View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19241_high_2 (Length: 312)

Name: NF19241_high_2
Description: NF19241
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19241_high_2
NF19241_high_2
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (24-312)||(22831323-22831611)
chr7 (24-312)||(22805601-22805889)
chr7 (24-299)||(22858724-22858999)
chr7 (24-297)||(22809951-22810227)
chr7 (24-312)||(22815319-22815609)
chr7 (33-311)||(22898556-22898836)
chr7 (27-312)||(22876208-22876492)
chr7 (24-301)||(22840355-22840638)
chr7 (27-311)||(22894237-22894520)
chr7 (27-301)||(22889595-22889868)
chr7 (24-242)||(22842526-22842753)
chr7 (98-312)||(22880856-22881076)
chr7 (26-161)||(22873589-22873723)
chr7 (42-111)||(22885988-22886057)
chr7 (148-240)||(22914032-22914124)
chr7 (46-82)||(22881079-22881115)
chr7 (162-194)||(22885937-22885969)
chr7 (260-297)||(22885897-22885934)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (24-300)||(21150134-21150410)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22831611 - 22831323
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22831611 cttataaataataaacaccgaacagaactacacaagcattattcattcacaaactataatcatgttcctcaagcttgtgtttatgttgttttttcttgtt 22831512  T
Q  124 acattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttac 223  Q
    ||||| || |||||| | || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831511 acatttgtagcaagtgaagacagcagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttac 22831412  T
Q  224 taagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttccaatgcaagtgtg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22831411 taagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttcgaatgcaagtgtg 22831323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22805889 - 22805601
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22805889 cttataaataataaacaccgaacagaactacacaagcattattcattctcaaactataatcatgttcctcaaacttgtgtttatgttgttttttcatgtt 22805790  T
Q  124 acattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttac 223  Q
    ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22805789 acattagtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggttttgctgagttaacctcagatggcatac 22805690  T
Q  224 taagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttccaatgcaagtgtg 312  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||  | ||   ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  22805689 taagactcaccaatgatacagaacaagtaataggtcatgctttctatccaaatccaatagttttcaaaaacacttccagtgaaagtgtg 22805601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22858999 - 22858724
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgtt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||| | ||| ||||||    
T  22858999 cttataaataacaaacaccgaacagaactacacaagcattgttcattcacaaactaaaatcatgttcctcaagtttgtctttatgttatgtttgcttgtt 22858900  T
Q  124 acattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttac 223  Q
    |||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22858899 acattggtagcaagtgaagacaacggtttcatctataaaggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcaactggcttac 22858800  T
Q  224 taagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttc 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22858799 taagactcaccaatgatatcgggcaagatacagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttc 22858724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22810227 - 22809951
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacag---aactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttctt 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810227 cttataaataataaacattgaacagcagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttcctcaagcttgtgtttatgttgttttttctt 22810128  T
Q  121 gttacattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggct 220  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22810127 gttacattagtagcaagtaaagataacagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaaccccagatggct 22810028  T
Q  221 tactaagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacact 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |  || | || | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  22810027 tactaagactcaccaatgatacagaacatgaaaaaggacatgctttctatccaaatcctgtagttttcaaaaacact 22809951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22815609 - 22815319
Alignment:
Q  24 cttataaataataaa-caccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaacta-taatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttg 121  Q
    ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  22815609 cttataaataacaaaacatcaaacagaactacagaagcattgttcattcacaaactaataatcatgttcctcaaacatgtgttcatgttgttttttctcg 22815510  T
Q  122 ttacattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggctt 221  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22815509 ttacattggtagcaagtgtagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttaaatcttgatggtattgctgagttaacctcaaatggctt 22815410  T
Q  222 actaagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttccaatgcaagtgtg 312  Q
    ||||| ||||||||||||||| |    ||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22815409 actaaaactcaccaatgatacagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatgaaagtgtg 22815319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22898836 - 22898556
Alignment:
Q  33 aataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaacta---taatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgttacattg 129  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22898836 aataaacactaaacagaactacagaatcattatt-attcacaaactactataatcatgttcctcaagcttgcgttcatgttgttttttcatgttacattg 22898738  T
Q  130 gtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttactaagac 229  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| ||||    
T  22898737 gtagcaagtaaagataacagtttcatctataatggtttccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctaatttaacctccaatggcttacttagac 22898638  T
Q  230 tcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttccaatgcaagtgt 311  Q
    ||||||||||||||  || ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  22898637 tcaccaatgataccaagcaagaaaaagcacatgctttctatccaaatcctatagttttcaagaacacttctaatggaagtgt 22898556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22876492 - 22876208
Alignment:
Q  27 ataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgttaca 126  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22876492 ataaataataaacaatcaacagaactgcataagcattatt-atccacaaactataatcatgttcttcaggcttgtgttcatgttgttttatcttgttaca 22876394  T
Q  127 ttggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttactaa 226  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22876393 ttggtagcaagtgaagaaaacagtttcatctataatggattccaatcatcaaatttatatcttgatggtattgctgagttaacctcaaatggcttactaa 22876294  T
Q  227 gactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttccaatgcaagtgtg 312  Q
     ||||||||||||||| |     || | || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22876293 aactcaccaatgatacagaatatgaaaaaggacatggtttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttccaatggaagtgtg 22876208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22840638 - 22840355
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22840638 cttataaataataaacaccaaacagaactacagaagcatcatttattcacaaactataatcatgttcatcaaacttgtgttcatgttgttttttcatgtt 22840539  T
Q  124 acattggtggcaagtaatgataacagtttcatct------ataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatg 217  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| | |||  ||    
T  22840538 acattggtagcaagtatagacaacagtttcatctataaatataatggattccaatcatcaaatttatatcttgatggtaccgctgagttagcctcaactg 22840439  T
Q  218 gcttactaagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttcca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | ||| | || | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22840438 gcttactaagactcaccaatgatacaaaacaagaaaaaggacaagctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacacttcca 22840355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22894520 - 22894237
Alignment:
Q  27 ataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgttaca 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894520 ataaataataaacactgaacagaactgtataagcattatt-attcacaaactataatcatgttcctcaggcttgtgtttatgttgttttttcttgttaca 22894422  T
Q  127 ttggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttactaa 226  Q
    |||||  ||||| | || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||    
T  22894421 ttggtaccaagtgaagacaaaagtttcatctataatgatttccaatcatctcatttgtatcttgatggtattgctaatttaacctccaatggcttactaa 22894322  T
Q  227 gactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttccaatgcaagtgt 311  Q
    ||||||||||||| |||   | ||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  22894321 gactcaccaatgacaccaaacaagaaaaagcacatgctttctatccaaaccctatagttttgaagaacacttccaatggaagtgt 22894237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22889868 - 22889595
Alignment:
Q  27 ataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgttaca 126  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22889868 ataaataagaaacaatgaaccgaactgtataagcattatt-attcacaacctataatcatgttcctcagacatgtgttcatgttgttttttcatgttaca 22889770  T
Q  127 ttggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttactaa 226  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22889769 ttggttgcaagtgaagacaacagtttcatatataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaactacaaatggcttactaa 22889670  T
Q  227 gactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttcca 301  Q
     ||||||||||||||| |    ||| | || | ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  22889669 aactcaccaatgatacagaaagagacaaaggacatggtttctatccaaatccaatagttttcaaaaacacttcca 22889595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22842753 - 22842526
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacag---aactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttctt 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22842753 cttataaataataaacattgaacagcagaactacagaagcattgttcattcacaaacaataatcatgttcctcaagcttgtgtttatgttgttttttctt 22842654  T
Q  121 gttacattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataat------ggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcag 214  Q
    ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||      |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22842653 gttacattggtagcaagtgaagacaacagtttcatctataataatagaggattccaatcatttcatttgtatcttgatggtattgctgagttaacctcag 22842554  T
Q  215 atggcttactaagactcaccaatgatac 242  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22842553 gtggcttaccaagactcaccaatgatac 22842526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22881076 - 22880856
Alignment:
Q  98 ttgtgtttatgttgttttttcttgttacattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataa------tggattccaatcatcacatttatatcttga 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22881076 ttgtgtttatgttgttttttcttgttacattgatagcaagtgaagaaaacagtttcatctataaatacaatggattccattcatcacatttatatcttga 22880977  T
Q  192 tggtattgctgagttaacttcagatggcttactaagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaa 291  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |    ||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22880976 tggtattgctaaggtaaactcaaatggcttactaagactcaccaatgacacagaaagagccaaaggatatgctttctatccaaatcctatagttttcaaa 22880877  T
Q  292 aacacttccaatgcaagtgtg 312  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  22880876 aacacttccaatgaaagtgtg 22880856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22873723 - 22873589
Alignment:
Q  26 tataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgttac 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  22873723 tataaataataaacactgaatagaactgcataagcattatt-attcacaatccataatcatgttcctcaggcttgtgctcatgttgttttatcttgttac 22873625  T
Q  126 attggtggcaagtaatgataacagtttcatctataa 161  Q
    ||| || |||||| | || |||||||||||||||||    
T  22873624 attagtagcaagtgaagacaacagtttcatctataa 22873589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22886057 - 22885988
Alignment:
Q  42 cgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  22886057 cgaacagaactacagaagcatgattcattctcaaactataatcatgttcctcagacttgtgttcatgttg 22885988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22914124 - 22914032
Alignment:
Q  148 agtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttactaagactcaccaatgat 240  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  22914124 agtttcacatataatggtttcaaatcatcacatttatatcttgatggtgttgctgaattaacctcaaatggtttactaagattaaccaatgat 22914032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22881115 - 22881079
Alignment:
Q  46 cagaactacagaagcattattcattcacaaactataa 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22881115 cagaactacagaagtattattcattcacaaactataa 22881079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22885969 - 22885937
Alignment:
Q  162 tggattccaatcatcacatttatatcttgatgg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885969 tggattccaatcatcacatttatatcttgatgg 22885937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22885934 - 22885897
Alignment:
Q  260 atgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacact 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22885934 atgctttctatccaaatcctatagttttcaaaaacact 22885897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 21150134 - 21150410
Alignment:
Q  24 cttataaataataaacaccgaacagaactacagaagcattattcattcacaaactataatcatgttccacaaacttgtgtttatgttgttttttcttgtt 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  21150134 cttataaataataaacatcaaacagaactacagaagcattgttcattcacaaactataatcatgttcctcaagcttgtgtttatgttgtttaatcttgtt 21150233  T
Q  124 acattggtggcaagtaatgataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacttcagatggcttac 223  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21150234 acattggtagcaagtgaagataacagtttcatctataatggattccaatcatcacatttatatcttgatggtattgctgagttaacctcaaatggcttac 21150333  T
Q  224 taagactcaccaatgataccgggccagatacagcatatgctttctatccaaatcatatagtttttaaaaacacttcc 300  Q
    |||||||||| | |||||| |  |  || | ||   |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21150334 taagactcactagtgatacagatcatgaaatagggcatgctttctatccaaatcctatagttttcgaaaacacttcc 21150410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University