5095931 - 5096100
Alignment:
Q  241 atcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg 340  Q
    ||||||| || || ||| ||||||  ||||| ||||||||||    |||||||  ||||||||||  || ||||||| |||   ||||||| ||||||      
T  5095931 atcagatggaagagagttagatcagaagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatca 5096030  T
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5096031 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataag 5096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 28085287 - 28085642
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  28085287 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 28085381  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||  |   || ||||| |||||| |||| || |    
T  28085382 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatgg 28085481  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    || | |||||  | |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||||    
T  28085482 agtagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 28085581  T
Q  350 ttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085582 gtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28085642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6907103 - 6906843
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| ||||||| |||||||   || |||| ||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||      
T  6907103 gcacctatagtagaatagatggtcagaactaggcttacgtagtttggttatgtagagagaagacatgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatgc 6907004  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggt 349  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||   | |||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||| |    
T  6907003 agggtagtcaaatcacgagaggtagatgaagatcttgaaaagctataa-agagactattaagaaagatctagatattaacgagttggatataaaaatgtt 6906905  T
Q  350 ttatgata-gaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
     || |||| ||||||||||  ||   || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6906904 ataagataggaacattatgatgtcgattgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataag 6906843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 12890772 - 12890841
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890772 aaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 12890841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Original strand, 33083983 - 33084137
Alignment:
Q  65 atgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtaga 163  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||     ||||  |||||    
T  33083983 atgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagca-----cctatggtaga 33084077  T
Q  164 aaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggttt 223  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  33084078 aaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacctgtgggttt 33084137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14389445 - 14389202
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||  || |||||||||||| || |||||||    
T  14389445 tagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaaactt-aggtggtttggacatgtagagagaagacctatagactttgtagtaaggagaatagatcagat 14389347  T
Q  248 agaggatagtcagatcact-------agaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg 340  Q
     ||||||||||||||||||       |||| || |||| |||   | |||||| | | |||||||  |||||||||| |||| |||||| | || |||      
T  14389346 ggaggatagtcagatcactagagagtagagacaaaggaggacctaataaaactgtcacagaaactcttaagaaagatttagagattaataagttagatcc 14389247  T
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14389246 aaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Original strand, 32755925 - 32756187
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||  | || | ||||| |||| |||||| |||| ||    
T  32755925 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaat 32756024  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||| |||||  | |  ||||| |||| |||||     |||||| | |||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  32756025 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 32756124  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32756125 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaag 32756187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 266
Target Start/End: Original strand, 2079288 - 2079462
Alignment:
Q  88 tggtaagactagatgagataggat-tagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggttt 185  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  | |||||      ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2079288 tggtaagactaaatgagatatgatatagaaatgacaatattagagagggagttggg------tagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggctt 2079381  T
Q  186 aggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcact 266  Q
    | ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||    
T  2079382 aagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtagattatgtagtaaggagagtaaattagatggaggctggtcagatcact 2079462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Original strand, 608070 - 608427
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||       |  ||  ||    
T  608070 taagtgtagcggagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagaga-------gtgagggta 608162  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
     |||||| |||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  | | ||||| |||||  |||| || |    
T  608163 tcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatgg 608262  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagac---aataa-aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaata 345  Q
    |||| |||||||| |  |||||  || ||||||   | ||| |||||| |  ||||||| | ||  |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||||    
T  608263 aggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaata 608362  T
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  608363 tggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataag 608427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5258521 - 5258164
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaa-ttagagagaaa-attggggtagcat 148  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||   ||||||||| | | |||||     |    
T  5258521 taagtgtagcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtggggg----t 5258426  T
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| || ||| ||||| |||||| |||| ||     
T  5258425 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatg 5258326  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatgg 348  Q
    ||||| |||||  | |  ||||| |||| |||||   | |||||  |  ||||||  | ||   ||||| ||||  | |||||  | |||  ||||||||    
T  5258325 gaggagagtcatgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatgg 5258226  T
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5258225 tttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataag 5258164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9749491 - 9749369
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtc 258  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||| |||| | ||||| |||||    
T  9749491 gtagaaaagaaggtggaaacttggtttaggtggtttagggatgtagagagaagtcatgtagattttatagtaagaagagtagatcaaacagagggtagtc 9749392  T
Q  259 agatcactagaggcagaggaaga 281  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  9749391 aaatcattagaggcagaggaaga 9749369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 410
Target Start/End: Original strand, 9706951 - 9707036
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706951 ttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 9707036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 410
Target Start/End: Original strand, 5983809 - 5983897
Alignment:
Q  322 atattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5983809 atattaatgaattggatcgaaatatggtttgcgatagaacatgatagcgtaatttgatccacgtagccgaccccactcagtgggataag 5983897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3206558 - 3206475
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206558 aatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 3206475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 410
Target Start/End: Original strand, 5897625 - 5897723
Alignment:
Q  312 aaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5897625 aaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtgggataag 5897723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10617574 - 10617253
Alignment:
Q  74 ttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaaattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtg 173  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||    ||| || | |||||||||||     | || ||||||||||| | |     
T  10617574 ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgacaa----gagcgagagttggggtagca-----cttatagtagaaaagacg-ta 10617485  T
Q  174 gaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttc-gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggc 272  Q
    |||| |||  |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||| | | |||||||||||  ||| || ||||  ||||| |||||||||||     
T  10617484 gaaactagacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacctgt-ggtttctgcattaaggagagta--tcaaatggaggggagtcaaatcactagaggt 10617388  T
Q  273 agaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 372  Q
    ||| ||| ||    ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||   | | ||||||| |||||||||| | ||||||     
T  10617387 agaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactttggcgtt 10617288  T
Q  373 atttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
     ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10617287 gtttgatttatgtagccggccccacttagtgggat 10617253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 409
Target Start/End: Original strand, 31819014 - 31819096
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31819014 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31819096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 340 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7513076 - 7513008
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  7513076 gaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtagttgaccccacttagtgggata 7513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34934929 - 34934846
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34934929 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 34934846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Original strand, 2079477 - 2079547
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  2079477 gaaatatgatttatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccgactcgacttagtggggtaag 2079547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1748083 - 1747984
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||    
T  1748083 aaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgtag 1747984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3210616 - 3210541
Alignment:
Q  318 ctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacc 393  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3210616 ctagagattaatgagttggatggaaatatgagttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgacc 3210541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31832137 - 31831874
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||  | |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||    | || ||   ||| ||| |||||| |||||||    
T  31832137 tagcacctatagtaaaatagatggtgggtattaggcttaagtggtttggacatgtagagagaaggtccggagattatatagcaagtagagtagatcagat 31832038  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||||||||||||||||  |||   |||||||  |    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||    
T  31832037 ggaggatagtcagatcatcagaaatagaggaaagcctagaaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagttggatccaaacatg 31831938  T
Q  348 g-tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |||||||||||||||| | | | ||||| || |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  31831937 gttttatgatagaacattgtaggggaatttgattcatgcagtcgaccctacttagtgagataag 31831874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 409
Target Start/End: Original strand, 32097927 - 32098002
Alignment:
Q  334 tggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32097927 tggattaaaatatgatttatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgggataa 32098002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33998355 - 33998292
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgac-aaattagagaga 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33998355 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagaga 33998292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34143864 - 34143781
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34143864 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataag 34143781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34156480 - 34156397
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34156480 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataag 34156397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 655525 - 655411
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    |||||||||||| || ||||  | | || |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||  ||||     
T  655525 taagagaaactattaggaaaactttcgagattaatgaattggaccgaaatatggtttatgacagaacattgtggtgcaatttgatccatgtaggtgacct 655426  T
Q  395 cacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||    
T  655425 cacttagtgggataa 655411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7337274 - 7337220
Alignment:
Q  347 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttag 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7337274 ggtttatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttag 7337220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21870351 - 21870082
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtag--------agataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagta 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| |||        ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  21870351 tagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatttaggcatttagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagta 21870252  T
Q  240 aatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac--aataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgga 337  Q
     || |||| |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||  |  |||||||| |  ||||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||  |    
T  21870251 gataagatggagagtagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaaaactatctgagaaactattaag---gatctagagattaatgagttata 21870155  T
Q  338 ttgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    | |  ||||| | ||| || ||| |||||||     ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21870154 tagggatatgatatatcattgaatattatggttgcgtttgatccatgcagccgacctcacttagtgggataag 21870082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18130891 - 18130830
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18130891 tttattatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataag 18130830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 366
Target Start/End: Original strand, 26291788 - 26291999
Alignment:
Q  151 cacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagataga 250  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| | | | ||||||  ||||| ||||||| ||    
T  26291788 cacctataatagaaaatatggtagaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatgga 26291885  T
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtt 350  Q
    ||| |||  |||||  ||| | |||||||||| | |||||||| |  |||||| || || ||||||| |||| ||| |||| ||| ||  ||||||||||    
T  26291886 ggagagtgtgatcaaaagacgtagaggaagactaaaaaaaactat--gagaaattattatgaaagatttagagattcatgagttgaataaaaatatggtt 26291983  T
Q  351 tatgatagaacattat 366  Q
    ||||||| ||||||||    
T  26291984 tatgatataacattat 26291999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 406
Target Start/End: Original strand, 28891474 - 28891539
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  28891474 aaatatgatttatgatagaacattatggtgtaatttaatacatgtaaccgacccttcttagtggga 28891539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 409
Target Start/End: Original strand, 32068612 - 32068685
Alignment:
Q  336 gattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32068612 gattaaaatacgatttataatataacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataa 32068685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 32080658 - 32080731
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32080658 ttggattaaattatgatttatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccacttagtggga 32080731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 365
Target Start/End: Original strand, 547075 - 547215
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagata 324  Q
    ||||||| ||||||| |||| || || |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| | |||||||||| |||  || || || | |    
T  547075 gtagtaaagagagtagatcatattgatgatagtcatatcactagagtcagagaaagactaagaaaaactattagagaaactattaaacaaaatttaaaaa 547174  T
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacatta 365  Q
    ||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  547175 ttaatgagttggactaaattatggtgtatgatagaacatta 547215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 387
Target Start/End: Original strand, 1911575 - 1911623
Alignment:
Q  339 tgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1911575 tgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 1911623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6055910 - 6055806
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| || |||  |||||| || ||| ||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  6055910 aaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgta 6055811  T
Q  387 gccga 391  Q
    |||||    
T  6055810 gccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35199814 - 35199680
Alignment:
Q  234 agagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactt-taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgac 332  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||| |||| | || |||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||     
T  35199814 agagtagatcagatggagggtagtcatatcactagagctagagtaaga-attagaaaaattataaaagaaactattaggaaagatctagagattaatgag 35199716  T
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
    || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35199715 ttagatagaaatat-gtatatgatagaacattatggc 35199680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7150670 - 7150465
Alignment:
Q  70 aatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaaga 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || |||||||||  | |||||      || | ||||   || |||| |    
T  7150670 aatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagag--agttggg------taactcctatcataaaaaata 7150579  T
Q  169 tggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactag 268  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||| | |||||||| | || ||| | | ||||    
T  7150578 tggtggaaactcggattaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagattatatagtaaggagagtacaacagatagatggtaatcaaaccgctag 7150479  T
Q  269 aggcagaggaagac 282  Q
    ||||||||||||||    
T  7150478 aggcagaggaagac 7150465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7513334 - 7513283
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7513334 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgagataagatttgaaatgaca 7513283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12119733 - 12119658
Alignment:
Q  336 gattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12119733 gattcaaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataag 12119658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10099023 - 10098912
Alignment:
Q  297 agagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgacccca 396  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  10099023 agagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacactaa--cgtcatttgatccatgtaatcgacccca 10098926  T
Q  397 cttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||    
T  10098925 cttagtgggataag 10098912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245888
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| | |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataag 4245888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4948505 - 4948408
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctaga 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||    |||||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  4948505 gtagtaaggagagtagatcagatggaagatagtcaaaccactagaggtagaggaagacctacaaaaactaaaagaaaaactattgagaaagatctaga 4948408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4955476 - 4955379
Alignment:
Q  225 gtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctaga 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||    |||||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  4955476 gtagtaaggagagtagatcagatggaagatagtcaaaccactagaggtagaggaagacctacaaaaactaaaagaaaaactattgagaaagatctaga 4955379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 7492586 - 7492655
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7492586 aaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgggataag 7492655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 408
Target Start/End: Original strand, 9568874 - 9568962
Alignment:
Q  319 tagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  9568874 tagagattattgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggata 9568962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 9706687 - 9706827
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | | ||     ||    
T  9706687 taagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggagg-----ta 9706781  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttg 195  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  9706782 gcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 9706827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Original strand, 14030717 - 14030945
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggt-aagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcat 148  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     |    
T  14030717 taagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtggggg-----t 14030811  T
Q  149 agcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagata 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || |||||| |||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||  |  ||| ||||| |||||| |||| |||    
T  14030812 agcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaata 14030911  T
Q  249 gaggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    | ||| |||| ||| |  ||||| ||||||||||    
T  14030912 gtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagac 14030945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23888555 - 23888494
Alignment:
Q  349 tttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  23888555 tttattatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataag 23888494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789090
Alignment:
Q  345 atggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataag 30789090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 385
Target Start/End: Original strand, 32400297 - 32400374
Alignment:
Q  308 taagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    |||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  32400297 taagaaagttctagagtttaattatttggattgaaatatagtttatgatagaacattgtggtgcaatttgatccatgt 32400374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 409
Target Start/End: Original strand, 34939288 - 34939365
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccga-ccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34939288 ttggatcgaaatatggtttatgatatgatattatggtgtaatttgatccatatagccgacccccacttagtggcataa 34939365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 259
Target Start/End: Original strand, 5897483 - 5897592
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggttt--------gggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||        ||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||| |||||||| ||| ||| |    
T  5897483 agtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggccgtttgggcatgtagagagaagatatgtatattttgtagtatggagagtagatcggatgg 5897582  T
Q  250 aggatagtca 259  Q
    ||||||||||    
T  5897583 aggatagtca 5897592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25494105 - 25493909
Alignment:
Q  171 gtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagag 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||   ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| || || ||||    
T  25494105 gtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatattacaagag 25494006  T
Q  271 gcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatg 367  Q
    | | | ||||||    || |||| ||||||||||||  | ||||  | || | |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  25494005 gtacaagaagacctagaagaactataagagaaactatcaggaaaagtttatagattaatgagttgaatttaaatatggtttacgataaaacaatatg 25493909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 32913504 - 32913412
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagag 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||  |||| |||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  32913504 ttaggtggtttggccatgtagagaaaagagttgtagattatgtagcaaggagagtatattagatggagggtagtcaaatcactagaggtagag 32913412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 409
Target Start/End: Original strand, 585992 - 586115
Alignment:
Q  286 aaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgt 385  Q
    ||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||  ||| |||   | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||     
T  585992 aaaaaactaaaaaagaagctattaagaaagatctagcaattgatgtgcttgatagaaatattgtatatgatagaacattatgacgtcatttgattcatgg 586091  T
Q  386 agccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  586092 agccgacctcacttaatgggataa 586115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1615298 - 1615239
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1615298 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataag 1615239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 21089604 - 21089663
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21089604 tatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataag 21089663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Original strand, 30642980 - 30643035
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30642980 atagaacattatggagtaatttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaag 30643035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 410
Target Start/End: Original strand, 33730192 - 33730231
Alignment:
Q  371 taatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730192 taatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 33730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5129195 - 5129125
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagaga 133  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5129195 gatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagattcgatgtgatcggattagaaatgacaatattagagaga 5129125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 383
Target Start/End: Original strand, 7634553 - 7634611
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccat 383  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7634553 ttaatgaattagatttaaatatagtttatgatagaacattatagcgtaatttgatccat 7634611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Original strand, 18905894 - 18905943
Alignment:
Q  160 tagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataa 210  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18905894 tagaaaagatggtggaaatt-ggtttaggtggtttgagcatgtagagataa 18905943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1008124 - 1008072
Alignment:
Q  353 tgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtggga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  1008124 tgatagaacattatggcgtaatttgatccaggtag-caaccccacttagtggga 1008072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 251
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689747
Alignment:
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    ||||||| ||| |||||| | || ||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||  |||| |||||| |||||||||    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  250 ag 251  Q
    ||    
T  2689746 ag 2689747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10100228 - 10100003
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||  |||||||||   | |||||     |     
T  10100228 taagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagag---agtgggg----gtc 10100136  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatag 249  Q
    |||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||      
T  10100135 gcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatga 10100036  T
Q  250 aggatagtcagatcactagaggcagaggaagac 282  Q
    |||| |||||| | |  ||||| ||||||||||    
T  10100035 aggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagac 10100003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1747841 - 1747729
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    |||||||||||||   | |||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| ||    
T  1747841 tagtaaggagagtggcttagatggagggtagtcaaatttctagaggcagaggaagacctagaaaaaccataagagaaactggtaagaaggatctagagat 1747742  T
Q  326 taatgacttggat 338  Q
    |||||| ||||||    
T  1747741 taatgagttggat 1747729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8021321 - 8021265
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  8021321 gatagcacattatgacgtaatttcatccatgtagtcgatcctacttagtgggataag 8021265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30856808 - 30856744
Alignment:
Q  346 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30856808 tggtttatgatagaaaattatggcaaaatttgatgcatttagcagaccccactaagtgggataag 30856744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 402
Target Start/End: Original strand, 32945426 - 32945506
Alignment:
Q  322 atattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  32945426 atattaatgagttagatagaaatattttatatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacatcacttagt 32945506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 12890588 - 12890643
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  12890588 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta 12890643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 351 - 410
Target Start/End: Original strand, 30679603 - 30679662
Alignment:
Q  351 tatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30679603 tatgatagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataag 30679662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35043715 - 35043660
Alignment:
Q  152 acctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  35043715 acctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagaga 35043660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4948678 - 4948629
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4948678 taagtgtagcggagattaggatgttgctttggatgtgtggtaagactaga 4948629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 4955649 - 4955600
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 100  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4955649 taagtgtagcggagattaggatgttgctttggatgtgtggtaagactaga 4955600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21351922 - 21351853
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | || |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  21351922 aaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccgacctcagttagtgagataag 21351853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 410
Target Start/End: Original strand, 29900275 - 29900312
Alignment:
Q  373 atttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29900275 atttgatccatgtagccgacccctcttagtgggataag 29900312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 30679420 - 30679469
Alignment:
Q  158 agtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagaga 207  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  30679420 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagaga 30679469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 366
Target Start/End: Original strand, 33080319 - 33080368
Alignment:
Q  317 tctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 366  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33080319 tctagagattaatgagttgtatcgaaatatggtttatgatataacattat 33080368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 392
Target Start/End: Original strand, 306421 - 306473
Alignment:
Q  340 gaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgac 392  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  306421 gaaatatggtttacaattgaacattctggcgtaatttgatccatttagccgac 306473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4948578 - 4948534
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  4948578 gtagaaaagatggtggaaattcggcttaggtggtttgggcctgta 4948534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4955549 - 4955505
Alignment:
Q  159 gtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgta 203  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  4955549 gtagaaaagatggtggaaattcggcttaggtggtttgggcctgta 4955505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 123
Target Start/End: Original strand, 9568591 - 9568643
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||    
T  9568591 atgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaa 9568643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 410
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886370
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataag 21886370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30718990 - 30718922
Alignment:
Q  199 atgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcacta 267  Q
    ||||||||| || |||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||    
T  30718990 atgtagagagaatacatgtaaattttgtagtaaagagagtatatcagttggaagatagtcagatcacta 30718922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4027 - 3846
Alignment:
Q  226 tagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatat 325  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||   | ||    
T  4027 tagtaaggagagtagataagatggaagatagtcagattgctagaggcagaggtagacc-taaaaaactataagagaaactatttagaaaaatcattagat 3929  T
Q  326 taatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  3928 taatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggata 3846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3703
Alignment:
Q  355 atagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataag 3703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 964
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |  ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  1226 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 1127  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatg 347  Q
     ||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||| |||||| ||||  | ||||| ||||||  |||| ||    
T  1126 ggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 1027  T
Q  348 gtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1026 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgggataag 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44146 - 44023
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||   |||||||||||||| |  ||||    
T  44146 tagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccttcagattctctagtaaggagagtagactagat 44047  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagagg 271  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  44046 ggaggatagtcagatcactagagg 44023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 31399 - 31734
Alignment:
Q  71 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagat 169  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||||||| |    
T  31399 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtagaaaagtt 31493  T
Q  170 ggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactaga 269  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| |  | | ||||| |||||| |||| || ||||| |||||  | |  |||    
T  31494 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 31593  T
Q  270 ggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggc 369  Q
     | ||||||||||     |||||| | |||||||| | ||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| | ||      
T  31594 tgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaa 31693  T
Q  370 gtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31694 gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 31734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 178595 - 178509
Alignment:
Q  251 ggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttgga 337  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  178595 ggatagtcatatcactagaggcggagtaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgga 178509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 44229 - 44170
Alignment:
Q  64 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa 123  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  44229 gatgaggatgttgcgttggatgtgcggtaagactagatggtatagtattaaaaatgacaa 44170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43588 - 43528
Alignment:
Q  300 gaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaa 360  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43588 gaaactattaggaaagatttagaaattaatgtgttgaactgaaatatggtttatgatagaa 43528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 160463 - 160344
Alignment:
Q  287 aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||  ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  160463 aaaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgta 160364  T
Q  387 gccgaccccacttagtggga 406  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  160363 gccaaccccacttagtggga 160344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 58309 - 58242
Alignment:
Q  343 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  58309 atatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataag 58242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45582 - 45477
Alignment:
Q  288 aaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtag 387  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||   || |||||||| || ||  || ||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45582 aaaactatcagagaaactattaagaaagattcggaaattaatgagttagaccgagatatgatgtacgttagaacattatagcgtaatttgatccatgtag 45483  T
Q  388 ccgacc 393  Q
    ||||||    
T  45482 ccgacc 45477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 409
Target Start/End: Original strand, 14766 - 14848
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14766 aatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacgtagtgggataa 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Original strand, 4833 - 4901
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4833 aaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataa 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6864 - 6788
Alignment:
Q  334 tggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6864 tggatagaaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataag 6788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 410
Target Start/End: Original strand, 66653 - 66804
Alignment:
Q  260 gatcactagaggcagaggaagacaataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattg-aaatatggtttatgatag 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||    ||||| | ||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||| |||||||||    
T  66653 gatcattagaggcagaggaagacctagaaaaattataaaaaaaattattaagaaagatctagagattaatgagttagataggaaatatggcttatgatag 66752  T
Q  359 aacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || |  ||||||||| ||||||||||    
T  66753 aacattatggcgtaatttgattcatataactaaccccacttggtgggataag 66804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Original strand, 528 - 597
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  528 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16521 - 16452
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16521 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataag 16452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28974 - 28905
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28974 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 28905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 331
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11984
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||| | ||||||||| ||| | |    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagatctgtagctat-gtattgaggagagtagatccggt 11900  T
Q  248 agaggatagtcagatcactagaggcagaggaagacaata-aaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaatga 331  Q
     |||| |||| | ||||||||||||| | ||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  11901 ggagggtagtgaaatcactagaggcaaaagaaga-actagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatga 11984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48135
Alignment:
Q  335 ggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggat 407  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggat 48135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 82901 - 82984
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  82901 aatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataag 82984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 82632 - 82789
Alignment:
Q  52 taagtgtagcgg-gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcata 149  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||| | | ||||     ||    
T  82632 taagtgcagcggagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtggggg-----ta 82726  T
Q  150 gcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataaga 212  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||| || ||||| ||| |||||| ||||    
T  82727 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaaga 82789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25631 - 25548
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25631 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataag 25548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25788 - 25684
Alignment:
Q  79 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgaca-aattagagagaaaattggggtagcatagcacctaaagtagaaaagatggtggaaa 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||     ||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  25788 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggg-----tagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 25694  T
Q  178 ataggtttag 187  Q
    ||||| ||||    
T  25693 ataggcttag 25684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 16761 - 16844
Alignment:
Q  327 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16761 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataag 16844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 386
Target Start/End: Original strand, 39486 - 39561
Alignment:
Q  311 gaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgta 386  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39486 gaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 2432 - 2331
Alignment:
Q  295 taagagaaactactaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccc 394  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |  ||  |||||||||| ||||||    
T  2432 taagagagactattaagaaagatctagagattaatgagtttgatagaaatatgttatataatagaacattatggcattgttggatccatgtagtcgaccc 2333  T
Q  395 ca 396  Q
    ||    
T  2332 ca 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1858 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1858
Description:

Target: scaffold1858; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 893
Alignment:
Q  325 ttaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  976 ttaatgagttggaccgaaatatggtttataataaaacattatggcataattt-gttcaggtagccgaccccacttagtgggataa 893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 409
Target Start/End: Original strand, 7629 - 7705
Alignment:
Q  333 ttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 409  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  7629 ttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccatctccacttagtgggataa 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 253
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7550
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagat 247  Q
    |||||| ||||||| ||||| | || ||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |  |||| |||||| |||||||    
T  7445 tagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataagaagagtatatcagat 7544  T
Q  248 agagga 253  Q
     |||||    
T  7545 ggagga 7550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 347015 - 346870
Alignment:
Q  184 ttaggtggtttgggcatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcagatagaggatagtcagatcactagaggcagaggaagaca 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| ||  ||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||      
T  347015 ttaggtggtttgggtatgtagagagaaaacctatagattctgtagtaaggagagttgatcagatggagggtaggcagatcgctaggggcagagaaagatc 346916  T
Q  284 ataaaaaactttaagagaaactactaagaaagatctagatattaat 329  Q
       |||||||  |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  346915 tagaaaaactacaagataaactattaaaaaagatctagagattaat 346870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 44003 - 43944
Alignment:
Q  339 tgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  44003 tgaaatatggtttataatagaacattatagcgtaatttaatcaatctagttgaccccact 43944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24575 - 24516
Alignment:
Q  339 tgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccact 398  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  24575 tgaaatatgggttataatagaacactatggcgtaatttgatcaatgtagttgaccccact 24516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 86694 - 86627
Alignment:
Q  341 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggata 408  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  86694 aaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggata 86627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11874 - 11817
Alignment:
Q  148 tagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttgggcatgtaga 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  11874 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtaga 11817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11611 - 11565
Alignment:
Q  364 tatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataag 410  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11611 tatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataag 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Original strand, 26018 - 26078
Alignment:
Q  342 aatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagt 402  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26018 aatatggtttacaatagaacattatagactaatttgagccatgtagccgaccccacttagt 26078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1594 - 1548
Alignment:
Q  354 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccactta 400  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  1594 gatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccactta 1548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University