View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19264_low_12 (Length: 424)

Name: NF19264_low_12
Description: NF19264
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19264_low_12
NF19264_low_12
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (1-410)||(14025343-14025752)
chr6 (1-404)||(13932416-13932819)
chr6 (1-410)||(13892598-13893007)
chr6 (1-410)||(13862424-13862833)
chr6 (1-410)||(14015212-14015623)
chr6 (1-404)||(14110544-14110947)
chr6 (1-410)||(13911885-13912294)
chr6 (1-410)||(13874894-13875303)
chr6 (11-402)||(13472601-13472992)
chr6 (4-410)||(14047412-14047798)
chr6 (71-410)||(14084729-14085068)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14025752 - 14025343
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||        |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  14025752 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtcaaaaatcgttgttctgttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattcca 14025653  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
    |||||||||  |||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  14025652 ccatttctaaaaggttctacagttactgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcctatgtaaaaatggtatagatgcagtgttaggcc 14025553  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14025552 agtttgacctttcgaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcagcaacaatttttc 14025453  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14025452 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtagaactgcaagcattcctattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 14025353  T
Q  401 tgcaaaaagt 410  Q
    |||| |||||    
T  14025352 tgcacaaagt 14025343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13932819 - 13932416
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||        |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  13932819 ttcaaacaataatctcaaaggttcaattccaaatcttcaagtcaaaaatcactgttctcttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattcca 13932720  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
     ||||| ||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||  |||||||||| ||| ||  |||||||    
T  13932719 gcatttttacaaggttctgcacttattgatttgtccaaaaacaaattttcagattctcgcccattcctttgtgcaaatggtataaatgaaatcttagctc 13932620  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13932619 agtttgatgtttcaaataatcaattatctggacgaattccagactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagccacaacaatttttc 13932520  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13932519 agggaagattccaacttcaatgggatcacttgtaatactgcgagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 13932420  T
Q  401 tgca 404  Q
    ||||    
T  13932419 tgca 13932416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 13892598 - 13893007
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||        |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  13892598 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtcaaaaattattgttctattttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattcca 13892697  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
    |||||||||  |||||||    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||  |    
T  13892698 ccatttctaaaaggttctacacttattgacttgtccaaaaacaaattctccgattctcttccattcctatgtacaaatggtatagattcaatgttaggcc 13892797  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||     
T  13892798 agtttgacctttcaaataatcaattatctggacgagttccagactgttggaacaatttcaaggcattagtttatctcgatttgagccacaacaatttttt 13892897  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13892898 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtagaactgcaagcattactattgaggaacaacagcttaacagaggagatccctttctccttaatgaac 13892997  T
Q  401 tgcaaaaagt 410  Q
    |||| |||||    
T  13892998 tgcagaaagt 13893007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 13862424 - 13862833
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| |||        |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13862424 ttcaaacaataatcttaaaggatcaattccaaatttaaaagtaaaaaatcactgttctcttttatctctttcatcaaatgattttgaagggcccattcca 13862523  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  13862524 ccatttctacgaggttctggacttattgatctatcgaaaaataaattctcagattctcgttcattcctatgtgcaaatgttatagatgaaatgttagctc 13862623  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13862624 agtttgatgtttcaaataatcaattatctggacgaattccagactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagtcacaacaatttttc 13862723  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13862724 agggatgattccaacttcaatgggatcacttgtaaaactgcgagcattactattgaggaacaatagcttaacagagcagatcccttcctccttaatgaac 13862823  T
Q  401 tgcaaaaagt 410  Q
    |||| |||||    
T  13862824 tgcacaaagt 13862833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14015623 - 14015212
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnat--ctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||| |        ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  14015623 ttcaaacaataatctcaaaggttcaattccaaatcttcaagtcaaaattaattttttttttttatatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattc 14015524  T
Q  99 caccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagc 198  Q
    || ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||     
T  14015523 cagcatttctacaaggttctgaacttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcctatgtgcaaatggtatagatgcaatgttagg 14015424  T
Q  199 tcagttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttt 298  Q
     ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  14015423 ccaggttgacctttcaaataatcaattatctggacaaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagcttatgttgatttgagtcacaacaatttt 14015324  T
Q  299 tcagggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14015323 tcagggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgacgaacaatagcttaataggggagatccctttctccttaatga 14015224  T
Q  399 actgcaaaaagt 410  Q
    |||||| |||||    
T  14015223 actgcacaaagt 14015212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14110947 - 14110544
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  14110947 ttcaaacaataatctcaaaggaataattccaaatcttcaagtaaaaaattattgctctagtttatctctttcattaaatgaatttgaagggcccattcca 14110848  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
    |||||||||| ||||||     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  |    
T  14110847 ccatttctacaaggttcccatgttattgacctgtccaaaaacaagttctctgattcttttccattcttatgtgcaaatggtatagatgtaatgttaggcc 14110748  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14110747 aatttgacctttcaaataatcaattatctggaagaattccagactgttggagcaatttcaagtcattggtttatgttgatttgagccacaacaatttttc 14110648  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14110647 agggaagattccttcttcaatgggatcacttgttaatctgcaagcattactattgaggaacaatagcttaacagaggagatccctttctccttaatgaac 14110548  T
Q  401 tgca 404  Q
    ||||    
T  14110547 tgca 14110544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13912294 - 13911885
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13912294 ttcaaacaataatctcaaaggcttaattccaaatcttcaagtaaaaaatctttgttctgttttatcactttcatcaaatgaatttgaagggcccattcca 13912195  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
    ||||||||   |||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||  |||||  |    
T  13912194 ccatttctcaaaggttctacagttattgatttgtccaaaaacaagttctctgattctcttccattcctctgtgcaaatggtatagatgcagtgttaggcc 13912095  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    |||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  13912094 agtttgaccttccgaataatcaattatctggacaaattccagattgctggagcaatttcaagtcattagcttatctagatttgagccagaacaatttttc 13911995  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911994 agggaagattccaacttcaatgggatcacttgtagaactgcaagcattactattgaggaacaatagcttaacaggggagatccctttctccttaatgaac 13911895  T
Q  401 tgcaaaaagt 410  Q
    |||| |||||    
T  13911894 tgcacaaagt 13911885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 13874894 - 13875303
Alignment:
Q  1 ttcaaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattcca 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||        ||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  13874894 ttcatacaacaatctcaaaggattaattccgaatcttcatgtaaaaaatcattgttcttttttatctcttgcatcaaatcaatttgaaggctccattcca 13874993  T
Q  101 ccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctc 200  Q
    ||||||||  |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||  || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||  |    
T  13874994 ccatttctcagaggttctgtatctattgatttgtccaaaaacaaattctctaactctattcaatttttatgtgaaaatggtatagatgaagcgttaggcc 13875093  T
Q  201 agttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttc 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13875094 agtttgacctttcaaataatcaattatctggaagaattccagattgttggagaaatttcaaatcattagcttatgtagatttgagccacaacaatttttc 13875193  T
Q  301 agggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaac 400  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||  || |  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  13875194 agggaaaattccttcttcaatgggatcactcgtagaactgcaagcattaatgttgaggaacaacagtttaatggaggatatccctttctccttaatgaac 13875293  T
Q  401 tgcaaaaagt 410  Q
    |||| |||||    
T  13875294 tgcacaaagt 13875303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 402
Target Start/End: Original strand, 13472601 - 13472992
Alignment:
Q  11 aatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattccaccatttctac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||     
T  13472601 aatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgttcttttttatatctttcatcaaatgaatttgaagggtccattccaccatttctaa 13472700  T
Q  111 gaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctcagttcgacat 210  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||  ||| |||| ||||  || ||||  |||  | ||| |    
T  13472701 gaggttcttcatttattgatctgtccaaaaataagttctctgattctcgccctttcctatgtgcaaacggtagagatataatgttacgtcaacttgacct 13472800  T
Q  211 ttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttcagggaagatt 310  Q
    ||| |||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  13472801 ttcgaataataaattttcgggaggaattccaaattgttggagcaacttcaagtcattagtttatgtagatttgagtcacaacaatttttcctggaagatt 13472900  T
Q  311 cctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaactg 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13472901 cctacttcaatgggatctcttgtagaacttcaagcattaatattgaggaaaaacatcttaacagaggaaatccctgtctccttaatgaactg 13472992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14047798 - 14047412
Alignment:
Q  4 aaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgtgnnnnnnnatctctttcatcaaatgagtttgaaggacccattccacca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||        |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||     
T  14047798 aaacaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagccaaaagtcaatgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggtccactccacct 14047699  T
Q  104 tttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttatgtaaaaatggtatagatgcaacgttagctcagt 203  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||||    
T  14047698 tttctactaggttctggattaattgatctttccaaaaataaattctccgattctcttccattcttatgtgaaagtggtatagatgcaatattaggccagt 14047599  T
Q  204 tcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcaacaacaatttttcagg 303  Q
    |                    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14047598 t--------------------tatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaggcattagcttatctagatttgagccacaacaatttttctgg 14047519  T
Q  304 gaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaactgc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14047518 gaagattcctacttcaatgggatcacttgtagaactgcgagcattaatattgaggaacaatagcttaacaggggagatcccttcctccttaatgaactgc 14047419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14085068 - 14084729
Alignment:
Q  71 tcatcaaatgagtttgaaggacccattccaccatttctacgaggttctgggtttattgatctgtccaaaaacaaattctctgattctcgtccattcttat 170  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||      |||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| |||    
T  14085068 tcatcaaatgaatttgaaggtcccattccaccatttcttagaggttccataaatattgatctgtccaaaaataaattcaatgattctgttccattcatat 14084969  T
Q  171 gtaaaaatggtatagatgcaacgttagctcagttcgacatttcaaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagt 270  Q
    ||  |||||||||||||| ||| ||||| || |  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  14084968 gtgcaaatggtatagatgtaactttagcccattctgacctttcaaacaatcaattatctagacgaattccagactgttggagcaatttcaaggcattagc 14084869  T
Q  271 ttatgtagatttgagcaacaacaatttttcagggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgaggaacaacaacttg 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||     
T  14084868 ttatgtagatttgagccacaacaatttctcggcaaagattcctatttcattgggatcacttgtagaacttcaagcattactgttaaggaacaacagctta 14084769  T
Q  371 acaggggagatccctttctccttaatgaactgcaaaaagt 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14084768 acagaggagatccctttctccttaatgaactgcacaaagt 14084729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University